3PUVE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
total genus 114
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE01
2ANJA 2YJPA 1D9YA 3C36A 2Q8JA 2YPNA 1Y4TA 2FA7A 2Y7PA 1TFAA 1WVJA 2PVUA 1MXYA 2QS4A 1PBPA 3QYTA 1MQHA 1LCFA 1A40A 4NF8A 4EXKA 4GD5A 2CZLA 4BDOA 4OENA 1OIBA 1Y3QA 2A5TA 1CE2A 4XXUA 3C4MA 4RA1A 2QL3A 3KN3A 5FTHA 3G3HA 1B3GA 4QFLA 2I0CA 1JEVA 2F35A 1NNKA 3PD8A 3FZVA 4JSDA 1FW0A 5HBCA 3MQ9A 2V3TA 4LZ7A 2Z8EA 4YB6A 3CFZA 1B5HA 1DPEA 1NL5A 3TODA 3O6GA 3CSBA 5I2KB 4F39A 3CRBA 3R26A 4GL0A 3W15C 3HHGA 3MPKA 1LBBA 1WDNA 3FVOA 4F2OA 5BUUA 5AA2A 3MP8A 1B3HA 4LP2B 5TP9B 4PETA 4IY5A 4QSEA 1JQFA 1B52A 4KCDA 4OERA 2P1SA 1SVXB 4G68C 4YICA 3O6IA 5CRYA 3UP9A 3SEUA 3MPLA 4QFKA 3VLWA 3CFXA 2XXVA 1GVCA 5ITPA 1B32A 1SW1A 1BP5A 3EHTA 4IY6A 4NE4A 4AB5A 5J1DA 3K00A 2ESNA 2NOOA 1OLAA 3U1OA 5DVJA 2AIXA 4YZZA 3MZ1A 4IO2A 4U4SA 3UA8A 3KSXA 1UQWA 1B4ZA 2XXPA 3ZKKA 1B51A 1MM7A 4F1UA 3TQWA 2I6EA 4OVJA 4AB6A 4H5FA 1EU8A 2VHAA 2V25A 2QMXA 2NUVA 2R9JA 3B6QA 3BFUA 1AL3A 1Y4CA 2ONKE 4KYSA 1A8EA 3SDFA 2D3IA 2UYEA 4R2BA 1TFDA 3QSLA 1I69A 4ZEIA 1IIWA 5DYHA 4BDLA 5HPQA 4LQ2A 4GF8A 5I58B 4H6DA 1PB8A 1IZ1A 4NWCA 3IR1A 3TTRA 3EPEA 4KHZE 4Q8RA 3LUYA 3KJ7A 1A99A 1YAEA 2H99A 3THIA 4QFOA 3HSTA 3HPIA 3ZSFA 4PP0A 1ZU0A 3FV2A 5A5XB 3GBAA 1ZMGA 4X9TA 3WAFA 4I62A 4RPNA 1JW4A 3UN6A 1USYE 2RINA 3TCFA 3S9EA 2E0SA 4WEDA 2F7BA 3FATA 2IEEA 3CG1A 5FTIA 1FTOA 2OWSA 4KPTA 1UTBB 5ISUA 4DE8A 2ALUA 4XKNA 4MBPA 1NH8A 3FXRA 3RNNA 2HFBA 3VLUA 2PMSA 2F7AA 1M5BA 4G8HA 3LSFB 1I6AA 1B05A 2F5XA 4TLMB 3HO7A 2UXAA 3AXFA 4Z0IA 2GRVA 3KGCA 3T9VA 3O2AA 4TLLB 3IJXB 1URDA 1LAHE 4P11A 3I6VA 1FTJA 2B3BA 4Q0CA 1QJMA 1D4NA 5LOMA 1VE4A 1ZIUA 2ZMBA 4ELOA 2XX7A 5CC2A 4E0XA 4EDPA 1RKMA 2I3WA 5IAIA 3SKPA 1OVTA 1B5IA 3LBSA 2Z23A 1MDP1 2RCAA 1R9LA 4UA8A 1A54A 1OQHA 4FEDA 4H65A 5FHNA 3IK6B 4XKQA 3PUYE 3OENA 3IO4A 4U1ZA 1TT1A 