4QSEA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound glycerol
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
publication title Crystal structure of maltoside transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, target EFI-510558
rcsb
source organism Agrobacterium fabrum
molecule tags Transport protein
total genus 138
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA02
3GXAA 3CFZA 3JZJA 2RC8A 3H03A 5DTBA 5DYHA 3T9HB 2HQ0A 2NWJA 2OJTA 4F1UA 1LAFE 4M4GA 2F6PA 4YKJA 4RK2A 5I2NA 3O66A 3U94A 1JW1A 1B2HA 3HO7A 1BTJA 1VFDA 3TTNA 4DXUA 1Q35A 1SVXB 4EXLA 3RT8A 3UN6A 3FXRA 4F31B 2FA7A 1LLSA 2OBGA 3MP8A 4R72A 2Y7RA 2XD2A 1N7XA 2RCAA 3MPLA 4YKKA 2O68A 1JVXA 2Q88A 3Q28A 3B6QA 3H4ZA 3CRBA 3FD3A 5KDTA 2DWIA 1B46A 4KR5A 2BJJX 1NNKA 2GHAA 4NWDA 2ANJA 3MJNA 2DWHA 3K0VA 4OETA 2G29A 3CI8A 3TQLA 4OHNA 1SD3A 1VFEA 2HAVA 3PD9A 2V93A 1H45A 4FECA 2P1SA 1RYXA 3QSLA 2I6EA 5FHNA 1SW5A 3TELA 4OESA 4LZ8A 1M5FA 1N3XA 3GZGA 3MZ9A 3CSGA 4ISUA 3ZSFA 4ESXA 4ZEKA 2XXQA 2I4BA 3OEKA 1FQAA 4FAJA 4ZZEA 3B7DA 3KJTA 5BWJA 2ZYNA 1B51A 2H4IA 4IGTA 3CVGA 1IQ7A 3CSBA 1CB6A 2H9BA 4YKPA 1IXHA 3H06B 1VR5A 3L6HA 3T96B 2ZNTA 4HS7A 1H3DA 4RYAA 3ODBA 5I59A 1DSNA 1NFTA 4F19A 4KYEA 1IXCA 4U23A 4Z7EA 1USYH 4H5FA 1JEUA 3MP1A 3T66A 4JBZA 1MY1A 5FTIA 4KCDA 1JW5A 2QS3A 1Y3PA 4ND9A 5H8QB 1JVYA 1YCJA 2YPNA 1N0TA 3VFJA 4GL0A 4EQ9A 4G8MA 2Q8JA 5I2KA 3MW0A 3I5OA 1MQHA 1PC3A 3ZS6A 4OQOA 3ONMA 3O28A 3IOVA 1O7TA 3TTMA 3FUZA 2ESNA 1D9VA 4F3PA 1Y1MA 3T9VA 2DE3A 1DPPA 4ZS9A 2R6GE 3EPEA 2Y7PA 3I3VA 4OYVA 4LVQA 2PVUA 4WEDA 4HW8A 2I58A 1GV8A 4P0IA 1IIWA 1II5A 5J1DA 3FXQA 2GFEA 3TAJA 4ELOA 3K01A 3PPRA 4XKRA 4F3SA 1DOTA 1FTJA 2F6GA 2Y7WA 3G3KA 2LAOA 3V89B 4ZEIA 3QXMA 1XS5A 4TLLB 3H6UA 1BLFA 3UIFA 3SEYA 1ZBMA 3VLWA 3A3UA 3BFUA 4LQ2A 5ISUA 4YAHX 4N6PA 2PT1A 1AOVA 2A5TA 1FQDA 2XHDA 1MPBA 3TUSA 1B5IA 3MC2A 3OSRA 4F2QA 5H8SA 3K6XA 4F3GA 3RQTA 2F34A 1UTHB 4X48A 2I0CA 