1MM6A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
b'ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of activation and selectivity in a ligand-gated ion channel: Structural and functional studies of GluR2 and quisqualate
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A01
1OVBA 1IITA 3PMVA 1SW5A 2OWSA 1ZIUA 3N6UA 3H06B 3UORA 2QRYA 3IR1A 1Y1ZA 1J1NA 4OFLA 1HSJA 4XKRA 5AA1A 2AIXA 3EQ1A 1POY1 3T9HB 2F7CA 2ESNA 1DSNA 3PPOA 1O7TA 3MQ9A 1UTBB 3R7XA 1SW1A 3TQWA 4Q8RA 3HO7A 3MVYA 4R2FA 4ZE8A 1JW1A 4JDFA 4AQ4A 4MFIA 3TTLA 1NKXA 3L6HA 2ZNSA 2DQVA 3LUYA 4GLIA 1ATGA 4ZEIA 1O64A 2RCAA 2F6PA 1AIVA 2DE3A 1MM6A 4OEVA 4X1DA 4EF1A 2PX1A 3ZSFA 4ECFA 1LAXA 3I5OA 2X7QA 2P0SA 4OYVA 1A54A 2FYIA 1Z7ME 5I84A 1QJMA 3A3CA 3VDFA 4GQOA 3G3KA 3T9VA 4RPOA 4Q5TA 1MY3A 4RNSA 5JTYA 1B4HA 1B6HA 4POWA 1FTKA 2DSFA 3ZKLA 4LONB 1Y4CA 2O1MA 1S50A 1SD3A 4FEDA 2V93A 1VSOA 4ZEDA 1XS5A 2HEUA 3K02A 2DWHA 3K00A 5AE4A 3TKDA 1US4A 3T96B 2ZNUA 1XOCA 1ELJA 4LQ5A 1ZU0A 1OQGA 2H9BA 3O9PA 5H8HB 5CRYA 3MZ9A 2X7PA 4G68B 4GFRA 5DVJA 5FHOA 1LLSA 1MY2A 3EF7A 3MBPA 3TTMA 2UXAA 3TODA 1BLFA 4NWDA 1ZMGA 1N7WA 5A5XA 2YPNA 2OK2A 1QUJA 1OIBA 2F35A 1I6BA 4QFPA 1XT8A 5ISUA 3H6TA 3HPIA 2Q89A 1B3FA 3KN3A 4F31B 1PBQA 1R9QA 3HSTA 4PE5B 2R9JA 4ONYA 1MXXA 5I56A 2YLNA 4PETA 3CG3A 4K3FA 4P11A 3JZJA 1WODA 1A8EA 3TPAA 1H44A 1USYE 3FGSA 1Q35A 3D4CA 1DOTA 3MWBA 3VLVA 3I3VA 3PU5A 4O3AA 1O63A 2HFBA 1NFTA 1OQHA 1QW0A 1US5A 5AA3A 3CFZA 2CMOA 4AB5A 3SERA 2VGQA 5FTIA 3WAEA 1HSLA 4G4PA 1IXHA 2AYSA 2VD3A 3T9XB 3N5LA 4RA1A 3UN6A 3QYTA 4KQPA 1P1NA 3DP4A 4JSOA 4ZZAA 2O69A 3C36A 2ZYNA 3QUJA 4OMBA 3MVWA 4H67A 4IO3A 1EH3A 1IEJA 4RK2A 4Z7EA 3OO7A 3Q29A 4F29A 2GHAA 5J1DA 3KOTA 3BFTA 1Y3NA 1YPNA 2Z23A 5DVIA 5IAIA 4KHZE 3ONMA 3Q26A 4H5FA 1NNKA 4GRKA 3OSRA 3K2DA 4DXUA 1A40A 4I8CA 4AB6A 3SDFA 1D3KA 4BDNA 3C34A 1D9VA 2REGA 3QIMA 2QPQA 2I4BA 2DE2A 3SEYA 1B52A 3PD9A 4G77A 5HM4B 2KLFA 2F5XA 2QJEA 2YJPA 4R6HA 1M5CA 3G3JA 4KPTA 4OXVA 2RC7A 2H25A 3EHSA 3OO8A 2I4CA 4XKPA 5DTBA 5ITOA 1LB8A 3TAJA 1LGBC 2F78A 1MS7A 3PPPA 4OESA 2PT2A 3VXCA 3O2AA 4R2BA 1GTKA 1A55A 4ISUA 4NF6A 