3B6QA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) mutant t686a in complex with glutamate at 2.0 resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTAAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural and single-channel results indicate that the rates of ligand binding domain closing and opening directly impact AMPA receptor gating.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b6qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b6qA02
4H6DA 3FVGA 4RNSA 2F34A 5EHMA 2ZNTA 3LSXA 2PT1A 3A3UA 3TUSA 3I3VA 3OO7A 2OWTA 5L9MA 3VDFA 3ECRA 1KWHA 3KOSA 3OMBA 2H9BA 1GGGA 4OFJA 1MPBA 4ZEKA 4F3SA 2QS2A 4DLDA 2XXHA 1TT1A 4BDRA 1SYIA 4U23A 4GIZA 5FTHA 5BUUA 3OO9A 2XXTA 3PMWA 3O97A 3TMGA 4R9FA 4LUBA 3HV1A 4H5FA 4IO7A 4GF8A 1MY4A 1VE4A 1JW4A 2D3IA 3CR9A 1URSA 1JETA 2E0SA 3THIA 4C1TA 4I8CA 4DXUA 5HPQA 1OVTA 2I0BA 2G93A 1ZU0A 3QYTA 4KCDA 2ALUA 3TQWA 4TOZA 3TCHA 2GRVA 4C1UA 5CMKA 4HCYA 1OLCA 4RA1A 2H25A 1IXGA 3CFLA 4IGRA 3IJOB 2ABHA 1B52A 5I59A 4OXVA 2XX9A 4ELQA 3FXRA 1MY0A 5DT6A 3T96B 2VP1A 2VGQA 4ZS9A 2GHBA 1SW5A 4OENA 1O63A 1RYXA 4ZDMA 1ZMGA 3B6QA 1UQWA 4YB5A 4PFYA 3S9MC 1ZTYA 2PBWA 2I6EA 3A09A 3JZJA 1N3XA 4KCCA 3LUYA 1I6AA 2AIXA 2I0CA 4ZECA 4ZEFA 2UVJA 1FTKA 3FVNA 2THIA 3L6HA 5DVFA 4KFQA 1MXZA 3K0VA 2H99A 3LC8A 4NWCA 1O7TA 1N84A 5DVJA 3O29A 1AOVA 2WKYA 4PP0A 1PB8A 3CSGA 3ZKLA 3N94A 1B7ZA 1OMPA 4UACA 2RC7A 4MF3A 5CC2A 2Z8DA 5B7DA 3SETA 4QFKA 5DEXB 4OFOA 3QSLA 4ND9A 1FTLA 3KJTA 1D3KA 1P1UA 2KLFA 1HSJA 1A99A 5I58B 1UTBA 3H7MA 1B5HA 3EQ1A 4IO3A 2QL3A 3U8QA 1NKXA 4G4PA 4NE4A 2Q89A 3C33A 3ODBA 4YKPA 5FHMA 4RPNA 3PPNA 2M8CA 1URGA 2B3FA 1SD3A 2QRYA 3K6WA 1YAEA 1ZKBA 4RK2A 3MZBA 3B6WA 2XX8A 4U22A 2FA7A 2DOJA 2REJA 1A55A 4N07A 1MDP1 2H4IA 5FTIA 1O64A 1MQIA 5CI5A 1MPDA 1JVYA 3S4UA 3IR1A 2V93A 2Y7IA 2XD2A 4U4SA 2PVUA 1OQGA 5A5XA 1BKAA 1MS7A 4ZE8A 1MH4A 4DZ1A 3R6UA 1NNTA 4F3PA 5K2XA 3T22A 5CRYA 4G8HA 5H8NA 5AA4B 1TFAA 5JK4A 3HCQA 