2DE4A

Crystal structure of dszb c27s mutant in complex with biphenyl-2-sulfinic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
DTLTYSNSPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodococcus sp.
total genus 118
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de4A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de4A02
4I62A 4N13A 3FASA 4R6HA 1MDP1 2F7CA 3H3GA 3THIA 2QRYA 3MPKA 1NH7A 1A54A 4H6DA 3CFLA 3KGCA 3CG1A 4F3PA 1LBBA 4OXVA 4GD5A 2R71A 1JEUA 4ECFA 1JW5A 2OK2A 2M8CA 5H8FA 4JXIA 3TCGA 1JNFA 1Y4CA 3MC2A 1BLFA 1XHYA 4Z7EA 2F6PA 4HTGA 2R6GE 1M5EA 1VE4A 4AB5A 1N84A 4XKNA 4IO4A 1MH4A 2WKYA 1Y9UA 2F34A 4G4PA 1LAHE 4C1UA 4JSDA 2OWTA 3TODA 1YCJA 4EXKA 3S9MC 1USYE 3TTKA 4FEDA 3LC8A 1ZTYA 3S9NC 4DCYA 1Q35A 4IO2A 1SI1A 4IY6A 1MG1A 4F1YA 3G3JA 3SEUA 2ZYNA 3FVGA 1TXFA 2PT1A 3TAJA 1N3XA 2XXQA 1NFTA 2B3FA 2F7BA 4YB7A 1MXXA 3OO6A 3RPWA 2H99A 4POXA 4EF1A 1FQAA 4RA1A 4FAJA 2QSXA 3FXQA 3HN0A 2I4CA 2Z8DA 4OENA 3K1PA 1MY2A 3E3KA 2I49A 2D5WA 1B0HA 4QFKA 4NF8A 4F3GA 3K1NA 1B05A 1DPPA 3UGWA 3P7IA 5KCJB 3KEIA 4P0GA 4YZZA 3PPOA 4OWDA 5DEXA 4RYAA 1XOCA 3KZGA 4QFPA 4KCCA 3HHFA 4M4GA 4OFOA 3OO9A 1SW4A 2DP8A 4NMYA 1LB8A 3R26A 4NF4A 4GFRA 3S2VA 3H4ZA 2VHAA 3FZVA 2ONKE 4FORA 3IB2A 3QAXA 4R74A 3B6QA 4HS7A 2V3TA 5ITPA 5I2KB 3U93A 4L17A 3VDFA 3KOSA 4YKKA 1JW4A 4GXSB 1LLSA 2OZZA 4OQOA 4YB6A 4DCXA 4H5FA 1B5IA 3VVDA 2I58A 2ZNUA 5DT6A 3C31A 1NNTA 2OLBA 5IKBA 3GBAA 4DXBA 1II5A 2PX1A 3TTMA 3MWBA 1RYXA 5I56A 5JTYA 3N26A 1B1HA 2VD2A 4F19A 5KDTB 1MXVA 3T9HB 5J1DA 4IB2A 3K00A 1TFDA 2REJA 1B5JA 4H1XA 2NVUB 4OEUA 2HFBA 4IGTA 4WEDA 3H6VA 3AXFA 1YPNA 3IL1B 1TWYA 3SKPA 1HSLA 2PYYA 1LFIA 2ZYKA 4LATA 3TPAA 3MPLA 2Y7RA 4F2OA 3IK6B 1XVYA 1JETA 1J1NA 5EHMA 1A55A 1IIWA 3O6GA 3QSLA 1FQCA 4BDRA 1Y4TA 4XKPA 2NWJA 4DLDA 3FGSA 1AL3A 3RT6B 2Z8FA 3ZSFA 3T96B 3T9XB 3RGYA 2XXRA 4ISUA 3FJMA 5H8HB 2H98A 2QJEA 4ZEFA 2XXXA 3DLNA 4ND9A 1B3LA 3IB1A 