1LB8A

Crystal structure of the non-desensitizing glur2 ligand binding core mutant (s1s2j-l483y) in complex with ampa at 2.3 resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of glutamate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lb8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lb8A01
3EN3A 2XXXA 3WAFA 3VVEA 3O66A 1D9YA 3UIFA 1F9BA 5I84A 3PMWA 3EHUA 2NUVA 2GFEA 2E1SA 4MFIA 1UTHB 4IO2A 5BUUA 1AIVA 1DSNA 1UTHA 4PP0A 4ELQA 4JB7A 1B51A 4OXVA 2D3IA 2DP8A 3L6GA 3LSLA 4P0GA 2XXPA 1USYE 2V84A 4OMBA 4H8JA 2V3UA 4GFRA 3G3FA 1OLAA 4XIGQ 2OWSA 3FXRA 4OVJA 3OMBA 1I6AA 2IEEA 4HCYA 4BLAA 3VLWA 5H8SA 3IO6A 5ELVA 3HV1A 4BDRA 4NF8A 1P1UA 3K6WA 5L8DA 1YTVA 4QSCA 1EZ9A 3TDJA 5F7VA 3IJXB 2XXWA 3T9UA 1A7LA 3IORA 5BWJA 2W7YA 2ESNA 3IOWA 4JWXA 1N7WA 2RC9A 4FEBA 5HPQA 3HO7A 3LUYA 4PFWA 1AL3A 1IXHA 3LSXA 4GWOA 1FQCA 1GR2A 1BIYA 3IOUA 5H8HA 4YMAA 2XX8A 4F2QA 3SERA 3S4UA 4Q5TA 1BLFA 4ONYA 1WODA 2HEUA 1WDNA 1VR5A 1B3EA 4F1VA 3VVFA 1B0HA 3H03A 3TTLA 2I4CA 2ZMBA 2DS9A 3PV0E 2G29A 2B3FA 2OBGA 4JSDA 2H9BA 5JEIA 4LUBA 2AL5A 1I6QA 4NF6B 2M8CA 5H8NB 4KI0E 2BJJX 4GXSB 4R6YA 5ITOA 1IEJA 2I49A 2RCBA 4YB7A 1B46A 3RY3A 5A5XB 4GOTA 4KPTA 2QSXA 4G77A 4ZEIA 5A5XA 1H43A 2I3WA 1M5DA 4RA1A 1TWYA 3TTNA 1WVJA 5F1QA 1O63A 2ONRA 3AXFA 2Z8DA 2OJTA 1JETA 1A40A 3KJTA 1Z7NE 4F31B 1SW2A 3OSQA 1FQFA 2REJA 5K2XA 1RYOA 1A8FA 1DMBA 3I3VA 3H6TA 4U2RA 3TELA 2RCAA 5I2KA 4GF8A 4I62A 4E0XA 3PPOA 1OQGA 2RC7A 4ZECA 4X1BA 4U22A 1PB8A 1S7YA 5ICTA 1M5CA 2H99A 1JNFA 4GXAA 3EQ1A 2O1MA 1H45A 4KYDA 4I8CA 3OEKA 4PFTA 3OELA 4ISUA 1S9TA 4U23A 3W9VA 3MQ9A 1DTGA 1FQDA 5H8FA 4N07A 4U1OA 3FJ7A 3FXUA 1SW4A 3PMVA 5CC2A 2Q2CA 1R9QA 3K2DA 4RK9A 3HN0A 1MY2A 