4NF6B

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with glycine and ppda
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
280
structure length
278
Chain Sequence
DDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
total genus 84
structure length 278
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf6B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf6B02
2R9JA 4LZ5A 4TQUQ 1MM7A 2YPNA 3MWBA 5TU0A 1FTMA 2XXTA 4QFKA 3QXMA 4IO2A 1IXHA 5AE4A 3UA8A 3ZKLA 4GVOA 1P1QA 1B0LA 1P1NA 3CFLA 3PPRA 2PVUA 2DS9A 4F1UA 3IJXB 3ZS6A 1FQBA 3AXFA 1WODA 4C1UA 4QSDA 3TELA 4DE8A 4HTGA 3FD3A 2PT1A 3C31A 1H76A 2B3FA 4RA1A 5L8DA 3OSRA 3PMVA 4NF5A 5B70A 3PPPA 4H6DA 4F2QA 5BUUA 2UVHA 1A55A 3KBRA 2HZLA 3O29A 2HZKA 2XD2A 3RT8A 4DXBA 5H8HA 1M5CA 4EQ7A 3D4GA 3K1MA 1S7YA 3A3CA 2ZNSA 3TODA 3C4MA 4F3SA 4K3FA 3HPIA 4F29A 3KJTA 4IGRA 2OWSA 4EF2A 1A54A 1FQFA 4OERA 4I62A 1MQIA 1DPPA 4Q30B 4P11A 2OZZA 1Y4TA 4KR5A 1Y1ZA 2I0CA 3OELA 1O64A 2DE2A 4JSOA 5H8QA 5CI5A 4ELQA 4WXJA 1LCFA 4JXIA 1FQEA 2Q8JA 2NUVA 5I57B 5B7DA 3H6WA 3B6WA 1NFTA 2QS4A 4P0IA 3T96B 1ANFA 3RNNA 5EYFA 1YTVA 4X1DA 3CSGA 1LAXA 4ZS9A 4XKNA 1OVTA 1IXCA 1Y9UA 3CRBA 4OYVA 3VXBA 3VVFA 1IUDA 3OO9A 1I6QA 5DEXB 1LBCA 3S9EA 4NF8B 2ZYOA 2V25A 3MZ9A 2P1SA 2FA7A 1LLSA 1BTJA 5AA2D 1MXWA 1FQCA 1CE2A 1GVCA 3H6VA 3DP8A 5KDTB 4XKPA 1MQDA 5H8SA 3PPQA 2VD2A 1Z7ME 3RY3A 1J1NA 2UVGA 4RXLA 5HPQA 2I4CA 2RINA 3SDFA 5EHSA 3G3KA 4ZEFA 2I4BA 2YLNA 3QYTA 1USYH 1MG1A 2ESNA 4I8CA 4G68A 1O63A 4Z0IA 3WAFA 2GHAA 4QSEA 2F7CA 4C0RA 4NF4B 1SW1A 4BDOA 1N7XA 5DTBA 4LUBA 2R6GE 2Y7PA 2HCAA 1SW5A 5KCJB 4KFQA 2V84A 3I3VA 4UA8A 1RKMA 1SQYA 1QUKA 3SEXA 2O7UA 1PB8A 4EDPA 3VFJA 4PFTA 4OFOA 2Q2CA 5ICQA 2F36A 