4ELQA

Ferric binding protein with carbonate
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
SPTLTIYSGRGQSLVEPLVKQFEAETGIRVQVRYSTDAQILAALQEEGSRSPADLFWANTAGALGQASAKGLLRPLGETLLEKPIAFVPASRTWVPVTVRLRVLAYNPDRIKAEELPESLLDLPRFAREKGLVGRVGWTPTYSSFQDMVAGMIALYGEEKTREWLLAMKALAPKAYPSNPAMLDAIRAGEVDLGSTNHYYVVRFRRAGYRLGMHHFRDGDAGNLALVTGAGLLKTSKNLAAATRFLTYLLSPQAQQYFVGNIGEYPLVKGVALDPNLLPLEEALAKSPKLDLEKLPLDRALRLLRETGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of ferric binding protein A
rcsb
molecule keywords Iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein
molecule tags Metal transport
source organism Thermus thermophilus
total genus 114
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elqA02
3CFLA 4YMAA 2PT2A 3KBRA 3TDJA 4ELPA 4NEDA 4OVJA 3TUSA 2F5XA 3HV1A 4IO5A 1XVXA 4ZE9A 3IO6A 3DP4A 2GHAA 4N13A 1S50A 1B46A 4U2RA 5AA3A 1LFIA 3JYRA 4MFIA 1IZ1A 2OJTA 3IORA 4U21A 1PC3A 3TTLA 3A3CA 3QAXA 3R26A 4GQOA 5TP9A 1JQFA 3RQTA 3Q25A 1DTZA 3S2VA 1PEBA 3PD9A 4OMBA 1GTKA 3PMVA 1URGA 2V3QA 3I5OA 3H4ZA 3M3LA 3Q26A 1MQGA 2RC8A 2OLBA 1QJMA 2Y84A 5JEIA 3O66A 4Z0IA 5CMCA 1WDNA 4YKPA 3PMXA 1YAEA 3MQ9A 4JWYA 4RK9A 2D21A 5I84A 1FQBA 3B7DA 4F29A 4F3SA 2F34A 5I59A 1B7UA 5KDTA 3MVZA 4GOTA 5I2KB 2ZNTA 4RPOA 1KWHA 4XIGQ 3RNNA 2H98A 3D4GA 3KG2A 4EXLA 1JEVA 1UIUA 4ND9A 5DTBA 1B32A 3K1MA 3ZS6A 3EHSA 2QPQA 3KOTA 4WEPA 1GGGA 5H8NA 3FUZA 3T22A 2XX8A 2GFEA 3I3VA 5TPAA 1S9TA 4PFUA 4AB6A 3GXAA 1FTJA 1OMPA 4GLIA 1Y3PA 4GFRA 4IO3A 4LATA 3G3JA 4O3BA 1B52A 2REGA 3TTRA 1B3LA 4G8HA 4OYVA 1SI0A 2BJJX 1SD3A 2E1SA 3UIFA 3VXBA 3CRBA 1R6ZA 2XXTA 5IAIA 2XX9A 3DP8A 3R7XA 3K02A 4ZZEA 1EZ9A 5AA2A 2A5TA 1USYH 5I56A 5A5XA 3Q29A 4FAJA 4EF1A 2XXWA 3SEVA 2DWAA 2OK2A 3H6WA 1ANFA 1P99A 4OFJA 3K6XA 3C4MA 2Y7IA 3IJXB 5ICQA 