4KI0E

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to maltohexaose
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABC transporter related protein
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ki0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ki0E01
3QYTA 1TFDA 3H6UA 5DVJA 3T9XB 4F29A 4QFOA 4KFQA 4F1UA 2F7CA 3K6WA 1IXGA 3H06B 3TPAA 3SEYA 3RNNA 4FATA 4X48A 1B46A 1URSA 3MZBA 1MM6A 1QUKA 4G77A 1LBBA 4JBZA 4LVQA 1LCFA 3K6VA 2LAOA 5L8DA 1N0TA 3FVNA 3B6TA 3GBAA 2FA7A 4AB5A 4OYVA 1JVXA 3VVFA 1LGBC 2DSFA 4DZ1A 3DM0A 3CSGA 3FXUA 3FVOA 3HSTA 3UK4A 4UA8A 5CMCA 3OOAA 5KDTA 1MY3A 5I2KA 3K00A 2PMSA 3S4UA 1B05A 1B52A 4DXBA 3JYRA 1B4ZA 2O1MA 4P0IA 5A5XB 1LAFE 4U1ZA 3SERA 4XKRA 1T0KA 3IAZA 2H9BA 3C9HA 4H65A 2DOJA 4ELRA 5JK4A 3B7DA 4BLAA 4JB7A 4H67A 4O3AA 2OBGA 1I6AA 3PPPA 2QS3A 4NF6A 3KGCA 1B40A 4OERA 3KSXA 5CBSA 1B0HA 1FTKA 2O1LA 2PT1A 4PFYA 2PVUA 2F7BA 3E3KA 2O51A 4JSOA 3IO6A 4FEDA 4KQPA 4DCYA 3O97A 3M3LA 5LOMA 2D21A 1YPNA 3IOTA 3DP8A 2YLNA 3RN8A 4YB7A 3FD3A 3LC8A 3O9PA 1MXXA 3H6WA 2QS4A 1JETA 4L17A 1URDA 5TPAA 1Y4TA 4OMBA 1MY2A 1B1HA 2Q88A 3LSFB 4OESA 2Q2CA 5I59A 1B3GA 3PPOA 3FASA 4IB2A 3S9LC 3KZGA 3MVXA 4N6PA 5CM6A 4X1BA 3C34A 1MPBA 1AIVA 2QS1A 3IL1B 4RY1A 2UYFA 3MC2A 2QRYA 3OO8A 2F36A 2FNCA 2R9JA 1USYH 4DDDA 1EZPA 1B32A 1LFGA 3KOSA 2XXUA 1R1NA 1QULA 2OWSA 4AB6A 2DWIA 1SYIA 2XXYA 2GHAA 3PPQA 1OIBA 4ZZAA 3UORA 1B58A 2V3QA 4BDMA 4R2FA 1SBPA 4NWDA 1TXFA 4F3SA 4OVJA 5I57B 4ECFA 1QUJA 4ZEIA 2W7YA 3K2DA 4G68C 4IO5A 3JV9A 1R6ZA 4LZ8A 2DXYA 4PQJA 4P11A 4G4PA 4NF5A 3LSXA 3PMXA 4ZECA 3C4MA 1ZKBA 1D9YA 4KI0E 4NWCA 1SW4A 1LB9A 1FQDA 4U4XA 2FYIA 5EHSA 4WEDA 1PB8A 2XD2A 1JNFA 3PD9A 4GOTA 4PFUA 3N26A 2X7QA 4HCWA 3QIMA 3H6TA 3RY3A 1MS7A 1B0LA 2DVCA 5CI5A 1Y4CA 3K6UA 1GTKA 3MP6A 3B6QA 4ZEBA 4BDRA 1LSTA 3CIJA 4EQ9A 3T93B 3USDA 3MBPA 4NTLA 4KD5A 1IZ1A 3GBBA 4KPTA 3E9XA 2XXIA 3TZAA 5K2XA 2ANJA 1MXUA 3LUYA 3N6TA 3FZVA 1JW1A 2XXQA 3RTFB 2O7UA 4F1YA 4OQOA 4ELPA 4I62A 2M8CA 3R6UA 1Q35A 2I3VA 2UXAA 4GLIA 1N7XA 5H8NB 1NMUA 4R9FA 3TAJA 3I3VA 3O29A 3TTRA 2I58A 1SD3A 5KDTB 1IIWA 4MH5A 5B70A 3RLFE 