2R6GE

The crystal structure of the e. coli maltose transporter
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK
publication title Crystal structure of a catalytic intermediate of the maltose transporter.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 117
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE01
2OK2A 1S9TA 3FV2A 1ZBMA 1JW5A 3E9XA 4U21A 2Q8JA 4LZ5A 3TTKA 3H6UA 1DTGA 3RT6B 3RPWA 5ICQA 1UTHA 3B6TA 4U23A 4OFOA 3KOSA 4UA8A 4ZE8A 1SQYA 3MVXA 4JDFA 2CZLA 3H7MA 4OHNA 3PU5A 4FAJA 2GRVA 4IO5A 2V93A 1S7YA 2XXWA 5H8QB 3QXMA 2QS3A 4XXUA 4OVJA 4ZEKA 4O3CA 4ZEDA 4P11A 3N6TA 2RINA 1O7TA 4R2BA 1F9BA 1I69A 2ZYKA 2UVJA 2VD3A 3EPEA 4FIMA 5FHMA 2XXRA 1IQ7A 1Y1MA 1LBBA 3L6HA 3V89B 3EHTA 3FXQA 4G68B 1UIVA 3HPIA 4HW8A 4E0WA 3VDFA 2RC8A 3LUYA 4X1DA 2DE4A 4R72A 1AIVA 3RUMA 2BJJX 2I0CA 4JXIA 2ZYMA 1B5JA 4RXLA 1GV8A 4OEVA 4F3GA 3QK6A 5I56A 4H67A 3FUZA 1ANFA 1WVJA 4Q8RA 1QKBA 2QPQA 4ELOA 1Y4TA 3HHGA 4ZZAA 1B3GA 4LA9A 4OERA 5B70A 1MS7A 4LQ2A 4LP2B 1NNKA 4Q30B 4YKKA 3K1MA 3OENA 5I58B 1YAEA 4YB7A 3K0VA 3FATA 1OLAA 4F31B 1A54A 2OZZA 2VD2A 3KJTA 4OYVA 1Y4CA 2Q88A 3U8QA 2AL4A 4U22A 4H8JA 4EQ7A 2AL5A 3IOWA 2GHBA 2XXIA 3RLFE 4PFYA 3MPKA 1N3WA 2F6GA 4MBPA 2ALUA 4QFNA 2F7CA 1YTVA 4Q5TA 1MQIA 2B3BA 1QULA 1UIUA 1B5IA 1I6AA 1MPCA 5H8SA 4N07A 3T96B 4EF2A 4OMBA 4GRKA 1QJMA 1P1QA 1N3XA 3F11A 3N5LA 3EQ1A 3OO6A 3CFXA 4H6DA 2RF1A 3TMGA 3TUSA 2GFEA 1B0HA 2DWHA 1XVXA 4HCYA 3FVKA 3PUWE 4QFPA 3OSRA 3A3CA 1DTZA 3KN8A 2IA4A 3CFZA 1VE4A 3IX1A 3IO4A 5I57A 5ITPA 1NFTA 5K2XA 3T66A 3TEPA 3G3HA 2UYFA 3VXBA 3LSXA 1JNFA 1SYIA 3MVWA 4GL8A 3ECRA 2XD3A 5I59B 1O64A 5I58A 2X26A 3IL1B 3U72A 1B1XA 2DWJA 4IO7A 3O2AA 2F8DA 4PFUA 5KDTA 