3PUVE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 114
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE01
3SKPA 5I57B 1ZMGA 4H65A 1B0LA 1A40A 4OTEA 3F11A 1A55A 1MY4A 3OO8A 4YB5A 1GVCA 3CG3A 1N3XA 2XXPA 3FXUA 4DDDA 3ONMA 4GXSB 4POXA 1LBBA 3MQ9A 2XXWA 3C35A 3G3FA 3RUMA 1USYE 1B46A 3U93A 2IEEA 4YKIA 1MDP1 2KLFA 3EF7A 5HBCA 1MXVA 3G7WA 4U2RA 3OEKA 3IJOB 4F3BA 1US4A 3BKIB 3LC8A 1NKXA 4HCWA 1DSNA 3U94A 1D3KA 1D4NA 3K1MA 1R9LA 3EHSA 3W9VA 5DEXB 3V83A 3GLBA 4BDLA 3M3LA 1XT8A 5CMKA 3TQWA 1FQBA 5AA3A 3C34A 1B32A 3N94A 2UVJA 1MXWA 1B5HA 3MBPA 5JTYA 1YPNA 4QF9A 4QFOA 4LQ5A 3VV5A 1P1UA 1I6QA 4F19A 3KN8A 1XOCA 3CSBA 2F35A 2UYFA 1BKAA 2THIA 3WAFA 4F1YA 3FXQA 4RPOA 4JWYA 4NTLA 1JVYA 3IO4A 1IXIA 2HAVA 1YTVA 2REJA 4R2FA 4XTCQ 4Z7EA 4XXUA 4OFJA 3PPNA 3MUQA 1DOTA 2XXYA 5DT6A 3TKDA 1Y4CA 1ATGA 3G3HA 2RC9A 3VLUA 5FHNA 1N0TA 1CE2A 4U1OA 4BDMA 4RNSA 2H9BA 2X7PA 2UVHA 4EQ9A 1WODA 3RQTA 3O6IA 3VLVA 4I8CA 1D9VA 1CB6A 1JEVA 3KJTA 1B51A 3FJ7A 4H8IA 2VP1A 3MVZA 4QFPA 4ZECA 4X1BA 1MQDA 3U1OA 1SI0A 3FVKA 4PQJA 5LOMA 5J1DA 3K6WA 3KSXA 5FTIA 1HSJA 1O63A 4L17A 4PETA 4OEUA 1MG1A 3TYHA 3I3VA 1URDA 3PUXE 1DTZA 4M4GA 1ZU0A 2PT1A 1B4HA 1WDNA 4TLLB 1Z7NE 2E1SA 1M5EA 2V3TA 3O97A 1OIBA 4XKQA 2XXTA 2VOZA 1B1HA 3B6QA 4WEDA 5H8FB 1WVJA 3KZGA 2ZXTA 2RC8A 4F29A 4KCCA 5TU0A 2F5XA 1ANFA 3CFXA 1VR5A 1EZ9A 3JV9A 2A5TA 3MC2A 3FVGA 3PMXA 3Q26A 2Q9TA 5I2NA 4N13A 5CMCA 1MY0A 1SW1A 4YAHX 4R75A 3T22A 3UN6A 2I58A 3MAMA 4WXJA 4ZEBA 3N6UA 1B05A 3H4ZA 4R2BA 1B3GA 3OO9A 4ZEIA 3VVDA 4NF5B 1P1OA 5AA2B 4OFOA 3VXCA 1SYHA 4U4XA 4DE8A 3E3KA 3UIFA 3KSJA 5H8NB 4RK2A 2UVGA 1B3EA 4MF3A 4GRKA 1OVTA 1N76A 2QS1A 1MS7A 4IO2A 2RINA 2H4IA 3WAEA 2ONKE 5I84A 1POTA 3SERA 2G29A 1LFGA 1MY1A 1QKBA 3MVWA 1P1NA 2V25A 3EPEA 3IOVA 4EDPA 2BJJX 3RTWB 4R6YA 3TAJA 3G3GA 2HCAA 3K4UA 1ZIUA 1A8FA 3H03A 2F6PA 1P1WA 1P99A 1FQDA 3U72A 4H5GA 5K2YA 