5FHMA 3FUZA 3N6TA 1DMBA 1JNFA 4Q8RA 1USYE 3KG2A 1LGBC 4DCXA 3R6UA 5ITOA 3PGFA 4ZZEA 3MZBA 2Y7KA 2OLBA 3K00A 1B51A 4AQ4A 5DYHA 2O84X 3S2VA 2DQVA 2QRYA 3K6VA 3H6TA 1QUJA 5CM6A 4WEDA 4QFNA 5ISUA 1B46A 3B7DA 1R9LA 3U8QA 1Y20A 3T9XB 2F78A 5HBCA 4H0WA 4ELOA 3CR9A 4ONYA 3BBRA 3Q28A 2WKYA 4I9DA 1AMFA 4IB2A 4BLAA 1PDAA 3QUFA 4F19A 3IOWA 3PUVE 4OXVA 1LFHA 4LQ2A 4R6YA 1ZBMA 5TP9A 4JDFA 1OQGA 1SVXB 4EQBA 2DWHA 3CG3A 1LBBA 3SEWA 4DZ1A 5H8NA 5LOMA 4KYDA 4ECFA 4QSCA 3U72A 3HCQA 1YCJA 5EHMA 1FTOA 2D21A 2NVUB 3L6HA 1NNPA 2PX1A 1B3EA 3PMXA 3RPWA 3HSTA 3IR1A 4R6KA 3OMBA 3M8UA 1A8FA 4PFWA 4LZ7A 3H03A 4R73A 2CZLA 1P1WA 3W9WA 2XXHA 2AL4A 4IY6A 5I57A 1HSEA 2XXWA 4F31B 2I48A 4NE4A 3KEIA 2CMOA 2O1MA 1B1HA 1RYXA 3FVKA 2RCBA 3W15C 1US5A 3OO6A 1LSTA 2XXRA 2Y7WA 3GXAA 3TPAA 4F3BA 2F34A 4YKJA 4ZEDA 3H3GA 2H4IA 5L9MA 3ILTB 1XC1A 1LAFE 3S9LC 4F1VA 1MH4A 4HCWA 4RPOA 3TQLA 4G8MA 4U22A 3GBBA 4N13A 3IJOB 2XXPA 1FQDA 3MJNA 5AA2B 3PUWE 3OENA 4XKQA 4YZZA 5CRYA 1POTA 1MY3A 4GRKA 2P2AA 3MUQA 4DDDA 2R71A 3TFLA 2HAVA 1MPDA 1N84A 2QS3A 3F11A 2DE3A 4JB7A 2O68A 4ZZAA 5ELVA 1N7WA 3G3FA 4G2ZA 2HFBA 1SW2A 4YKKA 1URGA 3H7MA 4MBPA 3ODBA 4MFIA 1B5IA 4EXLA 4IO7A 4R9FA 4PETA 4YICA 2RCAA 2I6EA 2FNCA 2OJTA 1MPBA 3S4UA 4GL0A 3PD9A 4PQJA 3T93B 2PBWA 2HXWA 4X48A 3DP6A 5KCJA 4DXCA 4GL8A 4ESXA 4DLDA 1M5DA 4KCDA 3O6HA 3I6VA 3LC8A 5FTHA 1EH3A 1QW0A 1VE4A 1JW5A 1US4A 1MXUA 1OLCA 3QSLA 1A99A 2IEEA 1B3GA 1EZ9A 2O51A 2AL5A 2ONRA 1B4HA 2DYXA 1B58A 3N5LA 1N76A 1EZPA 2O6AA 2DE4A 4G68C 3IB0A 4IGTA 2LAOA 1LCTA 2B65A 2QL3A 5TP9B 4Z7EA 1MDP1 4G8HA 4BDRA 1URSA 1IXGA 4DXUA 1Q1KA 5H8NB 2HQ0A 2FYIA 1DPEA 3ECRA 3N6UA 1GV8A 2HAUA 3UGWA 2V93A 1N3XA 3V8XB 1SD3A 3KZGA 1QUIA 3RN8A 3K2DA 