2DE4A

Crystal structure of dszb c27s mutant in complex with biphenyl-2-sulfinic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
DTLTYSNSPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodococcus sp.
molecule tags Hydrolase
total genus 118
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de4A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de4A02
1P1QA 3FZVA 3U93A 5BUUA 4KCCA 3S2VA 4EXLA 1N0TA 3KBRA 3FIRA 3P7IA 4H1XA 4DZ1A 1VFDA 4THIA 5I2NA 1B58A 1SI0A 2P0SA 2X7QA 2DQVA 3TDJA 5ICTA 4OMBA 2UVGA 1R9LA 4OVJA 4KR5A 3Q26A 2VOZA 1LAXA 3TKDA 2ABHA 4F3SA 3ONMA 4F29A 3ZKLA 1MG1A 4ZEIA 4GWOA 1TWYA 3MPLA 5KDTA 3MWBA 4H0WA 3KJ7A 1OVTA 3M3LA 2ZNTA 3MZ9A 4JSOA 4U4SA 3TTKA 1P1NA 1NL5A 5FHMA 3QUJA 4ECFA 4YB5A 2Q2AA 1GGGA 3IOVA 2DS9A 5BWJA 1B3LA 3PUVE 4BDOA 1FQBA 3U72A 4RNSA 1MPDA 1TXFA 2I58A 2RCAA 4LQ5A 3IL1B 1TFAA 1XVYA 3R6UA 3O6IA 4NF6A 5FTIA 4JSDA 5I58B 3BFTA 2G29A 1VFEA 3EHSA 4ZE9A 3VXCA 2PX1A 4ELPA 2NWJA 2Q88A 3MAMA 3TFLA 5K2YA 2UVJA 3N6TA 1M5CA 5AA4B 2VGQA 1N3WA 2IA4A 3H4ZA 1LB9A 4R6HA 3VLUA 1QVSA 4IO3A 3SEXA 1PB9A 4X1BA 1B3EA 2F36A 4E0WA 5AA2B 4O3BA 5I2KA 4GLIA 5AE4A 2XHDA 3B6TA 4YKPA 1RYOA 4FIMA 1N7WA 2ONSA 4MF3A 3USDA 4F3PA 5F1QA 2O51A 1N7XA 2QRYA 1EZPA 5HM4B 3KJTA 3HV1A 4XKRA 2PYYA 1FTMA 1O7TA 4MLVA 3TMGA 1US4A 3KN8A 2Z8DA 4YU0A 4F2OA 3HPIA 4E0XA 1XS5A 1R9QA 3I3VA 4ZEFA 2HZLA 1LB8A 2F97A 3VFJA 5DYHA 1Y3PA 3IAZA 3T66A 1B2HA 3CFXA 3QUFA 4F3GA 3KOSA 1MRPA 1Q1KA 1AH5A 5EHSA 4WEDA 1OMPA 3MC2A 4AB5A 4LONB 5AA3A 4X48A 1OLAA 4OFJA 4NF4A 1NFTA 5JTYA 5L9SA 3JV9A 3KFMA 1LCTA 1M5EA 3T9XB 4JWXA 2GH9A 4IO4A 1XHYA 3UIFA 1Y4CA 4P0IA 1N3XA 1MQGA 4DXCA 2NVUB 3EHTA 4ND9A 4NF5A 1ZTYA 4HW8A 4F22A 2Q8JA 4GQOA 2V25A 5H8SA 3OMBA 1Z7NE 2DWJA 4G2ZA 3LSLA 4EF1A 4R9GA 4DXBA 2B3BA 2ZYOA 4H6DA 5CM6A 4G77A 2ESNA 3U94A 1NH8A 5CMKA 3FVNA 2O7IA 1FQFA 3WAFA 3C9HA 3T9VA 3IB1A 1I6QA 1QKBA 3H6TA 5I56A 3N26A 3OEMA 5H8HB 1LLSA 4ESXA 1OQGA 