3UGWA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with deoxycytidine at 1.87 a resolution
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Deoxycytidine at 1.87 A Resolution
rcsb
total genus 114
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ugwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ugwA02
1JQFA 5AE4A 2ZNUA 1ZIUA 1H3DA 3OO9A 4QSEA 2RKMA 1YPNA 3GXAA 2OCUA 2ONRA 3K2DA 4G4PA 4OTEA 2Y7IA 1MQHA 3CRBA 2OK2A 3S4UA 1FTOA 2PYYA 3CI8A 1JEUA 1WVJA 1NNKA 5FHOA 4RYAA 2Z23A 5FTIA 1B2HA 2H99A 2RF1A 4GXSB 3FVKA 4FEBA 3C32A 4R75A 1DPPA 1D9YA 4ZEDA 4F29A 3N5LA 5TPAB 4RXLA 4ZS9A 3CFZA 4NF4B 5IAIA 3TAJA 3LSFB 4LP2B 2Q88A 2UVGA 4YKIA 3C4MA 2XD2A 3K01A 2AIXA 1B58A 4GWOA 4EUOA 4RPNA 4H0WA 1DSNA 5AA2D 2VOZA 5BUUA 2Q9TA 3CFLA 3EF7A 1N3XA 3OO7A 4Z7EA 4GD5A 1B3GA 1R6ZA 1UTBA 3UP9A 4G68C 1NNPA 3DELB 1EU8A 2Y7KA 4ISUA 3PUYE 3I3VA 2CZLA 5I58B 2DE4A 4TQUQ 3C31A 3KFMA 4GIZA 4XTCQ 4PFTA 2I3WA 4DXBA 2DYXA 4RY1A 4C0RA 2CMOA 1PDAA 3K6XA 4ND9A 2O6AA 3HHFA 3ODBA 4RPOA 4EF1A 4EQ9A 3HPIA 3DP4A 3VE1B 4LA9A 3TQLA 1SD3A 1M5DA 4EXLA 3IOUA 3OO8A 1XS5A 1MXZA 3QXMA 3TQWA 2Q89A 2I49A 3TFLA 3MVXA 4IY6A 1MRPA 3GBBA 2ONKE 3K1PA 4KYEA 3O6HA 4IO2A 1DMBA 3T9XB 1USYE 5I2NB 4G68A 3VVFA 5L9MA 2OLBA 3O97A 4H67A 4YICA 3MVYA 2P1SA 3IJXB 1P1QA 1LAFE 1PB7A 2IA4A 4XKNA 4NF6B 3B6TA 1MXWA 3LUYA 1NMUA 4U23A 1IQ7A 3FVGA 1M5FA 1QUKA 4QSCA 1M5CA 3LSLA 3OSQA 4U2RA 1B9JA 5B70A 1IXHA 5TP9B 3K00A 4H8IA 4ZEKA 3H6TA 2QS2A 2ONSA 3E3KA 3T9VA 1XT8A 3T9UA 3PUVE 3T96B 1PEBA 1AOVA 3TMGA 3K02A 1S50A 2X7PA 5I84A 4ZZAA 2QPQA 2ABHA 2QS4A 3KN8A 1P1WA 3MZ1A 4IGRA 4OMBA 4KQPA 2GRVA 5DVJA 3RQTA 4U21A 3QIMA 4QHQA 2F36A 5ELVA 4ZECA 4Q0CA 4YAHX 3S9LC 4KD5A 