2DOJA 1M5FA 3PD8A 1II5A 4POXA 4Q0CA 2OBGA 4BDNA 4MLQA 3TTLA 1JEUA 1ZIUA 4MLVA 4ZEKA 4H1XA 2Y7IA 4R6HA 1MPCA 3LBSA 1XS5A 1MY0A 4PFUA 2NXOA 4JWXA 2X7QA 4KI0E 5I59A 5IAIA 3OEMA 2E1SA 2YJPA 3QK6A 4OZ9A 3P7IA 1ZJLA 4QF9A 4GD5A 2HEUA 1B1XA 2QS1A 3O6IA 4U4SA 2VD3A 4OFLA 1H45A 4X1BA 4X9TA 2DWIA 3BFUA 3MVYA 3SETA 1OIBA 1B32A 4LVQA 2Y7RA 4AB6A 1MY4A 1B3HA 1BP5A 4ISUA 1NH7A 2RC9A 1I6BA 1TFAA 1NMUA 3A3UA 3N26A 3VLVA 3R26A 4QFLA 2O69A 5I84A 4QFOA 4BDMA 4AB5A 3OXNA 4OTEA 1B0HA 3PUXE 4QRZA 5F1QA 5JTYA 4KHZE 2UYEA 2UVIA 1DTZA 1ZU0A 5AA1A 3T66A 1PEBA 1NL5A 2Z22A 3E4RA 1ZLQA 4KD5A 2Q9TA 1IITA 1FQAA 2QMXA 1LB9A 3C35A 5DVFA 5AA2A 1FTKA 3UORA 3M3LA 1Y4CA 3MBPA 1Y3QA 4F1YA 3TZAA 2I3VA 1ELJA 4ZE8A 3BKIB 4NWDA 3CSBA 2ONKE 4RK9A 3PPOA 2I3WA 3UIFA 1MXVA 5K2YA 1H44A 3L6GA 3QUJA 1FCKA 4U23A 3DM0A 3TDJA 5ITPA 2VHAA 4U1ZA 2ALUA 4FAJA 3KFMA 1R9QA 1B5HA 3O6GA 2Y84A 3SEVA 2OK2A 4IY5A 1IEJA 4JWOA 4R2BA 2XXYA 2REJA 4RK2A 2I0BA 5JEIA 1TFDA 2H25A 1MS7A 1AIVA 1XOCA 4GIZA 2XX7A 3MQ9A 4R75A 3TCHA 3SESA 1MH3A 3EQ1A 3ZSFA 1TXFA 3I5OA 4PP0A 4PE5B 2UYFA 3GZGA 3A09A 1NNTA 2H98A 3RLFE 1HSLA 3B6QA 1IZ1A 4U4XA 4OETA 2NOOA 3RQTA 1B4ZA 2GRVA 3FV1A 1UTHA 1QKBA 3FXUA 1ZKBA 3USDA 4ZEIA 4H65A 3H6UA 2DWJA 3TAJA 3UN6A 2Q2AA 5IKBA 1VFEA 4XXUA 4H5GA 3C9HA 1FTLA 4NWCA 2XXXA 4FJPA 1YAEA 5AA3A 2X7PA 3TTMA 1LAGE 3K4UA 3VVEA 2DVCA 1Y1MA 4YKPA 3OEKA 2OCUA 5I2KB 5I59B 1WDNA 4OFJA 3VV5A 1MY2A 5I56B 2XXQA 4IO3A 2H5YA 4BDLA 4WKMA 2UVJA 5AA4A 3O9PA 1UIVA 4LQ5A 2D3IA 1AH5A 5L9SA 3KN7A 3H4ZA 3UP9A 2XX9A 4E0XA 3LSFB 3Q27A 2QPQA 3TKDA 4RY1A 3EN3A 5F7VA 3LUYA 5CC2A 4XKRA 2PT2A 4ND9A 4ELPA 1B2HA 3FJ7A 1TWYA 4N6PA 3E13X 1WVJA 4DIGA 3FIRA 5JTYB 2KLFA 2V3QA 3O97A 1VR5A 4F18A 3V89B 1PBPA 