4X9TA

Crystal structure of a tctc solute binding protein from polaromonas (bpro_3516, target efi-510338), no ligand
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
TYPSRPIELIVPYPAGGGTDVLGRAFALASVKHLPQNLIVVNKPGASGAIGWADVINGKPEGYKVALLATDLMTQPNMGLTKITHEDFIPIARLNYDPAAITVRADAPWNTVEEFLAAAKQGDFRVGNGGNGSTWHLAAAAVEDKTGVKFNHIPFAGAAPAALSLLGGHIEAITVSAAEVYAYTSTGKLKTLAVMSEQRIKGFEKVPTLKERNIDISIGTWRGLAVTKGTPPEIVNVLRAATAKIVTEQSLRDALDRQNMGYAYAEGEAFGAVMARDHAFYKGLINKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Uncharacterized protein UPF0065
publication title Crystal structure of a TctC solute binding protein from Polaromonas (Bpro_3516, Target EFI-510338), no ligand
rcsb
source organism Polaromonas sp. (strain js666 / atcc baa-500)
molecule tags Unknown function
total genus 92
structure length 288
sequence length 288
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03401 TctC Tripartite tricarboxylate transporter family receptor
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x9tA02
3.40.190.150 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4x9tA01
1FTMA 1SDXA 3S9MC 4U23A 1LLSA 2F6GA 2F5XA 3U92A 2RINA 2O1MA 2ABHA 3DP6A 2QS3A 4WEPA 4THIA 1GGGA 4LP2B 5DVIA 1PBPA 3QUJA 3H6TA 5ISUA 3G3FA 4QSCA 4C1TA 1MH3A 3C32A 4F39A 1LAXA 1P1WA 2DVCA 1BP5A 1BLFA 4GWOA 3K1MA 2DP8A 3E3KA 1Y1MA 4NF4B 3G3JA 1DOTA 3QIMA 4FORA 4ZDMA 5JTYB 4PFUA 3CI8A 3T9HB 5LOMA 3N6UA 1B2HA 4RY1A 1DSNA 4YU0A 4QSEA 3OEKA 4I1DA 5L9OA 2DSFA 3N94A 1PB9A 4U1ZA 4OMBA 2PT2A 2ZYMA 3FVKA 2QMWA 4Q8RA 3EHTA 3RUMA 3TMGA 1N76A 1NNKA 3TTLA 3MJNA 4HW8A 2D5WA 3RTFB 3UGWA 4XKQA 4EF1A 4FATA 5DYHA 4U22A 4IB2A 1P1NA 2OZZA 1FQFA 1LAHE 3MZ1A 2V3QA 2Z8FA 5KCJB 4N6PA 2RC9A 3M8UA 2UVJA 3KEIA 3ECRA 4OHNA 4RNSA 2F8DA 1B3EA 2Y7RA 4IY5A 1B51A 1MY3A 4GLIA 2GH9A 2ZNUA 3EF7A 1MQDA 4U2RA 3DM0A 1M5BA 1B5HA 1B1HA 3P7IA 1TXFA 1JETA 4DXCA 2H98A 2DWJA 3RY3A 5IAIA 5AA2B 3KSJA 3MWBA 1USYH 3H4ZA 3RQTA 1MPBA 1IEJA 4ESXA 2QS2A 2ZYOA 4O3CA 2H4IA 1CB6A 1O63A 2DWHA 1D3KA 4LUBA 3RPWA 1AMFA 3IB1A 1NMUA 2QS1A 3M3KA 1B4ZA 4JDFA 