3B6QA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) mutant t686a in complex with glutamate at 2.0 resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTAAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and single-channel results indicate that the rates of ligand binding domain closing and opening directly impact AMPA receptor gating.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b6qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b6qA02
3PV0E 5HM4B 2H99A 3RTFB 4LVQA 2UYEA 3K00A 1SI0A 2UVHA 5I58B 1Z7NE 5H8QB 1T0KA 5AA2B 4P0GA 1QUIA 4RK2A 3TTRA 2Y7PA 4U4SA 2Q88A 1FQCA 2Q2CA 3MPLA 4UA8A 2P2AA 1MG1A 1A55A 3B6TA 1MPCA 1IIWA 3K4UA 3FD3A 1BTJA 2I4BA 1QUKA 1AMFA 1LCTA 4OVJA 1MXYA 2O7IA 5DYHA 1R6ZA 3O9PA 3UK4A 2O6AA 3T9VA 1DTGA 4ESWA 4FEDA 1B3HA 3LC8A 3PUYE 3RLFE 2UVJA 3L6HA 3Q27A 2DOJA 3G3HA 4FORA 4F1VA 4NF8B 4IGRA 3FATA 5AA1A 2H9BA 4U23A 1I6AA 2RC9A 2QRYA 4QFOA 4DE8A 2PT2A 1A54A 2GHAA 1VFEA 3FVKA 4K3FA 4TLLB 3OELA 3CG3A 1XVYA 3ILTB 2OBGA 3G3GA 1PEBA 5FTHA 3TCGA 4EQBA 2P0SA 1LFHA 3TODA 4NTLA 1B3GA 2V93A 4G77A 4HW8A 5H8FB 1PB9A 3M8UA 4H65A 2XXQA 1FTJA 3HPIA 4EQ9A 2GRVA 3N6UA 3FVOA 4F22A 4F3SA 4PFTA 3BFTA 4G68B 5K2YA 3GLBA 4YB5A 1B52A 3MP1A 2V84A 2HAVA 1NNFA 3FZVA 3LSXA 1MY0A 2PBWA 1TT1A 2D21A 3U72A 1PDAA 3VVFA 4EUOA 2B65A 1OQGA 1ATGA 4TQUQ 3CG1A 3IOVA 1EZOA 2F7AA 1OIBA 2Q89A 3VE1B 2REJA 2ZYOA 2DVZA 3FJGA 1EH3A 3N26A 1B7UA 1ZTYA 3E13X 2Y7KA 3TMGA 1XT8A 4R9FA 5HPQA 5I2NA 3H3GA 1SDXA 1BKAA 2AIXA 5FTIA 3ONMA 3PMXA 3SERA 4WEPA 4I1DA 1NMUA 3ECRA 3OD7A 1PB8A 3O28A 3UP9A 2QS3A 4ZEFA 3T9XB 3PD9A 3IB2A 4ELOA 2DQVA 3EF7A 3MZ9A 4IY6A 3H6VA 2XXVA 2QS1A 1QJMA 4ZEIA 1FQBA 3EPEA 2M8CA 2UXAA 5L8DA 1N7XA 4R9GA 1MPBA 3HV1A 1POTA 