1LB8A

Crystal structure of the non-desensitizing glur2 ligand binding core mutant (s1s2j-l483y) in complex with ampa at 2.3 resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lb8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lb8A01
4OEVA 1FQDA 2XXWA 4F3PA 5H8FA 5I59A 2A5TB 1PB9A 1MXVA 4X1DA 1JEVA 2QL3A 3N5LA 1AIVA 1A54A 1JVXA 3IL1B 3PUWE 3MPKA 1BIYA 5L9OA 1YPNA 5IAIA 2PT2A 2Q2AA 5KCJB 4LATA 2PT1A 1FTMA 1N84A 2H4IA 4GIZA 4H8JA 4MLQA 1MQGA 3RUMA 3E13X 2XXYA 1MXUA 1Y1MA 1MXZA 1LBCA 1UQWA 2OK2A 4U2RA 3TMGA 4F1UA 3OEKA 1SW2A 3K00A 2V84A 4RNSA 2KLFA 2V93A 1WDNA 2Z23A 3FJ7A 2QPQA 4U4SA 2GH9A 2IA4A 2HAVA 1FTLA 1SW5A 4IY6A 2LAOA 5ICQA 5M2VA 1H3DA 3FXQA 3LSWA 1JQFA 2ESNA 5H8QA 2QMXA 1B6HA 4FAJA 3VV5A 4ESXA 4LUBA 1LAFE 2HAUA 3PPRA 2XXPA 4NEDA 2HEUA 3C33A 5TPAA 1IZ1A 3ECRA 3RPWA 3V8XB 1POY1 4KI0E 5FHNA 2OCUA 4YU0A 1S7YA 1ELJA 4Q5TA 3WAFA 2R71A 3HV1A 1PBQA 3JZJA 5ICTA 1S50A 2QJEA 1B3EA 4G68C 4OETA 3UA8A 4RYAA 1H76A 3K01A 3OSRA 4KCDA 4FIMA 4EXLA 4DLDA 3U72A 1MM6A 1GR2A 3IK6B 4GFRA 4QSCA 2QS2A 2Y7IA 3E9XA 1H45A 2A5TA 2ZNTA 4QSDA 3CFXA 2UYEA 3O2AA 4IGTA 4N07A 5AE4A 1AOVA 1IUDA 1NNKA 2X7QA 3MVWA 1US4A 3CG1A 1A99A 1Q35A 1QUJA 2PMSA 3EN3A 4F3GA 1D9YA 1JNFA 1ZJLA 1NH7A 3H3GA 4F3SA 3VLUA 1Q1KA 4Q30B 4U1ZA 4JB7A 3K4UA 5CC2A 1MY0A 4KPTA 4HTGA 2ZYMA 1FQFA 4DZ1A 5DYHA 1UIUA 5ISUA 1Y3PA 3OELA 3GXAA 3EPEA 4KD5A 1P1NA 1SW4A 3OENA 4GF8A 2VP1A 3KFMA 4R6YA 1MPCA 3KBRA 2QMWA 3VXBA 4F18A 1OLAA 3EQ1A 2ZNSA 1SBPA 2G93A 3MP1A 4H1XA 5TU0A 4WKMA 1MY2A 1RYXA 4BDMA 1B4ZA 1CB6A 5I57A 3M3FA 3CR9A 1FW0A 3QUFA 1LCTA 1JETA 1N3WA 1N04A 2HZLA 2O6AA 3L6GA 4LQ5A 5AA1A 3RT8A 1UIVA 2Z8DA 3IOUA 4IY5A 4KQPA 3CRBA 1ZU0A 4R2BA 4TLMB 1MXYA 3SETA 1SD3A 3HHFA 2O69A 1I6BA 3IO4A 4R6HA 3KZGA 3TEPA 1QKAA 3QYTA 4NF6B 3EHUA 3H7MA 5I2NB 3RGYA 4U1OA 4R9GA 4MLVA 2E0SA 4YKPA 3CSBA 3MZ1A 1MS7A 1LB9A 4Q0CA 1A8EA 1MPBA 1B4HA 3UORA 3CIJA 4NTLA 