4F1UA

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with phosphate at ph 4.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
b'MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule tags Phosphate-binding protein
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f1uA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f1uA01
2FNCA 4H1XA 4NF8B 3CRBA 1YAEA 1BP5A 1R9QA 1JVYA 2DXRA 3WAFA 1IQ7A 1UTHA 4IO7A 3S9LC 3KN3A 3IX1A 4G77A 5L8DA 2O68A 3LR1A 3MZBA 1XC1A 4GXAA 3R7XA 4KYSA 3K02A 1MXYA 4NWDA 3KEIA 1P1NA 3VE1B 3VVFA 1I6BA 1NH8A 4LA9A 1M5FA 4WEDA 4KQPA 1QUKA 1LB8A 3ZKLA 4IB2A 5I58B 1IXGA 5CMCA 2G93A 3RQTA 3O28A 4P11A 2ZYMA 1MQHA 2I48A 4LONB 2PMSA 3RPWA 4LZ7A 5AA2D 4OTEA 4ZS9A 3H7MA 4KYDA 3LBSA 1MRPA 1N84A 3BFUA 3LUYA 1R1NA 3N6UA 2NUVA 4JSDA 3KG2A 4R73A 4XKRA 2O7IA 2FA7A 1P1WA 2I0BA 3T96B 1SYHA 4OMBA 3KSJA 4U4XA 5B7DA 1IITA 5CBRA 2O7UA 4ZE9A 3B6QA 4GOTA 1IZ1A 4H67A 4GL8A 5DVJA 3K6XA 3LSWA 1GTKA 4GFRA 5KDTB 3E4RA 1FTLA 3TCGA 3TELA 1OQGA 3C33A 2NXOA 2V3UA 5ITOA 4MLQA 1LAFE 3SETA 2RCBA 3VV5A 4EDPA 5DEXB 4TLLB 4FECA 4NE4A 1B3GA 3C4MA 2XXHA 4LQ5A 4PETA 1RYOA 4XKNA 3FJGA 5M2VA 1EZ9A 3MVZA 2GHAA 3UGWA 1QKBA 2I4CA 3B6TA 3IO6A 3RNNA 4LZ8A 2X7QA 2D21A 1JW4A 4GXSB 4OESA 1TFAA 4G2ZA 4QFNA 1B1XA 2XXYA 1SW1A 3PGFA 4NTLA 4WKMA 4H5FA 4EQ7A 2DS9A 5HBCA 2YJPA 3EHTA 1SBPA 1XT8A 1IXCA 3KJTA 3OO9A 3LSLA 1M5CA 2KLFA 4YB5A 5H8NB 1USYE 5L9MA 1A54A 1UQWA 3CFXA 1AOVA 1SQYA 1H45A 3N94A 3PMVA 1JW1A 3A3UA 4EF2A 2QL3A 4GF8A 3HN0A 4OHNA 3SEYA 3THIA 3MPLA 1IXHA 3CG1A 4Z0IA 5HM4B 1B0HA 1LBCA 2F6GA 5K2YA 2PVUA 3S9MC 3KN7A 2ESNA 4U21A 1ATGA 5A5XB 2HQ0A 3G3JA 1HSLA 3S9NC 3QUJA 1AIVA 3D4GA 1GR2A 1VFEA 2ZNTA 2F6PA 4I8CA 3JYRA 5TPAB 4IY5A 1IEJA 4U1ZA 1ZKBA 3K6WA 1B40A 1LCFA 3FXRA 1LAXA 2DWAA 2X26A 3SEVA 2O1LA 3OEMA 1OLCA 4FORA 2ANJA 2Z8EA 1OLAA 3IB1A 4IO5A 4GLIA 3IB2A 1SI1A 4RJZA 3Q28A 3PPRA 1XVYA 1A55A 1PDAA 3VVDA 4NEDA 2AL5A 1O64A 