2I4CA

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with bicarbonate and calcium
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
401
structure length
401
Chain Sequence
PEMMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Transport protein
molecule keywords Bicarbonate transporter
total genus 144
structure length 401
sequence length 401
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA01
4LZ7A 1FCKA 5JTYA 3C33A 1B2HA 1B7ZA 2OK2A 3IX1A 5I59B 2Z8DA 2V3TA 1HSLA 4OMBA 4ZEKA 5K2XA 3QXMA 5H8HB 3T9UA 1P1QA 2B3FA 3G3HA 5F7VA 4Z0IA 2O7UA 2XXUA 2CZLA 3T96B 3KJ7A 3MVZA 3U92A 1UIUA 2F34A 4LP2B 3K01A 5CMBA 5FTIA 5H8HA 1N76A 1MXVA 1BIYA 2HAUA 4NF6A 1EU8A 3K1MA 4MLQA 2NVUB 3RTFB 3T93B 5DEXA 4AQ4A 3LUYA 2DVCA 1LBCA 2GRVA 2H98A 2M8CA 3MC2A 3G3FA 4FAJA 3M3KA 2RF1A 4G2ZA 4QRZA 2XX9A 1UIVA 1MXZA 1JETA 2HAVA 2F8DA 3PD9A 3U94A 4JSOA 4X1BA 3UK4A 4F1YA 2AL4A 3IORA 3SEXA 3OEMA 1B5IA 1N3WA 2PT2A 1ZJLA 3QSLA 3RGYA 3VLUA 2F5XA 3PPNA 4IB2A 4EDPA 3N6TA 4R2BA 3W9VA 1I6BA 1NMUA 1B6HA 5H8NA 2HCAA 4OZ9A 5FTHA 3FXQA 2ZYNA 3TZAA 1JW5A 4BDOA 4IO7A 1MXYA 3MJNA 3MP6A 4Q30B 4QFOA 2Y7RA 2DXRA 2GFEA 4DLDA 1ZKBA 2OBGA 4JWYA 1AL3A 3EHTA 3VVFA 3V89B 4U4SA 4F18A 3ECRA 4NWCA 5CBRA 2ZMBA 3OO6A 3K0VA 3FV2A 3FATA 3IO4A 5J1DA 3R26A 3MBPA 4POXA 5ITPA 2HEUA 1MPCA 1BP5A 2F6PA 5AA2B 2VHAA 2XD2A 5H8FA 1N3XA 5EYFA 2QS1A 4MH5A 1XT8A 2H5YA 3S9LC 3LBSA 3O28A 2GHBA 1FQCA 4F3GA 2A5TB 4H8JA 3G3GA 3RQTA 2X26A 3S4UA 1A8EA 2XXTA 4ZS9A 4NE4A 1Y3QA 4KD5A 4ZEFA 2Q89A 3T9XB 5I58B 1URSA 4EQ9A 2DVZA 3CFLA 3H7MA 3GBBA 5B7DA 4ELRA 1ZLQA 4QSCA 3PPOA 3UP9A 4EF2A 1S9TA 1BTJA 2DP8A 3CFZA 3PPRA 1ZTYA 1MY4A 4ESXA 4EQ7A 3QYTA 5IAIA 2OCUA 3PUXE 4GFRA 4UACA 1FQAA 2HZLA 3H6UA 3U1OA 2BJJX 1SBPA 1Y1ZA 4H8IA 3DLNA 4ELOA 1B51A 3JZJA 4DCXA 2NXOA 3VVDA 1OMPA 3IL1B 3SESA 4F2OA 3PPQA 3OELA 4YMBA 3QAXA 2YPNA 1B3FA 2ANJA 3HSTA 3IOVA 4GRKA 5DVFA 3RLFE 4OFLA 1POTA 2E0SA 5FHMA 4C0RA 4EF1A 1IEJA 