2I4CA

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with bicarbonate and calcium
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
401
structure length
401
Chain Sequence
PEMMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Transport protein
molecule keywords Bicarbonate transporter
total genus 144
structure length 401
sequence length 401
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4cA01
4QFNA 3UK4A 4XTCQ 3PMWA 1PBQA 4H0WA 4QSEA 2ZNUA 4NMYA 3H6UA 1EZ9A 1URSA 2I6EA 3UN6A 4F1VA 4X48A 1EH3A 2Q88A 5I59B 4OEVA 4U1ZA 1M5CA 4RPNA 2WKYA 1SW5A 1B05A 1QJMA 3FVGA 4DXUA 4OENA 3LSXA 3T66A 2V25A 2PMSA 3K0VA 1JNFA 3K00A 1B0LA 2HFBA 5KCJB 5ICQA 1JEVA 1H3DA 3HHGA 3K02A 2NUVA 1WDNA 2R71A 5CMKA 1RYXA 1Y9UA 2OK2A 2UXAA 3JV9A 5TP9B 2XXTA 4ZE9A 4G68B 2V3TA 4U23A 1GR2A 2AYSA 3CG1A 2IA4A 1SI1A 3MBPA 3C32A 1JETA 1RYOA 4QFPA 1IIWA 4OTEA 2PT1A 2UYEA 3IX1A 5I58B 1NFTA 3H7MA 3KN7A 3SDFA 4NTLA 3SEXA 3HN0A 3N94A 3LC8A 1POY1 3H06B 4KCDA 4NF6A 2ZXTA 3F11A 5CMBA 3KN3A 4BDLA 3OEMA 2DWJA 3O6HA 4JB7A 2O84X 4QF9A 3RT6B 2XXRA 3RTWB 1QW0A 1N76A 4YB5A 1VFDA 1NNKA 3BBRA 1BLFA 4LATA 1B1HA 1MM7A 5H8FB 3SERA 3DP4A 3L6HA 3H4ZA 2XX8A 2QMWA 3PPQA 1US5A 4PFWA 5DEXA 3MZBA 5ISUA 1IXGA 1O63A 1P1OA 2ZYOA 3OOAA 1MDP1 4XKRA 1B58A 4F3BA 4Q5TA 1N84A 1SBPA 4F29A 2D21A 3QXMA 3IO6A 3KZGA 2ZYKA 1ZTYA 2F34A 2I3VA 4LVQA 4QFLA 5H8HB 4GL8A 2DQVA 1CE2A 3W15C 3S9LC 1PBPA 5CBRA 2F8DA 2I4CA 3OSRA 2ONSA 2VHAA 1NH8A 3A3UA 3PV0E 4LZ5A 4N07A 4U21A 3UP9A 1VFEA 1AL3A 3VDFA 3OO8A 3C9HA 3M8UA 3VE1B 4HW8A 1CB6A 1DMBA 4YKPA 3WAFA 5A5XA 4FE8A 3JZJA 4ZEIA 1M5EA 3K1NA 3MC2A 3MWBA 4KHZE 2RCAA 4GVOA 1OQHA 4F1UA 4YU0A 1S9TA 1Y3QA 5CC2A 5DT6A 3MVYA 4ZEFA 4BDNA 1UQWA 5L9MA 