4NF4A 3IJXB 3K00A 1N7WA 4R9FA 2B3FA 5KCJA 1ELJA 1MY3A 3PUXE 1SW1A 2VGQA 3MBPA 5H8FB 4BDRA 4DXBA 4FJPA 4H8IA 1Y1ZA 2I0BA 3LSLA 1O63A 2R9JA 3IAZA 3H6WA 2O84X 1B1XA 4YMAA 3DP4A 2UYEA 3PPPA 3V8XB 1ZKBA 3PMWA 3C34A 1LFHA 1MDP1 2REJA 3OO8A 4HCYA 2RF1A 4TLMB 1MM7A 2F8DA 3S9EA 4G2ZA 1PDAA 3RLFE 1SYHA 3U72A 2THIA 3KN7A 4R2BA 2PMSA 4YZZA 1A55A 1Y20A 2I4CA 4PP0A 4P0GA 4R73A 1H44A 4JDFA 4PETA 3GLBA 1LFGA 4QFKA 3DP8A 3Q27A 1QJMA 2DVZA 2QS4A 3TFLA 2QJEA 4ECFA 3TMGA 4H8JA 5JK4A 4RJZA 4ZECA 3TTRA 4YB7A 4Q8RA 1ATGA 1JETA 1LB9A 4OEVA 1MXVA 1QW0A 1WDNA 5AA2D 4XKPA 4I9DA 1UTBB 1O64A 1FCKA 3FJ7A 3HHFA 1MPCA 2XXYA 2F36A 3SETA 3O29A 4FEBA 3CIJA 5A5XA 5CBRA 3PV0E 3K2DA 3HCQA 3MQ9A 1T0KA 5CI5A 3FVOA 2I49A 4R2FA 5DVFA 2QRYA 2DE2A 1EU8A 1FTKA 1SI0A 3E9XA 3G3IA 3VDFA 4O3AA 5CMKA 3G3FA 2I3VA 3VLVA 1N76A 1MDQA 4RXLA 3H6TA 4NF5B 3FIRA 4ZEDA 2XX8A 3TEPA 2V3UA 4N07A 5IKBA 3A09A 1SBPA 3IK6B 5AA2B 4ZEBA 3OD7A 1LSTA 2O7IA 1B3GA 3KBRA 3TDJA 3SEXA 3QYTA 3TCHA 3CFLA 3IOTA 3LBSA 4POWA 3ILUB 4YKIA 2NXOA 1OVTA 2B3BA 4QSEA 2H25A 4OFLA 1DTZA 3M3LA 2AL5A 1POY1 3KSJA 4N13A 4IO7A 4QFPA 4AQ4A 4BDOA 3N5LA 5L9MA 1ZLQA 4U2RA 2QS2A 1MXZA 2Z8EA 1A99A 1DTGA 4G68B 3HHGA 1B0HA 2DQVA 5H8HB 2ZYOA 2DYXA 2DE4A 1NNPA 3PU5A 3SDFA 3C9HA 4YU0A 3SESA 3O2AA 2VOZA 1QUKA 3BBRA 5EYFA 1DMBA 1JNFA 3QAXA 5CMCA 1MH4A 4PQJA 4JWOA 4PE5B 4WEPA 2DXRA 3RPWA 4X9TA 1NNTA 4R74A 5K2XA 2DOJA 4RPNA 4DDDA 2REGA 4OMBA 4XTCQ 4E0XA 2VHAA 3OOAA 3V5AA 5CC2A 1WODA 3EN3A 4H1XA 1HSLA 4GXAA 4GQOA 2F7CA 3MP6A 3T9UA 2HAUA 3FXUA 2YLNA 4DLDA 3S2VA 3EHUA 1B4HA 3ZKLA 2D3IA 4G8NA 4QSDA 4K3FA 3O97A 2UVGA 3TKDA 4Q30B 3A3CA 3K6WA 3F11A 4OERA 4I8CA 2O51A 4EUOA 2AYSA 4C0RA 1OLAA 1FTMA 3FVKA 4R6YA 1S50A 3OMBA 4RK9A 3KZGA 3OELA 5ELVA 1BP5A 1IZ1A 3FVNA 4U1ZA 2F5XA 1Y9UA 4MFIA 3HN0A 3CG1A 2RINA 2HFBA 5EHSA 5LOMA 1QKBA 4FORA 3C33A 4HCWA 3M3FA 2PX1A 2CMOA 2FNCA 2Z8FA 1FQFA 2Q9TA 2XXVA 5M2VA 1RKMA 3USDA 4EQBA 1B05A 3I6VA 4G8HA 