2XXWA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) d776k lbd dimer in complex with glutamate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRKKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxwA02
4IY5A 3PUWE 5CBRA 3IR1A 5L9OA 3TYHA 4H6DA 2PVUA 4G2ZA 4C1UA 4GXAA 3CG1A 3D4CA 1YAEA 3I6VA 4HW8A 2I48A 2V3UA 2DP8A 1NH7A 2I4CA 3RN8A 4F31B 1RKMA 3Q25A 4GF8A 4YKIA 2RKMA 3QUJA 3O97A 4JWXA 3PGFA 4KI0E 1FQFA 4IO3A 4PFWA 3IJXB 2V3TA 4GD5A 1VR5A 1VFEA 3FATA 1BP5A 3T66A 5AA2A 3JV9A 2Y7PA 4U22A 1FTKA 3RY3A 2AL5A 3KEIA 2F6GA 3EPEA 5HBCA 1FQBA 1Y3PA 2DE2A 4R2BA 5FHOA 1P1NA 4ELOA 3FD3A 4BLAA 2RCAA 3OO6A 4KD5A 1JNFA 4EXKA 2F7AA 1B51A 1SW2A 1A55A 3ECRA 1MG1A 2HXWA 1H43A 4PFYA 4R9GA 1HSLA 3HO7A 5I56B 1POY1 2DWHA 4HCYA 4ZEBA 1OLAA 3Q28A 4O3AA 1NH8A 3HV1A 3SESA 1JW1A 3FVKA 1D4NA 5FTHA 4QF9A 1N3XA 4E0WA 5BUUA 2OWTA 3Q26A 1ZBMA 3CSGA 4NE4A 1N04A 4QSDA 1Y1MA 3KOTA 3IO6A 4GQOA 4YKPA 3E4RA 4PFUA 1FQDA 1SW1A 2ZYNA 1N7XA 2I4BA 4IB2A 3EQ1A 4ZE9A 4G68B 1QULA 4TOZA 5CBSA 1MM7A 4M4GA 3IOTA 1FW0A 2XXYA 2ZYOA 1WODA 1R6ZA 4IGTA 3CFZA 2FNCA 4BDOA 1BIYA 1B0LA 1FTJA 4I9DA 3ZKLA 4M1VA 1AOVA 5I58B 1M5CA 4TQUQ 1ANFA 4Q8RA 3TODA 3TUSA 2DXRA 2NXOA 2X7QA 3H3GA 3O6GA 5CMCA 4F18A 4PE5B 2F36A 3S9MC 1IITA 2CMOA 2I0CA 2KLFA 1LAHE 3PUZE 2V25A 4BDRA 3IB2A 1VE4A 3LR1A 3ZSFA 3PD9A 2D5WA 4DLDA 1BKAA 5M2VA 3KJ7A 4F3PA 3O66A 1EZ9A 4UA8A 5DEXA 2HZKA 3O29A 4POWA 4DZ1A 4ZS9A 1LFGA 2O7IA 2PBWA 1US5A 1UTHA 2PMSA 4WKMA 1DOTA 1N0TA 1NNPA 4UACA 2QS1A 1GGGA 4KR5A 1D9YA 3IX1A 3MP6A 3EN3A 5TP9B 1J1NA 1D3KA 3TMGA 4OFLA 5JK4A 3RTWB 1B05A 3KSJA 1ZLQA 1QKBA 2VD3A 3KBRA 3KZGA 3KGCA 1NNFA 3FZVA 1B0HA 3H4ZA 2THIA 3TAJA 3K1PA 3H03A 3UA8A 4HCWA 5J1DA 5DTBA 2O69A 4POXA 3PMVA 1A8FA 3OEMA 5CMBA 2OJTA 4JXIA 5A5XB 4YMBA 4F3GA 4QFOA 2XD2A 5KDTA 5F7VA 1I6BA 1NL5A 2P2AA 1I6QA 2O1MA 4LZ5A 4GXSB 3MP8A 2HFBA 4G68A 1B58A 4H5FA 3T9UA 3TTRA 1FQEA 3MZBA 