2PT1A

Futa1 synechocystis pcc 6803
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
QQEINLYSSRHYNTDNELYAKFTAETGIKVNLIEGKADELLERIKSEGANSPADVLLTVDLARLWRAEEDGIFQPVQSEILETNVPEYLRSPDGMWFGFTKRARVIMYNKGKVKPEELSTYEELADPKWKGRVIIRSSSNEYNQSLVASLVVADGEESTLAWAKGFVSNFAREPQGNDTAQIEAVSSGEADLTLANTYYMGRLLESEDPAQKAIAENVGVFFPNQEGRGTHVNVSGVGVVKTAPNREGAVKFIEFLVSEPAQAFLAQNNYEYPVLAGVPLNKSVASFGEFKSDTTSLDKLGPALAPATKIMNEAGWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport
source organism Synechocystis sp.
publication title The structure of the iron-binding protein, FutA1, from Synechocystis 6803.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron transport protein
total genus 119
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2pt1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2pt1A02
3FJ7A 1MPDA 1A7LA 3H06B 2O51A 2YLNA 4BLAA 2UVHA 5CRYA 3PUVE 5B70A 4TQUQ 2ZYOA 2I58A 4JB7A 4JSDA 1M5EA 3V89B 4KPTA 5H8HA 3K02A 1TXFA 3I3VA 4DZ1A 5AE4A 1NKXA 4HCWA 1MQIA 4OVJA 3UIFA 4IGRA 2THIA 3K6WA 1FQBA 1IIWA 2D5WA 1YCJA 5FTHA 4FIMA 5DT6A 3KZGA 1B46A 3HPIA 4F3GA 3KFMA 1MY3A 2XXUA 1HSJA 1ZIUA 4IY5A 1IXCA 5JTYA 1B5HA 1RKMA 4ELPA 3V83A 1I6AA 3C4MA 4X9TA 1NNKA 4MLVA 2WKYA 4FE8A 4KCCA 4RYAA 4EQ9A 4LZ8A 1SD3A 2XXPA 4YKPA 1MRPA 4GOTA 1GVCA 3GBAA 2VHAA 2XXQA 1OVTA 3PUXE 1SW1A 1LFHA 1AMFA 4NF6B 3H6UA 3OSRA 2QSXA 3FZVA 4GXSB 3K01A 5H8QA 2HQ0A 5L8DA 3H6VA 2V3QA 4PETA 3C36A 2V3UA 4Z0IA 2OWSA 3SETA 4QFPA 1L5TA 1FTOA 2DWAA 3TCGA 3RN8A 3G3FA 4FJPA 1B52A 1I6QA 2XD2A 1II5A 3G3JA 2UVGA 4OEVA 4KHZE 3I6VA 4YB5A 4OFJA 2OZZA 4U1OA 2QS2A 2ZXTA 3SDFA 1ATGA 1MXXA 4H65A 1N76A 1Y9UA 4KI0E 4F19A 4F1YA 1UTHB 1VR5A 3FJMA 4BDOA 2F34A 3V5AA 1R1NA 3N94A 1B7ZA 3N6UA 1SQYA 1PBQA 3SEXA 1B1HA 2ESNA 5I57B 4Z7EA 1H43A 1MXYA 1I6BA 3B6QA 3A09A 