3H6UA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns1493 at 1.85 a resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 86
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6uA02
3VVEA 4G8HA 1Q35A 5H8HB 3BFTA 1H44A 1MG1A 2DSFA 2IEEA 3C36A 2XD2A 5I84A 1AIVA 3KN3A 5DEXB 1A40A 3CG1A 3V5AA 2CMOA 4QSEA 3HSTA 4YB6A 4G77A 1D9VA 1JNFA 5ITOA 4U1ZA 3T9XB 4R6YA 1LFHA 5TPAB 1MDP1 1GV8A 3S4UA 4THIA 1B2HA 3K1PA 4RNSA 3S2VA 2W7YA 3ILUB 3TFLA 4KR5A 2PVUA 3SKPA 1UTHA 2XD3A 2V3TA 3SEVA 2RC8A 3TPAA 2X7PA 4ELPA 3T22A 3O6IA 1B4HA 2I3VA 3IX1A 5CM6A 1NNFA 1NFTA 1SW4A 4X1DA 2ZNTA 1TXFA 1LLSA 4X9TA 1VFDA 1LBBA 3OXNA 4DXUA 3M3FA 1R9LA 3A3UA 1LBCA 1ZIUA 1A8FA 2F7CA 3U93A 2RC9A 2I3WA 1B3LA 1DTGA 3A09A 2UYEA 2QMWA 3LSWA 1M5DA 4OQOA 4F22A 1B3HA 1URGA 3O28A 4HS7A 3LC8A 3C35A 1MXXA 1TWYA 2B3FA 1XHYA 4OFJA 4ZEBA 2PX1A 3IOWA 4QFLA 1JW5A 2NXOA 2D3IA 3FUZA 1PEBA 2XX9A 4ELOA 1LB9A 4RPNA 3IAZA 1MPCA 1B5IA 2GFEA 2NVUB 3Q29A 4MLVA 5FTHA 5FHMA 2DE3A 2H5YA 2DXYA 4OEVA 4KYSA 4QRZA 1DPPA 2ONSA 5HM4B 1Z7ME 2XXVA 4XKRA 1USYE 4BDNA 3Q27A 2AL4A 1B7UA 2OLBA 2XXYA 1LFIA 1SQYA 2VD2A 4RJZA 2X26A 5I57B 2AL5A 3JYRA 4OYVA 3EQ1A 3IO4A 3FZVA 4NF4A 3LUYA 4PE5B 1A8EA 4GXAA 1IIWA 3OD7A 4LZ8A 4EF1A 2P1SA 2DE4A 4U23A 2DVCA 1JEVA 1H76A 3MW0A 2XXHA 4NMYA 3U94A 1URSA 2Q2AA 3FXRA 2HFBA 4LQ5A 4F3GA 1YPNA 3E13X 2F36A 5K2YA 4BDRA 1NH7A 1Y9UA 5TU0A 1EZPA 3TDJA 1VFEA 1Y4CA 4OTEA 1EZ9A 1UTHB 1F9BA 2DQVA 3SEXA 3I3VA 1NNTA 2I48A 3CRBA 4TOZA 4IO7A 4DDDA 4LUBA 2DWAA 1MXYA 1N3XA 1ZTYA 2PT1A 1D4NA 1MY4A 3CG3A 1ZKBA 4LA9A 4R74A 4GLIA 4P11A 4EQ7A 3KJTA 3PPQA 4RA1A 3D4GA 2F6PA 1HSEA 3LBSA 2VOZA 3BBRA 3THIA 1N3WA 3PPOA 2E1SA 4OWDA 1XOCA 5I59A 5DVJA 1PC3A 1JETA 4GOTA 1QW0A 1JEUA 4FECA 2GH9A 1ZJLA 3FJMA 4KD5A 2ESNA 4RXLA 1J1NA 2ZYKA 3RGYA 1IEJA 4DCXA 3IOVA 2QS4A 4R6KA 3K00A 2XXWA 1BP5A 1H45A 2CZLA 3RTFB 5DVIA 1DTZA 4O3AA 2UYFA 3K6UA 1S50A 5AA2B 3QIMA 4G68A 1AMFA 4IO5A 1RYOA 2Y7PA 2GHAA 5A5XB 3E3KA 3F11A 2V84A 3T96B 1QKBA 1Q1KA 1UIVA 4G8NA 3BKIB 4TLMB 3DP6A 4C1TA 1JVXA 1T0KA 3Q26A 4EUOA 4GXSB 3HCQA 3C33A 2QPQA 4EF2A 1FQFA 2V3UA 4OZ9A 