2O6AA 1CB6A 1XS5A 2XXWA 3ZKKA 4LUBA 2OWSA 3IK6B 4OESA 2YJPA 3MVXA 3UK4A 5DYHA 1Y9UA 5I58A 1NMUA 1N7WA 2O68A 2B3FA 5AA4B 2OLBA 3KG2A 3ODBA 1YPNA 1N3WA 1BTJA 5FHNA 2AL4A 1MXVA 1Z7NE 3I5OA 2QMWA 3PPRA 3M3LA 1LLSA 4OTEA 4R2FA 3CSBA 2H25A 5I2KB 2H9BA 3B6TA 5DT6A 2NOOA 3OXNA 4X9TA 2HQ0A 2RCBA 3SEXA 2UVHA 4QSCA 3BBRA 2LAOA 4G68C 3IOWA 1B5IA 4KYDA 2Y7KA 3EHSA 3QIMA 1QUJA 2GH9A 1IUDA 3CR9A 2OCUA 2QS3A 1SI0A 2V3QA 1QW0A 1SD3A 4PQJA 3IAZA 3KN3A 3P7IA 1IZ1A 4OWDA 3MWBA 5FTIA 4GOTA 4L17A 5AA2B 3EF7A 3FVNA 3H7MA 1MDQA 3LSFB 2HZLA 3OSQA 1RYXA 3TCHA 3U8QA 1FQCA 1ZTYA 4LVQA 1OVBA 4MFIA 1KWHA 2E1SA 3B7DA 1IXCA 2Y7WA 3T93B 4AB5A 3K1NA 1B4ZA 3DELB 3QXMA 2DSFA 3PU5A 2F34A 2PT2A 3LUYA 2F5XA 4H1XA 1QUKA 1B3GA 3QK6A 4N13A 4K3FA 1PEBA 1A8EA 3G3FA 1IEJA 1B9JA 2V84A 2HCAA 1IXHA 4R72A 4U1ZA 3RLFE 1SYIA 3MP1A 5EYFA 3HCQA 4LA9A 4XKNA 4MLVA 2Q88A 1O7TA 5TPAB 3SEUA 2H4IA 1AIVA 3CG3A 2GHAA 2CZLA 1QVSA 2FA7A 4XKQA 1L5TA 3R6UA 4U21A 4YKKA 3R7XA 5AA4A 3C4MA 1TT1A 3DM0A 4F19A 2Z23A 1S7YA 3U1OA 3B6WA 1O64A 1PC3A 3C32A 3R26A 1TFAA 2UYEA 1LB8A 4IO4A 5I57A 5L9MA 1GTKA 3KFMA 2XXIA 1P99A 3RQTA 1B7UA 2G93A 3PMXA 3SKPA 3IL1B 3LBSA 5I2KA 3N6UA 1HSJA 4U4XA 1ZU0A 2Q89A 4QFLA 3U92A 3VVEA 4R6HA 4TLMB 5DVIA 5ICQA 2RF1A 3VXCA 3GLBA 1QJMA 5AE4A 4NWDA 1JW5A 2XXUA 1PDAA 5L8DA 3F11A 4FEDA 3N5LA 2RC9A 2DS9A 3E13X 5TU0A 1MPCA 4ZDMA 3LSLA 3QYTA 3VLUA 3K0VA 1H3DA 1A7LA 4ZECA 5AA1A 4O3CA 4PFTA 4PP0A 2RINA 3PV0E 5DEXB 3VV5A 1H44A 2ESNA 2Y84A 1SI1A 2H5YA 4RNSA 3N26A 1YTVA 4KFQA 1UTHB 3CFXA 4P11A 4R75A 1USYE 1B3LA 4ZEDA 2HEUA 1B52A 4G8NA 1JW4A 3TZAA 3PPNA 4H8JA 4ND9A 3TFLA 4OENA 3LC8A 3RUMA 1I69A 2XXQA 1VSOA 3OELA 3HHGA 2I3VA 3BKIB 4C0RA 1ZIUA 2ABHA 1NNKA 4X1BA 3MAMA 1NNTA 1PBQA 4EDPA 3CVGA 1QKAA 4G4PA 4X1DA 3K4UA 1URSA 2YPNA 5TPAA 1MQDA 4YKJA 5KDTB 4F2QA 1B6HA 2NUVA 4H65A 4MF3A 1P1OA 1AMFA 3RNNA 3N94A 2XXRA 5H8QB 4LZ8A 2DXYA 5ISUA 2VD2A 3SERA 