2UVGA

Structure of a periplasmic oligogalacturonide binding protein from yersinia enterocolitica
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
403
structure length
401
Chain Sequence
VNLRMSWWGGNGRHEVTLKALEEFHKEHPNINVKAEYTGWDGHLSRLTTQIAGGTEPDVMQTNWNWLPIFSKDGTGFYNLFSVKEQLDLAQFDPKELQQTTVNGKLNGIPISVTARIFYFNDATWAKAGLEYPKTWDELLAAGQVFKEKLGDQYYPVVLEHQDTLALIRSYMTQKYNIPTIDEANKKFAYSPEQWVEFFTMYKTMVDNHVMPSTKYYASFGKSNMYEMKPWNGEWAGTYMWNSTITKYSDNLTKPAKLVLGPYPMLPGAKDAGLFFKPAQMLSIGKSTKHPQESAMLINFLLNSKEGVELGLERGVPLSATAVTQLRASGVIKDEDPSVAGLNMALELPHKMTTSPYFDDPQIVSLFGDAIQYIDYGQKTVQETAEYFNKQGDRILKRAMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords ABC TYPE PERIPLASMIC SUGAR-BINDING PROTEIN
publication title Specific Recognition of Saturated and 4,5-Unsaturated Hexuronate Sugars by a Periplasmic Binding Protein Involved in Pectin Catabolism.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia enterocolitica
total genus 147
structure length 401
sequence length 403
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uvgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uvgA02
5CMMA 3UN6A 2AIXA 1AL3A 4ZEKA 4OYVA 3W9WA 1RKMA 3WAFA 3RT8A 1UTBA 3JYRA 5I2NB 2F7BA 2R71A 5H8NA 1R9QA 2XXRA 5H8QB 1IQ7A 3LC8A 4DLDA 2RCAA 1M5EA 4IO5A 4KI0E 5ICQA 1S9TA 5ITPA 2XXXA 3FIRA 2Q88A 3ZS6A 2NWJA 3DP4A 4YZZA 1B4HA 5I57B 1B7ZA 1M5DA 4NF8A 1TWYA 1JW5A 2X7PA 5H8SA 3K01A 1DPEA 3N6TA 1S50A 3PD8A 4EF1A 3PU5A 4KCDA 4DXCA 4ECFA 1ZJLA 3T9UA 3DELB 4OWDA 1Z7ME 1ZLQA 4DIGA 1I6QA 1WVJA 1Y1ZA 3T9HB 1SD3A 1ZTYA 2ONSA 2H5YA 4JWYA 2O1LA 3Q27A 2PT2A 5BUUA 1VR5A 2OLBA 1R1NA 2E0SA 3OO7A 3DLNA 4ELOA 4PFTA 5FTIA 4FORA 1ATGA 3VVDA 3M3KA 3V8XB 1LSTA 4PQJA 4OTEA 1M5BA 1FQCA 3TFLA 2ESNA 3FV1A 1XOCA 2XXVA 1EZPA 4WEDA 3FVNA 1QUKA 3IORA 3PPQA 1LBBA 3E13X 3KOSA 4NF5A 1B7HA 2V3UA 5EYFA 2QS2A 3O9PA 2HQ0A 