3PUVE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
total genus 114
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE01
1B6HA 5AA3A 3BBRA 5JTYB 3IOTA 2RC9A 1NNPA 1BTJA 1MS7A 4U22A 5H8NA 4NWCA 3OEMA 1N3XA 3C9HA 1UIUA 1XVYA 3G3KA 4ZEFA 4LATA 3MP6A 1EZ9A 1I6AA 4F1VA 3K0VA 2X26A 4GWOA 3UK4A 4LVQA 1WDNA 4FE8A 3VLVA 1R1NA 4H1XA 3O28A 4YAHX 3ODBA 2DQVA 3R6UA 4HS7A 5I56A 1URGA 5FHOA 2QJEA 2B3BA 1SQYA 4FIMA 3MP8A 3FZVA 1ANFA 1OVBA 4KI0E 1N84A 3C32A 1ZJLA 5I2NA 5H8HB 3E3KA 3VVEA 4LONB 2RC8A 1PC3A 3FXUA 2UVGA 4R2BA 1A55A 3GBAA 5I57A 1UTHB 4F1YA 3OELA 2Z22A 4YB7A 4ZECA 5AE4A 1FQCA 1QULA 1DPPA 2QMWA 4RJZA 1NH8A 3FD3A 1FTMA 1I69A 3IB2A 1B52A 3EQ1A 4GQOA 3TODA 1BIYA 2XX9A 3I6VA 3LC8A 4U1OA 4KYSA 1LFGA 3OEKA 4C0RA 2AYSA 5CBRA 4I9DA 2OZZA 1XT8A 2F7AA 4F22A 3O29A 3W9VA 2DE2A 3PPOA 3PPQA 3C35A 4NF8B 4ZEBA 3FV1A 3DP8A 3OENA 2OWTA 1JW5A 1FCKA 3VDFA 2Q2AA 1LBCA 1A8EA 2F6PA 4QFPA 2X7QA 5H8NB 3C4MA 3KOSA 3H03A 2B65A 4QSDA 1KWHA 4OXVA 2F34A 4XIGQ 2XHDA 4KYEA 3ECRA 3UGWA 1JEUA 1B7HA 4NF5A 3TDJA 3CFZA 4KPTA 3FXRA 4JBZA 4FATA 3D4GA 2F7CA 1LSTA 4G8NA 4GL0A 3PPRA 2ZYMA 1RKMA 2O69A 1YTVA 5BUUA 3RGYA 1BKAA 4N6PA 3VFJA 4TQUQ 3P7IA 1ZTYA 1B3HA 5DVIA 3SKPA 3MAMA 3SETA 5AA2A 5I56B 2ONRA 3PGFA 3O9PA 2ANJA 1UTBA 2NVUB 3PU5A 3FVGA 1RYXA 3GZGA 2YJPA 2O68A 4F3SA 3PV0E 4BLAA 4I8CA 2B3FA 1PB9A 1MXZA 1MH4A 4OWDA 1LCTA 4QSEA 3I3VA 4OTEA 4QFLA 3TCGA 3HV1A 4FECA 1ZKBA 4QFOA 4LUBA 2XXTA 3FVKA 3E4RA 3MVWA 4P0GA 3MZBA 2UVJA 1B3EA 3OO8A 1EU8A 2QS2A 2OCUA 1B46A 1OMPA 1MM6A 1POY1 2OK2A 5ITOA 2VOZA 1LB8A 2DE3A 5FHMA 3VLUA 2XX8A 4EF2A 2PMSA 3A3CA 4AB5A 1B1XA 1IIWA 4IB2A 2XX7A 3C36A 3PMWA 4JB7A 5H8FA 4IO6A 4MF3A 4OEUA 2ESNA 3VXCA 2OBGA 3V5AA 3U1OA 3CIJA 3MVYA 5DYHA 2HAUA 1MXXA 4LQ2A 3B6WA 2XXIA 4F2OA 4IO4A 5I2KB 2OWSA 3RQTA 4NTLA 1I6BA 4Q5TA 4DLDA 4HW8A 3C33A 1JW1A 3B6TA 3K01A 1LFIA 5KCJA 4ZEIA 2P2AA 1SYIA 