1MM6A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of activation and selectivity in a ligand-gated ion channel: Structural and functional studies of GluR2 and quisqualate
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 83
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A01
3EN3A 5I57A 3T9XB 5FTHA 4YB5A 3RUMA 4HS7A 3WAFA 4I1DA 3KN3A 3KZGA 1N7XA 3MQ9A 3CG3A 1DTZA 1MXXA 4E0WA 5I84A 3V89B 5A5XB 5FHOA 2HZLA 2FYIA 2ALUA 2HAUA 4GXAA 5ICTA 3SEXA 3KJTA 3MUQA 1A8FA 3N6TA 5CM6A 5H8NB 1MS7A 1URGA 2Q89A 2O68A 3G3HA 1B0LA 3VVFA 3CVGA 1P1OA 3LUYA 3RPWA 3ONMA 1A99A 1MY4A 3K00A 4NF8B 3FVKA 1MM7A 1MQGA 3KG2A 3PMWA 5H8FA 1Y20A 2FA7A 1SQYA 1MDP1 1MRPA 2Y7RA 3A3CA 3LSXA 4JWYA 3H6TA 5DEXB 1IIWA 1LFHA 3IJXB 1BTJA 1QKBA 4F18A 1LCTA 4ZE9A 4F2OA 3HO7A 2QJEA 1QJMA 2AIXA 1Y9UA 1I6QA 3O2AA 5CMMA 3C34A 3OELA 3PMVA 2D5WA 4WKMA 4ZS9A 3JYRA 4U23A 3IJOB 2F36A 2I4BA 4PFUA 4XKNA 1NNPA 4X1BA 3SKPA 4R9FA 4IO7A 4POXA 2I4CA 3TKDA 1SD3A 2DE2A 2VOZA 1UTBA 5B70A 3K6VA 3C4MA 4U1OA 3QK6A 4NWDA 2XXIA 1JQFA 5I59B 4I62A 4ESXA 4F1YA 3VLVA 4YMAA 2PX1A 2OZZA 2PVUA 4GFRA 2ONRA 1POY1 2Y7PA 3PPPA 4TLLB 1DPEA 3TQWA 2OLBA 3U93A 5CMKA 3SETA 5J1DA 4IY6A 3TEPA 2RC9A 3TTNA 1ZLQA 1RKMA 3FD3A 3T22A 5JEIA 4F1VA 1D4NA 4HTGA 3OXNA 4JB7A 4OHNA 3W9WA 3TUSA 3IR1A 3UK4A 4HW8A 3K01A 3JV9A 3QUFA 5ISUA 3FV1A 1MY1A 3GBBA 1MXWA 1US4A 4EF1A 2Q9TA 3MZ1A 1LB9A 2M8CA 3W15C 3DELB 1B05A 2QRYA 4DXCA 3LSLA 1MH4A 4FORA 1NNTA 3JZJA 3QXMA 1LSTA 3PPRA 5M2VA 1D9YA 1USYH 1WODA 1B9JA 3HCQA 3RLFE 2HXWA 5EYFA 4FAJA 1USYE 2F6PA 3D4GA 3L6GA 3OSRA 4GVOA 3M8UA 2O69A 1R1NA 3FATA 3LC8A 4MLVA 2V84A 3FUZA 4R2BA 4DE8A 1LAHE 4EXLA 3CI8A 1XT8A 1YTVA 2XXHA 1I69A 1OIBA 3K6UA 3G3GA 3QUJA 4LUBA 2XXRA 4NE4A 2XX7A 3ZSFA 2QS4A 1AMFA 4NF5B 3TCHA 4KQPA 4PP0A 4GXSB 2XX9A 4KYEA 5H8NA 3PU5A 1H44A 2I0CA 4KYSA 4MH5A 2BJJX 4YICA 4U4XA 4U21A 4RXLA 3RTFB 3Q27A 4G8HA 1US5A 3GXAA 2UYEA 1OMPA 2F7BA 3A3UA 3I5OA 1JW1A 1POTA 5TU0A 1LGBC 3MP6A 4OERA 2O7IA 3S4UA 3SEWA 3TAJA 2UVIA 1M5FA 1H3DA 4XXUA 2OWSA 2ESNA 2PT2A 3SERA 1LFIA 3T9VA 3G3FA 2QPQA 3M3LA 3O29A 4OMBA 2ZXTA 4F3BA 1SYIA 3OO8A 1Y4TA 