2DE4A

Crystal structure of dszb c27s mutant in complex with biphenyl-2-sulfinic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
DTLTYSNSPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodococcus sp.
molecule tags Hydrolase
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
total genus 118
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de4A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de4A02
3O6GA 2Y7WA 2E1SA 4GVOA 3B7DA 4X9TA 4ZEDA 2HQ0A 2Q89A 4ESWA 4KI0E 3T9XB 1IXGA 1CB6A 1MG1A 2Q2CA 2QS2A 4KYDA 4H67A 4WEPA 4YKJA 3TODA 1IITA 4ISUA 4NTLA 2DYXA 4KPTA 3IL1B 1Y3PA 3K6WA 3U94A 1SW1A 1NH7A 1NMUA 4PFWA 1BIYA 4EQBA 1QJMA 1B5HA 4L17A 4ZS9A 1N0TA 3MZ1A 4HW8A 3TUSA 4XTCQ 2I49A 3R7XA 3T93B 4LZ5A 3P7IA 1A40A 4LUBA 3LUYA 3B6QA 1VSOA 4OFLA 4RNSA 2GHAA 1IXCA 1OIBA 2HAUA 3OENA 1B58A 3PMVA 1JETA 1B3GA 5A5XA 3VLVA 5H8SA 1HSEA 3DP6A 3D4GA 3TQLA 2OJTA 4FJPA 4H0WA 4GOTA 4BDRA 2ZNUA 2Y7RA 2G93A 5F7VA 3TTMA 3HHFA 1QULA 3C9HA 3CVGA 3VXBA 2Y84A 3PUZE 2AYSA 1R1NA 3D4CA 1NNFA 1UTBA 1TXFA 1IEJA 3OMBA 4FECA 4KD5A 1LCTA 4MLQA 1UTBB 1JEUA 2H4IA 1JNFA 1OLAA 2XD2A 4FE8A 2P2AA 3H7MA 1Y20A 1ZMGA 2F7CA 3K2DA 1Q1KA 2HZKA 1QUJA 2OBGA 3C34A 3QIMA 1HSLA 4IO5A 2IA4A 4OYVA 4U4SA 3T66A 1SW2A 1SVXB 3FVNA 1M5DA 2D3IA 3QAXA 4JSOA 1AL3A 5TU0A 1OMPA 2DP8A 2V93A 3MZ9A 4KCCA 5AA2A 2I3WA 2R6GE 1B46A 2V3TA 4HTGA 5AA4B 3LSFB 1A54A 2ZNSA 4IO2A 1NL5A 5JTYB 3OELA 4ZECA 3MPLA 5AA1A 2XXWA 3SEWA 2ZYNA 1RYXA 3H4ZA 1P1QA 1TFDA 2VHAA 4NF5A 3TZAA 4PFTA 4F39A 4R6YA 3WAEA 5I2KA 3KOSA 3SEYA 4GFRA 3UGWA 1IQ7A 3H6WA 2RC8A 1MXWA 4FIMA 3V5AA 4PE5B 2D21A 1H45A 1H76A 2XD3A 3CI8A 3VVFA 1PC3A 3N6UA 3PPRA 1B32A 1URGA 2IEEA 2PT2A 5I59A 3K1PA 1S7YA 1YTVA 3TEPA 1LB8A 3Q29A 4O3BA 5FTIA 3SEXA 1FTOA 1Y1ZA 3RT6B 4DDDA 2GHBA 4G4PA 2ZYKA 2QS1A 3FD3A 5CBSA 4MFIA 2XX7A 4WXJA 4GF8A 5EYFA 1B2HA 1US4A 2XXTA 3THIA 5M2VA 4E0XA 3RGYA 1QVSA 4JXIA 1IZ1A 1JW5A 4BDNA 1UIUA 1UTHA 2O68A 4GQOA 