1XVXA 4BDNA 3E9XA 2DYXA 4F3SA 1DSNA 3RT6B 2F8DA 4RA1A 3K6XA 4U1OA 4EQ7A 4RYAA 2PX1A 4R6KA 1MXXA 3K1MA 3G3KA 1P1UA 5ELVA 2GRVA 1B3FA 3A3UA 2F6PA 4DDDA 1A54A 1JVXA 1IQ7A 3ZS6A 4KHZE 1SDXA 3TTLA 3H6VA 4NEDA 1ATGA 2UXAA 1PB9A 3MC2A 3C35A 2XX9A 4JWOA 2GFEA 4YMAA 4KPTA 3QSLA 1QUIA 3O9PA 2XX8A 3PD8A 5HM4B 3LSXA 3MBPA 4YZZA 4OYVA 4JB7A 1P1QA 2XXXA 3K01A 5H8FA 2Z8FA 4RY1A 1SW5A 4F1UA 3PUYE 1N84A 4OVJA 3OENA 1POTA 2PYYA 3O28A 4ISUA 1MXUA 1II5A 1AH5A 1H76A 3VXBA 2UVIA 1MQJA 3EHTA 3G3HA 3QAXA 1B32A 2Z22A 5CI5A 1UTBA 2I49A 2ZNTA 4YICA 4ESWA 3M8UA 1DMBA 1N76A 4BDLA 3WAFA 1US4A 2F7BA 3FVOA 4OERA 2NVUB 4NF5B 2F97A 1XC1A 3VE1B 2W7YA 3G7WA 2P1SA 2Q8JA 2QS2A 3TELA 4OZ9A 2QRYA 5JEIA 4P0IA 5AA3A 3PPOA 3FVGA 2WKYA 1TXFA 4HTGA 1UIUA 4XKRA 4EQ9A 2X7PA 3TEPA 2P0SA 2ALUA 5H8QA 1DPPA 1H45A 3BFUA 3S9LC 3MQ9A 4YB6A 1OMPA 2Y7IA 4GL0A 2BJJX 1WDNA 3OEKA 1OVTA 4U4SA 1MY4A 2I0BA 4LQ5A 2F35A 4ZZEA 4KQPA 3S4UA 3MPLA 3SEVA 1B3EA 4LZ7A 4NF6A 2E0SA 3HPIA 4IGRA 3M3KA 2HAVA 2ZYKA 3K6VA 2R9JA 4NF8A 5I84A 4F22A 5CMMA 1MRPA 1M5DA 4OQOA 3MZ9A 4R6YA 4QHQA 1D9VA 4OEVA 4THIA 5I57B 3T9XB 4GLIA 4ELQA 5H8NA 4LONB 3H6TA 3FIRA 1SYHA 2XXVA 1Q1KA 2DWIA 2D21A 4NF4A 4OHNA 3HSTA 4YAHX 1A40A 5ITOA 3I3VA 2XHDA 4H5GA 1EU8A 5EHMA 3PPPA 2HAUA 4FECA 2R71A 4LP2B 4Q0CA 4KYSA 4KYEA 3MZ1A 3UP9A 3T96B 4NMYA 4EF1A 2DE4A 2H98A 1UQWA 3BFTA 3MVZA 4FEBA 4Q5TA 1IXGA 3O6IA 4NF5A 1GR2A 4ELPA 1LAGE 1I6AA 3FV1A 3KN7A 4I62A 3VFJA 3GZGA 1P1WA 4XXUA 1SBPA 1LAFE 4EUOA 3Q27A 5IKBA 1B40A 1B2HA 1Y4CA 1O63A 3O6HA 3OO8A 4RXLA 1EZOA 2XXPA 4QFPA 1FCKA 4ONYA 5L9SA 5B70A 3LSWA 1B1XA 3UGWA 4Z0IA 2DWJA 4DE8A 3TKDA 3H06B 4FIMA 4IO2A 3VDFA 3HN0A 1GVCA 4DIGA 4OFOA 3V83A 4ZEKA 3TTMA 5ICTA 3G3IA 1JEUA 3H6UA 3HHFA 3MPKA 3AXFA 5FHMA 3ILTB 1LAXA 4BDMA 4DCYA 3U72A 4OXVA 1JETA 1R9LA 4OETA 3A09A 1IXIA 1Y4TA 1OQGA 4JSOA 1SVXB 2DVCA 2ZYMA 4OEUA 2QS4A 4R9FA 1DTGA 4GFRA 4AB6A 4F1VA 3C34A 