2DWJA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with raffinose at 2.3 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with raffinose at 2.3 resolution
rcsb
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwjA02
2O1MA 3PUWE 3KJ7A 4NF5B 4OMBA 1B4ZA 1MQHA 4KYEA 2X26A 4RK2A 1SW5A 3PUVE 4ZZEA 2YLNA 1UIVA 4U21A 3LR1A 3DP8A 3CIJA 2UYEA 4XKQA 4EQ9A 1H45A 2FNCA 4R9FA 4IY6A 2KLFA 4RXLA 5JEIA 2HCAA 1R9LA 3UN6A 2RKMA 4LZ5A 1WDNA 1Z7NE 3MVXA 5TPAB 2NVUB 5L9OA 3SEVA 3FGSA 2Q8JA 3VV5A 2HZKA 3LC8A 3OD7A 5I2KB 1MQJA 4G77A 4KI0E 3HO7A 1SVXB 1UTHB 1MM7A 1DPPA 1JETA 2I6EA 5TP9A 1YAEA 1AOVA 3U94A 1MXYA 3FVGA 1ANFA 4YU0A 1LSTA 4ESWA 3ONMA 3RUMA 1IXIA 1UTBB 3IJOB 4ZZAA 2V25A 2D5WA 2YJPA 1FTJA 2F7AA 4QF9A 3RTFB 4KCDA 3C36A 1B58A 3QXMA 5I2NA 3R26A 1SDXA 2XXXA 5AA2A 3V89B 2FYIA 5CBRA 3IB0A 1LGBC 3RQTA 2REGA 2XX9A 3CG3A 4QFKA 4F22A 2ONSA 3PPRA 4LATA 2DE2A 4F3GA 4BLAA 1PBPA 2ABHA 1HSEA 4H67A 2OCUA 3I3VA 3K6WA 4DCXA 5H8QA 4RA1A 2W7YA 4THIA 3D4CA 1CE2A 3VVFA 4O3CA 3SEYA 3SESA 1MG1A 2RC7A 3OSQA 2H98A 3SKPA 5CBSA 5DVJA 5CMKA 3IOWA 1S50A 2ONRA 4WEDA 2DP8A 1TWYA 3OO8A 4R72A 4Z0IA 3E3KA 1OMPA 4JBZA 5JTYA 2XXPA 2F97A 3PMXA 4TQUQ 5CRYA 1USYE 3CSGA 2D3IA 1B6HA 3PGFA 2ZYMA 4OVJA 1FTLA 2E0SA 1L5TA 4PQJA 2IEEA 5IKBA 2OLBA 4I1DA 4POWA 3O28A 5F7VA 1FCKA 2ALUA 4NF4B 1FQCA 3MUQA 2Z23A 4PFTA 1N7WA 1BIYA 4TOZA 5AA4A 3TELA 4F2QA 5CMCA 1N3WA 1PB7A 5L8DA 2I48A 5DT6A 2Q89A 3KBRA 2O84X 1NKXA 2RC9A 4QFNA 3TQLA 1Y3QA 3VE1B 1CB6A 3H3GA 4MLVA 1LFIA 4NEDA 1ZKBA 1B5JA 2I4BA 4DZ1A 1QW0A 4OEVA 2QMXA 3K01A 4GL0A 3TTKA 3T96B 4TLMB 3VVDA 4ZDMA 3ZKKA 1YCJA 4BDRA 1LBCA 3UORA 4KD5A 4F39A 3F11A 2VD3A 5I59B 4JWOA 3MZ9A 2OJTA 2F34A 2AL4A 4LQ5A 3RNNA 4KQPA 2H25A 3MJNA 1JNFA 1Q35A 3LUYA 3VLUA 1XVXA 5AA2D 3O29A 1EZ9A 4NF8A 4PP0A 1LCTA 1WODA 2H4IA 2XXUA 1QUIA 1LAGE 3MQ9A 5DYHA 4DIGA 1POTA 4YMBA 3DP6A 4KR5A 4GXSB 4LA9A 4DDDA 5KDTA 1O64A 3FJ7A 4R6KA 4BDQA 1N76A 5EHMA 1YPNA 4G8MA 2NXOA 4OERA 3KOTA 4ESXA 3MWBA 1IXGA 1A40A 3BFTA 2OK2A 2I49A 3FIRA 3CI8A 4DLDA 3OENA 3K1NA 3CFZA 2XHDA 3K00A 3U72A 2VP1A 1MDP1 3M3KA 4RY1A 5H8FA 2O6AA 