3PUVE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 114
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE01
4QFOA 2XXXA 4THIA 5KZTA 1MY0A 4OERA 2DS9A 1BKAA 3RT6B 4ESXA 1FTMA 2Y7PA 3T9VA 3OO6A 2I4BA 4LUBA 3U94A 4ZECA 4PFTA 4EQ9A 1A99A 3G3KA 2ANJA 3TTLA 4Z7EA 1DPEA 1FQFA 1B51A 3EQ1A 5ICQA 2P0SA 3KGCA 1LFIA 3MBPA 2D5WA 3PPNA 1Y3NA 2F78A 2Y7KA 3JYRA 1XS5A 2R9JA 4G8NA 3D4GA 2OCUA 3E3KA 3GLBA 4H5GA 4LONB 5I56A 3N6TA 3H6WA 2A5TB 5AA4B 2D3IA 4ZS9A 1DMBA 3VXCA 5A5XA 2XXQA 2DWAA 2QRYA 3DP4A 2OWTA 3G3HA 3GZGA 3KN8A 1EZPA 1UTHB 4L17A 1GV8A 3TTKA 4GF8A 3U8QA 1IIWA 5AA2D 3CIJA 4GD5A 3MP6A 2KLFA 2PMSA 3UORA 2HFBA 1B5IA 2NOOA 4FJPA 3FATA 4G77A 3TZAA 3CRBA 2Q9TA 5ITOA 4R2BA 1OMPA 2ZNSA 3T93B 4QFLA 1MXXA 2HZLA 3IAZA 1JQFA 4HS7A 5DYHA 3M3KA 3MVZA 1EZ9A 3PU5A 4C1UA 4JWXA 3MVXA 3T9UA 4F3BA 5CBRA 1B52A 1VSOA 4ESWA 2XXUA 1YAEA 1SI0A 4QFNA 3R7XA 1D4NA 3RUMA 3UK4A 3GXAA 3MP1A 4ELQA 3TQLA 1IQ7A 5EYFA 1FTOA 2GH9A 4NE4A 5I2NA 2RCBA 1B7UA 1YCJA 3ECRA 3IL1B 2GHAA 1O64A 3W15C 1IITA 1N3XA 1ZU0A 2RC9A 2VOZA 2YLNA 4FIMA 5FTHA 1R9QA 2X7PA 3UGWA 4BDRA 4R72A 1IXCA 1AIVA 1B0HA 1B5JA 4DXUA 1QUKA 4G68A 1MH4A 3SDFA 2ONKE 4H8JA 4EF1A 2F6PA 1A7LA 1MY4A 3EPEA 1N76A 3AXFA 5KDTB 4O3BA 3ZS6A 3CSGA 1OVTA 4G68B 4HTGA 3U92A 4YKPA 2XXVA 4FAJA 2QJEA 3SETA 4FECA 4QSEA 4F29A 4YMAA 1TT1A 1XVXA 1A8FA 1MY2A 3CFLA 3S9EA 3C36A 3M3FA 1XVYA 3TTNA 4LZ8A 4F2QA 5L9SA 3N26A 3KBRA 4GXSB 3KSJA 4YB6A 5F7VA 4F31B 4H0WA 2OWSA 5I56B 3ILTB 4R9FA 5AA2A 4PFWA 1DPPA 3PPRA 3SEWA 2QS3A 4DE8A 3K6UA 1MQGA 4IO4A 1XT8A 4Q0CA 4DXCA 5HPQA 1B3HA 3G3IA 5AA2B 1ZJLA 2I6EA 2ZYNA 2DVZA 2O51A 3K0VA 3JZJA 3KSXA 5TPAA 4EUOA 3VVDA 3S9MC 4KYEA 3S2VA 5I2NB 1A54A 1XC1A 5H8HB 3FZVA 2HQ0A 3O28A 4JDFA 1LAFE 1MH3A 1VFDA 3PUYE 4YKJA 4BDOA 2R6GE 2O84X 4N13A 4GRKA 5TP9A 1NNKA 3TMGA 1UTHA 5I2KA 3VLVA 1FTJA 1SW5A 2Y84A 3MW0A 5A5XB 3PV0E 4I8CA 2UYFA 1N3WA 