2I4CA

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with bicarbonate and calcium
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
401
structure length
401
Chain Sequence
PEMMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Bicarbonate transporter
publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Transport protein
total genus 144
structure length 401
sequence length 401
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA01
3B6WA 2XXVA 1Y3QA 3FJGA 5I2KA 3E13X 4I62A 4QFKA 3KSJA 3G7WA 4N6PA 5H8NA 4GXAA 3PPNA 4U21A 1T0KA 4Q5TA 5ITOA 2NVUB 2Y7PA 2QJEA 5H8QA 2HZKA 1M5FA 5I84A 3TPAA 1B32A 4R9FA 1D3KA 3TELA 1SBPA 5FTIA 2HQ0A 1MM6A 4BDQA 1IQ7A 3I3VA 2AL5A 1NMUA 3EHUA 5DEXA 3MWBA 2CZLA 2Q9TA 1F9BA 2GH9A 1M5CA 1R1NA 3TQLA 1JW1A 1M5EA 3MP6A 2BJJX 1P1OA 2Y7RA 1R9QA 3N26A 3TQWA 4DCYA 2O1LA 4QFPA 3TTRA 3DLNA 4RK9A 3ZKLA 2DVCA 2DXYA 4NF6B 5FHOA 3QXMA 2XX7A 1DSNA 4RPNA 1NH8A 3B6TA 1OVTA 2W7YA 3C35A 2D5WA 3TODA 4UACA 1LFGA 1N84A 3K02A 2H9BA 2I48A 3SESA 1JW5A 2H98A 3QAXA 1LB8A 1FQAA 3FXUA 4IGTA 3C31A 1KWHA 2CMOA 3BFTA 3VV5A 4ECFA 4O3CA 4PETA 2NXOA 4KPTA 1PB8A 3VLWA 5H8NB 1H45A 3K4UA 4XTCQ 1QULA 3FJ7A 1N7WA 1IEJA 4QSEA 2X7PA 4BDMA 5H8QB 4PFTA 1TXFA 4KCCA 1POTA 4LATA 4G8MA 2REGA 3BKIB 3UORA 1IITA 1DOTA 3RNNA 1S9TA 5DEXB 1H76A 4F19A 4NMYA 2DE2A 3A09A 1O7TA 1LB9A 1PB7A 2DYXA 5I59A 3DP8A 4I8CA 4OFOA 4ZEFA 1H44A 1Q1KA 2HXWA 4JDFA 5I58A 2AIXA 2NOOA 4R6KA 5LOMA 3M8UA 1SYIA 3HHFA 4X9TA 3K1PA 1IZ1A 4R2BA 4DIGA 5TP9A 3KGCA 4ZEIA 4GFRA 1MM7A 4YB6A 4POWA 4FIMA 4OXVA 4TOZA 1N0TA 4R72A 3PD8A 2D3IA 1ZMGA 2REJA 3PPPA 3USDA 4AQ4A 4X1DA 4F31B 3CFLA 1LSTA 3PUYE 3W9WA 4NWCA 1UQWA 2XX8A 1B40A 1M5DA 2V3QA 3GLBA 3T66A 3UA8A 1HSJA 4OHNA 