1MM6A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Mechanism of activation and selectivity in a ligand-gated ion channel: Structural and functional studies of GluR2 and quisqualate
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A01
1ATGA 2Z8FA 1PB9A 4QSEA 3R7XA 4G8MA 2PMSA 2PT2A 3PMXA 3N94A 1J1NA 3M3KA 1Z7NE 2XXWA 3T22A 2FNCA 4FE8A 1P1WA 4AQ4A 4KPTA 2ZYNA 1OLCA 3HHGA 4IO4A 1ZBMA 2X26A 1MY2A 5M2VA 5L9OA 1UTBA 5H8NA 4MLVA 2OBGA 3B6TA 4U1ZA 3FXUA 1IXCA 4LONB 2PX1A 3OSRA 3K2DA 5L8DA 3H6WA 3OELA 5K2XA 4KYSA 4F29A 3PV0E 1B3EA 4BLAA 1MDP1 2RCBA 5H8SA 4R6YA 3TEPA 3GBAA 1IXIA 4LA9A 4UACA 4EF1A 2XXTA 1MDQA 1GV8A 4R74A 1FQDA 3TAJA 3DP8A 3PD9A 3CFZA 3IB1A 4IO7A 2QMXA 1LSTA 5TP9B 3IK6B 5CMCA 1PEBA 3KSXA 1P1QA 3N26A 2ANJA 4NWDA 5F7VA 1POY1 1SYIA 4OTEA 3MZ9A 2CZLA 3KN3A 3L6HA 4H1XA 3FGSA 1PB8A 5CMBA 4DDDA 1POTA 3C34A 1HSEA 4NF8B 3PD8A 1H45A 3VVEA 4G8NA 3DP4A 1P1OA 4LVQA 2V84A 4OFJA 4OQOA 3OSQA 5KDTB 1FW0A 2QRYA 1N3WA 1I6AA 4ELQA 3PPRA 4LP2B 4KHZE 3FJ7A 1AOVA 3O6IA 2B3BA 5L9SA 2ZYMA 3MVYA 4RA1A 3QAXA 4YB6A 1IXHA 4PQJA 1O63A 2Q8JA 1GTKA 3HO7A 2HCAA 2O6AA 4QFKA 2I4CA 5JTYB 4G4PA 1B2HA 2E0SA 1BTJA 5FHOA 1CE2A 4FIMA 4YKIA 5AE4A 5DT6A 1D9VA 4JDFA 2Z8DA 4K3FA 4HCWA 3MWBA 1A7LA 3K6WA 1YAEA 1HSLA 3H4ZA 4FATA 2ESNA 2AYSA 1LAGE 2H98A 4X1BA 1JVYA 1SVXB 3G3GA 2H99A 2XXHA 3SDFA 3VLWA 1MS7A 1N04A 4NF6A 1B7UA 4IB2A 3MVWA 2ONRA 1M5DA 4OVJA 4WEDA 2XXQA 4L17A 4IO2A 4U2RA 4WEPA 1ELJA 1WDNA 4ZZEA 1OMPA 2UXAA 2XD3A 2FA7A 1SI1A 3B6QA 2QJEA 5BUUA 3V8XB 4O3BA 4XKQA 1QULA 3KZGA 1XC1A 4LZ5A 2DVZA 5KCJA 1LLSA 1PDAA 1MY1A 3KOTA 4N07A 4KD5A 2DQVA 5I59A 2QMWA 3SEYA 3IX1A 1FTMA 1HSJA 4U4SA 4OENA 2QS1A 3OOAA 1AMFA 4ZEFA 2I0CA 3FV1A 2V25A 3G3FA 3LR1A 4KYDA 3EN3A 3ONMA 3VXCA 1M5FA 3RT6B 1QKBA 4DIGA 3U93A 2OWSA 2AIXA 4YB7A 1M5BA 2UYEA 1PC3A 2UVGA 1A54A 3JZJA 1B7ZA 4P0GA 1LCFA 1QW0A 4ISUA 2D21A 3UP9A 1LB8A 2I0BA 1Y1MA 1VR5A 3E9XA 1ZMGA 4OFLA 2Y7KA 1Y20A 1SDXA 4PFWA 4POWA 3VLUA 3LUYA 1MM6A 1BP5A 3T9HB 1RYXA 3KOSA 2OZZA 5I2NB 2DS9A 4JXIA 4HTGA 5HBCA 1IIWA 1KWHA 2RKMA 4PFUA 4OWDA 4ZECA 4BDLA 3M8UA 1B52A 1A8EA 4IO5A 