3MZBA 2WKYA 3N94A 5AA2A 3OD7A 4FJPA 4TQUQ 4GLIA 4OYVA 4BDNA 4XKPA 3FUZA 1HSJA 1JVYA 3G3KA 3FXRA 3IR1A 4KFQA 3S9NC 4F31B 3KGCA 4DE8A 1SI1A 3Q29A 5ISUA 3OEKA 4L17A 1IXGA 3VVEA 1OQGA 2XXWA 3CIJA 3KEIA 1DMBA 4OFOA 1TXFA 3DP8A 3FVOA 1OLAA 2I0CA 2FYIA 2W7YA 1L5TA 1JEUA 4QF9A 3UN6A 3TDJA 1MS7A 1WVJA 2OJTA 4BDMA 2V3UA 1RYXA 4F3SA 1H76A 1XVXA 3BBRA 3TCFA 3QK6A 4OTEA 4G68C 5FHOA 1POY1 3U8QA 2VD2A 3B7DA 3EHSA 4YU0A 4ZE9A 4LVQA 2R9JA 3A3CA 2DWAA 2G29A 4KPTA 2RKMA 1US5A 5I2KA 3EHUA 4OEUA 4K3FA 2D21A 4NEDA 4POWA 1NNTA 5DVJA 3W15C 5AA4A 1MPDA 4DIGA 5KCJB 3PUVE 2O84X 1SW1A 4HCWA 4FORA 3Q25A 4OWDA 4R9FA 4JB7A 4G68A 1T0KA 3SEVA 1VFEA 2QS4A 1GTKA 2ZYKA 3T9VA 4G4PA 4PFYA 1P99A 4ONYA 3ILTB 1Z7NE 1B7UA 2X7PA 3F11A 2RC9A 3SETA 4H67A 3PUZE 4RK2A 2RC7A 4YB5A 5LOMA 4MBPA 5TP9A 4ZE8A 4M1VA 2O6AA 2I3WA 5CMMA 3MP8A 4XIGQ 1MRPA 2OWTA 4IO2A 1B9JA 1VE4A 4PE5B 1R9LA 2H4IA 2HFBA 3N26A 3OO9A 3THIA 1AIVA 4AB6A 1SW5A 1Q1KA 3K2DA 3C34A 5DYHA 4NF5B 5AA3A 4R73A 5I58A 1LFHA 3DM0A 1FTJA 2UVJA 4JXIA 3HO7A 3V83A 2DQVA 1MH4A 4HCYA 4JWXA 3FD3A 1AMFA 3Q26A 1A99A 4ND9A 4YKJA 3M3LA 5AA4B 1EZOA 4KCCA 3FGSA 2HXWA 2GH9A 3H3GA 2REGA 3PD8A 4ZZEA 3VFJA 1A40A 5DT6A 3VLVA 2RCBA 4F3BA 5KDTA 4H5GA 3PMWA 3M8UA 1QULA 4YICA 4QFNA 3SEWA 3IJOB 5AA1A 3ILUB 1N7WA 3E4RA 2ZXTA 3L6HA 4IGRA 4GL8A 2RINA 3TQLA 1II5A 1N0TA 2XXHA 3C35A 4RXLA 3FVNA 1NNPA 1SYIA 3FXUA 1ATGA 1QUIA 1Z7ME 1R1NA 2V25A 4H5FA 4HS7A 3CSGA 5FHNA 2REJA 3RNNA 5IKBA 3QUJA 3H4ZA 3GZGA 3CG1A 3WAEA 1IXHA 3LC8A 4IO5A 2ZYMA 1H3DA 3U72A 5I59A 1B3HA 3KJTA 3IAZA 1B3LA 2UYEA 1B3GA 1JNFA 3CR9A 1FQFA 1MXWA 3E9XA 3SDFA 1P1OA 3TTLA 1JQFA 4RPOA 1MG1A 3MP1A 5HM4B 4BDQA 1YCJA 2IEEA 2QPQA 3H06B 2H9BA 4F3PA 3O6GA 1URDA 4FEBA 2I4BA 3RUMA 1IUDA 4H6DA 3QUFA 5CI5A 2F35A 2G93A 2Y7IA 1FTLA 4ZEBA 1H45A 4OESA 2FNCA 3TFLA 3KSXA 4R6KA 3TODA 5DEXB 4XKRA 1TT1A 3RTWB 3KZGA 3IOUA 2I49A 2UVHA 3MZ9A 3Q28A 2O7IA 3IJXB 3PMXA 4O3AA 5ICTA 3TEPA 2Y7PA 3S9EA 