1MM6A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of activation and selectivity in a ligand-gated ion channel: Structural and functional studies of GluR2 and quisqualate
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 83
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A01
2RF1A 1B3LA 3CSBA 1P1WA 5FTIA 2XXIA 3FIRA 3MJNA 2FA7A 3FVOA 4YMAA 4G8HA 1IEJA 1QKBA 3EF7A 3KBRA 2ANJA 2E1SA 1Q35A 4C1TA 3FXRA 3TELA 3PPNA 3VLWA 2I49A 1MPBA 5EHSA 3FXQA 4YB5A 3EHTA 4M1VA 3LUYA 2F36A 1XHYA 4Z0IA 1EU8A 1NL5A 3H3GA 1M5FA 4QSEA 3KZGA 3KG2A 3DLNA 1FTKA 4F39A 2I0CA 4KHZE 1B05A 1TFDA 2Y7IA 3F11A 1P1OA 1NKXA 1IZ1A 3PD9A 4GRKA 5KDTA 5DEXA 4G2ZA 1D9YA 3I5OA 3FJ7A 4R72A 3ILUB 1EZ9A 4EF2A 1B6HA 2AYSA 1HSEA 4H65A 4IO4A 1RYXA 1POTA 3I6VA 3HN0A 2XXPA 3PPQA 2QS3A 1M5BA 3TZAA 2DVZA 1H3DA 1PC3A 1IUDA 5CMKA 3H6VA 1WDNA 4XKRA 1MH4A 4BDMA 1P1UA 4KYEA 1VFEA 4NF4B 3PMXA 3CFZA 4R74A 3KFMA 4ECFA 1R9QA 3FXUA 3IOUA 2RC9A 3S4UA 1CB6A 1NFTA 3MP1A 5JK4A 2F6PA 3IOVA 2GFEA 4EDPA 2ZNTA 3MZBA 3IO4A 3H6WA 3T93B 3K6XA 5ITPA 4F2QA 3B7DA 4RJZA 1SI1A 3MZ1A 5DVFA 4BDOA 4FORA 5CC2A 3VVDA 1N7XA 1FTLA 1US5A 3RUMA 4LZ7A 1FW0A 2F97A 3EQ1A 4QHQA 4WXJA 2UVGA 4U4XA 4P11A 2XXTA 5DYHA 2H5YA 1Y3NA 3FASA 2DOJA 1ZTYA 3MAMA 3TDJA 2KLFA 4F1YA 3HCQA 3T9VA 1Y4TA 2ESNA 5DTBA 3HSTA 5KDTB 4F3SA 3B6TA 5DEXB 1QUKA 4MH5A 3E9XA 1B5HA 1PBPA 2FYIA 1USYH 4OERA 3FGSA 4LONB 2O6AA 4LZ8A 3V83A 4RPNA 5L8DA 1IXGA 2F78A 4UA8A 1GV8A 3JZJA 1NNPA 3K0VA 1MY4A 3VXCA 3A3CA 1SW4A 1RKMA 3MP8A 3TQLA 2ONSA 3L6HA 1SW2A 1QUIA 5AA2A 3VLVA 5H8SA 1O63A 3CR9A 3SKPA 3FUZA 1LAHE 5CRYA 4HTGA 1MDP1 3PV0E 1N7WA 2ABHA 1JW4A 5AA1A 2NXOA 4ESWA 2H9BA 2F7BA 2BJJX 2Z8DA 1A7LA 2I58A 3RTWB 3U8QA 1MPDA 2X7PA 2W7YA 3GBAA 3ZSFA 1LAXA 1AL3A 1QJMA 5KZTA 2Z23A 4TQUQ 2NWJA 5B70A 1N0TA 3UK4A 2Z8EA 4LA9A 3CI8A 1EZOA 2HEUA 2NUVA 3U93A 4R9FA 3K4UA 3WAEA 4NF6A 5TP9A 5I57A 4KI0E 4DE8A 2O68A 2FNCA 1JETA 3A3UA 2IEEA 1D4NA 5A5XA 3TMGA 1B7ZA 1B7UA 5CMBA 3N26A 2XX9A 2UYFA 3I3VA 1FQEA 3LSFB 4QFKA 1MM7A 4IY5A 3K1PA 2PX1A 3O66A 1MQIA 1MXUA 4QSCA 1NNFA 1SQYA 1XC1A 4JSDA 4AB6A 4ZEFA 1URSA 3H06B 4HW8A 1Z7NE 