3KJTA 1BLFA 1US5A 4GIZA 1B7HA 4Q0CA 4C0RA 3G3HA 2UVHA 3U1OA 3MP8A 2DXRA 3FD3A 3FATA 3A3UA 2RCAA 5JTYA 3C4MA 2I0CA 4R73A 1GV8A 1NNFA 3QYTA 4EQ9A 3PMVA 1MDP1 3MVWA 1A54A 2O51A 5I2NA 4R74A 5I59B 2DWJA 4DLDA 2XXRA 1FTOA 2B65A 2O7IA 1XVXA 4OEUA 5I58B 3OSQA 1HSLA 3OO7A 2O1MA 3R26A 1WVJA 3V8XB 1VFEA 2DE3A 1QUIA 4EF1A 1Y3NA 5TP9B 3B7DA 2G29A 1AOVA 2V25A 2D21A 2PT1A 4NE4A 2GFEA 3C33A 3ONMA 3W15C 3H6UA 3CG3A 1POY1 1GTKA 2V3TA 2XXQA 3KSXA 2DP8A 4YKJA 1SI1A 3ILTB 2YPNA 2QL3A 1NL5A 3TFLA 1I6AA 3N6UA 4OETA 4LA9A 3FUZA 3TKDA 1FTKA 3RTWB 3IOTA 4C1TA 4FEDA 2ZMBA 4BDOA 4IO7A 3HSTA 2DQVA 5L8DA 4GWOA 1MY1A 4U23A 3PPOA 4F1UA 3ZSFA 3TTNA 3FV2A 3EHTA 1PB9A 1QW0A 1WODA 2XD3A 2HAVA 4MH5A 2QRYA 1N76A 1PEBA 3T9UA 1A40A 5BUUA 4OYVA 5JTYB 3KOTA 1I69A 2HZLA 4DXCA 2R9JA 4FATA 2M8CA 3MVXA 3MQ9A 3QSLA 2AYSA 1B46A 2RC7A 4U22A 4H5FA 1DPEA 1RYXA 4RK2A 3PV0E 4DZ1A 5HM4B 3G3FA 4ZS9A 4H8IA 4F18A 3BBRA 5I56A 4TLMB 4NF5A 3CVGA 2O6AA 5KCJB 2G93A 4IY6A 4EF2A 4ESWA 1QUJA 1FTJA 1I6BA 4L17A 3FZVA 3O2AA 1IXHA 3KEIA 4EQBA 4QSCA 2HFBA 1B05A 3H7MA 3E4RA 5L9MA 1O64A 4XKQA 2VP1A 4G77A 3U72A 3I6VA 4YAHX 4HS7A 1JVYA 5CMBA 5CMCA 1YCJA 3VDFA 4F22A 3B6QA 3R7XA 1SVXB 3JYRA 4U4XA 3H6VA 3K01A 1B58A 1YAEA 1LCFA 3MW0A 1BIYA 2XXXA 5K2YA 3G3IA 1B7ZA 2F36A 3JV9A 2OLBA 2AL4A 5AA2A 2YJPA 5ISUA 1Y20A 3T96B 1URSA 3IJOB 4H5GA 3KJ7A 1H3DA 5CRYA 4U4SA 1ZBMA 2QPQA 2I4CA 2V84A 1FQDA 5EYFA 3MP1A 5F7VA 4K3FA 4JSDA 5DVJA 1PDAA 3DP4A 2DWIA 1GGGA 3V5AA 2Y84A 3RQTA 1DMBA 5B70A 3MJNA 1IXCA 4YMBA 5I56B 2Q2AA 5ITPA 4GD5A 4NF5B 5TPAA 4YB7A 4ELQA 5H8FA 1IUDA 2Q89A 5DTBA 4IO6A 4QSDA 2F5XA 4YKIA 3FXQA 1EH3A 1MQIA 3MPKA 1MG1A 3VXCA 1J1NA 1ZJLA 1IXIA 3FV1A 2OCUA 1FTLA 1XVYA 1SI0A 4YB5A 1N7XA 1LFHA 3UGWA 4IY5A 