4QSEA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound glycerol
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of maltoside transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, target EFI-510558
rcsb
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
total genus 138
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA02
4YKIA 2QRYA 1JQFA 1JW1A 1UTHB 3W9WA 3PUXE 4ECFA 3UA8A 3K6XA 2QS1A 3TPAA 3FVNA 2X7QA 1LBBA 3HO7A 3TUSA 4JB7A 3CR9A 3ODBA 3FVKA 4R75A 3F11A 1MY4A 2HFBA 3V5AA 2REGA 3BKIB 2G29A 3PV0E 3IORA 3KN7A 5EYFA 3KGCA 3R7XA 4QRZA 2XHDA 4R72A 1F9BA 4GL0A 5CMBA 2V25A 1XHYA 3QYTA 4JXIA 1LGBC 3KN8A 1SBPA 2NOOA 2D3IA 4KD5A 3PPNA 3RLFE 3PPPA 1FTJA 4IY5A 2YJPA 3G3IA 4R74A 3UN6A 3O29A 3EF7A 1H76A 4H8IA 3CG1A 1MQHA 3BFTA 4YKJA 1MS7A 1EU8A 1SYHA 2O7IA 2REJA 3S9LC 4ZEDA 2O51A 1B9JA 1P1WA 4JSOA 1YTVA 3O6IA 2B3BA 4BDOA 2P1SA 1RKMA 2XXYA 3TTKA 1Z7ME 1H3DA 4RPNA 2XXWA 4ZEFA 3FXRA 4NTLA 1PC3A 4TQUQ 2A5TB 4X1BA 1SI1A 3U8QA 1USYE 5LOMA 3V83A 4ONYA 1A7LA 5AA1A 4F2QA 3C32A 5I2NB 3FXUA 5CC2A 2QPQA 5TU0A 1B7ZA 3CG3A 2RINA 3MP8A 2Q9TA 1VSOA 4XTCQ 3CFLA 3TTMA 1VFDA 3PUWE 2PYYA 4OQOA 2GH9A 4H5GA 4GFRA 1Y3QA 3KSJA 4H67A 1ATGA 4LZ7A 2OWSA 2VOZA 3T9VA 1UQWA 4C1TA 2D21A 3IO6A 3ECRA 3M3KA 3HN0A 2H98A 2I0BA 3LSLA 4XKPA 3LBSA 4G8MA 1LSTA 1MXZA 5I57A 3IX1A 4I62A 1JW4A 4DXBA 3TODA 3MC2A 2UYFA 4EF2A 5DEXA 5F7VA 1LCFA 1IXIA 4G77A 1PB8A 4ZEKA 3A09A 4ESWA 3B7DA 3FVGA 5BWJA 4X9TA 4L17A 1B7UA 4O3BA 1MM7A 4OZ9A 2HEUA 4QFKA 4MH5A 3HPIA 1B0LA 2GHAA 1OLCA 1MQJA 2V3TA 3PD9A 4KCCA 3MW0A 3LSXA 3T66A 2OZZA 3G3KA 3VE1B 3JZJA 4KQPA 4I1DA 4YICA 4G4PA 4F3BA 2DE2A 1NH7A 2XXQA 5ITOA 3VVFA 1NNTA 3VDFA 1BLFA 1IXGA 2XXPA 4THIA 4NF4A 2BJJX 4GIZA 2DWAA 1Z7NE 1YCJA 4OWDA 3RGYA 1WODA 3GBAA 5IAIA 3H7MA 1FTOA 1MY3A 4U4SA 3FATA 3GZGA 4AQ4A 1NH8A 4YB7A 1B5HA 1MY2A 1JNFA 1SVXB 3IOWA 3O9PA 1BP5A 1PB9A 3MVWA 4DDDA 2V3UA 1URGA 4H65A 4E0WA 3KJ7A 