4KI0E

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to maltohexaose
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABC transporter related protein
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ki0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ki0E01
5I84A 2A5TB 4AB6A 1MXVA 1B58A 5CRYA 2M8CA 3MAMA 4NF5A 1OVBA 3Q29A 2FNCA 1MS7A 4FJPA 4POXA 2Q2AA 4YICA 4OQOA 1SW1A 3ODBA 3KBRA 3RPWA 2DQVA 3O2AA 1KWHA 3SEWA 1B9JA 2NWJA 3OD7A 5ITPA 1FW0A 2DYXA 4F39A 3VLVA 3KN3A 1QUIA 3KOTA 1NH8A 1NMUA 5TPAA 1MQJA 4NMYA 2ZMBA 1Y9UA 2Y84A 5JEIA 3LSXA 3S2VA 2ESNA 2XHDA 5L9MA 3Q25A 4LATA 1JW5A 1LFHA 4F1VA 3K0VA 1B7UA 2ONSA 3OO8A 2F6PA 2Z23A 4Z0IA 3SETA 4NF4A 3DP8A 4ZE9A 5I2NB 5I59A 4PFYA 3TTKA 1B46A 1B32A 1VFDA 3TQWA 4OENA 4YKKA 4JDFA 5TP9B 3HHFA 1YCJA 1DTZA 3PV0E 3EHTA 3PMVA 5H8NA 1UQWA 3IJXB 4NF5B 5AA2A 2F7CA 3FUZA 5CMKA 4OZ9A 3TTNA 3PD9A 3E4RA 1MQDA 3PMWA 1N3WA 3IJOB 4OFJA 3BBRA 4ZDMA 1PC3A 3MC2A 1MXXA 5DVJA 4RPOA 4ZZAA 4H6DA 1VFEA 3EHSA 4QSDA 2D3IA 2I6EA 3PUWE 3VVDA 2BJJX 5ELVA 4KI0E 2QS4A 1T0KA 1SI1A 1XOCA 4IY5A 3N6UA 1PBQA 3V83A 4O3BA 4JWOA 5TPAB 4XKNA 1MXZA 4QFKA 3B6TA 3PPPA 4DXCA 4IGRA 1ZMGA 1JW4A 3OELA 5DVIA 1TT1A 3VVEA 3PUVE 4ISUA 3U72A 4I62A 3HN0A 2I0CA 3TEPA 3R26A 5BUUA 3LSLA 3TKDA 4NF4B 4O3CA 2XXTA 3IO6A 4MH5A 4I9DA 2RCBA 1PB8A 3R6UA 5I59B 1EZPA 3K1NA 4U4XA 2NVUB 3MPKA 4ZEKA 2XXRA 4OTEA 2QS1A 4P0GA 2RINA 1EZ9A 4GWOA 5H8NB 3F11A 1B7ZA 5DT6A 4YU0A 1XVXA 2XX9A 1P1NA 5AA2B 3U92A 1B3GA 4JXIA 2P1SA 4TLMB 2XXWA 4ZEBA 5AA4A 3KFMA 1R6ZA 4U1ZA 4DLDA 3MZ1A 5CC2A 3HO7A 1XT8A 3V5AA 1S7YA 1A54A 1FTKA 2DXRA 4C1TA 5ICTA 1N04A 1IXHA 1POTA 3U1OA 3ZS6A 4L17A 1H3DA 4RXLA 3OENA 2IEEA 4OVJA 2I4CA 4RNSA 4IY6A 3M8UA 1A7LA 4RK9A 4XTCQ 1P1OA 4ECFA 4UACA 3CIJA 1SW2A 3O6HA 2Q88A 3CG1A 4C0RA 3I5OA 4QSEA 1LCFA 2VGQA 4YB5A 3CSGA 2NUVA 2ANJA 3IOWA 4OXVA 1MDQA 3K1MA 3TCHA 3A3UA 3H06B 4FECA 3RTFB 2ZNSA 3CFZA 1SVXB 