3IB0A 3V5AA 1B9JA 4KCDA 3T22A 4N6PA 4R6HA 4BDRA 4ELOA 2OBGA 1WVJA 3B7DA 4KPTA 1IUDA 4YKKA 3LSXA 1O63A 3OSQA 3FVKA 4RYAA 2DWJA 4YKJA 3IJOB 4OXVA 4OFJA 2NVUB 5FHOA 1M5EA 4R6YA 4YKIA 3QIMA 5KZTA 4NF6B 1EZPA 5AA4A 4POWA 5I2NA 1MXWA 1B7HA 3P7IA 2DXYA 4EQBA 4R6KA 1QUIA 1ZBMA 2R71A 3UN6A 2GH9A 5DT6A 1ZJLA 4TOZA 4O3BA 1SW4A 3H6VA 4AB6A 3RUMA 3CG3A 2OJTA 2RC9A 3K4UA 1B3EA 3C34A 3UIFA 2XXRA 3DP6A 4NF4B 2QSXA 4N13A 2O69A 3TPAA 1Y4CA 1FTMA 1ZLQA 2DSFA 4I1DA 4NF8A 4MH5A 3ZSFA 2GHBA 1B2HA 4OZ9A 2A5TB 1SI0A 3I5OA 2H5YA 1MM7A 1Z7NE 3TQWA 4C1TA 3KFMA 4YZZA 3TFLA 3U8QA 4KI0E 4JWOA 1QUJA 3K0VA 4MLVA 4O3AA 3OO7A 1FQFA 3PPOA 5JK4A 1LBBA 3KZGA 1B32A 3PD9A 3HHFA 4MF3A 2RF1A 4MBPA 3O6GA 3TTMA 4DXCA 1I69A 2XXIA 4C0RA 4NMYA 4RPOA 1P99A 2A5SA 3H6WA 3KOSA 1Y4TA 3IL1B 3OEKA 4G8MA 2VHAA 4FEDA 4OETA 4GL0A 4ELPA 3MQ9A 1OVBA 2Q89A 3G3HA 4R72A 4I9DA 3MP8A 4Q30B 3Q29A 4DLDA 1T0KA 3FD3A 3MZ9A 5ELVA 2Y7KA 3F11A 3CSGA 2UVHA 2FYIA 2QJEA 2O84X 2QPQA 5CI5A 1MXVA 3T9HB 3OO6A 3TDJA 1AH5A 2O1MA 3PMXA 3MVXA 3U94A 1P1OA 2I49A 4QSEA 1O7TA 5CRYA 5I56B 1JW5A 2Q2AA 4U22A 3C36A 3CI8A 1LAGE 2H25A 5KDTA 5LOMA 1MDP1 3KGCA 3EHUA 3K01A 5H8SA 2DYXA 1MH4A 2P0SA 4HTGA 2REGA 3VXBA 4ECFA 4F1UA 3SESA 1B05A 3PUYE 5EYFA 4G8HA 1NFTA 1PC3A 4QSDA 2P1SA 4DIGA 3K1PA 3LSFB 5I57B 3C32A 2OWTA 4ZEIA 3TZAA 1FQBA 3MVWA 4PFYA 5EHMA 3RY3A 2Y84A 3FXQA 5DVFA 5F1QA 4DDDA 1WDNA 2B3BA 1B7ZA 1MY0A 2F34A 1Q1KA 5DTBA 5ICQA 1EU8A 3TMGA 1DSNA 3RT8A 4ND9A 3MUQA 2BJJX 4F3PA 1US5A 4R2FA 2ZYOA 1QKAA 4GWOA 3FASA 4OFLA 4WEPA 1AMFA 4BLAA 1NH7A 4IO4A 3L6GA 1GGGA 3FUZA 4LP2B 2QS4A 3PUVE 5L9OA 4PFWA 3ZKKA 1B5JA 1MQDA 5FTHA 2ZNUA 1B4ZA 1VR5A 2HXWA 4RA1A 4U23A 4F22A 1A8FA 5IAIA 1YTVA 1N76A 2F35A 4JWXA 4MFIA 4RK9A 2Y7RA 2OCUA 1SD3A 1JVXA 1MY2A 4KR5A 5A5XA 4JDFA 3ILTB 2OZZA 2W7YA 1VSOA 3USDA 4ZEDA 4Q5TA 4YICA 3FIRA 1H43A 1LFGA 2V93A 3FV1A 1N7XA 2Y7PA 2REJA 1MXUA 3QSLA 2RC8A 1FCKA 5TPAA 4AB5A 1MXZA 1P1QA 