3H6TA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and cyclothiazide at 2.25 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6tA02
3G3KA 1NNPA 3VVEA 3VXBA 5BUUA 3HCQA 3ZS6A 3OSRA 4WXJA 3UK4A 3RT8A 3E9XA 3VDFA 1A8EA 3OOAA 5JK4A 4IB2A 3OEMA 3SERA 5HPQA 2F34A 5FTHA 4OMBA 3D4CA 3SEUA 1MXWA 4NWDA 3IJOB 5TU0A 3TTKA 3IJXB 3N6TA 2UVIA 3OO9A 2XXWA 4BDMA 1MG1A 3H6VA 4XKRA 1HSEA 3W15C 4DCYA 3CG3A 1JW4A 4JBZA 2XXUA 3UN6A 2GFEA 4G8NA 1T0KA 1MY1A 5KCJB 5CI5A 2PT2A 2ZYOA 3W9WA 2OCUA 3PUYE 4Z7EA 5I58B 4NE4A 1R6ZA 4ELPA 3LUYA 3H6WA 4F3GA 2QPQA 3L6HA 4I9DA 2HFBA 5M2VA 4F1UA 2O69A 3ILUB 2B65A 4QRZA 3CSGA 2PYYA 1US4A 3TKDA 3K1PA 3K0VA 4IY5A 1MH4A 4GWOA 1ZBMA 3K6WA 4I8CA 3OSQA 2Q88A 3FVNA 2DE2A 4KCDA 1DTGA 3TMGA 1JNFA 3PD8A 3PPPA 4M4GA 4KI0E 3OO7A 1ZLQA 1N84A 3D4GA 2E1SA 4FJPA 2I3WA 1MPBA 1B2HA 4Q30B 4H8IA 2Y7PA 5TP9A 3TZAA 3DP4A 1PEBA 4JXIA 2RF1A 5H8NB 4GD5A 3C36A 4LVQA 3IR1A 3LSLA 2G29A 1Q1KA 1Y3PA 4NF4A 2XXYA 4R9FA 3VLUA 4RY1A 4G8HA 4EUOA 1MQDA 4DZ1A 4U23A 1OLCA 1AH5A 1SW5A 5AA4B 4WEDA 1B32A 1LFHA 4MH5A 4U2RA 2I4CA 5AA1A 1B58A 3THIA 4OEVA 3K1MA 3CFXA 1MQIA 3MAMA 3CFLA 1KWHA 2XXXA 5H8SA 3GXAA 2XXIA 1OIBA 1IXHA 1PDAA 1VSOA 1MY0A 5H8NA 1DOTA 1P1UA 5TPAA 3EF7A 4IO3A 1SW4A 4BDQA 4LZ7A 2XXVA 1HSJA 3MQ9A 4F1VA 1JETA 3JYRA 1B05A 5J1DA 3MW0A 1H3DA 1QUKA 1RKMA 4X48A 4R6HA 1IEJA 4EQ9A 1QKBA 1UIVA 1LBCA 2HZKA 1FQAA 1M5FA 5AA4A 4NWCA 1Q35A 3KZGA 3H6UA 3PMWA 1A8FA 4ONYA 1RYXA 4LUBA 2RC8A 1NKXA 4ZEDA 4U22A 4KPTA 2PVUA 3H4ZA 3U93A 1A7LA 1B52A 1A54A 2QMXA 3HHFA 4XXUA 1JEVA 3VVDA 1N7XA 5AA2B 3PMXA 3TDJA 4OFJA 2XXPA 1FTLA 2IEEA 2XXHA 2I48A 2OZZA 3ILTB 1GVCA 4AQ4A 4LONB 3KN8A 4QFNA 4M1VA 1IZ1A 1ZKBA 4GF8A 4MFIA 5EYFA 2DS9A 5ISUA 3HHGA 3K00A 1LSTA 2I4BA 1B3GA 4ZDMA 3KJ7A 1ATGA 2UVGA 4JWXA 4G68C 2O84X 3PMVA 1LB8A 4R6YA 3JV9A 1QVSA 1O63A 4QFOA 2VP1A 1AOVA 2VGQA 3ONMA 3G3GA 3K1NA 4R2FA 3H3GA 4KR5A 3IX1A 4R74A 1YPNA 2PX1A 5AA2A 3IB1A 1NNKA 3RTFB 3FJMA 5DT6A 4PFWA 2HEUA 3PPRA 4GRKA 5CMKA 2GRVA 5ELVA 1F9BA 3VV5A 2PT1A 1OQHA 1SBPA 1QKAA 1FW0A 4R75A 4OFOA 1ZU0A 3RQTA 2F7CA 2RINA 2ZMBA 