1EH3A 4DXUA 4ESXA 5I2NB 4GL8A 2O84X 4U23A 2VGQA 3RPWA 1NKXA 2ZNUA 3OD7A 5K2XA 5KCJA 4FAJA 1Y20A 2DOJA 4QRZA 2R6GE 3SEWA 3S9EA 3OSRA 2XD3A 5CM6A 2A5TA 1T0KA 3VLWA 2NWJA 2UYFA 2O51A 3PMWA 3MVWA 3JYRA 4LQ2A 3TTKA 4G8HA 5H8HA 3Q29A 3T9VA 3U94A 1Q35A 1LFIA 1B1HA 1B4HA 1WVJA 2Q2CA 4JSDA 1LFHA 5H8FB 2REJA 3TCFA 3K2DA 4C1TA 1PB7A 1ZKBA 3KOSA 3OOAA 4X48A 3IORA 4RK2A 3DP8A 3B6QA 2AYSA 4G77A 4Q30B 2REGA 3VLVA 1DTZA 1UTBB 3K02A 4F2OA 5JTYA 3JZJA 3V5AA 1MH4A 4F29A 5I59A 1MH3A 1MY1A 3VVDA 2Z8EA 1OIBA 4JWYA 3FV2A 3KN8A 3DP6A 2B3BA 4LATA 2OK2A 2DWAA 3DP4A 1URGA 5ITPA 1SQYA 1F9BA 2XX7A 4YU0A 1JQFA 5CMKA 4EF2A 4P0GA 3IOUA 3IB0A 3C9HA 4EQBA 4GVOA 4E0XA 4FATA 1MPDA 4QFNA 1AL3A 2FYIA 2DVZA 4RJZA 1NFTA 1Y3QA 3C31A 3FJMA 1USYH 3IJOB 2IEEA 4KCDA 5I2NA 1OQHA 4H8IA 3TPAA 3S2VA 2G29A 4NF6B 3FXQA 1B7HA 3DLNA 5H8SA 4KCCA 4XKPA 3UORA 1LGBC 3OO9A 5HPQA 4NF8B 2PT1A 3EHUA 1SW4A 2GHBA 3L6HA 3FGSA 5AA2D 3IO4A 3M3FA 3E3KA 4ZE8A 2VOZA 1BLFA 2B65A 4IO6A 3N6TA 4WXJA 1MXWA 1Z7ME 1XT8A 5H8NB 2ZNSA 3UN6A 3TDJA 2XXTA 1FTLA 4DXCA 1A99A 4IO5A 4NF4B 1JEVA 1R9QA 3T22A 3TTNA 4YB5A 2O1LA 5K2YA 2F7CA 1Y3NA 5KZTA 4NTLA 5IAIA 1B46A 3V8XB 2OZZA 4PETA 3CI8A 4RPNA 4ZZAA 1EZPA 1MQHA 5LOMA 1PBPA 2IA4A 3RTFB 4QFKA 2H99A 3USDA 1LBBA 2Y7RA 2OBGA 3FXRA 1LCTA 4N07A 1DPEA 1FQAA 2ZMBA 4H67A 3CIJA 2DE3A 1XHYA 2QSXA 2UVGA 5DVFA 1TFDA 1LB9A 4N6PA 2QMXA 4G8MA 3C36A 3W15C 3H6WA 4HS7A 2F78A 3IB1A 3GXAA 4RK9A 3VVFA 2RC8A 5I56A 3ILUB 4MH5A 3K00A 4GWOA 3CRBA 3MVYA 2ANJA 4ZEFA 4FJPA 2O7UA 2ONSA 1MXZA 1MDP1 4I8CA 4Z7EA 1B5HA 4WEPA 4GIZA 3T9HB 4U2RA 3G3GA 1RYOA 2ONRA 4DCXA 5DVJA 4BDQA 4AQ4A 5F1QA 4XTCQ 2M8CA 4F39A 3TQWA 2DQVA 1FTMA 5CC2A 1ZMGA 4ELRA 3RT8A 3C33A 3S9NC 3QUFA 4WEDA 3PPQA 4O3BA 2ONKE 3K6WA 3O2AA 2Q2AA 2UVJA 5KCJB 3D4GA 3A3CA 3U93A 3V89B 3W9VA 4OFJA 1MQGA 3SEYA 3PUXE 1IIWA 3UIFA 2A5TB 2A5SA 1M5FA 3FJGA 5B7DA 1B7ZA 2ZXTA 5BWJA 4FORA 4MBPA 4F3BA 