3H6UA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns1493 at 1.85 a resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6uA02
2O68A 1PBPA 1LB8A 4QSEA 3CG3A 4C0RA 3T9VA 1HSEA 4EQ9A 1IQ7A 5A5XB 2XXUA 2QMXA 1LCTA 3S9NC 3HO7A 4EDPA 4MLVA 3HSTA 2H25A 2GFEA 3SEVA 3GBAA 1MY1A 2O6AA 3MVWA 1B3FA 2GH9A 3G3GA 1VR5A 3VLVA 1R6ZA 4PETA 3N94A 1N3WA 2QS4A 2NXOA 2GHBA 4GRKA 4U1ZA 4C1TA 1PB7A 4GXAA 2W7YA 4EQ7A 2O69A 4Q8RA 1ZU0A 1MQHA 3O6GA 1DOTA 3CFXA 3HPIA 4OZ9A 5H8HA 2XXVA 5KDTB 4YMAA 1H76A 2VD3A 1XVYA 3FVKA 3H6WA 1Q35A 3TEPA 4YKJA 2QS3A 3IOVA 3SEWA 3IX1A 4OETA 3ILTB 4GXSB 1NL5A 2XX8A 3K2DA 5LOMA 3G3JA 4U4XA 1B7HA 4WEDA 1P1UA 2DYXA 3VVFA 5H8HB 2DWIA 2V25A 4YMBA 1A99A 3MWBA 4KPTA 1URGA 4KQPA 3IR1A 3OD7A 3IOUA 3IAZA 3KN3A 4I8CA 3TTKA 2DXRA 3TCFA 1I69A 1YAEA 1M5FA 4KD5A 1N84A 1LBCA 1Y20A 4KCDA 4WKMA 1MQGA 2DOJA 3T9XB 4ZECA 4ND9A 5ICQA 3FVOA 4LATA 4R6YA 4ESXA 4G2ZA 1IIWA 3EHUA 3VXCA 1TXFA 3PV0E 3TKDA 4YKKA 2CZLA 4DZ1A 2H9BA 5K2XA 4OEVA 2Q8JA 3Q25A 2H4IA 3PPPA 4Q30B 3K6UA 1IXHA 2F34A 4F3BA 3IB1A 2F78A 4NWCA 2V3UA 3CFZA 2I4BA 1H44A 4ESWA 1XS5A 2LAOA 5L9MA 3GZGA 4JDFA 2ABHA 2YPNA 5B70A 3CSBA 4XKPA 2F7BA 4KFQA 4YKIA 3T9UA 1DPPA 4R2BA 4E0XA 4JWOA 3WAFA 2F97A 3OO7A 4H67A 3O9PA 1GV8A 3K02A 2PYYA 2P0SA 4POXA 2O84X 4UA8A 5KCJA 1FTJA 4FIMA 4PFUA 3HN0A 1B5HA 1B3LA 2DE2A 2I49A 1M5DA 2DSFA 2ZMBA 1FTLA 4ZEKA 4E0WA 3WAEA 5H8SA 4R6KA 4IO6A 4IO2A 1B0HA 1MH4A 1UQWA 4IO3A 4N6PA 4U22A 4P0GA 4LA9A 2PBWA 2DQVA 1ZMGA 5KCJB 1QUJA 4EXKA 1MQDA 3S9EA 4NF8B 4JBZA 4NF6A 3U92A 3RY3A 1SVXB 3GXAA 4OYVA 3KN7A 4QFPA 1URDA 1S50A 3EHTA 4R72A 1QJMA 3UA8A 3TCHA 1I6AA 1SI0A 2O7IA 3MPKA 1BTJA 4NWDA 4LVQA 3K00A 4OESA 1T0KA 3L6HA 1OLCA 3CI8A 1QUIA 4NF6B 2O1MA 5AE4A 4TQUQ 1A54A 3CR9A 3MVYA 2DWAA 3IL1B 5AA1A 1B2HA 1QW0A 3TDJA 3H3GA 1Y3QA 3IJOB 2V93A 2GRVA 4NE4A 4OXVA 4MFIA 1MXYA 5J1DA 4F1YA 2RINA 3U93A 1FW0A 1B51A 4KYEA 4F19A 2P2AA 1US5A 4LQ2A 1BIYA 3MAMA 5CI5A 1OQHA 5AA4A 2IEEA 2AIXA 1LAHE 4XKQA 4OENA 4NMYA 1B3HA 3OSRA 3T22A 4G68C 1DSNA 2I3VA 1PC3A 1P99A 3SKPA 1JETA 1USYE 2Z23A 3IORA 1FQDA 4Q5TA 3MC2A 