3TUSA 2HEUA 3GBBA 3DP4A 5IAIA 4NF6B 1IEJA 2XHDA 4G68B 3SERA 1UTHB 4PFWA 1Y3NA 3KG2A 1ZIUA 3K6XA 3ODBA 4ZEKA 2B3BA 2V3QA 2VD3A 4LQ5A 5L9OA 4M1VA 3CRBA 4GLIA 1TT1A 1A40A 2O1MA 3FJ7A 3IOTA 1MRPA 1M5DA 3H6TA 4G8NA 1T0KA 3OEKA 2XXYA 1EZPA 4LQ2A 4WKMA 4U2RA 1UIVA 4H0WA 4EQ9A 2O7UA 2XXUA 2ZYOA 1MH3A 4X9TA 4YKPA 3DM0A 1URDA 3QXMA 3TEPA 3VV5A 1D9YA 5AA4B 3ILTB 4OFJA 4ZZAA 1R9LA 1F9BA 1D9VA 1H3DA 4BDLA 3ILUB 2HZLA 1SQYA 3EHSA 3OXNA 3E9XA 1MXWA 5HM4B 2QMXA 4R73A 3VXCA 1Y1MA 3OD7A 4KYEA 2UVGA 2P1SA 3SESA 1LCTA 1N0TA 3W9WA 1LAFE 4Q30B 4KYSA 2XD2A 3IOUA 3EHTA 4P0IA 4R6YA 3TCFA 1B3EA 4NEDA 1MPBA 3VVEA 1OMPA 1MY1A 1ATGA 1LAGE 4DZ1A 2XXTA 1IXIA 3HPIA 1ELJA 3U92A 4AQ4A 4OETA 5I57B 3TDJA 1SW1A 1PEBA 2V25A 3ONMA 3VVFA 3CSBA 1URSA 1B32A 4BDMA 2H5YA 2BJJX 3IOWA 3CFZA 2ONSA 2DXRA 3JZJA 5JK4A 2OWSA 4P11A 3MVZA 4U22A 2F6GA 3CG3A 1XVXA 3OENA 1MXYA 1NNKA 3K4UA 3VE1B 4WEPA 4KHZE 1JEVA 4YB5A 3OOAA 3QUJA 2DWJA 2FNCA 2X7PA 1URGA 3MP8A 1D3KA 2PVUA 1SW5A 3HHGA 5F7VA 3EF7A 1EH3A 3S4UA 4DXUA 5EYFA 1OQGA 4RPOA 4R9FA 2UYEA 1P1QA 4OHNA 4NF5B 2E1SA 1FTKA 1PBPA 3T66A 3GXAA 4YAHX 4N6PA 1B1XA 4H8IA 4KCDA 4JSOA 4ONYA 4BDNA 1SVXB 2UYFA 4E0WA 3MVXA 2H25A 4FECA 3G3KA 2VGQA 5CBSA 4MFIA 3CI8A 1MPDA 1FW0A 5H8NA 2RC8A 3SEXA 1B2HA 4U4XA 3N6UA 4XKRA 3O29A 5CMMA 1MY0A 5FHMA 4RXLA 3UP9A 5CBRA 3CVGA 1ZMGA 4GIZA 2Q9TA 1LFGA 1IXCA 1B7HA 5I58B 3BKIB 1ANFA 2F7AA 2ANJA 4R72A 4G77A 4IO3A 4F3BA 3O6IA 2I6EA 5B7DA 2RC9A 3B6WA 5DVJA 4OERA 2W7YA 1AH5A 2YPNA 1AMFA 2XXIA 2OBGA 2F36A 1M5FA 1DSNA 2Q89A 3KBRA 3F11A 2XXWA 4QSEA 2QPQA 3A3CA 1GGGA 4LONB 2DOJA 4U1OA 2REGA 3LSWA 5I59A 4G8HA 1MQJA 4YU0A 4IGRA 2I3VA 1B9JA 4ESWA 1I6BA 1I6QA 3O9PA 3BBRA 4F2QA 1ZJLA 3LR1A 4ZEIA 3PGFA 1OLAA 1LB9A 1M5CA 4PETA 4BLAA 4GF8A 3S9EA 3USDA 1NH8A 3RNNA 4IY5A 2NXOA 3VFJA 4QFOA 1UTBB 5H8QB 1NNPA 3MBPA 2QMWA 3HCQA 3D4CA 3IB0A 4RJZA 4O3AA 2QS3A 4YMBA 2IA4A 3H6WA 3MJNA 3MAMA 5TPAB 5DYHA 1IXGA 2DXYA 