4FJPA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with naproxen at 1.68 a resolution
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Naproxen at 1.68 A Resolution
rcsb
total genus 115
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fjpA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fjpA02
2HFBA 1P1QA 3H6VA 1Y20A 4I8CA 2O6AA 5AE4A 5KCJB 1P99A 4RA1A 3OO8A 5KDTB 4DXUA 4G8MA 4ESWA 3H4ZA 4YKKA 2XXQA 4IO4A 5I59A 5DTBA 3CRBA 4N07A 1R9LA 2V3QA 1DTGA 4ZEIA 1B46A 1JW5A 2R6GE 1M5CA 1WDNA 1FQDA 3LSLA 1B9JA 5BUUA 2DE2A 2ZNTA 1US5A 4WEPA 4C0RA 4JXIA 1DSNA 1H43A 1B40A 5A5XA 1SW5A 2OCUA 2E1SA 5AA2D 3OXNA 1DPPA 4RY1A 3D4CA 4THIA 4R2FA 2ESNA 5CMMA 2YPNA 2XXHA 1OQGA 1LGBC 1O7TA 3V5AA 3S9LC 1FQFA 3G3JA 4R6HA 3IAZA 1SI0A 1B58A 3T96B 2DXRA 3O6HA 4F19A 4OMBA 5H8SA 2F36A 1IXGA 4P0GA 1B3EA 2A5TB 3PPRA 3TODA 1B0LA 4F3BA 3U8QA 1PBPA 4F39A 2XX9A 1QUKA 1IITA 1BP5A 3H6UA 4TOZA 1USYH 3WAEA 1N0TA 3E13X 2Y7PA 3H06B 3FV2A 3K6XA 1S9TA 4Z0IA 4R74A 4U1ZA 4F3GA 3QYTA 5K2XA 5H8NA 2QMXA 5I2NB 4M1VA 3LBSA 4IY6A 1QJMA 4RXLA 3SETA 3DP6A 3PPQA 3TTMA 1JEVA 3Q25A 3HCQA 2QS1A 3OEKA 4PETA 1MQHA 1OIBA 4I1DA 1N3WA 2ZNUA 5ELVA 3KOTA 3TTLA 4X1BA 1BTJA 1JETA 2AYSA 3O29A 1PB7A 3FUZA 4OZ9A 2Z8EA 2XXVA 2QS4A 1MXVA 4QSDA 1FCKA 2ALUA 5I59B 1N76A 3K1PA 3M8UA 2UVHA 2XXIA 5IKBA 3PMXA 1LSTA 1MH4A 4G8HA 4ZE8A 3OMBA 1POY1 2O69A 2DOJA 3KSXA 2X7PA 3FIRA 3PPOA 2DQVA 1O64A 4Z7EA 4HCYA 5L8DA 2VD3A 1UIVA 2X26A 4XKRA 4R6KA 2F6PA 1B3HA 4G4PA 3PPNA 1D3KA 4F22A 1FTLA 1QKAA 3C32A 4HW8A 1HSJA 2F5XA 1DPEA 5DVFA 4AB6A 3RUMA 2DVZA 3CSGA 1UTBA 2XD2A 1SYIA 1NH8A 4LVQA 3N94A 2A5SA 2B3FA 3FATA 2DE4A 5ITPA 4G77A 4DXBA 1PC3A 3EHUA 5DEXA 4OESA 4WEDA 3TTKA 