2DWIA 4YMBA 3WAEA 1DSNA 4ISUA 3IJOB 1B3FA 3ILTB 4FE8A 4O3CA 4H5FA 3T9HB 5DVJA 3IOUA 1QUIA 3KJTA 3B6QA 1YTVA 4NF4B 4R6HA 4EQ7A 4Q5TA 3KSXA 5K2XA 3BKIB 3G3KA 1ZJLA 3MBPA 3QK6A 4FIMA 2Q2CA 1LAHE 3TQWA 2YJPA 4JWXA 3BFTA 1MM6A 4YZZA 1B2HA 2V25A 2IA4A 3TEPA 1M5CA 1B40A 2ZMBA 4THIA 1IXGA 1JW5A 2Q9TA 4JSOA 4KD5A 4R74A 4Z7EA 2XXQA 3PPNA 4TLLB 3MW0A 2GH9A 4EQBA 4NWDA 4LP2B 5DT6A 4PFWA 2NWJA 2O51A 1B0HA 3T93B 4OFLA 1IXIA 2V84A 4JB7A 1L5TA 5H8SA 1XC1A 2ALUA 3IB1A 1IXHA 1A54A 5ITPA 4NWCA 3O9PA 2Q8JA 3K6VA 3RN8A 2XXYA 4BDLA 4KPTA 5CBSA 4NF8A 2VD3A 3V89B 4Q8RA 4QF9A 1D3KA 3U8QA 3RPWA 3IR1A 1OIBA 2QS1A 1D9YA 3FASA 1Z7ME 2I4BA 3W9WA 3RTFB 1SYHA 3CG3A 3IK6B 3FJMA 2I0BA 5H8QA 4ZZAA 1P1UA 2XX7A 3MWBA 5TU0A 3HHGA 1MXZA 4DDDA 3E9XA 1P1OA 1QW0A 2F7BA 5KZTA 1A40A 1ZKBA 3OELA 2UVGA 1PDAA 4X1DA 5FTIA 2I3VA 1MPCA 1US4A 5CI5A 1B1XA 1PB9A 4LQ2A 1HSJA 2HAVA 2Q2AA 4YB7A 3U93A 3VVDA 2DWJA 2O69A 2XXXA 3RT6B 1AH5A 3LBSA 3TCFA 4KYDA 3WAFA 1FCKA 3OO9A 1AMFA 1CE2A 1D9VA 3PUYE 2OWSA 4F18A 1F9BA 2DXYA 5ICTA 2ONRA 3GBAA 3K01A 5IKBA 1HSLA 3U92A 2W7YA 3MPKA 2VOZA 3TTKA 3IX1A 3MZ9A 5LOMA 1YCJA 5L8DA 1H45A 3DLNA 4QSDA 4F31B 4HTGA 1ZU0A 1TFDA 3ONMA 3IAZA 1N7XA 3KN3A 1N7WA 1MH3A 2I4CA 1NMUA 4KYSA 2Z23A 3OMBA 3A3UA 5JTYA 1B58A 4GL8A 2P0SA 4N6PA 1H44A 3PUVE 3U1OA 4GXSB 3H6VA 5F1QA 4F3GA 5K2YA 3FXRA 3N5LA 3FATA 4IGTA 2NVUB 2ONSA 2H25A 1MDP1 1VFDA 1ZIUA 2V3UA 5KCJA 3H7MA 1P1WA 3K0VA 3N6UA 1LGBC 2REJA 1XOCA 3N6TA 4ZEFA 3T9VA 4I8CA 3EQ1A 2R6GE 5L9OA 3K4UA 1PB7A 1MPBA 1NNFA 4LQ5A 1EZPA 3FZVA 1TFAA 1B1HA 1ZBMA 1NFTA 1QKAA 4E0XA 3USDA 2AL5A 1SYIA 3U72A 4IO2A 1MY1A 1ATGA 4UACA 3FJGA 3S4UA 3H03A 4X48A 4GL0A 4ZEBA 4H5GA 1B3GA 4G77A 1QKBA 1YPNA 5I2NB 3IB2A 3S9NC 2Z22A 1B9JA 4ONYA 4GD5A 3O29A 3VE1B 3TMGA 1XS5A 5CMMA 2OWTA 4G68C 4ELOA 