2ESNA

The crystal structure of probable transcriptional regulator pa0477 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
299
Chain Sequence
PLLRRLDLNLLLVFDALYRHRNVGTAASELAISASAFSHALGRLRQGLDDELFLRQGNRMQPTQRAEHLAAAVAAALRALGEGLEEWRPFVPGQSQRTFVFAATDYTAFALLPPLMNRLQHSAPGVRLRLVNAERKLSVEALASGRIDFALGYDEEHERLPEGIQAHDWFADRYVVVARRDHPRLAGAPTLEGYLAERHAVVTPWNEDSGVIDRLLARSGLRREVAVQLPTVLAALFLAGSTDFLLTAPRHAARALAEAAGLALYPAPFDIPPYVLRLYSHVQGRDAHAWMIGQLKGLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title The crystal structure of putative transcriptional regulator Pa0477 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords probable transcriptional regulator
total genus 89
structure length 299
sequence length 301
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2esnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA03
3LSLA 2DPUA 1U5TC 4THIA 3DM0A 5J8FA 3CRBA 1DPEA 2O51A 3WTYC 3F8MA 2FNAA 3KZGA 3L6GA 4G68B 2LF7A 4ON0A 1ZKBA 5ELVA 2VC0A 4M6XA 5DCFA 1E2XA 3FJMA 2XAJA 1LB8A 3IO4A 4GOTA 2VOZA 1QQIA 4E0XA 5LHGA 3R61A 4B8XA 1N7WA 3SEYA 1ANFA 3BDDA 1MXXA 1ZJLA 4ENKA 1HSLA 2A5SA 5ITOA 3JW4A 4IGRA 4ZYHA 2QVOA 1SD6A 1XMKA 2FBHA 5L3GA 3THIA 4GLIA 3TFLA 4E70A 3F22A 2QYOA 1B3HA 4YAHX 1FTOA 3RY3A 1IAWA 4HF2A 2BYVE 1K7AA 1ZTYA 3KOSA 2ZNSA 5E8IA 3MZBA 3I64A 3IKTA 1FP1D 5M2VA 3W15C 1R5HA 1UHWA 1XT8A 1II5A 2NNNA 3F8CA 4BLAA 3H3UA 4GIZA 5CYVA 1W5TA 5ICCA 3E6MA 4KA4A 5BMZA 3GLBA 3VV5A 2FA5A 4KHZE 5DV5A 3ZMUA 2PYYA 1LFHA 4EGYA 1QKBA 5K2YA 2DWHA 5AE4A 5DTBA 2IW5A 4S04A 1FBSA 4M71A 2O69A 2F36A 2ZNTA 1FPQA 3ZMSA 4KNYA 3PUWE 2R7FA 1I6BA 2DWIA 4RAZA 1ZGJA 3P7IA 2XKOA 1JGSA 1SDXA 1M5CA 1O7LA 2VE8A 5A2QK 4EV0A 3K6XA 2XVCA 4K3FA 2DU9A 1PB8A 1FQEA 2RN7A 4YB7A 3PPPA 2XX7A 3CDHA 3LR1A 4L5IA 2F78A 3KFMA 5JEIA 3O29A 3M8FA 4UNOA 4N9HA 1B3GA 4M73A 3JTGA 4MLQA 3RNNA 4ESXA 3N97A 3GZ5A 3LQQA 1B51A 4GD5A 3A3CA 3R0AA 3SKPA 1DSNA 3TQLA 4L17A 4P0IA 3GLXA 4ZE9A 3ZN0A 1K79A 2ESHA 1EU8A 2K86A 5I59B 2OJTA 3UN6A 3ECHA 5H8SA 3SZPA 2RCAA 5CVVA 1Q35A 3V4GA 4A0YA 1ZGAA 4C1UA 1EH7A 3ODBA 1NNPA 