3B7DA 4H0WA 1R1NA 2ZYKA 2F8DA 3SEVA 1OMPA 4ELRA 5K2XA 4WXJA 3DELB 1VR5A 3UORA 1AMFA 3RUMA 3VDFA 1N04A 4IB2A 4F31B 1F9BA 4NTLA 3EHSA 2HXWA 5AA1A 4YKIA 1PBQA 4JWOA 2PT1A 1HSLA 4MH5A 2UVIA 3OOAA 5I59A 1Q1KA 2Q2CA 4GIZA 4FE8A 2DOJA 1HSEA 1ZTYA 4IO4A 3KZGA 3T9XB 5L9SA 1MQJA 1LCTA 3OO9A 4MLVA 4FAJA 1B3FA 4ZE8A 4DXUA 4GLIA 4KQPA 2XD2A 1N7WA 2OWTA 3IORA 4HS7A 2REJA 2DWAA 3V89B 3FJMA 4HTGA 1H3DA 3ONMA 4LZ5A 3A3CA 1CB6A 1B5JA 2P2AA 4OYVA 2O7IA 3MAMA 4R75A 1XOCA 3FVGA 2HQ0A 1IXHA 3VXCA 4ZZAA 1UIVA 1N3WA 1VFEA 5I2NB 1S50A 1MQDA 3RTFB 4C0RA 5H8HB 3PU5A 2P0SA 2V93A 2RF1A 3EN3A 2Q89A 3A3UA 3S9NC 3U72A 4PFYA 1P1WA 2R71A 4R6HA 3G3GA 1FQEA 3TQLA 2UVGA 4ZECA 3QAXA 4KFQA 1QKBA 3C34A 1EH3A 4ZEFA 3Q28A 3HN0A 4F1VA 1B6HA 5JEIA 2OCUA 4M1VA 4ELQA 3PUXE 4G68B 3K6XA 1MY1A 4C1TA 3CIJA 1MQIA 3B6WA 1QKAA 2DWHA 4ZEKA 4H5GA 4GOTA 3MJNA 3MVWA 3FV1A 3TKDA 4DLDA 4ELPA 3IOUA 2VP1A 1R6ZA 3MW0A 3UGWA 2PBWA 4IO3A 4Q30B 3TEPA 1MXVA 3OO6A 4H1XA 5I56A 1PDAA 3C35A 1H44A 3O9PA 3IOWA 2V3QA 3H6TA 2I0BA 4G8MA 2R6GE 1MY3A 2D5WA 5F1QA 4ZS9A 3PPRA 2DS9A 3KFMA 2UVHA 4EF2A 3H4ZA 4QFNA 3SEXA 3TTMA 3FJGA 1PB9A 4YMAA 4OQOA 1DTZA 1MXZA 3BBRA 1LAFE 1B7HA 3M3FA 3N5LA 3Q25A 4OFJA 4EF1A 2G29A 1B9JA 3PPQA 1QUKA 4G77A 3FXQA 1YCJA 3B6TA 5TU0A 2DWJA 4UACA 1ZKBA 1YPNA 5DEXB 3KBRA 4Q5TA 4R73A 5JK4A 4BDMA 1P1NA 3PPPA 4NF4A 4R9FA 1US5A 5CMMA 1SW5A 2ZYOA 1UTHA 1FQFA 3RTWB 2GH9A 5HM4B 2UVJA 2M8CA 3GZGA 5TPAB 4POWA 4GFRA 3K6UA 1O64A 5ICQA 3U93A 2DWIA 3MBPA 3N94A 1A7LA 2I4BA 3PGFA 1H76A 3M8UA 3EHUA 4ND9A 1T0KA 1II5A 5I57A 1LB9A 3QXMA 5AA3A 2GHAA 5JTYA 5FHMA 3WAEA 2BJJX 1VFDA 3K0VA 4JWYA 4ONYA 5F7VA 1ATGA 2AYSA 3K2DA 4FORA 3O66A 1GGGA 1XVYA 4P0GA 1H43A 1P1OA 3GBBA 4DCYA 5AA4A 1S7YA 2Y7RA 4RK9A 4H67A 4M4GA 3S4UA 2DSFA 2WKYA 1MH3A 2I49A 4POXA 4QSCA 1MQGA 4NEDA 3T66A 1PB7A 4I8CA 4R6YA 2RC9A 3IOVA 3RN8A 4QFPA 3USDA 1GTKA 3U8QA 3VE1B 3V5AA 