3VXCA 1LFIA 3LSLA 5ICTA 4OETA 1Y9UA 2O1LA 2VGQA 3K02A 1Q35A 1B3FA 3K01A 3QK6A 1ZJLA 4GL8A 4LQ2A 1MH3A 4XKNA 4QHQA 3GXAA 1OVTA 1N84A 3C35A 1YAEA 5K2XA 1GR2A 4ESXA 1ELJA 4P11A 4NF4A 1A8EA 5I57B 1GTKA 5DT6A 5I56A 1SQYA 1VSOA 2ANJA 4ZEKA 2I6EA 1WDNA 5KZTA 2I48A 3SDFA 4DXUA 3KBRA 4LZ8A 3K1PA 3U1OA 1B9JA 4IO4A 5EHSA 1L5TA 3MJNA 1KWHA 3OEKA 3C9HA 3TYHA 2VD2A 4GVOA 4FATA 1R1NA 3BFUA 3TAJA 2QMXA 2QMWA 5LOMA 5B70A 2W7YA 3TQWA 2GH9A 1OQHA 3DP8A 5DVFA 2HQ0A 4AB5A 2RC7A 3TTKA 5H8NA 4NWCA 3QXMA 3OO9A 3VXBA 3FIRA 3O66A 3IAZA 4JWXA 4YB7A 3U8QA 1B7HA 2NXOA 4NF6B 5CM6A 3THIA 2XXUA 2F6GA 4O3CA 1QKAA 2D5WA 4TOZA 2Z8EA 4ONYA 3GBAA 2DE3A 3H6UA 3CSGA 4BDMA 1P1WA 2ZYKA 1HSLA 2QL3A 1USYH 3CR9A 2HCAA 4XKRA 2V25A 3P7IA 1JNFA 3V83A 4H8JA 4XIGQ 1MQJA 5H8SA 5TPAB 3OO7A 1D4NA 3KOSA 4E0XA 4KFQA 1NFTA 1SW5A 4MLVA 5I84A 1LSTA 1MXUA 4GIZA 3S4UA 1II5A 3T22A 3SEUA 2O1MA 1WVJA 3VLUA 4OFJA 2O69A 1B32A 4BDQA 1YCJA 3FGSA 2DWHA 1MQDA 3C33A 3R7XA 1IITA 4R75A 4PP0A 3IJXB 3HCQA 4AB6A 4ECFA 1JW4A 3FV1A 3IOWA 3TCFA 4RPOA 4DXBA 3KN8A 4PETA 2IA4A 2F8DA 5ITPA 4KYSA 2ABHA 2D3IA 2HFBA 4F29A 4F31B 2LAOA 3RQTA 1N3WA 1I6QA 2XXXA 2G93A 3CFXA 1IXHA 2OZZA 4QFPA 4X48A 1DPEA 2I3VA 4I8CA 1B3LA 2Y7WA 1DOTA 5KCJA 4MH5A 3C31A 1BIYA 4F39A 3JV9A 3MZBA 3M3LA 1SD3A 4I9DA 3ZKLA 2F34A 4KYEA 2A5TB 4KPTA 2DS9A 4NMYA 3LSFB 4ZZEA 2XX7A 4OYVA 5KDTB 3C34A 4OFLA 3HHFA 4RNSA 1JETA 4YKIA 1A8FA 3VFJA 4R72A 2HXWA 2Q2AA 4X1BA 4OMBA 4C0RA 3D4GA 4PFUA 1FTMA 3CIJA 4N6PA 1M5DA 5H8NB 1R9LA 3OSQA 2ZNUA 3K6WA 3SEYA 3FXQA 1OMPA 4G4PA 3PPOA 4OXVA 4G8HA 1LAFE 1O64A 3H4ZA 4U2RA 3VLVA 3T9UA 1MS7A 1MY2A 3N94A 4F18A 4C1UA 4KR5A 4F1YA 3KSJA 1MXZA 3OO8A 4Z7EA 1EU8A 1S50A 3QYTA 1QUJA 1FQDA 1D3KA 2P1SA 4KCDA 2RCBA 3OENA 