2XD3A 3PPNA 3ZS6A 1BTJA 2O1LA 1FTJA 1N04A 3O97A 2DSFA 3DELB 3IAZA 3PD8A 2OCUA 4Z0IA 3U94A 1D4NA 3UA8A 1P1OA 1WDNA 3K6UA 3G7WA 2ZMBA 3KOTA 4LUBA 2A5TB 2XX8A 4KI0E 1MY3A 1R9QA 1US5A 3VLVA 2F97A 3T22A 3U1OA 3N94A 1O63A 4EQ7A 3OMBA 2VP1A 5L8DA 1I69A 2D3IA 1O7TA 2KLFA 3L6HA 1YAEA 2HZKA 4R9GA 4XIGQ 1DOTA 1Y3PA 5TP9A 5K2XA 1MQHA 4XTCQ 1MY4A 4PQJA 3H6UA 3OEMA 5BUUA 2ESNA 3G3IA 5AA1A 1CB6A 2ALUA 4QSDA 1EU8A 5I2NA 1WVJA 3UORA 1SBPA 3MVYA 5I57A 4H8JA 4Q0CA 1SD3A 1OVTA 4X1BA 4OYVA 1TFAA 1ZKBA 4DXCA 2V84A 2P0SA 4ZEBA 3VLUA 2LAOA 3HV1A 1UQWA 5CC2A 1AOVA 1B51A 3HSTA 3RY3A 2Y84A 3PUXE 3QK6A 4G8MA 4R2BA 1LGBC 2O69A 4TLMB 4QFLA 3FV1A 4KR5A 1IITA 4LZ8A 4NE4A 2UVHA 1H76A 1PB9A 4FEBA 2E0SA 3C36A 4F22A 5A5XB 3IJOB 4KQPA 4NF8B 2GH9A 4ZECA 5M2VA 1MXZA 1XS5A 4R75A 3C32A 4QSCA 5DEXB 5HPQA 4RPNA 3KN3A 2Z8EA 4F18A 1QUKA 3MVWA 3DP6A 2QS2A 2OJTA 2AL4A 4NF4B 3M3LA 3I3VA 4IO5A 4LZ5A 3N5LA 3OO8A 1DMBA 2DE2A 1FCKA 3RLFE 4PP0A 1HSEA 1B4ZA 4RK2A 4OVJA 3PPPA 2F35A 4RNSA 2F78A 4EDPA 5ELVA 1N3WA 2UXAA 3K6VA 1Y20A 2HQ0A 5CM6A 4FJPA 3DP8A 3TFLA 4PFYA 2AIXA 2QL3A 3MP6A 3CFXA 4YMAA 1MS7A 5I56B 5JTYB 1SYHA 1B52A 2O68A 1B46A 2D21A 2ONRA 1KWHA 2H9BA 2ZXTA 1O64A 3T93B 3O6HA 4TLLB 4I9DA 1PB7A 3RUMA 4F31B 1YTVA 4GL8A 3TZAA 1XT8A 1CE2A 1B3FA 4X48A 5FTHA 2XXVA 1QVSA 2DWHA 3C33A 4RY1A 2YLNA 4WXJA 4O3CA 1ZBMA 2XX7A 3LBSA 1A8EA 3O2AA 1H43A 1SI0A 4DIGA 3FVOA 3TCHA 5K2YA 4HCWA 1DTZA 4X1DA 3KFMA 1IZ1A 4LVQA 3LSLA 3TKDA 3TQWA 2RINA 5EHSA 1VR5A 2VOZA 3Q27A 1IXHA 3W15C 5H8QA 1LAXA 5KCJA 1R6ZA 1PB8A 2YJPA 2XX9A 1GR2A 4HW8A 3K2DA 2PT2A 2QS1A 3H03A 1JQFA 4ELOA 1H44A 2RF1A 1QKBA 3KN8A 5L9SA 4OMBA 2DE4A 3FD3A 3TYHA 3RN8A 2DYXA 3PPQA 5AA3A 4G68C 3M3KA 1FTOA 4ELRA 1H45A 3TQLA 1RYOA 4GOTA 5I84A 3SEYA 4I1DA 2IEEA 4H65A 5HBCA 3OSQA 4ELPA 3JV9A 4GWOA 5I2KA 1WODA 2CMOA 3QYTA 2F8DA 4KPTA 2A5TA 3M8UA 2O84X 2RCAA 2I3WA 5ICTA 1OLCA 4OESA 1P99A 2F5XA 1OQHA 4ZS9A 4GQOA 1MQDA 1P1NA 2Y7WA 