3EHUA

Crystal structure of the extracellular domain of human corticotropin releasing factor receptor type 1 (crfr1) in complex with crf
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
453
structure length
441
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFDQHCESLSLASNISGLQCNASVDLIGTCWPRSPAGQLVVRPCPAFFYGVRYNTTNNGYRECLANGSWAARVNYSECQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Recognition of Corticotropin-releasing Factor by Its G-protein-coupled Receptor CRFR1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FUSION PROTEIN OF CRFR1 EXTRACELLULAR DOMAIN AND MBP
molecule tags Membrane protein
source organism Escherichia coli
total genus 125
structure length 441
sequence length 453
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehuA01
4.10.1240.10 Few Secondary Structures Irregular Hormone receptor fold GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain 3ehuA03
3RNNA 4KQPA 4NMYA 3CFXA 3H7MA 2G93A 1P99A 2DOJA 5F7VA 3TEPA 1B51A 2JNCA 3U1OA 2H5YA 2OK2A 1GR2A 4RA1A 4PQJA 2YLNA 1OMPA 1EU8A 5KDTB 4OEUA 3LSWA 1OLCA 5AA4A 2PMSA 3CVGA 3GLBA 5DVJA 1Q35A 3LSFB 3EHTA 1IXGA 1ZTYA 2V3QA 4F2OA 4LF3C 5L9OA 3QUFA 3EN3A 3G3HA 5DEXA 3I3VA 4H5FA 4LZ7A 3S9LC 4JWOA 2OCUA 5H8NB 3B7DA 4ELQA 1RYOA 2RKMA 4RNSA 4X9TA 1MXUA 1D3KA 2V3UA 4OXVA 5LOMA 2OLBA 4Q5TA 5I2NA 5I2KA 5EHMA 3C9HA 4IGTA 2DWHA 4OQOA 3IAZA 4F22A 5I56B 5K2YA 3LUYA 3CG3A 4I8CA 1DOTA 1B3HA 1N76A 1B5JA 3MWBA 4NF6B 3FVKA 3K01A 2D3IA 5F1QA 1FQCA 2JNDA 1FQBA 2XXWA 3KOTA 4NF5B 3IB2A 4GQOA 2HFBA 4YKKA 4OTEA 1S9TA 2R6GE 2UVIA 3MZ1A 4XXUA 5TP9B 4EQBA 4NF4A 3SDFA 1IITA 4U1ZA 3P7IA 3C59A 1PB7A 4AB5A 3KEIA 2H98A 3T9VA 2ZYNA 1S50A 2Z8DA 3S2VA 4YKJA 3SESA 1NKXA 3IOVA 3RN8A 4C0RA 1JW5A 2DWIA 1VR5A 2UVGA 1QW0A 3L2JA 3VVEA 1LAHE 3W9WA 3HV1A 3THIA 1B3EA 2OWSA 4U1OA 2DVZA 2RINA 4QFOA 1B05A 4FEBA 4U22A 1OQGA 1PC3A 2DE4A 2ZYKA 4G8MA 4F19A 1MXZA 4FATA 1B58A 2Q88A 4ZEBA 5FHNA 3EHUA 2R71A 3FV1A 3U72A 3K1NA 4NF8B 3N6UA 4XIGQ 4M1VA 4IO2A 3FVOA 4QSCA 1IEJA 2NXOA 3EHSA 3MP8A 3E4RA 2H4IA 2M8CA 5H8HA 