2I4CA

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with bicarbonate and calcium
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
401
structure length
401
Chain Sequence
PEMMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bicarbonate transporter
publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Transport protein
total genus 144
structure length 401
sequence length 401
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA01
2QRYA 1FQEA 2Z23A 4Q5TA 4G2ZA 3Q26A 4EXLA 3VVEA 1B7UA 4MH5A 5K2YA 4ZZAA 5CBRA 1MXYA 3KZGA 1P1UA 1SQYA 3RTFB 4R2FA 3V5AA 1OIBA 4F2OA 2ZNSA 3FJGA 3MZ9A 1Y3QA 4O3BA 3B7DA 1N3WA 1GGGA 2XXWA 3CRBA 5I2NB 2RCBA 3FV2A 2I3WA 4GXSB 4F3GA 1OVTA 4H6DA 3OEMA 3U92A 4C1UA 2DS9A 3KOSA 1UIUA 3A09A 4KI0E 3K01A 2O6AA 2DOJA 1DSNA 1MDP1 1IITA 4QF9A 3TCFA 2OBGA 5CMBA 3VLWA 4RK9A 1M5FA 4MBPA 2F35A 5H8QB 4YKIA 5JTYA 4GRKA 3V8XB 3G7WA 1OMPA 1Y1MA 4KCDA 4YICA 1QW0A 1FQBA 2UVGA 5DEXB 1FCKA 3PMWA 1Y4CA 4AB5A 1ZJLA 1UQWA 5FTHA 3T93B 1UTHA 1WDNA 4BDRA 2IEEA 3RNNA 2Z8DA 1MQIA 4JXIA 3T96B 1LGBC 4OVJA 2QSXA 2X7PA 3K2DA 3TTLA 5AA2B 5L9OA 4HW8A 2ZNUA 3W15C 5I57B 1BP5A 1LAGE 4FEBA 2GFEA 4HCYA 2HXWA 3FVKA 2XX7A 4GIZA 3O29A 3L6HA 3TODA 3VXCA 2OJTA 5L9MA 3TTKA 2R71A 3PUZE 1XOCA 1VR5A 5DT6A 2DVCA 4H67A 2Q2AA 4OENA 4RNSA 2PT1A 3MPKA 4AQ4A 1LCTA 3EPEA 4RXLA 1R9QA 3O6HA 1L5TA 1B58A 2Y7KA 4F3PA 1JEVA 2XXIA 3VV5A 2QS1A 2ZYNA 1SYHA 2I0BA 1B5HA 1QUKA 2XXUA 1XVYA 4FJPA 3TQWA 1ZBMA 4GVOA 2A5TB 4ZE8A 4OFLA 5CI5A 3PUWE 3O97A 2UVIA 1USYH 3IK6B 3S4UA 2ALUA 4ELQA 1LBCA 3EQ1A 1TFAA 5ELVA 1MXVA 4ZE9A 4NEDA 2XD3A 4E0WA 2V84A 1Q1KA 1A7LA 5I58A 3O6GA 5I59A 1PB8A 1P1QA 1AMFA 2I3VA 2ZNTA 2VHAA 2GHAA 3OO7A 3CIJA 3IOUA 4U4XA 5H8FB 4IO2A 3IB0A 4OETA 3ECRA 3S2VA 1PC3A 4R73A 1YPNA 1MXUA 4JSOA 4EQBA 3RGYA 3UP9A 5EHMA 4OQOA 3JV9A 2QS3A 5K2XA 4ZS9A 2H5YA 4OESA 5BUUA 3IB2A 4XIGQ 1Y1ZA 2IA4A 1O63A 2VD2A 2DWJA 2DP8A 3CFZA 5H8SA 5CC2A 1LB9A 4P0GA 4FE8A 