2ONRA 3CFLA 2Q9TA 4KD5A 1FQCA 3Q26A 1DTGA 5JTYB 3B6TA 5I84A 4F2OA 3FGSA 1MPBA 2QS2A 3PUWE 4ESWA 4GIZA 4XIGQ 1QKAA 2QMXA 3FZVA 1O64A 2AIXA 1D9VA 2CMOA 4G8MA 4O3BA 3T96B 5B7DA 2QS1A 5IAIA 5H8QA 3UORA 5CRYA 3GXAA 3PPRA 2D5WA 1R1NA 2X7QA 4MBPA 1MQDA 1Q35A 1QUKA 1MS7A 1YAEA 2RKMA 3K6VA 2NOOA 4NF5A 4NF5B 4ELOA 3ZSFA 4I8CA 4O3AA 1RKMA 1LAGE 1MH3A 4MF3A 2AL5A 5K2XA 3LUYA 1GGGA 1L5TA 3K01A 5BWJA 1LB9A 4YMAA 4BDOA 4G8HA 3FV1A 1B5IA 1FQEA 3GBBA 3M3LA 2GRVA 2Z23A 4PQJA 1DTZA 3HO7A 5TPAA 2DOJA 4AB5A 3Q25A 3S9MC 3AXFA 2DVCA 1FQBA 1QVSA 3IB2A 1B6HA 4ZEKA 3MVWA 4PP0A 1OIBA 4MH5A 1M5BA 3LBSA 5DYHA 5L9OA 2RCBA 3OD7A 4TLLB 1O7TA 4XKNA 3TODA 5ITPA 5CBSA 3W9VA 2VD2A 1B0HA 1AMFA 1H44A 3HHFA 4U4XA 3TQWA 2DXRA 3T9UA 2E1SA 2Y7IA 2ZNSA 1Y3NA 4LP2B 4QHQA 5AA4A 4FORA 3TMGA 5A5XB 4YB6A 2F5XA 1B4ZA 1MQJA 2REJA 2X7PA 3O9PA 3OELA 3RGYA 5EYFA 2XXUA 3FASA 4LUBA 3G3JA 2XHDA 3TCHA 3PPNA 3A3CA 3R6UA 4ONYA 1A40A 3IOWA 2VOZA 4YKIA 1MPDA 2DS9A 2NXOA 1US4A 3G3HA 1UTBA 4QSCA 1FQAA 3LSWA 1B46A 1URDA 2H5YA 3D4GA 1MXWA 4LONB 2H4IA 1PB8A 4F19A 5FHMA 1OVTA 1I6BA 1I6AA 3TTKA 1POTA 3R26A 4P0IA 4DE8A 1AH5A 2OWSA 2PT2A 1IUDA 2B3FA 5CMCA 4RPOA 4F18A 2RC9A 2FNCA 5ICTA 3KEIA 3TUSA 3MZ9A 3ECRA 4R6KA 1A54A 4JDFA 2YJPA 1N7WA 4MFIA 5L8DA 1B52A 1JW1A 2X26A 2V93A 3EHUA 1B51A 3O28A 4DCYA 4R6YA 4GXSB 3GBAA 1NKXA 5L9SA 1R9QA 4X1BA 3G7WA 1B32A 3U92A 5AA2A 2ALUA 4GLIA 2HZKA 1A8FA 5H8NB 3IOVA 2HAVA 4LQ5A 5I56B 2O7IA 2QRYA 1MRPA 1JVYA 2XXXA 3FJ7A 3G3GA 3H3GA 1UTHB 1MY0A 1OLCA 1Z7NE 2B65A 1MY2A 1FTLA 1LCTA 1XC1A 2Q2AA 4IO4A 3QIMA 3RY3A 3Q28A 2V3UA 1TWYA 2I3WA 1B40A 2ZYMA 1LAHE 3BKIB 3KSJA 5F7VA 4QFKA 3RNNA 4IY5A 2Y7PA 1MG1A 5I59A 4I1DA 5JK4A 3T9VA 2P1SA 2E0SA 2F78A 2W7YA 4U4SA 1DPEA 