2R6GE

The crystal structure of the e. coli maltose transporter
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK
publication title Crystal structure of a catalytic intermediate of the maltose transporter.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 117
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE01
5CBSA 2PBWA 1BIYA 4MFIA 1B7HA 1MPDA 4OFOA 2AL4A 4YKKA 1N3WA 4R73A 3CFLA 2ONKE 1P99A 3H6WA 3FXUA 3WAFA 1Q35A 3TCFA 1URDA 4OHNA 4AQ4A 1MY4A 4FAJA 3L6HA 1WVJA 5H8HA 2IEEA 4ZE9A 1JVYA 3GLBA 3CIJA 2QMXA 4YMBA 4Q0CA 2O51A 1D3KA 1EH3A 1POTA 3IK6B 1M5CA 2I0CA 2V93A 4EDPA 1TWYA 3PMXA 1LAHE 3RLFE 5I58B 3PMVA 1R9LA 3PUXE 4DXBA 4G77A 4DDDA 4PFUA 3IOUA 1DSNA 3FIRA 4F3GA 1SBPA 1AH5A 4U1OA 2REJA 4U22A 3RGYA 3MVZA 2DQVA 1N04A 2AIXA 2QMWA 5DT6A 3ILUB 3RT6B 1MXVA 2KLFA 4KQPA 3G7WA 2ZNTA 5TP9A 5CI5A 3T9XB 2RC9A 5JEIA 4RPOA 2I0BA 2Q8JA 4KR5A 3U93A 1LFHA 3T9UA 2QS3A 5CMKA 2QPQA 2XXWA 2IA4A 1FQBA 4U1ZA 1Q1KA 2VHAA 3C33A 1IXGA 4NEDA 3K2DA 4JSDA 2DOJA 1FTMA 2HEUA 4LUBA 5I57B 4U21A 3FVNA 4OMBA 3KOTA 3V83A 1LGBC 3SETA 1MQGA 3Q29A 1TFDA 1OMPA 4QFNA 4I8CA 1M5EA 5I59A 4KHZE 1B5IA 4IGRA 3CRBA 2A5TB 1MG1A 3HPIA 1FW0A 2I49A 3S9LC 1DPEA 4ZS9A 1VFDA 4JWXA 1MQJA 1MXWA 4H5FA 2OCUA 3PUVE 3SEUA 3SEYA 3HHGA 4H6DA 4Z7EA 3FASA 1ELJA 4KCDA 1UTBB 1Y20A 3B6QA 2YJPA 4FIMA 2DS9A 3V8XB 1QW0A 2G93A 4X9TA 2GH9A 3QSLA 1O7TA 4M4GA 5A5XB 4HCWA 1LFIA 4OEUA 5H8SA 4EQ7A 4ONYA 1SI0A 1S50A 5AA4A 3OSQA 1VE4A 2YPNA 3CFZA 1FTJA 3ODBA 2HCAA 3W9VA 4FEDA 4R2FA 3FGSA 1B58A 1B32A 4MH5A 4QSEA 1PB7A 1TT1A 2D21A 2VP1A 3KN7A 1OVBA 4F39A 2REGA 2R9JA 3KJTA 1MY0A 1RKMA 3LSFB 1JW4A 1M5FA 4EXKA 4X1DA 1QVSA 3VDFA 4C0RA 1N76A 3JYRA 1ZLQA 1B5HA 3TYHA 4GL0A 1QKBA 2QSXA 5DEXB 4R2BA 4BDQA 3K6UA 4BDLA 4OXVA 2DXRA 1Z7ME 3TZAA 5DYHA 3PU5A 5AA3A 1QUJA 5FTIA 3F11A 5KCJA 4PE5B 5DVIA 3KEIA 3U92A 3B7DA 3RT8A 4ZE8A 3C32A 3HO7A 4NMYA 2XXUA 4OEVA 5JTYB 1B7ZA 4XXUA 2HZKA 