3K00A 4R72A 2QS4A 4PETA 3FD3A 3KSJA 2FA7A 2HCAA 1IEJA 1TXFA 2UYFA 1BTJA 4H8JA 2F35A 4PE5B 4BDRA 2GHBA 1US5A 1AL3A 3CVGA 1LAFE 1B4ZA 1FTKA 4ECFA 1B5IA 2LAOA 1MM7A 3AXFA 3Q28A 3JV9A 1OLAA 4OESA 3FJ7A 4QFLA 1B4HA 3K1PA 4K3FA 1WVJA 4KQPA 4OQOA 3S9MC 2XD3A 1OLCA 3KFMA 4JWOA 3IB0A 3KZGA 2ZYMA 5DEXB 4KFQA 3E3KA 3H3GA 3FV1A 3R6UA 5DVFA 3VVFA 2O68A 2Y7RA 3TAJA 1ZMGA 2PVUA 2QJEA 3BFUA 4U4XA 1MXYA 3MP8A 2DS9A 3TFLA 5FHNA 3EHUA 2R9JA 3KN8A 2ZYNA 4R6YA 3PPOA 4POWA 5EYFA 4F2QA 1LAXA 3IOVA 1B7HA 2HQ0A 3LUYA 3ECRA 1O64A 5H8HA 3SDFA 5CBRA 3PPQA 2ESNA 1LBBA 3QIMA 2PBWA 3RLFE 4EQ9A 4QFOA 1TT1A 3PV0E 1II5A 2AIXA 4F1UA 4ELRA 3FV2A 1O7TA 4R2FA 3IL1B 1D4NA 2DE4A 2F6GA 4PP0A 3V83A 2DE2A 3BBRA 1IXCA 2RF1A 4MLVA 3H6UA 1WODA 2RCBA 1MY2A 4H0WA 5BUUA 1B3HA 5I58B 3HO7A 3V5AA 4RNSA 5L9SA 5AA4B 1LCTA 4LONB 5I2NA 3HHFA 3UA8A 1P1QA 5HM4B 4F19A 3B6TA 2I0CA 4FEDA 1LLSA 4ZEKA 1POY1 1O63A 3SETA 4I62A 4DLDA 1SDXA 3P7IA 4FEBA 4POXA 3KEIA 1P1NA 3MPLA 4NF5B 4OEVA 3OSQA 4XKRA 1GV8A 5AA1A 1MQHA 2RINA 3OXNA 4P0IA 3B6WA 4DCXA 4JXIA 1M5BA 2F78A 3CR9A 3ZSFA 1XVYA 2DE3A 4G2ZA 1IUDA 2RC7A 2Q88A 3MZ1A 4R6KA 4H67A 1A55A 3VLVA 4GWOA 1JW1A 5DVIA 2VGQA 3RT8A 4H1XA 4N07A 3LSLA 2O7UA 1Y4TA 2G29A 2QS3A 4LZ5A 1ELJA 1N3XA 1QUKA 3RGYA 1IQ7A 3M3KA 2O1MA 4TOZA 3TCGA 4RXLA 4BLAA 3PU5A 5I2KA 1N3WA 3UORA 1Y1ZA 1B3EA 1JNFA 4PFTA 3FVGA 4Q30B 4DCYA 2Y7PA 3OD7A 1UTHB 2NOOA 3TYHA 4YKKA 4EXKA 2X7QA 3CSBA 1MDQA 1NL5A 5J1DA 4ZEDA 3SEXA 2F6PA 3K6WA 2Q89A 1H76A 3C32A 1SW1A 5ISUA 3GBBA 5CC2A 2XXIA 1MPDA 1RKMA 1S7YA 2DYXA 3ILUB 3KJ7A 3O97A 3CIJA 3S9LC 3G3HA 5DYHA 2O84X 4TLMB 1USYE 4O3AA 3T9XB 4X1BA 2D3IA 1NNPA 1MY3A 1FQEA 4KR5A 3E4RA 1LAGE 2Z8EA 2V3TA 1QUJA 3RUMA 1DOTA 2I6EA 2OZZA 4WXJA 1PBQA 4HCYA 3KOSA 1JVXA 3CG1A 4P0GA 4WEDA 2R71A 4RJZA 1B6HA 