2UVJA 4P11A 3RGYA 1A99A 2I0BA 2THIA 1ELJA 2V3QA 3RPWA 3IOUA 2F7AA 1MPDA 1FQCA 1VE4A 1SW2A 1WVJA 4H8JA 1B3LA 4ZEIA 4FORA 4IY6A 2DWAA 1MY3A 3HO7A 3BKIB 1B7HA 4THIA 4F3SA 1DMBA 1NH7A 3OO6A 1S7YA 2HQ0A 3QK6A 1BLFA 3UIFA 4U4SA 4EQ7A 3T22A 1Y20A 3G3FA 3QUFA 3K6UA 3LSWA 4F2QA 5B7DA 3HSTA 5K2XA 3RNNA 3O6HA 2DSFA 1SYHA 3USDA 1CB6A 1JEUA 2XX7A 3M3LA 3TUSA 4F2OA 2YJPA 1SW1A 3K6XA 4OEUA 1LCFA 1FQBA 3LC8A 2P0SA 1R9QA 2F8DA 4OTEA 5CC2A 2Q2AA 1B40A 1MS7A 2ZYKA 3R6UA 4U21A 1XVXA 2VOZA 4YZZA 4FE8A 4EDPA 4F3PA 2RCAA 1FTJA 4L17A 3DP8A 1BIYA 3PD9A 3PGFA 4LP2B 1QULA 3IOWA 2VD2A 4ECFA 3U92A 4GVOA 1US5A 1B3HA 2A5SA 3PU5A 3Q29A 3MP8A 2R71A 3C31A 4DXUA 2D21A 3FD3A 4JWYA 4XIGQ 2M8CA 3Q25A 1N3XA 1N3WA 3M3KA 1B5IA 4EXKA 3SKPA 3FXQA 3N94A 1TFDA 3RLFE 2NVUB 4GLIA 3TCFA 1P1WA 4ESWA 4RNSA 4JSOA 3W9VA 1LFGA 1GGGA 3K6VA 4OETA 4TQUQ 2DYXA 4HCYA 3RT6B 3C35A 4DXBA 4NF8A 3SEVA 1II5A 3E13X 3IORA 4BDLA 3QUJA 1P1NA 2V84A 1UQWA 4OXVA 3CVGA 3G3IA 3ECRA 4YKKA 3MJNA 3B7DA 3G7WA 5TP9B 2V93A 2Q2CA 5AE4A 2AL5A 2ABHA 3TTLA 4OERA 3IOTA 2QS3A 4G8MA 4O3BA 3SEWA 2RKMA 3A3CA 4NF4B 3PUVE 2XD2A 4ZE8A 3GBBA 1XS5A 4FATA 5AA2D 2RCBA 3G3HA 3H06B 5AA3A 4ZEBA 3T9UA 3MZ9A 1LFIA 4RJZA 2X7QA 3FZVA 3ZKLA 1MY4A 2LAOA 3CR9A 4U1OA 5DVIA 3V8XB 4MLQA 3UP9A 1VFEA 5I2KB 4YAHX 5L9MA 1SYIA 3MC2A 5DYHA 2O7IA 1ANFA 1P1OA 4ZZEA 3FJGA 1LB9A 2O1LA 3OELA 2V25A 5L8DA 1NL5A 3IOVA 1OVTA 4LA9A 2DE3A 1B0HA 2OK2A 5JEIA 1NMUA 1H76A 1H44A 1PBQA 1NH8A 4POWA 3VVFA 2HAUA 2OWTA 3R26A 1MM6A 5TPAB 5I59A 1M5DA 5A5XB 4QFLA 1XVYA 3KSJA 2OWSA 3MVWA 2Z8EA 4HTGA 3M8UA 4YKIA 2UYEA 2HCAA 1J1NA 3LSXA 1DSNA 1PBPA 5BWJA 4F19A 2ZNTA 1Y4TA 2HXWA 5I2KA 3CG1A 1EZOA 3C4MA 3MVXA 1TXFA 2XXQA 4Z0IA 1B1HA 4O3AA 1OVBA 3E4RA 4FEDA 1UIUA 2I49A 4QSEA 3BFUA 3MZBA 2F5XA 4I62A 4NMYA 3OEKA 2H98A 2DOJA 1FCKA 1LLSA 2I6EA 1DPEA 3TFLA 5H8QA 4GFRA 2XX8A 4RPNA 4YMBA 2R9JA 1B6HA 1B7ZA 3VLWA 4PE5B 2UXAA 4PFTA 5DTBA 5A5XA 4ESXA 3F11A 2AIXA 1USYE 4E0WA 3QYTA 3IO6A 4JSDA 2Q8JA 3FVOA 4ZE9A 2I0CA 4P0GA 1I6AA 2ONRA 3OMBA 2QMWA 4IGRA 4OWDA 2OLBA 5KDTA 2RC7A 1VFDA 1XT8A 1FQFA 4NEDA 4XTCQ 