3UGWA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with deoxycytidine at 1.87 a resolution
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Deoxycytidine at 1.87 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 114
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ugwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ugwA02
2ZXTA 1SW1A 3E4RA 3EQ1A 1DTZA 4XXUA 4U4XA 3SEUA 4IO4A 3KJTA 3KN3A 4ZE9A 4I8CA 2OWTA 5FHOA 4R2BA 3A3CA 3K00A 1NFTA 5ITOA 3DP8A 3OSRA 2OWSA 3B6TA 1HSLA 2ZYMA 3TODA 1HSEA 1B1HA 1DSNA 2V25A 4R2FA 2REGA 2XHDA 5L9SA 4KYDA 1IXGA 2GHBA 4BDNA 2F7CA 3KSXA 2DQVA 4XKQA 1TXFA 4HCWA 1IXCA 3VVEA 1CE2A 5ISUA 4JWXA 1EZPA 1B58A 1IIWA 1P1UA 1MDQA 1B05A 4QF9A 1LFHA 4GRKA 1PB7A 4WKMA 1S7YA 2DSFA 1RKMA 3L6GA 3DP4A 3SEYA 4P0IA 3IB2A 3FJMA 4RY1A 3FJGA 3O6IA 4DXUA 3MVYA 3PPRA 3G3JA 2G29A 5ICTA 3TELA 4GF8A 3IR1A 1LAHE 1MS7A 5AA4A 3O6HA 3IOUA 5DVJA 2ONKE 4OETA 4JSOA 1UTHA 5L9MA 1WDNA 2ZYNA 4LZ5A 1LCTA 1N7WA 4DXCA 5AA1A 4IGTA 1DOTA 4BDLA 2V3QA 4U23A 1IEJA 2XXIA 3SEVA 1DTGA 2ANJA 4F1VA 4KR5A 4X9TA 1B0LA 1MPCA 3PPOA 4LZ7A 4N6PA 2A5TA 1O63A 4P0GA 2I58A 1B7ZA 1IUDA 3JYRA 2VOZA 2XXRA 3DM0A 3KGCA 1Z7ME 2I4BA 2PVUA 2OK2A 1R9LA 1UTBB 1BIYA 2HZLA 4XKNA 4KCCA 1Q1KA 3TEPA 3C4MA 1UQWA 1A8FA 4G4PA 2THIA 3TQWA 1LAGE 3IL1B 3E9XA 3PUWE 4YAHX 1H45A 1MXZA 4E0WA 3KN8A 3Q27A 3SDFA 2D5WA 2NVUB 1FTLA 4RJZA 2F6PA 1N3WA 3CSBA 3OENA 1NKXA 3O6GA 4NWDA 3MBPA 3BKIB 5AA2D 3SKPA 3C31A 4PFTA 5TP9B 2XXTA 3LBSA 4GOTA 1OMPA 1B51A 4ZZAA 1NH8A 3ZKLA 1QKBA 3PUVE 2ZNSA 1MDP1 4RA1A 5IAIA 4OFLA 3H6WA 4NF5B 3V8XB 2Z22A 5DEXB 2I49A 2KLFA 4ZECA 4H6DA 2HXWA 3VLVA 2F7AA 2D21A 4IO7A 5A5XB 3VXCA 4QFLA 3TCGA 5CMKA 3WAFA 3TKDA 3HCQA 1D9YA 1B1XA 4YMBA 3K4UA 3AXFA 3HHFA 4R74A 4P11A 3PU5A 4NE4A 3H4ZA 1YTVA 1GR2A 4R9GA 1S50A 1LSTA 3HV1A 4UA8A 2O7IA 4YB6A 4NF6B 3TCFA 3MP1A 3LC8A 4KFQA 2XXYA 5FTHA 4OHNA 3T96B 3PPNA 3FXQA 4N13A 4F19A 3C33A 4EF1A 4C1TA 3RTWB 1Y1MA 4YKKA 3HPIA 3FVGA 5CI5A 2UYFA 1QUIA 1BLFA 1NNKA 2DWHA 1P1OA 1US4A 4GLIA 5I59A 1SI0A 2OZZA 3T22A 1GV8A 1AIVA 3DP6A 4YICA 1P1WA 3H3GA 2I0BA 4IGRA 2B3FA 2DWAA 3CG3A 4AB6A 4FEDA 1OLAA 