3TCFA 3KN8A 3PUZE 3CR9A 3L6HA 3GZGA 3PPOA 4OWDA 5KCJB 1B46A 1H3DA 3MAMA 2DQVA 2V3QA 3TPAA 3C35A 3MZBA 1J1NA 1URGA 3EQ1A 1OVBA 3PV0E 3BKIB 4R73A 1I6BA 3SEXA 3EHUA 3T93B 3MBPA 2H99A 4FIMA 2RCAA 2PX1A 2QS3A 1LAXA 3FV2A 1TFAA 2A5SA 3UK4A 2G29A 3LSWA 3H6VA 3T9UA 3RTWB 3S4UA 5TP9B 4LONB 3K6XA 3TDJA 3DP4A 2HZLA 2Q88A 3Q25A 4PFWA 4N13A 3LSFB 4U1ZA 4P11A 2OBGA 2DVCA 2A5TA 3OXNA 3VFJA 1B3EA 3MZ1A 1JW1A 1O7TA 4GFRA 4YKJA 1NL5A 5L9MA 4QFLA 2F78A 1RYXA 3TEPA 3S9MC 3I5OA 1DMBA 1GTKA 2GRVA 4G8HA 3TMGA 4F1VA 1OLAA 4NE4A 4WKMA 4KYDA 2F36A 1B3HA 4YB5A 3OEMA 1OIBA 2DOJA 3K0VA 5H8QB 4GLIA 3EN3A 3U93A 3B7DA 5K2XA 1P1NA 2PVUA 5CI5A 4ZEFA 3USDA 3W15C 3IOTA 1NNKA 2DXRA 2XX7A 3KFMA 1B7UA 4H6DA 4LVQA 4MLQA 1QKBA 3MPKA 3FXRA 5I84A 4R74A 1B0HA 4GWOA 4ND9A 1D9YA 3IO6A 1VFDA 2O7IA 1R1NA 4JSDA 4IB2A 2AYSA 4X9TA 1IITA 4G68B 3H6WA 1NH8A 4F19A 4E0XA 1R6ZA 1LFGA 3DLNA 1B3LA 4QSDA 2O51A 3W9WA 1FQDA 1WVJA 3PU5A 3JZJA 4F2OA 5HM4B 3SEWA 4F18A 4HW8A 1MY1A 4U1OA 2UVGA 4QSEA 2NWJA 2M8CA 3TAJA 2RF1A 3IR1A 1LFHA 4YMAA 2PMSA 5A5XA 1QULA 4HCWA 4H5GA 4N07A 3T9VA 3IB2A 4C1UA 1HSLA 2QMWA 4U4SA 4BDMA 2RINA 5KZTA 2XXVA 3G3KA 2I3VA 2DWIA 3K1MA 3QSLA 3PMVA 2QS1A 2G93A 3E13X 3KJTA 1Y4CA 2AL5A 2HEUA 2REJA 3FUZA 4NF8B 4G4PA 3SEUA 1TFDA 1ZJLA 4RJZA 1N7XA 2Y7WA 3O6HA 3FV1A 3QIMA 4OHNA 5ICTA 4OFOA 1M5BA 3H7MA 2NUVA 3UP9A 1DSNA 4BDOA 4FEBA 4BDLA 3O2AA 1LAFE 2Z8EA 4LQ2A 5H8HA 4XTCQ 3WAEA 4C1TA 1MY2A 4GVOA 1AMFA 3A3UA 1NFTA 4GQOA 2PBWA 1XOCA 1IQ7A 1MQIA 4H5FA 1MXVA 4ELQA 4YKPA 1US5A 2R6GE 3ZSFA 1JW4A 3UIFA 5H8FB 1A8FA 3G3FA 2DWJA 4EUOA 4IO7A 1RYOA 1VE4A 3GBAA 1FTKA 4OESA 1GR2A 4IO6A 3HSTA 3MP6A 1QUKA 3PUXE 2GHBA 3MC2A 4MF3A 4FE8A 4F31B 5ELVA 1F9BA 2F6GA 1B9JA 1SQYA 4BDNA 5I58A 1Y20A 5DEXA 1BP5A 1SW2A 3PD9A 3KEIA 4QFPA 5CM6A 1ZBMA 1Y3NA 3CVGA 2P1SA 2UVHA 5I57A 1KWHA 3C32A 3AXFA 2H9BA 2Y7IA 3RT6B 1B5IA 4QHQA 1H43A 2CMOA 3KSXA 1Q1KA 3I6VA 3IX1A 3K02A 2XXRA 2CZLA 1AIVA 4E0WA 3G7WA 1EH3A 3D4GA 4ZEBA 5BUUA 1OVTA 2O7UA 3TCHA 3A3CA 4OXVA 1P1OA 1B7ZA 1A8EA 4I9DA 2Q9TA 3VVEA 3U92A 1SW1A 2Z8FA 1RKMA 4FATA 2F7CA 5I2KA 4OTEA 1VR5A 5TU0A 3C4MA 