4OVJA

Extracellular solute-binding protein family 1 from alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius dsm 446
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
396
structure length
396
Chain Sequence
DSKPVVTLTFGFWGDAKEEAVTLAAVKAFEKAYPNIHIQTEFGGPFNQYFTKLSTEVAGGNAPDIMQMDYEYIDAYAKEGQLLNLKGAKGINISTISPSVLKSGYIDGGLYGIPNALNNYAVIYDEAAFAKAGYHGQRVSWQQWADILEKVHKATGKWAENDDESWQTFGYWARQHGQHLYNASGTKLGFTESTLVSYLNYWANLRKEGVVPPGTVTSLIKQTADPTDPMVQGKSDAELTWVNYVVSLQSEMTRSLALALPPTQPGGEEGLYIKPSQFWSIYSKTKYPQQAELFVNFLLNNVQAGKALGLVRGIPVSSSVRTQLMASGTSAPEKAEFQLVNEALKVATPIDPPPPQHDKEIDQDFANMVQAVQYGKETPQQGAEQFMQEANDLLQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Extracellular solute-binding protein family 1
publication title extracellular solute-binding protein family 1 from Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446
rcsb
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius (strain atcc 27009 / dsm 4
total genus 139
structure length 396
sequence length 396
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ovjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ovjA02
2Y7RA 1EZ9A 3IB0A 1VSOA 1MXVA 1UQWA 5I58B 2V3QA 4ZEIA 1YTVA 2O7UA 3K2DA 4QSDA 1A99A 5K2YA 2QMWA 3SETA 2ZXTA 5H8NA 1NH8A 2AL4A 1XT8A 3V89B 4OESA 1R6ZA 3DLNA 1FQBA 2Z23A 3VVDA 5KDTB 1MXXA 4MBPA 2O51A 1VFDA 3FVGA 4H0WA 4HS7A 3CRBA 1A54A 2ALUA 4LQ2A 5J1DA 3FUZA 3PPRA 5TP9A 1PB7A 4YKJA 3H06B 4FECA 3CR9A 5B7DA 4NF8A 5H8HB 4G8HA 1USYH 3U92A 4Z0IA 4F1UA 1MY2A 1MPBA 2XD2A 3PPOA 2ZYNA 3IOWA 4F39A 2X26A 4DZ1A 1JNFA 3O6HA 1A8EA 3KEIA 4U4SA 2OWSA 4DDDA 4G77A 4Q8RA 1N0TA 3H03A 4JSOA 3EPEA 4R2FA 1VFEA 2P0SA 4DLDA 5I58A 4QF9A 3QIMA 2ABHA 3GXAA 3ZSFA 2DWHA 3DP4A 2Y7PA 1AL3A 4PFUA 1Y3QA 3C35A 4IO2A 4O3AA 3FASA 3FXUA 3MVYA 2R9JA 4X1BA 4I1DA 1MDQA 4R2BA 4GXAA 4GVOA 1MQHA 4KR5A 4YKPA 1BKAA 4YMBA 3S4UA 4LZ7A 3PMWA 1MXZA 3OO8A 2QJEA 3EHTA 4ZEFA 3K6WA 4PE5B 1LAGE 2ZYOA 3O6IA 3T96B 2I3VA 3WAEA 4NEDA 3GBBA 5H8HA 3OO7A 3FXRA 4OMBA 1JW1A 4GWOA 1LBCA 2RC7A 3SERA 5A5XB 1B5HA 1FQCA 2I3WA 3MUQA 4F18A 4OYVA 