1ZLQA 4H5FA 5AA1A 5IAIA 2XX7A 3VFJA 2P2AA 2Q2CA 5TU0A 4AB5A 4R6YA 4BLAA 1D9VA 3FJ7A 4GOTA 3PUZE 2V3QA 3BKIB 1US5A 4LVQA 3JV9A 4IO6A 1ZKBA 3PPQA 1ZTYA 5AA4B 5HM4B 1NFTA 2O7UA 4QSCA 1B1HA 3TCGA 3MBPA 3UORA 1EU8A 1AIVA 2V25A 4NE4A 5JK4A 1B5HA 3FVGA 3MVYA 5ICQA 1MM7A 3FASA 3EQ1A 3MQ9A 1QJMA 2XXHA 4YMBA 3H6WA 4GD5A 4LP2B 2H4IA 2DOJA 3H6VA 1H76A 2F34A 1URSA 3IK6B 1RYOA 2DXYA 3R7XA 1JVYA 4NWDA 4FEBA 1JNFA 4XKPA 1P1UA 4EXLA 3THIA 2Y7RA 2QRYA 4P11A 1NL5A 5BWJA 3M3FA 3G3KA 3S4UA 1RYXA 3QAXA 2E1SA 1L5TA 1SW4A 1B4HA 4ZEDA 1WDNA 1LFGA 2F36A 1NKXA 4M1VA 1OLAA 1MM6A 2DSFA 5ITOA 2Z8FA 4MLVA 3VLWA 1B0HA 3T9VA 3IR1A 2Q89A 2HEUA 3FJGA 5K2XA 1O63A 1FCKA 5DEXA 4N6PA 4EQ9A 5KCJA 3IB0A 3H7MA 4LZ8A 1N84A 3IOTA 1Y1ZA 3FXQA 2I3WA 3EN3A 1LAXA 1A8FA 2R71A 3PD8A 2PT1A 3SEXA 3PPNA 2GHBA 3IB2A 4R75A 1PB9A 4PFUA 1CE2A 3K6VA 2I0BA 2O1LA 1LAHE 2REGA 5A5XA 4F1UA 3L6GA 3OO9A 3SEVA 4F3GA 4HTGA 2XXVA 3W15C 4N13A 3SESA 3O66A 3K6UA 4H5GA 4EQBA 1OQGA 1HSEA 3WAFA 1H45A 3W9VA 1D4NA 4YKPA 1M5BA 1MY0A 1AOVA 1HSJA 1Y4TA 2VD3A 4K3FA 4G8MA 2OJTA 1MQGA 3MP6A 2ZYKA 3HPIA 4F3PA 2GH9A 1A99A 5DEXB 5H8HA 5KCJB 4MFIA 1MY2A 2ZNTA 3IO4A 3O6GA 2I58A 3KN8A 2OZZA 3MZ9A 3T96B 2ZYOA 1ZBMA 5EHMA 1ZIUA 3CR9A 3GLBA 5K2YA 1FQBA 2NOOA 2O69A 4GIZA 4OERA 4G68A 4NF8A 1IQ7A 1QW0A 3G3JA 5I58A 5KDTA 3UK4A 1A8EA 4NWCA 3SKPA 3OO6A 4BDRA 5CBSA 5A5XB 4XKRA 2W7YA 4R2BA 2I48A 4GRKA 3FXUA 4F29A 2A5SA 3MVZA 2I3VA 3OMBA 3PPOA 4ZZEA 4QFOA 4IO4A 4OFOA 2XXXA 3E3KA 4OMBA 4N07A 5CBRA 3TTLA 3EF7A 4E0XA 1TFDA 1O64A 4ZECA 2G93A 1Y3PA 3MP1A 4RY1A 1MY4A 4MLQA 1D9YA 4RYAA 3IOVA 3OSRA 4F2OA 3KJTA 3N5LA 3M3LA 3C4MA 1N7WA 1MG1A 1B4ZA 3FVOA 3MZBA 5H8HB 4EQ7A 3T93B 4GXAA 4GLIA 2OCUA 5DVFA 4G4PA 3FV2A 5L8DA 2XD2A 4LUBA 5I57A 1MXWA 2XXPA 3T9UA 2HFBA 2YJPA 5CMMA 1Z7NE 1IXIA 4G68B 4NF8B 3H6UA 3IOUA 3TCFA 1B2HA 4THIA 5I58B 3QK6A 5KDTB 3CRBA 3T9XB 3QUJA 1B40A 1Y3QA 2H5YA 1R1NA 2H25A 4OESA 2R9JA 