1YAEA 5L8DA 2G93A 1R9LA 2E1SA 1J1NA 2F35A 5TP9B 2HCAA 1A8EA 2ZYKA 1OLCA 1GR2A 4OENA 3MVYA 4WEDA 2RCBA 3IR1A 2Y84A 4LONB 3FV1A 2VP1A 3I6VA 3G3GA 1MXWA 4MF3A 4H67A 4EXKA 2V93A 5DVJA 3CFLA 2F7CA 1NNTA 4M4GA 1TT1A 5BWJA 1OQHA 3TKDA 4NF6B 3CFZA 4NWDA 1QUIA 3ZSFA 3A09A 4G2ZA 1D4NA 1US5A 4BLAA 2G29A 4EXLA 4P0GA 1OMPA 5A5XB 1N84A 4F3SA 4XKNA 4FEBA 1SBPA 3ONMA 2ZYNA 1AOVA 4UA8A 2QRYA 5DEXB 3TEPA 1XVXA 5I56B 3KBRA 4IO2A 1MPDA 3TYHA 3V89B 2WKYA 1L5TA 3FASA 4OESA 4R2FA 2ONSA 3K6UA 1QJMA 1IITA 3VDFA 1EU8A 2RCAA 3PUVE 3UP9A 4OYVA 4G68C 3IOVA 4IO6A 1P1OA 1LCFA 3A3UA 4FIMA 4R75A 1Q35A 5AA3A 4JSDA 1PEBA 1IZ1A 3RT6B 4HCYA 4AB6A 1UIVA 1B7ZA 5HPQA 4BDRA 1XOCA 4H6DA 3PPRA 1JEUA 3UK4A 4DCXA 4C1UA 4OTEA 4DDDA 3HCQA 4ONYA 3CSGA 4GL8A 3R6UA 3S9NC 3QUFA 3CSBA 1A55A 2DE3A 1EZPA 5CC2A 4F3BA 4I8CA 3PMWA 2O69A 4LQ5A 4LZ7A 4DXUA 4XIGQ 3MQ9A 3CRBA 3PU5A 5I2KB 3LSWA 3S9EA 4EQ7A 1B58A 4OWDA 2XX8A 5F7VA 3G3KA 3C35A 4NE4A 1VFDA 3SEVA 4DXBA 3H6UA 3M3FA 4F1UA 3V83A 1NFTA 2XHDA 5I58A 2OWSA 1B7UA 4GXAA 1FW0A 4U1OA 1F9BA 2HAVA 4R2BA 1B7HA 2FA7A 4IGRA 4AB5A 4IO3A 2XXQA 5FHOA 1ZJLA 3RLFE 3JZJA 2O68A 5L9MA 5CBSA 2GHBA 1POY1 2PBWA 3MVXA 4K3FA 1MY2A 4NF5A 1FTLA 3HO7A 4U21A 2Y7IA 2QJEA 1B1XA 3H6VA 2XXYA 4EQBA 2P2AA 3UN6A 3CVGA 4PFWA 1GVCA 1WDNA 4GOTA 5AE4A 1R6ZA 3KSXA 1LAFE 5JEIA 3T9XB 2UYEA 1PBQA 4DCYA 1FQCA 1FQDA 3HHGA 1BIYA 1HSEA 1JVYA 1UQWA 4I9DA 2VGQA 4WXJA 2ZMBA 3QK6A 2O51A 2ALUA 1II5A 5I2NA 1QUJA 3B6WA 1ZMGA 1TFDA 1B3HA 3PUYE 1OIBA 3E9XA 2D21A 1B3FA 1MDQA 1IUDA 4ZS9A 2FYIA 2V3TA 1N3WA 3UIFA 3GLBA 5B7DA 1RYXA 5J1DA 1SW4A 4RJZA 3OOAA 4Q5TA 4ESWA 5FTIA 3VLWA 1VSOA 2I48A 4BDMA 2I6EA 1B05A 4H1XA 4YMAA 1BKAA 4F22A 2XXVA 1I6QA 1MH4A 2B3FA 3H06B 5H8NA 4N13A 4KFQA 3K1NA 3E13X 2IEEA 2HZLA 4WKMA 3MC2A 4RXLA 2AIXA 2H99A 4ZEBA 4G68B 1Z7NE 3U94A 2CMOA 4R73A 5KDTB 1JW4A 3W9VA 1MY4A 1O64A 1N3XA 2NXOA 1LSTA 4QHQA 2Q2CA 3GBAA 4H8JA 2HXWA 1JW5A 3QSLA 3VLUA 3E4RA 3Q26A 1MS7A 1ATGA 3MZBA 4E0XA 5CM6A 1RKMA 2Q88A 4QFPA 1YCJA 3MP8A 4X48A 4QFLA 4ZZEA 1MXUA 4MH5A 1ANFA 1USYE 1NH8A 2UYFA 2O84X 1S7YA 1XT8A 4KCCA 3EN3A 