2DXYA 1MM7A 3H6UA 4ND9A 2OK2A 3G3HA 1Z7NE 5AA1A 4RY1A 1LB9A 1B7HA 4H8IA 3IB1A 1MY4A 2F6GA 1LCTA 4ELQA 2OJTA 3VFJA 3VE1B 1H45A 2F7CA 4DXCA 3FD3A 5ISUA 1NNTA 3FVNA 3KG2A 2THIA 5CC2A 1ATGA 2G93A 3K1NA 1FW0A 4KI0E 2DWIA 3FXQA 4RJZA 4G8MA 5I59A 4ZE9A 3HO7A 1D4NA 1MQIA 3DP8A 2ANJA 4C1UA 3CSGA 2Z8EA 5CBSA 3CG1A 2YJPA 3O29A 2I4BA 4ELRA 1TXFA 1GV8A 4BDOA 2ZNUA 3TMGA 3ZKLA 1NKXA 3UIFA 3H6VA 1B0HA 3IB2A 1LAXA 1VE4A 1NFTA 1GR2A 3TZAA 3T9HB 4R72A 1FTJA 3PGFA 2D21A 3Q26A 3TCHA 3OSRA 5ELVA 5A5XA 2VD3A 4JBZA 3T9XB 3I6VA 3K6UA 1B52A 4QFKA 1IXCA 3MBPA 2ONKE 4K3FA 4ZECA 5L9OA 4RPOA 2V93A 3C9HA 4PP0A 2AYSA 1H76A 1SD3A 5KZTA 3SESA 4O3BA 4E0WA 4O3CA 2PVUA 1B40A 5DVJA 4IGRA 2NWJA 4GFRA 4I8CA 1TWYA 1HSEA 3CIJA 2G29A 4OHNA 3TELA 3A3UA 4FE8A 5ICTA 1RKMA 1IITA 1URSA 1JVYA 3O6GA 3K6XA 5JEIA 3RQTA 2F7AA 2H4IA 2HQ0A 5H8SA 5ITPA 4WKMA 4F22A 2DSFA 3F11A 3GBAA 1S7YA 3U94A 4F1YA 3DELB 3KN3A 2I49A 1ZIUA 3KJ7A 1I6QA 3C32A 4POWA 4M4GA 5CMCA 1QKBA 1SW5A 5DTBA 4DCYA 3EQ1A 1MPCA 1PBPA 3K00A 5EHMA 2NOOA 4H5GA 4LONB 1PDAA 2Z8DA 5HBCA 4GRKA 3MZ9A 4NF5B 3CFZA 1SI0A 3H6TA 4NF4B 1II5A 3WAFA 3CSBA 3IOUA 2HAVA 4R6YA 5ITOA 4XKQA 1MDP1 4KCDA 5JTYB 1Y3PA 4M1VA 4BDNA 3KOTA 1IUDA 1AH5A 5ICQA 2NXOA 3ONMA 3IOTA 2QRYA 1NH7A 4EF1A 5CMBA 4YKKA 2QPQA 5K2XA 4UA8A 4R6HA 1LFIA 3C33A 3QK6A 4NWCA 4IGTA 1I69A 1FCKA 3RTFB 3OOAA 4RA1A 2DVZA 3EHSA 3HN0A 4WXJA 2X7QA 2O7IA 3ILUB 2Q2AA 5IKBA 3S9LC 1FTLA 2DWAA 2GHAA 2Q88A 3FV1A 5TP9B 3OSQA 3K1MA 2V84A 3MVZA 2VP1A 3FGSA 2I0CA 2V25A 3G3JA 3PD9A 2V3TA 2QS2A 2UVHA 3IAZA 3CG3A 4Q30B 4NF5A 1ZTYA 2FNCA 1KWHA 3MP6A 4OFOA 4NF4A 1YPNA 1B6HA 1QJMA 1LFGA 3K4UA 3GZGA 3D4GA 3V8XB 1NNFA 4FJPA 1A40A 1Y20A 5JTYA 4OXVA 1BTJA 3USDA 3MP8A 3OXNA 1URDA 3UORA 4HCYA 4I62A 3G3GA 4L17A 4C1TA 4OFLA 3E9XA 1EH3A 1MXWA 1UTBB 5CI5A 2RINA 4IO5A 1N76A 1POTA 5I84A 3R7XA 3H6WA 3MZBA 4FATA 3O2AA 5AA4B 5FHNA 2ZYMA 4ZE8A 1P99A 3LUYA 4QFLA 3BFUA 2GRVA 1DPPA 2RC9A 4JWOA 1MQGA 4OVJA 3TCFA 5L9SA 3THIA 3GLBA 1H43A 1OQHA 3N26A 5DYHA 1OMPA 3QAXA 3D4CA 3ILTB 2YLNA 2X7PA 4F3GA 1PB8A 2O68A 2UVGA 1M5FA 4RK9A 1B7ZA 2LAOA 