2DWHA 3CSBA 4QSCA 3LSFB 1LBBA 1P99A 3VE1B 2GH9A 5DYHA 4U21A 4U23A 3PMXA 4DIGA 4F3BA 4X9TA 5TPAB 3TCHA 2OCUA 3GBBA 4RJZA 4QFLA 1XC1A 4G8MA 3CSGA 4POWA 1GTKA 2F7BA 4RA1A 4G68B 5JTYB 4BDOA 3A3UA 1IEJA 2D5WA 3MZ1A 3QAXA 1NH8A 4QSEA 3RTWB 1Z7NE 3MWBA 4P0IA 1FQAA 1UTHB 1JEUA 2ESNA 4QRZA 4Z0IA 3PMVA 4RK2A 3MAMA 5HM4B 4KQPA 1OQHA 3C9HA 2X7QA 3IOWA 5AA3A 3CFXA 3L6GA 2XXHA 2B3BA 4YAHX 1NL5A 2F6PA 4IO6A 2F7CA 1ZIUA 1SD3A 5DEXA 2Z8FA 4ELPA 3MP8A 3DP6A 2M8CA 2XX9A 4PQJA 4U22A 3GZGA 4H0WA 1JW1A 4LZ5A 3G3IA 2PBWA 3FASA 4EQ7A 1HSEA 3I5OA 4G8NA 2A5SA 2DE2A 3JYRA 3K02A 4N07A 3IOVA 3RY3A 5IKBA 1TT1A 3HHFA 2F36A 3S9MC 3KOTA 1S7YA 3AXFA 4QFOA 1GVCA 2OWSA 4LVQA 3FV1A 3HCQA 4QHQA 3F11A 3D4GA 1DPEA 1LB8A 4R6KA 3LR1A 5DVIA 5L8DA 2AL5A 2Y7PA 3UA8A 3LBSA 3H06B 1NNKA 1B9JA 3G3HA 3GBAA 1R1NA 4WKMA 5M2VA 3OD7A 4OZ9A 5AE4A 2UYFA 3LSXA 4RPOA 2XXTA 4BDQA 1P1WA 4U2RA 1URGA 5I58B 4F1UA 1TWYA 2FNCA 3DM0A 3R6UA 1LAFE 5CMKA 3A3CA 4ONYA 2HEUA 4LZ7A 2XXRA 2ANJA 2WKYA 1MS7A 1TFDA 2HAUA 3K00A 4P11A 1IQ7A 4YKJA 4KYEA 3W9VA 3MP6A 3ONMA 5HBCA 2I4CA 1MQDA 4X1BA 3MZBA 3K6XA 4YZZA 3IAZA 3H6TA 2V3TA 1JNFA 4DLDA 4JWXA 1AOVA 2F34A 3BBRA 4POXA 1B51A 4FEDA 4JWOA 2LAOA 5H8FA 3KSXA 4RPNA 1N76A 4NF4B 4EUOA 2O1MA 3ZSFA 1LFIA 1MM6A 4EF1A 1FQCA 1N7XA 1MQJA 3K4UA 1USYE 4IGRA 1AIVA 4IY6A 2PVUA 3HPIA 5I84A 4ZEKA 2DE3A 1BKAA 2FYIA 2DXYA 2G93A 4GWOA 4OERA 3UGWA 3FIRA 5FHNA 4MF3A 1RYOA 3ODBA 4JDFA 2OZZA 3U93A 4E0XA 5A5XB 5KCJB 2B65A 3M8UA 1MXWA 4NMYA 1MXZA 1MPCA 1B0HA 1B0LA 2D21A 1VSOA 4UA8A 3VVFA 4ECFA 2VD3A 2HQ0A 1PDAA 2OK2A 1Q35A 4M4GA 3SETA 3KN8A 1M5CA 1I6AA 5TPAA 4C1TA 4ZZEA 1H44A 1IIWA 2ZMBA 4YU0A 4F1VA 3N26A 4F22A 3G3FA 4G68A 3R26A 2H9BA 1FQDA 5IAIA 4G4PA 3CFLA 1D4NA 5DVFA 2NUVA 4YKPA 3THIA 2THIA 1B05A 1FTKA 3GXAA 2F6GA 4ND9A 3CVGA 4HCWA 2YPNA 3UN6A 4MLQA 3E3KA 1XHYA 1OLCA 1B5IA 3M3LA 2E1SA 2FA7A 4THIA 1OQGA 3CG1A 3HV1A 2XXXA 1XVXA 1SW5A 1Y20A 3LSWA 3EHTA 1SW4A 1ZLQA 2YLNA 4RY1A 3RUMA 