3L09A 3K2DA 4RAYA 3FXUA 3GXOA 3HPIA 2PG4A 5J1DA 2FSWA 2Y84A 2XGXA 2ALUA 2WTEA 2IPQX 2FBIA 3Q27A 4ETSA 4A12A 1LSTA 3WTWC 3SDFA 5H6QA 4D0PA 5CVRA 3JV9A 4GRKA 5AA1A 2M30A 2O1LA 1W7PB 2RDPA 3C32A 1ZG3A 3RTFB 1QUJA 1GVCA 3HRSA 3K02A 2UXNA 1QBJA 4F39A 3GEZA 2M45A 1RNLA 1R5GA 2W57A 1A04A 1LCTA 1F9BA 5LHHA 4R8HA 5DEQA 1YTYA 4IB2A 4FX0A 4MBPA 2DTRA 2WV0A 2I0BA 3JZJA 3FVOA 2DXYA 3T5XA 3W6KB 1NKXA 3O9PA 2KJCA 4FEDA 3ZQ7A 1G3YA 2I3VA 2O7UA 2ISYA 4LK1F 1ON1A 4ZECA 4R2FA 4LMYA 1LJ9A 1XC1A 5AA2A 4EQ7A 4HF1A 3FJGA 5H8NA 4I02A 1B0LA 4NWCA 5FB2A 2Y7PA 2D2WA 3HRMA 4NTLA 3UORA 4FE8A 3TEPA 1P1UA 4KFCA 3E13X 3H06B 5H8QA 4PQJA 2IA1A 3BWGA 4BAYA 3IRRA 1G3TA 1O3SA 3O2AA 3IHUA 4KUMA 2QBYB 1TWYA 3FMSA 2HDCA 1UFMA 2AIXA 4L9TA 2I4BA 3IORA 5CBRA 2FNCA 1R7JA 4GFRA 3VEPA 5TRDA 1LEBA 1LBCA 2VD2A 4KR5A 2ETHA 2KRFA 1Y9UA 1TBXA 1OKRA 1JHFA 2UYEA 5ISUA 5CI5A 2GRVA 1RI7A 4ASNA 1SAXA 5ICEA 1L3LA 1MDQA 3G3GA 2F35A 3HUGA 2Z3YA 3LAJA 4KYSA 2H4IA 3L7WA 4HW8A 2UXXA 1DPUA 3QAHA 1URGA 3VE1B 2VBZA 1P4XA 1USSA 2PI0A 3HOTA 1OIBA 2RQPA 1SFXA 3B02A 2IT0A 1D5VA 1QZZA 2I0CA 1YAEA 1T0KA 1S7YA 2IEEA 2QMXA 4ESBA 5A2QZ 3WGHA 1LQ1A 1B58A 1B6AA 3N4MA 4HAMA 4EJUA 1ZBMA 2Z8DA 2OAZA 4XRFA 3C35A 4YMAA 5KCJA 2O6AA 3I59A 3KLOA 1FX7A 4MF3A 1F9NA 4QFLA 2QM3A 2V6CA 4IO6A 2IVMA 3ULQB 3P9CA 2JPBA 1YTVA 5EEHA 1B3LA 4BNCA 2ZXJA 1SYIA 2O84X 1LEAA 3WGGA 4RPNA 2OBGA 1JHHA 4NMYA 2XXQA 1JW1A 2W85A 3TAJA 4XLPF 4BHPA 4L0ZB 4LUBA 3TKDA 5I2NB 3TZAA 3OEKA 1BI3A 4YMBA 1B1HA 3H3GA 5I58A 1OVTA 4PCQA 5HPQA 3T8RA 4UHTA 2DPDA 3JSPA 5E1ZB 2HQ0A 5FTIA 1B9NA 1QO0D 1UQWA 4H0WA 2HS5A 1Z7UA 5DCMA 1EH3A 3WTUC 4G8XA 4KDPA 4IO5A 3V8XB 2DAOA 1F1ZA 1URSA 5FFZA 2GFEA 3IJXB 3HN0A 2RINA 4ND9A 1R23A 4X1DA 5HS8A 3VXBA 2X0LA 3DQVC 5LOMA 3DPLC 2E7XA 3Q29A 1SD3A 2BEOA 4POXA 3PUVE 4R72A 4XKNA 2RCBA 3MEXA 2H5YA 4MNUA 4OHNA 3VVFA 4JWOA 4ZYDA 4OIPF 2Z5UA 1B6HA 2Z22A 2DLLA 4G8NA 3FVNA 3JYRA 4ZEBA 2DE4A 3ZMVA 2R9JA 3H4ZA 2I3WA 4LG0B 4I2OA 3J80K 4DE8A 4I0AA 1SMTA 2A61A 4RPOA 4U21A 2PBIA 4PE5B 5CMCA 1ZRFA 1MGTA 2K4JA 1LAGE 3CUQC 2GZWA 5D5VB 1MXYA 3I53A 