4IB2A 5BWJA 1H45A 4I9DA 4WKMA 1GV8A 1B1HA 3K1MA 1M5BA 4G8MA 5K2XA 2GH9A 2VD2A 1SYHA 2D3IA 1R1NA 3C32A 3RY3A 5CMCA 4POXA 4FECA 4R6KA 5AA2D 2Q9TA 3RUMA 3DP8A 2P1SA 3S2VA 4LVQA 4OVJA 3RTWB 2ZYKA 4ND9A 1B2HA 5AA4B 1QKBA 5CMKA 4IO4A 4JWYA 5K2YA 5I2NA 1URSA 2AL5A 5ITPA 3RT6B 3CI8A 3K1NA 3FXRA 1LAFE 3DLNA 2GFEA 4OEUA 3EHTA 3I6VA 1DTZA 2IA4A 4WEDA 4X9TA 2XX8A 1MXZA 4F3BA 1GR2A 3ZKKA 1FQFA 1LAHE 3TTNA 4ZEFA 4XXUA 2DWAA 3QUFA 4JXIA 4MLQA 2I0CA 2B65A 4NF8A 3TCFA 2Z22A 3VXBA 1TXFA 4BDLA 4F18A 1RYXA 1BTJA 3USDA 1TT1A 2Q2AA 2OZZA 2HZLA 2Y7PA 2I6EA 1SI0A 2XHDA 3M3KA 4HCWA 3MUQA 1WDNA 3B6TA 1FCKA 5TU0A 2F34A 2Y7KA 3GBBA 1Q1KA 2Y7WA 4YB5A 4RK9A 5L9OA 4KCCA 1URGA 3V89B 3K6WA 1QKAA 3IOTA 5F1QA 1B51A 3K0VA 2HQ0A 1MM7A 3LSXA 3C31A 3TUSA 3R6UA 3SEWA 1DTGA 3R26A 3H6UA 3MJNA 3SESA 4LUBA 3T9UA 1B4ZA 1MPBA 5EHSA 3LR1A 5H8SA 1XC1A 1IXCA 1JETA 3PUVE 3BFUA 1B5JA 5I2NB 4GL0A 2A5SA 1LFHA 3O29A 3CR9A 1SBPA 1BP5A 4IY6A 2Q88A 4ELRA 4IO2A 5KCJB 4FAJA 1FQAA 5LOMA 5I59B 1B3HA 2Y7RA 4ZECA 1MPDA 1MG1A 3IB0A 3CVGA 4L17A 3IJXB 4N6PA 3K1PA 2ONRA 4H5GA 4LP2B 2CZLA 3TEPA 4NF8B 4QSEA 4OERA 3KN8A 3IB1A 1DPEA 3VLUA 3C33A 4WXJA 1ZTYA 1OVTA 3SKPA 1MH4A 1Y3QA 2HAUA 1PC3A 2I58A 4YMBA 1B7UA 2PT1A 4I1DA 2O68A 2XX9A 1JVYA 2VHAA 4JSDA 4RJZA 4WEPA 1B5HA 1LCTA 4PFYA 3QK6A 3HHFA 1M5EA 1XVXA 4GXAA 4F3SA 2F8DA 5JEIA 4KFQA 1MQHA 2UYEA 4JB7A 3ZS6A 4YZZA 4GL8A 1YTVA 3TQLA 1LBCA 2RF1A 3TTKA 4DIGA 4G8HA 3H6VA 4XKNA 4NF4A 1LB9A 3S4UA 4YKJA 1JNFA 3PGFA 4NEDA 4F1UA 1Z7NE 1POTA 1B0LA 3HV1A 4PFWA 1SW4A 5JK4A 2DWIA 4Q30B 3VVFA 1MQJA 3KOSA 4U1OA 2HZKA 3IO6A 4U4SA 5CI5A 3KZGA 3MW0A 4X1BA 1F9BA 3JYRA 1JEVA 3C9HA 5I57A 4RY1A 3S9NC 1PB8A 2R71A 3H4ZA 1UIVA 3OXNA 3SETA 4H6DA 3QXMA 2V25A 5F7VA 4QFOA 2ONSA 1B5IA 4FJPA 1VR5A 1P99A 1B3GA 1N76A 4UACA 4FORA 2PYYA 1VFEA 1LFGA 3FATA 4KYSA 3TYHA 3KN7A 2ZMBA 5KDTA 2O84X 2M8CA 3E3KA 3PMXA 5JTYB 3PPNA 3GXAA 3B7DA 2LAOA 1ZLQA 4TLLB 1B0HA 1B3LA 3U93A 1A7LA 1D4NA 3HCQA 2V3TA 3A3UA 1EZ9A 3QSLA 4R6YA 4JWXA 3CSBA 4NF4B 4EQ7A 1WVJA 2XXVA 1B9JA 3OO6A 3RNNA 2Q8JA 3CSGA 3MAMA 3U1OA 3VFJA 3MVXA 2F7AA 2WKYA 1TFDA 2H5YA 1BIYA 1MXYA 5CMBA 