4M1VA 4R2BA 2P0SA 1AL3A 1NNKA 3VE1B 1Z7NE 4U2RA 4DXCA 3MPKA 4JXIA 4EF2A 3HN0A 4F1UA 3D4CA 3C35A 3C9HA 3PMVA 1IXHA 3MW0A 3UIFA 4THIA 5ITPA 1USYH 3OENA 3N6TA 4POXA 4AB5A 5I56B 3PD9A 1LCTA 2Q88A 2Q8JA 1IQ7A 4OVJA 3C31A 1MQHA 4OERA 5ICTA 2F7BA 4R6YA 4GQOA 2Z22A 4I1DA 1LCFA 1N7XA 5I59B 3U94A 3B6TA 4ESXA 1NNFA 3KJ7A 3M3KA 4R2FA 4H67A 1LLSA 3Q27A 3K1MA 4OETA 5EYFA 4OFLA 4P0IA 2G29A 3G3IA 1LBCA 3TKDA 4LZ5A 3PPRA 4RPOA 2ONRA 3U92A 2XXRA 3OOAA 1NFTA 3TELA 2DE2A 4N6PA 5I57A 3H6TA 1DOTA 3TTLA 3M8UA 4R74A 3VXCA 1EZOA 1II5A 4LONB 2FNCA 4X9TA 2X7PA 3DM0A 1DPPA 3EPEA 1MH3A 3OO6A 1VFEA 4KR5A 2ZYKA 3PMXA 4WEPA 1M5CA 2ESNA 3W9WA 1YTVA 2YJPA 3G3JA 3FJMA 4ISUA 1IITA 1NH8A 3PUXE 5M2VA 4IO5A 1OQHA 4FORA 4Q30B 5JTYA 4IO4A 5AA1A 4MLQA 1PEBA 3G3KA 3FATA 1US4A 1LB8A 2AL5A 3IOVA 2DWIA 4LP2B 1B3HA 1B7UA 5TPAB 1UTBB 2XXYA 3PUYE 1QKAA 3UK4A 3SKPA 3KN8A 1FTMA 1Y3NA 3ZS6A 4E0XA 4EQ9A 3RTFB 4YMAA 3KZGA 3K02A 4GLIA 2V3TA 4IO6A 4YKIA 4H8JA 5IKBA 4X48A 3WAFA 1PB9A 1S7YA 4YKJA 3MZ9A 2D21A 3SERA 3LBSA 3G3GA 4O3CA 2F78A 5KCJA 1FQDA 3IOUA 2HFBA 1GTKA 4EQ7A 4ELRA 4JWYA 3KOTA 3TDJA 3FIRA 1B3GA 4AQ4A 3K6UA 3OO8A 3MUQA 5ITOA 4LQ5A 3VLVA 2DXRA 3KG2A 3MJNA 2Y7KA 3LSFB 3MP6A 1MRPA 3KSXA 3MC2A 1B58A 3DELB 4TQUQ 1B2HA 4HS7A 2NOOA 2F7AA 2ONSA 2Q2CA 5H8NB 3ILUB 2V84A 4R72A 1VSOA 4GWOA 4RY1A 4Z7EA 3VFJA 3F11A 1A7LA 3S9NC 5KDTA 3O66A 5IAIA 5I84A 2X26A 3BFTA 2F35A 4UA8A 2XXXA 4YICA 2ZMBA 2DE4A 1L5TA 3IB2A 5H8HA 1Y20A 1GVCA 5ELVA 4KYEA 2OBGA 2XXWA 4JSOA 1LFIA 4KYSA 1MPCA 3IO4A 4PFTA 3RQTA 4FEBA 1H44A 3CG1A 3IX1A 1Q35A 4YB6A 1DPEA 1DTZA 4Q0CA 1FQFA 1N76A 4K3FA 4QF9A 3VVEA 3PD8A 4ONYA 3S2VA 2DYXA 1Y3QA 2PX1A 5CM6A 5TU0A 4OZ9A 3QK6A 2A5SA 3R26A 2A5TA 3TODA 5AA2A 1FQCA 1A8EA 3CSBA 4POWA 4G2ZA 1VR5A 3GLBA 2YLNA 1B1XA 3RY3A 2XD3A 4ZZAA 3CRBA 2O69A 4KD5A 3BKIB 2HQ0A 2QMXA 5CMMA 2XXQA 2I49A 1PB7A 1H76A 5I57B 3JYRA 2NUVA 4ZE9A 1FQBA 3Q28A 1SQYA 3ILTB 4LZ8A 5CBRA 4DIGA 5K2YA 4FAJA 4BDNA 5F1QA 