2XXIA

Crystal structure of 1-((4-(3-(trifluoromethyl)-6,7-dihydropyrano(4,3- c(pyrazol-1(4h)-yl)phenyl)methyl)-2-pyrrolidinone in complex with the ligand binding domain of the rat glua2 receptor and glutamate at 1.6a resolution.
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
b'GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Integration of Lead Optimization with Crystallography for a Membrane-Bound Ion Channel Target: Discovery of a New Class of Ampa Receptor Positive Allosteric Modulators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 89
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxiA02
3E9XA 3CVGA 5H8NB 1ZTYA 4EQ9A 5H8NA 1XOCA 4KYSA 2XXHA 5AA4B 5CMMA 3FV2A 4OYVA 5AA4A 4QSCA 2OWTA 1Y1ZA 3I6VA 4KFQA 1BP5A 3G3JA 3BFTA 3DP4A 1Y3PA 4NF5B 2ONRA 4NF5A 3TMGA 3SDFA 4DZ1A 1UIUA 3UIFA 5ICQA 4KPTA 5A5XA 1NNTA 1B6HA 3U94A 2HFBA 4OESA 3CFZA 3RQTA 3KOSA 2XHDA 2XXWA 4U21A 2F6PA 2DWHA 3GBAA 2ZNUA 2I0BA 4ZEIA 4QF9A 4KD5A 3QIMA 3WAEA 1VSOA 3ZS6A 3KZGA 1Y4TA 4ONYA 3UORA 1B3LA 3CIJA 4R9FA 1D9YA 5JK4A 3HCQA 1M5CA 2CZLA 3I5OA 3IR1A 1JQFA 3G3KA 2DXRA 4P0IA 5AA3A 4QFKA 1IIWA 3CI8A 1MY4A 2ZMBA 3S9MC 1B51A 3OELA 1B52A 4I8CA 1LCTA 3H6VA 5FTHA 5I2NB 3O29A 4QFOA 5B7DA 2XXRA 3Q29A 3VE1B 1B40A 4P11A 4DXCA 1SQYA 4IO6A 4FORA 4Z0IA 1MRPA 4ECFA 3OD7A 1GV8A 3MZ9A 1Z7NE 4YB6A 3VLWA 4ELRA 5L9SA 1SDXA 3R26A 4JSOA 3GZGA 1M5BA 4R9GA 2ABHA 4GFRA 5ITOA 2F78A 2XXVA 3R6UA 2P1SA 4BDLA 3K4UA 1US4A 3MWBA 4ZE9A 3V83A 3T9VA 1MQIA 5H8FB 3VFJA 5F7VA 3H03A 5H8FA 3O6IA 4OZ9A 4YU0A 3C35A 3RT8A 3IB2A 4R75A 2REJA 1B9JA 3B6WA 3ZKLA 1B05A 3DELB 1RYXA 2XX8A 3TAJA 4BDOA 1HSEA 4MLQA 3DP6A 4RPOA 4ESXA 3PUWE 1I69A 1BTJA 3N26A 2XXTA 1NNPA 2RKMA 2BJJX 2X7PA 1LAHE 3W9VA 4F31B 3LSFB 4L17A 2ZYOA 