3PD9A 3EHTA 3PUXE 1B4HA 2I0CA 1MXWA 3HN0A 2AL5A 3B7DA 2DP8A 1B2HA 2ZMBA 2ONSA 1NNTA 5LOMA 4TOZA 3RT8A 3KJ7A 3LSLA 4LZ5A 3LSFB 3S9EA 2F8DA 3T66A 5AA2B 3QIMA 1PB8A 2P0SA 3N26A 1QUJA 2DWJA 3FJGA 1SBPA 3RN8A 4MLQA 2RC7A 1UTBB 3FJ7A 4C1TA 3EN3A 1OLCA 2H4IA 5ISUA 3FVOA 3MUQA 4NEDA 2XD2A 4TLMB 1B7UA 2ZNSA 4F31B 3N5LA 3GLBA 2XXPA 1B5HA 1B3LA 4IO3A 4RPOA 4EQ9A 3G3IA 4QRZA 3H06B 4QF9A 1T0KA 2LAOA 2ZYOA 1Y20A 5L8DA 5H8QB 2REJA 5ITPA 1D4NA 3F11A 5AA4B 2UYEA 1B51A 3DP6A 1BP5A 4H65A 1TXFA 1Y1MA 4G77A 3ILTB 4DCXA 1XC1A 3A3UA 3N6UA 5B7DA 1XHYA 2RF1A 3K00A 4F39A 3UN6A 4F3BA 1NFTA 3H7MA 2O51A 1VFEA 5I58B 2Y7WA 1MXVA 1QUIA 3A09A 1MPDA 4GRKA 4F3GA 3H6TA 4LZ8A 4POXA 1MPCA 5CMCA 3TEPA 2XD3A 1NNKA 3USDA 3ZSFA 2R9JA 3MPKA 4KD5A 3MBPA 3TELA 2ZYNA 5JEIA 4R75A 3FJMA 1O63A 5L9SA 2O84X 2W7YA 1A8FA 4MFIA 3S9NC 1MQJA 4XKRA 4ZE9A 1Y1ZA 2Q8JA 3IORA 3OXNA 2F7BA 2Q9TA 3DP4A 4U23A 3DM0A 1USYE 2V3QA 2O1MA 2IEEA 1XVXA 3HHGA 3DLNA 4EF1A 3RTFB 3OO7A 1H76A 2QPQA 3BKIB 4Z0IA 3HO7A 5K2XA 2H5YA 2H9BA 4DIGA 4X48A 3RT6B 2V3UA 3TTLA 5DEXA 3IB1A 2HFBA 5L9MA 3VVFA 4GOTA 2QS4A 4DXCA 2V93A 4YB5A 2ZNUA 5HPQA 3T9XB 1AIVA 2OJTA 2GHAA 4U21A 5FTHA 4KHZE 1FQFA 1OVTA 2RKMA 3TMGA 1SI0A 1ZLQA 2DE4A 1TFDA 4R73A 3H3GA 4JXIA 3SEUA 1B3GA 3BFUA 1M5BA 3SDFA 2F5XA 3O6IA 2XXVA 2A5TB 3FASA 4HTGA 4WXJA 4H8JA 3MVZA 1EZPA 2DVCA 1JW4A 1Z7ME 3TFLA 3QSLA 4OENA 4ND9A 3H4ZA 1YCJA 1S9TA 4JSOA 1Q35A 4BDRA 1P1WA 4E0WA 3S2VA 1ATGA 1UQWA 3EHUA 2DVZA 4UACA 1FTJA 2G93A 5I59A 1H45A 4ZDMA 2V84A 3OOAA 3Q29A 2I49A 4UA8A 2CMOA 2X7PA 1YPNA 3K6XA 3K1MA 3D4CA 3Q26A 1LFHA 4O3CA 3LSWA 2VGQA 4GFRA 2RCAA 2UVIA 3U93A 3TKDA 2PYYA 4MBPA 1B3FA 5JK4A 2I6EA 3THIA 3C31A 1EZOA 2DXRA 3RNNA 1Y4CA 4IO7A 4YB6A 2HZKA 4F18A 1MY2A 4Q8RA 1QW0A 4RA1A 5DTBA 3N6TA 2QMXA 2XXYA 1LGBC 1MRPA 1MXYA 2WKYA 5CM6A 1GGGA 4PP0A 3MJNA 1ELJA 2UVHA 4R6KA 1QKAA 4R9FA 2I4BA 2DS9A 3G3JA 5CRYA 