3ZKLA 2X7QA 1ZTYA 4KCCA 2D3IA 2RCAA 5CC2A 2ZNSA 5AA4B 4IO4A 1PB8A 5H8QA 4IO5A 1JVYA 4FATA 3RGYA 4C1UA 4TLLB 4RYAA 3TQWA 1PEBA 2AL5A 1II5A 4ONYA 3QK6A 1XHYA 2PMSA 3EHSA 1SYIA 1AOVA 1WDNA 4GF8A 4KYSA 1LCFA 2XXPA 1USYH 2E1SA 3IOTA 2XD2A 2OWSA 3MVXA 4BDMA 4OHNA 4MH5A 4ZEFA 3IK6B 5H8QB 3RPWA 1LFHA 4XKNA 4OFJA 3UK4A 2OJTA 3FD3A 4F2QA 4GL8A 3UIFA 1Y3PA 2ZYKA 3IJXB 1VFEA 1Y9UA 4MF3A 2RCBA 3EQ1A 4GVOA 4G8NA 4R73A 1QVSA 1LBBA 4JB7A 4G68A 3RT6B 1A8FA 4LQ5A 1GVCA 1LFGA 5FHOA 3K01A 4U4SA 4OWDA 1IXGA 2A5TA 2P1SA 1VFDA 2XHDA 4F3PA 3PUXE 4QSCA 4ZE9A 1JEUA 5I56A 1B1XA 3OSQA 2VOZA 3B6QA 4JSOA 5AA3A 5KZTA 1ZJLA 1N04A 1SI1A 3A09A 1NNFA 3FXRA 1O63A 4G68B 3O28A 1UIUA 2B3BA 2G29A 3HV1A 4QHQA 3E3KA 2A5TB 4JSDA 3USDA 4H1XA 2H5YA 3G3KA 4FAJA 1JQFA 3OO6A 5I56B 1FTOA 4JWXA 2DVZA 3CIJA 3OXNA 3HHFA 1N76A 1VE4A 4F31B 3DP4A 2H99A 3C33A 4XXUA 2REJA 3PUYE 3OO8A 3MP8A 1SW5A 3V89B 1P1WA 1MPDA 5FTIA 3LBSA 2XX9A 4GIZA 2Y84A 3RLFE 2X26A 3MZ1A 3PUWE 3H6VA 2PT2A 2V84A 4NTLA 2FNCA 1HSLA 2VD2A 4FJPA 4UACA 3G3FA 1O7TA 3Q26A 5BUUA 3DP8A 1A8EA 4NEDA 1URSA 1MY4A 1NH7A 3SEXA 4G8MA 1BKAA 4G77A 4FECA 3M8UA 3LSXA 1FQEA 3D4CA 2Z8FA 5F1QA 1IXIA 3R7XA 4P11A 3SESA 3U94A 4X1BA 5DVIA 1J1NA 3PUVE 4ELOA 2UVGA 3EF7A 4QRZA 5TU0A 4O3AA 4TOZA 1MH3A 1S7YA 1TFDA 2I0BA 3K1MA 3EN3A 4KR5A 3RNNA 4OEUA 1P1QA 2HQ0A 3MW0A 3CG1A 1B32A 1YTVA 3QSLA 4WXJA 3H06B 3QIMA 3LSFB 4PE5B 4X1DA 3T66A 4HS7A 1MPCA 1MDP1 3UP9A 4LUBA 1Q1KA 1B46A 3OEKA 1IUDA 3FATA 1PB9A 1NNTA 3OO9A 3QYTA 2F6GA 5DYHA 3PGFA 3G3HA 2QSXA 3GLBA 4PQJA 2R6GE 3ODBA 2ZXTA 4F1UA 4LP2B 2O7UA 4F3SA 4BDNA 3THIA 4IB2A 3FIRA 5JTYA 4ZEIA 1ZIUA 3N6TA 1D9YA 4EUOA 2ALUA 2UVJA 2BJJX 3KGCA 3DLNA 4DCYA 1SW1A 1MM7A 3N5LA 5CMKA 1B3EA 2NVUB 2PVUA 3K4UA 4H0WA 2B3FA 3A3CA 3SEUA 4DCXA 4RY1A 1MQJA 5JTYB 2IA4A 3TTNA 3W9WA 2O51A 1POY1 2PT1A 2ZNTA 3T96B 3W15C 1TFAA 1AL3A 1WODA 5CMBA 1P1OA 4BLAA 5I84A 2ONRA 3FVNA 1N0TA 4YZZA 5I2NA 4PFTA 4R6HA 1QUKA 1DMBA 4N13A 3PU5A 4PFWA 3C4MA 4QF9A 4FEBA 1B7ZA 1YCJA 3T9HB 3VVEA 3TODA 3P7IA 1TWYA 3TQLA 5DEXA 4YKPA 2REGA 3MUQA 4I62A 5M2VA 4IO7A 1ZBMA 