3PUVE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 114
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE01
1AL3A 1MG1A 3FXRA 3ONMA 3THIA 1A54A 3ZKKA 1FQDA 1FTKA 4XXUA 3VFJA 4DLDA 3DP8A 4I8CA 2X7QA 4KQPA 1LLSA 1DPPA 2DE3A 3OENA 2H9BA 4JB7A 4LQ5A 4YB5A 3MPLA 3N6TA 4LONB 1TT1A 3MZ1A 2RF1A 3TQWA 4N07A 4G68C 4FJPA 3DLNA 2ZNSA 4PQJA 5DVIA 3VLVA 4FE8A 2XXXA 3K02A 2I0BA 1N84A 1LAFE 3IL1B 3OD7A 1FTLA 3BFUA 4I9DA 1MXVA 1GVCA 4OVJA 5IKBA 5L9SA 3ZS6A 2KLFA 1XS5A 3BBRA 3Q28A 4H5FA 4OZ9A 2HEUA 2V3TA 2ZNTA 2PT2A 4H65A 2RC9A 3W9VA 1B5IA 4NTLA 1S9TA 3CSGA 4Q30B 1MQIA 3CSBA 3E3KA 1FQEA 2Q9TA 3H7MA 1IZ1A 1A8FA 3IX1A 3M8UA 4GD5A 4NF6B 1B0HA 2QMWA 1Y1ZA 2PT1A 3O6GA 4GXSB 1B4HA 2O69A 4NWCA 2THIA 3C35A 1GV8A 3VXBA 4THIA 2H98A 5TU0A 1OLAA 3EN3A 2O7IA 2QJEA 4R9GA 4ZEFA 3DELB 1NFTA 4XIGQ 3U92A 1D9VA 2QPQA 4QRZA 1YCJA 4ZE9A 4I62A 4U23A 2QS1A 4IO4A 2DWHA 3QXMA 2RC8A 3PPPA 5CC2A 5JTYB 4R9FA 4NWDA 4KYDA 3MP1A 3RY3A 1Y4TA 3LBSA 1NNFA 1MQHA 1QUKA 2A5SA 1JW4A 3M3KA 3V8XB 4NE4A 2Q2CA 4ZDMA 5CRYA 4F29A 4ZEIA 4FECA 3DM0A 3KJTA 4PETA 2XHDA 1FQAA 1JVXA 4G68B 4JWYA 4MFIA 4R6HA 2HXWA 2F6PA 3EPEA 2I49A 3IOTA 3MVWA 1B51A 4H5GA 3KJ7A 4QFOA 3C34A 4C1UA 2O1MA 4EUOA 1ZJLA 3A3CA 1HSJA 1B6HA 3EQ1A 3SEXA 3MVZA 4OWDA 2O7UA 3FATA 1F9BA 4YAHX 3LSXA 2YLNA 4F3GA 2I58A 4GF8A 5EHMA 1SQYA 4IB2A 3VDFA 4IO3A 4EF1A 1B7ZA 1II5A 3TAJA 4GOTA 1MH3A 1TFAA 2O1LA 1SW5A 1LFHA 4U4XA 3KOTA 5DTBA 3JV9A 2Q88A 3K1PA 5H8QB 1UTHB 2VD3A 2F78A 4AB6A 1RYOA 1LBCA 1MXYA 2PX1A 2ONKE 4H0WA 1D9YA 4MLVA 5AA1A 4F3PA 1H76A 2Y7IA 3BKIB 4BDMA 2NUVA 3MC2A 1SDXA 3QIMA 1B5HA 5DVJA 1EZ9A 1UIUA 1B9JA 1US4A 4KPTA 4R6KA 4X9TA 1Y1MA 1B46A 3FXUA 3S4UA 2XD3A 2XXVA 4K3FA 4JXIA 1O7TA 2GH9A 4NF5A 2ZYMA 3K01A 3MVYA 4KYEA 4G2ZA 4UA8A 2OWSA 4H1XA 1NMUA 1MPDA 5A5XB 1IXGA 1N7WA 2UVHA 3ILTB 4Q0CA 5I2NA 4O3BA 3TODA 5H8NB 2I48A 4LVQA 3Q27A 3TCFA 1JQFA 5H8NA 