1MM6A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Mechanism of activation and selectivity in a ligand-gated ion channel: Structural and functional studies of GluR2 and quisqualate
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A01
2Z8DA 2OJTA 3B6WA 1O7TA 1XS5A 4MBPA 3QUFA 2F34A 3H6WA 2O6AA 1B1XA 2HZKA 5KDTA 1O64A 1JVXA 3G3JA 3O97A 3TEPA 3IO6A 2F78A 2REGA 3IR1A 3QAXA 2GHAA 1SI1A 4KHZE 1LB9A 2F36A 4OQOA 5IAIA 1A40A 5ITOA 3CFZA 3TQLA 3VLUA 4QF9A 4PFUA 2Y7WA 2O51A 4OERA 4XKPA 3K0VA 1AMFA 4WEPA 4GFRA 1N76A 1B5JA 1JQFA 2F7AA 4LVQA 3M3FA 3E3KA 4F3SA 3TTKA 4WKMA 4X1BA 1OMPA 3FUZA 3CFLA 5FHNA 1AL3A 3K6UA 5B70A 5AE4A 4G8HA 5CRYA 4F1UA 2R6GE 4FAJA 4UACA 2PYYA 2ZNUA 3K6XA 1B3GA 2WKYA 4KYSA 3PUYE 4RJZA 4YB5A 3FXRA 1A54A 4PETA 3VDFA 2O69A 3CG1A 3FVGA 2A5TA 2THIA 1KWHA 4XXUA 4NMYA 1MY3A 3IL1B 2RC7A 1Z7NE 2ZYOA 4TOZA 1A8FA 2DWAA 3KBRA 2D21A 2Y7IA 1B0LA 3ODBA 4HS7A 3V5AA 4LP2B 1YTVA 2DWJA 2ZMBA 3KZGA 3C34A 5H8SA 5M2VA 4POWA 3T9XB 3BBRA 4RPNA 5H8QA 1FTOA 3TUSA 1TXFA 3C36A 4QSEA 1B1HA 1QUJA 2HAUA 3O6IA 2XXRA 2LAOA 3SERA 4E0XA 3TTMA 1O63A 2OZZA 2NUVA 1B51A 1SD3A 2ZYKA 4ELPA 5ICTA 3MP8A 1M5BA 3AXFA 3UN6A 2H4IA 5F1QA 2ABHA 3M3KA 1R9LA 1A99A 3T93B 4U4XA 1TFDA 3TCGA 3W9WA 4EDPA 3PMVA 3KSJA 2QMXA 4RY1A 4G68A 1LCTA 3FV2A 1MH4A 3CG3A 4TQUQ 2FYIA 5AA2D 3CVGA 1B3LA 4G4PA 3T9HB 3RLFE 5ISUA 4GD5A 1ZU0A 1FW0A 2I3VA 4BDOA 1IUDA 2B3FA 4DZ1A 1URDA 1VFEA 2XXTA 3TQWA 3OO6A 3FVOA 1NNPA 3JZJA 3L6HA 4JWXA 3HCQA 1PC3A 1Y3PA 4QFNA 2P2AA 3PD8A 3PPPA 4GF8A 4IO6A 2NXOA 5I58A 3H03A 3UIFA 4ZDMA 4NF6B 4JWOA 2Y7KA 4DXBA 3HSTA 1NNTA 4OFJA 3TFLA 2GHBA 3R7XA 2YJPA 4IO5A 4QFOA 2HAVA 3S9LC 2NVUB 5I59B 2RCAA 1WVJA 4GLIA 2O1LA 3W9VA 2XXWA 4IY6A 3MBPA 4IO2A 3FD3A 4ND9A 1Y1MA 3A09A 4GRKA 3C9HA 1USYH 3T66A 4F22A 3IK6B 3FGSA 1DTGA 2Q2CA 4KPTA 3RGYA 2W7YA 2DWIA 3BFTA 4OENA 2I3WA 2RF1A 1FQDA 1FTLA 4QHQA 1JETA 2ESNA 1SDXA 2UVHA 4QFPA 3MJNA 2O7UA 1I6BA 2DVZA 2G93A 4OESA 5DYHA 3SKPA 1M5CA 2XXPA 4MLVA 4F3PA 4R9FA 4IO3A 3VFJA 3CSGA 4AB6A 5IKBA 2DE4A 2F8DA 1EH3A 3K01A 3MZ1A 2GH9A 3H06B 3D4GA 2F7CA 1H45A 5K2XA 2QRYA 3BKIB 3T22A 