4OVJA 4C1UA 3IB0A 2ANJA 4NF6B 1Z7ME 4R9GA 1OMPA 3LBSA 3KBRA 3O6GA 4PETA 4TOZA 3B6TA 3FXRA 3IB2A 2V3TA 5DEXB 4N6PA 5FHOA 2IA4A 3SDFA 4Q0CA 1R9LA 3V83A 3U1OA 4F1YA 2VD3A 2REGA 4LZ5A 3FV1A 1Y1ZA 4N07A 4MLVA 2HAVA 2Y7WA 1B4HA 2ESNA 2PMSA 2E0SA 3N26A 4F22A 3FJ7A 1LBBA 1IQ7A 3TODA 5ITOA 1EZPA 3P7IA 3CIJA 4RK9A 3O9PA 2BJJX 1XOCA 1PC3A 4C1TA 2H4IA 4POXA 2F6PA 3I6VA 1FQEA 2Y84A 3V5AA 3S4UA 1BKAA 3FGSA 4NF6A 3PPQA 2Y7RA 1LAGE 2Z22A 3G3JA 1B0LA 4XKPA 3EHUA 4DXCA 4IO7A 2X7PA 5DEXA 2QS1A 2XXTA 2DQVA 3FASA 3IO4A 4ND9A 4H1XA 1USYH 3K2DA 3SEXA 3TAJA 2AL4A 5ICTA 4P0IA 3BBRA 4O3CA 3T9XB 4AB6A 1I6BA 1D4NA 2UYFA 5KZTA 1IXIA 1YTVA 4U4XA 1EU8A 4LQ5A 4F3BA 1PB7A 4IO5A 5L9OA 3Q27A 3HN0A 5CMMA 2DVZA 1ZJLA 4QSDA 2F97A 1FTKA 3VFJA 3PUXE 4GL0A 2DWJA 3Q28A 2O1MA 3U8QA 3TCGA 4WEPA 3MP1A 1TFAA 2ZXTA 2ONKE 4JB7A 3L6GA 4G77A 2ONSA 2NUVA 1WODA 4KYDA 4H5FA 3UORA 3QIMA 1YCJA 2P2AA 4JWOA 3C33A 1FTMA 4EF2A 3B6QA 4JDFA 3O29A 4BDOA 4R2BA 2FA7A 3TYHA 4QFPA 2W7YA 3I5OA 3DELB 3BFTA 4MBPA 4NF8B 3ODBA 4BLAA 4DDDA 1DPPA 3S2VA 4IO2A 1LAHE 3PPNA 4GQOA 1OQGA 3SESA 1AL3A 4KD5A 3MP6A 2B3BA 3T93B 1D9YA 3MVYA 3O2AA 4FECA 1YAEA 4FIMA 1UTBB 2Y7KA 1P99A 1B51A 5I2NA 3TELA 3R7XA 1GR2A 2ALUA 1IIWA 3HV1A 5H8FA 1URSA 3KSXA 4EXLA 3N6UA 5I57A 5H8HA 3S9NC 3FVGA 1IXGA 4DLDA 2A5TA 5FHMA 2Q9TA 2GHAA 1MXYA 3T9VA 3S9LC 1HSLA 4IO4A 4RA1A 2QRYA 1N0TA 1N76A 2QS2A 2O6AA 1EZ9A 1N04A 5DVJA 2DXRA 1JVXA 4QSCA 5LOMA 4ELOA 1AMFA 3SETA 4OYVA 4G2ZA 1MY2A 5FTIA 3RTWB 4OENA 5CRYA 4QF9A 1MXXA 1MDQA 3GBAA 1UTHB 5CBRA 3Q26A 2Z23A 1L5TA 1ZIUA 5EHMA 1UTBA 5ITPA 4QFKA 3PUWE 4PFYA 4TLMB 3S9MC 5JTYA 4YB6A 1NNTA 1B9JA 4Q5TA 2GH9A 4FEBA 3B6WA 1LAXA 4IO6A 4F39A 1MQHA 2XD3A 1A55A 4XKQA 3A3UA 5I59B 1JQFA 1M5EA 3IK6B 5CMBA 4LATA 2F78A 3MBPA 1R1NA 5L9SA 1GTKA 5ICQA 2I3VA 3MVZA 1BP5A 4X9TA 1MH3A 2XX9A 4GXAA 4YMAA 1FQDA 3GZGA 2Z8FA 2VHAA 2DE4A 3KFMA 1IITA 1UTHA 3EHSA 1AIVA 4DCXA 3KN7A 3FATA 1NNFA 1D3KA 1Y4CA 1IXCA 1ZMGA 2ZYMA 4ELQA 5F1QA 1S50A 4MF3A 3RY3A 5H8QB 3KG2A 4OQOA 1POTA 4EF1A 3ZSFA 1URDA 2WKYA 5IAIA 1SI0A 4PP0A 3H03A 1I6QA 4YICA 1GV8A 3K01A 