2AIXA 4I1DA 3M3KA 2QMWA 4G8NA 4KD5A 3K6WA 4XKQA 1VSOA 1DOTA 2F7AA 4LZ7A 1XS5A 1PDAA 3OXNA 3OSQA 2D5WA 2QSXA 3CVGA 3KZGA 2OWTA 1BTJA 1OLCA 4FE8A 4QHQA 1SI0A 2G29A 3V8XB 4FIMA 1UIVA 5AA2D 1MPBA 1SQYA 3H3GA 3C36A 2V93A 3KOSA 5F7VA 4R9FA 2F6GA 1M5EA 1YTVA 2VP1A 1UTBA 2FYIA 4ND9A 1I6AA 1B3LA 5I57B 3PU5A 2Q8JA 4KQPA 4ZEIA 3O29A 1TWYA 1QULA 1MPDA 4ESWA 4RK2A 1EZOA 4LQ5A 1I6QA 2VOZA 4R9GA 3QSLA 4BDQA 1Q1KA 1NNTA 4WKMA 3T66A 3KJ7A 1MH4A 3D4GA 3KSXA 3TAJA 3TUSA 1JQFA 4JWYA 1QVSA 2OK2A 3TMGA 5AA3A 2HXWA 1B6HA 1NNFA 4PP0A 2DWHA 1DSNA 2CMOA 2P0SA 1QUKA 4KPTA 4FATA 3MPLA 2NXOA 1OVTA 5FHNA 1LCTA 2ZXTA 2V3UA 4PE5B 3LSWA 4OYVA 3RT6B 4X1DA 4PFWA 1D3KA 1UTBB 2Q9TA 4WEPA 1QUJA 1S9TA 3V89B 3SDFA 1LLSA 1UIUA 5IKBA 2DS9A 2GHAA 4FAJA 3O97A 2UXAA 4Q30B 1JVXA 3RUMA 4YB7A 2Y7WA 2Y7PA 5CM6A 1SDXA 5CMCA 3MWBA 2VD2A 1MPCA 3OO7A 4IB2A 2DE3A 1B52A 1MQHA 4HCYA 4U23A 3KSJA 3C33A 4X48A 2DE4A 1N7XA 2XXQA 1GVCA 3VV5A 4EF1A 4M4GA 3TELA 1OIBA 3I3VA 2I4BA 2F5XA 1TFAA 2RC7A 4R2FA 1TXFA 4H65A 1GTKA 5HPQA 4H1XA 4TQUQ 2DWAA 1BP5A 3KGCA 2PVUA 3P7IA 3BFTA 1IEJA 1ELJA 3L6HA 3C35A 3VXCA 1JETA 2O6AA 4ELOA 3TPAA 4NF6A 5H8FA 2XXIA 3TZAA 4G8HA 3T9HB 3USDA 3EPEA 4ZEFA 2UVJA 1FQEA 4QFNA 3LUYA 3RLFE 4OETA 1O7TA 4ELRA 2UYEA 5L9OA 1URDA 1Q35A 1B3FA 1MDP1 1M5FA 1M5DA 2CZLA 3QIMA 1XVYA 4PETA 4GQOA 3TTRA 4EXKA 2FA7A 2DVCA 1BLFA 3E9XA 4QFPA 3O9PA 4AQ4A 5JTYA 3GXAA 2YLNA 5J1DA 4EDPA 3RGYA 3CI8A 3FGSA 4TLLB 4DCXA 1IITA 1SW5A 3U94A 3Q27A 3ECRA 1N3XA 4DXBA 5EHSA 4QFLA 4XIGQ 3ZSFA 3FZVA 1FQDA 4HS7A 1SD3A 1IZ1A 4DZ1A 1DMBA 2V84A 2O51A 1ANFA 3T22A 3GBBA 4ESXA 4DIGA 3LBSA 4ELPA 4Q8RA 1Y3NA 1LBBA 4XXUA 4NF6B 1FTOA 5H8FB 2Z8EA 2QMXA 1FTLA 3G3IA 4ONYA 3C34A 3MP8A 4F3SA 4R74A 3G3GA 1GGGA 1B5IA 1POY1 3PGFA 1LBCA 3AXFA 3CSBA 3FATA 4I8CA 1R9QA 4Z7EA 1S50A 1AMFA 1VR5A 3K01A 2PT2A 2ONRA 2RF1A 1USYH 1SYHA 2QS2A 4U4SA 4LA9A 1Z7ME 2ABHA 3FVKA 2I49A 5EYFA 2QJEA 3D4CA 1FQAA 