2ZYNA 2ANJA 4QRZA 1LAXA 3LSLA 3PPOA 4MBPA 3H6UA 4F3GA 3FV1A 5CMKA 4PFTA 3FZVA 4EQBA 2YLNA 1TT1A 4K3FA 2Y84A 1M5DA 3IO6A 2RC7A 1XVXA 2I48A 1UTBB 5AA2D 1BLFA 1UTBA 4KCCA 4ESWA 2GHAA 3C34A 4ZZAA 4LA9A 4NEDA 2F7CA 4H6DA 4ZE8A 4F1VA 3KOTA 4G8MA 1AIVA 3MVWA 2UVGA 4AB6A 1UTHB 5AE4A 1YAEA 4QFPA 2NVUB 1UTHA 1JVXA 3MVYA 4C0RA 4YKPA 3KBRA 4LZ7A 1DPPA 1PC3A 1H45A 3T93B 1ATGA 4IY6A 2DE3A 3SEXA 1XT8A 1FCKA 1EZPA 1P1WA 2E1SA 4XKPA 1LCFA 3Q28A 2XD2A 4R2BA 1M5EA 3U92A 2DQVA 2OCUA 1DPEA 3TELA 1OQGA 2GHBA 4ELQA 2B3BA 4PE5B 4DXBA 3IJXB 4GQOA 4P0GA 4GOTA 1IXIA 3PUYE 2DWJA 1P1OA 1NFTA 2UXAA 4GIZA 4IO4A 1B7UA 2Q2AA 4YKJA 3PPNA 2VOZA 4DDDA 2I3VA 3T9UA 4NF4B 2NUVA 3TYHA 3TFLA 4NF4A 2G29A 5I84A 4NF6A 3E13X 3VXCA 3CFXA 4RXLA 3CG3A 2H5YA 2I6EA 5L9OA 2REGA 1LAFE 1B1XA 3K6XA 2QJEA 4DXUA 3FVKA 3S9NC 4QSDA 4H8JA 4GVOA 4RY1A 4JDFA 5JTYB 1DTZA 2XXPA 3GXAA 5JTYA 3FXUA 4ZECA 4I9DA 1ZIUA 1MXYA 1S7YA 4KI0E 4R74A 4X9TA 3W15C 5HPQA 1MDQA 1UIVA 2RC8A 4X48A 3KJTA 4POWA 1A8EA 2Z8EA 3D4GA 1PB9A 1ZLQA 1D3KA 1RYOA 1MY2A 1M5FA 5CMBA 4ELOA 2F97A 4HS7A 3DM0A 1CB6A 3OO9A 3RTWB 5DVFA 3EF7A 5DVJA 2HXWA 1Y9UA 1OVBA 4GLIA 3SKPA 3WAFA 4RK2A 2R71A 1MY1A 2NOOA 3SEUA 2Y7WA 2I49A 5I57A 3RNNA 1FTMA 3MZ1A 4Q5TA 3S9EA 3FVOA 2OK2A 4PQJA 1I6QA 1I6BA 1MQHA 3MPLA 2PMSA 1WODA 3TCFA 2Q9TA 4PFYA 2DVZA 5L9MA 2FNCA 2V25A 5CRYA 3RLFE 3PUVE 3PU5A 3IOUA 2PYYA 4TQUQ 3OSQA 3G3FA 3UA8A 4IB2A 3QUFA 1SW1A 1IUDA 1LFIA 1WDNA 1SVXB 3CSGA 4MFIA 4XIGQ 5FHMA 3TCHA 1BIYA 4ZEDA 4BLAA 2ZYKA 5ELVA 3CRBA 2QS2A 2R6GE 4E0WA 4YKKA 3KSJA 3MC2A 3JV9A 3OO8A 5KCJB 5AA1A 3UN6A 4C1UA 3UK4A 5KCJA 1URDA 5DEXB 2XXUA 3TQWA 1MY0A 3IORA 5DEXA 4H1XA 3HHGA 3GBBA 3ECRA 1A55A 3KFMA 1US5A 1PBQA 5DVIA 1USYE 3EHTA 1N3WA 2YJPA 4OTEA 2VHAA 1FQBA 4TLMB 3FVNA 1FTJA 