2H99A 4GL8A 4N13A 4EQBA 3LSFB 4OFLA 2AYSA 3S9EA 3C9HA 4ELRA 1JW1A 2P1SA 5KCJA 3C32A 5KDTB 2CMOA 4IGTA 4ZECA 5I58A 1MXUA 3K4UA 4XKNA 3TCHA 3EHTA 1Y9UA 1IUDA 3MUQA 3KJTA 1QUIA 3FV2A 3VXCA 4RPOA 3KOSA 3EQ1A 3CFZA 2G93A 4OHNA 4R6KA 4RYAA 1B7UA 2DWHA 3DP6A 3QXMA 1N7WA 3TTNA 3TTRA 4UACA 3OXNA 1S9TA 3PV0E 1H45A 1FTOA 1D9VA 4H5GA 2O7UA 3OENA 5I84A 1MQJA 4H67A 5HBCA 1JVYA 4PFUA 2RC9A 3MZ1A 1TWYA 3PUZE 3FXUA 3JZJA 4BDNA 3T9HB 4WKMA 3V89B 2OJTA 1MPCA 2QL3A 4NTLA 1OLAA 3TEPA 3KOTA 3C34A 1VR5A 3H7MA 3RN8A 2F7BA 1TT1A 4YB7A 4DIGA 5K2YA 4RXLA 3DM0A 2DXYA 3TTMA 1B46A 5DVFA 4TLLB 3WAEA 2REJA 3SEYA 3RUMA 2HZLA 4DE8A 2DWIA 2D5WA 2YLNA 4HCWA 3EN3A 2Z8DA 4UA8A 4E0XA 2OBGA 3U94A 4GOTA 1QJMA 1MXVA 4GIZA 3HPIA 4BDRA 1O7TA 1Y3NA 4H0WA 2PBWA 5B70A 1M5BA 3I3VA 2H25A 2ZNUA 4ZEFA 1WDNA 4GXSB 4R73A 5IKBA 1I69A 3OO8A 2XHDA 4X1DA 3KN3A 3KGCA 4NF5B 4U1ZA 2YPNA 2NWJA 4G68B 3CSBA 2H9BA 5CBSA 1MQGA 2Q89A 2XXRA 3UA8A 2QJEA 3CI8A 3M3FA 2R6GE 4KQPA 4HS7A 1DTZA 2NXOA 4KCCA 1ZTYA 3A09A 3QAXA 1B3FA 1O64A 2KLFA 3FIRA 3TQLA 3K02A 1P1QA 5FHNA 2UVHA 3FVKA 2ZNSA 4ISUA 1POY1 3EPEA 3GLBA 4F29A 2O51A 5I56B 4QHQA 2X26A 2H5YA 4X1BA 1SD3A 2QSXA 1XHYA 3KEIA 4RK2A 5CM6A 3O6IA 3T96B 5F7VA 1PB8A 3IAZA 4KFQA 4NF5A 1B4ZA 3WAFA 5I2NB 2GHBA 4G68A 1H43A 4Q8RA 5H8FB 1B5HA 1CE2A 1A40A 1MDP1 2NOOA 5I57B 4PQJA 5H8HB 4G4PA 3LR1A 1MXZA 2A5TB 1B1XA 1SDXA 3CRBA 5CMCA 5HM4B 3DLNA 3OD7A 3MPKA 4KHZE 1LGBC 2F36A 4KYSA 4YKJA 1NFTA 1QW0A 2Y7IA 3TPAA 1PB9A 1LCTA 3UGWA 4ZZAA 2V3UA 4C0RA 3QSLA 5EHSA 4OZ9A 1URGA 4H6DA 4ZS9A 2DP8A 2FNCA 3O97A 5I56A 3PPOA 2B3FA 2O68A 1EH3A 3MWBA 3FUZA 3VE1B 2DVCA 3VLVA 2QS4A 1B3EA 4F31B 1M5CA 1JW5A 3E3KA 2D3IA 3MPLA 3N5LA 3AXFA 4H65A 1SQYA 4YKPA 1MM7A 2CZLA 4LQ2A 3TQWA 2FYIA 4AB5A 4R72A 3U72A 5JTYB 4ZEKA 4I1DA 3T66A 4FAJA 3IL1B 4YB5A 4K3FA 4HW8A 1LAFE 1RYOA 2F35A 1Y3QA 3H6TA 3O28A 1B5JA 3ZKKA 4LZ8A 4KYEA 1MRPA 1Z7NE 1BTJA 2I58A 2F6GA 4F18A 1SI1A 1SVXB 1Y1MA 1XC1A 1QUJA 2ZYNA 4YU0A 4OESA 3O66A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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