4OQOA 1B2HA 4I62A 5DT6A 2RINA 2DE2A 4ZDMA 3FXUA 3GBAA 2WKYA 1PDAA 5DVIA 4DDDA 3TTNA 2I3VA 2M8CA 1M5CA 4DLDA 5L9OA 4XIGQ 1P1QA 4QRZA 4JWYA 3T9UA 1VR5A 3PMVA 4X1BA 4WEPA 3A3UA 2DWJA 1I69A 3QSLA 4LZ8A 3K1NA 5H8QB 3TUSA 2E1SA 4E0XA 1A7LA 4F1UA 2QS3A 1NL5A 3H6UA 1VFDA 3FASA 4DZ1A 2Q2AA 2B3BA 4WEDA 3B6QA 3VLWA 5KZTA 2R71A 2HCAA 2ABHA 3O66A 4YZZA 4XTCQ 3FIRA 2QS4A 3OOAA 4ELRA 3GBBA 1IQ7A 4F31B 1H44A 1MY2A 1B5IA 2B65A 5LOMA 4FJPA 5TPAB 4NF5A 4DIGA 3ILUB 3H03A 5DEXA 2I4CA 3I3VA 1FTKA 3N5LA 1MQJA 2O6AA 3MVZA 1HSJA 1H3DA 4RPOA 3OXNA 4PP0A 4JXIA 3FVNA 3T9VA 4EUOA 1D4NA 4LA9A 1MM6A 4NMYA 1D3KA 1LB9A 3PMXA 3K6VA 3W9WA 1MH4A 2DP8A 3KOTA 2XXQA 4H5FA 3EHUA 5EHSA 2XXUA 5HBCA 4OFJA 4NF4A 5CM6A 3N6UA 5AE4A 1MY3A 4ELPA 1ANFA 3VVDA 3O28A 1MY0A 3VXBA 2F78A 3BFTA 5I58B 2R6GE 2UVHA 2H25A 3EHSA 2RCBA 4HW8A 1JVXA 3RT8A 3LUYA 4ZEDA 4FEBA 4YMAA 3O2AA 2X7PA 1FQFA 2H5YA 1MXYA 3K2DA 5ICQA 5F1QA 1Q35A 1FQAA 3FZVA 4F29A 3WAEA 3G3FA 5K2XA 1BKAA 2DWIA 4U1OA 1YCJA 4JDFA 4FATA 2CZLA 1EH3A 4EXLA 1KWHA 1POY1 3RPWA 4RYAA 1LAFE 2P1SA 1MQHA 1POTA 4ESXA 1MPBA 1GVCA 4Q8RA 3K1MA 4C1UA 2AL5A 5KCJB 2Y7KA 1VFEA 3PD9A 2F97A 3FV2A 1LB8A 5EYFA 3CFZA 3MAMA 5FHMA 3H06B 3N26A 1P1NA 2NXOA 4KI0E 1I6AA 4QSDA 2A5SA 3UGWA 4MFIA 2CMOA 5H8FA 1PC3A 2F6GA 2OCUA 1I6QA 1WODA 3M3KA 1N7XA 4R6HA 2ZNUA 1GGGA 4G2ZA 1TWYA 2H99A 3K6WA 3UP9A 1B5JA 5TPAA 4PFYA 2QMXA 5FHNA 1DPPA 3L6HA 4U1ZA 2P2AA 3QYTA 4R72A 5CBSA 5B7DA 3CR9A 4IY6A 5F7VA 3G3KA 4H5GA 4G8HA 2HAVA 1XVXA 1NNTA 1B6HA 3RT6B 5JK4A 1EZ9A 3E13X 2QSXA 4U21A 3HO7A 1B46A 4LP2B 4LQ5A 2GHAA 3QUJA 3IX1A 3T66A 2XXPA 3SESA 1JW1A 2O1LA 4DCXA 2O68A 4OEVA 1A40A 2HFBA 4LUBA 3R26A 3IK6B 1OQGA 4GD5A 2PMSA 3OELA 3EN3A 2W7YA 3U72A 3C9HA 1JW5A 4KYSA 1JEVA 1WVJA 2XXVA 4FE8A 3SEXA 3IOTA 1OVBA 4GL0A 3QAXA 3G3GA 4QFOA 4U22A 4Z7EA 1YPNA 3T9XB 1JQFA 2ZYKA 4ZEIA 2AYSA 4R6KA 2R9JA 3LR1A 1RYOA 5H8HB 2VGQA 3R7XA 3H7MA 3PPPA 2DYXA 4C0RA 1Y4TA 4RPNA 2PYYA 5I2NB 1FQBA 3H6TA 1PEBA 1Y3PA 2Q9TA 4YB5A 3RLFE 1URGA 1ZKBA 4ECFA 3LSLA 4FIMA 3KG2A 3HN0A 3RY3A 1Y9UA 1UIVA 3IB1A 3Q25A 2O51A 5I2KB 3OEMA 1OIBA 2IEEA 2QS1A 1LGBC 1MXWA 1URSA 1OVTA 3EHTA 3N94A 2ONRA 