4XXUA 2DXYA 5FTIA 3VLWA 1B1HA 1WODA 4G2ZA 4OFOA 1M5DA 1A99A 2Q89A 4QFKA 3PUZE 5TU0A 2QS1A 1SW1A 1M5FA 3M3KA 1VSOA 3LR1A 5ICQA 4NF6A 4EUOA 3Q27A 2O6AA 5I2NB 4X1DA 4EQ7A 4F19A 5AA2D 2VP1A 4F3PA 2QS3A 4JWYA 2F35A 3UA8A 1A7LA 1B4ZA 3PUYE 3S4UA 5I57B 3CG1A 1XOCA 1DSNA 3FUZA 4P0IA 5B70A 4O3BA 3KGCA 3T9UA 3H6UA 4F1UA 4ZZAA 1OQHA 2OLBA 1P99A 4HCYA 4R72A 2PBWA 4Z7EA 5F1QA 2I0BA 3IL1B 1SDXA 4JWOA 3M8UA 2DWAA 3QAXA 5I59B 1MG1A 2A5SA 4NE4A 4OQOA 1NMUA 1H43A 1SW4A 2DYXA 4OYVA 2PT2A 4GD5A 1XS5A 3WAEA 2FA7A 4AQ4A 2O7UA 4MLVA 5H8SA 2RINA 4NF4A 1R6ZA 1SI1A 3V89B 4M1VA 1HSJA 2XXRA 5ICTA 3HHFA 4U4XA 3VE1B 1B9JA 4RK2A 2DOJA 1Z7NE 3TPAA 4PQJA 4FJPA 1B7ZA 3CSBA 1YAEA 2R71A 3PMXA 2DSFA 2D3IA 2YPNA 3UIFA 3T22A 3R26A 1Q1KA 4NF5B 3EPEA 3CVGA 1Y9UA 3CRBA 3PMVA 3CI8A 4K3FA 2Q2CA 2R6GE 4PE5B 1MPBA 3MVXA 1Y3QA 1F9BA 1US4A 3K1PA 2KLFA 2NXOA 1B5IA 1MY0A 4JDFA 4RYAA 4XKQA 3PUVE 3RUMA 4XKNA 4JWXA 1TWYA 4XKPA 2QL3A 1JEVA 2FNCA 1LLSA 3K1NA 1USYH 4WEDA 1MM7A 4R2FA 1N76A 1PBPA 3TZAA 5KDTA 3IX1A 4PFYA 3KOTA 4IO5A 3ZKKA 2Z8FA 2HEUA 3KJTA 3TQWA 5CBSA 3U8QA 5F7VA 3SERA 4YKJA 3O6HA 1LAXA 3QXMA 4OMBA 4H67A 1B0LA 4KCDA 4KQPA 3LBSA 2Z8DA 4Q0CA 2PT1A 1S7YA 3KG2A 5M2VA 4R6HA 1UTHA 3H6WA 4R6YA 3CR9A 3VV5A 3G3FA 1NKXA 5AA1A 5IKBA 4LP2B 3TAJA 4RXLA 3IR1A 4GXAA 3IK6B 3JV9A 2HAVA 4DE8A 3VXBA 3PUWE 2ONKE 4LQ5A 1TT1A 1SVXB 2D21A 4DDDA 2G29A 5H8FB 5TP9A 4M4GA 4GVOA 1I6QA 1JQFA 1MXUA 3OO9A 3FV2A 3FGSA 3IB0A 2O1LA 4NF4B 4G8HA 3OSQA 2F97A 1A40A 5DT6A 4ESXA 1LAGE 4QHQA 4U4SA 2ALUA 2HXWA 4G8MA 4G68A 4H8IA 4ELRA 4U2RA 5EYFA 1US5A 2D5WA 1JVYA 4N13A 4MH5A 3O6GA 4NF8A 3RTWB 5KCJB 1VFDA 4ONYA 3C34A 1PDAA 5CC2A 3QYTA 1QJMA 4YKIA 3JYRA 4JSDA 2CZLA 2Y7RA 3K02A 2PVUA 1P1UA 4RNSA 1WVJA 4YICA 2GHBA 4ZZEA 4FEDA 3UORA 2RCBA 4WEPA 1H44A 4ZE8A 3EF7A 1MQHA 4GXSB 4KFQA 1B5JA 2REGA 1SW5A 1N0TA 5HBCA 3SEVA 1FTKA 4IY5A 1POTA 2VHAA 3CG3A 3FXQA 