2I4CA

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with bicarbonate and calcium
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
401
structure length
401
Chain Sequence
PEMMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Bicarbonate transporter
publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
total genus 144
structure length 401
sequence length 401
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA01
1NH7A 2R9JA 3K02A 3VLWA 4F3GA 4QFLA 4K3FA 4YU0A 3GXAA 3S4UA 1D4NA 1UIUA 3D4CA 1R9LA 1WODA 3OXNA 3H6VA 1YCJA 3OEKA 4R2BA 1J1NA 1ZLQA 1MY3A 1FQCA 5ICQA 4EXLA 1B3EA 4ESWA 5KDTB 4GD5A 3L6GA 1B1HA 4R9GA 2H99A 2XXIA 3DP8A 4R74A 1DSNA 2NOOA 2A5TA 4ELQA 5H8FA 1A99A 3TKDA 4X1DA 1B58A 1UTHA 1XHYA 3EHTA 4KCCA 3OEMA 4N07A 2ABHA 2DSFA 3Q27A 3UN6A 3E13X 1TFDA 1TXFA 4ELPA 2QMWA 1I6AA 4NMYA 5DYHA 3IOTA 1VFDA 2FA7A 3W15C 1P1WA 3TCHA 5HBCA 5I59A 1S9TA 4QFKA 1OLCA 1JVYA 3T22A 3R7XA 3FATA 2F7BA 4I1DA 3U94A 2AL4A 5TPAB 4GL0A 2DXRA 3PD8A 1A54A 3ZSFA 2DWAA 2I49A 5KDTA 3K01A 3FZVA 1AOVA 4YZZA 4HCYA 1NH8A 3PMXA 4LONB 1MPBA 4H65A 5I58B 4DCXA 1PDAA 3PUZE 1LCFA 2H4IA 4ESXA 5BWJA 4ZZAA 5CMCA 4U21A 4O3CA 3C35A 2WKYA 2HZKA 3LSFB 4GQOA 4FEBA 3CFZA 3BBRA 3A3CA 3H03A 5FHMA 3RNNA 4EF2A 1F9BA 5JTYB 2UXAA 5TPAA 4FJPA 4U22A 2ZYKA 3L6HA 1Y1MA 4DXCA 1JQFA 2A5SA 3CG3A 4JWXA 3IB0A 1SI0A 1EU8A 2GH9A 3FJGA 5I84A 4OVJA 3IO4A 1R1NA 4LZ5A 1Y3PA 1MY1A 1RKMA 3U72A 3LSXA 4F1VA 4ELRA 2DWHA 1B46A 5CBRA 1M5FA 4U4SA 2AYSA 3JV9A 2F35A 4WXJA 2GHAA 1MS7A 4LP2B 1B7ZA 1H45A 4NF6B 4QRZA 1Y20A 3GLBA 2I3WA 4GIZA 3MVXA 4QHQA 4THIA 5JTYA 4JWOA 1UQWA 1LBBA 2QRYA 1B3FA 3B6TA 1N04A 4JWYA 4O3BA 3ILUB 2V3UA 1TFAA 3C31A 3TPAA 5CBSA 3T93B 4F22A 4N6PA 3QK6A 4ZE8A 