1JW1A

Crystallization and structure determination of goat lactoferrin at 4.0 resolution: a new form of packing in lactoferrins with a high solvent content in crystals
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
APRKNVRWCAISLPEWSKCYQWQRRMRKLGAPSITCVRRTSVLECIRAIAGKNADAVTLDDGMVFEAGRDPYKLRPVAAEIYGTEKSPQTHYYAVAVVKKGSNFKLDQLQGQKSCHMGLGRSAGWNIPVGILRPPLSWTESAEPLQGAVARFFSASCVPCVDGKAYPNLCQLCKGVGENKCACSSQEPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKETTVFENLPEKADRDQYELLCLNNTRAPVDAFKECHLAQVPSHAVVARSVDGKENLIWELLRKAQEKFGKNKSQRFQLFGSPEGRRDLLFKDSALGFLRIPSKVDSALYLGSRYLTALKNLRETAEEVKARCTRVVWCAVGPEEQSKCQQWSEQSGQNVTCATASTTDDCIALVLKGEADALSLDGGYIYTAGKCGLVPVMAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIANQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSSLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESSADWAKNLNREDFRLLCLDGTTKPVTEAQSCYLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEKYLGTEYVTAIANLKKCSTSPLLEACAFLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Crystallization and structure determonation of goat lactoferrin at 4.0A resolution: A new form of packing in lactoferrins with a high solvent content in crystals
pubmed rcsb
total genus 99
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw1A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw1A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw1A03
1N7WA 4JWOA 4DCYA 1JEVA 1IXGA 3OEKA 4NF5A 2I49A 4LA9A 4ELRA 3AXFA 3H6VA 3K1NA 3OELA 4LQ2A 2XXUA 4GWOA 2DOJA 5FTHA 1BLFA 4DDDA 3U93A 3MP6A 3ECRA 2E0SA 4YKPA 2HAVA 1S7YA 3CSBA 1MY1A 3JV9A 4C1UA 4X1BA 2ANJA 4LQ5A 4NF8A 5L9SA 4NMYA 3OO9A 4WKMA 4ONYA 3QAXA 3V89B 1XVXA 4YU0A 2QMXA 3TEPA 1LBBA 4LONB 4WEDA 4H8JA 4F1VA 1B3EA 1Y3PA 2HEUA 3MUQA 1DPPA 1MXWA 5CMCA 3TMGA 4OXVA 1IZ1A 2OWTA 2B3FA 1P1OA 4PFUA 3TFLA 3M3FA 5H8FB 3QYTA 3SEYA 2F7CA 1R1NA 4PFTA 1GTKA 1SQYA 3K1MA 1DPEA 