4FEDA 3SKPA 3GLBA 1JQFA 4F3PA 3C34A 4FORA 2ABHA 4KPTA 3VLUA 3SEUA 4UACA 1YPNA 1TT1A 2F6PA 1ATGA 1MM6A 5CMBA 4RJZA 3PUZE 2ZYKA 2XXIA 3MAMA 4TLLB 3O2AA 3Q29A 1B9JA 5M2VA 1XHYA 3HN0A 4GXSB 4FEBA 2ZNTA 3EHUA 4F2OA 1N0TA 3VDFA 3KN3A 4JWYA 4YKIA 2Z8FA 5TPAA 1B6HA 1B52A 2Z8DA 5H8FB 2RKMA 3MVWA 1MXXA 2A5TA 4YB6A 2O7IA 5I58A 1P99A 2I58A 1MXZA 3U1OA 4WEPA 4XIGQ 2ZNUA 2REGA 1MRPA 4OENA 4C1TA 1SYHA 2RF1A 3TCGA 3K1NA 1UTBB 2XX8A 2Q88A 4IO6A 3LSXA 1QULA 2F5XA 3IX1A 3TMGA 5FHNA 4FECA 1SI0A 3O66A 3TQWA 3KSJA 3TTKA 3FV2A 1UTHB 1PB7A 2M8CA 1MQGA 4QFPA 3CIJA 3K1PA 3FASA 3MP1A 2VOZA 3IOUA 3E9XA 1B7HA 4R74A 1AOVA 3B6TA 4R72A 3T9HB 4OEVA 1LFIA 3MVXA 4F22A 4OQOA 3IK6B 4Q5TA 1EZOA 3SEYA 4DCYA 3FVGA 3OOAA 3CFZA 1B7UA 1ZMGA 4YB5A 2Z23A 3EHSA 5HM4B 3TCFA 1HSJA 4ZE9A 1XT8A 2ANJA 3SERA 2RC7A 2A5SA 2F7AA 4O3AA 1B7ZA 3TTRA 3FJGA 5BWJA 3THIA 1BIYA 2W7YA 3M3KA 5KZTA 3ILUB 5AA4B 1RYOA 2F7BA 3UK4A 1JETA 4N07A 4POWA 1FTJA 2F8DA 1JEVA 4YMAA 1VSOA 3EPEA 4OEUA 4G77A 3HHFA 3FXRA 3MZ1A 1FW0A 3R7XA 3CG1A 4TOZA 3IL1B 1JVYA 5I2KA 1JW1A 3IB2A 4YAHX 3IO6A 1B40A 3QIMA 3IOVA 2PYYA 4LP2B 5K2XA 5I2NB 5I56A 2XHDA 5FTIA 3KOSA 5DT6A 4F39A 3H06B 2G93A 1PC3A 5CBSA 4GXAA 3DLNA 3IB1A 3HO7A 3V83A 2RC8A 3V5AA 4M4GA 3MPLA 3TUSA 1OVBA 1H43A 1MDQA 3TYHA 3K0VA 1SDXA 4EUOA 4TLMB 2E0SA 3T9VA 4XTCQ 2AYSA 3C36A 3K6UA 4RNSA 4THIA 4KYEA 1D3KA 1S50A 2ZYNA 2DWAA 3G3HA 3PV0E 1CB6A 1L5TA 3CI8A 3K6XA 5TPAB 4GLIA 4ZEBA 4ELRA 1OQHA 2VP1A 5L9OA 1Y3NA 2A5TB 2DSFA 1EU8A 5JK4A 2ONSA 1DTGA 2B3BA 2XXUA 1UQWA 3C32A 2G29A 3RUMA 5I58B 3TEPA 4LATA 2GFEA 2DP8A 3OO8A 2VGQA 3W9VA 2F97A 3KGCA 1POY1 4GF8A 1URDA 2QJEA 4F3GA 1H3DA 3U94A 1Q35A 2O1LA 4EXKA 2QSXA 5A5XA 4NF6A 2UXAA 2XD3A 3IAZA 2H99A 1SYIA 