3FVOA 2FNCA 2PT2A 2YPNA 1WDNA 1N7WA 2O1MA 3W9VA 5DVFA 4KYEA 1JEVA 1I6BA 4AB6A 4RPOA 5L9OA 1IZ1A 1URSA 4PP0A 4ZDMA 2I4CA 1AIVA 4FIMA 5AA4B 4WEDA 4IO5A 2V3TA 4NF6A 2I4BA 5IKBA 1SW1A 1Z7ME 4IB2A 4JDFA 4IO6A 4Z0IA 4XXUA 4F29A 2NUVA 1MY4A 4NF5B 3VVEA 3M3FA 2XXWA 4H8JA 5M2VA 4RPNA 3E4RA 3T9XB 3M3LA 4YAHX 1NNTA 4YB7A 4H0WA 2F7AA 2B3FA 1HSJA 4MF3A 1Y1ZA 1EZOA 4OFOA 4DXUA 3VVFA 2Y7WA 3RUMA 3FASA 4HCWA 4ZEIA 2ZNSA 3KOTA 3PPOA 1MPDA 4M4GA 1SVXB 2QS3A 2XD2A 5JK4A 1LCTA 3AXFA 3P7IA 5AA4A 2QS1A 2G93A 3D4GA 5AA1A 4Q8RA 3GBBA 5DEXB 3ZS6A 1MXWA 3Q28A 4NF8B 1MQHA 1SW2A 1II5A 1B05A 3OSRA 5CRYA 5DVIA 1JEUA 3A09A 4IY6A 1NNFA 4NF5A 1AH5A 3OO9A 1JW4A 4GL8A 4ONYA 2RC7A 3PGFA 4Q5TA 2AIXA 5TP9B 1O63A 1B9JA 1POY1 3K1MA 5ISUA 4U23A 2OBGA 1B40A 1QVSA 3CI8A 4KD5A 3OO6A 3O29A 2X26A 2XXVA 4R2FA 2W7YA 1USYE 2V93A 4FE8A 1OQGA 3KJTA 2E0SA 5FHNA 4IO3A 5DEXA 1DTZA 3TAJA 4PFWA 4NF8A 2OCUA 2ZNTA 2UVHA 1Y9UA 4BDQA 4IGTA 1MM7A 1DPPA 1MQDA 3SEYA 1IXCA 4U4XA 3PPQA 1N0TA 3IJOB 4G8HA 1B7HA 3K6XA 4X9TA 3PUXE 1B5JA 4HS7A 3SDFA 1S7YA 1ZTYA 1ZMGA 5FHOA 3H6WA 2D3IA 4R6YA 4EUOA 1HSLA 4G8NA 5IAIA 4EQ9A 4F3BA 1MPCA 3MVWA 4PFYA 2XXUA 4I62A 5F1QA 1PBQA 1ZIUA 2NWJA 3IJXB 3N5LA 3DP4A 4NF4B 4R6HA 3FVGA 2PX1A 3WAFA 3KGCA 3CRBA 3O6IA 4DLDA 4PFUA 2A5TB 4U2RA 3N6TA 4YKJA 3VXCA 3LR1A 3FXQA 4TQUQ 3Q29A 3OELA 2DXYA 1CE2A 2DVZA 1WVJA 3V83A 3TELA 1OLAA 5KCJB 1QJMA 1JW5A 3H7MA 4FORA 3VXBA 3KN3A 5B7DA 3KBRA 1SBPA 5I59B 2I0CA 3CSGA 3DM0A 3EHUA 3G7WA 4KCDA 3VLUA 1LAFE 3CR9A 3Q26A 3FVNA 3IO6A 3C33A 3V8XB 3EN3A 2ZMBA 3VE1B 1JNFA 2F5XA 5CI5A 4NF4A 5H8QB 4F1YA 2Q8JA 1MXZA 4NTLA 1PB8A 4FATA 4POXA 1NNKA 4Z7EA 3KOSA 4P11A 4F2OA 4JSOA 3S9LC 4ZE9A 2DWJA 4LQ2A 3TTNA 1B32A 1ANFA 1FQBA 4PQJA 3S9NC 