4ELQA

Ferric binding protein with carbonate
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
SPTLTIYSGRGQSLVEPLVKQFEAETGIRVQVRYSTDAQILAALQEEGSRSPADLFWANTAGALGQASAKGLLRPLGETLLEKPIAFVPASRTWVPVTVRLRVLAYNPDRIKAEELPESLLDLPRFAREKGLVGRVGWTPTYSSFQDMVAGMIALYGEEKTREWLLAMKALAPKAYPSNPAMLDAIRAGEVDLGSTNHYYVVRFRRAGYRLGMHHFRDGDAGNLALVTGAGLLKTSKNLAAATRFLTYLLSPQAQQYFVGNIGEYPLVKGVALDPNLLPLEEALAKSPKLDLEKLPLDRALRLLRETGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of ferric binding protein A
rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords Iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein
total genus 114
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elqA02
3H6UA 4FEBA 3IO4A 4JBZA 3MZBA 1SQYA 2AL5A 2NVUB 4R2FA 3ONMA 4GWOA 1PB7A 2ZNSA 4O3BA 1B32A 2XXRA 3S9NC 1LCFA 4WXJA 2X7QA 2RINA 5I56A 5JTYA 4HCWA 1N3WA 2F7BA 1B9JA 1NNFA 3KSXA 3O6GA 5CBSA 4GL0A 3LSXA 2Q8JA 2DXYA 3IO6A 4QFKA 3VXBA 3GXAA 4ONYA 5I59A 5TU0A 1QUKA 5I57B 3ZS6A 2OK2A 4PE5B 3BBRA 2I6EA 4OMBA 1M5FA 5CI5A 2GHBA 2R71A 4H67A 3O2AA 5KCJA 2XD2A 3UA8A 3GZGA 1N3XA 4RJZA 4Z7EA 1NFTA 2V3UA 2H99A 3H06B 5AA4B 2QS3A 2HFBA 4XTCQ 3T9XB 4IB2A 1DOTA 5L8DA 2ZYNA 2AYSA 1MQJA 4F3SA 3TTRA 3TAJA 2W7YA 1VE4A 4EDPA 2Z8FA 3IAZA 1MQGA 3QSLA 4KFQA 3N5LA 1IIWA 4N07A 1BLFA 1DTZA 5ICTA 4UA8A 4G68C 3QAXA 4DDDA 2HZLA 3PUVE 1ZIUA 5EHSA 3USDA 4U1ZA 2D21A 2I0BA 3OEKA 1I6BA 3PPPA 4LATA 2O84X 1NNPA 3KBRA 4OXVA 3IORA 2RCBA 1AOVA 1PB8A 3KEIA 3MVZA 3K2DA 1ELJA 4N13A 1GTKA 5I58A 4ZEBA 2UVGA 2DQVA 1ANFA 3MPKA 3R6UA 4DIGA 3G3HA 3S2VA 3MVYA 4R6KA 2XX9A 4H65A 4YKPA 1B40A 4KCDA 1JVYA 4HW8A 1B4HA 3L6HA 2XHDA 4H6DA 4PFTA 3EPEA 5A5XB 5DTBA 5H8QB 2PX1A 2ZYMA 1MXZA 1PBPA 3TODA 1TFDA 4NMYA 3JZJA 2RC7A 2Q2CA 3MBPA 4IY5A 2QSXA 1OVBA 2ABHA 1ZMGA 