2XXWA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) d776k lbd dimer in complex with glutamate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRKKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
total genus 78
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxwA02
1LB9A 4HCYA 3VXCA 3K00A 5FHMA 3L6GA 4YZZA 3WAEA 5CRYA 3O6HA 4GWOA 4P11A 3N6TA 4JXIA 1NNPA 3ILTB 3PPNA 3FZVA 3RUMA 3M3FA 1ZBMA 4HS7A 1WVJA 3IOWA 4O3CA 3HHFA 3S9LC 1A8FA 4H67A 3MVXA 1S7YA 4R73A 1EZPA 4KCCA 5FTIA 4OVJA 3H6UA 2A5SA 1MH4A 4DE8A 4I1DA 3O29A 3S9MC 1A8EA 5HPQA 1R1NA 2HQ0A 4ONYA 2XD2A 1OIBA 1ZKBA 3MAMA 2DE3A 3PUXE 5I2NA 4F31B 3Q25A 4XKPA 2I0BA 2A5TB 3DP4A 4R72A 3KEIA 3E13X 4ND9A 4LATA 3TCHA 3P7IA 4IO2A 1MY0A 4U4XA 4OEVA 2HCAA 5A5XA 5CBSA 4F18A 1OVTA 4EUOA 1US4A 1GR2A 5DYHA 5AA2A 2QS2A 1D3KA 2O69A 2F7BA 2VP1A 3SKPA 4WEDA 2UVGA 1FQEA 3CG1A 1RKMA 3I5OA 4IO7A 1SW5A 4ZE9A 1JQFA 3PPOA 3GBAA 4EXKA 3OEMA 3O9PA 1POY1 2O6AA 4U21A 2Y84A 2HAVA 5KCJB 2ZXTA 1P1OA 1FTJA 3PMXA 3Q27A 5CM6A 2R6GE 1UTHB 2E1SA 2AYSA 2GHBA 3PV0E 1IITA 2P2AA 1B7UA 3G3KA 4BDOA 1B3LA 4JWXA 4NF5B 1MXUA 3DP8A 3D4CA 3KGCA 2IEEA 4NF4A 3O2AA 5JEIA 2F5XA 3ECRA 2H98A 4IB2A 3C36A 4IO5A 3OMBA 1B5IA 1MPCA 3QAXA 2Q8JA 1TFAA 3TMGA 2H4IA 5ICQA 1GV8A 3RT6B 1LGBC 3HHGA 4XKRA 1MG1A 3HV1A 4QFKA 2Q2AA 2DXYA 3TTRA 1YAEA 5F1QA 3VLVA 1WODA 3ZS6A 4H8JA 1YPNA 1Y1MA 4BDRA 4G77A 4RXLA 1MDQA 1NL5A 2O1MA 3CFZA 4KYSA 3U8QA 2AL5A 1P1NA 5H8NA 1JEUA 3G7WA 2OJTA 1USYH 4QSDA 1MM7A 3IOVA 1EH3A 3FVNA 1LBCA 1GGGA 2H25A 1LAXA 3R26A 1H76A 1MRPA 3QIMA 4OERA 1I6AA 3LUYA 1MY3A 4TQUQ 1FQCA 1N84A 2DVZA 3C35A 2QS3A 4X1BA 4M1VA 4Q30B 3UP9A 3O6GA 2XXWA 3T9XB 3S9EA 5ICTA 1B3FA 5IAIA 1Y20A 4XXUA 4IO4A 1HSJA 2XXXA 1FTKA 3CR9A 2RF1A 1B7HA 4NF8B 1D9YA 3EHSA 3IX1A 4MFIA 3QUFA 4IO6A 3CFLA 1LSTA 3TFLA 1XVYA 3IORA 4ZEIA 3MWBA 1B1XA 1IXHA 2G93A 3RPWA 3H03A 1MY1A 2ZYOA 1URDA 4R2BA 2DXRA 1MXXA 1N3XA 4F3SA 4QFPA 5J1DA 3CRBA 3T9UA 1P99A 5L9MA 3LSXA 3OO6A 3O6IA 1EU8A 3PGFA 3IB1A 3RTWB 2VD2A 3D4GA 5EHSA 4LZ7A 2I49A 3WAFA 2YLNA 2DQVA 4ZE8A 3FVKA 4FATA 2UVJA 1RYOA 2HFBA 4EF2A 2DWHA 1SI1A 3I3VA 4QFLA 