3A09A 5H8FA 2PT2A 3OELA 3FJ7A 1PEBA 3L6HA 4H5GA 4EUOA 3HO7A 5CM6A 5JEIA 1WODA 3U72A 1B4HA 3TTNA 1J1NA 2B65A 4QFLA 3W9VA 3M3FA 3SEUA 1MY4A 1LGBC 5AA1A 4OVJA 4RY1A 3S2VA 4JBZA 1FTJA 3BFTA 4Q0CA 1H76A 2H4IA 3HCQA 1VE4A 3I3VA 3IK6B 3H06B 1XS5A 1MDQA 4GQOA 3SDFA 3B6WA 3G7WA 2F7BA 4LUBA 1OVTA 4G68B 3MC2A 1B5HA 5L9SA 3MJNA 1URGA 4IGRA 3KN8A 3K1MA 4H65A 3EPEA 1JEUA 1IXIA 1NNFA 2XHDA 3KBRA 3CFLA 3C31A 4E0XA 3M3KA 4XXUA 4R75A 4OFOA 4YAHX 4NF6A 1DOTA 3C35A 1HSJA 3V83A 1Y3NA 3FJMA 1LFHA 2GFEA 5FHNA 1H3DA 3PV0E 3KJ7A 3PPPA 5H8HA 3T93B 4F31B 1A8EA 4R9FA 3G3FA 1A99A 2UYFA 3FVGA 3LC8A 2XX8A 1FQEA 2YPNA 1UIUA 3RTFB 4DZ1A 2RC7A 2D5WA 4RXLA 2RKMA 3RN8A 5I84A 3CSBA 4FAJA 3G3IA 1II5A 1SYIA 5FTIA 4F1VA 4UA8A 3MVYA 1NKXA 4FIMA 2ZMBA 2DP8A 4DCXA 3TAJA 1ZU0A 4I62A 3K1NA 4HW8A 1VFDA 3OSRA 3IO4A 4F29A 1PBQA 3TEPA 4G4PA 1TT1A 2OLBA 3MAMA 2XXXA 4GRKA 4F2OA 2PBWA 3DP4A 5KCJB 1CB6A 1LLSA 3T9XB 2XXPA 1LB9A 3G3KA 5EHSA 2DVZA 4ZECA 1N3XA 4QHQA 3MP6A 1HSEA 4ZEBA 2V25A 2XX9A 3U92A 4POXA 4F39A 1QW0A 4PFUA 5TP9A 1POY1 2LAOA 3HSTA 3OOAA 1N3WA 1DPEA 4KHZE 1M5DA 1MQJA 5FHMA 4BDMA 1Q35A 3PUWE 4N07A 3K2DA 3FATA 2XXVA 3K6VA 4R74A 2QS3A 4ISUA 4PE5B 2XD2A 1SW2A 2I3VA 3O6IA 4YMBA 4TQUQ 3U93A 4HS7A 2Y7IA 3HHGA 3FV2A 3CVGA 4BDLA 3OMBA 2F8DA 1Y3PA 3VLVA 4JWYA 2O51A 1B3LA 3H6TA 3WAEA 2XXTA 3PPQA 3IR1A 3ZS6A 2Z8DA 2NWJA 1FTOA 1DTGA 1NNPA 3S9EA 1URSA 2HFBA 3GBAA 4X48A 3Q26A 1MPDA 4DXBA 4HCWA 4H8IA 3RTWB 1DTZA 5H8QB 1RYXA 4AQ4A 3TCHA 4OERA 4R9GA 1B0LA 5I58A 3Q25A 2IEEA 4X1BA 4FATA 2E1SA 4M1VA 2WKYA 5AA4B 4X1DA 1I6AA 2DQVA 2AYSA 2I4BA 1Y3QA 3MZ1A 2Z22A 3UP9A 4F2QA 5I59B 4IY6A 3DLNA 1ZMGA 5I57A 3EHSA 2F7AA 3U1OA 1B58A 4FJPA 3A3CA 2ONKE 1KWHA 2AIXA 2G29A 4G68C 3T9VA 1NMUA 3IOVA 3O6HA 1UTBB 4FEBA 3PD8A 3G3GA 3UORA 3OENA 2HAVA 4ELQA 1N0TA 4PP0A 5J1DA 2Q8JA 1SDXA 2DOJA 2M8CA 4ONYA 3SERA 5JTYB 3O29A 4NF5B 2PX1A 3TYHA 1URDA 2VD3A 2H99A 1Y1MA 2V3QA 4U1OA 3E9XA 2F7CA 