2REGA 4QFPA 2G29A 1R6ZA 3WAFA 2VP1A 4EQBA 4LZ7A 1IITA 2B65A 4EQ7A 3PUYE 4QHQA 1B5JA 1UTBB 5IAIA 5H8NB 2H9BA 4FEDA 3PPPA 5ISUA 1LAFE 3CG3A 1LCTA 1MH3A 3MAMA 1MXUA 5AA4A 3K02A 2ZNSA 1IQ7A 3Q26A 3FVKA 4ZEIA 3TTLA 4OHNA 4JSDA 3WAEA 4PE5B 1MPBA 2DXRA 1Y3PA 1YTVA 5AA2A 4UA8A 1MXWA 1MQIA 2GHAA 1URGA 4MLQA 3ZS6A 4I1DA 4NF4B 5EHMA 3VFJA 2WKYA 1B6HA 3KJ7A 4LQ2A 4XKRA 2DE3A 3IO6A 2QS2A 3MZ1A 3MP6A 5EYFA 5TPAA 3S9EA 4ECFA 3TDJA 5I56B 1Y9UA 4R2FA 2PT1A 1RKMA 2QSXA 2IEEA 3UGWA 2V3QA 3K6XA 4ESWA 3ZKLA 4F3GA 4H67A 4KYEA 3OO6A 4GVOA 3D4GA 5I2KA 2AL5A 3EHSA 4JWOA 3T96B 3S9MC 3RY3A 1JW1A 2CMOA 2HZKA 2F97A 4U23A 2ZNTA 4H5FA 3K01A 2R6GE 3EHUA 1B9JA 3GBBA 1UQWA 4Q5TA 3IB0A 3PPQA 2Q89A 1SI0A 2Y7RA 4HW8A 1QVSA 1YPNA 4GXAA 4G68A 4H0WA 1MPDA 5B70A 1LFGA 5CBSA 3Q29A 2A5TB 2F5XA 1I6QA 3QUJA 2H4IA 3ZSFA 1MY3A 3TQLA 1MY0A 1RYOA 4G8HA 3PUZE 1D9YA 1N7XA 2IA4A 4C1UA 4NWCA 3T9UA 4P11A 3PUWE 1PBQA 1QUKA 3F11A 1OQGA 1JW4A 4F22A 3IORA 1PB7A 3B7DA 2XXRA 3V83A 5I59B 4IO3A 2RC9A 3OXNA 1JEVA 4G77A 1GGGA 5EHSA 3K0VA 4RPNA 1Z7ME 3T66A 1B4ZA 3K6UA 1UTHB 1DTGA 1QUJA 2O68A 3IJOB 2ABHA 4GD5A 3SERA 4PFYA 2F34A 2ZMBA 5DEXA 1Q1KA 1USYH 3O97A 1DMBA 2DVCA 1O64A 1GVCA 4F2QA 4TOZA 5KZTA 4ZDMA 4F19A 2I3VA 2F35A 4GFRA 1ZJLA 2F6PA 2RCAA 2V3TA 2DXYA 1YCJA 4IGRA 1FQBA 3DELB 2F78A 3FATA 4KCCA 4XKNA 2DP8A 5HPQA 4X1DA 2I48A 1QKAA 3MVZA 2RINA 3FUZA 5JEIA 2UYFA 3Q27A 3UA8A 1NH8A 3PGFA 2HAVA 2LAOA 4RK9A 3Q25A 3P7IA 3IOUA 1JVXA 3SESA 4U1OA 2Z23A 4ESXA 2YLNA 1NNTA 3RUMA 2DYXA 3EHTA 2O7UA 4QSCA 1MXVA 3BFUA 3AXFA 3MP8A 1M5EA 3DLNA 4Q30B 2XXXA 3HHFA 1B1XA 3H6VA 4GXSB 3FJGA 5ICTA 3CG1A 4RNSA 1XOCA 3TTNA 1JNFA 5AA4B 4Z0IA 1JQFA 3TTMA 3PPOA 3FIRA 1NNFA 1UIVA 3IOTA 1EU8A 3S2VA 5I57B 3TELA 3T9VA 1XVXA 4JWYA 3QXMA 4ZE9A 3RLFE 2XX7A 1B3FA 4F1UA 1I69A 3TCGA 3VE1B 3PUXE 4G2ZA 3G7WA 3M3LA 3PU5A 4X9TA 4ELRA 3BKIB 3IJXB 4PFTA 4ELOA 5DVFA 4P0IA 2NVUB 4FEBA 4MBPA 1M5CA 4JBZA 4KQPA 3JV9A 3N6TA 1ZKBA 3IR1A 4ND9A 3CFLA 4H5GA 5ITPA 5TPAB 3LSLA 4H6DA 3FASA 5F1QA 4Z7EA 5ELVA 1L5TA 4XKPA 2PVUA 1B0LA 1EZPA 1II5A 4IY6A 4R75A 3G3IA 4ZEBA 5I58B 3H7MA 1QUIA 3BFTA 2XHDA 