4ZEDA 1MXZA 1SBPA 1FQDA 4P0GA 1N7WA 2ABHA 3ONMA 2THIA 4JDFA 1URGA 2D21A 1ATGA 4NF6B 2Z8DA 4KI0E 2ZMBA 1A40A 1O7TA 1J1NA 3BBRA 4MLQA 2A5TA 1MPDA 3VFJA 1B1HA 1FTLA 4G2ZA 4BDLA 3U72A 5DT6A 1UIVA 2AL4A 2QMXA 3K02A 3BFUA 3LSWA 1SYIA 5CMKA 3H7MA 2RINA 3IOUA 3SDFA 4F2OA 4OFJA 3TODA 4FEDA 4OQOA 3T93B 1I69A 3TTNA 5I58B 3K0VA 1MPBA 3IL1B 2XXHA 4NMYA 1H43A 2Z8EA 1M5EA 3FGSA 4G68C 3G3GA 1MXYA 1NNFA 3RY3A 1L5TA 4TLMB 5KCJA 3S4UA 1QJMA 4THIA 5TU0A 1JEVA 4FJPA 1UTHA 3EN3A 3CVGA 4BDMA 1QW0A 2I4BA 2UXAA 2I48A 4NF5A 2F35A 2OWSA 4RA1A 3FUZA 3U94A 4OYVA 1XC1A 2O7IA 1JVXA 2VOZA 3VVDA 1MS7A 3F11A 3PPQA 4GRKA 2YPNA 5B70A 2RKMA 1B5JA 5DTBA 2XX9A 3PU5A 1II5A 4DIGA 3K1MA 3UGWA 3L6HA 2DVCA 5TPAB 1JETA 4PQJA 3OOAA 3CI8A 4LUBA 3C34A 4U4SA 4OEUA 4NTLA 2XD3A 3MP1A 1PDAA 4XKQA 2ZYNA 3T22A 2NOOA 2VGQA 2ZNSA 3RN8A 1XHYA 4F19A 1FQFA 3OSQA 4N6PA 3QK6A 2QMWA 4KPTA 2F78A 1JW4A 4H0WA 2OBGA 5I59B 3FATA 4EXLA 1IQ7A 1B58A 3C9HA 4HTGA 3C32A 1QKAA 2XXVA 3H6VA 5I2KA 4U23A 4Z0IA 3KOTA 4H6DA 3SERA 1UQWA 5HBCA 4ZZAA 1PEBA 3IB0A 3U93A 1EZOA 3OSRA 4NWCA 4LA9A 5DEXB 1ELJA 5FHOA 3KN8A 3PD9A 1ANFA 1MQDA 1IXIA 4P0IA 1AH5A 3FVGA 2DOJA 4NF8A 1Z7ME 2V25A 1H44A 1NNTA 4PP0A 5TP9A 3UIFA 1M5FA 1XT8A 1AL3A 1UTBB 4C0RA 3Q29A 4MH5A 3TAJA 5I56A 5H8QB 1MXWA 1ZLQA 3M8UA 2VD3A 3BKIB 1B3GA 1A7LA 3ZKKA 2D3IA 2Q9TA 2XX8A 3K1NA 2X26A 1URSA 2Z23A 4ELQA 3OELA 3BFTA 3MZ1A 4AB5A 1MY2A 3KN3A 2KLFA 1CB6A 2BJJX 2DS9A 1B05A 1PBPA 1B3HA 3K6VA 3EHUA 3TQLA 3G3FA 5ELVA 1NH8A 3ZKLA 2P1SA 5DVJA 1SW4A 1O64A 2ESNA 3TCGA 5I57B 4HW8A 4EQBA 4NF6A 3GXAA 1OQGA 4PFTA 1QKBA 4GLIA 1LCFA 4UA8A 4PE5B 3RLFE 4Q0CA 3T9HB 1FQBA 4N13A 4ECFA 4U1OA 4E0WA 3PPPA 5H8HB 4LQ5A 3FV1A 3I6VA 3N6UA 2M8CA 1VE4A 1IZ1A 4R75A 1B7ZA 4BDNA 4G8NA 4H65A 3MW0A 3G3IA 1LFGA 4O3AA 1B40A 2Y7PA 3MQ9A 2ONKE 3QYTA 5I58A 3EF7A 2ONSA 4Q5TA 4G8MA 3ZSFA 2B65A 4IO3A 3MP6A 2XXPA 2Y7WA 3RNNA 3SEYA 4WXJA 1NNKA 1Q35A 3SETA 4QHQA 3MPLA 4KHZE 2OZZA 5CMCA 4AB6A 1MM6A 2QS4A 4EDPA 5H8FA 4X1DA 1B0HA 2ZYMA 3TEPA 1UIUA 5L8DA 3JZJA 2XXTA 1R9QA 1B9JA 4DZ1A 3HPIA 4DCYA 3Q28A 1GVCA 3VV5A 4YU0A 3T66A 3PUWE 1N3WA 5ITPA 3ODBA 4TLLB 2V84A 