2PYYA 5L9MA 4JBZA 1H44A 3EF7A 3PMXA 4OTEA 3K6UA 3VE1B 2O7IA 1QUJA 4OQOA 1SQYA 5FHMA 1J1NA 3IB1A 3GBBA 1B1XA 3O2AA 1EZOA 4F39A 3FV1A 3U94A 1NKXA 3UN6A 4GRKA 2THIA 4ZE9A 3TCGA 5DEXA 1MQGA 3VDFA 1Y3NA 4KD5A 3RTFB 3Q29A 1DTZA 4LVQA 2QS1A 1XC1A 2O68A 2UYEA 4BDMA 1SVXB 4RXLA 4YICA 3MVXA 3OSRA 2GHAA 2Y7PA 3CFXA 1ZU0A 5CRYA 3T66A 5ISUA 4H6DA 1PEBA 2DVZA 3ZKLA 2HXWA 1ZKBA 2O69A 2Z22A 4Q30B 4O3BA 3LC8A 2B65A 3MP1A 4BDQA 1GVCA 2I6EA 3RGYA 5KCJB 2RINA 4O3CA 2UYFA 1MPDA 1ELJA 4O3AA 4ZDMA 2QMXA 2Q89A 4ZZEA 1JEVA 1QUIA 1FTKA 4ELOA 4H8IA 1NNFA 3FGSA 3DP4A 4NEDA 2DYXA 2F78A 4KHZE 4TQUQ 1PB7A 3Q28A 4YU0A 1JW4A 1ZIUA 2P1SA 1GGGA 1POY1 2XXHA 4OYVA 1Y4TA 2OCUA 4OFJA 4PFYA 3HSTA 2FNCA 3K4UA 3IX1A 1FTMA 1XOCA 1MY4A 2ZYKA 3DELB 4IY6A 2DXYA 1NL5A 5H8QB 4UA8A 3IK6B 1B32A 4GL0A 5TPAB 4IGRA 5I57B 1P1NA 2QL3A 2DWIA 2HQ0A 1FTJA 5FTIA 4G8HA 1Y20A 1O7TA 2H4IA 2QJEA 4TLMB 3RPWA 3CG3A 5DTBA 4GVOA 3KG2A 1I6BA 1URDA 3CG1A 1R6ZA 3EPEA 4HW8A 4BDOA 5DT6A 4KYSA 3L6HA 4QFNA 2Q2AA 3RQTA 5JK4A 4H0WA 5B7DA 1LCTA 4MBPA 1N0TA 5DYHA 1AMFA 1LAXA 3ZKKA 4G68B 3TFLA 3C9HA 4X1DA 1DPPA 2QRYA 5FHOA 4G8NA 3TODA 1H76A 4E0WA 3G3GA 4FORA 3JV9A 3BBRA 3M3LA 3MVYA 4KR5A 4U21A 3T93B 3ODBA 1B4ZA 3KOSA 4N6PA 3K6VA 1N3XA 5AA2A 3PPNA 3SEWA 1IZ1A 4NF4B 1Y3PA 5JTYB 3TMGA 4RPNA 4U1ZA 3G3HA 5TP9A 3MZBA 3FASA 4YAHX 3UK4A 5I2NA 1B2HA 1GTKA 1LSTA 2XX7A 1LFGA 3IL1B 4EQBA 3P7IA 2I0CA 3JYRA 1TT1A 2AL4A 3Q27A 1TXFA 3LSFB 4JXIA 2NWJA 2PX1A 2REGA 2PT1A 4C1TA 3SKPA 1MPBA 2D5WA 5FHNA 5IAIA 5ITPA 2RF1A 5CBSA 3TCFA 2XXUA 3CSBA 1RKMA 5DVFA 1II5A 3G3JA 3OD7A 3EHTA 3BFTA 3TQWA 1POTA 3MP8A 1FQBA 3HPIA 4H5FA 3OXNA 2XXQA 2F34A 4YB6A 4EXKA 4NF5B 3GBAA 4DXUA 1XVYA 4MLVA 4Z7EA 4IGTA 