2ESNA

The crystal structure of probable transcriptional regulator pa0477 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
299
Chain Sequence
PLLRRLDLNLLLVFDALYRHRNVGTAASELAISASAFSHALGRLRQGLDDELFLRQGNRMQPTQRAEHLAAAVAAALRALGEGLEEWRPFVPGQSQRTFVFAATDYTAFALLPPLMNRLQHSAPGVRLRLVNAERKLSVEALASGRIDFALGYDEEHERLPEGIQAHDWFADRYVVVARRDHPRLAGAPTLEGYLAERHAVVTPWNEDSGVIDRLLARSGLRREVAVQLPTVLAALFLAGSTDFLLTAPRHAARALAEAAGLALYPAPFDIPPYVLRLYSHVQGRDAHAWMIGQLKGLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of putative transcriptional regulator Pa0477 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords probable transcriptional regulator
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 89
structure length 299
sequence length 301
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2esnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA03
5LGNA 3E6MA 2F97A 3U9GA 4P55A 2DE2A 3KOTA 1MGTA 4M1VA 4FHTA 3IL1B 1R9LA 3OEMA 4NB5A 4UV8A 4E70A 3A09A 4NQWA 2XXVA 3VB2A 1W7PA 4PFYA 3EDPA 1U78A 4BQAA 1GHCA 1MH3A 3B73A 3G3HA 2HYGD 1ZG3A 5BMZA 3T96B 4YB5A 2DVZA 1FTMA 4KPTA 2V9VA 4EM0B 5K5OA 2ZXTA 4ZZAA 3TGNA 3F8BA 5J8CA 4ZEKA 5HLHA 3FUZA 2PYYA 3ZMUA 4PE5B 4EV0A 2COMA 3F22A 1GXQA 3IB0A 3ILTB 1YAEA 1YW9A 3FMRA 4KUMA 4G7OF 2A68F 1KYZA 1V4RA 5LGTA 1LAHE 3QK6A 4IRHA 5L8DA 3TKDA 3RPQA 2H09A 3LC8A 3WGIA 4G8NA 3N4MA 4N9HA 2RV8A 1FTJA 4G9YA 5ILVA 4HF0A 2F6PA 1PC3A 4U23A 5F7VA 3SEVA 4CHUA 3E97A 3Q28A 2BGCA 3TKYA 1I6QA 1LFHA 3DM0A 1EZPA 4GL0A 4QFLA 3ZSFA 3IORA 3MZHA 6PAXA 4ESBA 2O61A 1F9BA 4ONYA 2PEXA 1DDNA 3IRQA 1QUJA 4HZFA 1FPQA 4A12A 2E0SA 1G3YA 3FWEA 3DEUA 4XLPF 2O7IA 4L9TA 3H4ZA 3WTZA 1Z9CA 4ZEIA 1B46A 2R3SA 2HQ0A 2F2EA 1HKTA 5F1RA 4KR5A 5I57B 3WE3A 1B7UA 1OLAA 4I0AA 1SMTA 5EEHA 4I8CA 2YLNA 5I2NB 4PGGA 1MY0A 3WE2A 4X1BA 2KJBA 4A5MA 4ASNA 3CVGA 4L9JA 1H45A 2CZLA 1R7JA 2E1NA 3EHUA 2VE8A 4KIGA 4IJAA 1Y9UA 1LDDA 2DS9A 3B7DA 4MTDA 1MQJA 1QVSA 3LFKA 2KKOA 3WU0A 3L9FA 3DXJF 2P2AA 3V8KA 2O84X 3H3ZA 1MY2A 2XD3A 1SDXA 1QULA 1AL3A 2KJCA 2V3QA 4YU0A 4G8XA 5TPAB 5L9SA 1GR2A 1KU7A 2CMOA 