2F34A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer with ubp310 at 1.74 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
b'RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f34A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f34A02
2UXAA 2ONKE 3FJ7A 4KCCA 4POWA 1B58A 4U1OA 3T93B 4E0WA 4H0WA 4N6PA 1NNPA 5I84A 3T9HB 2ESNA 2YJPA 3FJMA 4JBZA 4P0IA 3ONMA 4GIZA 4BDMA 1B3FA 3G7WA 4ZEKA 1AH5A 1JEUA 3TCFA 2OZZA 3RPWA 1MY1A 3RTWB 2F6GA 4JWXA 1UIUA 1B4HA 3CFZA 1IIWA 1ATGA 1USYE 3OOAA 3PD8A 4PE5B 1P1OA 4RJZA 1BP5A 1FTKA 2HEUA 3TYHA 1LFIA 4QRZA 3TTKA 2FYIA 2HQ0A 4Q0CA 2PX1A 3T9UA 1R1NA 3O29A 1SYHA 2I6EA 2ALUA 1LCFA 3VVDA 2X26A 1LFGA 2M8CA 1MQHA 3OEMA 1WDNA 2ZYOA 2Z22A 3MBPA 3K02A 2F5XA 3UP9A 2RINA 1VFDA 1T0KA 1IUDA 3CFLA 3FV1A 3LBSA 3C31A 3N94A 4BLAA 3I3VA 1B3HA 1FQBA 3PPOA 2QMXA 3AXFA 1LFHA 4U4SA 3RT6B 2OK2A 2RCAA 2I4BA 3S9EA 4TOZA 1MH3A 3IR1A 1Y3PA 3HHFA 2V3QA 4LONB 1CB6A 3RY3A 3KN7A 1QUKA 3T9VA 1OVTA 2UYEA 3OENA 1B1XA 3IOVA 4RA1A 3T66A 3SERA 3LSFB 3QXMA 3THIA 4H65A 1A8FA 4Z7EA 1XC1A 4GVOA 1M5BA 2Y84A 2RF1A 4I1DA 3TQWA 4LUBA 3OMBA 1QVSA 3PMVA 1LAXA 2XXQA 1DOTA 1EU8A 3FUZA 2F34A 1SW5A 1TFAA 5M2VA 1B0HA 1MM6A 1QKBA 4OETA 5DTBA 4F19A 4HCWA 1S50A 2O6AA 3MAMA 5CMBA 1DPEA 3FXUA 4EXLA 2A5SA 3VLWA 1ZMGA 1LGBC 4JWOA 2GH9A 3TCHA 4NF8A 1JW4A 1JQFA 1O7TA 2Q8JA 4NF8B 2NVUB 3MP1A 3V5AA 4YKPA 4JSDA 5F1QA 5CBRA 2Y7PA 3KEIA 4YMBA 1FQDA 2D5WA 1BIYA 1MPDA 2HZLA 3CFXA 1FW0A 3EHSA 2XX7A 3U8QA 3R26A 3QUFA 2IEEA 3JYRA 4BDLA 3VLVA 4YU0A 3FASA 3VXCA 2OJTA 3BKIB 1XVYA 4DXCA 4KFQA 4QHQA 2DWHA 2THIA 1SQYA 2XX9A 5DT6A 1O64A 4F3BA 1ZLQA 3CG1A 3RLFE 1IXIA 3IOWA 3HCQA 2DOJA 2HCAA 2Q9TA 4ZE9A 3FJGA 1B5HA 2CMOA 1B5JA 3LSLA 4OEVA 5ISUA 1MXYA 2FNCA 3KOSA 3PGFA 4MH5A 1XVXA 5FHOA 3G3HA 4KHZE 1AOVA 3R6UA 4F29A 1MS7A 4FATA 1UIVA 2A5TB 2D21A 1D9YA 2Y7RA 4H67A 3MZBA 5J1DA 3FZVA 4H8JA 3U94A 4NWCA 4LZ7A 5FTHA 4PFTA 4F2OA 1B9JA 5DEXA 4KPTA 4ONYA 4OMBA 5H8FB 4P0GA 2I4CA 2W7YA 2OWTA 3MZ9A 1JVYA 2DP8A 3GXAA 1ANFA 4G4PA 3TPAA 3MC2A 1MY0A 4FIMA 2HAVA 4OESA 1S7YA 2UVIA 1GGGA 4O3BA 4AQ4A 3GLBA 1B3GA 1YAEA 3QYTA 1KWHA 