4JB7A 1Y20A 3PMWA 1S50A 1FQCA 2I6EA 5CBSA 5CMKA 3T66A 5I2KB 4P0GA 3IJXB 2VGQA 3UK4A 5DEXA 4IO2A 2RCAA 2QRYA 2ABHA 3EQ1A 3H4ZA 1QJMA 2HCAA 1H44A 2R6GE 2THIA 1M5BA 1MQGA 3S4UA 3FVOA 2Q88A 5HPQA 4Q8RA 2I0CA 4NWCA 4KCCA 3DP8A 3TTRA 1PB8A 5AA2B 4RNSA 1OQHA 4QF9A 1I6QA 3KOTA 5F7VA 4DXUA 2IA4A 3MW0A 3SEXA 2AL4A 1CE2A 1L5TA 2B3FA 4IO3A 3DELB 1DMBA 2VOZA 3RT6B 1MPCA 1UTHB 5H8NA 3QXMA 3H3GA 1FQDA 2QS2A 1YPNA 4QFOA 2Q2CA 1OIBA 4U4SA 4H8JA 3SEWA 4XKQA 2PYYA 3VFJA 5AA3A 1B5IA 2P2AA 2QMWA 3KSXA 2F36A 1MG1A 3BBRA 4JSOA 1D9YA 1B46A 4HCYA 1R9LA 1MS7A 2HEUA 1TWYA 4G68A 1GV8A 4BDOA 3DM0A 4PFTA 4EXLA 1NL5A 3ILUB 2VP1A 3H6UA 2V84A 3K6UA 2UVIA 4H0WA 2UYEA 1LAHE 1MQIA 3PU5A 4LZ5A 4GVOA 3V8XB 1AL3A 4ZEKA 2XXUA 5ISUA 1MPBA 3IORA 5BWJA 1FTKA 2HZLA 5B70A 2Z8FA 1A7LA 4R2BA 1DPPA 4QFKA 4XTCQ 2ALUA 2HZKA 4X9TA 4ESXA 2RINA 3VXCA 3JV9A 2ZNSA 2DE3A 3EN3A 1OMPA 4C1UA 4F3GA 1S7YA 3VVEA 1EH3A 4M4GA 4Z7EA 3O97A 3AXFA 2D3IA 1QVSA 3O9PA 4TLMB 1POTA 4JXIA 1BTJA 1FQAA 3GXAA 3JZJA 3OD7A 4IGTA 1Y1ZA 1TXFA 2CMOA 4ZE8A 3OO8A 1LCTA 3UA8A 1TFDA 4OWDA 4OEUA 3SKPA 4K3FA 1LFIA 1NNKA 3O2AA 1R6ZA 3PPNA 4XIGQ 5K2XA 3H03A 1N7WA 4YKPA 1B52A 4BDNA 3RGYA 5KCJA 2DVCA 1JNFA 2CZLA 4OYVA 3BKIB 4LQ2A 4EF1A 1IIWA 1D3KA 1SVXB 3IOWA 4L17A 4F3SA 2F97A 2ZYNA 1Y9UA 3ECRA 5H8FB 1ANFA 5DVIA 3V89B 4YB7A 4F3BA 2YLNA 4YB6A 1SW5A 3VDFA 2O6AA 1YCJA 1QULA 3EF7A 2PT1A 2DE4A 3C9HA 1B1HA 4P0IA 4NF4A 3ODBA 1BLFA 1ZTYA 4EXKA 4F18A 2QS1A 3CFZA 4F19A 3I6VA 1USYH 2Y7WA 5AE4A 5CC2A 1JETA 2A5TA 3CIJA 1FW0A 4OENA 1RKMA 2VD2A 2UVGA 2V3TA 3MWBA 4DE8A 3FGSA 3MPKA 1B51A 2ZYKA 3HPIA 1MH3A 3N6TA 4RK2A 1F9BA 1MXXA 2DE2A 3ONMA 3K00A 4OEVA 2I3WA 5H8QA 5ICTA 3QYTA 4KD5A 4QSCA 2ONSA 1B6HA 2Q9TA 3TTKA 1MY1A 3T9UA 3RLFE 1P1UA 5CMMA 2H9BA 1MY3A 4LVQA 3QAXA 3TTLA 2NOOA 3HV1A 4KYEA 1D9VA 4QFPA 3CR9A 5H8HB 5I59A 3FZVA 1XOCA 3GBBA 2UVJA 3GZGA 1ELJA 2UXAA 3D4CA 2HAUA 2XXQA 1GVCA 4QRZA 4BDQA 2XX7A 1N04A 5CMBA 