4QSEA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound glycerol
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
publication title Crystal structure of maltoside transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, target EFI-510558
rcsb
source organism Agrobacterium fabrum
total genus 138
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA02
2OK2A 1RYXA 2DXYA 5I2NB 1A40A 2HQ0A 3CG1A 3EHTA 1B7HA 1XOCA 1LAXA 4F3GA 2XHDA 1PC3A 3Q27A 3IO4A 4OFOA 1P99A 4M1VA 1NKXA 2XXXA 3FVOA 3IAZA 1N76A 3RLFE 5I2KB 4OERA 1PEBA 1FW0A 1LGBC 4UA8A 1Y1MA 1D3KA 3JZJA 3LSWA 4POXA 1MPDA 4NF6A 4KYEA 1US5A 3G3FA 4FEDA 3MWBA 3KBRA 1B46A 4PFTA 4G68A 4K3FA 1I6AA 5CRYA 3G3IA 3TELA 4F22A 3VFJA 1MDP1 4FAJA 1B4HA 3LBSA 2Y84A 1SYHA 1UIVA 2QPQA 2PT2A 2Y7WA 2VOZA 4AQ4A 5LOMA 1DPPA 3BKIB 3SESA 2I4BA 4BDOA 4FEBA 4QF9A 1IITA 3OO8A 1DTZA 4DCYA 2I3WA 2NWJA 3MPKA 4OFLA 2DVCA 1H45A 4JBZA 2OCUA 3UORA 3IJXB 4TLLB 3ZKLA 4PFWA 3A09A 1SBPA 1SI1A 2GHAA 3U92A 4QSEA 3QAXA 1ZMGA 1SYIA 3CSBA 1HSEA 5I58B 4KQPA 2PX1A 2O7IA 4QSDA 3SEVA 1LAGE 2O1LA 4ELPA 3A3UA 2XXIA 3T93B 2Z23A 4E0WA 3E9XA 4GL0A 4GL8A 3PD9A 1A55A 3EHSA 2OZZA 3VXBA 3VXCA 2OWTA 3MC2A 4XKQA 3MBPA 1LB8A 5KDTB 4YKIA 1B4ZA 1B3FA 4FECA 1MS7A 1NNPA 3FZVA 3KN8A 3PPPA 3N6UA 5FHOA 3TTKA 1HSLA 2QL3A 3RT8A 1MY2A 1NMUA 3OOAA 5HPQA 3TCHA 1WDNA 1Q1KA 4E0XA 3KEIA 2F7BA 1LFIA 1MXUA 1B2HA 1IXHA 2F6GA 3PU5A 5JEIA 1IXCA 2R6GE 5IAIA 3FXRA 4LUBA 1B05A 4NWCA 4HW8A 2F8DA 1AOVA 1EU8A 1FTMA 4R9GA 1MQHA 1NNKA 3DP8A 4NF4B 5ITOA 3VVDA 1Z7ME 3S9LC 1M5BA 3N6TA 1AH5A 5TP9B 1LFHA 4MLVA 4WXJA 3KSJA 2GRVA 4OZ9A 3F11A 2XXTA 3QSLA 3THIA 2GH9A 4H5GA 2H25A 5ICTA 3MP6A 1LFGA 1SW2A 2I49A 4F29A 1JNFA 4P0IA 5H8NB 2PBWA 