2F34A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer with ubp310 at 1.74 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f34A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f34A02
4IO7A 3VLVA 3R26A 4GIZA 3RTWB 3ECRA 1ZTYA 1QW0A 5FTHA 2XX7A 1FQEA 4NF8B 2XXUA 3K01A 4EQ7A 1UQWA 3OO8A 3N94A 4L17A 2XXHA 3OEKA 3QXMA 4OTEA 4LUBA 2XX8A 4NF4A 4KQPA 4GWOA 4ELRA 4U23A 2O84X 1VSOA 1XOCA 3O29A 1MY3A 1YCJA 1MDQA 2XXWA 1BIYA 3RT6B 1MH3A 2NOOA 4X9TA 4JSDA 3T22A 2VHAA 3E13X 3E4RA 4YKPA 3VDFA 1T0KA 2M8CA 5CBSA 4R9FA 4R73A 1BKAA 3H03A 4I1DA 4U1OA 1BLFA 4RJZA 3CR9A 3M8UA 4OESA 2DWHA 4ZEKA 1B58A 4YAHX 3PMXA 1LLSA 2Q2CA 3HPIA 3LSWA 1MY0A 2O1MA 1QUKA 3ONMA 5IAIA 3TYHA 1B5JA 2Y7IA 5AE4A 5TPAB 4KR5A 2P2AA 5TP9B 4BLAA 3UK4A 2B65A 4Q30B 4DCYA 3K1PA 2F6GA 3UP9A 1R9LA 5DVIA 1NFTA 1FCKA 1SYIA 1VFDA 2DXYA 4MF3A 5I59B 4YKIA 5H8NB 3EQ1A 1NNTA 3ZKKA 1P99A 1MS7A 1MXZA 1YTVA 3MC2A 3FIRA 3TTLA 4C1UA 4C1TA 1N04A 4R72A 2I48A 1B7ZA 2AL5A 4Z0IA 3UIFA 1XHYA 4IO3A 4AB6A 2XHDA 2P0SA 5H8FA 5DT6A 1B0LA 2NVUB 5J1DA 2GH9A 3O6GA 2F7BA 3OO6A 4F3PA 1US4A 4ZDMA 1Y1ZA 4NF8A 1HSJA 2Z8DA 1TFAA 2I49A 3PD9A 3CG1A 1IUDA 5KCJB 1LB9A 4KHZE 2FA7A 4NF5B 3FVGA 3N6TA 2V25A 3K6XA 5H8HB 2VD3A 3O97A 2NXOA 3IX1A 2ANJA 4KFQA 5CMMA 1QKAA 3T9UA 3KN8A 4P0IA 3GBBA 3K4UA 3Q29A 1SI1A 1HSEA 1MQGA 2G29A 1IEJA 4ZE9A 2F7AA 1QKBA 1Y20A 5L8DA 3TPAA 4NE4A 4G77A 1IXHA 1Y3NA 5KZTA 4FIMA 1O7TA 3TUSA 4KPTA 5H8QA 3PPNA 4AB5A 1YPNA 3F11A 4OFJA 3PU5A 1XVYA 1FQFA 1B1HA 1H44A 1RYOA 4THIA 1N7WA 1B3LA 1A7LA 4BDOA 3TCHA 2H5YA 2OWSA 3WAEA 1P1UA 1ATGA 3QAXA 4ZZAA 3GZGA 4IO4A 2W7YA 3MZ1A 3M3FA 1JEUA 4U21A 4HW8A 1AOVA 3TTMA 3DP6A 4PFTA 2QPQA 2XXXA 4ECFA 1B40A 4LA9A 3C34A 3P7IA 3WAFA 3EHTA 4NF6B 5AA1A 1GR2A 1NH8A 3U72A 3M3KA 3H6VA 3V5AA 1URSA 5AA2B 2GRVA 2DYXA 3QSLA 1MM7A 1S9TA 4XIGQ 4JDFA 2I6EA 5B7DA 3CFLA 4H8IA 1B52A 3KSJA 2UVJA 2X7QA 1A55A 1PB9A 2O68A 1B05A 2Z22A 1XC1A 3LSXA 5I84A 1MPBA 3CSGA 4PE5B 1MPCA 2DS9A 3LSLA 4NWDA 4OXVA 2DWAA 1P1NA 2AIXA 2Y7RA 2A5SA 4U4XA 3H4ZA 2I4BA 3Q25A 2DE3A 2HZKA 4U22A 3C33A 1DOTA 4XKPA 3PUYE 1H76A 3UGWA 5KCJA 