1LAGE 1B40A 3U92A 2ZMBA 3SDFA 4MLVA 4XKRA 3O6IA 2Y7PA 4EQBA 1UIVA 4HTGA 1SW1A 4DDDA 2HAVA 4RK9A 5ITOA 2V93A 2DYXA 3H6WA 3LBSA 3SESA 3FATA 1NH8A 4N13A 5KCJB 3FXQA 5DT6A 3K6XA 4EF2A 3A09A 2X7QA 1FTMA 2IEEA 4FEDA 1B32A 4OEVA 3GBBA 4ZEFA 2HCAA 1JW1A 1N0TA 3IO6A 1P1QA 4GD5A 2QL3A 4H8IA 3SEVA 2P1SA 3H6UA 4F3PA 5I59A 2I6EA 3M3LA 2Q9TA 4FIMA 2Y7KA 3SEUA 4U1OA 1IIWA 1MH4A 4F3SA 3AXFA 2GFEA 1CE2A 2RF1A 3KZGA 1LAXA 2YLNA 3MJNA 5I2KB 3TCHA 2F78A 3MVYA 1QKBA 3H6VA 3LSFB 1QW0A 1FTKA 3VLWA 3TEPA 2VGQA 5CI5A 3I6VA 1OQHA 4DXBA 4G4PA 1N04A 4IO4A 5CMCA 3C31A 4NMYA 1SBPA 4X1BA 3MUQA 1MXVA 2F7AA 3TCGA 1LAHE 3PV0E 3CSBA 1B6HA 2O7IA 4Q30B 1IXGA 4Q5TA 4QSEA 5CRYA 3KSXA 1M5FA 4C1TA 3PUXE 1B05A 2VHAA 2DVZA 1FW0A 3IL1B 4E0WA 3SEWA 1H43A 2V84A 4JDFA 1TFDA 2HZKA 3TCFA 2UYEA 3IOVA 3KSJA 1DTZA 1A54A 1O64A 4U23A 2QPQA 4KR5A 2O69A 1XHYA 3TQWA 2ZNUA 3C35A 3QAXA 4KPTA 1H45A 3O66A 1MY1A 4M1VA 1VFDA 4IGTA 4YAHX 1NNKA 1LAFE 1XT8A 4KHZE 5AA2B 1VE4A 1B52A 4KQPA 1MXWA 1OIBA 4PE5B 1DTGA 3UGWA 2XX8A 1P1NA 3I5OA 1IITA 1RYXA 4R9FA 4ZZEA 5L9SA 3DP8A 3S9NC 3PPPA 3A3CA 3U72A 4H1XA 2O84X 1JVXA 3HPIA 2Q2AA 3MVXA 2CZLA 3LSWA 4NWCA 3PD9A 3PUZE 2DXRA 1USYE 1ZU0A 3W15C 1MPDA 3ONMA 1A99A 4LA9A 4OXVA 3S9MC 5KDTA 4ZEBA 1PC3A 3LSXA 1OLCA 5M2VA 4YKKA 1JETA 1FCKA 1KWHA 2XX9A 4P0GA 3RGYA 1FQBA 2O51A 3K2DA 5TP9B 1MQHA 3RTFB 4BDMA 3H06B 3T96B 3L6GA 4FECA 3Q25A 3K6WA 4NEDA 3G3KA 3V5AA 1PBPA 3U1OA 4TQUQ 5CBSA 2W7YA 1B7UA 1N7WA 3QUFA 1EU8A 1YPNA 5JTYB 3MWBA 5J1DA 1UTBB 4BDRA 5H8NB 3B6QA 3DM0A 2Y7WA 3SERA 3CVGA 3E3KA 1URGA 2WKYA 3W9VA 5HM4B 4PFUA 2NVUB 3MPKA 1R9LA 3VXBA 2KLFA 5I56A 2I4BA 3MW0A 4POWA 1LFGA 5TP9A 1HSEA 2NUVA 3PMXA 4OMBA 3PUVE 4NF8B 1B58A 2I49A 3SEYA 3SETA 1II5A 4F1YA 4XKPA 1B3HA 2I58A 3O6HA 4XKNA 4YMAA 1H44A 1LCTA 5JTYA 1GV8A 1B3GA 1MPCA 4R9GA 2O1MA 2R9JA 4U4SA 1B1HA 5HPQA 1MDQA 2F34A 3EHSA 3QXMA 