3H6TA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and cyclothiazide at 2.25 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 79
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6tA02
2XX9A 2D21A 4ZEFA 1D3KA 2PX1A 2XXTA 3H4ZA 1XHYA 4R75A 3KZGA 4P11A 3SEVA 5TPAB 2H99A 2VGQA 1I6BA 3ZSFA 3LBSA 4YB5A 1B7ZA 4G68B 3SEUA 5I56B 1PBQA 2PT1A 5I2NA 3Q28A 2E0SA 3E3KA 2DSFA 4LZ8A 5J1DA 4QFPA 3KSJA 4NF5A 4NF8B 2GH9A 5H8FA 2I3WA 5DEXB 1AH5A 5I59B 2O51A 2Z8FA 1FQFA 1HSLA 4G8MA 4AB6A 3SDFA 2F78A 3B6WA 1N0TA 1A40A 1P1OA 2RC9A 4IO6A 4HTGA 3MPKA 4LA9A 2ESNA 5ITOA 1XS5A 2ZXTA 3S9NC 1B46A 5TP9A 5A5XA 4G68C 4E0WA 2RF1A 4OZ9A 4H8JA 5H8HA 4X9TA 5HPQA 4MLVA 3GZGA 1P1NA 4IGRA 1VR5A 2F7BA 3PPOA 3RUMA 1MDQA 3T9VA 2XXYA 3TFLA 3LUYA 4YAHX 3FZVA 4N6PA 3KN8A 3KJ7A 3MWBA 4RJZA 3MPLA 1LSTA 3OOAA 3R6UA 3UGWA 4I8CA 3LSWA 4ELQA 1SBPA 3W9VA 5KDTA 4KYSA 3RT8A 3OO8A 5JK4A 2YLNA 3PU5A 4PE5B 4KD5A 2FYIA 3M8UA 4H8IA 5TPAA 3U8QA 2X7QA 5AA3A 3V89B 5L9SA 1GGGA 1NKXA 1CB6A 1P1QA 3K00A 4OXVA 4XIGQ 4ZEBA 4NWDA 1JEUA 4ZEKA 2HEUA 2QS4A 3BBRA 4ESXA 2H4IA 4KQPA 2DYXA 4R9GA 4F2QA 2I6EA 2RC8A 4EUOA 1B4ZA 3TEPA 4G8HA 1Y3PA 4IO2A 5AA4B 2Y7WA 2Z8EA 3LC8A 4DE8A 1AOVA 1MXXA 4XKRA 4X1BA 1SQYA 2P0SA 5H8NB 3KFMA 2D3IA 3KG2A 1URSA 4YMAA 5L9MA 4C0RA 1N84A 5JTYB 4HS7A 2V3QA 5FTHA 1A8EA 3HHGA 3TTMA 3BFTA 1WVJA 2ONRA 3IOTA 3RPWA 4F29A 2I3VA 5TP9B 4QSCA 2QPQA 3TUSA 1QKBA 1VFEA 3GBBA 4BLAA 5IKBA 3OMBA 1SI0A 3K4UA 4EQBA 3FVKA 4F3GA 1UIVA 2RCAA 3B6QA 3F11A 1QUIA 4IO4A 4BDRA 1SW4A 3VXCA 3O6HA 1FW0A 3O28A 1SI1A 5CRYA 1SDXA 5H8FB 5I59A 4DCYA 1P1WA 1US5A 4BDOA 2DP8A 1NH8A 2Q89A 4EQ7A 5I2NB 1NL5A 4GQOA 5L8DA 2ALUA 2IA4A 2RKMA 4ZZAA 1T0KA 4ZE8A 4C1TA 1N7WA 3C33A 1UTHA 4NF4A 3U72A 2YJPA 3L6GA 2CZLA 1Y1MA 4RNSA 2O1LA 3MW0A 4IO7A 2Z22A 4H5GA 4OYVA 2H25A 3U1OA 3TCFA 2I58A 1MG1A 3C9HA 5BUUA 4MLQA 4EXKA 1MY2A 2F97A 5CBSA 1Y20A 2V93A 3G7WA 4OESA 