2H99A 1P99A 1GVCA 3TELA 5FHNA 3EHSA 4KFQA 2PT2A 2F78A 2Y7KA 4DLDA 2O7IA 4MLVA 2F36A 1O63A 1FQDA 3OMBA 5B7DA 3VLUA 3OD7A 5JEIA 1Z7ME 1GR2A 3KFMA 2A5TB 2R6GE 3IK6B 1VSOA 3S9EA 1NL5A 2PMSA 4OESA 4RY1A 5EHSA 1LFIA 3QUJA 4EQ9A 1XOCA 4LVQA 1WODA 1XT8A 4P0GA 4M1VA 5AA2D 1PBPA 4FEDA 3VLWA 4G2ZA 4GVOA 4LQ5A 4F18A 4EXLA 5L9SA 4NMYA 3MVYA 3SEXA 4PETA 3TFLA 5AA3A 1IXHA 4ESXA 3RNNA 2OWSA 5CRYA 3USDA 3N26A 1BKAA 1EU8A 1LAGE 1B7ZA 3M3KA 3AXFA 3K4UA 5TU0A 2ONKE 4U1OA 1LCTA 1H44A 3FIRA 4F3PA 1MXZA 2V3QA 4XIGQ 4ELRA 1LFGA 3MJNA 1MY3A 4POWA 3VFJA 3JYRA 1MY2A 2HAVA 2RC7A 4Z0IA 1B9JA 4BDNA 1QUIA 2A5TA 5H8FB 4PFWA 4GL0A 3OO8A 2ONSA 3O6IA 4YKIA 4U4XA 5TPAB 3IJOB 3FJ7A 3O29A 4QSEA 3C9HA 4N13A 3T9XB 3N6UA 1TFAA 1LB8A 3C4MA 2F7BA 3S9MC 1B46A 1NNTA 4I8CA 1DMBA 3M3FA 1USYE 3SETA 1LB9A 3DP8A 3R6UA 4R6YA 2OCUA 4IY6A 4ONYA 2DSFA 3K1NA 3QSLA 4THIA 5DTBA 4XKNA 1CE2A 2I6EA 4FECA 1B3FA 1OIBA 4EF1A 2R9JA 3H6VA 1NMUA 2ZYNA 3VVFA 4R2FA 3KGCA 4KHZE 4JWOA 3PPNA 1LAFE 4R6KA 3M3LA 3OXNA 3KOTA 2DXRA 1ZJLA 4OEUA 2NVUB 3S9LC 3O66A 5AE4A 1JEUA 1MRPA 1LFHA 3C33A 4QFLA 5F1QA 4DCXA 2FNCA 2QJEA 3U92A 3D4CA 1II5A 2HEUA 4F29A 2DP8A 1US5A 1B3HA 3MZBA 5H8FA 3JZJA 5AA4A 3E13X 4G8HA 4HS7A 3TTRA 1B0LA 5TPAA 5K2YA 3VLVA 4YB5A 2I48A 2Y7RA 4QFKA 4POXA 5KCJB 1B4HA 3RTWB 2DS9A 4RK9A 2YLNA 1URDA 3QUFA 4LZ8A 3H06B 2XXPA 4XKPA 2Z23A 2XXUA 5EHMA 2I3VA 4Z7EA 1YPNA 1Y3NA 3FASA 3PMVA 3S4UA 3LSLA 4RA1A 2ZYOA 2ZNTA 5BWJA 3P7IA 2OWTA 3PPQA 3IO6A 1P1OA 1NNPA 3R26A 1P1UA 4ND9A 4R9GA 1MG1A 2QL3A 1MY1A 1BTJA 3Q27A 4H5FA 1SW5A 4ELQA 5CMKA 1IXCA 3JV9A 3LSWA 4U4SA 1FW0A 3A3UA 4GLIA 1SI0A 4ESWA 3O28A 3LBSA 1MDQA 2W7YA 4C1UA 3QYTA 3IB0A 3S9NC 4DXUA 4WEDA 4PP0A 1SBPA 5M2VA 3KN3A 