1M5DA 4U1ZA 2ABHA 1Y3NA 1XT8A 3LSWA 2O1LA 4XTCQ 5I58A 1LB8A 3TZAA 3PUXE 1GR2A 3I6VA 5AA4A 2NXOA 1VE4A 1LSTA 1IIWA 1SW4A 1ZLQA 4OWDA 3C36A 4OTEA 4NF4A 4U22A 5CRYA 3TCHA 2YPNA 2VHAA 4XKNA 4LZ8A 3TODA 1MXWA 2XHDA 4G68B 1FTLA 3ODBA 2D5WA 4YB5A 5I59B 2H4IA 4R2BA 4BDQA 4HW8A 2QMWA 4YAHX 4FJPA 1LFGA 3C31A 1VSOA 4F2OA 2X7PA 3PD8A 3MAMA 4R75A 3CFZA 3OEMA 2B3BA 4IY5A 3ZKKA 4EUOA 4LZ7A 2Z8DA 2THIA 4F3PA 2DWHA 3FXUA 1FTOA 2QMXA 4FECA 3MP6A 1SW2A 4IB2A 1MQIA 4H65A 1I6BA 1JETA 4M4GA 1SVXB 3C33A 4YU0A 3V8XB 2UXAA 3HPIA 1B7ZA 2UVHA 4JBZA 4HCWA 3PGFA 1FTMA 1UTHA 4PFYA 2FNCA 2DP8A 3C9HA 4NF6B 4EDPA 4AQ4A 3PPPA 5A5XB 1CB6A 4IO4A 1MS7A 1MG1A 1FQFA 5FHOA 3FXQA 3FVOA 3LSFB 1SW5A 3G3GA 2QS2A 2QSXA 1NH7A 3CI8A 4YB6A 2AYSA 4QHQA 1RYXA 4H8IA 3ZKLA 1HSEA 3OEKA 1DPEA 3HCQA 3LR1A 3MZBA 4JDFA 3MVWA 3OENA 3VDFA 2HAUA 1N0TA 3OOAA 4P11A 3QSLA 3L6HA 3M8UA 2DOJA 1H3DA 4EF2A 1VFEA 3N94A 3PPRA 4E0WA 2B65A 3O28A 3PUWE 2AL4A 1TWYA 3O6IA 5EHSA 3IOWA 1N84A 4YICA 4WKMA 1LFHA 1B5JA 5AE4A 1A99A 1SBPA 2XXHA 3G7WA 3IO4A 3OO8A 5CM6A 3EPEA 1M5EA 1SI1A 5JK4A 4GVOA 3S9EA 3QXMA 2I58A 4F39A 4MBPA 5FTHA 3VFJA 2VD2A 1AIVA 2I48A 4QRZA 1UQWA 1JEUA 4GIZA 1JW4A 3MUQA 5HPQA 3H6TA 3HN0A 3Q27A 4QFNA 4ELQA 1Y3QA 2OCUA 4G68A 4X9TA 2QL3A 2A5SA 4G4PA 1R9QA 1M5FA 2O7IA 1DTGA 4IY6A 2XXUA 2Y7KA 2FYIA 5ELVA 4U23A 2CZLA 2ZNSA 3SESA 2V93A 1UTBB 3U94A 5M2VA 3FVNA 1FQDA 2P1SA 4L17A 1URDA 2XXVA 3QUJA 5CMKA 3TTMA 3CSGA 1LB9A 4ZE8A 2I49A 3EN3A 3K1NA 4BDNA 4NF8B 5I57B 5B7DA 3A09A 2OBGA 2G93A 3G3IA 2IEEA 4YKJA 1BP5A 4DXCA 2UYEA 4OERA 4OEUA 2DVZA 3VXCA 4R9GA 1Y1MA 4KCDA 3UK4A 3W9VA 4QFKA 1ZTYA 5H8QB 2B3FA 1BIYA 3QUFA 4ZECA 3TELA 2F7CA 3F11A 3VLWA 4DXBA 1OQGA 4NF6A 4G8MA 2ZYKA 3GZGA 2ZYOA 1DMBA 1FQCA 2DXRA 4QSCA 4DIGA 1A8EA 1DPPA 4ESWA 2H99A 1QULA 3DP6A 