3H6TA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and cyclothiazide at 2.25 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6tA02
2AL5A 4ZEDA 1JW1A 4IO7A 4FIMA 3QXMA 3EF7A 1A55A 1I6BA 2P1SA 3B6WA 2O7IA 4HS7A 3FJMA 2HQ0A 3IO6A 1YAEA 3O66A 4UACA 3C35A 3BBRA 1Q35A 1XOCA 1I69A 1POTA 1FW0A 3IK6B 3OEKA 4YB7A 1H43A 2XXHA 3H6VA 5J1DA 1XVXA 3PUWE 1SBPA 2DXYA 1ZKBA 1BKAA 3GZGA 2ZMBA 3FV2A 2NOOA 4X48A 4YKJA 5CI5A 3IX1A 1FTLA 3HN0A 3USDA 3SEXA 2XD2A 4I8CA 1Y1ZA 1L5TA 1QKAA 2OK2A 1TFAA 1NNKA 4QFNA 1SQYA 5FHOA 3H3GA 4OESA 3MP6A 4MLVA 4JXIA 2QMXA 2OJTA 3KZGA 4PE5B 3H6TA 3FXUA 2I49A 4U4XA 4F18A 1JEUA 1JW4A 3Q26A 1XHYA 5ICTA 3A3CA 4GQOA 2DWJA 3T22A 1EH3A 1CE2A 5CM6A 5ITPA 3CFZA 4MLQA 3LBSA 1M5CA 3TPAA 3IB1A 3A3UA 1A8EA 5KDTA 3VV5A 3CG3A 2V84A 1H76A 2D5WA 4JBZA 3TQLA 3RT6B 4M4GA 5AA2D 1B05A 2I3VA 4RPOA 3FJ7A 4DE8A 3VVFA 3SETA 2O1LA 2ZYKA 1UIVA 1JVYA 2ZYNA 3PUYE 4G68C 4DCXA 2F7BA 5CMMA 3KOSA 3IB2A 3G7WA 3RTFB 4NF4A 1B7UA 4JWXA 1PEBA 3D4CA 3K02A 1Y20A 4U2RA 5HM4B 1ZLQA 4NF6B 3CSBA 4E0XA 3O6HA 4G2ZA 4KYDA 4OXVA 3KSXA 2XXXA 4GIZA 4DLDA 1PB8A 1LBCA 1D3KA 3U1OA 1B3HA 3ZKLA 5I59B 1A40A 1QKBA 3PPNA 3MAMA 4G68A 4H5FA 1M5EA 3GLBA 1P1UA 4RNSA 5CMCA 3IR1A 5FHMA 4NF5A 4PQJA 3VVEA 4EDPA 1SI1A 4GXSB 3TODA 3E3KA 1IUDA 3MVYA 3P7IA 3MZBA 2PT1A 2GH9A 2HEUA 1MS7A 3RNNA 4LZ7A 3K00A 3EHSA 1B0HA 3PPRA 3DLNA 5CBSA 3L6HA 5H8HB 4OERA 3RTWB 4EXKA 1B5IA 3VXCA 2F7AA 4WEPA 3TDJA 1DOTA 2QS4A 4ND9A 4GD5A 4BDOA 2IA4A 1SW1A 3UIFA 4ISUA 3K6UA 2BJJX 1POY1 3E13X 2Z8EA 1Y4TA 1BLFA 5EHMA 2YLNA 3N94A 3THIA 1B58A 3TMGA 1NFTA 3FXQA 3QIMA 1D9YA 5DEXA 4QRZA 4NF8A 3UK4A 2AYSA 1MXZA 3MC2A 2Z22A 2Z8FA 3JV9A 3OMBA 1IXCA 3VLWA 3ILTB 1B3FA 2AIXA 1R6ZA 3KN8A 2Q2CA 3RT8A 4ZEFA 4R75A 4FEDA 1FQCA 3V8XB 1YCJA 1URGA 4BLAA 3DM0A 1OVTA 4IO6A 2Q8JA 1LGBC 1A99A 4NF8B 4P0GA 3OEMA 2FYIA 3VXBA 3TELA 3IL1B 3U92A 2HAVA 3HSTA 4YKIA 2QJEA 3PUZE 1IQ7A 4RY1A 4HW8A 2UVIA 1N0TA 5H8NA 2A5TA 4OQOA 2O84X 4WEDA 3IJOB 4U1ZA 4FECA 4NTLA 1PB7A 4PP0A 2I4CA 2Q89A 3L6GA 1B9JA 1QULA 4LP2B 5I2KA 4POXA 4EQBA 3H6UA 2Y7IA 4JSOA 2HZLA 3QSLA 