2DE4A

Crystal structure of dszb c27s mutant in complex with biphenyl-2-sulfinic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
DTLTYSNSPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodococcus sp.
molecule tags Hydrolase
total genus 118
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de4A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de4A02
2V93A 3VXCA 4BDOA 4IO4A 4YB7A 2FYIA 4RA1A 5KCJB 4RK2A 3UK4A 5CC2A 3B6QA 3KOSA 4JBZA 4FATA 4Z7EA 3AXFA 4YKIA 1P1NA 1IXGA 2QS3A 1N84A 4F1UA 1NNFA 4NF8A 2PMSA 4PETA 2B65A 3T96B 3IOWA 4R75A 1XVXA 1MH4A 2RC8A 4IO6A 2Y7WA 4BLAA 5AA3A 5HM4B 4LZ5A 1Y4TA 3BBRA 1Y20A 1LCFA 1N04A 3A3CA 5H8NA 1JEUA 3MVXA 1XVYA 2P2AA 2DWHA 1MS7A 4PFUA 4ELQA 1QVSA 3MC2A 2XXUA 1US5A 5CMCA 3HCQA 4NF5A 4ZDMA 2YLNA 3FJMA 4ZE8A 4U23A 5K2YA 4RPOA 2ZMBA 4HTGA 3TFLA 5JTYA 4KHZE 1S50A 1S9TA 4M4GA 1MDQA 1USYE 4ND9A 2GFEA 4OXVA 5I58A 4RY1A 2DE4A 4U1ZA 2F97A 2G29A 3T9VA 4MLVA 5JK4A 1BLFA 1OVTA 1UTHB 3N6TA 4AB6A 4KCCA 4OZ9A 5F7VA 3TTLA 2HZKA 5H8FA 3TEPA 4R6YA 1JVYA 1QUKA 3SKPA 1LLSA 1QKBA 4JWXA 3C34A 4NF8B 3SDFA 1JEVA 3MPKA 3MVWA 2O6AA 1B52A 5I56A 2R71A 3VLUA 2PX1A 3ZSFA 1YAEA 2RINA 4G68B 3TELA 3SEVA 4OTEA 1VR5A 3EF7A 3MWBA 4KD5A 4QRZA 1POTA 4P0GA 1MM6A 4POXA 5TPAA 3C32A 1QUJA 2HAUA 3R6UA 1PBQA 4OEUA 1MPDA 1ZLQA 1B9JA 4Q30B 4KCDA 5CMKA 1Z7ME 2Y7KA 1OVBA 2X7PA 1B7HA 1HSEA 3TCHA 1BIYA 2XX9A 1N7XA 3QUFA 1Y4CA 2XXIA 4I1DA 1IQ7A 3TUSA 1R6ZA 2ABHA 4F22A 4N07A 2F5XA 4F2QA 1D3KA 1MQGA 5DTBA 4H0WA 1VFEA 4I8CA 4PFWA 1XS5A 2DXRA 1B5IA 4R9GA 4O3AA 3TTMA 2Q2AA 4YKKA 4EQ9A 4ZE9A 5EHMA 3BKIB 3TKDA 4Q0CA 1OLAA 3K1MA 2A5SA 4OMBA 1XC1A 2O7IA 1B46A 3G3GA 2VGQA 3CSBA 1Y1ZA 1MY2A 3UIFA 3H6TA 3LR1A 1FQAA 3MQ9A 4ZEDA 3U93A 1TXFA 3P7IA 2ONSA 2OWSA 3TTRA 3UN6A 2CMOA 3ZKKA 4MH5A 4E0WA 3SEYA 3V8XB 1IUDA 2H25A 1N7WA 3IORA 5I2NA 1VSOA 4OFJA 1WODA 4H1XA 3MZBA 2O1MA 1ANFA 1I6QA 3FV1A 3H4ZA 3GZGA 2FA7A 3PUYE 1A8EA 1Y9UA 4BDNA 