1US4A 1Y4TA 3SEYA 1WDNA 4MLQA 1M5BA 3KJ7A 1DMBA 1B3GA 2B65A 2F34A 2UVJA 1B3FA 4PFUA 4M1VA 1A7LA 2HXWA 4YAHX 3FJ7A 3GLBA 4O3BA 5L9SA 4DXCA 2O51A 2OK2A 5IAIA 3IK6B 4YU0A 3MVYA 3KN7A 3MVZA 2Z8EA 2H98A 5I2NB 3T9VA 2F97A 3PUXE 3R6UA 4FJPA 3UP9A 4H65A 5I2KA 3ZKKA 2DXRA 4I9DA 4ZS9A 2O1MA 2XX8A 2D21A 3M8UA 4KYDA 1IITA 2XHDA 2VD3A 3VDFA 4PFTA 3W9WA 5I58B 4ZZAA 3LSFB 3K4UA 4NEDA 3V83A 3OSRA 4TQUQ 4EXKA 1Y20A 4NF8B 2OWTA 5IKBA 5CMKA 1OVTA 4BDLA 3FVNA 3K02A 4RY1A 4P0IA 1FTOA 1OQHA 3ECRA 3K1MA 4NWCA 2QS2A 2AIXA 3TTMA 3IORA 1MY2A 4PP0A 3TKDA 5CMCA 3UGWA 4FATA 4GF8A 1B58A 1SW2A 1OLCA 3OEKA 4GL8A 3OMBA 3H6VA 3B6WA 2V93A 2HZKA 1MY3A 4XKNA 1TT1A 4MH5A 4R2BA 3RY3A 5M2VA 3GXAA 1EH3A 3K2DA 2A5SA 1MPBA 2ANJA 4G68B 4JB7A 3PUYE 4R9FA 3KOSA 4ELQA 3FXQA 3G3IA 1MH4A 3SESA 4G68C 3DP4A 2X7QA 5FHOA 1MQDA 3PD9A 4HCWA 4MBPA 5CMBA 4KI0E 1FQCA 3MC2A 1Y3PA 4H67A 1MQHA 3OO7A 3W15C 3IB2A 2PMSA 1MY1A 5AE4A 4X1BA 4DE8A 5CBRA 4GQOA 4GFRA 1FCKA 1NMUA 4MF3A 1MDQA 3MPLA 1B52A 2Q2CA 4P0GA 3TUSA 4LZ7A 3OELA 3JV9A 2ZNSA 1FQBA 1B40A 1SYIA 2YPNA 3H6WA 3CFXA 2Q9TA 5I56A 1SBPA 1VSOA 4IO6A 4ZE9A 5ITPA 1N04A 3N5LA 5CI5A 1FW0A 3OEMA 4F31B 1P1NA 5L9MA 1DOTA 5LOMA 4NWDA 1TFAA 1WVJA 2WKYA 1LCTA 4U4XA 5H8QB 3PUZE 3PMXA 2I6EA 3SEUA 2PT2A 3TAJA 4FIMA 3ZS6A 1P1QA 1GR2A 2VGQA 2F78A 3KZGA 4E0XA 4OERA 4BDMA 2XX7A 1FQDA 1FQEA 3T93B 3IL1B 3QUFA 3ILTB 3DELB 1I6BA 5L9OA 4QSCA 1CB6A 3S9LC 1R1NA 3TELA 1ZMGA 3IR1A 3UK4A 2ZXTA 4R72A 2O7IA 2HCAA 1RYXA 1YCJA 2DE2A 1P1OA 3SDFA 4H5GA 4GRKA 5TP9A 4JWXA 1Y3NA 3TZAA 3L6GA 4BDOA 4YMAA 4C0RA 3FASA 3QAXA 1NL5A 2Y7WA 1SDXA 3PU5A 2DP8A 2R9JA 3QXMA 1MS7A 3DLNA 3HN0A 2M8CA 4AB5A 1LB8A 4OEUA 4M4GA 5AA3A 1ELJA 2F35A 3Q28A 3QUJA 4FORA 3CFZA 5FHNA 5AA4A 2Z23A 1H3DA 3B7DA 4KFQA 1ZBMA 1CE2A 3GZGA 5CRYA 3UIFA 3RN8A 4JDFA 1Z7NE 4Z0IA 1A54A 3T66A 2O84X 3L6HA 4ZZEA 3K6WA 1FTKA 3K1NA 4ZEFA 1HSLA 1RKMA 3TMGA 3VVFA 4HCYA 1IUDA 2NOOA 2DWIA 4JWYA 5KDTA 2QS3A 2XXUA 3HO7A 1D9YA 1N7XA 1BTJA 4I8CA 1POY1 4R9GA 2R71A 1AH5A 4F18A 1Y1MA 4LZ5A 4NE4A 1GGGA 1B1XA 1YTVA 2LAOA 4YKIA 3UN6A 1LCFA 2OWSA 5I56B 1XS5A 2XXTA 