3K1NA 3MPKA 3CR9A 2O51A 3VV5A 3MZBA 2F7CA 3C33A 2B3FA 1URSA 2DE4A 1SYHA 3TTKA 2D5WA 1B3GA 5AA3A 3UIFA 3PMWA 3KN8A 1VE4A 2PYYA 5DYHA 4Q8RA 1NKXA 3MP1A 4DXUA 3MW0A 5K2YA 1O7TA 5L9MA 3TMGA 4LQ5A 3W9WA 4I8CA 3DP6A 2O69A 4R9FA 3SETA 3E3KA 5CM6A 1A55A 2UVJA 3ODBA 3C32A 4DXCA 1DPPA 2V93A 1R1NA 1TT1A 2Q88A 3SEUA 3VVDA 1IEJA 2KLFA 1IXGA 1NMUA 4EXKA 2H5YA 2R9JA 4RK2A 2ONSA 2H25A 3E13X 2R71A 1XVYA 1NNKA 4RJZA 1Y4CA 1MY4A 3USDA 1N3XA 3KGCA 4HS7A 1B32A 1Q35A 1N0TA 1P99A 3A3UA 1MXXA 3K1PA 5I84A 4OEVA 3I5OA 3GLBA 4R9GA 4EF2A 2HQ0A 3OEKA 4QF9A 1P1NA 1PBPA 3CFXA 4ZEKA 4DCYA 1LAHE 4NF5A 4TLLB 3CI8A 4YKKA 1TFAA 4OMBA 3THIA 2DWHA 4G68C 2RF1A 1LFIA 1VFDA 4IGTA 1B0HA 3CSGA 5HM4B 3LSXA 3FXQA 2QS4A 4JWXA 1MXYA 1MG1A 2FYIA 2ZYKA 3W9VA 4FJPA 5A5XA 3SKPA 3TODA 5CBRA 1MQHA 5CRYA 5KDTA 3U94A 4KR5A 4NE4A 4F39A 1MQDA 2YPNA 3QSLA 1XS5A 2Y7PA 3S9NC 4R73A 2OJTA 1TWYA 3KJTA 2NWJA 1MQGA 3VLVA 1NNPA 4F1VA 4TQUQ 1EH3A 5H8QA 4EDPA 1N76A 3PMVA 1P1UA 2XXUA 5JTYA 1DTZA 2F7AA 5J1DA 1US4A 1FTLA 1XT8A 3C4MA 3H6TA 4YMAA 5CMKA 2P1SA 1AH5A 4DLDA 3ILTB 1AIVA 4Q0CA 4WXJA 4DE8A 3H03A 4F3BA 1ANFA 4M4GA 4YU0A 1OIBA 1A99A 1BKAA 4OERA 4XIGQ 1SQYA 1ZU0A 4QFOA 1NH7A 3R6UA 2THIA 1H76A 3O28A 2O1LA 1B3HA 3N6UA 1A8FA 2YJPA 1NL5A 1B5IA 5FTHA 4C0RA 3U8QA 3TZAA 2I58A 1JEUA 3O6HA 1LBBA 1Y1ZA 2VD2A 5IKBA 4X48A 3VVFA 2O84X 4GRKA 3U72A 1N7WA 1Y4TA 4OEUA 1SD3A 2VD3A 1MQJA 3PPNA 2XD2A 3KN7A 2ZYOA 2BJJX 2UVHA 4NF6B 4QRZA 4U22A 4DZ1A 4ZS9A 3DM0A 2XXPA 4YKJA 3I3VA 4MFIA 3RTWB 1IZ1A 3FV2A 2RC7A 3M3FA 3FVGA 2Z22A 4E0XA 1VFEA 2X7PA 5DTBA 1WVJA 1SW4A 3HPIA 3KEIA 3KFMA 3MPLA 4F1YA 3S9LC 1B3LA 3H06B 4BDMA 5KCJB 3UK4A 1B5HA 3OO8A 3HV1A 5ICQA 2M8CA 3UN6A 4OZ9A 3QIMA 2Q9TA 1B7HA 2G93A 2Q2AA 1Y3NA 4YMBA 4O3AA 3LSFB 3VDFA 3D4CA 3OO7A 5H8HA 1N84A 3RPWA 3A3CA 3O29A 2VHAA 4NTLA 4EQ9A 1H44A 3RNNA 2OCUA 4F3SA 3SEWA 2PBWA 4I62A 4KI0E 3RGYA 2F6GA 1S50A 3KG2A 1EZOA 3FVNA 2REJA 4FORA 4KCDA 4N13A 4RPOA 1SW5A 4N6PA 4FAJA 1EZ9A 2E1SA 3LSWA 5CMMA 4AB5A 1FTOA 1B40A 4F2OA 3S4UA 4DCXA 4F18A 3GZGA 3O66A 3H6UA 4IO6A 3OEMA 4GF8A 3TYHA 4DXBA 1QJMA 4HCYA 1MRPA 3IOVA 2OLBA 1BIYA 