1SI1A 3C31A 2DVCA 3KFMA 2UYFA 2ABHA 4EXKA 5TPAB 2I3WA 4KYDA 2QPQA 5I58B 3IX1A 3FV1A 3O6HA 4OWDA 3VVEA 1B6HA 4ELQA 1MG1A 4DZ1A 1LCFA 4Z0IA 1F9BA 3W15C 4I62A 1Z7NE 3SERA 3IO4A 3PD8A 3UORA 1PB7A 1R9QA 4QFLA 1A40A 1LAHE 3RT6B 5TP9B 1US4A 1B3HA 3PMXA 1LBCA 3MVYA 4GOTA 2Z8DA 3WAFA 1P1NA 1M5CA 1MM6A 4R6HA 3N6UA 3RUMA 2VD3A 1OQGA 5I57B 4NF8B 3L6GA 4BDNA 1OLCA 4LONB 3SKPA 2V3TA 3W9VA 3TZAA 5HPQA 5FTHA 1S9TA 3HPIA 3FJMA 1B5HA 4NTLA 4ZEFA 3ZKKA 4G68A 2R71A 4FIMA 1H76A 4XXUA 1TFAA 3N26A 1YPNA 5AA4B 4IO6A 3TYHA 1LAXA 1NL5A 4Q5TA 4ONYA 3FATA 1Z7ME 2HCAA 3FVGA 4LUBA 1XHYA 5DEXB 2QS1A 4XKQA 4F39A 1MY0A 1Q1KA 4LZ5A 2X26A 3T93B 1OIBA 3RTFB 1I6AA 4IO5A 3VXCA 5I2NB 4RA1A 2FYIA 2RC9A 3E13X 3E3KA 3LC8A 2OWSA 3PUVE 4QSCA 3SEUA 2DSFA 1RYOA 1SDXA 4YB5A 1MQGA 4BDLA 2H5YA 2GHBA 1MY4A 1B1HA 5KDTB 3MZ1A 4PFYA 3JV9A 1B58A 4NEDA 2OK2A 2UVHA 2O7UA 5CMBA 4F1YA 3OEMA 1LCTA 1MRPA 1LBBA 4E0WA 3PGFA 3DM0A 4OZ9A 1B3FA 4FE8A 3TODA 3G3HA 2D21A 5JTYB 1J1NA 3G7WA 4LQ5A 1NNFA 2F78A 4JXIA 1OMPA 1FTOA 3G3JA 3QIMA 3MAMA 2V84A 1USYE 2X7PA 2ZYMA 4RY1A 4G4PA 2AL4A 5H8QA 1QVSA 4ZZAA 1LB8A 3KG2A 4MH5A 3D4CA 3PUYE 3FJGA 4QF9A 3U8QA 3UA8A 2Q89A 2OWTA 2XXWA 1UIUA 1US5A 1AMFA 1P1UA 1I69A 3TTKA 1A8FA 4F22A 1MXXA 3S9LC 5ICTA 3EHTA 3IORA 1M5EA 2XX9A 4LZ7A 3C32A 2UVJA 1TWYA 3LUYA 1P1QA 3Q29A 4IB2A 3QK6A 1EZOA 2QSXA 3KEIA 1IXGA 2F7AA 4GL8A 1VE4A 3MVZA 2RC7A 3DP6A 2XXUA 3VLUA 1TT1A 5AA3A 2PYYA 1B4ZA 2IA4A 5TP9A 3VXBA 4UA8A 2O6AA 5IAIA 1MXUA 4C1TA 3B6WA 5I2KB 3EF7A 3TCGA 3TPAA 1D9YA 4JB7A 4P11A 1B52A 2NOOA 1MXYA 5CBSA 5I57A 3IOUA 2HZLA 4NF8A 3T22A 1A54A 1DPEA 1TFDA 2GRVA 3C35A 3U92A 3RY3A 3FGSA 1XOCA 1EZ9A 3G3GA 2OLBA 2OZZA 3PUWE 3KOTA 1UTHA 4WXJA 3S9NC 4MLQA 5JEIA 5K2YA 1IEJA 1YAEA 2HEUA 2UXAA 3P7IA 3MVWA 4MBPA 1FTLA 2QMXA 4QRZA 4F1VA 2XXRA 5CMMA 3K6UA 3VVFA 1B32A 2DXYA 4XKNA 2V3QA 4EF2A 5H8FA 2Y7KA 1QUIA 3OENA 1H43A 3KN8A 1BKAA 1CE2A 3D4GA 2ZMBA 5DEXA 3RN8A 2Z23A 1QULA 2YJPA 3IJOB 