3FJMA 4R6KA 4RNSA 4DDDA 2FNCA 5ELVA 1SW4A 1FQDA 4GWOA 4YU0A 3O29A 1B3FA 2VD3A 1CB6A 1O7TA 2HEUA 2ZNUA 4YAHX 2F7AA 3HN0A 1FTLA 2DE4A 3P7IA 4K3FA 2I49A 4P0IA 3THIA 3TYHA 1MY1A 1NFTA 2D21A 3KOSA 3V8XB 2DXRA 5H8FA 5IAIA 4RPNA 1QULA 1JVXA 4NF4B 2AIXA 4R2FA 3SESA 1UIVA 2YPNA 3A3UA 1QJMA 4BDNA 1DOTA 5DVJA 1B3LA 4JXIA 4IGTA 3TCFA 4Q8RA 1LBBA 3CI8A 3PD8A 1USYE 3Q29A 1PC3A 4R9GA 4O3AA 4U4XA 3TQWA 3TTMA 1B4HA 3QYTA 3C35A 3K6VA 2QL3A 1L5TA 3SEVA 4ELPA 1D9VA 1Q1KA 3U72A 1LAGE 1O63A 3T96B 3HV1A 3L6HA 3A09A 3SEYA 1IUDA 1YTVA 5CRYA 5DVIA 4KR5A 1MXZA 2Z8DA 1PB8A 1TWYA 4JSOA 3GBAA 1BTJA 3KN3A 3QSLA 3VFJA 3ZSFA 1MXWA 1I69A 4BLAA 1TFDA 2V84A 5DVFA 5B7DA 3LUYA 4WEPA 5EHMA 4OFLA 3IOUA 1TFAA 3RTFB 2REJA 3LSWA 4ZZEA 2DSFA 4H1XA 1US5A 1S50A 4NF8B 3MZBA 4OXVA 1OLCA 1T0KA 4TOZA 3VE1B 1NH7A 4U1ZA 1IXGA 5AE4A 3K4UA 5ICTA 4OETA 1I6QA 1OQGA 2PT1A 2UVJA 2OBGA 4R74A 5H8HA 1MS7A 1MG1A 1R6ZA 1N7XA 3FVGA 3M3LA 3VLWA 1AMFA 3OO7A 4G68C 2QMXA 3MJNA 2F8DA 3PMVA 4F1UA 1B3GA 3KN7A 4OWDA 5IKBA 3MAMA 4UACA 1Y9UA 3OELA 2DYXA 3L6GA 1B1HA 3K01A 3O66A 1Y4CA 2CZLA 3FIRA 1UTBB 3QXMA 1WODA 2FYIA 2W7YA 2A5SA 1H44A 4KPTA 5FHMA 4NF6B 3K6XA 3N5LA 1LAHE 1ZTYA 2IEEA 4IO3A 4MH5A 2XXTA 4R73A 4U1OA 3SEXA 5JEIA 3LC8A 2RINA 4NF4A 4ND9A 3OEMA 4R6YA 3Q27A 4LZ5A 5CI5A 2XXWA 1URDA 2RCAA 5CC2A 3G3FA 3ZKKA 4ELRA 3C32A 3O6GA 5L9MA 1Z7NE 4N6PA 4R75A 3TCGA 2H4IA 3QAXA 5H8QB 1H76A 3HHFA 2H98A 3H4ZA 4IY6A 4NWCA 4YKKA 1NNTA 4NEDA 4OHNA 4ZEBA 2X26A 3ONMA 1SI1A 1TXFA 3H06B 3H6UA 2O6AA 1B7HA 4GOTA 5J1DA 4IY5A 4I1DA 4IO2A 4ZZAA 1PBPA 1WVJA 4OFOA 1ATGA 3O2AA 4RYAA 1DTZA 1CE2A 4P0GA 3KZGA 1M5FA 5AA4A 3RGYA 5KDTA 3IJXB 4WKMA 3CG1A 4EXKA 1AH5A 2DE3A 3OSQA 3LSFB 3H6TA 3QIMA 3O6HA 3FVOA 4Z0IA 3VDFA 3ODBA 4TLMB 3EHSA 2I48A 2UYEA 2XX8A 3CFXA 4NF5A 3IK6B 3FV2A 5FHNA 5I58B 1R1NA 5AA1A 4DIGA 4GIZA 2ALUA 4U22A 5I57B 4IB2A 2OZZA 2B3BA 4MFIA 5CMCA 3WAEA 