4RYAA 4FAJA 4ZEFA 5TU0A 1WODA 3FD3A 4NEDA 2WKYA 1BP5A 1MRPA 3TAJA 4MH5A 4RA1A 4L17A 3K4UA 3TDJA 3M3KA 3IOVA 3C32A 4U1OA 1ZMGA 1A54A 3QUFA 5I2NA 1FQFA 1XS5A 4Q8RA 4BDMA 1B40A 4NF6A 2LAOA 1B05A 4F29A 4XKRA 4H6DA 3ILUB 4HW8A 1R9QA 3SEVA 4ZE8A 4R75A 4F3SA 4OYVA 4YMAA 4IO2A 3K0VA 2FNCA 1MM6A 1SI1A 1MPDA 4DE8A 1XT8A 1FTJA 3RT8A 4TQUQ 4NTLA 4XTCQ 3MVYA 1A7LA 1ZKBA 2YPNA 2F97A 3KN8A 4OENA 3TUSA 2YJPA 2H99A 4O3AA 3G7WA 2I3WA 2PT1A 3W15C 4H5GA 4QFNA 3T9HB 4ECFA 3RN8A 2UVHA 1SBPA 2B65A 3W9WA 1OQHA 3IB0A 1MXXA 1II5A 3KN7A 1OMPA 5JEIA 2ZYOA 3OSRA 3FUZA 2R71A 3K6XA 1M5FA 1NH7A 3CG1A 4EF1A 4ESWA 3H6WA 4LZ7A 1Z7NE 4O3CA 2GHBA 5FHMA 1OVBA 1L5TA 4R9GA 3HCQA 3IB2A 4RJZA 1MQHA 1A55A 1B5IA 1ZIUA 2A5TA 4PETA 3SESA 2XXRA 1B3FA 3VLWA 5ITPA 1MQDA 3PD9A 3RQTA 1O63A 1FQEA 2W7YA 4U4SA 3O97A 5FHNA 1B32A 1JVXA 3S2VA 5H8HA 3K6UA 1QULA 5EHSA 5A5XB 2QS4A 2PVUA 2YLNA 3PUVE 5AA3A 1NMUA 2E1SA 1H76A 1FTOA 4Z0IA 2D21A 1MH3A 2AL5A 3L6GA 1B4HA 1QJMA 4KI0E 5F7VA 1B7UA 1PB8A 4F22A 1MDQA 1QUIA 5I58A 1FQAA 3TELA 4C0RA 2O1MA 1N84A 1JQFA 1TWYA 4ZDMA 2XXXA 3Q28A 3Q26A 2O69A 4DXCA 3RNNA 4KR5A 3EHUA 1Y1ZA 4KYSA 1MXVA 4EXKA 5ITOA 2ONSA 2XXVA 2F7BA 3QXMA 4Q5TA 1ZJLA 4P11A 2DE4A 3IORA 1B46A 3GXAA 2PBWA 2H5YA 4MFIA 1Y3NA 3FXQA 2Q89A 5CMMA 3PD8A 1NNPA 2OJTA 2Z8FA 2I3VA 4RPOA 2GFEA 3LC8A 1KWHA 4ZE9A 5I56B 1H44A 4Z7EA 3QUJA 1N3WA 1UQWA 3LR1A 1UTHA 2G29A 4FATA 4NF5B 4PFYA 4QRZA 1VFDA 2Z8DA 2F78A 4QFKA 4JWYA 3FVGA 4LZ8A 1BKAA 1FW0A 3C9HA 4IO4A 1B0HA 3OOAA 4HS7A 1Y4TA 1WVJA 4G8HA 3ZSFA 3VVDA 1YAEA 4R6KA 3TTKA 1B3GA 2OWSA 3MW0A 2ZNTA 2DQVA 3C34A 1AOVA 1LB9A 3KGCA 3IB1A 3CFXA 3SKPA 4BDNA 3UGWA 2F35A 3HHGA 4H67A 4OHNA 4ZEIA 1SI0A 1QUJA 3IL1B 4JSDA 2XXYA 4ZEBA 4LATA 3MWBA 1B51A 4TLMB 4R2BA 1QKBA 4KCCA 1NNTA 1MXZA 1SVXB 2FA7A 3SETA 1FTKA 5AE4A 1NKXA 4MLQA 1A8EA 1N76A 4OTEA 4QSEA 3Q29A 4OERA 5DYHA 1B9JA 4E0WA 2I58A 2DXRA 1Q35A 1D9YA 1D4NA 3EF7A 1VFEA 5CBSA 3EPEA 