3EN3A 2ANJA 4F3PA 1B4ZA 1UIUA 2H98A 2XXRA 4OESA 4QFPA 4O3CA 4F22A 4OFJA 3MP8A 2QMXA 4NF8A 2I4BA 4KPTA 3S9MC 4OZ9A 5ICTA 1MQDA 3O28A 1AL3A 2Y7WA 3S9EA 1BP5A 3TTMA 3N6TA 5ITPA 2GH9A 5ITOA 2XXWA 2XHDA 3MQ9A 4R2BA 1N76A 1H44A 4ZE8A 4XIGQ 2I0CA 4YKKA 1POY1 3SEWA 4YKPA 4MLQA 4DDDA 4IO7A 3THIA 3T66A 1LGBC 5H8FA 1SW2A 4R6YA 2HEUA 5ICQA 1ANFA 3V83A 3W15C 5I57B 1FQFA 5H8QA 3H03A 4POWA 4ESXA 3DP8A 2AL4A 3PUXE 1US5A 2NOOA 2DXYA 3RT6B 4X1BA 5H8HA 5ISUA 4OHNA 1EZOA 1JETA 3TTKA 2I0BA 1TFAA 4HW8A 3WAFA 1P1OA 2ZYNA 5AA3A 1RKMA 5EHMA 2M8CA 1ZTYA 4F3BA 1B7HA 3MJNA 1MG1A 3TYHA 3SDFA 4QFLA 2OBGA 4YMBA 3B6WA 4OEUA 2Q2AA 4X9TA 3A3UA 1SYHA 4XKQA 4EQBA 1AIVA 2XXUA 3TCFA 2DWIA 4R6KA 3R7XA 1JNFA 2DVZA 1OQGA 4HS7A 1BIYA 2YPNA 3IB1A 4H1XA 4P0IA 5CMBA 5I2KB 4NF5A 4BDMA 1UQWA 3VFJA 1DTGA 1RYXA 1ZKBA 1B32A 4MH5A 3RT8A 3USDA 2RC8A 4IY5A 4I62A 3GLBA 3PMWA 1FCKA 4C1TA 1XOCA 2Q2CA 4PP0A 3SEXA 4U22A 4F2QA 2PT2A 3PV0E 1HSLA 1ZMGA 1Y20A 4F19A 1MY4A 5CMCA 4OXVA 1CB6A 1EZPA 4RK9A 1TXFA 3V5AA 4QF9A 1WODA 3LSXA 3JYRA 3FJ7A 3Q25A 3B7DA 4TLLB 3H6VA 2Z8EA 3E9XA 4PQJA 2O1LA 2YLNA 4OETA 4BDNA 1MXYA 4BDLA 1I69A 3BFUA 3O2AA 1ZBMA 4O3AA 4LQ2A 5AA4A 3N26A 5TPAA 3VV5A 2O84X 3VVDA 5DVFA 4UA8A 5KCJB 1URDA 1D3KA 2F7CA 2QJEA 1A40A 3QUFA 1GR2A 3L6GA 2GFEA 1A8FA 3IOVA 2UVJA 3TCHA 4TLMB 2R71A 5DT6A 3CIJA 4EQ7A 1VSOA 1B46A 4FORA 3PUZE 4BLAA 5AA2B 2H5YA 1B05A 3H3GA 4QFKA 4EF2A 1JW1A 5I58A 3PPNA 2GHBA 4YB7A 1ELJA 2HZLA 3DLNA 1XVXA 2W7YA 4ZEFA 3TCGA 2PX1A 5DEXB 5I59B 1AMFA 1H45A 2HAVA 5K2YA 1UTHA 1MY2A 3ILTB 4JXIA 4F31B 1FTKA 2DE3A 1IUDA 4WEDA 1OVBA 4N13A 2HXWA 2Z8DA 4HCWA 1YTVA 2A5TB 1R1NA 4U4XA 3D4CA 4MF3A 2O7IA 4M1VA 4Q5TA 3O29A 4BDQA 4TOZA 5H8SA 4IO6A 