4U1OA 1US5A 5KCJA 1D3KA 2ESNA 4AQ4A 4UACA 3IOVA 2H98A 1YPNA 1B7UA 3UA8A 1SDXA 1LLSA 3ECRA 1N84A 3H4ZA 1MRPA 5EYFA 3VVDA 3PUYE 2X7PA 3H3GA 3QUFA 1LAXA 5CM6A 2H25A 2VOZA 5AA3A 2RKMA 2DS9A 3S9EA 2Q2AA 1ZU0A 1Y4TA 1QULA 3IORA 4O3AA 2CZLA 3RPWA 2VD3A 3HN0A 2RC8A 5H8QA 3T9UA 1FQAA 4R6KA 3IAZA 2ONKE 4YKIA 1MQIA 1LGBC 3MC2A 4QF9A 3F11A 3OO7A 4KQPA 2Q2CA 5L9SA 1JETA 3MBPA 1EZPA 2ZYMA 1SW4A 3JYRA 4FAJA 3QSLA 4ISUA 2P0SA 3C9HA 2UVGA 3TMGA 5CMBA 3KG2A 2UVJA 2REGA 4PFTA 4POWA 3LC8A 4BDLA 2I6EA 2M8CA 3ILTB 2RCAA 3FJ7A 3CFXA 3U1OA 4F1UA 1BKAA 4YB5A 3G3IA 1H76A 3ODBA 4LUBA 4GVOA 2GHBA 2F78A 3PMWA 3EHSA 3RTFB 3MZ9A 4DE8A 5TU0A 4EQBA 1BIYA 3A3UA 3FXUA 3H6TA 2XXQA 3IL1B 4OETA 1SW5A 4HW8A 4OXVA 2Z22A 4OFJA 2E1SA 3PD9A 4IY5A 1BP5A 1B52A 3LUYA 5HPQA 3QUJA 2O84X 1B3HA 1B5IA 2RF1A 3IX1A 3MQ9A 1MDQA 3KN8A 3TQWA 2DE3A 5I2NB 4ZEKA 4G68B 3PUVE 3CFLA 1FQFA 3U8QA 1URDA 2QSXA 4FECA 3T96B 4KYSA 4GWOA 2O7UA 2PMSA 3ZKLA 2Y7PA 4F3PA 1GV8A 4XIGQ 3TCGA 2UVIA 3O9PA 2D21A 1QW0A 4LVQA 1POTA 3W9WA 2VP1A 1QUKA 1H3DA 4BLAA 4Q30B 4ZEBA 3IOUA 3MPLA 3CVGA 2V3QA 4BDMA 1SD3A 1LAHE 3T66A 1LSTA 3CIJA 3PMVA 5B70A 4UA8A 4OHNA 3TODA 2REJA 1MY2A 4HTGA 1IIWA 1A55A 3UIFA 5I2NA 1OVTA 2GFEA 4G68A 4H8IA 2I3VA 3K1PA 3R6UA 2IA4A 1Y3NA 3OENA 3MZ1A 1SYHA 4KFQA 1MH4A 1PC3A 2F8DA 4XTCQ 3DP6A 5DT6A 1IXGA 2XXXA 3OD7A 2OWTA 2P2AA 4YMBA 2DOJA 3S2VA 5K2YA 1O7TA 3O66A 1L5TA 4BDOA 1Q35A 4OEUA 1KWHA 2F6PA 5ICTA 5ITOA 4IO7A 3FGSA 2ALUA 1M5CA 4RYAA 3SEXA 3MUQA 4YMAA 2HEUA 2ZXTA 4F2QA 4RY1A 1LB8A 2OLBA 2XXHA 2Q89A 1P1OA 3FV2A 1MXUA 5L9MA 4RJZA 1MQJA 1ELJA 3SESA 1NL5A 1MXVA 4ZS9A 3HV1A 3MVZA 3RGYA 1PBPA 3TTMA 3OMBA 3UGWA 2I58A 1QUJA 2NXOA 2Q88A 1NFTA 4OZ9A 5K2XA 4H5FA 3RQTA 3TCFA 4NEDA 1PB9A 1RYOA 