4OXVA 3MVYA 3DP4A 2ZNUA 3TAJA 3CR9A 4ESWA 2RCBA 5CMKA 3IJOB 4NF8B 4BLAA 3EQ1A 4GXAA 1P1UA 2D21A 2GFEA 1SD3A 2DE4A 4K3FA 3N6UA 4DZ1A 2A5TB 3IB2A 4PFUA 3UIFA 2O69A 3HCQA 4EXLA 3OELA 2F78A 5L8DA 2HAVA 5KDTA 2Z8DA 3G3JA 3TMGA 4GRKA 1MPCA 5CBSA 2O1LA 1JW1A 5CI5A 5H8QA 1XHYA 3JZJA 3PPNA 1PC3A 3I3VA 2XXHA 2V84A 2GHBA 1M5FA 1UTHB 3T22A 1B7ZA 3OMBA 4ISUA 5AA2B 4KI0E 4TOZA 3MVXA 2H98A 4DCXA 1M5DA 1Y1ZA 4HCWA 3D4CA 3KN7A 4OHNA 3S9LC 2Y7KA 2PT2A 3K01A 3DP8A 3FASA 3FJ7A 2AL5A 5EHMA 5I57B 1B58A 4BDNA 4YB7A 1DPPA 2ZNSA 1O7TA 5JTYB 1EZOA 3G3KA 3CSGA 2NVUB 4JSOA 4JDFA 1J1NA 2B65A 1JW5A 2Y7IA 3FIRA 3PPOA 2ZYNA 5AA4B 3TTNA 2DXYA 3VVDA 3TTLA 1MPBA 2QMWA 1B4HA 4MF3A 2O51A 4E0WA 4U23A 3G7WA 4MLQA 4GWOA 3DLNA 4RY1A 2O1MA 3OSRA 4IO7A 1GV8A 1Z7ME 1Y1MA 4N6PA 5KCJA 5CMCA 5M2VA 3V8XB 1FTLA 3TTKA 2HAUA 1DTGA 3KOTA 1IXIA 2DE3A 4X48A 5H8FA 1B46A 4U1OA 3K02A 4ZE9A 2F6GA 1RYOA 4N13A 4BDRA 1MM6A 5L9OA 3PUVE 4L17A 5CBRA 1LFGA 2UYFA 1AH5A 1AOVA 3T96B 3H03A 3JYRA 1LGBC 2XX8A 3PD9A 4ECFA 2RC8A 4U2RA 2DYXA 2OK2A 4O3BA 4IO5A 2H4IA 3VLVA 1I6QA 4OEUA 2ZXTA 3LSXA 3PMXA 3H6WA 2O7UA 3TZAA 3C32A 3MUQA 1JETA 2XX9A 1A8FA 3SETA 1XVXA 1LAGE 3E4RA 3OEMA 3MZ9A 3TDJA 1B1XA 1H45A 2F7CA 1DMBA 1NNTA 1SI1A 3C9HA 3IB1A 3BKIB 2HCAA 1LFIA 1QUIA 4JXIA 2Q2AA 2HEUA 2Q88A 1QUJA 3Q26A 2OLBA 5TP9A 4MFIA 4H8JA 3IX1A 3O97A 2QPQA 4X1BA 5DVIA 1AIVA 4GXSB 4OMBA 4EQ9A 1BTJA 2ZYMA 2OBGA 5ITOA 3FVKA 1RYXA 4OFLA 3O29A 4EUOA 3FGSA 1BIYA 1N84A 3OO8A 1LBCA 4YKJA 2NXOA 1B7UA 3MP6A 1LB8A 4R72A 3BFTA 3QK6A 1Y20A 3P7IA 2E1SA 4X1DA 1D3KA 5BWJA 2NWJA 3W9VA 1FQBA 3N26A 4RJZA 3TCHA 3A09A 4YU0A 2XXYA 5DVFA 4IO6A 1P99A 3OSQA 3CI8A 3SESA 4GQOA 3MZBA 4IGTA 3KOSA 4THIA 2I4CA 3S9MC 3TFLA 2QSXA 1XS5A 3F11A 3UK4A 5H8NA 3PMVA 1Y9UA 3TUSA 4WKMA 5CMBA 2QS3A 4EQBA 2DE2A 3ZKLA 2F34A 3LR1A 3TPAA 4OEVA 3IL1B 1JEUA 4LATA 5I59B 2AL4A 4OFOA 1R9QA 1NMUA 1SYIA 1IXGA 