2R6GE

The crystal structure of the e. coli maltose transporter
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structure of a catalytic intermediate of the maltose transporter.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK
total genus 117
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r6gE01
3ECRA 4K3FA 3LSFB 3OSRA 4EQ9A 1B5JA 2Y7RA 1B6HA 1NNTA 3EHTA 4R74A 1MXVA 2Q88A 3UA8A 3IO6A 2XXTA 1B7HA 4R6HA 4X9TA 2PVUA 3EF7A 5DTBA 2OK2A 3FVKA 4ZS9A 4OHNA 5JEIA 2HCAA 3F11A 5CMBA 4RXLA 1JVYA 4I62A 4ZE8A 4U23A 4JSDA 1B9JA 2VGQA 1MPDA 3OEMA 3PMWA 4FE8A 4RY1A 4M4GA 3H6VA 2I0CA 1MQGA 2ZMBA 1TT1A 4GL0A 4F19A 5I2KA 3VVFA 1MXYA 3H03A 3TCGA 3U1OA 3C35A 1TWYA 4JDFA 3N94A 3MVWA 5H8FA 3MP8A 2H9BA 4ESXA 4G77A 1I6BA 2PYYA 2GH9A 2RCBA 1LGBC 4ZZAA 1R6ZA 1N04A 1BKAA 4ND9A 2DE2A 4XKNA 3A3UA 4KYSA 4R6KA 1FQAA 1ELJA 2ZYKA 3K6XA 3OO8A 1D9YA 5DVJA 2LAOA 1SDXA 5I2KB 2G29A 3U72A 3N5LA 3KJ7A 2XXQA 3A3CA 2X7QA 3MP6A 2R71A 3PPPA 1MPBA 2OZZA 1IEJA 2GHBA 2I3WA 3OELA 5H8FB 4QFPA 3BFTA 3FVOA 1B4ZA 5JK4A 3OO9A 4U1ZA 1B58A 1XS5A 5BUUA 3SEVA 3UN6A 4P0GA 5F7VA 3V89B 1I6AA 4F2OA 3CFZA 4DZ1A 1EH3A 2Z8DA 3TQWA 2P1SA 3T9VA 3K1NA 2QMWA 5CMCA 1VFDA 4ZEFA 5BWJA 1IQ7A 4KCDA 1Y4CA 4MLVA 3LSXA 3PPRA 1RYOA 3IOUA 3MBPA 1RYXA 2ANJA 4QFKA 2DP8A 3VXBA 4XKRA 3WAEA 4YKKA 4DCXA 3GBBA 1O64A 2H98A 2PBWA 4LQ5A 4GRKA 5FTIA 2NWJA 1LB8A 3MW0A 3TAJA 1B52A 2O7IA 4XKPA 2AL4A 1OIBA 1VE4A 2OLBA 3HSTA 3K00A 1A8FA 3FVNA 4KPTA 4F22A 1KWHA 2O68A 5TU0A 4IY6A 3EQ1A 4BLAA 2GFEA 3TUSA 4AQ4A 3PD8A 4QSEA 3U8QA 4QSDA 4RPNA 4TLLB 3TZAA 1TFDA 3SEYA 2I0BA 1LCFA 3OENA 3T9XB 1FTLA 2DWAA 4N6PA 2F7AA 5ITPA 4AB5A 2I58A 2XXRA 4H1XA 1MDP1 3K02A 4LA9A 1ZIUA 4R9FA 2Y7WA 1B0HA 1S7YA 1B1XA 1JQFA 3H6WA 4YB7A 2IA4A 1OQHA 3B6TA 4XXUA 4F3PA 1MRPA 2DXYA 4RK2A 3RN8A 2O51A 1IXCA 4GQOA 4RPOA 1ZKBA 3PUZE 1B5HA 2M8CA 3GXAA 1O7TA 4RA1A 4ZE9A 2XXHA 1N7XA 2W7YA 3PUVE 2F5XA 3PUWE 3IR1A 4PETA 