4QFPA 3IORA 1ZKBA 2Z8FA 4ZS9A 3TQWA 1PEBA 2DWAA 2RKMA 2FA7A 3M3LA 3U1OA 2VD3A 4GQOA 1B0HA 3OXNA 3T93B 5L9SA 2OWTA 2DXRA 1SW1A 2OLBA 1N7XA 1BKAA 4H5FA 4L17A 2GHAA 1N3XA 1GGGA 3FV1A 3S9LC 1RYOA 3DP8A 1TXFA 5I59B 2ONRA 3EHTA 3KN7A 1MRPA 3C9HA 2VD2A 2H25A 3K1PA 4FEBA 3N94A 3TTRA 3IX1A 4OWDA 1GV8A 5KCJA 3OEMA 1XVXA 1BTJA 4OYVA 2V3TA 4PFTA 4R75A 5EHSA 3VVFA 1B51A 3V83A 2Q2CA 4RPOA 2ABHA 3ZS6A 3N6TA 1JEUA 3H06B 4JSOA 5BUUA 5A5XA 3Q27A 4ZZAA 3UK4A 3WAEA 3O97A 1R9QA 1LAXA 4Z7EA 1MY3A 1USYE 1LSTA 2REGA 3EHSA 1PBPA 2HCAA 2O68A 3N6UA 3ONMA 4HCYA 4DE8A 4RA1A 4YMBA 2O1MA 2ZYOA 2F35A 2HFBA 2RF1A 3O66A 2UXAA 4LONB 4OQOA 3RLFE 4AQ4A 5KDTB 2HQ0A 1B9JA 1BP5A 2ZYNA 3USDA 5CMKA 3D4CA 3RT6B 2XXXA 4N6PA 1UTHB 1MH4A 4YKIA 3R6UA 1OQGA 3TELA 5JK4A 2DOJA 5EYFA 5B70A 5DT6A 2I3VA 4LZ8A 4OZ9A 4KYEA 1IIWA 4QRZA 3R7XA 5AA2D 4XKRA 3U94A 1YTVA 2DVZA 3MUQA 4NF5A 4G68A 4G4PA 4GRKA 5HPQA 1HSLA 4ZZEA 1QVSA 1Y20A 2DSFA 3BKIB 3SEUA 3VLWA 5AA4B 2I48A 3W15C 4DCYA 3HO7A 4BDQA 1DTGA 1DPPA 4PE5B 5EHMA 2ONKE 5DEXA 5I56B 3IOVA 3SKPA 4ESWA 3HN0A 3G3FA 3I6VA 1DOTA 4OERA 3P7IA 4ZEDA 2I4CA 5I2KA 2UVJA 4OFLA 4RPNA 1BLFA 3DM0A 4XKNA 4ONYA 4YAHX 1B1XA 2DVCA 3TCHA 1FTJA 2F7AA 3BBRA 3ZKKA 1P1QA 3VFJA 2ONSA 3T9HB 3FD3A 2Q89A 3ILUB 3T66A 1I69A 1B7UA 1II5A 4F3BA 4F31B 1SYIA 5JTYA 4QFKA 3PMXA 1P1WA 1Y1ZA 3B7DA 3DLNA 3PMWA 1MXXA 1FQBA 1AH5A 3PUXE 4OXVA 4LQ2A 2NXOA 1T0KA 2YLNA 3KSXA 4H67A 1QKBA 4F2QA 1FTOA 1LB8A 3K6UA 4QHQA 3VE1B 2DE3A 4FECA 4Z0IA 3VDFA 3SDFA 4ZEFA 3UN6A 3S9MC 1ATGA 4MBPA 4U22A 5DVJA 2DXYA 3FJMA 2ZXTA 1FTKA 1O7TA 1EZ9A 1NMUA 1P1OA 1WODA 3QXMA 4I9DA 4X1BA 4GOTA 4F1VA 2XXUA 3C4MA 4R73A 4NMYA 4NWCA 3C34A 2B3BA 1EU8A 1PB7A 2R6GE 1PDAA 3DP6A 3MAMA 4ZEIA 4QFLA 3W9WA 5JEIA 2HZKA 1IXGA 2AIXA 4RJZA 3TTLA 1TFDA 4RK9A 2DWJA 4THIA 3PUVE 3Q25A 5CMMA 3KJ7A 4WEPA 2ZMBA 3IB2A 3MJNA 3HSTA 4NE4A 4YZZA 3LBSA 1J1NA 3A3UA 3FIRA 2XXIA 1LLSA 2DE4A 3KG2A 