4GF8A 5DVJA 3O66A 3C33A 3CG3A 3IL1B 4IO3A 2PT1A 4H5FA 4G77A 4BDLA 3FXRA 4U4XA 1MM7A 3K1PA 4YMAA 3MPLA 2DYXA 3PD9A 1POY1 4MBPA 3CSGA 2GRVA 3C9HA 1B3HA 3T93B 1EZOA 3SEWA 1AL3A 1P1QA 3E13X 3O9PA 5AA2B 4X48A 4QFLA 4QSEA 3W9WA 1LB9A 3S9EA 2XXVA 1P1WA 3RTFB 1YCJA 1D4NA 3CVGA 2PMSA 1F9BA 5DEXB 2A5TA 1Y1MA 3KJ7A 4NF8B 1BP5A 2PVUA 3SEXA 2A5SA 4ECFA 4H8IA 1MXWA 3K00A 4POXA 5HBCA 1B3LA 1SYIA 3PUXE 4Q8RA 4NWCA 2Z23A 1A8FA 2H4IA 3LBSA 5ISUA 3E3KA 2G93A 4IO6A 2DWHA 3TKDA 2ALUA 2O1LA 4TOZA 5LOMA 3KZGA 4G8NA 4NF4A 3IJOB 4TLLB 4OHNA 3U92A 5DT6A 2HQ0A 4G4PA 4R74A 1WVJA 4KPTA 3O29A 2V84A 3T9VA 2NUVA 3I6VA 2OWTA 1TWYA 2QS2A 1D9VA 4LA9A 1SBPA 4OETA 3FV1A 3FJGA 4C1UA 4YKKA 4RK9A 1TT1A 3VFJA 4FE8A 1JEVA 1MPCA 4IO5A 3FJMA 5AE4A 2V93A 3CFXA 1B51A 3MP8A 3M3FA 3MVWA 3MAMA 1LFIA 5BWJA 1B5JA 1IEJA 3MC2A 4DXBA 3EN3A 3K6XA 3MP1A 1LAFE 2RKMA 4JSDA 2QMXA 1MXXA 1A54A 3HCQA 1M5EA 3RLFE 3A3UA 4KQPA 4EQBA 4IO2A 4G68B 3BFTA 4F29A 1HSEA 4KYDA 4G2ZA 1I69A 3V8XB 4NEDA 1D3KA 3S9MC 4ZEKA 2O69A 2F7AA 4AB6A 1NNTA 3U94A 4GFRA 4XXUA 3DP8A 4LONB 2Y7WA 1VFEA 4GQOA 3WAEA 4JDFA 4R72A 1POTA 1QULA 3JV9A 1QKBA 4NF6A 1H45A 3MVXA 2XD3A 3TDJA 4BLAA 3F11A 3IOUA 1A99A 2QRYA 3RT8A 1XS5A 3O6IA 3RGYA 1MM6A 1MDQA 4GL8A 2X7PA 4ELRA 4EUOA 2I4CA 3H7MA 1FTMA 1R9LA 3S9LC 4LVQA 3GLBA 3OXNA 5TPAA 5I2NA 1O64A 1LSTA 1JQFA 3CSBA 3HPIA 2QS4A 4WKMA 3VXCA 4XKPA 1RYOA 3CRBA 4KCCA 4GXSB 1URDA 3C34A 2Z22A 4F2OA 1MH3A 5KDTA 2RC9A 3ZSFA 3HHFA 1WODA 5ICQA 1HSLA 5H8FA 2FA7A 3G3IA 1ZBMA 3R26A 3O97A 2OWSA 3N94A 4BDOA 4FEDA 1FTKA 1N7WA 1DSNA 3IJXB 1EH3A 4O3CA 4ESWA 1Y3QA 4XIGQ 2FYIA 2F36A 1NKXA 3OO7A 1FTOA 2D5WA 4MLQA 2THIA 3K0VA 4FJPA 3O28A 3VVEA 1B5HA 2ZXTA 1Y20A 1MPDA 4F1VA 2XXYA 1FW0A 4JSOA 2HAVA 4EF2A 2O68A 2DVZA 1B7ZA 3VV5A 2I3WA 1B0HA 3ILUB 1XVXA 