3G3IA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer i442h k494e i749l q753k mutant with glutamate and nacl at 1.37 angstrom resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
256
structure length
255
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLELSTHLGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREEVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 255
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3iA02
3BFUA 3S9EA 5EYFA 4DE8A 4RXLA 5CI5A 3SKPA 1LGBC 1B40A 4DZ1A 3PUZE 2DS9A 3IOWA 3QXMA 4ZZEA 5I59A 2I49A 4Q0CA 1OVTA 1OVBA 4QFLA 3FATA 3IOVA 4JBZA 3G3GA 2B3BA 1VSOA 3HPIA 1EU8A 2P1SA 5CM6A 5I57A 5F1QA 3R7XA 4EF1A 4IO4A 4OEUA 2QJEA 3OSRA 5I58B 4XKPA 3U92A 3DLNA 4U23A 4JWXA 2I6EA 5JTYB 4KCDA 5FTIA 3FUZA 1JQFA 1SI1A 2DE4A 4DIGA 5ITPA 3A3CA 3MVXA 3U93A 1QKBA 3PV0E 4C1TA 2DVZA 3CIJA 1D9VA 4F1VA 4XXUA 1YCJA 4ZEDA 4F18A 4MLQA 3TEPA 3E4RA 1USYE 2CZLA 3RT8A 5AA1A 3VXBA 1KWHA 4G68A 3U94A 2OCUA 2PBWA 3D4GA 3O6IA 2XXRA 2Q8JA 4YB7A 4Q5TA 3GXAA 3V83A 2DYXA 3S9LC 1FQFA 1DSNA 3MQ9A 2XX7A 4MH5A 2ZNSA 5L8DA 4FEBA 4JDFA 3GLBA 1MH3A 1O64A 3RUMA 2Y7RA 1NMUA 1WDNA 5HM4B 1LAXA 2I4BA 3FXRA 1T0KA 4QSEA 1A54A 1R9LA 4OWDA 1I69A 5AA3A 5KZTA 1UTHA 1USYH 2AL4A 4MLVA 3VVFA 5TP9A 2F5XA 3TKDA 1ELJA 4GL0A 3E13X 2XXVA 3EHUA 2NWJA 1TT1A 1LAFE 3RQTA 5CC2A 1ZIUA 2V93A 4KYSA 3K4UA 1DMBA 4JSOA 3K0VA 4FIMA 2RC9A 5AE4A 1FQEA 5AA2B 1FQAA 3MZ9A 1LFIA 4GWOA 5CMCA 1LCTA 1SDXA 4R74A 3EPEA 4NF6B 3PPRA 3PUXE 3VLWA 2DXRA 4U4XA 1OLAA 4NE4A 2WKYA 4YICA 1B7UA 1LBCA 2Q88A 3B6TA 3UGWA 1QUKA 1SW2A 2F35A 1FTOA 1A99A 4QFOA 2ZMBA 4X1DA 4XTCQ 3IK6B 2NOOA 1S9TA 2F8DA 2H5YA 1MY4A 5K2XA 1B9JA 2XXIA 4QFNA 3S2VA 4TOZA 4F2QA 1B3HA 4DXUA 2QRYA 1Y1ZA 