1SW4A 2CMOA 4KI0E 5I2NB 3LUYA 3T93B 4KYDA 4ECFA 4OMBA 3CRBA 5ITPA 4AB6A 3KJTA 5L9OA 1OLAA 1ATGA 1FQFA 3MP6A 2HCAA 4GL0A 5DEXB 1IXCA 3QXMA 4QSDA 4F39A 1Y1MA 3FXUA 3TELA 3K6VA 1US4A 1NFTA 4X9TA 4AQ4A 4G4PA 1UTBA 4ZZEA 2DWHA 2VGQA 3TCGA 4WEPA 2VP1A 2DXYA 2DE4A 5I59A 1QKAA 5CBSA 5I2KA 5TPAA 1R1NA 3PMXA 1MS7A 3TAJA 3O97A 4IGTA 5I57A 1LAXA 1M5BA 2Y7IA 1GR2A 1R9LA 3OENA 5DVJA 2UVHA 4GWOA 2QS1A 5BWJA 3FJ7A 3H6UA 1IZ1A 3K6XA 2YLNA 4ZE8A 4FORA 4XKRA 4I1DA 4L17A 1UTBB 4EF2A 3FUZA 1MXZA 1B05A 2B65A 3O6IA 1UTHA 2ANJA 2DVCA 5I59B 2Y7KA 5I2KB 5TPAB 2UYFA 3FJGA 3M3FA 5I57B 3B6TA 1SQYA 3LC8A 3RQTA 3CVGA 3D4GA 1IITA 1XVXA 1QKBA 4RPOA 3DELB 4ELRA 3I3VA 3VDFA 2GHAA 3KZGA 3IO6A 4RXLA 4R75A 1LAFE 2HXWA 4KHZE 1H45A 1FQBA 4P0IA 1MM6A 4PFYA 3K6WA 2XD3A 1MXXA 4N07A 5DT6A 5CMMA 2XXXA 3TTLA 3R6UA 3OELA 1XC1A 1OVTA 4AB5A 2RC8A 2Q2AA 3IB0A 2OWTA 4RNSA 2ZYNA 3PPQA 3KBRA 4H5GA 4XTCQ 1P1NA 1QULA 1S9TA 4H8JA 4RJZA 2XXQA 5FHMA 3I5OA 3E4RA 4GQOA 2XXRA 1N3XA 3QUFA 3RTFB 1ANFA 3LSWA 1IEJA 2HAUA 5H8FA 2V3QA 1B6HA 1MXVA 4K3FA 1GGGA 3C36A 1BLFA 2I3WA 5B7DA 1LFIA 2ONKE 3GBBA 3LR1A 3VV5A 3U1OA 2YJPA 3HCQA 5JEIA 2XXIA 1HSJA 1NNPA 1B4HA 2DS9A 3KSJA 1JNFA 3O29A 5H8NA 3S4UA 5H8FB 4O3CA 1M5EA 1RYOA 4DXBA 2Q88A 2Y7PA 1B5IA 3C9HA 4LZ5A 3HHGA 3TTMA 4ZEBA 2A5SA 2XXTA 3PUZE 3OEMA 3RUMA 3TPAA 1FQAA 2ZYMA 1OVBA 3B7DA 1FTMA 4DDDA 4H8IA 1JW1A 4M1VA 5KDTA 1Z7NE 3E9XA 2G93A 4MBPA 2ONSA 5H8NB 3DM0A 4O3BA 5TP9A 1DTZA 1A40A 1A55A 1CE2A 2I0CA 3W9VA 4QFOA 2AYSA 3FV2A 4X48A 1B1HA 4R74A 3UN6A 3KSXA 1CB6A 2Z8DA 3ECRA 1DTGA 4F29A 3IOWA 1AIVA 3TZAA 1OMPA 2M8CA 3H4ZA 2V3TA 3JZJA 2D5WA 2I48A 3PPRA 5TP9B 3F11A 3BKIB 3TYHA 3E13X 3SEYA 2QJEA 1I6QA 1SYHA 1MXUA 2Z22A 4LZ8A 1JW5A 5ELVA 4DE8A 1EZ9A 1MDQA 4ELPA 1N7XA 2AL4A 3H6TA 3N26A 4YB6A 3MQ9A 1B9JA 3FGSA 1MQIA 2D21A 2HEUA 1LSTA 3M3KA 1NMUA 1MG1A 3C34A 1JEVA 2QRYA 5L9SA 2F36A 3B6WA 1FQCA 5DVFA 3BFUA 4OQOA 4ZS9A 1LAGE 1AH5A 3L6GA 4OTEA 1D3KA 2DE3A 4QFKA 5L8DA 1SD3A 1MRPA 3C32A 1B3GA 3S2VA 5ICTA 1B7UA 1POTA 2O1LA 3O2AA 4NF4A 3KEIA 1WVJA 1RKMA 5IAIA 3KOSA 3O6HA 4OFLA 3MP1A 3QAXA 