4C1UA 3VE1B 1S7YA 2A5TB 1B7UA 3M8UA 1IITA 2XXIA 4BDQA 3V83A 5ITPA 2D5WA 3ILTB 1OVBA 3IR1A 4GLIA 5FHOA 4ELRA 4PFUA 3MPKA 4X1BA 4NE4A 1R9LA 4NF4B 1VSOA 1D3KA 5I84A 3WAEA 5KCJB 4KQPA 4BLAA 1WVJA 5FHMA 2XXPA 3OXNA 4KD5A 3S4UA 4ZE8A 4X1DA 2Z22A 1FQCA 4FEDA 2M8CA 4PFWA 3N94A 4LA9A 1FQBA 1R1NA 2E1SA 3Q26A 4F18A 4XIGQ 5JTYA 4ELPA 3QUJA 3KJ7A 2F35A 3M3KA 3PPQA 4U22A 4YMBA 1B9JA 4GD5A 3PUZE 4H67A 2ONSA 3IB2A 4POXA 1GTKA 3LSXA 3FV2A 4L17A 1LAGE 1HSJA 4OTEA 3MZBA 4G77A 1LFIA 4JSOA 4YB6A 4RNSA 2WKYA 4ESWA 1ZIUA 3O9PA 4R75A 5I56B 1UTBA 2XX7A 1OQHA 3IOWA 1NH7A 4NF6B 1JW4A 2ZNSA 3R26A 2ONKE 5ICQA 1AIVA 3KGCA 1TXFA 3O6IA 3ECRA 5CM6A 3AXFA 1MY2A 4G68C 5DVJA 2QMWA 3VVDA 1PBQA 2XXHA 1I6QA 4KFQA 3PPOA 4IO2A 1QKAA 1L5TA 4GF8A 4I1DA 2HZKA 4DCYA 3CFXA 4EDPA 2KLFA 3H3GA 2NVUB 1ANFA 4AB6A 1Y4CA 3HSTA 3E4RA 4WKMA 1MQDA 1IUDA 4OFJA 2DWJA 1IXIA 4F29A 4EQ7A 2G93A 2ZNUA 4NF5A 2F7BA 1PBPA 2X7QA 3OO9A 3B6TA 4YICA 1JQFA 2IEEA 4Q0CA 3TCFA 4ZE9A 3W9WA 4TOZA 4JWYA 1PEBA 1GR2A 5AA2A 4EF1A 3DLNA 5A5XB 4FATA 2Q2CA 3OO6A 4M1VA 1HSEA 1B0LA 3EQ1A 1YTVA 4R9GA 1P1OA 4H6DA 5TU0A 3C36A 1XVXA 4IO3A 3N6TA 1B3LA 3GBAA 1ZTYA 4OVJA 4IY5A 1B40A 1UIVA 1JEVA 2VD2A 2O1LA 1B5JA 5H8NB 1N3WA 3IL1B 4F2OA 2HXWA 2OCUA 1GVCA 2ZYKA 2AIXA 2Y7IA 1URSA 2H99A 4IGRA 4TQUQ 3UP9A 1EZPA 4JWXA 1KWHA 1NKXA 1PB8A 2RCBA 4H5GA 4U4SA 4GFRA 5EHMA 4IO4A 3T9XB 5H8HA 4OXVA 5ITOA 5AE4A 1N84A 1MQJA 3MVXA 1QUJA 3H7MA 4KPTA 4ZDMA 3IB0A 2V25A 3PPNA 1B7HA 2I48A 2XD3A 3UGWA 2O1MA 3R7XA 3SEVA 4UACA 5CRYA 2B65A 3GBBA 5B7DA 3DELB 2ALUA 5AA1A 4OFOA 3LSFB 1XT8A 5DVIA 3S9MC 4O3BA 1AH5A 4F3BA 3JYRA 3CG3A 2P2AA 5L9OA 1B7ZA 1XVYA 4H0WA 1SYIA 2W7YA 4DCXA 4BDMA 1I6BA 2Q2AA 4MF3A 3TQWA 3RTWB 1MXWA 1ZJLA 1BIYA 1N04A 1ZMGA 5KZTA 3FASA 1MQIA 4DIGA 1R6ZA 2O69A 4QFOA 2GH9A 3K02A 3K4UA 2Y84A 3OSQA 4THIA 5I56A 4NMYA 4NF6A 2A5SA 4HTGA 1B3EA 3KOSA 5F1QA 1A8EA 1M5DA 1Y3NA 4RPOA 5HBCA 2VP1A 3K1PA 1PB9A 4GIZA 4MLVA 3C4MA 1Y4TA 