1O64A 2PX1A 2Y7KA 3TPAA 3V89B 4NF4B 4DXCA 4H5GA 5JTYB 4HCWA 2F8DA 2RC9A 3IR1A 5FHMA 3RY3A 1MY4A 2VGQA 5AA2A 1N7WA 3MZBA 3O6HA 3OO7A 2QS4A 3G7WA 3PUZE 3MVYA 1L5TA 4E0XA 3IOTA 4I62A 2XD2A 3Q26A 1VE4A 1XHYA 3MZ9A 1A55A 5FTHA 1URDA 3IB1A 2F6GA 1LAHE 2I49A 3O29A 1OVBA 1LAGE 1YAEA 1VR5A 4LZ5A 3SEVA 4FATA 4ZECA 1MXWA 1OVTA 2DWIA 3K1MA 2Q9TA 3SESA 3OOAA 4NF8B 2I0BA 1XS5A 3FVNA 3PD8A 4IO3A 3IOWA 5FHOA 3VVEA 4MF3A 4EQ9A 1QUIA 2IEEA 1Y3QA 2REJA 3B6QA 3HHGA 4TQUQ 4G68B 1B1HA 4H8IA 2QSXA 2Z8EA 5KDTA 3LUYA 2GFEA 4JWXA 2QRYA 3FUZA 5CI5A 3SEWA 1P99A 4F29A 3PPPA 4LZ7A 3FATA 4PQJA 2XD3A 3TYHA 3RTWB 3G3HA 1OMPA 1USYH 4H6DA 2I6EA 1MQIA 4DXUA 1A8FA 1JW5A 4IO4A 5B7DA 3RN8A 1KWHA 4OTEA 1ZBMA 4JDFA 3V5AA 2YPNA 2H99A 4O3BA 3C35A 3O6GA 4N13A 2QS3A 3IJXB 3THIA 3QUJA 3T9XB 4JWOA 2DE2A 3TODA 4U4XA 4R74A 1LCFA 1Z7ME 2RINA 3MVZA 3PPOA 5CMBA 3TTMA 2DP8A 5HBCA 3U92A 1FCKA 4EQ7A 1IITA 1TT1A 5I58A 1B0LA 1YCJA 1ZTYA 2P1SA 4IO5A 1IXHA 5CBSA 1UTBB 5L9MA 1EZPA 2XX8A 3C32A 1DTZA 3RTFB 4EQBA 5F7VA 4FEDA 1JW4A 4P0GA 4KR5A 4AB5A 1ZIUA 1MQJA 2ALUA 2O1LA 2P0SA 4EDPA 1MQHA 1Y4TA 2WKYA 4FORA 4ISUA 3GZGA 3PD9A 5FTIA 3PUYE 4IB2A 3KOSA 1FQCA 1P1UA 2RCAA 4FE8A 3UP9A 1OLCA 4ELPA 1M5DA 3PV0E 3TZAA 4G2ZA 3SEYA 2W7YA 1B3LA 2QS1A 4GVOA 4HS7A 4I8CA 3AXFA 2FNCA 4IO7A 4OFJA 1B52A 3GBBA 2Q8JA 4C1UA 4ELRA 5I2NA 2VHAA 5J1DA 1A7LA 3D4GA 2UVIA 4GXAA 2OBGA 3MVXA 4OMBA 4RXLA 4BDLA 3PMVA 4R6KA 5H8NB 1IQ7A 3IAZA 4U23A 3Q29A 2I3WA 4M1VA 5K2YA 5CBRA 4EXKA 1JW1A 3MWBA 4Q8RA 3H6UA 2Y7RA 1PC3A 1ZMGA 4YB6A 3QAXA 3DP4A 1FQAA 1R9LA 1URSA 2BJJX 3CG3A 4P0IA 4BDRA 5CM6A 2PYYA 2AL5A 3UGWA 4JXIA 1FQEA 2GRVA 3L6HA 4F39A 3IB0A 3R26A 4KHZE 5ELVA 2DS9A 3OD7A 1Y9UA 1QJMA 3BFUA 3JV9A 3QK6A 5ITOA 2GHBA 4BDOA 4JSDA 3H6WA 2OZZA 3LR1A 3ILTB 1GVCA 4UACA 4KFQA 3KSJA 1XOCA 4O3AA 4ZDMA 4HW8A 2CZLA 2XHDA 2V3QA 1QULA 1AMFA 1OIBA 5H8SA 4LA9A 1RKMA 3B6TA 3FV2A 1B58A 4POWA 4QSEA 1B05A 