1JEVA 1NMUA 4LZ5A 3WAEA 4IO6A 4IO7A 3FUZA 3KOSA 1US5A 1B52A 2Q2AA 2FYIA 3K00A 1OLAA 2IEEA 2AYSA 1XHYA 2XXRA 3TTRA 1POY1 4H6DA 1U34A 2UYFA 1BP5A 5IAIA 1P1UA 2QS1A 5AA4B 2O6AA 3QIMA 3G3KA 4G77A 4XKRA 4HS7A 3FXRA 1IZ1A 2DWAA 4R74A 1SQYA 4F3GA 2Z22A 3K1MA 1FTJA 5AA2D 1XT8A 1B4HA 4GVOA 4H0WA 3A3UA 3TQLA 3ILUB 3BFTA 4EF1A 5B70A 2HEUA 3C5TA 1UIVA 5DEXB 1LAGE 4GRKA 1MXWA 4R2BA 4X1BA 2Z23A 1N7WA 4FIMA 1N7XA 2IA4A 3RLFE 3C34A 3HPIA 3N6TA 2HCAA 5I2NB 4H67A 3VE1B 3KSXA 2XXYA 3TFLA 3UK4A 1AMFA 3PMXA 4KYDA 1BKAA 1B40A 3H6TA 4EDPA 2Z8FA 1ZKBA 2I48A 2UYEA 3RT6B 4PETA 2PVUA 4RJZA 1SVXB 1MQDA 3KBRA 4ZEKA 4ZGMA 3N7SA 4C1TA 1GV8A 1A55A 2VP1A 4IO3A 3FGSA 1WDNA 1B32A 4O3BA 1B7UA 4ESWA 3DM0A 5CBRA 1D9VA 4HCYA 4NF4B 4R9GA 2XX8A 1BIYA 4DCYA 2XXPA 2QSXA 1F9BA 1MY4A 1KWHA 3FZVA 2QL3A 3OEKA 3UORA 3QUJA 3HO7A 3TTKA 4PFUA 1HSLA 3C31A 2R9JA 3ZKLA 4F1YA 4X1DA 3LSLA 4FECA 4BDNA 2ZYMA 1PB9A 1SDXA 4QSEA 3PUVE 3K2DA 1TFAA 4DXUA 5DVFA 3CI8A 3KN7A 1GVCA 5H8QA 2CZLA 1I6BA 3H6UA 1JNFA 4OETA 4JSDA 1PBQA 3IOTA 3EPEA 4JWYA 3VLUA 1Q1KA 2WKYA 3TDJA 1R6ZA 3DP8A 1SW4A 3RQTA 4R2FA 2DSFA 2RCBA 3I5OA 3IB1A 2Q89A 4Q30B 3TTLA 4JDFA 2ANJA 4R6HA 3TMGA 1D4NA 2XD2A 5A5XA 1FQDA 3K6VA 1EH3A 2OBGA 1JW4A 2ONKE 2F7AA 3PMWA 5I58A 4MF3A 5H8HB 3FJMA 5FHOA 5CBSA 4O3AA 2Y7KA 3IO6A 3G3IA 1USYE 1XVXA 3AQFB 4RXLA 4YZZA 3RT8A 2NUVA 3KN8A 3TTNA 2O69A 3BKIB 1MXYA 4DXBA 1CE2A 3TODA 3IL1B 1B3GA 1NNFA 3A3CA 1WODA 3LBSA 1SD3A 4ZEIA 3QSLA 5K2XA 3FIRA 2GH9A 1O7TA 1M5BA 1SW2A 3FVGA 4NE4A 5ELVA 3MVXA 2F8DA 4BDMA 2YJPA 2NVUB 1FQAA 3TQWA 4EQ9A 4G68A 2Y7PA 4AB6A 1JVYA 3KSJA 4KFQA 1XS5A 3SERA 3FV2A 1JW1A 3TYHA 1URGA 1AL3A 4YICA 1OVBA 1QKBA 1VFDA 2XXHA 4DCXA 3MJNA 2GHAA 4YAHX 1B2HA 1Z7ME 3W9VA 4LUBA 2P0SA 4PFTA 1B6HA 3K4UA 5DTBA 2OWTA 1TXFA 5I59A 1YPNA 3CG1A 1MQGA 4H8JA 1MG1A 1MXVA 3IOUA 1DSNA 3CR9A 3H3GA 3O66A 1IIWA 1FTMA 2DE3A 2XX7A 3V5AA 3N94A 1LLSA 3D4GA 4ONYA 2X7QA 5CI5A 2QS3A 3BBRA 4DLQA 1GTKA 3M3KA 4H1XA 2A5TA 4LA9A 3DELB 1UIUA 3MQ9A 4Z0IA 5ITPA 4OHNA 4ZDMA 1XC1A 3K1PA 3DLNA 1NH7A 4K3FA 4F3BA 1B0HA 5ISUA 4GXAA 5CMBA 