1LAXA 3MW0A 1MY4A 3L6HA 3O28A 4F31B 5DVIA 1XVYA 5AA2A 2HXWA 2PVUA 3FXUA 4PP0A 4PQJA 3QAXA 2XXYA 1HSLA 1JW1A 3N5LA 3KJ7A 3MVWA 4IO7A 5H8QA 4E0WA 1EZ9A 3L6GA 3MVZA 4YB6A 1Y3PA 5H8NB 1B5IA 2RINA 3T22A 5KZTA 4OQOA 4PFWA 1EH3A 2F8DA 5TPAB 1NL5A 2ABHA 3T9UA 3DELB 2ONRA 4NMYA 4GOTA 3ZSFA 4ESXA 3T9VA 3PMVA 2REJA 2UVGA 4F18A 3LSWA 3IORA 1QULA 5AA3A 3CSBA 4P0IA 1Y3NA 5ISUA 3IB1A 2B3BA 1ZTYA 2OWTA 4OFOA 1A8FA 4H5GA 1AH5A 3MBPA 1XS5A 5H8FA 3ILUB 3U72A 3VXCA 3M3FA 2O1LA 1BKAA 2ONKE 4G8NA 1LCTA 3THIA 4UACA 1B7HA 1XOCA 4X1DA 4BDOA 2XXTA 4U4XA 3O66A 3S2VA 1Y1ZA 1Y3QA 3OSRA 4YKPA 1MQDA 3MZ9A 4NE4A 2RF1A 4RJZA 3IO6A 1MPCA 4U23A 3S9MC 1B5HA 2RC8A 1FW0A 3ZS6A 1ELJA 3CG1A 4QSCA 3JV9A 5CRYA 1ZU0A 4ZEFA 3FVKA 4F1VA 2O68A 4ZZEA 3U1OA 3UN6A 1UTBB 5I2KA 2F7CA 3MQ9A 4NEDA 3PUWE 3SEWA 1UTHA 4H0WA 4LUBA 3TMGA 1GR2A 2V3TA 3RTFB 3RQTA 2DS9A 3QUFA 5DEXB 4GXSB 4JWOA 5HM4B 3K4UA 2RC9A 1B05A 4QFLA 3LSFB 2NUVA 3FXQA 2IEEA 5AA2B 2Y7IA 4POWA 3K2DA 4U22A 2W7YA 3FVGA 3N6UA 4KD5A 1N3XA 3HSTA 3SESA 3U93A 2F78A 1MPDA 5H8QB 1JW4A 2QRYA 4HCWA 2D5WA 2Y84A 3EQ1A 5ICQA 1II5A 4PFTA 5CC2A 2HQ0A 3ILTB 5FTHA 4BDNA 2G29A 1DTZA 1M5DA 5HBCA 1D9VA 3B6WA 2H99A 4OENA 1AOVA 1TFDA 3LSXA 4JB7A 1OVTA 2LAOA 4GWOA 4PFUA 2WKYA 3IB2A 4XIGQ 2E0SA 5EHSA 1POTA 5I58A 4KYSA 4DLDA 2RCBA 1MXYA 1IXIA 4YU0A 4C1TA 2PT2A 1TXFA 4LP2B 5H8FB 1QKBA 1PDAA 3CFZA 1B3FA 4EDPA 2YJPA 2OK2A 4LZ7A 3MZBA 4ND9A 4TLMB 3Q26A 3SERA 5EYFA 1OLAA 3ZKKA 5CBRA 1IIWA 1MPBA 3KGCA 3EF7A 4L17A 1VE4A 2ZNSA 2GRVA 4JDFA 4FJPA 3KSJA 1N7WA 3K01A 1R1NA 2YLNA 3OELA 1MQIA 2DP8A 1A7LA 3DM0A 2PYYA 3IJOB 5I2KB 3TPAA 2Z23A 1PEBA 3SEXA 1UTHB 1NMUA 4NF4A 2H9BA 5EHMA 4FAJA 3K6VA 3EHTA 3LUYA 4GQOA 3JZJA 4AB5A 