3G3IA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer i442h k494e i749l q753k mutant with glutamate and nacl at 1.37 angstrom resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
256
structure length
255
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLELSTHLGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREEVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
total genus 84
structure length 255
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3iA02
2Y7IA 3Q27A 4OWDA 3IORA 2VD2A 3VVFA 3O66A 4ZECA 2FYIA 1MRPA 3E4RA 3IB1A 4GLIA 1S7YA 4RJZA 4MBPA 3SKPA 4KCCA 1A40A 3QK6A 3SEXA 2ZMBA 1ZIUA 5ELVA 5KZTA 3H6UA 5FHMA 2I4CA 1OMPA 1O7TA 1R9LA 3UORA 1QJMA 2OBGA 2FA7A 2G29A 1B3HA 5HM4B 1LAHE 3ZKLA 3M3KA 3PPOA 1TFDA 2OJTA 1JW1A 2WKYA 1POTA 4H0WA 4MFIA 4Q8RA 3CFZA 2NOOA 3FATA 5CMBA 5KCJA 1OIBA 4LP2B 4OFLA 2Y7PA 5CMMA 1BTJA 4F31B 4ESWA 2YJPA 3E3KA 4EQBA 1SW4A 2RINA 3G3HA 2F8DA 2THIA 1FQBA 2ZYNA 4JSOA 3RGYA 3SEUA 1XVYA 4HCWA 1MY1A 1B5JA 1SDXA 1DMBA 1A55A 3OD7A 3UP9A 4F2QA 3OMBA 1Y4TA 4XKQA 4YMBA 1JW4A 4R6YA 2RC9A 5I84A 3DP4A 1LCTA 5I56A 4ZEIA 5ICQA 3OO9A 4ELRA 1NKXA 3O29A 3KBRA 4EQ9A 3S9NC 4H1XA 1QUIA 5DEXB 4GQOA 2OWSA 3HSTA 4N07A 1DTGA 3B6QA 3IJOB 2BJJX 4RK2A 4FIMA 5H8QA 3T9XB 5DVJA 4X1BA 3TTKA 4XIGQ 3R7XA 2QL3A 1B7HA 4LUBA 3E13X 4DXCA 2B3FA 4HS7A 1DSNA 3S9EA 1QUJA 2F36A 1TWYA 4THIA 1P99A 2ZYOA 3TFLA 1FTKA 3SEYA 2Z8DA 5A5XA 2DOJA 1LGBC 4BDMA 4NF4B 4YB6A 4ND9A 3T22A 2I4BA 4R9GA 3MP6A 4RPOA 3ILTB 4G8HA 1US5A 3RY3A 3HO7A 1IEJA 1GV8A 4ZDMA 1A8FA 2B65A 3MPLA 4JSDA 1M5EA 4ZEFA 1I6QA 3K2DA 3QIMA 3FGSA 1VFDA 2XXVA 3TCGA 1LCFA 3TTLA 1PB8A 4EQ7A 1B1HA 1LBCA 4ZE9A 4ZZAA 5TU0A 4M4GA 3O9PA 5I58B 1VFEA 4TLLB 2VGQA 4TQUQ 1MXXA 2O84X 