4NF8A 5H8HB 3FV1A 3UK4A 3TCGA 2IEEA 3IOVA 1B0LA 4ZS9A 2ZYKA 2XXUA 4FEDA 4NF6A 1O64A 4HCWA 4XTCQ 5AE4A 2G93A 1B52A 1QUIA 3S2VA 4GQOA 4M1VA 2P0SA 1LB8A 1XOCA 2OK2A 4POXA 3E4RA 3PUXE 5A5XA 1LAGE 3VVDA 3ODBA 5I57A 3FASA 3HO7A 4OEUA 5I58B 1UIVA 5EHSA 1FTOA 3H6VA 1R9QA 3N26A 2DP8A 4L17A 4P0IA 1AMFA 3FVKA 1FTMA 4U2RA 3TQLA 5LOMA 2XXYA 3O2AA 4QF9A 1Q35A 4JBZA 4IGRA 4YICA 3SEUA 2QS2A 4YMBA 5I2KA 4QFKA 2Z8DA 3FJGA 2X7PA 3LSLA 2D5WA 5H8SA 5AA2B 4EQ7A 2QS3A 2RCBA 4GXAA 4PE5B 3FD3A 1YTVA 5M2VA 3RT8A 4RXLA 3T66A 1MY1A 1CE2A 1ZLQA 3C32A 4OETA 1D4NA 3R6UA 4LP2B 3KEIA 3PMWA 4XKQA 1A55A 5ITOA 1BIYA 2ZYNA 1FCKA 2DS9A 1OLCA 3D4GA 5CI5A 5L9MA 3WAEA 1N3WA 4OTEA 1B40A 2AYSA 2H25A 4JWXA 4ZEBA 3CIJA 4HS7A 2XXRA 1GTKA 4F3BA 4R2FA 3VLWA 3VVFA 4QFLA 4ELOA 1MQDA 1SYHA 3M3LA 4NF8B 3T9XB 2A5TB 1Z7ME 3T9HB 3IAZA 4MLQA 1IXHA 3PMVA 1URGA 2QMXA 3G3IA 2AIXA 1A40A 3HHFA 4ONYA 1UTBA 4ELRA 3S9EA 2ABHA 3OO9A 1QVSA 5L8DA 3IB2A 1PB7A 4DXUA 1MS7A 2Q89A 4EDPA 3CR9A 2W7YA 3FV2A 3KZGA 3IJXB 5CMKA 1P1WA 1HSLA 3V89B 4QSDA 1RKMA 4E0XA 1QKAA 1MY3A 1Y20A 3CG3A 2OWTA 2XXPA 3DP6A 3MUQA 4KCDA 4MH5A 5H8HA 4F2QA 1I6QA 4HW8A 5DEXA 3CG1A 5B7DA 2NXOA 1N76A 3PPRA 1MXXA 2XX8A 3MP6A 4UACA 5KDTA 1VFDA 5KZTA 2OBGA 3OXNA 4TLLB 1FQFA 2P2AA 4IY5A 1JETA 4X48A 3M3FA 2A5TA 4F1UA 1P99A 1ANFA 3RTWB 3GBAA 2D3IA 3O6IA 4TQUQ 3USDA 4F2OA 4KI0E 5J1DA 4YU0A 1MQJA 2O84X 2Y7KA 2YJPA 3KFMA 4JWOA 4LA9A 5H8FB 1SVXB 2O6AA 3K00A 1B4ZA 4PFYA 4PFUA 3MQ9A 4YKPA 4BDOA 4GL8A 3L6GA 2CZLA 2F97A 4LQ2A 2XX7A 4Z0IA 1IXCA 5L9OA 4GRKA 4HCYA 3OMBA 2HCAA 4DE8A 1T0KA 3VLUA 1DTZA 4QSEA 3RUMA 1WODA 1P1NA 3O9PA 1LFIA 1B1HA 1P1QA 1US5A 3IR1A 2DE2A 3L6HA 3PUZE 5FHNA 1DMBA 2F6GA 4RPNA 1OQGA 3GBBA 1WVJA 3LC8A 2HAUA 4DXBA 4R6YA 1A7LA 1DOTA 2IA4A 3C31A 1MDQA 3H6WA 3P7IA 1D3KA 3TTLA 3S9MC 2V25A 1QW0A 5I58A 1R6ZA 5TPAA 3TTRA 4EQ9A 4G4PA 1S50A 3KBRA 1DSNA 2D21A 2PYYA 4R2BA 