2XXIA

Crystal structure of 1-((4-(3-(trifluoromethyl)-6,7-dihydropyrano(4,3- c(pyrazol-1(4h)-yl)phenyl)methyl)-2-pyrrolidinone in complex with the ligand binding domain of the rat glua2 receptor and glutamate at 1.6a resolution.
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Integration of Lead Optimization with Crystallography for a Membrane-Bound Ion Channel Target: Discovery of a New Class of Ampa Receptor Positive Allosteric Modulators.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 89
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxiA02
3GBAA 4IO6A 4LZ5A 4IO5A 1B0HA 4E0XA 1LFHA 5L9SA 1DSNA 1PC3A 4ZEFA 2OCUA 3QXMA 2ZYOA 4GOTA 3TPAA 4G2ZA 2QJEA 1B40A 3C33A 5L9OA 2XD3A 1FTMA 1P1QA 2B3BA 4YMAA 4Q5TA 3BBRA 4F1UA 4U2RA 4GWOA 2XXTA 1A54A 2RF1A 4H0WA 3K1MA 2DS9A 1LBCA 1SBPA 3G3GA 2DQVA 3H6VA 3UK4A 2ZNTA 2GHAA 3T93B 1JETA 2XXPA 4ELPA 2HEUA 3TEPA 3SDFA 1QULA 3L6HA 3Q26A 5DT6A 1B0LA 4I62A 2GFEA 2Q8JA 3G3KA 4JSOA 2XXXA 1ZIUA 3FGSA 5KZTA 3RLFE 4MF3A 2B3FA 1AOVA 3SERA 3BFUA 4XKQA 1O7TA 2H5YA 2HQ0A 2YPNA 1TFAA 4I8CA 1VFEA 4ZEKA 4C0RA 2LAOA 4XKRA 5I56A 3S9LC 4H8IA 2HXWA 1MQJA 3H06B 4KHZE 5DEXB 4F19A 1MS7A 5FHMA 4IO2A 1WODA 4OYVA 4NF8A 1SVXB 1FQEA 3N5LA 3OD7A 1FQFA 1HSEA 5IAIA 2DXRA 3K0VA 3PMXA 4JBZA 4LA9A 5EHSA 5HPQA 4R6YA 3MBPA 4ZZEA 3VLWA 1SW4A 4PFUA 3USDA 1T0KA 3O6GA 3CRBA 4JB7A 4G4PA 1Z7ME 4NTLA 2ZMBA 2QS2A 2Z8DA 4R73A 1SW1A 1VE4A 4QSDA 4GXAA 2DWIA 3FV1A 5DVFA 4H67A 3TAJA 3EHSA 4WKMA 1TFDA 4FE8A 3DM0A 5AA1A 3PMVA 2DWHA 5H8HA 2KLFA 4F3GA 2PMSA 2XXIA 4GIZA 4DZ1A 4XIGQ 1Z7NE 2W7YA 3PGFA 4EXLA 2NWJA 5A5XB 2ONKE 4JSDA 3PUXE 5CC2A 2UVIA 4EDPA 4UA8A 3KJ7A 4MH5A 1FTLA 1PBPA 1M5BA 3CG1A 3IB2A 2IEEA 1NMUA 2RKMA 2DWJA 3OSRA 4EQBA 1QUIA 4YB6A 