2RKMA 2ESNA 1H43A 4TLMB 1NKXA 3IO4A 4DXUA 1R9QA 3RN8A 4M4GA 3U72A 5K2YA 3A3UA 2PX1A 3K1NA 4THIA 3MJNA 4F1VA 4HCWA 5I58A 3V83A 3ILUB 3Q28A 2R9JA 3ZKKA 4F3GA 2OBGA 1EZPA 2XX7A 4NF4B 3MPLA 4OFOA 3VLUA 1N7WA 3RT8A 2E0SA 2F7AA 2UYEA 3KFMA 2OZZA 4DXCA 3EPEA 4G8HA 3FV1A 2Q2CA 5I58B 4BDOA 5HPQA 2HAVA 4F18A 5FHNA 3S9MC 3VE1B 4MLQA 1F9BA 5ITOA 1A7LA 2UVIA 3PPNA 4ZEDA 1LGBC 3PMWA 3SDFA 2NWJA 1MXWA 2FYIA 3ONMA 3TFLA 4U1OA 2RC7A 2XXYA 1B0LA 3C35A 3PMVA 4NF8A 5CMCA 2R71A 3JYRA 3K0VA 5CM6A 1SDXA 4YU0A 1Y1ZA 4BDLA 2QS2A 1MY3A 3LSLA 3KOTA 1SW2A 2QPQA 2X7PA 3V5AA 3FJMA 2F35A 1SBPA 3OMBA 1Y3NA 2Q89A 3Q27A 3C31A 2F7CA 4FE8A 3R26A 4I9DA 3QUJA 2THIA 4DIGA 2Y7WA 3TTRA 2DWJA 1FCKA 4XIGQ 2XXWA 4Q0CA 3AXFA 4QFNA 3MBPA 1EZOA 1OQGA 4RK2A 3H7MA 4EF1A 2I6EA 3FVGA 3TMGA 4GLIA 5FTHA 4YAHX 3I6VA 3TUSA 3VFJA 3JV9A 5ISUA 4POWA 1L5TA 2UXAA 1MY2A 4ZZAA 1JW4A 4DLDA 1MPBA 4ELQA 4GD5A 2F5XA 4HW8A 2OCUA 3UORA 5CBRA 2I4CA 5EHMA 3FZVA 4YB5A 3S9LC 3MZ9A 2FA7A 1B40A 1EU8A 1B5JA 4IY5A 4BDQA 3FASA 2F6PA 1O64A 1NH8A 1MY0A 4OVJA 4ZDMA 1NNKA 2QL3A 3PPOA 3V8XB 2F8DA 1XT8A 3FXQA 4U21A 2Y7RA 1Z7ME 5AA2A 3UGWA 1TT1A 4U2RA 3PD9A 2HZKA 1ELJA 2HZLA 1I6BA 4IY6A 4H6DA 4R9GA 3SERA 3U8QA 1PBQA 4JWYA 5HBCA 1GTKA 3H03A 1D4NA 1EH3A 2QMWA 2NOOA 4RA1A 2NUVA 4GFRA 3O66A 3DP6A 1Y4TA 3CFLA 3VVDA 4PP0A 1M5CA 3KJ7A 5DTBA 4RPNA 1UTHB 1RYXA 2I58A 2XXHA 5F7VA 5AA2B 4BDRA 1JVXA 2H98A 1KWHA 1UIVA 4YICA 4QFLA 1FTKA 5CRYA 2WKYA 5AA2D 2ZNUA 3BBRA 1DPEA 1AMFA 1ZKBA 4EQBA 4HCYA 1BP5A 4YB7A 2DP8A 1B52A 4Z7EA 2Q9TA 2OLBA 1H3DA 4GOTA 4R2FA 4IGRA 1PDAA 3G7WA 4R9FA 4JXIA 3VXBA 1OIBA 3ZS6A 4HTGA 2ZYOA 5HM4B 4H65A 3RTWB 4ISUA 1ZLQA 2RF1A 4RK9A 4Z0IA 1XOCA 5IKBA 4FEDA 4NF5A 3VLWA 2OK2A 4H5FA 4LONB 1LB9A 5EHSA 5JK4A 3KG2A 4F2OA 3MVZA 3PD8A 4EXLA 3IB2A 2VHAA 2Z8EA 1Y4CA 3K1PA 3N6UA 1VSOA 2KLFA 3CSGA 1B58A 1D9VA 5A5XA 3OOAA 3MZBA 3SETA 3M3LA 1B4ZA 1LLSA 2HFBA 4U23A 3G3IA 4OERA 5EYFA 4F22A 3Q29A 3ZSFA 4NF5B 4LZ7A 1YPNA 3BFTA 3KN8A 2RC9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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