2AL4A 4O3AA 1MXZA 1PB9A 3K0VA 1DPEA 4POWA 2Q8JA 1SW4A 2OZZA 4GWOA 2Y84A 4EF2A 2QRYA 5AA2A 2I3VA 4F18A 2GRVA 3F11A 1B5JA 3A09A 1Y3PA 3MZ9A 1Y3QA 5I56B 4U21A 1UTBB 2F7BA 2UVJA 4YKKA 4F3SA 4TOZA 1MRPA 4ZZEA 1POTA 3IB1A 4OERA 1XHYA 1ZKBA 2F35A 3S9NC 3GLBA 3OEKA 4GL0A 2DWAA 5CMCA 4H8JA 4JSOA 3TTNA 2O68A 2Y7WA 2Z22A 3PD9A 1M5EA 5TPAB 5TP9A 3PGFA 4OMBA 2NWJA 3T96B 2DXYA 2QL3A 1LAXA 1OQHA 2Y7PA 1PC3A 3G3HA 4MBPA 3U1OA 1JW5A 4ESXA 2DYXA 2YPNA 4FORA 4G8MA 5IAIA 2UXAA 4YKIA 3T22A 3MP8A 3V5AA 2PMSA 1N7XA 1FTJA 4R73A 1TXFA 4RY1A 3TFLA 4F22A 4U1OA 2F34A 5F7VA 1AOVA 2ONSA 3QYTA 2I0CA 2FNCA 4RK9A 3HSTA 3HHGA 1JW1A 4LATA 3H6UA 1TWYA 1OVBA 4IO7A 4C0RA 1JEUA 3C36A 4IO2A 5ELVA 4DZ1A 1OVTA 3BFTA 2ZYOA 2VGQA 5I57B 1Y9UA 3KG2A 2I4CA 3MZBA 4RJZA 4DCYA 1VR5A 4YB7A 3FIRA 5TP9B 3I3VA 1YAEA 4P0GA 2ZMBA 5FTIA 4C1TA 3O29A 1VE4A 1BTJA 3IK6B 5I2KB 2R71A 1MM6A 4G68A 4G8HA 4N13A 2UVGA 3PUWE 4OYVA 2F36A 3H6TA 1O63A 5DT6A 3MPKA 3QAXA 4RA1A 4RK2A 1USYH 1ZMGA 1XVXA 1EU8A 1HSEA 2XXHA 2XXIA 3C33A 3LUYA 4GVOA 1QJMA 2AL5A 1L5TA 3PUYE 4Q8RA 1H45A 4OESA 2FYIA 2M8CA 1MY4A 4IO5A 5B70A 2H4IA 1EZOA 3PU5A 2ESNA 5JTYA 1A99A 3PV0E 3I6VA 1EH3A 1B32A 3OO7A 1R9LA 2FA7A 2R9JA 3O97A 3RQTA 5DVFA 4WXJA 5ICTA 3FUZA 3KN7A 4G77A 1BP5A 3Q25A 4FEBA 4YZZA 3TYHA 4DIGA 3UORA 4X1DA 5F1QA 1PEBA 1GR2A 5FTHA 3OSQA 2Z23A 2REGA 3C9HA 5CBSA 2B65A 1TFDA 3LSWA 3MWBA 4F1VA 2V84A 1POY1 4P11A 3R7XA 1I69A 3FGSA 3C4MA 3T93B 4Q5TA 2NVUB 2OCUA 3U72A 1NNKA 1MDP1 1P1UA 4DCXA 5I59A 4EXKA 4KYSA 1IQ7A 5ICQA 1FW0A 4R72A 4RNSA 2RCAA 3R26A 2RKMA 2XXQA 4U1ZA 1LCFA 3OEMA 2XXWA 4LUBA 1MY0A 4AB5A 3FVGA 3O66A 1LGBC 4ZEDA 1NNTA 1NH7A 2P1SA 4XKRA 1ZBMA 2R6GE 2B3BA 3FJMA 3UP9A 2PBWA 3O6HA 4DXCA 3HN0A 3UA8A 3MW0A 1OIBA 4G8NA 4RPOA 4U4SA 2F7CA 5FHMA 4F1YA 1IXIA 5I84A 3TMGA 4H6DA 4GFRA 1PBQA 4KFQA 4H8IA 4O3CA 4ZEKA 5H8FA 3SEVA 1H43A 4ZECA 5I59B 2V3UA 1PDAA 