4LZ8A 3TQWA 3MZ9A 1B6HA 4ECFA 5L8DA 1SW5A 1VFDA 4NE4A 4R6YA 5K2XA 5TU0A 1D4NA 2ABHA 3T9UA 3VE1B 1FQAA 3TEPA 3TUSA 1ELJA 3SEUA 2GHBA 2PMSA 3K2DA 2YPNA 1URSA 1LCFA 4F1VA 4BDRA 2DOJA 1MY4A 4OZ9A 2H9BA 4LA9A 3C4MA 5JTYB 1OQGA 4G8MA 5DVIA 5I58B 1N3WA 4KCDA 3CIJA 1GV8A 1Y9UA 2RCAA 3BFTA 5AE4A 2QS2A 5H8FA 3HPIA 1QW0A 4KPTA 3SDFA 4E0WA 4RYAA 5TPAA 1UTHA 3IOTA 2GRVA 3MVZA 5A5XB 4QFLA 4YZZA 1IEJA 1LAGE 3TTKA 2G29A 2H5YA 2QS3A 3S9NC 4R9GA 3MQ9A 1GVCA 5DYHA 4ONYA 2F78A 2UVHA 2AL4A 1MH4A 4POWA 3EPEA 1IXIA 4DXBA 1UTBA 2X26A 3UP9A 4YKPA 2UYEA 3FD3A 3MUQA 4G8NA 2H99A 4F3SA 3RN8A 4XXUA 2V93A 3O9PA 1FQBA 3K6XA 4I62A 2F8DA 4H67A 1TXFA 3TTMA 3MP8A 3MWBA 4R72A 4QSCA 4U22A 3W15C 1T0KA 4DCYA 4OFJA 4XIGQ 2XXUA 2H25A 1OQHA 4IB2A 5AA2B 3C9HA 3U93A 4Q0CA 3T66A 1VFEA 1MXUA 3LUYA 3PPQA 1FQDA 3G3KA 2Z8DA 3O6IA 2DS9A 3VLUA 3M3FA 1SDXA 3UA8A 4YAHX 5FTIA 3TTRA 1N3XA 5FHNA 4QHQA 3H03A 1NNTA 4FJPA 1R9QA 4PFWA 3PGFA 5CMKA 3IB0A 2Y7WA 3W9VA 3GBBA 1MDP1 3K1PA 2O51A 1MPBA 4ZE9A 1B0LA 2Q2AA 4NMYA 5ICQA 3K6VA 1LSTA 2Y7RA 4KYSA 1QVSA 3SERA 1B3LA 3FVGA 5HBCA 1B7ZA 4BDNA 1JQFA 1A54A 2NXOA 3RQTA 3HCQA 3K6WA 1EZ9A 3T9VA 1N76A 1JETA 1YTVA 2CMOA 2Y7PA 4FATA 4FEBA 3WAFA 2QMWA 4F31B 3T93B 1DMBA 3LC8A 3MBPA 1Y4CA 2NUVA 3S9MC 3H06B 2F34A 2XXWA 3I3VA 4DXCA 3ILUB 2QL3A 3GBAA 1PBQA 1OIBA 1MXXA 4THIA 1N84A 4QFPA 4N6PA 4DXUA 4KR5A 4F39A 2X7QA 4QSDA 3MPKA 1MPCA 3QK6A 2RC7A 2DWAA 4Q8RA 3IJXB 1SW4A 4NF6A 3LSLA 3N6TA 3FASA 5BUUA 4OHNA 5CC2A 3B7DA 2DYXA 1S9TA 5I84A 4EQ7A 3QAXA 3KSJA 1LCTA 5I59A 3M3LA 2DSFA 1ATGA 1B32A 3CFLA 4ZZAA 1B5HA 1US4A 1PBPA 2YJPA 2REGA 2DWHA 3TZAA 5DVJA 3G3HA 2PVUA 1MQHA 4IO3A 1B1HA 3BFUA 1ZU0A 1QUKA 1IIWA 3PU5A 1I6QA 1HSLA 1IITA 2XXIA 4GFRA 3RLFE 4FE8A 4O3CA 2ALUA 3V89B 1Y3NA 1JNFA 1MQDA 4GXAA 5H8QB 3SEYA 5H8HA 3ZKKA 3TCHA 1PDAA 5F7VA 1NL5A 3PMXA 3FVKA 4GF8A 2QRYA 1OLAA 3EQ1A 1AIVA 4C1UA 4OFLA 4XTCQ 4OENA 4M1VA 3MZ1A 4PFUA 1N7WA 2ONRA 2VGQA 1IXHA 3Q28A 4QFOA 2VD3A 2FNCA 3TKDA 4F3GA 1WDNA 2XXQA 4AB6A 4KCCA 2PX1A 1MY0A 2P2AA 2GFEA 4TLMB 3S9EA 2XXTA 3I5OA 1LB8A 4OVJA 1A7LA 3N6UA 1XS5A 3OO9A 