4GD5A 5JEIA 3DELB 4F19A 2QS4A 1N84A 2OZZA 5KDTB 3CSBA 3SETA 4HTGA 4QHQA 1ZLQA 3TZAA 2ZXTA 4BDQA 2F36A 4KYEA 4X9TA 3MP8A 4ZEIA 5I2NB 3RGYA 4PFYA 2I3VA 4JSDA 1M5BA 1II5A 1P1UA 1B32A 3PPNA 1IXIA 1B51A 4WEDA 4KHZE 3FZVA 4OEVA 3MAMA 1MY2A 2Z8DA 1Y3PA 2X7PA 2DP8A 2DE2A 5FHMA 1PBQA 1AMFA 1PC3A 1JVXA 4RA1A 3C36A 3S9NC 1TXFA 3HHFA 3SDFA 3TODA 5I58A 1H44A 4N07A 1N3XA 2ZYNA 3K6XA 2A5TB 2UVJA 1Y20A 3FVKA 3OO8A 1IQ7A 2YPNA 4ZECA 1JEVA 1N7WA 4IY5A 3ECRA 3UN6A 3G3JA 1BLFA 2H9BA 1NFTA 1EZPA 1MQIA 2W7YA 4KR5A 2PX1A 4ZDMA 3Q25A 4F3BA 2Y84A 1WODA 4WEPA 3QUJA 1YAEA 3CG1A 1QULA 2GHBA 4ZE9A 4ZEFA 1SD3A 4ELOA 3CR9A 1LB9A 3OELA 4HS7A 1Y4TA 2ANJA 2QS1A 1O63A 2F6PA 3O6HA 4K3FA 4F3GA 1BIYA 2V3UA 3MP6A 4QRZA 2H99A 1H45A 1MY0A 2DWAA 3P7IA 3FJGA 4PFWA 3FV1A 1MXYA 5FTHA 2AYSA 1HSEA 3FV2A 5K2YA 4ECFA 4H8JA 3KEIA 1IXCA 3IX1A 1Y4CA 3M3FA 3M3KA 3VFJA 1SBPA 4NF4B 1M5EA 3JYRA 2F7AA 4F1UA 3MVWA 3ONMA 5L9MA 5AA2A 5ITOA 4X48A 3PU5A 1GV8A 2Z8FA 3TCHA 4JXIA 2F6GA 2IA4A 4O3AA 1MY1A 1LAHE 2XXTA 3V8XB 2R6GE 1RKMA 4NF6A 3MZBA 2QS3A 3KOTA 1JEUA 2RKMA 5HPQA 2R71A 3TTNA 4PQJA 3Q27A 1B6HA 1N04A 2Z23A 4LZ7A 1QUJA 1Z7NE 3O97A 2ESNA 2M8CA 3K1PA 2REJA 2NXOA 4RJZA 1HSLA 2O7UA 5DTBA 1JETA 3TELA 1UIUA 1B0HA 5A5XA 1I6QA 4H8IA 3O9PA 1OIBA 1QKAA 3GBAA 2HFBA 3KZGA 2ALUA 1B3FA 4N6PA 2ZYKA 4GIZA 4MBPA 1R9QA 4FATA 5ICQA 4E0XA 3PUVE 3QSLA 1ZBMA 4RK9A 5I2NA 2Q2AA 3TTKA 2ONSA 1LCFA 3H3GA 1TFAA 2UVGA 4GVOA 3DP8A 4WKMA 1NH8A 4RPNA 3TTRA 3UORA 3TCGA 1CE2A 1MPDA 3G3KA 3GBBA 3Q28A 4POXA 5CBRA 2XX8A 1DPPA 4RPOA 3LSXA 1JVYA 3T22A 4LQ5A 1OLCA 1I6AA 1MXWA 1ZU0A 2PYYA 2RF1A 4EDPA 3HV1A 3OD7A 5H8FB 4H6DA 1URSA 1NL5A 1D9YA 2O84X 2O7IA 2HZKA 2ZNUA 2GH9A 3C35A 1MXZA 3FXUA 4OZ9A 2XD2A 2I4CA 3FXQA 3RTFB 