3PUVE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 114
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE01
1A54A 3TKDA 3R6UA 4POWA 3DLNA 3IB0A 2B65A 4EQ9A 4I1DA 3AXFA 4OYVA 4RJZA 4H5FA 1A40A 1RYOA 3ZKLA 3E9XA 4OWDA 1US4A 4NF6B 3KBRA 5I59B 1OLAA 4GVOA 1B3FA 3TQWA 2OWTA 3HO7A 3S4UA 3LBSA 3K4UA 4YB5A 4LATA 3RTWB 1MY2A 4F3GA 5AA2D 2LAOA 1HSJA 4C1UA 1OMPA 2I58A 2ZNTA 2AL5A 3D4GA 1YTVA 2X26A 2Z8EA 4YAHX 3TCGA 3RGYA 4FIMA 5L9SA 1NMUA 3A3UA 4WEPA 3DELB 3PUWE 5FTHA 2NXOA 4RPNA 4L17A 1LAHE 1LGBC 3OO9A 1TFDA 1D9VA 3RY3A 4NF5A 2H25A 5H8NB 1LFHA 4GQOA 2P1SA 4U4SA 3I3VA 4OVJA 3G3KA 4TOZA 3K2DA 1Y20A 2Z23A 5B7DA 4C1TA 1B6HA 1PEBA 2XX9A 2UXAA 2ONKE 3UA8A 1Q1KA 2HFBA 4EQ7A 1H3DA 1MPDA 4RK9A 3C36A 4G4PA 2XXYA 1B5JA 3HPIA 3IJXB 3RPWA 2QJEA 1N3XA 3Q28A 4X1DA 4JWXA 3IK6B 4NEDA 1RYXA 3N6TA 3MVXA 1D3KA 1SYHA 1MH4A 4YB7A 3KSJA 3TZAA 3K1MA 3PMWA 4KR5A 4OFOA 1N7XA 1NNKA 3OEKA 2YJPA 4R9GA 1I6QA 4MBPA 4GFRA 4KYEA 3HCQA 4LUBA 1MY1A 4RPOA 3MVWA 2I0CA 1MDP1 3TUSA 4KHZE 1URSA 1DOTA 5H8QB 1OQGA 4F2OA 2HAUA 1VFEA 2YPNA 2DE2A 3SEUA 2ANJA 1EZ9A 2F5XA 3ZS6A 1LB8A 3H7MA 3IO4A 1R9QA 3CFXA 3FASA 4U1ZA 3VXBA 4GLIA 4OMBA 4YB6A 2NWJA 1JETA 2XX7A 2Y7KA 1N0TA 4NE4A 4F22A 2FA7A 1FQAA 3H4ZA 3Q27A 1IEJA 1MY3A 3IX1A 4FE8A 2XXXA 4MLQA 3ZSFA 1JEVA 2Y7WA 5CMKA 4MF3A 1B7ZA 3H6VA 3DP6A 1Y1ZA 3LSXA 2R71A 3N5LA 1FQBA 4EQBA 2F7BA 4YKKA 1GVCA 4KQPA 1XOCA 4NF8A 3S9NC 2I3VA 1M5BA 4RK2A 3LR1A 3MVYA 4O3BA 3GZGA 2QRYA 2DE4A 2M8CA 4XTCQ 1VSOA 4QF9A 1Y3QA 4OERA 5KCJB 3V5AA 3VE1B 3CI8A 3IB1A 1MQDA 3PPNA 3U94A 3MP1A 3MW0A 1B1HA 4FJPA 3EHSA 1H43A 3TAJA 1EZPA 3FV1A 1S50A 2UVIA 2F6GA 3QK6A 1XS5A 2UYEA 2F36A 2QS2A 3K0VA 1IXHA 2H9BA 4ZZAA 1P1OA 3W9WA 4IO4A 1ZLQA 3TEPA 1SW2A 4ZS9A 1UIVA 3PPOA 4F2QA 4X48A 3FGSA 3GBBA 4IO3A 2X7QA 2QS3A 4R2BA 4PP0A 1JEUA 3KOTA 1YAEA 2NOOA 1RKMA 3DP8A 1ATGA 3K00A 4BDOA 2AL4A 2Q89A 2KLFA 1LFIA 