4X9TA

Crystal structure of a tctc solute binding protein from polaromonas (bpro_3516, target efi-510338), no ligand
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
TYPSRPIELIVPYPAGGGTDVLGRAFALASVKHLPQNLIVVNKPGASGAIGWADVINGKPEGYKVALLATDLMTQPNMGLTKITHEDFIPIARLNYDPAAITVRADAPWNTVEEFLAAAKQGDFRVGNGGNGSTWHLAAAAVEDKTGVKFNHIPFAGAAPAALSLLGGHIEAITVSAAEVYAYTSTGKLKTLAVMSEQRIKGFEKVPTLKERNIDISIGTWRGLAVTKGTPPEIVNVLRAATAKIVTEQSLRDALDRQNMGYAYAEGEAFGAVMARDHAFYKGLINKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Unknown function
molecule keywords Uncharacterized protein UPF0065
publication title Crystal structure of a TctC solute binding protein from Polaromonas (Bpro_3516, Target EFI-510338), no ligand
rcsb
source organism Polaromonas sp. (strain js666 / atcc baa-500)
total genus 92
structure length 288
sequence length 288
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03401 TctC Tripartite tricarboxylate transporter family receptor
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x9tA02
3.40.190.150 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4x9tA01
4YKPA 3IOWA 1BLFA 1FTMA 4JXIA 2O51A 1AL3A 3TMGA 5K2YA 3H3GA 4R2FA 4KYSA 3K6XA 1VR5A 3MZ1A 1P99A 3CRBA 3UGWA 1N0TA 3SEYA 2OLBA 3QK6A 2XXPA 1O7TA 3TYHA 3CSGA 3I6VA 5BWJA 3U92A 1BKAA 3VDFA 2HZKA 3TTRA 1N7WA 1NNTA 3Q28A 1LAHE 1ZLQA 3KZGA 3KOTA 2NWJA 5EHMA 5A5XB 4IO2A 3CFZA 3M3LA 4I8CA 3MPKA 1DTGA 3TAJA 3SETA 2DOJA 4F1UA 3K00A 3DM0A 1UQWA 1ZJLA 3OO7A 4BLAA 3IO6A 1URSA 1MXXA 2I4BA 2CZLA 1B3HA 2PX1A 1MY0A 1IITA 3HN0A 3T96B 3KG2A 4NF8A 3EHUA 4HS7A 2F36A 1GR2A 4OERA 2WKYA 1MPBA 3R6UA 1JEVA 3MZ9A 1FQEA 4M4GA 5DVIA 3U94A 3IX1A 1A8FA 3C35A 1WDNA 5CI5A 2F7CA 3MBPA 4KFQA 4YMAA 3RQTA 2OJTA 4LVQA 3E4RA 3ZSFA 3IK6B 4NEDA 1SW4A 4R73A 4F1YA 5DYHA 2DE4A 5L9OA 2O1MA 5DTBA 1ZMGA 4GVOA 3TUSA 1POY1 1M5EA 2H9BA 