3T9VA 1ATGA 3TCHA 3U94A 2REJA 4AQ4A 5CBRA 1B7UA 2V3QA 2WKYA 1N04A 1IITA 3FJ7A 1B3HA 4NEDA 4XKNA 1SW1A 4E0WA 4PFWA 1XC1A 3N94A 3K6WA 3QUJA 1SYIA 1KWHA 2ALUA 3A3UA 5HM4B 4NF4A 5AA4B 1JEVA 1VFEA 1XT8A 1ZIUA 2ANJA 3K1NA 3LR1A 3H4ZA 3CRBA 3FVOA 3D4CA 1URDA 4WEPA 3QSLA 4OFOA 3RNNA 4OHNA 3SKPA 3U93A 1NL5A 1JVYA 3K1MA 3PUVE 3IOWA 3PPQA 3IOUA 4JSDA 3SDFA 3KN3A 3IO6A 1WDNA 2B3FA 1M5BA 3JYRA 3ZSFA 1UQWA 5CM6A 3V83A 1EZPA 2DVCA 4WKMA 1I6BA 2ZXTA 3W15C 2XX9A 3KN8A 3FVNA 5JEIA 4YB6A 4ND9A 3K6VA 3GXAA 3K6XA 3OOAA 1MY2A 4IO6A 3RGYA 5K2XA 3RLFE 3TTMA 4BDQA 2RINA 3LSFB 3PMXA 4LZ5A 3TDJA 4F39A 1A8EA 1MXWA 1SD3A 2PVUA 4M4GA 1UTHA 2HFBA 2VOZA 1B3FA 1MPCA 1NKXA 3HCQA 3QUFA 2HZLA 3VXCA 2GHBA 3ZKLA 1QKBA 1ELJA 4EXLA 3EF7A 2DSFA 2O51A 2Y7RA 1B3GA 4IY6A 4LZ8A 1MQGA 1LBBA 1FQCA 3MAMA 4QFPA 4ECFA 2DWIA 1B58A 1MM7A 4FIMA 1IIWA 2UVIA 5HPQA 3GZGA 4QFNA 1N3XA 4GIZA 3Q26A 1NH8A 4YKJA 1FQBA 1SI0A 3N5LA 4RYAA 5HBCA 3MVXA 3CFZA 3OO6A 3VV5A 2LAOA 4BDNA 3B6TA 3IB0A 4ISUA 1LSTA 3TTKA 1S7YA 3ILUB 4KR5A 5BWJA 1BLFA 1P1OA 1NNPA 2E1SA 2DXRA 3VE1B 4NMYA 3PPOA 5FHOA 4OXVA 5DYHA 4OFJA 3RT6B 1MH4A 1MXUA 2DE4A 1H3DA 3IO4A 4FAJA 1BKAA 2E0SA 4Z7EA 4MF3A 3KSXA 5KCJA 1SBPA 2UYFA 2I4BA 2Z8FA 3FZVA 4OEVA 4U22A 1M5DA 5KCJB 3B6WA 2HZKA 1IUDA 3G3KA 1XVYA 4IGTA 2NOOA 4NF5B 2VP1A 2DVZA 3WAFA 2XD2A 2DWJA 3KGCA 4I1DA 3HPIA 4NF4B 4R75A 5AA4A 1USYE 1B3LA 1YPNA 3IORA 1I6AA 3SETA 3G3GA 5I2NB 3PD8A 3EHTA 1VSOA 2ONRA 3O28A 3MBPA 2CMOA 4KD5A 4QHQA 3RN8A 2F8DA 5AA3A 4HTGA 3S9LC 5BUUA 1Y3NA 3H3GA 4JDFA 3CVGA 1LB9A 1QUJA 3RPWA 4ESWA 4LZ7A 5JK4A 1B2HA 1SW2A 1N0TA 1Y4CA 3QK6A 4ELPA 3TKDA 2H5YA 1OMPA 4TLMB 5K2YA 1SI1A 4OENA 2H99A 4XKPA 4BDLA 3UIFA 2OLBA 1PBPA 2QS4A 3JZJA 3N6UA 1LFGA 5CMBA 3TPAA 2VD2A 4R74A 4BLAA 1IEJA 2F7AA 3K2DA 2UYEA 4H67A 3TUSA 3B7DA 4N6PA 3EHSA 1Q1KA 1MPBA 4EQBA 1AH5A 3DP4A 3K4UA 4F19A 4GLIA 3G3FA 4X1BA 2HAVA 4OQOA 