3LSWA 4GXSB 4GVOA 2DP8A 2RKMA 2P0SA 4AB5A 3MWBA 2DWAA 1MS7A 1A7LA 3O6GA 1MH3A 5B70A 4U21A 5DT6A 3U93A 3MUQA 5F7VA 1P99A 3RGYA 1MPDA 4QHQA 3RNNA 4KI0E 3QUFA 1EH3A 4DE8A 5TPAA 3TTLA 4DXCA 4U4XA 5I58A 1FW0A 3Q25A 4KYSA 4PFTA 2QL3A 3BKIB 3LR1A 2H98A 3CR9A 2DS9A 1LGBC 5I59B 4IY6A 3UK4A 3HV1A 2E0SA 4OEUA 3KN3A 4R6KA 2ZXTA 3U1OA 1D4NA 3IB1A 1XC1A 3FZVA 4U1OA 3R6UA 3VV5A 4LATA 5L8DA 3OO7A 2F97A 5BUUA 1GGGA 1POTA 1UQWA 3K1MA 1NH8A 1URDA 5H8NA 2UVIA 1AL3A 3THIA 1ZU0A 1M5BA 4JSDA 2XXXA 3K6VA 4KCCA 4GWOA 4O3CA 4NWCA 2XXTA 1FQEA 3K1NA 3EHSA 5L9SA 4QFNA 2NUVA 1SW2A 1Y3QA 2CZLA 2PT2A 4LP2B 3BFTA 2ONRA 5HM4B 3SEWA 4GRKA 4KHZE 3H6VA 3KSXA 4H65A 3IO6A 2PBWA 5AA4A 1NMUA 1URGA 3PMVA 4OENA 1P1WA 1SW4A 1SQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GXAA 1QGXA 3CFZA 3JZJA 2RC8A 3H03A 5DTBA 5DYHA 3T9HB 5IZ3B 2HQ0A 2NWJA 2OJTA 4F1UA 1LAFE 4M4GA 2F6PA 4YKJA 4RK2A 5I2NA 3O66A 3U94A 1JW1A 2KQZA 1B2HA 3HO7A 1BTJA 1VFDA 4PDDA 3TTNA 4DXUA 1Q35A 2GQ1A 1SVXB 3SZPA 3RT8A 4EXLA 3UN6A 1XI6A 3FXRA 4F31B 3MSTA 2FA7A 1FPKA 1LLSA 3A29A 2OBGA 3MP8A 4R72A 2Y7RA 2XD2A 1N7XA 2RCAA 3MPLA 4YKKA 2O68A 1JVXA 2Q88A 1RDYA 3Q28A 3B6QA 3H4ZA 3CRBA 4OVRA 3FD3A 5KDTA 2DWIA 1B46A 2PFZA 4KR5A 2BJJX 3HFUA 1NNKA 2GHAA 4NWDA 2ANJA 3MJNA 5I5PA 2DWHA 3K0VA 4OETA 2G29A 4N17A 3CI8A 2VPOA 3TQLA 4OHNA 1SD3A 1VFEA 2HAVA 3PD9A 2V93A 1H45A 2Q8MA 4FECA 2P1SA 1RYXA 3QSLA 2I6EA 5FHNA 1SW5A 3TELA 4OESA 1NUZA 3RPLB 4LZ8A 2CEXA 1M5FA 1N3XA 3GZGA 3MZ9A 3CSGA 4ISUA 3ZSFA 4ESXA 4ZEKA 2XXQA 4OANA 1FPBA 2I4BA 3OEKA 1FQAA 4FAJA 4O7MA 4ZZEA 3B7DA 3KJTA 5BWJA 2ZYNA 1B51A 2H4IA 4IGTA 4NGUA 3CVGA 1IQ7A 4O7IA 1FPLA 3CSBA 1KZ8A 1EYKA 1CB6A 5IGAA 3RYDA 2H9BA 4YKPA 1IXHA 3H06B 1VR5A 3L6HA 3T96B 2ZNTA 4HS7A 1H3DA 4RYAA 3ODBA 1LBVA 5I59A 1DSNA 1NFTA 1FBCA 3ROJA 4F19A 4KYEA 1IXCA 4U23A 4Z7EA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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