2X7QA 4R9GA 5L9MA 1QKAA 3OO9A 3E4RA 5EYFA 4F2QA 3KFMA 3PPQA 4G77A 3E9XA 3FVKA 3UGWA 4HW8A 1A40A 4ZEBA 3B6QA 3K4UA 3K6UA 2Q89A 3VFJA 3FIRA 3TFLA 4QFPA 4ELRA 4RXLA 4YICA 1II5A 2XXTA 5IAIA 3M3FA 4FAJA 3EPEA 4U2RA 4G8NA 3H06B 5CI5A 5AA2D 3MVWA 2ZNUA 1VFEA 3O6IA 3VVEA 1IEJA 2B3FA 4R6YA 4KR5A 4ZDMA 3IO6A 4ECFA 4R6KA 2AIXA 5CMKA 5HBCA 1MRPA 3OSQA 3RGYA 5TP9B 3FVOA 3IJXB 4XKQA 1N84A 4EQ9A 1Y3NA 2I58A 4JSOA 3SKPA 1B3LA 4R75A 3PPNA 4NE4A 5JTYB 5CBSA 4G8HA 1DSNA 4P11A 5ICQA 4MLVA 3P7IA 3OO7A 4Z0IA 2R71A 4ND9A 1VE4A 1A7LA 1EZPA 4ISUA 3TODA 1PC3A 2H99A 5I58A 1B4ZA 3U93A 1UTHA 4H8IA 4G68C 1UTHB 1IITA 1N76A 4EXKA 4DCYA 2ZYKA 2X7PA 4Q5TA 1R9QA 2ZXTA 4C0RA 5BWJA 1ZTYA 3ODBA 4G68B 1MXUA 1QUJA 3M3KA 1ELJA 3G3JA 3FXRA 1US5A 4R9FA 1H43A 4LZ8A 3UORA 1URSA 4R73A 2H5YA 3MPKA 2O1MA 1MXVA 4BDOA 4IO4A 1POTA 2ABHA 3B7DA 1QJMA 3N6UA 3C36A 4F1UA 2UVHA 4RPOA 2D3IA 1DTZA 2ONRA 2F78A 5CRYA 4ZE8A 1B05A 1D3KA 1JNFA 2R9JA 2GFEA 3OO8A 1UQWA 4G2ZA 1FQFA 1D4NA 1Y4CA 3E3KA 2UVJA 2DSFA 3O28A 3C34A 4OXVA 2CZLA 3GBBA 1HSLA 3F11A 2PT2A 2QJEA 2QSXA 1NL5A 1N3WA 4OEUA 2AL5A 4EF1A 3FVGA 2QMWA 3RTFB 4UACA 3KJ7A 3IO4A 4NF4B 3VLUA 3K1MA 1XT8A 1RYXA 3KBRA 3KOTA 1B52A 4XTCQ 5ELVA 4M1VA 3FVNA 5I57B 5CMCA 2DS9A 2VHAA 4XKRA 4KYDA 2R6GE 3BFTA 4OWDA 1MQDA 3EQ1A 4YAHX 4HCYA 3Q27A 2F8DA 2DVCA 3SDFA 3K2DA 3A3UA 3B6TA 1SW2A 3U92A 4IY5A 3H6UA 4KYSA 1AIVA 3KG2A 4IGRA 2XHDA 4WEDA 1M5CA 2Q2CA 2FA7A 3EN3A 3SESA 2XD3A 1Y20A 1P1NA 1H44A 5TU0A 3OO6A 1QULA 1MPBA 3PUVE 1ZKBA 4GXSB 2Q88A 5H8HB 4G8MA 1B2HA 4OZ9A 3FD3A 4YB7A 3MVZA 3CVGA 4BDRA 2PBWA 1MY3A 1A54A 3IB2A 1GVCA 3O2AA 4ELPA 3MJNA 1JW5A 2QS4A 1FCKA 2LAOA 1IQ7A 4U1ZA 4I8CA 2GRVA 4F3PA 3UIFA 3C9HA 1GTKA 5F7VA 1URGA 1SD3A 3G3KA 2I3VA 4DIGA 4I62A 4M4GA 1SI1A 1P99A 4QF9A 2Z23A 3C32A 3PMXA 4F22A 1PB7A 1HSEA 3HO7A 4RY1A 3KN3A 1M5FA 3V83A 1XHYA 1SVXB 4F1YA 1WVJA 1A99A 3SETA 1R6ZA 2WKYA 3V8XB 1PBQA 3IX1A 3W15C 4ZECA 3TTLA 2Y7WA 4PFUA 1MXZA 3IL1B 1F9BA 3GZGA 5HM4B 1MM7A 4UA8A 1LCTA 1NFTA 3CSGA 2UVGA 4OFLA 3TCGA 5L8DA 3ZS6A 3T22A 2HXWA 4H5GA 2E0SA 2VOZA 1LB9A 4MBPA 4LA9A 1N04A 2DWJA 2KLFA 1JEVA 4WXJA 