1N76A 4H6DA 5DTBA 5KZTA 2Z22A 4OVJA 4F1UA 5CBRA 3DM0A 4KYSA 4EXKA 1P1OA 2NOOA 3E4RA 4JB7A 4QSEA 4C1TA 4OESA 3IOTA 3I3VA 4DE8A 5I59B 2ZYMA 3CFZA 2V3UA 3MVXA 4NEDA 3UK4A 2GRVA 4QFOA 2I3VA 3H6UA 3PUXE 4U22A 4AB6A 4Q8RA 1PDAA 1SDXA 2OZZA 1FCKA 2XX8A 2RF1A 1BTJA 1PB8A 2OCUA 2RC7A 3GLBA 1XHYA 1MY1A 4ND9A 4XKRA 3UORA 1AOVA 1TFAA 4PFUA 3KGCA 1B52A 1R6ZA 1LCFA 4LVQA 4JSDA 4F19A 5ITPA 2VP1A 1ZTYA 4KFQA 4XKNA 4NF5B 1A99A 1UIVA 1DTGA 2I6EA 3L6GA 1ELJA 4P0IA 1MXZA 3PUVE 2O7UA 3RTWB 4U1OA 4KCDA 5DVFA 4QFLA 5L9OA 3S9EA 1LFIA 4BDMA 5KDTA 1B3EA 5I2NA 1FTLA 5AA2B 4QFKA 1MQHA 4QHQA 3Q26A 5J1DA 1EZOA 4OXVA 2XXYA 4GLIA 3SERA 4PP0A 2UYEA 4ZEBA 4RA1A 2I48A 1FTKA 4DXCA 4IO6A 3IOUA 1SQYA 3E3KA 2QS4A 1LAXA 1MDQA 1F9BA 2XXXA 3EN3A 3IJXB 2AIXA 3G3GA 3IORA 4R9FA 3TAJA 3U1OA 1D4NA 5JK4A 5L8DA 5H8QB 2HCAA 1UTHB 3ZSFA 3PMWA 5FHMA 4RXLA 4R75A 3OD7A 5L9SA 3KJ7A 4IGRA 4EUOA 1PBPA 1PBQA 4OERA 3FJMA 2F35A 1MM7A 1ZKBA 2RC9A 4POXA 5I58A 1SYHA 3I6VA 3G3IA 2Y7IA 3C35A 3ECRA 4X1BA 3IB0A 2O51A 1B4ZA 2UVJA 3G3JA 4IO4A 2H9BA 4JDFA 1Y3NA 1R9QA 2F7AA 1B3FA 1DPPA 3H3GA 1NKXA 3M3KA 3FATA 3EF7A 1GVCA 3O29A 3TTRA 3ZKKA 3ILUB 3MC2A 3JYRA 3A3CA 4RPOA 4F3BA 5I58B 5H8NA 3PD8A 2P0SA 2I0CA 2F8DA 1Y4CA 3KOTA 4KYEA 4X48A 5H8NB 4U1ZA 3MWBA 4FEBA 2PX1A 5I84A 1B7UA 1B1HA 1LFGA 3SEUA 4MH5A 4AB5A 2RKMA 1LB9A 3KBRA 3GXAA 1MPCA 4F2QA 5HM4B 3PD9A 2HXWA 2QPQA 3VE1B 1NNPA 3IO6A 3LSLA 5AA3A 5JEIA 4F3SA 3IX1A 4F2OA 2ZYOA 3PPOA 4YB6A 3FV1A 2QJEA 3OO8A 1JEVA 4DXUA 4F3PA 2QL3A 1VFDA 1MPBA 1IXHA 1YPNA 2AL4A 2NUVA 3C36A 3FXUA 1PB9A 3QUJA 4OEUA 5DVIA 3ODBA 4ZEKA 3RN8A 5B70A 5TP9A 4PFYA 1MXXA 2QSXA 3MPKA 4RK9A 3UP9A 1FQAA 3PGFA 1BKAA 3T96B 4EQ9A 2DOJA 4G8NA 3FJGA 2I4CA 2F34A 1SI0A 1DTZA 3N26A 1I69A 4H8JA 3H06B 4G68C 4QSCA 4QFPA 3FXQA 4RJZA 1D9VA 4X1DA 4N07A 1US5A 3IB1A 5EHSA 3RT8A 4ESXA 3ZKLA 3DELB 4IY5A 3IJOB 3FJ7A 3PPQA 1B5JA 4I8CA 5CMMA 4H1XA 5I57A 4YMBA 3MJNA 3V8XB 4M4GA 2PYYA 4G2ZA 4P11A 