2FYIA 1QUKA 4IY6A 3M3FA 3TFLA 2O51A 3D4GA 3SEYA 2Q2AA 4F2QA 4F18A 2AL4A 2AYSA 3OELA 5LOMA 4NTLA 4PFUA 2RINA 1D9VA 4KHZE 1N0TA 4HTGA 4FIMA 2DE3A 3PPPA 2DVCA 4RJZA 4JBZA 4HW8A 4HCWA 2D5WA 1OLAA 4C0RA 3OEKA 1QW0A 3RUMA 3FZVA 4NF8B 4R9GA 3SEUA 3W15C 4F29A 1B51A 2HZKA 2QJEA 2HZLA 2IA4A 1P99A 3TTKA 3OXNA 2CMOA 4QRZA 1AMFA 2E1SA 3FJGA 3FXUA 4NF5A 1LGBC 4F19A 4F31B 1H45A 4YB7A 3E4RA 3GXAA 5KCJB 2RC9A 2Y7PA 4YAHX 1WVJA 1MXWA 5AE4A 2B65A 4MBPA 1RYOA 4GXSB 5HM4B 3O6GA 4QSCA 3B7DA 1P1WA 3K01A 4Q5TA 3GZGA 3E13X 3VLWA 3FVKA 3UN6A 1TFDA 2ZYNA 3V5AA 4DE8A 3RGYA 2DWHA 4H1XA 4NMYA 4PE5B 3ONMA 1PBQA 3O28A 3VLUA 2R9JA 3QAXA 5DTBA 4ESWA 4JDFA 1EZ9A 1Y1ZA 4ZEBA 4XKQA 5L8DA 4BDQA 2V3QA 3CFXA 4U1OA 4ZEDA 1B4HA 5H8HB 1J1NA 1MY1A 3C36A 1MG1A 3LSLA 2I3VA 1LAHE 4F39A 5HBCA 3SESA 2YPNA 1ZBMA 3IJXB 4DXBA 4G8MA 1QULA 5ISUA 3KSJA 1Y9UA 4OEUA 3TCGA 3AXFA 1EZPA 1PC3A 4FE8A 4WKMA 3MQ9A 1MDQA 3MAMA 3C34A 3RT8A 1B3FA 4OMBA 5TP9A 4IO2A 3T66A 3DP4A 2A5TB 1FTOA 1MQGA 2IEEA 3U72A 3TTNA 3EF7A 1UTHA 3G3FA 4BDOA 3OSQA 1R9LA 3IL1B 3PUVE 2QPQA 4FEDA 4QFLA 1B32A 3IO6A 4LZ7A 4O3AA 3EHUA 3E3KA 5I2KA 3N26A 3MBPA 2OCUA 5CBSA 2Y7WA 5B70A 2RKMA 2Y7RA 2UYEA 3O6IA 1D9YA 4QSEA 3VVDA 1H3DA 1JQFA 4P11A 2DS9A 3MP8A 4ECFA 1N3WA 1R9QA 1FTJA 4Q8RA 4BDMA 3L6GA 2ZNSA 3SEXA 3GBAA 4QHQA 3H6UA 3UGWA 2DP8A 1B7HA 3TEPA 2F6GA 1MXUA 3CI8A 1S9TA 3PPQA 3Q25A 4P0GA 1OVBA 2QMWA 4G68C 1LAGE 2O6AA 1NH7A 1A40A 4E0WA 4NF6A 4XKNA 2HXWA 3UA8A 2ZNUA 2UVIA 3EHTA 3USDA 4YKKA 4WEDA 3M3LA 4FJPA 4ELPA 3RPWA 3IB0A 3U93A 5I2NA 4XKPA 4LATA 1ZIUA 4OEVA 4L17A 1B46A 1UIUA 2QSXA 4NF5B 1IZ1A 4KPTA 1GV8A 1LB9A 1MY3A 3PUZE 3I6VA 2BJJX 4NEDA 2H98A 2CZLA 3HHGA 1ELJA 3TPAA 1MXYA 3H06B 2HAVA 1HSLA 1RKMA 3K1NA 1JEUA 4NWDA 3MPLA 1MXXA 2QS4A 2O84X 3MP1A 3H3GA 1LBBA 3KGCA 1B0LA 4QSDA 4ZEIA 1T0KA 4XKRA 5JEIA 1DTGA 4QFPA 2B3BA 5DEXA 1FW0A 4DCYA 4RK9A 2F36A 1SI0A 3IAZA 3WAEA 3FUZA 2DXYA 1VFDA 1B5IA 3PPOA 3IB1A 1N04A 2XXPA 3T93B 1QUIA 3O6HA 