4ELOA 3C35A 2OLBA 3KEIA 4ZEBA 3A09A 2BJJX 3G3GA 4QSEA 1IQ7A 2FYIA 3OSQA 3OO9A 3T66A 4JB7A 1UTBA 1I6BA 4H0WA 1MH4A 5CRYA 1B5IA 1FW0A 1SD3A 1LCFA 3V83A 5FHNA 3JV9A 1MY1A 4YICA 4G8MA 4E0XA 3S9EA 5ITPA 4KI0E 2RC8A 2DVCA 4F3SA 3K1MA 4BDLA 3T9VA 4R74A 4ESWA 3O66A 3KZGA 1MM6A 4DDDA 4I9DA 4RA1A 3PUVE 4LVQA 3KFMA 4JWOA 3UORA 1SI0A 2VD2A 4QFPA 3U1OA 2XXRA 1R1NA 1S7YA 2VGQA 1QUJA 2UVGA 4OFLA 3O2AA 4G4PA 4LQ2A 3TTNA 3IK6B 1POTA 1JETA 4H1XA 1M5BA 5HPQA 4NF6A 1MQHA 2OCUA 2PT1A 3CSBA 4QSDA 4YKJA 5CMKA 1GV8A 2DWIA 4K3FA 1MXXA 5DVJA 2V3TA 1MQIA 3MVZA 4IGRA 4OZ9A 4OMBA 3FD3A 4PFYA 1SVXB 2DE2A 4DXUA 3MAMA 3MQ9A 3H6WA 2ABHA 4GQOA 3JZJA 5EYFA 3FVNA 4YZZA 4YMBA 3TCFA 1B51A 5ELVA 1JVYA 5AA4A 3GBAA 1DMBA 1FTJA 1GGGA 4R2BA 4GD5A 1B32A 4EUOA 1LFGA 4H65A 2UXAA 1WODA 2XXTA 1FTKA 3KN3A 3OENA 3SESA 1F9BA 4R6YA 3VXCA 3RPWA 3TQWA 5H8FB 1LAXA 3OO7A 2THIA 2XD3A 3DELB 1GVCA 1PB7A 2ONRA 5DVFA 4U1ZA 4LONB 4XTCQ 2A5TA 3O9PA 4PETA 3IJOB 5ITOA 4X48A 4KCDA 4RYAA 4WEDA 3U8QA 1DPPA 4LZ8A 1LFHA 4G2ZA 2E1SA 2I0BA 4Q8RA 1N3WA 1B7HA 2H98A 3UN6A 4JWYA 1PB8A 3FGSA 3TODA 3MP8A 1B3EA 2I3VA 1FQBA 2RC7A 2ZYNA 5L9MA 3KOSA 3TZAA 4OHNA 3QYTA 3USDA 1M5EA 5H8QB 4F1VA 3MZ9A 4F3BA 2D21A 4QFOA 4QFLA 3V89B 3RLFE 4I62A 4YMAA 4F2QA 3H3GA 2PYYA 2OJTA 1IXCA 2G93A 4NTLA 2VOZA 3KOTA 1MXYA 3IR1A 2V93A 3RUMA 4IO6A 1DPEA 1II5A 3K6UA 1B6HA 1QUIA 3FVKA 3T9HB 3SETA 3IB0A 5DYHA 3KJTA 4NWCA 4MBPA 1URDA 1WDNA 3RGYA 5ISUA 1URGA 1Y9UA 4YU0A 3PGFA 4WKMA 4RPNA 3U94A 4RK9A 1ANFA 3H06B 4JSOA 2H25A 3DM0A 3FJMA 1RKMA 3W9VA 3I6VA 2IEEA 1MXUA 4FJPA 1LGBC 3QIMA 1WVJA 4OWDA 5FTIA 2DWJA 4IO5A 3N5LA 5DEXA 1I6QA 2D5WA 3KSXA 1NNPA 1B5HA 2Y7WA 4R9GA 4ZEDA 2KLFA 5EHSA 2OZZA 4H67A 4ZS9A 4BDQA 4E0WA 2UVHA 3MZBA 3HHGA 4ZZEA 4M4GA 1FTOA 1B7UA 1M5CA 1IXIA 2F78A 1UTBB 2X26A 3MVWA 4ELQA 2ZNSA 1R9QA 1ZMGA 4RY1A 2NUVA 3OEMA 4ND9A 1XS5A 2HAVA 1B46A 3MW0A 1M5FA 4DIGA 4ISUA 4OVJA 3N6UA 1D9YA 2GHBA 5ICQA 1OQHA 2QS3A 4JXIA 4RXLA 4Z7EA 3O6IA 3U92A 3K02A 3FXUA 3KGCA 2R71A 3VE1B 4FE8A 2PX1A 4ZEFA 1POY1 4M1VA 3TFLA 1BTJA 5AA2D 3C32A 4XKRA 3LUYA 3IOUA 4JBZA 1KWHA 4QSCA 3A3CA 