1MM6A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
b'ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Mechanism of activation and selectivity in a ligand-gated ion channel: Structural and functional studies of GluR2 and quisqualate
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A01
1NFTA 2WKYA 3BFTA 3T9HB 4QRZA 5CMKA 1AL3A 2ZXTA 2HAVA 3N26A 1USYE 1F9BA 1UTHB 4OEUA 3RN8A 4KQPA 2HEUA 1P99A 2PT2A 3KGCA 2YLNA 1MY1A 2D21A 1T0KA 3LSWA 1FQAA 5H8FB 4XIGQ 5I58B 3LSXA 4QFKA 4G2ZA 3RLFE 3UGWA 3PGFA 2AIXA 3PV0E 1XT8A 3S9EA 1B4ZA 3FJ7A 3TMGA 1FTLA 1ZTYA 4GXAA 4G8NA 3N5LA 2I48A 1TWYA 3EHSA 3C36A 3QK6A 3GBBA 3A3CA 3Q25A 1MXUA 3DP4A 4YKKA 3OO7A 3MVXA 2V84A 4R75A 3UA8A 4ZS9A 2DE3A 3QUJA 1B0HA 4JWXA 3S9NC 5I2KA 5JTYB 2QS4A 2XXTA 4EQ9A 5JK4A 1N7WA 3LSLA 3BBRA 3CSBA 4Z7EA 1LBBA 5IKBA 2XXIA 4GD5A 1B05A 3FJGA 3CIJA 3MZ1A 3O97A 1R9LA 3RT6B 4OZ9A 1IZ1A 3GBAA 5AE4A 3TODA 5I59B 1XOCA 3G3HA 4LQ5A 5B7DA 2CZLA 2P2AA 5HBCA 4RA1A 3HHGA 4ESWA 1OVTA 1DSNA 1SQYA 1JETA 2ZYKA 2DWHA 2F7CA 1LFGA 4LVQA 1B1XA 1MQJA 1RYXA 4BLAA 2XXYA 5H8NB 3UN6A 1D9VA 3G3FA 3SEWA 2GFEA 1QVSA 4U2RA 3MZ9A 1SW5A 3WAFA 3U94A 5JEIA 1PB7A 3MC2A 4YU0A 4X1DA 3CG3A 5J1DA 2OCUA 2Y7KA 3PPRA 3R6UA 2ALUA 2DP8A 2Z8EA 4KFQA 2Y7WA 4RPNA 4BDRA 2VD3A 3K01A 3U1OA 3QAXA 3FXUA 3S9LC 1BIYA 3T22A 1CB6A 4KCCA 3MAMA 4GRKA 1DPPA 1N3WA 4HW8A 3E3KA 3SESA 5M2VA 4ZEKA 5I2NB 2RC7A 2HCAA 3OSRA 2NWJA 4C1UA 4EXKA 3R7XA 1OQHA 1LCFA 2UVHA 2XXUA 4G8HA 3IO6A 2DOJA 1R9QA 2R9JA 5KCJA 4IY5A 4GL8A 4F3SA 2W7YA 4DZ1A 1TT1A 1I6BA 4G68A 1FW0A 2RINA 1NH7A 2YPNA 2DYXA 2QMXA 4E0XA 4PFYA 3FV2A 3QIMA 1IXGA 1VFEA 2F7AA 4DDDA 1SI0A 1DOTA 2AYSA 2QMWA 3H3GA 4R74A 1EU8A 4OMBA 1R1NA 4PP0A 