4BDRA 4FEDA 2DS9A 4OZ9A 3RUMA 4ZECA 4EF2A 4F22A 1WODA 4ONYA 2PBWA 4Q5TA 4X48A 2XX8A 3JYRA 4JWYA 1IZ1A 1IITA 2F5XA 3KG2A 4EQ7A 4NEDA 4QRZA 1MXVA 3IORA 4HS7A 2Y7KA 4U4XA 1Y4TA 2Q89A 2DE2A 2P2AA 4PP0A 1AH5A 2XX9A 1JW1A 5K2XA 4JWXA 1SYHA 1SI1A 1USYH 1BTJA 3SKPA 3M8UA 4YKJA 4F3PA 4QF9A 1SYIA 2I3VA 2Y7IA 3TFLA 1VSOA 5H8NA 3DLNA 4ELRA 3BFTA 1NH8A 3MP6A 5F1QA 3FUZA 3QYTA 2GH9A 1I69A 4OEUA 5L9OA 1QW0A 2UXAA 3E9XA 3LSFB 4X1BA 1BLFA 1B0HA 1A8EA 1SI0A 2F7BA 3O2AA 1AIVA 5CMCA 1JETA 2F6GA 3O6HA 3A3CA 4KQPA 2VGQA 3SEWA 3VFJA 4IO4A 3MC2A 2QS3A 4H67A 4NWCA 4QSCA 4DLDA 4LVQA 5I58A 3EHUA 3MVXA 3JZJA 3MP8A 4MFIA 3KJ7A 3QK6A 3G3GA 2LAOA 3O6IA 3UP9A 3ILUB 3HCQA 5CMBA 4RK2A 2ONRA 1DPEA 4F39A 4U1ZA 4YKIA 2Q8JA 3UORA 5EYFA 2PT2A 2RCBA 2V25A 4NF8A 3U92A 4RPOA 1Q1KA 1B5IA 4ZEDA 3ZSFA 5ITOA 3S9EA 1DTGA 3HHGA 5TU0A 1AL3A 2R6GE 2ZYMA 3THIA 1OVBA 4EDPA 2OK2A 4QSEA 3Q27A 3D4GA 2ONSA 4JSOA 3A3UA 1ZJLA 3EF7A 4YICA 3RY3A 3HSTA 3E3KA 3IB1A 1D3KA 3VDFA 3K1PA 4DXBA 3BKIB 1PDAA 3H6TA 4QFNA 3KOTA 4GL0A 1XVXA 3O9PA 1LLSA 2B65A 4PFWA 3PV0E 4R2FA 1URSA 4DXUA 3VVDA 3IJOB 4OWDA 4DIGA 1QKAA 2DOJA 1MQGA 4ZEIA 3MUQA 1JW4A 2P0SA 2V3TA 4O3AA 3FVNA 3ODBA 1URGA 1EZPA 5BWJA 3MAMA 3MZ1A 3B6WA 3OD7A 5TPAA 3L6GA 4LONB 3K6VA 4BDNA 1Y3QA 3OO7A 3G3IA 3DP4A 1ZLQA 3DP6A 4YU0A 4QSDA 4LUBA 3D4CA 3FGSA 4LQ5A 3IR1A 3EHSA 2XXIA 3RQTA 3PD8A 4LZ7A 4OERA 1D9VA 5HPQA 3IJXB 3TTMA 3DP8A 1DSNA 3OXNA 5FHOA 4DXCA 1M5CA 4ELOA 4ZEFA 3TQWA 1MPCA 3MWBA 1TWYA 3W9WA 1XOCA 1PB9A 3SEYA 4WKMA 1CE2A 4XKQA 4WEPA 2CZLA 3H4ZA 3TUSA 3EN3A 3FVOA 1XS5A 4R9FA 3T9UA 4IO5A 2DE4A 1EZ9A 3LUYA 2XXXA 4G8MA 3Q25A 4DCYA 1B40A 2XXYA 4GD5A 1FTLA 5AA4B 3AXFA 3QUFA 5FHNA 1TFDA 2GHBA 2HXWA 4LA9A 3EQ1A 3T9HB 1XT8A 2ALUA 3N5LA 1LGBC 5I2NB 2DVCA 2ZYKA 4OTEA 3CFZA 5CMMA 1QJMA 2AL4A 1B9JA 4EF1A 4I8CA 