4QSEA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound glycerol
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of maltoside transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, target EFI-510558
rcsb
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
total genus 138
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA02
3N5LA 4G77A 2DYXA 3KGCA 5M2VA 1B1XA 4GD5A 4TOZA 2QSXA 5BWJA 3QSLA 4OQOA 1QW0A 4OERA 3K6XA 3M8UA 4U1ZA 5CMMA 4PP0A 3PPPA 3K01A 3WAFA 1BLFA 4QF9A 3MP6A 4RPNA 1AH5A 4NF6A 4RJZA 1P1QA 5FHMA 4F22A 1SBPA 2Y84A 3SEWA 1Y1MA 2ANJA 4G2ZA 4LZ5A 3Q25A 2XXIA 1ELJA 1XVYA 1FQFA 3MP8A 3MVZA 5H8NA 3OO6A 3IOWA 5DVFA 3CRBA 2DXRA 2ZYKA 4WKMA 1MXYA 3KFMA 1PC3A 3RLFE 2VHAA 3SEVA 3FGSA 3T9XB 1PBQA 3JZJA 4LZ7A 4GFRA 2IA4A 1P1OA 1Q1KA 3PGFA 1LAXA 1MQIA 3VDFA 5ITOA 3MP1A 4YMAA 1MG1A 3RPWA 4FIMA 3MPLA 2DE2A 1NMUA 4NF4A 5L9SA 5ICTA 2ZNSA 1BTJA 3LUYA 1POY1 1R1NA 4M1VA 4YB7A 4ELRA 4BLAA 5BUUA 1ZU0A 3PMWA 4YU0A 1QUJA 4FECA 4QRZA 1P1UA 4GRKA 3UN6A 2OLBA 1IXHA 4H5GA 2Y7WA 4LONB 4G8HA 2RF1A 5CMBA 4IGTA 2NWJA 2I3WA 1DSNA 4LZ8A 1FQCA 4G68A 2IEEA 4JSOA 1A8FA 3QAXA 3H7MA 4EQ9A 4L17A 3EF7A 3OMBA 2OWSA 3K6UA 3BBRA 3H6TA 5DEXA 2F6GA 5AA4A 2DE3A 4YICA 1OIBA 4X1DA 3GBBA 4NF5B 3WAEA 4YKKA 4OHNA 3V83A 4IO7A 3OSQA 2F34A 1PBPA 1BP5A 3KBRA 2RKMA 4QSDA 2O7UA 3UA8A 1VFEA 2YPNA 5K2XA 1JVYA 3IK6B 2HAVA 4ELPA 3N6TA 1R6ZA 2I6EA 2F36A 3UORA 3IOTA 1POTA 4TQUQ 1SW2A 4C0RA 4JBZA 1N04A 2B3FA 2ZYNA 4YMBA 2DWIA 1B3FA 3VE1B 1R9LA 5AA1A 2AL4A 4UA8A 3GLBA 2HZLA 3OD7A 4O3AA 2AIXA 1NL5A 3IR1A 4OEUA 2UXAA 3LC8A 4OZ9A 4WEPA 4ZEIA 4LQ5A 3VLWA 2VD2A 4IY6A 2ONKE 4OWDA 4MH5A 1OQHA 2I58A 1M5FA 1WDNA 1N0TA 1FQAA 5TU0A 2DXYA 4THIA 4OFJA 1B3LA 1AMFA 2DE4A 2D21A 4DXCA 2DVZA 1H3DA 1B52A 3TTNA 2UYEA 4Z7EA 2D5WA 4P11A 2VP1A 3DELB 4DXUA 2Y7KA 1IEJA 1EZOA 1UTBB 1I6BA 4K3FA 5TPAA 3HCQA 1JW4A 1OQGA 4QSCA 2H9BA 1MQHA 4JB7A 2R6GE 4YZZA 2D3IA 2F78A 5I59B 1B40A 3MAMA 4ZE9A 4OYVA 1I6QA 3HSTA 3FXRA 1MH3A 4P0GA 4H5FA 4GWOA 2FNCA 3CI8A 3O97A 4IB2A 2OJTA 3V89B 2OK2A 4BDQA 1Y4CA 2XD2A 5EHMA 4Q5TA 1L5TA 1JEUA 1LAFE 5H8FA 5TP9B 4OXVA 3O29A 4R6YA 5JK4A 