4P11A 4OXVA 3I3VA 3KBRA 3OD7A 1VFDA 3V89B 3LR1A 5H8HA 3G3GA 1B51A 3VE1B 3PPNA 1MXWA 1TXFA 5TPAA 2QS3A 4PFTA 3MPKA 1IXIA 3IJOB 1LLSA 2QPQA 3IORA 3ZS6A 1LFHA 5I84A 3OEMA 3MP8A 3FASA 2RF1A 3TTMA 1MRPA 1Q1KA 4H65A 3OELA 3B6WA 4WXJA 1B7HA 3RQTA 1TFDA 3T66A 3I5OA 2IA4A 3V83A 5F7VA 1JEVA 1MM7A 1US4A 2CMOA 3KN3A 1PB9A 1MQHA 3HO7A 2H5YA 4PETA 1FQCA 5BUUA 4F1UA 4R6HA 2I58A 2B3BA 2NUVA 1LAFE 5H8QA 1ZMGA 4POXA 1ATGA 2XXPA 2DE4A 2FYIA 4FJPA 2ONSA 1QUIA 3FD3A 3O6GA 2OBGA 3G3IA 3MVZA 1MY0A 1Z7NE 3MW0A 4H8JA 2DVZA 3C31A 4FE8A 5ICTA 4UA8A 5KDTB 4XKQA 2O7IA 2Q88A 3RPWA 4N6PA 1A55A 1B5HA 4GIZA 1H45A 2PMSA 3FZVA 3PUYE 4H1XA 4WEDA 4Q30B 3H4ZA 1WODA 2DWJA 1M5DA 4QSCA 5FHOA 4FIMA 3PUWE 2NOOA 3K1MA 4XXUA 2V3UA 4MLVA 1B4HA 1SDXA 3P7IA 1B52A 3H03A 4X1BA 1JW5A 5H8SA 4FAJA 1NL5A 4DXBA 5KCJB 4ESXA 1AOVA 2HZKA 2F8DA 1B58A 1PC3A 2ZNSA 3M3LA 3LC8A 3SDFA 1FQEA 4IO5A 1ZU0A 3LBSA 2XXXA 2ZNUA 3KG2A 2ABHA 3EN3A 4F2OA 4F3PA 3SERA 1LGBC 2GRVA 3PUXE 5A5XA 4GL0A 3DLNA 2Q2CA 1SVXB 3RUMA 4M1VA 5LOMA 3L6GA 2DS9A 4DLDA 4EDPA 1H44A 3QUFA 5ISUA 2BJJX 4Q5TA 1H3DA 4I8CA 4ECFA 3GLBA 5TPAB 4POWA 1UQWA 3IO4A 1LAXA 3OMBA 1H43A 3E9XA 3DP6A 4LATA 3JYRA 3HPIA 3OENA 1NMUA 1MQGA 4NEDA 3OSQA 4P0IA 1GV8A 1A99A 1LB9A 3TKDA 1B5JA 3IK6B 2I6EA 4NWDA 1S9TA 5K2YA 1VSOA 2OZZA 3PUVE 4RXLA 4LQ2A 1DTZA 3Q28A 4M4GA 1VR5A 5FHNA 4IO3A 2G29A 3EPEA 3WAEA 2QJEA 2VHAA 3VLWA 2P1SA 1FTOA 5H8QB 2B65A 2IEEA 2X7QA 1MH3A 2XXHA 1Y1MA 4RNSA 4F39A 1IEJA 1Y3QA 5CM6A 4FEBA 2O6AA 1XC1A 3TTLA 4WKMA 3TELA 1GTKA 2A5TB 1P1WA 2DWIA 2XD3A 1A7LA 1M5BA 2PVUA 4AB6A 1P1QA 4YMAA 2DXRA 1FQDA 2D5WA 2UVIA 4U23A 1MXYA 4R73A 3ZSFA 3Q26A 3AXFA 2GH9A 4DCXA 4EQ7A 1MM6A 5L9SA 2REGA 3CVGA 1B0LA 3GZGA 