2D21A 1H3DA 3VFJA 4RPNA 5FTHA 3HSTA 2P2AA 3OENA 4NF4B 4HCYA 2M8CA 2I0CA 4G68C 2RCBA 1LBCA 1XC1A 3MQ9A 1B2HA 3GXAA 2XD2A 4F31B 3VLVA 4HW8A 3FV2A 4N07A 4QFNA 3THIA 2RC9A 2GHAA 2G29A 2F7CA 2FYIA 5TPAA 4ZEIA 3ODBA 3OSQA 4NF5B 1MDP1 1PEBA 3V89B 1NFTA 2QSXA 3LR1A 1B3LA 4OERA 4DE8A 4F2QA 1TFAA 2Z8DA 3ILTB 1O7TA 4NTLA 4QSCA 3H6TA 4F1VA 3KN7A 3TTLA 4EUOA 4BDNA 3G3FA 3TTNA 4Q0CA 1NNPA 3EQ1A 4RNSA 2OWTA 5L9MA 1PDAA 1QVSA 4GXAA 2ZYMA 4ZE8A 3LSLA 2F35A 4JXIA 3IB2A 1FQDA 2DSFA 4H5FA 1IXHA 3C9HA 4GF8A 3TTKA 4NF4A 4RYAA 4R2FA 3K00A 3IJXB 4JWOA 2PT1A 2DXYA 4K3FA 3QSLA 2F36A 1DOTA 4XXUA 4BDLA 4LZ8A 3U94A 4E0XA 3TZAA 1D4NA 2B3BA 3VVFA 1MXZA 3RY3A 3D4CA 3SEXA 4NWDA 3QUJA 5I59B 3EHTA 1OVTA 4F2OA 2Y7RA 3DP6A 4XIGQ 4RK2A 4LZ7A 1EZ9A 4AQ4A 3FJ7A 1IXCA 2Q89A 2OCUA 1NL5A 5L8DA 2B65A 1WDNA 3OEMA 1BTJA 2I3WA 1MXYA 3OSRA 3K0VA 2H9BA 5JK4A 4MLQA 1SW4A 3FD3A 2ONKE 2I3VA 3ZKLA 4C0RA 5H8FA 3U93A 4C1UA 2UXAA 4YICA 1PB7A 4GL0A 3FVOA 3R6UA 4QFKA 4OENA 4KYEA 3RQTA 3P7IA 3QYTA 4KYSA 2VD2A 3MPLA 3RLFE 3O6GA 2GRVA 2XX7A 3QK6A 4ZS9A 1B1XA 2XXIA 1NMUA 2DVCA 1LFHA 4UA8A 5EHSA 2XXTA 3IO4A 2RINA 1O63A 1CB6A 4MBPA 1SI0A 4R2BA 3O28A 4OFOA 2Y84A 5BWJA 3UK4A 5F7VA 1A8EA 1D9YA 4OVJA 1OMPA 2F8DA 3HV1A 2XXHA 2OJTA 3TYHA 3CSGA 1MH3A 2DE4A 2GHBA 4N6PA 3TPAA 4IB2A 1EZOA 1POY1 3C34A 4MFIA 4QRZA 4YU0A 1MY0A 1F9BA 3EPEA 3FXRA 4F22A 1MXXA 1HSLA 4QFPA 1A8FA 3PPOA 2I0BA 1USYH 2HZLA 4GOTA 4I1DA 4ELRA 4LP2B 3VDFA 4F1UA 2ABHA 4JB7A 3FUZA 1RYOA 3FVKA 3FXUA 3M8UA 3K02A 3HN0A 1NNFA 4NF6A 4QFOA 3PGFA 4G77A 4QHQA 4EDPA 3R26A 4DCYA 4R72A 4OZ9A 2RC7A 4R75A 1JNFA 3G3IA 2REJA 2E1SA 2OWSA 4R74A 1MQDA 1FTLA 5DEXA 4YB5A 3CG1A 4LZ5A 1BIYA 3ILUB 3MZBA 4QF9A 1Y4TA 1XVXA 3TQLA 4PP0A 4KCCA 5H8HA 1NKXA 1QUJA 5KDTB 3MZ9A 4BDOA 1DSNA 4Z0IA 1QJMA 1GVCA 1FQFA 2O68A 5DVFA 2FA7A 3GZGA 1QUIA 2QS3A 4XTCQ 3KJ7A 1GR2A 1R6ZA 4U4XA 2VOZA 