1YCJA 2QL3A 2F7BA 4H5FA 4HCWA 1B3FA 3Q26A 4BDLA 5AA4A 3V83A 3U93A 1MXZA 4P0IA 1UTHA 4OEVA 3S9MC 3U8QA 3TPAA 4PFYA 1LB8A 1MXUA 2Z8EA 4RK2A 4YMAA 1S50A 2V25A 4FJPA 3VE1B 3HPIA 5ITPA 4M1VA 3G3FA 3UGWA 4K3FA 2V3QA 1A8EA 4ZEKA 3R26A 1PDAA 1LFIA 2V3UA 3RTFB 2AL5A 5A5XB 4DIGA 3E4RA 3LUYA 4X48A 2HQ0A 1RKMA 1B9JA 3VXBA 4JSOA 3CI8A 3DLNA 3LSXA 4U4SA 3N94A 3E9XA 1N04A 4RYAA 4F19A 4KYEA 2P1SA 1P99A 1MG1A 4NEDA 4EXKA 1Y4TA 2QS4A 2AIXA 1PBPA 4YKJA 3QXMA 3PUVE 1SW2A 3KG2A 4KI0E 5DT6A 3SEVA 1IXHA 4NF5A 4PE5B 1I69A 2Y84A 5H8NA 1B5IA 3DP4A 2NOOA 3D4CA 4KFQA 1B52A 4QSDA 4THIA 3FXUA 2M8CA 1NNKA 2DP8A 3U92A 4DDDA 4F3BA 5TU0A 5I2NA 5KCJB 3RNNA 5DEXB 3OOAA 1WDNA 4U2RA 4JB7A 1ZIUA 1NKXA 1EZOA 4JSDA 4N13A 3IOUA 5B7DA 3MWBA 4R72A 2F97A 3SETA 1B3EA 3Q29A 2E1SA 5DTBA 1DPPA 1P1NA 1JVYA 2E0SA 3KEIA 3B7DA 2PVUA 3MZ9A 4IO4A 1US5A 1R9QA 2UVJA 2KLFA 1R1NA 1LAGE 1MQJA 3IO4A 4NF8A 4YICA 3PU5A 2XXVA 4Q8RA 5AA2B 2F5XA 2VP1A 3H6VA 2UYFA 5CC2A 2PMSA 5TPAB 4EQ9A 3HO7A 3QUJA 1IXGA 3DP6A 3UK4A 3C4MA 4F18A 4H0WA 4HW8A 1D4NA 4QFLA 2V84A 3EHUA 1ANFA 2RINA 5KDTB 1QKBA 4EF2A 3QIMA 1CB6A 3ILUB 4XKNA 2R71A 3B6TA 1SW1A 2Y7RA 1DOTA 1Z7ME 2VD3A 3I5OA 5I57A 1B7ZA 4KQPA 1Y1ZA 3SEWA 2Z22A 5CMBA 4ECFA 2DXRA 3KOSA 3O28A 1A7LA 3KGCA 2X26A 3PD9A 1QVSA 4GOTA 4ESXA 1MQIA 2Z8FA 2OCUA 1VE4A 1P1QA 5CMMA 4H1XA 3VVEA 4LQ5A 1JW5A 3ZS6A 4H8IA 3O6GA 3K1MA 4F3GA 4U23A 1Y3NA 3C32A 2RC9A 1UQWA 3RPWA 3EHSA 5HPQA 2Q9TA 1P1WA 1BLFA 1D9YA 2ZYMA 3EQ1A 4EXLA 3S9NC 4H5GA 2XX8A 4IGRA 2OK2A 4MLQA 3SEXA 1T0KA 3G3HA 1MRPA 4DE8A 1RYXA 3UA8A 3JV9A 4I8CA 3OO7A 3KOTA 1MY4A 1D3KA 1Q35A 2IA4A 1NH7A 1HSEA 4C1UA 3HN0A 3FVKA 2ZYNA 2F6GA 3MQ9A 5HBCA 3CIJA 4EF1A 1FQCA 3ZSFA 4F29A 1FTJA 1XT8A 2X7PA 3EHTA 3FATA 4HCYA 5ELVA 2HFBA 1ZLQA 4QRZA 4PFTA 2REJA 3U72A 4I9DA 4FE8A 1URGA 1GTKA 2HEUA 1I6QA 5CMKA 1OQGA 5EHSA 1MDQA 1IITA 3PPOA 1CE2A 1QKAA 2FA7A 1JEUA 4OVJA 2RCBA 4I1DA 3UORA 2OWSA 3IAZA 4ZE8A 1OLAA 4R6HA 4N07A 4G68B 3G7WA 1A55A 4ESWA 1M5EA 2I58A 3TAJA 2VOZA 4NF6A 1VFDA 2OWTA 4R6YA 1LCFA 3WAFA 3M8UA 4GXSB 1Q1KA 2I49A 4KCDA 2QS1A 3IJXB 1B4HA 4GQOA 4G68C 4ZZEA 4N6PA 3IB2A 