1B2HA 3N6UA 2OK2A 3T93B 4NWCA 3MPLA 3IOVA 5I57A 3V8XB 1P1OA 1MPBA 3EHTA 4NF6A 4HCYA 2E1SA 3K4UA 1I6AA 1SW2A 2XX9A 3IAZA 5ITOA 3G3KA 3UORA 1SYHA 5DYHA 1LAGE 3TAJA 2HFBA 1QW0A 5TP9A 3EHUA 4ZZAA 3PMVA 3Q29A 4I62A 4QFNA 1O63A 1IXHA 4F3GA 4LP2B 3KN7A 4F1YA 2F7BA 3PPQA 3A09A 3TQWA 1QKAA 4OESA 4TQUQ 1S7YA 2Q89A 3MZBA 4FEDA 2D3IA 4YKJA 5AA4B 4N13A 2F35A 3O66A 1QKBA 3DELB 1PBQA 2G93A 1MY2A 1DMBA 4KYEA 4U22A 3K1NA 4Z0IA 1UTBB 3B6QA 4GXSB 4O3CA 4YMBA 2VOZA 5HM4B 3T9UA 4KCDA 1B3HA 2M8CA 3QXMA 3CG1A 4QSEA 1B46A 4H6DA 3CR9A 3JZJA 1JW1A 5CMCA 1LBCA 1B1HA 4NF5A 1BKAA 4PE5B 4IO4A 3M8UA 4F3BA 4U1ZA 3ODBA 1EZ9A 2HZLA 2QS1A 2I4BA 4LZ8A 4MH5A 3H6TA 1ZIUA 3W15C 2X26A 2AL4A 4H8IA 1N84A 1ZBMA 5CMMA 1P1NA 3A3UA 4NTLA 3DP8A 4IO6A 3M3FA 3V5AA 2ONRA 3U93A 4OYVA 4G77A 3MWBA 4AQ4A 4X9TA 1POY1 3FVNA 4GLIA 4LUBA 2RC9A 1JNFA 4OVJA 3IL1B 5CI5A 2DXYA 4P0GA 1OMPA 5CBRA 4YKPA 3I6VA 1OLCA 3PMXA 4BDLA 4ELPA 3IOUA 3B6TA 3SETA 4QF9A 4IY6A 4ZDMA 1MDQA 1MPCA 4R2FA 2XXWA 4LA9A 1WVJA 5I56A 5I2KB 5F1QA 1B3LA 3BFUA 3QSLA 4F22A 3ILTB 1ZKBA 2I0CA 1MY3A 1N04A 1AMFA 3ECRA 5I57B 3FVGA 2R6GE 1RKMA 2RC8A 2REJA 1SI1A 4NF6B 3G3JA 4Q8RA 3BKIB 4YAHX 4F1VA 3SEXA 3K6XA 3RY3A 3SEYA 3MBPA 3S2VA 4MBPA 3O6HA 1QUJA 1B7UA 4NMYA 2ZYMA 5TP9B 4DIGA 2ZNTA 3F11A 2PX1A 2F36A 3CSGA 4RJZA 4JB7A 3C4MA 3IX1A 4ISUA 3K02A 2I49A 1EZPA 5DVJA 1MDP1 3EF7A 2H9BA 4G68C 1XHYA 4NF8A 1Y20A 1N7XA 4DCYA 2F6PA 1B40A 4JWYA 4LZ5A 1BP5A 4GF8A 5EYFA 1B32A 3KJ7A 4R9GA 5EHMA 4GOTA 4NF4A 4GFRA 3TUSA 2A5SA 1UTHA 4EXLA 3H6VA 4WEPA 3VV5A 4OTEA 2FNCA 4THIA 3RTWB 2P0SA 3C9HA 4KHZE 4NE4A 4RY1A 5B70A 2Z23A 4EF1A 1R6ZA 1JW4A 2O68A 4ZE8A 4NF5B 3U8QA 3VVFA 3HSTA 1MPDA 4LZ7A 3D4GA 2H25A 3C35A 3K6WA 