1B7HA 3QUFA 3OO7A 5M2VA 2XXRA 1MQGA 4I9DA 1MY1A 4ELOA 1MQJA 3D4GA 3H7MA 4GVOA 5DTBA 3E4RA 4I1DA 1LBBA 1AOVA 1MXYA 3RUMA 3QYTA 4YB6A 2F6GA 3LSXA 2OCUA 5F1QA 4LVQA 1LAFE 1DSNA 2XXYA 1TWYA 2R71A 3VLVA 1LFIA 4EF1A 2V3TA 1SI0A 2M8CA 5AA4A 4PFYA 3FJGA 4FORA 1Y3QA 4EXLA 3B6TA 4JSDA 3I6VA 3PPOA 4BDQA 4H1XA 1O7TA 4MF3A 2F7CA 1MH3A 3V5AA 4TOZA 4ZEBA 4XKRA 3AXFA 3DP8A 4YMBA 5FTHA 3GXAA 3PMWA 1DTGA 4KFQA 4F29A 4G77A 4BDMA 4ZDMA 4U23A 1NH7A 4TLLB 4LQ2A 5AA4B 2O6AA 4F3BA 2QSXA 1SYIA 4F19A 4KYEA 1O63A 1MM7A 2RCBA 4ESXA 2XX7A 3OD7A 3R26A 4QF9A 4OYVA 1Q1KA 2E0SA 2NWJA 4TQUQ 5JTYA 2ZNUA 5I58A 3R7XA 3TYHA 4H8IA 2Y7KA 4PFTA 1FTMA 5TP9B 2OZZA 2FA7A 3F11A 3A09A 5L9MA 3KG2A 2Q88A 3G3GA 2F36A 5A5XA 3HHGA 4O3AA 3PPPA 1ZBMA 3CG1A 2VP1A 4RJZA 3MW0A 1USYH 1NNFA 5DT6A 1B51A 3C31A 3EN3A 4GL0A 1GTKA 2RF1A 4QSEA 1B1XA 1PB9A 2I48A 4R9FA 1ZMGA 2V25A 3CI8A 2RC8A 2OWSA 1RYOA 4F1UA 4X1BA 5I56B 2Z23A 1CB6A 2XXVA 4RPNA 1M5DA 3G3FA 5K2YA 4JB7A 1DTZA 1WODA 3OELA 3C32A 2O1MA 4F1YA 3IOUA 3MP1A 3FIRA 5AA2A 2ESNA 3DP6A 2IEEA 1S50A 4RK9A 4K3FA 4AQ4A 2PT2A 3TTLA 3OXNA 4F3PA 1SW2A 1UIUA 3T9HB 5I57B 2HZKA 3OO8A 3TTNA 1BP5A 2VD2A 1VSOA 3FV1A 1EZPA 4ELRA 3VFJA 4DIGA 1IZ1A 2B65A 5H8SA 1N04A 3IAZA 1XVYA 1QJMA 4KD5A 3LSFB 3PMVA 3JYRA 1AL3A 1BTJA 1SVXB 5IKBA 2R6GE 5JEIA 2Q9TA 5CBRA 1I6AA 1N7XA 1B5JA 2DE2A 2HCAA 4KQPA 3LR1A 1P99A 3QUJA 2WKYA 2HFBA 5B70A 1F9BA 4X1DA 3M3KA 3UORA 4XKNA 3KEIA 4ELPA 2ONSA 2XHDA 3S2VA 2V3UA 4EF2A 1JVXA 1LB9A 4Z0IA 4ZECA 2R9JA 3G3IA 1R1NA 3KFMA 5I2NA 3VDFA 4H65A 4XKQA 4IGTA 3OENA 2ONKE 3SEVA 4JWOA 3MPLA 4DZ1A 3OSQA 2I4BA 1P1NA 1LLSA 4HCYA 4U4SA 3FGSA 3RGYA 3VVDA 1P1QA 2ANJA 5LOMA 2PBWA 4GL8A 4RA1A 1NH8A 2B3FA 1NNPA 4ZZEA 4ZEKA 3C34A 4IY6A 3ZSFA 3C36A 2THIA 5I2NB 5AA1A 4YU0A 4KHZE 4LQ5A 5CRYA 2O7UA 1VE4A 4G8HA 5L9SA 1Y1MA 3ODBA 3MVWA 2F5XA 1QUJA 1B3EA 4U21A 1MPDA 1B46A 4ESWA 3KOTA 2X7PA 5B7DA 2F97A 3R6UA 2I58A 3B6QA 4OMBA 1B3GA 1H44A 4IO4A 2REJA 4PETA 2DXRA 1M5FA 2HXWA 3K0VA 2B3BA 4OTEA 1B40A 3Q27A 1HSEA 3WAEA 1FQEA 2UVGA 4OEUA 4H0WA 4IY5A 3HV1A 1A8FA 3T9XB 1IXGA 5H8QA 3O6GA 4LONB 