4QSEA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound glycerol
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of maltoside transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, target EFI-510558
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
total genus 138
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA02
2AL4A 4YZZA 5ELVA 5EYFA 3V8XB 3KJ7A 2YPNA 2DP8A 2DXRA 1NH8A 4P11A 1USYH 3TZAA 1UTBB 3B7DA 4XTCQ 4FECA 3VVDA 4RPOA 3BFUA 3GBBA 2I3VA 4GIZA 3PD8A 1S9TA 2Y7IA 1F9BA 4YKKA 4HTGA 5ITPA 3EHUA 1URGA 4R9FA 3USDA 5TPAA 1A40A 3FVOA 1UQWA 2DSFA 4QSCA 1N7XA 3R7XA 5CBSA 1PBPA 1LAHE 1B5JA 1MXZA 5JTYB 1B3EA 4U1OA 2O7IA 4LATA 1VSOA 2O84X 1XS5A 2XX9A 3E4RA 3F11A 1SW5A 3K0VA 1KWHA 5AA2D 3A3UA 1IUDA 3IO6A 3RQTA 1FTMA 4UA8A 2OLBA 2UVHA 3N94A 3A09A 1LLSA 2XXHA 3EN3A 4U4XA 3EQ1A 5LOMA 2ANJA 2F34A 5DTBA 4IO4A 3RTWB 5J1DA 4R72A 1UTHA 1S50A 2Z8EA 2I4CA 3S9EA 2A5SA 2XXYA 1NL5A 2DWJA 4KQPA 4GVOA 1AH5A 2AYSA 3M3FA 2I0CA 3CIJA 3QK6A 4ISUA 1PB9A 1URSA 1B9JA 1B6HA 1NNKA 3FV1A 2QMXA 3CRBA 1P1QA 4YB6A 1B4HA 4RYAA 5AA1A 4C1TA 1R1NA 3OELA 1POY1 5AA3A 4NF8A 3K6XA 2NVUB 5K2YA 1VFDA 2Y7KA 1Y4CA 4PE5B 2F7CA 4ZZAA 3TELA 4NF5B 2DVCA 1FTJA 3SEXA 1FQDA 3KZGA 3UP9A 1LAFE 3VV5A 2I0BA 4ESWA 3K01A 3O28A 1XT8A 2F97A 3C35A 2HQ0A 3PPRA 3LBSA 1Y3QA 3OD7A 5JK4A 4R9GA 3RLFE 2ZYOA 3FASA 1O63A 3G3JA 4GD5A 4IY5A 3OEMA 4F1UA 1MPCA 1XVYA 1B1HA 3K2DA 4ZZEA 3N5LA 2UVIA 3IOVA 3O2AA 3B6QA 1UIVA 2FA7A 3FVNA 2DE3A 3W9WA 4XKRA 1FQEA 3W15C 3E13X 1B3GA 5DEXB 3KSJA 1XOCA 4RNSA 3SETA 1RYOA 1FQAA 4RXLA 2DVZA 4I62A 5KDTA 1I6BA 1TFAA 4G68A 3LSWA 3HCQA 4QHQA 1SW1A 3N6UA 1HSEA 2Q9TA 1QUJA 4LONB 3SEYA 3I5OA 1MY0A 3RN8A 4OESA 4TQUQ 1GGGA 2XXPA 2QJEA 2UVGA 3UGWA 2AIXA 2FYIA 4KYEA 4GWOA 2QL3A 2HXWA 5CMMA 3FZVA 1JEUA 3MVZA 4FORA 3IX1A 3Q28A 5I59B 3G3KA 2O51A 1OIBA 3H06B 4IO6A 1JW1A 2R9JA 1Z7NE 4DCXA 1JETA 2YJPA 3DLNA 3MP1A 1H3DA 2B3BA 1NFTA 2IEEA 4OETA 1ANFA 3RUMA 5KCJB 2Z22A 4DZ1A 4X1BA 2PT2A 1MH4A 3PD9A 1RKMA 3K6UA 2VHAA 4IO3A 2XXXA 4RA1A 5DYHA 3ODBA 4XKQA 3PGFA 4MLVA 5F1QA 1LAXA 1B7UA 1MY4A 1Z7ME 5FHMA 1MH3A 3U92A 3I3VA 1B52A 1MPDA 2THIA 