2GH9A 5KDTA 3KG2A 2BBYA 1SW1A 1O7LA 4AWXB 3BPXA 1E2XA 4P5OA 2L4MA 3P9KA 1ZIUA 3RIRA 3WAFA 2YU3A 2D3IA 5H8FB 2L54A 1ZLKA 1MDP1 2B65A 3O66A 4LG0A 3K1NA 2HCAA 2PMHA 4JSOA 1IXIA 3K69A 1AIVA 4E0WA 5AA4A 5AONA 2MC3A 4EQBA 2VD2A 3OOPA 1AMFA 2ZFWA 1Y4TA 1Z6TA 5FHMA 1R5GA 1YTVA 1SBPA 5K5RA 3TCHA 4Q47A 4HCYA 3QU3A 3GFIA 4GXSB 1SVXB 1MXYA 1PB8A 5CMCA 1LDKB 3GWZA 1BTJA 4AIKA 2V6CA 3M3FA 5D6EA 3KFMA 2DPUA 4N6PA 4U2RA 4F22A 1N7XA 2Q8JA 4KFCA 4P0GA 2Q2CA 2W84A 3OO6A 3MP6A 2X0LA 5ILSA 4F3BA 5I58B 3TQNA 3GEZA 3O6GA 1O7TA 3MPLA 3HTUA 5L9MA 1MXXA 2WV0A 1SW5A 4YKKA 2C6YA 4S05A 3V4GA 4H8JA 3ML6A 4ENKA 4RXLA 1MQIA 4HTGA 2PI0A 2XD2A 1B58A 2R7FA 1H43A 4GFRA 1WKMA 2THIA 4YKJA 1SAXA 1PB9A 4RK2A 3RTFB 3P9IA 2AIXA 3QPTA 1F9NA 2JT1A 2HR3A 4BHPA 2IA1A 1M5FA 3HRMA 3TO9A 4IXAA 4OYVA 3FD3A 1T98A 1SD5A 4UUVA 1JVXA 3S9MC 1QJMA 1UTHB 5LGUA 2F5CA 4NWDA 1KU2A 2DWJA 1IW7F 1FBSA 5H8NA 2ZYOA 1I6XA 1IXRC 5E20A 4KYSA 2NOOA 2XXTA 3GBAA 4PFWA 1IRGA 1QZYA 5FO5A 4P0IA 3HRTA 1XC1A 1B3GA 3TPAA 4JXIA 1EZ9A 1YG2A 1B51A 2FRHA 1HW2A 3KGCA 4QSEA 1S7AA 1XMKA 2EFPA 1B9NA 3TFLA 1EV7A 2K86A 3RKWA 4R9GA 4HLYA 3HCQA 2XAFA 4HS7A 1M5DA 4I7HA 3W9WA 2P7VB 2ESHA 3TO6A 4NHJA 1H9TA 3D4GA 1RUNA 2IPQX 4THIA 4AB6A 1B4AA 1B59A 2CWEA 4EJOA 3EN3A 1KWHA 4I01A 5AIQA 1JXSA 5HLGA 1BI0A 3FX3A 3F8CA 1QBJA 5AA1A 4XKQA 2D1VA 4U0YA 3I71A 3L09A 5CBRA 4EXLA 4BNCA 1B1HA 2LDUA 3CUQC 1BBYA 3RTWB 2F35A 5H6QA 3CSBA 1Z91A 4RAYA 5ICQA 4GYGA 5K2YA 3FVNA 3H06B 4LLNA 3E4RA 1ZRDA 3RDIA 3K00A 2IP2A 3NEUA 2ZNUA 5L3GA 1BLFA 1D9VA 5LHGA 2XRNA 4NF5B 2XXHA 4JWXA 3H6UA 2Z8EA 4MFIA 4U21A 2X7PA 5CLSA 1XSDA 4N9IA 1B9MA 3V83A 4MBPA 4IHTA 2LF8A 4NWCA 5CMKA 4LJZF 4RB3C 3PQJA 5LOMA 3MZYA 4N07A 1P1OA 1N3WA 1BC8C 3FV1A 3IRRA 1B40A 1ZAOA 3HRSA 4Q5SF 3V7CA 3DFGA 1TT1A 3J81Z 3D4CA 2ZCWA 4CZZA 4RK9A 3TCGA 1O63A 3PD8A 3E5XA 4ZECA 5H8HB 2ONSA 1QQIA 1FP2A 5CMBA 3FJGA 4YFKF 4BDNA 3CR9A 3G7WA 1J59A 1VSOA 3QAXA 1P99A 4FEBA 2X26A 4KI0E 2I6EA 4F1VA 4U4SA 4KIFA 5EEGA 1BP5A 5DEXB 3KFWX 3U72A 4MNUA 3TDZC 1CF7B 3BZ6A 4ESJA 2Q9TA 3R26A 4MTEA 2OZZA 5FLXK 2F5XA 4U88A 2GZWA 