1POTA 3EHTA 4U1OA 1ZLQA 3G3HA 3D4CA 1MXWA 2I49A 3VE1B 2UVHA 1B7HA 4NF5A 4GVOA 3G3GA 5DTBA 3MP1A 1TFDA 4JSDA 3MJNA 4ONYA 3KG2A 2Y84A 2XXPA 3MVXA 3IOTA 3U72A 4PFYA 3CI8A 1SVXB 1DSNA 2QRYA 3H3GA 2PYYA 1B5HA 4YKKA 1I69A 4PQJA 1M5FA 5K2XA 4F3PA 2V25A 3CVGA 1M5EA 4YZZA 2OCUA 4GIZA 5JEIA 2I0BA 4F2OA 4YKJA 4EQ9A 2RCBA 3ONMA 4H1XA 4WEDA 4EQBA 1QKAA 4E0WA 4ZECA 1II5A 3MBPA 3O29A 2VHAA 1L5TA 2XXIA 4JWOA 3HV1A 4FAJA 2UVGA 5BUUA 1B05A 4WKMA 4KYEA 3OO9A 1MRPA 3R7XA 3E4RA 4FEDA 3UA8A 4LQ2A 5AA4B 4HW8A 5H8HA 4NF4B 3PPNA 1S7YA 3QSLA 1BLFA 4OFLA 4ZEKA 2NWJA 2IA4A 1IXGA 2RC7A 3RUMA 2BJJX 3FD3A 3IJOB 3MAMA 3SETA 2H4IA 3K0VA 3H03A 5ICTA 3VLWA 4ESWA 4Q8RA 1WODA 3TTNA 5AA1A 1SYHA 3ZSFA 5L8DA 4H0WA 2B3BA 1BKAA 4DZ1A 3MPKA 2Z8DA 3H4ZA 3O6HA 3CIJA 3MWBA 3UORA 1IZ1A 2DS9A 3H7MA 2ABHA 2HAUA 2UXAA 1I6AA 3TYHA 1PBPA 1B1HA 3S9EA 3R26A 1O63A 2ZMBA 4IY6A 3RQTA 1MXUA 5H8SA 4NF5B 4LP2B 3OOAA 1NH8A 3CSGA 1OVBA 2DOJA 1B32A 2P0SA 2FYIA 1MPDA 4IGRA 2F8DA 3H6UA 2A5TA 3OSQA 1US5A 3DM0A 3U92A 2PBWA 4IO4A 2H9BA 4UA8A 5DT6A 5I59B 3EHUA 1IXIA 4RPOA 1B0LA 5B7DA 1B4ZA 4XIGQ 3FATA 4OXVA 3FV1A 1OMPA 3TTKA 3G3JA 4L17A 1IXHA 2HQ0A 2Y7RA 5HPQA 4OVJA 3TEPA 4G2ZA 3H06B 4O3CA 4ECFA 1AL3A 3G3KA 1QUIA 1IQ7A 3T9UA 1M5CA 3FVKA 1ANFA 3G7WA 3RLFE 3MP8A 3I6VA 5I57A 1SI0A 3PV0E 4YB5A 3OO8A 4PFWA 3T9HB 4OMBA 4YMBA 1BIYA 1LAXA 1MXVA 1UQWA 4OENA 4QSDA 3IJXB 4BLAA 3OENA 2I0CA 2XXXA 1S9TA 1JW1A 4KQPA 4IO2A 4FE8A 3VVDA 1SD3A 2GHBA 3TQLA 3KBRA 3W9VA 4F19A 4HTGA 3S9MC 2O1LA 1EZOA 4OETA 5DYHA 4ND9A 4U21A 3RNNA 2I4BA 3C9HA 1N7WA 4N13A 2G29A 2G93A 4IGTA 4OFOA 1JW4A 1LGBC 2RKMA 4YICA 4PETA 2REJA 2QSXA 3TCFA 3IOUA 3RTWB 3KN8A 2HZLA 4G4PA 4YKPA 1SI1A 5JTYA 1MQGA 1XT8A 4DIGA 2F6GA 3MVWA 3TTRA 3VLVA 4MFIA 1GTKA 1HSJA 2YLNA 3N6UA 5J1DA 3FV2A 1H43A 4QFPA 2ALUA 5I2KB 4F39A 3KSXA 3V8XB 4ELRA 3QYTA 5EHSA 3B6TA 1EU8A 2FA7A 1AOVA 1USYH 3TCGA 2DWJA 5KZTA 1VE4A 2A5TB 3PPRA 3MUQA 3ODBA 4QFKA 2O7UA 3A3CA 3C34A 3FVGA 4ZEDA 4I1DA 5BWJA 1FQAA 4ZE8A 4EXLA 3PGFA 2AYSA 3DP8A 2O6AA 3KSJA 1N84A 1QUKA 2ONRA 3PPPA 3MZBA 3LR1A 1FTLA 1O7TA 1I6QA 3G3FA 4C1UA 5B70A 