2I4CA 1JEVA 3L6GA 3OSQA 2XXYA 4U23A 4F19A 4ELPA 1PBQA 2XX8A 3C9HA 1URGA 2HQ0A 2R71A 3LSFB 1NL5A 1QW0A 1B1XA 1FTMA 3HN0A 3O9PA 1N84A 1O63A 1UTBA 2Q8JA 3RT8A 1B58A 4DCYA 4E0XA 3OENA 3ZKLA 2F97A 5CMCA 1NH7A 3OO8A 3OO7A 4BDLA 1QUJA 3TYHA 4U1OA 3TPAA 2UVGA 3KOTA 5HPQA 2D5WA 3CSBA 2F7AA 5EHMA 2V3QA 2O1LA 1LAXA 3U93A 1JVXA 2Z8FA 2F7BA 3PPPA 3KN3A 2XXPA 4NF5A 1DOTA 2XXQA 5TU0A 1B05A 2QMXA 5I56B 3E3KA 1QUKA 2PBWA 3DP6A 4AB5A 3IB0A 3FVKA 3K6WA 3TKDA 3H6WA 2VP1A 4IO6A 3K1NA 3I6VA 1MQIA 1XHYA 2ONKE 3FJ7A 1QJMA 3KOSA 2ZNTA 4FIMA 4YZZA 1USYE 4RY1A 3IO6A 3W9WA 2Z22A 3ONMA 4I9DA 5L9SA 1IZ1A 5CRYA 4GXAA 1ZMGA 4NMYA 4PQJA 3VXBA 2DWIA 1O7TA 2D3IA 1I69A 1J1NA 3C4MA 3VLWA 2DWJA 4MFIA 2RC8A 3T66A 4F1UA 3USDA 5EHSA 3CVGA 2QSXA 2O1MA 4NF8B 1MY3A 1UTBB 4NF4B 1EH3A 2DE3A 5L9MA 1LB8A 3G7WA 4OXVA 3TCGA 4F22A 1MM6A 1MQJA 3HCQA 4G8NA 3BFTA 2XXVA 3LSLA 4JWOA 3JV9A 5CMKA 4JBZA 3TCHA 1A54A 1N04A 1RYOA 3V5AA 5H8NB 1FQBA 2YJPA 1MQHA 2DSFA 1DPEA 4IO4A 1NKXA 2RCAA 4PFTA 3MUQA 2O68A 1FQEA 1D9YA 1ZBMA 4UA8A 1B3EA 2P0SA 1MXXA 1GGGA 1B46A 2ESNA 1B0HA 3FASA 4KCDA 1XVYA 2Q2CA 3I3VA 3H03A 1P1NA 1LLSA 1M5CA 2PX1A 5JTYB 1QKAA 2DOJA 4GXSB 1OLCA 1MQGA 2OZZA 3MPKA 2XD3A 4TOZA 3T9HB 4YB7A 1MY0A 4F39A 4LUBA 2XXRA 3GXAA 3AXFA 3MVWA 3VXCA 2DXYA 4H65A 1OIBA 5BUUA 3LR1A 4BLAA 2B3BA 2NUVA 3MW0A 3H6TA 3MQ9A 4P11A 4X9TA 3TTKA 3VV5A 3O6HA 1IQ7A 2QS2A 5AA2D 3OOAA 4GQOA 4GIZA 4NF8A 2QMWA 4WEDA 5TPAA 1Y4TA 2UVIA 3D4GA 4NF6B 4LZ5A 4WXJA 3FZVA 5M2VA 1A55A 3UGWA 1QKBA 3WAFA 1DSNA 2ZYOA 2XX7A 4O3BA 5I2KB 3S9MC 1CB6A 4PFUA 1PDAA 3OSRA 1A8FA 1VFDA 3C32A 4OFJA 2QS3A 1B4HA 2DYXA 1PC3A 4NWDA 1B52A 2A5SA 2I58A 3C31A 3IB1A 4RYAA 3TAJA 1R6ZA 1SYHA 4G68B 1N7XA 1D9VA 1DTGA 1SDXA 4QHQA 3RY3A 1OQHA 2DS9A 3A3UA 5ICQA 3IOTA 3KN8A 4JSDA 2DE2A 4QFKA 2QJEA 1B5HA 1USYH 1MDP1 1S7YA 4THIA 4LONB 4KHZE 1UTHA 2XXIA 4R6HA 2F36A 2DE4A 3N5LA 5TP9B 3VE1B 2AYSA 3G3JA 1MM7A 2E1SA 1LSTA 4G8HA 3KSJA 1NNKA 2ONSA 3E13X 