4FJPA 1YPNA 3VLVA 2O7UA 1NH7A 2Z8FA 3FVKA 3QAXA 4R2BA 4EUOA 2DE4A 2Y7RA 1ZBMA 1LBCA 2Z22A 3C36A 3FJGA 3SKPA 3V5AA 3EHSA 1USYE 3KG2A 4RJZA 1EU8A 4U1OA 5HBCA 3CRBA 1F9BA 3OO6A 4H5GA 2BJJX 1B3HA 3KJ7A 1N7XA 2DE2A 4I62A 1PB7A 2I49A 3VLWA 1M5FA 4R2FA 5H8FA 2F7AA 3CI8A 2F7BA 2HXWA 3G3KA 3OO9A 4MLVA 5TPAB 3ZS6A 1DOTA 4Z0IA 2A5TA 1OQGA 1IZ1A 5I2KB 3HPIA 1Y20A 2VD3A 3FD3A 2UYFA 1A99A 3CR9A 3K1MA 4EDPA 5DVIA 1M5DA 1ZKBA 4U22A 1LCFA 1PDAA 1GTKA 3KBRA 3USDA 4DLDA 3KOSA 2AL4A 4LQ2A 1GVCA 4EF1A 1XS5A 1QKBA 4ESXA 3EPEA 3VVDA 4GF8A 4GRKA 4FEDA 3VXBA 3WAEA 4ZDMA 3E13X 1Z7ME 4PFUA 1TFDA 4RK2A 4ZS9A 1MH4A 1UTBB 1J1NA 3L6GA 4NWCA 3VLUA 4C1TA 1P1QA 3UGWA 1IXIA 3IL1B 3PPPA 5EHMA 4RXLA 3FXRA 3MZ1A 4TQUQ 1BTJA 3PU5A 1IXHA 4N13A 2D3IA 5DVJA 2Q89A 1B7ZA 3OEKA 3VVFA 4M1VA 3KN8A 4BDMA 2XXHA 3RLFE 2O6AA 3SEUA 3ZKLA 5K2YA 4Q0CA 3K6UA 2PBWA 3SETA 4H8JA 1OMPA 3TTMA 3ONMA 1H43A 2QL3A 3D4CA 4YB7A 5JTYA 4IO6A 3KSXA 3G3IA 5DVFA 1XVYA 2P0SA 4JBZA 4KI0E 1AOVA 3I3VA 3IAZA 3PD9A 1P1UA 3HSTA 4F31B 1SW4A 1TT1A 2G93A 3T9HB 4P11A 2O1MA 4E0WA 3M3KA 3PUYE 1Y3PA 4LZ8A 1I6QA 4KQPA 3W9WA 4JWOA 3JYRA 1IXCA 1HSEA 2I48A 3PUXE 4OMBA 5EHSA 4R9GA 3S2VA 4GOTA 2ESNA 4OWDA 2HCAA 1MDQA 2DSFA 4NWDA 4YKKA 4DCXA 4HS7A 1S50A 3Q29A 3V89B 3IORA 1UTHA 3HV1A 4JWXA 4RNSA 5H8QB 4OEUA 4ZZEA 3RPWA 4F3PA 4G4PA 3MVXA 3S4UA 1P99A 2DWAA 4OETA 1LFGA 4GWOA 4OFLA 2O51A 3TELA 3MAMA 1R6ZA 3CSGA 1SI0A 2Z8EA 3FJMA 2GHAA 3MW0A 5AA2B 1UIVA 4JXIA 3OXNA 3CG3A 2PVUA 4H67A 3T93B 4C1UA 1VR5A 4F1YA 1NNFA 4F3SA 1B7UA 4G8NA 4H8IA 4I9DA 4U2RA 4WEPA 5I2KA 1DSNA 5FTIA 1B3LA 4ELQA 3MVZA 3K4UA 3C31A 2V84A 4HTGA 4NF6B 3IK6B 4ISUA 4RK9A 4NEDA 1N04A 4F39A 4WKMA 1N3XA 4X9TA 3TTLA 4RA1A 1HSLA 1WODA 1ZJLA 3IB0A 4K3FA 