4F3GA 5AA1A 1VFDA 2X7QA 2XXUA 4Z0IA 3QYTA 1NNKA 2G29A 4NTLA 3VXCA 1EH3A 3C35A 5HBCA 1JVYA 1XHYA 1B5IA 3FXRA 3O6IA 3FJGA 1AIVA 1AL3A 3C36A 3B6TA 4H0WA 3EHUA 3TQLA 1IQ7A 4BDNA 4DCXA 1GR2A 3VE1B 4TQUQ 1ZIUA 2RKMA 3M3KA 4DDDA 3C9HA 3QSLA 3C32A 1PBPA 1B5HA 1JW5A 1MQIA 1JEVA 4OESA 4YKIA 4M1VA 1YPNA 5LOMA 3I6VA 3RGYA 4QSCA 4ECFA 5BUUA 1M5BA 1QUJA 2I0BA 4PE5B 4F3PA 1OVTA 1SI1A 2PYYA 4EQ7A 1AOVA 1FW0A 2A5SA 4PFWA 3SEVA 2DOJA 2I3VA 1N84A 2Q88A 3FVNA 1MM6A 1KWHA 3FVOA 3K1MA 3SEYA 2XX8A 4ELOA 4X48A 1QKAA 2XXPA 4L17A 1S50A 4RK9A 2REGA 5I58B 4QRZA 2V3QA 4H67A 1H76A 1H45A 2Z8EA 4NF6A 1SYHA 3BBRA 4OQOA 4PFTA 3RNNA 5I2KA 2P0SA 3BKIB 3UGWA 1LBBA 4ESWA 3K2DA 3O9PA 3OEMA 2PT1A 3PUVE 1EZPA 2P1SA 1I6AA 4YZZA 4ELQA 3IO4A 2ZMBA 4OFLA 4ZE8A 2ANJA 4AB5A 5IKBA 1ELJA 2DXYA 3DLNA 1Z7ME 3H6WA 3ODBA 1IEJA 1FTMA 3FJMA 1UTHB 2CMOA 4IY5A 3T9UA 4C0RA 4MLQA 1P99A 2UXAA 1FCKA 4YAHX 5ICQA 2CZLA 3EQ1A 5CMBA 4LZ8A 1ANFA 1JW4A 4KFQA 5I2NA 4H5FA 2H4IA 4O3BA 1BP5A 3N26A 1LAFE 2ZYKA 3MPKA 3Q25A 3KEIA 3K02A 4QFPA 1A55A 2PMSA 3CSGA 3OEKA 3K1PA 4OENA 2XXQA 3GLBA 3IK6B 3ILUB 2ZYOA 4OETA 1Q1KA 1MXVA 2LAOA 4R6KA 3CSBA 2GHAA 5H8QA 2F6GA 1DPPA 3CR9A 3QIMA 4H6DA 2D3IA 1FTLA 1N3WA 4JWXA 2GRVA 4AB6A 4Z7EA 1FQDA 1ZBMA 3S2VA 3VV5A 4UACA 1B7HA 3C31A 4NF4A 3IO6A 3ZKKA 3HPIA 1CE2A 1QVSA 4MBPA 3R6UA 3CG1A 4NMYA 1NKXA 2R9JA 3IOTA 2D21A 1DMBA 1IXIA 4NF6B 4XKPA 4GF8A 2XD3A 5I2KB 2B65A 3U94A 5AA2A 2Q2CA 4N13A 1O63A 4NWCA 4JDFA 4KCDA 5JK4A 1R9LA 3TTMA 2ZYMA 1VFEA 2Q2AA 3B6QA 1S9TA 2DXRA 3EF7A 3FJ7A 4ND9A 2O84X 2V3TA 3BFTA 5H8SA 2OCUA 3KFMA 3SDFA 4F29A 5ELVA 3KJ7A 1TFAA 2VD3A 3GZGA 3IAZA 2F34A 5H8QB 1B4ZA 4ZZAA 3TPAA 2Y7KA 1IXCA 1ZMGA 4OTEA 3ECRA 3OD7A 1DSNA 4FEDA 4G68C 3UORA 3V83A 5AA2D 4QHQA 4IO2A 3CRBA 4PETA 1MQJA 4N6PA 2OK2A 1B32A 2XD2A 1MPDA 3B6WA 1MDQA 1QUKA 4H1XA 4LONB 5DT6A 5F7VA 3UIFA 3PD9A 3T9HB 3UA8A 5I56A 1R6ZA 4IGTA 2O51A 1N7WA 4ELPA 4N07A 4GIZA 4Q0CA 4F22A 2ZYNA 1FQEA 1DTGA 2XXXA 4GRKA 3RN8A 2NUVA 3B7DA 4KI0E 3O66A 1SW4A 2H5YA 1MPCA 1GGGA 2F97A 4G8NA 5AA4B 1B58A 5L9SA 2VHAA 3OENA 1LAGE 2AL4A 3G3KA 1EZOA 4GLIA 1CB6A 1GTKA 3PMXA 5KDTA 1N04A 