5ISUA 1SYHA 2M8CA 4IO5A 4ELPA 5EHMA 1UQWA 1LB8A 3BFUA 3IB1A 3VXBA 4EQ9A 1MQIA 3USDA 2Y7KA 5AA4A 2UVJA 2X7PA 3WAEA 1ZTYA 4QSDA 1MQHA 5H8NA 3RN8A 3RLFE 3N26A 2NUVA 3TZAA 1QJMA 2Q2AA 2ZYMA 5AA2B 1PB7A 3ZKKA 3FXUA 4NF8A 2O7UA 5KCJA 1GTKA 1FTMA 4R2FA 1D9VA 1MY0A 4C1UA 1R6ZA 3KN3A 4Z0IA 1JEVA 1R1NA 2V3TA 1Y4TA 5CMCA 1PBPA 1ZBMA 2F7AA 3VVFA 3N94A 3OSQA 3MP8A 3CSBA 3E4RA 1QUJA 3K6UA 4FORA 4QFOA 4RYAA 4U1OA 3S9MC 4GOTA 5B7DA 2DS9A 1OQHA 4R6HA 1TT1A 2P1SA 2F6GA 4IB2A 3G3GA 3FD3A 4I9DA 3SEWA 2I48A 4WEDA 4JB7A 3T93B 1H45A 4U22A 2O7IA 4GXAA 1LAFE 5CM6A 1EU8A 4DZ1A 3KBRA 1B1XA 1RYOA 2F34A 3O2AA 3ONMA 3T22A 4TLLB 3K1PA 2UVGA 3IOWA 4PETA 3MP1A 2OK2A 4RXLA 4YKIA 1B3EA 3H03A 1POY1 1Z7NE 4R74A 2REGA 4XKPA 2D5WA 3FIRA 1A99A 5AE4A 4YICA 1MY3A 4WKMA 3R7XA 3MVXA 3TYHA 1LFHA 1MY4A 3IB0A 4TQUQ 2F35A 2XXHA 5BWJA 3E9XA 1OIBA 3IO4A 1DTGA 1FTLA 4P0GA 1AIVA 1MH3A 1FQEA 3SETA 4BDNA 5I56A 3Q25A 3QK6A 4PQJA 3QUJA 5K2YA 3PGFA 3M3KA 3TQWA 3CRBA 5ITPA 5F7VA 4H5FA 3CI8A 4F1YA 3V83A 4JWOA 3THIA 4DXUA 3IORA 2PYYA 1H76A 1IIWA 2R6GE 4LVQA 3VLUA 4BDLA 1M5DA 1FQBA 2H5YA 2I0BA 3OENA 1XVYA 3FJ7A 4U4XA 1IQ7A 4OEVA 3PD8A 1I69A 3LR1A 3Q26A 3H7MA 3JV9A 4GL8A 4OTEA 3U93A 4EDPA 1A8FA 2ZYOA 2ZYKA 3N5LA 3VLVA 1LAGE 1POTA 3SEYA 3HN0A 4PP0A 2H98A 3O9PA 4FATA 4O3AA 4Q8RA 4GD5A 4GFRA 3V5AA 1B5JA 1ZIUA 2DWAA 1NFTA 3CIJA 4YZZA 3RTWB 2XXXA 2GFEA 2RINA 3LSLA 2FNCA 2ONSA 3EHUA 4FECA 1IXCA 4OFOA 5TU0A 3HV1A 3QSLA 4H1XA 1Z7ME 3SESA 5CMKA 3CFZA 1MY1A 2V84A 3CVGA 3O66A 1BIYA 3QAXA 4MH5A 1MPDA 3CSGA 1JNFA 5AA1A 3VDFA 4XTCQ 4DLDA 2XXVA 1B2HA 5H8QB 4RPOA 3FVOA 3OO9A 1N04A 1A7LA 1NNKA 1DPPA 1P1UA 3H3GA 4LQ2A 4U1ZA 4YKPA 3SEXA 3IO6A 3C32A 1JW1A 3UIFA 4LZ5A 1MXZA 1OVBA 2THIA 4UACA 4OETA 4OHNA 4R72A 3S2VA 5EYFA 3H6VA 5K2XA 3G3FA 2HCAA 1B5IA 1IEJA 4Q30B 1OQGA 2G29A 1WODA 2I4CA 3EHSA 4LP2B 3FJMA 1CE2A 1I6AA 4YB7A 4NE4A 1M5CA 1GV8A 1H3DA 1A54A 1VFDA 1Y3NA 