1B4HA 1MY3A 3GZGA 3ILUB 2F6PA 3C31A 1USYH 4OETA 3RN8A 5KDTB 3PPQA 4XKQA 1GV8A 4LZ5A 5IKBA 4NWDA 3H6UA 4LQ5A 1MXYA 3QK6A 4OHNA 3LSWA 1OQHA 1MH4A 3CR9A 3C32A 5AA2D 2XXTA 3IAZA 4FIMA 3DM0A 3O28A 1B6HA 1A54A 4C1UA 3O6HA 4OZ9A 3HHGA 3U93A 1MM7A 3RT8A 1OIBA 3K00A 1XT8A 2O51A 1MXVA 1VFEA 2DOJA 3PD8A 4I1DA 1QKBA 3A3UA 4LA9A 1B05A 1ZBMA 3U92A 4WEDA 2HCAA 2NOOA 3T9HB 3U72A 1IXGA 4NF6A 1VFDA 5H8NA 3KZGA 1MQDA 1R9LA 4OEVA 1L5TA 2XD3A 1IXIA 2UVIA 2F97A 4RPOA 2A5TB 3N5LA 3CVGA 2O7UA 3QYTA 2R6GE 1PBPA 2E0SA 4WKMA 4HCWA 4FATA 1OVBA 3K01A 2DSFA 3DP6A 4LZ8A 2V25A 3BKIB 3KBRA 3KN7A 2DXRA 3TYHA 4DCXA 3W15C 1UQWA 2O6AA 3FATA 3G7WA 1PB9A 3HHFA 3OO9A 1LFIA 3PUWE 2F6GA 4OESA 2I58A 3SEYA 4GQOA 2XXYA 3UORA 4JWYA 4P0IA 3O97A 1MG1A 1MRPA 2F36A 2Y7IA 3KJ7A 2I4BA 4F1UA 1UTBB 3FJGA 1UTBA 1SBPA 1IIWA 5CMKA 2VOZA 1LBCA 5AA4B 2DE2A 2OLBA 1KWHA 4XXUA 4F3GA 2FA7A 3O6IA 3KN8A 3T9XB 4EQ7A 1A8EA 1B1HA 2P0SA 3C4MA 3JZJA 3FXQA 4WEPA 3S9MC 3OENA 3V89B 4RK2A 1N7XA 4IO6A 1ZTYA 1JQFA 4EF1A 3GXAA 3QIMA 3OO8A 4K3FA 1QULA 4R2FA 1QVSA 2XD2A 3SESA 1SW5A 4Q8RA 4POXA 1NFTA 4WXJA 3V8XB 3PUVE 1H3DA 5LOMA 3GLBA 5I56B 4QFPA 1XS5A 1N84A 4OWDA 2UXAA 2NXOA 3TZAA 4H1XA 2DWHA 4R9FA 3V83A 2ZXTA 4GIZA 4DXCA 3KSJA 1AH5A 1R1NA 1OLCA 5CMCA 4LONB 4LP2B 4EDPA 3K1MA 4QFOA 3MPKA 5KCJA 1CB6A 3B7DA 2V3TA 4JSOA 3K1NA 1B9JA 1SI1A 1HSJA 1EH3A 3TTRA 3DP8A 4BDLA 3TKDA 3HCQA 3IB0A 3CRBA 1B5JA 1MDP1 3S2VA 1Y1ZA 3MAMA 1MXUA 3E13X 3PGFA 2GRVA 4F1YA 4ELRA 3TPAA 2WKYA 3UGWA 3H7MA 2OZZA 4PETA 4AQ4A 4F3SA 4F3BA 4AB5A 3UA8A 1MXZA 4L17A 3ZS6A 1B5HA 3A3CA 4RJZA 1Q35A 1UIVA 4R72A 2V3QA 2QS4A 4M1VA 5H8QA 1IQ7A 3OEMA 5TPAA 4JDFA 1URSA 5I57A 3KGCA 5I58B 3KOTA 4H65A 1LGBC 1FQEA 3FVNA 