1VR5A 2F35A 3FVKA 5JEIA 2Y7KA 1SDXA 3PU5A 4H65A 3BFUA 4FECA 3HN0A 3ZKKA 5L9SA 3KFMA 1JEVA 3ILUB 2ALUA 4I9DA 3SKPA 5AA2B 3D4GA 3RN8A 3LSXA 4IO3A 1RKMA 3FJMA 3RTFB 5AA3A 5KZTA 1ELJA 4XKPA 4G68C 2OJTA 4LUBA 1TT1A 3AXFA 2UYFA 3H06B 3V83A 1MQDA 5KDTA 3VVEA 4NF4A 3M3FA 3HV1A 2ONRA 2P2AA 5BWJA 4F3BA 3KN8A 1Y4TA 3O6GA 2H4IA 5EHSA 3P7IA 5I2KB 1SW4A 5FTHA 4IGRA 3UIFA 4BDNA 3K1NA 4ZDMA 4BDRA 3MC2A 1ZKBA 2A5SA 4HW8A 4KYSA 4LZ7A 3PUZE 3GXAA 3T9XB 1MXUA 4ONYA 2I6EA 4FJPA 3GBAA 1URGA 1B5JA 2Y7IA 1ZTYA 3K1MA 4THIA 3IOWA 3O97A 3FGSA 3K00A 2V3UA 1GVCA 5TPAB 3IOUA 4GXSB 2QSXA 3EHSA 4P0GA 3O9PA 3HCQA 3OO8A 4R9GA 5M2VA 4H1XA 4OQOA 3CFXA 3IOVA 2RF1A 1DTZA 5ELVA 1XS5A 3S2VA 1B3LA 3MZBA 4C1UA 1YTVA 3LC8A 1AH5A 4AB5A 5CM6A 4LQ5A 2RKMA 3U94A 1MXWA 1B9JA 1QJMA 4LP2B 4ZEKA 3ODBA 4Z0IA 3EF7A 1N04A 4F2OA 2Z8DA 4NF8A 2RC8A 1A8FA 4I1DA 4N13A 3IB0A 5FHMA 4H0WA 3C34A 4ZEBA 1BP5A 3CSGA 5JK4A 3H6TA 3OXNA 5A5XA 4WKMA 2XHDA 5KDTB 1MY2A 4NF4B 1USYE 2F6PA 3W9VA 3LSWA 5IAIA 4E0XA 1JQFA 3SEWA 1ZLQA 3O29A 1MXZA 4YZZA 3SDFA 4GRKA 3K0VA 3SETA 4FEBA 3QUFA 4OMBA 2YLNA 1OQHA 4JB7A 1R9LA 2FYIA 4PFWA 4GF8A 1P1UA 2A5TA 3U92A 2OBGA 3S4UA 4G8NA 2I0BA 4MFIA 3U8QA 4EQ7A 1L5TA 1URDA 3WAFA 3KN7A 2DWAA 1H43A 4F3GA 5CI5A 1MDQA 5H8HA 2ZYKA 4HTGA 5J1DA 3O6IA 2I49A 4FE8A 2NUVA 1Q35A 3CSBA 2F7AA 4U1OA 4ISUA 4Q8RA 1B52A 3TCHA 4KD5A 4KCDA 1USYH 4MLQA 3VVDA 5AA2D 1S50A 3TYHA 3Q29A 1B0HA 1NFTA 4Z7EA 4ELRA 3JZJA 4PP0A 2LAOA 1SW5A 4F1YA 3N6TA 4JXIA 2XXPA 1B0LA 4GVOA 2UVJA 2VD3A 3QK6A 1MRPA 3MAMA 4DCXA 1MXXA 3PUWE 4ZE9A 1OVBA 1VE4A 4P0IA 2I58A 1AL3A 4GQOA 3CG1A 3WAEA 3SEYA 5AA1A 1B5IA 2F6GA 2OK2A 5HBCA 3CR9A 4Q30B 1SW2A 1M5BA 3K2DA 3VLUA 3OOAA 3RGYA 2A5TB 1VSOA 1MXYA 2HCAA 4MBPA 1MQHA 1UTHA 