1H76A 4R6HA 4R75A 2XXPA 1MDQA 3U93A 4PFTA 3O9PA 4UACA 4LVQA 1ZTYA 3G3GA 3TODA 4U23A 3N6UA 4R73A 2QS1A 2XHDA 1UTHA 2PMSA 3U94A 1XC1A 3EHTA 3OO8A 1O63A 1VFDA 3FVNA 4OESA 4R6KA 3ODBA 3D4GA 4F1UA 4GQOA 1QULA 1H45A 2XX8A 2DS9A 4EF2A 1FQEA 2PT2A 4GIZA 4XKRA 5DT6A 3CG3A 1B51A 3BKIB 1EZ9A 3GZGA 4KYSA 3ONMA 1IITA 3ZKKA 4H6DA 2O6AA 4OVJA 2GH9A 4OTEA 2DQVA 4ZDMA 1N3WA 4XKPA 3VLUA 5I58B 3EPEA 3UP9A 4N6PA 5KCJA 3H3GA 3VLVA 1EU8A 2F35A 3I6VA 3FVGA 3OO9A 3G3IA 4X48A 4QFNA 1MXXA 4KQPA 2A5SA 4F19A 2QMWA 5FHNA 1CE2A 4R9GA 3H06B 1B9JA 3PUXE 3C32A 1QKBA 4F3PA 5AA3A 1NNKA 1J1NA 3DP4A 1FTJA 4G4PA 3VXBA 3LSWA 4EDPA 1TXFA 3T93B 4ESXA 1NH7A 3U92A 3L6HA 2O1LA 1B5JA 3C33A 1M5CA 4NF8B 1SW5A 3VVFA 4HW8A 4KCDA 1F9BA 3RQTA 4ZS9A 1AL3A 3JV9A 3TEPA 3OOAA 2F6PA 2QMXA 3B6WA 3TZAA 4H65A 4I62A 3K00A 1URSA 4FATA 4NEDA 2UVGA 3RGYA 1IUDA 2Y7PA 5I57A 5F7VA 4YAHX 4IO3A 3FATA 3KN7A 4DIGA 3LSXA 3TAJA 1MXWA 1US5A 2UYFA 3SEXA 4RNSA 4MF3A 2ZMBA 4I1DA 3BFUA 4NF6B 5CM6A 2REGA 2DP8A 2REJA 5I56A 1RKMA 3QYTA 3FJ7A 4F1VA 2V3UA 1B7UA 4QFOA 3C4MA 3PUYE 4O3BA 3K0VA 1EH3A 5H8NB 3A09A 2DOJA 4E0WA 1LB8A 4DCYA 5KZTA 2QL3A 2ONRA 3P7IA 2G29A 3USDA 3IL1B 5JTYB 2XXTA 4R74A 3U8QA 1JW1A 5HBCA 4NF4B 3LSFB 1B5IA 1O64A 1SI1A 1JETA 3S4UA 4F2OA 2F8DA 3S9EA 2RCBA 4G8NA 4YB5A 4RK2A 4JXIA 2A5TA 2O68A 1LLSA 3EN3A 3C36A 4EXLA 5IKBA 4PFWA 1MY2A 4O3CA 4Q0CA 3K1NA 2G93A 3D4CA 1LBBA 1B7HA 4HCYA 2V25A 4H67A 2QS4A 3FV1A 3BFTA 5DVJA 1B4HA 4G68B 3O28A 2F7BA 3TCGA 4H1XA 5LOMA 2I49A 4P0IA 3FJMA 1MM6A 5CMKA 4IGRA 4OFLA 3TELA 1B32A 5DEXB 3CFZA 3MVXA 5I2NA 3MVYA 3CSGA 1NH8A 3IB2A 4R2BA 3G3HA 3CR9A 3O2AA 2ZYOA 2AYSA 5AE4A 4F18A 1B3EA 3TMGA 4JWXA 3PPRA 1II5A 3ZS6A 1TFDA 4JSDA 2FA7A 1A8EA 1YPNA 3F11A 1OLCA 1TT1A 1FQDA 5CBSA 1DTGA 1ZBMA 2Y7IA 1QUIA 3SEYA 4ZECA 1MPCA 4U2RA 5DYHA 3E3KA 2F97A 3UK4A 1DOTA 3S2VA 4OEVA 4ECFA 2HEUA 1LSTA 4QSEA 3UGWA 1XS5A 1VE4A 3FJGA 3DLNA 3U72A 2GRVA 4FEBA 4NWDA 3IOUA 4ELOA 1Y9UA 4PETA 1N3XA 3GXAA 4TLMB 5L9OA 3QXMA 3TKDA 3PMVA 3N94A 3S9NC 2OCUA 4FEDA 5CBRA 1MRPA 1A99A 2B3BA 1N84A 3MW0A 3O6IA 1LAHE 3E4RA 3IOVA 4MLVA 1USYE 2E1SA 3VFJA 2RC8A 2Z8EA 3O66A 2QPQA 2X26A 3Q29A 