4GRKA 3K0VA 2DVZA 1IXGA 4HCYA 2O7UA 1N84A 3OOAA 3G3IA 3PMWA 4TLMB 1DTGA 2CMOA 4MLQA 1LAFE 3FASA 3Q27A 3M3LA 4GF8A 3FV1A 4P0GA 3LBSA 3LSFB 1CE2A 4U2RA 3I5OA 3E3KA 5TU0A 3H6UA 2F97A 1H45A 4BDNA 4HTGA 3TQLA 4F3GA 3MP1A 3KN7A 3LC8A 2HCAA 3PMVA 4IY6A 3RTFB 3SEWA 1UIUA 3T9XB 5L9SA 3E9XA 2ZNTA 5AA4B 1Y4CA 2ONKE 1PBPA 1R6ZA 1P1WA 1NNKA 1JW5A 3OELA 1LAGE 3CIJA 3HCQA 3VLUA 2HEUA 4TQUQ 5I2NB 5K2XA 3EHUA 2XXVA 3IB2A 3W15C 1ZU0A 2O7IA 4KYEA 4G8HA 5BWJA 3B7DA 4H6DA 1AIVA 5CI5A 3IO6A 3RN8A 2GFEA 2V3QA 4QF9A 2H9BA 4KCCA 3L6HA 1OIBA 3DP8A 3FJGA 3TKDA 1MXWA 2A5TB 2XX9A 1EZPA 1B1XA 3C9HA 2QS2A 2DQVA 4EQ9A 1RYXA 4ONYA 1AL3A 4DXCA 3S2VA 2QRYA 4EF1A 1OLCA 4IB2A 3PPRA 2UYFA 4R2FA 1JQFA 5FHMA 3VVDA 3O6HA 4LP2B 2CZLA 4F1YA 2F6PA 3HSTA 5IKBA 3G3FA 1JNFA 1B9JA 1IIWA 2DP8A 4G68B 1UTHA 1YAEA 4JWXA 4OYVA 4DZ1A 1J1NA 1LBCA 3RQTA 4HCWA 4AQ4A 1TFDA 2OK2A 2DOJA 2F36A 3MP6A 1FQAA 1Y3PA 2B3FA 3TAJA 5I58A 4X1BA 4ZEIA 3FXQA 4I8CA 1MQDA 3MWBA 1SW4A 2DSFA 4EDPA 5I56B 3IAZA 4R6HA 2Q8JA 3IO4A 1AMFA 2QMWA 1B2HA 1FTMA 3BBRA 4G68C 1VE4A 3VVFA 1PEBA 2ZYMA 2ONSA 2FNCA 1TT1A 1L5TA 1Y4TA 5CBRA 4XXUA 5BUUA 4XKQA 1VR5A 1P1OA 2D3IA 2F35A 3CVGA 5I2NA 5K2YA 2AL4A 3KJ7A 1Z7ME 3D4GA 4F31B 3IL1B 5DEXB 3MPKA 1ZBMA 3G3HA 3RNNA 4YKKA 4YB6A 3EN3A 4R75A 3TELA 3CRBA 4MLVA 3C36A 1MDP1 2O6AA 1JW4A 1LB8A 5I57A 1PC3A 1XT8A 3VV5A 3SDFA 1Y3QA 1FQCA 4GVOA 3PUZE 2QMXA 1PDAA 2QS1A 4U4SA 1H3DA 4BDMA 2Z23A 4UA8A 3PUXE 3EHSA 2XXYA 3OSRA 1GTKA 5I2KA 1ZIUA 3MPLA 4X1DA 3JYRA 3FUZA 2WKYA 2F5XA 3V8XB 1MG1A 1A40A 3CFZA 1TWYA 2QJEA 2R6GE 4HS7A 4G68A 4FAJA 2X7PA 3ODBA 3K2DA 3H7MA 3H6TA 1QVSA 3KG2A 1N7XA 4DE8A 4H5FA 1A99A 2IA4A 3K6WA 3FXRA 4O3AA 5LOMA 1MQJA 5JTYA 1LBBA 2GHAA 4NMYA 1LCTA 3HN0A 1UIVA 1Q1KA 2Z8FA 3DLNA 4N07A 2AYSA 4GXSB 3ZKLA 2Z8EA 3RY3A 1NH7A 3IJXB 5I56A 3BFUA 2H4IA 2RC9A 1QULA 4TLLB 3SEUA 2B3BA 4WXJA 4OFOA 3B6QA 2ZYKA 2Y7PA 5ICTA 2ESNA 4FEDA 5DTBA 3T96B 3MJNA 2Q2AA 4OERA 4QFKA 4ELPA 5M2VA 4UACA 1CB6A 3N26A 4QHQA 2XD2A 1B3GA 1NL5A 5F1QA 2PBWA 1B0HA 4C0RA 1OQGA 2DE4A 1FQDA 1Z7NE 3OMBA 3RT8A 3IORA 4OEVA 2Q88A 4MFIA 1EH3A 3HHFA 3R7XA 