1B5HA 4DCXA 2F7CA 4FEDA 2G29A 4KI0E 4FE8A 1B3EA 1UIVA 3T9XB 3RT6B 1JW4A 1AIVA 4GXAA 3K6WA 1MXVA 2REGA 1MH4A 3LC8A 3HHGA 4LVQA 3LSLA 1O7TA 4YU0A 2G93A 1CB6A 2QMWA 3H06B 1URDA 2H98A 4FJPA 3PUWE 5L9OA 4I62A 2LAOA 1POTA 3C31A 4IGRA 5DEXB 1MXXA 2QMXA 3IJOB 3OO6A 5H8NB 1M5FA 3RY3A 3VE1B 2O1MA 2VP1A 2THIA 1MY3A 3IOTA 4ZEKA 5CMMA 4H65A 4LZ5A 3PPPA 3KN3A 4GFRA 4U2RA 2I0CA 3I5OA 4R9GA 1IXHA 1A8EA 1B1XA 5TU0A 1EZOA 4Z7EA 3QK6A 2I0BA 2YLNA 3IO4A 1MM7A 2KLFA 3FVNA 3TTLA 1N76A 2VD3A 3IB1A 5CRYA 3W15C 3MWBA 2VOZA 2DOJA 1IUDA 4F29A 5KCJA 4EQ7A 3T93B 1LAGE 3B6WA 2HQ0A 4U4SA 4NF4A 4GL8A 4OHNA 1ZKBA 4NMYA 4GRKA 1RYOA 3U1OA 4IO6A 3PUYE 4MF3A 4LQ2A 3IB0A 4H0WA 4LZ8A 1YPNA 3WAFA 4ESXA 1MQGA 1XOCA 1US5A 1BKAA 4RY1A 3H6WA 4C0RA 3RLFE 4QSCA 2HAUA 3TAJA 1XT8A 1L5TA 4F1YA 1MPBA 3H6VA 3V5AA 5F7VA 5I56A 3ZKLA 5IKBA 4LP2B 3G3HA 3UK4A 3CFXA 4NF5A 1A40A 3G3FA 2FYIA 5L9SA 1P1WA 3VVEA 1FTJA 5H8HA 3C4MA 1B7HA 1FTMA 2F78A 1IEJA 3KG2A 4R72A 3FD3A 1P1OA 1NNTA 3H6UA 4R2BA 1B2HA 3B6QA 1WVJA 1Z7ME 4I9DA 2B3FA 2E1SA 1NNKA 4Q30B 1HSJA 3O2AA 1VFDA 3TQWA 2YJPA 2O6AA 2I3WA 2VD2A 4DXCA 2GHAA 4UACA 1B7ZA 4YB6A 4NTLA 2RC7A 3HN0A 2HAVA 3R26A 4G68C 4ONYA 4P0IA 3TFLA 4ZZAA 3SEUA 2XXPA 1A7LA 3UIFA 3T96B 2NVUB 1MDP1 2Y7IA 3PPOA 1YTVA 4ND9A 2V3QA 2Y7WA 1MG1A 3PMVA 3RPWA 1MQHA 2RCAA 2XHDA 1SW4A 2FNCA 3TYHA 3EHTA 5H8FA 4KQPA 3QIMA 3IAZA 3CRBA 5ICTA 4OETA 1XVXA 3LSFB 4RK2A 4IB2A 4PETA 4ELPA 5JTYA 3Q26A 1D3KA 3OO7A 3HO7A 4I8CA 4IO5A 4EQ9A 3SESA 4XKRA 2V84A 5EHSA 2ONRA 3KN8A 2VGQA 1S7YA 1JW5A 3B7DA 1B52A 2CMOA 3W9WA 1B4ZA 1LFHA 2DSFA 3THIA 2RCBA 5IAIA 3VDFA 3O66A 3KSXA 2P0SA 3MVYA 1ANFA 3PD8A 2R9JA 4ESWA 3H7MA 1MQJA 1XC1A 1OQGA 4G68B 3EN3A 2NUVA 1N7XA 2UYFA 2P2AA 4NF8B 3OEMA 1A55A 