1DTZA 4X1BA 3K0VA 4IO2A 5TPAB 1LB8A 2XX8A 4NE4A 2OBGA 2PX1A 1YCJA 5FHNA 3H03A 3OD7A 4C1UA 3B6WA 3IORA 4NF5A 3U8QA 1MQDA 1NL5A 3IO4A 4KYSA 3TKDA 4GFRA 4NF4B 2Q89A 4GXAA 3LUYA 3MVXA 2DVZA 5I56B 4HW8A 1IEJA 5K2XA 2Q2CA 5BUUA 2DE3A 5CMMA 1DOTA 4NWDA 4HTGA 3MQ9A 3CI8A 4GIZA 1H76A 2F6GA 3CG3A 2I3VA 1NNTA 3TPAA 3Q28A 1IXCA 1XS5A 3IX1A 4PP0A 4QFPA 2QS4A 1N7XA 4F3SA 3PPOA 3VFJA 2ANJA 3VXBA 5KDTB 1QUKA 3FVKA 3HCQA 1Y1MA 4RJZA 1I69A 1TXFA 4TLLB 1A99A 3OEKA 1IZ1A 3MPKA 3IJOB 4GL8A 4KD5A 1PB8A 5EHMA 2D5WA 5I57A 1SW1A 4RNSA 5EYFA 3T93B 5AA2B 1XC1A 1JQFA 4ECFA 4R6KA 1FQAA 3B6TA 3H7MA 1IXHA 1NH8A 3IOTA 2PT2A 3FZVA 2W7YA 4UACA 1B6HA 4IO5A 1MY3A 2OWTA 1EZOA 1JW5A 1SW4A 2I4CA 5HBCA 3D4GA 1P1QA 4YKJA 4OFLA 2RKMA 1MXZA 3U1OA 4ZEIA 3TODA 1GGGA 2OK2A 2Y7IA 2O7UA 4OVJA 2X26A 3H6UA 3TAJA 2F34A 3DELB 2DWJA 4YMAA 2V84A 4R74A 2HXWA 4GVOA 1SW5A 5A5XA 4EQBA 3M3FA 3PMWA 4OYVA 3VVFA 1F9BA 4YKIA 4P11A 3RUMA 3FUZA 4MLVA 1CB6A 4RPNA 3DP6A 1PBQA 2RCAA 1FTOA 3EQ1A 5B70A 3A3CA 4BLAA 2NWJA 1NNKA 4WEDA 5I2KA 2XX9A 1H43A 4I62A 3PPRA 3SDFA 1Y3NA 1OVTA 1I6BA 1NKXA 2I48A 1FTKA 1IUDA 1P1UA 3ZKKA 2B3FA 1XOCA 5JK4A 3PPPA 1GR2A 1MDQA 2XX7A 3OOAA 4FE8A 3K1MA 4U4SA 4JXIA 3R6UA 3MAMA 1AMFA 2H25A 4RYAA 1QUIA 1KWHA 2YLNA 2B3BA 1R6ZA 3ONMA 2OWSA 4GXSB 1USYE 2LAOA 3G3KA 5K2YA 5TPAA 2E1SA 4IO3A 3QXMA 2NXOA 2UXAA 1MM7A 4YB7A 4ZZEA 4ZEDA 3DP4A 3GBAA 3UORA 4ND9A 3K1NA 2Y7WA 4TOZA 3IB2A 1HSLA 4YU0A 1ATGA 4Q5TA 3QUJA 1UTHB 1O64A 4PFWA 4IY6A 3EPEA 1J1NA 1B51A 1B4HA 3S9NC 4LZ5A 4PQJA 3UK4A 3TEPA 1O63A 3GZGA 3SERA 3OO7A 1FQCA 3PD9A 3S2VA 1B2HA 4HS7A 2ONRA 4JSOA 4FJPA 4F2OA 5H8FB 3M3LA 1D4NA 4WKMA 3DP8A 3MVYA 1IITA 3FD3A 2F6PA 3TTNA 3L6GA 3KBRA 3SKPA 4H1XA 3U72A 1JNFA 4KPTA 4OFJA 3MPLA 2XXQA 4C1TA 3PV0E 1B0LA 2Z8FA 4AB6A 1IIWA 2ZNSA 2GRVA 4O3BA 4QHQA 2O69A 2Y7KA 4WEPA 4NF6B 4G68A 2QS2A 4F18A 2FA7A 2PVUA 3PUYE 3C9HA 5KZTA 4LQ5A 1URGA 1MM6A 5I2NB 3IR1A 1JVXA 4U4XA 1NNFA 