2M8CA 2ONSA 3FATA 3UN6A 3FVOA 1SW2A 2I48A 4Z0IA 4YB7A 2FNCA 2XXQA 3FXUA 1GV8A 1II5A 1B5IA 3PMWA 1AMFA 1XVYA 1B7UA 1SI1A 4L17A 4LP2B 1M5BA 5B70A 5CC2A 1LAXA 5H8NB 3G3FA 4QFOA 4ELPA 1LCTA 5TP9A 4EQ7A 2GH9A 2QL3A 4U23A 2R6GE 4GVOA 5H8HA 1B7HA 4ZZEA 3E4RA 3K6VA 4ZS9A 2I3VA 2ZNTA 1M5CA 3QIMA 3U1OA 3TTLA 1LGBC 3VVDA 1JW1A 4OEUA 1Y3PA 2DWAA 1O63A 3R7XA 5EHMA 3H6TA 1BTJA 4OWDA 3KSJA 3FD3A 4NF5A 5I2KB 3WAFA 3S4UA 2AIXA 2XXTA 3FXQA 3MZ9A 1LFHA 1MQIA 1EU8A 3K01A 4GXAA 4MLVA 4RYAA 3ZKKA 1H76A 3T9UA 3DP6A 1GR2A 1Q35A 2YLNA 3UORA 4KR5A 2G29A 2WKYA 3O6HA 4R75A 4ZE8A 2O7UA 3C36A 1RYXA 2XXHA 2Y7PA 1SD3A 4WEPA 1UTHB 2Y84A 4TLMB 1FQBA 1H43A 3VLWA 3TTKA 3ODBA 4BDMA 3QK6A 3HO7A 4RXLA 2UVIA 1JW5A 2ZYOA 1DPEA 4IO7A 1B3EA 4I9DA 2V25A 3RY3A 4C1TA 5I57A 4WEDA 2Z8DA 4H0WA 4DCXA 1PC3A 4YB5A 3Q26A 1B05A 1B2HA 1VFDA 2DE3A 4ZECA 1P1OA 5CMCA 1MXYA 2VOZA 4F1YA 2P1SA 5CM6A 5M2VA 3C31A 1ZKBA 1IQ7A 1NMUA 4YZZA 5AA4A 3PGFA 4OZ9A 1M5DA 4P0IA 5CMKA 1IZ1A 2Q9TA 4U22A 4R9FA 4OENA 1CE2A 1L5TA 1S9TA 2UYEA 3C32A 3LR1A 3FASA 1B46A 4R6YA 1A7LA 4HCYA 2F7CA 5DVIA 2E0SA 5ITPA 3VE1B 3G3GA 3TYHA 4F18A 5CBRA 4IGRA 2Q89A 4IGTA 5F1QA 3KFMA 3RT6B 4ND9A 3OO9A 1H44A 3LSFB 5H8SA 4H8JA 1MY1A 2B65A 3TTMA 4R73A 3U93A 5IKBA 1Y4CA 4DLDA 1UIVA 2OBGA 3KN3A 4H1XA 2CMOA 1T0KA 3E9XA 1XOCA 2Z8EA 3DELB 4OTEA 3UP9A 1QW0A 3SEUA 1ZTYA 4OQOA 4DZ1A 4YKJA 1MY2A 2DP8A 3Q28A 3Q27A 4THIA 3FVKA 1OLCA 2XXXA 2UXAA 1Y4TA 4BDQA 1OVTA 4NE4A 2IA4A 2UVJA 3UGWA 5K2YA 2I58A 1UTBB 4TQUQ 2XXPA 3KN8A 5A5XA 5H8QA 4M1VA 1MPBA 1R6ZA 1SDXA 1D9YA 2P0SA 5CMMA 1OIBA 1MY0A 3HHGA 4LZ8A 1CB6A 1HSJA 3G7WA 3AXFA 3PU5A 3W9VA 4KYEA 1QKAA 2OCUA 2QPQA 4ISUA 3U8QA 3K1MA 4E0XA 2HAUA 3T96B 4PQJA 2F97A 5CMBA 2VP1A 3DM0A 4F2QA 4YMBA 1S50A 1R9QA 2F34A 1IITA 2OJTA 3K02A 4JWOA 