4MBPA 4UACA 3TTLA 1ZU0A 3IOVA 5DVFA 3FJGA 2DWAA 4F1UA 1FQEA 5KDTA 4YKJA 3K1MA 3TTRA 4AB6A 1A7LA 4OFLA 1B5HA 3FUZA 2HAVA 4OZ9A 2I4BA 3ZKKA 3E13X 2P2AA 5CI5A 1NL5A 1Y3QA 4H5GA 2X7QA 3VLWA 1NNFA 2GFEA 3FV2A 3M3FA 2Z23A 1PDAA 5L9MA 3MZBA 1JW1A 4LP2B 1NKXA 3SDFA 3B6TA 1N76A 4G2ZA 2R9JA 3RTWB 1EZOA 3UN6A 1R1NA 3GLBA 3PPRA 1JVYA 3TMGA 3E4RA 3I6VA 1B0LA 2NOOA 3IO4A 3PMXA 1N7XA 3LSFB 1B40A 4F39A 1FQDA 4XKQA 4GL0A 4MLQA 4POWA 5LOMA 1MM6A 4JB7A 5AA2B 3SEVA 3PV0E 1BIYA 1Z7NE 2HXWA 3CR9A 2GRVA 4I8CA 3K6WA 5H8HA 5JEIA 2HCAA 1B6HA 3V8XB 3LSXA 5F1QA 3I5OA 1A8FA 2Z22A 1XC1A 3G3GA 2NUVA 4NWCA 5CMBA 1OIBA 4NF6A 4JWOA 4G68A 2ABHA 2X26A 1UTHA 3KN7A 5FTIA 3H06B 5A5XA 2ZNSA 1P1UA 3OELA 2DVCA 4GRKA 4U23A 1B7UA 2THIA 3OSRA 1QJMA 2V93A 3A3UA 3SETA 2UVJA 5AE4A 1AIVA 1FQBA 5KZTA 5BWJA 4KYDA 1OVBA 1QULA 4DDDA 3T9UA 5AA4A 3C4MA 2I0BA 5CMCA 5CMKA 3FXRA 2XXHA 4OTEA 3U72A 5AA2D 2FYIA 5FHOA 5H8SA 5CRYA 5H8NB 5ICQA 4MH5A 4K3FA 4UA8A 1BKAA 2Q88A 1QKAA 4EXLA 2H4IA 4ZE8A 4QHQA 4JDFA 1Z7ME 2Y7KA 3MUQA 1FTMA 2DQVA 4H67A 2I0CA 4FATA 4MLVA 4QFNA 4XXUA 1Y1ZA 3UIFA 5H8FB 1ZLQA 1VSOA 3SEWA 1QUJA 2DVZA 3FXUA 2UVIA 3PU5A 4U1ZA 4E0XA 3Q25A 4Q5TA 4KFQA 2GHAA 4GXAA 3K02A 3G3HA 3V83A 2RC7A 4FIMA 3IO6A 2Y7PA 1MPCA 2DS9A 4F1VA 3Q29A 4PFUA 2B65A 3O66A 2I48A 1S7YA 5I59B 3MP1A 2O7IA 1M5BA 4RK9A 1DPEA 2V3UA 2Q8JA 3IR1A 4ZDMA 3MZ9A 2ZYMA 3FVKA 1USYH 1US4A 3FVNA 3PMVA 2ZNTA 4BDQA 4FE8A 3BFTA 3KSJA 1S9TA 1LBCA 5DTBA 4ZE9A 3TELA 3KJ7A 3R6UA 3T9VA 3EPEA 3FATA 3Q28A 4BDOA 4NWDA 3OO7A 1VFDA 2HAUA 4ESXA 3PMWA 3A09A 4OEVA 1B3HA 1N7WA 5ITOA 4NF5A 1EZ9A 1VFEA 1I6AA 4N07A 3S9LC 4ZZEA 4KD5A 1MM7A 4MF3A 1LSTA 3O28A 3ZKLA 4F29A 4U21A 3HO7A 2G29A 4JWXA 4R2FA 4EQBA 4PFTA 3ECRA 5B70A 5ISUA 1QUIA 4IO6A 3VXBA 1SYIA 1B7ZA 1P1WA 2QS4A 2PBWA 5TU0A 4F3SA 4C0RA 3IJXB 3U8QA 1A99A 1B4HA 2XXPA 3KJTA 4EF2A 4IO7A 5I58A 3BFUA 3JYRA 2G93A 2O6AA 3QUFA 1UIUA 1GV8A 3TTNA 1QW0A 1PBQA 3LUYA 4DE8A 