5CMBA 3K6UA 3VVFA 4ELOA 1ZMGA 1ZJLA 3MP8A 4MBPA 4LONB 3KJTA 4OEVA 1SVXB 3DP8A 3TQWA 3PUVE 5K2YA 5H8HA 1MM7A 3FVOA 5I57B 4U21A 2PMSA 3S9NC 1LFGA 3KOSA 1YTVA 1N04A 2O51A 1B7ZA 3GBBA 3H6WA 4U2RA 5J1DA 3E4RA 1SW2A 3CIJA 1SW1A 2XXWA 4E0XA 1ZKBA 2P2AA 4XKPA 4KHZE 1L5TA 2M8CA 3HV1A 2HAUA 2RKMA 5I58B 2O7UA 4G2ZA 1HSEA 2BJJX 2ZMBA 1RYXA 1J1NA 3OO6A 3Q29A 4O3BA 4YB7A 3V83A 1GGGA 2OJTA 4X48A 3LR1A 3TDJA 4PFYA 5TPAA 3V8XB 4RPOA 3KZGA 2QPQA 4QFOA 3C4MA 3OSQA 3ECRA 4BLAA 5I84A 3RT8A 2PX1A 4LZ5A 1H45A 3UGWA 1FTKA 3PMWA 4ELPA 1AMFA 3CFLA 5ITOA 1JVYA 4QRZA 4OEUA 3IK6B 1NFTA 2FYIA 4ZDMA 3UA8A 4NF4B 1XT8A 2O1MA 1OLCA 4KR5A 3DP4A 1SDXA 5CMKA 1IEJA 3KN7A 2I0BA 4ZE9A 3HO7A 4EQ7A 1R9QA 4Q0CA 2VD2A 3F11A 5H8HB 4LQ5A 3VFJA 1VSOA 1BLFA 2OLBA 4XXUA 3FVNA 4ZEBA 3A3CA 1QUIA 4BDQA 2QJEA 4JWYA 4KQPA 4H65A 3RNNA 3O6GA 4GRKA 2F7AA 3R7XA 4YKJA 4F2OA 5DT6A 2HCAA 2Q89A 1OVBA 3S9EA 1NH7A 3TFLA 5CI5A 2DXYA 2GFEA 1ATGA 5DVJA 4P11A 5B7DA 4XTCQ 3RGYA 1PB8A 4YMBA 3CFXA 1MG1A 3EPEA 4NWDA 3W9VA 1H76A 2XX7A 3HHGA 3D4GA 4RK2A 2NXOA 4IY5A 3RN8A 4EXKA 5F7VA 3KBRA 3BFUA 4BDLA 3O9PA 2VP1A 3TTNA 3G7WA 4GVOA 3ZKLA 1MY1A 4I9DA 3K0VA 2OWSA 3OENA 4EF2A 2PT1A 3B6QA 2ZXTA 2IA4A 3BFTA 4FE8A 1OQHA 2I3VA 2GHBA 3U94A 2I3WA 3Q27A 1B6HA 3C34A 2VOZA 1Z7ME 3B7DA 1IXCA 3FJGA 1AL3A 1PB9A 4LA9A 4X9TA 5B70A 3W15C 3MJNA 3G3KA 4IO3A 2Q2AA 3FV1A 3TQLA 2FA7A 1B1XA 1PBQA 1MRPA 1NNFA 3CI8A 4F29A 1Y4CA 1VFEA 3OD7A 4F3SA 4ZEDA 3VLWA 3C33A 3GZGA 3RTWB 2OZZA 3ONMA 1FTMA 4POXA 4DXCA 3HPIA 4K3FA 4ISUA 1M5BA 5L9OA 1Y9UA 4EF1A 4R75A 5CMCA 3I5OA 2XXRA 4OVJA 3W9WA 2DSFA 3R26A 3JYRA 1GTKA 2UYEA 4ELRA 3MUQA 5I57A 1B3LA 2DVCA 2QS2A 3MP6A 1LAGE 4NTLA 3IOWA 4DCYA 4OERA 1SI1A 4R9GA 1RYOA 