1DPEA 5L9SA 4WKMA 3VVFA 3OO7A 3FJGA 3PPOA 3T9UA 1ZMGA 1DTZA 4ZZEA 4QSDA 2I4BA 2VD2A 3MVWA 2QS4A 5KZTA 3CSGA 5ICQA 2RC9A 5I57A 1FQFA 3F11A 3O29A 2VD3A 4ZZAA 3MUQA 5H8FA 2XD3A 2UVHA 3SEXA 1NNPA 3Q26A 4AQ4A 3O28A 2O84X 4KHZE 1MH4A 3S9EA 4FJPA 5TPAB 3QAXA 5H8QB 1MXXA 2B3BA 1OIBA 2ZNTA 2B65A 4JWXA 1NNKA 1J1NA 3N26A 4ZS9A 3MP6A 2H99A 1YAEA 1H44A 4OESA 1EZOA 4RY1A 4OEVA 4U2RA 5JK4A 3HHFA 1TFDA 4Z7EA 1SW5A 4G4PA 2RF1A 5A5XB 4BDLA 2ZXTA 2XX9A 5I58B 3KJTA 5EYFA 3SEYA 3PPRA 3VV5A 1TT1A 1URDA 2QS2A 1MY3A 2E0SA 1QULA 1SI0A 3FASA 1YTVA 1XVYA 2D5WA 2I4CA 4MFIA 1N3WA 1PDAA 4H8IA 3TCHA 4KCCA 2UVJA 1N3XA 4ELRA 4EUOA 2D21A 2PT2A 1B1XA 3PU5A 1MPDA 4N07A 5CM6A 2VOZA 5B7DA 4GOTA 2B3FA 4IO5A 2ONSA 3CSBA 4RYAA 1MQIA 3G3GA 4QFLA 3DP6A 3ZSFA 2DXYA 2RC7A 3MPLA 1LGBC 3C32A 4G68B 1SBPA 3G3FA 1LBCA 2DE2A 1ATGA 4YB6A 2XXVA 4YB7A 1ELJA 3O6IA 1JEUA 1ZBMA 4WEPA 2W7YA 4TOZA 1MH3A 3PD9A 3IX1A 5AA2A 2F6PA 2Y7WA 4F1UA 2DS9A 1Y3PA 2GHBA 2Q2CA 5I59B 2QMXA 1I6QA 3C33A 1PBPA 2HXWA 4LP2B 4THIA 2F34A 5DT6A 3FXQA 1M5EA 3L6HA 1I69A 1Y1ZA 3OSQA 4QRZA 1PB8A 2V93A 1VE4A 1A40A 2HZKA 2QJEA 4QHQA 2A5TB 3VDFA 2HAUA 3GZGA 1XOCA 1QUJA 4TQUQ 1R1NA 4LATA 3PUZE 4MBPA 1BTJA 4HW8A 4OZ9A 1ZU0A 4FAJA 2I0BA 2H9BA 4QF9A 1Y1MA 3KGCA 4NWDA 1SW1A 3FD3A 1MY2A 3OSRA 4POXA 5I2KB 1B1HA 4F2QA 3FJ7A 2I3WA 2Y7RA 3WAFA 1LAXA 3PMVA 3K6UA 4X48A 4TLLB 4ZE8A 1T0KA 5HBCA 3S4UA 2ZMBA 4OFJA 3VFJA 2PX1A 2AL5A 4F3PA 5I57B 3FXUA 2X26A 1Y3QA 5FTIA 5KCJA 3V83A 5H8FB 3Q29A 3PUWE 2P2AA 4F29A 3EQ1A 3SETA 1M5FA 4NWCA 1IXIA 2AL4A 3MC2A 1DTGA 2JODA 2ABHA 5BUUA 3ODBA 3RTWB 2OZZA 3MP1A 1MRPA 3HSTA 3T66A 5AA3A 3IOLA 4R6KA 3OMBA 4UA8A 1MY0A 1O64A 3RY3A 1UQWA 3USDA 4ZEDA 3K0VA 3S9NC 3ILTB 4E0WA 4R73A 2DYXA 1MQJA 3H6WA 4G8NA 1MS7A 4P11A 1P1QA 2PBWA 5IKBA 3S9MC 2DWJA 3T9XB 3ECRA 3H4ZA 3LSXA 4DDDA 2XXIA 4KI0E 4R72A 1A8FA 4U4SA 1N84A 3UP9A 3PPNA 3VXBA 1LBBA 4HTGA 2V3TA 3PUYE 2O1LA 4GD5A 4I9DA 2P1SA 2XXTA 3TPAA 4LVQA 3EF7A 5CRYA 3A09A 1B3FA 4IO4A 1MPCA 4ERSA 3Q27A 4F1VA 2UXAA 3PPQA 3E13X 1A54A 1ZIUA 3QXMA 3U8QA 3O6GA 4FEDA 4DLDA 2DVCA 4G8HA 3IORA 