4QSEA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound glycerol
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
b'DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
publication title Crystal structure of maltoside transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, target EFI-510558
rcsb
total genus 138
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA02
3FGSA 4I8CA 1VFEA 1N04A 2DE3A 4NF8A 4YKJA 5TP9A 1IEJA 2V3UA 4C1UA 3H03A 4F31B 2DOJA 1ZKBA 1D4NA 3G3IA 4F29A 5CM6A 4JWOA 3A09A 3IX1A 5L8DA 3KOTA 4F3PA 3P7IA 2F8DA 2RF1A 4X48A 1SDXA 2I3WA 2PYYA 4IY6A 2BJJX 2XX9A 2F36A 3MPKA 4QFNA 3TQWA 3BKIB 2RC9A 2XXTA 1MY2A 3OSRA 5CMMA 1MQJA 3D4CA 4ZS9A 2ONRA 4LQ5A 1MPDA 1POY1 3C36A 1LAXA 1US5A 3EQ1A 4AQ4A 1AOVA 3KN3A 1B58A 1LAFE 1B52A 3MVXA 5DEXA 4OTEA 5TP9B 2YJPA 4ZZEA 2ZNSA 3FJGA 2DWJA 2ZMBA 2FA7A 3L6HA 4NF6A 5FTHA 1B4ZA 1EH3A 3I6VA 2FNCA 3D4GA 2O51A 5KCJA 5LOMA 3LSXA 4Q8RA 2QS4A 1Y4CA 2Z23A 4FIMA 3TDJA 1P1WA 3GXAA 2O1LA 2YPNA 3FVNA 1IUDA 3LSWA 1P99A 1M5CA 2A5TA 2RCBA 4JXIA 4R6HA 3UORA 1POTA 3K1MA 5KDTB 5I58A 3EHTA 3V89B 4X1BA 4QHQA 4O3AA 5ITOA 3THIA 1MM7A 2I58A 2NXOA 2XXVA 4R6KA 2PT2A 2DE4A 3KN7A 3PUWE 4DCXA 3V5AA 3N6UA 4DXUA 5B7DA 4G8NA 3H6WA 4H8IA 4IGRA 1EZPA 4FEBA 3BBRA 1UIVA 2DQVA 2H98A 3PPQA 4I62A 4G68C 4KR5A 4PFYA 1B3GA 1M5DA 4QFOA 3VDFA 3TTMA 3FV1A 2HEUA 4NF6B 1NNTA 1F9BA 4HS7A 4YB5A 4U2RA 3PMXA 1B32A 2RCAA 2I49A 3LC8A 3K2DA 3N94A 4KHZE 1A99A 1BTJA 2G29A 2XXHA 3O97A 3PPPA 1Q35A 1Y9UA 3Q26A 3TTKA 5H8HA 2DSFA 4BDQA 4C1TA 1JVYA 4ELRA 2V93A 5DVJA 4AB5A 4GLIA 2QS2A 2RC7A 3CIJA 2XXPA 1TT1A 1JVXA 2I4CA 2O1MA 3FV2A 3IOUA 4ESWA 1R6ZA 3LSLA 4G8MA 3FIRA 4DIGA 2Y7PA 4OXVA 3OO8A 2H4IA 3KBRA 3ZSFA 1MRPA 2PVUA 4K3FA 3IOVA 4N13A 4GD5A 1QKAA 1MY4A 2F7BA 2Q2AA 1FQCA 4RK9A 3IR1A 4G2ZA 2DWAA 4IO3A 2P1SA 4PFUA 4E0WA 5EHMA 5AA2A 3JYRA 1URGA 3E13X 2QSXA 1B7ZA 1Y3QA 1BP5A 1B0HA 1IQ7A 3QAXA 4XKPA 1PDAA 1XVYA 1L5TA 