2RCAA 1US4A 4GLIA 4TLLB 1XHYA 3AXFA 1D9YA 3SDFA 1FQEA 4OTEA 3FXRA 3MP1A 3RY3A 4C1UA 2FNCA 4R9FA 3C31A 3A09A 4QFKA 3O6IA 1P1NA 1JEUA 4DE8A 1P1OA 3RT6B 1CE2A 2GH9A 1DOTA 4O3AA 4MF3A 4FATA 5HPQA 1QUJA 3EN3A 2ZYOA 4R73A 2Z8DA 4U1OA 1NNTA 3SKPA 1NKXA 2DYXA 4OFLA 4R6YA 2NVUB 4MFIA 5TU0A 4Q8RA 3KEIA 4ZS9A 5CBSA 3FASA 1FQAA 1URGA 2V25A 2HAVA 2ZYMA 1Q35A 5JEIA 5JK4A 4KYDA 3VV5A 4GL8A 1LFHA 2H98A 2H4IA 3TUSA 2QMWA 2XHDA 4DZ1A 3K1NA 1YCJA 1B0HA 2I4CA 1LLSA 1B4ZA 1SYHA 2UVIA 4YB5A 1MDQA 3IOTA 1SD3A 4QFNA 4UA8A 3T9HB 3TTRA 4F2QA 1B51A 2UXAA 4WXJA 4HTGA 1D4NA 4G68A 3IL1B 2NOOA 3HN0A 4NF5A 3E9XA 4GFRA 1CB6A 1EU8A 3SEVA 1T0KA 1SW4A 3T66A 2QSXA 1I69A 3VVDA 4YKIA 4IGTA 3T93B 3O2AA 2P1SA 2Y7WA 3PPPA 4YMAA 4DIGA 1LAHE 5IAIA 1XC1A 2I4BA 1USYE 5LOMA 2XXPA 4F3PA 4ZEKA 3OO7A 3MPKA 4JBZA 4EQ9A 1ZBMA 4H67A 3GLBA 3MAMA 4DCXA 3VVEA 3I3VA 3H3GA 4YICA 1O63A 1B3GA 3M3KA 5FHNA 3PUZE 3IO4A 2H25A 2H5YA 3VXBA 4YAHX 4TQUQ 2V84A 1R6ZA 1A55A 4Q5TA 4FEDA 1LBCA 4F1YA 1IXHA 1JNFA 4RK9A 5TP9A 1B1HA 2Z22A 2DWHA 5DYHA 3VLVA 1SBPA 3IX1A 1MY2A 3IJXB 3R6UA 1H44A 3K02A 4XKNA 1GV8A 1XVXA 2I48A 4RYAA 2HZKA 4N6PA 1B7UA 1MY3A 1FQBA 3KG2A 1IZ1A 1TWYA 2DWJA 1WODA 1YAEA 3OOAA 1GVCA 4XKQA 1A54A 2XD3A 2Q2CA 4WKMA 1TT1A 3VDFA 2DWIA 4NF8A 3U92A 4H8IA 5I56A 3A3UA 1LB9A 2V3UA 1IQ7A 3FJ7A 4OHNA 1M5FA 1SQYA 3FZVA 4OXVA 1WVJA 2AL5A 4NF6A 3MVYA 1LBBA 1N84A 3QK6A 3Q28A 3C35A 5M2VA 4FIMA 4G68C 3P7IA 3KN3A 4G68B 3T9XB 4NF5B 4LZ8A 4QFPA 2R9JA 1VFDA 3LC8A 1KWHA 1P1WA 1LCFA 1ANFA 4JSDA 4EXLA 3O97A 3K1MA 5L9SA 4H1XA 1B4HA 4KCCA 2F97A 4AQ4A 3FGSA 3MPLA 2XXXA 3G3HA 1S7YA 3C9HA 4KFQA 2QS3A 1JQFA 3BBRA 3M3LA 1Z7NE 3CG3A 1LB8A 5JTYA 4FORA 4H5FA 4MLVA 2F6GA 5A5XB 3PV0E 