3CG3A 3IB0A 1P1WA 3FV2A 5H8SA 4JWOA 2DQVA 3I3VA 2AYSA 3VFJA 4ESXA 4FIMA 3SKPA 1P1QA 2Y7WA 3KJTA 4IO7A 3O66A 5A5XA 3FUZA 2OK2A 3JV9A 3SEXA 3HPIA 3T22A 3QUJA 1AMFA 4H5GA 1IUDA 2X7PA 2RF1A 1JETA 4OWDA 3KSXA 3ILUB 2G93A 4IGTA 1FTKA 4N6PA 2F78A 1NNKA 3FXQA 4OHNA 4I9DA 2Y7PA 4HCYA 4GWOA 3G7WA 2Z23A 4EXLA 3OO9A 3SDFA 2DP8A 5I2KA 4PP0A 4G2ZA 2ONKE 3Q29A 3PUVE 4Z7EA 2DVCA 4NWDA 1P1NA 3IJXB 1USYE 4DDDA 4EDPA 3ZS6A 3PUWE 1LFIA 1AH5A 3W9VA 3C32A 3RT8A 1ZIUA 3OO6A 1LSTA 4NF4B 4PE5B 4GD5A 4BDOA 3F11A 3N26A 1I6QA 1PEBA 1R9QA 2NXOA 1MRPA 4NF5B 1OVTA 4R75A 1Y4CA 5I56B 1QKBA 1XVXA 3MPLA 4X48A 3UA8A 2QS2A 1O63A 2ZNUA 4ISUA 2OBGA 2ALUA 3RNNA 1MH4A 2F8DA 3D4GA 4G8MA 1H3DA 4R74A 3KFMA 4LATA 4E0XA 5JK4A 4RPOA 2DWHA 3N94A 2HAUA 2Z8FA 4XTCQ 2RCAA 2UYFA 1PC3A 3T66A 1JVXA 5I2NB 3E3KA 1B51A 4H65A 1II5A 4OEVA 4F3SA 4N07A 4WEPA 1NH8A 1I6AA 2FYIA 4RY1A 1B58A 3IB2A 4R6HA 4QFLA 3H6VA 5DEXB 2RINA 1USYH 3OEMA 3MVZA 2H98A 3BKIB 3S9LC 2ABHA 4TLLB 5FTHA 1US4A 3GBBA 2RC7A 1D9VA 3PD9A 4OEUA 2QL3A 3E9XA 3W15C 2Q8JA 5ELVA 1Y1MA 4F39A 2AIXA 1RYOA 2Y7RA 4O3BA 1POTA 5CC2A 3FJGA 4H1XA 4PFUA 1UIUA 1NNPA 4NF4A 2PBWA 4EXKA 4R6KA 4EQBA 4MFIA 3MW0A 4I62A 4IY6A 4H0WA 5J1DA 4Q30B 2I49A 4PQJA 3M3KA 1XVYA 1ANFA 3H03A 2QSXA 4GLIA 3O97A 3PPPA 2UVJA 1N7XA 5L8DA 3CI8A 1IEJA 1B5JA 2IA4A 4KPTA 5ICQA 3K01A 5AE4A 4EF2A 1LAGE 1B7ZA 3LBSA 4ZEIA 5L9SA 1FTJA 1D4NA 4WKMA 2IEEA 1BIYA 3CFXA 4GL0A 3VXBA 1YPNA 4LONB 1MQJA 1MY2A 3CSBA 4G68B 1YTVA 4ZZEA 4QF9A 1UTBB 4GXSB 4KD5A 1O64A 1GTKA 3TDJA 4PFWA 3O6GA 3UN6A 5AA2B 4ZZAA 4ZE8A 4OENA 3ZKKA 2H99A 1EZOA 3G3JA 5AA4A 1Y1ZA 5H8NA 2DWJA 4THIA 1MXWA 1R9LA 5HBCA 1CB6A 1B1HA 3MP6A 5B7DA 1A55A 1FCKA 2A5TB 3LSWA 4R72A 2XXHA 1JW5A 5TP9B 2ZYOA 2QMWA 4RA1A 4XKNA 5I59B 2E1SA 2GH9A 1NKXA 1I6BA 2I58A 3H7MA 4C0RA 2I4CA 1URGA 3JZJA 3T93B 4GRKA 4RXLA 1T0KA 3N6TA 4DIGA 3IOVA 5I58A 1HSJA 