2HQ0A 2XHDA 4G8MA 5LOMA 1SI1A 4N13A 4GRKA 2ANJA 3U93A 1IQ7A 2QL3A 2OK2A 1IITA 2FYIA 3FV1A 3C4MA 4E0XA 4GLIA 4ECFA 4C1TA 5H8NA 3LBSA 3KEIA 4OMBA 3KJ7A 4KPTA 3USDA 4TLLB 1QUIA 3K6WA 3FUZA 1P1QA 2ZYNA 2HZLA 5KZTA 4C1UA 4P0GA 3E3KA 1A7LA 5F7VA 4I8CA 4Q0CA 3TEPA 1H44A 4E0WA 3UORA 1JW1A 4I9DA 3O28A 3IB1A 1OIBA 3FXRA 3K2DA 2O69A 3SEUA 2Y7RA 3G3KA 1I6QA 1LFGA 3Q25A 2LAOA 3O6HA 1FTKA 1USYH 1S50A 1A8EA 1MDP1 2ONRA 4XKPA 3LSLA 3KZGA 5AE4A 1PEBA 1FTLA 4OFLA 2F7CA 1RYXA 2YJPA 2G29A 2IEEA 3G3GA 2HFBA 1R6ZA 4LA9A 4NE4A 4GFRA 1CB6A 3DELB 1BTJA 4L17A 4F19A 4NWDA 3N94A 3B6WA 4EF1A 4G2ZA 2PBWA 3THIA 1B6HA 4YKKA 1FTJA 2XXRA 3MWBA 4AB5A 2DVCA 1DPEA 4F31B 3MW0A 1B0HA 4RK9A 2XXTA 3B7DA 4LZ7A 3MAMA 3TTLA 5EHSA 2XXPA 1N7XA 1B0LA 3KSJA 2Z8FA 4H5GA 5L8DA 3K0VA 4RA1A 4XKNA 3UK4A 1XVXA 4OYVA 3LSWA 1D9YA 1EH3A 1JVXA 4H67A 4RK2A 4OTEA 1Y4CA 3RLFE 2HAUA 1XOCA 2YLNA 1FQEA 4QSCA 1DTGA 2DP8A 1MG1A 2VHAA 3FVKA 4R9FA 3PPNA 2D5WA 3EQ1A 1B3LA 3S9MC 4DZ1A 4YB6A 5ELVA 1B1XA 3I6VA 2O6AA 2V84A 2VGQA 1Z7NE 4GOTA 3G3JA 2X7QA 4QFNA 2AL5A 1Y3QA 1LB9A 3VFJA 4G68C 4F18A 4BDNA 1Q1KA 2XX8A 3SETA 3JZJA 5I56B 2HAVA 3TTRA 1XVYA 4OERA 1XT8A 3BKIB 3TYHA 1AMFA 3K4UA 3T9HB 2PVUA 2O7IA 1AL3A 2KLFA 5CMKA 5ITPA 4OQOA 1SQYA 3HHGA 5JEIA 2Y84A 1EZ9A 3T9VA 2I48A 4OWDA 3VLVA 3MPKA 1GTKA 3SEVA 4LATA 2DQVA 4GXSB 4PE5B 2B65A 3QAXA 2UYEA 3G3HA 2F97A 3QXMA 4MH5A 1MQGA 5I56A 1D9VA 4OEVA 1YAEA 3HCQA 3H06B 2RC9A 5I2KB 2UYFA 4FEDA 3OO8A 3G3FA 1FCKA 4M1VA 3MP6A 3E9XA 2PYYA 3HSTA 2I0BA 4X48A 3U92A 1B5HA 4IGRA 2Z8EA 1M5DA 4EDPA 2ZYOA 1TWYA 1QKBA 3FD3A 3PUWE 3K6VA 5I58A 3CSBA 3WAEA 3OSQA 2Q9TA 3I3VA 3C32A 1IUDA 3M8UA 4KHZE 3GBAA 4DDDA 2O68A 1VFEA 3GZGA 3QYTA 4H6DA 2V25A 5I2KA 2Y7IA 4YKPA 3IR1A 