3TUSA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with meta-hydroxy benzoic acid at 2.5 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Meta-hydroxy benzoic acid at 2.5 A Resolution
rcsb
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-09-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tusA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tusA02
1A55A 1ZMGA 2O6AA 1Y20A 3KBRA 4M4GA 1CE2A 3H03A 1USYH 2DWAA 4MBPA 4ZECA 3PPNA 3PD9A 1JVYA 2IEEA 2Y7PA 2P2AA 3TFLA 4UACA 1ZLQA 5KDTB 3I3VA 1QJMA 3FXUA 3QAXA 4KFQA 2RINA 3N26A 4IGTA 3DLNA 5I2NB 4G4PA 1GTKA 3CFXA 3IJOB 3PUZE 2UVJA 3N94A 1FTOA 2R9JA 4JWYA 4AB5A 4QFNA 4EXLA 2DQVA 3CSGA 1PBQA 5CI5A 1I69A 1B3EA 2QMXA 2F8DA 3C32A 4O3BA 3S9LC 4XTCQ 3O2AA 1Y9UA 4GFRA 5HBCA 4LQ2A 4GF8A 5L8DA 3PV0E 1B52A 1OVTA 4LZ5A 1FTMA 4YMAA 3LSFB 1B9JA 1MQIA 1FQDA 1Z7ME 4YMBA 3HHGA 4ESXA 4ZEBA 1MQDA 1TFAA 3SEXA 2PMSA 5I2NA 2ONKE 2BJJX 3QXMA 5H8SA 1VFEA 4LATA 2I49A 4ELRA 1NL5A 3D4GA 4PFTA 1MDP1 3OOAA 1Y3PA 2CMOA 3G3KA 4Z7EA 4PE5B 3LSWA 1MPBA 4DDDA 5JK4A 4R6KA 3I5OA 4H8IA 3SEUA 2HAUA 1MS7A 2X7PA 5F7VA 2VD2A 4LUBA 1XOCA 3IR1A 1ZKBA 3MW0A 1PEBA 3CR9A 3KOTA 3N6TA 4JDFA 2QSXA 4F3GA 4EQBA 2V3TA 3G7WA 5KCJA 2DSFA 2O1LA 1JQFA 5FHNA 3PD8A 4G8NA 3IOVA 3M3KA 2F5XA 3SEVA 2ZNTA 3OO9A 1B4HA 2HXWA 1JEVA 1RYXA 5CMMA 5ITPA 1O7TA 4YKPA 1FCKA 4MFIA 1N0TA 3FIRA 2ESNA 2Q88A 1SBPA 3L6GA 1I6QA 1SYHA 3R7XA 3FJMA 3FV2A 1H43A 3HSTA 1QKBA 5I59A 1P1NA 4EXKA 1B1HA 1IIWA 2ONSA 2DWIA 3K00A 3TCGA 4ZS9A 3SERA 3VVDA 2G29A 1MPCA 1D3KA 4F3BA 3TCFA 4U4XA 3OD7A 1B32A 3PUWE 2OBGA 2HQ0A 3VV5A 2F6PA 4IO4A 2RC8A 4H1XA 4BDNA 1FTLA 4P11A 4F31B 1II5A 4DCXA 4MLVA 4ZZEA 2Z23A 1TWYA 3V83A 2P0SA 1MQJA 1MY4A 4GQOA 