2F97A 4GOTA 3H06B 1P1WA 5ICTA 2QL3A 2VOZA 2CZLA 2UVGA 4ZEKA 4EUOA 1SW2A 2XXYA 4R9GA 1UIVA 1SYIA 4GD5A 1FQEA 1B4ZA 5CM6A 2P2AA 4U23A 4N13A 1LSTA 3C35A 2RC8A 3MC2A 2PMSA 4R9FA 5EHSA 3LBSA 3HSTA 1ZIUA 3N94A 3KN3A 3MW0A 1RYOA 5H8QB 5HPQA 1QKAA 3M3KA 3S9EA 4GWOA 4DE8A 2Z22A 1VSOA 4QF9A 4EXLA 3ILTB 4PFYA 3RN8A 2WKYA 5AA2D 1EU8A 3CSBA 1MXXA 1WDNA 3P7IA 4QSCA 5IKBA 3CG1A 3O6HA 1SYHA 3R7XA 3LSLA 5DVFA 4XTCQ 3KOSA 4FATA 4ZDMA 1B9JA 4POXA 1QULA 3TTKA 5H8NB 2F36A 3HN0A 3IOWA 2H98A 3VV5A 2DE4A 4N07A 3TQWA 2BJJX 2XXRA 1XT8A 3UGWA 3IAZA 3MBPA 3QIMA 3E13X 3WAEA 2V25A 3UN6A 1PEBA 3LC8A 1IQ7A 2PT1A 2XHDA 1B3HA 3TFLA 4BDOA 3K6VA 4FEBA 3MWBA 4DZ1A 2VGQA 1B3FA 4THIA 4OWDA 4N6PA 3HHFA 5I58A 4G68C 1B05A 3TTMA 4ELRA 3FV1A 1VFEA 1MXYA 1ZKBA 3OXNA 1ZTYA 4JDFA 2QS1A 1N3XA 3FJ7A 5DTBA 5HM4B 1ZU0A 1B1XA 3MUQA 1R1NA 4F31B 3H6VA 3QK6A 3O2AA 2ZMBA 3EN3A 5FHOA 4GRKA 3G3HA 1LBCA 3C34A 5TP9B 1A55A 2ZYMA 1M5DA 4RK2A 1MY2A 2RC7A 2Q2AA 4KYEA 1B52A 2UVJA 3KG2A 3KZGA 1Z7NE 4IY5A 3FXRA 3DM0A 1AOVA 2O6AA 1YTVA 3I3VA 4H67A 1FQDA 3BFTA 1H44A 4L17A 1Y4CA 1SQYA 3VLVA 4H8IA 3MZBA 2XXVA 4JBZA 3PPQA 1OLAA 4G8HA 2NVUB 1EZPA 2ZXTA 4HCYA 2DWHA 3RTFB 4H0WA 3K6XA 2UYFA 3EHSA 2P1SA 2A5TA 1D9YA 3OO9A 3Q27A 3IB1A 3V89B 2Y7RA 3A3UA 4ZECA 3TELA 4IO4A 1MRPA 5L9SA 3PUWE 2I6EA 1LAFE 1NH7A 3S9MC 4NF6A 4R6HA 4ZEFA 3LR1A 3OENA 1AIVA 3FATA 3DLNA 3H3GA 4AB5A 1P1NA 2O1LA 1I6QA 5I84A 2VD2A 3H6TA 1UTBA 3VLUA 4LP2B 3T9VA 5I2NA 1A8EA 3O6IA 1Y3PA 2QJEA 1AL3A 2I58A 3TCGA 5L9OA 3O66A 3KN8A 4TQUQ 4XKNA 3OSRA 4I1DA 3CVGA 1FQFA 3K02A 4I9DA 1US4A 2DVCA 1GTKA 4FECA 3K1PA 2DYXA 4ESWA 1YPNA 3G3IA 2HAVA 1SDXA 4QFKA 5AA4B 1HSJA 3H4ZA 3RY3A 4DXCA 3TDJA 1A40A 3VVEA 4GLIA 2XXXA 2OLBA 1USYH 3HV1A 3TCHA 1US5A 2ABHA 1SD3A 1Y3QA 3T22A 3T96B 3VLWA 2F7CA 3T9HB 1B3EA 1BKAA 2VD3A 4G4PA 4QRZA 3C36A 3CFXA 4E0WA 5DEXA 3SEXA 3SESA 1YAEA 3MP1A 2XXHA 3BFUA 3MVWA 1MH3A 5ITOA 3QAXA 3FVGA 5H8NA 3GBBA 