4NF5B

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with glycine and d-ap5
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
279
structure length
273
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDICVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 84
structure length 273
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf5B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf5B02
2DWIA 4HS7A 1QVSA 4Z0IA 5I2NA 1HSJA 3TTKA 4MF3A 3SKPA 3FXUA 1P1WA 2DE2A 3MAMA 4F3PA 3THIA 4MLVA 2PMSA 1H76A 3PGFA 4RK9A 1B6HA 1WVJA 2PT2A 1MY2A 4F19A 3HCQA 4N6PA 1XHYA 4F1YA 2V3UA 4IO3A 5JTYB 3TEPA 2O7IA 1AL3A 4RJZA 3G3GA 3UP9A 1UIVA 4N13A 2DOJA 1XVXA 5KCJA 1LLSA 3K0VA 5EYFA 2NXOA 2V3QA 3FXQA 1MXWA 1N0TA 2OZZA 1B7UA 5CBSA 3VDFA 4YB7A 4G8NA 5CBRA 2A5SA 2D21A 4G2ZA 2I6EA 2DWAA 1QUJA 1LB8A 4R6KA 3VVDA 3IK6B 1O64A 3GZGA 5FHOA 2A5TA 1LCTA 1H43A 4O3AA 3FVKA 3KSXA 3O6HA 1B3FA 2Y7WA 1MXVA 1A55A 4ZS9A 1MXYA 1BP5A 1OQGA 4I1DA 3OELA 2ZXTA 3RUMA 4KYEA 3G3IA 4TQUQ 4KYDA 3T9UA 2XX7A 4HCWA 4OTEA 1YAEA 4F39A 4OQOA 1UTHA 5ITPA 3OEMA 2XXQA 3QUJA 4LQ5A 3N26A 4OZ9A 1PB9A 4R6YA 1AMFA 4KHZE 4H5FA 4LA9A 2REGA 1FQAA 2F97A 1UTBB 1SW5A 3MZ9A 2YJPA 1VSOA 1LAGE 2DQVA 4QSCA 1RYOA 4WEDA 1N76A 1ZJLA 3O66A 2O1MA 3EN3A 4Q8RA 3G3FA 3U72A 1KWHA 1T0KA 3T66A 4EXLA 2THIA 3IO4A 4EQ9A 2R6GE 3RLFE 2D3IA 4ELRA 3EHSA 3TPAA 5I56B 5JK4A 1USYE 2ZYNA 2OCUA 5I2KA 4LZ8A 1A99A 1Q35A 1B2HA 5A5XA 3RTWB 4JSOA 5B70A 5DVFA 5CMCA 4F2OA 4KFQA 4U1ZA 1TWYA 3MPLA 4G8HA 5CI5A 1I6BA 2RC9A 5CMMA 2E1SA 3OSRA 5L8DA 2OBGA 5I2NB 3VXBA 4BDNA 2DSFA 3VLUA 4DIGA 4BDOA 3RNNA 1P1QA 3KZGA 5FTHA 1POY1 4GFRA 1OVTA 1L5TA 1OLCA 5ISUA 5CMKA 2DE3A 3WAFA 1YCJA 1LSTA 1LAXA 2Y7KA 3HPIA 4ONYA 1QW0A 4HCYA 5KCJB 2ESNA 3MBPA 4U22A 3G3JA 3FXRA 2OLBA 2UVGA 2XD2A 3H6UA 2F7CA 2F7AA 1ZIUA 3D4GA 3TKDA 3JV9A 1PBQA 4DXUA 4OYVA 2ZYOA 3CI8A 3K00A 4XKNA 3PMVA 2I58A 4DCXA 2H99A 3H4ZA 1NH8A 5B7DA 3LSWA 4H8JA 1FTLA 4G8MA 1M5DA 4G77A 2F7BA 2XXWA 4GF8A 3TTRA 3V5AA 1VFEA 2A5TB 3M3LA 1Y20A 2QMWA 4DDDA 3PMWA 4F3BA 1DOTA 4R6HA 1DPPA 1EZOA 4ZZEA 1LBCA 4YB6A 3FV2A 4GXSB 3MC2A 3K1MA 1OVBA 4Q0CA 2F6PA 3S2VA 2DP8A 4XKPA 