4PFYA 4LQ2A 1OVBA 1NMUA 1JW1A 2ZYMA 5H8HA 3B6TA 2F34A 3M3KA 1FTJA 4NF8A 1BP5A 4GFRA 2ONSA 1H43A 1OMPA 3CVGA 5CBSA 2ESNA 1PB7A 4KQPA 4OMBA 1LBCA 4H6DA 3KN3A 4DZ1A 5EHSA 3R6UA 2DS9A 1M5CA 4RXLA 4WKMA 3IB1A 3TTRA 1LB8A 4U21A 3PV0E 3FUZA 3OO7A 1POY1 3HN0A 3PUYE 4QFLA 3DP6A 5I59B 4GIZA 1LB9A 3K2DA 1IQ7A 1KWHA 2HXWA 4ESXA 1I69A 3CG1A 4U1ZA 5L9OA 3MZ1A 3C4MA 1EH3A 3PPRA 5L8DA 2GH9A 1SBPA 3ILTB 1QUKA 2Q2AA 3O66A 1LCTA 4AQ4A 4GLIA 1QVSA 2Z22A 4F18A 1QUJA 1DPPA 4KCDA 4C0RA 3K02A 2PBWA 4Q5TA 5L9MA 3HHFA 2Y7WA 1TT1A 4BLAA 2QSXA 4LUBA 1MQJA 1NFTA 3RY3A 1HSLA 2DWIA 3MP6A 1LLSA 4P0GA 4QSDA 3G3JA 1B7ZA 4H67A 4FEBA 4YZZA 3EQ1A 5ICQA 2GFEA 4NE4A 3KOTA 2OCUA 1JW5A 3W9WA 3TCFA 4RY1A 5I57A 1VSOA 4IGTA 3K01A 1B5IA 3HPIA 4IO7A 4OESA 1NH7A 3H6UA 4G8MA 4R9GA 3IK6B 2HEUA 4ELPA 3IORA 1XVYA 2UYEA 4X9TA 2P0SA 4THIA 4DXBA 2I0BA 1LCFA 3M8UA 4FAJA 3QSLA 2HQ0A 4GWOA 4N07A 5KCJB 1MQIA 2XX7A 4EF1A 4POWA 5BWJA 2ONRA 2O51A 4OETA 2VD2A 3QK6A 4OXVA 1N3WA 4ZDMA 1OQHA 2DE4A 3I6VA 1VFDA 3USDA 3RT6B 3S9MC 5DEXA 1OQGA 3TCHA 4O3CA 1Y20A 4TLMB 2O68A 2AYSA 1B5JA 1USYH 4F3GA 3E4RA 3LR1A 3Q27A 3OSRA 5ITOA 1NNKA 1L5TA 3TQLA 2R9JA 1Y3NA 1A99A 2H99A 1AL3A 1DTGA 2ZYNA 1AH5A 1B4ZA 2F7BA 3OO6A 2ZYOA 2DWJA 4FE8A 2QMWA 3VE1B 1N04A 5CI5A 1T0KA 3SEWA 3RLFE 4F22A 4RK9A 4YB7A 4F31B 2DE3A 4IY6A 4O3BA 1YCJA 2G93A 3M3FA 3T9HB 2H5YA 2OK2A 5DVFA 2Y7RA 2DWHA 2RF1A 3EHTA 3O6GA 3GXAA 4F3SA 3VVEA 3FD3A 4BDQA 4IO3A 1FCKA 1UIUA 2DQVA 5BUUA 1A8EA 4I9DA 2NUVA 3K6VA 2REGA 2VD3A 3SEVA 3KOSA 2OZZA 2X26A 3VVFA 5FTHA 3KN7A 3CRBA 2UVIA 1FTMA 3QXMA 4HS7A 4GF8A 1MXXA 4GOTA 1B9JA 1I6BA 3MJNA 2DP8A 4YICA 2Z8DA 1MXYA 2ZNSA 1RKMA 4ELRA 4JDFA 1S7YA 4PFTA 1MDQA 4LZ5A 3RN8A 1MM7A 2RCAA 4IO6A 2RC7A 3N5LA 3K0VA 1FQCA 1Y1ZA 2Z8EA 3T9XB 4G77A 4I1DA 3JYRA 2O69A 1IXHA 3V8XB 5H8FA 2XX9A 4ZS9A 3SDFA 4KD5A 3BFTA 5K2XA 3S9NC 1ZKBA 5TPAA 5KZTA 1B3FA 3MVYA 