2HXWA 2V84A 4AQ4A 2HCAA 2YLNA 3H06B 5BUUA 3GBAA 1DSNA 1JEUA 3AXFA 4OETA 5CBRA 5DT6A 3DELB 1B3LA 2F7AA 4XIGQ 3QXMA 3DP4A 4YB7A 5H8QA 4NMYA 2Q9TA 3FVGA 2P1SA 3ECRA 5LOMA 2UYEA 4JDFA 5KCJB 3T9VA 3VVEA 4DXUA 4GIZA 1SW1A 4YICA 1MM7A 2XXWA 2F97A 4IO5A 2XXYA 1N04A 3C33A 4C1TA 4EUOA 1UTBA 3QSLA 3PD8A 3OENA 1XOCA 4GL8A 4U1ZA 1B7UA 1Y3QA 4YKIA 5AA2A 1JQFA 1N3XA 1AIVA 4BDNA 3S9EA 4FORA 5KDTB 1LFHA 1LFGA 3MP1A 2DE2A 1QVSA 1LCTA 2QRYA 2P2AA 5H8HA 3CR9A 4MH5A 3ODBA 4F3PA 4PETA 5TU0A 4ZEKA 3IOUA 1WODA 3V89B 2PVUA 3TCGA 3PV0E 5DVFA 3MWBA 2D3IA 1IXGA 4U23A 2OWSA 4JSDA 3RY3A 2UXAA 3CG1A 1PB9A 4OXVA 5CM6A 3K2DA 4YKKA 3HV1A 2VD3A 2UVIA 1B3EA 3UP9A 2V3UA 4JSOA 3G3KA 1FQCA 2F34A 4R9GA 2VP1A 2XXQA 4F1VA 1DTZA 1QULA 4UA8A 5CMCA 2GHAA 4JB7A 3THIA 3T9HB 1YAEA 4QHQA 5HM4B 1B1XA 3IAZA 2PYYA 4RNSA 3O28A 4P11A 3K0VA 2NOOA 3B6WA 3FVNA 4HCWA 4LZ8A 2XXXA 2QMXA 1SI1A 1PB7A 4G4PA 4K3FA 1M5FA 1IXHA 3KN3A 4RK2A 4R2BA 5EHSA 4IGRA 4FEDA 4R6YA 4BDQA 3MVXA 5H8FB 1OLAA 4M1VA 3OOAA 2XX8A 3O6IA 3MZBA 1XT8A 4U21A 4U22A 4F19A 2NUVA 3FVKA 2ZYKA 2X7QA 1Y20A 1OQGA 2XXRA 4NWCA 1Z7NE 1LBCA 3H6WA 3V8XB 3GXAA 1B3FA 4X9TA 1MDP1 3MUQA 4YB5A 3H6TA 1H43A 4JWXA 2V3QA 3TCHA 1EU8A 1DMBA 2DXRA 4ZECA 2ESNA 3I5OA 4IB2A 4DXCA 3G3IA 4ZEBA 1UTHB 2ZYMA 2VD2A 1P1UA 2RC9A 3C4MA 2O1LA 4DE8A 3FGSA 1JVYA 1LB9A 3PMVA 1D3KA 2DE3A 3VVDA 3QYTA 1A54A 2CMOA 1MQDA 4IO3A 4HW8A 4H67A 4XKPA 3C34A 4UACA 1EZ9A 1S7YA 4FAJA 1PB8A 1FW0A 1NNFA 3FIRA 3LC8A 3PUZE 1S50A 4XKRA 1IIWA 1A8EA 5I57B 2I6EA 3U93A 4NF6B 4EQ9A 5B70A 2AL4A 1B4ZA 1H44A 3PU5A 2Z8DA 1NL5A 3UK4A 2D5WA 3M3FA 1D9YA 3N5LA 3LSFB 2DYXA 4OVJA 5H8FA 4OYVA 1MXZA 3G3HA 3VLVA 3CIJA 1BP5A 3FVOA 4Q8RA 1ATGA 3C31A 4Q0CA 3LSLA 1ELJA 3IR1A 1GVCA 3E13X 2XXIA 1B5IA 1TFDA 3FJ7A 3M8UA 4Q5TA 1DPEA 1LGBC 4TQUQ 3TFLA 3K02A 1P1OA 2Y84A 2BJJX 4WXJA 3LR1A 1FQDA 1XS5A 3MAMA 1MXUA 2O84X 