1LAGE 2VGQA 3PMVA 1B3LA 2THIA 4OYVA 5I2NA 2Z8FA 2ESNA 4EXKA 1H43A 2UXAA 4NTLA 3Q29A 2NUVA 4PFYA 2PBWA 5JTYA 3CFXA 4NF6A 2V93A 5KDTB 3IJOB 3W9VA 1Y4CA 3V8XB 3TTNA 5H8NB 1N7WA 1SDXA 2X26A 4YB6A 5TP9A 5CM6A 3I6VA 4EDPA 2V3QA 3FJGA 4GF8A 2ALUA 4BDOA 1M5BA 3FVOA 3UA8A 1B5HA 3CG3A 1XVYA 1L5TA 1JW5A 2PVUA 2ZNSA 1QKAA 4AB6A 3RNNA 3KN3A 2Y7RA 3KN7A 3OO6A 1S7YA 4DIGA 3SERA 5I56B 4QFOA 3O66A 3U92A 2H4IA 3KG2A 3Q27A 3R6UA 4IO5A 3PPQA 1A7LA 1Y4TA 1NNTA 3N94A 4U4SA 4JDFA 1O7TA 2RCBA 3P7IA 3HCQA 2P2AA 3UORA 4M4GA 2VHAA 2QSXA 2VD2A 3KJ7A 3K6WA 3ECRA 4U1OA 1SYIA 4R9GA 1SW1A 1I6QA 3UIFA 3Q28A 3K1MA 4YU0A 1H76A 2UVIA 4FAJA 3MBPA 5LOMA 3SESA 2P0SA 1MXUA 4PE5B 3H4ZA 4IGTA 3HHGA 2UYFA 3OMBA 4G77A 1ZU0A 1IXGA 1RYOA 3SEVA 2RC9A 1FW0A 4P0GA 3BBRA 4OEVA 1QUIA 2XXYA 4F1UA 1IEJA 5CMMA 2D3IA 2I6EA 5I57A 3OSRA 1TWYA 3TPAA 4ONYA 4OFOA 1B51A 3EQ1A 3CSGA 4F3GA 1BLFA 3IAZA 3W9WA 4DZ1A 2H9BA 3U94A 2OWSA 3CG1A 4KCCA 2O51A 4HCYA 4Q30B 2DSFA 3H06B 1SI0A 3V89B 3C35A 2XX8A 4YMAA 1B52A 3PU5A 1VFEA 2F7AA 3KEIA 1P99A 2REGA 1GGGA 4GXAA 1MPBA 2IEEA 3Q26A 4DE8A 5A5XB 1LB9A 4R73A 1A99A 4R74A 3U1OA 1NL5A 3FXQA 3MUQA 3PD8A 1J1NA 4DCXA 3S2VA 1LAHE 3FV1A 2OZZA 2DE2A 5I2KA 3A3CA 2ZXTA 4R2FA 4F3SA 1B0LA 3VXBA 1A55A 2H25A 2AL5A 2F78A 2HFBA 1HSJA 3ZSFA 1XHYA 2DOJA 4XKPA 3D4GA 1Y3NA 4MLVA 1B3HA 1LFHA 3MZ9A 1FTMA 4FECA 3H6UA 3OXNA 2AYSA 1AH5A 4G2ZA 3IO4A 4Z0IA 2F5XA 3FJMA 3RUMA 4IB2A 1MDP1 3G3JA 1FTLA 4POXA 4H65A 4KFQA 4NF8B 3CSBA 2R9JA 3O9PA 4IO3A 2B3BA 3LBSA 3GBAA 2ZYOA 4LVQA 5J1DA 2DQVA 2QMWA 1EZ9A 4JWYA 3TODA 3C36A 4P11A 3KSJA 3HN0A 1MXVA 1N04A 2KLFA 4GRKA 3U93A 4KR5A 1US4A 4ZEIA 2V3TA 3G7WA 1N7XA 4DLDA 2O7UA 4ELPA 4JBZA 3SEUA 2YJPA 3AXFA 5CC2A 3IOTA 