4F1UA

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with phosphate at ph 4.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Pseudomonas fluorescens
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f1uA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f1uA01
3RTWB 1MXYA 4QFPA 4BDRA 1A8EA 5EHMA 3QXMA 4IB2A 4DLDA 1DPEA 1A99A 2DWAA 3OXNA 1I6AA 3RLFE 4F39A 2RC9A 2XXYA 1MXZA 4JXIA 3K01A 3TDJA 2OWSA 2DE3A 1QUIA 3D4GA 3IOTA 3QIMA 5AA1A 3PGFA 1LGBC 5ELVA 3Q27A 2OBGA 3EN3A 1EZ9A 4PFUA 1M5DA 4F1VA 3S9NC 1MH3A 1NNKA 2M8CA 4C0RA 3CI8A 3GBBA 4X9TA 3D4CA 2F7CA 2IEEA 3KJ7A 4OYVA 4F31B 1NH7A 3U1OA 1B2HA 3B6QA 2I4CA 3RTFB 2UYEA 3GLBA 1FW0A 3K2DA 3CFZA 5FHNA 4NWCA 4GWOA 3TFLA 1DPPA 4F3BA 1EZPA 5AE4A 1BLFA 2ZNTA 3K1MA 3PUZE 1USYE 4O3AA 4LVQA 2ZNSA 4KYDA 2R9JA 3UORA 2DP8A 3RQTA 1MPBA 5CM6A 4ZEBA 3FGSA 1FTLA 3TUSA 4WXJA 1WDNA 4GIZA 1A8FA 1GTKA 2O69A 1MXUA 4PETA 1H45A 4N6PA 3FVGA 4Z7EA 2Q89A 4KYEA 4KFQA 4P0GA 1JW1A 1LB9A 2GRVA 3MW0A 3MP8A 2E0SA 3RT8A 3IOUA 1LAXA 3BKIB 2QPQA 2KLFA 4H5FA 1Y4TA 3O6GA 4LATA 4N13A 4M4GA 3KOSA 2XXXA 2BJJX 4BDOA 5FHOA 1M5EA 3OO7A 1R9QA 1DMBA 3RY3A 3FIRA 4OETA 2ONSA 3HV1A 3T9UA 2Q8JA 4IO6A 1PBQA 1P1NA 3TTKA 3VVEA 1Y3PA 3FJGA 4GXSB 4ONYA 3H4ZA 1POTA 3IJXB 2XX9A 1LSTA 4X48A 4G68A 1Y20A 5FHMA 3FV2A 3G3FA 1N84A 5DYHA 1AIVA 2UYFA 1DTZA 3K0VA 5AA3A 1NKXA 4LQ2A 3TKDA 5LOMA 3P7IA 4XKNA 3TZAA 3MP6A 1J1NA 5I2KA 1PC3A 2XD3A 1FQBA 3C4MA 2H4IA 1JEVA 3ILTB 3K6UA 3RNNA 3OELA 3RT6B 4R9GA 3KGCA 4G8MA 1LBCA 2ZYOA 1MG1A 1B7UA 4N07A 1ZBMA 1B46A 2OJTA 3GXAA 1TFAA 1ZJLA 3E13X 3OOAA 3V5AA 2DWJA 2ZNUA 4ISUA 1SYHA 4FEDA 4ZZAA 4RA1A 5DVIA 1MPCA 3SEUA 3R26A 4R6YA 3OO8A 4EF1A 2VP1A 2PBWA 4G68B 3IB0A 3U93A 1ZMGA 5BUUA 1UIVA 1IXIA 3KSJA 3IORA 4G2ZA 4DXCA 2NXOA 4H8IA 4JDFA 1HSLA 5HM4B 1BIYA 4R73A 2DE4A 3IL1B 5I2KB 4LA9A 3V8XB 1BKAA 1MY0A 2HZLA 4RY1A 3G3GA 4KHZE 3O97A 2AIXA 3UK4A 3SEXA 3W15C 3R7XA 3K6VA 2XXIA 1MY3A 5DVFA 3C9HA 2X26A 3QUJA 3VVDA 5H8QA 3VDFA 4MLQA 2DSFA 1PDAA 3QYTA 1NFTA 3ZKLA 1JW5A 4R9FA 4IGTA 2DXYA 5H8HA 3C31A 2QS3A 2FA7A 4FAJA 4DXBA 1B7HA 2V25A 5J1DA 3CFXA 3PPRA 4ZEDA 2VOZA 