4R74A 1IITA 1LAFE 4FIMA 3K1PA 4NF4A 1URGA 4G68A 3U8QA 2YLNA 1VE4A 4BLAA 3EF7A 3I5OA 1R9LA 1S7YA 3SEVA 4Q8RA 2GHBA 5I2NB 2NWJA 3SESA 2DE3A 3PD8A 3IR1A 4POXA 2NVUB 5LOMA 2UVGA 4IY6A 4DIGA 4KFQA 1JEUA 3KJTA 3LSFB 3C33A 1TXFA 3TCFA 4E0XA 1MY4A 2DWIA 1T0KA 3TTNA 3RN8A 3H6TA 3OO7A 4YAHX 1LLSA 1MXXA 2DWHA 3FXQA 4TLMB 3TDJA 3U72A 2FA7A 4POWA 3MJNA 4FECA 2ANJA 4GXAA 4FATA 3DP8A 5I56A 2H9BA 4F2QA 1ELJA 2Y7KA 3KGCA 4OYVA 5H8NA 5AA2D 3RT8A 5DEXB 3TFLA 3RUMA 3TAJA 5CM6A 1MXUA 2OZZA 4YZZA 1II5A 2CZLA 3S9EA 4OQOA 1BP5A 2OLBA 2DYXA 5FTHA 1B3EA 1B7HA 1SDXA 2I4BA 1JQFA 1NL5A 4GL0A 3O2AA 1D9YA 4LA9A 1MQIA 4NE4A 5TP9A 4AQ4A 5HPQA 4EXLA 3CVGA 4KCCA 4BDQA 1SVXB 5KCJA 4WEDA 3B7DA 4XXUA 4DXCA 5I58A 2Q8JA 3DP6A 2H25A 5ITOA 1BIYA 1Y4CA 2F6PA 2H98A 3N6UA 4KYDA 2UVHA 5CI5A 5F1QA 1WVJA 4NF8B 1GV8A 1D3KA 4OXVA 2ONKE 3QYTA 3IOTA 2XD3A 3EHTA 2QSXA 1N3WA 1N0TA 1SW2A 1JVXA 2DP8A 2F7CA 3TKDA 3FUZA 4F22A 3T22A 1SYIA 3FVNA 4OESA 1B1XA 4H6DA 4OERA 1Y4TA 4UA8A 3HCQA 3UA8A 4H65A 4KR5A 5DTBA 2LAOA 4R72A 1FW0A 2HAUA 5AA4B 2F97A 4QSDA 3T9XB 3S9NC 1BKAA 3BFTA 3O6GA 2Y7WA 3B6WA 1SQYA 2I58A 1H45A 2OWTA 2DXYA 3PMVA 1XHYA 1XOCA 3DELB 3Q27A 4RYAA 2ZYNA 3OENA 2REGA 3SEWA 4IO7A 1B3GA 3H6WA 1MXYA 2O1LA 3C4MA 3EQ1A 4YICA 2QS4A 2RF1A 5KDTB 2R9JA 3O29A 1B3FA 1Y1ZA 3LSLA 3CSBA 1LFHA 5TU0A 3QUFA 2HEUA 3KOTA 4IGTA 4DDDA 2XX9A 4WXJA 4XKPA 1FTMA 2UVIA 2VGQA 2FYIA 3QSLA 1ANFA 4X1DA 3GLBA 4KYSA 1ZMGA 3TPAA 4IO2A 1ATGA 3ILTB 4ELPA 4OZ9A 3A09A 3N5LA 1B4HA 1YCJA 3FVOA 1B9JA 2V3QA 1KWHA 1LFIA 1NMUA 1JW4A 2DVZA 1OVBA 4IO5A 4M4GA 5H8SA 4ND9A 4ZZAA 1EZPA 3DM0A 3DLNA 4PFTA 4O3CA 4OFJA 1MXZA 3E9XA 1LAXA 1MPCA 3H03A 1XT8A 1LGBC 1VSOA 4GQOA 2XXVA 2QJEA 3E4RA 3MPKA 3MP8A 4LZ7A 4G2ZA 5J1DA 