3K01A 4HS7A 4O3BA 5H8FA 4MH5A 4JSDA 4G8NA 4U1OA 1DOTA 1PB9A 1S9TA 3VE1B 4E0WA 1AL3A 4LZ8A 3FJMA 4OHNA 3MW0A 1KWHA 1NKXA 2Z8EA 4FATA 3O28A 3MPKA 4JBZA 1O7TA 1NNFA 1MQHA 1PBQA 3K02A 1UTBA 3PU5A 3FGSA 3FZVA 3LR1A 3CVGA 3PPNA 2ZXTA 4R9GA 1QKAA 3KN8A 4NF5B 2X26A 1IXIA 4M1VA 1LB8A 4IO5A 3BFTA 1BKAA 4H8IA 2THIA 4EQ9A 4GFRA 4ZDMA 3K6WA 3E3KA 3QAXA 3VLWA 5H8HB 1QJMA 3JV9A 2DXYA 2GH9A 3IO4A 1GR2A 5ICTA 3DELB 4GOTA 3LSLA 3Q26A 3FXQA 4EF1A 1OMPA 3EF7A 2XXVA 3G3GA 2DXRA 3HHGA 3N94A 2V3UA 1SI1A 3CFXA 4GQOA 1MXYA 3D4CA 1MQJA 2PMSA 3G3IA 1XVYA 3G7WA 4FIMA 5H8QB 3JYRA 3PMWA 3PUYE 1D9YA 1Z7NE 2V3TA 4U2RA 3JZJA 1ZTYA 1F9BA 4HW8A 4MF3A 1JVXA 2AIXA 4U21A 3MC2A 1N04A 2ZMBA 2NWJA 1A7LA 3Q25A 4YMBA 3G3JA 2F6GA 4P0GA 1DSNA 1D4NA 1N3WA 1GTKA 4NTLA 3FVOA 3OO7A 3LSWA 3RTFB 5DVJA 5DVIA 1LFGA 3MP6A 3T22A 1OLAA 2QMWA 4NEDA 1NH8A 1B05A 1B3LA 4PFYA 3ZKKA 1JW4A 1SW4A 1P1UA 4NMYA 4H67A 1SBPA 5I2NA 1M5BA 3GBAA 2GHBA 3OSQA 4ZECA 3HV1A 1IIWA 3T9UA 1UIUA 3FATA 1Y3PA 3U93A 2OWTA 3VVDA 3C33A 2DVZA 1BLFA 1I6AA 3S9MC 1I69A 2IA4A 2ZYMA 1M5EA 1NNKA 3OD7A 5DEXA 4I1DA 4NF8A 1QVSA 1R6ZA 2Q89A 3DP4A 1A40A 2H9BA 5FHOA 4GWOA 5KDTA 2P0SA 4H5FA 5CMKA 4ESWA 4G68B 4LONB 1D9VA 4H8JA 3RT6B 3VXCA 4L17A 1A8EA 2D5WA 2QS2A 1XVXA 3TTNA 1LAHE 3EHTA 4YU0A 3ONMA 1GGGA 3IOTA 5A5XB 4NF6B 4LA9A 1P1OA 4OMBA 4KCCA 4OWDA 3M3FA 4G4PA 2F35A 4KYSA 1B3FA 3RGYA 5CBRA 3WAEA 4RPNA 5CMCA 4FE8A 3FVNA 4O3CA 3MP8A 4OVJA 3RTWB 3KSXA 3KJ7A 3IORA 1MY1A 1R1NA 4YB7A 1IQ7A 3MVZA 3U92A 1VFDA 4HCYA 5CMMA 4RYAA 3S9NC 2BJJX 4NF4A 4OESA 5J1DA 4QHQA 1T0KA 3KOTA 2I49A 1B5JA 4R2FA 4KQPA 4IO4A 4BDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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