3H7MA 3TZAA 1GR2A 3PUYE 1LFHA 3EN3A 3K02A 3K6VA 3THIA 3OXNA 5BUUA 2I3VA 3OSQA 4PE5B 4YAHX 3ILUB 4OYVA 4QF9A 2RC8A 3MVZA 3MBPA 3LR1A 5ITPA 4U2RA 2UXAA 3V89B 4LZ8A 5AA4A 4R72A 1ATGA 4AB6A 1B5IA 2DWAA 3IO6A 3L6GA 2OZZA 5EHSA 4NEDA 1N04A 4IGRA 3CVGA 4YKKA 4ZE8A 1MXUA 2Q8JA 3TCFA 3K0VA 4ISUA 4RXLA 1BP5A 1A7LA 2V84A 3USDA 4DIGA 1BIYA 1XOCA 4OEUA 1UIUA 3LSLA 2R9JA 5CMCA 3LSXA 1P1NA 4R73A 2PX1A 4EUOA 3MAMA 1TFAA 1USYE 3H3GA 4IGTA 4DCXA 4O3CA 3Q29A 2DXYA 3BBRA 1SYIA 4JBZA 1B4ZA 4OQOA 2QS1A 4P11A 1NNKA 3QUJA 4BDOA 3MP8A 2XXXA 1SD3A 1MXYA 4QFNA 3U93A 3O28A 2F35A 3CR9A 2D5WA 1YAEA 1ELJA 1OVTA 2DS9A 4Z0IA 2PT2A 1P1OA 2DE2A 1SW5A 2QRYA 3PPNA 1JVYA 3TUSA 2F6GA 3FD3A 3VXCA 2H98A 4H5FA 2XXIA 1IUDA 3KN7A 4F1YA 3H6VA 1WVJA 2I48A 4YMAA 3MP1A 5IKBA 3DM0A 4H67A 3T66A 4AB5A 2Q9TA 3K6XA 3IB0A 5TP9A 1NH8A 1TXFA 1B32A 1B5HA 3U1OA 3T9HB 3S9MC 3EPEA 1YCJA 3W15C 2HZLA 4AQ4A 5JTYA 5EHMA 1B9JA 3TKDA 5J1DA 1PB9A 4PFUA 4M1VA 1PEBA 1ZKBA 2REGA 4LONB 2F7BA 3EHTA 4DDDA 3DP6A 4R6KA 3PMWA 1GVCA 1NL5A 4I8CA 3CRBA 3OO8A 5I56B 4POWA 3H03A 1PBQA 5FHOA 2UVIA 5DYHA 1R9QA 2QJEA 4G68A 2XX8A 2PBWA 1IZ1A 3Q25A 4MF3A 2XD2A 5H8QB 3MZ1A 2X7QA 4FEDA 1POY1 3FVOA 2QMWA 2QS4A 2V93A 5CC2A 1MXVA 4ONYA 3W9WA 3A09A 1D4NA 5B70A 4KYEA 4RNSA 2M8CA 3UIFA 2A5SA 2UYFA 3MVXA 2HQ0A 4JWXA 5M2VA 5A5XB 3E9XA 4OMBA 3K1NA 4L17A 4H5GA 3SETA 1ZBMA 2O68A 3IB2A 3KGCA 5AA1A 1JQFA 4MLQA 1M5CA 4N13A 4IY6A 2HZKA 4KI0E 2ALUA 1URDA 4P0IA 3DLNA 2I6EA 4UACA 2V3TA 3SESA 1FQFA 1MY3A 4U22A 3HCQA 3LC8A 5HBCA 3EQ1A 3C4MA 2AIXA 5I2KA 1S9TA 1ZU0A 1LFIA 4HCYA 2DE4A 2F7AA 3PMXA 4LQ2A 2HCAA 4I1DA 4YB7A 3DELB 2Q89A 3T93B 3PPRA 2X7PA 4UA8A 3SEVA 3DP8A 1MY2A 5EYFA 1KWHA 3FIRA 1XHYA 2A5TA 2O51A 3TYHA 3MWBA 3I5OA 1R6ZA 3CI8A 