4R6YA 4E0WA 1UTBB 4G77A 5A5XB 2GHAA 3CFLA 1EU8A 3SEVA 5ITPA 3G3HA 1AOVA 3PU5A 2RC7A 5J1DA 3WAEA 2XXWA 4XIGQ 1USYE 5KDTA 4QSCA 4G8HA 3TTKA 1B52A 1D4NA 2QMXA 3P7IA 4GOTA 1QULA 4PFTA 2Y7IA 4FEBA 1BTJA 4LP2B 5M2VA 3K6VA 4F39A 3B7DA 1N76A 3BKIB 4WKMA 4EXKA 5AA2A 2V93A 2NVUB 2Q2CA 1T0KA 4U2RA 4OXVA 3EPEA 3TTLA 5DVJA 4BLAA 4UA8A 1SYIA 2ZYNA 3RLFE 3B6TA 2GFEA 3EHUA 3KJ7A 3M3LA 1Y3PA 3VVFA 1A7LA 3TDJA 2B3FA 3EQ1A 3IAZA 3SERA 1MM6A 3MJNA 3VFJA 1NNFA 3C31A 4NF6A 5I59A 3CSBA 1B40A 4GXSB 5FHNA 5CMMA 3PD9A 4AQ4A 2XXUA 3T96B 4QFKA 4ZE8A 3T93B 1R6ZA 3WAFA 1QUIA 1XT8A 1LB9A 3PMVA 4YMBA 5TP9A 1Z7ME 4JSOA 1AIVA 1XC1A 2E1SA 1IXIA 2DS9A 2ESNA 4NF4A 3FJMA 2I48A 2A5TB 4KD5A 2BJJX 3H6WA 1LBBA 2RCBA 5DT6A 3T22A 3D4CA 1R1NA 5CBSA 2ZYOA 5BWJA 4ELQA 3IO6A 1Y9UA 1NFTA 1Y3NA 3OO7A 3Q29A 3PV0E 3H6TA 1SW4A 1QKAA 5CC2A 1FTJA 2I3WA 2O1MA 3O6HA 3V89B 1IITA 4Z7EA 5I2NA 2Y7RA 4F29A 1NH7A 3O97A 1TXFA 4XKQA 2FNCA 5BUUA 1QKBA 5ELVA 3FZVA 5LOMA 3VV5A 1WDNA 3U93A 2V3TA 3ZKKA 1PBQA 2XHDA 4OZ9A 3T9UA 1GGGA 3N94A 2HXWA 2V3QA 3PMXA 4YZZA 3LSWA 3OMBA 1MDQA 4PQJA 1JW4A 5I58B 4R6HA 4PFUA 4U23A 4OQOA 4ELRA 4JXIA 3RQTA 1JQFA 3UP9A 1B05A 4ND9A 5DVIA 3U8QA 3MP8A 3F11A 1B5IA 4PE5B 2O68A 1M5CA 1OVTA 2RKMA 5F7VA 4AB6A 1QJMA 3T9HB 1IIWA 2O69A 3VLWA 4F3PA 1Y4TA 3M3FA 2UVJA 3MC2A 4EF1A 2A5SA 3FVGA 3QXMA 3FXRA 1JW1A 3O9PA 3N6UA 4P11A 2I6EA 1PB7A 1URDA 1MG1A 3KN3A 3IOVA 3MZ1A 5CMBA 1LFGA 3FATA 2XD2A 4ZDMA 5TPAA 3U92A 1DTGA 4LONB 3OENA 4NMYA 2QS4A 2DP8A 3FJ7A 4G68B 2PX1A 1P1NA 2B3BA 1ZBMA 2Q9TA 1IXGA 4HCWA 1LLSA 4KPTA 4QHQA 3OOAA 3UIFA 3RTFB 1MXUA 5DVFA 3MZ9A 3S2VA 4DE8A 4RA1A 5ITOA 3BBRA 1JVYA 3G3IA 4ZEFA 3OEMA 2QS1A 2F8DA 5H8SA 3JYRA 3TTMA 1B3HA 2DYXA 2YLNA 3O28A 2D21A 1LCFA 1NH8A 4HS7A 3RN8A 4YKPA 1MXVA 4AB5A 2Q8JA 3CIJA 4U1OA 5DEXA 1O63A 4M4GA 4TLMB 1Q35A 3VDFA 1B5HA 1JVXA 1CB6A 3IOUA 4P0GA 5EYFA 1SD3A 4BDRA 4DCXA 