2QS4A 1XC1A 4YKJA 3ILTB 5AA1A 4DXUA 2YJPA 3MAMA 2Z8DA 3CI8A 1H44A 4R9FA 1PBPA 4X1BA 3KN8A 4JB7A 5AA3A 4RYAA 4H8JA 1Y4CA 4NF4A 3GXAA 1B0HA 4YB6A 1VR5A 3VFJA 1AOVA 1XVXA 3TUSA 3EN3A 2XHDA 4OESA 4OYVA 3H6UA 4GRKA 4R6YA 3W15C 5A5XA 2NUVA 4JSDA 4NF8B 3C31A 2Y7WA 1R1NA 4Z0IA 1Y4TA 3ZKKA 4QFLA 3EHSA 4ISUA 1JW5A 3Q29A 4JWXA 4NMYA 1ZBMA 1IZ1A 3EHTA 1JETA 3QSLA 2DE4A 3S2VA 5ELVA 1LFGA 1JVXA 4YZZA 2XX7A 4G68B 4U22A 3W9WA 1M5DA 4OEVA 4P0GA 3S9MC 4FE8A 1ATGA 3G3FA 3SKPA 4Q5TA 3D4CA 2QS1A 4BDQA 1VSOA 1ANFA 3VLUA 2H25A 3IX1A 5DT6A 5FTHA 2O7UA 1MXZA 2W7YA 3RTFB 4IO5A 3KZGA 4RPOA 4RK2A 1XVYA 2V3UA 1FQCA 3H06B 4NF8A 1S50A 3CFLA 3PMXA 3UA8A 3JYRA 2V93A 1B5JA 1MDQA 1MY1A 2O51A 1BLFA 5B7DA 5I2KA 3HO7A 4G2ZA 1Y3NA 4GIZA 5TPAB 2VHAA 3BBRA 3KG2A 4K3FA 2M8CA 2O7IA 1QUIA 2RF1A 4FEDA 1GR2A 1MM6A 1UTBB 4U2RA 3GZGA 2Y7IA 2FNCA 4XKQA 4R74A 1VFDA 3JZJA 3B6TA 1LAGE 1FQBA 2VGQA 5H8NA 1POTA 1TXFA 2ZXTA 3O6HA 1DPPA 3U92A 1B6HA 2XXVA 2VOZA 2DE3A 3RY3A 2PYYA 4GD5A 1QW0A 5JEIA 3OEMA 4GLIA 3K6XA 2DXRA 2XXTA 4RNSA 3KSJA 3TMGA 1B58A 1ZJLA 3E4RA 1A8FA 4PETA 4HW8A 4R2FA 5K2XA 2Q9TA 2CZLA 2F35A 4RPNA 4QFKA 1MRPA 2QJEA 3L6HA 1DSNA 1B3HA 4EF1A 4X48A 4ZEKA 4TOZA 3MZ1A 3FV1A 1B7ZA 2Q89A 3T96B 3VLVA 4I1DA 4LA9A 4LVQA 5CM6A 1B0LA 5DEXB 4GL0A 2RCAA 2X26A 5K2YA 5H8FB 2V3QA 5DYHA 1LFIA 5TP9B 4OETA 3KGCA 5L9MA 4U23A 2F7CA 2DS9A 4KD5A 4N07A 3H6WA 3IOUA 2XXHA 4YICA 3N6UA 4GXSB 3VXCA 3HV1A 3ZS6A 2GFEA 1DTGA 2ZYKA 4OWDA 1MY2A 3SETA 4QFPA 4RA1A 2I0CA 2OK2A 1IUDA 4RJZA 3DM0A 5AA2B 4NWDA 1YPNA 3G3HA 1QVSA 3TELA 5JTYA 1ELJA 3CG3A 2REJA 1UIVA 1Y3QA 1P1WA 3V89B 1WVJA 4NWCA 2OWSA 5CBRA 2ZNUA 1AIVA 2UVHA 4YKKA 2AL4A 3QYTA 4OHNA 3UGWA 4IGRA 3F11A 3MPLA 3RN8A 3ZSFA 4WKMA 