3T9HB 3WAEA 1MQGA 1GV8A 2R6GE 3MVXA 3SESA 3V89B 3Q28A 4NWCA 4YB6A 4IO5A 2ONKE 2Q8JA 1I69A 2Z22A 4ESXA 4KFQA 4LP2B 1ANFA 3H6WA 2H99A 4X48A 1B3EA 5H8HB 3T9UA 4G8HA 1A54A 5ICTA 1O7TA 1POY1 1BTJA 2W7YA 3FJ7A 2ZYMA 3QUJA 1D9YA 2UYEA 5TU0A 2XXVA 4ELRA 3FATA 1P1NA 3RT8A 3LSLA 1EZ9A 1EZPA 3M3FA 4YB5A 4IB2A 3H4ZA 3O9PA 1MG1A 3IL1B 1Y3NA 2Z8EA 2XX8A 2O7IA 4NWDA 3MP1A 3T22A 1ZU0A 3TFLA 1B40A 4U1OA 4PETA 4F31B 2NWJA 1B4ZA 1FTOA 3LUYA 4MLVA 3SEYA 1R6ZA 1JVYA 3N94A 3P7IA 2QL3A 3FXUA 4R9GA 4F19A 3ZKKA 2AIXA 4NF5A 4Q0CA 1SW2A 4GOTA 2RC7A 1J1NA 2Q89A 3TTMA 3MJNA 1JETA 2E0SA 2Q2CA 3OO6A 3PGFA 3FZVA 3VDFA 3DP8A 3H6VA 4ZEFA 4TLMB 1WVJA 1SBPA 3QXMA 3WAFA 4M1VA 4C0RA 3KJTA 3IORA 3TCGA 1DTZA 3MUQA 1HSLA 4BDNA 4DCYA 5DVJA 1QKBA 2F97A 1YTVA 3B6WA 2DWIA 4OEVA 4NF4A 2I48A 1IZ1A 3C4MA 1DOTA 4X1DA 3PPRA 4DXUA 2ONSA 2REJA 3C31A 4JWYA 4H5GA 2AL4A 1PB7A 5I2KB 5I56A 1JW4A 2P0SA 1A40A 5A5XA 1MPDA 4QFNA 5KCJA 1PBPA 3IR1A 3Q25A 4BLAA 3N6TA 2AYSA 1N7WA 4OTEA 4R9FA 1LAHE 4PE5B 3QYTA 1HSJA 4PFWA 4LONB 1QUIA 3FXRA 1JQFA 3B6QA 3DLNA 3T66A 3TPAA 1US4A 1A99A 4H5FA 4KCCA 3DP4A 1WODA 1PEBA 1FTLA 5ITOA 5KDTB 1BLFA 3OXNA 4KHZE 3G3GA 1EZOA 2PT2A 4I8CA 1AH5A 3SERA 5HPQA 2Q88A 4OEUA 3K6UA 4HS7A 1H76A 3KEIA 4GL8A 5ITPA 1I6QA 4PFTA 3G3KA 3OO8A 1VFEA 1M5EA 2PYYA 1EH3A 4ELOA 1MY2A 2DYXA 2UVHA 3KJ7A 1LAXA 3S9LC 1B6HA 4XKNA 2OLBA 4YMBA 3H3GA 3SKPA 4H8JA 3TDJA 4EXKA 4XKQA 2XXYA 1LLSA 2PMSA 2CZLA 2OWTA 3SEWA 5KZTA 3K1MA 3VFJA 3BFUA 4F29A 3C34A 2Q9TA 1B46A 4WXJA 3K6VA 3N6UA 3TMGA 4N13A 1ATGA 5H8HA 1D9VA 3K1PA 2XXQA 2RINA 4XKRA 3HO7A 2CMOA 3O6IA 1RYXA 3ZS6A 1SDXA 3C32A 4GF8A 1A8FA 2H25A 5BWJA 1URDA 1H3DA 2O68A 4NF6B 4OWDA 4PFYA 2ZXTA 4ZEIA 1B4HA 2HAVA 4NF5B 3HN0A 3K6WA 3TZAA 3FJMA 3JZJA 3EN3A 2DE4A 1M5BA 3OENA 2PX1A 4XXUA 3O66A 3I3VA 1LFGA 2VP1A 2D3IA 1LCFA 3HSTA 1IXIA 5LOMA 1GR2A 3U1OA 1H43A 2X26A 3OEKA 4Q30B 4JBZA 4XKPA 2O7UA 4KD5A 2O1LA 2HZKA 2F78A 3HHGA 1AL3A 1SW1A 4RYAA 2P1SA 2XHDA 