3KGCA 1B0LA 4YZZA 2ZNUA 1RYXA 2F36A 4RY1A 2Q2CA 3C32A 4ZZAA 3IB0A 4UACA 4NF8B 3LSLA 2QMWA 3O66A 1MG1A 2RINA 2RCAA 2Y7RA 4LQ2A 3KJTA 4P11A 5K2YA 3E13X 3FVKA 2X7PA 1B4ZA 3PPNA 2ABHA 1H44A 2UYFA 5I59B 1VFDA 4H5FA 3CG3A 3FV1A 1FQCA 2PX1A 5B7DA 1BKAA 4G68B 2HAUA 3QAXA 4G2ZA 2DQVA 3MW0A 1H3DA 4R9GA 2E0SA 3PPQA 4YAHX 4RJZA 2XXHA 3QIMA 2RC9A 3C35A 3MVWA 4R73A 3FJGA 3H03A 3FXUA 5DVIA 5A5XA 4GXAA 3CRBA 3B6TA 2ONKE 1EH3A 3O6GA 4R2BA 4NF4A 2UYEA 2H25A 3HO7A 1FTMA 3H6WA 2IEEA 3K6XA 4THIA 4NE4A 1Y1ZA 3IOWA 5AA1A 5H8SA 1LFIA 2QMXA 1MQHA 5J1DA 4FORA 1BIYA 1GGGA 4IY6A 5H8FA 3TTKA 2A5SA 1FCKA 2F97A 3ECRA 3ILTB 2I3WA 3TQLA 4GQOA 3CSBA 1N04A 3S9MC 4Q0CA 1IXIA 1SDXA 1B3FA 2DP8A 3K00A 3EHTA 2I0BA 4XIGQ 3CFXA 5KCJA 1MY0A 1NNTA 1OIBA 1J1NA 1JW5A 1GR2A 1B7UA 4PQJA 4KR5A 2QJEA 1MDP1 3EPEA 4NF5B 4QHQA 4OENA 1IQ7A 1LBCA 2A5TB 4F29A 3WAFA 2HFBA 5TP9A 4C1TA 2ZNSA 1IEJA 1P1OA 1YPNA 3Q29A 5I56A 4YMAA 4FATA 1NL5A 5I2KA 3K1MA 1SW4A 3L6HA 4OYVA 5AA2B 4KCDA 1B5JA 1P1UA 3RLFE 4O3BA 4NTLA 2Z22A 3PMWA 1B05A 3PGFA 3IB2A 1ANFA 4MLQA 4H5GA 3OO9A 2O69A 3RNNA 4MF3A 4IGTA 2G29A 2Z8DA 1JQFA 3MP1A 2H99A 1MY1A 4BDQA 1IUDA 3K4UA 3KSXA 4JDFA 3RGYA 4R6KA 2XD3A 1Z7ME 4KYEA 2FYIA 2Q2AA 4Q30B 1OQGA 3IO4A 2I4BA 4H6DA 1CB6A 5H8HB 4DE8A 5FHMA 2PT1A 3TYHA 1ZKBA 3SEVA 1NFTA 3FASA 3LBSA 3G3HA 3U72A 1B2HA 4IO6A 1PBPA 3P7IA 3RTFB 2B3BA 5I84A 2DVZA 3OOAA 5JTYB 2YPNA 4H8IA 4PFUA 3CG1A 2PMSA 4PFYA 2RC8A 1MY4A 1S7YA 4FAJA 4YMBA 3MPLA 5CBRA 2DE3A 1DTZA 1B4HA 2I49A 3B7DA 5CM6A 2ANJA 3RPWA 1OMPA 1DOTA 1B3HA 1M5FA 1A8FA 2GFEA 3VXBA 4I9DA 2NOOA 4N13A 2Y7WA 5H8QB 1LAFE 4RA1A 5KZTA 1R9QA 2NUVA 3ONMA 3QUJA 2Y7PA 4M1VA 1R9LA 5ELVA 3GBBA 5ICQA 3HN0A 4RPNA 1UIVA 4GIZA 1Y3PA 1MM6A 3IK6B 3OENA 3CFLA 5KCJB 3PMXA 4WXJA 3FXQA 2QL3A 4KD5A 3T9XB 2V93A 3JV9A 1FQDA 4EQBA 