2E1SA 2AL4A 3CG1A 2PMSA 4Z0IA 1WVJA 2OJTA 2V93A 1S9TA 2H9BA 1MXZA 1DMBA 5CMCA 1ELJA 1Q35A 5DEXA 5KZTA 5DVIA 4IY5A 4WXJA 3MQ9A 2XXTA 3K02A 4OENA 5ISUA 4IGRA 3G7WA 2NUVA 3L6GA 1BP5A 4R73A 1MXUA 1PB7A 1PC3A 3QSLA 1SW4A 1Y1MA 1WODA 3E3KA 2VP1A 2ONKE 4QHQA 1Y9UA 4M1VA 1JNFA 2I4BA 3QK6A 1US5A 1IIWA 1FQCA 4NF8B 4O3AA 4FE8A 4P0GA 1EH3A 2F6GA 3EN3A 4X9TA 4QSEA 1UTBB 1IXGA 4GF8A 5CBSA 2ZYNA 3FVGA 3C32A 3W9VA 1IQ7A 3Q29A 5I2NB 3IX1A 3PPRA 3OXNA 2H99A 3U92A 4PP0A 2I6EA 1LCFA 1MPCA 2HFBA 1JW5A 4EQ7A 3W15C 4OESA 3THIA 4F19A 1SBPA 2I0CA 2XX9A 1USYH 1AOVA 3FATA 2E0SA 2F8DA 3V8XB 4OZ9A 1LAGE 1BTJA 1DTZA 2XXWA 3Q27A 5H8FA 3MP1A 4YMBA 2VD2A 4H5FA 3F11A 3EPEA 3O2AA 3E13X 2OZZA 2XXVA 1Z7ME 3UN6A 3OENA 3CVGA 3K4UA 1AMFA 3MVWA 3K0VA 1YAEA 3IB2A 1MQHA 1SD3A 1ATGA 3DELB 4ISUA 4JWOA 4ZZAA 1FQDA 2QMXA 4NF6B 3K6XA 4IO6A 1L5TA 4QFNA 4HS7A 3TCHA 4GOTA 2HEUA 2D21A 3H6VA 5B70A 3H6WA 3LBSA 3IJOB 4F1VA 1MS7A 1SYIA 3D4CA 3TELA 1FTJA 1B0LA 1IXCA 1YPNA 1QUIA 3GXAA 3UA8A 2FYIA 2DXYA 2O68A 2GHBA 5JEIA 1B0HA 2REGA 3PUWE 4JWYA 1AL3A 1LAHE 3CIJA 2VHAA 2AIXA 3TPAA 4BDMA 1PDAA 2YLNA 3O97A 3OO7A 4FEBA 2ZNSA 2DWHA 4NMYA 4EXKA 1B7ZA 5I2KB 3GZGA 4POXA 1MM7A 1AIVA 4R74A 3CR9A 4GFRA 3D4GA 4TLLB 1YTVA 3PUZE 3C36A 1H43A 1R1NA 1OQHA 2YPNA 4R72A 4NWDA 1JVYA 2B65A 3MBPA 4FEDA 4Q8RA 1P1UA 3N94A 4LVQA 4YKKA 1D9VA 1MY4A 4UA8A 4NE4A 2XXQA 5TPAA 4KYEA 3EF7A 1B05A 2H25A 5FTHA 3KG2A 4YZZA 3K2DA 5ELVA 3TQLA 1MXXA 4C0RA 2RC7A 5HPQA 2UYEA 4RJZA 2D5WA 3H3GA 4IGTA 4H8IA 1LFGA 3DP4A 2OBGA 4ZE8A 3H7MA 2UVIA 4NF4B 4PFYA 5DVJA 3VDFA 4QF9A 4LP2B 5DVFA 1QW0A 2A5TA 4BDQA 3VLWA 4POWA 4NWCA 2QPQA 3VVDA 3CSGA 2XXRA 1JEUA 3TUSA 2UXAA 2VD3A 1B4HA 1JQFA 5CC2A 1MH4A 4U4XA 1B5JA 4NF5B 4LZ7A 2DWIA 1SW5A 3K6VA 4U22A 1VE4A 1POY1 3SEWA 4PFWA 1IITA 4IO2A 3BFUA 4NEDA 3DP8A 3QYTA 3T9UA 5J1DA 2BJJX 1B1HA 1MY3A 1DSNA 1H3DA 2P1SA 4DXUA 4QFKA 4R2FA 2UYFA 3HSTA 3IJXB 4Q5TA 5H8QA 1MY2A 4Q30B 2Y84A 3T9HB 