5CBSA 4GFRA 2O51A 1OLAA 2Y84A 4EDPA 5CMCA 5FTIA 2UVJA 4IGTA 3E9XA 4QFKA 2Y7IA 5I56B 3BFTA 2GRVA 4JB7A 4U4SA 3TTRA 1FTJA 4DZ1A 4O3AA 1Y4TA 3PPPA 5FHMA 1B5JA 3DELB 2DWAA 3TAJA 3PUXE 3RPWA 2V93A 1DTGA 3KG2A 4I9DA 2REGA 4R72A 3FGSA 4LUBA 2G29A 2F8DA 1MDQA 5I2KA 4DE8A 1FQFA 3W9WA 1XS5A 1I6BA 2VGQA 3MPLA 2I6EA 2H98A 3N5LA 3TKDA 3E4RA 5ISUA 1MM7A 3MQ9A 3U72A 1UIVA 3FD3A 4IO7A 5TP9B 2NXOA 3C35A 1B7HA 1CE2A 1IUDA 5F1QA 4LQ2A 4KR5A 3CG3A 2R9JA 4BDLA 3RT6B 2HFBA 2KLFA 4G68C 3PPOA 3QK6A 1A8EA 1MQHA 4FIMA 1MPBA 3IOTA 4LQ5A 1NNFA 2I58A 1B52A 3Q27A 4G77A 5KDTA 3VVDA 3EF7A 3C36A 2P2AA 3TELA 3OELA 3TTNA 3ILTB 2HCAA 4KPTA 3FVOA 2QS4A 1VE4A 4DDDA 2I49A 3UK4A 3PUVE 3UIFA 1B2HA 4R74A 4TQUQ 3QUFA 1PB9A 3ILUB 3SDFA 3SEVA 4EQ9A 4FAJA 2ONRA 2XXPA 1YCJA 1B1HA 3FXQA 3T9VA 2VOZA 4OFOA 3IX1A 3K0VA 2DQVA 1KWHA 3H7MA 3VLUA 3RLFE 1P1OA 3VXBA 3VLVA 3KN3A 4Q8RA 1IXHA 1T0KA 3B6TA 3MVWA 3ZKLA 2UXAA 1N04A 2I0CA 5AA4A 5FHOA 1IXCA 1MY1A 5EYFA 3QSLA 1MXXA 2ZYOA 3U94A 2RKMA 1B7ZA 5ICQA 2F7AA 3FUZA 4XTCQ 2QMXA 4NF6A 1JW5A 3V83A 2QJEA 2RF1A 4AB6A 4R6YA 1UTBB 4WEDA 4O3CA 1NKXA 1MH3A 4TLLB 1EU8A 3M3KA 4NF8B 1QUJA 4F18A 3O2AA 4LZ8A 3MW0A 3RN8A 4YKKA 5JK4A 4I62A 3LC8A 3OOAA 1SYIA 3PPQA 3FVNA 1N3XA 1F9BA 4QFPA 4R2BA 2RC8A 3MC2A 4PP0A 1B3FA 2QS2A 2ABHA 4H8IA 3KSJA 1LFHA 3TEPA 3TQLA 2DSFA 2B3FA 2XD2A 5H8NA 1N84A 2RCAA 1Y3PA 4H1XA 3SEUA 1QVSA 4BDMA 5CRYA 5AA1A 4MFIA 2QMWA 3UORA 4NTLA 3H6UA 3MVZA 5AA2D 1RKMA 3RQTA 5EHSA 4YMAA 1ZTYA 3FVGA 3IJOB 2H4IA 1B3LA 5B70A 1US5A 3O28A 4DXBA 4LATA 3GLBA 1M5DA 1TXFA 5I2NA 1OVBA 1II5A 3EHSA 4GD5A 3K1NA 4WEPA 4OFJA 3S9EA 4GLIA 3PD8A 4JSDA 5B7DA 2Y7RA 4PFUA 4F2QA 5JEIA 1CB6A 1H45A 3TUSA 1NMUA 4GL0A 4Z7EA 1POTA 5TP9A 5L9SA 5DTBA 3EHUA 3MBPA 3H03A 3PD9A 1B3GA 1D3KA 4HTGA 3KFMA 4IO4A 2RC9A 1SI0A 1Y9UA 1BIYA 2V3QA 2Y7WA 1ELJA 3S9NC 4OHNA 3QIMA 3C33A 4LA9A 3MVYA 1SVXB 1URSA 4ZEBA 5H8QA 1JVXA 1Z7ME 4H65A 1PBQA 4FORA 3SEXA 2F5XA 2V25A 1NH7A 4OMBA 3KGCA 