3O97A 3GBBA 3SESA 1PEBA 1LFGA 2XX7A 1NNPA 2VD3A 4DXUA 2DYXA 5AE4A 2Q9TA 3C31A 3CRBA 2KLFA 4OEVA 1EZ9A 2H98A 2XXPA 1LGBC 2PBWA 5B70A 1EH3A 2Z23A 4OFOA 1IXCA 1IIWA 3HO7A 4NWDA 1B1HA 3K1NA 1MY1A 5ITPA 1A8FA 2RKMA 4U4SA 1SQYA 3T9HB 1P1UA 3Q26A 5KZTA 1LAXA 4M1VA 4FIMA 1CE2A 3KBRA 1AOVA 3RQTA 4R9FA 3LSWA 3IK6B 1FTLA 1B6HA 3FV2A 3M8UA 1Y1MA 1JW1A 4U22A 2F7AA 4UA8A 1OMPA 3MP8A 3KGCA 2X7QA 3OEMA 3SETA 3C4MA 4PFTA 5KCJA 2DS9A 1I6AA 1IZ1A 2DWAA 1II5A 2AYSA 2XXHA 1RYOA 3FZVA 3I3VA 4GL8A 3KSXA 2A5TA 1H3DA 1MQDA 2DWJA 2XD2A 3OELA 3TODA 5DT6A 1ZBMA 3IJXB 2Y7PA 4ZECA 4ELPA 1IXHA 1DOTA 3S9MC 4OESA 1D9YA 4LONB 2PT1A 4NE4A 3HHFA 1JNFA 3K02A 1M5EA 1SVXB 4YICA 1NMUA 3C35A 3USDA 4ECFA 2XX8A 2DOJA 1R9LA 3E4RA 1FQDA 4IO2A 1PBPA 5DYHA 3UA8A 3IB2A 3KEIA 1EZPA 2F6PA 4FJPA 4GRKA 3OO6A 4OYVA 3FVNA 1B4HA 3K6WA 5I57B 4RYAA 4H5FA 2OJTA 4IB2A 5DVJA 2I6EA 4ELOA 3L6HA 3TTNA 4G8NA 5TP9B 3SEXA 2HXWA 4IO7A 2M8CA 1Y3PA 2PYYA 3QAXA 3I5OA 4YKJA 2WKYA 3RT8A 4NTLA 2FNCA 1VE4A 4JDFA 4R73A 1Q1KA 4F3BA 1N3WA 2XXTA 4ZS9A 3Q27A 3PMVA 1LSTA 4FEDA 3KN3A 2XXVA 4QFOA 1I69A 3PPPA 3B6TA 3IO4A 2B3BA 4H65A 4U1OA 4JWYA 2Q8JA 3JYRA 2VP1A 3G3JA 2Y7RA 1UTHA 3W9WA 3QYTA 3SEWA 1DSNA 3FVGA 2DP8A 4TOZA 1XOCA 2A5TB 1ATGA 1ZKBA 2OCUA 2VD2A 5JEIA 2ZYOA 3O2AA 4OFLA 3U72A 1BTJA 1SD3A 4PQJA 3MUQA 3RTWB 1GGGA 3IL1B 2RCAA 4C0RA 2H4IA 3IOUA 1SI1A 3MW0A 2ESNA 4IO5A 4G68A 3SEUA 4EDPA 1B7ZA 3MJNA 1B5JA 1Z7NE 4BDLA 4GLIA 4U21A 2NVUB 5KDTB 4GXSB 3PV0E 1FTOA 4QFNA 2O7UA 2PT2A 2QPQA 1MDP1 3A3UA 4MBPA 3T22A 1N0TA 1OLCA 4G8MA 3CG1A 4U2RA 4YKPA 4Q8RA 3QSLA 3U1OA 1MXXA 1TFDA 3KN7A 2ZYKA 4KI0E 1M5FA 2NUVA 3TMGA 2ANJA 4RPNA 4R2BA 1A7LA 1AH5A 1PDAA 2O68A 5CRYA 4F1YA 1FQBA 3U94A 4MF3A 4TLMB 1FTKA 1KWHA 4RXLA 2XXWA 4THIA 2NXOA 4GWOA 1AL3A 3K6XA 3M3FA 2ONRA 1JETA 3OO9A 2F34A 2R6GE 4EQBA 3MP1A 1MPCA 5I59B 2LAOA 3MVYA 4EQ7A 2F8DA 1LAFE 4N13A 4GFRA 1IXIA 3IX1A 3L6GA 3WAEA 1UTBB 2THIA 2Y84A 3Q28A 4QSCA 