3MZ9A 3N6TA 5KDTB 2ZMBA 3SERA 2NVUB 4M1VA 3TQLA 3TQWA 4U23A 5AA2B 2QRYA 2DS9A 4U22A 2PYYA 3T9VA 1VR5A 2UVJA 2NUVA 1SYIA 4AQ4A 2XXPA 4RXLA 4TOZA 3T96B 1FQCA 2M8CA 3CIJA 3FV2A 3PU5A 1M5BA 4F39A 3C33A 2AIXA 4JDFA 3RT6B 5IAIA 2GRVA 2DP8A 2QS1A 3PMVA 3CRBA 1US4A 1JNFA 3DM0A 3K02A 3OO8A 4H5FA 5B7DA 4RK2A 1XC1A 5CC2A 4IY6A 2ONRA 3IOTA 1CB6A 1UIUA 1EH3A 1MXUA 2Q2CA 5I57A 1UTBA 4PE5B 4F3BA 3FATA 3H06B 2ZNUA 4F2OA 2OZZA 1H45A 4GL8A 4H1XA 1MY4A 3MZ1A 4PQJA 3FXRA 1TXFA 5JK4A 1PBQA 4ISUA 2Q88A 3WAFA 2X7QA 4DLDA 5DTBA 5I2KB 3G3JA 1S9TA 3GBBA 2B3BA 5H8SA 3BFTA 2O1LA 4G68C 3UIFA 3MBPA 2I48A 4EUOA 1Q1KA 3HV1A 2AL4A 3VXCA 4OMBA 1M5DA 3OEMA 3N26A 4OEUA 4X9TA 5AA4A 2I0BA 1BTJA 4P0GA 1B3LA 1B1XA 4G8MA 1LCFA 1USYE 5DVJA 3DELB 4YZZA 4YB7A 4EQ9A 3T66A 4G77A 4KPTA 2O68A 4KYEA 4R6YA 1IUDA 1URSA 4NE4A 1A8FA 1LAHE 2V93A 2X26A 4GXAA 3FVNA 2Z22A 3RTFB 1B7ZA 1MDP1 1AH5A 3OO6A 1US5A 3PPQA 1P1NA 2DVZA 2VOZA 1R6ZA 4RPNA 4DZ1A 1D3KA 4EQBA 1RYXA 5JTYA 3S9NC 3UA8A 4M4GA 5CMKA 2CZLA 4ESXA 5H8QA 4FECA 3IO6A 2X7PA 4N07A 4QSCA 1B5JA 5I59A 4OESA 3R7XA 1PEBA 3U94A 4YKJA 2HZLA 1DMBA 2V25A 4G68A 5AA2D 2HQ0A 4Q30B 3MP1A 2UXAA 4YMBA 2REJA 3OMBA 1B7HA 4OVJA 1B1HA 4LVQA 1MXYA 1MS7A 3MQ9A 3TTNA 3PPOA 2F6PA 5TPAA 3E3KA 4YKIA 2Q2AA 1OLAA 4P0IA 4GF8A 3KN3A 3KBRA 2QS3A 2XXQA 1I6QA 1LAFE 3ZKLA 4FIMA 2Y84A 2P2AA 3CFZA 1YTVA 1LFIA 1M5EA 2O84X 4N6PA 2THIA 3IO4A 3B6WA 3RTWB 3GBAA 5FTIA 3VDFA 3IR1A 4QFOA 3IOWA 3O28A 4K3FA 4LP2B 4DXBA 3LBSA 2V3QA 3UORA 3TCHA 4FORA 2O51A 3FJ7A 2I4CA 3O6IA 5I84A 2DXYA 3MJNA 1OIBA 4XKNA 2QSXA 3VVEA 3DP6A 1HSJA 3HPIA 3N94A 1PBPA 3V5AA 3LSXA 4FE8A 3N6UA 1ANFA 4YICA 3HN0A 2F6GA 5L9OA 1F9BA 4I8CA 3PV0E 5BUUA 1MM7A 1N3XA 2DSFA 4GXSB 3KSJA 4QSDA 3IAZA 1TFAA 1QUKA 3TZAA 1MPCA 2PX1A 3P7IA 3G3FA 3EHTA 3EQ1A 3C36A 3T9XB 4KQPA 4ELPA 2DWAA 3ZS6A 4IY5A 4POWA 4XXUA 4YB6A 2H9BA 2UVIA 3TYHA 5H8NA 4GLIA 3USDA 4OFOA 4MF3A 4BDOA 2ZYNA 1Z7ME 3G3HA 1D9VA 