1JW1A

Crystallization and structure determination of goat lactoferrin at 4.0 resolution: a new form of packing in lactoferrins with a high solvent content in crystals
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
APRKNVRWCAISLPEWSKCYQWQRRMRKLGAPSITCVRRTSVLECIRAIAGKNADAVTLDDGMVFEAGRDPYKLRPVAAEIYGTEKSPQTHYYAVAVVKKGSNFKLDQLQGQKSCHMGLGRSAGWNIPVGILRPPLSWTESAEPLQGAVARFFSASCVPCVDGKAYPNLCQLCKGVGENKCACSSQEPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKETTVFENLPEKADRDQYELLCLNNTRAPVDAFKECHLAQVPSHAVVARSVDGKENLIWELLRKAQEKFGKNKSQRFQLFGSPEGRRDLLFKDSALGFLRIPSKVDSALYLGSRYLTALKNLRETAEEVKARCTRVVWCAVGPEEQSKCQQWSEQSGQNVTCATASTTDDCIALVLKGEADALSLDGGYIYTAGKCGLVPVMAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIANQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSSLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESSADWAKNLNREDFRLLCLDGTTKPVTEAQSCYLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEKYLGTEYVTAIANLKKCSTSPLLEACAFLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Crystallization and structure determonation of goat lactoferrin at 4.0A resolution: A new form of packing in lactoferrins with a high solvent content in crystals
pubmed rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 99
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw1A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw1A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jw1A03
3MAMA 4RPNA 3IX1A 4G68A 5FTIA 4ELPA 1LLSA 1Y1MA 4DXBA 1AOVA 3LBSA 2VD2A 4KQPA 1MXXA 3FXQA 5TU0A 4NF8A 1ZLQA 1BLFA 4LZ5A 4OENA 1MM7A 2B3FA 4G77A 4GF8A 1UTHA 2Q88A 1O63A 2RINA 4KYEA 4ONYA 2XXQA 4H5GA 2Y7PA 4R6KA 1LBCA 2XXYA 5DT6A 2R9JA 4PFWA 5H8FB 3SEVA 4R74A 4R9FA 1ZMGA 4IGTA 3CG3A 1NNKA 2I49A 4AB5A 5HM4B 2ZYKA 4QSDA 1N84A 1QUKA 1ATGA 5B7DA 1YPNA 3UN6A 2Z8EA 2I0BA 1JW4A 5CI5A 3Q27A 3MZ1A 1J1NA 1Z7ME 4C0RA 1OVTA 4P0GA 4TOZA 1QULA 2QSXA 1M5EA 5ITOA 2NWJA 4E0WA 1FQAA 3K2DA 1R9LA 1EZ9A 4OMBA 1UTBA 2I58A 4OFOA 1H43A 1SYHA 3ILUB 4H8IA 3MP1A 3RNNA 3TODA 3CVGA 1Y4CA 2DP8A 3B6QA 4ZEIA 1OMPA 5DVFA 3FJGA 3KG2A 2XX8A 1LAHE 4OXVA 3U1OA 3V89B 3R26A 5CRYA 