3KJ7A 4HCYA 1BTJA 4X1DA 1R6ZA 2ONKE 1R1NA 3O29A 2F34A 2DP8A 1RYOA 1QULA 1IQ7A 1M5EA 5I2KA 5KCJA 1F9BA 1SI0A 4NF5A 4MH5A 3IOTA 3SEYA 4Q30B 2B3BA 2NOOA 3QYTA 3CG3A 4GXAA 4MF3A 5DEXB 4UACA 4ONYA 4X9TA 1Z7NE 5CC2A 3TMGA 5I56A 3TODA 4RNSA 3KFMA 3R6UA 3MVYA 4ZZAA 4H8JA 1CE2A 3Q29A 4OMBA 4G8NA 1B9JA 4G77A 1MH3A 2AL4A 1JVYA 2HFBA 2R9JA 3BFUA 1USYH 4THIA 5DVJA 2H4IA 1LSTA 3IO6A 4Z0IA 1YAEA 4KD5A 4R6KA 4PFYA 5L9SA 4MBPA 3C33A 5ICQA 1LBBA 1TFDA 3PUYE 1MXXA 1AMFA 1JVXA 4XIGQ 4GWOA 4G68B 2CZLA 4RYAA 4OESA 3WAEA 2VP1A 3MVXA 3OSQA 4FIMA 4C1TA 4OFJA 5BUUA 5IKBA 3ILUB 3A3CA 1UQWA 3IORA 3OEKA 2B65A 2NUVA 1NNFA 4G4PA 3O28A 1SW1A 3GBBA 3KZGA 4F19A 1Y4CA 1GTKA 4IO2A 2P1SA 3U1OA 1IZ1A 4YU0A 2XXPA 1ZJLA 2I58A 2H98A 3DM0A 1QKBA 3EPEA 3MJNA 2F36A 2AIXA 3MAMA 4F3PA 3C34A 5AA2D 3M3FA 4F1YA 3GLBA 3Q26A 1JW1A 2YJPA 1SQYA 1KWHA 1QVSA 3V89B 3VLWA 1AIVA 3IX1A 1S9TA 2H5YA 3K6VA 3KOTA 3RUMA 3RQTA 4QFPA 3KOSA 1P1UA 2ONSA 1FTKA 3TTMA 1Y3QA 4QFOA 1H43A 4DIGA 5L9OA 4JSDA 1EZPA 4X48A 1PDAA 4F1UA 3UGWA 3DP6A 4DXCA 3TQLA 2V3QA 3FJ7A 1II5A 1B51A 3SERA 4YZZA 2HZLA 4QSCA 3EN3A 3KSXA 3BBRA 2XXRA 1MRPA 3CFLA 3B6WA 3MVWA 2Z8DA 1QJMA 4IGTA 4I1DA 1WODA 3EQ1A 1J1NA 3IB0A 1A99A 3N94A 4LATA 1CB6A 4EF1A 2RKMA 4PFUA 4U21A 2ZNSA 1UIUA 3IB2A 2KLFA 4F2OA 3PUXE 1MQDA 2XXVA 3OMBA 4X1BA 1I69A 3K6UA 3MZBA 5I84A 3PMVA 3OEMA 4LZ5A 4NMYA 3S9EA 3OO9A 2W7YA 3IK6B 3WAFA 3TPAA 4EQBA 1DTGA 3H6TA 2VD2A 5L8DA 1YPNA 2I3VA 1B52A 4R75A 4KCCA 5ITPA 3PUVE 1PB9A 1RKMA 1ZTYA 2DWJA 2LAOA 4U22A 4JWYA 4PQJA 5KCJB 4GRKA 2REJA 4IO5A 4NF5B 1IEJA 3H4ZA 1VR5A 5H8QA 3M3LA 1A54A 4KCDA 3I5OA 4HS7A 1GVCA 4ECFA 2ZYKA 3TUSA 2NVUB 2O68A 1PB7A 1OMPA 3U93A 3TCFA 3H6WA 4NF8A 3CI8A 4R74A 4Q5TA 5H8FA 