1I6AA 4IO2A 4OHNA 2F5XA 3K0VA 2NOOA 2B65A 2YJPA 1ANFA 2F34A 2I0CA 3MP6A 3F11A 1B7ZA 3OSQA 4XKPA 4H0WA 4M4GA 3S4UA 1B40A 3M8UA 3G3KA 4U21A 2X26A 3W9VA 1MH3A 2I4BA 2XXQA 2THIA 4MFIA 4OEUA 3VLVA 3CVGA 4YKJA 4C1TA 3K6WA 5KZTA 1MY1A 3A09A 4R9FA 3GBAA 1SQYA 2H98A 3TTKA 3DELB 2H5YA 1DMBA 1URGA 1XT8A 4P11A 1IEJA 4GLIA 5TP9B 2Y84A 5ITPA 3O6IA 1R6ZA 2V3UA 1NFTA 3H4ZA 3C36A 5CMCA 3O28A 1TWYA 2O7UA 1HSJA 3OMBA 1PB8A 3CFLA 2Z22A 4F22A 1XVYA 1Y4CA 1ZLQA 2NUVA 1D9VA 1IXIA 4ZEKA 1B2HA 4DCXA 1LFGA 4POXA 4G8MA 4OENA 4RK2A 1MDQA 4RY1A 1R1NA 4GWOA 1SDXA 4YB7A 5H8QB 4KYSA 3S2VA 2O84X 3K02A 2VOZA 3MQ9A 3T9UA 5I2KB 5A5XB 1EZOA 2NVUB 2E1SA 1SVXB 3MPLA 2RC8A 1D4NA 3FVGA 4QF9A 4XIGQ 5DEXB 3FJGA 1POTA 3RQTA 3VVDA 2F6PA 2ZNUA 3MP8A 4PFUA 1B32A 4E0WA 2RCBA 4NF8A 1A40A 2M8CA 3GLBA 3TCFA 3O9PA 1B5HA 4ECFA 3ZKLA 3KEIA 4G8HA 2R9JA 4O3CA 3TFLA 3TTNA 4EF1A 4IGRA 5DTBA 3E4RA 4FJPA 2PBWA 2X7PA 3MW0A 4G8NA 4KYDA 5K2XA 5H8FB 3FVOA 4ELQA 1I6QA 5AA3A 1F9BA 4TLLB 5CRYA 3M3KA 3T9VA 4C0RA 4UA8A 3E3KA 1MG1A 5AA2B 5AA4A 2F7CA 3ODBA 4X48A 4IO6A 3PPNA 2ANJA 1VSOA 1AL3A 2D3IA 4BDNA 2NWJA 3LC8A 5I84A 1B3HA 2D21A 1OQHA 3K1NA 4K3FA 2UYFA 4NWDA 3T22A 1MDP1 2F78A 3EF7A 3MBPA 1UTHA 4YICA 3H6TA 2Y7PA 1SI1A 1N0TA 2UVHA 2XX9A 4DXBA 1JVYA 4ZE9A 1B46A 1VFEA 5DVFA 2AYSA 2XXVA 3KGCA 2RC7A 5TP9A 3A3CA 2ZYKA 3HPIA 3PU5A 4JWYA 2OWSA 3G3JA 5IKBA 2Y7WA 1S9TA 2F7BA 3S9EA 3HCQA 3SEXA 3S9NC 3FXRA 4H65A 4OESA 3K2DA 3LSLA 4MH5A 3PGFA 3TDJA 2XXTA 5BWJA 1D3KA 3FASA 3CI8A 1QUKA 2DYXA 3FVKA 4QFOA 1M5FA 5DVIA 4ZE8A 1NH8A 3TQLA 4YKKA 4BLAA 2UVGA 1NL5A 4EUOA 4KCCA 4X9TA 5L8DA 3Q28A 2OJTA 1SYHA 2CMOA 2XXRA 4XKQA 4ELOA 1HSEA 4GL8A 1DPEA 3OO8A 4NF4A 3BFTA 1MQDA 2Q88A 3LSFB 1NNTA 2HXWA 2D5WA 1US5A 4PP0A 1SI0A 4WEDA 1WVJA 3UIFA 3TUSA 1B5IA 3KOTA 2DWHA 1TFAA 2O7IA 4GD5A 4F19A 2AL4A 1CE2A 4I1DA 1VFDA 3PPQA 4ZEBA 4DIGA 4XTCQ 3TAJA 4NF6A 1NKXA 4YB5A 1LFHA 3CFZA 3I3VA 3K6VA 