1VE4A 3O9PA 4BDNA 1LFIA 4XTCQ 5JTYA 2H4IA 3U72A 4OENA 4O3AA 4IO2A 3SKPA 4R2BA 5FTHA 2RCAA 1QJMA 4BDMA 3OO9A 4G68B 4KYDA 2ANJA 3IB2A 4RK2A 5I59A 3PD9A 5TU0A 1FQFA 2Y7IA 3PD8A 1A54A 5I56B 3RTFB 2KLFA 3TFLA 1J1NA 3LUYA 3G7WA 2H99A 3CRBA 3VFJA 2V25A 4EF2A 3GXAA 2DE2A 4ZE9A 3ILUB 3VDFA 4X48A 4ELRA 5H8HB 3HV1A 3T9VA 3VVEA 3K2DA 1NNTA 2ZYNA 5H8NA 5DTBA 5AA1A 1FTMA 1LCTA 4RK9A 2UVJA 1M5FA 4GWOA 4Q0CA 2RCBA 4TLMB 1I6QA 1QULA 4OQOA 3JV9A 3W9VA 3Q27A 2Y84A 1Y9UA 1DTGA 2OWTA 4F19A 3OEKA 1TFAA 4JWOA 3FIRA 4NF8B 2V3QA 1OIBA 1KWHA 1P1UA 1FTJA 1BLFA 3FATA 3MVYA 2Z8FA 1FTKA 4C0RA 2THIA 1QUKA 2ONKE 2UXAA 5DVIA 4JXIA 4NF4B 3HCQA 3UIFA 4H5FA 1URDA 1Q35A 5I2NA 1NNKA 2UYEA 1YPNA 2X7PA 1Y1ZA 3HHFA 5DVFA 1N0TA 1B6HA 3FVKA 3PUZE 2DSFA 4I1DA 5HPQA 1MG1A 4FATA 3H06B 3L6HA 4AB5A 2O69A 3K0VA 3OO6A 4PFUA 4ONYA 4BDOA 2PT1A 2XXRA 4OFJA 4JSDA 3FXRA 2QRYA 1JVXA 1LB8A 4UACA 2VGQA 1MY4A 1Z7ME 2UYFA 4OWDA 4OETA 3O28A 3DM0A 3RNNA 4JDFA 4IGRA 3FXQA 4IGTA 4YZZA 3IJXB 2I3VA 3R26A 3TCGA 4EUOA 3KFMA 2Z8DA 4OEVA 5AA3A 2F5XA 4GVOA 3N6TA 3SEVA 3K1PA 1SBPA 4O3BA 4L17A 1A8EA 2DWAA 1H76A 2I3WA 1NH8A 2ZYOA 3E13X 5L8DA 4ZEIA 3FGSA 3K6UA 5CC2A 2H98A 5ITPA 3CFLA 2PBWA 2UVGA 1SYIA 2HXWA 3CFZA 4DE8A 1BTJA 3MP6A 4MLQA 1S50A 5A5XB 1ZJLA 2HQ0A 3TPAA 1DPEA 3C33A 3HN0A 4K3FA 3PU5A 4U4SA 4KPTA 4YB5A 4I9DA 3USDA 5ICQA 2I0BA 2Q9TA 4IO7A 1USYH 4ZEBA 4ZEDA 1POTA 1MH4A 2GHBA 4N07A 1EZOA 3TEPA 4BDQA 2PYYA 4XKPA 1MXVA 4R9FA 2FA7A 3KOSA 4G4PA 1XS5A 1JQFA 4YICA 3LSFB 2XXVA 3RT8A 3O29A 4DXCA 3OXNA 1D3KA 1XVXA 2AL5A 1L5TA 4LONB 1JEUA 5KDTA 1N76A 4HCWA 3VLVA 1IIWA 3C32A 3UP9A 2Y7RA 3PPPA 3IB1A 1B9JA 2GHAA 3ZKLA 2QL3A 4TOZA 1D4NA 5AA2A 3TQLA 2XX8A 5CMBA 1GGGA 