4OFOA 4XTCQ 3T9VA 4QSEA 5TPAA 2F97A 2NUVA 3MUQA 2DSFA 2HZLA 2VHAA 3QUJA 2QRYA 4ELRA 2H5YA 2PT2A 3UK4A 1BLFA 4IGRA 1SYHA 1MQGA 2ONRA 2QJEA 4YMBA 4AQ4A 4YKPA 3DELB 3ILUB 1LAFE 3OO7A 3AXFA 4R9GA 1LFHA 4X48A 4YB7A 4R6YA 4U1ZA 3M3KA 2DYXA 2XXRA 2V3QA 2OCUA 1N7XA 1LB8A 3MBPA 2O1LA 4BLAA 3PUZE 4ZDMA 4R6KA 4I62A 3SEUA 1LAGE 2GH9A 5DVIA 2I6EA 1Y4TA 1FTMA 1S9TA 1HSLA 4ZEBA 5DEXA 2O84X 3MPKA 4E0XA 3OEKA 2D5WA 4OTEA 3U1OA 3FVOA 1ZJLA 2I3VA 3SEXA 1B32A 5A5XB 2H9BA 4QSCA 5H8QA 3MVWA 4GL0A 3CSGA 1R6ZA 3OO8A 1FW0A 1P1WA 4UACA 4YAHX 1ZU0A 5ITOA 4R9FA 3SESA 2H99A 4QFOA 5F7VA 1O63A 3KSXA 3Q26A 5I84A 2OK2A 3UA8A 4EQ9A 4RJZA 4LZ8A 3FJGA 5AA3A 3B6WA 1XS5A 4GVOA 4JSOA 4R6HA 4H8IA 3C33A 4ZZEA 3FIRA 2F34A 4K3FA 4NEDA 3PUVE 4U22A 2G29A 4YB6A 4LQ2A 1QUIA 4JWYA 5JTYB 2Z22A 3C31A 1Y3NA 4F3GA 2ZYKA 2UVIA 2Y7IA 1LLSA 3G3HA 4F1VA 4KYDA 5I57A 2RC9A 1QUJA 3MVZA 1P1QA 1FTOA 4YKKA 1USYE 1B4HA 3EPEA 4PETA 4NF4B 4G8HA 3H6TA 2GHAA 4JWOA 5H8HA 1ZTYA 4KYEA 4ELPA 3JYRA 3T96B 1NMUA 4RPNA 3H3GA 3A3CA 3TDJA 3LBSA 1B46A 1Y4CA 4FIMA 2FA7A 1SI0A 1TFDA 1JW1A 5CC2A 1IEJA 1Y1ZA 3IAZA 4MBPA 4XIGQ 4DXUA 3JV9A 3A09A 1M5DA 1AMFA 3VVFA 3DP6A 1SDXA 5H8NB 2PMSA 3UORA 4C1UA 4F3BA 1SQYA 3RTFB 4M4GA 2PVUA 5FTHA 1TXFA 5H8SA 3OO9A 1ZMGA 4F3PA 3QSLA 2V3TA 2E0SA 2PT1A 3VLUA 3HN0A 3KBRA 2I58A 2IA4A 2UYFA 3CIJA 3B6TA 3U92A 3GZGA 1LCTA 1B0LA 3RQTA 1QUKA 1JVYA 1IUDA 3OD7A 4I8CA 2I3WA 2ZNUA 4RK9A 2XXQA 3PMVA 4Z7EA 2RCAA 3FXUA 2QPQA 3QXMA 3K01A 1I6BA 3CSBA 3OXNA 2RC7A 4GFRA 4GL8A 1BP5A 4LP2B 4LVQA 1SW2A 2HXWA 1VFEA 5DVFA 2OLBA 1D9VA 2LAOA 2X7QA 2HAUA 4OETA 3HCQA 1P1UA 4FEBA 5KDTB 2OWTA 2Y7KA 4RY1A 5HM4B 1OLCA 2AIXA 1VSOA 4ZS9A 3H06B 1IIWA 2XXUA 3IK6B 3IOTA 3TTMA 1H3DA 1BKAA 2F8DA 1MQHA 2HZKA 4QFNA 2F36A 1FCKA 2REJA 2CZLA 3V89B 5AA1A 4YMAA 1VR5A 1M5CA 4HCWA 4LONB 1OVBA 3K2DA 5CI5A 3TQWA 2V3UA 3GLBA 2GFEA 5CBRA 2F6PA 3R6UA 3K1PA 3K6XA 4LZ5A 3SEWA 4OZ9A 3FD3A 1DPEA 3VXBA 2F7CA 1AOVA 4ESXA 5L9SA 1R9LA 4OENA 3HSTA 5BWJA 4FECA 3UN6A 3H4ZA 2DE2A 1MQJA 4F1UA 4GD5A 4YB5A 3KOSA 1SD3A 1SVXB 1DMBA 2I4CA 5AA4B 3IO6A 1Y9UA 1GTKA 3H6WA 4GQOA 3FV2A 1F9BA 4OWDA 4WKMA 3MC2A 