4FJPA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with naproxen at 1.68 a resolution
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Naproxen at 1.68 A Resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 115
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fjpA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fjpA02
2XXHA 2RCBA 1EZOA 3IK6B 3CSGA 2PX1A 3I5OA 4GOTA 5ITOA 3T9HB 1MY4A 4QFPA 3EHTA 1YAEA 3LSFB 1XS5A 4YKJA 3FXQA 2XX7A 3HHFA 3VVEA 3L6HA 2ZYOA 3USDA 2UXAA 3ECRA 1IXHA 4H65A 4GQOA 2HQ0A 1PDAA 3IOUA 1S7YA 4QFLA 5DYHA 2D5WA 3DP4A 4K3FA 1A55A 1OIBA 1QKBA 4ZS9A 3DP8A 1MQGA 3HCQA 5F1QA 1RYXA 2H99A 4O3AA 4IO2A 4U1ZA 1N76A 4F3SA 3TQWA 3K02A 1M5CA 2NOOA 2F36A 3P7IA 4IY6A 2HZLA 3VXCA 3KOSA 3Q26A 3QUJA 4QFNA 3DLNA 3B6TA 4R9GA 1P1UA 3CR9A 5KDTA 3O6GA 1P1QA 2R9JA 4GWOA 1EH3A 3CI8A 1B3LA 4LATA 1URDA 3EHUA 2OWTA 2QPQA 4QHQA 4RYAA 3O29A 1BTJA 5JTYB 4POXA 4LZ5A 3EQ1A 1MPDA 1FW0A 2V25A 4YMAA 1B5JA 2IEEA 3BKIB 1A40A 4R2BA 2QMWA 4WKMA 4ELQA 1B32A 3OEMA 4ND9A 4YB6A 1H45A 5EYFA 5KZTA 3Q25A 1VE4A 4OESA 5DT6A 2DVCA 5L9MA 4ZE9A 4DCYA 4R74A 2O69A 2V3UA 5ISUA 1B9JA 3CSBA 1DTGA 1WDNA 1IXCA 4QFKA 3Q29A 4DXCA 1MXUA 4LQ5A 1UTBB 4OQOA 3S2VA 4JSDA 4F1UA 4YAHX 2OCUA 1L5TA 2Y7IA 1QUJA 4TOZA 4MFIA 2Y84A 1M5DA 3LUYA 2ZYMA 4DCXA 1LAXA 1HSEA 3MQ9A 3I3VA 5IAIA 3EN3A 1LCFA 3K6XA 4JSOA 5AA4A 4X1DA 4GF8A 2V93A 1FQEA 3HV1A 4MLQA 3A09A 1XC1A 3FJGA 2F7AA 4IO7A 4QSDA 3FVOA 2RCAA 3FASA 1FQFA 3PMVA 2NUVA 2P2AA 3MPKA 3EF7A 1JW4A 2HAUA 1POY1 3MZ1A 3BFUA 2PBWA 2G29A 3M3KA 1LAHE 2O1MA 2F97A 3H6VA 3MP1A 1LLSA 4RA1A 1B4HA 1SDXA 3IO6A 3PPPA 4OMBA 3LSLA 1S50A 4GXSB 5I57A 2OK2A 5H8HA 1VFDA 3TCGA 1Y3NA 2NXOA 1D9YA 2ABHA 4F3GA 1LB9A 3N6UA 4IB2A 2B3FA 2CZLA 3L6GA 3VV5A 1Z7ME 3H06B 3MVYA 2IA4A 3KSJA 1BIYA 3TTRA 1MXWA 2XX9A 3SETA 1R6ZA 1MQDA 4R6HA 4F22A 3CFXA 4TLLB 4GLIA 1B6HA 4JWOA 3TCHA 3QSLA 4PFUA 1JW1A 4X1BA 3MVWA 1GGGA 3BBRA 3G3IA 4JB7A 5L9OA 1MY2A 2DOJA 3PPNA 4YB7A 4EQ9A 4I62A 1B7HA 1JQFA 3SERA 1HSJA 3QXMA 2QJEA 1UTHB 1KWHA 1N0TA 2VD2A 3MPLA 3FUZA 3OD7A 3CIJA 1D9VA 3F11A 3K1MA 1A8FA 5EHSA 1B3HA 1NNPA 3T22A 4OFOA 1SYIA 3N26A 