3U72A 2PT2A 1GVCA 1PC3A 5DTBA 3RTFB 2THIA 3UP9A 2VOZA 4ECFA 4YAHX 1DTGA 2RCAA 1YCJA 3K6WA 1LAGE 3HHFA 1RYOA 5H8FA 5K2YA 2PYYA 1MH4A 3FD3A 2NXOA 3C31A 2RC8A 4PQJA 1OLCA 2QS1A 3RY3A 4BDRA 4NWCA 4U4XA 4QSCA 3FIRA 1MXWA 2F6GA 4ISUA 5I59B 3H4ZA 3BKIB 2XXWA 2RKMA 1B3EA 1MM6A 3I6VA 1TWYA 2W7YA 4KYSA 1B40A 2B65A 5H8NB 1HSLA 1NNTA 5KZTA 4M4GA 4BDNA 3ILTB 3KOSA 5ICQA 2OK2A 1LCFA 4KHZE 1WVJA 3QIMA 4WEPA 1Z7NE 3OO8A 5FTHA 2XXIA 4YMBA 1IXHA 4N07A 3K00A 1LFHA 3SEWA 3FV1A 3KN3A 3IORA 1M5FA 3T22A 2PVUA 4RNSA 3EHUA 4XIGQ 4F1YA 3GBAA 1O7TA 4O3CA 3CI8A 2XD2A 4IO5A 1IUDA 1ANFA 1EU8A 3IB0A 3H7MA 3FVKA 1N7WA 5CBSA 4OFJA 3VXBA 4GRKA 4I1DA 5IAIA 3O6GA 1B5IA 3MZ9A 4MLVA 2F78A 4FJPA 4U1ZA 2V25A 4ELQA 3EPEA 4ZZAA 4P0IA 1MY1A 1R1NA 1PB7A 3DELB 1CE2A 4U22A 1B58A 3HHGA 4YICA 3PUWE 1B0LA 1B5JA 3KZGA 4JBZA 3TEPA 1M5BA 4EQBA 1N3XA 3TKDA 3DP4A 5I59A 3Q29A 3MP6A 2V3QA 4LZ8A 1LCTA 1FQFA 3TMGA 4ELRA 4Z7EA 4ZEKA 5H8NA 1O64A 1N3WA 4RA1A 2H5YA 1EZOA 4U23A 4N13A 1Y3QA 2YJPA 4G2ZA 1NL5A 2YPNA 3S9MC 1B46A 3CFLA 4IO6A 2V84A 3CSBA 2V93A 4GXAA 3MQ9A 4I9DA 1HSJA 3G7WA 3ZSFA 1M5DA 2GHAA 3E3KA 4ZEFA 1CB6A 3PD9A 4Q30B 3T96B 3IJXB 1SD3A 4IO4A 2UVHA 1FW0A 4I8CA 1PBPA 1D4NA 3MBPA 1MY4A 2ZMBA 4NE4A 5JTYB 1DPEA 4LATA 3O29A 5H8HB 2REJA 1S50A 1TFAA 4YKJA 3O6HA 3BFUA 3QK6A 1D3KA 4F2OA 4ZE8A 2UVJA 3MZBA 3HPIA 4ZS9A 4HW8A 2Z8FA 2DSFA 2X7PA 4FE8A 4RXLA 4WXJA 2X7QA 4F1UA 2OBGA 3M3LA 3EN3A 1MQGA 2PX1A 4ZECA 2F8DA 3TZAA 4BDMA 3E4RA 2GFEA 2E1SA 2I3VA 4F22A 4FECA 3T9VA 2HFBA 1JETA 3A09A 3TTLA 4YKKA 3I5OA 4EXLA 3RT8A 4GD5A 3OEMA 2CMOA 1ZU0A 2XXVA 2F7BA 4KFQA 5AA2B 5L9OA 4LUBA 3SEUA 1FQBA 3ODBA 4Q5TA 1I6AA 3KSXA 4H8JA 2O84X 2AIXA 3IO4A 3PUYE 3N26A 3OSQA 5H8SA 2KLFA 4OEVA 2GRVA 2DS9A 4KCCA 3A3CA 4WEDA 2Y7IA 2Q89A 4DCYA 3S2VA 5KDTA 1JEVA 1SQYA 4F3BA 1YAEA 2Y7WA 3M8UA 3SDFA 1A7LA 3QXMA 3IO6A 4FEDA 5JTYA 3LSLA 3U93A 1GV8A 1FTKA 5H8HA 3V83A 3A3UA 4GXSB 3DP6A 4LZ7A 1IQ7A 4IB2A 2HZKA 2Q2AA 3K1PA 3TAJA 4YB7A 3QYTA 3MUQA 2H25A 3B7DA 4MH5A 1MS7A 3BFTA 3TCGA 4F19A 3FXUA 4EF2A 1LB9A 3H03A 1YTVA 3MVZA 3TDJA 1BKAA 2D5WA 4OFLA 5HPQA 1XVXA 3TPAA 2REGA 2GH9A 3HO7A 4NEDA 1B7UA 1P1UA 2F7CA 4OTEA 