3H6TA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and cyclothiazide at 2.25 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 79
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6tA02
4YKIA 4ESXA 4GRKA 3TZAA 4MF3A 3MP1A 3HCQA 4IO7A 5CBRA 1WODA 3CFXA 4UA8A 1B3LA 5I59B 1QUKA 4R2BA 2G93A 3B6QA 4ZECA 5ITOA 4IO3A 3KSXA 4ELPA 1B5JA 3IORA 2F36A 2DS9A 4G4PA 4LZ7A 3C9HA 1I6AA 1H45A 2PX1A 2B3FA 4WEDA 2ANJA 4NF8B 3VV5A 3K1PA 2YLNA 4YB6A 4NTLA 4R74A 2GH9A 1TFDA 2ZNTA 1UTBA 4GL0A 3MVYA 1UTHA 3FVGA 3FD3A 2HZKA 1R6ZA 1SBPA 2XX7A 4KYEA 3IO6A 1LAFE 1LB8A 2F7CA 3TEPA 2OJTA 5FHMA 3OO8A 4QFOA 3DP6A 1OQGA 1RKMA 2O1LA 4FORA 2ZYMA 4F31B 1MM7A 1USYH 4H1XA 2ZYNA 1A99A 2QMXA 4NWDA 5AE4A 1IXGA 2XXTA 2QSXA 3TMGA 4WXJA 3P7IA 1QUJA 3H3GA 4FECA 4U22A 1D3KA 1EZOA 4I62A 5AA3A 1Q35A 1B51A 4HW8A 1MXVA 1SVXB 3TODA 3RTWB 2NWJA 4KPTA 1NL5A 4FE8A 4ZDMA 1R1NA 2XXYA 1AIVA 3MPKA 1ZJLA 3V5AA 3Q25A 2WKYA 1MQDA 3VVEA 2GHBA 2B65A 1JEUA 4NF5B 3TPAA 3MZ1A 4AQ4A 4OWDA 5TU0A 1UIVA 2REGA 3LUYA 1JQFA 3OELA 4G68B 4JXIA 3TYHA 4GF8A 4KHZE 5I57B 3T66A 3QUFA 1PBPA 3IOVA 2A5TB 1P1WA 4R6YA 4YKPA 1PBQA 1LBBA 1IXCA 4BDLA 4NF6B 2QS4A 5DTBA 1JW1A 4QHQA 1JW4A 1PB8A 2Q9TA 3K4UA 1XT8A 3THIA 3KBRA 1O64A 4IO4A 4ZS9A 5JTYA 1UQWA 1EZPA 5A5XB 1DTGA 2F35A 4WKMA 4NF4A 2RC8A 2QRYA 3O9PA 4R9GA 1Z7ME 2Q2AA 4OYVA 3Q27A 2OWSA 1MH4A 2OLBA 3S9NC 5CC2A 4C1TA 4RJZA 3GBBA 3LSLA 2BJJX 2REJA 3KZGA 2DSFA 2OK2A 2Z8FA 5I2NB 2Q88A 5TPAB 4F2QA 1M5FA 3V8XB 3TAJA 4R6HA 5KDTB 4ZEKA 1NFTA 5FTHA 5H8SA 3I5OA 4KD5A 3OENA 3KSJA 3PD8A 3K0VA 2UVIA 1IZ1A 1IXIA 2PBWA 1FTLA 4ZE9A 1WVJA 1MQHA 2V84A 3MZ9A 2DE4A 4ZEDA 1XVXA 2Z8DA 3O2AA 5I56B 3ECRA 2RCAA 3QSLA 1IEJA 4F3GA 4RXLA 3Q28A 4OXVA 5L9SA 4ZEFA 3SEYA 3PPQA 4X1BA 1MDQA 1I6QA 3H6UA 4PFUA 3RGYA 4H5GA 1NNKA 3RN8A 3E13X 4X1DA 2NVUB 4F3SA 1KWHA 2VHAA 3MJNA 5CI5A 3FGSA 1AMFA 3H4ZA 1XS5A 3FJGA 3WAEA 2I3WA 4OFJA 3K6VA 3JZJA 4X9TA 3IAZA 4NMYA 3EHTA 1B52A 3QK6A 1SW1A 2DWAA 4DCXA 2I49A 3PPPA 1MY3A 1QULA 3G3FA 1FTKA 4KCCA 3CSGA 1A54A 1OQHA 3DLNA 2R6GE 3TQWA 3MP6A 1P1OA 1OVBA 1OVTA 2IA4A 2X7QA 2Z22A 1B0LA 5CBSA 