1N7XA 1B3FA 2AL5A 2H99A 2F97A 5JTYA 4ZE9A 4GLIA 3TYHA 2P2AA 3K4UA 1DTGA 3UP9A 3KN7A 1WODA 3B6TA 3DLNA 4ECFA 1HSJA 1NNPA 3UGWA 1P1UA 2XX8A 2Z8EA 3LUYA 4F22A 4C1TA 2F6PA 1VSOA 1B5HA 2HCAA 1AL3A 1H44A 4RXLA 4AB5A 4M1VA 4OHNA 4OMBA 2I0CA 4X1DA 5H8QB 2HEUA 5H8SA 1MQHA 2F36A 1UTHA 1R9LA 1LAHE 2O1LA 3CFLA 4ZEKA 5I58A 2O51A 3KJTA 5TPAA 5CRYA 5H8HB 3T9VA 3SESA 1OQGA 1FTKA 4R2FA 2DE2A 4KD5A 1S50A 3MUQA 3CR9A 4LQ5A 2XXPA 4FEBA 3DP6A 1OLCA 4POWA 4IO3A 3OEMA 4IY5A 4F1UA 1FTJA 3KBRA 5JTYB 2QL3A 3KOTA 4MFIA 4BLAA 1SVXB 4YB6A 3FVNA 1MY4A 1YTVA 1USYH 1O63A 1UTBB 3SEVA 4H0WA 2ALUA 5CMBA 2XXVA 1Y3QA 4JWYA 5CBRA 2I3VA 2OLBA 1MXVA 4H6DA 4YAHX 1MQIA 2Q88A 3Q25A 3N94A 5CMMA 2Z23A 1VE4A 3LSFB 4RNSA 3CSGA 1XVXA 3TCHA 2A5SA 4IGRA 4NF4A 3A3CA 3MZ9A 1XHYA 4WEDA 2I4BA 2H9BA 1B4HA 1UTHB 1OMPA 4KI0E 1R6ZA 5I58B 3VFJA 1NNTA 3FVKA 4ELQA 3PPOA 5A5XA 5TPAB 1MRPA 1ANFA 1DOTA 2FNCA 2GHBA 3QK6A 5CI5A 2B3FA 4E0XA 3MQ9A 3MVWA 4F19A 1GVCA 3FD3A 2Z8FA 3M8UA 4QRZA 2I48A 3L6GA 3FXRA 4QSDA 3OMBA 2RC7A 3TTLA 2X7PA 2FYIA 4GL0A 3MJNA 3PMVA 1Q1KA 4GQOA 1IUDA 2AYSA 4YKPA 3TAJA 1JETA 3H3GA 3H6WA 5I84A 3MVYA 3I5OA 4TLLB 5AA2B 4IO5A 4OEUA 2O6AA 4FIMA 1QUKA 5F1QA 4H5GA 3IAZA 1IEJA 4XKPA 3E4RA 4FORA 4ZE8A 5BWJA 3KSXA 4O3CA 2O7UA 4RJZA 3K6WA 1SBPA 4H65A 4PFTA 1LBBA 3EF7A 2F7AA 3ONMA 3DELB 1LFGA 3GZGA 2NWJA 1XT8A 3A09A 1MDQA 3FATA 2RKMA 4G77A 3KFMA 4ZECA 3MP1A 4O3BA 3ODBA 5HBCA 3G3IA 1O7TA 1QW0A 4PQJA 1F9BA 2IA4A 2R71A 2B3BA 2ESNA 1JVXA 3LSXA 2W7YA 2XD2A 2F6GA 1B7ZA 2PVUA 1M5BA 3E3KA 4YB5A 1B3LA 2HZKA 4AB6A 4OXVA 3KN3A 2O7IA 1B58A 1AMFA 1B0LA 4JSOA 1D3KA 4Z0IA 1I69A 1MM6A 4PP0A 5EYFA 4I8CA 5DVJA 3T96B 2Q2AA 3JZJA 2DWHA 2VD2A 3ZS6A 2WKYA 1MH4A 2RF1A 4EUOA 4YMBA 1TXFA 5L9SA 2ABHA 1B4ZA 3USDA 2RINA 3VLWA 1MXXA 5F7VA 5CBSA 4YB7A 1AOVA 1H3DA 3TPAA 1OVBA 4XXUA 4LZ8A 2OWTA 5CC2A 3T9XB 5DEXA 4R6HA 1I6QA 1B1HA 3M3FA 3IOVA 5ISUA 1NNFA 2ZYMA 4QFNA 3TQLA 4R2BA 3PUXE 4U4SA 3IB1A 2REGA 3MPKA 4OESA 3MAMA 3BFUA 1T0KA 2V93A 3N5LA 3CIJA 3QAXA 4EF2A 1IIWA 1IXCA 2ONRA 3EPEA 4YKIA 1MDP1 3R6UA 3K02A 1NL5A 1Q35A 2VHAA 5IKBA 4GOTA 4XKRA 1O64A 3TCGA 3VLUA 3HSTA 1EZOA 