2F35A 4JXIA 5DVIA 1F9BA 4Q0CA 2Y7KA 5K2XA 4JDFA 4HW8A 4NF6A 4FEBA 1JNFA 1B58A 1FQBA 3KG2A 2AL4A 1EZ9A 3C34A 1MQDA 1N7WA 3LR1A 3KN8A 3G3FA 3UIFA 1H44A 2PYYA 1P99A 3WAFA 4POWA 3RQTA 4KFQA 1PB9A 4QRZA 5H8NA 5B70A 1MQIA 1OVTA 4G8NA 4P11A 2Q2AA 3VVDA 4ELOA 1ZJLA 3G3JA 4YMBA 2ALUA 3PV0E 3GLBA 2REJA 1H43A 3OSQA 2V84A 2Z8FA 3O97A 1ELJA 1NNPA 5CBRA 2CMOA 2O7IA 3JYRA 1R6ZA 4H5FA 2DE2A 4OFLA 2A5TA 1FQCA 2PBWA 1OQGA 3K01A 1HSLA 3O66A 4ESWA 3KSJA 1DTZA 4OERA 2F5XA 1SDXA 5I2NA 1LAFE 3VVFA 4OETA 5FHNA 5H8SA 4O3BA 5TP9B 3MVZA 1M5FA 3KZGA 3HN0A 3K00A 1LAXA 1LSTA 3H3GA 4OEUA 2V25A 4FIMA 4NE4A 3MZBA 4NF4B 1BIYA 4UACA 2UXAA 3TDJA 4KYEA 3O2AA 1MG1A 2WKYA 2HZKA 4U23A 3K4UA 3IO4A 3QAXA 1UTBA 3RNNA 1MM7A 1B6HA 1QJMA 2FYIA 1H76A 4QF9A 2OWTA 3QSLA 3FVNA 5I58A 1ZKBA 1FTOA 2RC7A 5I59A 1B4ZA 2FNCA 1MPBA 1URSA 4QSCA 4GXSB 1QUJA 1LAGE 1FTJA 2QMWA 1SYIA 2ABHA 3IR1A 4QFKA 3VLVA 2UVJA 3T96B 2Y84A 3PUWE 4EXKA 3EHUA 3K1PA 1MDQA 3PUZE 1MQGA 4C1TA 4XKPA 2O7UA 3S2VA 4IGTA 3K6WA 3LBSA 3C36A 4G8HA 4H6DA 3SEXA 3RTWB 4LZ7A 2F7BA 1B7UA 3IO6A 4F3PA 1QKBA 3E3KA 1MXZA 5I2KB 3C32A 3IOWA 1A8FA 5CRYA 5I57A 2F78A 1IIWA 3N6UA 4RPNA 3SEVA 5FTHA 2HCAA 2XD2A 3IB0A 5DYHA 1DTGA 4LP2B 1GV8A 2XXRA 1PDAA 2I4BA 3OEKA 4U22A 1WDNA 3MP6A 2FA7A 5KDTA 4MLQA 3HV1A 1B3EA 2GHBA 3TQWA 2DXYA 1P1NA 1MY0A 3H6UA 2D21A 4BDQA 3SEUA 4ELQA 2VOZA 3TQLA 2THIA 1LCTA 3RTFB 3GBBA 4RYAA 5ICTA 1SQYA 3FXRA 4PP0A 3I5OA 1UTHB 5TPAA 1ANFA 4F3BA 4YKPA 3OXNA 3QYTA 1IXHA 1FQAA 1TT1A 2H98A 1OVBA 1MH3A 2DVZA 3MPKA 4QHQA 4FEDA 1QVSA 5K2YA 1URDA 2AL5A 1MXXA 1CB6A 1SI1A 2ZXTA 4K3FA 5H8FA 2ZYNA 1QW0A 3O6HA 4NMYA 1D3KA 3V8XB 4EUOA 3I3VA 3A3UA 1XT8A 2G93A 3PUYE 1OMPA 3KN7A 2XXVA 4IO4A 3K02A 4PQJA 4R9FA 5M2VA 1OLAA 3E9XA 3PD9A 1VR5A 3IJOB 1B3GA 