1DTZA 2YLNA 2V84A 4LZ5A 1MY2A 3T93B 2XXIA 1USYH 3QUFA 1D9VA 1I6AA 1P1QA 4KYSA 4N13A 4KYDA 5JEIA 5A5XA 3R6UA 1IITA 1ZLQA 4F18A 5EHMA 3C4MA 2PMSA 3TTRA 3U93A 5HBCA 3QUJA 3MUQA 2VP1A 3W9WA 4XKNA 4POXA 1PBQA 2RINA 3ZS6A 2ALUA 1SYHA 1H43A 4DCXA 2ZYOA 4PQJA 4MH5A 4NEDA 2NWJA 3D4CA 2HAUA 4PFWA 1N76A 1BP5A 4O3BA 2HXWA 2OWTA 3BFTA 4TOZA 3S4UA 4PP0A 1S50A 4ZECA 4F2OA 2F34A 3ZSFA 3AXFA 4F22A 4OQOA 3IOWA 3IOTA 3VFJA 3G3JA 4YB5A 3PPPA 1USYE 2REJA 4R6KA 3I3VA 2Q89A 4DXBA 3SEXA 4DLDA 1OMPA 2ZNUA 1FTLA 5TPAA 1A8EA 1D3KA 5TP9A 5L9OA 1MY4A 1UTHB 1JW1A 3FZVA 1AH5A 2HZLA 3K00A 4H8JA 1OVBA 5CC2A 2YPNA 5I59A 4FEBA 3MVXA 5H8NA 3SERA 3HV1A 2I58A 3MBPA 4QFNA 3MVYA 1JVXA 2QL3A 3G7WA 5I58B 5KDTB 2RKMA 3BKIB 3CG3A 1Q35A 3S9LC 2Y84A 4GL8A 2I4CA 3DP4A 2RCAA 3SKPA 3Q26A 1OLAA 3ILUB 3GXAA 1O63A 5AA3A 2O1LA 2YJPA 2DXRA 3SEYA 3L6GA 3FV2A 3SEVA 4EXLA 1A8FA 3EF7A 3UA8A 4ZE8A 3CI8A 4IY5A 4LATA 2H99A 4H5GA 4RK2A 4GOTA 1EU8A 2RCBA 4OEUA 4Q0CA 5FHOA 1SW2A 5CMBA 4Q5TA 3K6VA 4IO2A 5CM6A 4OETA 1IZ1A 4F39A 3TTKA 5F7VA 2XXQA 4NF5A 4G8NA 3B6TA 1B4HA 5H8HA 1SW1A 4IGTA 1B4ZA 1ZJLA 1NKXA 2O51A 4F19A 5B70A 4BDRA 5I57B 4LQ5A 1MXVA 2UYEA 1US5A 1D4NA 3PUWE 3OD7A 4O3CA 2PT2A 3A3UA 3TEPA 1SDXA 4F29A 4RNSA 2Q9TA 3GLBA 1DSNA 1SW5A 1HSLA 4F1UA 5CMCA 2RF1A 1LFIA 1Y1MA 4NF4B 2E0SA 3G3KA 3K1NA 3HO7A 4OENA 3TCGA 5I2KB 2QSXA 2ZMBA 3FATA 3EPEA 2OBGA 3VLWA 4LZ7A 4YB7A 3B6WA 1ZKBA 1NNFA 5JK4A 3PD8A 4FORA 1OVTA 3PV0E 4KD5A 1EZ9A 3O28A 2I3WA 3QK6A 1MPDA 1LSTA 4EQBA 3THIA 4RPOA 5KDTA 3VVEA 5JTYB 2I0CA 2ZXTA 4FECA 4GXAA 3IOVA 3TDJA 1LAHE 5AA2A 1ELJA 1JEVA 1N0TA 4WEPA 2F7CA 2HQ0A 3KBRA 2V3UA 3S9NC 4FATA 3IB1A 4N6PA 4GLIA 1M5DA 3VXBA 1SBPA 2HFBA 3PPOA 1B3HA 4GFRA 1A54A 1NMUA 1QJMA 1XVXA 2UVIA 2PVUA 3C31A 4EF2A 3OXNA 1MRPA 4QRZA 4PFUA 3LR1A 2XXPA 3FJ7A 1B3FA 3S9MC 4ESXA 2P1SA 3PPQA 1O64A 1SQYA 1TXFA 2REGA 1EZOA 1N3XA 4P11A 3FVOA 2R9JA 4GL0A 2F8DA 4EXKA 2LAOA 2O69A 2QS4A 5HM4B 5H8SA 3Q28A 1I69A 3TMGA 5A5XB 4POWA 2Y7KA 3ILTB 3CFXA 1VFEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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