3TFLA 1VR5A 3CSGA 4UACA 3O66A 2HEUA 3L6GA 3FVOA 4F3BA 1MM7A 4IY5A 3K6WA 3FXUA 5K2XA 1NNTA 1B51A 4DXBA 3K02A 4IO5A 1P99A 5FHOA 2HAVA 1ZTYA 4Q30B 5AA4A 4N07A 1ELJA 1UTBA 2F7CA 5A5XA 4O3AA 5K2YA 3SESA 4BDQA 2F6PA 3IL1B 4LZ5A 3FV2A 2Z8DA 4QFPA 4OEUA 2OK2A 3K01A 3FVKA 1AH5A 2UVGA 4NWCA 5I2KA 5H8FA 2PT2A 2ONSA 3DM0A 1N7WA 2V84A 3HV1A 3IR1A 3OXNA 2HCAA 1Y1MA 1SI1A 3R26A 1MS7A 5JTYA 4FORA 3SEXA 1QW0A 2DVZA 1KWHA 3PD8A 1B3EA 4QSEA 3CRBA 3UORA 3G3GA 1SDXA 1A8FA 5CM6A 1USYH 3KJTA 4F31B 3GLBA 1Z7NE 1LAFE 2XXIA 3A3CA 4G8MA 4JB7A 3KOSA 3VVEA 2XXTA 2HZKA 4KCDA 2DE3A 4PFWA 3TPAA 2GHBA 5CMCA 4NTLA 1ZKBA 4OEVA 2O6AA 1UQWA 3UGWA 3G3FA 3CG3A 2H4IA 3T9VA 1OLCA 1MXZA 3KSXA 2Y7PA 4FECA 4R74A 1R9LA 1EZOA 4Z0IA 3THIA 1CE2A 1LCTA 1M5FA 2Q88A 3ILTB 1MQJA 3VLUA 3G3JA 3SEWA 3W15C 1B7UA 3E13X 4G2ZA 3LUYA 1DMBA 1MPCA 5DTBA 2HZLA 3HHFA 4OFJA 4QFOA 2QL3A 2REJA 1FQFA 2PBWA 3MP6A 4IO6A 3IJOB 2RC8A 1SBPA 2HQ0A 3B6QA 2H99A 3MWBA 4EF2A 3O6IA 3UK4A 4MFIA 2A5TA 3C35A 4H67A 3IB2A 1PB9A 3PPRA 4IO7A 5I56B 4TLLB 1ANFA 2F97A 4LQ2A 4OFLA 4WXJA 3O29A 1GTKA 1PDAA 1SVXB 3OO6A 3MZBA 4NF8B 2IA4A 1MY0A 1PB8A 3C34A 2F34A 3FVNA 4PETA 5AE4A 4NWDA 1H44A 3SETA 1GV8A 1QVSA 5KZTA 4ESXA 4R72A 2RF1A 3K1NA 4RY1A 1B3LA 3QYTA 2PVUA 3JV9A 2X7PA 2DXYA 1LAGE 2F35A 4P0IA 1GR2A 1VFDA 4H1XA 4JBZA 1H45A 2OZZA 4OTEA 1LBCA 1MQHA 2O51A 3IOTA 5I58A 1EH3A 3LC8A 3KEIA 4I62A 3QSLA 2Q2AA 3H6UA 4YKJA 2QSXA 3RNNA 3U1OA 1LSTA 1AL3A 1FQEA 2PYYA 2FYIA 1OIBA 3RUMA 1A55A 2OWSA 2GH9A 4U4XA 1IQ7A 5EHMA 4LVQA 2XD3A 2ALUA 3KFMA 3PUVE 4F1UA 4I9DA 4C0RA 4EUOA 3MPKA 4KI0E 4IO2A 1MH3A 4IY6A 4ONYA 1O7TA 2XX8A 3SKPA 3CR9A 4F1YA 1AMFA 1P1UA 3TTRA 2G93A 3OSQA 2V3UA 1FQCA 3EHTA 2CZLA 1FTOA 1MPBA 4OENA 4G68C 3PPPA 2Z8FA 3H06B 4DXUA 1B0LA 5H8NA 1J1NA 3SEYA 5KDTB 5B70A 1BKAA 3T66A 1TT1A 2OJTA 4DLDA 4H65A 4DDDA 3TELA 2RCAA 4R6KA 5H8HB 4H8IA 2XXRA 3IOWA 1B4HA 3ODBA 