3T9UA 3TZAA 4PP0A 4ELQA 4KCCA 3SEYA 2I6EA 1B1XA 1LAHE 3PPNA 1R1NA 2DOJA 1PB8A 2G29A 2Q2AA 2Z8EA 4ZE8A 3W9WA 1CB6A 1QULA 3CI8A 4FATA 1M5CA 4KHZE 2I3WA 3IJOB 5EYFA 3E13X 1JNFA 1H44A 3CFLA 3KOSA 2VHAA 3VVEA 3ECRA 1GGGA 3Q29A 1AIVA 2HQ0A 3KSJA 2GHAA 3B6QA 5KDTB 3OSRA 4YMAA 3EHUA 3TEPA 5DEXB 2XXTA 3OO8A 3RTFB 4PFTA 3CFXA 1DTGA 2F5XA 1B3EA 3G3JA 3SESA 3FXQA 3OELA 1ZU0A 4QSCA 1B05A 2V93A 5CMMA 2QSXA 5I56A 2RC7A 3I5OA 5AA2D 1URSA 1J1NA 2GFEA 3E9XA 3UGWA 3MJNA 4BDRA 4ZZAA 3TELA 5ISUA 4OFLA 4WEDA 3U8QA 1ZTYA 3K6UA 4F31B 3AXFA 2ZNUA 3HV1A 3G7WA 3SEWA 3UN6A 1B7HA 1LCTA 3SERA 2BJJX 3H06B 5H8QA 3H03A 5ITPA 1RYXA 2DQVA 1Z7NE 2OJTA 2X26A 1M5FA 4DDDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1AL3A 3OENA 4LQ5A 3MZ1A 2RF1A 4G68C 4FE8A 3K02A 3IL1B 1FTLA 3KC1A 3ZS6A 3BBRA 4H5FA 4MNIA 4NTLA 3H7MA 2QMWA 3O6GA 3C35A 4GBWA 1NV6A 5TU0A 4R9GA 4ZEFA 3DELB 4XIGQ 1D9VA 4ZE9A 1IMDA 4U23A 2DWHA 3QXMA 1FPFA 5CC2A 4DI4B 1MQHA 2A5SA 2Q2CA 5CRYA 4R6HA 3KJ7A 4QFOA 4EUOA 1HSJA 3SEXA 2O7UA 4GX4A 5IZ3B 1B7ZA 3TAJA 1MH3A 3MYUA 2O1LA 1SW5A 3JV9A 2Q88A 2FBPA 2VD3A 4MLVA 2PX1A 4XFEA 5AA2A 5AA1A 5LDZA 1H76A 3BKIB 1UIUA 1B9JA 4OVPA 2XXVA 4KYEA 2WYKA 1IXGA 2I48A 3TCFA 3UK4A 3TCGA 4ZS9A 5AE4A 5A5LA 4M1VA 1LB8A 3PUXE 4NF0A 1FTOA 3H6VA 4L17A 4P0IA 2DP8A 4N91A 4U2RA 1JP4A 5LOMA 4QF9A 4JBZA 4YICA 2QS2A 2D5WA 5AA2B 4EQ7A 4GXAA 2OWZA 4HXVA 5ET5A 1ZLQA 3R6UA 4LP2B 3KEIA 3U65A 4MIJA 5CI5A 1N3WA 2H25A 4JWXA 4HS7A 1SYHA 2Y5KA 3M3LA 2A5TB 3IAZA 4MLQA 1IXHA 2QMXA 4OVQA 4DXUA 1MS7A 3CR9A 5CMKA 3IJXB 1HSLA 4GWZA 3V89B 1RKMA 1MY3A 3MUQA 4MH5A 3CG1A 5KZTA 2P2AA 4IY5A 4I40A 3M3FA 1ANFA 3RTWB 3GBAA 2D3IA 4TQUQ 1MQJA 2Y7KA 4ELOA 3MQ9A 4O7IA 2CZLA 2XX7A 5L9OA 4HCYA 3OMBA 1US5A 1DMBA 5FBPA 4R6YA 1A7LA 2IA4A 3C31A 3P7IA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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