2ONKE 3IJOB 2HXWA 1MH4A 1ZLQA 1YPNA 2UVGA 5ICTA 3JYRA 3SEUA 2DVCA 4XIGQ 3O6HA 5DEXA 2UYFA 1Y9UA 4DCXA 3CVGA 4YKKA 5TP9B 3FIRA 1FTLA 4KCDA 4BDLA 2VD2A 4GL0A 1MQGA 1FCKA 3EHSA 4QF9A 2VP1A 1P1WA 3QIMA 3MPLA 2F36A 4HCWA 4KYDA 3WAEA 3T22A 1N0TA 4LZ5A 5B70A 3O66A 3D4GA 2P1SA 4X1DA 1LB8A 1N7XA 3PGFA 2HAUA 3KZGA 1EU8A 3I5OA 4RK9A 1HSEA 3KEIA 4FEBA 2OLBA 4QFLA 3UK4A 1T0KA 4NF8B 4F2QA 1SD3A 1NH8A 3PUYE 4EF2A 1FQBA 3KFMA 3S9LC 1O64A 3U72A 4H65A 3MC2A 4JXIA 5A5XA 1OQGA 3W9VA 3MPKA 4U4XA 1IXIA 4FEDA 1ZBMA 2RCAA 2RKMA 1SW2A 4IO3A 1O7TA 4MBPA 2HFBA 2UYEA 4IGTA 3PUXE 1JW1A 3PPPA 4PFWA 3T9UA 3O9PA 5BWJA 2GHAA 3GZGA 3UN6A 5CRYA 3PMXA 1JW4A 4ZECA 3IOUA 2Y7WA 3SEWA 4U1ZA 5IKBA 2I0CA 3O29A 4KFQA 1LBCA 3OD7A 1IEJA 3PPNA 5I2NB 1DTGA 3KJ7A 3FJGA 1LCTA 2VD3A 3DLNA 4NF6B 3KJTA 4IO5A 2RINA 4MLVA 4BDQA 2I6EA 3IX1A 3H4ZA 3HSTA 3M8UA 2A5SA 4F18A 1PB9A 3KG2A 4R72A 5KZTA 1RYOA 3N5LA 2RCBA 4O3BA 2RF1A 3PUZE 5I59B 2F7AA 4QFPA 1Y3QA 5I56A 1LAXA 2NXOA 1M5CA 4G68B 3TCGA 4ND9A 4C1TA 2ALUA 5K2XA 2Z8EA 3CFLA 2XD3A 3QSLA 4N13A 1GGGA 1SW4A 2Z23A 1SW5A 5TPAB 4OQOA 4HCYA 1B2HA 3VLVA 1IQ7A 3RPWA 1Y20A 2H25A 3TPAA 3U1OA 1SYHA 2DE2A 2NOOA 2F5XA 4U2RA 1NL5A 2BJJX 3MVXA 1XOCA 3OSQA 2G93A 2O6AA 1IIWA 1B52A 3I3VA 4JWXA 3ZKKA 3KSXA 2P0SA 4AB6A 3PUWE 4WXJA 2Y7RA 1B0LA 3LUYA 2D5WA 3BKIB 3H03A 5FHOA 3VV5A 1IITA 4R74A 2DWIA 4POXA 3VLUA 1LGBC 2A5TB 3C4MA 3FZVA 3ONMA 4I1DA 4GQOA 2DE3A 2I4BA 4X48A 3LSFB 5CBRA 4GVOA 5EYFA 3SEXA 3I6VA 3E9XA 3Q25A 2AYSA 5KDTA 3FV1A 3A3UA 1IXCA 1OVTA 3S9EA 3MZBA 5H8HB 3E13X 5DT6A 4NF4A 5AA2A 4F19A 1DTZA 3S4UA 1IXHA 3R6UA 3VVFA 4ZZEA 5KCJA 3O2AA 1ZU0A 1R9LA 3FJMA 4G4PA 1MG1A 1I6AA 1RKMA 4FJPA 4H8IA 3TCFA 2OK2A 4OEVA 4U21A 1P99A 5I58B 2R6GE 1B3HA 1B5HA 3IK6B 1LFGA 2V84A 4F1YA 5H8NB 1CE2A 1LSTA 1SDXA 1LFHA 1MY2A 3THIA 1DSNA 5CM6A 2RC8A 4HTGA 1J1NA 5ELVA 5K2YA 5M2VA 4LUBA 3H6UA 1OLCA 3FXUA 4BDRA 1Y4CA 1S50A 2QPQA 1ELJA 2XXWA 4YAHX 