3MVWA 3RTWB 3E3KA 4HS7A 1Y3QA 2ONSA 2ABHA 2D21A 1B0LA 4XKRA 5DVJA 4PE5B 3PPRA 1FCKA 3H06B 3FD3A 4QSEA 2F8DA 4PQJA 1QW0A 3KSXA 4KCCA 2Y7RA 1UIUA 4I9DA 2H5YA 2V93A 2DE4A 4U4SA 4EUOA 3MW0A 3MC2A 3SETA 2ZNSA 1EU8A 2RC8A 3VXBA 1BTJA 2Z8EA 3UP9A 3K02A 4OFOA 1SI0A 2DWAA 4EF2A 4G68A 1D3KA 4ZEFA 1B5IA 4YKPA 4R73A 4N13A 3FVOA 1JVYA 1A99A 4YZZA 5AA1A 4EXLA 2HAVA 3SEXA 4NMYA 2X26A 5J1DA 4ECFA 3IJOB 4XKNA 4YKJA 2F7AA 5CI5A 4F3PA 1OVTA 3E9XA 1QUKA 4NTLA 1NNTA 4G2ZA 3VLVA 2OK2A 4HTGA 1DOTA 4NF4A 5JTYA 4AB6A 3D4CA 4NE4A 3IR1A 4RNSA 1HSEA 1MXXA 1JW1A 3QUFA 2CMOA 1LB9A 3CI8A 3USDA 3THIA 2F7BA 3G3IA 4Q0CA 4F19A 4P11A 5I59B 2VD3A 3O6GA 2HZKA 3QAXA 3M3FA 3OO6A 1QKAA 2GHBA 1MQJA 1LLSA 2DE3A 1MPCA 1IITA 1FTLA 2IA4A 1BP5A 3FZVA 1SYHA 3W9WA 3O9PA 4G68C 3T96B 1M5FA 3M8UA 3U8QA 1N04A 1LAGE 3ONMA 3LBSA 4DLDA 2H25A 3I6VA 1TFAA 2XHDA 4QFLA 1Y9UA 3QUJA 3FVKA 4IY5A 2YJPA 4IB2A 3C35A 3PPPA 3S9NC 4YKKA 1DPEA 3RUMA 4NF5A 1B40A 2QS3A 3B6QA 1RYXA 1IXCA 3FJMA 2AIXA 5TU0A 4GL8A 2DVCA 4X48A 2PBWA 5ICQA 4R75A 4NF8B 3B6TA 1US5A 5KDTA 4IO3A 4YMBA 3ZSFA 1A55A 3MPLA 1ZLQA 5K2YA 4ZS9A 3M3KA 4KCDA 2Z23A 2XXIA 1MY0A 4OEUA 3FV2A 1FQAA 3U1OA 1B3FA 4ZEKA 2I3VA 3FVGA 1B3GA 4G4PA 2ANJA 3TUSA 5FTHA 4C0RA 1Y1MA 3EHSA 2Z8FA 4TLLB 4OFLA 5HM4B 4DIGA 5H8HB 4DZ1A 2I0BA 2F7CA 2PT2A 1LBBA 2VGQA 3MP6A 2ZYNA 4ELPA 2B3BA 1HSLA 5HBCA 2ZYMA 4QRZA 3C36A 4FAJA 2UVHA 3IO4A 3VVDA 1URGA 2XXRA 3MVZA 2X7PA 3PUYE 5AA3A 3N6UA 1LCFA 3DLNA 5CMBA 3C34A 1CE2A 1NMUA 4DCYA 2ONKE 2A5TA 4NWCA 1MXWA 2R71A 1B58A 3R7XA 3OOAA 4R74A 2UVJA 3K6XA 4FE8A 2LAOA 1ANFA 3CFLA 3CFZA 4Z0IA 3I5OA 4F2OA 3MUQA 4RY1A 2ZYOA 3MZ1A 3K0VA 4IO5A 3H6WA 3R6UA 4DE8A 1LAHE 1XVXA 1MH3A 2VD2A 4ZE8A 2ZNUA 