1LBCA 2XXUA 1FQAA 4LZ7A 2ZNTA 3IX1A 1US4A 2B3BA 4O3CA 4ZEDA 1B46A 4FEDA 1XOCA 4U21A 3MAMA 3A3CA 2R9JA 3ZKLA 1LAFE 5L8DA 5I84A 3LC8A 1QUKA 4ZS9A 2I4BA 4G2ZA 1ZBMA 4G77A 1SQYA 3S9EA 1GR2A 2P0SA 4PFWA 1MS7A 4IGTA 1N0TA 4R6KA 4YKKA 4EQ7A 2DXYA 1LSTA 1DTZA 3TZAA 5I56A 1FTKA 3IORA 4R75A 1RYOA 2ONKE 1IEJA 1H44A 3VXCA 1EU8A 3FASA 4ISUA 1B0HA 3Q28A 1IXIA 1OLCA 4JDFA 1B5HA 1R6ZA 5H8FA 1FQEA 3DM0A 2UVGA 4H6DA 2RC8A 1Y4CA 3KJ7A 1LGBC 4LZ8A 4POXA 1BKAA 3B6QA 1LFHA 1UTBB 2I0BA 5H8HB 1SVXB 3T9VA 4OFLA 3VLWA 2Q89A 2PBWA 2H9BA 4GXAA 2ZXTA 4NWCA 2Z23A 3K2DA 1P1UA 5AA3A 3TCFA 5K2YA 3OD7A 2D5WA 4JBZA 3FVNA 5JK4A 4F39A 1PB7A 2CZLA 3MUQA 5FHMA 2AL4A 2GFEA 1LAHE 2XX7A 2OBGA 5TP9A 3EF7A 3OEKA 3RUMA 5EYFA 4ZZAA 4WEDA 1DSNA 3IOTA 4FECA 1AH5A 5AA4B 5DVIA 4ELOA 2XHDA 3U1OA 4FATA 4PP0A 2DS9A 2Y7PA 3QK6A 4OWDA 5A5XA 2F6PA 3MVZA 3EN3A 2OLBA 4YB6A 1JNFA 3OMBA 1POTA 4F2OA 3O9PA 4XTCQ 3KFMA 4F1YA 3OENA 3OXNA 4OXVA 2V3TA 1VSOA 3RT8A 2Q88A 3F11A 1XC1A 3MP1A 1OIBA 1NMUA 5JTYA 1LAXA 4XIGQ 2F35A 4LONB 1JW4A 1PEBA 3R6UA 4IY5A 3I6VA 3T9UA 2DVCA 3G3IA 2DSFA 1MDP1 5ICQA 4R73A 2UYEA 3LSFB 4EUOA 2ZNSA 1H43A 4NF5B 3GBBA 3S4UA 2RKMA 2D3IA 5H8NB 1MXXA 1J1NA 4X1DA 4KCCA 4I62A 4GL8A 2Q8JA 4FORA 4RA1A 1BP5A 2XXYA 3K00A 3K6WA 4RPOA 4NWDA 5I2KB 5I2NB 4RK9A 3H6TA 3MVYA 1EZPA 3K1PA 2VHAA 3PV0E 4PQJA 1MQGA 2PT2A 4P11A 3Q25A 3FV1A 3PGFA 3CR9A 3IOVA 4NF4B 3EPEA 3UP9A 1PB9A 3SEYA 1WODA 5CBRA 3V8XB 3GZGA 3MPKA 4AB5A 1YAEA 3SEUA 1IXCA 1NL5A 4DXCA 1XHYA 2G29A 1EZ9A 4TLLB 5TPAA 2VGQA 2V93A 1DPEA 4X9TA 1VR5A 1MY2A 4ZEIA 4GIZA 3S2VA 4WXJA 3KN8A 4NF8B 4YMBA 1H3DA 5L9MA 5CI5A 4E0WA 4C0RA 3OSRA 4R2BA 2XXHA 4GVOA 3BFUA 3P7IA 3ILTB 1SBPA 1GVCA 4NE4A 1S9TA 1HSLA 5L9SA 3PPRA 5CBSA 4R74A 3USDA 2XD2A 1MM7A 2I4CA 1B4ZA 3MP6A 3T96B 3RY3A 4IO7A 2I6EA 3OELA 3RT6B 5FHOA 4BLAA 4GWOA 3SDFA 2XXQA 1TT1A 4Q5TA 4AQ4A 1QUIA 3O6HA 1XVXA 4ZEFA 3Q27A 4ZECA 1FQBA 3MPLA 2DQVA 1B05A 2UVIA 5I57B 1II5A 3FJGA 3PUXE 4YKIA 1TFAA 3H3GA 1MXVA 4EQBA 4H8JA 1B58A 4FEBA 3N6UA 4XKQA 1IQ7A 5LOMA 1SI0A 2BJJX 1B7UA 2QS3A 4C1TA 2H98A 3KJTA 2B65A 1LLSA 4LATA 2IEEA 1M5FA 1P1OA 5BWJA 