1USYH 1B1XA 3A3UA 2THIA 3MQ9A 4POWA 3U72A 1FQEA 4PQJA 5KCJA 3BKIB 3FVKA 3HCQA 5H8QA 4XKPA 4K3FA 3HO7A 1FQCA 3CG3A 2UYFA 1NNKA 3O9PA 3TELA 3ZS6A 5CMKA 1ZLQA 1LBBA 4H5GA 1EH3A 3FIRA 4JBZA 4R6HA 4BDOA 4E0WA 5JTYA 1LSTA 1QUKA 2CMOA 2YLNA 4TQUQ 3KG2A 1NH8A 5F1QA 5ISUA 4IGTA 1VR5A 3FXRA 3LBSA 4DZ1A 1H43A 1SW5A 3PPNA 4ELPA 1SW4A 2FNCA 3C33A 4GWOA 3FZVA 4G8HA 3T9VA 5CC2A 2OLBA 4I1DA 3M8UA 2DVCA 3H6TA 3K1MA 4EQ7A 3MP1A 4HCYA 3PUWE 4LZ8A 1B0HA 5FHOA 5ITOA 5K2XA 3G7WA 1AMFA 3VFJA 3S9NC 1OVTA 2ABHA 1B3LA 4LONB 4MLVA 4ZE8A 2ESNA 4U2RA 1IUDA 1N3WA 1D3KA 1MY2A 2CZLA 1QKBA 2X26A 2ZXTA 3CSBA 2KLFA 2F5XA 3QK6A 4KR5A 2RCAA 4LATA 4OQOA 5CI5A 1XVXA 5EHMA 2W7YA 4ZEIA 4IY6A 2DQVA 1HSJA 1QW0A 2G29A 3MP6A 5FTHA 3FASA 2O1LA 2XXHA 4XKQA 3RQTA 1P1NA 4RYAA 1MXVA 3U8QA 4OMBA 1Y4TA 2REJA 2Y7KA 4YB5A 5L9MA 4G68A 1WDNA 4GRKA 3LC8A 4HS7A 4F1VA 3MW0A 1DSNA 2FA7A 5I2KB 4O3AA 2H99A 3G3HA 3TFLA 1O7TA 2F6GA 4NWCA 3K4UA 4O3CA 2DWJA 3FGSA 3IK6B 3KSJA 2YJPA 2O84X 1ZJLA 2I4BA 1N3XA 3O66A 3VVDA 1LLSA 3U92A 3PMXA 4RK2A 1UQWA 5I56A 1GGGA 1B05A 2OWSA 1I6QA 2DS9A 3CRBA 4NMYA 1VE4A 3GBBA 3K00A 3O6HA 2WKYA 1D9YA 1MY4A 2YPNA 1RKMA 3IB2A 1M5BA 3MVWA 4JWXA 4QFNA 1MH3A 5CRYA 5DVJA 3S4UA 3TMGA 3KN7A 3QUFA 3DP4A 3W15C 5KDTB 4QF9A 3IO4A 1NNTA 3FV2A 1M5EA 4G8MA 2ANJA 1YAEA 3EHSA 1FQBA 2Z8FA 3UA8A 1TT1A 3CG1A 3TCHA 2HAVA 1P99A 2OWTA 5ICTA 2F78A 1B9JA 2O1MA 2R9JA 4G77A 3PV0E 1MDP1 3KSXA 4NE4A 4OFOA 2VOZA 5A5XB 4FATA 4FEDA 2ONRA 4R73A 3KEIA 4JWOA 3K02A 1LBCA 1DMBA 3RPWA 2B3FA 2FYIA 2Q88A 2HZLA 3JZJA 2NVUB 2QRYA 1PB7A 3Q25A 3M3FA 2H25A 4MF3A 3TYHA 5AA4A 2PVUA 3BFUA 3QXMA 1Q35A 2PBWA 4Z7EA 5I2NB 4YICA 5DEXA 4DCYA 2UVGA 3WAFA 3U93A 3FVGA 4H65A 4R9GA 1BP5A 2Q2AA 2RCBA 3K6XA 1JQFA 5DYHA 2XHDA 3UN6A 3I5OA 5AE4A 1KWHA 5HBCA 4ZZAA 3KFMA 3PUYE 1DOTA 2BJJX 3S9MC 1EU8A 5B7DA 3V83A 3A09A 2F7BA 3K0VA 5FHNA 2B3BA 3VXCA 1EZPA 3T22A 1DPEA 4JWYA 2HFBA 3OSRA 4ELOA 4NF6A 4H8IA 4N13A 3QYTA 1XC1A 1XVYA 