4ECFA 3PMXA 5KZTA 2G29A 4TOZA 1IEJA 3K6XA 4EQBA 4HCYA 4Q30B 1MM6A 4NF8A 4L17A 1A7LA 3ILUB 3PPOA 3THIA 2M8CA 4THIA 2F36A 3U94A 4BDRA 3VXCA 3O66A 3IOUA 4PE5B 1B5JA 1LBBA 1P1NA 4RY1A 5M2VA 3MP6A 4FEBA 5AA3A 5HM4B 1MQGA 3OSQA 1FTOA 1MQHA 2XXPA 3PUVE 3FATA 2UVJA 3MUQA 5IKBA 4EQ7A 3FV2A 1TFAA 2IEEA 2Q2CA 2GFEA 2PYYA 3K6WA 3QUJA 1PC3A 3SEYA 3VFJA 4ZECA 1Y1MA 3IJOB 3O6IA 3ODBA 1ZU0A 1I69A 4ZEDA 1JW5A 4IGRA 3C35A 5AA1A 3GZGA 1FQDA 2O68A 3IJXB 3M3FA 4HCWA 4MLQA 5FHOA 5H8HA 4EQ9A 3FXUA 3V8XB 2ABHA 4YKJA 1MY3A 3FIRA 4EF2A 1QUIA 3CIJA 3TYHA 4AB6A 1USYH 4EXKA 2Z8DA 5AE4A 2Y84A 1HSJA 4PFYA 2XD2A 3TQLA 4PETA 3R7XA 5I57A 5I57B 2HQ0A 3K2DA 5CMMA 4N6PA 3E3KA 2XXWA 4ZE8A 3UIFA 4Z7EA 2XXIA 3ZKKA 1DPPA 3BFUA 1PEBA 4G77A 3I6VA 3U93A 1QULA 3TCGA 3B6QA 4P0GA 3TEPA 1ZIUA 4OVJA 2OJTA 1B5HA 3RQTA 2OCUA 1A8EA 3PUZE 3OMBA 3MP1A 3VV5A 5I2NA 1EZOA 3TTRA 4ZEBA 4R73A 1LSTA 1PB9A 4GFRA 2F35A 4NF4B 4OFOA 4F3GA 4XKQA 4JSDA 3TZAA 1OLAA 4QFOA 1NNTA 5KDTA 1XVXA 4JSOA 1UIUA 3QK6A 4FAJA 3H6VA 4R75A 2ZNTA 3PGFA 2GH9A 2XXQA 3IB1A 5BUUA 1H76A 2H99A 1MXVA 3MQ9A 4R9FA 2B3BA 3N6TA 4R6HA 1FTKA 3CFZA 4KYEA 1FQFA 3VVEA 2HZLA 1P1WA 1A55A 3EN3A 3N26A 5ELVA 2RC7A 4UACA 3U1OA 3LR1A 2F6GA 1SW1A 2R6GE 2VP1A 4GD5A 2ZMBA 5FHNA 1Q1KA 1SYHA 2THIA 4H1XA 2I0BA 1SD3A 4IB2A 4JWYA 1FTJA 2XX7A 1IQ7A 4YMBA 5B70A 4C0RA 4ELRA 2O69A 3CFXA 1ZLQA 1D4NA 1YTVA 3V83A 2PX1A 4H5FA 4DXBA 4G68C 4IO3A 4QRZA 1AIVA 2A5SA 2OBGA 2QPQA 2YPNA 2RC8A 3RTFB 3MPLA 2P2AA 4OHNA 4DZ1A 5JEIA 2RINA 2A5TB 1QUJA 2I0CA 1MY1A 3C34A 3IO4A 1B2HA 1FCKA 3O97A 3P7IA 4KPTA 2QS3A 2XXYA 1LB8A 3KFMA 3G3FA 1NNPA 2KLFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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