5ITOA 4ZEFA 2F7CA 4KD5A 2Y7IA 4EF2A 3OO9A 3HHGA 5J1DA 1MY1A 3LC8A 4GL8A 3UGWA 2DP8A 4ELPA 5AE4A 4Q8RA 4WXJA 4RK2A 3K02A 4XKPA 4DXCA 2ALUA 4JXIA 3DP4A 4YU0A 4YMBA 1Y4CA 3T96B 3L6GA 3H06B 2V84A 3E3KA 3CFLA 1M5DA 1URSA 4R9FA 1LB8A 3MZ9A 4KPTA 2XXUA 1US4A 4NF8A 4EXLA 1FTLA 3U94A 2Y84A 4PE5B 4U4XA 1RYXA 4YKPA 4O3CA 3V89B 4XKQA 1O63A 2QKHA 1FCKA 3QYTA 2F7BA 3TKDA 1AIVA 3KFMA 3V8XB 1Y4TA 2I49A 4MLVA 3KJ7A 1PEBA 3HN0A 1ZLQA 3O2AA 2QRYA 3SEVA 4PFYA 1JVXA 3I6VA 1H76A 1HSJA 2G29A 3RPWA 2REJA 4ND9A 3T9HB 4YB5A 2I58A 4H5GA 2FA7A 2O68A 2HQ0A 2O7IA 3FATA 1TWYA 3UA8A 4FORA 1I6AA 2THIA 4RPOA 3RTFB 5KCJB 3C4MA 4QFNA 2Z8EA 1B5HA 4R75A 4KCDA 4MLQA 4ECFA 1B0LA 5JTYA 1H3DA 3KN3A 3SEWA 3TAJA 4U21A 5H8SA 1P1OA 3ONMA 2HZLA 4JSOA 2E1SA 4DIGA 4LZ8A 1MQHA 5CMMA 2GFEA 5CMKA 4MH5A 4IB2A 3G7WA 2I6EA 2F36A 4PFWA 4ESXA 1A7LA 4Q0CA 2FNCA 3PGFA 4N13A 2XXQA 5JEIA 4BDOA 1CB6A 1B5IA 1UTHA 3C36A 1P1WA 2RCAA 2VHAA 4POWA 4F39A 4OENA 3FVNA 1AH5A 3LR1A 1LFIA 4OMBA 2F5XA 1VSOA 3TCFA 1II5A 3G3JA 5HM4B 1YCJA 2H25A 1QJMA 1H43A 3N7PA 3MAMA 3CFZA 3CRBA 1IXHA 3GXAA 5DYHA 3E9XA 3VLVA 1LCTA 2A5SA 3QK6A 4YKIA 1R9QA 4GIZA 4EXKA 5DVIA 1N0TA 4E0XA 1Y20A 3O9PA 1NH8A 2KLFA 1NNTA 3UIFA 5BWJA 3W15C 4ZE9A 2QMWA 3VLWA 2HAVA 4KYSA 2PT1A 1QVSA 2PYYA 3OO6A 5L8DA 1FTKA 4KYEA 2F6GA 3ZS6A 3MVZA 5CC2A 3MBPA 2DXRA 1POTA 4UACA 1L5TA 3H03A 1B7HA 3IOWA 4LQ2A 1M5CA 4TLMB 3B6QA 1FW0A 1SYHA 2NOOA 2O1MA 3AXFA 2ONRA 4KR5A 3R26A 4GXSB 3T93B 2L27A 4GLIA 1B46A 3CIJA 2LAOA 5L9MA 1USYH 3OD7A 1SI1A 2I0CA 1UTBA 4QFKA 4RPNA 3M3FA 3JZJA 3Q25A 4HCWA 1MDQA 3T22A 3IJOB 4F3SA 3TCGA 3PUXE 1MDP1 3SEUA 4M4GA 3HCQA 3OOAA 2I3VA 3K6WA 1N04A 3R6UA 4DE8A 1IUDA 4P0IA 5TU0A 4IY5A 5JTYB 1Y9UA 5ICTA 5CMCA 1EZ9A 1LAFE 1DMBA 3IK6B 5KDTA 3ZKKA 1LSTA 3N7RA 4OYVA 3MZBA 3D4CA 2O51A 1JETA 5M2VA 2Q9TA 4F31B 5FHMA 2QPQA 4G2ZA 1MM6A 1QUIA 3BFUA 4YMAA 1LFHA 1IXCA 1DPPA 1VFEA 2NWJA 1NFTA 4ZECA 1UTHB 2ZNSA 3U93A 3GBBA 1QUKA 1D9YA 1Z7NE 2BJJX 3OEMA 2OJTA 2F78A 4LQ5A 1ANFA 1B9JA 3MW0A 1MM7A 3OXNA 3KZGA 1EZPA 2DQVA 1IQ7A 5H8NA 4OFOA 4BDRA 3IJXB 2F35A 1LCFA 