1TXFA 4I9DA 2Y84A 4OWDA 1LFHA 5F7VA 1Q1KA 5A5XB 3QUFA 3V83A 4GXAA 4EDPA 1B0HA 2F8DA 1BTJA 4F2OA 3TZAA 5AA3A 4BDLA 2ZYMA 2H5YA 3H03A 4O3BA 2DVZA 1JW5A 4IB2A 3TCFA 5AA2D 2DWJA 2XXVA 4MH5A 3DLNA 3PGFA 1QJMA 1ZJLA 2X7QA 2PMSA 5TP9B 1ANFA 2ANJA 4EXLA 3FV2A 1SVXB 3FD3A 3MWBA 3KBRA 4H8IA 3CVGA 2OJTA 2REGA 3K00A 4IGTA 1SW4A 1UTHB 3MVXA 1GR2A 4OESA 1AIVA 3IOWA 4XXUA 5ICQA 5AA4A 1B9JA 3HPIA 5I2KB 1EH3A 2DWAA 1ATGA 1JW1A 3N6UA 1R1NA 2GFEA 3SEVA 2F97A 2O68A 2RF1A 1CB6A 4MLVA 2V25A 3EHSA 4G8NA 1M5FA 1M5BA 2VHAA 4G68A 1FQAA 5KZTA 2VOZA 2UVGA 5CMBA 1SI1A 1TWYA 5I56A 3CG3A 4ELOA 3KEIA 3JV9A 4IY5A 5H8FA 2XXUA 1UIVA 4NF6B 1Z7ME 3ZKKA 1MY2A 4PFWA 2P2AA 1XVXA 5BWJA 2HAUA 1DSNA 1A54A 4GD5A 1JVXA 3VXBA 1SDXA 5I2NB 2LAOA 3UORA 1EU8A 5JTYB 3V8XB 1WODA 5H8SA 4JSDA 1M5EA 1B4ZA 2OWSA 4GFRA 4Z0IA 3TQLA 4F22A 2R71A 5H8QA 1B6HA 4YZZA 4TLMB 3U1OA 1XOCA 4KYDA 2UYFA 1YCJA 5L9OA 3V89B 1USYE 3R7XA 2I48A 1XVYA 4GRKA 4N13A 3E9XA 3MVWA 3KN7A 3PUWE 2RCBA 3H6VA 4XTCQ 3RNNA 4NF4A 1FQEA 2Z23A 2Q9TA 4H65A 5J1DA 2NVUB 1LSTA 5DYHA 4FATA 3G3HA 4GL8A 2QS1A 4OHNA 2RCAA 3K4UA 2Z8EA 4U21A 5TPAA 1M5DA 1XT8A 5FHOA 1YPNA 1B05A 2XXIA 1LFGA 3S9LC 4MFIA 2HEUA 3CIJA 1F9BA 3ZSFA 2OLBA 3HO7A 1JEVA 1NL5A 4RYAA 3I5OA 1B40A 1AH5A 2DQVA 1Y3PA 2P1SA 3TTMA 3CFZA 1B1HA 3HSTA 5KDTB 4YU0A 3RLFE 2UVHA 1WDNA 3BBRA 4EQBA 3IORA 2F6PA 3C4MA 3K2DA 4RXLA 3T9XB 4LVQA 3T9UA 3T9HB 2NXOA 3RTWB 2I58A 4ZZEA 2QS3A 1MQJA 1LAXA 1SW1A 2F7CA 1IUDA 4H5GA 2O7UA 4F1YA 3SEWA 2Z8FA 3K6VA 3LR1A 1MQDA 3MZ1A 3N5LA 2W7YA 2HCAA 3TTRA 4PETA 1I69A 2I4CA 4F3GA 4LQ2A 2O1LA 3A3CA 1B5JA 5CMCA 3HHFA 4EUOA 1H43A 3FXQA 3QXMA 4JWXA 2XX7A 5AA2B 1Y4TA 2V3UA 4DCXA 1MM7A 1LAFE 3S9EA 4G68B 1I6BA 1P1NA 1A8FA 4H0WA 3QIMA 4LA9A 4QFNA 2F5XA 3OSRA 3C32A 3Q26A 4DDDA 1XC1A 3K1PA 3PU5A 1BIYA 5H8FB 2UXAA 4I62A 2VD3A 2I3WA 1HSEA 4M4GA 3IOTA 3RT6B 4FECA 1US5A 2GHAA 5L9SA 1MM6A 2ZYOA 4EXKA 4TLLB 2O7IA 3QUJA 3FGSA 1URDA 4R75A 1B3EA 3UP9A 1IXIA 4R73A 