4RA1A 1NFTA 1KWHA 2PMSA 3B6TA 4QFLA 4RNSA 4QSEA 4U22A 1H44A 2Z8EA 3O6IA 4FEDA 4YMAA 5BWJA 4DXUA 2XXXA 3RT6B 4OEVA 1B5JA 2VGQA 2X7QA 3H6VA 4MLVA 4R6YA 4YKPA 1NNFA 3B6QA 4U2RA 1Y4CA 3TTNA 4Z7EA 3GLBA 1SD3A 3CFXA 1LAHE 2A5TA 2ONRA 2O69A 2V93A 2Y84A 1D3KA 4DXBA 3MVXA 1P1UA 3FJGA 3R7XA 2F78A 4NF4A 1GV8A 5I2NB 4WEPA 4OERA 1MH3A 4QSDA 3A09A 4MF3A 3K02A 4GL0A 1ELJA 4RK9A 5H8QA 1IITA 1IXCA 4FECA 1NH8A 5KDTB 1PB9A 3B6WA 4KYSA 3I5OA 4G8MA 5F1QA 1MPBA 3C36A 3DP4A 3CRBA 3PUYE 5I2NA 4BDRA 3BFUA 1LCTA 4LATA 4ELQA 4X1DA 3CI8A 5H8QB 1UTHB 4H0WA 3K6XA 3O29A 4OHNA 4ZEIA 3K6UA 3N6UA 1YAEA 3TUSA 1IIWA 1GR2A 4P0IA 2I0BA 3MWBA 3RN8A 3K6VA 3KBRA 1GVCA 3SEUA 2ABHA 1MY1A 4TLLB 4DZ1A 1WDNA 5L8DA 3KN7A 3R6UA 3TTMA 1SVXB 3IOWA 1VSOA 1EZPA 1M5DA 1LB9A 2H25A 4KR5A 4XTCQ 3K00A 1BKAA 3UA8A 4IGTA 1B4ZA 2PVUA 5H8FB 4LZ8A 2Q2AA 4N13A 1MQDA 1RKMA 2LAOA 3KFMA 4YKIA 4XXUA 1B32A 4XKQA 1B40A 1XC1A 2QL3A 2UXAA 4ISUA 4R9GA 2I3VA 2CMOA 1R9QA 1PEBA 3EF7A 2YLNA 4M4GA 2Y7KA 1SI0A 4R74A 4YB6A 2FA7A 3MVYA 4LA9A 4OQOA 5ITOA 3RPWA 2O51A 4E0WA 1AOVA 4EUOA 3K4UA 4HTGA 3G3IA 1ZU0A 1JW4A 4PFWA 2AL5A 3OXNA 1CE2A 3DELB 3UORA 3PUWE 3HV1A 3VDFA 2DWHA 3MPLA 4WKMA 4F29A 1YTVA 4RJZA 3IK6B 4GOTA 3CG3A 4IO3A 3S2VA 4N6PA 3EQ1A 1ZIUA 2PT1A 2VD3A 2XHDA 3FIRA 1PB7A 1LFGA 3ZKKA 4FATA 3PGFA 2Q9TA 4R75A 5DTBA 1Y1MA 3IB2A 2I48A 1MDQA 3PV0E 2KLFA 1HSEA 2P2AA 1LGBC 5I56A 2AIXA 4EQBA 4ESWA 3HHGA 4JDFA 1UQWA 2THIA 1Y20A 1Y3NA 5K2YA 1M5EA 5DVIA 3LSWA 3ZS6A 1MXUA 1IXIA 3D4CA 4ZZAA 1B7HA 1I6QA 5AE4A 1Y9UA 2F6GA 3JYRA 2B65A 3O2AA 4Q5TA 4EXKA 5JEIA 5I84A 1MY2A 1SQYA 4KYEA 2Q88A 1M5BA 3HPIA 4YKKA 1LAFE 5HBCA 4LQ5A 1FTKA 5H8SA 1XOCA 4Q0CA 1JW1A 3T22A 3M3FA 5CM6A 5KZTA 4R2FA 4YAHX 4PETA 1OVTA 3TELA 4PP0A 4X48A 3TQWA 2Y7WA 5I57A 3SEYA 5L9OA 1QVSA 4TLMB 1DTZA 1F9BA 2OWSA 1SW2A 2UYFA 3P7IA 1PB8A 3OMBA 5A5XA 2I6EA 4XKNA 4ZECA 1M5FA 5KCJA 4HW8A 1B0LA 2H99A 3EPEA 4GD5A 4GF8A 2QRYA 1VR5A 3V8XB 3MAMA 3HHFA 