4KCDA 1UQWA 3N94A 2NOOA 4ECFA 5ICQA 4HS7A 4R75A 3B6WA 1B51A 5F1QA 3TELA 3UORA 1P1UA 1LAHE 2RCAA 1B3FA 5EYFA 5L9MA 1XHYA 3L6GA 2P1SA 4Q8RA 4DXBA 4FATA 4RK9A 1RYXA 4YKIA 4G68B 5CM6A 4TLLB 3T9VA 4PFTA 3IX1A 3K6XA 3VV5A 5JTYB 3GXAA 3G3IA 4HTGA 1Y4TA 3QIMA 1ZU0A 4NF5A 3M8UA 1NH7A 1ZTYA 1A40A 1AMFA 2Y7WA 3ZKLA 1M5EA 3ZS6A 4G77A 4YZZA 2XXQA 1UTHA 4KYSA 2OJTA 2H99A 5AE4A 4JWOA 4ZEIA 1MY3A 3OEMA 1TXFA 1ATGA 1VSOA 2F34A 5DVJA 2QL3A 3E13X 4EF2A 1N3XA 5HM4B 4JWYA 3C31A 3CVGA 1Y9UA 3H4ZA 3U93A 4F31B 5ITPA 4LVQA 4ISUA 3FJ7A 2I3WA 3BKIB 4WEPA 2B65A 3U1OA 5AA4B 1MXWA 4IO7A 4P0IA 1N84A 1XOCA 4MBPA 4JWXA 4BDMA 2DOJA 2X7PA 3H03A 4YU0A 3I6VA 1MH4A 4MFIA 3TUSA 3UP9A 1SD3A 3TZAA 3OO6A 1MXYA 2ZYMA 2I6EA 1SW2A 4AQ4A 1LFGA 4BDRA 3SEWA 4F18A 1AH5A 3TCGA 3H7MA 1SI0A 3MPLA 1B1HA 4RA1A 3VXCA 3KBRA 1NKXA 2VGQA 3FJMA 1IZ1A 4DXCA 2D3IA 1LBBA 1M5DA 4Q30B 3TTRA 4FAJA 5KCJB 5CMKA 5DEXA 3B6QA 3TFLA 1IQ7A 1B4HA 2XXUA 3RPWA 2F6PA 3W9WA 3MP8A 4G68C 4GRKA 3CR9A 3MVYA 1QUKA 3U8QA 4WXJA 1N7XA 4DIGA 2ZNUA 1B5HA 1B46A 5IKBA 3FVOA 3R6UA 1D9VA 2DYXA 1KWHA 3EF7A 1B5IA 4BDNA 4X48A 3C4MA 4U4SA 1FCKA 2DE4A 1B5JA 4F2OA 2OK2A 1DMBA 3MJNA 3CIJA 3K2DA 2XHDA 2DWAA 4N07A 3IK6B 3T9XB 1Q35A 5CMMA 4DCYA 3ODBA 4Z7EA 1JVYA 3R7XA 1B05A 1RKMA 2V93A 4R2BA 1EH3A 2I0BA 3C9HA 2A5SA 2PT2A 1GTKA 1O64A 4TLMB 4BDOA 3TODA 5JK4A 3KJTA 1JEUA 4KQPA 5A5XA 3O6IA 2RINA 3RN8A 2QS4A 2QMXA 1Q1KA 4DXUA 2HZLA 3LSXA 3Q27A 4U21A 3S9NC 5AA2B 2XXYA 4ELRA 3PD8A 4E0WA 5FTIA 4RY1A 3VFJA 2I58A 5H8QB 4OTEA 2I0CA 3CG3A 2XX8A 3IAZA 2HFBA 3MWBA 4YKJA 4U1ZA 3D4GA 1H3DA 3QUJA 2CZLA 4YICA 3OELA 4THIA 4F1VA 1R1NA 2OWSA 1OQHA 3MW0A 2I48A 4QFPA 5L8DA 3U92A 1SYHA 1YAEA 4TOZA 3OMBA 1Y4CA 2QSXA 3Q25A 3O9PA 3RT8A 1A55A 3UGWA 4GF8A 3ECRA 1D9YA 1JW4A 