3Q25A 3O6GA 2NOOA 1VR5A 2REGA 4Q8RA 2DE2A 3W15C 3H6WA 3U92A 2FA7A 5CMKA 4GQOA 4OWDA 3EHSA 4R2FA 3H6TA 1LAHE 2QPQA 1M5EA 3MP8A 1Z7ME 2ZYMA 4EQ7A 4RY1A 4U4XA 1O7TA 3W9WA 2GHBA 4OHNA 4YKPA 3FV2A 2ZNSA 3FUZA 1B58A 3V8XB 1MY3A 1B5IA 4DXCA 2F6PA 1EZPA 3TCHA 4HS7A 1N04A 4R73A 1A7LA 3BBRA 4FEBA 1Y1MA 4F3PA 1LCFA 1N76A 1PC3A 2VP1A 5EYFA 4OEUA 1MH4A 1FQFA 1UTHB 1LFGA 1DTZA 5I2KA 1BLFA 5F1QA 1IXGA 4QFLA 3MVYA 2OCUA 5H8HA 4RA1A 3I6VA 1SYIA 3TELA 3UGWA 2DXRA 2XD3A 5AA2D 3OOAA 2OLBA 1UTBA 3JZJA 3U94A 3B6QA 5I59B 3RNNA 2Y7RA 1H43A 4YKKA 4R6KA 5JTYB 1SW2A 1UIVA 4RPNA 3OSRA 2XX9A 5TP9B 3MWBA 5BWJA 4YZZA 5AA4A 3FXUA 1XVXA 3SESA 3K1MA 1NH8A 2V3UA 1B51A 1IEJA 3RUMA 1P1QA 3ZKKA 3UIFA 4EDPA 3TQLA 3M3KA 3TUSA 2RCAA 4IO2A 4BDLA 2E0SA 4TLMB 2O68A 3A09A 3UN6A 4ZE9A 4YKJA 2XXWA 1XC1A 2AL4A 5IAIA 2ONSA 1IZ1A 1SW1A 2F97A 2XXHA 2ONRA 1YPNA 4IGTA 2VHAA 1OLCA 3TTLA 4R2BA 3G7WA 4XXUA 1A40A 3IOUA 4LZ7A 1I69A 4ND9A 4MFIA 4PFWA 2I0BA 1FTOA 3N5LA 4F3BA 3IB0A 4JWYA 3U93A 1DPPA 3C32A 3R6UA 3O97A 4H5FA 4MLQA 4RXLA 3WAEA 5CC2A 2X7QA 1URSA 2OWSA 2XXYA 3A3CA 3KN3A 5JK4A 5CRYA 3B6WA 2NUVA 3FVGA 1Y20A 2DWJA 2B3FA 4HCWA 3VVEA 3LSWA 4HTGA 2OWTA 5M2VA 2F5XA 4OESA 1PBQA 4GLIA 3PUZE 2HZLA 3AXFA 4LQ5A 1AL3A 4NF5A 3RT8A 2QS4A 1P99A 3PMVA 3O6HA 4H5GA 3EHTA 1GV8A 3KZGA 1DMBA 5JEIA 2AYSA 1H76A 2YJPA 1B1HA 4H1XA 4IO6A 1B2HA 4XKQA 5F7VA 4U22A 4BLAA 3PUWE 4E0WA 2RKMA 3LUYA 4KI0E 2F7CA 4M4GA 5A5XA 3PPQA 1RKMA 1P1UA 4O3AA 4JDFA 1HSEA 2OJTA 1MQIA 2CZLA 3RTWB 4RJZA 4N13A 4POWA 1ZMGA 3KGCA 4JWOA 3CRBA 4EXLA 3DLNA 3S9MC 1NNKA 3K6VA 2KLFA 1QVSA 4H67A 2VD3A 4WKMA 5I2NB 5TU0A 4YB6A 3JYRA 1P1OA 3H06B 2Y7IA 1JW1A 2THIA 5I58A 1Y4CA 1MM7A 1URDA 1B46A 5H8QA 1Q1KA 5AA2A 3E3KA 5FHNA 3F11A 1B05A 