3C4MA 1LFIA 5H8FB 1YAEA 2F34A 5K2XA 5JEIA 3TTMA 4DCYA 3USDA 3C32A 1MY1A 4NF5A 2QS3A 3KFMA 3VDFA 4YMBA 2DXYA 1Y1ZA 1D4NA 4R9FA 3SEXA 4Q8RA 5AA4B 4MLQA 3S4UA 3ZSFA 4NWCA 2OWTA 5I59A 3FJMA 3RLFE 3U92A 3C36A 3FVOA 4TQUQ 3UP9A 1B1XA 3CFZA 3KN3A 4HS7A 1QW0A 1QVSA 4DXUA 3MQ9A 1SYHA 3C34A 3I3VA 4NF8A 4FEBA 4X48A 3G3IA 3PU5A 3T22A 5L9MA 3DP8A 1FCKA 2FYIA 4KCDA 4RK2A 4ZE8A 2KLFA 3T9VA 2F78A 2VD2A 4M4GA 1I6BA 4GIZA 4U2RA 4FEDA 1B58A 1LAHE 1MY0A 5DVFA 4H0WA 2Q8JA 1LLSA 2ALUA 3FV1A 2VGQA 2I4BA 3T93B 1ZU0A 4GOTA 4Z7EA 3OEMA 5H8HB 1ELJA 1TXFA 5IAIA 2DE2A 3UIFA 2PT2A 1M5EA 4XKRA 4IGRA 3QUJA 1H76A 1YTVA 4ZEIA 1N76A 2OZZA 1P1UA 1B6HA 2F97A 1M5BA 4IB2A 1PEBA 2I3VA 2UYEA 2FNCA 1QKBA 5AA2D 1A55A 1WDNA 2ZYKA 4ND9A 4P0GA 3HHGA 4O3BA 4PFWA 4ELQA 3OO7A 1FTMA 3EF7A 4DE8A 4RPOA 4XIGQ 2M8CA 1MY4A 3U93A 3ZKKA 4ZEBA 1P1QA 5EYFA 4G68A 4JBZA 1GV8A 2PVUA 5I57A 1ZIUA 1FTOA 4OVJA 1B3HA 1CE2A 2P2AA 3T9UA 2A5TA 3OO6A 3U8QA 3U94A 4LATA 4NF6A 1Y9UA 2V3QA 4F39A 4QSCA 3GXAA 4KYSA 1TT1A 2YJPA 2ZMBA 1LFGA 4HCWA 3EHUA 3BBRA 4OFOA 2OCUA 3ZKLA 4IO6A 3VE1B 1B3GA 5DEXB 2Y7KA 1VE4A 3TCHA 5A5XA 4U21A 4OMBA 5CM6A 3OD7A 4H65A 3A09A 2HEUA 2ONRA 4LONB 3VXBA 1Z7NE 3VVDA 4JSDA 3IB1A 3O6IA 5I2NA 3FVKA 5TPAA 4KR5A 4H6DA 1MS7A 2VD3A 3S9LC 1OMPA 5KDTA 1POY1 2HXWA 4QSEA 2F7AA 3RUMA 3PUVE 4F3PA 3MWBA 3SERA 2RC7A 3HO7A 3O28A 1N84A 4GXSB 1N04A 4QF9A 2XHDA 4I1DA 3CSBA 4POXA 3IJXB 5TP9B 3SEWA 2I4CA 1JVXA 5AA1A 5L8DA 5EHSA 1MXXA 1Y4CA 3JYRA 1GR2A 1VSOA 2GRVA 5I56A 3KOSA 2UVHA 4PFTA 3MVXA 2XXWA 5ELVA 4G77A 3LSWA 4XKPA 3VXCA 4U4SA 2H99A 1URSA 1D9VA 3N5LA 3W9VA 1BKAA 2VP1A 3M3LA 3SKPA 3FVNA 5I2KB 2O84X 3K1MA 1Y4TA 4OETA 4R75A 4F18A 1SI1A 2I0BA 3SESA 3MZBA 1LBCA 1XC1A 1QJMA 2ESNA 3G3KA 4P0IA 3EQ1A 3RTFB 4EXKA 2F6GA 4I8CA 2ZXTA 3FXQA 1HSJA 4RYAA 4GFRA 2AYSA 3ODBA 3IOTA 4PE5B 5HBCA 1DMBA 1POTA 3FUZA 3B6WA 3M3FA 3OSRA 1HSEA 5H8FA 3W15C 1S9TA 1USYE 5BWJA 3FIRA 1BLFA 1OIBA 5AA4A 3B6TA 1EH3A 1R9QA 1B7HA 1B0HA 5ICQA 2Y7IA 1Y3PA 5CMKA 2H4IA 4GWOA 3OOAA 3FASA 5B7DA 5H8NB 1DOTA 3LC8A 4BDNA 4L17A 4H8IA 3PV0E 1B05A 3UORA 4IY5A 4C0RA 4H8JA 1FW0A 