3SEYA 4BLAA 1MH4A 4U4SA 3PV0E 3H6TA 1NNFA 1ZLQA 3UK4A 1N84A 2V3TA 3H4ZA 3KFMA 3I5OA 4F3BA 4WEDA 3KGCA 5DTBA 3ONMA 1Y4TA 1QW0A 1SYIA 3DP8A 4FEDA 3LUYA 4U4XA 3C31A 4JWXA 1LCFA 2Z22A 1FQAA 1MDP1 4QFPA 4O3BA 1R9QA 1IIWA 4THIA 2W7YA 4XIGQ 1DTGA 3TODA 5BWJA 3IL1B 2OWSA 2PT1A 1O7TA 2I3VA 4GIZA 4LATA 4RPNA 4LUBA 4XKRA 1FCKA 2X26A 3UIFA 5I2NB 4YKPA 2THIA 3KG2A 3RUMA 5A5XA 2F34A 3TFLA 3C33A 3VVEA 3HV1A 2HZLA 1B0LA 2PMSA 4XKQA 1IXHA 5DEXB 5FTIA 3TTNA 3EN3A 1VR5A 1O63A 4PP0A 4IO7A 5H8QB 3RQTA 3S9LC 3R7XA 3T22A 3B6QA 5CC2A 1Z7ME 3A3CA 1SYHA 1ZTYA 4YMBA 5AA2B 1B40A 1WDNA 5JEIA 3MPLA 1PC3A 5JK4A 4DDDA 3K6WA 4LP2B 4OERA 4F22A 1UIUA 2G93A 2GH9A 3E3KA 4GXAA 3FASA 1MPCA 1PBPA 5M2VA 2ZYNA 3VXBA 3OEKA 3PU5A 3CSBA 2R9JA 1MQIA 3MAMA 3M8UA 3OD7A 3MBPA 3SEWA 3TQLA 2KLFA 4HCWA 1I6BA 2HXWA 2NUVA 4FJPA 4F1VA 3DP6A 4ZEDA 1BLFA 3I3VA 3OEMA 4YKIA 4YKKA 4NF4B 5FHOA 4ZECA 1AH5A 2H99A 2UVIA 3GBBA 4QSCA 3USDA 3SKPA 3K0VA 2D3IA 3TMGA 3HPIA 3O9PA 3JZJA 3UGWA 1GR2A 1MXXA 1PB8A 2OZZA 2XD3A 3MP1A 4R6YA 4X1DA 5AA4A 3KJTA 3MJNA 3RGYA 3FVGA 2OBGA 1B3HA 4JWYA 5TPAA 2Y7IA 3FXUA 4IGTA 1LB8A 3MVYA 3QXMA 4KCCA 4GVOA 4POXA 1XOCA 3DM0A 3IO4A 4XKNA 3U1OA 3U72A 4EXLA 3IJOB 2ZXTA 3G3JA 4N07A 5FHNA 2IEEA 1OIBA 1AMFA 4OZ9A 1GV8A 1IXCA 1H45A 1YTVA 3S9MC 3Q25A 5I59B 2NOOA 4E0XA 5I2KA 4TQUQ 2F97A 2XXXA 3HHFA 4GRKA 1FTKA 3R26A 4H5GA 4YICA 3OO6A 2XX8A 1FQBA 4R74A 1ZU0A 1MS7A 4P0IA 2B3FA 3CSGA 1A55A 2ONSA 1N7WA 2HAVA 1EZOA 2UVJA 1TXFA 2Q88A 2UYFA 3VLVA 2Q2CA 4R72A 3T9XB 2XX7A 2Y7RA 4ZE8A 1DSNA 1BKAA 4JDFA 1B1HA 4LA9A 2Y84A 2F6PA 4M4GA 1VFDA 4KYDA 1EU8A 3IB1A 4YZZA 4P11A 3VLWA 4ELPA 5JTYA 3RLFE 3UA8A 3K4UA 2H9BA 3C35A 4TLLB 4OWDA 4YAHX 4ZZAA 3IB0A 3MP6A 2XHDA 4OFJA 5I56B 3H6VA 4YMAA 3B7DA 1WVJA 1B4HA 3KSXA 1R9LA 4F18A 1SI0A 3PPRA 4R9FA 1DPPA 3FVOA 3F11A 1O64A 2HQ0A 4L17A 4OETA 3GZGA 2QS1A 1DPEA 1UTBA 4YB6A 3PMVA 1QUIA 2ONKE 3PUYE 1OLCA 1B3LA 4GL0A 4H0WA 4ZDMA 1UTHA 1URSA 3VLUA 