5I56A 4R6KA 4PE5B 2XXHA 1TT1A 2HAVA 1TFDA 3LC8A 1QULA 3MP6A 3BBRA 1ANFA 2IEEA 3QIMA 4FATA 3H4ZA 4PQJA 3FUZA 1S7YA 3FVOA 4G68C 3VLWA 4MF3A 1B3EA 1FQFA 1QKBA 5KDTB 3OSRA 3P7IA 4Q5TA 5FTIA 4ZEBA 1SW2A 4RJZA 1TFAA 3C35A 3K00A 4U1OA 4NWCA 4M1VA 1T0KA 1H44A 4RY1A 2I4BA 3TCFA 4O3CA 4YZZA 2ZYNA 1BKAA 3UK4A 4IGTA 4H1XA 5A5XB 1L5TA 1MDP1 2P0SA 2DE3A 3O2AA 3S2VA 3KOSA 2QL3A 4P11A 3TTRA 4ELRA 5AA3A 1OQGA 4XKNA 2XX7A 2QS4A 2Z8FA 3G3HA 4F29A 4MBPA 4QF9A 1XT8A 4OMBA 2NVUB 2RKMA 1XS5A 1N7WA 4P0GA 3SDFA 3PMXA 3TYHA 1A55A 3CFZA 2PMSA 4LVQA 4JSDA 3C4MA 2DS9A 2NWJA 4F39A 3CSGA 3KFMA 1AIVA 1UTBB 2O1MA 1CE2A 2XXVA 2O6AA 5H8HA 4ZS9A 3SEYA 4JWOA 4KYEA 3Q26A 4R9GA 2XX8A 3QSLA 5F1QA 3UP9A 2OK2A 5DTBA 3EHUA 3MWBA 2AIXA 1ZU0A 4YMAA 1M5DA 1QKAA 4WEDA 4LP2B 3N26A 4RXLA 2Q88A 1B3FA 3FXQA 1OIBA 1N76A 1B3GA 2UVJA 2DP8A 2FA7A 1MXWA 3S9EA 3L6HA 1IITA 1JEUA 3ILTB 5CBSA 3JV9A 2F7AA 3H6WA 3N5LA 3S9MC 3KZGA 2LAOA 4R2BA 4F18A 4TOZA 4C0RA 1R1NA 3A3UA 3SEWA 3MPKA 3K02A 4BLAA 1EZ9A 1NKXA 3IOVA 2Z8EA 3PMWA 4Q30B 2G93A 1MY0A 1R9LA 1DTZA 3T9UA 2ZNUA 2Z8DA 3QAXA 2R6GE 4KPTA 1URSA 3RQTA 2H25A 1H43A 2Z23A 3G3JA 5ICQA 1S50A 1NMUA 1N7XA 3G3FA 2THIA 2F7CA 4U2RA 3TCGA 2ONRA 1JW5A 2E0SA 1Q35A 3D4CA 4NF4B 1M5BA 3PPRA 3IJOB 1D3KA 5DT6A 2Q8JA 4OEVA 5TPAB 4P0IA 3TELA 3K1NA 3ZKKA 2DWHA 1EZPA 4DIGA 3SETA 3ILUB 3FJ7A 1FTMA 2ZMBA 3OELA 1US4A 1N84A 1I69A 1N3XA 3IB0A 2O1LA 1TXFA 4GRKA 5H8NA 3G7WA 1IUDA 4RK2A 4F1YA 3FJGA 4MLVA 5I56B 3H6VA 3KN3A 1LCTA 1EH3A 3IK6B 2X26A 3E4RA 5CBRA 3AXFA 2AL5A 1B6HA 2XX9A 5I58A 5KCJA 1GR2A 4BDRA 1M5FA 1A8FA 1HSEA 5AA2A 2QS3A 2UVGA 4DCYA 1LFIA 1B4ZA 3E13X 4NEDA 4BDLA 4Z7EA 3JYRA 5I59A 3MVYA 4G68A 3B6QA 3EQ1A 2CMOA 4PETA 4QFNA 1B7HA 4ESXA 1MXXA 3N6TA 5DVJA 3U92A 3W9VA 1B3HA 4QHQA 4M4GA 4ND9A 1ZMGA 1SYIA 1JEVA 3K6VA 5DVFA 3R6UA 4NF6B 2VD2A 3H06B 2I0CA 4LUBA 1FW0A 4POXA 3FZVA 3VLUA 4HCWA 3CRBA 1SQYA 4FE8A 4R73A 2D5WA 2V84A 1FTLA 2AL4A 3V89B 2ANJA 