4QRZA 4RPOA 4OESA 2DWIA 1B52A 2RC8A 1JW5A 4DCXA 4F1YA 1LFIA 5ISUA 1OLAA 4MLVA 4O3BA 3MP8A 2QL3A 2DP8A 2XXYA 5IKBA 5B7DA 1MXVA 1N04A 5JTYA 2PBWA 3KZGA 3MZBA 1B2HA 4OMBA 3B7DA 3FXRA 4ELOA 3VE1B 1N76A 1B51A 5JK4A 2ZNTA 2Q88A 1DPPA 2GRVA 2Q89A 4KQPA 1DTZA 4ZEKA 1DTGA 3TELA 3TYHA 2FNCA 4POXA 3EQ1A 4DLDA 1WDNA 5BUUA 3LSFB 5CMMA 1B5HA 3KJTA 4EQ7A 3FJ7A 4R74A 1TT1A 1ZIUA 1Y3PA 3HO7A 3VLWA 3R7XA 4OHNA 5EYFA 1S50A 3O66A 1YTVA 2DE4A 2R9JA 4G68B 1N0TA 4TOZA 3O97A 4H1XA 2O51A 4FAJA 3E9XA 4XKNA 1OMPA 4RK2A 4U2RA 3MJNA 4KD5A 3TTKA 4EF1A 4IY6A 3N5LA 1MH3A 1YCJA 1NFTA 3RT8A 4GIZA 1B3EA 3USDA 3VDFA 1KWHA 3IO4A 3CFXA 1MY4A 5I2KB 1A54A 4G4PA 4OXVA 3W9WA 3K4UA 1LAHE 1I6QA 3TTLA 3IR1A 1MQIA 4N07A 3KG2A 4IGTA 1QVSA 2P0SA 1EZ9A 3V5AA 5L9OA 5I59A 3KJ7A 4GXSB 2Z8FA 4WEPA 3C4MA 3A3UA 4KCDA 3RGYA 2XX7A 2NVUB 1B4ZA 1SW1A 1XOCA 5TP9B 2YJPA 4IY5A 3LSLA 3IJOB 3EHTA 4MF3A 1BIYA 4GXAA 5I56B 3SEVA 1XVXA 4FE8A 5K2XA 5FHNA 5I2NB 3W9VA 1AIVA 5AA2D 3TKDA 4PFUA 3GBBA 3MVYA 4F39A 2XXIA 4POWA 5AE4A 1BTJA 3CG3A 1PB8A 5KDTA 1Q1KA 3E3KA 3PUYE 4PFWA 4JSDA 2XHDA 1QULA 1UTBA 2NWJA 5AA2B 4I9DA 4L17A 4OFLA 2R71A 3IJXB 4DXCA 3OENA 4FORA 4RYAA 1A99A 3LR1A 4NWDA 1HSEA 3DM0A 1TWYA 1PC3A 2HEUA 3KN7A 4NE4A 1PBQA 2PYYA 3PD8A 4KFQA 2W7YA 4RNSA 1DSNA 1NKXA 4R2FA 3V8XB 4DDDA 2NXOA 2B3FA 4C1TA 3DLNA 3K6WA 3PPRA 4GOTA 1RYXA 4JB7A 2WKYA 3G3JA 3O28A 1Z7NE 1Y3QA 5KZTA 5EHMA 4F2QA 3KSJA 4BDQA 1T0KA 3FASA 1IXGA 3THIA 5AA4A 2UYEA 3TCFA 4H5GA 4F22A 3LC8A 5M2VA 5CMBA 2PX1A 1IXCA 2O7UA 3FJMA 5LOMA 3FXQA 4YKIA 1POTA 2O68A 1PB7A 1OQHA 5K2YA 1A55A 1PB9A 2Y7RA 4X9TA 3V83A 3KFMA 4H5FA 2ANJA 1M5BA 4F29A 5H8FB 3IB2A 3E4RA 2F7AA 3TZAA 3M3LA 4ESWA 2X7PA 4GF8A 4JBZA 4PFYA 1JNFA 2B3BA 2RCBA 3MZ9A 2DWJA 3TPAA 2CMOA 4ZEFA 1DOTA 4KR5A 3S2VA 1LBBA 2REGA 1VFDA 2I0CA 2FYIA 4DXBA 2F6GA 2V93A 3N94A 3VVEA 4YICA 1FQAA 1MDP1 4G68A 3B6QA 1D4NA 3TUSA 4ISUA 3S9NC 3W15C 2QS1A 4ZECA 1B6HA 1H45A 2DWAA 1US5A 2Q2CA 2UVHA 3K6UA 4QF9A 4YKJA 2QSXA 1NH7A 4Q8RA 3PMWA 2ALUA 1CE2A 3N26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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