3H6UA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns1493 at 1.85 a resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6uA02
3IJXB 4PQJA 1B5HA 5KCJA 1B3LA 2O84X 1GR2A 1MXZA 3MVWA 5I57A 1URDA 5I2NB 3KZGA 4LZ8A 4GL8A 1B0HA 4I1DA 3CG1A 4BDRA 1LFGA 1MH3A 4RXLA 5H8QB 1SW5A 2E1SA 5IAIA 4R6KA 1GV8A 1ZLQA 2A5TB 2I3WA 3K6XA 1VR5A 4GRKA 2DQVA 4IO7A 1UQWA 2LAOA 1B4HA 4R6HA 3SETA 1YTVA 4YB6A 4O3BA 2H25A 2I58A 2ANJA 5TU0A 4FE8A 3KJTA 3N6UA 3O66A 3CRBA 3MVYA 4M1VA 2P1SA 2XX8A 4HW8A 3FVNA 4I62A 1LAFE 3KSJA 1B4ZA 3O29A 3PD8A 4QFNA 1ELJA 3GXAA 4NF8B 1LB8A 5FTIA 1Y3PA 3IB2A 3C9HA 3K4UA 1ZKBA 1N84A 3IB0A 2VD2A 3I5OA 1VE4A 2F7CA 3TQLA 2DWAA 3E13X 4HCYA 1OQHA 4Z7EA 1AH5A 4HCWA 4C0RA 5DEXB 1N7WA 2UVHA 3QYTA 4DIGA 3LSFB 2F34A 2G93A 3PUZE 3S9LC 1SVXB 4X48A 1P1OA 1LAXA 1OMPA 4KD5A 3C33A 1IUDA 5F7VA 3U94A 1Y20A 4QHQA 1P1WA 3CVGA 3LUYA 3GZGA 1H45A 4MF3A 3T9XB 3TEPA 3B7DA 1PC3A 3O6IA 3C32A 1UTHA 1N3XA 4OXVA 4KYDA 4QRZA 1GVCA 2DS9A 3WAFA 4FECA 4IO3A 3HO7A 3L6GA 2XXWA 1MPBA 3IOTA 2CMOA 5ITOA 4GWOA 4G68C 1B32A 3LSLA 1B5JA 2ONSA 4X1BA 2DWJA 2OCUA 3CFLA 2A5SA 2ONRA 2THIA 1I6BA 2V84A 2QMXA 3SEWA 1LB9A 4UA8A 3MP6A 3PD9A 4YZZA 5AA2D 1MXUA 3RY3A 4AB6A 2F97A 1IIWA 1US5A 4OTEA 1EZOA 1A40A 5BWJA 4JWOA 3TAJA 1FQDA 4DDDA 3UK4A 4DE8A 4GL0A 4QSEA 3D4GA 3W9WA 1Y1MA 5L9OA 3KG2A 4TLLB 1EZPA 4C1TA 3IB1A 3G7WA 1TWYA 2DXYA 1O64A 1LAHE 3FASA 4NF4B 3DELB 2XXRA 4DCYA 4BDNA 5LOMA 3D4CA 3V8XB 2QS4A 2H98A 3KN7A 4TQUQ 4GFRA 3FJ7A 3ONMA 4G68B 1M5EA 4NWCA 5KZTA 1FTKA 5JK4A 1JEVA 1MDP1 4F1VA 4ND9A 1Z7ME 1IXIA 3O6HA 1B7ZA 4NF6B 2AYSA 2E0SA 4ESWA 2VP1A 4JDFA 2DXRA 1JW1A 4KI0E 4JXIA 3CI8A 3EHTA 2XXUA 4QF9A 3IOVA 4G4PA 5AA1A 5B70A 3M3LA 2ZNSA 1NKXA 4XKPA 1D9VA 1Y3NA 4GF8A 3GLBA 3H6WA 4U4XA 1VFDA 4EXLA 2Z23A 1MH4A 1QW0A 3T66A 2Y7PA 1D3KA 2PT1A 1YCJA 1H76A 1Y4CA 1TFDA 2O51A 1USYH 1TXFA 3K2DA 1DPPA 3FIRA 5DTBA 2PMSA 2HXWA 3HN0A 1SDXA 3HV1A 4O3AA 4H8JA 4ELPA 3KOSA 4FATA 4DLDA 2O1MA 2O7UA 1PDAA 1LAGE 3TCFA 1B9JA 1NH7A 2FNCA 3KEIA 2O1LA 5TP9A 3BFUA 4OFJA 2NUVA 4DXUA 4NF5A 3T93B 1PB9A 2PT2A 4F2QA 3KGCA 3TTNA 