3FJGA 2XXHA 1MH4A 5DTBA 1MQGA 1MPCA 1SBPA 3KZGA 4R6HA 1GVCA 1Z7ME 1DTZA 1B40A 4GOTA 4XKPA 1EU8A 4NF6A 4OFJA 4IO3A 3K2DA 4NMYA 3DELB 2Q2AA 1LLSA 1H44A 3M8UA 4GRKA 3Q27A 3CFLA 3TTRA 1IEJA 2DE3A 3N26A 3OSRA 2V3UA 3HCQA 5LOMA 3GBBA 1FQAA 3OOAA 2ANJA 5K2YA 2Y84A 2QSXA 4U4XA 4EF2A 1PDAA 4JWYA 2FA7A 3CRBA 3KN7A 3H6UA 1D4NA 5FTHA 1EZPA 3FATA 3TZAA 1I6AA 1NNPA 3T9XB 1SYHA 4R6YA 1JEUA 3PD8A 5JK4A 2X7QA 1XC1A 2I4CA 1BLFA 1D9VA 3T22A 2UYFA 4LUBA 1JQFA 2XD2A 3IK6B 4R9GA 4F3SA 3HN0A 1US4A 2V84A 5CMMA 3PPQA 4LZ8A 3KN3A 3TTNA 1N04A 4DCYA 1PEBA 3Q29A 3TKDA 2X7PA 5ITOA 3T9HB 2I58A 1N3XA 5A5XB 1SI0A 1SD3A 1ZU0A 3O6IA 3CG1A 4ELPA 1R9QA 4EQ7A 1TT1A 2PYYA 1P1WA 4GL8A 3PMWA 2XXQA 3ILTB 2HAUA 4DE8A 4H65A 3TCGA 5H8SA 1M5DA 3RPWA 1B4HA 5I56A 2F7BA 3EF7A 4XIGQ 2DS9A 5ICQA 5I2NB 4OZ9A 5AA2B 4ZE8A 3QYTA 1DOTA 2Y7PA 4EXLA 4UACA 2HQ0A 5I59A 2YPNA 1MH3A 2OWSA 1MDQA 1NMUA 3RLFE 1ZIUA 3JYRA 4YZZA 1GGGA 5CMBA 3T66A 1B0LA 4RYAA 2Q2CA 3KGCA 3GXAA 4JB7A 3ILUB 3P7IA 5FTIA 3H6TA 1TXFA 3O6GA 3M3LA 2OZZA 1H76A 4YAHX 2QPQA 3C9HA 1MXZA 2O68A 1M5CA 5AA3A 5F1QA 3TQWA 1ZMGA 4XKNA 4ZS9A 5JTYB 2GHAA 3KSJA 1USYH 1II5A 4PFYA 1QVSA 2Y7KA 3IB1A 4TLLB 2ZYOA 3Q26A 2QJEA 4O3BA 4Q5TA 2P2AA 1B51A 5FHNA 3U1OA 3CSBA 1T0KA 2VGQA 4R2BA 1D3KA 3HV1A 4JSOA 1LB8A 4GF8A 2OWTA 3KG2A 5I58B 4JWXA 3N6UA 5ITPA 5DEXB 5AE4A 5AA4B 1B2HA 4OYVA 1B3GA 4PETA 3IOVA 5ISUA 3H06B 4JDFA 5I57B 1B5HA 5KCJA 4YB6A 2THIA 3M3FA 4O3AA 2F35A 3K1PA 2DWHA 1A54A 1EZOA 1N84A 4ZECA 4NWCA 3ODBA 1MRPA 4KYSA 1OQGA 1MXWA 3B6WA 5B70A 1DTGA 4RK9A 3OELA 1MQDA 3W9VA 3G3IA 3QUFA 2E1SA 3UA8A 2XXTA 4OFLA 1OQHA 3OO7A 2BJJX 4YKIA 3VDFA 4F1YA 5H8NA 2UVIA 3GLBA 1ZTYA 1IXHA 4IO4A 1URSA 3ECRA 4R75A 3TYHA 3QK6A 3KOSA 4F3BA 3VXCA 4H1XA 1FQEA 4LP2B 1Y1MA 3BFUA 5M2VA 2RC8A 4NF6B 4X48A 1QJMA 3CFXA 1A99A 3FZVA 4L17A 2ZYNA 4ONYA 3EHTA 2V93A 5B7DA 5J1DA 1MM6A 3N6TA 5FHMA 1FTMA 3B6TA 1B05A 1BTJA 3EHSA 1JVYA 1S7YA 4EF1A 4DXUA 1B1XA 5KDTB 2R71A 3TODA 2ZNTA 1JVXA 2ONKE 2VHAA 3R6UA 1AL3A 4KPTA 4RPOA 1NNFA 1YTVA 3S9NC 3FXUA 1IXCA 4ECFA 1SI1A 1IIWA 5EHSA 1GV8A 4KHZE 1VFEA 4I62A 1FTOA 2LAOA 4ELOA 3WAFA 