1B3FA 1H43A 3I5OA 1QW0A 2H9BA 4PETA 5H8HB 1N76A 3VXCA 2A5SA 3IJOB 3C31A 4R2FA 1B5JA 4F1YA 1UTBA 3MC2A 3N26A 3CSGA 2DQVA 3H6VA 3KN3A 3OO6A 3QIMA 5H8NA 3RNNA 1LBBA 5I56A 4LP2B 4WXJA 5I57B 4PFWA 4DDDA 3LSXA 2F97A 3KJTA 3SERA 3JYRA 1IXCA 1H44A 1Y3NA 3IO6A 3K6XA 3T96B 3FGSA 1B7HA 3G3IA 4F2OA 5HM4B 2F36A 5H8HA 4EF2A 2V25A 1MM7A 4XXUA 2P2AA 3TCGA 4QFNA 1MPDA 4LVQA 3FZVA 1M5CA 3H03A 4NF5B 5LOMA 1M5BA 2G29A 4PFYA 1B3GA 4YMAA 3B6WA 3KN8A 4G77A 4GXSB 5TPAB 1O63A 2FYIA 1NNFA 2I58A 2PVUA 3QSLA 1LFIA 3OO9A 4OFOA 1DSNA 1EH3A 3FXUA 4TOZA 3U8QA 3U93A 2B3FA 3G3GA 3ZSFA 4R72A 4OVJA 1GTKA 3TKDA 1Z7NE 4JBZA 5I58B 4GL0A 1LGBC 2O51A 4AB6A 2XXHA 1NNPA 2XX7A 4ND9A 1XC1A 1M5EA 5F1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F3PA 2XWVA 2QL3A 3IL1B 3MPKA 5L9OA 1YPNA 2PT2A 2PT1A 1N84A 4H8JA 4GIZA 2GQ1A 3OEKA 3K00A 2V84A 2KLFA 2Z23A 3FJ7A 2QPQA 2GH9A 2IA4A 1SW5A 2LAOA 5ICQA 2ESNA 2QMXA 3VV5A 4ESXA 3PPRA 5TPAA 1IZ1A 3ECRA 4MCOA 1POY1 4Q5TA 1ELJA 3JZJA 5ICTA 1BK4A 4OETA 1GR2A 4QSCA 4P47A 2Y7IA 1H45A 5AE4A 1AOVA 1FJ9A 1US4A 1A99A 3CG1A 1FTAA 1MY0A 2ZYMA 1UIUA 1Y3PA 3OELA 3EPEA 3KFMA 1XI6A 3EQ1A 1SBPA 4H1XA 5TU0A 4BDMA 2HZLA 1N3WA 4LQ5A 1N04A 4KQPA 3SETA 4TLMB 3CRBA 1MXYA 1AWBA 1QKAA 3H7MA 3RGYA 4MLVA 2E0SA 3CSBA 1MS7A 1MPBA 4QFPA 1ZKBA 2Z8FA 4ZS9A 3U1OA 4HXVA 1B0HA 3OXNA 3T93B 2OWTA 1INPA 3DP8A 3EHTA 2VD2A 3N94A 1DK4A 5KCJA 1GV8A 3OEMA 1XVXA 1BTJA 4R75A 2ABHA 4DI4B 1LEVA 3H06B 4JSOA 3O97A 4Z7EA 2REGA 1VDWA 4YMBA 2O1MA 3O66A 4OQOA 4NX1A 1FPBA 2ZYNA 3D4CA 3RT6B 1OQGA 4O8MA 1YTVA 3MUQA 4G4PA 1Y20A 3VLWA 2I48A 1FBEA 5I5PA 3SKPA 3G3FA 4PE3A 2I4CA 4MEVA 4OFLA 5EQAA 2F7AA 1P1QA 3T9HB 3ILUB 4PF6A 4QXDA 4F3BA 5EQ8A 4QFKA 1P1WA 3EKIA 1FQBA 3CHGA 1QKBA 1LB8A 4QHQA 1ATGA 4MBPA 1FTKA 1P1OA 1WODA 3D1RA 4NMYA 4NWCA 2B3BA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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