4JWYA 3Q25A 5EHSA 4DLDA 1B5IA 4R6HA 4L17A 3CG1A 1URDA 3O6IA 1Y4CA 3QAXA 4ELPA 1N7XA 1FQBA 2QPQA 4OVJA 1A54A 3T22A 3AXFA 4XTCQ 4PE5B 4TLLB 3PMVA 3K02A 4PQJA 2XX9A 4MFIA 4C0RA 1MQIA 1H76A 2HEUA 2DVZA 1DTZA 4JXIA 3UORA 4G8HA 3TCHA 1QULA 4RPOA 5F1QA 4R72A 1UTBA 1IXCA 4H65A 1A8FA 3VLVA 2F97A 2A5SA 3VV5A 3TCGA 5M2VA 4EF2A 4KPTA 4O3BA 3GXAA 4TLMB 4OQOA 2I4BA 2DQVA 3S4UA 3O9PA 1N0TA 1RYOA 3A3CA 1LB9A 3G3HA 4NTLA 4YKPA 1Q1KA 3OSRA 2OCUA 5H8QB 2RKMA 1MY0A 2P0SA 4YB7A 3VXBA 1LBCA 4KYSA 5DT6A 3O28A 3Q28A 1H45A 4Z7EA 2YPNA 3K1PA 1TWYA 2DXYA 3TTNA 4OXVA 1SI0A 2HFBA 3OO7A 2X7QA 5IKBA 2V3UA 3CG3A 4DIGA 4BDLA 2RF1A 1B52A 2GRVA 4X1BA 3W15C 1XVYA 1KWHA 2CZLA 1MPCA 2AL4A 3IO4A 3O97A 2R6GE 2ZNSA 4BDQA 5CMCA 3TQLA 2DWAA 3MP6A 1B46A 1LAGE 3MAMA 1VE4A 4OEUA 1I6BA 4OFJA 3FXRA 2HZKA 5HBCA 2Z8EA 1M5DA 1A7LA 2DXRA 3I3VA 1T0KA 1DTGA 2VD2A 1MXXA 2A5TA 1MQJA 1A99A 3U93A 3MUQA 1UTHA 3FJ7A 3OO9A 4XKPA 1S9TA 4AQ4A 4F31B 3RT8A 4F3PA 5EHMA 3LSXA 4ZZAA 3KN8A 5H8FB 1Y20A 2O1LA 3N26A 1LGBC 3WAFA 3SEXA 3HHFA 5HM4B 2AL5A 4FAJA 2Q9TA 4JWOA 4Z0IA 1TFAA 1GTKA 3O6GA 1QUKA 4KHZE 4R9GA 5ITOA 3ILUB 4YKKA 1MXYA 4P0IA 1H43A 3ILTB 1Z7ME 4XXUA 3EQ1A 2R9JA 2F36A 3OO6A 4I62A 2FNCA 1ZU0A 1BTJA 3OENA 5I56A 3SEYA 2W7YA 5I58B 2XXPA 3SESA 1JNFA 2XXWA 4MLQA 3H6WA 3IL1B 3PV0E 4DE8A 1OVBA 2OBGA 3HSTA 2XXUA 3MVWA 3H7MA 2QL3A 3FZVA 1Y3NA 1EZOA 4NWCA 3S9LC 1B32A 3QYTA 4RPNA 5I57B 2OK2A 3FJMA 3O6HA 5TPAB 3FUZA 3RNNA 4DZ1A 3LSFB 1QKBA 4IGTA 5ICTA 1N04A 1QW0A 3OD7A 3SETA 4G8MA 3TDJA 5H8HA 1YPNA 3H3GA 4GF8A 4E0WA 4JBZA 4FJPA 2P1SA 3K6XA 4BDNA 4EQ9A 3PUZE 3HV1A 3F11A 2QMXA 3K2DA 1B40A 3BFTA 4G4PA 1FTOA 2ANJA 3KG2A 3OSQA 1SW1A 5BUUA 2UVIA 2X26A 4F18A 4Q0CA 4R9FA 2THIA 5AA1A 3FVNA 3K6WA 2I3WA 2GFEA 3O2AA 1SQYA 1OQGA 3DLNA 1EZ9A 4R6YA 1NH7A 2IA4A 4QF9A 2OWTA 3KJTA 1FQEA 2B65A 4O3AA 3VXCA 3PPQA 3HN0A 5KZTA 5I2NB 1SD3A 3IB0A 3PUWE 4IO7A 3DP8A 3EHSA 3IJOB 1OLAA 2F7BA 4ZECA 4MLVA 1IXIA 1SW2A 3D4GA 1Y3PA 2NUVA 4RYAA 1B6HA 2F6PA 3T96B 2ONRA 4OFOA 4JSOA 1DMBA 4JB7A 5EYFA 4R74A 3MP1A 2I49A 4ZEIA 2PT1A 1SYIA 2DOJA 4LZ8A 3HPIA 