4ISUA 3FD3A 4NF6B 3RY3A 2GHAA 2NWJA 2R9JA 2VHAA 4E0XA 4GOTA 3OO8A 4HCWA 1H76A 3U92A 3OSRA 4F2OA 4AB5A 4QFLA 3RLFE 4IO3A 1BKAA 4NWCA 4N6PA 1MY3A 4XKNA 3VLVA 1B05A 4KYDA 1LCTA 4F3PA 4R6KA 4JSOA 4XKPA 4FEBA 3O6IA 1SW5A 3FXQA 5ISUA 3OOAA 5F1QA 1YTVA 4ZZAA 3CFZA 1WVJA 3ONMA 1MXVA 1AIVA 2Z22A 4ZEKA 3GLBA 1MXZA 3UORA 3TAJA 2UYEA 3BFTA 4DXBA 1M5BA 3O28A 5DVIA 3U8QA 2I4BA 4ZZEA 1QJMA 3C33A 2F35A 2XXXA 3OEKA 4QFKA 2Q88A 3K6UA 4KYSA 5ICQA 2DVCA 4OERA 4NEDA 1NL5A 3G3KA 3G3HA 2D5WA 3A09A 3PPNA 5EHSA 1LBCA 2H99A 3Q29A 3VDFA 2QS1A 3FGSA 1SBPA 1MXWA 1LFIA 3H06B 4IY6A 3UGWA 2P0SA 3ZKLA 4LUBA 3H03A 1MQJA 3HSTA 3DM0A 1F9BA 2OZZA 3K6VA 3IOTA 1ZTYA 3T9XB 2OWTA 1MM7A 1PB7A 2DWIA 5BWJA 3SERA 4HW8A 2UYFA 1DPPA 3PGFA 5J1DA 4GF8A 3PD8A 2RCBA 4Z0IA 2H5YA 3ODBA 4OHNA 3GBAA 3KZGA 2DE2A 2HEUA 1FCKA 3EN3A 3MVZA 1DPEA 3HV1A 4XIGQ 2IEEA 1N3XA 1XHYA 4H8JA 1URDA 3RGYA 3O9PA 1QUIA 4R74A 4DLDA 4QSEA 3PUZE 1B2HA 3ILUB 4U4XA 1LBBA 4QF9A 4G8HA 4EF2A 2I0CA 1R9QA 1URGA 3VVDA 3B6WA 5FHOA 1DMBA 3CG3A 3S2VA 2GHBA 3RNNA 2E1SA 5CI5A 3CR9A 3PUXE 2HCAA 3F11A 1S7YA 3G3IA 2XD3A 1MY0A 1SW2A 2YJPA 4X1DA 1PB9A 5I57A 3I6VA 3LUYA 3ILTB 4KQPA 1PC3A 3GXAA 1NFTA 2B3FA 3PPOA 4G2ZA 3O6HA 1Y3QA 4YMBA 1J1NA 5CBSA 2UVIA 5TP9A 2P1SA 5HBCA 3TYHA 4ESWA 2X26A 3CVGA 4OETA 2V3TA 1POY1 3K01A 4I9DA 4OQOA 5H8SA 2I4CA 4C1UA 2XXYA 1A55A 2BJJX 1EZOA 3HHGA 1USYH 1NNKA 3PPQA 3UP9A 4LQ2A 3G7WA 5IKBA 4JXIA 4UACA 3WAFA 4I62A 2XXQA 1MRPA 3JV9A 4HS7A 4PP0A 2Z8EA 2GRVA 3PMWA 3O66A 1HSJA 3KJTA 1O64A 1B40A 4EXLA 1B3LA 1QKAA 1NKXA 4GIZA 3O6GA 4DZ1A 4QFPA 1HSLA 4H8IA 2ONKE 3H6UA 3KJ7A 3OSQA 1MQHA 1NNTA 1SYIA 1RKMA 4MFIA 3K4UA 4FE8A 1QULA 5H8QB 4KPTA 4OWDA 3K0VA 2F78A 4ONYA 5KDTA 3MAMA 4YB5A 2AIXA 4MLQA 2OBGA 3PU5A 1MXUA 2QSXA 2REGA 4RK9A 2RC9A 1B5HA 1H45A 3S4UA 1OQHA 1B7UA 4IY5A 4P11A 1JQFA 4QHQA 1JW4A 2O84X 2ZYNA 1VFDA 2AL4A 3TQLA 1MY4A 5DVFA 4KYEA 1FTMA 3DP8A 2QJEA 3V89B 1O63A 2NOOA 1LB9A 4EF1A 