5I56B 1QUIA 1FQBA 2OWSA 4IY6A 4R6YA 3LSFB 1ZIUA 2F6PA 4ZE9A 4OEUA 5DVFA 2XXQA 1XHYA 2F97A 4PP0A 5A5XA 2F7CA 4G8HA 4RK2A 3VV5A 4ELRA 2OJTA 1AL3A 3GXAA 3L6GA 3VVEA 2NXOA 5FHMA 1B1XA 4ZZEA 3PPOA 1MM6A 2IA4A 3G3GA 4GVOA 1OLCA 4O3CA 4RPOA 5B7DA 3CIJA 3K1PA 4ESXA 3HN0A 2Q8JA 4MLQA 4O3BA 1LAHE 3TDJA 5I57A 1MQJA 3T96B 1IXIA 3FXUA 3GBAA 2Q2AA 4ZEDA 1MXVA 3FJMA 5H8HB 2XD2A 1SVXB 3K1MA 3V8XB 4XKRA 3QXMA 4DZ1A 1JEUA 3QK6A 3RN8A 3N26A 4YB7A 4DCXA 1QUJA 2CMOA 1XVXA 2RCBA 2V25A 1XC1A 1N7XA 2I4CA 2RC8A 3UIFA 3FD3A 3ILTB 4LZ7A 3MP1A 4ZE8A 1Y3NA 1MPBA 4HCWA 1MH4A 2ANJA 3VVFA 2QSXA 3DELB 2RC7A 4AB5A 4R6HA 4ELQA 3FVGA 1N7WA 2V93A 1H44A 5CMKA 3JV9A 1B0LA 3PGFA 3KG2A 1YCJA 2WKYA 4LA9A 3SDFA 1B6HA 1ATGA 3LSXA 1MDQA 1B3GA 2UVJA 4I9DA 4Q0CA 4KYDA 4ESWA 1H3DA 2QS3A 4DE8A 5HM4B 3D4CA 4G2ZA 3QUJA 4YB5A 3PUZE 3RPWA 4G8MA 3K6WA 5FTHA 4BDRA 1ELJA 3UN6A 2BJJX 1B3LA 2ZNUA 2UXAA 2Q9TA 5CMMA 3PV0E 3UA8A 2D3IA 4EQ7A 3KGCA 1TXFA 4QFNA 3SEWA 4EQ9A 2X7PA 1EH3A 1B5HA 3K0VA 2V3TA 1PBPA 4XTCQ 4GOTA 5I59A 1LLSA 2Y7RA 3T9HB 3SETA 2G29A 5M2VA 3JYRA 5K2XA 3LUYA 2Q2CA 4YMBA 2DWIA 4ISUA 3KJTA 2F5XA 2G93A 3MZ1A 4U4XA 1OLAA 2ALUA 4IB2A 3TTRA 2PYYA 2V84A 3OXNA 4KYSA 2RF1A 4XKPA 2Z8EA 1PB8A 4R2BA 1P1NA 3TAJA 3Q25A 3S4UA 3HSTA 4F39A 2D5WA 1MY4A 2O69A 3LR1A 4GLIA 4ZEBA 2XXHA 3FIRA 2M8CA 4TOZA 3OENA 3MP8A 1ZBMA 1IXGA 1B40A 3T9VA 3G3HA 2QS4A 3V5AA 4ELOA 4R9FA 4U2RA 4FORA 5H8QB 1MY1A 3MVZA 3FATA 4F2QA 2DE2A 1OQGA 5CMBA 3O97A 5H8SA 1LB9A 3BFTA 4F1VA 2O51A 1FCKA 1DOTA 4GQOA 2UVGA 2ZNTA 4NF8B 5EYFA 4EXLA 3W15C 3FV1A 5H8FB 1FTLA 3O9PA 2FNCA 4BDLA 4QRZA 3TTLA 4GFRA 3H3GA 5H8HA 3USDA 3O2AA 3EHUA 4R72A 1VFDA 5AE4A 4U1ZA 4OEVA 4NTLA 4ZS9A 4P11A 3TTNA 1MXZA 5JTYA 4EXKA 