1PC3A 3BBRA 1DMBA 1NMUA 1FW0A 1QULA 1Y1ZA 4HW8A 3W9WA 4UACA 3VVEA 5CBRA 2UVJA 4MLQA 3C9HA 4NF4A 4G68C 3KBRA 1P1UA 3MP1A 4MF3A 3KN3A 2PT1A 1MXUA 1LLSA 3Q29A 3OOAA 4GVOA 1DPPA 5I56A 1NNFA 5CM6A 3SETA 5L9OA 3C31A 2XX9A 2DE4A 2D21A 1D3KA 4H8JA 2VD2A 4OESA 3VDFA 4O3CA 4GFRA 4C0RA 1B3HA 1IITA 4WXJA 4NF4B 2ZNTA 2Z23A 3UIFA 2RINA 5B70A 1MXZA 3CIJA 3DP8A 3G3GA 3R6UA 1N76A 5I57A 2QS3A 1URGA 4GD5A 3FXQA 3PUXE 4GF8A 2UVIA 1MY2A 3TKDA 5I56B 1LAGE 4MBPA 3MUQA 3R7XA 1B3LA 3U94A 4NEDA 3IOWA 1A55A 5FHOA 1GGGA 2I4BA 1DOTA 1ZU0A 2QS4A 4H65A 2UVGA 1VSOA 2Q89A 3LBSA 1ATGA 1MS7A 5M2VA 1ZMGA 2PX1A 2F34A 5I57B 3L6HA 1B05A 3VXCA 1IXIA 4F3SA 2FA7A 5I2NA 4HTGA 4KR5A 4TLMB 3B7DA 4H5GA 1N0TA 3VV5A 3QIMA 2X26A 3FVGA 3IB2A 4JXIA 1MH4A 5ISUA 4U2RA 3ILTB 2QRYA 2GRVA 4R72A 2QS2A 1H44A 4N13A 3KSJA 1CB6A 3OMBA 5H8QA 4Q8RA 2RC9A 5I2NB 4IO6A 3FASA 4ONYA 4OWDA 3FZVA 5EYFA 4H0WA 3K1PA 1JEUA 1USYE 4JSOA 1GVCA 1PB7A 3JYRA 3S9MC 2F36A 3FXRA 5DVIA 1L5TA 4KHZE 4R2BA 5CC2A 3RY3A 3TYHA 3VLVA 3QSLA 4G2ZA 1B2HA 1QUJA 1B32A 5H8QB 2IEEA 3VLUA 4IO3A 3UP9A 2ONRA 3C4MA 4YB6A 5FTHA 3ZS6A 4EQBA 4POXA 5AE4A 2VD3A 3Q28A 4PQJA 3I3VA 2Y84A 4QF9A 1B0LA 5FHMA 1M5DA 3O2AA 3M3KA 3TDJA 4OYVA 3FXUA 3PUYE 4QSCA 3IJOB 3KGCA 3MPKA 2G93A 3USDA 2DXRA 2Q8JA 3H6TA 3CG3A 4NWCA 1A54A 5LOMA 3M3LA 1J1NA 2ZXTA 4LZ5A 4OTEA 3IK6B 2XXUA 2OWSA 2DYXA 1QW0A 1HSLA 5CMKA 2UYFA 3QUFA 4Z0IA 5IAIA 2H25A 3TEPA 3EPEA 2HFBA 2HZLA 2I3VA 5EHMA 2CMOA 2NOOA 3MPLA 3M3FA 3QUJA 4GXSB 3TCHA 5CBSA 1DTGA 1BLFA 2PT2A 1PBQA 5AA2A 5J1DA 5I59A 1SW4A 1PBPA 1ANFA 3DM0A 2DQVA 1YPNA 1B46A 3SERA 4EXLA 1OQGA 2AIXA 1S50A 1JETA 1MPCA 4PP0A 3SESA 4IO2A 2YLNA 4C1TA 4KQPA 5AA1A 4X1DA 2F97A 1MY3A 2XD3A 1JW4A 4FORA 2AYSA 3CI8A 1P1WA 3QK6A 2A5TA 3U93A 1URDA 3TELA 1IXHA 5AA2B 1QUKA 5I59B 4RYAA 3TTMA 5KCJA 4GOTA 3V5AA 4OFOA 2XXXA 4YAHX 1EU8A 3MAMA 1N7WA 4THIA 1SBPA 3CSGA 3W15C 3FJMA 1T0KA 4GXAA 1ZTYA 3HN0A 1IZ1A 3GLBA 