4TLMB 1JQFA 4ZEDA 4ISUA 4X1DA 2PVUA 1WDNA 4YAHX 3T9XB 4POWA 2ZNUA 5JEIA 5ELVA 4GRKA 3S9NC 2F6GA 3BKIB 4Q5TA 3MVZA 1UTHB 4IGRA 5FHNA 2HXWA 3T93B 3FV1A 2REJA 2XXHA 1M5FA 2IA4A 5AA2A 3H03A 2XXTA 1NNKA 3ECRA 3EF7A 3QXMA 5HBCA 4QFKA 3E4RA 4QHQA 1NNPA 5L9OA 3JYRA 2UVHA 4P0GA 4YZZA 1I6AA 4DE8A 4YKKA 2KLFA 5H8SA 4IO5A 4LVQA 3TFLA 1GGGA 3M8UA 5EHSA 3H06B 4FJPA 3UA8A 3ODBA 2P2AA 4RNSA 1Y1ZA 3KN7A 4PE5B 1POTA 1B52A 2UYFA 4KR5A 3QK6A 4ECFA 5I2KB 2FNCA 1B1HA 1SD3A 5A5XB 5F7VA 1B46A 1NH7A 4F3SA 2QS4A 4MH5A 4O3BA 1B4HA 2RC7A 1PDAA 2G29A 1ZKBA 2AIXA 4G68C 5ICTA 3C4MA 2I0CA 4OESA 1FCKA 4RK2A 3H6WA 5KDTA 1DSNA 1IUDA 3ILTB 3DLNA 3SETA 2H25A 4AQ4A 5BUUA 1NNFA 1PB8A 2V84A 4F1VA 4H67A 4FEBA 2RKMA 5AE4A 1EH3A 2O6AA 4OETA 2G93A 4GQOA 4KD5A 4IY6A 3MP8A 1Z7ME 2ZMBA 5TU0A 3PUZE 4OHNA 4EQBA 4YICA 3PPRA 4G68B 1S7YA 2O1LA 3K6VA 3CSBA 3C33A 3QUFA 4GD5A 3VVEA 2VD3A 1H44A 1MG1A 2XX9A 4JB7A 4OMBA 3SESA 3PUXE 4WKMA 2DVZA 4AB5A 2YLNA 5AA1A 1NFTA 4RXLA 4GLIA 1B3EA 1ZU0A 1DMBA 3PMXA 1P1NA 4EF1A 1PC3A 1I69A 5H8HA 1SW4A 3CFZA 3Q29A 1AH5A 3LSFB 1SI1A 3Q27A 2B3BA 2HAVA 4E0XA 4GL8A 5IKBA 3Q28A 3KOSA 3TTMA 4PFUA 4M1VA 3VLVA 3OXNA 3K2DA 4FIMA 4OERA 1EZPA 3IJOB 4UACA 4EF2A 4FEDA 4ZZAA 1B0HA 2X7PA 2AL5A 4LZ7A 1B5IA 1IXIA 3OOAA 3R6UA 3USDA 3MP6A 4R72A 4YU0A 3UK4A 5DTBA 3RT8A 4OVJA 4JDFA 2NWJA 4YMBA 1SDXA 1VE4A 4XIGQ 4R9GA 2Q2AA 1NNTA 4NTLA 1P99A 2F5XA 1IQ7A 1P1OA 3S9MC 3I3VA 3CFXA 5AA2B 2X26A 4QSEA 3H6TA 3E9XA 5AA4A 2HAUA 1GTKA 4XKQA 2V25A 3VV5A 3RTFB 1TT1A 4F18A 5I84A 3MZ1A 4EXKA 3C9HA 3PPQA 4NEDA 2H4IA 4KPTA 4KI0E 4ELOA 3KJTA 4KCCA 1M5BA 2Y7IA 2P1SA 3TCHA 2GFEA 4KYSA 2O69A 3OD7A 4RA1A 1SQYA 1IXGA 1IZ1A 3W15C 3N94A 3M3FA 2XXVA 4F31B 3MW0A 2DXRA 4U2RA 4LATA 2CMOA 1URGA 1IITA 1MQGA 4GOTA 1MPBA 4PETA 4IGTA 3MQ9A 3K01A 2GHAA 3CG3A 1A54A 1XVYA 3C35A 2VGQA 2O51A 3DP8A 3PUYE 4NMYA 3DELB 5KDTB 1B7HA 5DVJA 4YKJA 1SYIA 1PBPA 1R9QA 4PQJA 3IOTA 1US5A 5AA2D 3TCGA 3C32A 3PD8A 3O9PA 3C34A 1DTZA 4GXAA 3SEUA 3IOUA 4H8IA 1J1NA 3IJXB 4XKRA 2NOOA 4EQ7A 3R7XA 3BFUA 3OEKA 3VFJA 2Q88A 3JZJA 2DS9A 2CZLA 3S9EA 3OO7A 3I6VA 1WODA 1LAHE 1FTJA 4R2BA 1Y4TA 3OO6A 4OWDA 4JBZA 3KN3A 3RQTA 1LAFE 