1H76A 1Z7NE 4KYDA 2OLBA 3O28A 1YTVA 1NNPA 1OQHA 3TEPA 2HZLA 2XXWA 1MM7A 2D3IA 4XTCQ 3FVGA 2Y84A 3HHFA 4XKNA 1NMUA 2RF1A 2O7IA 3ZS6A 1JEVA 2BJJX 5I2KB 1HSLA 1QUIA 4PFTA 1SW5A 5HM4B 1M5BA 4NF6A 4U23A 3ZKLA 3TTNA 1A54A 2UVIA 1P1WA 4G8HA 1ZMGA 4F18A 1N7XA 3RT6B 4G68C 4H1XA 3M3KA 1B58A 1B1XA 1TT1A 2XX7A 1LB8A 1O63A 3OELA 2X7QA 2RKMA 2AIXA 4WEDA 3OO8A 5H8NB 2UVJA 3T9VA 4XXUA 1P1NA 4RK9A 1N84A 4KFQA 4XKPA 2F8DA 4E0WA 2B3FA 3VV5A 4JXIA 1QULA 5DEXA 1UTHA 4GLIA 3CI8A 1TFAA 1P1QA 3O29A 4G8NA 3W9VA 3C9HA 4BDLA 2DSFA 4F2QA 4TOZA 1MQJA 3RTWB 1R6ZA 1XHYA 1FTJA 4POXA 5I58B 2CMOA 2GHAA 4C0RA 4ELQA 2GRVA 4F31B 1ZU0A 2Z8FA 3PUWE 4IO7A 2QS4A 4O3CA 2KLFA 3SERA 1PB7A 4ND9A 3UK4A 2PVUA 1PC3A 1QVSA 1A40A 5EHSA 4GWOA 1ZTYA 5F7VA 4JWOA 2AYSA 3PPPA 1VE4A 4IB2A 2RC7A 4GRKA 4F2OA 4ZE8A 1QUJA 5JEIA 2VP1A 4GL8A 3K1NA 3C33A 1OLAA 5AA3A 2XXVA 3PPRA 4YKKA 1N7WA 4R72A 1LSTA 5CBSA 2DWHA 3F11A 4GVOA 3GZGA 3QSLA 5EHMA 3PMVA 2O68A 4ESXA 3MPKA 4G77A 2I4CA 4DDDA 4UA8A 4F1UA 2Z8EA 2NWJA 3T66A 3E4RA 3BBRA 5DTBA 5IKBA 2O1MA 2I48A 1B3EA 1HSEA 1MH3A 4Q8RA 3IO6A 3MQ9A 3KEIA 4C1UA 3K2DA 4RNSA 5LOMA 5CC2A 1JEUA 3SEUA 4R75A 3FIRA 1F9BA 3UA8A 1P99A 4MBPA 2DXYA 4FECA 4F1VA 2XHDA 1WVJA 2DWIA 2REGA 5TPAB 5FTIA 2Z23A 2H9BA 2DYXA 3QXMA 4AB6A 2VD3A 1SVXB 3TODA 2X26A 5DVJA 4U22A 5KDTA 1KWHA 4M4GA 4QFKA 1A55A 5IAIA 2OCUA 2R71A 4N07A 1NNFA 4I62A 4QFLA 3W15C 1MQDA 3IL1B 1JVXA 1S9TA 2NVUB 1B3LA 1OLCA 1ZBMA 3VVFA 3OSQA 2ZMBA 4YB7A 1YAEA 3FATA 3U1OA 1URDA 1UIUA 4LZ5A 1T0KA 4U2RA 3KN8A 3CIJA 1FQEA 5HBCA 1LAHE 3KSJA 1SW2A 3VLVA 4EUOA 4ZEBA 3O97A 2OJTA 4ZZEA 2O7UA 5DEXB 4OXVA 2HZKA 4QFOA 3FXRA 4PE5B 4N6PA 5DVFA 1XVYA 1O7TA 5ITPA 3S9LC 1MXZA 4L17A 4X1DA 3TKDA 3M3FA 3CSGA 5CMKA 1MPBA 1RYOA 4JBZA 1Y1MA 3KBRA 3VLWA 1MS7A 1ELJA 3I5OA 2M8CA 3TTLA 2G93A 2Q9TA 3FD3A 