3W9WA 1YCJA 3PUYE 3A09A 3JV9A 4U21A 4C1UA 2H4IA 3H03A 3G3FA 4IB2A 2V3TA 2VD3A 4THIA 4FECA 3HN0A 3S4UA 1GR2A 3KGCA 2A5TA 3DLNA 5LOMA 3PU5A 2QS3A 3KSJA 3QIMA 3MVXA 4FORA 4ZZEA 4R2FA 2QPQA 4NTLA 3HHGA 5AA1A 4KI0E 3K6VA 1RYOA 5DVJA 4PQJA 2RCBA 1PB8A 4PFWA 1NH8A 1BKAA 1IXGA 5H8FA 3RUMA 3TAJA 5I59A 1SYIA 1M5DA 2XXHA 5I59B 1LAGE 4QFLA 3ZSFA 3MW0A 3TELA 5KCJB 1MXXA 1L5TA 3S2VA 1RKMA 4AB5A 1HSJA 2GHAA 2B65A 3D4CA 1YTVA 3K1PA 4F39A 4GRKA 1NMUA 3KN8A 3VVFA 2O69A 2O51A 2YPNA 5BUUA 4DLDA 1B7HA 1PEBA 1MH4A 3MVYA 5A5XA 1MDQA 5L9OA 5A5XB 1LAHE 3S9MC 3MZ1A 3Q28A 1Y1MA 3CG3A 3HV1A 3O97A 4LQ2A 1FTJA 3W9VA 3CI8A 4GFRA 4YKIA 2XD2A 3TDJA 2REJA 3K6WA 4AB6A 1NNKA 2ANJA 1B5IA 4X1DA 2E1SA 3OSRA 3IB1A 4EQBA 1J1NA 3IB0A 3OD7A 4QFNA 3D4GA 3WAEA 3LC8A 5B70A 5TP9A 3OELA 3TTRA 4O3CA 4F31B 1MXWA 5DVFA 4RPNA 1CE2A 5FTIA 4NWDA 5AA4B 3JZJA 5JTYA 4OHNA 1MDP1 3MUQA 5EHSA 1B6HA 1M5EA 1PBPA 1ZIUA 4ELQA 4FE8A 1TWYA 5AA3A 4BDQA 1VSOA 1MG1A 4DDDA 2P2AA 4R6HA 2I0CA 1LBBA 3UK4A 3RT8A 1MY2A 1TT1A 3ILUB 5B7DA 4LVQA 2DYXA 1Z7NE 4NF6A 1OIBA 5HPQA 4H1XA 4NF6B 3R7XA 4X9TA 5H8NA 3H6VA 1P1WA 4YMAA 1TXFA 5I56B 4R2BA 5H8NB 3H4ZA 3SEWA 5KZTA 1DMBA 3MP8A 2H98A 5I2NA 2ZNSA 2I0BA 3RNNA 3O9PA 5I2NB 1B51A 3L6HA 3LSXA 2DQVA 2V3UA 4G68A 4NMYA 1OLAA 3RQTA 4RK9A 3E13X 2V25A 1FTOA 3ECRA 3HSTA 4Q30B 3A3CA 4IGTA 1AMFA 4RYAA 5AA2A 1IZ1A 2Q2AA 5AA2B 3KZGA 3H3GA 3O6HA 2UYFA 4EQ7A 2XXIA 4QSCA 3CR9A 1ZJLA 4O3AA 3H6WA 3OXNA 4TLMB 4F3SA 3IJOB 3C33A 1S9TA 4IO5A 3SEYA 4H5FA 4LQ5A 3PUXE 1XOCA 4QSDA 2O1LA 3ZKLA 1NKXA 4OFJA 1GV8A 3H7MA 2OBGA 2V84A 4DE8A 3IAZA 4ZEIA 4FEBA 2O68A 3VDFA 3K0VA 2F36A 2OCUA 4F3GA 2P1SA 1LAFE 4ZEFA 1NNTA 1PB9A 3IOUA 3TKDA 3B6WA 1QW0A 2PT1A 3O6GA 1PDAA 1POY1 4JXIA 5ICTA 4LATA 2VGQA 1NNFA 1SW1A 3EHTA 3WAFA 2DXYA 3GBAA 1N0TA 5FHNA 3I5OA 1Q35A 3PMWA 3EF7A 2IA4A 4NF4A 2I49A 4F18A 1P1UA 5L9SA 1FQCA 3L6GA 3C35A 4ZZAA 5CMMA 4LP2B 2Z8FA 5DVIA 2QL3A 4GF8A 4YZZA 2O7UA 5I57A 3ILTB 2XXRA 3MP6A 4OVJA 1LLSA 4MLQA 2Z8DA 2DWIA 5CC2A 1R9LA 2XXPA 4GXAA 5AE4A 3TTMA 3K6XA 1EH3A 2QS2A 3QK6A 1Y4TA 2AL4A 5ITOA 3K00A 3PD9A 4OTEA 5DYHA 1FQAA 3Q25A 3BFUA 5TPAA 