3IB1A 3C35A 3FD3A 4YAHX 3KGCA 1FTJA 2M8CA 4U23A 4F2OA 4BDQA 2OZZA 4BDLA 1D9VA 2I4BA 4KYSA 3KJTA 3TQWA 4RPOA 5K2YA 4F29A 4QF9A 3T9HB 3G3HA 2XX7A 3IB0A 3O9PA 1N76A 2O7UA 2VD3A 4LP2B 5KCJA 3K6WA 2DVCA 5DVJA 4R6KA 1IITA 3BKIB 3WAFA 1MXZA 1PBQA 1UIVA 4OQOA 3IOTA 3TTLA 2CMOA 4RA1A 4IO5A 5M2VA 4Q5TA 2UYEA 1B32A 1GTKA 4N6PA 5FHMA 1XVXA 4YKPA 3PPRA 1I6QA 1H44A 3CG3A 2XXHA 4JDFA 4F19A 2V3QA 2QJEA 2UVIA 2AL4A 5TP9B 5I57B 1JNFA 1B46A 2QS2A 3MVXA 1ATGA 2Q8JA 4EXLA 3V8XB 3R26A 4JWOA 3CIJA 4U1OA 5A5XB 2P1SA 3VDFA 3MVZA 1LBBA 1USYE 2QL3A 4LQ5A 4LZ5A 4C1UA 5BUUA 2DWAA 3OELA 2ZNSA 4GL0A 1MG1A 2I48A 3PD8A 3UIFA 4IB2A 3SEWA 5I59A 1LGBC 3QUJA 4ND9A 3IO6A 2AL5A 1LSTA 2Z22A 1EZPA 2F34A 3PMVA 4R75A 3MZ9A 5CMCA 1ELJA 3T9UA 4R2BA 5FHOA 3OSQA 3T96B 4JBZA 1CE2A 2YJPA 3JYRA 5CBSA 3SDFA 3MP6A 1YTVA 3PUWE 4BDRA 1TFAA 3IOWA 2OCUA 1ZLQA 5TPAA 3E13X 2B65A 1A54A 3GXAA 4WKMA 2I4CA 3PPOA 3PU5A 2ZYMA 2Q88A 3SEUA 4MLQA 5KCJB 3W15C 1B7HA 4GWOA 5ITOA 4ZECA 2ONKE 4FEBA 2R9JA 3ZKKA 3VE1B 2Q2AA 2NOOA 3PUVE 4ZS9A 3RQTA 3R7XA 1OVBA 5I56A 3MBPA 4C0RA 3BFTA 4TOZA 1P1QA 3G3KA 3JV9A 1B40A 1PEBA 3G3IA 1LFHA 4DCYA 4XTCQ 3KOSA 2XXXA 3W9VA 1JQFA 3M3LA 1TXFA 1I6AA 1N3XA 4MBPA 1R6ZA 2V93A 3RPWA 3TTNA 3OXNA 3S9NC 5ISUA 3T22A 4H8IA 4O3CA 2ONRA 2I3WA 4O3AA 3TUSA 2E0SA 1Y4CA 3ZS6A 4NMYA 1IQ7A 3KN3A 4XIGQ 3OMBA 5I59B 4AQ4A 4JSOA 3HV1A 1FCKA 4DCXA 4OZ9A 1HSLA 1R1NA 1YPNA 2PYYA 3OD7A 4ZEIA 3HO7A 3ZKLA 4OMBA 3VV5A 2UVJA 3RT8A 2X7QA 3Q25A 4IO3A 2QS1A 1GR2A 1NH8A 4KQPA 4YKJA 4RK2A 5I2KA 4DDDA 5TPAB 1OVTA 3QUFA 3TYHA 1XS5A 1ZBMA 4NE4A 3H4ZA 2F35A 2OWTA 4GOTA 4H67A 2VGQA 2DWHA 4OENA 1MY2A 2UVHA 3K6VA 4R6YA 4U22A 2GH9A 4E0WA 3IORA 2H4IA 1Y1ZA 2OJTA 1UQWA 3FV1A 4QFNA 3C36A 4GD5A 4LUBA 3G3FA 2RKMA 2ZMBA 4NWDA 1A40A 1MQGA 1B4HA 4PP0A 4KR5A 5I56B 4ELRA 1A8FA 1MY1A 1FTMA 5LOMA 4GVOA 4GQOA 5EYFA 3KN7A 1XOCA 5B7DA 3VVEA 4KCCA 2V25A 3KJ7A 4IO6A 1BP5A 1AOVA 3FV2A 2ZYOA 4JB7A 2XXYA 4QFPA 2GHAA 3VLUA 3N5LA 3Q26A 3E4RA 2XD3A 5CM6A 3LR1A 4PFTA 1FTOA 1IXHA 4GXAA 3EPEA 3THIA 2XD2A 3U94A 1NNTA 3T66A 2RCAA 2Z8FA 1H43A 3MPKA 1M5CA 3L6GA 2DYXA 2O1LA 1MY3A 3MUQA 5TU0A 2H98A 