3C9HA 1B7HA 3IOWA 3OD7A 3OSQA 3TCGA 1P1QA 4G68B 2GHAA 3OENA 3PPOA 2PVUA 4RYAA 4EQ7A 1VFEA 1TFAA 4PE5B 3C36A 1B1XA 5JK4A 1FTOA 1MPBA 3QIMA 3LSWA 4GVOA 4NF5A 5AA2A 3D4CA 2DVZA 1II5A 1FTLA 2R6GE 4X1DA 3W15C 4YKKA 4M1VA 4R72A 4YMAA 1MPDA 3ECRA 3GBAA 4F2QA 5H8NA 1TFDA 4ELQA 2A5SA 4RA1A 3N26A 5CMBA 1IXGA 3RT8A 2X7QA 3A3CA 1ZLQA 1IIWA 3UK4A 1PEBA 1RYXA 4H5FA 4OVJA 3UORA 4F2OA 5DYHA 4LVQA 3FGSA 3AXFA 2NVUB 3RTFB 4IO4A 4R73A 3IB2A 3FZVA 1N7XA 1LGBC 4NEDA 5B70A 1NH8A 5A5XB 3KBRA 2WKYA 2ZNTA 1LSTA 4OENA 2NWJA 3VDFA 4ISUA 4EXKA 1NNPA 1F9BA 4KYDA 3C33A 2O1LA 4MH5A 2B3FA 1H44A 4OERA 1O64A 2DXYA 2ZNUA 5DTBA 3SEUA 1R9QA 3VXBA 4R6HA 3L6GA 1GGGA 2FA7A 4MBPA 2H98A 3TTMA 3H6WA 4DXUA 3SEXA 4YB6A 1FTKA 3BFUA 5I2KB 2F97A 2FNCA 3BBRA 3C31A 1MRPA 4E0XA 4BDNA 3PPPA 3MWBA 3TUSA 4MLQA 4ELOA 4JWXA 3FJMA 3IR1A 1XHYA 1IITA 3LSLA 3THIA 1Q1KA 4F1VA 3T66A 4QFKA 2D5WA 5ICTA 5AA4B 4YKJA 1ZTYA 4ZEFA 1SW4A 3QUJA 2Y7KA 1UTHB 4XKNA 3FXRA 1TWYA 5CRYA 4OWDA 4F1UA 2ZYKA 2ABHA 2QMXA 3D4GA 1PB9A 5FHMA 5DVJA 4EF2A 2OJTA 4H0WA 1SW2A 2A5TB 4Q8RA 5CM6A 2P2AA 1H3DA 1PBPA 4ZE9A 5I59A 4NMYA 2QL3A 2XXXA 4DCYA 3UGWA 4GXAA 3IX1A 3P7IA 4PP0A 3CIJA 2GRVA 4U4SA 3N6TA 2ALUA 3ILUB 3LBSA 3CSGA 2XD2A 3MZBA 4KI0E 2O1MA 5IKBA 5KDTB 4E0WA 5B7DA 4G2ZA 4NF4B 5I56B 1GR2A 4DLDA 2XXIA 5M2VA 1AMFA 1SQYA 4JXIA 5I58A 3K00A 1IUDA 2XXRA 4OZ9A 1R6ZA 2PYYA 1MY3A 3O28A 1UTBB 3U8QA 1FW0A 3PD9A 4QFNA 1ZJLA 4EQBA 3IAZA 3MZ9A 1AIVA 1DMBA 1UIVA 1TXFA 4GD5A 3OEMA 4YU0A 4GL0A 3PMVA 3HSTA 5KCJA 3IJXB 4TQUQ 4PFWA 5ISUA 1JEUA 3JZJA 3EN3A 2DOJA 1Z7ME 3HCQA 4ZEKA 1ELJA 1N84A 3B6WA 3TPAA 2HFBA 1UQWA 2IA4A 3ZKKA 3TEPA 1B2HA 5HPQA 1Y3PA 3SESA 2PT2A 3PU5A 2Z8FA 5F7VA 2Y84A 1JVXA 4YMBA 4ZZEA 3S4UA 2DVCA 5H8QB 3PD8A 3ZKLA 1O7TA 2D21A 1GV8A 1R1NA 3O29A 3HHGA 4JBZA 1PC3A 1PBQA 5TP9B 1LFIA 1A54A 4YKPA 3SEYA 3KJ7A 4N6PA 3VLWA 4QRZA 4JB7A 3R7XA 3QYTA 4I62A 2PX1A 