2AYSA 4OENA 5TPAB 1I6BA 3DP6A 3M3LA 1FTMA 1N7WA 1Q1KA 1FQEA 4KYEA 3LSWA 2F6PA 1DTGA 1P1QA 4FEDA 4ESXA 1VR5A 1B7ZA 3M8UA 5H8HA 3C4MA 1Y1ZA 5CM6A 2RC8A 1EZ9A 2ZMBA 2YLNA 4DXUA 4YB6A 4K3FA 2V93A 2DXRA 4E0XA 3LUYA 3FATA 2HAUA 3Q29A 2G29A 1UTBA 1UTBB 4U4XA 1NH7A 3O66A 1JETA 4ELOA 3IOTA 3MPLA 4EDPA 2HFBA 2F7AA 4HTGA 2XXVA 4WEPA 1TFDA 4QFOA 3VE1B 3PUZE 4GOTA 3CIJA 3K1NA 4DXBA 3HPIA 4GLIA 1BLFA 3TTNA 4YKJA 3OEKA 4N07A 3TMGA 3I6VA 4GD5A 4FJPA 1OVBA 4XKPA 1MY4A 4H6DA 3V89B 3T9XB 3DP4A 3S9LC 2OLBA 1D9VA 3G3IA 1QUIA 3RN8A 4EF2A 1LB8A 2GHBA 4HS7A 4R72A 4QSEA 2XXYA 2PMSA 3PUWE 4U23A 2DWAA 3TZAA 1B0LA 3N26A 2B3BA 3DELB 1XS5A 5H8QA 4XXUA 4WKMA 5H8QB 1OQHA 4EUOA 4DZ1A 2DE3A 4IO3A 4IO6A 3FV2A 3N5LA 2QS1A 2PVUA 4TLLB 2I48A 2DVZA 1EZOA 5I2KA 1B7UA 5I2KB 3USDA 2NXOA 3EHUA 3DM0A 4R74A 2ZYNA 2O84X 4X1BA 1FTLA 2F35A 1OQGA 1OMPA 1SI0A 4GQOA 3S9NC 1MQGA 1SBPA 3QAXA 1MPCA 4PFYA 2RC9A 3SEXA 4X48A 2VP1A 3G3GA 2NUVA 4KD5A 3VV5A 2XXUA 2P0SA 5KDTA 1SW4A 2I3WA 1JW1A 2NOOA 5KDTB 2H9BA 4GL0A 3U72A 1Y9UA 1N3XA 4ESWA 5KCJA 2BJJX 4GWOA 2RC7A 1IXCA 2QRYA 1MQJA 1JVXA 3QSLA 1A55A 4GL8A 4QFKA 5DEXB 3BBRA 2G93A 2VD2A 1LBCA 4XKNA 2XXXA 4XIGQ 3ZKKA 2F97A 4JB7A 1OLCA 1ZBMA 4OYVA 3PPRA 4TQUQ 3IK6B 4N13A 1N7XA 1DPPA 2ZNTA 4I9DA 4JDFA 3UA8A 3KSXA 1Z7ME 3K01A 4IO7A 4BDNA 1H76A 1IXHA 4OERA 5K2YA 1H45A 1B32A 2PYYA 2XX8A 4KQPA 1BTJA 1B46A 3PV0E 2ZYMA 2Z8EA 4OQOA 4MFIA 4MF3A 3N6TA 3TQLA 1I69A 2Y7KA 4RNSA 5FHMA 2H25A 1H3DA 2REGA 3TEPA 4ZEDA 5IKBA 3H6TA 2Y7IA 1Y3QA 3FGSA 2F7CA 3QUJA 5AA4A 3DP8A 3MQ9A 4IO2A 3FXQA 2ONSA 1B40A 4LZ5A 4PETA 2NWJA 4JWYA 5K2XA 2DE2A 1WODA 4YKKA 1O63A 2HZKA 4YB5A 1YPNA 4POXA 5JEIA 4NF5A 1I6AA 4NF5B 2XXWA 2DE4A 3VXBA 1AL3A 3U1OA 5I56A 4PP0A 4C1TA 2F7BA 1USYH 5EHMA 3KJTA 5H8SA 1URDA 3Q26A 4NEDA 4OFOA 5ITPA 3SEVA 1LSTA 3IORA 3PPPA 3CRBA 1MQIA 1SDXA 4KCDA 4F1VA 5JK4A 5I58B 4IY6A 4RK2A 4L17A 1B3EA 2RKMA 4ZS9A 3TUSA 1US4A 2OWSA 3MWBA 3CSBA 4U22A 1A8EA 1I6QA 1B1HA 3UN6A 4Q8RA 3LR1A 3SEUA 2O7IA 1ZU0A 4DCXA 3T96B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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