2H4IA 1DMBA 1B3FA 2Y7RA 3U8QA 3IJOB 1FCKA 5CMBA 4TLMB 2AIXA 2H98A 4HTGA 1R9QA 3O29A 1N0TA 4MH5A 3M3FA 2FA7A 2VD2A 3PUYE 4F2QA 3I6VA 5AA2B 2XD2A 4BDQA 1L5TA 3FUZA 3KZGA 1Y20A 1LBBA 4FECA 1Y4CA 2I6EA 4XKPA 4MLVA 1B7UA 3PUXE 3VDFA 3B6WA 2Q88A 3C34A 3V83A 3LSWA 1AOVA 1QW0A 3C35A 3TYHA 2DVZA 4JWOA 1VSOA 4ND9A 3T93B 4OFOA 4O3CA 1B0HA 3K1PA 2O7UA 1SD3A 3CFLA 1ZU0A 4POXA 4EQ9A 1QUKA 2O84X 3OD7A 3IJXB 3IOVA 1SW2A 3VFJA 4NWCA 4Q5TA 3DLNA 2XX7A 3S9LC 2NUVA 1MXVA 4KQPA 3ZSFA 5JTYB 4KYEA 2RC7A 3FVKA 1B9JA 3D4GA 4GXSB 4ZZEA 3OO9A 3H6VA 2AL4A 2Z8EA 1MY4A 4IO6A 5FTIA 3KBRA 3K6UA 4JB7A 3KEIA 2QJEA 1USYH 1ZLQA 3W9VA 2P0SA 2UVIA 3UA8A 5H8HA 4G8MA 4R73A 2DE4A 1FQEA 1LBCA 2DE3A 2NOOA 1UTBA 5I2NA 4F1YA 1H43A 2PX1A 1QUJA 4NF8B 4PFUA 4U4SA 3FV1A 1J1NA 1O7TA 1BTJA 1TFDA 1JNFA 4ZE8A 2RC8A 1JW4A 3TTLA 1SI1A 5ELVA 3OEKA 1MM7A 2H9BA 2XXXA 3KSJA 3TMGA 1XHYA 2F36A 4TQUQ 5TP9A 3MVXA 2V84A 3U93A 4YKPA 3THIA 5KDTB 4O3AA 4KHZE 3GXAA 3RUMA 4QFNA 3PUZE 2UVGA 3T9HB 4FAJA 3U94A 3GZGA 1TT1A 1UIUA 2PT2A 1NNPA 1A55A 2GH9A 3HHGA 1B3EA 2PBWA 3UN6A 3TTRA 1SBPA 3QK6A 1M5EA 5A5XA 4KPTA 1M5DA 5HPQA 3MJNA 4H0WA 3MZ9A 3MPKA 2HAUA 4ISUA 1A54A 1CB6A 2LAOA 3MWBA 4EF2A 2VD3A 1XOCA 5AA4B 1MRPA 4NF6A 1MXXA 1ELJA 4GFRA 1QKAA 3M3LA 2VP1A 2UYEA 2Q2CA 2OJTA 3MUQA 4F3SA 1II5A 3V5AA 3SERA 4DXBA 3MP8A 4K3FA 1JEUA 4QHQA 3TCHA 5CMCA 2REJA 2QMWA 4R6YA 2DS9A 3FATA 3I5OA 3UORA 4OZ9A 1LFGA 3USDA 4NF8A 3IAZA 1IZ1A 1ZIUA 1FQCA 3Q28A 1H76A 4OTEA 4M4GA 3B7DA 1SYIA 4POWA 4H8JA 3IORA 2Y7PA 4EQBA 2ALUA 5H8QA 2QPQA 1N76A 3JZJA 1B40A 1MXUA 3R6UA 2O1MA 4XKRA 2X26A 4G68B 3VLUA 3TAJA 2XD3A 3IO6A 5BUUA 1Y3NA 5CRYA 5KDTA 3U1OA 1GTKA 5I57B 1XT8A 3F11A 4UACA 2V3TA 2GFEA 3PD8A 2ZYOA 2XX8A 3RNNA 3D4CA 4X48A 3OMBA 1N84A 4R75A 1XC1A 2F7BA 5B70A 2F8DA 1JETA 1MQIA 1IXHA 5I84A 1N04A 5I56B 2F34A 3N6TA 4Z0IA 4R9FA 3A09A 1TFAA 5CBRA 1SDXA 1FQDA 1O64A 2Z8DA 2ESNA 3UK4A 3W15C 1MY1A 4YKIA 3S2VA 1SYHA 1BP5A 3PGFA 2V3UA 5CC2A 5TU0A 1B3HA 4ESWA 3G3IA 1PB9A 1LLSA 1R1NA 4BDOA 3SETA 3VV5A 3E3KA 2FNCA 5I58A 1B52A 3CI8A 4BDMA 2Q89A 3FGSA 3K0VA 4OMBA 3CVGA 4PE5B 1B7HA 2Y84A 2I48A 2YLNA 2OLBA 4G8NA 4LATA 