2QS2A 1ATGA 1MS7A 4LATA 3T9VA 4ESXA 2Y7KA 5I2KB 3BFUA 3QXMA 5CMMA 1IUDA 2RKMA 3RT6B 5AA4A 4QFKA 3N26A 2PVUA 1N76A 5EHSA 2O84X 1MM6A 2HAUA 1JVXA 2Q9TA 2F5XA 1MDQA 4PFUA 5H8FB 1FTOA 4GD5A 1MQHA 3TTKA 2ALUA 3IOTA 3T22A 3N94A 3S9EA 3D4GA 3A09A 4GLIA 2Q8JA 4EQ9A 3TCHA 3KFMA 2DWJA 3TEPA 2YPNA 4H67A 5I56A 1P1OA 4JWOA 1PDAA 1M5EA 2F35A 2VP1A 5L9SA 1OMPA 1P1QA 3SEUA 4KQPA 1JW5A 5M2VA 5DEXB 4POWA 1P1WA 4ZEDA 4UACA 3KN3A 5L9OA 3ILTB 3MJNA 4OERA 3V5AA 2XX9A 2QMWA 4QHQA 4KFQA 3CIJA 2P2AA 3MWBA 3F11A 4XTCQ 1D4NA 3KEIA 4U4XA 5KZTA 2OWTA 2QPQA 3TAJA 2R9JA 1P99A 3VLUA 1SW1A 1S50A 4MLQA 3TQLA 3N6TA 3RLFE 1XHYA 5AE4A 1SD3A 1VE4A 3PUXE 3H4ZA 2VHAA 4IO4A 5CM6A 1O64A 5EYFA 4F22A 1US4A 1MY1A 2I48A 3K1PA 3QSLA 3S9LC 1SYIA 3Q26A 4MF3A 4R2BA 4LQ2A 2Y84A 1Z7ME 3B6WA 1D9VA 4YKIA 3PD9A 1PC3A 4R6KA 5DVIA 1Q1KA 1B3HA 4F29A 4QSDA 1YAEA 5I58A 4DDDA 4M4GA 3VXCA 4R9GA 4G8MA 4TOZA 4R6HA 2FYIA 2Y7WA 3FIRA 3ECRA 1LAFE 4FJPA 3CSGA 2NVUB 1ZMGA 1SDXA 1TFDA 1QJMA 3TTMA 1JEUA 1YPNA 3OO7A 2H98A 5B70A 4ND9A 3LR1A 1B7ZA 3E4RA 1NNKA 1B7HA 2GH9A 4XKPA 3MZ9A 3FUZA 1LFHA 1EZPA 4F18A 5CBRA 4LZ7A 4IO7A 2YLNA 3PU5A 1BKAA 3IB2A 2KLFA 4H5GA 1PBQA 1B52A 1FW0A 2DQVA 4KYEA 3O29A 2A5SA 1AOVA 2XXVA 2ZNTA 3VFJA 1NH8A 4YB5A 2Q88A 2X7QA 2HZLA 1T0KA 3R26A 1NNPA 4FECA 1M5BA 3RNNA 2PMSA 3IOVA 2HFBA 4ZZAA 3H3GA 4DXBA 1N3WA 1I69A 4X9TA 1Y4CA 2O1LA 4OENA 4BDNA 2AYSA 1LB8A 3VV5A 3C33A 1YCJA 2CZLA 1MQIA 5AA2B 3PUZE 1ZJLA 1VSOA 3MBPA 3WAEA 4ESWA 4FEDA 3SEVA 4ZEBA 3SDFA 1B3LA 2UVGA 4MH5A 5TP9B 2G93A 4RYAA 3H6VA 4QF9A 5EHMA 5I2NB 1NH7A 5I59A 4THIA 3G3KA 1B7UA 3Q25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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