4NEDA 3N5LA 4XKNA 1WVJA 2X7PA 1H45A 3IO4A 4EQ7A 2XHDA 4R6YA 4H65A 1FTOA 1JQFA 4WEDA 2ESNA 4JBZA 2RC8A 3JV9A 5AA1A 2GRVA 5I84A 4QFPA 1OVTA 1R9LA 5HPQA 3U92A 1P1NA 4GL0A 4G68C 5I56A 1ZJLA 5FTHA 3GBAA 2V25A 3MPKA 3O6HA 1MPBA 3B6WA 3R7XA 1Y3NA 4OWDA 4NF6A 1OQHA 4PP0A 4LONB 1AOVA 2AIXA 4L17A 1S7YA 1B7ZA 4NTLA 2YPNA 3OENA 3SKPA 3IR1A 4ISUA 4NF5A 1LFGA 3VVDA 3Q28A 2F97A 5TPAA 3H6VA 4DLOA 3B6TA 4N6PA 4BDQA 5TP9A 1SYIA 3KG2A 3TTMA 4XTCQ 1BLFA 4P0GA 4ELOA 4OVJA 3PD8A 3M3LA 3C35A 3PV0E 3TELA 3K6XA 2VGQA 1GGGA 2XDGA 1A99A 4IY6A 3OELA 4OERA 2O7UA 2Q8JA 3MVYA 1RKMA 4BLAA 4I62A 4HJ0A 4RK9A 3RUMA 1B3LA 4F18A 3M8UA 3TUSA 3RGYA 4GWOA 1UTBB 1QKAA 4IGRA 2ZYOA 1NL5A 4FE8A 2ZNUA 4JB7A 3OO8A 5AA2B 1A8EA 5EHSA 3VXCA 3TZAA 4GF8A 3JYRA 3UN6A 4I1DA 4U23A 3PPPA 2CMOA 1B4ZA 4C1UA 4OFLA 4GFRA 3O97A 4DZ1A 1LB9A 3IB0A 1HSEA 5II0A 1FQEA 2REGA 2XXXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RNNA 4KQPA 4NMYA 3CFXA 3H7MA 2G93A 1P99A 2DOJA 5F7VA 3TEPA 1B51A 2JNCA 3U1OA 2H5YA 2OK2A 1GR2A 4H46A 4RA1A 4PQJA 2YLNA 1OMPA 1EU8A 4N81A 5KDTB 4OEUA 3LSWA 4PAFA 1OLCA 5AA4A 2PMSA 3CVGA 4NG7A 3GLBA 1YXIA 5DVJA 1Q35A 3LSFB 2JJKA 2FIXA 4O94A 3EHTA 1FJ9A 4QXDA 4MMPA 1IXGA 1ZTYA 2V3QA 4F2OA 4LF3C 5L9OA 4PF8A 3QUFA 3EN3A 3G3HA 5DEXA 3I3VA 4H5FA 4LZ7A 3S9LC 4JWOA 5ET7A 2OCUA 5H8NB 3B7DA 4ELQA 1RYOA 4N91A 2RKMA 4RNSA 4X9TA 1MXUA 1D3KA 2V3UA 4OXVA 5LOMA 2OLBA 4Q5TA 5I2NA 5I2KA 4X8RA 5EHMA 5I7IA 3T0JA 3C9HA 4IGTA 5IGAA 4OA4A 2DWHA 1FBFA 4OQOA 1FPEA 1Q9DA 4P1LA 3IAZA 1NI9A 3QMFA 4F22A 5I56B 5K2YA 3LUYA 3CG3A 4I8CA 1DOTA 1B3HA 1N76A 1B5JA 3MWBA 4NF6B 3FVKA 4G61A 3K01A 2D3IA 5F1QA 1FQCA 2XWOA 2JNDA 1FQBA 2XXWA 3KOTA 4NF5B 3IB2A 1JP4A 4N17A 4GQOA 2HFBA 4YKKA 4OTEA 1FBGA 1S9TA 1K9YA 2R6GE 2UVIA 3MZ1A 3FBPA 4XXUA 5TP9B 4EQBA 4NF4A 3SDFA 1EYJA 1IITA 1YYZA 4U1ZA 3P7IA 3C59A 1PB7A 4AB5A 3KEIA 2FIEA 2H98A 3T9VA 2ZYNA 1S50A 2Z8DA 3S2VA 3A29A 4YKJA 3SESA 1EYKA 1G0HA 1NKXA 1XI6A 3IOVA 3RN8A 1DBZA 4C0RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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