4ECFA 1S7YA 4C0RA 2ZYMA 4U1OA 5IKBA 3TTRA 3TZAA 2H5YA 5KDTA 1H45A 3C33A 2XXQA 1SD3A 2QL3A 3IK6B 4OFLA 4NTLA 1VE4A 4ZEIA 3U94A 3RPWA 3TTNA 2D3IA 5EYFA 3B6QA 5BUUA 1LSTA 4POXA 4LP2B 3VVFA 3TYHA 1SVXB 2R6GE 1ZU0A 1S9TA 2ZYNA 1CB6A 4U21A 2ANJA 1B3LA 1PDAA 3KEIA 3MWBA 5ICTA 3LSLA 1URGA 2B65A 2HAVA 1US5A 3CG1A 4H6DA 3T93B 3CSBA 1LGBC 3RTWB 4F3SA 2Y7RA 3LUYA 4PFUA 1A40A 4ZDMA 3LSXA 3PUVE 4JXIA 3PGFA 4NEDA 4ELPA 2H4IA 2QPQA 3G3IA 4Q0CA 4BDLA 3GLBA 4OZ9A 2D21A 5ITOA 1NNFA 1T0KA 4TQUQ 2I6EA 2XD2A 1A99A 3DP8A 4G8MA 1FQFA 1YCJA 1AMFA 1N7XA 2F34A 1XHYA 2NVUB 5CBSA 3MC2A 1UQWA 2OWTA 2PBWA 1MXVA 3IO6A 2Z8EA 3M8UA 4KCDA 2Q2AA 1FTKA 2H98A 1N04A 2ZNSA 2O69A 4EDPA 3TQLA 3LBSA 3LR1A 2HZLA 3OO7A 4FEBA 2LAOA 1YAEA 4O3CA 4NE4A 1PC3A 1DTZA 1A7LA 1LFHA 1XT8A 2UVIA 4ND9A 2B3BA 2I0BA 1LAXA 4ELQA 4N13A 2HEUA 3TAJA 2Q2CA 1EZOA 4F1UA 2HFBA 3LC8A 4JBZA 4EQ9A 3K01A 3IB1A 5F1QA 3PPOA 4DLDA 4R9GA 3PUXE 1JEUA 2Z8FA 1FW0A 3UP9A 3FUZA 4QHQA 3OENA 2I3WA 4E0WA 3OSQA 4POWA 3PMWA 1D9VA 3P7IA 3B6WA 4BDOA 3O9PA 1LCFA 5ICQA 1A54A 1BIYA 3RLFE 3MUQA 4GVOA 1MQHA 4M1VA 3HHFA 1QUJA 1IXIA 2RC9A 4OXVA 3CFZA 5I58B 1B2HA 3M3FA 1J1NA 3FJGA 3VDFA 3VLWA 4F2OA 1GGGA 1P1OA 1ZTYA 2GHBA 3K6WA 4RK9A 2QS3A 3K02A 2PT2A 4PQJA 5H8QB 3TEPA 3TQWA 3VE1B 3TPAA 2R71A 4LONB 2XXWA 3UN6A 4RXLA 4DZ1A 2I4BA 5CC2A 1BP5A 3T66A 3IAZA 3E13X 2AL5A 3V5AA 3FVGA 4DXBA 4LZ7A 4EF2A 1NNKA 3MQ9A 4NF5B 1LAFE 3EPEA 2DXYA 3BKIB 2REGA 3CIJA 4QSEA 1N3XA 3B7DA 1IXGA 1MXXA 5H8HB 1B4ZA 1FTJA 3ZKLA 4OENA 3K6VA 1P1QA 3SDFA 2VD3A 3PPRA 2A5TB 1PB9A 3U93A 3IORA 4MLQA 2HZKA 2OLBA 3IL1B 3R26A 4GWOA 2I3VA 3OMBA 2NWJA 4KPTA 3C36A 1NFTA 4EUOA 1YTVA 4C1TA 3BFUA 2GHAA 2NOOA 1LBCA 2OZZA 3QUJA 3UK4A 1PB8A 4KYDA 4FECA 