3IL1B 3HHGA 3T93B 3EHTA 1URSA 4EF2A 1M5EA 4OVJA 3FVGA 1MH3A 1JNFA 1O7TA 1SI0A 2I48A 3IB1A 4YB7A 5DEXA 2Y84A 5DVFA 1S7YA 3TFLA 1JVXA 3N94A 4X1DA 2E0SA 1OQGA 1MXYA 3PPOA 2KLFA 1R9QA 2RC8A 3C33A 2PBWA 3DP4A 1WVJA 1D9VA 1B3GA 1LFGA 1PC3A 1Y1MA 1ZU0A 1XC1A 1QUIA 3KBRA 3MVXA 2F8DA 3FIRA 4JSOA 4JSDA 2H25A 5H8HA 1NL5A 3OO6A 4G68A 1B2HA 3ZS6A 3RQTA 4XTCQ 2GH9A 4KYDA 5A5XA 2WKYA 3F11A 2R6GE 2GFEA 3FZVA 2VD2A 2O7UA 3IX1A 4IO5A 3U8QA 1H43A 3VVDA 1URDA 5ITPA 4F39A 1GVCA 4C1UA 3D4CA 2G93A 3RT8A 4LA9A 3CFZA 4FJPA 1L5TA 1RYOA 1UIUA 1BLFA 2QMXA 1B3LA 3PUXE 3MBPA 2DVCA 2B3BA 3S9LC 3DM0A 3PUYE 3VLUA 3OSQA 3V8XB 5DVIA 4PFYA 4P11A 3H7MA 3DP6A 5EHSA 3MW0A 1FTJA 2DQVA 3SESA 2H9BA 3TDJA 4QFLA 1A7LA 2VGQA 2Z22A 3PPNA 3TTLA 3PUZE 3K6WA 4NEDA 3S9NC 3PUWE 2O1LA 5KDTB 2OWTA 4TOZA 2UYFA 3KOTA 3Q29A 2O1MA 4P0IA 2I3WA 5DYHA 4EUOA 2DS9A 3QAXA 4RK2A 3MVZA 4ONYA 4ZEIA 4IO6A 2X26A 2RINA 3U72A 1II5A 1AH5A 1Y4CA 1XS5A 2DWIA 2OBGA 4LATA 4R74A 4YB6A 4ZEKA 5TP9A 3UP9A 3MZ9A 1EZ9A 4FE8A 4QSEA 3MVYA 1ZJLA 4Q8RA 4TLMB 2IEEA 2QL3A 2F7CA 4FEBA 4BLAA 2XXTA 2YLNA 3R7XA 4I9DA 4OWDA 4XKQA 3SEUA 4XKRA 3A09A 4DCYA 1F9BA 1LAXA 1B5JA 1FQCA 3W9VA 3U1OA 5TPAA 5CBRA 4G2ZA 4C1TA 1OLCA 3Q28A 2E1SA 5TPAB 5I58A 5KCJA 3OO7A 1B3FA 3RT6B 4F19A 3G7WA 4P0GA 4R2FA 1B7UA 3IB2A 4THIA 5H8FB 5ITOA 4AQ4A 4EQBA 1MY2A 3K4UA 5I57B 1A54A 1HSLA 1NNFA 1PBQA 1FQFA 3FASA 3K6XA 3S9MC 1IXGA 1O64A 3IORA 1B3EA 5DTBA 4WEPA 1MXZA 1XOCA 1D3KA 4G68B 5K2XA 2AYSA 1M5CA 2V3UA 4RNSA 3N5LA 2QS2A 2RCBA 1B51A 3KSXA 4JWOA 1B3HA 2YPNA 1VE4A 2REJA 3PGFA 4KD5A 3KN7A 4KCCA 4G77A 3PV0E 5CBSA 3MP8A 4WXJA 2DVZA 5FTIA 2DWHA 1SBPA 2Y7WA 3TTRA 1PB7A 4U22A 1A8EA 1MXUA 4LZ7A 3HN0A 4GD5A 1YAEA 2VP1A 4U4SA 3LSWA 3U92A 4YKJA 3OOAA 4OXVA 4QSDA 1B40A 2UVGA 3EPEA 3HSTA 4K3FA 4DXUA 1QULA 1ZTYA 3G3JA 4LZ5A 4IO4A 1B46A 2Z8FA 3IB0A 4F3SA 2NXOA 1FTKA 1LBCA 3Q26A 1A40A 3E13X 4ZZEA 5L9OA 5HM4B 4IB2A 2QSXA 1JETA 3VDFA 1B7ZA 2QMWA 1B52A 3AXFA 4R72A 3H06B 4NF5A 1N0TA 5F1QA 3T96B 4BDMA 4BDLA 1SDXA 4OEVA 5HPQA 4NF4B 4LVQA 3TELA 3KOSA 4O3AA 4Q5TA 3KGCA 1XVXA 2RF1A 3FXQA 2HEUA 5TP9B 2H98A 2HAVA 1J1NA 1P1NA 1I6BA 