2I49A 1H45A 1AL3A 1XHYA 3L6GA 4JWOA 4QSDA 2I3WA 5I2NA 5KCJA 4ND9A 1M5BA 2QL3A 1B1XA 3CSBA 2V3UA 2VOZA 4M4GA 2Y84A 3KG2A 3G3KA 2Y7WA 3KEIA 3TCFA 4XXUA 4TLLB 1MY1A 2V3TA 3IORA 1B5IA 4NMYA 4EF1A 3VXBA 4G8NA 2I6EA 4MF3A 3Q28A 3SKPA 1OQGA 3W9VA 4ZEDA 5I58B 2B3BA 3O2AA 4O3CA 4GFRA 4GL8A 3IR1A 3VVEA 1IUDA 3CG3A 1LBCA 2Y7KA 1XVXA 3CI8A 3MP8A 3M8UA 4E0XA 2ONKE 3FATA 5BWJA 4LP2B 1Z7NE 2OZZA 4R6HA 4RK2A 1URGA 5TP9A 3LSLA 1US5A 2THIA 2QSXA 2AL5A 5I59B 3FVKA 3OD7A 1FQBA 1A8FA 2QMWA 4G2ZA 4JXIA 1OMPA 1VFDA 1ATGA 4NEDA 4R6KA 4U21A 1LFIA 2IA4A 5AA2A 4H8JA 4YAHX 4OEUA 2ZXTA 2I4CA 4YZZA 2Q8JA 3PUWE 4G68B 1UTBA 4IO7A 1TWYA 2F78A 4YICA 1O64A 3I5OA 5FHMA 2DWAA 3O6HA 1LLSA 4FORA 3IOUA 2A5TB 5AA2D 4YB5A 2O6AA 3U94A 5I84A 3FGSA 4YKIA 4NF4B 5H8FB 2F97A 1MPDA 4R75A 1OLCA 4F31B 3HPIA 5H8QB 4POXA 1Y3PA 1JVYA 2PT2A 2Z22A 3CVGA 3THIA 3V8XB 3BFUA 2DE3A 5DEXA 1FQAA 4MFIA 2QMXA 4R72A 2CZLA 3U1OA 5L9OA 2UYEA 3TTLA 3ECRA 4C0RA 4F18A 4HW8A 1M5EA 1B5JA 2UVJA 2ZYOA 4U22A 1WDNA 3WAFA 3MPKA 4IO2A 4AQ4A 4DXCA 1DOTA 1MY0A 3Q27A 1S7YA 3C33A 3Q29A 3O6IA 1P99A 1A55A 3MVZA 4G8HA 2HCAA 3SETA 2DXRA 3FJ7A 4BDLA 5H8HB 3LSWA 1I6QA 3VE1B 3T96B 3PPRA 3U8QA 2E1SA 2XXHA 3LBSA 2IEEA 4H0WA 1QVSA 3K1NA 1I6BA 4ISUA 3IX1A 1VE4A 1NNTA 3IOWA 1S9TA 1P1QA 3GLBA 3PGFA 5FHOA 1IEJA 1VR5A 3PD8A 1B51A 1RYXA 1R9LA 1BP5A 2XXVA 4OETA 3O6GA 1MRPA 1B7HA 1US4A 3T66A 3OO6A 1SVXB 3QXMA 1EH3A 2O7IA 3BKIB 3KN8A 1N84A 5DT6A 4H8IA 1SI1A 1EZ9A 3K02A 1ZIUA 4KCCA 3EQ1A 2DQVA 4F1VA 1H76A 5M2VA 3HHGA 2VHAA 3G3FA 5CRYA 4OHNA 4C1UA 4GL0A 1FTJA 3D4CA 3MVYA 3VVDA 3ILTB 4X1DA 4GQOA 1HSJA 1QUIA 2RINA 3SEXA 1ZU0A 5IKBA 4OTEA 3S9EA 3HV1A 1SW5A 3L6HA 4NF8B 3Q25A 3TCGA 3CR9A 1B3LA 3IJOB 1BTJA 3RQTA 4QFNA 1MM7A 3EPEA 3OSRA 4JSDA 2YJPA 1DTGA 4MBPA 1Q1KA 1MG1A 1N3WA 4OENA 4FECA 1O7TA 3D4GA 3FV2A 4UACA 3V5AA 4OFOA 4IO3A 2G93A 3UN6A 4EF2A 4ESWA 3DELB 3KJ7A 3PUZE 1MQDA 4OFLA 3EF7A 5JTYA 1PB9A 1GVCA 4QFLA 1UTHB 1LAHE 2O68A 5KZTA 1FTLA 2ZNTA 5I56A 4R73A 4U1OA 1EU8A 3N5LA 1I69A 4RYAA 2X26A 4X9TA 2ONRA 2HXWA 2A5SA 3UIFA 5HM4B 3VLUA 4ZE8A 3FXRA 3JZJA 5CBRA 2I48A 4JWYA 3DP6A 2ALUA 5DVIA 3MVWA 