4U21A 3TUSA 3KJ7A 2XXQA 3G7WA 1UTBB 3DM0A 3K00A 4F3SA 3C33A 3DP6A 4JWYA 1FW0A 3LSWA 3PPQA 4G8HA 2UVIA 1B5IA 2OWSA 4EUOA 2XXHA 1ZTYA 5DYHA 4XKNA 3VVDA 4QSDA 4U1OA 1J1NA 3OOAA 1NH7A 1IZ1A 1XS5A 5TP9B 1MDQA 1B46A 1VFEA 2XXXA 3K1NA 4YKJA 3N6TA 1LBBA 3VLUA 4ZE8A 1Y9UA 5DVJA 4ELQA 3IJXB 4OFOA 3LBSA 4LONB 3IOUA 3JZJA 4BDOA 2AIXA 4OERA 4OYVA 5BUUA 1LSTA 2I48A 5TPAB 3T9VA 4ELRA 3OENA 4F31B 4UA8A 3D4CA 4O3CA 3CG3A 3VV5A 2OWTA 5J1DA 3K01A 3TQLA 2OJTA 2Z22A 3MPLA 5I84A 3SEVA 5AA2D 3FJ7A 4R6HA 4L17A 1SW1A 1FQBA 2QSXA 2VHAA 4HCWA 4YZZA 5ISUA 1D4NA 3ZS6A 3PMXA 4M1VA 1GTKA 1PB7A 3RTWB 4P0GA 2QS2A 2X26A 3A09A 1NKXA 4H5FA 4ISUA 1N3WA 5KDTA 4F3PA 1DPEA 3T9HB 3AXFA 3CFZA 3G3IA 3O6GA 3M8UA 5DVFA 1PB9A 4MFIA 2D3IA 1IXGA 5I2KB 1F9BA 3U8QA 4PP0A 4XKQA 2DVCA 1H76A 1Y3NA 2GRVA 3KBRA 2A5SA 3TCFA 5AA4B 3IO6A 3IR1A 4Z0IA 1ZMGA 2ZNTA 3BFTA 1A8FA 1P99A 3M3LA 2E0SA 3KFMA 2QL3A 2QPQA 3Q29A 4R73A 3QUFA 2DWIA 2DE3A 3I3VA 4F39A 3R6UA 4U1ZA 3N5LA 1IITA 2Q2CA 4I1DA 4IY6A 1FTKA 4ZS9A 3H03A 1TFDA 4EXKA 4GQOA 3T9UA 3LUYA 2V3TA 2A5TA 2BJJX 3L6HA 3TMGA 4OFJA 3FIRA 1MXUA 1H43A 4BDRA 3JV9A 5JK4A 4G2ZA 3FJMA 1OQHA 4OENA 3S4UA 2Z8EA 1JW1A 4LA9A 3L6GA 4GXSB 4G77A 2F97A 4HW8A 5FHOA 1P1QA 3TTMA 4BLAA 4TLLB 4NF8A 4GLIA 4U22A 4H67A 4YMAA 3F11A 1MPCA 3ZSFA 1MQDA 3C32A 1UTBA 4G4PA 2XXUA 4FORA 4EQBA 1SYIA 3CSGA 3QAXA 2XXWA 4IO2A 4GF8A 4H1XA 4DDDA 4OESA 4OFLA 3EHSA 4EXLA 3K02A 1SI0A 5M2VA 5CMKA 3OEKA 1I6BA 1FTLA 2HCAA 4IGTA 1B58A 3VLVA 4R6KA 1RYXA 2XX9A 5FHNA 4HCYA 2DXYA 4Q8RA 4BDLA 4X1BA 4OMBA 2RC8A 1US4A 1FQCA 3ODBA 1SYHA 3TPAA 1DOTA 3E3KA 4TQUQ 3KOSA 1PEBA 4ZEBA 3IB2A 2H4IA 5TPAA 4YKPA 4OXVA 1FCKA 1POY1 3SEYA 1OMPA 4PFTA 3QYTA 5H8QB 2HEUA 2D5WA 2GFEA 3CFLA 1QJMA 3KSJA 