3PPRA 3CG1A 4BLAA 4YB5A 1IXIA 4ESXA 4F31B 5KCJB 3PMXA 5I2NB 5L8DA 4F2QA 2I6EA 2F5XA 3FVOA 4NF6A 2ZNSA 5AA2A 4L17A 2QL3A 4RPOA 3FATA 4H1XA 2I48A 1FQEA 3H06B 4QFLA 3H6VA 4U1OA 2UYFA 5JK4A 1MRPA 1FCKA 4YU0A 2OWTA 4P11A 3RT6B 3O97A 1JW1A 4PETA 4U2RA 3S9NC 3K6VA 1MPDA 1NKXA 3RTWB 3G3KA 3EHSA 2XHDA 3U8QA 3OO6A 2G93A 1OIBA 3IB1A 1II5A 2AYSA 4M1VA 3FXRA 1M5CA 5CBRA 2DE3A 4FORA 2ZYNA 3PUXE 1A54A 2RC9A 4RK9A 2XX9A 4ZE9A 4XTCQ 1B3HA 1LAFE 5H8QB 2HQ0A 3M3KA 4R2FA 5FHMA 2DWJA 2R71A 2O1LA 1JVYA 3MW0A 1JVXA 4IY6A 3O6IA 1TT1A 1SI1A 3G3GA 5DYHA 3OO9A 4R2BA 4R6YA 4IO3A 4X48A 1N76A 2NUVA 4LVQA 4MBPA 1QKBA 3OMBA 3FUZA 2G29A 3TTMA 3R6UA 1I6BA 3C33A 4H0WA 3OENA 2NOOA 4OQOA 1VSOA 2QMXA 1MDQA 1XC1A 2Z22A 1MXVA 1ZKBA 3VVEA 2ALUA 3SESA 5KCJA 2QRYA 3PPOA 3KEIA 1P1NA 3ZS6A 1TXFA 2H4IA 1A55A 4IY5A 4LONB 2RC7A 4TLMB 4IO2A 3N94A 2Y7RA 4IGRA 2QS2A 3HCQA 2Z23A 1Y4TA 4XXUA 1H3DA 1RKMA 3TQLA 4I62A 4Z0IA 3G3IA 3KN8A 4RK2A 3HV1A 2OCUA 3K1NA 3N6TA 1JNFA 2Q9TA 5FHNA 1LAXA 4YKIA 4KYDA 3W9VA 4NMYA 3CR9A 4UACA 4KD5A 3RQTA 2HAVA 3O28A 1LFIA 4NWDA 4XKRA 4O3BA 3OELA 2GHBA 5ICTA 1P1QA 4RY1A 4OWDA 2XXTA 1B51A 2I3WA 1MY2A 2VP1A 3MJNA 3WAFA 2F7AA 3IB2A 5H8QA 3JZJA 4JWYA 4U21A 4MLQA 3PUVE 4OZ9A 3CIJA 1MPCA 3LSWA 5AA4B 4DE8A 1IITA 2DYXA 4LQ2A 1A8FA 1EH3A 3VLUA 3FJ7A 1NNFA 2IEEA 5AA2D 1AH5A 3MC2A 5TPAB 3U94A 4JDFA 2DXYA 1IZ1A 3V8XB 1SW1A 1D9YA 1PDAA 3PMWA 1OVBA 4OETA 2F35A 4ELOA 4FEBA 2H98A 3K6XA 4YKPA 3M3FA 5I84A 4G8NA 2P1SA 3CRBA 2BJJX 1MQDA 3MVYA 2XXPA 5F1QA 4DXCA 4YMAA 1D9VA 3PU5A 4OVJA 2A5TB 1XHYA 3P7IA 4OERA 3N5LA 1DMBA 3DM0A 2DWAA 1JQFA 3B6WA 1US4A 1B7HA 4H67A 1DOTA 5DEXB 3LSFB 2H99A 1LBBA 1S7YA 3T9XB 3IOTA 1DTZA 4X9TA 3H6TA 4F18A 3T66A 1Y20A 4BDQA 3RGYA 1B05A 1QW0A 1MQHA 1JEUA 5AA4A 3OD7A 4Q0CA 4F39A 3MVWA 4DDDA 2XXHA 5IKBA 5M2VA 4EUOA 1Q35A 2OZZA 1FTJA 1URDA 5TPAA 4ZZEA 2R6GE 1IXGA 2FYIA 3C34A 1ZIUA 1T0KA 4POWA 4ZEBA 1ZTYA 3S9EA 1SYIA 4GFRA 4ZEDA 2F34A 1R6ZA 3T93B 4DIGA 3DP8A 1N0TA 2HXWA 4AB6A 2DXRA 2HEUA 2V3UA 3RUMA 1Y1ZA 1HSEA 3PMVA 3OXNA 3IL1B 3W9WA 4EQ9A 3UK4A 3Q28A 1NMUA 3QAXA 2VGQA 3SKPA 3WAEA 2XXXA 3LC8A 1IXCA 2UXAA 1B5HA 3PPNA 5AA1A 4C1UA 3PUZE 3K6UA 