1HSEA 4QFOA 4PFTA 1MG1A 1H76A 1S50A 1JW5A 4RPNA 2Y7KA 5LOMA 3PUXE 4IO7A 3MW0A 2VOZA 5AA4B 3M3LA 4RK9A 3OO6A 3MPKA 1QW0A 4U4SA 2XXPA 1IQ7A 2ZNUA 3WAFA 3O6HA 1MY0A 4I9DA 4NE4A 1JVXA 1WDNA 3U8QA 3GBBA 2QS3A 3IK6B 5AA2D 1Q1KA 4EDPA 3LBSA 2Z8FA 4NWCA 4X1DA 3IR1A 3EHUA 3K00A 3Q26A 2Y7RA 4O3AA 3IOTA 1NMUA 4R9FA 2GHAA 3MJNA 1VSOA 5I57B 1PC3A 1B6HA 4Q5TA 2LAOA 3I6VA 4F39A 3KG2A 1TT1A 3UA8A 2H99A 1P1WA 2Z23A 4QSEA 3ECRA 3VLVA 2DE3A 3C36A 4YU0A 3IOUA 1Y1MA 3MQ9A 2ZNSA 1UQWA 2Q2CA 3G3FA 2DWJA 3EF7A 4C0RA 1II5A 3H6TA 1MQHA 3ZS6A 4WEDA 1NH7A 3RT6B 3KZGA 3HN0A 1JETA 1EZ9A 4KR5A 1OQGA 3U72A 3C32A 4H65A 1PDAA 4BLAA 4ZEDA 2QS2A 2Y84A 1Y9UA 3HHGA 1ZTYA 4JDFA 4PFWA 5CBRA 5CMKA 4DE8A 4F22A 2NVUB 3U94A 1M5DA 5TP9B 2XXUA 4JXIA 1I69A 2YPNA 5JTYB 1B0HA 4ELPA 1QKAA 3V83A 4R6HA 2E0SA 3WAEA 2V3UA 3K1MA 5ICTA 2B3BA 5TPAB 4F18A 4QHQA 3FJ7A 3MZBA 3T96B 2HXWA 2Z8EA 4IO2A 2IA4A 2D21A 4ELQA 1R1NA 4G68B 2X26A 1ZLQA 4NF5A 3OEKA 2OCUA 2XX9A 4R2FA 3N6TA 4G4PA 4OXVA 2UVJA 4MLVA 1H3DA 4GIZA 4EXKA 2GH9A 2P2AA 4EXLA 2ESNA 1MQIA 3S4UA 3G3KA 3G3GA 5JK4A 4QSCA 3OELA 1GGGA 1MPDA 4GL8A 3H06B 4FEBA 4QRZA 3TTNA 4E0XA 4KHZE 4GFRA 1UTBA 1Z7ME 2GFEA 2O7UA 2Q88A 1A99A 3UGWA 4QFLA 3IJXB 3MVYA 4BDLA 2UYEA 4H8IA 1N3XA 3RLFE 5I57A 4NMYA 1Y4CA 5L8DA 3SEWA 2P0SA 3LSWA 3HV1A 4X9TA 4ELOA 3K01A 3B6TA 4XXUA 4GXAA 2P1SA 5I2KB 4Q0CA 3A3CA 1Y3PA 2O1MA 3D4CA 3QUFA 2ZXTA 1JEVA 2ONSA 3U92A 4XKRA 4KCDA 3OO7A 4PFYA 2A5TB 1NNPA 3CFLA 2HEUA 1P1QA 2XXTA 3OSRA 1F9BA 1XS5A 1ANFA 5DT6A 3HHFA 2F97A 3QAXA 3UN6A 4QFPA 3OOAA 2HFBA 2I3WA 1FQEA 2HAVA 3JZJA 1LFGA 2CZLA 2Q2AA 3S9LC 1IIWA 3GBAA 1XT8A 2Z22A 3ODBA 1RYOA 2AYSA 2VD3A 5F1QA 4F3BA 1LAGE 4ZS9A 5B7DA 5L9SA 3IOWA 4POXA 1Z7NE 5HPQA 4ESXA 5DTBA 1EU8A 