2Y7PA 1FQDA 1MRPA 4DLDA 2PT1A 3PUWE 1LCFA 1MPDA 4BDQA 2XX8A 1PB7A 2P0SA 1H3DA 1NH8A 3TKDA 1O63A 2Z23A 1UIUA 3CG3A 3FJ7A 2DVZA 4R72A 4AB6A 3SEVA 3K6XA 2RCBA 1M5DA 1A40A 3RT6B 4YKKA 3QYTA 3VLUA 2H25A 1P99A 3N94A 4QFPA 5H8HA 4I9DA 4FATA 3RNNA 1US5A 1QUIA 1N0TA 4OEVA 2NOOA 4G8NA 1B40A 1NMUA 5CMCA 2DOJA 1IITA 4FJPA 3RT8A 3KOTA 3QXMA 1SDXA 3SETA 3PUYE 5IKBA 1DPPA 3IB2A 5FHOA 3I6VA 3A3CA 2XXPA 4PETA 1MDP1 2I58A 3T9HB 3PD9A 4GD5A 1FQFA 1FTJA 1LGBC 4G68C 3BFTA 1LFHA 1AL3A 4OHNA 2HAVA 1P1NA 4EQBA 4U23A 4F2OA 2F7BA 4OQOA 1B1HA 1B5IA 3Q29A 3UK4A 1FQAA 4OZ9A 3WAFA 4EF2A 1F9BA 5I58A 1VFDA 2ZNSA 5ICTA 1XVYA 1R9LA 4JSOA 4POWA 5ISUA 3O29A 3IK6B 2XD2A 4QFLA 3D4GA 4LZ5A 2HAUA 4ZZEA 3CI8A 1B3FA 5DEXA 4F1VA 4MFIA 1MXYA 2X7PA 3TTRA 2XXHA 3QAXA 1JVYA 3ONMA 1B3EA 2RKMA 2AIXA 2O6AA 4DDDA 5JK4A 4O3CA 4EF1A 2YPNA 5J1DA 4YB7A 4NEDA 4BDOA 2ZNUA 1EZ9A 4DXCA 4RPNA 3FXUA 1TWYA 4EUOA 4ELOA 3RPWA 4KYDA 1S7YA 4OENA 2UYFA 1Q1KA 1RYOA 2XXQA 1MQJA 3VLWA 3DELB 2XXVA 4MH5A 1O7TA 4GL8A 5LOMA 2Q89A 4GVOA 2RC9A 2GFEA 4Q5TA 3O6GA 1ZMGA 5H8QB 2D5WA 4ELRA 3HHFA 1URDA 1J1NA 3C35A 2HCAA 2DP8A 5TP9A 4Z0IA 5BUUA 5F7VA 1NNTA 1MPCA 1IIWA 2O68A 2XXXA 3OO9A 4XKQA 4YICA 3FZVA 1AH5A 3VLVA 1XOCA 1RYXA 4N07A 3MAMA 2H5YA 1H44A 4ONYA 3PMVA 5KCJB 3MBPA 4DZ1A 4F19A 4ECFA 1B46A 4THIA 3MVWA 3S9MC 3PPRA 1IXHA 2VOZA 3H03A 1B4HA 1CB6A 5I84A 4PFYA 1OLAA 1FQBA 5I58B 1EU8A 3IOUA 2DWIA 4QFKA 1YPNA 1ANFA 5CRYA 4YB5A 2DQVA 4PP0A 4YZZA 3HV1A 3ILUB 3R7XA 1VR5A 1LAGE 3KJTA 5I2KA 1S50A 4YAHX 2RINA 2DWHA 5L9OA 3MVZA 2THIA 2F8DA 3G3JA 2I48A 3KEIA 2XD3A 2Y7WA 5CMMA 4QFNA 2V93A 3CG1A 1M5CA 3U72A 1ZTYA 1NNPA 3E3KA 1YCJA 3VFJA 4RK9A 2R9JA 1B7ZA 4KI0E 3FV2A 2Z8EA 4XKNA 4U4XA 3IL1B 2F5XA 3D4CA 3GLBA 3OEKA 3IJOB 4E0WA 2NUVA 3M3KA 2QMWA 3V83A 3DM0A 3N26A 1MQIA 2XXUA 4DXBA 1LAXA 4LQ5A 3K01A 4EXLA 3CIJA 1GTKA 3KN7A 2Y7RA 3T96B 3TQLA 1L5TA 5HM4B 1MXUA 2DYXA 4Q30B 5H8NA 1BTJA 1NKXA 3K6UA 2NXOA 4U1ZA 3TDJA 1SD3A 5M2VA 1Y1MA 4OTEA 1II5A 3MP8A 3GZGA 2P1SA 3C31A 4Q0CA 3T9XB 4H67A 1N7XA 4LVQA 2ZYOA 1A7LA 4O3AA 1B4ZA 2Q2CA 3RY3A 3ZS6A 1BIYA 3AXFA 4IO2A 1HSLA 