1MXUA 3N6TA 3V5AA 1S50A 4JBZA 1POTA 3G3FA 4THIA 5TP9B 4GVOA 4LA9A 1MDQA 4YICA 1L5TA 3RTFB 1GTKA 2O51A 1B3GA 5I2NB 2AYSA 4PE5B 3CSGA 3GZGA 3MZ1A 3RQTA 3V89B 3RT8A 1DTGA 5FHNA 3B7DA 1RKMA 1IUDA 4HCYA 2Q2AA 1SW2A 3KSXA 4U4SA 1MQIA 5AA2A 2GHBA 3L6GA 3EQ1A 3IX1A 4JWYA 2Y7IA 1LCFA 2A5SA 1HSJA 4QF9A 4TOZA 1SDXA 4LZ7A 4NTLA 2RKMA 2FA7A 1UTBA 3QIMA 3UK4A 1FQFA 3H7MA 4R6KA 3WAFA 1MQGA 3C34A 4O3BA 2AL5A 3FIRA 3IORA 4QRZA 2PMSA 3K01A 3Q26A 3PUVE 5DVIA 1B58A 2Q2CA 5TPAA 1BP5A 3MQ9A 4YKIA 1GVCA 1FTLA 1PC3A 4EUOA 2DWIA 2CZLA 1JVXA 2RCBA 3EN3A 3CIJA 3W9VA 3D4GA 1Q1KA 3WAEA 1POY1 1LFHA 4TQUQ 3C9HA 3PUZE 3C35A 1NMUA 3K0VA 4ELQA 3PUWE 3PD9A 4ZEDA 3MW0A 3EHUA 3R7XA 2DE3A 4Q8RA 4C1TA 1IQ7A 3PUYE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I62A 4N13A 3FASA 4R6HA 1MDP1 2F7CA 3H3GA 3THIA 2QRYA 3MPKA 4NG7A 1NH7A 4OVPA 1A54A 3U65A 4H6DA 3CFLA 3KGCA 3CG1A 4F3PA 1LBBA 4OXVA 4GD5A 2R71A 1JEUA 4ECFA 3CHGA 1JW5A 4GWWA 2OK2A 2M8CA 2PFYA 5H8FA 4JXIA 3TCGA 1JNFA 1EYIA 1Y4CA 3MC2A 1BLFA 1XHYA 4Z7EA 2F6PA 4HTGA 2R6GE 1M5EA 1VE4A 4AB5A 1N84A 4XKNA 4IO4A 1MH4A 2WKYA 1Y9UA 2F34A 4JVDA 4GWSA 4G4PA 1LAHE 1NUXA 4JSDA 4C1UA 2OWTA 1IMCA 3TODA 1YCJA 4EXKA 3S9MC 1USYE 3TTKA 4FEDA 4PFRA 3LC8A 1ZTYA 3S9NC 4DCYA 1Q35A 4IO2A 1SI1A 4IY6A 1MG1A 4F1YA 4GWUA 3G3JA 3SEUA 2CZHA 4GWYA 2ZYNA 3FVGA 1TXFA 2PT1A 3TAJA 1N3XA 2XXQA 1NFTA 2B3FA 2F7BA 4YB7A 4NGUA 1MXXA 3OO6A 3RPWA 2H99A 4POXA 4EF1A 1FQAA 4RA1A 4FAJA 2QSXA 3FXQA 3HN0A 1FBEA 2I4CA 2Z8DA 4OENA 3K1PA 1MY2A 3E3KA 2I49A 2D5WA 1B0HA 4QFKA 4NF8A 4F3GA 4O94A 3K1NA 1B05A 1DPPA 5T3JA 3B50A 3UGWA 3P7IA 5KCJB 3KEIA 4GWZA 4UABA 4P0GA 4YZZA 3PPOA 4OWDA 5DEXA 4RYAA 1XOCA 3KZGA 4QFPA 4KCCA 3HHFA 4M4GA 4OFOA 3OO9A 1SW4A 4X8RA 2DP8A 4NMYA 4MEVA 1LB8A 3R26A 4NF4A 4GFRA 3S2VA 3H4ZA 2VHAA 4PTKA 3FZVA 2ONKE 4FORA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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