1USYH 1SQYA 4F2QA 5I58A 5FHOA 3H6UA 4OESA 3PUWE 3PMWA 4O3AA 4YMBA 2Q9TA 2H25A 1SYHA 3ECRA 2O84X 1S9TA 4F18A 1OLCA 3KSJA 4PFWA 4R74A 2YLNA 4YB5A 4QSDA 3L6GA 2F97A 2THIA 3DP6A 1LLSA 1IUDA 5A5XA 1M5CA 3LSLA 2XXQA 3RT6B 3ILTB 3IAZA 3K1NA 4XIGQ 4KD5A 4LONB 4Z7EA 3G3FA 3VVFA 2PYYA 1B40A 1OQGA 4LQ5A 5EYFA 2QS2A 1FTKA 4FECA 2F36A 1ELJA 1IITA 1UTBA 4ZEBA 2X26A 4AQ4A 4FATA 5DT6A 1NH7A 4LA9A 3K1PA 1OVBA 1JNFA 1TWYA 4I9DA 1IEJA 3Q29A 2FYIA 2CMOA 4I1DA 3RY3A 1WODA 1ZJLA 1MY4A 4OZ9A 1O63A 4F29A 1NFTA 1Y3NA 4H8IA 4F19A 2OZZA 5KZTA 1VSOA 5AA2D 2RC7A 2XXWA 5K2YA 3IO6A 2RKMA 3FXUA 1SBPA 3PV0E 5I84A 3OXNA 1TXFA 5CM6A 1Z7NE 2XHDA 3PUZE 4GL8A 1LFHA 2V3UA 4LUBA 3FVNA 5H8NB 5I56B 1MY0A 3JV9A 3M3KA 3ZS6A 1BKAA 3IB0A 3RLFE 3O28A 4QF9A 1BLFA 5ICTA 2DVZA 3RT8A 5L9MA 3K6VA 5IKBA 1FQCA 2ONSA 2XXTA 4HCYA 4PQJA 4G2ZA 1M5EA 4KR5A 5AE4A 3VV5A 3Q27A 5B7DA 3MC2A 4DDDA 3L6HA 1SW4A 1QULA 2VOZA 3TYHA 4PE5B 1FQDA 2I58A 4F3PA 4NF4B 1UIUA 3RQTA 4YKKA 2KLFA 1XC1A 1EZPA 4F3BA 1B1HA 3MP1A 2FNCA 3LSWA 3W9WA 3R6UA 5B70A 3TCGA 3CVGA 3E9XA 1MS7A 1MPDA 1L5TA 1EZ9A 4G8NA 2X7QA 4KCCA 1SI0A 1LAXA 1US4A 3SERA 3OD7A 4XKRA 3E13X 1B3EA 4RXLA 4F1YA 3C31A 4KYDA 3GXAA 2QJEA 2REGA 1Y3PA 4FEBA 1URGA 1POTA 1Q35A 2O6AA 1DOTA 4FJPA 3U94A 5I2NA 3H6VA 4ESXA 2Z22A 3O6HA 2OJTA 2F6PA 3M3LA 4LVQA 3ILUB 4JB7A 5H8HA 4TQUQ 3VXBA 4U21A 4HW8A 2I48A 4F3GA 2ONRA 1NKXA 2Y7WA 3U92A 1MG1A 5DTBA 4R6KA 4NF6A 1B0HA 3D4GA 4YAHX 4NF5A 4NWDA 3C33A 4G68A 2HZKA 4GVOA 4RPOA 2Z8FA 1LSTA 3VFJA 3MWBA 4FIMA 4QHQA 1YTVA 3KN8A 3T9HB 4XKPA 3KEIA 1NNPA 3V83A 3GLBA 3QUJA 3K4UA 3K6WA 1NNFA 4U22A 4R2FA 1URSA 5EHSA 1KWHA 3VVEA 4F3SA 1DSNA 4YKPA 2IA4A 3IOTA 2H9BA 1MRPA 3KG2A 4RNSA 3DM0A 1P1QA 3G3IA 1N0TA 4JBZA 5KDTB 1ZLQA 2B3FA 1FCKA 5ELVA 1ZBMA 2G93A 4PFTA 4C1UA 1A55A 1IXCA 5H8QB 1QW0A 4OTEA 4RK2A 4P0IA 3OO7A 3QIMA 1SW2A 2XD3A 4LZ8A 2QS1A 3R7XA 1MXXA 1GR2A 1MXWA 3S2VA 