1FCKA 4H67A 4YKJA 3VLWA 4NF6B 1AMFA 4QF9A 5I2KA 2REJA 2Y84A 2Z23A 4YKKA 4MF3A 2HFBA 1XT8A 3I5OA 1J1NA 2V25A 2P2AA 3ILUB 3R26A 4OVJA 4POXA 1EH3A 3P7IA 3JZJA 4KYDA 1B0HA 3S4UA 1QKAA 4ZDMA 1DPEA 1MS7A 3TTLA 1IZ1A 3M3LA 5I58B 1S9TA 1LBCA 2PBWA 3D4CA 5ELVA 3EF7A 2DWHA 4LONB 4X48A 4OWDA 4JWXA 4KI0E 3ZS6A 2DE4A 3TQLA 4ESWA 4F3SA 1B3GA 1BKAA 2XXPA 2Z8DA 3MZ1A 2O1MA 3MZ9A 2ONKE 5H8SA 4F3PA 3TELA 2I49A 3K01A 1UTBB 4JXIA 3QXMA 2Q88A 2BJJX 3C35A 3FV2A 3W9WA 4U21A 3S9LC 4R6YA 3FV1A 4QFLA 5CBRA 4QFNA 4HCYA 2DOJA 1DTZA 4FAJA 1LAHE 3EQ1A 2XD2A 4NWCA 2DXYA 2W7YA 3IB2A 3N6UA 4FJPA 4XKNA 4YB6A 3E13X 1DSNA 5DVJA 3BKIB 2OCUA 1B1HA 3MC2A 2QMWA 2Q8JA 4LATA 2Y7PA 5FHMA 3OSRA 3QYTA 4RA1A 5DYHA 5M2VA 2O69A 1XVXA 2VD3A 5IAIA 2Y7RA 2Y7IA 2HAVA 4L17A 4O3CA 2ZYNA 1XC1A 4GF8A 3TCGA 1ZLQA 1HSJA 1JQFA 1B6HA 2IEEA 2UVHA 3QIMA 1OMPA 1US4A 3K02A 2HQ0A 3M3FA 4G68A 2OWTA 3KOTA 4PFTA 5CI5A 1RKMA 4DXCA 1ZMGA 1URDA 2AL5A 4KPTA 3H6UA 4OMBA 4ZEIA 3T9HB 4F1VA 3LSXA 1LCTA 1VSOA 1Y9UA 3PUWE 1H43A 3FXRA 3OXNA 4ISUA 2OJTA 1IITA 2QL3A 4F3BA 3PUYE 1R9QA 4M1VA 4AB5A 3FJGA 1B9JA 2QS1A 3A09A 4DDDA 3KOSA 2KLFA 4R9FA 4DIGA 1B0LA 3DP4A 1L5TA 1M5EA 4P0IA 4KR5A 1B40A 1O7TA 4WXJA 1NNTA 4ZEDA 4OFJA 1H44A 4GRKA 4G2ZA 4FE8A 2HZLA 1B52A 3TAJA 3TTNA 5HM4B 4Q5TA 1UTBA 2UYFA 4QSEA 1A55A 1B3LA 3K1NA 4UA8A 2PT2A 4ZZEA 1ATGA 2RC7A 3GLBA 3H6TA 1PB9A 3N6TA 4OERA 3O6GA 3UK4A 2ZMBA 4EF1A 1II5A 1Y4CA 4H0WA 4WEPA 1EZ9A 3ILTB 1UIUA 3TTRA 1LGBC 4OENA 3B6TA 3IL1B 4H6DA 1IXHA 4LQ5A 4BDQA 2Q2CA 3TPAA 1B58A 3PPRA 4QRZA 5I58A 3MZBA 3IK6B 5DVIA 3T96B 5FTIA 5ICQA 2XXQA 2A5SA 3IOVA 3PMWA 2VP1A 3SKPA 3H6WA 5ICTA 3MP6A 3PD9A 3T9XB 4NEDA 5B70A 3HO7A 3KSXA 5L9OA 4G8NA 2AYSA 4NF6A 4QHQA 1NMUA 3K1MA 3OO6A 4BDMA 1B7UA 2A5TA 3H06B 1Y3QA 4IY5A 4JSDA 4PFWA 1YAEA 2H9BA 3KGCA 3KJTA 4MFIA 3RGYA 1B7HA 1R9LA 3A3CA 2G93A 3O29A 2DE3A 2VOZA 4KFQA 1GR2A 3O97A 1S7YA 1LLSA 2AIXA 