3E4RA 4KI0E 4YB5A 3SKPA 4U21A 1DTGA 4C0RA 5KCJB 3TKDA 4IO6A 2GHBA 2PBWA 1MXUA 1H43A 2VHAA 1JETA 2X7QA 3OEKA 4DXBA 2ESNA 3BFUA 3I5OA 2Z8EA 1B9JA 3FJGA 3LSLA 3QUJA 1IXIA 3B6QA 3B7DA 2Q2AA 1P1NA 4IO5A 4GL0A 3T66A 3T9XB 5CMKA 4LQ2A 3FASA 2DE2A 1XOCA 2Y7RA 4PQJA 3BKIB 4FEDA 4FEBA 4ZE8A 4HCYA 4U23A 1I6BA 1RYOA 4O3CA 1PDAA 2DQVA 3G7WA 3PUWE 3UP9A 2F35A 1NMUA 3KJ7A 3SEUA 3VVFA 1JVYA 1GVCA 1ELJA 4XKPA 4KYSA 1FTKA 3OXNA 2F36A 1QW0A 2IA4A 3B6TA 3PUXE 4GQOA 4OENA 1SVXB 4OYVA 4F3SA 1BP5A 1NNFA 2Q89A 2Z8FA 1MM6A 2FA7A 4YZZA 2Z23A 1S9TA 4XIGQ 5TPAB 4JWYA 3C9HA 4Q30B 1Q35A 1SYIA 2ABHA 4GFRA 4PP0A 3USDA 3FXRA 1POY1 1Z7ME 2G93A 3V5AA 1B3EA 5I84A 1B32A 1JEVA 5LOMA 5H8NB 2RKMA 4ONYA 3EHTA 1B58A 2HXWA 1II5A 2V3TA 4X9TA 4XKQA 3PMXA 5BWJA 4IO7A 1FQCA 1P99A 2F7BA 3KG2A 2OK2A 1NL5A 1Y3PA 3OSRA 1RKMA 4UA8A 1MDQA 3DP6A 3V89B 3S9LC 1YPNA 2THIA 4E0XA 4RY1A 5CM6A 2NXOA 5H8QA 1LCFA 4F3GA 1UIUA 1D9YA 2I3WA 1MXVA 3MUQA 5JTYB 3OENA 4C1TA 3Q26A 4FE8A 2O1MA 2I58A 3MWBA 1LCTA 2UVHA 2O68A 2XXRA 3DM0A 3K2DA 1LFGA 4QSCA 5CMBA 2ONRA 3FJ7A 3K02A 1POTA 1VR5A 1IZ1A 2HAUA 3OO9A 5I59A 5H8SA 4LZ7A 2P2AA 4RJZA 3S9NC 4QFKA 4QRZA 4YMBA 3HSTA 4XTCQ 4OZ9A 3IR1A 1MY3A 4HCWA 5KCJA 2VD2A 2ZYKA 4G2ZA 4ISUA 3IJOB 4DCXA 5B70A 4MBPA 1QVSA 3OOAA 3W9VA 4LA9A 3LSXA 3RN8A 3ILUB 3O9PA 1B4ZA 3O6IA 1PB9A 3H6VA 2ZNTA 4XXUA 1H3DA 3BBRA 1VE4A 2PVUA 3VLUA 3HO7A 3FV1A 4NMYA 1UQWA 1N04A 1NNPA 1B46A 4LQ5A 3U93A 1MPCA 2B65A 4G4PA 2REGA 4ZE9A 1URSA 1OIBA 3IB0A 3T9HB 1HSJA 1N84A 2ZXTA 4QFPA 5AA3A 1MXYA 1B05A 1JEUA 1JW5A 2ZYOA 3MQ9A 4OMBA 3K1PA 3OD7A 3KFMA 4H5FA 1FCKA 3IOTA 4OFJA 5K2XA 1US4A 4F19A 4U2RA 2DWJA 3TODA 3OMBA 2XD2A 4XKRA 3DP8A 4IGRA 4AB5A 3RPWA 1M5EA 1LLSA 1PBQA 1IEJA 2HAVA 5HM4B 3V83A 2ZYMA 1P1QA 2Q8JA 1P1WA 1ZKBA 2V25A 3PD9A 1M5DA 2Q2CA 1BLFA 1Y4TA 1I6AA 4NF8A 4NF6A 5DEXB 3RLFE 4E0WA 4F39A 4NWDA 3PPOA 4KYDA 4F18A 3E9XA 