1N76A 2HXWA 2R71A 3IK6B 1VSOA 2BJJX 4NWCA 4X1BA 1GGGA 3MVYA 4G4PA 4OENA 3O97A 3ZKKA 1LFIA 3BFUA 1MXYA 1HSEA 5CC2A 4MFIA 1N3WA 1UTBB 1SYIA 4EXKA 1LBCA 4R73A 4C0RA 2ONSA 1M5BA 3PPPA 4DIGA 5FTIA 3C34A 1O64A 1B4HA 1FW0A 2QPQA 2XD3A 1ATGA 5DVJA 2QMXA 4IO2A 3SERA 3IB2A 3OOAA 4JXIA 5A5XB 3EF7A 1I69A 3V89B 1OQHA 5EHMA 2R6GE 2QS4A 4GXAA 1IEJA 2H5YA 2XXYA 1NMUA 2DE2A 3M3KA 3QIMA 3VDFA 3C36A 2F36A 4TOZA 1TT1A 3RY3A 4ELOA 1B3GA 3N6UA 3MZBA 1B4ZA 3HHFA 3N26A 2DE4A 2OZZA 4DXBA 4JSDA 4IO4A 1UTBA 3RT8A 1MH3A 2O1LA 4OESA 3ONMA 4ND9A 4QSEA 1FTMA 4R75A 1MXXA 3HO7A 2XX7A 4F39A 1LFHA 2O51A 3SEWA 4BDRA 2QJEA 3TQLA 5A5XA 3V5AA 3BFTA 5H8HB 5H8NB 5H8SA 3UP9A 3FIRA 2QS2A 2Z23A 4JBZA 1A40A 1XS5A 1P99A 5BUUA 1UIVA 3HPIA 1PB7A 3MJNA 1IXHA 3K6UA 1YTVA 3RT6B 2NVUB 3RTWB 3CG1A 4H1XA 1DOTA 3FJMA 4RXLA 2GRVA 1FQDA 5J1DA 3O6GA 4P0IA 3H6UA 1QKAA 2ZNUA 3PU5A 1H43A 5CMMA 3TDJA 1DMBA 2RCBA 4JB7A 2XX9A 1P1NA 1M5EA 3PPRA 2PT1A 4ZZEA 5I57B 5H8HA 1XC1A 1ZJLA 1FTOA 4U1ZA 2P1SA 1B2HA 2Y7KA 3RN8A 3EPEA 1P1UA 3TFLA 5AA2B 3K1NA 1NNPA 1ZKBA 4R72A 4TLMB 1NKXA 2DWIA 4QFOA 1URGA 4GF8A 3O2AA 3TUSA 1VE4A 2F34A 1R9QA 2HCAA 5HM4B 1IXIA 4XKRA 4YICA 2RINA 2OJTA 4LQ5A 3R26A 3IOWA 3KN7A 3MP1A 4XKQA 1OVBA 4G77A 2VD2A 3K00A 2DYXA 4ZEDA 1GR2A 5TP9A 4MBPA 3MP8A 4KR5A 1MY0A 4WKMA 4LZ8A 4MLQA 4QSDA 2F6GA 1A8FA 2Z8DA 1GVCA 5I57A 1B51A 2THIA 1T0KA 3DLNA 4QFPA 3KFMA 4EQ7A 1BLFA 5AA2A 2B3BA 4F3SA 1ZBMA 5DTBA 1N3XA 3SKPA 2CMOA 5FTHA 4KI0E 4ZECA 1US4A 4DCYA 4MLVA 3PV0E 3KSXA 1VR5A 5AA2D 5H8FB 4RNSA 1LAGE 1OMPA 4WEPA 1UTHB 3B6QA 2H9BA 3TTKA 3I5OA 1MM6A 4KYDA 4PETA 2OWSA 3VV5A 3TZAA 4ZEFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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