2Z8DA 1A8FA 1GGGA 3QAXA 3C4MA 1DTGA 3MUQA 1CB6A 1USYE 1WVJA 4KCDA 1ZMGA 1R6ZA 3ILUB 3K6UA 4RA1A 2F36A 5H8HB 1J1NA 1Q1KA 4KFQA 4HS7A 3OELA 2HZLA 1MXVA 3K6WA 4OQOA 3K0VA 3JYRA 1VFEA 5JTYB 1H3DA 2ZMBA 4I8CA 5A5XA 4OENA 3ZSFA 5CMKA 3RNNA 4FIMA 2UVJA 4OEVA 5ISUA 4GIZA 4PFWA 3VVEA 3H03A 4KYSA 4LA9A 4H8IA 3RT8A 1MY1A 3QUJA 3UP9A 3HHFA 3TMGA 3IX1A 1NMUA 4OERA 5HBCA 3FXQA 5H8FB 3QSLA 3PPOA 1ZBMA 5BUUA 3PPQA 4H65A 4DXBA 3O97A 3KBRA 3CSGA 3FV2A 2QL3A 3K1NA 2AL5A 1QKAA 3PMVA 1OVBA 3OO6A 1ANFA 3TELA 1QUKA 2V3QA 3MQ9A 3S9NC 2RC8A 2Y7IA 3KJ7A 4PFUA 5CI5A 1N0TA 3TYHA 4BDLA 4GVOA 4U21A 1AMFA 4F1YA 2OLBA 4F29A 4ESXA 4HTGA 1UTBA 3T22A 4YU0A 1MS7A 3L6HA 2OBGA 4ZZAA 2I48A 4EF1A 4ZDMA 2UVIA 4THIA 2ZYMA 3PPRA 1QJMA 3O2AA 3ILTB 5J1DA 2V93A 4GD5A 5I59B 2R9JA 1LFIA 2Z22A 3RN8A 2NXOA 1WODA 1BTJA 3O9PA 3B6QA 5I2KA 1LBBA 3S9EA 2ZNUA 3WAEA 2D21A 5L9SA 3EHSA 3MJNA 1LGBC 5CC2A 1BKAA 3SERA 2AL4A 4FAJA 1PBPA 3VVFA 2Q88A 3H4ZA 5I56A 3PPPA 1NL5A 5K2XA 4WEPA 5L9MA 1QUJA 3IO4A 3BKIB 3VLWA 1UIUA 4F31B 1BP5A 3VE1B 1AL3A 1I69A 3C34A 3TDJA 1LCTA 3Q28A 1N04A 2OK2A 3PUYE 1FTMA 4QSDA 2QS3A 1XHYA 4R73A 2DE3A 4JBZA 4ZEIA 4Z0IA 1ZU0A 3S2VA 1NNTA 3RLFE 1O7TA 2REGA 3KFMA 2Y84A 3IL1B 1A99A 1ZIUA 1MRPA 4MFIA 2X7PA 4YKPA 3TQWA 4JWYA 1US4A 2QSXA 3H3GA 3IORA 4EDPA 1XT8A 2I4CA 1Y9UA 1MY2A 4EXKA 2F5XA 3MVXA 1OIBA 4QFKA 2HQ0A 3I6VA 3VXBA 4E0WA 4Q8RA 4MLVA 4MLQA 3CR9A 3K1MA 3S4UA 2OWSA 1CE2A 2ZXTA 2OZZA 2OWTA 2RINA 1LLSA 3E3KA 4U4SA 2D5WA 3TCHA 5IKBA 3C31A 3O28A 4U22A 3CFXA 2M8CA 3USDA 4FJPA 5ITPA 3FV1A 4IO6A 5EHSA 3IAZA 1B58A 4IB2A 4Q5TA 1LSTA 1O63A 4IY6A 4ZECA 2ZNTA 5KDTA 3O6GA 4PFTA 1B40A 1EU8A 4FORA 2V3TA 2O68A 2I0BA 4R72A 4R2BA 2HCAA 3OD7A 3E4RA 1H44A 3TKDA 4TLMB 4OESA 2NWJA 4XXUA 3SDFA 3G3JA 5FHMA 5EYFA 3VVDA 1R9LA 4ISUA 3IO6A 3V89B 5H8QA 3JV9A 3THIA 3ODBA 1LFHA 4AB5A 2A5TA 4IO2A 5AA2B 4NTLA 4H0WA 3FATA 5B7DA 3FUZA 1FQAA 4GQOA 1DTZA 4H67A 5CBSA 5CM6A 1SBPA 2Q8JA 3VLVA 1B1XA 2KLFA 2Y7WA 3OSRA 4M4GA 3RTWB 4UACA 3MW0A 1BIYA 2AIXA 3U72A 2ZYNA 5AA4B 5I58B 2UYEA 4ELOA 1HSLA 5ELVA 1NFTA 3H6VA 2BJJX 4NF8A 