3UGWA 4GIZA 3PPPA 2DXRA 2UVHA 5H8NB 3HHFA 1NNKA 1S50A 3E4RA 4U23A 4OETA 3VLVA 5I56B 3G3JA 3RTWB 3EHUA 3OO6A 4ZEKA 4QFOA 1I69A 3UP9A 4OWDA 3HHGA 2PBWA 2D3IA 2V84A 2M8CA 4G68A 1GR2A 4RK2A 5DEXB 2XXYA 2DYXA 5I84A 2DWAA 4FATA 1MQIA 4OFLA 3LSFB 2DE4A 4OEVA 1BLFA 3MP8A 1O64A 3KGCA 2IEEA 3S4UA 1PEBA 1UQWA 3PMWA 4H67A 3FXQA 2PT2A 4RXLA 3SEUA 2Y7RA 3RUMA 2KLFA 4RA1A 2Z22A 1FW0A 1SDXA 4N6PA 3JZJA 3A09A 4GD5A 1MQDA 1HSLA 2ZNUA 3RY3A 5KCJA 3RNNA 5LOMA 3EQ1A 2XD2A 3MZBA 3M3KA 3IOUA 4PE5B 4LQ2A 3FVKA 2H98A 1A8EA 4JXIA 1UTHA 3KEIA 1WDNA 1B3FA 4GL0A 3KSXA 2XX8A 2AL5A 1TFDA 1Y1ZA 3PPOA 2X7PA 2ALUA 2ONRA 1MXYA 5I59A 5DTBA 3G3KA 4EQ9A 4R9FA 3C33A 1JETA 4QFPA 4YMAA 3GBBA 4KI0E 5AA2D 5H8FB 5CMBA 5CBRA 3TCGA 1DOTA 1MQJA 2QS4A 3CFZA 5AA2A 1B5HA 2F78A 2OWSA 4ZZEA 3TTMA 4N13A 2HXWA 3CI8A 3O6HA 4ZECA 1MY1A 3SKPA 4QSCA 1A7LA 2V3UA 2Q89A 4M4GA 3K01A 2FNCA 3RTFB 3MJNA 4OHNA 4KCDA 3RN8A 4DLDA 1B9JA 5IKBA 4FORA 3LSWA 3OD7A 1LSTA 2PVUA 3B6QA 4LA9A 1TT1A 1P1WA 3A3UA 4GRKA 2R71A 3JYRA 3FXUA 3ECRA 3OO8A 1VR5A 4U1ZA 3PMXA 2I49A 3G3IA 5JK4A 3TEPA 4OERA 4R6KA 4F2QA 2H5YA 1POTA 1LFIA 3SESA 1NNFA 3T22A 4TQUQ 5EHMA 1EZOA 5DT6A 3V83A 1SYHA 2QSXA 1B4ZA 4PFUA 4LATA 3H6UA 1LBBA 5TU0A 1YCJA 5ITOA 1II5A 4OEUA 5EYFA 2XXIA 2Y7PA 1A99A 4HCYA 2I3VA 2GHAA 1MH3A 3RQTA 1URSA 4I62A 2H4IA 4O3CA 5KDTB 1Y3NA 4XKNA 1ZBMA 4XXUA 3OSRA 2W7YA 2F7AA 3OSQA 3KN7A 1R6ZA 3N5LA 3ODBA 2QMWA 2HZKA 1B46A 3ZS6A 1H45A 3L6HA 3CSBA 4H5GA 4DCYA 1F9BA 1IEJA 2NXOA 3MZ1A 1RYXA 1P1OA 4AB6A 2O1LA 4XKPA 3PU5A 3HN0A 2REJA 3GLBA 1MDP1 1ZJLA 3C34A 4HTGA 4I1DA 3CRBA 4IO5A 4U21A 3HCQA 4RPOA 3CFLA 2O6AA 3C4MA 4RY1A 1B5IA 3SETA 3IB0A 3VV5A 1MXWA 2NOOA 1JW4A 1QUKA 4KFQA 1ZLQA 3VE1B 4MBPA 2F7BA 5I57A 4YICA 1B32A 3PV0E 3C35A 3CG3A 2ZMBA 3H06B 2Y7KA 3OOAA 1JEVA 2Y7WA 3O28A 3MP6A 4Q0CA 3QXMA 2GFEA 4KYDA 3S9EA 4EF2A 1N04A 2XXXA 3SEYA 5AA1A 3IR1A 5H8QB 3WAEA 4ELOA 4KPTA 1LAFE 4FECA 1HSEA 2F34A 4KQPA 4AQ4A 