5AA2B 4MFIA 3MJNA 2QS1A 1SW1A 3GBAA 1TWYA 3H6VA 4UA8A 4YKPA 5FHNA 1P1QA 1VR5A 3CIJA 4BDQA 1OQHA 1B1HA 1MY3A 1DOTA 3L6HA 4I8CA 3LSFB 4QFNA 2H99A 2DWAA 4U2RA 1Y1ZA 2F35A 2YJPA 4BDOA 4ZEBA 4DIGA 4WEDA 1UTHA 4Q30B 4H65A 1BKAA 2DWJA 3KN8A 1Y3QA 3H4ZA 4M4GA 4KHZE 5EHMA 4F2QA 2V93A 4R6HA 2XXVA 5L8DA 3H03A 4PQJA 3TMGA 4H8JA 3TODA 5I2NB 1XVYA 4RPNA 2Z8DA 1TT1A 3TCGA 3RTWB 4FECA 3PD8A 5JTYB 3MP1A 1MG1A 1NFTA 1P1UA 3KSJA 3O28A 4IO3A 4ISUA 4OYVA 4U1ZA 3UN6A 4H8IA 3H6UA 1NH8A 3TZAA 1LB8A 2UVJA 3ILTB 2QS3A 3USDA 4RYAA 5AA3A 1SW5A 1FTOA 4EDPA 1P1WA 2Q8JA 2DE3A 2HQ0A 2XXWA 3M3FA 4LP2B 4XIGQ 3K0VA 4QFOA 1YCJA 5B7DA 4QFKA 1FQAA 1B4HA 2I58A 3MPLA 2GHBA 2F7AA 3VXBA 5KCJB 4RY1A 5KZTA 1UIVA 5CRYA 2DYXA 2V25A 1HSJA 5FHMA 2UVHA 3CFLA 3I3VA 3O6GA 1MPBA 3E3KA 1PDAA 3EHSA 2O6AA 2ZNTA 1VSOA 1T0KA 2ONKE 4F1UA 1B0HA 2OJTA 2FNCA 3OO9A 1IZ1A 4GL8A 2XXYA 5BWJA 1Q35A 4ZEFA 2RC7A 1NMUA 1MQDA 1NH7A 1TFDA 1OVBA 2THIA 3BFUA 4GOTA 3P7IA 1JEUA 4HCWA 4IGRA 4OEUA 3VFJA 3WAEA 2HZKA 4H5GA 3E4RA 3FXUA 5AE4A 3K1NA 4RPOA 3IOVA 2DP8A 3MWBA 1ZKBA 3OMBA 4KPTA 3THIA 3HV1A 4LQ5A 4DLDA 4R75A 4GWOA 4YU0A 3IOWA 3PPQA 1TXFA 4OFOA 2ZNSA 5JTYA 2XHDA 1ATGA 1EU8A 4JBZA 2A5TB 1HSEA 4RA1A 1SW2A 3V5AA 5CC2A 1QW0A 2R71A 4X9TA 3FV2A 2A5TA 4LQ2A 1Y3PA 3MC2A 2X7PA 3O6HA 4R9GA 3T66A 3RY3A 3S9EA 1PB9A 5I59A 5H8HB 5K2YA 3TTKA 3CFXA 2HCAA 4GL0A 4ZECA 1FQBA 4ZEDA 2I49A 4OZ9A 4OFJA 3MVWA 4POWA 3IOUA 4YKKA 5L9MA 1UQWA 3TYHA 2DSFA 1SVXB 2DE4A 1IITA 2F78A 2Y7IA 1PEBA 3LBSA 1GV8A 1OLAA 4HCYA 4R73A 2ONSA 1LCFA 4NF8A 1MQHA 4YMBA 2W7YA 2NWJA 5I56B 4BDRA 3ZKLA 1IUDA 2B3FA 1IXHA 1B1XA 2RCAA 3O97A 4EXKA 4G8MA 2I6EA 2ABHA 5CMCA 3E9XA 4FATA 3FGSA 4GQOA 3G3IA 2Z23A 3VVEA 1MY0A 4JXIA 5AA4A 1LLSA 1N76A 3MZBA 3N6UA 1WDNA 1RYXA 2HFBA 5DVJA 3TCFA 4DXBA 2AL5A 4E0XA 4G4PA 1M5DA 3LR1A 5CI5A 4RJZA 4ZDMA 1Z7NE 4DZ1A 1Y3NA 4EQ9A 4F31B 1PB8A 1UTBB 4O3CA 4QF9A 4MF3A 1BIYA 3R26A 2F5XA 2NOOA 2IA4A 2P2AA 1N3XA 3H3GA 4FIMA 2NVUB 3VLWA 3HHFA 2ZNUA 4ELRA 4KR5A 3MAMA 5IAIA 3DP8A 1B6HA 4R6YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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