1NNPA 5AA3A 3IK6B 4IGTA 5AE4A 1L5TA 2ESNA 4Q30B 4R6YA 4OFJA 2QJEA 1Y20A 2WKYA 1LFHA 4YMBA 2NVUB 1QJMA 2XXTA 2D3IA 4F39A 1A54A 1USYE 4GF8A 2AL4A 3ZKLA 1PB7A 1J1NA 4ZDMA 3EHSA 1OQHA 2NOOA 4GWOA 1SQYA 1YTVA 2OLBA 3FJGA 4K3FA 3H6VA 4C1TA 2OJTA 2O69A 5K2YA 1HSEA 2R6GE 1II5A 4PETA 5AA1A 4DLDA 5F7VA 3QUJA 4E0WA 1UIUA 3H7MA 1MXZA 3PUXE 2F5XA 2XHDA 1SI0A 4HTGA 4TLMB 4PFWA 1MY4A 1DPEA 2P2AA 4R2BA 2RKMA 3RT6B 5DVFA 4KYDA 2YPNA 3HCQA 4RA1A 2Y7RA 3GXAA 4YMAA 4ONYA 1Y3NA 3O28A 3OMBA 1IXCA 3HO7A 3TEPA 2DWJA 4WEPA 1OVBA 1Y1ZA 2OCUA 2OWTA 1BLFA 2GH9A 1AMFA 1OVTA 1KWHA 3IB0A 5A5XA 1MQIA 2XX9A 2QS2A 5ICTA 3A09A 4OZ9A 1NFTA 4U2RA 3PV0E 3RPWA 1POY1 3K4UA 1H43A 1FQFA 1YCJA 2RC9A 1P1NA 2PBWA 4OWDA 4RNSA 1B2HA 5I2KB 1LB8A 3BBRA 1B3EA 1IXHA 3PUYE 3T9HB 3RTWB 3TKDA 2ZYMA 1SW2A 3P7IA 3TCHA 4RPNA 3ILUB 4U4SA 3FVGA 4YB6A 2V84A 3AXFA 3K01A 1D3KA 3G3JA 4XKPA 4QSEA 4ESXA 1P1OA 1CE2A 1SDXA 4NF6B 3A3UA 1BIYA 1PDAA 1NH8A 4U23A 2HFBA 4LZ7A 3IJXB 1NNKA 3ZS6A 3OO7A 4QFPA 3TTKA 2XX8A 3B6WA 3S9NC 3FJMA 1A99A 2G29A 4P0GA 4EDPA 2REJA 4LQ5A 4GRKA 2KLFA 2DP8A 1A8EA 2RC8A 3VLWA 2Z8DA 3Q26A 3VXCA 3T22A 3IOVA 1O63A 1MH4A 4THIA 3S2VA 2DWHA 3HHFA 5TPAB 1N04A 3S9MC 2RC7A 1D9VA 3QSLA 1Y1MA 3TQWA 4LQ2A 4Q8RA 4KHZE 5I57A 3V89B 3KBRA 5FTHA 1XT8A 4XKNA 3ZKKA 2VP1A 1H44A 1IXIA 4N07A 5FHNA 4RJZA 5ISUA 4KCDA 1WODA 1OLAA 1GGGA 2H99A 3F11A 3RT8A 3SDFA 4ELQA 3A3CA 3ONMA 3CFLA 2VGQA 4IO6A 1FCKA 3OXNA 4HS7A 3MWBA 3TTMA 4QSCA 1PBPA 3IB1A 1PC3A 4ELOA 1QW0A 4F3BA 2GRVA 1RYOA 4BDNA 4H5FA 2RCBA 3H03A 1P1UA 4IO4A 4YKKA 1LCTA 1PBQA 2Q9TA 3K1PA 4FAJA 4NE4A 5ELVA 1B5HA 4NF5B 3MW0A 4EUOA 5AA4A 1LAXA 4O3BA 2XD3A 4F3PA 1DSNA 3RGYA 3MJNA 2ONSA 3MZ1A 5IAIA 2UVIA 4EQBA 4GIZA 1SYHA 2HAUA 1JW5A 2HAVA 2I0BA 4PE5B 1ZBMA 2Y7PA 5FTIA 4I8CA 2ABHA 3MQ9A 4Z0IA 4YKJA 3PMWA 5CMBA 4TOZA 2Y7IA 4XTCQ 4R9GA 1HSLA 2XX7A 2AIXA 5ICQA 3ODBA 4F2OA 1JW4A 2F7AA 2Z8FA 3W9WA 1MPCA 5H8NA 1ZLQA 3RUMA 3G3IA 1MQGA 3M3FA 2F6GA 2F6PA 3PUVE 1JQFA 1UQWA 4DE8A 4EQ7A 3PU5A 2PX1A 3C35A 4GXAA 3GZGA 2F8DA 2ZYKA 1LAGE 4F22A 1ZTYA 2H5YA 1CB6A 2UVGA 5TU0A 1B7ZA 3IB2A 3R7XA 1POTA 3CRBA 1B3HA 2Z8EA 