4KI0E

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to maltohexaose
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ABC transporter related protein
publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ki0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ki0E01
2E0SA 4Z0IA 3MP6A 4BDQA 1PC3A 4KYSA 3A09A 5H8FB 5AA3A 3IX1A 2O7IA 1DOTA 3BFTA 4IY6A 3FJ7A 5FHNA 1ZBMA 4G8NA 1NMUA 1PB7A 4LZ7A 3CFZA 3SEUA 5AA2D 4OFOA 2GHAA 3G3FA 3FVGA 3UP9A 5H8HA 1NNPA 1QKBA 2XXVA 3RN8A 3RT6B 3LSFB 3C34A 4Q0CA 2XD3A 4HCYA 2Y84A 5H8NA 1MXYA 5I58A 5CMKA 2QS4A 1H45A 1LLSA 3OXNA 1MXZA 4ZEBA 1B05A 1MXVA 2XXPA 3QXMA 3EPEA 4YB7A 4RY1A 2XXRA 2ZNTA 3QYTA 4KYDA 3MUQA 1SW5A 4M1VA 5JEIA 4R72A 5I59A 3G7WA 4QSDA 1Y3NA 2QMWA 3JV9A 2DWIA 4GF8A 1LAGE 5CMCA 2UVIA 1PEBA 1IXGA 3TKDA 1D9VA 2XXTA 3SEYA 5KDTB 3Q28A 4R6HA 3TUSA 3S4UA 1WDNA 1SI1A 2VHAA 3THIA 4DCXA 4IO3A 1B40A 4FEBA 1GGGA 1HSLA 1LB9A 4QFPA 4H8JA 4ND9A 3E4RA 4QHQA 3S9MC 3T9XB 5A5XA 3IJOB 2AL5A 3RUMA 1MPBA 2GH9A 3IAZA 4H0WA 1P1WA 1MY2A 5KZTA 3K02A 3FXRA 4ESXA 4BDLA 2UVJA 2W7YA 3VV5A 3CSGA 4C1UA 3OO8A 1POTA 5I56A 3K6UA 2NXOA 3W15C 1H43A 1D3KA 3TAJA 3N6UA 4RA1A 1S50A 1EZOA 3KG2A 4RYAA 5L9OA 4PFYA 4QSCA 1QKAA 3O29A 3OD7A 3DM0A 3MVZA 5I2KA 4POWA 3VLWA 4F3SA 3W9WA 3PUYE 1IZ1A 3HHFA 3P7IA 4TLMB 3PPQA 3OENA 5CMBA 4P11A 4NF8A 1AH5A 2M8CA 4H65A 2O7UA 4ZECA 2I3WA 1M5FA 1RKMA 1P1NA 3TQWA 1LFIA 3K0VA 4DXBA 4IO6A 1H76A 3MPLA 4GIZA 2O1MA 1RYOA 3MW0A 4QF9A 3V83A 2UVHA 1Z7ME 1JVXA 1IXCA 2GHBA 2NWJA 2DSFA 4IGRA 4QRZA 2WKYA 3WAFA 2I58A 3F11A 4EF1A 1B5JA 3SEXA 5B7DA 1URDA 1AMFA 3TTKA 4OHNA 4FECA 4HW8A 3CG3A 3G3KA 3TYHA 4WXJA 4XXUA 4WKMA 2F97A 3HO7A 3PU5A 1B0LA 5AA4B 1ELJA 1ZTYA 1UTHB 4IO2A 1B1HA 2OZZA 1RYXA 3ODBA 4EQBA 3VE1B 1TT1A 2HAVA 4KHZE 3GXAA 3I3VA 4TOZA 1MS7A 1N0TA 1OMPA 1XS5A 2ZYNA 3S9LC 2I48A 5I57A 2F36A 4FJPA 3SEWA 1Z7NE 4JSDA 3H6TA 2DXYA 2HEUA 4ZDMA 3EHSA 5KCJA 1T0KA 3T22A 4G68A 2B65A 2ESNA 3QK6A 2YPNA 1B4ZA 1MM6A 3UIFA 1US4A 2RKMA 4E0WA 2Q2CA 3VVFA 1MY3A 2F5XA 2ZYOA 3K1MA 3T96B 1B9JA 4DIGA 4EUOA 2A5SA 5H8HB 1MG1A 3BBRA 2F6GA 5ITPA 3U1OA 3RGYA 3HCQA 1QUKA 3Q25A 