4NMYA 3JZJA 1B3GA 4YKPA 4EDPA 2A5TB 1B7UA 5JTYA 1R9QA 5TPAA 2Y7IA 2E1SA 4U22A 1ZLQA 1FTJA 4H8IA 1MQJA 4ELQA 1OVTA 5KCJB 3HHGA 2Q9TA 4G8HA 4R6YA 1N3WA 4R75A 1CE2A 4F1YA 4POWA 1XVYA 5DT6A 2KLFA 4YU0A 2THIA 4DXUA 3H6UA 3QXMA 4E0WA 3TQLA 4NWDA 3O6GA 4FATA 4LP2B 1XVXA 5JTYB 5TPAB 4BDMA 4C1UA 3KN7A 1A7LA 1YCJA 1MG1A 4TOZA 2V3TA 2RCAA 4I1DA 2RC7A 5CRYA 1P1NA 3UORA 4ZZEA 4GL8A 3Q27A 3G3FA 1Y9UA 3RGYA 4FJPA 3S9NC 4LZ8A 4KFQA 3RTWB 1LFGA 1PB9A 4R2FA 1DTZA 1WDNA 3PV0E 1NH8A 1Q35A 2ZYOA 3EN3A 5IKBA 2ONSA 4OZ9A 1UTHA 2H5YA 4U1OA 3S9LC 1DSNA 2V93A 4OFJA 5AA2D 3MWBA 1SQYA 3E9XA 3SKPA 3P7IA 2B3FA 3O6HA 4Z7EA 2XXIA 3O97A 3PMXA 5F1QA 3HPIA 4MFIA 4YKJA 1OVBA 4E0XA 4P0IA 5H8HA 1MQHA 3ODBA 3RLFE 4DXCA 4F39A 3KG2A 1UTHB 2ZNSA 5CI5A 1IIWA 4WEDA 2NVUB 1MY4A 3VVDA 1JW1A 1SD3A 4HCYA 4IB2A 2R9JA 3MJNA 2Y7PA 3CFLA 3KN8A 2O7UA 5H8NA 1LAFE 2I4CA 3KOTA 3UGWA 1AH5A 4PFTA 1LCTA 4YICA 1A99A 5H8HB 1LFHA 1FTOA 1Q1KA 2DWHA 5I84A 4JWYA 5ITOA 5HM4B 3FATA 3T9HB 2RKMA 1XC1A 2O6AA 3E4RA 4XTCQ 4ECFA 3ZKLA 5H8NB 4RNSA 4O3BA 3K1MA 5ICTA 4QHQA 1O63A 3ONMA 1A8EA 4LATA 4YMBA 1EZOA 1FTKA 3PPOA 1JNFA 1ZBMA 3KOSA 1NNPA 5H8SA 4EQ7A 4NTLA 3VFJA 2GHAA 1B7ZA 3IX1A 1B1HA 3K6VA 1TXFA 5HPQA 3CFXA 3K4UA 3CSBA 2V3UA 4JWXA 4F1UA 1NKXA 3LSLA 4LONB 2H4IA 4Q0CA 3AXFA 1P1OA 3SDFA 3FD3A 3O6IA 1PEBA 2BJJX 2F78A 2F6PA 4F3GA 1H76A 3IORA 1Y3PA 1URSA 1NH7A 3E3KA 4OERA 4KD5A 4R9GA 5A5XA 4JBZA 3ILUB 2ONKE 4KYEA 4ZEIA 3SEXA 3TTKA 3GZGA 4PFYA 2B65A 2UXAA 2F6GA 3TTRA 2FNCA 2VHAA 4EXKA 2PMSA 4GWOA 3RUMA 4TQUQ 1B3FA 1LSTA 3E13X 1BP5A 1I69A 3Q25A 4QFOA 1II5A 3D4CA 2REGA 3T9UA 4QFNA 3PD9A 4DCYA 4IO5A 3I5OA 2Z22A 3RT8A 4DE8A 5A5XB 4OFLA 2DOJA 1HSEA 3FGSA 4ZEKA 3PPNA 2WKYA 1FCKA 4OXVA 4N07A 5L9SA 5TP9A 2OCUA 4M1VA 3TTNA 4F1VA 3U92A 1POY1 2HXWA 3TFLA 4BDNA 3IB0A 4NF5A 1B4HA 2VP1A 4NF6A 2Z8FA 2QSXA 3MZ9A 5L9MA 3N6TA 2QL3A 2DWIA 2DSFA 5K2XA 1PB8A 1S9TA 1ZJLA 3HHFA 2XXVA 4F3BA 5L8DA 