4PFUA 4HCWA 5HPQA 3I5OA 5EHSA 5TPAB 3TUSA 1VSOA 1OVBA 2M8CA 4FE8A 3B6TA 2HZKA 4EQBA 3TTLA 1UTBA 3FASA 3VV5A 1XT8A 2Z8FA 5I2KB 1GR2A 4RPOA 2NXOA 1QKAA 2CMOA 1M5DA 2HCAA 3MC2A 3O6GA 1ZIUA 3KJTA 4EUOA 2OZZA 4PE5B 3LBSA 3EQ1A 4ISUA 2DSFA 2P2AA 3OEKA 4IO6A 1ZKBA 4KYDA 4DCXA 1BIYA 3H6WA 3IB1A 4BDOA 1FTKA 1HSEA 3C31A 3MZBA 3HO7A 3TCFA 1IXIA 2ZNTA 4AB5A 1NNPA 1R9QA 5CI5A 3K1PA 4F3SA 5DTBA 5JEIA 3HPIA 3M3FA 1T0KA 1DMBA 2VOZA 3PUZE 5H8HA 3T96B 3SERA 3TQWA 2XXHA 2DVCA 3TTMA 5AA2B 3CFLA 1D9VA 3K02A 4R9FA 3C34A 3MPKA 3FVKA 4ZZAA 3PV0E 1LAGE 2PBWA 5IAIA 3KZGA 1B5HA 1Y20A 2V3TA 3Q27A 3MZ1A 1S7YA 1IXCA 2XXXA 4GXAA 4LA9A 4KD5A 3IB0A 1D9YA 4MLQA 4GLIA 2I4BA 4H8IA 4YKIA 1QVSA 4DXBA 1SYHA 3SEUA 3IJOB 1BKAA 4DE8A 2YLNA 4GXSB 1YCJA 4KR5A 2GHBA 2V3QA 2XXUA 4KHZE 1VR5A 4F31B 3RUMA 2RC7A 3LSLA 4ZZEA 1XHYA 3H6VA 3M3LA 1Q35A 1LCTA 2W7YA 2E0SA 5H8SA 4FAJA 4YB6A 2R71A 1YAEA 4ESWA 1NKXA 1MQDA 5CMCA 3E13X 1GTKA 4PFYA 1FTOA 3PUWE 5A5XA 2BJJX 4KPTA 3S9LC 1FCKA 1Y4TA 3IAZA 4BDNA 1UIUA 1MY1A 5H8QA 2ESNA 2O69A 1B0LA 2F7CA 3KOTA 3R6UA 4C1UA 1P1NA 3CG1A 4NMYA 2LAOA 1KWHA 2NVUB 1JQFA 4HTGA 3OO7A 3W9VA 1USYH 4I9DA 4RXLA 1IQ7A 3N26A 4GVOA 2AL5A 3CVGA 1O7TA 1GVCA 4U4SA 4ZEKA 1ZLQA 3ZSFA 1B6HA 1SW1A 3FUZA 1AOVA 3QUFA 1MXZA 3K6VA 3KEIA 3IO6A 4OFOA 3KN3A 4U22A 2PVUA 1IIWA 1URGA 3C35A 2OWTA 3ILTB 1ZJLA 4R2FA 2H5YA 3HN0A 5HM4B 1MDP1 4PQJA 2OBGA 2Q9TA 5KDTA 1B7ZA 3KG2A 4YKPA 4N13A 3ECRA 3PU5A 5I57B 2QRYA 5FTIA 2WKYA 3MVWA 3FD3A 1N7WA 4R72A 1LFHA 4ONYA 3TTRA 2XXYA 2UVIA 1B58A 3R7XA 2X7PA 2ONSA 4QHQA 2XX9A 2UVJA 4YKJA 3KJ7A 3RTFB 5I56B 4LATA 4BDLA 5ISUA 1I6AA 3HHGA 1JEVA 1DTZA 4QFLA 1B05A 2P0SA 3OEMA 4X9TA 1TFAA 1N7XA 4EQ7A 1LFIA 1PEBA 3EHUA 3W15C 3K1MA 4DZ1A 3K4UA 5ELVA 3EHSA 4F39A 2O7IA 3TPAA 3K2DA 3LR1A 3TQLA 4NWCA 4F3BA 1FQBA 3QUJA 2QJEA 2Y7RA 3Q28A 1PDAA 1US4A 5JTYA 4H8JA 4AB6A 2RC9A 2A5TB 3PMXA 2I3VA 3PPNA 1S50A 3FVOA 2THIA 4LUBA 2XXVA 2XXQA 4EF1A 1LCFA 2PYYA 4U21A 3T9VA 3Q26A 4XIGQ 3A3CA 3KSXA 3MQ9A 2I0BA 2VD3A 4ZEDA 2CZLA 1NNFA 2Z23A 2HQ0A 5L9MA 3G3KA 5AA4B 5I2NB 5B7DA 3H4ZA 1SD3A 4LQ2A 2H4IA 1YTVA 1URDA 2XD3A 3ILUB 4MBPA 1B1HA 2Q2CA 1WVJA 