3GBBA 4QSEA 3TCHA 3UORA 1UTHB 4HTGA 5J1DA 1EZPA 5CM6A 1JW5A 3VE1B 1DPPA 4X1BA 4F3GA 2RF1A 5I2KB 2Y7KA 3Q26A 4PFTA 5CMBA 5TP9B 5BUUA 2RCBA 3MPLA 4KI0E 4EQ7A 4XKQA 3LR1A 3IK6B 4PE5B 1I6QA 1Q1KA 2CZLA 5F7VA 4XKPA 4ZDMA 3GZGA 4QFPA 2E0SA 3FVGA 2ZNUA 2ABHA 1B6HA 1BTJA 4DLDA 3IOVA 2PT1A 2I0CA 3IOWA 3MP8A 3SETA 1XT8A 2ONKE 3SEXA 3PD8A 3K02A 1XOCA 3JV9A 3CFXA 3KBRA 4GIZA 4KPTA 2DVCA 1UTBB 3MPKA 2H9BA 2I4BA 4IO7A 2XXUA 3D4GA 5CC2A 2Y84A 1R9QA 1VFEA 4H5FA 3TTNA 1PBQA 1P1OA 1IIWA 3FJMA 2Q8JA 3K01A 4UA8A 1NH7A 1GTKA 2IA4A 1GR2A 5ISUA 3IOUA 4X1DA 4QHQA 2P2AA 1QKAA 3O66A 3PPPA 3SERA 1B52A 2DWHA 3UGWA 3TTRA 5I2KA 3C35A 1ELJA 4PFUA 5TP9A 1MQIA 1QVSA 3G3JA 3IAZA 1MY3A 5L9MA 2VD3A 3V5AA 3IR1A 3L6HA 1B32A 2O1MA 3PGFA 3VV5A 4E0XA 2O68A 4FIMA 4GOTA 3EF7A 3VLWA 4QFKA 4AQ4A 4O3AA 1H44A 4POXA 1MG1A 1P99A 1FTLA 1Y3PA 3VVFA 3FZVA 5CMMA 5ELVA 2V3TA 1B9JA 1AIVA 1WDNA 4N6PA 5L9SA 5ITPA 4WKMA 1BP5A 3K4UA 2ONSA 3PPQA 2ZXTA 3UA8A 3D4CA 3KOTA 3L6GA 3RLFE 1XS5A 5B70A 2NVUB 3R7XA 1IEJA 1POTA 4C1TA 4LP2B 1ZBMA 5DVJA 5JEIA 3G3FA 3W15C 3UIFA 1URGA 1USYH 5EYFA 3MWBA 1UIUA 5I2NA 3TELA 1B3FA 2LAOA 1VR5A 1QUIA 4KCDA 1H76A 1MY0A 1NFTA 3QUFA 3OEKA 1PB8A 2YLNA 1QUJA 3H3GA 1B0HA 5EHMA 1WODA 3VFJA 1LGBC 2OJTA 3H6WA 1NH8A 2X26A 3O2AA 1FQCA 3TTKA 4F3SA 2FNCA 1USYE 1TFDA 3FASA 2F36A 2UYEA 3N6UA 3O9PA 2PMSA 4GVOA 3USDA 1FTOA 1PB9A 1B1HA 4H65A 1UQWA 1SDXA 2D3IA 2I4CA 3U92A 4JXIA 4QF9A 3TCFA 3PV0E 4XKNA 4LA9A 1SW2A 5K2XA 2P0SA 3CSGA 4NTLA 3ECRA 2O69A 4JWOA 2ZYMA 3E9XA 3HN0A 1SBPA 1MXZA 3VVDA 4ND9A 2OLBA 2XX7A 2F6PA 1B3LA 2HCAA 3OO7A 3KGCA 4F1VA 2QJEA 4G8MA 4NF4B 1OQGA 3SEYA 3F11A 4BDOA 2OWSA 4OESA 1MXUA 5FHOA 1B4HA 3GLBA 2AL5A 4G8HA 2Q2CA 3LUYA 3THIA 3S4UA 4RJZA 5I57B 3S9LC 4G68C 3ZKKA 3KJTA 5AA3A 1AMFA 4R73A 4NF5B 1UIVA 4EDPA 3AXFA 2Z8DA 3E13X 3VXCA 5I56B 3TQWA 2UVIA 4R75A 3LSXA 1MQJA 2HAUA 4R6HA 3C32A 4GL0A 3KFMA 1B1XA 1SW4A 3C4MA 5A5XB 1MPBA 4YB6A 2FA7A 1RYXA 1A40A 4G4PA 4QFNA 2D21A 4BDLA 5I58B 4HCWA 2AL4A 1QJMA 4GL8A 3K1MA 4LQ5A 2DVZA 3FVNA 4DCXA 2O7UA 4PP0A 2M8CA 1S9TA 2WKYA 4JSOA 3ZKLA 1ZJLA 1B4ZA 3C9HA 1AL3A 4PFYA 4FAJA 5CMKA 2HZLA 3OOAA 1B7ZA 2DE2A 3T9HB 