4NWCA 4H5FA 3U8QA 3VXCA 5H8HB 1SI1A 3KOSA 4XKRA 1MQGA 2VD3A 5TU0A 3FD3A 5AA2A 3IX1A 3G3KA 2G93A 5M2VA 1NNFA 1MH4A 3BKIB 3HV1A 3RLFE 3E4RA 5JK4A 4OWDA 3PPOA 2F35A 3TDJA 3QUJA 5HM4B 2XXQA 3CR9A 1VFDA 5IKBA 4QRZA 2DVCA 5DEXA 3G3GA 5I59A 4UACA 3EHUA 3EPEA 1LCFA 3G3FA 3EHTA 1B4HA 2ZYKA 1O64A 3MAMA 3RTFB 1OLAA 2RCAA 2LAOA 1Y3PA 2PT1A 1S9TA 3SKPA 1N3WA 4NF4A 4ZDMA 4I8CA 2A5TA 1NFTA 4OERA 3C33A 1NKXA 4OQOA 5BWJA 3IL1B 4JB7A 1ZJLA 4JSOA 2WKYA 2QRYA 2HQ0A 1II5A 2HCAA 5EYFA 2V25A 1FQAA 4G8NA 2F7BA 3IB2A 2REJA 3OEKA 1IZ1A 1R9LA 3K6UA 3DP6A 1EH3A 5KZTA 3SEYA 2I4CA 5HBCA 1MQIA 1I6AA 2B3FA 1D4NA 2D21A 5KDTA 4MBPA 3IR1A 1B3EA 3UN6A 3TEPA 4RK2A 2PMSA 1QKBA 1FTJA 1DTZA 5H8NA 2Z22A 3IOWA 4F18A 2XD3A 1OQHA 1MH3A 1Z7NE 5L8DA 1MDQA 2BJJX 3IO6A 4YKJA 4N6PA 3IORA 3QYTA 5DVIA 4ELQA 2DS9A 3C34A 1KWHA 4C1UA 5L9SA 3TUSA 1F9BA 4LONB 5CBRA 3RGYA 4GL8A 4AQ4A 5AA4B 4RNSA 4L17A 1SBPA 2I58A 3TTRA 5L9OA 4F1YA 5HPQA 5I56A 3BFTA 1LLSA 4GLIA 2R6GE 2XXIA 4KI0E 3ZS6A 3ILUB 4ZEBA 3M3KA 1FQEA 3H7MA 2ZYMA 4X48A 1YCJA 4F39A 3M3LA 1QJMA 1Y9UA 1GVCA 3LR1A 3EHSA 4THIA 4JWOA 1OVTA 1ATGA 1GTKA 1GV8A 4WXJA 3C9HA 2QL3A 1URSA 3FXUA 3QK6A 3KZGA 4N07A 1Y1MA 4X1DA 1P1UA 2NWJA 1LBCA 1FQCA 4LUBA 4HTGA 4NWDA 4E0XA 5FHMA 1LSTA 3T9HB 1MPCA 1N84A 1NH7A 1B5JA 4GL0A 3OENA 4NEDA 1OIBA 4GFRA 4U1ZA 1MY0A 3ZKLA 1UTHB 1A8EA 2NVUB 3KJTA 3A09A 1Q35A 2Q8JA 1ZLQA 2GHAA 3MWBA 4FEDA 2E0SA 5FTHA 2DWJA 5DYHA 1BTJA 4KCDA 4DCYA 1PB8A 5F1QA 3IK6B 1VE4A 3G3IA 1D9VA 1TFDA 3RPWA 1MS7A 4KHZE 3B6QA 1MXXA 4I1DA 1JEVA 2OJTA 3HO7A 1Y1ZA 4Q8RA 1UTBB 4YB5A 2G29A 4E0WA 4R9FA 2ZNTA 1B40A 1MQJA 3MC2A 1LFGA 5B7DA 5JTYB 4ZE9A 1PBQA 1IITA 1B1HA 2DXRA 4RJZA 3JV9A 1N0TA 2OWTA 1OMPA 4QFNA 2O1MA 