4R2FA 4DZ1A 4FORA 3CIJA 3OEMA 1PBPA 3T22A 4YB5A 5JTYB 2Y84A 3T9HB 2F6PA 3KJTA 4GXAA 4C1UA 5CRYA 5HM4B 1XVYA 1H45A 1Y4TA 1MPDA 4R9FA 2HQ0A 2XXXA 1MY1A 3DP4A 3LR1A 1JVYA 3FGSA 3G3GA 2RC9A 3SEXA 3PU5A 1Y3NA 1VR5A 2Q2CA 4EXLA 4EQ9A 5FTHA 4QFOA 3SERA 3FV2A 2ESNA 3H3GA 3EHTA 5L9MA 5I2KA 3MP1A 2ZNSA 4GQOA 5KZTA 1A40A 4GL8A 4OETA 2XXRA 4FEBA 4H0WA 3O28A 3GBBA 4U4XA 4WXJA 5TP9B 4EUOA 1LBCA 5FHMA 4HW8A 3VV5A 2F8DA 4TLLB 4NWDA 1FQDA 4U21A 3S9NC 4XKRA 2QJEA 3TFLA 2ONSA 2Y7WA 1S9TA 4OTEA 5CMCA 1OVTA 3Q27A 4NF5B 3HCQA 5H8QA 1DPEA 2DVZA 3SEVA 2RCBA 3S4UA 5IKBA 2HAUA 2VP1A 2FYIA 3OOAA 1DPPA 3GLBA 3LSWA 4JBZA 1Y1MA 4BDNA 3OD7A 5J1DA 2W7YA 1TWYA 3T9XB 2ZXTA 4DXCA 3N94A 3FASA 4FAJA 2GHBA 3Q25A 3DELB 4GF8A 1IIWA 2HZKA 3K6UA 2H9BA 1I6BA 3QXMA 1FQBA 1RYXA 1MQDA 4ZDMA 2HCAA 2I6EA 3MUQA 4RYAA 4IO3A 1Y1ZA 2Y7RA 4OVJA 3OO7A 4UACA 4F1UA 1II5A 1FQCA 1NFTA 3MQ9A 2Y7KA 2OCUA 4X1DA 1ZLQA 2DVCA 1ZTYA 2DE4A 1N0TA 5KCJB 3I3VA 1B05A 1LAFE 3B6WA 3OMBA 5JK4A 5AA2B 4KFQA 3E9XA 1MPBA 4ZZAA 1LFGA 3MJNA 4NE4A 2F5XA 3H6UA 4G8NA 4QSCA 3C36A 5I2NA 1GTKA 3MVXA 5I59B 4HCYA 4AB5A 1O64A 3M3LA 1B52A 2PT2A 1FQEA 2DXRA 4ELPA 1B1XA 3RT8A 1XOCA 3IL1B 4JDFA 4ZEIA 1B5JA 2VGQA 1MM6A 3TKDA 1BIYA 2X7PA 3C9HA 4JWYA 1IEJA 2DQVA 1P1OA 4RPOA 4OFLA 3IOTA 2XXIA 3IOUA 2O84X 3MVZA 1QUIA 2AYSA 3VFJA 1US5A 4PFYA 4UA8A 3ZSFA 1B5IA 2ZNTA 2YLNA 3R26A 2M8CA 3OXNA 5K2YA 2Q89A 3MZ9A 2H99A 3LSFB 5I84A 3RN8A 5H8FA 4LONB 4ZE8A 4HTGA 2DOJA 1B51A 3CVGA 2OLBA 2GRVA 5I57B 3RT6B 4FJPA 1GV8A 2F36A 1KWHA 4DXUA 1J1NA 3A3CA 3RY3A 3OO6A 5B7DA 1Y9UA 5L9OA 5DYHA 5DEXB 5AA2D 2NXOA 4OXVA 2CZLA 4GWOA 1MQGA 4YMBA 2NUVA 3VVEA 4LZ8A 3H6TA 3U93A 4PP0A 4K3FA 4ZZEA 2QS2A 4XIGQ 1QW0A 3WAFA 5EHSA 4YKKA 4ZE9A 1UIUA 4OYVA 2F7BA 3O97A 1MQIA 5EHMA 2PBWA 2XD3A 3PUZE 3H03A 4OHNA 3TMGA 4LQ5A 4EQ7A 3SESA 1QUJA 4DE8A 5L8DA 2UXAA 1ZIUA 1NL5A 2HZLA 1FCKA 1LAHE 3C34A 4GLIA 1P1UA 4O3AA 1AOVA 5H8QB 1JVXA 4H5FA 1B3LA 