4P11A 4R6KA 1LBBA 3JYRA 1B51A 1M5DA 5AE4A 3FIRA 1LGBC 1B3GA 4IO4A 4RK2A 2XXVA 4EXKA 4XIGQ 2E0SA 3RNNA 3U72A 2PT1A 3KBRA 4H1XA 2VOZA 1FTOA 1FQAA 3LSLA 1VR5A 2XX9A 5I59B 1UTBA 1GVCA 4OFJA 3BBRA 5FHOA 4EUOA 2DS9A 4XKNA 4MFIA 1IXIA 5AA4A 3MVXA 3I5OA 2I58A 1PBQA 2PYYA 4POXA 3RGYA 2PBWA 3C4MA 4RXLA 4IO6A 2WKYA 2XXPA 4OTEA 2I48A 4ECFA 2H98A 3KN8A 1MH3A 4WEDA 3W15C 3OEKA 3RY3A 5HPQA 1EZPA 4X9TA 1Y4CA 1O7TA 3PD8A 5I2KB 1FTKA 3O66A 2GH9A 1IZ1A 2HZKA 3Q27A 1R9QA 4BLAA 5TU0A 4N6PA 1Y1MA 3C34A 1B5IA 1XHYA 4H65A 4GQOA 2P2AA 4KYEA 4TOZA 2REGA 3N5LA 1DSNA 3T9UA 4WEPA 1B4HA 4R73A 1QVSA 2REJA 3TPAA 4X1DA 4JB7A 1SW1A 2Y7KA 1B4ZA 1RYXA 3IL1B 3KFMA 1P1OA 3HCQA 1BLFA 2IEEA 2Q8JA 2H99A 1FQFA 4Q0CA 2DP8A 2HXWA 1ZU0A 4ZS9A 3MW0A 3RUMA 4U4XA 3TDJA 3TTNA 3UA8A 4HW8A 3OENA 3SDFA 3PUVE 4QFOA 1OLCA 3VVFA 2M8CA 1OQGA 3PMVA 1M5CA 4YICA 2A5SA 2XXYA 1PEBA 4U21A 1MY3A 2HFBA 1IXGA 2FA7A 1QULA 4FEDA 1SYHA 4ISUA 4ESWA 3V83A 1USYE 4EQBA 3MAMA 1WVJA 5L9MA 4LATA 1A8FA 4LVQA 5F1QA 3VLUA 3FV2A 3PPNA 2YPNA 4ELOA 2F6PA 4E0XA 2DOJA 5I2KA 3QYTA 4OEVA 2ESNA 1MXYA 1H3DA 2XXHA 3S9NC 1T0KA 3LSWA 4NTLA 2HCAA 2OBGA 4GOTA 1IQ7A 1NNKA 4H6DA 3VXCA 2F5XA 2PMSA 3QUFA 4EF2A 1DPEA 4BDMA 1MY1A 1XVXA 3MPKA 3K02A 5H8QB 1N3WA 3FVOA 1WODA 4G68C 1B1XA 4YB7A 1PC3A 1RYOA 2B3BA 3PUWE 4R9FA 3S9EA 3TKDA 1CE2A 3S9MC 2QS3A 1YAEA 1EZOA 1QW0A 3Q25A 5HM4B 2DE4A 2XXQA 1Y3NA 2UYEA 2ZNSA 5CMMA 4MLVA 1URGA 3IX1A 1B3HA 4Q5TA 3RLFE 1IXHA 3HV1A 4F31B 1N7XA 2DQVA 2QS1A 4KD5A 1DMBA 4QFPA 4P0IA 3TEPA 4OZ9A 1FTMA 4H5FA 3TYHA 2AL5A 1IEJA 2NVUB 3IO4A 1NMUA 2DVCA 3UK4A 1N7WA 3TAJA 1UTHB 4DIGA 4F3PA 5I2NA 4YZZA 1N84A 3OEMA 4IO3A 1DTZA 2ONRA 1HSJA 1B7UA 4EDPA 3OO6A 2F78A 4I9DA 1SYIA 1XS5A 3KN7A 4BDQA 4IY5A 5AA3A 4YKIA 4YU0A 2ZMBA 4G68A 2XXWA 3MC2A 1SI1A 1B1HA 5BUUA 3QUJA 5F7VA 2PT2A 5AA2B 2OWTA 2A5TA 3T9VA 5H8QA 3T66A 3SEUA 1Y1ZA 4BDRA 4QRZA 2Z8FA 1B3FA 3L6GA 3W9VA 3FJGA 2NUVA 1ELJA 2XXUA 4PFTA 3E4RA 1XOCA 4ZZEA 3CI8A 3IK6B 2PX1A 2QSXA 4TQUQ 1DTGA 1JEUA 1LB8A 3TQWA 3E3KA 3H7MA 5TPAA 5FTIA 3L6HA 1BP5A 1B32A 4U1OA 1TT1A 2H25A 4OERA 3CFXA 5M2VA 5DVFA 