3WAFA 4G68C 1MXXA 1OVBA 1ZBMA 3K2DA 3D4CA 4OERA 2DSFA 2XXIA 4DZ1A 1TXFA 1F9BA 3KSXA 1B0HA 3T93B 3GBBA 4KQPA 1MRPA 4MF3A 2Z23A 4ELQA 3IB1A 1TWYA 3O6IA 4YICA 2H5YA 1VFDA 1ZU0A 2AL5A 3PGFA 4F19A 2CMOA 4NF4B 3KFMA 3M3FA 5I56B 4YU0A 1D9YA 4IO5A 2DWAA 5BUUA 1QKBA 2H25A 4NF8A 4LZ5A 2VOZA 4LATA 4ZDMA 3IX1A 2XX8A 3K6UA 4JSOA 2DWIA 2RF1A 5ITOA 2FYIA 3MPKA 3MW0A 1JEVA 3UORA 1AIVA 2X26A 5CMCA 2HEUA 2PVUA 1FCKA 3E9XA 3W9VA 1WODA 1LLSA 1JVXA 1N7WA 3A3UA 3G3FA 2I49A 4PQJA 2ESNA 3IJOB 2X7PA 5H8FA 1EZ9A 3ZS6A 1NNTA 4OENA 5FHOA 3H7MA 2G29A 3SEWA 2V3QA 2XXTA 1IQ7A 4G68A 1B5JA 5IKBA 2IEEA 1SYHA 3FJ7A 2DYXA 3IOTA 3UA8A 4GF8A 3BKIB 3QUJA 4GRKA 1GGGA 1J1NA 4OFOA 2HAUA 2Q9TA 3KJ7A 4ZEBA 3E4RA 2B3BA 2Y84A 1B4ZA 2DP8A 3EN3A 4IO3A 1R9QA 5J1DA 4JXIA 1IXIA 4L17A 2PT1A 4F1UA 3FASA 2Q8JA 4LUBA 1UIUA 3C36A 4G2ZA 1NKXA 4OEVA 3T66A 4R6YA 4AQ4A 2ALUA 2XXPA 2DE4A 4KHZE 2V3TA 3TEPA 3Q29A 2HZKA 3N6TA 1DSNA 1FQEA 1JW5A 5CMMA 3OXNA 4QSDA 3RPWA 2XXRA 4QSCA 1QULA 4G8MA 2UVIA 1JQFA 3V5AA 1MQGA 3KJTA 1M5CA 4R74A 1Y3QA 3G3IA 3IL1B 5CMBA 1AH5A 3R26A 3CFLA 3FVNA 3DM0A 2ONKE 1MY4A 1SI1A 2F36A 2O7UA 4GFRA 2R71A 3H03A 2H98A 2GFEA 1LBBA 4JSDA 1ZLQA 1S7YA 4FIMA 3FJMA 4HCYA 2H4IA 1GVCA 4GL0A 3EQ1A 4H8IA 5CBRA 5CI5A 2NVUB 4RYAA 1ANFA 5KCJB 2R6GE 3USDA 2A5SA 4WEDA 4R6HA 5I57A 4EF2A 4ZZAA 4I62A 4KCCA 3PD8A 3MZ1A 4ELRA 1I6BA 3PPRA 2I3WA 3EHUA 1YTVA 5DEXA 3O29A 5EHMA 1MM6A 3MP6A 1FQAA 5FHMA 3LBSA 4YMBA 4U21A 3S2VA 3C4MA 2RC8A 3I3VA 1ZIUA 1USYE 1MQHA 1US4A 4GXAA 5L9SA 3DELB 5DVIA 1BP5A 3FXRA 3K1NA 2I0CA 3ILUB 4Q5TA 4DDDA 2F78A 1Y4TA 4DLDA 1JEUA 4QF9A 5ELVA 3V89B 3KOTA 4PE5B 3MVZA 4U1ZA 1P1NA 3VDFA 3CVGA 3IO6A 4XKPA 1B0LA 4H6DA 4O3BA 5DTBA 3TFLA 3K6XA 1PBPA 4POXA 2OK2A 3DP4A 3PPNA 3SKPA 