1MY4A 1S9TA 1FTMA 2V3UA 3CR9A 1MRPA 4K3FA 5AA2A 3T9XB 1LSTA 5I57A 4FATA 4NE4A 1YAEA 1IXGA 4ISUA 3IB1A 1MY0A 4IO3A 2DXRA 5F7VA 4GXAA 1SI1A 3PU5A 1MY3A 1QKAA 5CM6A 4U1ZA 1DPPA 2QPQA 3I6VA 1B32A 5CMMA 4IY5A 3Q29A 3OSRA 3IJXB 3E13X 2YJPA 3KN7A 3D4CA 4ESWA 4UACA 2O69A 4R75A 4FECA 1QJMA 5AA4B 3U8QA 3PV0E 3R7XA 1VFDA 1FW0A 2NVUB 4L17A 3KBRA 1MH4A 3IO6A 2HZLA 1B3HA 2ZYKA 1ZKBA 2GHBA 1DMBA 3PPNA 1NNTA 4R6HA 4F39A 4YB7A 3IO4A 4KYDA 3OSQA 3PUYE 4ZDMA 3OO9A 2I4BA 2A5TA 1S50A 2O84X 5I59B 3OMBA 3G3JA 4F3SA 1O64A 1QULA 4ZEDA 3CI8A 1A55A 3BKIB 4N6PA 1UTBA 2BJJX 4KYSA 2NOOA 4F1YA 4NF8A 4DXCA 4DCXA 4GQOA 1B1XA 1N0TA 1XT8A 4QSDA 1R9LA 3USDA 4ZECA 5J1DA 1NNPA 5H8NB 3TYHA 1ZMGA 4OYVA 1NFTA 4I1DA 4TOZA 4EF2A 2DVZA 4OXVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QRYA 1FQEA 2Z23A 4Q5TA 4G2ZA 3Q26A 4EXLA 3VVEA 1B7UA 3KC1A 4N8YA 4MH5A 5K2YA 4ZZAA 2QVVA 5CBRA 1MXYA 1FBPA 3KZGA 1P1UA 1SQYA 1FPBA 1RDYA 3RTFB 4NF0A 2OX3A 4R2FA 3V5AA 1OIBA 4F2OA 2ZNSA 3ISPA 3FJGA 4NGUA 3MZ9A 1Y3QA 4O3BA 3B7DA 1N3WA 1GGGA 2XXWA 3CRBA 5I2NB 2KQZA 2RCBA 3FV2A 2I3WA 4GXSB 1IMBA 4F3GA 1OVTA 4H6DA 3OEMA 3U92A 2HPGA 4C1UA 2DS9A 4HE2A 3KOSA 1RDXA 1UIUA 3A09A 4KI0E 4PC9A 3K01A 2O6AA 2DOJA 1DSNA 1MDP1 1IITA 2OWZA 4QF9A 3TCFA 2OBGA 5CMBA 3VLWA 2CZHA 4RK9A 1M5FA 4MBPA 2F35A 5H8QB 4YKIA 5JTYA 4GRKA 3V8XB 3G7WA 3T1BA 1OMPA 1Y1MA 1FBCA 4KCDA 4YICA 1QW0A 1FQBA 2UVGA 5DEXB 1FCKA 3PMWA 1Y4CA 4AB5A 1ZJLA 1UQWA 5FTHA 3T93B 1UTHA 1WDNA 4BDRA 2IEEA 3RNNA 2Z8DA 1MQIA 4JXIA 3T96B 1LGBC 4OVJA 2QSXA 2X7PA 3K2DA 3TTLA 5AA2B 5L9OA 4HW8A 2ZNUA 3W15C 5I57B 1BP5A 1LAGE 4FEBA 2GFEA 4HCYA 2HXWA 3FVKA 4P1EA 2XX7A 4NG7A 4GIZA 3O29A 3L6HA 3TODA 3VXCA 2OJTA 5L9MA 4GX3A 3TTKA 2R71A 3PUZE 1XOCA 1VR5A 5DT6A 2DVCA 4H67A 2Q2AA 4H45A 4OENA 4RNSA 1FTAA 2PT1A 3MPKA 4AQ4A 1LCTA 3EPEA 4RXLA 1R9QA 1NV4A 3O6HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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