3OO9A 5FHMA 3VFJA 1J1NA 5BWJA 3RN8A 5FHNA 3LR1A 3O97A 4LVQA 3TMGA 2RC8A 3MZBA 5H8SA 1MPBA 1BP5A 2B65A 5H8FA 3IJXB 4H1XA 4H67A 1AOVA 1HSLA 4Q8RA 4U22A 4FJPA 4TQUQ 4G77A 4ZEBA 1S9TA 2XD3A 5KCJB 2I3WA 2I4BA 5AE4A 1D4NA 1XOCA 1M5BA 2VP1A 1I69A 5ITPA 2A5SA 1FTOA 3TAJA 3UIFA 2X7PA 4NE4A 1B0HA 4MH5A 2DE2A 4G68A 2F7BA 4F2OA 2Z22A 5EHMA 1IXIA 4O3CA 3CG1A 3S9NC 3MJNA 3E13X 4PE5B 3EPEA 3GZGA 2YLNA 2I4CA 5AA3A 1MQHA 1AMFA 4GVOA 1MY1A 1DMBA 4KYDA 3IB2A 1N3XA 3OELA 1B05A 2Q2CA 3ZKLA 5CBRA 1IITA 3TCFA 2O1LA 3MW0A 3PUYE 2AIXA 2PT2A 4UACA 1XVXA 3R6UA 1TFAA 4C1TA 1ATGA 3PU5A 4QSEA 4KYEA 1ZJLA 4L17A 4N6PA 1QW0A 1XT8A 3TKDA 1ZLQA 3N5LA 4R9FA 2AL5A 4DXBA 2H9BA 1NNFA 3FXUA 4R72A 2FNCA 4LA9A 1B52A 1M5FA 5JK4A 4GRKA 2QSXA 4GIZA 1Y1ZA 4NF5A 4ZE8A 4LUBA 2V84A 1JW5A 5B7DA 3RTWB 4YKPA 4ZZAA 4ELRA 1EZ9A 4P0IA 3TTLA 5CC2A 1B3FA 1Q35A 3GLBA 4WXJA 4IO6A 3PMWA 2Q89A 3H4ZA 1B5HA 3TZAA 4F2QA 2O51A 2DXYA 1Y20A 5K2YA 2F6PA 1UQWA 4JWYA 3IOTA 1LCTA 3LBSA 3UK4A 3KGCA 1MRPA 2GH9A 1QVSA 4KCCA 2D21A 4LZ7A 3RUMA 3EHSA 3C31A 2PMSA 3BFTA 3CVGA 2DWHA 4Z7EA 3PD9A 1MXYA 3MAMA 3C9HA 1Y9UA 3QIMA 3SEXA 3IOVA 1IIWA 3M3LA 3RT8A 1MH3A 1B46A 1PC3A 1R9QA 1RYOA 3FJ7A 5KDTB 2H25A 4H8JA 2XX8A 1SW2A 5H8NB 1B1XA 2ONKE 1NH8A 3IX1A 3VLVA 4N07A 2I49A 1O64A 4BLAA 1LB8A 2Y7KA 4E0WA 1SQYA 1Y4CA 2QRYA 1B0LA 3PUWE 1IXGA 1I6AA 1IUDA 2XXTA 2QS1A 1PBPA 4FE8A 1MG1A 5HBCA 2F6GA 4EQ7A 3HSTA 3UGWA 1FCKA 5H8NA 3T96B 3V8XB 3UA8A 4RPOA 3KEIA 4FIMA 3VLUA 1SD3A 1A7LA 3PD8A 4FORA 4PQJA 4DDDA 4G2ZA 1Y3QA 3OMBA 1B58A 1JEUA 3MUQA 1Y4TA 3MP8A 1ZTYA 4OETA 4THIA 3RGYA 1DSNA 2NWJA 3VVDA 2ZMBA 2F78A 3G3HA 1TXFA 4LP2B 1EU8A 1PEBA 2W7YA 1QKAA 3O6IA 2DP8A 5B70A 1BKAA 3C4MA 5AA4B 4Q30B 1SW1A 1IZ1A 3G3JA 3B6WA 4BDOA 2VD3A 4QRZA 1FTKA 2XXIA 3HPIA 1MDP1 1SI0A 1R9LA 3M8UA 2AL4A 3E3KA 2UVJA 3OSQA 1MM6A 4G68C 3SEYA 1LGBC 3DM0A 1OQHA 1LFIA 4DE8A 1VR5A 1PB9A 2OBGA 3KJTA 1DPPA 4NEDA 3JYRA 1NL5A 2QS3A 3ZKKA 4G4PA 5I57B 5H8HB 2DE3A 1R1NA 3AXFA 3TUSA 4I1DA 1B1HA 3RPWA 5CRYA 3K4UA 4ZEDA 3FZVA 1GR2A 2VGQA 4ZZEA 2F34A 2ZNSA 4F31B 4RY1A 3CG3A 1I6QA 5TP9B 3OO8A 3E9XA 2P1SA 3O28A 1MDQA 1SVXB 3QUFA 4I9DA 3PV0E 