5A5XB 5EHMA 5B70A 4YKKA 5EHSA 2DVZA 4JSOA 2OLBA 4ZDMA 4L17A 2F7AA 4TLMB 4RJZA 4C1UA 1FQAA 1ZKBA 3ZSFA 3U8QA 4YKJA 2I0BA 3C31A 3VDFA 2VD3A 4IO7A 1ZLQA 2DE3A 3IOUA 4H65A 4OWDA 4AB6A 4JB7A 1MQIA 2R71A 1MG1A 4NEDA 1A8EA 4LQ5A 2VGQA 5I57B 1URGA 1T0KA 2Y7KA 4LZ8A 4OQOA 3O6IA 2RINA 3H03A 4BDQA 1QKAA 4R2FA 1UTHB 2XD3A 1MQGA 4DLDA 3IJOB 1JETA 1QUKA 1DMBA 2HAVA 3B6TA 3L6HA 3FUZA 3TQWA 3RT6B 1N3WA 3H6UA 1QW0A 1POTA 4ZEKA 3PPNA 4YAHX 3ONMA 4Q8RA 1H76A 4QFKA 1B5IA 1LCFA 4KHZE 3MQ9A 1TWYA 1B7UA 3E4RA 2E1SA 1O64A 2THIA 2QMXA 2PMSA 3N5LA 2P2AA 3OO7A 3R26A 3KN7A 5BWJA 4BLAA 5CI5A 3CSGA 4IGRA 1XS5A 2X7QA 2Z22A 4FE8A 4RA1A 3MPLA 2RC9A 1B0HA 3U94A 2D21A 5CM6A 2YPNA 2P0SA 4C0RA 1GGGA 3HHFA 4N6PA 2O1MA 4N13A 3O66A 3I6VA 1NFTA 4HTGA 2XX7A 4TQUQ 4Z7EA 1ZU0A 1BKAA 3EF7A 4G68C 3VE1B 1NL5A 4GF8A 1UTBA 1FQCA 1FQFA 3R7XA 1JW5A 1B58A 4H6DA 1N84A 5L9MA 5KZTA 2O6AA 2E0SA 4QFLA 3IR1A 1BP5A 4QHQA 1Y3PA 3HO7A 4YMAA 5I59B 1OQHA 2HCAA 3FGSA 1NH8A 5TPAB 2ONRA 2Y7PA 4WEPA 1LCTA 3H7MA 3RGYA 2B3FA 2Q88A 3K1NA 2GHBA 4KR5A 1B1HA 3G3KA 4GXSB 2XXUA 4GIZA 2DOJA 3I3VA 1HSJA 2IEEA 3FASA 5DT6A 4EUOA 3OD7A 4IO6A 2QS1A 4MFIA 1VSOA 2YLNA 2QRYA 2ZYNA 1DPEA 2DWAA 3QIMA 3ZKKA 1SDXA 1EZ9A 4H5FA 5ISUA 5CBRA 4R73A 1M5CA 5DYHA 3D4GA 4OETA 4WEDA 1TFAA 1O7TA 1PBQA 2AYSA 2F78A 1POY1 1XVYA 2V3UA 3RTFB 3GZGA 3W9WA 1UTHA 3S9NC 2Q89A 3C9HA 4KPTA 1M5DA 2DSFA 4U23A 3T9XB 4H8IA 3IL1B 1N0TA 3T66A 4NE4A 5JTYB 2HAUA 3B7DA 3CRBA 3IOWA 3P7IA 1P1WA 3O6GA 4ZEIA 1OVTA 4YICA 1D9YA 4LP2B 3K01A 3M8UA 4O3AA 3HHGA 2A5TB 1M5FA 4DXBA 3K2DA 5CBSA 3OO6A 4U1OA 3U72A 4DXUA 1N3XA 3IB1A 4IY5A 3B6QA 1N04A 1VE4A 1URSA 3FJGA 1WVJA 1S7YA 4IO4A 3DLNA 5AA4A 2FA7A 1NNTA 1Y20A 4LVQA 4ND9A 2I0CA 1DSNA 