4H1XA 1O64A 3FVGA 3PU5A 4ZEDA 2ALUA 4KI0E 1P1WA 3MZ1A 1OVBA 1TFAA 4U4XA 2F7CA 3SKPA 1Y3PA 4F2QA 4NTLA 1H43A 4G77A 2NOOA 3LSXA 4QFPA 4ECFA 5CBSA 4GVOA 1LFIA 3UIFA 1YPNA 1DPPA 3ODBA 3FJMA 5JK4A 4I8CA 1WODA 4EXLA 1S50A 1US4A 4I1DA 4IY6A 1AH5A 1EZ9A 4IY5A 4KQPA 5TPAB 2HZKA 1D4NA 2PYYA 1TWYA 1LCFA 1ANFA 3BKIB 3KG2A 2NWJA 4O3CA 1SW4A 3O97A 4C1TA 3Q27A 1PBPA 5B70A 2OLBA 4OENA 1I6AA 4GWOA 3PMVA 4OVJA 4Q8RA 4RPNA 1A7LA 3QIMA 4KYDA 5ELVA 2ZNUA 4I62A 5I57B 1LBBA 1TFDA 4OETA 1XS5A 4P0GA 4FE8A 4F1VA 5A5XB 4U1ZA 3K1PA 4ZDMA 4U21A 1FTOA 2ZNSA 3O66A 1B1HA 3TTRA 4DDDA 4C1UA 1LAGE 2IA4A 3TMGA 1FQDA 2V84A 4R72A 2P1SA 4DXCA 2GHAA 4N07A 1FW0A 5CC2A 3GBAA 2VOZA 2Z23A 2R6GE 4LQ2A 3SERA 1Q35A 3ZSFA 3EN3A 1BLFA 3FV1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B2HA 2V3TA 1HSLA 5K2XA 3QXMA 2B3FA 2CZHA 1UIUA 2F34A 5J16A 5FTIA 2HAUA 2NVUB 2H98A 3MC2A 3M3KA 1FBHA 3PTYA 2WX9A 3SEXA 3QSLA 1ZJLA 3VLUA 2F5XA 2WEFA 1I6BA 5H8NA 2HCAA 5FTHA 3KC1A 3TZAA 4IO7A 3MP6A 2DXRA 3EHTA 3ECRA 1EYJA 3K0VA 3FV2A 3IO4A 3R26A 1XI6A 1MPCA 2VHAA 5H8FA 2QS1A 2H5YA 3O28A 4H8JA 1A8EA 4O8MA 4ZS9A 1Y3QA 4ZEFA 1ZLQA 3B50A 3PPOA 1BTJA 2DP8A 4P1EA 1ZTYA 2BJJX 4H8IA 1B51A 4DCXA 3VVDA 3SESA 4F2OA 3PPQA 4YMBA 3HSTA 4GRKA 2WKYA 5AA2A 4FJPA 4GLIA 4XKPA 3FUZA 1HSJA 3IR1A 1IXGA 3VVEA 2XXWA 3CIJA 1TXFA 2I0CA 5EYGA 1WVJA 1XVXA 3BBRA 4LN5A 3EHSA 4GBWA 4ZE9A 3A3CA 2DWAA 4POWA 5KCJB 1NNTA 3PUVE 4HCWA 4AS5A 3Q25A 4ONYA 3ILTB 1Z7NE 1B7UA 4RK2A 5LOMA 5TP9A 4M1VA 3MP8A 4XIGQ 2HFBA 1FPJA 4I3EA 2UVJA 3HO7A 2DQVA 1AMFA 1A99A 2GH9A 3H3GA 2REGA 3PD8A 1A40A 5FBPA 4H5GA 4YICA 3D1RA 4GL8A 2RINA 3FXUA 4H5FA 3CSGA 2REJA 3GZGA 5I59A 2Y5LA 3IAZA 1RDYA 1MXWA 3CHGA 4RPOA 1MG1A 4PCDA 5HM4B 2IEEA 2H9BA 4H6DA 2Y7IA 1FTLA 3TFLA 3KSXA 4R6KA 4XKRA 2QVVA 3RTWB 3IOUA 3Q28A 5ICTA 1PBQA 4KFQA 2HQ0A 1NL5A 1FTMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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