3M8UA 3UK4A 4ZS9A 1FQAA 4TLMB 3FJGA 3BBRA 3QAXA 1B6HA 4TOZA 2OCUA 4R2BA 1H76A 2Q2CA 4JBZA 5ICQA 4I8CA 1CE2A 4IO7A 3O6GA 1J1NA 4G68B 4ZEBA 2X26A 2R9JA 2QJEA 5L8DA 3S9MC 4L17A 1EU8A 3B7DA 4F1UA 4MLQA 4RPNA 2Q9TA 4C1TA 1XVXA 2F35A 4K3FA 2OWTA 1ANFA 3ILUB 3TQWA 1JW1A 3RT6B 3U1OA 5A5XA 4PETA 5TP9A 2CMOA 4IY6A 4ELQA 1PBPA 2F7CA 1M5DA 2QL3A 3A3CA 4BDLA 2OLBA 1PBQA 1GTKA 3I5OA 2ZXTA 1PB8A 3LC8A 1O63A 3T93B 5JTYB 1DTGA 3MPKA 3PMVA 1N84A 4F31B 2I48A 1CB6A 1D3KA 2RF1A 3TYHA 2Z8EA 4BLAA 4WEPA 5KCJB 4G8HA 1XOCA 3LUYA 3MVZA 3IOTA 1Y20A 1OLCA 5F7VA 4PQJA 4KD5A 1UTHB 2GRVA 3FV1A 1NNPA 4Z7EA 5M2VA 4WKMA 4JDFA 3S9NC 4G4PA 3K00A 3FD3A 4KHZE 3LR1A 1QULA 1IZ1A 1NKXA 1B3HA 2XXHA 4F39A 1IUDA 2O84X 5I59B 2XXPA 3DM0A 3VXBA 3IO4A 3W9WA 5IAIA 1MY0A 3PD8A 3K1NA 1HSJA 4ZDMA 1QUJA 2THIA 1GVCA 1MXVA 1QJMA 4G8MA 4OTEA 2O69A 4F1YA 4FJPA 4DCXA 2I4CA 1Y3QA 3MUQA 1D9YA 1N76A 3MVXA 4JB7A 4OFOA 4I9DA 3DP6A 2WKYA 1BKAA 4FAJA 4BDNA 1ZU0A 2G93A 2DP8A 1URGA 5L9OA 4ELRA 4YAHX 1SW2A 4DE8A 4F3BA 3PPNA 4H65A 3ZKKA 4KYSA 2QS3A 1IXIA 3V5AA 1MDQA 4R75A 4QSDA 3M3FA 4UACA 4GXAA 4YKJA 1ZKBA 4F18A 4MFIA 4OXVA 3SEVA 4OQOA 2Z23A 5CMMA 1DPEA 4LZ8A 1LFHA 3B6WA 4X1DA 2Y7IA 3K6WA 4GXSB 3UORA 1B7UA 2PT1A 2QS2A 5K2XA 3E9XA 1MM6A 3SDFA 1B40A 4EDPA 1B3GA 3ZSFA 1USYE 3TCFA 5CRYA 1Y4TA 1T0KA 3T96B 3LSXA 3FXRA 3KSJA 2Z8FA 1NMUA 3TZAA 3FJMA 4H8JA 5I58A 2B3FA 3Q25A 1KWHA 3O66A 1OVBA 3TTNA 3RPWA 1A8FA 4R6YA 3AXFA 3K1PA 2DE3A 5B7DA 1FCKA 2DOJA 2F5XA 3FASA 3Q28A 2AYSA 1BIYA 3C31A 3H03A 4U1OA 2DVZA 1LGBC 5AA4A 2RKMA 2I0BA 3BKIB 1XC1A 3PPQA 2F6PA 3IO6A 4N07A 2ANJA 2P2AA 5FHNA 2O1MA 1VSOA 2RINA 2LAOA 4OYVA 5H8NA 3R26A 4EQBA 4ONYA 4ESWA 2XD3A 1A40A 3IOWA 4YKIA 4U2RA 2FA7A 3U8QA 4RYAA 3RLFE 5FHOA 3I6VA 5HBCA 3PGFA 3MW0A 1UIUA 4DIGA 3K6UA 2V3QA 1B1XA 1DPPA 2DE2A 1A55A 2HQ0A 3R7XA 5I57B 3VVEA 3FVOA 1P99A 2CZLA 3OEKA 4BDRA 3OELA 2HCAA 4HCWA 4PFTA 2I3WA 4GL8A 1UIVA 1URDA 4P11A 1B51A 1B52A 