1B3LA 1R6ZA 3O2AA 4F1VA 3GBBA 1Y4CA 2DSFA 2VD2A 2GH9A 1NNPA 3FVOA 4EF1A 1POY1 3O9PA 2OZZA 3OEMA 4KQPA 2R6GE 3VV5A 4BLAA 1MXVA 1CE2A 5H8QB 3BFUA 3K6XA 1OIBA 2I4BA 4AB6A 2XHDA 5EHSA 3VVFA 3MVYA 3P7IA 4X1BA 3G7WA 4OYVA 2ONKE 3Q29A 1Y1MA 3H4ZA 2NWJA 1QVSA 4NF4B 4G77A 3FV1A 3FJ7A 4GL0A 4WXJA 3TYHA 3TAJA 1XHYA 2PT2A 1P1OA 1IEJA 3PV0E 3H6WA 1D4NA 2RC8A 1NMUA 1IXCA 4QFOA 3EN3A 4U4XA 1SYHA 1SBPA 4GVOA 1JNFA 2OK2A 1POTA 4PQJA 3W9VA 1QUJA 5DVIA 2O1MA 1BLFA 1QKBA 3KN3A 3T9VA 1PDAA 4NF8A 4R6KA 4OTEA 3DP8A 4GOTA 4U1ZA 1I6QA 4XIGQ 1N7WA 3KFMA 3OD7A 3LSWA 1BP5A 3MVZA 2PYYA 3DP6A 4YMBA 3FASA 4F3BA 1S50A 3IK6B 5I58A 4JB7A 4KI0E 1ZLQA 1IIWA 1P1QA 1XS5A 1FCKA 4X1DA 1PBPA 5FHNA 3RN8A 1SW2A 3SDFA 4OQOA 4JWOA 4R6HA 2ZXTA 1DMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1AOVA 1KZ8A 2WKYA 4PP0A 1PB8A 3CSGA 3ZKLA 3N94A 1B7ZA 1OMPA 4UACA 2RC7A 4MF3A 5CC2A 2Z8DA 5B7DA 3SETA 4QFKA 5DEXB 2KQZA 4OFOA 3QSLA 4ND9A 1FTLA 3KJTA 1D3KA 1P1UA 2KLFA 1HSJA 3A29A 1A99A 5I58B 1UTBA 3H7MA 1B5HA 3EQ1A 4IO3A 2QL3A 3U8QA 1NKXA 1CNQA 5ESYA 4G4PA 4NE4A 2Q89A 3C33A 3ODBA 4YKPA 5FHMA 4RPNA 3PPNA 2M8CA 1URGA 2B3FA 1SD3A 2QRYA 2VT5A 3K6WA 1YAEA 1ZKBA 5F24A 4RK2A 3MZBA 4MMPA 4AS4A 3B6WA 1FPDA 2XX8A 4U22A 2FA7A 2DOJA 2REJA 4O8MA 1A55A 1FJ6A 4N07A 5EYHA 1MDP1 2H4IA 5FTIA 1O64A 1MQIA 1LEVA 4GWYA 5CI5A 1MPDA 2Y5LA 1JVYA 3S4UA 3IR1A 1G0IA 2V93A 2Y7IA 2XD2A 4U4SA 2PVUA 1OQGA 5A5XA 1BKAA 2FIXA 1MS7A 2WBDA 4ZE8A 1MH4A 4DZ1A 5IM2A 3R6UA 2V4CA 1FBCA 1NNTA 1YXIA 4F3PA 5K2XA 3T22A 5CRYA 4G8HA 5H8NA 2PFYA 5AA4B 1TFAA 5JK4A 3HCQA 4M1VA 4R2BA 2P0SA 1AL3A 1NNKA 3RYDA 3VE1B 1Z7NE 4U2RA 4DXCA 1FBPA 3MPKA 4JXIA 4EF2A 3HN0A 4F1UA 1VDWA 3D4CA 3C35A 3C9HA 3PMVA 1YYZA 1IXHA 4P3LA 3MW0A 2HPGA 3UIFA 4THIA 5ITPA 1USYH 4P1LA 3OENA 3N6TA 4POXA 4I3EA 4PAFA 4AB5A 5I56B 3PD9A 1LCTA 2Q88A 2Q8JA 1IQ7A 4OVJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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