3VDFA 1FQCA 1MS7A 4LATA 2W7YA 2H9BA 1OLCA 4GF8A 3MZ9A 4G8NA 4YKIA 4YKPA 4DXUA 1WODA 4U1OA 1URGA 4OFOA 4TLMB 1LB8A 4MH5A 5TPAA 3CG1A 4BDQA 3M8UA 1D9YA 4KFQA 1M5BA 4BDNA 5AE4A 3GLBA 4XKNA 5IAIA 1IXGA 1OQHA 3PD8A 2XHDA 4XKPA 5CBSA 1H44A 1LAFE 4F1UA 1MQDA 4F29A 3BKIB 2GHBA 3KSXA 3BFTA 3O6GA 1DPPA 4NTLA 4KPTA 1I6AA 4PQJA 4G77A 3RTFB 3A3UA 1EZPA 1HSJA 4OEVA 2XXHA 4WEPA 4U21A 4GWOA 1B3FA 3EHSA 1SW2A 1FTOA 1L5TA 3TCHA 2DQVA 3K1PA 2I58A 3K6UA 1D9VA 4NF8B 2VHAA 4BDRA 1B58A 3IOVA 4XTCQ 1MDP1 3FXRA 1H45A 4DZ1A 2VP1A 4KYDA 3QXMA 3JYRA 1QULA 1GTKA 3IX1A 1PBPA 1MDQA 2OK2A 3VE1B 4NF6A 1MXWA 1B7UA 4GOTA 4F3PA 4LVQA 3QYTA 1MPCA 1LBBA 3VV5A 5I59A 4IB2A 1RYXA 4OTEA 4WKMA 3T9UA 3G3JA 3PU5A 1MPBA 4F3SA 4LQ5A 3VVDA 2PVUA 3W9VA 4NF5B 5BWJA 1N7XA 5L9OA 3C31A 1JNFA 1N76A 2AL5A 3TMGA 4IO5A 5H8SA 4JWOA 1LSTA 2OLBA 1MM7A 3RN8A 4FJPA 2REJA 4TOZA 3KN8A 1YTVA 1IITA 2QPQA 4ECFA 2PT1A 1JEUA 4Z7EA 5FTIA 1SVXB 2ZYMA 3GXAA 3PPPA 4IY5A 3VFJA 4G2ZA 1UTBB 3O97A 3QSLA 1IXHA 2XXQA 3KSJA 2D3IA 4FECA 3CSGA 1O64A 3RT8A 1A54A 3D4GA 4QSDA 3FJMA 3P7IA 1HSLA 3R26A 1BLFA 2I0BA 2V3QA 4DLDA 2DWHA 2QSXA 3L6HA 2F78A 4K3FA 3V5AA 1SI0A 2PMSA 1M5FA 5K2YA 1SI1A 1EH3A 4C1TA 4X48A 2F5XA 3TEPA 3KJ7A 3K6WA 1CB6A 3KOTA 4QFKA 4R2BA 3TAJA 3FV2A 1NNTA 1A8EA 3T9VA 5AA3A 2I49A 1N84A 4LZ7A 3G7WA 4H8JA 3HPIA 4DXBA 2NXOA 2F6PA 4GD5A 3TDJA 5FTHA 1T0KA 1SW1A 4F19A 3C9HA 4OENA 5DVFA 4OESA 1AIVA 3CSBA 1DOTA 5H8HA 1B7ZA 3C35A 3M3FA 2KLFA 2XXYA 3RUMA 3K4UA 4OERA 2ONKE 1J1NA 3S2VA 1DPEA 1ZJLA 1UTHB 3LUYA 1PB7A 3VXBA 4ZEBA 1MH4A 2DXRA 2O69A 1D3KA 5CI5A 3TTMA 3FVNA 3CFXA 4NF8A 3FV1A 3H4ZA 2DYXA 4IO3A 5KDTB 4YICA 3SDFA 3VLWA 2R71A 3TQWA 2ONRA 2YLNA 3O6IA 4P0GA 1BKAA 4KQPA 1AMFA 3FASA 1N7WA 2RF1A 4OHNA 3FVKA 