4MF3A 2GRVA 4MLVA 3VVFA 3VXBA 2DE4A 4NWCA 4OTEA 1JNFA 3TTMA 3PPRA 2H4IA 3KN3A 4I8CA 3RY3A 5HM4B 4RK9A 1UIUA 5M2VA 5TP9A 4FEBA 3IO4A 3S9LC 4IO3A 4QFOA 1MY3A 1NNTA 3O9PA 1FTLA 1CE2A 2XHDA 2XXQA 2R71A 3IJOB 4AQ4A 1XHYA 4KQPA 4WEDA 2YPNA 3THIA 1NKXA 1YTVA 3QYTA 2ESNA 1JVXA 1OVTA 3KSXA 4BDMA 3SESA 1N3WA 2O68A 1MXZA 4XXUA 4BDQA 2KLFA 2RKMA 2WKYA 5H8FB 3A3UA 1A54A 3W15C 3K6VA 1QJMA 2I3VA 5ELVA 3FXRA 1USYE 4GL0A 3T9XB 3G3FA 4NF6B 4QF9A 1US4A 3M3FA 4RNSA 4NWDA 2OLBA 2GHAA 5FHOA 1JVYA 1N7WA 5CBSA 2NVUB 3K6UA 3G7WA 3TDJA 4ESXA 3GBAA 4YMBA 4G68B 4EF1A 1Q1KA 1TWYA 2ZNUA 1PBQA 2M8CA 3OSRA 3RNNA 2OZZA 3H3GA 1NH7A 5I56B 1P99A 4NF6A 1LAGE 4PFYA 3U92A 2F35A 3H6WA 5I2KB 3T9UA 4FATA 2V3TA 3LC8A 4IY5A 1B3EA 3A3CA 1OLCA 3C33A 2O6AA 1IQ7A 1B7UA 4F3BA 4FECA 3W9WA 4ZEIA 2REJA 3O6HA 5I56A 1P1NA 5TU0A 2RC9A 4ZEFA 2ZNTA 1Z7NE 1O63A 1B51A 5I2KA 1QUKA 2ALUA 1ZIUA 4G8HA 1URSA 4IGRA 5CMCA 3K2DA 2H5YA 1MXVA 4KYSA 4NF5B 4X48A 4YZZA 1VFEA 1EZPA 4AB6A 2Y7RA 1ZMGA 4LZ8A 3S9EA 4QSCA 3QAXA 1H76A 4LQ2A 3MC2A 3ILTB 4EDPA 3IAZA 3O66A 4OZ9A 3K01A 3VDFA 2XXWA 2CMOA 2XXPA 2HZKA 2I58A 5CM6A 1NNKA 3TYHA 2I0BA 4YICA 4HTGA 1POTA 3SDFA 1BLFA 4ECFA 2THIA 4U23A 4Q0CA 4R2FA 3PPQA 1MPCA 3B7DA 3SKPA 2XXVA 3VE1B 4OVJA 2RINA 5FTIA 4H0WA 3TELA 3U72A 3MVXA 1T0KA 1MXXA 1N04A 4HCYA 3H6UA 2QMXA 5JEIA 2Z8DA 3TTNA 4YKKA 4OENA 3WAFA 3MWBA 5F7VA 1WODA 4U21A 5DTBA 3KOTA 3HN0A 4ONYA 2XXRA 5DEXB 1LAFE 2ZYKA 1WVJA 2Q9TA 4BDNA 4DIGA 1A99A 2X7QA 4GFRA 1M5EA 1SI1A 1AH5A 1LBBA 5I59A 4PFTA 3K6WA 3KN8A 3SEUA 4C1UA 3MZ9A 3DP6A 2DSFA 4HS7A 4F3PA 1ZU0A 4R6KA 3JV9A 4RXLA 1LFGA 1FTJA 3FVKA 4OWDA 5DEXA 4XKNA 1FQCA 3TTKA 1DPEA 5CMMA 3IORA 2F5XA 2ZYNA 1JETA 2XXUA 5IKBA 3HO7A 4YKIA 2ANJA 2I6EA 4RPNA 2RC7A 1MS7A 4F18A 5L8DA 1D3KA 1USYH 2DXRA 3SEWA 4JWXA 3FGSA 3ZS6A 4HCWA 5CMKA 2UVHA 4P0GA 2FYIA 4JDFA 1FQBA 4KCDA 3D4GA 4H8IA 1XVYA 5AA2D 3PUVE 1YPNA 3C34A 4JBZA 3B6QA 1SW5A 3KJ7A 3FV2A 2D3IA 4H5FA 5BUUA 2Q8JA 1AIVA 3TODA 3FV1A 3OO7A 5FTHA 3ONMA 2F8DA 5CMBA 4OERA 1MQIA 2REGA 1N7XA 4KPTA 3S9MC 3TQLA 3MP6A 3DELB 3RTFB 3Q27A 2UYFA 2HFBA 2H98A 4X9TA 1MM7A 2E0SA 5JTYA 2O84X 3HHGA 4RJZA 4POWA 