5I59A 2ONKE 1M5EA 4RK2A 4XKRA 3T9UA 3DELB 1ZLQA 3TTRA 5H8NB 3VVDA 2I4CA 1OVTA 3C33A 3IJXB 2B3BA 1US4A 1NKXA 4HS7A 1ZIUA 1LCTA 3K0VA 5DVFA 2I3VA 4FECA 1B3GA 3THIA 3PPPA 3TZAA 4KI0E 4IY6A 2DE4A 4Q30B 1Y9UA 3O66A 2REGA 3L6GA 3U8QA 4GQOA 3TTMA 3N6TA 3IB2A 4GRKA 2Y7PA 3MW0A 4G77A 1PB7A 3FJGA 1YTVA 2OJTA 5CBRA 4G8NA 2YJPA 4KQPA 4ZEDA 1IXHA 4HCWA 4NF8A 3LBSA 2UXAA 4JWXA 3O29A 3FATA 4F2QA 3C4MA 4H0WA 3TAJA 5AA4A 3ZKLA 4POWA 3VVEA 4PFYA 5K2YA 1WODA 2XXRA 4F1VA 1NNPA 4ZEKA 5ICQA 2UVHA 3KOTA 1VFEA 4RA1A 4ELQA 4ISUA 4GD5A 1ZKBA 2ZXTA 2XXXA 3K6VA 4QFNA 1QVSA 2VD3A 4QFOA 5L9SA 4KYEA 3C34A 3ZS6A 1H44A 1JQFA 1B0LA 1M5CA 1MG1A 1JW1A 4R6KA 2ESNA 3KJ7A 1D9VA 1AL3A 3TODA 2V25A 4OFLA 3JV9A 3TFLA 1NL5A 3TPAA 1UTBB 2H5YA 2DE2A 5JK4A 3MPLA 3USDA 1Y1ZA 4NF4A 4X9TA 3PPOA 3IOUA 3H03A 1PDAA 5JTYA 4G68A 3KFMA 1N7WA 3U1OA 4OERA 5KDTA 3GBBA 3PUXE 4YKIA 5CRYA 1SVXB 2DWIA 3UA8A 4PETA 3FVGA 1POTA 3KZGA 3PD8A 1FQAA 1LB8A 3Q27A 4IO5A 3M3LA 1B0HA 1NNFA 4LA9A 2HAUA 2NOOA 3OO8A 3CFXA 4M1VA 4ZEFA 2Q8JA 2I0BA 2GHAA 2Z22A 2KLFA 1MRPA 3KN7A 3FIRA 3TQWA 4KYDA 2AYSA 2D3IA 3D4CA 3V8XB 3LSLA 1SI1A 1XHYA 5FTHA 1ELJA 1PC3A 3EPEA 4LZ5A 2XXHA 5KCJA 3FGSA 3MZ9A 5K2XA 3T9VA 3VE1B 3MBPA 3OELA 3IK6B 4QRZA 1MQGA 2X7PA 2F34A 3IO6A 4N07A 3B7DA 2F78A 4KCDA 4YMBA 2QS4A 4H5FA 1O7TA 1HSJA 3MVZA 5CI5A 1IIWA 3SEWA 2VHAA 3PMXA 2A5TB 3W9WA 3MPKA 3B6QA 3IOWA 1M5FA 1UTHB 2XXTA 1IXGA 4P11A 2OLBA 1P99A 4TOZA 3T93B 5AA2A 4F19A 4KR5A 4FE8A 1WVJA 1R9QA 3OEMA 2XD2A 3B6TA 4OEVA 1DPEA 4NEDA 3LR1A 4KD5A 4EUOA 5H8QA 3C9HA 4YAHX 3G3IA 1XC1A 3K4UA 5I84A 3IX1A 2YLNA 3OXNA 4GFRA 3FV2A 4F2OA 1B4HA 1FCKA 2O7UA 4NMYA 2LAOA 2Q2AA 3R7XA 3OMBA 3N5LA 4YB5A 5TP9A 5CMKA 3WAEA 3IORA 5B70A 2H9BA 1I69A 3TCFA 4F1YA 4ZE9A 4LQ2A 2R71A 3LUYA 1XS5A 4GVOA 2XXIA 1FTJA 2Y7KA 3TTKA 1A40A 2BJJX 3BBRA 5ITPA 5CMBA 5FHMA 4OETA 1LFIA 3ZKKA 3IOTA 3FXUA 4U4XA 4YB6A 4GXSB 3FXQA 3RN8A 4NF6A 3RGYA 4EDPA 3RTWB 2O7IA 4PFTA 4BDOA 4MBPA 3SKPA 3DP4A 1MQHA 1PB8A 4YICA 3CIJA 3PPNA 3PD9A 1CE2A 5A5XA 3QXMA 3R26A 2REJA 4IO4A 3TUSA 5ELVA 5H8HB 4PP0A 5DEXA 1DPPA 3BFUA 3FD3A 