5H8NA 3CG3A 3FJGA 2NWJA 1Y20A 3PPQA 5AA2A 5CM6A 5H8FA 3MVWA 4YB5A 4N6PA 1MQJA 5F7VA 1B3EA 4R75A 2V25A 3VVEA 1NFTA 3PUVE 5CRYA 3BFUA 1CE2A 3R6UA 3OENA 4U4XA 1ZMGA 2UVGA 2O6AA 3N6UA 2HAUA 3RTWB 2O7IA 1RKMA 4YZZA 2H5YA 2OWTA 4WXJA 3Q28A 3KOSA 5I2NB 4HTGA 4LZ5A 1LLSA 1B40A 1AL3A 3PGFA 4JB7A 2H25A 4RA1A 3ZKKA 3N5LA 3OEMA 3G3IA 4O3BA 4OVJA 3AXFA 3PUWE 1N0TA 3H6WA 3TODA 3PV0E 2FNCA 4KD5A 4YKJA 4OZ9A 3FZVA 1H43A 1OVBA 4H6DA 1FTJA 2PYYA 4NF6B 1Y3NA 2DP8A 2DWIA 3TELA 4OETA 5FHNA 5ISUA 4G8MA 5I59B 1IXIA 4F3GA 4C1UA 3I3VA 4Q30B 3LSFB 2ZNTA 3B7DA 3TTRA 3ZSFA 3UK4A 4U1ZA 4GL0A 4RY1A 3V8XB 1B46A 3SERA 1US4A 4GXSB 3VLUA 3N94A 4GVOA 1FW0A 3O2AA 2XD3A 4DCYA 4F1VA 4HW8A 1MM6A 1O63A 2Y7WA 1AOVA 1B05A 4FORA 2ABHA 1SQYA 1B0LA 2RC7A 2XXRA 1YPNA 4PP0A 1AH5A 1LB9A 2AL4A 1N3WA 1QVSA 4NWDA 2DVZA 1LAXA 4RYAA 4EF1A 3F11A 5JEIA 2RCAA 3C33A 5DEXA 4E0WA 1SBPA 1B51A 5DVIA 1UTHA 2UVHA 3ONMA 1MQGA 2G93A 1B52A 1USYH 4I62A 4LA9A 2R6GE 1DTZA 1MH3A 1URSA 1OLAA 5KDTA 2H4IA 3PUZE 4R74A 4FATA 1FQDA 4G68C 3PD9A 5KCJB 1Q35A 1Y1ZA 3GZGA 1I6BA 2CMOA 2O1LA 4NF4A 3KEIA 4IO4A 3FUZA 3JV9A 1FTMA 5K2XA 4JWYA 2F34A 3FVGA 1EZOA 3B6WA 3PMVA 3FXQA 3IL1B 1B1XA 3KFMA 2DVCA 4PETA 1FQAA 5ITOA 3TPAA 2QMXA 2F7CA 3MC2A 4GRKA 5H8HB 2E1SA 3IAZA 2DSFA 1B3GA 1UIVA 4KYSA 2IEEA 5I58A 3C34A 3KJTA 2NUVA 5I2NA 1FTLA 3MUQA 3RNNA 3RPWA 1VE4A 2I0CA 2XX7A 3CIJA 1B4HA 4FAJA 4ZEKA 1MY4A 4ZZEA 4EF2A 2RCBA 1VR5A 5L9MA 3N26A 3TQLA 4OFJA 2GRVA 5H8NB 3RQTA 1B2HA 2ANJA 1IXCA 1XC1A 1NNFA 2RKMA 1Y3QA 5AA2B 1QUKA 3FXUA 5H8FB 2XXWA 4U23A 3KN3A 1FCKA 1SYHA 4FE8A 4IO6A 2ZYKA 4F2OA 1B3LA 1P1UA 1QKBA 1XVXA 1MXZA 3IO4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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