4BDRA 5DVIA 2H9BA 5AA2B 1OLCA 1VFEA 2IEEA 5CMBA 2AL5A 3HSTA 3PPNA 1URGA 4LUBA 1TFAA 3QIMA 2LAOA 4E0XA 3DP4A 2F6PA 3H6VA 5B70A 3K6WA 1MXZA 4KFQA 3TELA 1B2HA 2O69A 2G29A 1PC3A 3L6GA 3LR1A 1FQCA 4AB5A 1NNFA 1GVCA 1SYIA 1N7WA 3TCGA 1A8EA 3LBSA 1SW5A 4YMAA 3RQTA 1JETA 2XX9A 1SI0A 5FTIA 2O1MA 4BLAA 2QS1A 1UTBB 2PMSA 1PB9A 1UTHB 4GXAA 2V3TA 3GBAA 3HPIA 3E9XA 4UACA 3H6TA 1LB9A 3CFLA 4FAJA 3VVFA 3FATA 3EN3A 3H7MA 1MH3A 1LSTA 4GLIA 3TFLA 4GQOA 1I69A 3EHSA 3IX1A 4JDFA 3TTNA 4WEPA 1JW5A 3G3HA 4BDMA 2QJEA 2X26A 2I6EA 2UXAA 5ITPA 3TTKA 4RA1A 3UGWA 4JB7A 3PMWA 4TLLB 4OERA 4K3FA 3UN6A 4F1UA 3CRBA 4EQ7A 4RY1A 5DVJA 2AL4A 2R71A 4MBPA 5HPQA 4F1YA 4ISUA 4FIMA 2CMOA 3L6HA 3O97A 5EHMA 4HTGA 3R26A 3O6HA 1JEVA 3O66A 1AOVA 2DXRA 4XXUA 4NE4A 4LZ8A 2HQ0A 2Y84A 3PPOA 3F11A 4JWYA 4EDPA 2XXRA 1IUDA 2PYYA 4KQPA 1B9JA 1MG1A 1MY2A 3SDFA 4R2FA 4F3BA 4N13A 4N6PA 1B7UA 3M8UA 3UA8A 3OXNA 3V89B 4QSDA 5KZTA 3K2DA 1BP5A 3N6UA 1US4A 4LQ2A 4YKJA 4JWXA 4QRZA 4G8MA 1XHYA 1Y20A 3MC2A 3CR9A 5H8QA 4P11A 1N3WA 1Y3NA 4TOZA 2DVCA 4LA9A 4G8HA 4EQ9A 3TTLA 1B32A 3TUSA 5JTYB 1SQYA 1JNFA 1DTZA 2GHAA 4NF4B 1SW4A 3LSFB 1GGGA 5KCJA 3CVGA 3IR1A 1LCTA 1MXWA 5K2YA 3OSQA 2ABHA 2CZLA 3JV9A 1H43A 4OEUA 3Q26A 3SEUA 4H5FA 1ZKBA 4OESA 4IGTA 1MPBA 2O7UA 4R6KA 1ATGA 3MUQA 3U1OA 1NH7A 2HZLA 3C33A 3PGFA 3EPEA 4U1OA 3KGCA 3N6TA 3IO4A 2O7IA 2V25A 1DPEA 2D21A 4YU0A 4ZZAA 1PDAA 3IB0A 3E4RA 2O51A 3KJ7A 3K02A 2OBGA 4IY6A 4IO5A 1A8FA 1IQ7A 2ONKE 5DT6A 1FQEA 3A3UA 5DYHA 2HFBA 3G3GA 3H6WA 2I0CA 3PMXA 4XTCQ 2E0SA 3BFUA 3KN8A 1D9YA 2QL3A 3K00A 4ESWA 4DIGA 1MQGA 4R73A 4F29A 2DWJA 3MW0A 2QS2A 1ZBMA 4F22A 3B7DA 1MM6A 4MLVA 3PUZE 4OFLA 3TCFA 3R6UA 2W7YA 2UVGA 3H06B 2RF1A 3OMBA 2FA7A 3G7WA 1DSNA 2B3BA 2DE3A 5FHNA 4PQJA 4TLMB 2H98A 5F1QA 3ILTB 4G2ZA 1QKAA 4JWOA 2D3IA 3BKIB 1SW2A 2V3UA 3S2VA 3S9EA 4HCYA 1ZLQA 2ONSA 3KG2A 4M1VA 4LP2B 1B5HA 3IOWA 3PUXE 2UVJA 1N3XA 3FXRA 4C1UA 4RNSA 1Y3QA 3W9WA 1T0KA 3MPLA 2E1SA 2A5SA 3K1NA 2QPQA 3HN0A 2XXIA 3LSXA 5AA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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