4OFJA 3VE1B 2ZYKA 3PPNA 5I57B 1Y1MA 5I56A 2DXYA 1GV8A 4OXVA 3TQLA 2PBWA 3C9HA 3TMGA 4QFKA 4C0RA 5EHSA 2NXOA 3R6UA 4OEUA 3S2VA 1US5A 2HCAA 2HAUA 4NF6A 2XXUA 4NF4A 5F7VA 4LQ2A 4FJPA 5CMBA 1Y9UA 1EZOA 3O6GA 4HCWA 4NE4A 1I69A 1MDQA 4DIGA 4Q8RA 3O66A 5CRYA 3MJNA 4EUOA 1FCKA 4RPNA 2OBGA 4F3GA 1I6QA 2ZNUA 2ZYMA 4H67A 5H8SA 5I58B 4TLLB 4ONYA 5H8HB 4GL0A 3PUYE 4OENA 1XHYA 3RNNA 4HW8A 3VXBA 3O6IA 3MUQA 3N26A 4R74A 4RY1A 3O29A 2RCAA 3ILUB 4AB6A 4FATA 2A5TA 2NWJA 1R9LA 4WXJA 3G7WA 2F78A 5EHMA 1L5TA 3H7MA 3DP8A 3IK6B 5ICTA 3MP8A 4H0WA 4UACA 1A55A 4NWCA 1IEJA 4R2FA 4ELRA 1A8EA 4NMYA 5I2KB 2Y7PA 2ZYNA 1MQJA 3O9PA 5H8NA 2DS9A 1H43A 1II5A 1QW0A 3U93A 5L9OA 3FVKA 3MPLA 4ZE8A 2V25A 1CB6A 5ISUA 3K6WA 2UYEA 2E0SA 3CR9A 2P0SA 4GRKA 5ICQA 4I1DA 4U22A 3HHGA 3HSTA 1SD3A 5TP9A 4NTLA 5AA4B 4DXBA 4WEPA 4THIA 2HZKA 2F8DA 3TCGA 2Y7RA 1IXCA 4ELQA 4LZ8A 3QUFA 5ITOA 3U72A 1XVXA 3PMWA 3HV1A 3DELB 3TAJA 4WEDA 2HEUA 2Z8DA 4NWDA 3FXQA 3IB2A 5M2VA 4F29A 3JZJA 2CZLA 3RT8A 3ZS6A 4ZEKA 1MM6A 1POTA 1OMPA 1ELJA 1B51A 3PUWE 1NNPA 2D3IA 3CSGA 1EH3A 3MVYA 4ZEIA 3QUJA 1VR5A 5H8QA 3L6HA 3PMXA 3MBPA 3DP6A 1VFEA 2Y7WA 5TPAB 4ZECA 4DCYA 1MQDA 1N3WA 4XIGQ 3VFJA 3OSQA 3VLUA 4GFRA 3OENA 3MPKA 3T9UA 5KZTA 3FXRA 4DLDA 2F5XA 1OQGA 2Q88A 4YKJA 4ZEFA 1NMUA 4YICA 2RINA 2PT1A 4F19A 1B46A 3CG3A 5JTYA 1B3FA 1CE2A 3OSRA 2M8CA 3TEPA 3JYRA 1TT1A 4JB7A 2CMOA 3IOWA 2F7AA 1XC1A 4GF8A 4KYSA 1M5BA 2IA4A 4XXUA 3ILTB 1BTJA 4R6HA 3O97A 3VDFA 2VD2A 2REJA 1MPBA 1FQCA 2RF1A 1A8FA 2D21A 4JWXA 1EZPA 3KSXA 2ONSA 4POWA 4O3AA 3QAXA 3HHFA 1QUIA 1BIYA 3FJGA 2F6PA 4ND9A 3OMBA 4G77A 5CC2A 2GH9A 5CBRA 4ESXA 4N07A 2H98A 1US4A 2R71A 1JW5A 4F1YA 4F39A 3RPWA 4TOZA 3M3LA 2VOZA 3FIRA 3D4GA 2ALUA 1LBBA 3OOAA 3TKDA 1B05A 2V3UA 3MWBA 1I6AA 1QJMA 4DXCA 4GL8A 3U1OA 4H6DA 2QS1A 2ABHA 3SESA 3C4MA 4LVQA 2RC8A 2GFEA 2XXIA 3KOSA 2HFBA 3M8UA 4R2BA 3T9HB 4OMBA 4Q0CA 4YU0A 1M5DA 1AOVA 2GHAA 4IGTA 1DPPA 2XHDA 2O1LA 1GTKA 3G3IA 4F1VA 2Z8FA 4H65A 1OLAA 2OZZA 3ECRA 3MVWA 5BWJA 1B5IA 1BKAA 5AA2B 1B4ZA 2QMWA 2I48A 4F18A 1YAEA 1D3KA 1PB7A 5A5XB 3U8QA 2O1MA 3OO6A 3TQWA 4ELOA 3RTFB 4O3BA 5DEXA 4G68B 2AL5A 1AL3A 