5K2XA 4GQOA 3IR1A 4DCXA 1GR2A 3OO7A 3FJ7A 5FHMA 1O7TA 5I59A 1B3GA 5IAIA 1SW1A 4WEDA 1N76A 2DSFA 1LAHE 1A40A 3LSXA 4JB7A 2OLBA 4ZEIA 2Q2CA 3TCGA 1UTBA 2O1LA 4G4PA 4IGTA 3KSJA 3PPRA 4BDMA 4YZZA 1M5DA 1B32A 4F3GA 5L9SA 4RJZA 4NF6A 5AA4B 2D21A 5I84A 5H8HB 2F36A 1ZMGA 4P0IA 5L9OA 4XXUA 3VV5A 4YAHX 5FTIA 1RYXA 3PUVE 3FUZA 4LVQA 5AA2D 5DEXB 3JZJA 4BDRA 5CBRA 2ZNTA 3OD7A 4F1VA 3RN8A 2QS4A 3N5LA 2ZXTA 4X48A 4ESXA 4FAJA 1B3EA 3IJOB 5L9MA 1UIVA 5AA2B 3PMXA 5I2KB 1MG1A 2H9BA 3MPLA 3MBPA 4LP2B 4NF4B 3S9LC 4BDQA 1URSA 3S9EA 3FXRA 1EU8A 1MPBA 2QRYA 4ELRA 4XTCQ 4OENA 1SYHA 3N6UA 1BP5A 4G68C 3CI8A 4PFYA 3E3KA 1P1WA 3LSLA 3N26A 2ZYMA 5FTHA 3ZS6A 4O3CA 1ZIUA 1DTZA 2O69A 5A5XA 3DP4A 1UIUA 3HN0A 1M5CA 3TCFA 1AMFA 2I49A 1D4NA 3KFMA 3TPAA 2I3VA 4F19A 4POWA 4R2FA 3VE1B 1IITA 2V84A 4R6HA 1H43A 3OXNA 4GL0A 1B3FA 3PUWE 4QSDA 1FTJA 1GTKA 3N94A 4LZ8A 5L8DA 4ZEFA 1CB6A 3G3FA 4K3FA 2O51A 4GD5A 3EHSA 4WEPA 2DQVA 3DELB 5AA1A 4RNSA 3DLNA 2E0SA 3QIMA 1L5TA 1TWYA 3CIJA 3R26A 3C36A 2HAVA 4F3SA 1NH8A 5H8NB 1FW0A 3RTFB 2F6GA 3H6WA 1YPNA 2DXYA 1MH3A 3LSFB 1B51A 2ZNUA 1WDNA 4HCYA 3H6VA 3TTKA 4NF5B 3C9HA 3D4CA 3CFXA 3HPIA 2OK2A 2REJA 3T93B 2QS2A 2Q89A 4H5GA 4LZ7A 3MZ1A 1FQEA 4JWOA 5JTYB 2QMWA 2VOZA 4YMAA 5I58B 2I3WA 1NH7A 1H44A 1LB8A 4LATA 3D4GA 4KFQA 2F7BA 4KR5A 4DIGA 2I0BA 1P1QA 4C1TA 5A5XB 3K1PA 3VLWA 4DXCA 2RC7A 3H7MA 3RUMA 3V5AA 5H8FB 5ELVA 4L17A 2YPNA 3FATA 2W7YA 4TLLB 4YU0A 3OMBA 2UVHA 2V25A 3IOVA 4PE5B 3W15C 2CZLA 3ECRA 3E13X 4F18A 2Y7IA 3FXUA 3IO6A 5I56B 1B1XA 5B7DA 4EUOA 3IB0A 1B58A 2ZNSA 5FHNA 1UQWA 3FASA 4XKRA 1Y3NA 5ICTA 1OIBA 3THIA 2V3QA 5TPAB 3RPWA 2AL5A 4FECA 5H8QA 4H6DA 4LA9A 1ZU0A 1P1OA 1B3HA 4F29A 2HZLA 3M3KA 3OENA 3Q25A 3K2DA 3LBSA 1IEJA 1FQCA 2ALUA 5ITOA 3VVFA 1B4ZA 1D9VA 3MZ9A 3KN8A 3EHTA 1OQGA 4DCYA 3V83A 2DVZA 2IA4A 2PVUA 3KOTA 3K00A 1GV8A 1SDXA 1FQFA 1T0KA 2UVGA 3T66A 1LAGE 5EYFA 3TDJA 5CMMA 1P99A 3T9UA 4F31B 4AQ4A 2QMXA 5TU0A 