4KYDA 3TAJA 2GFEA 3U1OA 2Z22A 2FNCA 1PDAA 1QVSA 3ZKLA 3DM0A 5K2XA 4Q0CA 3IO4A 1YAEA 1N04A 4PFTA 3K1MA 4Q8RA 1MG1A 4MFIA 3Q29A 3MZBA 5H8SA 1B58A 4F2OA 4OFOA 1MXUA 3KBRA 1MXYA 2O68A 1MH4A 1AMFA 5KDTA 1MPCA 3IJXB 3EHSA 3UIFA 3LUYA 3K01A 3PGFA 3QK6A 2V93A 1Y3PA 4LA9A 4GVOA 3C31A 4R6YA 3SEUA 3L6GA 1A99A 5A5XA 4KI0E 1UIVA 5ICTA 4MLQA 4FECA 1ZBMA 1D9YA 1A54A 2HXWA 4YAHX 4LATA 4XXUA 4IO6A 1FQAA 1D4NA 2ZYKA 3VLVA 3T96B 3THIA 4JWXA 3RPWA 3PPOA 2V3QA 1OQHA 3I5OA 4Z0IA 1SW4A 1EZOA 1POTA 3OEKA 4F19A 2QMWA 4G2ZA 3K6WA 1Y20A 1B4HA 1LAGE 4YKPA 2R9JA 5AA4A 2F34A 4BDQA 3O6HA 1NNKA 3TQWA 3VXCA 3HV1A 1P1QA 1B46A 1WVJA 4I9DA 1UTBA 3IAZA 2RF1A 3KEIA 2WKYA 4OERA 3TCHA 3KG2A 1HSJA 3BFUA 2DYXA 4N6PA 4F22A 3DLNA 1B32A 3MPLA 5H8HB 1SW5A 1OVBA 4FEDA 1LB9A 4G8HA 4NF8A 4OENA 3RTWB 2VHAA 4EF1A 4FIMA 1D9VA 1IQ7A 4DCXA 1M5EA 5H8FB 4GOTA 2ALUA 2DWJA 3QUFA 2UYEA 2PX1A 1MH3A 1SI0A 3OO9A 1IXHA 2RC7A 1QJMA 3RUMA 4IO4A 1P1NA 4OEUA 3PD8A 1FTKA 5CMMA 3FD3A 1B0HA 4GXSB 3SKPA 2ABHA 1Y4CA 2R71A 3CI8A 4TLMB 4POWA 1LB8A 4F3SA 4EDPA 4N13A 2E1SA 1Q1KA 3T93B 1PEBA 3MZ1A 1UTHA 2I4CA 4U23A 4ELQA 3PPQA 2PVUA 2Y7PA 1VE4A 1DMBA 3DP6A 4GD5A 3KSXA 2QSXA 2Y7IA 4I8CA 3USDA 5ISUA 2I58A 3UGWA 3VXBA 2QMXA 1O7TA 3UORA 3B6TA 4KCDA 1I6AA 2P2AA 3M8UA 2A5SA 1O63A 1M5CA 3HHFA 3RNNA 1PB7A 3U72A 1OLAA 4ISUA 5ITPA 1LFHA 5TPAA 3KOTA 3W15C 4LZ5A 1DTGA 3QUJA 4HS7A 3PUYE 3IB1A 3IB2A 1P99A 2ONKE 2B65A 3MAMA 1N3WA 3PUVE 1ZKBA 3MBPA 2ZYOA 5AE4A 1GVCA 1B1HA 4ELOA 2F6GA 3C33A 1OMPA 5FHOA 3OSQA 5ELVA 4IB2A 5H8NB 3O6GA 3GXAA 1ZJLA 1R9QA 1QUKA 2F35A 4QSDA 1USYH 3U94A 4KR5A 1A8EA 1GGGA 2I49A 2RC8A 4EXKA 4QFLA 3CSBA 5I58B 1NNFA 4KYSA 3VVDA 1YPNA 3TTNA 3TDJA 3OO8A 3FJMA 3EPEA 4AB6A 2A5TA 1B2HA 4IO7A 2DWIA 2I48A 1DOTA 4WKMA 4G68B 3D4GA 4X48A 2DXYA 4R6HA 2I3VA 4XKQA 3N6UA 3TEPA 4NF6A 3O66A 4NMYA 4E0XA 4YU0A 2DSFA 1CB6A 4F31B 4EQBA 1AH5A 1AL3A 3HHGA 1LLSA 4KHZE 3RTFB 3K1PA 1LAXA 2XXTA 3PMVA 