4JSOA 2ONKE 5H8NB 5CMMA 2PVUA 5I58B 2R71A 1PB9A 4MFIA 2XX7A 2V3UA 2UYFA 5FTIA 1B3LA 3VXCA 3M3LA 1AIVA 3B6QA 4U23A 2F34A 1MRPA 1B7HA 5JTYA 4FEDA 3N26A 3L6HA 1B3HA 4MBPA 3O66A 3TPAA 1QUIA 1A55A 2HXWA 1JEVA 3N5LA 3VVEA 1USYH 5DYHA 1ATGA 4QFKA 4RNSA 4ZZAA 1A8FA 4I1DA 2H5YA 4ESWA 4O3CA 3O28A 1QUJA 1BKAA 5AA1A 4YB6A 3MVYA 1Y3QA 3ZSFA 1DTGA 5AA2B 4OMBA 4YAHX 3M3FA 4DDDA 1OLCA 4R6KA 2RF1A 2QMXA 3OSQA 3VXBA 3O6HA 3H3GA 4KI0E 4U1OA 3BFUA 3ZS6A 4O3BA 2I0BA 4F2QA 4RK2A 1MXWA 4R73A 2UVGA 1XVXA 1FW0A 4NF4A 3FIRA 1FTOA 2QS2A 3K01A 4JBZA 1SVXB 3DELB 4FAJA 3OELA 2FYIA 3Q27A 3D4CA 4HCWA 4X1DA 4KPTA 1HSJA 5K2YA 5DTBA 4FATA 2BJJX 4PETA 3C4MA 4PE5B 1IEJA 3R7XA 2ALUA 4NE4A 1B7UA 4R2FA 4F29A 5HM4B 5I2KB 4F1UA 3GBBA 3OO9A 2Q89A 1FQBA 1SDXA 4NWCA 1QW0A 3TMGA 4H5GA 4LA9A 2CMOA 3S9NC 1NNKA 3FATA 1OIBA 2HZLA 1NH7A 3T66A 5TPAA 4NF8B 2I49A 4F39A 3IO6A 2I6EA 3FZVA 4I8CA 4NF5A 1B3EA 3E9XA 3FV1A 2ZNUA 2REGA 1D9YA 1PBPA 3IB1A 3MZ1A 2VP1A 3SESA 1IUDA 3B6WA 3RQTA 1YPNA 2PX1A 4OTEA 2I4CA 4F19A 4KCDA 2YLNA 4IO5A 4I62A 2D5WA 2Y7KA 4IY5A 1LBCA 1LFHA 1TFAA 1FCKA 4THIA 1I6BA 2Y7IA 3PD8A 5L8DA 4OETA 4LATA 4IO4A 5BUUA 1R9LA 1A7LA 2AL4A 5IAIA 5DT6A 4YMBA 1YAEA 1BLFA 3E13X 3OOAA 3I5OA 1MQDA 3SDFA 4H6DA 1B3FA 5H8QA 3FVOA 2H25A 3M8UA 5H8SA 5CM6A 2F7BA 1OVBA 3TCGA 4JXIA 4ELQA 1N7WA 2H9BA 3ILUB 1GV8A 4R9FA 5FHOA 3PV0E 3IO4A 5I57B 4QFLA 3H6VA 3T9UA 2NVUB 3TEPA 1B6HA 3IB0A 1A54A 2IA4A 3W9VA 1R6ZA 1MXXA 3PMXA 5KCJB 2XHDA 4I9DA 2G93A 4WEDA 3MP8A 3IOUA 3FUZA 3KN7A 1QJMA 1EH3A 4IO7A 1OQGA 4ZZEA 1QVSA 2HAUA 3UN6A 2FNCA 3UGWA 1P1OA 1MPDA 3VVDA 1JVYA 3QUJA 4DE8A 2A5TB 1ZU0A 3O97A 2Y7WA 1LCFA 1VSOA 2GRVA 4R6YA 1B52A 3SETA 1MXUA 4FE8A 5M2VA 3UORA 2ABHA 3OO7A 1B46A 1A8EA 3KOSA 5JTYB 1NFTA 2F35A 3O9PA 3KOTA 4IB2A 4BDMA 4DXUA 4G68C 5B70A 3LR1A 4PFUA 1O63A 3DP8A 3N6TA 5TP9A 1GTKA 5DEXA 3SERA 1Y4CA 1LAXA 3CIJA 2PYYA 2DWJA 4JWOA 5FTHA 1J1NA 4NMYA 4GQOA 4AQ4A 3VFJA 3KN8A 2FA7A 5DVJA 3QUFA 3OEKA 3PMVA 5ISUA 1MH4A 4NF4B 2P2AA 1ZIUA 2B3BA 1L5TA 2HFBA 3MZ9A 5HBCA 3C35A 4YKJA 3U8QA 2O69A 1VFEA 2P1SA 4GRKA 2VD3A 4POXA 1MDQA 4BLAA 3TZAA 5DVIA 1B2HA 4XKNA 