2P1SA 4ZE8A 1OQGA 3KZGA 3F11A 3T93B 2QS2A 1WDNA 4KI0E 2F7CA 4EXKA 1AIVA 4JWYA 4R6YA 2VHAA 1B3GA 4PE5B 2DVZA 2ONKE 5I2NB 1A8EA 1XT8A 3CIJA 2XXHA 5DT6A 3TTKA 4KFQA 2ANJA 1P99A 4XKNA 3L6HA 4WEDA 3OO9A 1FQEA 1NNKA 4RJZA 4OVJA 3SEVA 2R71A 3LR1A 3O28A 2HEUA 3G3JA 1LAHE 2ESNA 3DELB 1NNPA 2VOZA 3H3GA 3RLFE 5EHMA 1OMPA 2I3WA 4ELOA 2I4BA 1MPCA 2GRVA 1Y3PA 5IKBA 2OWSA 3GBBA 1EZOA 2WKYA 3IX1A 5CC2A 1D4NA 3FIRA 3TCGA 1I6QA 2XXYA 2FNCA 4HCYA 1OLCA 2I3VA 3CFZA 3VE1B 4YKKA 2FA7A 3O6HA 3IR1A 3VXBA 5I57A 3TUSA 3RUMA 4F39A 2UXAA 3K6XA 1B1XA 4PQJA 4DE8A 4NWDA 4QRZA 3Q25A 2QMWA 1D9YA 4EUOA 1FQFA 5HPQA 5CMMA 5TU0A 2UYEA 1MPBA 3OD7A 4GL0A 2PBWA 4MF3A 1FTMA 1Y9UA 4RY1A 2O68A 5FHNA 2H5YA 1B3FA 2O84X 5L9OA 4F3SA 3FASA 3MVYA 4DXBA 1LCTA 1SQYA 3RT6B 1TWYA 4P11A 3FVOA 5CBRA 4G2ZA 3IO4A 3TDJA 3MZ9A 2R6GE 1MPDA 5CBSA 1LBBA 1B1HA 4KQPA 4QFOA 3FVGA 4IO4A 3C32A 4POXA 3L6GA 2DSFA 4X48A 3CI8A 2XXTA 4XKRA 3OENA 2DE4A 3OMBA 2XD2A 3IB1A 3QIMA 2E1SA 3ECRA 4F29A 1N3XA 1QKAA 3KBRA 3T22A 4KHZE 1JVXA 1N3WA 1NH7A 3IL1B 3EQ1A 1B51A 4G4PA 3S9EA 4YMAA 1JETA 2P0SA 4F2QA 3IO6A 3HHGA 1EZPA 1EZ9A 4ZZEA 3MBPA 1O63A 5I57B 4WXJA 1LAXA 1LAFE 3QUJA 4XXUA 1R6ZA 2Y7WA 1CE2A 1D9VA 3Q28A 3C9HA 3DM0A 2RCBA 2KLFA 1FQCA 3ZS6A 1A7LA 1MY4A 2O69A 3PMWA 4OTEA 2OWTA 2X26A 4F3PA 4OEVA 3IB2A 1B4ZA 3UP9A 1S7YA 4RNSA 2GHAA 2ZNTA 3FXRA 2ZYMA 4R75A 2F78A 1P1QA 4XIGQ 5K2XA 4ZEDA 3S9LC 4IO2A 2F34A 4O3BA 3TTLA 4R6HA 4EXLA 5H8FB 4U2RA 2QS1A 3S9MC 4RA1A 3OSRA 3OO6A 3MUQA 4M1VA 2VD2A 2X7QA 2QS4A 3TCFA 3PMXA 1P1WA 1BKAA 1RYOA 4GOTA 1JW4A 2PMSA 3TEPA 3E3KA 3UN6A 3PUVE 3PGFA 1AMFA 1JEUA 1HSEA 5ICTA 4JWXA 4NTLA 4FAJA 3V89B 3IAZA 3MZ1A 2ONSA 2ZNUA 1B4HA 3K6UA 2RINA 2Z8EA 4QHQA 1LFIA 4OENA 3SERA 3MVZA 1LGBC 