1KWHA 4QFKA 4IO5A 3OSRA 4R2FA 1LAHE 1AH5A 4L17A 3E9XA 3C33A 1FTKA 1YPNA 3PUXE 3EHUA 3O29A 4ZS9A 1RKMA 4GRKA 3OO6A 4F2OA 5KDTB 2UVJA 3DELB 2CZLA 3FUZA 1RYXA 2DP8A 1MXVA 4YKKA 3W9WA 2OWTA 2ZNTA 4IO2A 2I3WA 4R73A 3FXRA 4LUBA 4EQ9A 2OLBA 3IO4A 3Q29A 4XKPA 4EUOA 2H98A 2ZYMA 3CFXA 3H4ZA 1FQFA 3N5LA 3ECRA 2UXAA 4N13A 4AB5A 4GOTA 3H6WA 4NF4B 3ZS6A 3Q25A 4NEDA 4KI0E 5ITOA 1TFDA 3BKIB 3O2AA 4Z7EA 3KBRA 1DPPA 1O64A 4OFOA 1VR5A 1LAXA 4F22A 5JK4A 4G68B 1BIYA 4JWYA 4N07A 2ZXTA 3PD8A 5KCJA 2XX9A 4NF5B 4U1OA 3V83A 5DVFA 3UGWA 2ZNSA 3HO7A 2XD3A 5HPQA 3U8QA 2F35A 2QPQA 2V3QA 3SKPA 1MG1A 3EHTA 2VHAA 2XX8A 1II5A 4NWCA 1OVBA 4Q30B 5KCJB 4H6DA 3K1MA 1B4ZA 1LFHA 5ISUA 1ANFA 2DVZA 3CSGA 2G93A 4LZ5A 4YB5A 1TT1A 1AMFA 1EZOA 1MQIA 1MY2A 3IOVA 1B52A 4MBPA 5DEXB 3RY3A 1GGGA 1SYHA 1XC1A 4R6HA 1B4HA 1MXWA 1JW5A 1UQWA 5EYFA 1P1WA 1ZTYA 1FTJA 4DDDA 2QS1A 2F6PA 1MM6A 1MY3A 3CRBA 3KJ7A 3MVXA 3RPWA 2KLFA 3HHFA 3K4UA 4R6KA 4C0RA 3TAJA 2DWIA 3MJNA 2ZYOA 3O97A 2OBGA 2O68A 3SEWA 4YMAA 1S7YA 5TP9A 3JZJA 1P1OA 2VOZA 1USYE 3S9LC 1NMUA 3T96B 1OMPA 3FVNA 3N26A 1MRPA 5CMBA 4YICA 4G4PA 3KN3A 5H8NB 2DE3A 2A5TB 3PUVE 4F2QA 1GR2A 2DVCA 3S4UA 4RK2A 3IORA 3OOAA 5IAIA 1QUIA 3IOWA 1J1NA 2H4IA 1OLCA 3UN6A 3CVGA 1XT8A 2DE4A 1URDA 5AA3A 2I0CA 5I2KB 3K01A 2A5SA 1HSJA 1WVJA 1MDQA 4NWDA 4JDFA 5L9OA 3KJTA 1US5A 4IGRA 5I56A 2I6EA 1SD3A 1FCKA 4O3BA 2PYYA 3KN7A 3FVOA 4ELQA 2UYFA 4C1TA 1PC3A 3K1NA 4P0IA 1FTOA 4WXJA 1B2HA 4GLIA 3U72A 4R2BA 4OWDA 4H8JA 4ZEIA 2W7YA 4P11A 1Z7NE 5EHSA 2P0SA 4LATA 2D21A 2NVUB 2O69A 1NKXA 4Q5TA 1ZIUA 3SESA 4R74A 1H3DA 2Y84A 4HTGA 3PD9A 5I57A 2DQVA 3M8UA 1JEVA 3TCFA 4ZE8A 1DPEA 1Y3PA 1H45A 2HAUA 2XXPA 4GWOA 2RC9A 4MFIA 1LFGA 2RINA 5BWJA 3KGCA 4BDLA 3FATA 4H5GA 1M5BA 3ONMA 4HCWA 1D9VA 1Z7ME 1R9LA 4OEVA 4FAJA 3DP4A 3G3JA 4OETA 5H8FB 2D3IA 3PV0E 4MH5A 2E1SA 4X9TA 3TCGA 3FZVA 3LSWA 2LAOA 5TPAB 1UTHB 2GHAA 3U94A 5KZTA 1EU8A 2I0BA 1ZJLA 4RXLA 4WKMA 4UA8A 3CR9A 5ELVA 3O28A 1UTBB 3TFLA 2RKMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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