2DE3A 3TPAA 1Y1MA 3H6VA 1OQHA 3ILTB 3N94A 4EDPA 3KN8A 1MXUA 3BBRA 4NF4A 4HCWA 5H8HA 4AQ4A 4F1YA 1SI1A 2QMWA 2UVIA 2XXPA 3CFLA 3GZGA 3MAMA 4C0RA 5CM6A 2O6AA 4YKKA 1MM6A 1AIVA 4R74A 4DIGA 1H3DA 3OO9A 5ICQA 4XIGQ 1LGBC 2X7PA 3G3KA 3TTLA 2HEUA 1OLCA 4H5FA 4KHZE 1WODA 2ONKE 2H98A 4TOZA 4YKPA 1CE2A 1SBPA 1SYIA 2Z8EA 2XXIA 5CMCA 4BDLA 4YAHX 1N84A 1ZIUA 3IAZA 3MBPA 3R26A 4U21A 4F31B 1LAGE 3C32A 3H03A 4YB7A 5K2YA 2O7IA 1ZBMA 3CIJA 1B7HA 2B65A 3VLWA 1S9TA 5TPAB 1XT8A 4Q30B 1A7LA 2QS3A 2ZNTA 4R2BA 1JVYA 2I58A 3OEMA 4EF1A 1LAHE 4F29A 5KCJB 5H8FA 3VV5A 3K6UA 4R6KA 2DXYA 3TQWA 1MXYA 4YKIA 4QSDA 3C31A 3UIFA 4LZ7A 3S2VA 5I57B 2ALUA 1A55A 1XOCA 1MPDA 2H5YA 2PT1A 2DE4A 2V25A 4LA9A 1A8FA 1ATGA 4NWDA 3R6UA 4OWDA 4WKMA 4YU0A 3SDFA 2OK2A 2R71A 3K01A 4THIA 5DEXB 3TTKA 1O64A 3BFTA 4EXLA 4TLMB 1USYE 3E13X 2VGQA 1MH4A 3HN0A 3OOAA 3Q28A 1FTMA 1T0KA 2QMXA 3N5LA 4F3GA 2XXUA 1MY0A 1N04A 4PETA 1MS7A 1P1WA 5H8FB 3PU5A 1GTKA 4G68B 3C4MA 4TLLB 3W9WA 3T9HB 1PEBA 3JV9A 1N7WA 2VD3A 4OEVA 5ELVA 4RPNA 5I56B 2DWIA 4I9DA 1IXIA 3IR1A 3CSGA 4Q0CA 3OO6A 4R2FA 5IKBA 3MP8A 4BDQA 4YZZA 3RNNA 4DCXA 4OENA 2E0SA 2XXRA 4FAJA 2Q9TA 3HV1A 2A5TA 2Y7PA 4XXUA 3SESA 4OETA 3V89B 4ELRA 3EHUA 1B3HA 3OO7A 3O97A 4R72A 5CMBA 4ECFA 1II5A 2PMSA 1MQJA 4UA8A 2P1SA 4OTEA 3HSTA 1J1NA 1Y9UA 4C1UA 1POY1 1FW0A 1FQFA 2UXAA 3ONMA 4OHNA 3B6WA 2DWHA 2RINA 2VD2A 1O63A 2XXQA 2XXVA 2LAOA 2Z8DA 3IOVA 3LR1A 4DXBA 1B5IA 1RYOA 3AXFA 3B6TA 3IOWA 1POTA 2X7QA 1QUIA 4N6PA 3DLNA 2GH9A 5BWJA 2NXOA 4GXSB 3TKDA 4IO3A 1LAFE 3RY3A 4Q5TA 3GBAA 1Z7NE 3VLUA 3SEVA 2A5TB 3OSQA 4OZ9A 1I6BA 4NF8B 4I62A 2V3QA 4ZEFA 1GV8A 3LSXA 2XX9A 1URSA 3O28A 3MUQA 1JW4A 1ANFA 5TPAA 2AL5A 3QSLA 1B0LA 1MQIA 3TCGA 3N6TA 3SKPA 1ZU0A 3MZBA 4RY1A 1TWYA 1XS5A 2I0BA 3KN3A 3USDA 1MRPA 4ZDMA 1FTJA 3VVEA 3M3LA 4OFJA 4ELQA 5LOMA 3TTNA 1MQDA 2DSFA 3RUMA 3MVZA 1P1UA 2DWAA 3Q27A 1H44A 1B7ZA 4LP2B 4FORA 3RTFB 3OXNA 4Z0IA 5IAIA 1AH5A 1JW1A 3CR9A 4IB2A 