4KYSA 3MPLA 3AXFA 3BFTA 3PPQA 4F2OA 4F2QA 1UTHA 4IB2A 3H4ZA 1AOVA 1HSLA 2RC8A 1SDXA 1N04A 3RN8A 2D3IA 1LSTA 4TLMB 4NF6B 5LOMA 2GFEA 4RPNA 2O69A 4EXLA 1MPDA 4PQJA 2RCBA 3ZS6A 5AA2A 4DE8A 4OEUA 4LP2B 2D5WA 2B65A 3MVWA 4DCXA 1B0LA 1P1QA 1AMFA 1P1WA 1DOTA 4OETA 3VLWA 4GD5A 4YB5A 3CVGA 3G3FA 2F97A 2P1SA 3N6TA 3HSTA 3SKPA 2O1MA 1US5A 3VLVA 2XD3A 1Q1KA 5KCJB 1IIWA 5I56B 2UXAA 2F8DA 3G3IA 1UIVA 2HAUA 4U2RA 1BIYA 4LUBA 4QHQA 1B3LA 4P0GA 3TQLA 1NNPA 1A7LA 2ZYKA 3OELA 3OO9A 1Y9UA 3IR1A 4R75A 3K01A 1L5TA 5I57B 1ANFA 2OLBA 3IOVA 3C36A 1SQYA 3SEWA 4MF3A 3B6TA 4NF6A 5FTHA 1GGGA 4DXUA 1OVBA 3U93A 1EU8A 1A55A 2UYFA 3U8QA 2XXIA 3TCGA 1FQEA 3PUZE 1LAHE 1SW4A 5CBRA 4YAHX 1Z7ME 1I6AA 3TTRA 1XC1A 3B6WA 3O9PA 4JWYA 4FAJA 2Y84A 4NMYA 4F3BA 3UGWA 4LQ5A 1PB9A 2ZNTA 3W9WA 5AA2D 1XVYA 1O63A 5B70A 4AB6A 2F36A 4U23A 1MXUA 2V3UA 5KCJA 3PPPA 4N13A 5IAIA 5I56A 4IO7A 3VVEA 1ZMGA 4NE4A 4KYDA 1LAFE 4KQPA 2H9BA 3Q28A 2XX7A 5EHSA 5KDTA 1R9LA 5H8FB 3KSJA 1QUJA 2DE3A 4GXSB 3E13X 1JEVA 4FIMA 3OMBA 5I57A 4ZEDA 3Q29A 3TTKA 1MH4A 3H3GA 1MM6A 4G8NA 3MQ9A 4Z7EA 3IJOB 1R1NA 4XKRA 3MP1A 4RYAA 1UIUA 2RCAA 1H44A 2O6AA 3MJNA 2OZZA 3MWBA 3S2VA 4ZZAA 4G4PA 1P1NA 3RTWB 2E1SA 4JSDA 5DVIA 4EQ9A 1D9VA 1US4A 3P7IA 1MY0A 2RKMA 3FATA 4R9GA 3N6UA 1B58A 3RT6B 1JETA 1FQDA 4F3SA 4ZDMA 1OVTA 2QS4A 1B9JA 3BKIB 1JW5A 1AIVA 4THIA 3DP6A 3HPIA 3JV9A 3EF7A 3KJTA 4U1ZA 4XXUA 4C0RA 4MH5A 5DEXB 1MQDA 1LFHA 1JQFA 4PETA 4TLLB 2QL3A 3VV5A 4F19A 2CMOA 2UVJA 2VGQA 2W7YA 2FYIA 5CMKA 3PMXA 3T22A 1SBPA 3M8UA 2DWJA 4NWDA 4PFYA 1OIBA 1JW4A 3KOSA 3VDFA 3PUXE 3EN3A 3R6UA 4QSCA 1D9YA 3PV0E 4H67A 1D3KA 2I6EA 1P1UA 5H8FA 3TFLA 3ECRA 2DYXA 3B6QA 1LCFA 4XTCQ 1M5EA 5CRYA 4LZ5A 4KCCA 4F1VA 2KLFA 1B05A 3G7WA 3M3KA 5I2NB 4X48A 4HCWA 5BWJA 1B3EA 3A09A 3UP9A 2XHDA 3FVKA 1Y4TA 5FHMA 3M3FA 3FJ7A 4HTGA 4R74A 2I0BA 4G68B 2H5YA 3CFLA 3U1OA 1TFAA 1SW2A 4GIZA 1I6BA 1GTKA 2R6GE 4N07A 3LBSA 1OLAA 1O64A 3R26A 3IORA 2A5TB 2F35A 1QKAA 3T93B 4YB6A 3JZJA 3N94A 1LLSA 4DXBA 3TTLA 4ZEKA 2BJJX 5L8DA 1MS7A 2OCUA 4QSEA 3KZGA 4ELPA 5DEXA 3FZVA 3KGCA 4KPTA 4GF8A 4YMAA 