3DLNA 3KJ7A 1US5A 4THIA 2DQVA 4DXUA 2F97A 4OHNA 4OYVA 3ONMA 4NF4A 1L5TA 1SI0A 4QFOA 4F3PA 1URSA 3TUSA 1GGGA 3G3HA 2QS4A 2DE4A 4R9GA 3MVXA 3B6TA 3OSRA 3TFLA 1A8EA 5I57A 2QMWA 5KDTB 5HBCA 4DZ1A 4TQUQ 2PBWA 2DWIA 1OQHA 1Y3NA 5AE4A 1P1WA 4NF5A 1DSNA 1LSTA 5EHSA 2XXRA 4GWOA 4U4SA 4OEUA 5I56A 4F29A 4HS7A 3Q25A 2O6AA 4K3FA 4G68B 1A99A 1POY1 1OLAA 4TLLB 5A5XA 4FATA 5I58A 3K0VA 4Q8RA 5CMCA 1MXYA 2XD3A 2A5TA 3IJOB 1VFDA 3KN7A 4NF8B 1BIYA 5LOMA 1SW5A 1MH3A 1NNPA 3EHTA 3FV2A 3I3VA 4JWXA 5DEXA 4H6DA 3T9UA 2ESNA 2ZNTA 3CFZA 3VDFA 2ZYOA 3JYRA 4EF1A 2ONRA 3QSLA 1FTMA 2UVGA 2O51A 3BBRA 4NF6B 3EQ1A 3TYHA 4KR5A 4MF3A 1LFGA 1XVYA 3RPWA 1B2HA 1MDP1 4JSDA 1KWHA 4GQOA 2O7IA 3QUJA 1FQDA 5DVIA 1N04A 3H6UA 3HSTA 2DOJA 2QPQA 3RN8A 4ESWA 4MFIA 1N7XA 2B3BA 4EXKA 4RYAA 3VLVA 3FGSA 1I69A 2A5SA 1LB8A 1PEBA 1B3GA 4HCYA 4GLIA 2ANJA 3GXAA 1VE4A 4YZZA 5BWJA 1Y9UA 4QRZA 1F9BA 3KSJA 4R72A 1H45A 3C36A 4JB7A 1SVXB 2QS3A 2VHAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MAMA 4RPNA 3IX1A 4G68A 5FTIA 3EKIA 1LEVA 4ELPA 1LLSA 1Y1MA 4DXBA 1AOVA 4MIJA 3LBSA 2VD2A 4KQPA 1MXXA 3FXQA 4MHFA 5TU0A 4NF8A 1ZLQA 1BLFA 4XFEA 4LZ5A 4OENA 2KQZA 1MM7A 2B3FA 4G77A 4GF8A 1UTHA 2Q88A 1O63A 2RINA 4KYEA 4ONYA 2F3DA 2XXQA 1INPA 4H5GA 2Y7PA 1NUYA 4R6KA 1LBCA 2XXYA 5DT6A 2R9JA 4PFWA 5H8FB 3SEVA 4R74A 4R9FA 4PE3A 1ZMGA 2QVVA 3CG3A 4IGTA 4NAPA 1NNKA 2I49A 4NG7A 4AB5A 5HM4B 2ZYKA 4QSDA 1N84A 4PF8A 3ROJA 1QUKA 1ATGA 2ZZXA 4PCDA 4DI4B 5B7DA 4O8MA 1YPNA 3UN6A 2Z8EA 2I0BA 1JW4A 5CI5A 3Q27A 5I7IA 4I3YA 3MZ1A 1J1NA 1Z7ME 4C0RA 1OVTA 1KA0A 4PDDA 4P0GA 1YZ0A 4TOZA 1QULA 2QSXA 1M5EA 5LDZA 5ITOA 2NWJA 4E0WA 1FQAA 3K2DA 1R9LA 4N8GA 5EYGA 1EZ9A 4OMBA 1UTBA 2I58A 4OFOA 1QGXA 1H43A 1SYHA 3ILUB 4H8IA 3MP1A 3RNNA 3TODA 3CVGA 1Y4CA 2DP8A 1NV4A 2WYKA 3B6QA 4ZEIA 1OMPA 5DVFA 3FJGA 3KG2A 1EYJA 2XX8A 2GQ1A 4OVTA 1LAHE 4OXVA 3U1OA 4NGUA 4N91A 5LTCA 4GWYA 3V89B 3R26A 5CRYA 3U72A 2PT2A 1GVCA 1PC3A 5DTBA 3RTFB 2THIA 3UP9A 2VOZA 4ECFA 4YAHX 1DTGA 2RCAA 2PCRA 4QBAA 1YCJA 3K6WA 1LAGE 3HHFA 1RYOA 5H8FA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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