3DP4A 4MF3A 3O28A 3QUFA 4WKMA 4ZEFA 1PEBA 1A7LA 3CR9A 4QSDA 5TU0A 2R71A 5HBCA 3KSJA 1H3DA 3C34A 3MZBA 5H8SA 4KFQA 3ZKLA 5B70A 2HZKA 1GVCA 3C9HA 1LAGE 3RTWB 2Q89A 3TCHA 1I6AA 1LB9A 5AA2D 5CBSA 3WAFA 5KDTA 3MVZA 3TCFA 1SQYA 1SVXB 1B9JA 4GQOA 4IO6A 4F1UA 5I57A 1JETA 3TKDA 3IOTA 2AL5A 4DLDA 2DWHA 4GOTA 4I1DA 2I6EA 4IB2A 3TELA 3TTRA 5I59A 3K1NA 4MH5A 1JQFA 5K2XA 3H7MA 4ONYA 1USYH 2X7QA 4OEUA 5ICTA 1SBPA 3CFLA 2Y7WA 3G3FA 4H5FA 2ZNTA 3OELA 2P2AA 2RC8A 3KOSA 3EF7A 1S7YA 4FORA 4MFIA 2V84A 2HAUA 1FTMA 1SW2A 2I48A 3BFUA 3H6UA 4NE4A 2NWJA 4I9DA 3EPEA 4GFRA 2D5WA 3CFXA 3ECRA 2QJEA 4R2FA 5I84A 1B6HA 4Z7EA 4LZ8A 1NFTA 2A5SA 1ANFA 3TPAA 3VE1B 4ZEKA 3BFTA 2R6GE 1D9VA 3FJ7A 4EQ9A 1B3FA 1P1NA 2QRYA 3OENA 4RNSA 5HM4B 4Q5TA 3JV9A 1NNKA 3ODBA 1II5A 4ESXA 2DP8A 2V3QA 5K2YA 4KYSA 2VOZA 3WAEA 4DZ1A 4FATA 1SW1A 1CB6A 4RA1A 4NWCA 3VV5A 1JEUA 2ALUA 2OJTA 5EYFA 3K6UA 4NF5A 4BDRA 1MY1A 3CFZA 2OCUA 1A8EA 1IZ1A 4F2OA 3V83A 4EUOA 1MY3A 2Z8EA 3N26A 3KN8A 3O29A 5I2KB 5BUUA 1JNFA 4GL8A 3HSTA 4PQJA 2ZYMA 2DXRA 4POWA 4U23A 3T96B 1T0KA 2ZNUA 1NKXA 2DVCA 3OXNA 3T66A 2ZYKA 4NWDA 1B46A 4YU0A 3LR1A 4P0GA 4HCYA 1N3WA 3QYTA 5HPQA 5ITPA 3KEIA 1RYOA 1B5IA 1I69A 4WXJA 2D21A 1N0TA 1Y3NA 2WKYA 2F6GA 1FTJA 3ILTB 4JB7A 1LBCA 4KYEA 4OMBA 4RYAA 1YAEA 4EQBA 4G68B 2LAOA 5CMCA 1DTZA 1PB7A 3G3HA 3MUQA 5AA3A 3U94A 1LFGA 1MXUA 1R1NA 5H8NB 3UP9A 5FHMA 4XTCQ 1B5HA 4N6PA 5I57B 2AL4A 1RKMA 3QSLA 4ZEBA 4X9TA 1MH3A 3CG3A 1Z7NE 3K02A 1B5JA 1QJMA 3MZ1A 3V8XB 5CBRA 1DOTA 3OMBA 2V25A 3FUZA 3CG1A 3IB2A 1D3KA 3ILUB 3IAZA 4JSDA 4H8JA 2UXAA 1MDQA 1LSTA 4Q30B 3PD8A 4R73A 3G3KA 1GGGA 2F78A 4OHNA 2VP1A 5I2NA 4NEDA 1UTBB 2IA4A 3IO6A 1SW4A 1B1XA 2E0SA 3EHUA 3SEXA 3ZS6A 5CMKA 2Z8FA 1USYE 4YB7A 2AYSA 3OO7A 1CE2A 1TFDA 2CMOA 4GXSB 4LQ2A 3K6XA 1QVSA 4RXLA 1H44A 1LAHE 1MQHA 2ZYOA 5AE4A 1A8FA 2QMWA 5I56A 3S9EA 1NH8A 1SW5A 2XXUA 2DS9A 5EHSA 4FAJA 4KCDA 2REGA 5AA1A 1YCJA 5DYHA 4QRZA 5H8NA 3HN0A 