1VE4A 5H8NA 1JVXA 4DDDA 4ZEBA 4OTEA 5B70A 4BDRA 3DP6A 3UGWA 2RKMA 1XVYA 4N13A 5A5XB 1N3XA 4IY5A 2H99A 3K6VA 3AXFA 3RGYA 4C1UA 2G29A 4Q0CA 3PUYE 4MBPA 3C4MA 3CFXA 4KD5A 2OLBA 3H6WA 3TMGA 3S9LC 3V83A 5FTHA 5TP9A 2H98A 4RYAA 2XXIA 3FV1A 3MZBA 2O51A 5I56B 1MQGA 2XXWA 2GRVA 2HAVA 5DVFA 1S9TA 5HPQA 4F22A 3N26A 2R6GE 2ZXTA 1B58A 1JQFA 5B7DA 1AOVA 3RLFE 3L6GA 2O6AA 3UIFA 4GWOA 4ZE9A 4DCXA 4H0WA 5FHMA 4JBZA 3FASA 4ESXA 2DYXA 2FA7A 3MP6A 5L9SA 2F36A 4NE4A 4C1TA 3MP1A 4PFUA 3RN8A 4XKQA 1NH7A 3MC2A 1N04A 3PPRA 4ZDMA 4C0RA 5I2KA 2UVHA 1PB9A 3VE1B 5L9MA 5M2VA 3G3HA 3FXQA 4DZ1A 2IEEA 1A99A 3W9WA 3ILTB 4GOTA 4X48A 4TQUQ 1JEUA 5AA2A 3KFMA 4N07A 4YKKA 2F6GA 4E0XA 4EXLA 2V3UA 3WAFA 4KCDA 4OETA 3BBRA 3T93B 1GVCA 3KBRA 4R74A 2NWJA 3RQTA 4U1ZA 2DE4A 1H43A 3LSLA 1Y9UA 3H3GA 2PVUA 2XD2A 4QSCA 4G8NA 3C35A 5EHMA 4ELOA 2OWTA 1NNPA 3TDJA 3OEMA 3RTFB 1Y1MA 1SW2A 2Y7IA 1RYOA 2XXTA 2PBWA 5TP9B 2B3FA 3GLBA 1FQEA 4BDMA 5BUUA 4ZEKA 2NUVA 2DOJA 4YKPA 3SEXA 1N0TA 4QF9A 4FE8A 1H3DA 4LATA 2XXXA 1I69A 1MXVA 3M3LA 1D9YA 1A8FA 2ANJA 3SEUA 1MH3A 2Z8FA 1AMFA 3OELA 1LSTA 1CE2A 1B46A 1ZBMA 5CMMA 2XXUA 2RC8A 2VP1A 4OQOA 1AH5A 1B3EA 3FIRA 2I3VA 2DVZA 2BJJX 2UVJA 4F1YA 4NF6B 4QHQA 3OMBA 1YAEA 3DELB 3OENA 1NH8A 4DLDA 3BKIB 2QS1A 4EUOA 4F2OA 1Y20A 4DXCA 2NVUB 4ZZEA 4U4XA 1IQ7A 2XXQA 5TPAA 4EF2A 3O6GA 4F1VA 1UIUA 2O1LA 3G3GA 1RKMA 4O3CA 3FUZA 2Z8EA 1II5A 3O6IA 4M4GA 4ESWA 2QS2A 1Y3PA 1LCFA 2DXRA 4EDPA 1FTOA 2Z8DA 2I48A 1M5FA 2DVCA 1R6ZA 3KEIA 5DYHA 1AL3A 2Q2CA 3IX1A 3E9XA 1EZPA 2RCBA 4DE8A 4TOZA 1MDP1 1PB7A 5ELVA 4XTCQ 4BDOA 1FQDA 1MQDA 3IORA 4R72A 5H8QA 4H8JA 5H8HA 1N3WA 2DS9A 2HXWA 3E13X 4KYEA 4OFJA 3IAZA 4G68A 2RC9A 3CG1A 1LFIA 1IIWA 3TELA 5HBCA 2ZYMA 4E0WA 4H65A 3THIA 5DT6A 3EPEA 4PFTA 1P1UA 4G2ZA 3FVKA 3MVZA 1IXIA 4U22A 1MDQA 2V84A 3E4RA 1LBBA 4RXLA 3O66A 3MPLA 4QRZA 4DXBA 1NL5A 1MY1A 4IO5A 3UA8A 4EQBA 4P0GA 4GD5A 5TPAB 3DM0A 3KSXA 3HN0A 1I6AA 4NWCA 2I49A 1ZKBA 1FTLA 2XX7A 3B6WA 2XXHA 1QULA 4QFLA 3ECRA 3OO9A 1OLCA 1FTMA 3GBAA 1QVSA 1NNTA 1FQCA 3PUWE 3PPQA 3IB2A 3FVGA 3ODBA 1P1QA 2PMSA 5CBSA 1I6QA 4PQJA 3A09A 5KZTA 2FNCA 3TCHA 4F3GA 