3PU5A 5TPAB 3E9XA 1PBQA 3VFJA 4ZZEA 4F18A 1EZ9A 5CBRA 1JEUA 1EH3A 1FTLA 2GH9A 2B65A 3V83A 1POY1 1B3HA 1URGA 4BDOA 5DEXA 1N3WA 3MZ9A 4X9TA 2O69A 4JSDA 1NNPA 3TFLA 3EN3A 3VV5A 3CFZA 2Q89A 3PUXE 1FQFA 2PBWA 4LQ2A 3QK6A 1P1NA 5FHOA 3R26A 1BLFA 3T9HB 2FA7A 1QVSA 4EUOA 2F35A 4YKKA 2DP8A 3TCGA 2XD3A 4ZEKA 3MC2A 5CMBA 2GHBA 3LR1A 4LATA 2NOOA 4YICA 3IR1A 2HZKA 3VXCA 1MPCA 3MAMA 3BFTA 1TT1A 2XXHA 2DOJA 5H8NB 4XKRA 3TTRA 3PMXA 4F3SA 2RC7A 1P1UA 4YAHX 3TUSA 1MXXA 3OO9A 4LZ5A 4X1DA 5FHNA 1R1NA 3CSBA 4ELRA 3QIMA 4QFLA 2VGQA 2DYXA 1OQGA 4EQ9A 2UXAA 3HHGA 1SI1A 2QPQA 1MM6A 3OENA 1MM7A 3TTMA 4QFOA 1FQEA 4P0GA 4R2FA 3TPAA 2DSFA 3MPKA 1JW5A 3R7XA 1M5FA 4RPNA 5KCJB 4N07A 3M3FA 3UORA 1Q35A 3MP1A 1I6QA 3OOAA 4EF2A 5I57B 1ATGA 4BLAA 5HPQA 3EQ1A 3FJMA 3FD3A 4R74A 1XVYA 1JQFA 3HCQA 5I56B 4G68A 4KCCA 1S7YA 1SW4A 4YKJA 1HSEA 3V5AA 4OFOA 4ZS9A 1L5TA 1Y3QA 4C1UA 5AA3A 2F7AA 4NF6A 4Q30B 1RYOA 1FQCA 1D4NA 3FXUA 5K2YA 2DVZA 3MPLA 2HAVA 1MPDA 2I4BA 1XC1A 1S50A 2I0CA 4O3CA 2WKYA 3FJGA 1SW2A 5CRYA 3OSQA 3C35A 1T0KA 1SYIA 3HPIA 3CIJA 3K00A 3S9MC 4WEDA 3GBAA 3IOWA 1ZTYA 5HM4B 4RNSA 1IXHA 3M8UA 1OLAA 4OMBA 1YPNA 2QMWA 1Z7NE 4PFYA 3RQTA 5DVIA 2ESNA 3AXFA 2Q2CA 1SI0A 2P2AA 4MH5A 2F78A 3U93A 1JW4A 2I3VA 2IA4A 2F7BA 1MDQA 1H43A 3EHUA 1FW0A 3K02A 1FCKA 4KYEA 4ONYA 1A55A 1QUIA 4IO4A 1OLCA 4QFPA 1A8EA 1LBCA 3DP6A 4OVJA 2H9BA 3B6TA 3N26A 4P0IA 2GRVA 4EQBA 2XX9A 3ZKLA 1TFAA 4XTCQ 4GLIA 3QXMA 2RC9A 2Q9TA 1UTHB 1MQJA 3SEVA 1B0LA 3EF7A 2PX1A 1RKMA 1DOTA 2I49A 4KR5A 2ZYKA 4R9GA 4G8MA 2HAUA 2RCAA 2XHDA 2R71A 5H8HA 3IJOB 3GBBA 2UYFA 3PGFA 1S9TA 4G8HA 2HEUA 4FEBA 3A3UA 4H1XA 2QJEA 2F6PA 3OMBA 2CZLA 1A7LA 2QRYA 5JTYA 2DVCA 2F6GA 3G3FA 1B51A 3SEYA 4POWA 2XXPA 2PYYA 3CG3A 3ECRA 4DCXA 3MZBA 4LZ7A 3G3HA 1B3FA 2ALUA 1M5BA 4JWXA 4XIGQ 2XXVA 3W15C 3Q26A 1MY4A 4YKIA 1SW1A 1M5CA 3TTLA 3DP8A 1B6HA 1PEBA 3B6WA 4H5GA 3Q25A 5H8FA 1LCFA 1MY0A 3I3VA 4L17A 3OXNA 3DLNA 1B1HA 4YB7A 4ZE8A 2IEEA 1N7XA 3N6TA 2GHAA 3KOTA 4RPOA 1Y1ZA 2DWHA 3JZJA 3KN8A 4IY5A 2UVGA 2G29A 4ZEBA 4U1OA 5F1QA 3G3GA 3SEUA 4PP0A 4U1ZA 3G3KA 1IZ1A 1KWHA 