4QRZA 3P7IA 1MY4A 4FJPA 5FHOA 4KYDA 1B4HA 2ONSA 2REGA 2RCBA 4R9FA 4ONYA 2F6PA 3TTLA 4BDMA 1UTHA 1M5CA 5TPAB 3KGCA 1B0HA 3OELA 4G68C 4XXUA 2DVZA 3H4ZA 4KR5A 2RKMA 3SERA 1B05A 4NF5A 1N3WA 4ELPA 2QPQA 3K1NA 3PPRA 5I56A 3O29A 1MXVA 3L6GA 4F18A 2XD2A 4QSDA 4GFRA 1PBQA 1OQHA 4F22A 5I57A 3K1MA 1Y3PA 2V25A 4G8HA 4L17A 3VE1B 4KCCA 4RYAA 4ELRA 1A40A 1MQIA 1QUKA 4F3BA 1QW0A 3HHGA 5M2VA 2XX9A 3IJOB 1YCJA 1QUJA 5I2NA 1NFTA 1R1NA 3RLFE 4H5FA 2HZLA 1LAFE 2DWIA 3EPEA 3FASA 1US5A 2QS4A 5DEXA 1M5DA 3EHSA 3TTNA 1OMPA 4OQOA 2ZMBA 3G3FA 4ZEFA 3IO4A 1H76A 2F35A 2THIA 3SESA 3KEIA 2REJA 2YJPA 1ZBMA 2AL5A 4FECA 3FV1A 1XHYA 3S2VA 2W7YA 3A3UA 5TPAA 1MM6A 2A5SA 3GLBA 3LSXA 2XX7A 2ONRA 1B46A 4AB6A 1VFDA 2H4IA 1S9TA 1J1NA 1PBPA 3QUFA 1TT1A 2XXUA 4QSEA 2FNCA 2H25A 4KHZE 3PPNA 2Y7IA 1URDA 1QKAA 4X1BA 1LLSA 3TKDA 3L6HA 2UVHA 3FD3A 4P0IA 2HQ0A 4NF8B 1SBPA 3PGFA 4ZE9A 4LA9A 4U4SA 2B65A 3W9WA 5CMBA 3R7XA 3C36A 3DP8A 4I1DA 1LAXA 1ZTYA 4POXA 5HPQA 3MVYA 3VLWA 3HO7A 5ITPA 4RPNA 4G68A 1XC1A 1VSOA 2Q89A 4QFOA 4LZ5A 1B40A 1BTJA 3OXNA 4RK9A 3TODA 1H45A 3S9MC 4MBPA 1EZPA 3SEUA 1B9JA 3KN8A 3QAXA 1SDXA 1B3GA 4ELOA 2RC8A 3VVFA 4IO4A 1M5BA 1MH3A 1MXYA 5CRYA 4WEDA 3TPAA 2A5TA 2V3TA 4IO6A 3FXUA 4KI0E 3TEPA 5TP9A 3EF7A 5I84A 3EQ1A 3K1PA 3KJ7A 1SW5A 1RKMA 1TWYA 1MPCA 5I59A 3C9HA 5ICTA 4JWYA 5FTIA 1JNFA 1PDAA 4F2OA 2Z8EA 4U1OA 3PMXA 2VHAA 2ZNTA 2O7IA 5JTYB 2ZNSA 1SYIA 5ISUA 4YU0A 4F29A 3MC2A 3Q27A 1SI0A 3OEKA 4YMBA 2R71A 1MQGA 3EHTA 4TOZA 2F5XA 2X26A 3TQLA 3O2AA 3G3GA 4LZ7A 2I3WA 4ND9A 3MQ9A 2GHBA 5I2KB 2I48A 4DZ1A 2ANJA 3TELA 4F3GA 1N84A 2HAVA 1FTOA 4QSCA 5KCJA 1Y3NA 4DXBA 1OVBA 4OFOA 2Y7KA 1WVJA 1MY1A 2OZZA 1B7HA 2O68A 1N76A 4ZS9A 1B2HA 3T9UA 3KN7A 4GXAA 1DPPA 3IOTA 5KDTA 4U2RA 2Q88A 4OFLA 3FZVA 1TXFA 3BFUA 1R6ZA 4KCDA 3KSJA 1ZKBA 1FTLA 2D21A 4POWA 5IAIA 1GV8A 5CMKA 3MP8A 3UORA 3OD7A 3ILTB 3PPQA 