5L9MA 3TYHA 3K0VA 1MDP1 3OEKA 4WXJA 1B6HA 2CMOA 3TUSA 2B3FA 2NWJA 4FIMA 1QKAA 3OELA 1IQ7A 3MPLA 3MZ9A 5I2NB 5KCJB 5EYFA 1FQEA 4XKQA 1F9BA 3PPNA 1N76A 3OSQA 5CMMA 2R71A 3SEVA 4LZ5A 4EXKA 5I58A 1N7WA 3TFLA 2ZNSA 4LONB 4XIGQ 1MQHA 3E4RA 2RF1A 4MLVA 4BDOA 4F19A 2VD3A 4QF9A 3V83A 2X7PA 1MXYA 4KR5A 1DTZA 4DIGA 4ZEKA 1B4HA 3SEWA 2ZNUA 4QHQA 4KYEA 3QAXA 4H1XA 1D4NA 3FV1A 1Z7ME 4LA9A 4BDQA 3EHTA 3MUQA 5B7DA 3FIRA 1VSOA 2D5WA 2AYSA 4DXUA 3G3GA 3KJTA 3O66A 4G68A 3K1MA 4OEVA 4F3GA 4DCXA 1A7LA 1B7UA 3TQLA 2REGA 2NXOA 4EXLA 2DE2A 4LUBA 1NL5A 3OEMA 5HBCA 2OK2A 1AH5A 4Z7EA 2A5TA 5TP9B 2F34A 1M5FA 3MP1A 1FQCA 5ITOA 4RK9A 2B65A 5L9SA 4NF4A 5H8FA 1R9QA 3CFZA 5CMKA 1AOVA 1TFAA 5AA2B 4IY6A 2Z23A 3TODA 2E0SA 1MDQA 4GD5A 4FEBA 1Y9UA 3H3GA 4YU0A 3R26A 5H8QA 2HEUA 1UTBB 3CG1A 2P0SA 3SEUA 1XC1A 3E13X 3TELA 1N3XA 3TMGA 1DPPA 3PMVA 3KN3A 1ZJLA 1UIVA 1JEVA 4FE8A 3KN7A 1A40A 3DP4A 5ITPA 1FTMA 3EHUA 3MAMA 2XXWA 5JEIA 2H25A 3T9VA 1VFEA 5F1QA 2XXXA 2ZMBA 1MQJA 4IGRA 3M3KA 1WVJA 4JDFA 4WKMA 3N94A 3TTNA 1P1WA 1M5CA 2HZKA 5H8SA 1NH7A 5DEXB 2V25A 2XXRA 2DVZA 2VD2A 5H8HA 5AA4B 4H5GA 4M1VA 3W15C 2V93A 2BJJX 1Y3QA 4F2QA 1JEUA 1ZMGA 2F35A 3SESA 4ZEFA 3DLNA 4G8MA 1XS5A 4H6DA 1FTOA 2ZYNA 4RPOA 2NUVA 3U93A 2O84X 4POWA 3K6XA 2I0CA 3UA8A 4Q0CA 5CC2A 1EZOA 3VLVA 1GR2A 2I4BA 2PYYA 1ANFA 1PEBA 4R74A 4GXSB 2UVHA 2GFEA 2DE4A 1M5DA 3LR1A 3ZSFA 2RCAA 3QK6A 5DYHA 3QUFA 1SW1A 3BFTA 3UP9A 2H98A 1S50A 3VDFA 4QFKA 1NNFA 3G7WA 3C32A 2GHBA 3VV5A 2QPQA 4NF8A 2HZLA 3WAEA 3OO9A 4QRZA 2Q2AA 4I1DA 4RXLA 1GV8A 4ZZEA 4ZS9A 4YKPA 3OENA 4HCYA 3U72A 4GVOA 4PP0A 5EHMA 4KYSA 1UTHA 2DYXA 1ELJA 4Q5TA 3IO4A 4FJPA 1XVYA 3EN3A 3HN0A 1MXVA 5HPQA 3C31A 3C36A 3KSJA 5BUUA 4OXVA 4LATA 5DTBA 3FXQA 1QKBA 3KFMA 5J1DA 3U92A 1XOCA 1B9JA 2H4IA 3TDJA 1TT1A 1MH3A 1YAEA 4JWXA 3FUZA 2P1SA 2DS9A 3CFXA 2Q89A 3UGWA 1RKMA 5JTYB 3H4ZA 3N6UA 1NKXA 4N13A 2HQ0A 4MLQA 1DMBA 4ZE9A 2XXPA 3T9UA 1B3FA 5I56B 4IY5A 3G3HA 3KOTA 1H3DA 4PFTA 1MXWA 4TQUQ 1BKAA 1FW0A 3I6VA 3VFJA 4I9DA 1IITA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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