3D4CA 4BLAA 4G68A 3TZAA 3TMGA 4ELPA 3LSFB 1UIVA 2QMXA 1OLAA 2HAUA 1GR2A 2E0SA 2PX1A 1Z7ME 1B7UA 1DPPA 4H6DA 4HCWA 1OIBA 1B2HA 2DOJA 2THIA 4ZZAA 4H67A 5CMKA 1UTBA 4U1ZA 1FW0A 1SYHA 2V93A 3S9NC 4LVQA 4TLLB 2Z22A 4UA8A 3PUXE 2OZZA 3Q26A 4LZ5A 4BDLA 2XXWA 4O3AA 2XXUA 1NNTA 1UIUA 1II5A 2UVIA 1US4A 3PD9A 1XOCA 1SW1A 1ZU0A 1B5HA 1DTGA 4OFLA 4OZ9A 2DWHA 4EDPA 4KR5A 2Z23A 3HO7A 4X1BA 4N07A 2ZYNA 4QF9A 3TAJA 3VVFA 4YICA 4ESXA 1Y1MA 5DVFA 2RC9A 1B3EA 4WEPA 3SEUA 4GL8A 3HPIA 3U93A 4YU0A 1QKBA 1PBPA 1Z7NE 2PVUA 3A3CA 2Q2CA 2QS3A 2F97A 1YPNA 2PYYA 5KCJA 1A99A 1MH3A 1B6HA 2ZXTA 4DXUA 4NF8B 1P1NA 2H99A 5AA4A 3T9VA 3H4ZA 2F8DA 3R6UA 3RT8A 1XC1A 1XHYA 4G68B 1MQGA 2O7UA 4DDDA 5A5XB 5H8SA 3KG2A 3TTMA 3C36A 3UK4A 2B3BA 2VGQA 5AE4A 4LQ2A 1ATGA 4PFYA 3THIA 3K6VA 1UTBB 4G8HA 3G3KA 4F1VA 3I5OA 1TFAA 2PT2A 4PFUA 2F7BA 3VFJA 2B3FA 1B3HA 4FORA 2ZYOA 4OERA 4LONB 2Q8JA 4AB6A 3OEKA 4JSOA 3EN3A 4RXLA 1FQBA 3M3KA 4YKPA 5ICQA 3N94A 4M4GA 3PPQA 3KOSA 3SEXA 3IK6B 3IORA 1QVSA 3GZGA 4TQUQ 1JNFA 1MY0A 2H25A 3FVNA 3E9XA 4NEDA 1PC3A 1PBQA 4LZ8A 5H8HB 4OWDA 2DS9A 3RY3A 5DVIA 4R2FA 1FCKA 3H6WA 3IJXB 4RYAA 2IEEA 2XX9A 4KYEA 2IA4A 4QFNA 2ZNSA 4OESA 5AA4B 2Z8FA 3MPLA 3EPEA 4IO5A 1LAGE 4RPOA 4JWOA 1Y1ZA 1IXGA 4QFLA 3T9HB 4ND9A 3Q27A 1MY3A 2ABHA 3KN3A 2NWJA 3LUYA 3OEMA 1LBCA 1EU8A 5F1QA 3RPWA 1QUKA 3DP6A 3PPRA 3H03A 3OELA 4OFJA 4E0WA 3N5LA 1A55A 3M3LA 1SD3A 1MS7A 1VFDA 3LBSA 4GLIA 3CRBA 4JBZA 2UVGA 1IIWA 4NF6A 4KYDA 1NKXA 2GHBA 2Q88A 5B7DA 4H8JA 1CB6A 1TFDA 4ZECA 1LLSA 1MXVA 3G3GA 3K6WA 3VLVA 1Y4CA 3O66A 4MLVA 2XXIA 1MQJA 1MH4A 1ANFA 1ZIUA 1UTHB 5DYHA 4IB2A 1BTJA 3LSLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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