3VLUA 3H6UA 4OESA 3RN8A 3PUYE 1AOVA 2O69A 4U4XA 4YKJA 3RTWB 1B5HA 1VE4A 4NTLA 5AA3A 2OCUA 4OMBA 2XD3A 3PPOA 5JTYA 4O3CA 4DCYA 1Q1KA 1JW1A 3GZGA 4NE4A 4LQ2A 3OSQA 1SQYA 4FEBA 4C1UA 1L5TA 1MDQA 3K6UA 1QJMA 4ECFA 3U72A 3S9NC 2LAOA 3HCQA 4GF8A 2QS1A 4PFTA 3RUMA 4PFYA 2DSFA 3HSTA 5F1QA 1VFEA 2I0BA 3KOSA 4GQOA 1OIBA 1IQ7A 1NMUA 2HEUA 3SEWA 1NH7A 4O3AA 1MQHA 1B52A 4FATA 1EH3A 4LP2B 3IL1B 1F9BA 1HSEA 3ONMA 4YZZA 4LUBA 3R26A 4OZ9A 4QFKA 1FQBA 3ZKLA 5CBSA 3Q25A 1B32A 1B0LA 1Y9UA 3O6HA 3MVWA 5EYFA 4ELQA 4N13A 1MPDA 1FQAA 1SVXB 3N6UA 5FHNA 3PMWA 2ZYNA 2H5YA 4JBZA 2V93A 2XXTA 2ZXTA 4YAHX 1MS7A 3TTMA 3RPWA 1IZ1A 5DVJA 4H6DA 1LB8A 2YPNA 1GGGA 5ITOA 4YB6A 1HSLA 1LCFA 2Q2AA 1A99A 2KLFA 3CVGA 2FA7A 2E0SA 2F7BA 3OMBA 1JW4A 2NVUB 4G77A 3QIMA 1FQFA 5FHMA 4MLVA 3BBRA 3KBRA 1DOTA 2OWTA 1Z7ME 5AA4B 4XKQA 4X1DA 5H8NB 5CMMA 4H8JA 2QS3A 5F7VA 5L9MA 3O9PA 3A09A 3B6TA 3OSRA 2I3VA 4HTGA 3U8QA 2O6AA 2R9JA 3D4CA 5K2XA 4G8NA 4F2QA 4IY5A 3S4UA 1Q35A 3DP6A 2I0CA 3Q26A 4QFNA 3VXCA 1MY3A 1RYXA 1SD3A 4NF6A 1A7LA 5I58B 3A3CA 1I69A 4ESWA 3K4UA 3FATA 5IKBA 3SEVA 3WAEA 4DCXA 4KQPA 4KYEA 5H8QB 4EQ7A 3WAFA 4GOTA 3TCFA 3K6WA 1QUIA 3UIFA 3TQWA 2O7UA 2F6GA 3V5AA 3TZAA 5JEIA 1CE2A 3PUXE 4MLQA 2DWAA 4BDLA 4LQ5A 3EN3A 2B3BA 3OO8A 1TFAA 2M8CA 3FJMA 4P0GA 4ZDMA 2Q2CA 3IB1A 2P0SA 2Z22A 4FE8A 1UIVA 2GFEA 4H8IA 1MG1A 1B6HA 4E0WA 1SW2A 2UVGA 2GRVA 2VGQA 2XHDA 3HHFA 2HFBA 4OTEA 5AA2D 3MJNA 5H8HB 4ZEDA 2PMSA 2QJEA 1LBBA 2XXVA 3B7DA 1Y4TA 4DLDA 4AB5A 2DXYA 2R6GE 3DLNA 3LUYA 3RT6B 3IORA 2PT1A 3U1OA 4MF3A 4Z0IA 2G29A 3VV5A 1KWHA 3RGYA 1OLCA 4BDRA 5AA1A 2VOZA 4TLMB 4OFJA 3CFLA 3USDA 2B3FA 3RTFB 3V83A 4QFPA 3K6VA 3TTKA 1IXIA 5KZTA 3T9XB 1IXCA 1SYHA 4EF1A 3BFTA 4F31B 3B6QA 3JYRA 4RJZA 2DS9A 2PT2A 3FXRA 1ZU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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