2PX1A 3KN7A 5FHMA 5JTYB 1IIWA 3ILUB 2UVHA 3SERA 3DM0A 2UVIA 2B3FA 4FORA 2HCAA 2O1MA 4U22A 4IO3A 3VE1B 3IAZA 2HAVA 2H99A 4O3AA 4R73A 1H44A 3FJMA 3E13X 3EHUA 1EH3A 3PUYE 2YPNA 3N94A 4YMAA 1IUDA 1PEBA 2QPQA 3BFUA 2O7IA 5L9SA 2UVGA 2Z8DA 3K02A 4G77A 3PPRA 3IORA 4KFQA 1P1WA 3UP9A 5AE4A 2Y7IA 3FV1A 4YZZA 4ZE8A 3IL1B 1GR2A 3VLUA 5FHOA 1URGA 3K2DA 4PFTA 2XX8A 4NEDA 4U2RA 1LGBC 2RKMA 3S9LC 2ALUA 3HCQA 3UN6A 3DLNA 4YKIA 4GFRA 2Y7KA 5I56A 1USYE 4F31B 1DPPA 4KCCA 2PMSA 2F35A 5H8SA 1JW1A 3FD3A 1R9LA 3VVFA 3HSTA 4TOZA 1B51A 3UIFA 3HHGA 2DVZA 4DDDA 2F78A 2VHAA 3W9WA 1LB8A 3TQLA 3K00A 2GFEA 3FXRA 4MF3A 4OHNA 2R6GE 3IX1A 5HBCA 4LZ5A 1NNKA 1LB9A 1B3HA 4KYSA 3HV1A 1NNPA 2KLFA 4F1YA 1BIYA 4JSOA 1N0TA 1QKAA 4LQ2A 2RC9A 1QKBA 3LC8A 1AL3A 1ZU0A 5CI5A 3H6TA 2QS3A 1FQCA 4HCWA 4UA8A 4F19A 3H4ZA 1DPEA 4GL0A 2HZLA 3Q26A 2B3BA 2GRVA 4RPNA 4BDOA 3G3HA 1YPNA 4KCDA 4H0WA 1BKAA 4R6HA 2F7BA 2X7QA 2X7PA 3S9NC 4EF2A 2PYYA 1UTHA 1N76A 2D21A 2O68A 4YAHX 2XXUA 5I56B 1MXYA 2HAUA 3GZGA 2B65A 4DXUA 3RNNA 1A55A 1B7HA 1US4A 1HSLA 3TFLA 2DWIA 1GV8A 2RC8A 1FTJA 3FIRA 4G68C 3TDJA 1PB7A 4GVOA 2DE2A 1Y4CA 4U1OA 5DYHA 2HQ0A 4JWXA 2RCAA 4H67A 1H43A 3CFLA 2QL3A 3TTMA 1OMPA 1JEVA 2OLBA 2UYFA 2AL5A 3VXBA 4Q0CA 3PMXA 4GXSB 1LFIA 2Z22A 1JEUA 2REJA 3CG3A 3GBAA 4X9TA 1NH7A 1DTGA 1PBPA 4C1UA 3ZKKA 3LR1A 2AL4A 4BDLA 2ZYNA 2XXYA 4RJZA 3A3CA 5KZTA 2OWSA 2WKYA 4G2ZA 3OEMA 3ILTB 1M5CA 3RT8A 3TODA 3TYHA 2O84X 1UTHB 4QF9A 3DELB 4JB7A 3O28A 5B7DA 4F22A 4WEDA 3C32A 4RA1A 5FTHA 4HW8A 1IXCA 3RQTA 3LSFB 5M2VA 1FQFA 1I69A 1B0LA 3MJNA 3SEYA 3SEUA 5I2KA 3UGWA 4GF8A 1SYIA 2DWJA 1Y20A 4R72A 3O6IA 4IO7A 1LAFE 2THIA 3KEIA 3MVXA 4F2QA 2ONKE 3A09A 4U21A 3MVWA 4YB6A 4WXJA 3H03A 3K1PA 1ATGA 4KHZE 4E0WA 5B70A 1SBPA 2H98A 4MBPA 3IB1A 3WAEA 3KG2A 3UA8A 3ONMA 4NTLA 1P1QA 1AH5A 2PBWA 3I6VA 4JBZA 4P0IA 4LONB 3FVNA 3C9HA 3QUFA 3K4UA 5F1QA 4ELQA 1MY1A 1II5A 2V3TA 1MH3A 2ZNUA 4OEVA 