5H8FA 3FATA 2I0CA 4PFWA 4ND9A 4IO4A 1B05A 3TAJA 1A40A 4EXKA 2XXQA 3LBSA 4EF1A 1D9YA 3MW0A 1LCTA 2NVUB 4OYVA 2E1SA 2P0SA 4LONB 3HHGA 1I6QA 1NNPA 3TYHA 4HTGA 3W9VA 4O3CA 4AB6A 1QUKA 4RJZA 3SESA 1VE4A 3M3LA 2X7PA 3T9HB 4EF2A 4LVQA 1AIVA 4U21A 3PUVE 4OESA 3Q27A 1LFHA 2O68A 2XXRA 3TUSA 4IY5A 3S4UA 1LGBC 1ZMGA 3RT8A 3MWBA 4PFTA 3UN6A 4KI0E 1P1QA 1LLSA 1MG1A 1XT8A 2GFEA 4PE5B 4R9GA 4G4PA 1Y1ZA 2A5TB 3CI8A 1UTHB 1Y3PA 4RPOA 3RTFB 5KCJB 3MC2A 4F19A 3SEUA 2H25A 1DMBA 1TFAA 4GWOA 4OQOA 5TPAB 4IO2A 1JW4A 1JW5A 1KWHA 1JW1A 1SI1A 1VSOA 2HCAA 3M3FA 3RT6B 1OQHA 3PUXE 3CVGA 3IJXB 4WEPA 1FW0A 4MLVA 1Y1MA 4H65A 1QKBA 1HSEA 3VFJA 5ISUA 4LZ7A 5H8FB 4EQ7A 2DYXA 4JSOA 2XXWA 5H8HB 4U1OA 2QS3A 4BDMA 4EDPA 1ZBMA 1J1NA 3K00A 3L6GA 1M5EA 3G7WA 5JTYB 2ABHA 3MZ9A 1BIYA 4JBZA 1MXVA 3SEVA 1NL5A 3IK6B 1ZIUA 2FYIA 2F35A 3C32A 3RPWA 5L9SA 3U8QA 1MPBA 3W9WA 1FQEA 2GRVA 1IITA 4H67A 3S2VA 4QFLA 1H76A 1NMUA 1XC1A 3HCQA 1RYXA 1XHYA 2VGQA 3IORA 3VVDA 3OOAA 3MP8A 3SERA 3KZGA 4KPTA 4PETA 4UA8A 2VD3A 1A54A 5H8QA 3N6TA 3E9XA 1B51A 2F5XA 4RK2A 3U93A 4DE8A 5I58B 4FECA 1SD3A 3SDFA 1Y20A 4ELOA 4R75A 1S50A 1FTOA 4KQPA 2I4BA 4QFKA 3OSQA 1ELJA 2O6AA 3FJMA 3N5LA 1FQDA 2UVHA 3FD3A 1MXWA 3RN8A 2CZLA 3B6TA 4U1ZA 4TLMB 3PMWA 4M1VA 4TOZA 5CMBA 5DVIA 1OMPA 2VD2A 3O6IA 1HSJA 1B3EA 1S9TA 1ZJLA 2F7AA 4LZ5A 4OENA 5CI5A 2DXYA 5AA4B 3FZVA 3PPOA 3S9NC 1EZ9A 2O69A 2H5YA 1GTKA 2ESNA 2B65A 3FVKA 4KD5A 4XXUA 4NMYA 4DXBA 1QULA 5KZTA 3O2AA 2PBWA 3ZKKA 4F39A 1WODA 4RY1A 3G3GA 2AIXA 1N76A 3Q29A 3A3UA 3E4RA 1QUJA 3GLBA 2O7UA 3K01A 5DVFA 1NH7A 1B2HA 3RY3A 4ZE9A 2QMXA 2OLBA 3FXRA 3IOWA 2HFBA 3O6HA 1Q1KA 4FE8A 3PD9A 3TCGA 1N7XA 2ANJA 4ECFA 5ELVA 3KJ7A 4QSEA 4UACA 1FQFA 2O84X 4OFOA 1H43A 2Y7KA 4NF5B 3RNNA 4H6DA 3TZAA 3W15C 3B6WA 5IAIA 3K1PA 3O66A 1UQWA 1PB9A 2GHAA 4NF8B 2YLNA 4U22A 1OLAA 3TEPA 1MXZA 3VXCA 1FTLA 2DE2A 5A5XB 5CRYA 1N3XA 5L9OA 4MBPA 1OVBA 3LSFB 2DVZA 2M8CA 4F1YA 5J1DA 3PUZE 3U92A 