3HPIA 3DP6A 3OEMA 5JEIA 4JDFA 1N3WA 2UYEA 2DE2A 4PFYA 3CG3A 3L6HA 4O3BA 3FGSA 2F7CA 5FHNA 1MH4A 2A5TB 2HAUA 4G4PA 3V8XB 4Z7EA 1Q35A 2DVCA 1LAXA 2DQVA 3MBPA 2GRVA 3OO7A 5H8QA 4I1DA 1LB9A 4R73A 3ODBA 3JYRA 2FA7A 3OELA 1ANFA 3G3JA 2I4BA 2QS3A 2XXWA 3FATA 5DT6A 4EF2A 3UN6A 1NNPA 4FEDA 1B32A 3MVWA 5HBCA 4U4SA 3IJOB 3EN3A 4R6KA 1GVCA 4RY1A 3RNNA 2O6AA 2LAOA 1S50A 3Q29A 3T9UA 3VVEA 4GVOA 1TFAA 3D4GA 2B3FA 3RTFB 2F8DA 2I0CA 3S9EA 2QJEA 1SW2A 1N7XA 3K2DA 3K6XA 3PMXA 3TMGA 2CMOA 1MXUA 1LBBA 1MDP1 1BTJA 2OLBA 1ELJA 2UVIA 2E1SA 3IR1A 4GIZA 5I2KB 3W15C 1B3FA 2ZNSA 3PPNA 4ND9A 5CMBA 3PPPA 3TKDA 1ZU0A 3UORA 2DWIA 1MXVA 3I3VA 1FTOA 2VHAA 4FIMA 1MRPA 3PMVA 4ONYA 3CG1A 4GWOA 2PMSA 2X26A 2ZNUA 3G3HA 3IOUA 1MM6A 1JW4A 4RK9A 1KWHA 1QW0A 1IXIA 4AQ4A 4EXLA 5AA2D 4KHZE 4QFKA 2B3BA 5DTBA 4LUBA 1QVSA 2GHBA 1SYIA 2WKYA 4XKQA 3MUQA 3KN7A 4ZE9A 2XXUA 1JVXA 1UTHB 4NF4B 4NTLA 1OVTA 4KCCA 4YMBA 5KDTB 5DEXA 3K6VA 3FASA 1ZKBA 2ABHA 1O63A 1JW5A 1B3HA 1URGA 3C31A 2DVZA 3A3UA 4IY6A 1FTKA 3U94A 4N07A 4PFUA 2HZKA 2NVUB 1EZPA 1NH7A 2OWSA 4MBPA 1FQCA 1MXYA 4Q0CA 2QSXA 3EPEA 3TDJA 1IXGA 4OQOA 1RYXA 5KCJB 3U92A 1MXWA 2DXRA 3C4MA 3FXQA 3VE1B 4F1UA 5H8HB 4F19A 5CC2A 1EZOA 1NNFA 3B7DA 4ELRA 1SW1A 1Y1ZA 1ZJLA 2XX7A 5A5XB 3CFXA 3MVZA 1YCJA 4THIA 1D9YA 1DMBA 2NOOA 4RK2A 3VVDA 2XXIA 2F36A 1B51A 1MQJA 2Q9TA 3EHTA 3IJXB 3G3IA 5LOMA 2ANJA 1QUKA 1LFIA 1WDNA 4G77A 4LZ7A 5F1QA 4DXBA 1FTJA 2PVUA 2QRYA 4NMYA 3VV5A 1N3XA 3GXAA 1FQAA 3C34A 1FQDA 4GLIA 3RQTA 2QS2A 3UA8A 4F2OA 1MPCA 2R9JA 2O68A 2VD2A 3HHFA 3PPQA 4U2RA 4YU0A 3KEIA 3FVGA 4N13A 3PUZE 4XXUA 1O64A 3DLNA 4KYEA 1LFGA 2UXAA 3OD7A 3AXFA 2HXWA 2XX8A 3WAFA 4DCXA 4HW8A 1P99A 5I84A 1HSEA 1TWYA 2DWJA 5DVFA 5AA2A 1MPBA 4R2BA 3MQ9A 3TODA 2QMXA 4KCDA 3MJNA 5I57A 3O6IA 1IUDA 1JVYA 2F6PA 3LSFB 4I62A 3TTKA 4F22A 1PEBA 1F9BA 1TFDA 2F5XA 1M5FA 2O84X 3GBAA 1MQDA 3K6WA 4M4GA 3UP9A 1SVXB 1XOCA 