1LNWA 3T8TA 4BXUA 4M72A 4IY5A 2M1BA 4RGSA 4H1XA 2QBYB 3B6TA 3LSFB 1B5JA 4UHTA 4YIIA 3VFJA 1RI7A 2JSCA 2WC2A 3H6WA 2O7UA 3V7SA 1MDMB 3BFTA 4FJPA 1KA8A 3GX4X 3TTNA 5KK1A 2RKHA 4G8MA 1UQWA 2PLYA 3MFKA 1B32A 3V5AA 2VT3A 1D4NA 3I54A 3COAC 3S9LC 2QLZA 2ESNA 3HSRA 1BIYA 4NF4B 1Y0UA 4PFTA 5D6FA 2FU4A 1FQFA 5TP9B 4NF6A 4P9UA 3U8QA 4BDRA 3G3KA 3BPVA 5FGMA 3IOWA 1J9IA 3DF8A 3MVYA 3Q27A 2QRYA 4GXOA 1FX7A 1LB2A 3QU6A 1KU3A 3GBBA 1I6AA 5HS9A 3F72A 3QP6A 1R6ZA 2F7BA 1EH7A 3IB2A 1HSTA 2JPBA 1NH8A 1QNTA 3ZKKA 1MY4A 5D5XB 1KU9A 2UXAA 5CVIA 3KN8A 3F21A 1U5TA 3FZVA 3LWFA 5J6XA 3BROA 4NEDA 1POTA 3MBPA 1E17A 3KP2A 1ONVA 3C31A 5AA2B 5DV5A 2HTSA 1UTBB 1R23A 2NXOA 4LB6B 4LLGF 3IKTA 5E18F 1XDSA 3B6WA 4EM1A 1B0LA 4L5IA 2UZKA 1AOYA 5IKBA 2XXWA 4L0ZB 4X9TA 1IXHA 5A2QK 3WTSC 1OKRA 1O7FA 2CG4A 2AYSA 1OMPA 2HOEA 3P7IA 1FCKA 4AB5A 3I5OA 1P4AA 1YS6A 2GHBA 4FE8A 3LQQA 3KBRA 3E6DA 3FVGA 1XGMA 5JTYA 1UHWA 3JAMK 1W5TA 4RB0A 1ZLJA 3C34A 1USYE 3DKWA 2A69F 5B70A 4PETA 4Q0CA 3MVXA 5IT3A 3QUJA 4KYEA 2ZMEA 1GGGA 1T0FA 5I56B 2Y48A 4QSCA 2OK2A 2A6HF 1HXDA 4IO3A 2PBIA 4A0XA 2HAVA 1JETA 4X1DA 3CTAA 3TTKA 2VBXA 1O3SA 1MDQA 2FQ3A 4P11A 5ERIA 3SETA 1XVYA 3KZGA 3F8NA 4Q8RA 4A2UA 3VOEA 4OFOA 3FHZA 2A5SA 3SERA 1ULYA 3I53A 3T93B 1A54A 4F31B 3U1OA 1O57A 3MAJA 2D1HA 2XXQA 1S9TA 3KN3A 2F34A 4I2OA 3TOAA 3M9AA 3T9VA 1OMIA 3T1BA 3C36A 1B0HA 3WGGA 1L3LA 2HXWA 4MF3A 4WXCA 2DXYA 1A8EA 1POY1 5AA3A 4IRGA 4RB1A 2F7CA 1I27A 2XX9A 3E9XA 3IWFA 5FHNA 4HV5A 1BI2A 5ITOA 4HBLA 2VC0A 1Y4CA 2PN6A 1BOAA 4G8HA 4H65A 3I4PA 4LQ2A 3U92A 1MKMA 1SD6A 4BHCA 1FBQA 1D8JA 1O64A 4R72A 1FQDA 2DXRA 1KGSA 5TRDA 3OOAA 3E13X 1MS7A 1ODDA 1MY3A 5JVTA 4IO7A 2HKXA 4YB7A 5K2XA 4F1YA 3OD7A 3QP5A 2YJPA 2XHDA 2W85A 4NF8B 4WF2A 3N97A 2Z8FA 3TEPA 2RINA 5DCFA 1ZMGA 5ED4A 4GQOA 5A5XA 2VE9A 4CGZA 1YW8A 3JW4A 1B6HA 3KP6A 1D3KA 4GOTA 3I58A 3MP8A 1LFGA 4XKPA 3RJPA 2ZXJA 4QFPA 5D5VB 2K4BA 4RJZA 4H67A 1XSXA 3ZKLA 1FWZA 4LZ7A 1T2KA 4Y17A 4HF2A 3G73A 4R73A 3K1PA 3RYRA 4GGGA 3UP9A 4LZ5A 2VBWA 1LGBC 4GYIA 3WAEA 2OD5A 3IKVA 3FJ7A 3C18A 3PMWA 3HRUA 4I1DA 4R9FA 