3UA8A 1TT1A 3UN6A 4H0WA 2V3TA 2XXYA 2PX1A 3TQLA 3PUXE 3H03A 3FD3A 2QS4A 5KCJA 4F19A 1MXXA 2I3WA 4ZEIA 3PD8A 4FEBA 4ZS9A 4L17A 1M5FA 3KN7A 4NEDA 1SW4A 1SVXB 3ZKLA 5H8NB 4BDLA 2UYEA 4YB6A 3CG1A 1ZLQA 3B6WA 5CMCA 3SDFA 4KYDA 3GXAA 1GGGA 2XXXA 4BDMA 3UK4A 1FQBA 2XXTA 1M5DA 3SEUA 3K00A 3CI8A 2HXWA 3BFUA 1FQEA 1B6HA 1CB6A 5IAIA 1T0KA 2ABHA 5H8QA 3KSJA 4DCYA 4KPTA 4PFTA 3I5OA 1N7XA 4RNSA 2X7PA 1QVSA 1FQAA 4BDQA 2X7QA 3K1PA 1LAXA 1PDAA 3FV1A 3QAXA 1MH4A 5LOMA 1MPDA 4YU0A 1B32A 3MPLA 5HPQA 1D9VA 4NF4B 3UGWA 2DE2A 2F34A 3U1OA 3H4ZA 4YZZA 4IO3A 2DQVA 2GHAA 4IGRA 4WXJA 4G68A 4F1YA 2O7UA 2HAUA 2REGA 4QSDA 3TCHA 3QIMA 3I3VA 4IO2A 4JSDA 1SDXA 3IORA 5H8NA 2A5SA 3Q26A 4MFIA 1TXFA 4IGTA 2UVIA 1ZTYA 3B6QA 2PT1A 3PUVE 3BKIB 1FTLA 1LAHE 3BBRA 4RPOA 3DLNA 3T9VA 1B7HA 1PBQA 3TQWA 5CC2A 4KCCA 4F2OA 5JK4A 4U1ZA 4R74A 2NWJA 1SW2A 5I2KB 5ELVA 3MZ1A 3T9HB 4X9TA 2WKYA 2NOOA 1AOVA 1IUDA 2DYXA 4XKQA 2YPNA 2VGQA 5EYFA 2Y7PA 1EH3A 3C31A 3KBRA 3O97A 4RPNA 1ZIUA 3IB2A 2I4CA 3FXUA 1KWHA 1R9LA 4BDRA 4NF4A 3PUYE 1ZU0A 4KR5A 3TTLA 1QW0A 2XHDA 3VVDA 5DVFA 1J1NA 1PB9A 3K2DA 3CFLA 2Z8DA 3MP6A 1RKMA 1JW1A 1Q1KA 3GBBA 1B7UA 1N84A 2NXOA 1I6QA 3FZVA 1N76A 2XXVA 1SD3A 3LC8A 4RYAA 1S50A 2VHAA 3ZKKA 1SI1A 3TZAA 4OWDA 4I1DA 3N94A 1HSLA 4AQ4A 3K6XA 2D3IA 3H3GA 3O9PA 1MDP1 3FVOA 5I59A 1H45A 1IXIA 5AA1A 4ECFA 4LONB 4XKRA 2Y84A 3W9VA 4KYSA 2UVHA 2QMXA 3LR1A 3GZGA 1A8FA 2Z22A 4NE4A 1D3KA 5FHOA 4ZZEA 3ILTB 2H9BA 4H1XA 4F2QA 5L9OA 1B05A 2DWIA 4QF9A 1JVYA 5CMMA 1B3LA 3THIA 3KG2A 2H5YA 4X48A 1FTMA 5CMBA 2QMWA 2QS2A 3C34A 3C32A 4MLQA 1A40A 3SEVA 2ZMBA 1MXYA 4OFJA 4GIZA 3VV5A 4OXVA 4OFLA 4YAHX 4EQBA 3Q28A 3TCGA 3MP1A 2H4IA 4WEPA 1DPEA 2REJA 3KJ7A 4HTGA 4YKPA 