2Y7IA 3CSGA 5DEXB 3BBRA 3FVKA 1N04A 4H0WA 4XKQA 3K1PA 4IB2A 3KOSA 3ODBA 5I2KA 3CG3A 1QW0A 3CI8A 2ZXTA 4IO6A 1VE4A 1JW5A 2HCAA 4JSOA 4F1UA 2XX7A 4THIA 5ICQA 3TTRA 3D4CA 3MAMA 1UTHB 3JZJA 2R9JA 2ESNA 4TLLB 5H8FA 3RUMA 5CMBA 1LAGE 3F11A 4KD5A 4G2ZA 1AIVA 2RC9A 3HHFA 2VHAA 2H4IA 4I9DA 2F8DA 3A09A 3TODA 2IA4A 2DWJA 4UACA 2O7UA 4JBZA 2XD2A 1EZPA 2V3UA 2VGQA 3O6GA 3QK6A 3K6WA 4R9FA 1A40A 1BIYA 1LLSA 4QHQA 1ATGA 2OBGA 2QL3A 1JVYA 3V83A 4OFLA 5CI5A 1GR2A 2ZYMA 1B58A 3GLBA 2PT2A 3VXBA 1H3DA 2FYIA 3K00A 2H98A 1NNKA 3VE1B 5EHMA 3KOTA 4GRKA 4IGRA 4ZEDA 4XKPA 4WEPA 1B4ZA 4Q0CA 4OZ9A 1GV8A 1JETA 3RY3A 1TT1A 3FASA 2D3IA 3MVZA 4R2FA 1TFDA 3SDFA 4ZEKA 4KHZE 5F1QA 2XX8A 2Y7PA 4ZS9A 1PC3A 4RNSA 4F3GA 5HBCA 3ILTB 1H43A 2CMOA 3TKDA 2XXIA 3L6HA 3A3CA 3B6QA 1EZOA 3MVWA 3IJXB 1PDAA 4EQ7A 1QKAA 1HSLA 4ELQA 2O7IA 3CR9A 4OFJA 4EDPA 2IEEA 3K01A 3T93B 3K2DA 4BLAA 1I6BA 1MY0A 4JB7A 1XVYA 1POTA 5LOMA 2QJEA 1PB7A 2ZYKA 4DXUA 4NWDA 1EZ9A 2REGA 3EN3A 3LSLA 2RC7A 1MY3A 3OO7A 1POY1 4GOTA 1I69A 1UIVA 1FQDA 3U8QA 4F3PA 2QMWA 1NFTA 3PMWA 3H6TA 3BFUA 3Q27A 3DP8A 3G3KA 1P1QA 4F31B 2ZNSA 3V8XB 4IO7A 5I57B 3MP8A 4NWCA 5L9MA 1UTBB 4GIZA 2XX9A 1MPBA 4E0XA 2XHDA 5AA1A 2XXHA 2NWJA 1VSOA 2Q8JA 4ZZAA 3PPRA 5L8DA 3H3GA 2KLFA 4OWDA 2Y7KA 3FGSA 3DP4A 1YCJA 3LSWA 3RGYA 3S9MC 3B6TA 3R26A 3TTLA 3B7DA 4AB5A 3C35A 1MQIA 4R73A 3VFJA 5J1DA 1GVCA 4RY1A 3U92A 2GH9A 3OENA 5DVIA 4EXLA 1SW1A 3H7MA 2F34A 4OETA 1MQJA 1JEUA 1XHYA 5AA4B 4UA8A 1AL3A 2OCUA 3FVOA 2Q9TA 4GFRA 2PMSA 1B6HA 3M3LA 2HZKA 2DYXA 1P1UA 3RLFE 3OXNA 3E4RA 4G8NA 3HO7A 4PP0A 1URDA 3UP9A 2V3TA 1WDNA 5DVFA 1DOTA 2DWHA 4ELOA 2QS2A 1URGA 1FTMA 5TP9A 3G3GA 4NF4B 1Y1MA 1QVSA 1USYH 5JTYB 4GD5A 5KCJB 4I62A 3C31A 5ISUA 2ABHA 5H8QB 1AMFA 4DIGA 2XXTA 3G3IA 4R6HA 1A99A 1ZTYA 1NNFA 3TTMA 4YB5A 5HPQA 5HM4B 3K6VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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