1IITA 4KI0E 4ND9A 4MLVA 3OOAA 3B7DA 3TTLA 3A3CA 5ELVA 3FV2A 1IXCA 1B52A 3QUFA 3CFZA 3VLUA 1MDP1 1POY1 4BLAA 3EPEA 1BKAA 4AB6A 1IXIA 1UIUA 1VFDA 1LFIA 4ZECA 1B3LA 2XXWA 1DOTA 1BTJA 2Y7RA 2DP8A 2F7CA 3K1NA 3FJGA 4N13A 2VD2A 3TCHA 2UYEA 1LB9A 3JV9A 3CFXA 2NVUB 3U94A 1A7LA 3UN6A 1R9LA 4FORA 2RCBA 5TP9A 3TYHA 5AA2D 3FVKA 3K6UA 2O51A 4DCXA 3KGCA 1XVXA 1YPNA 4GQOA 4NF4A 1N3WA 2O84X 4X1BA 1I6QA 4R6KA 3HCQA 4IB2A 5CBSA 4YB5A 1A8EA 4OQOA 3N6TA 4OESA 1XS5A 5I56B 3U72A 4ZEDA 1I69A 2O69A 2V3UA 4ESXA 1WVJA 4G8MA 1EZOA 3MUQA 2V3QA 1NNFA 4NF8B 1B3HA 4BDLA 3V5AA 1S9TA 1LLSA 1P1WA 2ZYKA 3OO9A 3T9HB 2VP1A 4H8JA 4NWCA 3N26A 1YCJA 3S9MC 3PPOA 3MQ9A 3IOVA 1IEJA 1II5A 3LSLA 3ILUB 1ZMGA 2D5WA 3TMGA 1B32A 1BP5A 1US4A 1MY2A 4F39A 4OEVA 3EHTA 1N0TA 2YLNA 3FXUA 4X9TA 4OXVA 2Z22A 1US5A 2F36A 2V3TA 3VVEA 4OMBA 4OZ9A 1MQHA 1S7YA 4C1UA 1ZBMA 5EHMA 4ZZAA 2I49A 2QS1A 4NWDA 2XX9A 5H8HB 4IY6A 2UYFA 4F1YA 1R9QA 2X7QA 3RUMA 2F8DA 3Q28A 3DP6A 2R9JA 4ZDMA 5DTBA 3T66A 3EN3A 5I2KA 4DLDA 3VE1B 4RXLA 1ZLQA 1J1NA 1D4NA 4IY5A 3E4RA 4M1VA 1IUDA 2Q9TA 4OFOA 4I1DA 2I3VA 1DPEA 4R2FA 4LATA 4M4GA 4HCYA 4LQ5A 4QFNA 4NF6B 1MM6A 1I6BA 2E0SA 3T9UA 1FW0A 3KOTA 2O1LA 3CSBA 2ONRA 4KD5A 4GLIA 1YTVA 3FUZA 3SESA 2YJPA 4PFWA 2O6AA 3MAMA 2BJJX 4ONYA 4GFRA 2I4CA 5LOMA 3LUYA 2H9BA 2X26A 3ZKKA 2NXOA 2QPQA 1GGGA 2XXHA 3PPNA 5H8NB 3TTKA 4ZEBA 4R74A 4YAHX 3RGYA 2PX1A 2Y7PA 4RPOA 1Y3NA 4KYDA 1Y1MA 4TQUQ 4RK2A 3OO8A 3Q29A 1OLCA 4KR5A 3M3LA 4QFLA 3M3FA 1JQFA 4XTCQ 1JEVA 3HPIA 2Z23A 3PPQA 3KEIA 5ISUA 2E1SA 4H1XA 4NEDA 2A5TB 3G3HA 2O1MA 3KOSA 3PUVE 4F22A 1Y1ZA 1MXVA 4GD5A 3A09A 4N6PA 3C35A 1Y3QA 3H6TA 2OLBA 3HO7A 5AA3A 3EQ1A 3G7WA 5I2NB 3DLNA 4R9GA 1B7ZA 2REGA 5J1DA 4YB7A 1B7HA 1I6AA 3DP4A 3PMWA 3LSWA 1GR2A 3IOUA 2R6GE 