3FD3A 2O7IA 1JW4A 4DCYA 4ELQA 2I3WA 3KJTA 2DXYA 3HHGA 4MF3A 3U72A 2D5WA 2OBGA 1CB6A 3FZVA 1MY0A 1B40A 3VLWA 1EU8A 4GIZA 4KYDA 3N6TA 5H8QB 3F11A 1UQWA 5CM6A 4JWOA 3PD8A 3MZ1A 1SVXB 2P2AA 4LZ5A 3S9MC 4NTLA 3PUZE 1M5DA 4O3BA 3KG2A 2THIA 3FV2A 3LBSA 3SEVA 1MXUA 3OD7A 1ZJLA 2Y84A 4BDQA 4EQ9A 3FVNA 4IGTA 3D4GA 2HCAA 3K6UA 1SYIA 5EYFA 3UK4A 2F7BA 2DP8A 3H7MA 3KSJA 4HTGA 1KWHA 3G3FA 4OZ9A 4OENA 3O6HA 2ZNTA 2E0SA 1B1XA 1BKAA 2G93A 5CC2A 1OLAA 4YB6A 2OCUA 1DMBA 4XIGQ 2QMWA 4LZ8A 3P7IA 2XXRA 3T66A 4M1VA 3S9EA 2NXOA 4FEBA 3K4UA 3UP9A 4BLAA 1L5TA 3G3IA 4U23A 3IK6B 2W7YA 3RPWA 3U94A 2XXYA 4PP0A 3TTRA 4NMYA 3PMWA 3W9VA 3M8UA 1USYH 3O97A 3OSQA 3W15C 4FIMA 1MQIA 4RPNA 4MLVA 2REJA 3V8XB 2UYFA 5CBRA 1S7YA 2QL3A 4F3PA 4NF5A 1SI1A 5I57B 3Q28A 3IOVA 2RINA 5IKBA 4F19A 1P1WA 4EXKA 1YCJA 4F2QA 2DWJA 2ALUA 2ABHA 2XD3A 1TFAA 3QAXA 4G68C 1EZOA 2XXPA 1ANFA 3H03A 4MH5A 3EN3A 3FJ7A 3JV9A 2V3QA 1JW5A 4YB7A 2VOZA 4IO7A 3LSWA 1FTJA 1VFDA 4TLMB 4R73A 1IXGA 4F39A 3OEKA 3T22A 5AA4A 4IO6A 1UTHA 4H8IA 4R9FA 2I0BA 5KDTB 4OFOA 4KR5A 4GXSB 3LSFB 1MY4A 1B05A 3TFLA 4KI0E 3O28A 1URDA 4OHNA 1IUDA 4R9GA 1NMUA 4I62A 3ILUB 2E1SA 3TCGA 1N7XA 3CIJA 1OMPA 3M3FA 1NNFA 3PUXE 2QSXA 2ONKE 3VVDA 3U92A 4H1XA 1HSEA 3TZAA 5I58A 3PV0E 2UVIA 4YMAA 3FJMA 5H8FA 3IJOB 3FJGA 1B7ZA 1MRPA 2X26A 3Q27A 4ELPA 3VVEA 4THIA 5DEXA 1FW0A 4Z0IA 5H8NB 1IZ1A 1R9LA 4NF5B 2O7UA 3CFLA 3V5AA 2GHBA 4GVOA 1Y4TA 4LQ2A 3K6XA 2UVGA 2A5TA 4HW8A 3OOAA 4QSDA 3RT8A 4P0IA 2QS4A 1B7HA 3FXUA 4LA9A 4YAHX 3K01A 3LC8A 4UA8A 4QFKA 2H4IA 1XHYA 3VV5A 1T0KA 3U8QA 1UTHB 1MXWA 2B3BA 5L8DA 3IO4A 3G7WA 4YU0A 1N84A 1UTBA 5ICQA 3CRBA 1LAGE 3EHUA 1DPPA 1SQYA 1B32A 4OWDA 5KCJA 4GF8A 2OJTA 5I59A 1FQBA 3FVOA 1PBPA 3Q25A 3KGCA 1QUIA 4YKIA 3IOUA 1TWYA 4QFNA 5I58B 2NOOA 5I2KB 3MPKA 3IOWA 1H76A 3B6QA 3MP8A 5H8FB 2ZYOA 2QMXA 4ZS9A 1GGGA 1SDXA 3IL1B 2QS3A 1P1OA 5DEXB 4HS7A 5FHNA 1PEBA 5AA2B 1QUKA 4HCYA 4YICA 4R75A 2A5TB 2F97A 3N94A 4IGRA 2D21A 2AL4A 5ICTA 4U21A 1MPCA 3KJ7A 3GZGA 4FATA 4LZ7A 4U2RA 1PDAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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