5HBCA 2H4IA 3E3KA 2ZYMA 3TZAA 5L9SA 2YPNA 2Q2AA 1RYOA 1MXVA 5AA4B 1SDXA 3TTLA 5B70A 4U1ZA 5JTYA 2O69A 1MDQA 1HSLA 2F78A 4F3GA 3K4UA 1IZ1A 4LQ2A 5JEIA 1DSNA 2UVIA 1R6ZA 1B40A 4IY6A 1URDA 4RA1A 1WDNA 2KLFA 2UVHA 3K2DA 5CMKA 4PFWA 5CI5A 2OJTA 4ZECA 3V8XB 4F1VA 3OENA 4N07A 1I6QA 4QFPA 3WAEA 4H6DA 5HPQA 2RCAA 3FIRA 2OWTA 4RNSA 1ELJA 4NF8B 3K0VA 4F3PA 1NNPA 2XD2A 2F97A 4YB6A 2XXUA 5TP9A 3CFXA 2I3WA 5I2KB 2IA4A 5FHNA 4OESA 1POY1 1PBQA 1XC1A 2O7UA 3Q28A 3ZS6A 5BUUA 1SD3A 1VFEA 4PFUA 4RK9A 2OBGA 1MRPA 5CM6A 1JETA 3EN3A 4QSEA 2VD3A 4IO5A 5M2VA 3HSTA 4BDMA 5DVIA 3TQLA 4OFJA 1SW1A 4WEPA 3DP8A 4NF5A 4U22A 4IO2A 3I6VA 4IGRA 2B3FA 3IR1A 4DLDA 3M3FA 3ONMA 1IXCA 1XVXA 2PT1A 1BTJA 2H5YA 3FV1A 4H8JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YKIA 2QRYA 4O7IA 1JQFA 1JW1A 1UTHB 3W9WA 3PUXE 4ECFA 3UA8A 3K6XA 2QS1A 3TPAA 3FVNA 2X7QA 1IMBA 1LBBA 3HO7A 3TUSA 4JB7A 4MNIA 3CR9A 3ODBA 4P56A 3FVKA 4R75A 3F11A 1MY4A 2HFBA 3V5AA 2REGA 3BKIB 2G29A 3PV0E 3IORA 3KN7A 5EYFA 3KGCA 3R7XA 4QRZA 4UABA 2XHDA 4R72A 1F9BA 4GL0A 5CMBA 2V25A 1XHYA 3QYTA 4JXIA 5IZ3A 1LGBC 3KN8A 1SBPA 2BJIA 2NOOA 2D3IA 2WYPA 4KD5A 3PPNA 3RLFE 3PPPA 1FTJA 4IY5A 2YJPA 3G3IA 4R74A 3UN6A 3O29A 3EF7A 4PE3A 3PTYA 1H76A 4H8IA 3CG1A 1MQHA 3BFTA 4YKJA 2FHYA 1MS7A 1EU8A 1SYHA 2O7IA 2V4CA 2REJA 3S9LC 4ZEDA 2O51A 1B9JA 1P1WA 1EYIA 4JSOA 1YTVA 3O6IA 2B3BA 4BDOA 2P1SA 1RKMA 2XXYA 3TTKA 1Z7ME 1H3DA 4RPNA 2XXWA 4ZEFA 3FXRA 4NTLA 1PC3A 4TQUQ 2A5TB 3CHGA 4X1BA 1SI1A 3U8QA 1USYE 5LOMA 3V83A 4ONYA 1A7LA 5AA1A 4F2QA 3C32A 5I2NB 3FXUA 5CC2A 2QPQA 5TU0A 1B7ZA 4PF6A 3CG3A 2RINA 3MP8A 2Q9TA 2CZHA 1VSOA 4XTCQ 3CFLA 3TTMA 1VFDA 3PUWE 2PYYA 1FBPA 4OQOA 2GH9A 2CZKA 3E78A 4H5GA 1FPEA 4GFRA 1Y3QA 2QFLA 3KSJA 4H67A 1ATGA 4LZ7A 2OWSA 2Q8MA 2VOZA 3T9VA 1UQWA 4C1TA 2D21A 1FPFA 3IO6A 3ECRA 3M3KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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