4YKKA 5HPQA 1LCFA 1NH7A 4HCYA 2F6PA 3SETA 4EDPA 3G3JA 4C0RA 3VLVA 4F1UA 4DXBA 4OETA 2I3WA 4RNSA 4ZEIA 3RT8A 4Q0CA 1M5FA 3TFLA 3K6VA 4EQBA 3IO4A 3ZKLA 3S9LC 4LZ7A 1PB8A 4QSCA 3BBRA 4QRZA 3U8QA 4IGRA 3SERA 3V83A 4G68A 2Y7RA 1URDA 1XT8A 4P0GA 1FW0A 4NF5A 2XD3A 3S2VA 3FVNA 3TTLA 2UXAA 3RY3A 3PUYE 4GIZA 1SW4A 2IA4A 4ELRA 3FJMA 3HHGA 4XXUA 5BWJA 4U2RA 2F5XA 4G8NA 3UGWA 1ATGA 2XXIA 1MXXA 3QAXA 1QKAA 2ZMBA 5EYFA 2ZXTA 2XX8A 4DXCA 1FQBA 3C33A 3E9XA 5TPAA 4FJPA 4YICA 5I56B 2A5TB 4G68C 3MW0A 4QFOA 3EPEA 4H0WA 1N0TA 4Z7EA 3MVWA 4OENA 2D21A 4K3FA 2HAVA 3JV9A 1UTHA 3THIA 2RCBA 1LB9A 4HTGA 1MPBA 3N94A 1I6QA 1IZ1A 3IAZA 2QS4A 1AH5A 2ZNSA 1DPEA 4H8JA 2DXYA 2GH9A 3LSXA 4MFIA 4NTLA 1OLCA 1Y9UA 1UTBA 2V3TA 4F29A 3G3HA 4HS7A 3Q28A 4KCCA 3O97A 3QUJA 4JXIA 1ELJA 3OEKA 3MPLA 2I0BA 3N5LA 3A09A 3FVKA 1QUJA 1LAHE 4OEUA 1XVYA 1O63A 4ZEKA 1MXUA 4WEPA 4H8IA 3TUSA 1B52A 3HPIA 2ZNUA 3K6UA 1B32A 1MY4A 1UQWA 2VD2A 1VSOA 2DSFA 3R7XA 2F8DA 3FXQA 2H5YA 4WXJA 4PFUA 2VOZA 2GFEA 1ZLQA 2PT1A 2UVJA 4FECA 2AIXA 1SYIA 2DYXA 3E4RA 3C31A 3RN8A 4Q30B 3TTMA 1A55A 3S9EA 3LBSA 2DWAA 2Z22A 1XHYA 3K4UA 2NOOA 1PC3A 3MVYA 3SDFA 2QS2A 2QRYA 3MP1A 2HFBA 3O66A 2HXWA 4FAJA 3O9PA 1MPDA 3VXBA 1B3FA 1A7LA 4NF4A 2B3BA 4P0IA 3C34A 4MBPA 3LSLA 4XKRA 2XXWA 4U22A 5H8NB 3OO6A 3V5AA 3FVOA 3IORA 3PPPA 2WKYA 2O1LA 1LBBA 4X1BA 3H4ZA 3G3GA 1I69A 1FQFA 5FHOA 3IJXB 1PBQA 1MS7A 4IO5A 3HHFA 4NWDA 4Q8RA 1PB9A 4GD5A 2P0SA 4AQ4A 4ISUA 2R9JA 4UA8A 1IUDA 4ZE9A 4M4GA 1B1HA 2DE4A 5HBCA 4IY5A 3RGYA 1S9TA 1B7HA 2PT2A 5L9SA 4G2ZA 2DVZA 1MY0A 5AA1A 1NNTA 3L6GA 5CC2A 3IL1B 3OMBA 4FORA 4EXKA 3DM0A 2QL3A 4IGTA 5DVIA 2ZYKA 5H8HB 3OO9A 1P1UA 1BKAA 1JW5A 3VLWA 4F3PA 4POXA 1Y1ZA 3H03A 1HSJA 4MH5A 1JEVA 4R2FA 3V8XB 3B6QA 4N6PA 4OQOA 3IOUA 2Z8DA 4U23A 2ESNA 1MY3A 4AB5A 4YB7A 1Y4TA 4PE5B 2B3FA 5DVFA 3FD3A 2B65A 4X1DA 4KFQA 4AB6A 5IAIA 3FASA 4I8CA 4GXAA 1M5EA 1P1QA 4IO2A 1POY1 2XXYA 3ZS6A 1Y3PA 3MP8A 4FEDA 1P99A 3MVZA 2O69A 3PPNA 4ZEDA 1UIUA 4M1VA 2I0CA 4RPNA 1XS5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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