4KQPA 1B51A 4ONYA 2DE2A 1FQDA 1JVXA 4UACA 4NF8A 3SETA 2F6PA 3KJTA 4MBPA 3TDJA 2D5WA 1SD3A 4U23A 1I6AA 2NWJA 5BUUA 3O2AA 2DXRA 1M5FA 3K6VA 2GFEA 3HPIA 5DT6A 4YMAA 2O69A 4M1VA 3CFXA 2F97A 1OVBA 1NFTA 1Y3QA 3EHTA 3PPPA 3K1NA 4NF6B 3O6IA 3VDFA 3S9LC 4BLAA 3G3FA 2DVZA 1QKAA 4IO7A 5AA2D 1YCJA 4GL0A 2Z23A 3EPEA 2Q8JA 1R9LA 2F36A 1URDA 1BLFA 2ONSA 1A8EA 3DP8A 4LQ5A 1MQGA 3HHGA 4NF4B 4QRZA 1Z7ME 5H8HB 4ZZEA 1MY3A 2A5SA 3W9VA 4F18A 1S50A 3L6HA 1OQGA 1GR2A 3KZGA 3FVOA 5TP9B 3FUZA 4ZE9A 2REGA 3E9XA 2M8CA 1IIWA 1VFEA 2UVHA 2V84A 3EQ1A 3TCFA 1M5CA 1L5TA 2ZMBA 4GD5A 3F11A 3MVYA 4GL8A 4GXAA 4WEDA 3OEKA 1B4HA 3RLFE 1WVJA 4GIZA 4F22A 5HPQA 1B40A 3LSWA 4U4XA 4DLDA 4EF2A 3T9UA 4LQ2A 1LFHA 1B6HA 1N7XA 4P0GA 1EZ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y7WA 4GVOA 1G0HA 2HQ0A 4KI0E 1MG1A 3TODA 4H67A 3LV0A 2FHYA 3K6WA 1QJMA 1N0TA 3TUSA 3R7XA 5KZTA 2GHAA 1IXCA 1OIBA 1B58A 3PMVA 2WX9A 1RDXA 4GOTA 5F7VA 3CVGA 3PUZE 2AYSA 3D4CA 4DLDA 1TXFA 4NQ8A 1JEUA 1OLAA 3K2DA 5EYFA 4IO5A 2IA4A 1SVXB 5TU0A 1M5DA 4JSOA 4N17A 2DP8A 2R6GE 3MPLA 5AA1A 4OVRA 2ZYNA 1RYXA 1P1QA 1TFDA 3TZAA 3CHGA 2KQZA 4HXVA 3KOSA 3IFCA 1H45A 2XD3A 3RPLA 3N6UA 3PPRA 1B32A 4O3BA 4PAIA 1FTOA 4G4PA 2QS1A 1FJ6A 4GF8A 1US4A 3THIA 4JXIA 1IZ1A 5DTBA 2Z22A 4EXKA 2MKZA 4PC9A 2WEFA 4DE8A 5I59B 4EF2A 1NV4A 3UK4A 2GRVA 5I7IA 4Q8RA 2XX8A 3RUMA 1FBCA 3GLBA 1XHYA 4PFUA 3KGCA 4LVQA 4JSDA 5ITPA 2VP1A 1ZTYA 4KFQA 4XF5A 4GBWA 4NF5B 2I6EA 3L6GA 1ELJA 4U1OA 4KCDA 3S9EA 4QFKA 5J1DA 2WBDA 4ZEBA 2I48A 2V4CA 4N6KA 1MDQA 1F9BA 2XXXA 3IORA 4R9FA 4H45A 1FJ9A 1FRPA 2HCAA 1UTHB 4RXLA 1PBQA 4POXA 2O51A 2UVJA 3G3JA 2H9BA 4OFJA 2F7AA 1GVCA 3H3GA 1NKXA 3TTRA 5H8NA 2I0CA 1Y4CA 4FEBA 5I84A 1B7UA 4MH5A 4F2QA 1BK4A 2HXWA 3LSLA 1FBDA 4F2OA 2ZYOA 3FV1A 1NV0A 1VFDA 3C36A 3FXUA 1IMCA 4P9KA 3ISPA 1MXXA 1FQAA 1NV2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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