1S50A 4G68C 4N9IA 1MM6A 5I2KA 4GVOA 2NWJA 2AS5F 2V3UA 4F3BA 5JI6A 4R79A 1HQCA 1ZH5A 5F7VA 2V9VA 3R7XA 2XIGA 1IXIA 2D5WA 4EVIA 1AWCA 4EGZA 5L3BA 4HDVA 2FNPA 2H9BA 3CIJA 3IOWA 1MY3A 2VBYA 1R1UA 1FBUA 3UA8A 3M8EA 5E20A 1DTGA 2FMYA 2DE3A 4WEDA 3L00A 2DVZA 4N07A 4DQ2A 4M74A 2D3IA 1ZRDA 4R9FA 2F34A 4PFTA 1A54A 4DCYA 1CE2A 1LDKB 2MBFA 4G77A 4U0WA 2EFQA 1FSEA 3LFKA 3T9XB 3I5OA 4ELQA 4DZ1A 5KDTA 5JR3A 3TDZC 4N13A 5DVJA 3TUSA 2F5DA 2Q2CA 5JHUA 1SW4A 2MLKA 3MVWA 2QPQA 4G7ZF 4EQBA 4I98B 2Z9OA 4Y13A 4GQOA 1R1TA 3HOSA 2F5XA 4U7DA 2XROA 3G3FA 4GCVA 5FLXK 1ZHFA 4R1HA 3SQNA 1C0WA 1FTKA 1XVXA 1DTZA 3VB2A 3K9TA 5LGTA 1T6SA 4XBFA 3CSBA 4DNCA 2VGQA 2LDUA 1KU2A 2B3BA 4ZDMA 1QULA 4AIHA 3Q28A 4S05A 3MJNA 3BY6A 2H09A 2J5PA 3FMRA 2OU2A 3D4CA 3QP6A 3MPLA 4ZH4F 3KP3A 2DWJA 5TP9A 2R3SA 3L6HA 5FHNA 3ZKLA 1NNFA 1IW7F 4U4SA 1XGOA 3Q25A 4EDPA 2QS2A 1GHCA 2F7BA 1RYXA 4R73A 1ZIUA 3M7GA 3GYHX 3HO7A 3R26A 4YFNF 4Z7EA 1HSJA 4G94A 2P5LC 3Q9VA 3GWZA 3V7CA 1MY1A 2ZXTA 4F1YA 4U22A 4DDDA 4UV9A 3VODA 2E1CA 3VFZA 3M3KA 1HW2A 1NNTA 2QSXA 1MJBA 3BKIB 3FGSA 1VTNC 5CMBA 3BPXA 3EHUA 1LLSA 3E5XA 3WU0A 3MCZA 2HEOA 3QUFA 1GV8A 2FYIA 4YKIA 4XKRA 4FECA 2ZMEA 4EMSA 3J80Z 1UTHA 4MFIA 4DLDA 1KWHA 4OQOA 4XKPA 4UXNA 2GXGA 4FIMA 4G6DA 3VLWA 4OOIA 2ZCWA 3V7SA 5H8HA 4JSOA 1Z7NE 2WKYA 5L3FA 1K78A 2QJEA 4DXCA 1CF7A 2EFNA 4ENMA 2QS4A 1R1NA 3LUYA 3IAZA 4H5GA 4DXBA 3CJNA 1PEBA 5AA4A 5BWJA 2V1XA 5HS9A 1IRGA 1LVAA 2ACJA 5FGMA 2HAVA 4HQEA 4EM2A 1VR5A 4LJZF 4GWOA 2PMHA 3OO8A 3SESA 3U1OA 3C36A 1VE4A 3QOPA 2PX1A 2ONRA 4O3AA 3LWFA 4KIBA 2H25A 4RB0A 1HSEA 2Y0MA 2ZJ2A 5CJ9A 4HLYA 4IGTA 5JTYA 4M4GA 4EUOA 2FU4A 1U2WA 3D0SA 2IA0A 2JRTA 3HSEA 5ITPA 3EYYA 4BHCA 1AH5A 2KKOA 3M9AA 1Y3QA 5K5QA 4CDGA 2ZKZA 1V3FA 1XHYA 3RLFE 1XGMA 2DP8A 3K69A 5JFRA 3ECRA 1H76A 4OFLA 1Y4TA 4HOBA 3S9NC 4O3BA 4H8IA 4H6DA 1NH8A 3PQJA 4A0XA 1Y20A 2LF8A 1KA8A 2OWSA 2GXBA 4R2BA 1ZLJA 2A5TA 3TMGA 3LC8A 5AA2B 5D4SA 2B65A 4TLMB 5H8FA 5H8NB 1OPCA 2HTJA 2Y7IA 1FP2A 4L5JA 1B9MA 4WX9A 2A3SA 2ZYNA 5H8QB 4CICA 4CHUA 1A99A 4P0GA 2MH2A 2G9WA 1KU7A 3MFKA 1USTA 2BJJX 