2HZLA 4OESA 1XT8A 3LSWA 3B6WA 3SEYA 4G68A 4R9GA 5I2KB 4FEDA 2H25A 4N13A 1YCJA 1OLCA 2ZYNA 2DP8A 1P99A 1SW1A 2F8DA 1OQHA 4M4GA 4XKQA 4F1VA 3S9MC 3PUYE 3D4GA 3VXBA 1VR5A 2XXQA 1MPCA 4FECA 4U2RA 5H8FA 4KFQA 4GFRA 1OQGA 5FHNA 4DXCA 3VVFA 2Y7KA 4OFLA 2QS4A 1MDQA 4OFJA 1H45A 4RYAA 4G8NA 3QK6A 5AA4A 1S50A 5J1DA 1KWHA 1N3WA 3VFJA 4EQBA 3C9HA 3P7IA 3RTFB 2DS9A 3CRBA 4GLIA 3GBBA 3PGFA 3SESA 3Q27A 3Q29A 4BDNA 4OFOA 2GRVA 2I3VA 3TPAA 4O3BA 3FVNA 3DM0A 4ELQA 4YB6A 3UN6A 4DXBA 1Y20A 1DPEA 4ONYA 1URDA 1VSOA 2OK2A 3UA8A 3Q28A 1SW5A 1PDAA 5JTYA 3HHGA 3RNNA 1II5A 2CZLA 4H1XA 4X48A 3DP4A 1NNKA 4LQ2A 3ONMA 5DT6A 1MRPA 4X1DA 2PBWA 4XKPA 4G68C 5AA2B 1AH5A 3K1MA 2Y84A 3W9WA 3TAJA 3PUXE 2HFBA 4KD5A 3TCHA 3K1NA 3MW0A 1IIWA 1B58A 4G68B 3MPLA 3U72A 2XXUA 4POXA 3TTKA 4WEDA 3IB2A 2IA4A 1LFIA 1FQDA 3HHFA 4ZE9A 4IY6A 1BLFA 3V5AA 5H8FB 4RY1A 3KSJA 1MQHA 4BLAA 3SEVA 4NWCA 1DOTA 3C4MA 5AE4A 2XXRA 5AA4B 1B2HA 3EHSA 4NF6B 4ZE8A 4Z7EA 2D5WA 4WEPA 5EHMA 4I1DA 4N07A 3CFLA 3N6UA 4PETA 2Y7PA 5I84A 3LC8A 3UGWA 3SEXA 5CI5A 2QSXA 5FTHA 3TCGA 1I6BA 2VP1A 4MLVA 3CFXA 2RC7A 3O28A 4R6HA 3LSXA 3FVKA 5JTYB 3CSGA 1DMBA 1B5IA 1A99A 2G93A 5L9SA 3QXMA 1ZIUA 1LLSA 1QVSA 5CMMA 1QULA 1RYOA 2HAVA 2AIXA 4E0XA 1JVYA 5HPQA 4JWYA 3MVYA 2O84X 1QKAA 2B3BA 5HBCA 2HZKA 3C31A 2DWJA 1B9JA 4I8CA 1LAFE 1LBCA 3LBSA 1LCTA 4LATA 2R6GE 2Q2CA 4K3FA 2Q89A 1M5EA 1Y9UA 2V3TA 2VOZA 1B52A 5BWJA 4OVJA 3S9EA 3CVGA 4GF8A 3OENA 1LCFA 2G29A 1SD3A 2P2AA 1I69A 4OEUA 2I6EA 3RGYA 3S2VA 5I2NA 1B3FA 1B1XA 4OWDA 3B6QA 4NF8A 2D21A 3D4CA 4MF3A 3O6IA 4MFIA 3U1OA 2F6GA 4HCWA 5AA2D 3MVWA 1P1NA 3UORA 1B0HA 3OO8A 2O7IA 2RINA 2ZYKA 3CG1A 1JEVA 1EH3A 1S9TA 2LAOA 3PMWA 5H8QA 2A5TA 3IAZA 1B4ZA 4FE8A 3BFUA 2F5XA 3O2AA 1ZU0A 2NVUB 1NH7A 5ICTA 3C34A 3OEMA 4F31B 3TODA 1UIUA 3DP6A 1DPPA 4F22A 4GL8A 4L17A 4KYDA 2PMSA 4ESXA 1UTBA 4QFLA 3H6UA 4U1ZA 1TT1A 4POWA 2Q9TA 3M3FA 1NMUA 1JEUA 1YAEA 4R2FA 3KSXA 4RNSA 4OYVA 2VD2A 4QSDA 4ELOA 4G4PA 3IJXB 4QRZA 2REJA 3RT6B 4H6DA 4I62A 1IXIA 3G3JA 3QIMA 4H5GA 2O69A 1SBPA 2PVUA 1DTGA 1B5JA 4ELPA 3IL1B 2B3FA 4G77A 1VFDA 3O29A 2DE4A 2DSFA 1DSNA 3LSLA 2XXWA 4LVQA 