2QS1A 3HV1A 3M3LA 3SESA 4H8JA 3Q28A 3TMGA 1USYE 1IXHA 1WDNA 4OESA 2PYYA 2FA7A 3UGWA 3N26A 3IOTA 4AB5A 4K3FA 1MY2A 4OHNA 5L9SA 2HAVA 3CR9A 1N3WA 3MVZA 2O1LA 3IOUA 2HCAA 1MXUA 3VXCA 3ZKKA 4TLMB 4XKRA 4E0XA 1POY1 3TCFA 4OETA 4HCYA 2V84A 4ISUA 4GF8A 3K0VA 1LFGA 4R6HA 3TZAA 4RXLA 1M5DA 3R6UA 2E1SA 1D9YA 1A99A 3KN7A 4NMYA 2XXTA 1FW0A 3TCHA 2I6EA 5AA4A 1B6HA 3U94A 4KYSA 1US5A 5A5XB 3T22A 3TPAA 1MXWA 4EXLA 3GXAA 1S50A 1UTBA 3N6TA 4POWA 2OBGA 4NF4B 3TELA 5I2NA 1H45A 2HEUA 3TDJA 4F3BA 3GLBA 3MZ9A 5JK4A 2Q88A 4TLLB 3H3GA 1IXGA 2H4IA 3MVYA 1DMBA 4I1DA 3MZBA 3OEMA 3DM0A 3LR1A 4LP2B 4OFLA 3WAEA 2O6AA 1B7HA 3RT8A 4HTGA 2YJPA 1QKBA 5H8FB 1N3XA 3V8XB 5KDTB 3OO6A 3K6UA 3PD9A 2O84X 4H0WA 5DYHA 5BUUA 1NH7A 1DPPA 3CVGA 1B51A 2DXRA 1GTKA 5CI5A 3LSXA 3OEKA 2W7YA 3PU5A 4OMBA 4R74A 4FEBA 5I59A 5AA2D 4MH5A 4G68A 1FQAA 2DWJA 3PUYE 3LSWA 4F3SA 1Y20A 1GV8A 3S9NC 2ZNTA 3TTRA 2H98A 3MJNA 4IO3A 3BFUA 4HW8A 3C34A 5TP9B 1XC1A 2I0CA 3MBPA 2H5YA 1B3GA 1VFEA 4U21A 5I56B 3VLUA 4ESWA 4G4PA 1N0TA 1LAGE 1AOVA 3OMBA 1PEBA 4YB6A 3FV2A 4LATA 1BP5A 2FNCA 3R26A 3VE1B 3T96B 2P1SA 2F78A 3VVEA 4ZEKA 3IOVA 5M2VA 3S2VA 3S4UA 2AL5A 4R6YA 1POTA 4OQOA 3G3KA 4AQ4A 2D21A 3DELB 3USDA 1D4NA 4OFOA 1LB9A 4P0IA 2REJA 3U93A 1JNFA 2XXRA 3PUZE 1LCFA 4ZDMA 2F7CA 2ZYNA 4ZE9A 4NF5A 2OWTA 2QPQA 3R7XA 3KOSA 4P0GA 3H7MA 3C31A 1B32A 4GFRA 4IO2A 4DCXA 2A5TA 5I57A 2F7AA 2F35A 1LCTA 1MH4A 1JVYA 2R9JA 1MDQA 2F6PA 4EXKA 5ICTA 3PPOA 1O64A 1UQWA 3TAJA 5AA2A 4ZS9A 1SBPA 1Y4CA 3Q26A 2NXOA 4U4SA 1Y3NA 2QRYA 5L9MA 1UTBB 1Q35A 5ISUA 1FTKA 2IA4A 1LAXA 2VD2A 3IX1A 4ECFA 3G7WA 1EZOA 1EU8A 4BDMA 3U8QA 2VOZA 3LC8A 3UN6A 3T93B 1LBBA 1QUKA 1US4A 3IAZA 3KN3A 1PB8A 4NWDA 1FQFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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