4AB5A 3LC8A 4U22A 2Y7WA 4JXIA 1B2HA 1J1NA 3K0VA 4GLIA 5TPAB 1QUIA 2Q9TA 1CB6A 1B5JA 2Z22A 3QSLA 3UN6A 1ZJLA 2O1LA 2Y7IA 2ONSA 1ZLQA 1POY1 2I4CA 3HHFA 3LSFB 3LSXA 4F29A 2Q89A 2XXXA 5JK4A 3B7DA 4UACA 2DE2A 4FORA 4GL0A 3TODA 3A3CA 4BDLA 1N3XA 1S9TA 3G3KA 4H8JA 4QFNA 4ZEBA 4ESXA 3K6VA 1WDNA 1ZKBA 4ONYA 3TUSA 2XXRA 1MRPA 1MQJA 5CM6A 4PFWA 5EYFA 2XXTA 3LR1A 3RT8A 3DM0A 1NL5A 2Q2CA 1Q35A 3EHUA 4RNSA 4OENA 3SEYA 4LZ8A 2GHBA 2RF1A 3C31A 2VD2A 4IY6A 3IJXB 2AIXA 4JDFA 1QUKA 4JWXA 1MG1A 2F34A 5H8NB 4KHZE 3V5AA 3TTMA 3ZKKA 3O28A 3SEVA 2IA4A 1B46A 3OD7A 2B3FA 3PU5A 3ODBA 1ZBMA 2HZLA 3VXBA 3PUYE 4AQ4A 3K1PA 3M3LA 1YCJA 1F9BA 2DXRA 2F7BA 2XX8A 2HEUA 4G2ZA 1SVXB 4GL8A 3SEXA 3KSXA 3IO6A 1M5BA 4LA9A 1JVXA 3RPWA 3I3VA 2O84X 4NF8B 2CZLA 1S50A 4XKPA 4OQOA 4EQ7A 3MZ1A 4MLQA 3FJMA 4OWDA 2UVIA 2QMXA 4FEBA 3HHGA 1TFDA 5DT6A 3QXMA 4KFQA 3O97A 2R71A 2VHAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y7RA 1EZ9A 3HFUA 3QMFA 3IB0A 4XFEA 1VSOA 1MXVA 4MJOA 1UQWA 2CEYA 5I58B 2V3QA 4ZEIA 1FPGA 1YTVA 2O7UA 3K2DA 4QSDA 1A99A 2P3NA 5K2YA 4PFIA 2QMWA 3SETA 2ZXTA 5H8NA 1NH8A 2AL4A 1XT8A 3V89B 3T0JA 4OESA 4PE3A 1R6ZA 3DLNA 1FQBA 2Z23A 3VVDA 5KDTB 4I3YA 1MXXA 1NV1A 4MBPA 2O51A 1VFDA 3FVGA 4H0WA 1KA1A 4NX1A 4HS7A 3CRBA 4P1LA 1A54A 2ALUA 4LQ2A 5J1DA 3FUZA 3PPRA 4P8BA 5TP9A 1PB7A 4YKJA 3H06B 4FECA 3CR9A 5B7DA 4NF8A 5H8HB 4G8HA 1USYH 3U92A 4Z0IA 4F1UA 1MY2A 1MPBA 3B8BA 1VDWA 2XD2A 3PPOA 1FJ6A 1LBZA 2ZYNA 3IOWA 4F39A 4N17A 4HE1A 2B4LA 2X26A 4DZ1A 1JNFA 3LV0A 3O6HA 1A8EA 3KEIA 4U4SA 2OWSA 3LUZA 4PTKA 4DDDA 2WEFA 4G77A 4Q8RA 1N0TA 3H03A 4JSOA 3EPEA 4R2FA 1VFEA 2P0SA 2OX3A 4XF5A 4DLDA 5I58A 4QF9A 3QIMA 1FPKA 2ABHA 3GXAA 3ZSFA 2DWHA 3DP4A 2Y7PA 1AL3A 4PFUA 4MCOA 1Y3QA 3C35A 4IO2A 4O3AA 3FASA 3FXUA 3MVYA 4MHFA 2PFZA 2R9JA 4X1BA 4I1DA 1MDQA 4R2BA 3CHGA 4GXAA 4GVOA 1MQHA 2Y5LA 4KR5A 4YKPA 1BKAA 4YMBA 2CEXA 3S4UA 4LZ7A 3PMWA 4HXVA 1MXZA 3OO8A 2QJEA 3EHTA 4ZEFA 3K6WA 3E79A 4PE5B 2KQZA 1FTAA 1LAGE 2ZYOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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