4JWXA 4I62A 1A40A 1B3HA 1IQ7A 3OEKA 1FTOA 3DP4A 5EHSA 4EXLA 2ZXTA 4F3PA 4FJPA 3MWBA 1D9VA 3PMWA 3H7MA 2H5YA 3KN8A 1Y1ZA 1UIUA 1A55A 2OK2A 1B51A 1HSEA 4R6KA 3H6VA 4DCXA 1IITA 1P1QA 4JB7A 1S9TA 4LZ7A 3TMGA 4ELOA 3TEPA 1GV8A 2UXAA 4TLMB 1IXGA 3GBAA 1II5A 4OQOA 4QHQA 3IX1A 3O66A 2ANJA 2ZMBA 3O29A 3G3KA 4F3SA 3S2VA 1LLSA 1AH5A 1R1NA 1B3GA 5IAIA 2GFEA 4YZZA 2OCUA 1MXWA 1D4NA 2Y7RA 2NVUB 3OSQA 2HXWA 5L9MA 3O9PA 4KR5A 1CE2A 3C32A 4U1OA 4ZDMA 1PBPA 2Y84A 2HAUA 1QKAA 1MY1A 3B7DA 3ZSFA 2F5XA 2V3UA 3C36A 2XXUA 4KQPA 3E9XA 2REJA 2CZLA 2XXWA 1NMUA 5CMCA 1JW4A 2DXRA 4IO4A 5K2YA 1N7WA 4KYSA 4U23A 4MF3A 1P1WA 2I0BA 1LCFA 1POY1 3K1NA 4NEDA 3RPWA 3LSLA 3SERA 2F35A 3O28A 1FQDA 4WKMA 2XHDA 3KEIA 3T93B 1GR2A 4YICA 4NF6A 1A54A 1SYIA 4NWDA 2Y7WA 4OWDA 4GF8A 2UVHA 2F34A 2ZYNA 1B5JA 4P11A 4UA8A 2V3TA 4GRKA 2E1SA 4ESWA 3JV9A 2F78A 4RPNA 1Y1MA 5ICQA 1TT1A 4OFJA 1FQEA 4MH5A 4TQUQ 4R72A 5I56A 4HS7A 1M5CA 2GHAA 5JK4A 1YPNA 3TQWA 4OVJA 3MZBA 4LP2B 4NTLA 4I9DA 1LFIA 2Y7PA 1Y9UA 1MQJA 1URSA 3JYRA 4Q8RA 4YMAA 3PPPA 2NUVA 3S9MC 2YJPA 5B7DA 4Q30B 1NH8A 1I6BA 2P1SA 1US4A 2O1MA 3TTNA 4PFWA 4RK9A 1B1XA 1M5FA 4ZZEA 1OVTA 2D21A 3U8QA 4DIGA 2O84X 3EHTA 4NF6B 3FJ7A 2X7QA 3K1PA 3PU5A 4GD5A 1B40A 3EHUA 3HPIA 4F3GA 1RKMA 4XKQA 1B05A 3OENA 3O6IA 4R75A 5ITPA 3ECRA 1PEBA 3O2AA 3W9WA 1H43A 4EDPA 4H67A 4IY6A 1ELJA 3PD9A 1B0HA 5I56B 2I49A 2DVZA 1OQHA 4DCYA 3DM0A 4GVOA 4LZ5A 2V84A 2H98A 1MS7A 5K2XA 3G3JA 1JNFA 2B65A 4U2RA 4OFOA 3OD7A 5ITOA 4QFOA 1UQWA 4PE5B 2YLNA 5I2NA 1BP5A 5JEIA 3T22A 5I59A 3O6HA 1VFDA 3FVOA 1XC1A 3OO6A 4NE4A 3C33A 1ZTYA 3BBRA 4NF4B 3CVGA 1QJMA 4U4XA 3CG1A 2HFBA 1LCTA 1VR5A 1ZKBA 3MPLA 5L9OA 3C35A 4PFYA 4C1UA 4LUBA 3MBPA 2QMWA 1MQGA 3H6UA 2UVGA 2PMSA 4IO2A 3U92A 4ESXA 4L17A 1WVJA 5KCJA 3TODA 5A5XB 4DZ1A 4BDMA 1LB8A 2DYXA 3ZKKA 2R6GE 4H8JA 2G29A 2Y7IA 3HCQA 3U72A 3F11A 4ZS9A 4X1BA 3PPQA 1SQYA 4U1ZA 3H6TA 2H25A 5H8NA 5I57A 2RC8A 5HPQA 1QVSA 2RCBA 3QSLA 3CG3A 4U21A 3SETA 1L5TA 3IB2A 4JWOA 5M2VA 5I2NB 3H06B 3IK6B 3DP8A 5H8FA 4FE8A 1EU8A 5I59B 1FQCA 3OO9A 2V3QA 4G68C 1URDA 3L6HA 3G3HA 4EQ7A 1MQDA 4XIGQ 3I6VA 4EQ9A 1OLAA 