2GFEA 1MPDA 4JWYA 3B7DA 4UACA 1NNKA 3ILTB 1FW0A 4LZ5A 1NMUA 1EH3A 4EUOA 1EZOA 4FATA 3ODBA 1QUJA 1B58A 3QXMA 3PPQA 1DTGA 4NWDA 4WKMA 4DLDA 2HEUA 4GL8A 3KN3A 3V8XB 2QL3A 4OERA 3FJ7A 1LAGE 2FYIA 4OETA 3SEYA 3A3CA 1FQAA 3LSXA 4IGTA 1Q35A 1XS5A 1Y3NA 4NF8B 4H65A 4GD5A 1LBCA 1XHYA 3H06B 3IAZA 2PVUA 5I2NA 3N6UA 4ZZEA 1Z7ME 1B5HA 4F3PA 4JBZA 2DE2A 4F19A 3D4CA 4GXSB 4RNSA 3CR9A 4H67A 4FEBA 4DCYA 1S9TA 4H8IA 3K1NA 1EU8A 1URGA 4QSEA 2OJTA 1II5A 4QHQA 4OENA 4F2OA 3PPPA 2OBGA 4KCDA 3HV1A 1ZMGA 1A7LA 3G3GA 2DE4A 3T9XB 1R6ZA 2QMWA 4NWCA 1MXVA 4IY5A 3BFUA 3B6QA 4IO2A 3BBRA 3QK6A 3O97A 4BDMA 2ESNA 1P1QA 1GTKA 4EXKA 1IEJA 3FASA 1T0KA 2Y7KA 2QMXA 3KN7A 2O84X 4LQ2A 5CI5A 4ELPA 5I2KB 1MPCA 3FATA 4R2FA 4RPNA 2IA4A 4M4GA 3MZBA 3UGWA 3OMBA 1A40A 1QW0A 4RK9A 2QS4A 2F6GA 4KYEA 3PMWA 5J1DA 2AIXA 3RTFB 3W9WA 3PD8A 1Y4CA 4G4PA 3EHSA 4OEUA 3VVDA 1N7XA 3N94A 1DMBA 4AB5A 4EF1A 3MBPA 3ILUB 3MW0A 2F34A 4EQ7A 4TOZA 4MF3A 3IOVA 3MP8A 5CBSA 3MUQA 4FE8A 4LQ5A 2RINA 1L5TA 1S50A 1R9QA 3K6VA 2ZNTA 5ITPA 2UYEA 2VGQA 4F29A 1Y3QA 2F7BA 4Z7EA 4ZEBA 4F3BA 1FTKA 3H6TA 3S2VA 3MAMA 2Z8FA 2H9BA 1MXZA 1MDP1 5DYHA 3MVZA 4OFJA 2DWAA 3A09A 2HZLA 1O63A 4F39A 4OEVA 3JZJA 4JWXA 2B65A 3U93A 2NXOA 1JEUA 1B46A 3H3GA 4GL0A 4LONB 1SD3A 2DXYA 1OMPA 1SBPA 3CSBA 5BUUA 1QULA 2GH9A 1F9BA 1LLSA 2DS9A 4PETA 1OQHA 2PT1A 1XVYA 2WKYA 5I56B 4BDRA 4O3BA 3IO4A 1MPBA 5TP9B 3TCGA 2AYSA 1D4NA 3FJMA 2OWSA 2XXXA 5TP9A 4G8NA 3USDA 3N6TA 3IB0A 1LSTA 3H7MA 3UP9A 2HQ0A 3G7WA 1LFHA 4WEPA 2VD2A 1SW4A 1SW2A 4RA1A 4KHZE 4IO5A 1QVSA 3TODA 4YMAA 1J1NA 2ZNSA 2THIA 4YMBA 3I3VA 3TUSA 4F1UA 3TEPA 1QUKA 1B4HA 5TPAB 3PMXA 3Q25A 3C9HA 5TPAA 1O7TA 3QYTA 1H44A 2I0CA 1CE2A 4WXJA 3OEMA 1H3DA 2HAVA 5H8QB 3K6UA 4MH5A 4R73A 1O64A 4GF8A 2F7AA 1N04A 4N13A 3SESA 