1NH7A 4LONB 4EXKA 4NF6A 2PYYA 1TFDA 4BDRA 2F7BA 4FE8A 3TPAA 2PX1A 1A99A 2WKYA 4IY5A 1MXVA 3DP6A 1B7ZA 3TDJA 3MQ9A 3QAXA 4ISUA 1B1XA 4GWOA 5TPAA 3S9EA 2UVGA 3SEXA 2O84X 4Z0IA 4EF1A 1NNPA 5ISUA 4Q0CA 4YMAA 5HBCA 1M5BA 5AA3A 3LR1A 1TFAA 2XHDA 2DXYA 3IORA 3MBPA 1JVYA 1Y1ZA 1FW0A 1SVXB 4IB2A 5AE4A 3CFZA 3TTNA 1XHYA 1LBCA 1PB7A 2E1SA 3TKDA 3G3JA 3QIMA 3PU5A 2YLNA 3OMBA 4ELPA 4KYDA 2YPNA 1MY1A 1CB6A 3VLWA 1MXWA 1SW4A 3HHGA 3CI8A 3L6GA 3ZSFA 5I2KB 4QSEA 2ZMBA 1B3EA 1IXCA 1O63A 4QFKA 5DEXB 3HO7A 3RN8A 5H8HB 1B4HA 3Q26A 3MUQA 2I4CA 1ZKBA 4IO7A 3B7DA 4GOTA 3TZAA 4GD5A 2Z22A 1UQWA 4KD5A 1IUDA 1URGA 2A5TA 3OEMA 1UTBB 4X1DA 1Y3NA 3QSLA 2R9JA 1H3DA 1SBPA 3PUVE 4F2OA 5KDTA 3KEIA 5L9OA 3MAMA 4GXSB 1POY1 4H0WA 4THIA 4X9TA 3S9NC 4XTCQ 3Q28A 5AA4B 4OZ9A 3S9LC 2XD2A 1N0TA 4WXJA 4ZECA 3PPPA 1HSJA 2ZNTA 1M5FA 3QUFA 4YAHX 1Y3PA 4DIGA 4DCYA 1LAGE 4U1OA 1LB9A 3TTMA 1N3XA 1LB8A 4PFYA 3T9HB 4MBPA 4BDOA 1LAXA 1CE2A 1NL5A 4ZE8A 5L9MA 2ZYNA 4ZS9A 1MPDA 2I58A 3KN7A 4ZEDA 4QFNA 1S9TA 4C1TA 4F2QA 3IR1A 3PMWA 4BDNA 4M1VA 1B40A 1XS5A 1MDQA 2Z8DA 2ZXTA 3SEVA 5ICQA 1H44A 4NWDA 1AOVA 2FNCA 3VV5A 1B6HA 3CSBA 3RY3A 1D9VA 4LP2B 2F35A 3PUXE 3GZGA 5CBSA 3I5OA 1VE4A 3HSTA 3KG2A 1US5A 1RYXA 2RINA 4JBZA 4RK9A 4NEDA 4OQOA 4FAJA 3MC2A 4UACA 4G8NA 4DCXA 3O2AA 4Q30B 2QS2A 2BJJX 1XOCA 5DVJA 1H45A 3RGYA 1RYOA 2Z8FA 3G3KA 3VVDA 4NF5B 4P0IA 2PMSA 1B5HA 2QSXA 3OO6A 1FTLA 3IO4A 1FTKA 4FECA 3ODBA 1OLAA 3K0VA 1UTHA 3MVWA 4FJPA 4OTEA 1MDP1 2O51A 4QRZA 5A5XB 4F3GA 3HN0A 2UYFA 3IK6B 5B7DA 3T96B 2NWJA 2DVCA 5I59A 4N07A 5JTYA 4JB7A 3SETA 1QW0A 5TP9A 3RT6B 4LA9A 1LGBC 3MVXA 2QJEA 4NE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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