3CFXA 3EF7A 5HM4B 4PQJA 4OEUA 3U92A 3PPQA 3VE1B 1SVXB 2I0CA 2XX9A 1ZBMA 4H65A 2HQ0A 4BDRA 3SEWA 4O3BA 5I59B 1A8EA 4G77A 3V89B 1ZJLA 4LQ2A 4BLAA 1QVSA 4GIZA 1B32A 1B3LA 4H1XA 3MVWA 3M8UA 4U2RA 2PT1A 3TPAA 1B5HA 2Y7IA 4OWDA 1A99A 4EXKA 3MP6A 3LSXA 3FD3A 1D9VA 4KCDA 3UIFA 5ITPA 5KCJA 1IITA 3TZAA 4GXAA 2ZNTA 2FYIA 1QJMA 1R6ZA 2QL3A 3K6XA 1XVYA 4RK2A 1FTOA 4G68A 3K01A 2RCAA 4OERA 1AL3A 1SW5A 4IY5A 4FORA 4RNSA 5I57A 2YJPA 1I6BA 4HS7A 3S9NC 4PFWA 4GWOA 2NWJA 4AQ4A 3VVFA 4RXLA 2HZKA 4X1DA 3TFLA 3MC2A 3FJ7A 3OO7A 3C36A 3RGYA 1YAEA 1AH5A 5H8NB 4ONYA 3IB0A 3O97A 2YPNA 5I56A 3EPEA 4THIA 2DVCA 4RK9A 4JSDA 1FW0A 4MLQA 4EDPA 4KD5A 3ZS6A 3FXRA 4ZEKA 4GL8A 2Q8JA 3JV9A 4YKJA 4F3PA 3GLBA 5DTBA 1MPDA 1LAXA 3CG1A 1NMUA 1M5FA 4IO5A 5L8DA 3RTFB 4G68C 2D3IA 3QXMA 3G3HA 2G93A 4F22A 4OXVA 4NF4B 3K02A 4MF3A 1AMFA 2RKMA 4PETA 3KOSA 2UVJA 4GVOA 4ZEBA 1Y1ZA 1RYXA 1S9TA 2Z23A 3TQLA 1B4HA 4L17A 1US5A 4IB2A 1JVYA 2DXRA 5J1DA 3G7WA 4OESA 1MG1A 3Q29A 2VHAA 2RC9A 2QS2A 5BWJA 3ZKKA 2QRYA 3PMWA 4EQ7A 3P7IA 3CIJA 2X7QA 2V93A 3S9EA 4F3GA 4I9DA 2XXHA 3IOWA 3CSGA 4F39A 5K2YA 2RF1A 1PBPA 1P99A 1B3GA 4YU0A 2OBGA 3MW0A 4ZEFA 1T0KA 4AB5A 2F35A 3MPLA 3MZBA 3CRBA 3Q26A 4Q0CA 1URDA 4I1DA 4ZS9A 1ATGA 2ZMBA 3BFUA 1LCFA 5I2KA 4F18A 2O69A 4YB7A 3KJ7A 4TOZA 2IA4A 3TTMA 2Z8FA 1B4ZA 3KFMA 4WXJA 3C32A 1ZTYA 1MH3A 4M1VA 2DXYA 3ECRA 3TTKA 4ELOA 3RN8A 3RQTA 5M2VA 5AA2A 5AA3A 2F5XA 3OSQA 4QSEA 1N3XA 5EHMA 1SQYA 3IO4A 3TDJA 5H8FB 1OLCA 2I3WA 4H67A 4Q30B 3S4UA 1PB8A 3ONMA 4ELQA 4QSCA 3OO6A 4MBPA 3KN7A 5H8NA 4DCYA 4DE8A 3HSTA 3ODBA 2XXWA 4H8IA 3PV0E 2DOJA 4OVJA 5H8SA 5JEIA 3BBRA 2E0SA 1FTJA 2BJJX 1NNFA 1QULA 2Y7WA 4LONB 1IXIA 1Y3QA 1EZOA 1EU8A 1MQGA 4GQOA 4OENA 1PBQA 3S9MC 3QIMA 4NTLA 4OYVA 2GRVA 5JTYA 1F9BA 4N07A 1VE4A 3ILTB 1SW4A 3QUFA 4QFPA 3O9PA 2UXAA 1UTHB 1ZMGA 1XS5A 4NEDA 1LFIA 3LSFB 5DYHA 2HEUA 3MZ1A 3DELB 4F2OA 1DPEA 4F3BA 1MQDA 3MQ9A 1OQHA 5CMMA 4JBZA 3FVOA 1FTMA 4IO3A 2A5TB 1USYE 1Z7NE 2ONSA 4HCYA 4IO2A 1M5BA 4LVQA 5IKBA 5DVFA 1NH7A 3OO8A 4TLLB 4QFKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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