4XTCQ 2RC9A 1M5FA 3GBAA 2YJPA 1I6BA 4YB7A 2ZYKA 1MPBA 3MVYA 2XXUA 3TTLA 4GVOA 3PD9A 3ILTB 1LBCA 1SW1A 2V3TA 4NTLA 3PUXE 1H44A 3IK6B 1D4NA 2HAVA 4G68C 3RGYA 5TPAB 3N6UA 1EZ9A 1B7HA 4QRZA 3KOTA 2RCBA 2QS1A 5A5XB 3FGSA 2XX7A 5TP9B 1SVXB 4ZEDA 4IB2A 1I6AA 1SQYA 1GV8A 4C1UA 2DVCA 1A54A 1FQEA 1NH7A 5CI5A 3FUZA 4LZ5A 3K1MA 2OK2A 3SERA 4XKQA 3G3FA 1QKAA 2A5SA 2A5TB 5H8HA 4DDDA 4XIGQ 1S7YA 5ITPA 4QFLA 1XT8A 3VVFA 1ZIUA 1OIBA 3O9PA 2HAUA 4LUBA 2ZYMA 1M5BA 3OO9A 2DSFA 1FTKA 4G8NA 4EUOA 3QIMA 2R6GE 3V89B 2RC8A 3DLNA 2O7UA 1NNTA 1SI1A 3O29A 5L9MA 3PUYE 3TODA 3KZGA 3IORA 1RKMA 3RT8A 1ZMGA 1FTLA 3HO7A 3G3GA 3S9LC 3TAJA 3G3HA 4MH5A 4YB6A 4NF8A 3KN3A 1FTOA 3FV2A 1IXHA 1JVXA 4RK9A 3FJ7A 1UTBA 3TTRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P1QA 3FZVA 3U93A 4UABA 5BUUA 4KCCA 3S2VA 4EXLA 1N0TA 3KBRA 3FIRA 3P7IA 4H1XA 4DZ1A 1VFDA 4THIA 5I2NA 1B58A 1SI0A 2P0SA 2X7QA 5EQ9A 2DQVA 3TDJA 5ICTA 4OMBA 4AS5A 2UVGA 1R9LA 4OVJA 4KR5A 3Q26A 2QVUA 2VOZA 1LAXA 5EYHA 1FPIA 3TKDA 2ABHA 4F3SA 3ONMA 4F29A 5I3SA 3ZKLA 1MG1A 2CZIA 4ZEIA 4GWOA 1TWYA 2DDKA 3MPLA 5KDTA 3MWBA 4H0WA 3KJ7A 1OVTA 3M3LA 2ZNTA 3GYYA 3MZ9A 4X8RA 4JSOA 4U4SA 3TTKA 1P1NA 1NL5A 5FHMA 3QUJA 4ECFA 4YB5A 2Q2AA 1GGGA 3IOVA 2DS9A 5BWJA 1B3LA 3PUVE 4BDOA 1FQBA 3U72A 1DCUA 4RNSA 1MPDA 1TXFA 2I58A 2RCAA 4LQ5A 3IL1B 1TFAA 1XVYA 3R6UA 3O6IA 4NF6A 5FTIA 4JSDA 5I58B 3BFTA 2G29A 1VFEA 3U65A 3EHSA 1FJ6A 5EQAA 4ZE9A 1KZ8A 3VXCA 2PX1A 4ELPA 2NWJA 2Q88A 4GWWA 3MAMA 3TFLA 5K2YA 1NV0A 2UVJA 1NV3A 3N6TA 1M5CA 2Q74A 5FBPA 5AA4B 2VGQA 1N3WA 2IA4A 3H4ZA 1LB9A 1KA1A 4R6HA 3VLUA 1QVSA 4IO3A 3SEXA 1PB9A 4X1BA 2CEYA 1B3EA 2F36A 4E0WA 5AA2B 4O3BA 5I2KA 4GLIA 5AE4A 2BJIA 2XHDA 3B6TA 4YKPA 1RYOA 5IZZA 4FIMA 1N7WA 2ONSA 4MF3A 3USDA 4F3PA 4NAPA 5F1QA 2O51A 1N7XA 2FIEA 2QRYA 1EZPA 5HM4B 3KJTA 3HV1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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