4ZEBA 5KCJB 4G8NA 1N84A 1Y9UA 3RQTA 4F22A 5CC2A 2FNCA 2UYEA 1MXUA 2D3IA 5JTYA 3O9PA 2V3UA 3VVDA 3N5LA 3OEMA 2E0SA 4F19A 1PB9A 3R26A 3AXFA 2X7QA 1ZJLA 1DTGA 2DWIA 5F1QA 3USDA 4ELOA 3E3KA 5CRYA 4JWOA 4NF8B 3E9XA 3VE1B 4NF5B 3OMBA 1Y1ZA 4NF4A 4Q30B 4M1VA 2F78A 5I56A 1FTLA 1S9TA 2OJTA 2P0SA 4MBPA 4OTEA 4DLDA 1LCFA 1A7LA 4QSDA 1FCKA 2AYSA 1XVXA 2Z23A 4R72A 4P0GA 4R6YA 1Y4TA 5FTHA 4EF2A 4PFTA 1POY1 4F2QA 4ISUA 3IOVA 2O1MA 3O28A 5KDTA 3BKIB 4IO7A 4LONB 3MZ1A 3C4MA 4P0IA 2DWAA 1H45A 3EHTA 3OO8A 1B3LA 4XKPA 4EF1A 4OETA 1NNPA 5TU0A 3FJMA 3GXAA 4ELQA 5AA2A 1SI1A 4DXUA 1URSA 2ESNA 1HSEA 2ZYKA 1B0HA 1MQIA 4LQ2A 4OENA 2UVIA 1LB9A 1UQWA 1CE2A 4LA9A 4F3BA 1JW1A 4Q8RA 5ITPA 5LOMA 3FJGA 5DVJA 1XHYA 3Q26A 3U94A 1T0KA 3ZS6A 2Q88A 4GQOA 4F1UA 4IGTA 2XXTA 3G3JA 2F7AA 4YICA 4BDRA 5FHMA 2F5XA 2ZYOA 2O68A 4RXLA 4YB5A 2DE2A 3IJXB 1GV8A 4DIGA 3RNNA 4LZ8A 4O3AA 1BP5A 1M5BA 1II5A 1P1OA 3ECRA 4H8JA 4XKRA 2XD3A 2OZZA 1MS7A 2O84X 4R75A 1DMBA 4KFQA 1B1HA 1N7WA 2RF1A 3FV2A 3O97A 4MLQA 4DCYA 1B46A 3LSWA 3KFMA 3TUSA 4G2ZA 5J1DA 1UIUA 3SEVA 2Y7PA 1MQHA 5CMBA 3FVOA 2UVHA 5AA1A 4LZ7A 4ZZAA 4OESA 3TTRA 5IAIA 3JZJA 3K01A 4JB7A 4TLMB 5I2KB 4G8MA 3S4UA 2ONSA 4YB6A 5AE4A 4KYDA 2Q9TA 1LAXA 2ALUA 3I6VA 2RCBA 1B40A 1QJMA 2NUVA 2X7PA 1H3DA 5B7DA 1ZBMA 3UA8A 2DSFA 5F7VA 4YZZA 3ZSFA 5ICQA 3IB0A 3UIFA 1NFTA 4F1YA 3N6UA 4O3CA 3K4UA 1TFAA 1OQGA 2AL5A 3VXCA 5BWJA 1RYXA 2F7BA 1A54A 1DPPA 4GF8A 1ANFA 1MH4A 5H8HB 2ZYNA 4F3PA 3TTLA 3RPWA 2GHBA 3MJNA 1PDAA 2F8DA 4FORA 2NOOA 1B3GA 4KI0E 3CR9A 3BBRA 4OERA 2DP8A 4UA8A 4NF8A 4QFOA 1WODA 3ZKLA 2CMOA 1I6AA 2G29A 1UTHA 4OQOA 1OQHA 1R9QA 3FXQA 1GVCA 3A09A 4H65A 3D4CA 4KCCA 3PPNA 5L9MA 3KSJA 2ZNUA 2RINA 1LFGA 4RK9A 1L5TA 1D9VA 3QYTA 1JEVA 1SVXB 3O29A 3V5AA 2H99A 2HFBA 3N26A 3K6WA 1MY1A 3QUFA 2R71A 1JETA 1BLFA 3MP8A 3MP6A 5H8FA 2PYYA 4IO6A 1NMUA 1PC3A 1S7YA 3CSGA 3G3GA 4PETA 4WXJA 2FYIA 3C31A 3THIA 1ZMGA 1N0TA 2V3QA 3E4RA 