4BDQA 4NF4A 4F31B 4M1VA 3MVXA 2ZXTA 5FHMA 4H65A 1D3KA 3FXRA 4NF5B 4QFNA 4H8IA 2OWTA 3EQ1A 3QUFA 4R6KA 1XHYA 4OFOA 1MH4A 1US5A 4OETA 2HFBA 1B4HA 2I6EA 3O6GA 3RN8A 5B7DA 3HCQA 5I56A 4R6HA 3G3JA 2AL4A 4ZZAA 3OD7A 1ZTYA 4LZ8A 1OVTA 4ZEDA 5A5XB 3V89B 4YB5A 3I6VA 2Y7IA 4OYVA 1FTJA 2XX9A 1H43A 5AA2B 3CRBA 4U21A 4GWOA 5DVJA 3Q28A 2Y84A 2P2AA 1DPEA 5H8QB 1VSOA 2NOOA 3C36A 3ECRA 5ITOA 1FQAA 5AA1A 3T93B 1B46A 4THIA 4TLMB 2DWIA 1WODA 1FCKA 4YAHX 5H8FA 3CSBA 3KBRA 3TCFA 4F3PA 1B51A 3W15C 3QK6A 3C31A 3TPAA 5I2KB 3CIJA 2A5TA 1OLAA 1LBCA 3O2AA 1S7YA 4YZZA 2ONKE 1LGBC 3IB2A 4O3CA 1FQFA 1ZLQA 3U1OA 3O9PA 3RT8A 4GLIA 1BLFA 3LC8A 1CB6A 3CVGA 1F9BA 3JYRA 3SEXA 1MM7A 4ZE8A 1FQCA 2GHBA 4G68B 1R9LA 1H3DA 5BWJA 3ILUB 1OVBA 2UVIA 5CI5A 4EUOA 1SBPA 3C9HA 4YICA 1UTHA 3UORA 2V3UA 5JK4A 3ZKKA 1R9QA 3A09A 1TXFA 1LB9A 4NEDA 2I4BA 1MPCA 2QS3A 2DWAA 5TU0A 3RTFB 3FJMA 3FZVA 3T9XB 2GRVA 1LFHA 3IO4A 5LOMA 4PETA 4WKMA 1DOTA 2I3WA 1MXZA 4GL0A 3MJNA 3EF7A 1UIUA 4EXLA 5TP9A 4LATA 5DVIA 3TTRA 3FD3A 2O7IA 3IOWA 3E4RA 5H8HB 2NXOA 1USYE 1JETA 3K00A 4FECA 2HXWA 1D4NA 5DEXB 3G3KA 1T0KA 4ELPA 2QL3A 3TQWA 2GFEA 2XXYA 2P0SA 3RQTA 2DOJA 4NF8A 4PP0A 4QFLA 2DSFA 3EPEA 4BDRA 2RC8A 3B6WA 1B58A 3H3GA 4JSOA 4U4XA 3OO9A 1I6BA 1LAXA 3V5AA 3GXAA 3K4UA 4IY5A 3PUVE 3MUQA 1NFTA 4LUBA 2W7YA 3TFLA 5I57A 1FQEA 3TKDA 3MQ9A 4OESA 4OXVA 3L6GA 3K1MA 3IAZA 3MC2A 1TFDA 4YKPA 4MF3A 4GL8A 3IL1B 4KFQA 4NMYA 1GR2A 2O1MA 1SW2A 4I9DA 4RYAA 1DSNA 1B05A 4GIZA 1Y3QA 3QYTA 4XXUA 3R26A 5CC2A 2XX8A 4RY1A 3N5LA 1S9TA 2X7QA 3MBPA 3KSJA 2VGQA 2ALUA 1A40A 4MH5A 4JB7A 1B1HA 2QPQA 3HN0A 3U92A 4R2BA 1OQHA 4C1TA 1AL3A 4AB6A 4XTCQ 5I58A 1JW5A 4POXA 3VXBA 4R72A 1SW1A 2XXVA 4BDOA 3LBSA 4BDNA 2NUVA 3C35A 1FTKA 3OMBA 2D3IA 5FHNA 4E0WA 3TUSA 2XXIA 3K6VA 2F36A 3TCHA 3FVOA 1IUDA 2VOZA 4ONYA 2HAUA 2Z8EA 1ZIUA 4QSDA 5H8FB 2DE2A 3G3HA 2A5SA 2OK2A 2F8DA 3OENA 2I49A 4GOTA 2Q2CA 2HEUA 4H8JA 3SEVA 5FTIA 3HSTA 2ZNUA 2F7BA 2GH9A 4RXLA 4GQOA 2DWJA 2HZLA 5AA2D 5I2NA 2Y7WA 3BBRA 1URDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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