4FEDA 3UK4A 4ELRA 5ELVA 1A7LA 2ZKZA 1I6BA 3Q9VA 3TO7A 1B05A 1URSA 4CO8A 3K0VA 3TDJA 1Z7UA 2QQBA 4O3CA 1GV8A 2PQ8A 2HTJA 4P9FA 1AOVA 1TTYA 2XUBA 4JWOA 1ZGAA 4XSXF 4XSZF 3C3WA 1SQYA 3REOA 5HDNA 3O6IA 1Q35A 2DSFA 2MLGA 1ELJA 4KN4X 4KA4A 3H92A 1HBXG 2DPDA 3KJTA 1QGPA 2O3FA 2HYFA 4HX7A 2AXLA 2G7HA 3LSTA 4EQQA 1FTKA 2AL5A 2FYIA 2PBWA 3O2AA 3CUQA 1NH7A 5LEJA 4LATA 3J7AO 2IRFG 3C4MA 3ZMDA 2HS5A 5KCJA 3N6TA 4BYYA 3PFIA 1US5A 5I2KA 4LD5A 1IIWA 3RQTA 3HHGA 3ZMZA 3RPWA 3QRFF 5LHIA 4F18A 3ZPLA 2LKPA 2LAOA 5EHSA 3FXQA 2QS4A 2XVCA 5JR3A 1M5EA 1B7ZA 1IZ1A 3WODF 2EWNA 2JZYA 2NNNA 2OQGA 4WKMA 3KP4A 1ATGA 3ABUA 5L3BA 4ND9A 3ILUB 4HOBA 3SZTA 4OOIA 1HSJA 3PUXE 3JZJA 1EH3A 4OVJA 1S8NA 3S4UA 3O6HA 3ZS6A 2R6GE 3VE1B 2E1CA 1ZG1A 3K9TA 5TU0A 1SI0A 3JSOA 3HTSB 4YKPA 3RNNA 2OWTA 3JYRA 2RVCA 1JGSA 3K6VA 1U5TC 2Z23A 4C0RA 4M9XA 2Z33A 1YS7A 1TXFA 3M7GA 4YAHX 4M6YA 4G68A 2KIMA 2XAHA 1QKAA 3CDHA 5E1ZB 1N0TA 4IO5A 1SFEA 4OU0A 1G4DA 1DSNA 4O3BA 1USSA 1RZ4A 3TTRA 3NQOA 5HM4B 3E5UA 5DDGA 3T9UA 2FNPA 2A61A 2FNAA 2XROA 2NVUB 2DBBA 2MH9A 2HZKA 4RPOA 2Q2EA 5DCMA 4MEYF 5I59A 1TBXA 2D5WA 1Y3PA 2MH2A 2Q8KA 4LP2B 2FA5A 2XXPA 2ETHA 5DD8A 3DV8A 2H6CA 3ZN1A 3OMBA 3GF2A 1TFDA 3WG9A 4I98B 1K78B 1Q1KA 4C1UA 3PUYE 3MCZA 4Q30B 3KCCA 1LB8A 3U2RA 2XXXA 4YG2F 3TTLA 2QUFA 1H76A 3GUDA 3R60A 1XMAA 5D5UB 1LBCA 3RI4A 2KRFA 3KLOA 3IOVA 2IA0A 1OYIA 1FQAA 3OSRA 4PGHA 3IL2A 1H3DA 1MJAA 4G6QA 4XTCQ 2FMYA 3B02A 4LQ5A 3ECOA 1Z6RA 1FOKA 4WXHA 3TMGA 1JHFA 3RY3A 1B7HA 1T38A 1ZYRF 4B09A 1B4HA 3PMVA 2A6EF 4EUOA 2ZYMA 3QUFA 1HKQA 4EJTA 2QMXA 3MZ9A 1FP1D 1JE8A 1R1UA 3VLUA 3K2DA 1LBBA 3G3JA 2Z99A 2M5WA 2PFBA 4QFOA 3M8EA 3G3FA 5BUUA 2FSWA 2K7LA 3GLXA 3FM3A 2LSOA 1WSUA 2M8CA 2KIFA 5FFZA 2ELHA 1ZARA 3V8LA 2MD5A 4YB6A 2XKPA 2H4IA 3TAJA 3I6VA 5BPDA 1LJ9A 5D4SA 2I48A 4OERA 1SW2A 2QQ9A 4Y15A 2NS0A 2EFNA 4JBZA 4Q48A 4LUBA 1UB9A 5DEQA 4LK1F 1G3WA 4HW8A 3E5QA 3R4KA 4LFUA 3K1MA 4RB2C 2OCUA 3MPKA 1B3HA 1SFXA 5CVVA 3TDUC 1IXSB 1DP7P 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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