2YLNA 1M5CA 2GFEA 1AMFA 3MZ1A 4ZEDA 3PPNA 5KDTB 3TTNA 1A54A 5ELVA 4DCYA 1FQDA 3KSXA 2XXHA 4RK9A 1H3DA 1O64A 3L6HA 5J1DA 2I3WA 3KBRA 3SEXA 1FQAA 1R9LA 1DPEA 3W15C 4H6DA 2Y7IA 3V8XB 3G3HA 2AL4A 1B0HA 1P1NA 1AL3A 2XXXA 4QSCA 4TLLB 4IY6A 3BFTA 2FYIA 3UP9A 1IXCA 3KN3A 3KEIA 5FHNA 1UIVA 1QKBA 1GTKA 2NWJA 4G68C 5TP9B 3T9HB 1D3KA 1B05A 3Q28A 1MY4A 4H5GA 1HSEA 2HZLA 1RYOA 1PB7A 3HPIA 1FTOA 3IOWA 3AXFA 5CI5A 4OETA 3CSGA 4L17A 1SYHA 4R9GA 5EHSA 3M3FA 1Y3PA 1MQIA 4FAJA 2Z23A 3IOUA 1ZBMA 4G68B 1ZU0A 1HSLA 4FEBA 4O3AA 1IXHA 1ZIUA 1LCFA 3GXAA 4EXLA 2ZYKA 4EQBA 1URSA 3ONMA 5I2KA 5L9OA 1L5TA 2P1SA 4NWDA 1OLAA 1FQEA 2F36A 3IJOB 5EHMA 1SW2A 4BDLA 4RPNA 2HQ0A 4H5FA 1S50A 3U94A 2V3TA 4DXUA 1LB9A 5DEXB 4Q30B 1Y3NA 4IO2A 4ZEKA 3U92A 4XTCQ 3IAZA 4F29A 4POWA 3HSTA 2I58A 1IXGA 3K2DA 3RPWA 2Y84A 3PPPA 3K6WA 2NOOA 1FW0A 2O7IA 3FATA 1BLFA 3G3GA 1LBBA 3LSXA 2H99A 2H25A 4BDMA 1URDA 4YU0A 1SD3A 2HCAA 4OESA 3TYHA 2DWIA 2QRYA 2Q88A 1VR5A 2QSXA 1DTZA 4ELOA 1ZMGA 1PEBA 4N07A 2VD3A 4GL8A 1MQDA 3IO4A 4EDPA 3ZS6A 2XXUA 1IXIA 3K6UA 3S9LC 5A5XA 1GR2A 4G4PA 2I48A 3QUJA 4ISUA 4GIZA 4OHNA 3HCQA 3B6QA 2I3VA 1GVCA 4YMAA 2GH9A 1JNFA 1GV8A 3KN8A 3ILUB 3MP1A 4P11A 5DVJA 5DVFA 3CFLA 4KCCA 3JZJA 1JVXA 3TTKA 3TTRA 1B58A 1N7WA 5H8QA 3KFMA 1MDQA 1NH7A 4BDOA 1JETA 4DXBA 4X9TA 5AA4A 4EXKA 4ECFA 4LZ7A 2M8CA 3VVDA 3W9WA 3FIRA 3N94A 1VE4A 1D9VA 3TTMA 3TUSA 3KSJA 3T96B 3ZKLA 2V25A 3L6GA 1B32A 4HCWA 3I5OA 5TPAA 5CMBA 3SESA 4GF8A 4OEVA 1FTLA 3U72A 3S9MC 5I58A 1N7XA 1AOVA 2DWHA 2ZXTA 4OFJA 4H0WA 1LAFE 3E13X 1QUKA 4LA9A 3MZ9A 1MH3A 3O66A 4IGRA 4YKPA 5BWJA 3R7XA 4DZ1A 3Q25A 2Z8EA 3KN7A 4F2QA 3RLFE 1NL5A 4GLIA 1B40A 5JTYA 2ABHA 3QUFA 3T9VA 4BDNA 2E1SA 4YZZA 3MC2A 2UYFA 3CFXA 3K4UA 4C1UA 1D9YA 4YKKA 4QFNA 1FQBA 2UXAA 3T93B 3MPLA 3DELB 3PD8A 3OSRA 1TFAA 3H6VA 2THIA 3OO6A 4PFWA 1DOTA 2H98A 5I84A 4ESWA 2GRVA 4OERA 1PBQA 3TCFA 4OZ9A 5HM4B 