4QFOA 3K1NA 3PPPA 1O63A 4NF5A 4ZEDA 1B51A 4G68A 5I57B 3DELB 2F7AA 3MP6A 3PPQA 1SYIA 2H99A 3T9VA 2ZMBA 4F19A 5HPQA 4OERA 2DYXA 2UVGA 3FATA 4AQ4A 4G77A 4H67A 1MM7A 4IO2A 3TDJA 2DVZA 2KLFA 4R72A 4H65A 2A5TA 3ONMA 3H4ZA 1NH7A 5ISUA 1MXYA 1OLAA 3OXNA 3C34A 1ZIUA 3Q27A 4FAJA 4X9TA 2DVCA 3IOTA 4G68C 3MP8A 1H3DA 4I9DA 5CMBA 4XKPA 1M5CA 5IAIA 3I6VA 2P1SA 2XX9A 1TFDA 4DIGA 3HCQA 4YB7A 2Z22A 5DVFA 3C4MA 4IY6A 3V8XB 3MVWA 5TPAA 3DP6A 3FZVA 3FVKA 3O28A 4R73A 1FQEA 4WEPA 3FXQA 1GV8A 1SQYA 3HN0A 1UTBA 4FORA 3FGSA 5I57A 3K6UA 1B1XA 2V25A 2D5WA 3OSRA 2XXPA 2XD3A 3EF7A 1B40A 1B46A 4LQ5A 4X1DA 1EU8A 1P99A 3O66A 3MVYA 2F78A 4P0IA 2XXUA 1FQAA 4RY1A 4GOTA 3OO6A 4I62A 4IY5A 2DE2A 3MP1A 1M5EA 3AXFA 1LLSA 2HCAA 3IO4A 2F7BA 1Q35A 2I58A 5CMKA 1OMPA 1IQ7A 3UIFA 2GRVA 4F18A 4ONYA 3K2DA 2VP1A 4F22A 4XXUA 4WEDA 5AA4B 4E0XA 4TLMB 1EH3A 1JNFA 1MPDA 1M5FA 2Y84A 1JW4A 3IJXB 4F1VA 2A5SA 4YAHX 4IO3A 1WODA 1KWHA 1PB7A 5DEXA 3BFTA 5H8FA 2YPNA 4FATA 5TP9A 3MVZA 1USYE 1OQGA 2X7QA 1N3WA 3O29A 4GL8A 1MXUA 1B3FA 5EHSA 3ILUB 3U72A 5J1DA 3H7MA 4PFYA 1N84A 1HSLA 2UYFA 4F2QA 1MH4A 5KCJB 5AA2A 2THIA 4ZZAA 3QIMA 5AA4A 2G93A 3KN7A 5EHMA 3MPKA 1R9LA 4OVJA 1Z7NE 1HSJA 4HCWA 4BLAA 3QUFA 2AIXA 4OFOA 5FHMA 1P1UA 3N5LA 3VXBA 3HPIA 1POY1 2H9BA 4HS7A 1EZPA 1LAHE 3WAFA 3TTLA 1DPEA 3ODBA 3OELA 4C1UA 2V84A 4FJPA 1MH3A 2OJTA 4DCYA 3SEWA 3ECRA 2RC7A 4QSDA 4TLLB 3S9EA 4R2BA 4ELOA 5L9SA 1RKMA 1L5TA 5I59B 4JWOA 4Q30B 2Y7KA 4OQOA 2GH9A 4R75A 2ONRA 3RT8A 1OIBA 3CRBA 4NF6B 1SW5A 2DWJA 5I56B 4H0WA 3TCHA 3K4UA 4WXJA 4HCYA 2E0SA 3E9XA 3RT6B 4ZE8A 5DTBA 3K1MA 1OVBA 2YLNA 3KN3A 4GXAA 1B05A 1QULA 1IITA 2XXIA 5FTIA 3C9HA 2RCBA 3PUYE 3UORA 3H3GA 3A3CA 3GBBA 2QMWA 4Q8RA 1F9BA 4BDMA 