3MWBA 1SYIA 3OSRA 4NE4A 1I69A 2ABHA 1NNTA 2XX7A 2ZNUA 2F7AA 4IO4A 5B70A 4FORA 4NF5A 3T22A 1DPEA 4JWOA 3O6HA 2Q8JA 1Z7NE 2XXWA 5EYFA 2HFBA 4RK9A 1NFTA 3W9WA 4RA1A 4U1OA 3RN8A 4C1TA 1GV8A 4Q8RA 4GOTA 1B0HA 4IO2A 1A54A 1LBCA 1N76A 4XKQA 2V84A 4POXA 1Y1ZA 4QFPA 4NTLA 3DM0A 5FHOA 1MH4A 5AA2D 1D4NA 4QFKA 1GGGA 2Z22A 4BDMA 3A3UA 4ZEBA 1AIVA 4M4GA 3FIRA 1PB8A 1JVXA 1B2HA 2O1MA 3K6WA 3RNNA 1SDXA 3RT8A 1Z7ME 3RT6B 5L8DA 4HS7A 4EXKA 3IORA 1MY3A 1A55A 3G7WA 4XXUA 4IO5A 4IY5A 3T9UA 1MY0A 1DPPA 1PB7A 3HV1A 3E9XA 3KSJA 1OMPA 4XTCQ 5FTHA 2KLFA 1IZ1A 3OENA 2O84X 4XKNA 3TYHA 3IX1A 1B46A 3CFXA 4Q30B 4ZEFA 3H03A 5DVIA 1A7LA 1FW0A 1QJMA 4H0WA 3TFLA 4JWYA 5F1QA 3OELA 1IXGA 3C9HA 5J1DA 4AQ4A 2HXWA 4F29A 2O51A 3R26A 1M5BA 2UVHA 3CSBA 5K2YA 4OETA 2RINA 5I59A 3SETA 2VGQA 1MXUA 4KI0E 5I84A 3DP8A 5I2KA 1SQYA 4DLDA 5CRYA 3RY3A 1B3HA 4OMBA 3DP6A 4I8CA 1SI0A 5H8FB 2YJPA 1S9TA 1M5EA 3TCHA 3QK6A 1MQJA 1P99A 5CC2A 3L6GA 3PPQA 5TP9A 2X7QA 1CB6A 2I0CA 1LGBC 3G3JA 5H8HB 2Z8DA 4GL8A 3B7DA 3PD8A 1UIVA 3TDJA 1Y3NA 2ALUA 1UTHB 4F2QA 3SKPA 3AXFA 3SESA 2I48A 1FTLA 1MY4A 1H43A 4GL0A 3GBAA 2ZYMA 1HSLA 1JW5A 4LP2B 3U1OA 2DWHA 3IJXB 5AA2A 1WODA 3KOSA 4U4XA 3CIJA 4X1BA 2HAUA 3G3FA 1B3GA 1MM7A 3MJNA 3M3KA 1XVXA 4ND9A 2RCAA 2NOOA 2F5XA 1OVTA 3QIMA 1PB9A 3SDFA 2PT1A 3THIA 4ZE8A 1Y3PA 3MZ9A 4DDDA 1QUKA 2DWJA 3TTKA 2H25A 1RYOA 4F3GA 3UIFA 1UQWA 4ELQA 3PPOA 4POWA 2I4CA 5KCJB 2Q2AA 4KFQA 3PUVE 3FXQA 3H6UA 3VXCA 2QS2A 5I58A 1RYXA 1MXVA 1HSJA 1JNFA 5A5XB 3VVEA 2R9JA 3T9HB 4RYAA 1MQGA 5H8QB 1MPBA 4MFIA 4OENA 5ICQA 2B65A 1A40A 2DWAA 3OXNA 4Z0IA 1SW4A 2H99A 4BDRA 1MPDA 4KYEA 3KN8A 1D3KA 4TLLB 1H44A 4G68C 3V8XB 2FYIA 2Q89A 3PD9A 1TWYA 1XOCA 4RY1A 4E0XA 1ANFA 3MUQA 4GF8A 3FZVA 1FTMA 5ITPA 2PX1A 2H98A 1Y3QA 4FJPA 3B6QA 3IO4A 3FXUA 1ZMGA 3V5AA 4NF8A 3MBPA 2GFEA 2QS3A 2V93A 1LFGA 2Q88A 4N07A 5KDTB 3FV2A 3RTWB 1LB9A 2ZXTA 3T66A 3VVDA 3ZKLA 1OLAA 1ATGA 2NUVA 4JDFA 1EZPA 4WXJA 2P1SA 3HHFA 4F1YA 2XXRA 1P1WA 4KCCA 4WEDA 3I3VA 1B4ZA 4G8MA 1SVXB 3S9MC 1MS7A 2GHAA 3JYRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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