2QRYA 2NOOA 3FASA 1NL5A 2I6EA 3K1NA 2OWTA 3S9EA 1FQEA 2AL5A 4ESWA 1FQAA 2PMSA 2V3UA 1IZ1A 2CZLA 4FIMA 4OYVA 4ZZAA 4MLVA 4FEDA 3H3GA 4EXLA 3PGFA 4NF6B 2O7UA 1JW4A 3IOTA 4BDRA 3V89B 3OELA 2XD3A 2DWAA 3E9XA 3PMWA 4R6KA 3TTKA 3FATA 1EZPA 1DPEA 1OLAA 4IY5A 3K6UA 4P0IA 3O9PA 2UXAA 4ZEDA 1MPCA 4G68C 3B7DA 2HZLA 2OLBA 4ND9A 4ZE8A 2P1SA 3IL1B 3S9LC 4C1UA 4HW8A 1IXCA 3T9UA 3LSXA 1VE4A 2LAOA 3LUYA 3C32A 3Q29A 3MW0A 2O6AA 1IEJA 1JNFA 2DSFA 3DP8A 2B65A 4QSCA 4G68A 4XKRA 4KYSA 1LAHE 1MM6A 3QUFA 4KFQA 3TDJA 1QULA 4G8HA 2QPQA 4Z0IA 4F3PA 1HSEA 2XXQA 3HO7A 2QS2A 2F7CA 1Y9UA 3FVOA 1SI1A 3LSFB 3CI8A 3KGCA 1AOVA 4FORA 1LAGE 1XVXA 1B52A 2NXOA 4IGRA 3DP4A 3SETA 4KYEA 4Q0CA 2I49A 2H25A 3R26A 1J1NA 2DYXA 3TELA 3RPWA 3ZS6A 3MP8A 4LP2B 4G8NA 4EUOA 3QAXA 2W7YA 4AB5A 5A5XA 1B3HA 1N7WA 1SDXA 5CC2A 4XKPA 2I3VA 4H8JA 3FVNA 5JTYB 3T96B 4HTGA 3IOUA 3CFLA 3ZSFA 4K3FA 4FJPA 3K6XA 1M5FA 5I2KA 2RCBA 2XXVA 4FATA 3I5OA 4LONB 1Y3QA 4JSDA 2Z23A 2Y7IA 2OBGA 4F39A 2XX8A 4HCYA 1MXZA 2QJEA 5AE4A 2F7AA 5IAIA 4RPNA 5AA4A 3FV2A 1MY2A 1MH3A 2YPNA 1UTHA 1EU8A 3HV1A 1QW0A 3MP1A 2AL4A 3PUZE 5TPAB 4DCXA 5EHMA 3PUVE 2ANJA 1ZBMA 2F78A 1B7UA 2I4CA 2V84A 1I6AA 1MH4A 1D9YA 2Q88A 5ELVA 3H6VA 1PB8A 1JETA 1URGA 3H06B 1H76A 3A09A 1PDAA 2F36A 3MVXA 3OXNA 5EYFA 5H8SA 2D3IA 3GBBA 4LZ7A 1URSA 4X48A 3KG2A 2F6GA 4ONYA 1XC1A 5KDTA 1BTJA 3FJGA 4JWOA 4LATA 5HM4B 1US5A 4NF4A 4KR5A 5I56A 1SVXB 2QS4A 3OMBA 3KFMA 1LFHA 4GL8A 1GTKA 4IB2A 3O6HA 1JQFA 5I2NB 1LAFE 2I48A 1Y4TA 2Y7PA 2XHDA 3TTLA 3TTNA 3KEIA 1Y1MA 5AA1A 3ODBA 3S2VA 5CMMA 3H7MA 1NNTA 5ITPA 4G4PA 1UTBA 4U23A 1B0HA 2OWSA 1BIYA 2DXRA 1B58A 4QSEA 2I0CA 4Q30B 4PFUA 3IO6A 4NWDA 1NNFA 1MXUA 2Q8JA 4C1TA 1YAEA 3TMGA 2Q89A 3PUWE 5FHOA 3RGYA 3A3UA 2DE2A 1A7LA 3CFZA 3CR9A 4U22A 4OFLA 2Q2CA 4O3AA 2VHAA 2O84X 2HZKA 1SD3A 3T93B 2XXUA 4LA9A 4GQOA 1M5DA 4KHZE 4DXCA 3GZGA 4UACA 4JSOA 4WEPA 3Q28A 