4NEDA 1SQYA 4PE5B 4AB5A 2UYEA 5EHMA 4BDMA 3N94A 3U72A 4P11A 2ONKE 3CI8A 1AL3A 1M5DA 3ILTB 2OBGA 3PD9A 1ZJLA 1QUIA 5A5XB 2ZYOA 3SEXA 1B3LA 3FVGA 2OK2A 2IEEA 2O69A 3BKIB 1PDAA 1H3DA 3O29A 5I2KA 3UA8A 4NWCA 3ZKKA 2PMSA 2F7BA 3FVOA 3MJNA 5AA4A 2ZYMA 3MPKA 4LUBA 4OTEA 5BWJA 2Y7PA 3I6VA 4QFPA 4R9FA 5CMBA 3ILUB 2Q89A 4IO7A 4E0WA 5I59B 4YB5A 1GVCA 2F34A 2V25A 4KFQA 1MS7A 1IIWA 3FASA 2PVUA 3PGFA 4DXBA 2AL5A 5I57B 2B65A 4YAHX 4G8MA 1B1HA 3H6TA 4KCCA 4QF9A 5ELVA 4R2FA 2I58A 2H25A 1B05A 1Q1KA 2DWJA 1LLSA 4AB6A 1DTGA 4RYAA 4YMBA 4FECA 4R6YA 2XXYA 4R75A 3KN7A 3OMBA 3S9MC 1GR2A 2Q9TA 1BTJA 4JWOA 1Y3QA 1XVYA 1ATGA 1AOVA 1R6ZA 4XIGQ 4THIA 3KJTA 3OXNA 3MBPA 5B70A 3RNNA 5DEXA 3EQ1A 3K1MA 1B3GA 2FA7A 3K6VA 2O68A 5H8NA 2O1LA 1EH3A 3TDJA 4FAJA 1TWYA 5HBCA 3PMWA 4NWDA 3RN8A 4POWA 3OO9A 4RNSA 1VR5A 4EF2A 4IO3A 3VXCA 4KYDA 5CBSA 2HZLA 3T66A 3W9VA 3BBRA 3K6UA 1UQWA 1UTHB 3N26A 3LR1A 3MZ1A 1LB8A 3SEWA 1FQDA 1B4HA 1PBPA 1VE4A 4LATA 1SVXB 3V89B 2XD3A 3SERA 3N6UA 4YKIA 5KCJB 4OVJA 1N0TA 1NNFA 3C34A 1AH5A 3GZGA 5H8SA 3A3UA 1B5JA 3IL1B 4JB7A 4H5GA 3MUQA 3C9HA 1Q35A 3WAEA 2Y7KA 4O3BA 4M4GA 5H8QA 3HCQA 2PT1A 4F22A 1JNFA 3MVZA 2DQVA 2O51A 1Y1MA 1S50A 2DWHA 3FGSA 3K2DA 3IORA 2ABHA 4QFKA 1EZ9A 4GOTA 3CVGA 2HXWA 4YKKA 1QVSA 1B0LA 1URGA 1GGGA 1SW5A 4OQOA 1NNPA 5I56B 5DVIA 3EF7A 2OLBA 4KD5A 4NF5B 1M5CA 2RINA 1MM6A 4C1UA 1DTZA 5DT6A 4F2OA 1R1NA 3HSTA 4WXJA 5H8HB 1QW0A 2X7QA 3OSQA 1BP5A 3MW0A 4G8NA 1MRPA 3USDA 4DCYA 4N13A 2UVHA 4TLMB 2UXAA 3DP4A 3MC2A 4DLDA 2PT2A 3MP1A 4AQ4A 4PFUA 4BDNA 4KPTA 2D21A 5LOMA 1XHYA 1PB8A 3KGCA 3O28A 1P1NA 3E9XA 3UP9A 3H4ZA 1LFGA 5B7DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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