2OLBA 2ABHA 1P1QA 1SQYA 3QIMA 3E4RA 2I49A 4F19A 2ONRA 4N13A 3B6WA 3PGFA 2F78A 4Q0CA 3G7WA 1L5TA 4XKRA 3TCFA 4H6DA 1S9TA 4YMAA 4MH5A 3KN8A 4JWYA 4M1VA 5DYHA 2XXHA 3TQLA 1MY4A 4YU0A 4OHNA 3S9EA 2P2AA 3HSTA 5JEIA 2QPQA 3C33A 1VE4A 1ZU0A 4H8JA 4F18A 4EXLA 4RYAA 3FUZA 2F7AA 5AA1A 2VD3A 5H8QA 4GRKA 4TQUQ 1PBPA 3L6HA 5I57B 4JDFA 3BFUA 5TP9B 3V8XB 3OD7A 1DPPA 2VD2A 3M8UA 2Y84A 3FIRA 5ICQA 3GBAA 3MPLA 4NF4B 4KFQA 1XHYA 4XKPA 1M5DA 5FTIA 2DQVA 1XVYA 1MXYA 1UTHB 4U22A 2AYSA 1N04A 3S9LC 3DP4A 1JNFA 3FJGA 4HCYA 4EDPA 1FTLA 4KYDA 3VLVA 3KGCA 1F9BA 5I2NB 1DTZA 1B46A 1FQDA 4BDMA 1N3WA 2H98A 3ECRA 4QRZA 3O2AA 5L9OA 1P1WA 4QSDA 3W9VA 4GWOA 3KN7A 4O3CA 2O7UA 4KCCA 5KCJA 1D9YA 3LSFB 3BFTA 2UYFA 2ZMBA 3H03A 3FXQA 3KZGA 4RXLA 3USDA 3UN6A 1I69A 1MQGA 2I4BA 3HHGA 5F1QA 4WEDA 2OBGA 4GIZA 4R75A 2P0SA 3PUYE 2DVCA 3CG1A 1MQIA 4GXAA 1LAXA 1JW5A 1NKXA 1M5EA 4BDLA 1DSNA 3EF7A 2AIXA 2DOJA 3MBPA 5ISUA 5CBRA 4NF5B 2DWAA 3QUFA 4LA9A 2ZNSA 4OESA 5CRYA 4U21A 1POTA 4ELOA 3R7XA 4DCYA 1II5A 5TPAB 3PPQA 4DZ1A 1OVBA 1B58A 2VHAA 2DWJA 2XXPA 1WVJA 1MXWA 5TU0A 4QFLA 4IGTA 2VGQA 1PC3A 3LSLA 5I56A 2W7YA 3GXAA 4FATA 2DWIA 3VVDA 4R9FA 3PUXE 3QUJA 4JSDA 3TODA 2H5YA 2CMOA 4X1BA 3VXCA 3H3GA 3IORA 1B3GA 2VP1A 4ECFA 4LQ5A 1N84A 2WKYA 4FAJA 1S7YA 3JZJA 4LZ7A 2IEEA 1OQHA 3N26A 4ZEIA 3C4MA 4XXUA 1NNPA 2PMSA 3O6GA 1B9JA 3HN0A 4H0WA 1ZJLA 5HBCA 4N6PA 5L9MA 5DEXB 4GL0A 2ZXTA 1FTKA 2THIA 4IB2A 2R9JA 3Q26A 2DXRA 1XVXA 1B0HA 5HPQA 2D5WA 4FEDA 1HSLA 1SW1A 1SI0A 3S9MC 5IAIA 2O1LA 1TFAA 4MLVA 1B7HA 3K6UA 1B32A 3TCHA 1QUJA 3K6XA 5CI5A 1B2HA 3PUZE 3TTNA 5JK4A 5I84A 4JWOA 5AA4B 3MAMA 1MRPA 5ICTA 2Z22A 2I4CA 4XKNA 1B1XA 2DWHA 4ZEDA 2QMWA 3V83A 4OETA 3TMGA 5I2KB 5H8FB 1I6AA 1I6BA 4F3SA 1H76A 4BDNA 4X9TA 4ESWA 1FTMA 1A8EA 5IKBA 5H8HA 4F1VA 1IXCA 4I8CA 5JTYB 1FW0A 1IZ1A 3E3KA 4POXA 3FD3A 4ZZEA 4HTGA 3OELA 4Q8RA 3I5OA 2E0SA 3MQ9A 1ZIUA 