3K1MA 2O68A 1POY1 1D9VA 2XXXA 4RYAA 2XXIA 4NMYA 1IQ7A 2ABHA 2LAOA 1JVXA 5DEXA 5I2KA 1SDXA 3H3GA 2Y84A 4DIGA 4QRZA 3EF7A 1N7XA 1XT8A 1MXUA 4XTCQ 3I5OA 4KYEA 2DP8A 1B2HA 4JWXA 3FD3A 3T93B 3RGYA 5TPAA 4ZZEA 4U4XA 3SEYA 2ZNTA 1MDQA 4IGRA 4EQ7A 3T9UA 3MVZA 2VD2A 1HSJA 1QVSA 4OWDA 1MY2A 3HHFA 3N6TA 4ZEDA 3LC8A 3KJTA 1N76A 4OETA 3RPWA 2W7YA 4DXCA 3CG3A 4F22A 4G4PA 4ZDMA 2DQVA 2HZLA 2QRYA 1FTMA 1FQAA 2PX1A 3FUZA 2I3VA 1N3XA 2DXRA 4NF6B 3TELA 3ODBA 4BDQA 1I6BA 1B3LA 4NF5B 2A5SA 3OEKA 3SEWA 3QUFA 2XXRA 1ANFA 3H7MA 1MH4A 3H06B 4N07A 1B0LA 4O3CA 5KCJB 3CFLA 3HV1A 2XXUA 2H5YA 4DXBA 2X7PA 5H8SA 4WEPA 1JVYA 3E3KA 2DVCA 2VD3A 2VGQA 1PEBA 4R9GA 5H8FB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ANJA 2YJPA 3EKIA 1D9YA 3C36A 4PFBA 2Q8JA 2YPNA 1Y4TA 2FA7A 1FBEA 4MCOA 2Y7PA 4N8YA 3D1RA 1TFAA 1WVJA 2PVUA 1MXYA 2QS4A 1PBPA 3QYTA 1MQHA 1LCFA 1A40A 4NF8A 4NG7A 4EXKA 4GD5A 2CZLA 4BDOA 4OENA 1OIBA 1Y3QA 4PDDA 5EYGA 2A5TA 1CE2A 4XXUA 3C4MA 4RA1A 2QL3A 3KN3A 5FTHA 3G3HA 1B3GA 4QFLA 1RDXA 4P1LA 2I0CA 1JEVA 2F35A 1NNKA 2ZZVA 3PD8A 3FZVA 4JSDA 1FW0A 4JVIA 5HBCA 3MQ9A 2V3TA 4LZ7A 5ET8A 2Z8EA 4YB6A 3CFZA 1B5HA 1DPEA 1NL5A 4PFIA 3TODA 3O6GA 3CSBA 5I2KB 4F39A 3CRBA 3R26A 4GL0A 3W15C 3HHGA 3MPKA 1LBBA 1WDNA 3FVOA 4F2OA 5BUUA 5AA2A 1DK4A 3MP8A 1B3HA 4LP2B 5TP9B 4PETA 4XFEA 4IY5A 4QSEA 1JQFA 1B52A 4KCDA 4OERA 4NAPA 3BIGA 2P1SA 1SVXB 4G68C 4YICA 4MNIA 4PDHA 3O6IA 5EQ7A 5CRYA 3UP9A 3SEUA 3MPLA 2WBBA 2ZZXA 4QFKA 3VLWA 1YZ0A 3CFXA 2XWIA 2XXVA 1GVCA 5ITPA 1B32A 1SW1A 1BP5A 3EHTA 4IY6A 4P3LA 4NE4A 4AB5A 5J1DA 2WYPA 3K00A 2ESNA 2NOOA 1OLAA 5DVJA 4PAKA 3U1OA 2AIXA 4YZZA 3MZ1A 4IO2A 4U4SA 3UA8A 3KSXA 4P8BA 1NUYA 1UQWA 3MSTA 1B4ZA 2XXPA 3ZKKA 1B51A 1MM7A 2OWZA 4F1UA 3TQWA 2I6EA 4OVQA 4OVJA 4AB6A 4H5FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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