4FORA 3QK6A 1OQGA 3MQ9A 1IUDA 1IEJA 4NF6B 2F78A 4E0XA 1O7TA 2Y7PA 3IJXB 3E9XA 3O97A 1EH3A 3O2AA 3IOVA 1MQGA 1CE2A 2PX1A 4AB6A 3WAFA 1J1NA 3G7WA 5H8HA 5A5XB 1IITA 2AIXA 4PFUA 3LUYA 1IZ1A 4BDQA 2A5TA 1LAHE 1AH5A 2NUVA 1II5A 1DTGA 4X1BA 3OMBA 3TQLA 1MY1A 1NNFA 4RY1A 2IA4A 3SEYA 4ELQA 2ZNTA 4YMBA 1IQ7A 1N04A 1CB6A 4R74A 2XXQA 5CMKA 1MY3A 1MDP1 4U1ZA 2Y7KA 4WKMA 5K2YA 4THIA 3V83A 1P1QA 4ELPA 2XXWA 2I4CA 4OVJA 5TPAB 1R9QA 4PETA 4NMYA 3FVNA 3IO6A 4ZS9A 1Y4TA 2VD2A 5IAIA 4PFTA 4KYDA 1M5EA 4I1DA 4I62A 4KR5A 3RY3A 3TCHA 2F6GA 3KZGA 4IGTA 5CMMA 5KZTA 1QVSA 1DMBA 3K6VA 3MWBA 3OD7A 3EHSA 1N3WA 4OFLA 3SEWA 3GBBA 2E0SA 2BJJX 3MW0A 1OIBA 1P1OA 3M3LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B6HA 1DBZA 5AA3A 3BBRA 5I3SA 5JTYB 3IOTA 2RC9A 1NNPA 1BTJA 1MS7A 4U22A 5H8NA 1FRPA 4NWCA 3OEMA 1N3XA 4PBHA 4IR8A 3C9HA 4MNCA 1UIUA 4PTKA 1XVYA 4I40A 4N81A 3MYUA 4LN5A 3G3KA 4ZEFA 4LATA 3MP6A 4JVIA 4PDDA 1INPA 1EZ9A 1I6AA 4F1VA 2V4CA 3K0VA 1IMEA 2X26A 4GWOA 3T0JA 3UK4A 4LVQA 1WDNA 4FE8A 2BJIA 3VLVA 1R1NA 4H1XA 3O28A 4YAHX 2F3BA 2DQVA 3ODBA 1NV5A 3R6UA 4HS7A 5I56A 1URGA 5FHOA 2QJEA 2B3BA 1SQYA 4FIMA 3MP8A 3FZVA 1ANFA 1OVBA 4KI0E 1FSAA 1N84A 3C32A 1ZJLA 4OANA 5I2NA 2XWOA 1DK4A 5H8HB 3E3KA 3VVEA 4LONB 2RC8A 1PC3A 3FXUA 2UVGA 4R2BA 4N8GA 1A55A 3GBAA 5I57A 1UTHB 4F1YA 3OELA 2Z22A 4YB7A 4ZECA 5AE4A 1FQCA 4MNIA 1QULA 4PCDA 1DPPA 2QMWA 4RJZA 1NH8A 3FD3A 1D9QA 1FTMA 1I69A 3IB2A 1B52A 3EQ1A 4GQOA 3TODA 1BIYA 2XX9A 3I6VA 1IMFA 3LC8A 4U1OA 4KYSA 1LFGA 3RYDA 2QVRA 3OEKA 4C0RA 2AYSA 5CBRA 4I9DA 2OZZA 1XT8A 2F7AA 4F22A 1NV7A 3O29A 3E79A 3W9VA 2DE2A 4GX6A 2KR0A 3PPOA 3PPQA 3C35A 1NV4A 4NF8B 4ZEBA 3FV1A 3DP8A 3OENA 2OWTA 1JW5A 1FCKA 3VDFA 2Q2AA 1LBCA 4KXPA 1A8EA 2F6PA 4QFPA 2QVVA 2CEXA 2X7QA 5H8NB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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