4X48A 4LVQA 4OVJA 1TFAA 3V8XB 1IUDA 1NL5A 5TP9B 1P99A 4U4SA 3H3GA 3T66A 3BFUA 1MM7A 2A5SA 4PFWA 1LBBA 4BDOA 4PFUA 4U4XA 5K2YA 2H99A 4NF5B 3B6WA 4NF6B 2Z8EA 3S9EA 3LSWA 3JV9A 3ZSFA 1FQDA 4OETA 3CRBA 4JWOA 3G3HA 1H3DA 1Y20A 2F7CA 3OO7A 3G3JA 3I6VA 3M8UA 5AA4A 1MQDA 4FEBA 4ZEDA 2Q2CA 4G4PA 4GLIA 3K6WA 1VR5A 3OXNA 3H4ZA 3H7MA 1PDAA 1FQBA 2XD2A 2XXPA 4ISUA 1FQCA 2HAVA 3HV1A 4FECA 1MQIA 3WAFA 1SW2A 2QPQA 2OJTA 3MVZA 4UA8A 1DPEA 5KZTA 2DS9A 4R73A 2I49A 3W9VA 5AA4B 1FQFA 2CZLA 3OO6A 1QUIA 2DVCA 4XKQA 1N3XA 3QYTA 3PU5A 3L6GA 4ELOA 2DWJA 2R6GE 1US4A 1SI1A 1NFTA 1Y3QA 3MQ9A 4DDDA 4FAJA 3A09A 3IB1A 3MVYA 2ABHA 2O1LA 2REJA 1UTBA 4Q30B 2V3QA 5ELVA 1JVXA 2DVZA 1WODA 4OMBA 3MC2A 4ESWA 3TMGA 5B7DA 1LAXA 3O28A 1AMFA 1GTKA 2HEUA 4AB6A 1M5FA 1D9VA 1VFEA 3LR1A 5FHNA 3C32A 1HSJA 1SVXB 3EHUA 1IXGA 1OLCA 1B40A 3K0VA 1UTBB 1GR2A 1QKAA 3DP6A 3UK4A 3OSQA 4H67A 5EHSA 4F2QA 4OENA 4LZ7A 3LC8A 3RTFB 3S2VA 1SI0A 2QJEA 1MDQA 4NF8A 3PPQA 4H6DA 2OBGA 1OMPA 3HCQA 4OEVA 1AIVA 3IOVA 2YJPA 2Q2AA 1MXWA 4YB5A 4OEUA 3TPAA 5DYHA 1OLAA 2RF1A 3DP4A 4WKMA 2D3IA 1JW5A 4RK9A 1H43A 2NXOA 3OEKA 1UIVA 4ZDMA 2F8DA 4FEDA 1BIYA 3DLNA 4NF8B 4LQ2A 1Y4TA 4BDQA 2OWTA 2D5WA 2I48A 3TTLA 3RPWA 1N84A 1MM6A 2F35A 3LUYA 4ELRA 2XX8A 2XXWA 3TODA 3HO7A 2X7PA 1QVSA 1AL3A 3G3IA 4PE5B 5I58A 3R26A 4H5FA 3KFMA 3OD7A 3IJXB 2RC8A 3O66A 1LAHE 2HZKA 2DE3A 3MVXA 3VE1B 2AL5A 2QS1A 2P0SA 4L17A 1M5BA 2P2AA 2O84X 3T22A 1XHYA 4G8NA 1M5EA 1LB9A 1FTMA 4ZEBA 4HCWA 1MY1A 2XX7A 3KSXA 5ICQA 2HAUA 3BKIB 1SYIA 1Z7NE 3C33A 1Z7ME 2UYEA 3ZKKA 4X1BA 2QMXA 3RNNA 1BTJA 4IO7A 1B3EA 3KZGA 1Y1MA 1RKMA 3N6UA 4EF2A 3FV2A 1MY0A 5I58B 3THIA 4JB7A 2V25A 4DXBA 3VLWA 4WEPA 4IGRA 1B51A 1LBCA 4QFLA 2ZYNA 1P1QA 3MZBA 1SW5A 3DELB 5KDTA 1B5IA 4YZZA 2FYIA 3CR9A 4BDLA 1H45A 4ELPA 4BDRA 4RJZA 4OQOA 3QAXA 3IAZA 4EUOA 1F9BA 3H06B 1QJMA 3TCFA 4I8CA 4KCCA 3IL1B 3K01A 4DIGA 3Q26A 3V83A 5DVFA 2VOZA 1I6QA 3N26A 3PGFA 