1JEUA 4RPNA 4X9TA 1FQFA 4I9DA 4QFLA 4ESWA 4DXCA 4XTCQ 4JWYA 1O63A 4U4SA 1IIWA 3UIFA 3EHUA 3FD3A 4LUBA 4G68A 1MM7A 5H8HB 5IAIA 2FYIA 4PFTA 3IR1A 2Q9TA 2Z8FA 4I8CA 4NF6B 2M8CA 3BBRA 4FAJA 1A40A 1LFIA 3PPOA 4ZECA 2QSXA 3KSJA 4ZE9A 4LONB 3FJGA 5M2VA 4OXVA 4R73A 3SDFA 2O7UA 3E3KA 3LBSA 2XXIA 1RKMA 1JW5A 3KGCA 4KQPA 3QAXA 2RCAA 5K2XA 4ZEFA 4C0RA 4QF9A 2RC8A 3IB2A 3LSXA 4ESXA 3K1NA 2VP1A 3UGWA 2ZNSA 3G3KA 2Z22A 4BLAA 1FTKA 1MDQA 1IXHA 1H3DA 4PFYA 3SEVA 2I0BA 3IX1A 1EU8A 1M5EA 1XC1A 2OJTA 4GVOA 3A3CA 5AA4B 1QKBA 3O28A 4NWCA 4DZ1A 1B05A 1LFGA 1A8FA 1MDP1 3EPEA 1URSA 4U4XA 1R1NA 2QJEA 4YB5A 3RY3A 2GRVA 5FTIA 1SW1A 4MFIA 3T22A 3TQWA 3W9VA 2I3WA 2BJJX 3RN8A 2ONKE 1ZLQA 2OWTA 3DP4A 4TLLB 1OIBA 3CSGA 3G7WA 3G3HA 1HSEA 2NVUB 5CMBA 2ONRA 2Y7RA 3TTLA 3B6QA 3V83A 1IXCA 3FGSA 4ND9A 1PB7A 2VD2A 1XT8A 1TFAA 1Q1KA 1VFDA 5I58A 3DM0A 4HTGA 3RT6B 2WKYA 1N84A 3ZKLA 4YKPA 2B3FA 1TFDA 3O6GA 4QFPA 1ATGA 3FJMA 3N6TA 4H65A 1US4A 1B32A 3ILUB 2ZYMA 5ICQA 1S9TA 2AL4A 2HFBA 4R74A 1LFHA 1USYH 5H8FA 3T9VA 3MVXA 2XXYA 4NF8A 2HQ0A 4R75A 3KN8A 5DVIA 2F8DA 3IOWA 3ZS6A 1FTOA 4BDLA 3GLBA 1NMUA 3OO9A 1SW2A 3M3KA 3TELA 3PV0E 3K6XA 1N3XA 2I48A 3O2AA 2Y7PA 4QFOA 3K02A 4EUOA 3F11A 3HSTA 1YTVA 3FUZA 1Y3NA 3IB0A 5DYHA 2XX8A 3FVOA 4R9FA 2X7QA 1O7TA 3I5OA 3B6TA 5CM6A 5BWJA 2OWSA 1Y9UA 5FHMA 4LZ5A 3CG1A 1EZ9A 4ZDMA 2XXUA 3H6VA 4JXIA 3U1OA 4GIZA 4PP0A 3HV1A 5I59A 1DTGA 2DWHA 3A09A 4ZEKA 5L9MA 4ELQA 3U93A 1IEJA 4DCYA 1JW1A 1D9VA 2Q8JA 4MBPA 3K1PA 3KEIA 3IORA 2Q89A 3DP6A 1B9JA 5TP9A 5HPQA 1ZMGA 1MY1A 3TZAA 2DXYA 3Q26A 3FASA 5K2YA 4IY5A 1N7XA 4M4GA 2QS1A 3OO8A 4NF4A 1H45A 1MXXA 1QULA 3C31A 2Q2CA 2QPQA 4ZE8A 1AOVA 1F9BA 2D5WA 1GR2A 4X48A 2ONSA 1FW0A 3OENA 4NF6A 3TQLA 1JVXA 3U92A 4UA8A 3GXAA 2H9BA 1R9LA 1B7ZA 2XD3A 2E0SA 3FZVA 1MM6A 3MVYA 1JETA 3CVGA 1MXUA 1MY3A 4DXBA 3E13X 3KOTA 2I49A 3H3GA 4WEPA 1B3GA 1MY0A 3SERA 3UN6A 2IEEA 3CIJA 5CC2A 5TPAB 1SI0A 4BDMA 2QMXA 1SYHA 4FE8A 5I58B 3EQ1A 3O97A 3RGYA 4FORA 3MWBA 1JVYA 4L17A 3T9HB 4C1UA 3K4UA 4LP2B 1OLAA 4IO4A 1LB9A 5DEXA 2F36A 1ANFA 2VHAA 2DE4A 4LQ2A 5I57A 3FIRA 4KCDA 1MRPA 3PUWE 5H8FB 4F22A 5H8QA 1FQDA 3R26A 3TMGA 4NF8B 3LR1A 