4Z0IA 3T93B 2QPQA 1LBBA 4OFLA 2RINA 1ATGA 2DWIA 3VVFA 4IO5A 1JEVA 2QL3A 1MM6A 3QUJA 4ISUA 1MQGA 2B3BA 3QIMA 4Q0CA 2RKMA 1HSLA 2XXYA 3M3KA 3T9UA 4F2QA 1OVTA 1PBQA 1XS5A 2VHAA 3MVWA 3FXQA 1IXIA 4G68A 4DXCA 2O7IA 5F1QA 2I0BA 3TTLA 1TWYA 4HW8A 5IKBA 3K6VA 2Q8JA 2OWTA 1URDA 1XVXA 2F7CA 1M5FA 4G8HA 2UYEA 3OO9A 3PPNA 3QK6A 1B7UA 1P1OA 3C4MA 3H06B 1US4A 4ELQA 3T9VA 5F7VA 2XD2A 5L9MA 3DLNA 3Q28A 4BDNA 2UVGA 3GBAA 3H3GA 4OEVA 1MY0A 3EHSA 4F3SA 1YPNA 2PX1A 3DELB 4QF9A 4OVJA 1P1UA 4MLQA 1IXGA 1MXYA 2REJA 3PGFA 4H1XA 4GF8A 2XXIA 1B7HA 3R6UA 4F3GA 1AL3A 1MQDA 2Z8DA 3CRBA 5ICQA 1OQGA 1LFIA 3HO7A 2GHBA 4G77A 4NF4A 4NTLA 4R2BA 4ZEIA 4BDLA 4DCYA 5DT6A 2Q9TA 2OK2A 3SETA 3MQ9A 4BDOA 3O6GA 3AXFA 4C0RA 1M5BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDZA 1N04A 5TP9A 4F31B 1ZKBA 4F29A 4F3PA 3P7IA 4PFRA 2PYYA 3MPKA 1MQJA 3D4CA 3EQ1A 4AQ4A 1AOVA 1B52A 1NUXA 4ZZEA 2ZNSA 3FJGA 2DWJA 2ZMBA 2FA7A 3L6HA 3I6VA 4LN5A 2O51A 2QS4A 1P1WA 2O1LA 3LSWA 1IUDA 1FPEA 2RCBA 4JVIA 1POTA 5I58A 4QHQA 2NXOA 2PT2A 3KN7A 3MYUA 4X8RA 4H8IA 4FEBA 3BBRA 2DQVA 2WBBA 1M5DA 1QGXA 4QFOA 3TTMA 5IGAA 1A99A 1BTJA 2G29A 2XXHA 3TTKA 2V93A 4H46A 4AB5A 1JVXA 1R6ZA 2ZZVA 3LSLA 4P1LA 1NUWA 4K3FA 5EQ7A 1EYIA 2F7BA 4RK9A 3IR1A 5AA2A 2P1SA 5EHMA 1DBZA 1B0HA 1IQ7A 4XKPA 1PDAA 1XVYA 5T3JA 3PV0E 1ZLQA 3UK4A 1N84A 3I5OA 4WEDA 3KGCA 5ET5A 3ONMA 1Y4TA 3DP8A 4FEDA 3LUYA 4JWXA 1LCFA 2Z22A 1MDP1 2W7YA 4XIGQ 1DTGA 4AS4A 2OWSA 4GIZA 4RPNA 4PF8A 4LUBA 4G61A 5A5XA 2F34A 4GWUA 4N15A 3TTNA 3EN3A 4PP0A 3S9LC 5CC2A 3A3CA 2GH9A 3FXBA 1MQIA 3OD7A 2KLFA 4HCWA 1I6BA 4FJPA 2NUVA 3DP6A 4ZEDA 3I3VA 3OEMA 4YKKA 3GBBA 4QSCA 4GBVA 4N4UA 3JZJA 1GR2A 1MXXA 3MP1A 4R6YA 3KJTA 3MJNA 5IZ1A 3FVGA 2Y7IA 1LB8A 1XOCA 1YTVA 3Q25A 2F97A 4GRKA 4H5GA 4R74A 3LV0A 1MS7A 2B3FA 3CSGA 1EZOA 2UVJA 2Q2CA 4R72A 3T9XB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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