1ANFA 2A5SA 2BJJX 4YKJA 1JVYA 4ESXA 3IR1A 3UIFA 1FQEA 4R6HA 4QFLA 5HBCA 5FHNA 1AOVA 4KD5A 4RPOA 3KBRA 4X1DA 1I69A 1QKAA 4F29A 1Y3QA 4PFYA 2DOJA 1SVXB 2ZNSA 1LFIA 2RC8A 3IOUA 5FHMA 5K2XA 2DWJA 3G3JA 4IY6A 1J1NA 4UACA 5DVIA 5ELVA 1M5CA 2DP8A 1XVYA 3OELA 1I6BA 2UVGA 5I56B 3OMBA 3IOWA 1NNTA 1VFEA 1ZKBA 3H03A 2QRYA 4ZE9A 1YTVA 3OO8A 5AA4A 5AE4A 3FVGA 3MP1A 4PFWA 4L17A 3MP8A 3ZKKA 2DS9A 2H98A 4GRKA 5I58A 2O7UA 3K1NA 2Z8EA 2YJPA 2OBGA 2PMSA 1LB8A 1WODA 5ICTA 3VLUA 3L6HA 3JV9A 4I9DA 5F1QA 5AA3A 1MQJA 3OXNA 1BLFA 1Y9UA 1P1OA 1B46A 4O3BA 4RY1A 4MH5A 3CFLA 1UQWA 3PMWA 2I4CA 4IY5A 4U21A 2CMOA 4THIA 3C36A 5AA1A 2ZYNA 3IK6B 2Z22A 4PETA 3T22A 1AIVA 1DMBA 4OETA 5TPAB 3RTWB 2V3TA 2ONRA 1T0KA 3MZ1A 3UP9A 2THIA 2F6GA 1VSOA 4HCWA 5DYHA 2F97A 2REGA 1UIUA 3M3FA 3GBAA 2A5TA 3PPRA 2P0SA 5DTBA 2XXYA 2YPNA 3V83A 4ZECA 4GFRA 1H76A 3A3UA 3EN3A 1P1WA 4JSDA 1B3EA 3D4GA 4H8JA 4R6YA 3EHUA 2NXOA 2UVJA 3C4MA 3PUYE 3TODA 2IA4A 3E9XA 4IO6A 3Q29A 4LVQA 5A5XA 3PPNA 3FGSA 4YB7A 2X26A 3OEKA 1B5IA 1Y4CA 5FHOA 4MF3A 3B6TA 3TDJA 4KFQA 3BFUA 4EQ9A 4G2ZA 4H0WA 1Q1KA 4F19A 4ELQA 1MPBA 3IB1A 1L5TA 4ESWA 4ZDMA 1MY4A 2XHDA 2HXWA 3B7DA 4DXUA 3QIMA 3CR9A 2XXQA 1PB9A 1AMFA 2NOOA 4GVOA 3CIJA 2F5XA 3FJGA 3Q28A 5TU0A 4O3CA 1Y3PA 1LGBC 4F39A 2H4IA 3VVEA 5CMBA 1JEUA 1SQYA 3K1MA 3G7WA 3VXCA 5I2NA 1DPPA 1LB9A 3MBPA 4LATA 4F3BA 4U2RA 5CC2A 5H8QA 5H8FB 1OVBA 4AB5A 1LCFA 4LQ2A 3K1PA 1IXIA 4FE8A 3TTMA 3N26A 2Q2CA 4RJZA 4WXJA 2QMWA 1B0HA 2UYFA 1PBQA 3T9VA 2DQVA 5I57A 2PYYA 3FJMA 4G8NA 2Z8FA 2VD3A 4OEUA 3FASA 4OHNA 1ELJA 2RKMA 3K4UA 2H99A 2XXWA 4TLMB 3TKDA 2DE2A 4AB6A 3PMVA 4M4GA 5B7DA 1TT1A 4IGRA 1SI1A 2FNCA 3LUYA 1NH7A 3C32A 2PX1A 1LLSA 4YB6A 2DE3A 4H65A 2ZYKA 4XKQA 4ONYA 3KGCA 1YAEA 3IOTA 4IO7A 4H5GA 3RPWA 5CBRA 4FAJA 2ZYOA 3CFXA 4OQOA 4WEPA 1MM6A 2OZZA 2DWHA 2H25A 1JQFA 1UTHB 1B51A 2AYSA 2HFBA 2OK2A 4KYDA 