5FHMA 1POY1 4ZE9A 2G29A 2NUVA 3CVGA 4THIA 4Q5TA 1Y4CA 2VOZA 1O64A 3Q25A 1NL5A 3RT6B 4DIGA 4YKIA 2XXVA 4R2FA 3RT8A 4H5GA 1YPNA 4KYSA 5L8DA 3MUQA 1IUDA 1QUKA 2UVHA 2ZYMA 4GD5A 1UIUA 4K3FA 1HSEA 2XXQA 2GRVA 5AA3A 3MVZA 2ZNUA 3CFZA 4ZEBA 3TYHA 3ONMA 1WODA 3C9HA 4PFYA 5EHSA 2O84X 1YCJA 1BLFA 2R6GE 3T9XB 2OCUA 4GL8A 2RINA 2I0BA 2D3IA 1US5A 3QAXA 3KG2A 4E0XA 4RNSA 5I57A 3M3KA 1URGA 2PT1A 1BP5A 4R73A 3C32A 2DSFA 4HW8A 1DPEA 4GF8A 5HM4B 1BIYA 4G8NA 4YICA 3SDFA 3K1PA 4ISUA 1MXXA 2REGA 1ZMGA 1UTHA 1SW5A 2ZYKA 4ELPA 3A09A 1B4ZA 4ZECA 4G68A 4DXCA 2RC9A 3OO8A 1TWYA 5AA2B 3EN3A 3OSRA 1A99A 2O7IA 4LZ8A 3ILUB 3U72A 1FCKA 3I6VA 2V25A 4IGRA 4ZEKA 4QFNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JVIA 1A54A 3TKDA 3R6UA 1DK4A 4PFIA 4POWA 3DLNA 3IB0A 2XWVA 2CZKA 3SZPA 2B65A 1NV6A 4EQ9A 4I1DA 3AXFA 4OYVA 4RJZA 4H5FA 1A40A 1RYOA 3ZKLA 3E9XA 4OWDA 1US4A 4NF6B 3KBRA 5I59B 4MIJA 1OLAA 4GVOA 1B3FA 3TQWA 2OWTA 4PF8A 3HO7A 3S4UA 4GWWA 3LBSA 3K4UA 2PFYA 4YB5A 4LATA 3RTWB 1MY2A 4F3GA 5AA2D 2LAOA 1HSJA 1G0IA 4P47A 4C1UA 1OMPA 2I58A 2ZNTA 2AL5A 2QVRA 3D4GA 1YTVA 2X26A 2Z8EA 4YAHX 5I7IA 3TCGA 3RGYA 2CZHA 4FIMA 5L9SA 1NMUA 3A3UA 4WEPA 3DELB 3PUWE 5FTHA 2NXOA 4RPNA 4L17A 4PBQA 5IZZA 1LAHE 1LGBC 4HXVA 3OO9A 1TFDA 4NAPA 2FHYA 1D9VA 3RY3A 4NF5A 2H25A 5H8NB 1LFHA 4GQOA 2P1SA 4U4SA 3I3VA 4OVJA 3G3KA 4TOZA 5ET6A 3K2DA 1Y20A 2Z23A 5ESYA 1LBVA 5B7DA 4C1TA 1DCUA 1B6HA 1PEBA 2XX9A 2UXAA 2ONKE 3UA8A 4OVTA 1INPA 1Q1KA 3D1RA 1NV2A 2HFBA 4EQ7A 1H3DA 1MPDA 4RK9A 3C36A 4G4PA 2XXYA 1B5JA 3HPIA 3IJXB 3RPWA 2QJEA 1N3XA 3Q28A 4GX6A 4MNPA 4X1DA 4JWXA 3IK6B 4NEDA 1RYXA 3N6TA 3MVXA 1D3KA 1SYHA 1MH4A 4YB7A 2GQ1A 3KSJA 3TZAA 3K1MA 3PMWA 1NV3A 4KR5A 4OFOA 1IMAA 1N7XA 1NNKA 3OEKA 2YJPA 3FXBA 4R9GA 1I6QA 4MBPA 4GFRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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