1Y4TA 3ZKLA 1WODA 4H8IA 4KYDA 1A7LA 3G3FA 3PPPA 1LFGA 3TTLA 2DWAA 5DVFA 4IGRA 1TWYA 2FNCA 2G93A 1P1NA 3SERA 2Q8JA 2V3TA 3KBRA 3UA8A 2PX1A 4H5GA 2PVUA 2F35A 4AQ4A 3MZBA 1Y20A 1SW2A 3WAFA 1M5FA 3TUSA 2DOJA 3HO7A 4F3PA 4ZDMA 4PP0A 4DE8A 3FUZA 3M3KA 1MXVA 2H9BA 5L8DA 3S9NC 3QXMA 5IAIA 1LAGE 3PUVE 1LSTA 3IO4A 4F2QA 2ZNSA 4OYVA 1YCJA 4IO2A 4OQOA 2ZNTA 3TPAA 1R9QA 1JNFA 1N3XA 2PMSA 4BLAA 2E1SA 3TYHA 1YTVA 1MXYA 3G3HA 4IO7A 5FHOA 5K2XA 4XKPA 4I8CA 2V93A 3B6TA 3EHTA 3L6GA 5DT6A 3MW0A 1TFDA 4KCDA 2XXTA 2GHBA 3I6VA 2H99A 1IQ7A 4H8JA 3TCHA 3PUZE 4MH5A 1PB8A 4MF3A 1B3LA 4EDPA 3TFLA 5H8FA 1NNTA 2DYXA 4PFWA 4RK2A 5I56B 3QIMA 1A99A 2KLFA 4JXIA 1Q1KA 1SW4A 2ZMBA 1P99A 3VXCA 5I57A 3IAZA 1Q35A 1SVXB 4P0GA 1ZJLA 4NF4B 1QUKA 3T66A 4PETA 4QRZA 3IORA 1N76A 4XKNA 2R6GE 1T0KA 1ZKBA 3ONMA 3OEKA 3KN3A 4QSEA 1S7YA 4GQOA 4ZS9A 1NKXA 1UIUA 4EQBA 5I2NB 1LBCA 3FGSA 3TTRA 4G4PA 1H44A 4WKMA 4YB7A 3MQ9A 1IIWA 4KHZE 1JQFA 1QKAA 5I58A 1SBPA 4NEDA 3K00A 5H8HA 4KR5A 3H4ZA 1SI1A 2A5TB 3O6HA 3SKPA 1B32A 1A54A 4OVJA 4QF9A 1FQFA 3CI8A 4OEVA 4QFPA 4U1ZA 5IKBA 4Q30B 1DSNA 4FEDA 1B58A 1LCTA 1R6ZA 3HN0A 2ONKE 1FTKA 1MY2A 4KPTA 5I84A 5B70A 1EU8A 2H4IA 1SQYA 1WDNA 1Y3PA 1LFIA 1JEVA 3RT6B 2I58A 3V89B 2DQVA 2WKYA 1FW0A 3VLWA 1SDXA 4F22A 4BDLA 1B0LA 3RY3A 3H6UA 3S9MC 2XXRA 3OO8A 3VVFA 4OTEA 2OCUA 1EZ9A 1WVJA 3KJTA 1GVCA 2NUVA 3C31A 1P1UA 3FVGA 4QFLA 3Q25A 4Q5TA 4F2OA 2QS3A 1DMBA 2QPQA 4YMBA 2XD3A 2H25A 2I3WA 3PMVA 4F3SA 2UYFA 1H45A 1N0TA 3OO7A 3CSBA 3TTNA 2GRVA 3KG2A 5BUUA 3EPEA 4H1XA 4PQJA 2ONRA 3PPOA 1UTBA 2HAVA 3K02A 3IJOB 5H8QB 3R26A 3H6WA 3GLBA 3E3KA 4QFNA 2QS4A 1USYE 3DP4A 4KI0E 1HSLA 5B7DA 3KEIA 1DTGA 2F36A 1Y3NA 1MRPA 4ECFA 4IO5A 2DWHA 3FJMA 3MZ9A 2OWSA 1AMFA 2NOOA 1OVBA 4N13A 2Z23A 3KOTA 1B7ZA 1D9YA 4U23A 3RGYA 3UORA 1B1XA 1M5CA 3C34A 3Q29A 1MQHA 4F31B 1HSJA 2V3QA 1MQGA 4M1VA 4EQ7A 3LR1A 3QSLA 3DM0A 3CFLA 4BDOA 1UTHB 4FEBA 4QSDA 4BDMA 3MP6A 4EXKA 3CFXA 3KFMA 4KCCA 1PDAA 1QULA 4TLMB 4RK9A 1VE4A 3C32A 1BP5A 3G3GA 1IZ1A 4R6YA 4R6KA 3TDJA 3IJXB 1Y1ZA 2B3FA 3LSXA 4NF8B 4JSDA 3CG1A 1MM7A 1YPNA 1SYHA 4F3BA 5CM6A 3GZGA 2D5WA 4EF2A 3C36A 3T93B 4JSOA 