1B6HA 3H6TA 2V93A 5L9SA 4NWCA 5F1QA 1XS5A 2RKMA 3IB0A 3L6HA 4IO5A 3DM0A 3V5AA 1OLCA 2YLNA 5H8QA 4R9FA 3UP9A 4TOZA 4XIGQ 2HAUA 2YJPA 4UA8A 1Q35A 4MFIA 1RYOA 5TP9A 3VFJA 4OHNA 3MPKA 3FIRA 4LZ8A 3DLNA 5H8HB 2XXHA 4NF8B 2QS3A 1EZOA 1QKAA 4OQOA 4ECFA 1S50A 2FYIA 2I4BA 2R71A 5AA2D 4FECA 2VGQA 4OEVA 4KPTA 3DELB 2GHBA 2E0SA 5I58B 1MQHA 4BDOA 1QUIA 1H45A 4RJZA 2F8DA 2V3QA 2B3BA 5CBRA 3MPLA 3Q25A 4NF6A 1MQGA 3O2AA 2CMOA 4R74A 3FV1A 5DVIA 3TODA 3E13X 2I3WA 1SYIA 1QJMA 3PPQA 4QHQA 1SW5A 3RNNA 4H1XA 2M8CA 3T9VA 2AIXA 1LAXA 1M5BA 1BLFA 3TZAA 5JEIA 2ZMBA 3TFLA 2O7IA 3EHUA 4DIGA 3UA8A 4P11A 1S9TA 3G3KA 1FQFA 3U92A 1B40A 3G3IA 3OOAA 4AB6A 3K1PA 1B3LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SKPA 2FHYA 5I57B 1ZMGA 4H65A 1B0LA 1A40A 4OTEA 4PAKA 3F11A 1A55A 1MY4A 3OO8A 4YB5A 1GVCA 2OX3A 3CG3A 1EYJA 1N3XA 2XXPA 1EYKA 3FXUA 5IZ3B 1NV1A 4DDDA 3ONMA 4MHFA 4GXSB 4POXA 1LBBA 3MQ9A 2XXWA 3C35A 3G3FA 3RUMA 1USYE 1B46A 3U93A 2IEEA 4YKIA 1MDP1 1FBDA 2KLFA 3B50A 3EF7A 5HBCA 1MXVA 3G7WA 2VPOA 2HXRA 4U2RA 3OEKA 3IJOB 3T1BA 4F3BA 1US4A 3BKIB 3LC8A 1NKXA 4HCWA 1DSNA 3U94A 1D3KA 2CZKA 1D4NA 3K1MA 5I3SA 1R9LA 3EHSA 3W9VA 5DEXB 1EYIA 1IMBA 3V83A 1IMEA 3GLBA 4BDLA 3M3LA 3GYYA 1XT8A 5CMKA 3TQWA 1FQBA 4N8GA 5AA3A 3C34A 1B32A 3N94A 2UVJA 1MXWA 1B5HA 1LBYA 3MBPA 5JTYA 1YPNA 4QF9A 4QFOA 1XI6A 4LQ5A 3VV5A 1P1UA 4LN5A 1I6QA 4F19A 3KN8A 1XOCA 3CSBA 2F35A 2UYFA 2R8TA 1BKAA 2THIA 3WAFA 4F1YA 3FXQA 4RPOA 5ET8A 4JWYA 4NTLA 1JVYA 3IO4A 1IXIA 2HAVA 1YTVA 2REJA 4R2FA 4P1EA 3KBZA 4XTCQ 4Z7EA 4XXUA 4OFJA 3PPNA 4P47A 3MUQA 1DOTA 2XXYA 1D9QA 5DT6A 3TKDA 1Y4CA 1ATGA 3G3HA 2RC9A 3VLUA 5FHNA 1N0TA 2KQZA 1CE2A 4U1OA 4BDMA 4RNSA 2H9BA 2X7PA 1RDYA 2UVHA 4EQ9A 1WODA 3RQTA 3O6IA 3VLVA 4I8CA 1D9VA 1CB6A 1JEVA 3KJTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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