1AIVA 4R9GA 2DWHA 1FQFA 2A5TB 3FIRA 3RTWB 3CRBA 1Y9UA 3LSWA 3ECRA 2HCAA 3K02A 1SW5A 4XKRA 5F7VA 2XXIA 3PMXA 4KR5A 1GV8A 1S7YA 1B6HA 1FTMA 4OFOA 1USYE 4Q0CA 3N6TA 2QJEA 1F9BA 3TKDA 4LUBA 4YZZA 4U22A 4DCYA 5H8QB 2FNCA 3QYTA 4OHNA 1MQDA 2XXXA 4R2FA 2XX9A 1MQHA 1LBBA 3O2AA 1ATGA 3H6UA 1FCKA 3MVWA 1ELJA 1MM6A 4U1ZA 4LQ2A 1MXWA 1TWYA 4KD5A 4UA8A 4BDRA 5FTHA 4ELRA 4DLDA 4O3AA 3N26A 2HZLA 4BDMA 1YPNA 2H99A 4LA9A 4OEUA 2QS2A 1IZ1A 1XVYA 3TELA 3RQTA 1LFGA 5DVJA 1DMBA 2GRVA 5CM6A 2O1MA 5JEIA 1JW1A 5FTIA 2ANJA 5AA1A 3TTNA 3PMWA 1M5DA 4DCXA 1N3XA 5I59A 3H4ZA 4KYDA 3ZKKA 3LR1A 2O68A 1MPDA 1SYIA 1BIYA 3OEMA 4MF3A 1OVTA 4GL0A 1B40A 1N3WA 3C35A 3PPQA 3C33A 3HHGA 5I58B 3K1NA 4Q30B 1SYHA 2DOJA 3VVFA 2HXWA 3CSBA 1AOVA 5J1DA 1N84A 4O3BA 1B3HA 2Q2AA 1MY1A 1MPCA 2CMOA 2DE3A 1B2HA 3FZVA 2YLNA 2ONSA 3MZBA 4ELQA 3OO8A 1OVBA 4RNSA 3V89B 4BDNA 1GGGA 3THIA 4FIMA 1B7HA 3DELB 1URSA 1UTBA 5H8HA 4HTGA 1Y3QA 4H67A 5I56B 3W15C 3SESA 5KZTA 2QSXA 1L5TA 1ZTYA 3O66A 1MH3A 1I6AA 4M4GA 2H5YA 3TODA 4MH5A 5BUUA 3TDJA 5H8FB 3FJMA 3MC2A 4H65A 3CFXA 3L6GA 3OO9A 4ZE9A 4F2QA 3DP8A 1IIWA 3KSXA 5L9OA 1QJMA 2DE2A 1Y20A 2H25A 4OETA 3I3VA 3K6VA 4LZ5A 3IB1A 1JEVA 1NNFA 2XD3A 2QPQA 3MW0A 4G8NA 5EHMA 1UTHB 3TCHA 3TTLA 3IB0A 3LBSA 1MPBA 5TP9B 2QMWA 3G3GA 1ZKBA 2O84X 3TTRA 3IOWA 3VLVA 4L17A 3N5LA 2ONRA 3E13X 2ALUA 1UIUA 4YB7A 3TMGA 1QW0A 4OTEA 2DYXA 4Z0IA 3KN7A 3HV1A 4NTLA 3PUWE 1ZMGA 3A3UA 3JYRA 2PT1A 4G8MA 3VVDA 4P0GA 3FXQA 4ONYA 1UIVA 2I0CA 3PUZE 4TLMB 3K4UA 3U94A 1N7WA 2PX1A 4YKPA 4F31B 3O29A 3G3KA 1PBQA 4JWYA 2UXAA 5KCJA 3PPNA 1B32A 3ONMA 3LSLA 1MXYA 1HSJA 3M3LA 5DEXA 2A5SA 4YU0A 3MVXA 2VD2A 4IB2A 5JTYB 4U1OA 3FJ7A 4RXLA 1NH8A 4BDQA 1BTJA 2NWJA 2X7QA 4OZ9A 4QFKA 3RN8A 4YAHX 3C31A 3KN3A 3HHFA 5I2KA 1ZJLA 1OQHA 1N7XA 3QSLA 3GLBA 3TYHA 4MFIA 4OYVA 1H76A 1MY0A 1POY1 3OSQA 1D9VA 4DXUA 4NF4A 1SW4A 4OMBA 4Z7EA 3IJOB 1QULA 5HM4B 1NFTA 5DVFA 4ZEBA 5CMCA 4JXIA 3WAEA 2I48A 5AA2A 2AYSA 1PB8A 2YPNA 4QSCA 4F1VA 2O7IA 3VV5A 3H7MA 3GBAA 3GXAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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