4ZEFA 4AQ4A 1B4ZA 3SEVA 5AA2A 2Q2AA 4I8CA 2DE2A 1TXFA 1I6QA 5AA1A 4ELOA 3FJ7A 3IX1A 3RUMA 5L9SA 2ONKE 4HTGA 1P1UA 3I5OA 3JYRA 4XKRA 2DSFA 3PPNA 5DEXA 3SKPA 4OYVA 2B3FA 2O1MA 4NF8A 5FTHA 4GOTA 5I56B 3G3KA 4QSDA 5JTYB 3EQ1A 1Y3NA 3H3GA 1A55A 1US5A 2V3QA 3C35A 3H4ZA 4OFJA 3VDFA 1B1XA 3RN8A 2LAOA 1MH4A 2RC8A 3MW0A 3N6UA 4X1BA 5I59B 4ZEIA 5DYHA 3CFLA 4EQ9A 1VR5A 5L9OA 1SW1A 1P1NA 3IK6B 2NOOA 3BFUA 1RKMA 4RA1A 5KCJB 3GBAA 4P11A 1SI0A 4OESA 4FAJA 1ZJLA 4MF3A 3TUSA 4U4SA 5I84A 1MQHA 3T22A 5EYFA 4RNSA 3OELA 3B7DA 2H9BA 1H3DA 3KG2A 1N76A 3BKIB 4FIMA 3KN7A 2NXOA 4NTLA 1FQEA 3PMXA 1B3GA 4IY6A 3I3VA 4MH5A 2XX7A 2YPNA 5JK4A 3A3CA 4YKIA 4FATA 1DPPA 1Z7NE 3UIFA 4PETA 3TMGA 3MWBA 4K3FA 3ZKLA 3RNNA 2NWJA 3OOAA 3EHTA 5DVFA 1QVSA 5I58B 2F35A 3SETA 4KHZE 3EHSA 3K1NA 3T9HB 5AA3A 3P7IA 4OFLA 3B6QA 2BJJX 4U1OA 4DE8A 1JW4A 4G68A 1FQFA 2RF1A 2DWIA 1IUDA 3Q25A 3TCGA 1B1HA 3HSTA 4I1DA 2REJA 1URSA 2F6PA 3IOTA 3ECRA 3OMBA 1AIVA 2ONRA 1ZLQA 1NH8A 3QYTA 2Q88A 4U21A 5K2XA 1O7TA 3FUZA 1P99A 3CFZA 2HCAA 3N6TA 2P2AA 3SDFA 3DP4A 2H5YA 1LLSA 3OENA 4POWA 5AA2D 3B6TA 3FIRA 5FHNA 2X26A 2PT2A 3IB0A 2VGQA 2VHAA 3MUQA 2I0CA 4KD5A 2XXUA 1QUJA 3PMVA 1Q1KA 2F78A 3K6UA 4QSCA 5J1DA 4U2RA 3RQTA 4HS7A 2PBWA 1NH7A 3OO8A 2ZMBA 3EHUA 3SERA 1OQHA 1B52A 3TCHA 3THIA 3TELA 4UACA 4R6HA 3RTWB 1TFAA 4GRKA 3N26A 2A5TB 4I62A 2O6AA 4F1UA 4M4GA 1MG1A 1SW5A 1MDP1 2I49A 5CRYA 1OQGA 1LBCA 4KI0E 1B3FA 3SESA 3PPQA 2XXWA 4DXCA 1I6AA 4YAHX 5BUUA 1AH5A 1JETA 1QUIA 3H6VA 4PP0A 4OFOA 3K4UA 3PD8A 1N04A 2QJEA 4QRZA 5F7VA 2DOJA 4F3PA 3LC8A 1ZU0A 4X1DA 4EXKA 4NF4B 4P0GA 3CR9A 3IOWA 1A8EA 2I4BA 3G3JA 4KYSA 2R9JA 2H25A 1SVXB 3FV2A 3V89B 4MFIA 2OZZA 2Y7KA 1PBQA 1DMBA 1MXUA 1MQDA 4O3AA 3CIJA 2VD3A 2E1SA 4OVJA 3PPOA 3TCFA 2UYFA 2F6GA 3EF7A 3TQWA 1QJMA 