1PC3A 3LSLA 4G2ZA 4P0IA 4NF5A 4GXSB 3B6WA 5DVIA 4LP2B 2X26A 1B3HA 1NH7A 4G8HA 2XD2A 2I49A 4EQ9A 1IXIA 5FHNA 3MZ1A 5HBCA 2XXVA 1BLFA 2PYYA 2UXAA 4BDQA 3KGCA 1MXXA 4BDRA 3QYTA 2H5YA 3N6TA 4YAHX 1D9VA 4LZ5A 2VGQA 3UN6A 3P7IA 4X1DA 4IY6A 2Q2CA 3PU5A 2F7BA 3JV9A 5AA2A 2OJTA 4IB2A 3T9XB 5TU0A 1MG1A 2I4BA 4FAJA 2OK2A 3SEWA 5KDTB 4U21A 5A5XA 4HS7A 3WAEA 3CFZA 5FTIA 3TODA 1ZLQA 2Q2AA 3K1PA 1JW4A 4OFOA 4PFUA 1MY3A 4ZE9A 3W9VA 4OFLA 2O69A 3GXAA 3HPIA 3IOUA 1ZIUA 2UVJA 3H3GA 3BFTA 3K4UA 3T22A 3KN8A 3GBAA 2F6GA 2RKMA 1B5HA 3VLVA 2QSXA 3PUXE 3FV2A 3FXUA 1ZMGA 1FTLA 4E0WA 4M4GA 2XXQA 4LA9A 2W7YA 3T9VA 4HCYA 4KFQA 1OLCA 1JVXA 3Q26A 2O68A 2RC7A 1ZBMA 3SEUA 2QRYA 1LFHA 5I59A 1RYXA 3LC8A 2Y84A 1JVYA 1N7WA 3S4UA 3Q27A 1LGBC 4POXA 5FTHA 3OO9A 4MFIA 1MQIA 2RCBA 5KCJA 4PFTA 3MVXA 2REGA 4X48A 4OWDA 4G8NA 1AIVA 2OWTA 1IITA 3K1NA 1OQHA 4R73A 3H6TA 3FJ7A 3V5AA 4C1UA 3S9LC 1MXWA 3TCFA 1IXGA 2DE2A 5CMKA 1DPEA 4YKPA 1ZTYA 5CMCA 3ZSFA 1DTZA 3K1MA 1B0HA 2YLNA 1B40A 2XX8A 5H8FB 4X9TA 4BDNA 1QKBA 5JEIA 1O7TA 4PFYA 1MS7A 4L17A 3T96B 3IL1B 2I6EA 3K6VA 3AXFA 3UIFA 3CVGA 2G29A 2VP1A 3IR1A 4ZEBA 2B65A 3LUYA 3KN7A 4NF6B 1FQBA 2XXWA 2XX7A 4GLIA 4O3CA 3OXNA 4GXAA 4DXUA 3C33A 3MAMA 1DOTA 4K3FA 3ZKKA 4OHNA 1MY1A 3IOTA 1P1WA 4JWYA 1QVSA 1O64A 4EXLA 3H6VA 4H5FA 4YB5A 3EF7A 1MXUA 5I2NA 3UK4A 3V83A 1IXHA 4KD5A 2RC9A 3H03A 4N6PA 5DVJA 4ZEDA 4OERA 4LUBA 1J1NA 1SI0A 2QS2A 4U4SA 1TXFA 1PEBA 1N84A 4FIMA 1ZU0A 2HZLA 1LB8A 4YMAA 1SYIA 4Z7EA 4LQ5A 3LSFB 4FE8A 1LCFA 3VVEA 5L9MA 5CI5A 2BJJX 3D4CA 3PPQA 1NNFA 3PV0E 1D4NA 1B7HA 1LB9A 2X7PA 3SDFA 4QFOA 3E9XA 3FD3A 4MBPA 5HPQA 3BBRA 3SEVA 1GR2A 2P1SA 5H8NB 3IB1A 2O6AA 4JDFA 4R75A 5I2KA 1PBQA 2DE4A 5AE4A 1OVTA 3THIA 5L9SA 1URDA 4RJZA 5TP9B 2P2AA 4EF1A 3TTKA 3MC2A 2X7QA 2V84A 4G68C 2LAOA 4JBZA 2ESNA 3U94A 5AA4A 2ZXTA 1M5EA 4I9DA 3TTMA 4G8MA 4AB5A 5HM4B 3FATA 1H76A 3A3CA 1FTOA 3EHSA 4Z0IA 1P1OA 1N04A 1MDP1 4GOTA 4MLQA 4LZ7A 4YKIA 4ELPA 4U2RA 1B2HA 3IB0A 1ATGA 2O7UA 4DDDA 2DWIA 4JWOA 4OZ9A 3BKIB 2VD3A 4E0XA 2Q89A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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