4OFLA 2V93A 4XKNA 3KOTA 4HS7A 3TTRA 1II5A 3O6IA 2ZMBA 1LSTA 5CRYA 1I69A 1B3EA 3TTNA 3THIA 1US5A 3K00A 5L9OA 1O64A 3PPOA 4KYSA 3MJNA 3OO8A 4QFLA 1YAEA 1N3XA 3MP1A 1D9YA 4QSDA 2O1LA 5EHSA 5CBSA 2NXOA 2NVUB 2Q8JA 5IAIA 4QHQA 4KD5A 1WDNA 4ZZEA 3VXCA 1IQ7A 3EQ1A 2ESNA 1B7ZA 5DEXA 2RKMA 2F97A 4F31B 4C1TA 1ZLQA 1MXZA 3W9WA 3IOWA 1PEBA 2XHDA 4E0WA 2DVCA 1MS7A 4FECA 3UK4A 4MFIA 2O1MA 1B5IA 2QSXA 2XX7A 1SW1A 2R71A 2OWSA 1YCJA 1O7TA 2OLBA 2VD2A 1ELJA 2E0SA 2VP1A 3VVDA 1AH5A 3H7MA 3MVWA 4DXUA 4F2QA 1ANFA 1A8FA 4ZECA 3FUZA 4H5GA 4U1OA 3KJTA 1URSA 3S9MC 1FQBA 4PQJA 3E4RA 5ELVA 4KI0E 3KSXA 4ELOA 1IXCA 5KZTA 1OVBA 1UIUA 3ONMA 2O7UA 1Y3PA 2I4CA 2F34A 1A40A 1JVYA 4HTGA 1HSEA 4YKIA 5AA2D 4F18A 4PFWA 1HSLA 1HSJA 4JBZA 1PDAA 3T96B 5H8FA 3B7DA 2OJTA 5FHMA 5I58A 4OFOA 4R6YA 3N94A 2XXQA 3TDJA 2Z22A 1SD3A 4FORA 2B3FA 1NNPA 2HAUA 3H6WA 2A5TA 2Q2AA 1IITA 4F29A 4RYAA 2O84X 3D4CA 3K6VA 1CE2A 2O51A 3IOTA 3TZAA 3VXBA 3TYHA 1SW4A 4TLLB 5FTIA 4MF3A 3TCHA 2Y7PA 3KSJA 2YJPA 3TCFA 4JSOA 2QS2A 1Y4CA 5DT6A 4YB7A 3PMWA 3MQ9A 4YB6A 3ZKKA 1Y3NA 5K2XA 5AA2B 4IB2A 1LAHE 4RPOA 3QYTA 1MQIA 4H0WA 4ELQA 1FCKA 1RYOA 4GQOA 3IR1A 3FV1A 5BWJA 4R6KA 1M5EA 1MXXA 4OHNA 3KN8A 1B3FA 1UIVA 4OERA 1AIVA 4R72A 1IUDA 3CI8A 1NNFA 4KR5A 2F6GA 3H6UA 3M3KA 1URGA 1YTVA 3O2AA 1XVYA 3S4UA 2V3TA 3MUQA 1GR2A 3OOAA 5DEXB 4XKRA 3TTKA 1OLAA 1M5CA 4ND9A 4QFPA 4G8MA 3FVOA 1GVCA 3SEUA 2XD2A 1B3GA 3KZGA 2DQVA 3VLUA 3RGYA 2F78A 5AA4A 1Y4TA 3CFXA 3C34A 1OQGA 1MQDA 4U21A 3U92A 1PB8A 1PBPA 2LAOA 4U4XA 3T9XB 4EQBA 3FJMA 4ZEFA 1UTBA 1NKXA 4H67A 5L9MA 3IB0A 1EH3A 3KEIA 4QFOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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