1POY1 1MQGA 2CMOA 3MVZA 3FVNA 1WDNA 4GD5A 2F7AA 1FQFA 4EXKA 1MH3A 4FATA 1UQWA 1PC3A 1R9QA 1ELJA 2RKMA 3U94A 4JSOA 1DPPA 2B3FA 3SKPA 4YMAA 4O3BA 3UIFA 2V25A 3VE1B 1M5EA 2FYIA 3T9UA 4JBZA 1LCFA 3EHUA 1OQHA 2XXQA 2UXAA 5DEXB 1FCKA 2ONRA 3KEIA 3CVGA 4NTLA 4TQUQ 1MM6A 1OQGA 2Z8FA 4OQOA 3KSXA 2F97A 2UVGA 1JEVA 3W9WA 2D21A 4FJPA 5DYHA 2ZNSA 4UACA 2M8CA 3MW0A 5L8DA 4AB5A 1EZ9A 5AA2B 2Y7WA 3UORA 4R6HA 3O6GA 3IOTA 4FORA 2DOJA 1M5BA 1EZOA 1NNFA 5DT6A 1R6ZA 1MQJA 3C36A 1I6BA 3CRBA 2GH9A 3HN0A 2E1SA 2QS1A 1MXUA 3ONMA 3OO9A 3FXRA 2I58A 3V5AA 4M4GA 3K6VA 1OVBA 4Q0CA 1NKXA 3TPAA 1USYH 3Q29A 2ESNA 5IKBA 2XX7A 4G77A 1D9YA 3IR1A 4R75A 4H8IA 4GWOA 3EF7A 3OEKA 4R9FA 4DXCA 1B5HA 4YKJA 1DOTA 3TCFA 4P0IA 3IOUA 3MQ9A 1IIWA 3KZGA 1AL3A 2F5XA 4PQJA 3PGFA 1MQDA 4DZ1A 3MAMA 4F3BA 2D5WA 2Q9TA 5I56B 2OBGA 2ZXTA 3G3IA 4G8NA 3ZS6A 2ANJA 3CIJA 5CI5A 5ITOA 3CG3A 2DXYA 5AA2A 1SYHA 3DP6A 4GF8A 3PPPA 4ZE9A 1QKAA 1MPBA 3MP8A 2E0SA 1B4ZA 1EZPA 4IO4A 1XVYA 1PB7A 3HV1A 1N0TA 3D4GA 4TLMB 1VFEA 3G3FA 1B40A 4F1VA 1HSJA 3ILUB 3MWBA 2RCAA 1MXVA 1N7WA 2G29A 2HZLA 4RK2A 3K02A 2V84A 1B52A 2RC9A 4N6PA 2QSXA 3H6WA 4QFOA 1Q35A 4KQPA 1FTKA 4DXBA 4XTCQ 3TTNA 1MY0A 3E4RA 3G3JA 1JVXA 2B65A 1JQFA 1NH7A 3FJMA 3OOAA 1OVTA 3MC2A 3OSQA 1IXGA 3B7DA 4LATA 3FJGA 3PPOA 3PMWA 3MBPA 3HCQA 3GLBA 5I57B 4KCDA 3O6HA 3VVEA 3OO7A 4K3FA 3V8XB 4E0XA 5FTIA 4JWXA 2HFBA 3HO7A 3CR9A 4DIGA 1D4NA 2IEEA 4JB7A 3IOVA 4H65A 1LSTA 5KZTA 4GXSB 1PB8A 4AB6A 3GBAA 1IEJA 1Z7NE 2V3UA 2FA7A 1Y9UA 5KDTB 4QSCA 1PEBA 2HQ0A 1XS5A 3RN8A 5J1DA 2O51A 3G3KA 2OLBA 2R71A 2I4BA 4HCWA 3A09A 2XXHA 1B3EA 1Y3PA 3MZ9A 4IO6A 3S2VA 3L6GA 1ATGA 2P0SA 1A7LA 4IY5A 3SERA 3K01A 2KLFA 3SEWA 3TTMA 1LGBC 1URGA 