4HCWA 2RC9A 2Q88A 4ZDMA 4NE4A 4IO7A 1I6AA 1PB8A 3AXFA 3C36A 4THIA 5KZTA 1VE4A 4O3CA 3TDJA 4GXAA 2I4CA 4Q0CA 5K2YA 4R72A 3MP1A 4OVJA 1IITA 1ZJLA 3BKIB 2I58A 3HHFA 2GRVA 1D9VA 3O2AA 3FVGA 3O6GA 4YB7A 3K00A 2V3UA 1NNFA 1UQWA 3EHUA 3IX1A 1QKAA 3C32A 5LOMA 4FJPA 3ZSFA 2HZKA 1LBBA 2Z23A 3DP8A 4JSDA 4LVQA 2AL4A 2PX1A 5CM6A 1MXWA 5JEIA 4M1VA 4BDNA 2Q8JA 2LAOA 4PP0A 1IZ1A 2G93A 5BWJA 4FIMA 5CBRA 4F18A 1NH8A 2QPQA 4ND9A 2V3TA 4PFWA 3O6HA 3K2DA 3P7IA 5AA2B 1N76A 5IAIA 1B2HA 3RY3A 1LB9A 4H5FA 5H8SA 3IL1B 4ZEFA 4XKRA 3TTLA 3MP6A 3C31A 1MQGA 4U23A 3RUMA 3K6WA 5B70A 3S9LC 4Q30B 3FXQA 3RGYA 3ZKKA 4OXVA 3R7XA 3FXRA 1N0TA 3KN8A 4YICA 2XXYA 4F2QA 3KG2A 3IOWA 3F11A 5FHOA 2AL5A 3VLVA 2X26A 4YAHX 4F22A 4OHNA 3VLUA 1B1HA 3U72A 2H98A 1N84A 3PGFA 3T9HB 1MXXA 1YCJA 3OO7A 4X1DA 3T22A 3G3HA 4U1OA 1NH7A 3K1PA 3SERA 1MS7A 2F8DA 1JW4A 1FQEA 1VR5A 1H43A 3TKDA 1EZ9A 3VV5A 2V84A 4R6HA 3KSXA 4G77A 4KR5A 5FHNA 2P2AA 4JWOA 1POTA 3TTKA 5A5XB 4U1ZA 2ALUA 5TU0A 5HBCA 5K2XA 4DIGA 1ANFA 4LP2B 3O66A 3Q26A 2KLFA 3FUZA 4I1DA 3S4UA 3THIA 4XKNA 1TXFA 5EHMA 1OIBA 4WEDA 1P1UA 2UVJA 3B6TA 2I4BA 3EQ1A 2QS3A 4XXUA 1TWYA 3IOTA 4NF8A 2UVHA 2DWIA 3SEVA 2Y7PA 1B3HA 2Y7RA 5L8DA 3OENA 4AQ4A 3HSTA 5ICTA 3LSWA 3TQLA 4MLVA 1VFEA 4PFUA 1HSJA 2E0SA 3OOAA 1R1NA 4G68B 1P99A 2O68A 3E3KA 3PMVA 1IQ7A 1VFDA 2HCAA 4G68A 2ZYMA 4G68C 3HO7A 3M3LA 1P1NA 1B0LA 1USYH 3PUXE 1FTOA 3KGCA 4DE8A 3T66A 1DOTA 1B4ZA 1LGBC 4U2RA 4YB5A 1Y1MA 1SI0A 5IKBA 3H6WA 3H4ZA 3K01A 3DLNA 3HN0A 3RT6B 3CFLA 2F35A 1QKBA 5CC2A 1AH5A 1MM6A 4R6YA 1B5IA 1LB8A 1ELJA 3JYRA 4JB7A 3M3FA 4O3AA 2V93A 2A5SA 2A5TB 3V89B 3E4RA 2O1MA 1KWHA 2A5TA 3OXNA 1YPNA 3M8UA 3IK6B 2HAUA 4JXIA 1PDAA 3OEKA 2IEEA 4OMBA 4E0XA 3VDFA 5EYFA 5I2KA 1OLAA 3EPEA 2QSXA 5EHSA 1IXGA 1JNFA 2PBWA 