2NXOA 1SD3A 1JETA 3IAZA 4U23A 3VFJA 3PV0E 3TCHA 2OBGA 2AL4A 3HSTA 3CR9A 1USYH 1DOTA 2GHAA 2V3UA 1AL3A 3PUVE 4K3FA 1BP5A 1I6QA 2OZZA 1OLCA 4OEUA 2ZNTA 3SERA 2B65A 3DM0A 4FEBA 4NF5B 4F31B 1BLFA 1B4HA 1PB8A 1VE4A 5FHOA 4TOZA 3IX1A 5I57B 1B05A 3G3KA 1OLAA 2R71A 3DP8A 1MQGA 2NWJA 1B5HA 1TXFA 3Q27A 2XXRA 1N76A 3FVNA 4OFLA 5EHSA 3RY3A 3MAMA 4E0XA 4ELOA 4JWYA 3C36A 3K0VA 3OEKA 1M5BA 4IO3A 1D4NA 4JBZA 3FUZA 4POWA 3MVYA 3I6VA 4GXSB 3HCQA 3PUXE 4X1DA 4F39A 3RT6B 4TLMB 4ECFA 1PC3A 5CMMA 4GL0A 4HCWA 2RCBA 3ECRA 4IGTA 3DELB 4ZS9A 2XD3A 3ZKLA 4F18A 1MM7A 5JTYA 4ZECA 1Q1KA 1LCFA 1YTVA 2YPNA 4H65A 3T66A 2XHDA 4RPNA 1QULA 1SW5A 3CFLA 1PDAA 4JSOA 1YPNA 3QUFA 5KZTA 1USYE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZEFA 1XHYA 1I6BA 2F3BA 1B7ZA 1FBGA 2Y5LA 3E3KA 4NF5A 1FPBA 2O51A 2F78A 3B6WA 3TMGA 1P1OA 2RC9A 4IO6A 4HTGA 4LA9A 4OZ9A 4MLVA 1P1NA 4IGRA 4YAHX 4N6PA 3KN8A 4NAPA 3MPLA 1LSTA 3UGWA 1SBPA 3W9VA 2YLNA 4PE5B 4KD5A 5TPAA 2X7QA 4XIGQ 4NWDA 3BBRA 4R9GA 4EUOA 1B4ZA 2Z8EA 4XKRA 1SQYA 5H8NB 4YMAA 4C0RA 1A8EA 1FBFA 3TUSA 1SI0A 4F3GA 4IO4A 4H45A 3O28A 2CZHA 4DCYA 4EQ7A 2DP8A 1NH8A 4JVIA 3LUZA 2IA4A 4ZZAA 5LDZA 4I3YA 1NUYA 2CZLA 4RNSA 3C9HA 1MY2A 3G7WA 5ISUA 1SYHA 3IB1A 4EQ9A 4MMPA 2X7PA 1LBXA 1MQHA 3TZAA 3RLFE 1GTKA 1FTMA 4C1UA 1MY0A 5CMCA 1PBPA 1ZBMA 3OSQA 3MP8A 3CSBA 3S9MC 1FPLA 1IMFA 5IZ3A 1OQHA 3U8QA 1TT1A 2F6GA 3G3GA 3T93B 1H45A 1LAFE 1B1XA 2UVGA 3U93A 1POY1 4R74A 2D5WA 1LFHA 1MY4A 2XXHA 3E9XA 1IMDA 4PC9A 1FQEA 4BDNA 3QK6A 5K2YA 3PGFA 3M3KA 3TQWA 3V83A 4JWOA 1M5DA 2XXKA 3FJ7A 1I69A 3VLVA 2ZYOA 3HN0A 3V5AA 1B5JA 3LSLA 2FNCA 3EHUA 5TU0A 1IXCA 5CMKA 1BIYA 4DLDA 4XTCQ 1DPPA 1OVBA 1FPKA 4OHNA 1FPFA 5EYFA 5K2XA 1CNQA 2HCAA 2I4CA 5EQ7A 1FBDA 5ESYA 1CE2A 4NE4A 1A54A 1VFDA 1FCKA 1FBCA 1LBYA 1AMFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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