2ANJA 3Q25A 4OEVA 3HHFA 2V3TA 1LGBC 1B40A 1UIUA 3B7DA 4JWXA 2P0SA 1A7LA 5L9SA 3KFMA 4RY1A 3K6WA 3K6UA 1SBPA 1MXZA 1Y4CA 3W9WA 2GH9A 1MPCA 2W7YA 1B5JA 3MP1A 3OSQA 2RINA 4H5GA 1ZBMA 3ZKKA 2DVCA 1AIVA 4IO2A 3D4CA 3MVWA 4HW8A 2LAOA 1UQWA 5EHMA 1GV8A 2XXXA 4U23A 1N04A 2DWJA 3QSLA 3TAJA 4POXA 4E0WA 3OMBA 4JWOA 2I4BA 3SEXA 5I59B 4YKIA 1Z7NE 3GBAA 4AB6A 1FQEA 2YPNA 2AYSA 1LBBA 4I62A 1DPEA 4MLQA 4NF5A 1CE2A 5CRYA 2F35A 2B65A 4G4PA 3PD9A 4Z7EA 5TP9B 4H0WA 3CR9A 2UVIA 3TYHA 1D4NA 3TODA 3U94A 3T96B 2UXAA 2DYXA 2GHBA 3LC8A 1NL5A 2Z8EA 4RYAA 3ZSFA 1N7WA 2OK2A 4XXUA 2UYEA 4TOZA 1HSLA 4IB2A 4IO7A 4NF4B 3TDJA 2QS2A 5AA3A 1LCFA 2PT1A 4NE4A 1MY4A 1OQHA 4ZEBA 4ELPA 1B3HA 2H98A 2FA7A 2XXPA 5H8NA 2XXRA 2QL3A 1VR5A 1S50A 3N5LA 2R71A 3IL1B 2NUVA 4OENA 1MH3A 1MQHA 3HO7A 1B58A 2RCBA 4FECA 4OFJA 1BLFA 2XHDA 3FJ7A 4X1BA 3FATA 2F34A 2F78A 2QS3A 3HN0A 2I4CA 4BDRA 4BDQA 1FQCA 4C1TA 4EDPA 1B3LA 3BFTA 1N3WA 3C36A 2Z23A 1Y3PA 1R6ZA 3N6UA 2HCAA 4OFLA 3SEYA 3MUQA 3IAZA 5DT6A 3B6WA 4R2FA 3HHGA 1FQBA 2PX1A 3KG2A 4WXJA 2Y84A 2HEUA 1II5A 3V89B 3TTNA 5JTYA 2HZLA 1Y1MA 3RPWA 3CRBA 2HZKA 3KJ7A 1MPDA 1YPNA 3U8QA 1B5HA 1MH4A 1OMPA 2O84X 4QSDA 3VE1B 1BKAA 3MJNA 5DEXB 1BTJA 2PBWA 4F1UA 4IO6A 2I3VA 2O68A 1PEBA 5ITOA 1A8EA 1URDA 2VOZA 2ZYKA 5I57B 3IB1A 5TPAA 1QUKA 1MQIA 1MQDA 3EHTA 3PPPA 5H8QB 3LSLA 1MS7A 1P1UA 3O29A 3UORA 3FVGA 3PPNA 3P7IA 4RPOA 2ABHA 3IO6A 4ZEIA 2ZNTA 4GL0A 1Y3QA 1I6QA 3FVNA 3H7MA 4NWDA 3VXCA 3KBRA 4Q30B 5KZTA 3IOVA 3VVFA 1B0LA 1B4ZA 3MPKA 4QFNA 2PYYA 1ELJA 1TXFA 1XOCA 1RYXA 1QJMA 2V93A 5HM4B 4H6DA 3LUYA 1D9YA 4YMAA 1CB6A 3CFLA 4OEUA 3TUSA 3A3UA 3GBBA 2ALUA 1B1XA 4U21A 1FTMA 4F3GA 1QKAA 2Z8DA 3VLWA 1UTBA 4OFOA 1ZTYA 1NKXA 5F1QA 5J1DA 1BIYA 4NF5B 3QYTA 2H5YA 3PUVE 3SEWA 1JEVA 4N07A 1MQJA 3S4UA 4H1XA 4F2QA 2UVJA 4P11A 1JNFA 1SVXB 3O6IA 3V8XB 3L6HA 2R9JA 1D3KA 3L6GA 4U1OA 3TCFA 1JW4A 5LOMA 4O3CA 4P0IA 1QUIA 5I56A 3ONMA 3S9LC 4QRZA 4JSDA 2RF1A 4THIA 5H8NB 1M5CA 4PFWA 4K3FA 1B51A 2QRYA 4DLDA 4F29A 3WAEA 3MZBA 4FATA 3PU5A 3QIMA 4GWOA 3AXFA 1GVCA 1XS5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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