1IITA 1ZLQA 4LUBA 1B1XA 5CC2A 5CBSA 4YZZA 1Y3PA 3DP6A 1MQHA 4F31B 5F1QA 4GL8A 4YICA 3V5AA 4HTGA 2O84X 2HZKA 1UTBB 1FTKA 2OK2A 1LB8A 1Y9UA 5TPAB 4PFTA 2XX8A 4NF5B 1LAHE 4ZEKA 2DQVA 2DOJA 2R9JA 4JB7A 3G3HA 4ELOA 1B5HA 2P0SA 3A3CA 2RC9A 2V25A 2XXYA 3USDA 3IK6B 1MQGA 3O2AA 3MJNA 5BWJA 3RT8A 3TTLA 3MWBA 1OLAA 1YCJA 4OZ9A 5EHSA 2OBGA 3MBPA 1FQFA 4ZEIA 2QS3A 1ZKBA 4XKRA 2AIXA 3TDJA 4OESA 2CZLA 3K6XA 1FTMA 4YB5A 3K4UA 4GWOA 1MY1A 2DXRA 2H99A 3N94A 3U72A 1F9BA 1N84A 3RNNA 1JNFA 5I84A 2XXQA 1R9QA 4Q30B 1XHYA 1H44A 4F3GA 4P0IA 4F3BA 3MAMA 4N6PA 1B58A 3O6GA 1TFDA 3RY3A 1N3XA 4LQ5A 4YU0A 5H8QB 2ZYKA 3T9HB 4U22A 3Q26A 3A3UA 3WAEA 4FORA 2ONRA 1LBBA 3HHGA 4RK9A 4NWDA 5EHMA 2GFEA 3FVKA 4ELRA 1CE2A 5I59B 3IJXB 3TTNA 1A40A 4DLDA 3PMWA 2XD2A 3HPIA 3RTWB 1NL5A 2ZMBA 3V8XB 1DPEA 1I6AA 4U2RA 3RTFB 2DVCA 1JETA 1OVTA 1JEUA 4AB6A 1O64A 4DZ1A 3L6GA 5L9SA 3U93A 5A5XB 1VFDA 4NEDA 3O6IA 2B3FA 2OCUA 2O1LA 3V89B 2NOOA 1B5IA 1D4NA 4OFLA 3S9EA 3TFLA 4KCCA 3TQLA 1P1QA 1YTVA 4LP2B 3TCHA 4ECFA 4OENA 2NUVA 3LBSA 2Z8EA 1N76A 3IR1A 2F7CA 3RLFE 2E1SA 5I56B 2I4BA 1URSA 4TQUQ 4PFWA 1FQAA 2KLFA 2RINA 4EQ9A 3PPPA 1NH8A 1VR5A 1US5A 1SI0A 1LGBC 1H3DA 3LSLA 1DPPA 1MQJA 4H67A 4QFNA 4LZ8A 4YKPA 5DEXB 2DWAA 2RCBA 4EQ7A 2V3QA 3Q29A 2XXXA 3K6WA 1FTJA 3CI8A 2AYSA 5FHMA 2V93A 4JDFA 4EXLA 2F78A 3EHTA 4GFRA 1MY0A 1MY4A 1USYE 4H5FA 2DP8A 5L9MA 2Q9TA 2OWTA 2QSXA 2RCAA 3BKIB 4GXSB 3JZJA 1I69A 2HQ0A 5AA4A 2I0CA 3PUZE 1UTHA 1IXIA 4G77A 2DYXA 1NNFA 3OEMA 3U94A 2F6PA 3FD3A 5IKBA 1Q35A 3EHUA 4TLLB 3T93B 3CSBA 4R75A 3VDFA 2XXUA 3CFLA 1M5EA 5TU0A 3HV1A 3TTRA 1JW4A 4YKKA 1O7TA 3EN3A 3MPKA 1B7ZA 4XKQA 2DE4A 3KSJA 4BDNA 3TELA 3PD9A 4H8IA 4YKIA 2D3IA 2V3TA 4EDPA 1QULA 4LQ2A 4PQJA 2I3VA 1PB8A 3IOTA 1FQCA 2ZYMA 3ECRA 4IGTA 4OEUA 3VLVA 3CFXA 3FV2A 3PUWE 5AE4A 2REJA 1IQ7A 5CBRA 4ZE8A 1SW4A 3IOWA 4OYVA 3KJ7A 3G3IA 3PPRA 5CRYA 2RC8A 3K1PA 2F8DA 4X48A 4F2OA 5ICTA 3LSXA 2Y7PA 4PP0A 4G68B 3MP1A 4ZE9A 4NF6A 3M3KA 3H06B 4H1XA 2X7PA 4XKPA 4YMAA 4GD5A 2RC7A 3IOVA 4U21A 2ANJA 4N13A 1FQEA 1UIUA 3QSLA 4XIGQ 4ISUA 3DP4A 1MPCA 1XVYA 2OLBA 1M5DA 2Q8JA 3FJGA 3ZKKA 1FQDA 4M4GA 