4KR5A 4OFLA 3UP9A 4U1OA 1VSOA 2QS4A 4IGTA 1NMUA 3H7MA 3UORA 4PETA 1JEVA 1PB8A 3H03A 1H44A 2ZXTA 3LSWA 5CI5A 3TPAA 4GXAA 4E0XA 4NMYA 2XXYA 3PUZE 4ISUA 4KFQA 1UTBA 2GHBA 3C32A 3IL1B 3FD3A 4YB5A 3IB0A 4NTLA 2V3QA 2DWIA 4ELOA 3OO6A 4ZECA 1SYHA 3ILUB 4R75A 1SBPA 4LONB 4FEDA 2YJPA 4F1VA 1FQAA 3RQTA 5LOMA 5I2NB 4FAJA 5DVFA 4UA8A 1FQDA 3GXAA 1P1OA 1LSTA 2P0SA 2Y7PA 3OOAA 2Z8EA 3KZGA 3V5AA 4NF8B 1SW4A 3T66A 3K1PA 2GFEA 1QUIA 5ICQA 5I84A 3KFMA 4OHNA 1OLAA 4GD5A 4RK2A 1QULA 3FVNA 1B4ZA 4U2RA 4IO4A 3MVZA 2RF1A 5I2NA 2ONRA 2Z8FA 2E1SA 1OMPA 4AB5A 1B2HA 2OJTA 2QS2A 4Z0IA 3Q28A 3U93A 4NF8A 2G93A 2DWJA 2QL3A 4M4GA 5J1DA 1A8EA 1I6BA 3GBBA 1MY0A 1LBCA 4G8NA 3RT6B 3V83A 4R73A 3FVGA 1B3GA 4ZEKA 2PVUA 3U8QA 1GVCA 4U4XA 2I0CA 1RKMA 3CFLA 4F1YA 4F39A 4XKRA 1ELJA 2DVZA 3OXNA 2ONSA 4O3BA 1B40A 1ZBMA 3PGFA 3C35A 4F19A 4DLDA 1TFDA 4H5GA 3WAEA 3PMXA 3VLWA 4GL8A 1PB7A 4BDLA 1CB6A 3ODBA 5L9SA 3FIRA 5A5XB 3G3KA 3W9VA 3FJMA 3CRBA 4EF2A 2A5TB 1B5IA 1H3DA 2XXXA 2AYSA 3UN6A 3IOWA 3RLFE 2LAOA 3KG2A 1UTHA 3KN7A 3PPOA 4IO5A 2Q2AA 1DOTA 1NFTA 4OXVA 5TPAB 3PUXE 4EQBA 1O7TA 3SEVA 4C0RA 1GTKA 4TLMB 5DVIA 3TFLA 3T9VA 3OEKA 1N84A 5A5XA 4BDRA 4PP0A 2DS9A 2I48A 2A5TA 3TEPA 5AA1A 3O2AA 2DQVA 4F29A 2XD2A 3U1OA 2UYEA 3JZJA 3K00A 3R7XA 1FTMA 4G8MA 1UIVA 5ICTA 2UVIA 5TPAA 1DTZA 2UVGA 2B3BA 4R6YA 3FATA 4MBPA 1OVBA 4XKPA 2R6GE 3QK6A 2DWAA 4WEPA 4EXLA 2PT1A 3IB1A 1TT1A 1ZKBA 2Q88A 1GV8A 2HEUA 2O7UA 5KCJA 3D4CA 4NF4B 3LSXA 2X26A 4H6DA 2Y7WA 3C36A 1LFHA 1Y3PA 4OYVA 5DVJA 1Y1MA 3OENA 2O7IA 4DXUA 4XKQA 4M1VA 1B7ZA 1H43A 2HXWA 1AL3A 3K1NA 4NF4A 4PFWA 1URGA 5I58B 3I6VA 1YCJA 1OQGA 4OFJA 5H8QB 2PYYA 4EUOA 4KD5A 2DYXA 1P1WA 3IR1A 1US5A 4OEVA 1IEJA 4OEUA 3MBPA 2FA7A 4KI0E 4JXIA 4XIGQ 3N6TA 4EXKA 3U94A 5AA2B 2OWSA 4HW8A 4YU0A 2Z23A 1ANFA 3CFZA 5I58A 5I59B 3T93B 5H8QA 2HCAA 3N94A 2VHAA 4ESWA 3ZSFA 3KBRA 2F7CA 2BJJX 3G3GA 2HAVA 3R26A 4P11A 1MH4A 3V89B 4N13A 4ZDMA 1II5A 4U4SA 5HPQA 5AA2A 2VOZA 3E4RA 4KHZE 4DZ1A 1F9BA 3K0VA 5K2XA 3H6TA 1MQJA 4ELPA 4Q5TA 4XTCQ 3S4UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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