3N94A 4JWOA 3IB1A 3MPKA 1AL3A 3PMWA 1GGGA 1ANFA 3OO8A 4KCCA 1NH8A 3N6UA 3PPQA 2E1SA 4KD5A 3PUZE 5FTIA 3H3GA 2H25A 3F11A 4RK2A 4KQPA 1FQEA 4ZEDA 1MM7A 2DXYA 2UVGA 4FORA 4X1BA 3R26A 1B7ZA 1FW0A 1ZBMA 1FQBA 3GBBA 2OLBA 2B3FA 1LB9A 4H8IA 2DOJA 5H8NA 5JK4A 4FATA 1MPBA 3PPPA 4PETA 3EF7A 1GTKA 4MF3A 2I0CA 1Y1ZA 1LAXA 1Y20A 1SDXA 4HW8A 2QS1A 2XXHA 2HZKA 4RA1A 1B2HA 2PX1A 5DEXA 1LFHA 3FXQA 3G3GA 3QK6A 1GR2A 2VP1A 1SW1A 3IB2A 3KOTA 3LBSA 3M8UA 1OLAA 2QPQA 3C33A 4OTEA 5TU0A 3U1OA 3TDJA 4DZ1A 4EQBA 4LVQA 2ONSA 2RF1A 3HPIA 3UA8A 4G8MA 2V3QA 4MLQA 3WAFA 3Q28A 3JV9A 3MC2A 2XXYA 1A8EA 4U4SA 3S4UA 3MZ1A 2QSXA 1N0TA 2ZMBA 4NTLA 4F2OA 1EU8A 3CSBA 3CVGA 5ISUA 5BUUA 4ZEKA 3CG3A 4JB7A 1M5BA 3TPAA 4GLIA 2O7IA 1JW1A 1URGA 1A40A 2F97A 2I0BA 3CFZA 5DTBA 3VV5A 1H45A 3VXBA 1LGBC 5I57A 4ZEFA 4F1YA 1LBCA 3BFTA 4GXAA 2CMOA 1QUJA 4YKIA 4F3PA 2DP8A 5I58A 2VGQA 5K2YA 3FVKA 4OESA 2DWIA 4I9DA 1B1XA 4ELOA 4PFUA 4F22A 3TEPA 2V3UA 2RC7A 3IOWA 3LR1A 3FD3A 1QUIA 2XD3A 4X1DA 3FVNA 1FQAA 2I3VA 3Q25A 3RQTA 3TFLA 3KJTA 4RPOA 1EH3A 4H65A 3O97A 2F7CA 4TQUQ 4YICA 4ZDMA 3A3CA 2XX7A 2O69A 1Y3QA 3EHUA 3IOVA 4XKNA 4F1VA 2DWHA 4NF5B 3KEIA 3UIFA 4ECFA 2PT2A 3K6WA 3H7MA 5F1QA 1KWHA 4LP2B 3MVWA 3TUSA 1HSEA 1B6HA 2Q88A 3B6WA 3C34A 2UXAA 3DELB 3EN3A 4OVJA 2LAOA 3QUFA 4GL8A 3CR9A 2I4CA 4POXA 4RXLA 3SERA 3TCHA 1MQDA 3UN6A 1R9LA 3PGFA 1QKAA 3VVEA 1SQYA 1P1UA 2NWJA 1SW2A 3K1NA 1LSTA 3K00A 4YB7A 1MDP1 2AYSA 3H03A 1D3KA 2XXPA 2XHDA 3MPLA 4MLVA 4OEVA 4WXJA 1J1NA 3RT8A 1EZOA 3C31A 3IO4A 1BIYA 5M2VA 1RYXA 4P11A 4EF2A 5CBSA 2AL5A 4JSDA 5ITPA 3TTRA 3FXUA 3TAJA 1PEBA 4AQ4A 4I62A 2HCAA 4PE5B 2OJTA 2QMWA 4M4GA 5I2KB 5TP9B 2Z22A 4BDLA 4N07A 1N7WA 4KFQA 4ZEIA 1SD3A 1OVBA 1SYHA 4R6HA 4BDQA 4OQOA 2GFEA 1MQHA 4M1VA 1LB8A 2Y7WA 3FUZA 3RTWB 4DCYA 5FHOA 2PYYA 2GRVA 1MRPA 1MPDA 4LATA 1B0LA 5L8DA 2O1LA 2YJPA 4POWA 1QKBA 2AL4A 2QS4A 2P1SA 2XXIA 