4ZE9A 5JEIA 1F9BA 4ECFA 2V25A 1PB7A 3VDFA 4F1UA 2ONKE 3N5LA 2B3FA 1OVTA 5DVJA 2R6GE 1JNFA 3SKPA 5ICTA 2OJTA 2XXYA 3TODA 3H6TA 4RYAA 4E0XA 3FVGA 3OO7A 4AQ4A 1XS5A 1M5DA 4OHNA 4WKMA 5I59A 4F39A 2B3BA 2XD2A 4EQ7A 5FTHA 3C36A 3MZ1A 4N13A 4TOZA 5L8DA 4YMBA 2VD3A 3RUMA 3FZVA 4KQPA 4NE4A 3H06B 2YPNA 3EPEA 5I2NA 2X7QA 2YLNA 1B3GA 5ICQA 1JVYA 1IXCA 1NNFA 1B7UA 5TP9B 1IITA 3T96B 4GXSB 2I6EA 4NF5B 4DXCA 3PUVE 3LC8A 1QULA 4OWDA 4R75A 2RKMA 4POXA 1A54A 4R9FA 5DT6A 3N94A 1MQGA 5CMMA 4ZEDA 4NWDA 2XXXA 1PB8A 1B46A 3K01A 5I84A 3ZS6A 5H8SA 3M3KA 3P7IA 3R6UA 4NEDA 1FQBA 1I6AA 1MQIA 5A5XB 1P1QA 5DVFA 1SYHA 3Q29A 2Y7RA 3OEMA 3MWBA 1B2HA 3IK6B 4XKNA 2QS1A 4LONB 4OEUA 4XKQA 3U92A 2DE2A 2F8DA 2QS2A 2RF1A 2REJA 3LBSA 3RGYA 3Q27A 1MG1A 3F11A 1JVXA 4BDMA 3A09A 3IOUA 3K6VA 1HSJA 4LP2B 4OYVA 2XXQA 4G77A 2Y7KA 1WDNA 1XVXA 5EHMA 4IGTA 2O7IA 2Z8EA 4OFLA 1IXGA 2H99A 1SD3A 4BDQA 3MP8A 4RJZA 2XXIA 2YJPA 3U1OA 1FTJA 4H5FA 2NVUB 3DM0A 4YMAA 2HFBA 4JB7A 4P11A 3PMWA 1R9QA 1VSOA 1NNKA 1B5IA 4I9DA 2H4IA 4F3PA 4F3BA 3T9UA 1UTBB 4K3FA 1N76A 1UIVA 3OO8A 3QUFA 4F2OA 4RY1A 5DYHA 2ABHA 1ZJLA 4YB5A 3FVKA 1Y4TA 2GFEA 3HSTA 1D9YA 1SQYA 1MQHA 4ZEFA 2ZYOA 1XOCA 4LVQA 4JSOA 4NMYA 1B52A 4RK9A 5I2KB 1B7HA 1IEJA 3RT6B 4LQ5A 3SEXA 5AA2A 2P0SA 5CMCA 3UGWA 4RK2A 3PV0E 1MXYA 4NF4A 3U8QA 3ZKKA 4G2ZA 3PUWE 5AE4A 1AIVA 3FVOA 4DZ1A 4KPTA 4U23A 4LUBA 5AA4A 5I58A 3TTKA 3RPWA 1URSA 2H5YA 2D3IA 3DP4A 4OZ9A 1POTA 2X26A 4G8NA 5TPAA 4IGRA 4ELQA 1MXWA 3KN3A 1AOVA 1JETA 1II5A 3FGSA 4MBPA 3RTFB 4H6DA 2W7YA 4WXJA 3H6UA 3SESA 2Q2AA 4Q0CA 3VLUA 4F19A 5M2VA 1DPEA 2XX7A 3LSWA 3TZAA 3KSXA 4R6YA 1GTKA 2VOZA 1DSNA 3K1PA 1IQ7A 1DMBA 4OETA 3UN6A 2RCBA 2V3UA 3UIFA 3FXRA 3LSXA 1MY3A 1B05A 5H8NA 3T9VA 2DE4A 4F3GA 1B3EA 1FTOA 2VHAA 4GOTA 3G3IA 2XXTA 3A3CA 3BBRA 4KHZE 4N6PA 3W9VA 4GXAA 4F22A 3PPNA 4U2RA 1QKBA 4FEDA 1RYXA 2PVUA 2Z8FA 4PE5B 4QSCA 3OEKA 2FYIA 1YAEA 3H7MA 2DWIA 1NH8A 1P99A 2O6AA 4PETA 4IO5A 3MBPA 3MVZA 1MQDA 3UA8A 5KDTB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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