3TPAA 5I58B 5KDTB 1B3GA 2RF1A 5I58A 5KDTA 4IO3A 4Q8RA 1TFDA 3TTMA 1RKMA 2DSFA 3O28A 1ZBMA 1MQDA 4DCXA 1PEBA 1FQDA 4QFNA 2XXQA 4HCYA 1PBPA 3IJOB 3IB1A 1ZU0A 3TZAA 3V5AA 2OLBA 4IGRA 3CG1A 4EDPA 1MY3A 2O6AA 3VXBA 1WVJA 1MH3A 5FTIA 4YZZA 1A99A 1Q1KA 3VVEA 1ZKBA 4KQPA 3PD9A 4H0WA 3MVXA 3KEIA 1B32A 2VD3A 4HTGA 3QSLA 1B5JA 4LZ8A 2QRYA 4NMYA 2OZZA 3MQ9A 3OSRA 3MPKA 4QFLA 2DOJA 3K02A 4HW8A 4XKQA 1JW1A 2O69A 1FQCA 3K1MA 2O1LA 2YPNA 4XTCQ 3L6GA 1JEVA 4RJZA 3ONMA 4FECA 3MJNA 2UYFA 2M8CA 4H5GA 1LFGA 5I59B 1BKAA 4TLLB 1AMFA 1SI1A 5M2VA 2B3FA 5I59A 1TFAA 5ISUA 1JETA 2Z22A 3T96B 3KJ7A 4N07A 2XX7A 1R9LA 4C1TA 5I56A 1PB7A 1N3XA 1IXHA 4GWOA 4G2ZA 1MQJA 1GVCA 4BDQA 2Z8DA 3PUZE 3C33A 3C4MA 1GR2A 5F1QA 4N6PA 2ONKE 4FAJA 4F1YA 1MM7A 2D3IA 4RYAA 4EF2A 3O9PA 2O7IA 3U8QA 2FA7A 1NKXA 4ISUA 4F3SA 1FQFA 4U22A 4KYDA 1NL5A 3A3UA 2D21A 4U4SA 4NF6B 2RCAA 2P0SA 2XD3A 2H25A 1SYIA 4EXLA 2V3QA 2Q89A 2Y7IA 3K0VA 2PT2A 3LBSA 2Q2CA 2R9JA 1B7HA 1FTLA 5H8QA 1A54A 1AL3A 4OQOA 3G3IA 2F36A 1B3FA 2H4IA 1HSLA 2ZXTA 3U1OA 1B7ZA 1N7WA 2XXIA 1SYHA 3VVFA 1MXUA 1A8FA 2F5XA 3FJGA 1DSNA 3SEWA 1B3EA 3FD3A 3FGSA 1B0HA 4X1BA 3LR1A 3PV0E 4NTLA 1URSA 1MH4A 1XC1A 1MG1A 5CMCA 2QS1A 5DTBA 4OFLA 2W7YA 4ZEKA 1QUIA 3FIRA 3RN8A 4ZS9A 2XX9A 3SETA 1YTVA 2RCBA 4I62A 2NWJA 4G8HA 3RPWA 3TTRA 2H99A 5H8HB 3LUYA 2X7QA 4UA8A 1QJMA 1OLCA 5H8HA 5I57B 1POY1 2O7UA 1OVTA 4GRKA 4R6KA 3M3KA 4U4XA 1IXCA 3HPIA 3L6HA 4LUBA 1AOVA 2DVCA 2UVIA 5AA2A 1SW5A 2I3WA 5DT6A 5HM4B 2ONSA 3QAXA 4OWDA 1H76A 1JW5A 2VP1A 2O51A 4YKIA 2DP8A 3N5LA 4LATA 4POXA 2D5WA 3OO6A 3PPRA 1Y20A 3TTNA 2DYXA 4FEDA 3Q27A 3LC8A 3GLBA 3QUJA 4OFOA 1JVYA 2CMOA 3EN3A 1GGGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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