4G8HA 3DLNA 1XHYA 3I3VA 5H8FB 1VFEA 1UTBA 4QSDA 2M8CA 4DLDA 2F5XA 3C4MA 2O7UA 1ZLQA 3R6UA 2R71A 2UVIA 5L9OA 2DVCA 1PB7A 2H5YA 3MZ9A 1B40A 1ZIUA 1USYH 2NVUB 1Y1MA 3FGSA 3RY3A 3ZKLA 4WEDA 4EQ7A 1M5CA 4EXLA 1F9BA 3HCQA 1SBPA 2Y7IA 2WKYA 1P1OA 2XX9A 1WDNA 5JTYA 4RK9A 3K1MA 2F34A 3I6VA 3W9WA 2G29A 4OEUA 5HBCA 2F6GA 1B5HA 1MQJA 4QHQA 4AB6A 1MQIA 2V93A 4BDMA 1NKXA 1DSNA 4KCDA 3T22A 2NUVA 1IXHA 5CMMA 5I59B 3HHGA 1S7YA 3D4CA 1JW4A 4GVOA 1AOVA 4X48A 2A5TA 3MVYA 1HSLA 4PFYA 3TELA 2QS2A 4Q5TA 4EDPA 1JNFA 2BJJX 1OQHA 4JBZA 2H9BA 4KHZE 2E0SA 4QF9A 3E13X 1ZMGA 3IO6A 4H67A 3RNNA 4TLLB 3MP8A 5DT6A 3G3JA 3IX1A 5EHSA 4H6DA 3PUVE 2RC8A 2H99A 1A55A 3IORA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y7PA 4EQ9A 5ICQA 2P0SA 3MBPA 3PPNA 1Y3NA 2F78A 2Y7KA 3E3KA 3GLBA 4H5GA 5I56A 5AA4B 3GZGA 1D9QA 1GV8A 5AA2D 4QXDA 3MP6A 2PMSA 4G77A 4PF8A 1OMPA 2ZNSA 4PBQA 3IAZA 5DYHA 3PU5A 4F3BA 2XXUA 4QFNA 3GXAA 1LBVA 1IITA 1ZU0A 2YLNA 4FIMA 1AIVA 1IXCA 1QUKA 1A7LA 1MY4A 1OVTA 4HTGA 4AS5A 4FAJA 2XWOA 3CFLA 4MX6A 3C36A 3KSJA 2OWSA 1FPEA 5F24A 5HPQA 3G3IA 2ZYNA 3K0VA 3D1RA 5H8HB 2XA5A 3O28A 1LAFE 5EQ7A 5A5XB 4GX6A 2UYFA 1N3WA 2HXRA 1B3FA 3THIA 4P0IA 1NFTA 2D21A 5IZ1A 4NF4B 3FXBA 4BDNA 1DOTA 1LBBA 3TQWA 3KC0A 1B4HA 3QYTA 3SEVA 1L5TA 1D9VA 3U72A 3L6HA 3A09A 4O7IA 3SEYA 4KR5A 2Z8DA 1FBPA 1PB8A 4JSOA 1BTJA 3ZSFA 5DVFA 4OFLA 3LSWA 4H1XA 4MNIA 4NF8B 1NH7A 4U1ZA 3K4UA 2UVJA 1MS7A 3FVGA 3M3LA 1FBFA 1B3GA 3KN7A 1B1HA 1H44A 1ZTYA 2IEEA 4R73A 3SEXA 4R6YA 3Q27A 4LZ5A 2RCAA 1YXIA 1FPDA 4ELRA 3TCGA 3QAXA 2B4LA 2H98A 3H4ZA 1TXFA 4I3YA 3O2AA 3IJXB 1AH5A 3LSFB 3H6TA 3VDFA 3EHSA 3CFXA 2XX8A 1LBYA 3FV2A 5AA1A 2ALUA 5CMCA 4KI0E 1DTGA 4C0RA 1EYIA 5KCJB 4IO6A 4DXBA 3I5OA 3FJGA 4MJOA 4OVTA 3B6QA 1P1NA 3T9XB 4GL0A 4LQ2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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