5CM6A 4G77A 4JSDA 1I6BA 1B0HA 1US4A 2HFBA 1DTGA 4H67A 3FJGA 3B7DA 1LFHA 2XHDA 2RF1A 4O3BA 2Z8FA 5HPQA 1Q35A 3EQ1A 1R1NA 3VFJA 1YCJA 3W9VA 3BFUA 1ZJLA 3QK6A 2DE3A 5CMBA 4DE8A 3CFLA 1A99A 2GH9A 1JW5A 1SI0A 5AA4A 3FVOA 3PD9A 4OVJA 3FIRA 3E9XA 2UXAA 3S9NC 3KG2A 4X9TA 4IGRA 1SW4A 5H8HA 1PB8A 1TFAA 3O29A 4R72A 2G93A 4YB6A 3H3GA 1XT8A 5I2NB 3LC8A 4WKMA 3VVEA 5DEXA 2I58A 5BUUA 3EHUA 4Q5TA 1A54A 1QW0A 3MP6A 4NMYA 3CSGA 4WXJA 4DDDA 3IB1A 1B0LA 2UVJA 5AA2A 2V3UA 5I2KA 1MXYA 3R7XA 1MQIA 2I48A 4TQUQ 4GXAA 4EXKA 3FVKA 3QXMA 3TZAA 3TQWA 3IAZA 5M2VA 4NF4A 3RT6B 1ELJA 5LOMA 2Z8DA 4GVOA 4LQ5A 4F39A 3QUJA 2HQ0A 1GVCA 3M3LA 2D3IA 4ZEBA 3DP6A 1TT1A 4X1BA 3VXBA 2F7CA 2XXRA 2QL3A 4FORA 1JVXA 4XKQA 3EPEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2V93A 3VXCA 4BDOA 4IO4A 4YB7A 2FYIA 4RA1A 5KCJB 4RK2A 3UK4A 5CC2A 3B6QA 3KOSA 4JBZA 4FATA 4Z7EA 3AXFA 4YKIA 1P1NA 1IXGA 2QS3A 4O8MA 1N84A 4F1UA 1NNFA 4NF8A 2PMSA 4PETA 4LN5A 2OX3A 2B65A 3T96B 4MCOA 3IOWA 4R75A 4GX4A 1XVXA 1MH4A 2RC8A 4IO6A 2Y7WA 4BLAA 5AA3A 5HM4B 4LZ5A 1Y4TA 1FBDA 3BBRA 1Y20A 1LCFA 1N04A 3A3CA 5H8NA 1NUZA 5T3JA 1JEUA 3MVXA 1XVYA 2P2AA 2DWHA 1MS7A 4PFUA 4ELQA 1QVSA 3MC2A 1FBHA 3U65A 2XXUA 5IZ3B 1US5A 5CMCA 3HCQA 4NF5A 4ZDMA 2YLNA 3FJMA 4ZE8A 4U23A 5K2YA 4RPOA 2ZMBA 4HTGA 3TFLA 4XF5A 5JTYA 4KHZE 1S50A 1S9TA 4M4GA 1FPKA 4NG7A 5EQ8A 1MDQA 1USYE 4ND9A 2GFEA 4OXVA 5I58A 4RY1A 4O7IA 2DE4A 4U1ZA 2F97A 1NV4A 5I3SA 4JVIA 2G29A 3T9VA 4MLVA 2XA5A 5JK4A 1BLFA 1OVTA 1UTHB 3N6TA 4AB6A 4KCCA 4OZ9A 5F7VA 4G61A 3TTLA 2HZKA 5H8FA 3TEPA 4R6YA 1JVYA 1NUWA 1QUKA 3SKPA 1LLSA 1QKBA 4JWXA 3C34A 4NF8B 3SDFA 1JEVA 3MPKA 1NV0A 3MVWA 2O6AA 1B52A 5I56A 2R71A 3VLUA 2PX1A 3ZSFA 1YAEA 2RINA 4DI3D 5I5PA 4G68B 3TELA 4NN3A 3SEVA 3IFAA 4OTEA 1QGXA 1VR5A 3EF7A 3MWBA 4KD5A 4QRZA 1POTA 4P0GA 1MM6A 4POXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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