2DQVA 1B3HA 1SD3A 4JXIA 1MM7A 4XKNA 1Q35A 3E3KA 2ABHA 3HV1A 2Y7IA 3SEXA 1IIWA 2RCAA 2O84X 2GFEA 3OELA 2I48A 4KI0E 5K2YA 3K4UA 1FTOA 4OVJA 4OTEA 4EF2A 5AA2B 4DDDA 1MXWA 3HPIA 5FHNA 4LQ2A 2XXYA 4NWDA 2UVHA 1B7ZA 3ODBA 1OVBA 5I2NA 1BLFA 4RY1A 1NH7A 2XX8A 2XX9A 3SEUA 4BDNA 3KN3A 2UYEA 1FQEA 3H6VA 1FQDA 3DP4A 3PMWA 4YKPA 1MY3A 3M3KA 2VHAA 3CFZA 3MZ9A 3CR9A 1P1QA 3K00A 4JWXA 1TT1A 3PUWE 4WKMA 1GV8A 1SW4A 2AL5A 3RY3A 4BDMA 1I6BA 2QJEA 1XT8A 3SKPA 5J1DA 5CMCA 4H67A 5TPAA 3TFLA 1R9QA 3TCGA 5DVIA 3W9VA 1A7LA 5F7VA 5TU0A 3T22A 4F31B 3K02A 1SW5A 4LONB 1O63A 2X26A 1Y4TA 3TYHA 3PMXA 3TKDA 3FXQA 3OSRA 3MUQA 2QMWA 2I6EA 4GD5A 2DYXA 2H9BA 1JW4A 2F35A 5JK4A 3VLVA 4N07A 4POWA 2ZMBA 4ZEFA 3C35A 1UTBB 4OENA 2O7UA 1ANFA 1MXYA 4IO3A 4FJPA 3G3JA 3E13X 4EDPA 4NF6B 1IUDA 3CVGA 1S50A 1US4A 2HEUA 3PD8A 3UK4A 3O6HA 3C4MA 4ZECA 5I58A 4FATA 3PPRA 1URDA 2ESNA 2HZKA 1JEVA 4JWOA 4YB6A 3Q28A 4F18A 2OBGA 3S9MC 3C36A 1B32A 2Z8FA 2PVUA 1Y1ZA 3V83A 2A5TA 4PETA 1B3EA 1EZOA 5KDTA 2REGA 5FTIA 3S2VA 4P0GA 5HBCA 4F3SA 1I6QA 1Y9UA 2FYIA 4OXVA 3ECRA 4RK9A 3H06B 1VFEA 4XXUA 1MPCA 1OIBA 3FVKA 1D9VA 4U4SA 3TZAA 2DE4A 4PE5B 4JDFA 4RPNA 3CFXA 2PT1A 3MW0A 2DWHA 5AA2A 3G7WA 5AA3A 1P1OA 3RTWB 4NF4A 5F1QA 3HCQA 4I8CA 5TP9A 3VLUA 4KFQA 2UVIA 3K6XA 4H0WA 5DTBA 1YTVA 1R9LA 2H99A 1D4NA 3T9UA 3PPQA 3TEPA 2HXWA 1A8FA 2QS2A 3UP9A 2XXWA 3LC8A 3RNNA 5H8NA 2ZYMA 3AXFA 1FTJA 5AA4B 3LSLA 1LAFE 4I62A 1BIYA 3QUFA 4H1XA 1B5JA 2ZYOA 4M4GA 3C32A 5ELVA 1LBCA 3FVNA 3IOVA 5AA1A 1GR2A 2DS9A 1MY0A 3FV2A 4RXLA 4OHNA 5DEXA 4OYVA 2UYFA 3ZS6A 1JQFA 2ZXTA 4F3BA 2A5SA 1USYE 2DXRA 1L5TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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