1PBPA 4G8MA 4GQOA 2FYIA 3M8UA 5A5XA 4YZZA 2FNCA 1Y3QA 4ELRA 3K0VA 1BKAA 3SETA 1MM6A 3MPKA 3FUZA 1Z7ME 4DXCA 3VVEA 1JVYA 1OLCA 2DP8A 3T93B 1USYH 3LC8A 1POTA 3TKDA 3F11A 1CE2A 1JVXA 3RN8A 1TT1A 3LSWA 1B7UA 4JWXA 3OOAA 2XXHA 3OELA 4PETA 3PGFA 1DPEA 4MFIA 2XXPA 2XX7A 2O68A 4LZ5A 1LFIA 4G68B 1I6BA 3DM0A 2A5SA 2F8DA 5CMKA 1IIWA 1QUJA 3PPPA 2Y7PA 3M3FA 1YAEA 1MY3A 3OD7A 1Q1KA 2V84A 4ESWA 1SW5A 1B6HA 3RTWB 3N6UA 3T22A 2Y84A 3UGWA 4AB5A 1HSEA 1LB8A 5CBSA 1M5EA 1B3FA 3FGSA 1QW0A 4R6HA 3ONMA 3PUWE 2D5WA 3L6HA 4H8JA 1B5IA 4LZ7A 3O6GA 4FATA 1MPDA 4FE8A 4LATA 4XXUA 3FV2A 4LQ5A 5DTBA 1WDNA 4H5GA 3TZAA 2F34A 2DWHA 2F6PA 1O63A 3OEMA 3KGCA 4ECFA 1A54A 3WAEA 3FATA 2QS3A 4OENA 2V3UA 4WKMA 4DXUA 1SVXB 4F2OA 5F7VA 1R9QA 4QSDA 3S9NC 4K3FA 2I48A 3PPRA 1FQBA 3HSTA 2DWAA 2UYEA 3O6IA 4LZ8A 3I5OA 3FIRA 1QVSA 4NMYA 1MM7A 2B65A 2O69A 4KYDA 4ZZEA 3MW0A 1B7ZA 3VLVA 4JSDA 3H6WA 3G3HA 2E1SA 4G8HA 4KYSA 1PB9A 4F1VA 1FQDA 3VLUA 2XX9A 3FASA 3CVGA 5CRYA 3MPLA 5KCJA 2RINA 3RY3A 3FZVA 2X7QA 3FVNA 5H8FB 4R72A 3ZKKA 1IXCA 4IO4A 3PD9A 3R26A 1LBBA 5H8QB 4WEPA 5FHNA 5JEIA 4GVOA 4FIMA 3KOTA 4BDRA 1UIVA 3UK4A 4GOTA 4OVJA 4NE4A 3MVWA 1DOTA 2XXXA 2XXTA 5K2XA 2NXOA 1PC3A 3TELA 3K1NA 5CI5A 1IXIA 3MVZA 2FA7A 1JW4A 2I3VA 3K4UA 3GZGA 3PMXA 4OFLA 1VR5A 4RA1A 3E13X 2XXVA 2F6GA 1XC1A 2F97A 1T0KA 1SW4A 3KSXA 3JZJA 2HZKA 2QS1A 1QULA 3MP6A 1SQYA 3QAXA 1NH8A 1MY1A 4I9DA 2ZMBA 3QSLA 3U72A 3KBRA 1LCTA 4PFUA 3MP1A 4H6DA 4NF5B 1B0HA 2RC7A 3IB0A 1B1XA 3TTLA 5EHSA 3VDFA 5AA1A 4O3BA 3FXRA 1URGA 2UVHA 1LAXA 2VP1A 3VLWA 4ELOA 3K6VA 4PFWA 2HAUA 1P1NA 3MZBA 4FJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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