1MXYA 1SI0A 4U4SA 3TTMA 3G3GA 3TTRA 4ZZAA 1O7TA 2DQVA 5IKBA 3K02A 1FQFA 1TWYA 4IGTA 3IJOB 1URGA 2V3UA 4EUOA 1GGGA 3OO6A 4THIA 4DLDA 3MC2A 3RY3A 5I2NB 3FATA 3FZVA 2HXWA 5JEIA 4ZDMA 4YKKA 4NF8B 4OEVA 5L9MA 4TLLB 4PFWA 2DXYA 4YZZA 1B3GA 3H03A 1UTHA 2OWSA 5H8NA 2YPNA 3MQ9A 3SERA 4FATA 5H8QB 2A5TB 3T9XB 4NEDA 1MXWA 1O64A 4OETA 1R9LA 2HQ0A 1OMPA 4XKNA 2ALUA 1LAGE 2REGA 4ZEBA 2H99A 3BBRA 3H6TA 5ELVA 4YKIA 3A09A 1SYHA 1DTZA 4P0GA 1Q1KA 1UTBB 4F18A 4QFOA 1PB7A 3SETA 4Q8RA 3N94A 3USDA 1N84A 4EXKA 2OLBA 3PUZE 1US4A 1MH3A 3GZGA 1A8EA 2O1MA 2OBGA 3K01A 3V89B 4YICA 1MQJA 3OOAA 1J1NA 4G8MA 4XXUA 3DP8A 4ZZEA 1QW0A 1S7YA 3FVGA 5K2XA 1A55A 1OIBA 3EN3A 3C32A 4KCDA 2ZNUA 1JW5A 5F1QA 4RK9A 2VHAA 3M3KA 3O97A 3K00A 1BIYA 5I58A 4F3PA 1B3EA 3UP9A 2DE2A 2QMWA 2P0SA 5H8HA 4PE5B 1OLAA 4NF5A 3KOTA 2X26A 1AIVA 5L9OA 2O51A 3G7WA 2HAUA 2F7AA 1UTHB 4I9DA 4R73A 2YLNA 5H8NB 3QYTA 1ZJLA 1BKAA 1MXVA 5AA3A 4IGRA 4UACA 1B3HA 3GLBA 1VE4A 1SYIA 4NTLA 2QRYA 1F9BA 3OEKA 4OTEA 3N6TA 4HS7A 1PB9A 1PB8A 3AXFA 1B1HA 1MQDA 4RXLA 1WODA 2ZXTA 2QMXA 1JVXA 4F1UA 1Z7ME 4OHNA 3U92A 1N04A 1B0LA 4DXUA 1T0KA 2I0BA 3K2DA 3R6UA 2HCAA 3E3KA 1D3KA 2Y7WA 3QAXA 3RN8A 3EHUA 2WKYA 4H8JA 1MY0A 2DWIA 2DE3A 1FQCA 1LFGA 2RC8A 4U21A 1ZKBA 2R71A 4FAJA 4F3GA 3TKDA 2PT2A 3FJGA 4YU0A 3OO7A 2GHBA 5HM4B 1BTJA 2F7CA 4GIZA 4DIGA 2Y7RA 4AB5A 4EF1A 1FQAA 4ZEDA 2A5SA 3RLFE 4HCYA 3QSLA 3IR1A 3TCFA 1POY1 4ISUA 4KPTA 2XHDA 1SDXA 1XVYA 1FQBA 1IXCA 5I58B 4EQ9A 1MXXA 3DELB 3PPPA 3KEIA 4X9TA 4F3BA 1Y3QA 5H8HB 5ICQA 3ODBA 1LB8A 1WVJA 4NF5B 2RCBA 3FJMA 1GVCA 3OSRA 2QPQA 4EQ7A 2DXRA 4TLMB 1QUJA 1ZMGA 1LB9A 3H7MA 4P0IA 4DZ1A 1H76A 2V84A 3OO9A 4Q0CA 4YMBA 1MM6A 1HSJA 2XXVA 4H0WA 4GXSB 5DVIA 3M8UA 4YB7A 4H5FA 1B51A 3IK6B 4PFYA 1Y1MA 1Y3PA 1MS7A 4IO7A 4PQJA 1JW1A 4ZEKA 2UXAA 4FIMA 5CBRA 3K6UA 4OXVA 1M5DA 3TFLA 3ILTB 1ANFA 3C33A 3ECRA 1L5TA 3O6GA 4FJPA 5IAIA 3MWBA 4JXIA 5F7VA 3HPIA 3S9LC 2D3IA 2XX8A 1AMFA 2THIA 4JWXA 4X1BA 4Q30B 3O6HA 4PFUA 2PT1A 3KN8A 4IO2A 4NF4A 3TEPA 1SVXB 3IX1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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