2XX8A 4O3AA 1OQHA 4THIA 1IXCA 4DE8A 2ABHA 1QKAA 4LZ8A 3Q25A 1N76A 1HSEA 3KJTA 3T9XB 4KI0E 1MY0A 4QSCA 4ESWA 4F3PA 1AL3A 1B7UA 4XKRA 2XXXA 1D9YA 3IOWA 4H5FA 4NF6A 1LB8A 3K0VA 5I56A 4F39A 1NH8A 1SW2A 5DVJA 1SDXA 4NF4B 3DP4A 2AYSA 3FASA 3EHUA 5L9OA 4MF3A 1UIUA 1SW1A 1MY3A 2FYIA 4L17A 5M2VA 4U4SA 1NNTA 1BKAA 1SW4A 4IO7A 5A5XB 1LB9A 1QUKA 3TODA 3U8QA 4BDRA 1IXHA 1LCTA 3G3JA 4ZE9A 4KR5A 5LOMA 3S4UA 3KOSA 1MG1A 5FHOA 2QRYA 5HM4B 3O6IA 2E1SA 2RKMA 2XXRA 3U1OA 3KFMA 4UA8A 4YKIA 1MQGA 2Q8JA 1B3GA 2F6GA 1RYOA 1Y1ZA 2F97A 5I84A 1I6AA 4YB5A 3Q28A 2ALUA 2PVUA 3FVNA 1N7WA 3VVEA 2O68A 1B5HA 3RUMA 2PT1A 2O1MA 1R9QA 3R6UA 3H6VA 3FJ7A 5TU0A 1Y1MA 5KZTA 1LBBA 2UYEA 4OMBA 3S9NC 1DOTA 3W9VA 4MH5A 4IB2A 2PX1A 1B7HA 2NXOA 3PU5A 3T9HB 3KJ7A 5I2KB 5I58A 4ZEFA 4XIGQ 1DMBA 4N6PA 3WAEA 3CVGA 5BWJA 1WDNA 3MZBA 1R6ZA 1A8EA 3T22A 3H6TA 1SI1A 3SEYA 4KYSA 2F36A 1SI0A 1NMUA 5H8QA 3RQTA 3O97A 1NNPA 5H8NB 4R6HA 1UTHB 4I8CA 3GBAA 2UXAA 3IB0A 3EQ1A 1BTJA 3MJNA 1O64A 4QRZA 3C35A 3RGYA 4JSOA 4KCCA 3JV9A 4AB6A 3K1PA 3FD3A 4OTEA 5AA2D 3TTMA 3TTKA 1XS5A 4PFWA 3Q26A 2XXYA 1URDA 2I4CA 3MBPA 4U1ZA 1GVCA 4FIMA 4IO6A 3G3GA 3FVOA 3USDA 3TKDA 1H76A 4HTGA 1Q1KA 3FXRA 3T9UA 5CRYA 4QF9A 1I6BA 3QK6A 4EQ7A 5H8HA 5CMCA 4F1YA 1US4A 2FA7A 1TT1A 5DVIA 1AH5A 3KSXA 4PP0A 4KYEA 3A3UA 4OEUA 4F29A 3OO8A 1UTHA 3E3KA 2DP8A 2DWHA 2DOJA 1M5BA 1EZ9A 5B70A 4DXCA 3IB2A 3M3LA 4KHZE 4KQPA 4G8HA 2B3FA 2IA4A 4YU0A 1NKXA 1D4NA 4H5GA 3SESA 2ZYOA 1IEJA 2I48A 1OLCA 3A09A 1B5IA 3THIA 2QS2A 3PMVA 1JW1A 1URSA 4OFJA 1MXWA 3OEKA 2O84X 3MVXA 2OCUA 5JTYB 5AE4A 3O6GA 3MZ9A 3RNNA 2WKYA 4XKNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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