2AYSA 3VDFA 3S9EA 4IGTA 1WVJA 3B6WA 3N26A 1B3EA 1FTMA 5H8QA 2ZYMA 3S9MC 5DTBA 5I2KB 1P99A 2XD3A 1Y1MA 3B7DA 4R6KA 5FTIA 2E0SA 2IA4A 4DCYA 1XHYA 3C31A 1YAEA 4IO2A 4JSDA 4EUOA 2HZKA 3JZJA 3PUXE 1LSTA 4POWA 4IO5A 3RN8A 4X1BA 2DP8A 1MRPA 4KYEA 4OWDA 1IXGA 4F18A 2A5TA 2H9BA 3CFXA 1I6BA 1B5JA 3MUQA 4KYDA 4DE8A 4H8IA 3OOAA 4F3BA 4BDMA 1LAGE 1B05A 4ZS9A 1CB6A 3N6TA 1RKMA 3G7WA 1J1NA 3RY3A 2X26A 3U93A 4OFLA 3Q28A 3JYRA 1OQHA 3MW0A 3B6QA 4QRZA 4H8JA 1MXUA 1F9BA 4Q5TA 5ISUA 3U8QA 3DP4A 5H8QB 1B1XA 3QYTA 5CMBA 5LOMA 3RTWB 4KR5A 1MY3A 4GL8A 3K6XA 4PQJA 2LAOA 2F97A 3ZKLA 1WODA 3G3FA 2OBGA 3DP6A 4FEDA 5I2NA 3OEKA 4BDNA 4YKJA 4OEUA 2F8DA 3QXMA 1VE4A 5TP9A 1ZJLA 1A40A 1MQIA 1XC1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I84A 2A5TB 4AB6A 1MXVA 2F3BA 1B58A 5CRYA 2M8CA 3MAMA 4NF5A 1OVBA 3Q29A 3LUZA 2FNCA 1MS7A 4FJPA 4POXA 2Q2AA 4YICA 4OQOA 1SW1A 3HFUA 3KBRA 3ODBA 3RPWA 2DQVA 3O2AA 1KWHA 3SEWA 5EYGA 1B9JA 2CZKA 2NWJA 3OD7A 5ITPA 1FW0A 2DYXA 4F39A 5I7IA 4N6KA 3VLVA 3KN3A 1QUIA 3KOTA 1FPLA 1NH8A 1NMUA 5TPAA 1MQJA 4NMYA 2ZMBA 1Y9UA 2Y84A 5JEIA 3KC1A 3LSXA 3S2VA 2ESNA 2XHDA 5L9MA 3Q25A 4LATA 1JW5A 1LFHA 4F1VA 3K0VA 1B7UA 2ONSA 4N15A 3OO8A 2F6PA 1NI9A 2Z23A 4Z0IA 2XXKA 2QVUA 4I40A 3SETA 4NF4A 3DP8A 4ZE9A 1FPGA 4NN3A 1FPJA 5I2NB 5I59A 4PFYA 3TTKA 1B46A 1B32A 1VFDA 1XI6A 3TQWA 4OENA 4YKKA 4JDFA 5TP9B 1LBVA 3HHFA 1YCJA 1DTZA 3PV0E 3EHTA 3PMVA 5H8NA 1UQWA 1D9QA 5DW8A 3BIGA 3IJXB 4NF5B 1IMFA 5AA2A 2F7CA 3FUZA 5CMKA 4OZ9A 3TTNA 3PD9A 3E4RA 1MQDA 3PMWA 1N3WA 3IJOB 4N8YA 4OFJA 3BBRA 4ZDMA 1PC3A 3MC2A 1MXXA 5DVJA 4RPOA 2KQZA 4P8BA 3T1BA 4ZZAA 4H6DA 1VFEA 3EHSA 3BIHA 2D3IA 4QSDA 2I6EA 4HXVA 3PUWE 3VVDA 2BJJX 5ELVA 4KI0E 2QS4A 1T0KA 1SI1A 1XOCA 4IY5A 3CHGA 3N6UA 1PBQA 3V83A 4O3BA 4JWOA 5TPAB 5LDZA 5EYHA 4XKNA 1MXZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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