2REGA 4N6PA 3IB1A 3VLUA 3VLVA 1B6HA 4C0RA 1N7XA 4ZZAA 4G8MA 4RPOA 3QUFA 1MXVA 3KJTA 3PV0E 5IAIA 2QMWA 2DVCA 5H8NA 2OLBA 5FHOA 4E0WA 1USYE 3DLNA 5L9MA 5HPQA 2HXWA 3GBBA 3SEYA 3M3LA 3MZ1A 2D3IA 3A09A 3RPWA 1IXCA 1FTLA 1LBBA 1PDAA 3FVNA 4JWXA 5I2KA 2ZYKA 3OO6A 4FECA 4QFPA 1FTJA 4EF1A 2DS9A 1YAEA 3D4CA 3IB2A 2XX8A 3C4MA 1B58A 4R9GA 3H03A 5ITOA 5ELVA 3IR1A 3Q29A 2O51A 3HN0A 1XHYA 4F31B 3PUYE 4LZ5A 4NF6B 4F39A 1YPNA 3MP6A 3MQ9A 4JB7A 3LSWA 1EZPA 4XKNA 1JVXA 2HEUA 3PPRA 3HV1A 4ESXA 4BDNA 1FQCA 1UQWA 4F22A 2KLFA 3LUYA 1GVCA 1OMPA 1UIUA 3TQLA 1LFGA 5TPAB 5I2NB 3TFLA 1UTHA 1KWHA 4LZ7A 4Q5TA 4GD5A 4YICA 1URGA 1MY4A 3KOTA 4JWYA 4NWDA 4ZEDA 1FQDA 1BKAA 5KDTB 1US4A 2F5XA 2UVHA 3T66A 1N0TA 2HZKA 4R2BA 4OEVA 5H8FB 3CG1A 1DTGA 1BIYA 1EZ9A 5FTIA 1Z7ME 3OD7A 1XT8A 2F8DA 2ESNA 3KOSA 3U72A 4XKQA 2YJPA 1WDNA 3PUWE 4PFWA 1GGGA 3B6WA 4QFNA 4X9TA 3W15C 5B7DA 1USYH 3FVGA 3TPAA 4PFUA 3ILTB 1PB9A 2ZNUA 3L6GA 1LAGE 3IOVA 3PUZE 1JEUA 1A40A 3H6WA 1IXIA 4F3BA 3MJNA 4FORA 2VD2A 4G8HA 4ZE9A 1ATGA 4GLIA 3LSLA 4LQ5A 1Y9UA 2PYYA 1FQAA 4F3GA 2QS1A 2CZLA 3M3KA 2H98A 1R1NA 4DXUA 1S7YA 3UK4A 4PFYA 2AL4A 1B0LA 4Q0CA 1IXGA 3VVFA 4RY1A 1FCKA 5HM4B 4BDRA 1Y1ZA 3OEMA 2RCAA 4ZDMA 2Y7IA 1OLAA 4EXLA 3V5AA 2GFEA 2DE4A 2B3BA 4JXIA 5TP9B 3OSQA 2DWJA 1YTVA 4AB5A 5KZTA 2Y7RA 4QF9A 3V83A 4F19A 5H8HB 1LAHE 4LUBA 4ELQA 3QUJA 3TEPA 3TTNA 3K6WA 1UTBA 1JNFA 2XXIA 1MY3A 2V3TA 2ANJA 5FHMA 4NF5B 1LB8A 4LQ2A 4YB6A 1VSOA 3KGCA 3M8UA 1NNKA 2IEEA 4YU0A 1NL5A 1SYHA 1MS7A 3FZVA 4RK2A 1N84A 5JEIA 1PEBA 4OERA 4RPNA 1IXHA 2GHAA 1MRPA 4H5GA 4QHQA 3FGSA 3CI8A 4GIZA 4Q30B 3QXMA 2O7IA 4IO4A 1XC1A 1SW4A 2DXRA 3D4GA 4DCYA 3OSRA 1J1NA 3TZAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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