3KFMA 4KCDA 2VHAA 3TELA 4BDRA 4NWCA 3V89B 4F1UA 2HZLA 2Y7RA 3MZ1A 4QSEA 2I0CA 3DLNA 1MQJA 4R72A 3TEPA 1LAFE 3UORA 1LFIA 1URSA 5TP9B 4M4GA 2HEUA 5FHMA 4YZZA 1MM6A 2G93A 3TAJA 2Q8JA 3K00A 1B5JA 4RNSA 2GHAA 1UIUA 2V93A 4MH5A 4ONYA 1MH3A 4ZECA 3WAFA 3USDA 2NWJA 1MXXA 1EZOA 2ZYNA 4N13A 3IOVA 3UK4A 4OFJA 3TCGA 3BKIB 3N26A 2ONSA 2CMOA 4H8JA 1NNPA 1FTOA 4HS7A 3OEMA 1OMPA 2Z8FA 4QF9A 1MXZA 1MDP1 5L9MA 3FJMA 4FEBA 1NNKA 3VLUA 3FD3A 4EUOA 4FECA 3SEYA 4NF8B 4R2BA 5I56B 1UQWA 3PUYE 4KYEA 1MY0A 1ZLQA 3QIMA 4DDDA 3G3IA 4NF6B 3IR1A 4IO5A 3E3KA 3G3GA 5BWJA 3KN8A 3TCFA 4IO2A 5FHOA 3UP9A 4OETA 1Q1KA 3I6VA 1B32A 2VGQA 3S4UA 4JSOA 1S50A 4QHQA 2Y7KA 1I6BA 1QVSA 4Q30B 5ICTA 2XXUA 2XX8A 1MQGA 3IB0A 5AA4A 1FQCA 3GXAA 3C36A 2CZLA 4O3CA 4IB2A 2Q9TA 2P0SA 2X7QA 2ZYKA 1JVXA 4RPNA 3MC2A 3ODBA 1F9BA 2QL3A 3CR9A 4JWXA 4LQ2A 4I62A 4U4SA 5JTYB 1RKMA 3TKDA 3N6TA 2O84X 3QXMA 3SEUA 4IGRA 1TFAA 2DWAA 3UIFA 4OWDA 3RLFE 5KCJA 1B2HA 5KDTA 1M5EA 3IOUA 3RPWA 4ZZAA 4IO6A 3K6WA 1ZIUA 2O7IA 2REGA 2F35A 3GBAA 3H03A 3HHFA 3PD8A 1QW0A 1A40A 4LATA 3H6TA 3TCHA 3EHSA 4OYVA 3OO9A 4EQBA 2KLFA 2PBWA 1MXWA 1N7XA 1FTJA 2I6EA 2OBGA 5AA1A 2Q88A 3G3FA 4GXAA 2RC7A 4GF8A 1A99A 3CVGA 2DE3A 1B52A 1Y1MA 4ELQA 4KPTA 2THIA 2ANJA 2UVJA 4H6DA 1URDA 3H7MA 1EZPA 3B6TA 2D21A 4PE5B 1MXUA 2F34A 4MLQA 1AIVA 1I6AA 2I49A 2A5TA 4GL0A 1A8EA 3PD9A 3PGFA 3MVXA 2F7BA 4ECFA 4GD5A 2B65A 1P1UA 1H3DA 1YPNA 1I6QA 1VR5A 5CM6A 2I58A 5AA4B 1MS7A 3TYHA 2AIXA 1Y4TA 1BIYA 5I2NA 5FTIA 3QUJA 1IUDA 4KI0E 3VE1B 2R71A 1DMBA 2D3IA 3QSLA 5F1QA 3PU5A 4BDMA 3TZAA 4GIZA 3MWBA 2UYFA 2AL4A 3PUXE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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