2KLFA 1Y20A 4IGRA 4BDMA 1QVSA 3GLBA 4MLQA 2F36A 3FVKA 3FIRA 4F1VA 4F1YA 1FW0A 1R9LA 4RPNA 2RC9A 1BKAA 3LC8A 3O6HA 3OO7A 1OVTA 1MXUA 3SEYA 1Q35A 3C35A 1PBPA 4IO7A 5H8FB 2ANJA 4PQJA 4RYAA 3VV5A 1MRPA 3T9UA 1OQHA 1NKXA 4NE4A 1I6AA 1N76A 1J1NA 4F3BA 4OENA 5ITOA 4OXVA 1NNKA 3UN6A 1AOVA 1I6QA 4NMYA 2ONKE 5F7VA 3PUZE 1OVBA 4R73A 5CMBA 2F7AA 4ZS9A 3MVYA 4RY1A 4C1UA 3KN7A 5DEXA 3E13X 3SEUA 2DVCA 3MC2A 4ESXA 4Q0CA 4KHZE 5JTYB 2XD2A 3CFXA 4YKIA 2WKYA 4GRKA 1B0LA 1UIVA 4M1VA 1LBCA 4DXUA 3RTWB 1MQJA 1URSA 3UGWA 4AB5A 2PYYA 5KCJB 2HZKA 4XKQA 1LCFA 1MH4A 1SQYA 4MF3A 3THIA 1UTBA 3MP1A 3TKDA 3VVEA 1Q1KA 2GRVA 1MQDA 1MXXA 2HZLA 4LVQA 4UA8A 4C1TA 1EU8A 3T96B 4KYEA 2P2AA 4OZ9A 4G8NA 3KGCA 2E0SA 1Y9UA 2X26A 4BDOA 2HXWA 3SERA 1EZOA 3C34A 4OHNA 3IOTA 4C0RA 3G3FA 5I57A 2XXPA 1XHYA 3M3FA 2PT1A 4GXAA 2H5YA 1H43A 3L6GA 2F8DA 5B70A 2HEUA 4R9FA 4H6DA 2I3WA 4NTLA 4OFOA 4QFPA 1R1NA 1EH3A 1JVYA 2NUVA 4RK2A 4F22A 2RCAA 1GVCA 1BLFA 3VLUA 5TP9B 1N04A 3EHTA 3MJNA 1A7LA 4HS7A 1PB8A 1MY0A 3UP9A 2ZNUA 1I69A 2PMSA 4ZDMA 1RYOA 2O6AA 3DELB 3SEWA 3HSTA 3OSRA 4U4SA 3LSXA 5BWJA 5AA2D 4TQUQ 4LA9A 2YLNA 1POTA 3OO6A 2Z8FA 3N26A 1A8FA 1NNTA 3JZJA 2UVJA 1VR5A 2Y7WA 1NH8A 1Z7NE 4NF5A 4DZ1A 1T0KA 2PX1A 2F97A 3T66A 5FHMA 3O6GA 4MH5A 5KDTB 5H8FA 4RA1A 4I1DA 3DM0A 4LUBA 1MXVA 4JSDA 5L9MA 5EHMA 3O2AA 2H9BA 4XKPA 2M8CA 2UVIA 1Y4CA 1B05A 3W15C 5HBCA 3D4CA 4OETA 4XXUA 2XXRA 1FQAA 5H8NB 2CMOA 1B5HA 2QRYA 3QYTA 2RKMA 5TPAB 4ZEIA 3TPAA 4GF8A 3EF7A 2VP1A 4FORA 2DSFA 2ZXTA 1MY4A 1IITA 3RY3A 3K2DA 3PMWA 5H8HB 1B51A 3MVXA 4KCCA 4DE8A 3FGSA 5AA2B 2A5TB 3H06B 4QSEA 4I9DA 4IO6A 4FATA 5I56B 2HFBA 4KI0E 3SKPA 3K6UA 3TTNA 3TQLA 2DQVA 4U1OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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