1HSLA 2VOZA 2M8CA 2DYXA 1P1QA 2RC7A 4FEDA 1Y3QA 2V84A 1S50A 1AH5A 4ZE8A 4LVQA 1FTKA 1D9YA 4QFKA 5H8FA 4OZ9A 2NWJA 1MXZA 3EHUA 1SW5A 2QSXA 4GL0A 4TQUQ 1H3DA 3KOSA 1GV8A 4POXA 4U4SA 1Y4TA 3T66A 3VFJA 3Q29A 3I5OA 4NF5B 4F29A 3FVOA 3VVFA 1URGA 3TELA 5TU0A 2I58A 3SDFA 1EH3A 4ELRA 1ZBMA 4GIZA 1JEVA 3GZGA 2H25A 4ND9A 1LBBA 3SEUA 2PVUA 1ZTYA 4LATA 3KGCA 2E0SA 3K00A 3PGFA 4UACA 3C36A 3LC8A 3L6HA 3U72A 3JYRA 1URSA 3CR9A 5I59B 5DTBA 1MDP1 2F7AA 4RK9A 2Q89A 5I2KA 4HTGA 5AA2D 5I57A 5TPAA 4YZZA 1MM6A 4X1DA 4H8IA 5H8SA 1UIUA 4YKJA 2HQ0A 2I0CA 2Z8DA 4F3GA 3G7WA 3K01A 1MM7A 2XD3A 3C31A 1P1UA 2NVUB 3ODBA 3S2VA 1VR5A 1I6AA 4H5GA 1IQ7A 2PX1A 1B3LA 1JVXA 1MXVA 2PYYA 3KN3A 4ELOA 5CMMA 1SYHA 1LFGA 1AIVA 2RC8A 3IAZA 1B9JA 2PMSA 4ECFA 4NF8B 2XX7A 3V5AA 3SERA 2O6AA 1QKAA 4QSDA 5AA4B 1LFHA 2Y7WA 2Z23A 5FHNA 1MY1A 2ZNTA 1B5JA 1R1NA 2UVGA 3BKIB 2DS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FTMA 1SDXA 3S9MC 4U23A 1LLSA 2F6GA 2F5XA 3U92A 4GWUA 2RINA 2O1MA 2ABHA 3DP6A 2QS3A 4WEPA 4THIA 3CHGA 1GGGA 1FBGA 4LP2B 5DVIA 1PBPA 3QUJA 3H6TA 5ISUA 3G3FA 4QSCA 4C1TA 1MH3A 3C32A 4F39A 4XFEA 1LAXA 1P1WA 5ET8A 2DVCA 1BP5A 1BLFA 4GWOA 3K1MA 2DP8A 4PDDA 3E3KA 1Y1MA 4FBPA 4NF4B 3G3JA 1DOTA 3QIMA 4FORA 4ZDMA 5JTYB 4PFUA 4NN3A 3CI8A 3T9HB 5LOMA 3N6UA 1B2HA 4RY1A 1DSNA 4YU0A 4LN5A 4HE0A 4QSEA 3OEKA 4I1DA 3GYYA 5L9OA 2DSFA 3N94A 1FBEA 1PB9A 4U1ZA 4OMBA 3B8BA 2PT2A 2ZYMA 3FVKA 2QMWA 4XEQA 4Q8RA 3T0JA 3EHTA 3RUMA 3TMGA 1N76A 1NNKA 3TTLA 3MJNA 4HW8A 2D5WA 3RTFB 3UGWA 4PC9A 4XKQA 4EF1A 4FATA 2F3DA 2WYPA 5DYHA 4U22A 3RPLB 4IB2A 1P1NA 2OZZA 1FQFA 3MYUA 1LAHE 4MIJA 3MZ1A 1EYIA 2V3QA 2Z8FA 5KCJB 4N6PA 2RC9A 3M8UA 2UVJA 2KQZA 3KEIA 3ECRA 4P9KA 4OHNA 2HPGA 4RNSA 2F8DA 1B3EA 1Q9DA 2Y7RA 4IY5A 1B51A 1MY3A 3LUZA 4GLIA 2GH9A 2ZNUA 3EF7A 1MQDA 3HFUA 3E78A 4U2RA 3DM0A 1M5BA 1B5HA 1B1HA 3P7IA 1TXFA 1KZ8A 1JETA 4DXCA 2H98A 1NUYA 4NHBA 2DWJA 3RY3A 5IAIA 5AA2B 3KSJA 4NF0A 2WEFA 3MWBA 1USYH 4N4UA 3H4ZA 2ZZWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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