4ZZAA 4U2RA 1B7UA 3VLUA 1UTBA 1XVXA 2I58A 4H6DA 2XD3A 4ZDMA 3FXUA 3E3KA 4ESWA 5JTYA 1JEVA 2GRVA 2ZXTA 3VLWA 1LSTA 4KFQA 1ZIUA 2F78A 4NF5A 4F1YA 3TODA 4YMAA 5I56A 1EZOA 5IKBA 4LATA 3N26A 1BIYA 1NNTA 1A40A 2ONRA 3MBPA 3R6UA 3TCFA 1PBPA 3R26A 5BUUA 3FVNA 2DWIA 2Z23A 3M8UA 3PUXE 3W9WA 5ITPA 1UIVA 2H98A 4EQ9A 4YU0A 3W15C 1Z7ME 1B3FA 2E0SA 1S9TA 3MP1A 2R9JA 4PQJA 5I2KA 4G8NA 5I2NB 2DWHA 4RPNA 4O3CA 4IO6A 2OWSA 1JQFA 4GD5A 1PB7A 2XXWA 1XHYA 3N5LA 2OK2A 1US4A 2X7PA 4OQOA 3TUSA 5DYHA 3E13X 4XKPA 4GIZA 3TQLA 2QMXA 3Q27A 5TP9B 1MM6A 4ELRA 2F5XA 3M3LA 5TU0A 3GLBA 1PB9A 4UACA 4E0WA 3IOTA 3IAZA 4ZEFA 4WXJA 3O66A 1BKAA 5AA2A 4DCYA 3OXNA 1B3HA 3PUZE 3TKDA 3IOUA 1D4NA 4FE8A 3QK6A 4THIA 4ZZEA 3QUFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FNCA 3A29A 4H1XA 4NF8B 3CRBA 2FIXA 1YAEA 1BP5A 1R9QA 1JVYA 2DXRA 3WAFA 1IQ7A 1UTHA 2XWKA 4I40A 4IO7A 1FPFA 3S9LC 3KN3A 3IX1A 4G77A 2XWVA 5L8DA 2O68A 3LR1A 3MZBA 1XC1A 4GXAA 3R7XA 4KYSA 3K02A 1MXYA 4QXDA 4NWDA 3CHGA 3KEIA 1P1NA 4PDHA 3VE1B 4P9KA 1I6BA 2CEXA 3MYUA 1NH8A 3VVFA 4LA9A 1M5FA 4WEDA 4KQPA 1QUKA 1LB8A 3ZKLA 4IB2A 5I58B 4OVSA 1IXGA 5CMCA 2G93A 3RQTA 5I7IA 3O28A 3T0JA 2XWIA 2ZZVA 1IMEA 4P11A 2ZYMA 4GWSA 5EYGA 2CZHA 5A5LA 1MQHA 2I48A 4LONB 2PMSA 3RPWA 4LZ7A 5AA2D 4OTEA 4ZS9A 3H7MA 4KYDA 3LBSA 1MRPA 1N84A 4NF0A 3BFUA 3LUYA 2FHYA 1R1NA 3N6UA 2NUVA 4JSDA 2QVRA 3KG2A 4R73A 5T3JA 1KZ8A 1KA0A 4XKRA 2XA5A 2O7IA 2FA7A 1P1WA 2I0BA 3T96B 4PFBA 1SYHA 4OMBA 4PAFA 5EQ9A 3KSJA 4U4XA 5B7DA 4JVCA 1IITA 5CBRA 5DW8A 2O7UA 4ZE9A 2P3NA 1IMBA 3B6QA 1NV4A 4GOTA 1IZ1A 3D1RA 4H67A 4GL8A 5DVJA 3K6XA 3LSWA 4PBHA 1GTKA 4GFRA 4DI3D 5KDTB 3E4RA 1FTLA 3TCGA 3TELA 1OQGA 3C33A 2NXOA 2V3UA 5ITOA 4MLQA 1LAFE 3SETA 2Q8MA 2RCBA 4MAGA 3VV5A 1LBYA 4EDPA 5DEXB 4TLLB 4FECA 4NE4A 1B3GA 3C4MA 2FBPA 1NV7A 4O94A 2XXHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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