4K3FA 4F29A 1SI0A 3WAEA 3FZVA 3IOWA 2D3IA 4MLVA 3IR1A 2Y7KA 1XS5A 4YKKA 3CRBA 4HCWA 4RPOA 4OFLA 4YU0A 2GH9A 3U94A 2VD3A 3G7WA 5KCJB 1Z7ME 5ICTA 4G4PA 1ZLQA 4I1DA 2VGQA 3RN8A 5FTIA 4HW8A 1PB8A 4QF9A 5B70A 5AA4A 2ONKE 4QFKA 2Q2CA 1ATGA 3V83A 5H8NB 2QSXA 1Y3NA 4MBPA 5I57B 1BTJA 1B32A 1Z7NE 2Z8DA 1N3XA 3A3UA 5H8FB 4OZ9A 1QUJA 3Q29A 2PX1A 1B52A 3RUMA 3CSBA 3TELA 3S9EA 1D9YA 1GGGA 2XXHA 4ELRA 2LAOA 3KG2A 2Z22A 4THIA 4XTCQ 5KDTA 2F8DA 4DXUA 1YCJA 2G93A 2A5TA 5KZTA 1LFHA 4DE8A 4E0WA 3I3VA 1MM7A 1B3EA 3TCFA 4P0IA 4DDDA 3N26A 2XXQA 2I6EA 4JBZA 3PUYE 4R74A 4HCYA 1B5IA 5DEXB 4NMYA 1SI1A 3IO6A 3UA8A 1XOCA 1SW2A 1N3WA 3C34A 1IZ1A 4KPTA 4OTEA 3UN6A 4EQBA 4ELPA 3MC2A 1KWHA 4POXA 3KZGA 2DWIA 1LAFE 4LONB 2UVJA 4FATA 1OIBA 4BDNA 5AA4B 1Y4CA 1N04A 3IJOB 5DT6A 2QMXA 1TFDA 4KCCA 4NF8A 3WAFA 1B9JA 3FASA 3V89B 1ZIUA 1A7LA 1P99A 1SW4A 4FECA 3FXUA 3FV1A 2QS1A 4OEVA 3VXBA 3TTMA 3T66A 5KDTB 2P0SA 1LAGE 2A5TB 3ILUB 1QKBA 2PT1A 3S9LC 4HTGA 3FJMA 2YPNA 4Q5TA 1XVYA 3Q28A 2UVIA 3M3KA 4BDLA 5TP9A 3LR1A 1SW5A 3SEWA 2F7BA 3VV5A 3LC8A 4QSCA 2RCAA 3PUVE 2CMOA 3HHGA 1P1OA 4GXAA 4YKJA 4KCDA 1FQFA 3AXFA 4G8HA 4GFRA 4OERA 2PYYA 1US5A 3VVFA 1MPDA 1SW1A 3K6XA 4JSDA 3LBSA 1N0TA 4RYAA 2HAVA 4NF5A 3PPNA 1FQAA 2D5WA 4G8NA 1IXHA 4IO7A 1DSNA 3MZ1A 3EQ1A 3UIFA 4TOZA 4F2QA 1JEUA 3S4UA 2XXRA 1SDXA 1YAEA 4U22A 4NF8B 5AA2D 4F1YA 3THIA 1UTBA 1S7YA 1H76A 3PUWE 3VXCA 2I58A 4ZEIA 3SDFA 4RK2A 2XX7A 3HN0A 3B6WA 1PB7A 1FCKA 3QUFA 2THIA 4Q0CA 1JQFA 3BFTA 1FTMA 3IO4A 1TWYA 4ND9A 1PB9A 5TP9B 4WEPA 2HQ0A 1CB6A 3HO7A 5L8DA 2PT2A 3PV0E 1URGA 3W9VA 4OENA 2QJEA 3RGYA 5DTBA 3TTRA 4EXKA 4BDQA 5CMKA 1SD3A 3VLVA 3MVZA 3T9HB 3HHFA 1JVYA 3M3LA 3N6TA 4NF5B 2QS4A 3MVXA 3LSWA 2QS2A 3N6UA 4QSEA 4F2OA 1EH3A 3FXQA 2ZYKA 3H03A 4ZEFA 1MY2A 2QRYA 2DVCA 2XXTA 4UACA 4QFLA 1RYXA 3VE1B 1QULA 1VFEA 4F18A 2Q9TA 3PD8A 3Q26A 3PMXA 5TU0A 3K00A 1B6HA 2DQVA 3OSRA 2O68A 3SEYA 5AA2A 1ZU0A 4H1XA 2DOJA 2DS9A 4AQ4A 2OZZA 1RYOA 2NOOA 3SKPA 2I3WA 4GL8A 3FUZA 1N76A 2AL4A 3EHSA 5FTHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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