2ANJA 2HAVA 1AIVA 3ZSFA 1XC1A 4G68A 4O3CA 3VXBA 4QSEA 1A99A 2Q89A 5F7VA 1QKAA 3PU5A 5JTYA 4ZE9A 1NH8A 4FECA 3IJXB 2VD3A 2M8CA 2DE3A 1Y20A 3IL1B 2R71A 1UTBB 1AL3A 2ZNSA 4GL0A 3R26A 5I58B 2ESNA 4ZE8A 3FD3A 3O28A 1P1OA 5I59B 1NFTA 5HBCA 3FXQA 3CFLA 2P0SA 3IORA 3V89B 2PVUA 4U1OA 3ILTB 4GVOA 5CI5A 1UIVA 5B7DA 4PETA 3SEYA 3IB1A 5BUUA 4WEDA 5JEIA 4FJPA 3FATA 3TKDA 1PB8A 3HHFA 3FZVA 2GRVA 4PFYA 4R72A 3WAEA 1USYH 1MY1A 2ONSA 3QK6A 4AB5A 3JZJA 1MPCA 3O29A 3TTNA 3LC8A 4PE5B 1H45A 3CI8A 2AIXA 4ZS9A 5AA4A 1B9JA 1JW5A 2VHAA 4KPTA 3OENA 1MY4A 2F7AA 3VDFA 1POTA 4U4XA 1BLFA 2UVHA 3MP1A 1MXUA 3MVXA 1CE2A 3OO7A 4LQ2A 5ITOA 1S50A 1RYOA 1HSJA 1PB7A 5I57B 2XX7A 2OBGA 3DP8A 1GVCA 2H25A 3H6WA 4OWDA 5FHOA 2G29A 1LCFA 2IA4A 1USYE 3FASA 3AXFA 3LSFB 4F3SA 1O63A 4OFJA 2PT1A 3MVWA 1LB8A 4EQ9A 3FIRA 3IOTA 1PEBA 1JW1A 4OENA 5KDTB 3D4CA 3PPRA 1IXGA 3P7IA 3PPPA 5CMBA 3W15C 2F6GA 4X1DA 2F97A 1FQDA 4H65A 5CMCA 1B2HA 2HAUA 1PBQA 3SKPA 2DVCA 3CSGA 3GZGA 5I84A 5KCJA 3T22A 3ONMA 1MPDA 4R6HA 5TPAB 4Z0IA 4OHNA 2OZZA 2O68A 1NNKA 3MZ9A 3KN3A 3MC2A 1EZPA 1FTKA 2Q88A 4RNSA 3B6TA 1SW5A 4DE8A 5H8FB 4L17A 3SETA 4GL8A 1Y3PA 4EQ7A 4XXUA 2P2AA 3KFMA 3S4UA 4RJZA 2RC8A 3M3KA 3FVGA 4LONB 2QS3A 5BWJA 4EF1A 3K6VA 1N04A 3RT6B 3HSTA 1URGA 1L5TA 3DELB 3MZ1A 4QFOA 4H5GA 3UA8A 4HCWA 4O3AA 2RC9A 2H4IA 4I9DA 4YKKA 4LUBA 2NUVA 2Y7IA 4XKNA 2UVGA 1NL5A 2AYSA 2QRYA 5TU0A 1N76A 4IO3A 4P0GA 3W9VA 3F11A 3HHGA 3BFTA 4F2QA 3S9EA 1LGBC 1M5CA 4POXA 4F29A 5AA2A 1MRPA 4OVJA 1NNTA 1OIBA 4NF5B 1EU8A 2GH9A 5H8QA 1JVXA 3V83A 2DSFA 4IGRA 1B1XA 1XVYA 4KCCA 3TTMA 1DPPA 3RY3A 2Z8EA 4DDDA 3KSXA 4LZ8A 3TCFA 3THIA 1TWYA 2Q2CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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