4I62A 2I0BA 1FTJA 2XX9A 3DP4A 4NF5B 1XHYA 5A5XB 1HSEA 1ZKBA 2Y7IA 1R1NA 4LZ7A 1RYXA 3FVGA 3W15C 3FGSA 1OMPA 3LSFB 5CBSA 4LUBA 3HHFA 2H98A 3ODBA 4JWYA 3PD9A 3PMXA 2VP1A 1BIYA 3SEYA 4GOTA 4EUOA 1AH5A 3G7WA 4F22A 1A55A 3TYHA 2O1LA 1VR5A 4ZEBA 3TDJA 1A8EA 2Z8EA 3BFTA 4GQOA 5ICTA 2O68A 5I84A 3WAEA 2VOZA 5H8HB 1P1NA 2PBWA 1LLSA 4OTEA 1B58A 4PE5B 1US4A 3WAFA 1A99A 3RGYA 1VFDA 4WKMA 4NWDA 2DVZA 4O3AA 5L9MA 1LBCA 4F39A 3Q25A 1FQCA 4IB2A 3RY3A 3PV0E 1B2HA 3T93B 1POTA 1XC1A 3HSTA 3SESA 4YICA 4NF5A 4OZ9A 1MQHA 5TP9B 3C35A 2P2AA 5A5XA 2QRYA 2O1MA 3RT8A 2Q89A 1ZMGA 3MUQA 5I2KA 5DVIA 4QHQA 4BLAA 1OLCA 4C0RA 3CSGA 4H5GA 4QRZA 1AMFA 3OELA 1GTKA 4DE8A 5BUUA 3E3KA 2PVUA 4YMBA 3DM0A 5I2NB 1FTOA 2H25A 3TAJA 4GFRA 1QUJA 2O84X 4ZECA 2XX8A 4MF3A 5H8HA 3K6UA 4X1BA 4F3SA 3RTFB 4C1TA 3OEMA 2NUVA 2RCBA 2Q2AA 5JTYB 2O69A 5F7VA 3CSBA 2I49A 1TWYA 5HBCA 1N04A 4BDOA 2G93A 3TKDA 3DELB 4NF8B 4TLLB 2DE3A 1UTBB 1YCJA 3TODA 2DVCA 1Y20A 3U93A 4OETA 5AA4B 5FTHA 2P1SA 1BP5A 2AIXA 3PPRA 3UP9A 1Y3QA 1B1HA 1H43A 5TP9A 4NF6B 3RQTA 4U2RA 1IITA 1B51A 3G3GA 1RYOA 3IAZA 3I6VA 1DSNA 3IB1A 2F35A 3VXCA 5CM6A 2F6PA 1MXWA 1NH8A 3H6TA 1IZ1A 1H3DA 4ZDMA 2THIA 4ZEFA 4R73A 4OENA 4FE8A 1L5TA 1JETA 3V83A 5I2NA 4KYEA 4KD5A 4MH5A 4I9DA 1UTHB 1TFDA 2DWAA 4TOZA 2OJTA 1P1WA 2ZNUA 5CBRA 4NWCA 4ELPA 5JTYA 3R7XA 4ISUA 4F1UA 3IJXB 1URSA 4NF8A 1M5CA 3ZSFA 2O6AA 3M8UA 1SW1A 1UTBA 4EDPA 1QUKA 1Y1ZA 5ISUA 2HZKA 3PUZE 4G68C 4GXAA 4NF6A 4G4PA 1BLFA 1H76A 1JW4A 3K6WA 2HCAA 2XD2A 2Q2CA 2PYYA 4KI0E 1MY4A 4DDDA 2AYSA 1MM7A 2LAOA 3EN3A 5DEXA 5HM4B 4RJZA 4G8MA 3T22A 5DVJA 2YJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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