4QSEA 1ZJLA 1R1NA 2D3IA 4OMBA 4RPOA 3GBAA 3G3JA 1LCFA 5H8HB 3RGYA 3THIA 1MS7A 2VHAA 4EXLA 4R74A 1XVYA 4FE8A 1VFDA 3KJTA 3W9WA 1ELJA 3ONMA 1LSTA 5EHSA 1FTOA 4I1DA 3KSXA 1MXYA 3K6UA 5TP9A 4GRKA 3PUVE 2I3WA 1MY0A 3FASA 1TWYA 2QPQA 3SETA 5JTYB 1YCJA 2X26A 3WAEA 1GV8A 1M5BA 1HSEA 1UIVA 2QJEA 4R73A 5I59B 2Q9TA 3IOVA 3FXUA 2I58A 1M5EA 4JDFA 2Z8DA 5A5XA 1CE2A 4H0WA 2AIXA 2V93A 2VP1A 4ZEIA 1Y1ZA 3FUZA 3MW0A 4TLLB 5CRYA 1B3HA 3MJNA 1MM6A 2YLNA 3CFLA 1MY2A 1XOCA 4F1YA 1URDA 3L6GA 4IY6A 1S9TA 4XIGQ 4YB7A 1LBCA 4IO7A 1MPBA 1S50A 1JVYA 3OMBA 1MY3A 1MQIA 1OLCA 4NWCA 3TQLA 3FJ7A 4JBZA 1PB8A 1B5JA 3OO7A 3GBBA 4MLQA 3MUQA 4DXBA 3TCGA 2XXHA 2RC7A 2QL3A 2I6EA 3SDFA 4ECFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IY5A 3PUWE 5CBRA 3IR1A 5L9OA 3TYHA 4H6DA 1BK4A 2PVUA 4G2ZA 4GX6A 4C1UA 4GXAA 3CG1A 3D4CA 3KC0A 1YAEA 2HPGA 3I6VA 4HW8A 4JVCA 2I48A 2V3UA 2DP8A 1NH7A 2I4CA 3RN8A 3T0JA 4F31B 4PDHA 1RKMA 1LEVA 3Q25A 4GF8A 4YKIA 2RKMA 3QUJA 4MIJA 3O97A 4XEQA 4JWXA 3PGFA 4KI0E 1FQFA 4IO3A 5EYGA 4PFWA 3IJXB 2V3TA 4GD5A 4P56A 1VR5A 1VFEA 3FATA 1BP5A 3T66A 5AA2A 3JV9A 4I40A 2Y7PA 4U22A 1FTKA 3RY3A 2AL5A 3KEIA 2F6GA 4NF0A 3EPEA 5HBCA 1FQBA 1Y3PA 2DE2A 4R2BA 5FHOA 1P1NA 4ELOA 4PAFA 3FD3A 4BLAA 2RCAA 3OO6A 4KD5A 1JNFA 5ET7A 4EXKA 2F7AA 1B51A 4XF5A 1SW2A 1A55A 3ECRA 1MG1A 2HXWA 1H43A 4PFYA 4R9GA 1HSLA 3HO7A 5I56B 1FPJA 1POY1 4PGNA 2VPOA 2DWHA 4HCYA 4ZEBA 1OLAA 3Q28A 4O3AA 1NH8A 3HV1A 3SESA 1JW1A 3FVKA 1D4NA 5FTHA 3CHGA 4QF9A 1N3XA 4E0WA 5BUUA 5IZ3B 2OWTA 3Q26A 1ZBMA 1NUXA 3CSGA 1NV0A 4NE4A 1FPKA 1N04A 4QSDA 1Y1MA 2WYKA 3KOTA 3IO6A 4GQOA 4YKPA 3E4RA 4PFUA 1FQDA 4GWWA 1SW1A 2ZYNA 1N7XA 2I4BA 4IB2A 3EQ1A 4ZE9A 4G68B 1QULA 4TOZA 5CBSA 1MM7A 1INPA 4M4GA 3IOTA 1FW0A 2XXYA 2ZYOA 1WODA 1R6ZA 4IGTA 3CFZA 1SPIA 2FNCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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