2RF1A 1VR5A 3P7IA 4XTCQ 4KHZE 3I5OA 4YB7A 1DPEA 3VLUA 1O64A 1XC1A 2QMXA 4JSOA 5EHMA 4IY5A 2OBGA 4X48A 1B6HA 3EF7A 5AA2A 4KCCA 2REGA 2XXRA 1UIUA 4KCDA 2Q88A 3PD8A 3V89B 1MM6A 5A5XA 4Z7EA 1N0TA 1FTMA 4AB6A 3FIRA 3HHGA 1A99A 4JBZA 4TLLB 3PMWA 5JK4A 2HAVA 5F7VA 2V3QA 1IXCA 4F1VA 4F29A 3KOTA 1FTJA 4H8JA 3BFUA 4OESA 4ZDMA 3KEIA 4POXA 3HPIA 4F3BA 2RINA 1LFGA 4AQ4A 3KFMA 2ZYOA 2Q89A 4F2QA 2D5WA 3MP6A 1NNPA 5H8FA 3O2AA 1XVYA 1PB9A 3U8QA 3B6QA 3M3KA 1KWHA 4N6PA 4NF6A 1QJMA 1XVXA 1B9JA 3S9NC 5KCJA 3O9PA 1ATGA 4GL0A 4LATA 3CR9A 4U22A 2ZYMA 4POWA 5JTYB 1PDAA 4IO3A 3FGSA 4FEBA 4EDPA 3FXUA 1JVYA 5F1QA 1LSTA 5I2NA 4LONB 4Q30B 4GD5A 2GRVA 1QUJA 3GBBA 3TCHA 2ONKE 2R6GE 2RCAA 1MH3A 4XXUA 3K6VA 3MZ1A 5CMMA 3N94A 3LSXA 1UTBA 5I58A 2E0SA 4KPTA 3KGCA 1MY0A 2ZNUA 1N76A 1MM7A 4NF8A 3SERA 4ESXA 4XKQA 4DXBA 3O6GA 4Q5TA 4ZEIA 5CBSA 4U2RA 3C31A 2THIA 3PUWE 1SW1A 2H99A 1JQFA 1D3KA 1GVCA 1NNKA 4UACA 5TP9B 3M3LA 2QL3A 3USDA 5EYFA 1OQGA 3CFLA 5H8NA 3WAFA 3OO6A 3AXFA 1MXZA 1Y1ZA 4Q0CA 1B46A 2YJPA 2I58A 2ZYNA 1LAHE 3VXBA 4WXJA 1R6ZA 3RPWA 4R73A 4GWOA 3CSBA 1PBQA 4F1UA 2Z22A 2OZZA 3SEWA 3MZ9A 4U4SA 4QHQA 3IB0A 3WAEA 3K6XA 5DEXA 3FVOA 4XKPA 2O68A 2HEUA 2XXQA 2FNCA 3C32A 4QFOA 2Y7IA 1P99A 3JZJA 4R75A 2F7AA 3VV5A 2F5XA 4QFNA 4F1YA 5TPAA 4R6HA 5KDTB 4G8MA 3HHFA 4H8IA 1LAFE 3Q25A 2I4CA 3K01A 5ISUA 1B51A 4BDQA 5H8FB 3TODA 3N26A 3IO6A 5ELVA 1P1WA 2UVIA 1A55A 2O69A 1LAGE 3E9XA 4NF6B 5KCJB 3PUVE 1OIBA 2QS1A 3RT8A 3TQWA 3ZKLA 4WEPA 3U1OA 1B0HA 4LVQA 5FTIA 2Z8FA 1ZU0A 2DYXA 2KLFA 2NUVA 5H8QA 1OLAA 1MQJA 2DVZA 4IB2A 1R9QA 5HBCA 5DVFA 4DCYA 3QK6A 4RK9A 4QF9A 4N07A 1URDA 1UTBB 3LSLA 4DLDA 4H6DA 2OJTA 4I62A 1PB7A 3FJGA 1Y3QA 5CC2A 1QVSA 2Q8JA 4H5FA 1PB8A 4JXIA 1SW5A 3C4MA 3EHSA 1NKXA 3MQ9A 3VFJA 3TTLA 3EPEA 3O97A 1B3EA 2VP1A 1QULA 4K3FA 3RT6B 1YAEA 3IB1A 4NTLA 3H6TA 4R2FA 2Y7KA 4RYAA 3PMVA 4ISUA 2DWHA 3N6TA 3O66A 3EN3A 4OHNA 2H25A 5AA2D 1B7ZA 2P2AA 5H8NB 1B5JA 3VXCA 1P1UA 2F7BA 3GBAA 4RK2A 5ICQA 4F3SA 1MQIA 2QJEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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