2AL4A 5EHMA 3N5LA 4R73A 4P11A 3ECRA 2PVUA 1BP5A 3HO7A 1I6AA 4NF6B 4QSDA 4YKIA 3RUMA 4I62A 4OFJA 4U22A 3B6WA 3O97A 4EXLA 2QS1A 3KOTA 5KZTA 3PUWE 1FQAA 3E4RA 3U8QA 3N6UA 2GH9A 4FJPA 2G93A 3ZSFA 5JEIA 1P99A 5DEXB 3H7MA 2HEUA 4POXA 1GGGA 4FEBA 1A7LA 4X48A 1IZ1A 1MQIA 4U1ZA 5H8HB 4Z7EA 3IB0A 3H3GA 5IKBA 1B3FA 3OD7A 5KCJA 3CFZA 1UTHA 1ZMGA 3MC2A 1MY2A 3TAJA 2UVIA 3KG2A 3O2AA 1Y3NA 3VV5A 3CRBA 5K2YA 5CMKA 3I3VA 1POTA 2LAOA 5L9OA 3CG3A 3GLBA 4GIZA 1B5JA 1N76A 1Y20A 5IAIA 1TXFA 5LOMA 3K6UA 4IO2A 1FTJA 1SYIA 1YCJA 4LQ5A 3RNNA 1ZIUA 3Q26A 3BKIB 1URSA 3JZJA 3C33A 3G3HA 4BDQA 3S9EA 2VP1A 5I2KA 4ISUA 2I48A 2D3IA 3T66A 2ANJA 3RN8A 4GLIA 1HSJA 1MRPA 1EH3A 4JSOA 2R6GE 1Y1MA 2HAUA 3KEIA 4G8MA 2UVHA 4RXLA 1FTOA 1B9JA 5AA4B 3S9LC 1MQGA 2F6PA 3T9XB 2QJEA 2QS4A 4H6DA 3KJTA 1MM7A 4WKMA 3IAZA 1QULA 5I58B 1ZBMA 3FZVA 3HCQA 1IEJA 1AH5A 1Z7NE 4Q8RA 4G68B 2XD3A 1MY3A 3TMGA 1MG1A 3MVZA 2AL5A 3VE1B 3H4ZA 3T93B 4YMBA 4F18A 3N94A 4TLLB 1N3XA 4RA1A 4JBZA 1S7YA 4EQ7A 4O3AA 3F11A 1D9VA 2O6AA 1SYHA 1BKAA 2V3QA 5CM6A 4LONB 3IX1A 3HHGA 4JWXA 2ALUA 1OLAA 4GQOA 1PB8A 3OOAA 4DZ1A 2B3FA 5B70A 2DWAA 2ZXTA 4IO3A 1URDA 3MVWA 2ZNTA 2D5WA 1B4ZA 1US5A 4TOZA 1JW4A 2XXPA 1B0LA 3RT6B 3TUSA 4OESA 3IJOB 4ELPA 3SKPA 3OO6A 3MP6A 5AA2D 2XXUA 3KN3A 3BFTA 4G68A 4R6KA 1JEVA 4GXSB 5AA2A 3TTRA 2A5TB 1XS5A 3BBRA 3KFMA 1GTKA 1US4A 3O29A 1OQGA 4GL8A 3R7XA 1P1UA 4HS7A 1B5HA 4BLAA 3CI8A 5I84A 4NE4A 2Y7IA 4LUBA 1SDXA 3UORA 4ZEDA 3OO9A 5ISUA 4G8HA 2PBWA 5A5XB 1D3KA 2Q8JA 3S2VA 4FATA 3KN8A 4P0IA 4ZZAA 3UA8A 3WAEA 4DCXA 1IUDA 4YKPA 1N84A 1N7XA 3S4UA 4F3GA 4I8CA 4X9TA 3USDA 1Q35A 1MS7A 2QMXA 5DVJA 3TELA 4GWOA 1MXUA 1A55A 2V25A 1N3WA 4OFLA 1SW2A 4H67A 1A40A 3HHFA 3K6VA 4EXKA 2DWIA 3EF7A 3G3GA 4ND9A 3MAMA 2Z23A 1SW5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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