5AA2A 4OERA 3AXFA 3PUXE 4L17A 5I2NA 1LSTA 1EU8A 1B4HA 3CR9A 3PGFA 4Z7EA 3R6UA 1AOVA 3G3JA 3HN0A 4F3PA 3K6VA 3GZGA 1CB6A 1EZPA 4FIMA 2Z22A 3OO6A 1II5A 2XXIA 1Y20A 4E0XA 4R9GA 3QIMA 3KJTA 4DCYA 1POY1 3FJMA 2LAOA 4UACA 1TXFA 1SYIA 4GL0A 2O6AA 3CVGA 1B3GA 1B0HA 2Q2AA 1S9TA 4R2BA 5DVFA 5EYFA 4F18A 1Y1ZA 1UIVA 4G8MA 4OEVA 1WODA 2VD2A 2H4IA 2XX9A 4X9TA 3U92A 3TCFA 4KQPA 3MVWA 3C33A 3D4GA 1A99A 5F7VA 1XOCA 1NKXA 2QJEA 3ZKLA 2THIA 3B6TA 3PUVE 4U1ZA 3LC8A 2QRYA 1ZJLA 4DXCA 2H98A 4F1YA 2XXHA 4UA8A 3GBAA 1KWHA 3MC2A 4MF3A 4U4SA 1JQFA 5H8FA 1ZMGA 4KD5A 3MQ9A 4RPOA 3FASA 3H4ZA 2OJTA 4WEPA 3VLUA 4LVQA 3OMBA 3JYRA 5HPQA 2PMSA 1SBPA 4O3AA 1PBQA 4GOTA 3KFMA 1UQWA 1Q1KA 5J1DA 3LSWA 4KYEA 4JWYA 4OFJA 1OQHA 1R1NA 3UK4A 4ZS9A 3C32A 1MQIA 3C9HA 2D21A 4G4PA 3SEVA 3KEIA 3QAXA 3H6WA 1BTJA 4G2ZA 4OXVA 3TODA 3R26A 2ZNSA 5JK4A 5ICQA 3FVNA 2Y7RA 2QS1A 4F22A 5KDTA 1HSEA 1URGA 2YJPA 4Q8RA 2X26A 4RXLA 4Q5TA 3G3GA 1BIYA 5CI5A 4LONB 1TWYA 1AL3A 3MVXA 4C0RA 1IXHA 2R6GE 3ILTB 3S2VA 2Z8DA 2UXAA 3UA8A 2F7AA 3KN3A 1ANFA 3I6VA 1DTZA 1SQYA 5K2XA 2A5TA 1FTLA 3C31A 1S7YA 1B32A 1N7XA 2OWSA 5ELVA 4G8HA 4OVJA 3EQ1A 2PT2A 4QFOA 4R74A 2ONSA 2V84A 4AB5A 4BDRA 2VGQA 3H7MA 3RPWA 4HS7A 4F1VA 3ONMA 4NF6B 4GLIA 3H03A 3LUYA 4NTLA 1IIWA 4N07A 2VOZA 1P99A 1LCTA 2O51A 3T9VA 4EXKA 4EF2A 1N3WA 3DLNA 1VE4A 3MZBA 4BDOA 4K3FA 3KGCA 4OWDA 4MH5A 3HSTA 1EZ9A 1M5CA 4ONYA 2IEEA 2PBWA 2PT1A 2DE2A 5I2NB 3FGSA 1I6QA 1BP5A 2UYEA 1SD3A 1JW1A 4GVOA 4KFQA 2Z23A 1SW1A 4MLQA 4JWXA 4XTCQ 2QL3A 3SKPA 2HCAA 4QSEA 3KSXA 2QPQA 3H6UA 3GLBA 1B51A 1LAFE 3K00A 2G29A 1NNTA 3FXUA 1N04A 1MM7A 4OQOA 4X1BA 3FXQA 3EF7A 3PPNA 2DE3A 4RJZA 3IORA 2X7QA 1Y4TA 4GXAA 3IB2A 4LZ5A 2DS9A 1SW2A 4RPNA 2XXWA 3CG1A 5TP9B 1XC1A 3K2DA 5ITOA 2O68A 1DSNA 3CRBA 1SYHA 4ZEFA 4ELPA 5LOMA 4C1TA 1M5BA 3KZGA 3K1NA 3PPOA 4KR5A 3IL1B 1WVJA 1MDP1 1UTBA 3E3KA 4P0GA 1JW5A 1P1UA 1Y1MA 4ZEDA 1GVCA 3B7DA 3C36A 2DVZA 2Z8FA 1PDAA 4MLVA 3OSRA 1DMBA 1LFGA 3KBRA 3TTMA 2Q88A 2DWHA 1XT8A 4U4XA 1MH3A 2ZXTA 1GR2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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