5AA3A 3KJTA 1YAEA 5KDTB 1MXXA 4O3AA 3G3KA 4Q5TA 1XOCA 4YMAA 4YKIA 4QRZA 3CG1A 4I9DA 1R9LA 1QKBA 3IO4A 4FIMA 1FQEA 4F29A 4NE4A 4G8MA 5HBCA 2ALUA 2UVHA 1UIUA 1XT8A 2E0SA 4F31B 4IY5A 2ZYMA 4DLDA 2ZNUA 3S4UA 4G68A 2O69A 4GIZA 3KEIA 2XXYA 4KYDA 2NUVA 3RQTA 1GV8A 3FIRA 3FJGA 1JEVA 1SYHA 1AOVA 4EF1A 4ZECA 4LUBA 3FV1A 5CMMA 3RT6B 1Y3NA 1US5A 3GBAA 3G7WA 3O29A 3T96B 1WVJA 3C34A 1NNKA 2HQ0A 3C36A 1EZPA 4HS7A 2YPNA 3SEWA 4G68B 1UQWA 3SEUA 4IGTA 3FUZA 4IO4A 4KI0E 5DEXA 1A40A 1POTA 2F7BA 2I6EA 3EHSA 3IOTA 4P11A 4MH5A 4XIGQ 1SW1A 2B3BA 3MZ1A 1D4NA 3CVGA 1R1NA 3PMVA 3B6QA 3O9PA 3K6UA 2O1MA 3D4GA 4U21A 2XHDA 2ESNA 1YTVA 1M5CA 3FJ7A 3T93B 2V84A 4F18A 5DEXB 1LFIA 2Y7KA 3K2DA 1EZ9A 1USYH 1MH3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ECRA 4K3FA 3BIHA 3LSFB 3OSRA 4EQ9A 4PTKA 1B5JA 3U65A 4PAIA 4O7IA 2Y7RA 4I3YA 1B6HA 1NNTA 3EHTA 4R74A 1MXVA 2Q88A 3UA8A 3IO6A 1AWBA 4NN3A 2XXTA 1RDZA 1B7HA 4R6HA 4X9TA 2PVUA 3EF7A 5DTBA 2OK2A 3FVKA 4ZS9A 4OHNA 3KC1A 2HCAA 3F11A 5CMBA 5JEIA 4RXLA 1JVYA 2B4MA 1IMAA 4I62A 4ZE8A 4U23A 4JSDA 1B9JA 2VGQA 1MPDA 3OEMA 3PMWA 4FE8A 4RY1A 4M4GA 3H6VA 2I0CA 1MQGA 4NHBA 2ZMBA 1TT1A 4GL0A 4F19A 5I2KA 3VVFA 1MXYA 3H03A 3TCGA 3U1OA 3C35A 3T0JA 1TWYA 4JDFA 2P3VA 3N94A 3MVWA 5H8FA 3MP8A 2H9BA 4OVQA 4ESXA 4G77A 1I6BA 5IZ3A 2PYYA 2GH9A 3BIGA 2RCBA 1LGBC 4ZZAA 1R6ZA 1N04A 1BKAA 4ND9A 2CZIA 1IMBA 2DE2A 4XKNA 3A3UA 4KYSA 4R6KA 1FQAA 1ELJA 2ZYKA 3K6XA 3OO8A 1D9YA 5DVJA 2LAOA 1SDXA 5I2KB 2G29A 3U72A 3N5LA 3KJ7A 2XXQA 4GWYA 3A3CA 2X7QA 4GWUA 3MP6A 2R71A 3PPPA 1KA0A 1MPBA 2OZZA 1IEJA 2GHBA 2I3WA 4MIJA 4OVSA 3OELA 1FBHA 5H8FB 3LUZA 4QFPA 3BFTA 3FVOA 1B4ZA 2PFZA 5JK4A 3OO9A 4U1ZA 5IZ3B 1B58A 1XS5A 5BUUA 3SEVA 3UN6A 4P0GA 5F7VA 3V89B 1I6AA 4F2OA 3CFZA 4DZ1A 1EH3A 2Z8DA 3TQWA 2P1SA 3T9VA 1SPIA 3K1NA 2QMWA 5CMCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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