1NL5A 3PPRA 1MPCA 4BDMA 3GFLA 4ZYEA 2DK5A 4EQQA 3KBRA 5CC2A 1EH8A 1YIOA 3M8UA 3RQTA 2X4HA 2PQ8A 3HRUA 1IF1A 1B0HA 4RY1A 3U2RA 4F2QA 1R6ZA 5J6XA 4YKPA 1FBQA 3QIMA 2GHAA 3AXFA 4PFWA 1FC3A 4R6HA 2L4AA 1HBXG 1FTMA 3TODA 2STTA 3LA3A 3OELA 1W4MA 4EQ9A 1JVYA 1YLFA 1NMUA 4GO1A 4XLNF 4NF6A 3F3XA 3N94A 3DLNA 2P6TA 3IX1A 3FX3A 3R6UA 2AXLA 4OMBA 2UVIA 4L9VA 1T38A 4H8JA 5TU0A 3NEUA 3FD3A 5E18F 2OBPA 3I71A 3K6UA 2CYYA 3CO6C 4QSDA 2BGCA 2FMLA 4FHTA 2E1SA 2W7YA 4LGWA 4FJPA 3LSWA 2MD5A 1QUKA 3IO6A 1BC8C 1ZU0A 3F23A 3IWFA 3QAXA 3QRFF 5KCJB 3IKVA 3I59B 4C1TA 3M1EA 2GA2A 4KT5C 3C33A 1MDMA 2XXTA 4G8HA 3HSFA 4ZEDA 5KZTA 3ZS6A 1SQYA 2OZUA 2V1UA 3MW0A 1MPBA 2VXZA 4L9JA 3PUXE 1RIOH 2KLFA 3SEVA 3K6WA 3V8LA 3OSQA 1IN4A 3RT8A 2CZLA 1JXSA 2A07F 3WGIA 3J7AO 2XAFA 5D8KB 4KICA 1DP7P 2PN6A 4RJZA 1OMIA 2AL4A 5I58B 4PP0A 2EA2A 3OMBA 3I3VA 3SHFA 3TDUC 3VVDA 2PBWA 1P1WA 4HLXA 3E3KA 5DCMB 2X7QA 1B4HA 2NXOA 1OLAA 2MH9A 2HZKA 2O6GE 4MLVA 2KJBA 1MQJA 5BS6A 3HSRA 2OWTA 3DFGA 2A69F 1IUYA 3H6UA 3IR1A 3C31A 1O3QA 3DEUA 3RUMA 3O97A 1UIUA 3KOTA 2Q8JA 5LGNA 2V84A 1K6OA 4JSDA 2NAZA 1QPMA 1USYE 2MC3A 1TXFA 1JQFA 2A6HF 4RB3C 1BIYA 1LB2A 2F5EA 3CTAA 5ICGA 4HW0A 1UHMA 2YJPA 3CVGA 4ESFA 4Q5SF 1S6LA 3DPTA 3UGWA 1IRFA 1L0OC 1ZN2A 1DUXC 1REPC 5CRYA 4F29A 1I69A 5ED4A 2I4CA 4ECFA 4HQMA 1O63A 5K2XA 3ML6A 3ROUA 1T98A 5DVFA 3TTMA 1Y1MA 4LK0F 2W84A 4OU0A 4RA1A 3SERA 2HZTA 2QL3A 5EYFA 3WODF 1PBPA 4KYEA 2G7HA 4M1VA 3QP5A 1KYWA 3D4GA 3MWBA 5I2KB 5L9OA 3I5UA 2RF1A 3SEUA 1FQBA 2PEXA 3RJPA 3HSTA 1AOVA 3RIRA 3RPQA 2ESNA 2J5OA 3WAEA 3ILTB 5HLIA 4KYDA 3RYRA 4BDRA 3VOEA 1O3TA 5HDNA 1UCRA 2ONKE 1IXSB 3K2ZA 4TV7A 4DIGA 1IZ1A 1Q1HA 4HV5A 4OEUA 3S9MC 3E6CC 1JE8A 3FV2A 3KZYA 4U88A 1OYWA 3RKYA 1BIAA 1H43A 4F3GA 1J75A 2DBBA 2UYFA 4ONYA 3ONMA 1M5BA 2F97A 3VXCA 1TQPA 3H6WA 1TFDA 4AVPA 2F2EA 2QQ9A 2XRNA 4EM0B 3ELKA 3IWZA 2QUFA 2HZLA 1SW2A 1PB7A 1UTBA 1TW2A 5TPAA 1HSTA 2HQRA 1B3EA 4OERA 1IUDA 1JETA 4EJOA 5EHMA 1TT1A 2FRHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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