2R6GE 1MDP1 1MPCA 3PD8A 5CMCA 2O7IA 4NTLA 5CBRA 4POWA 5I59B 3KSXA 1BTJA 1MPBA 4RA1A 4YAHX 3OELA 3I5OA 2V3TA 3KGCA 4BDMA 1A8FA 2Y84A 5ELVA 4MF3A 1LAGE 4X48A 2I3WA 2QRYA 3MZ9A 2H9BA 3W15C 4G68B 3Q25A 3TQLA 1LLSA 4Z0IA 4E0XA 3LSXA 2GFEA 3PUZE 2HAUA 2M8CA 1OIBA 4ELPA 4JWYA 1OLCA 4DCXA 1EZ9A 3IL1B 2DXYA 3EHUA 2H4IA 4U2RA 2XD2A 4EQ9A 2XXPA 2THIA 4YKPA 1LCTA 3T66A 4F1VA 1B7UA 1PBPA 3PGFA 5M2VA 1JEUA 3N6TA 1LBBA 2F35A 4NWCA 3OO6A 1IXIA 2GHAA 2XXIA 1VR5A 5H8QA 3TMGA 1B5JA 2H5YA 2HQ0A 3G3FA 4H5GA 1XVYA 3UP9A 3EF7A 2B65A 4LATA 3JV9A 3IO6A 2A5SA 3SEWA 4IB2A 3RTWB 2HZLA 4OZ9A 4F29A 4QFLA 4LVQA 5L8DA 4K3FA 2Z8DA 4RY1A 2Z8EA 5ISUA 4BDNA 2I4BA 3W9WA 3KJ7A 4XIGQ 3K00A 4XKQA 4ESXA 3M8UA 3O6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CBSA 2PBWA 1BIYA 4N6KA 4MFIA 5EQ7A 1B7HA 3HFUA 2V4CA 1MPDA 4MMPA 2VPOA 2AL4A 4OFOA 4YKKA 1N3WA 4R73A 2Y5LA 3CFLA 2ONKE 1P99A 1FPEA 3H6WA 3FXUA 3WAFA 1Q35A 2GQ1A 3TCFA 1URDA 4OHNA 4AQ4A 1MY4A 1AWBA 4FAJA 3L6HA 1WVJA 5H8HA 2IEEA 4ZE9A 1JVYA 3GLBA 3CIJA 4DI3D 2QMXA 4YMBA 4Q0CA 2O51A 2WBDA 1D3KA 1EH3A 1POTA 3IK6B 3IFAA 1M5CA 2I0CA 2V93A 4EDPA 1TWYA 3PMXA 1LAHE 3RLFE 5I58B 3PMVA 1R9LA 3PUXE 4DXBA 4G77A 4MX6A 3BIHA 4DDDA 4PFUA 3IOUA 1IMBA 1DSNA 3FIRA 5EYGA 4F3GA 1SBPA 1AH5A 1RDYA 4U1OA 2REJA 4U22A 3RGYA 3MVZA 2DQVA 1FPKA 1N04A 2AIXA 2QMWA 5DT6A 3ILUB 3RT6B 1MXVA 2KLFA 4KQPA 3G7WA 2ZNTA 5IZ3A 5TP9A 5CI5A 3T9XB 2RC9A 5JEIA 4H46A 4P1EA 4RPOA 2I0BA 2Q8JA 4KR5A 3U93A 1LFHA 3T9UA 2QS3A 5CMKA 2QPQA 2XXWA 4H45A 2IA4A 1FQBA 4U1ZA 1Q1KA 2VHAA 3C33A 1IXGA 4NEDA 3K2DA 4JSDA 2DOJA 1FTMA 2HEUA 4LUBA 5I57B 4U21A 3FVNA 4OMBA 3KOTA 3V83A 1LGBC 3E78A 1MQGA 3SETA 3Q29A 1TFDA 1OMPA 4QFNA 1EYJA 4I8CA 5LTCA 1M5EA 5I59A 4OVRA 4KHZE 1B5IA 4IGRA 3CRBA 2A5TB 1MG1A 3HPIA 1FW0A 2I49A 3S9LC 1DPEA 4ZS9A 1VFDA 4JWXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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