3U93A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p2221 form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
252
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 78
structure length 252
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A02
4NF8B 4KR5A 1B3EA 4NE4A 4P0GA 1QJMA 3KJ7A 1MS7A 2ZYOA 2PT2A 3TCFA 3EPEA 3OD7A 3UORA 3E13X 2G29A 1SD3A 3UN6A 2QS2A 2I49A 2HQ0A 1N7WA 1XC1A 1Y20A 3Q27A 3HHFA 3LBSA 3VVFA 1B0LA 1JW4A 2B3FA 5K2XA 2ALUA 1FQEA 4F31B 1IXHA 4BLAA 3WAEA 2RCAA 1PEBA 2XXVA 1B2HA 1LAXA 5KDTB 3M3FA 1L5TA 4IO7A 4OENA 1IUDA 3FXQA 1FQCA 1JQFA 4MH5A 4F3GA 3PUXE 4KCCA 3CG3A 5H8QB 5CC2A 1JNFA 4O3AA 4OTEA 3IOWA 4DXUA 5ICTA 2RINA 4WKMA 1B1HA 4LATA 1SDXA 1MDP1 4F3PA 5AA3A 3IK6B 3U72A 4OXVA 4ESWA 4R6KA 3C33A 5H8FB 1LAFE 4IGTA 3V5AA 2H5YA 4BDMA 4MF3A 5TP9A 3VFJA 3P7IA 1MDQA 3PPNA 2Z8EA 2I6EA 1EZPA 1AL3A 2XXPA 4M1VA 2A5SA 4X1BA 1M5CA 5DYHA 2DWAA 3C9HA 5TU0A 3MVYA 3S9EA 4EF1A 2XXIA 3K6XA 3N26A 3G7WA 3MVZA 2OCUA 3FVGA 1NNFA 5DTBA 4QRZA 4DZ1A 1N84A 4GIZA 2O7UA 5I59B 1P1UA 4OETA 3Q29A 1CE2A 4R75A 2NVUB 2XX9A 5H8HB 2E1SA 2F34A 3HHGA 3O6IA 1ZMGA 1SBPA 4YICA 1BLFA 1MY2A 4RYAA 2THIA 3MVXA 3OELA 4ZEKA 3RTFB 3TQLA 1B32A 4FAJA 5CI5A 4KQPA 1MQJA 1N0TA 3GBAA 1PC3A 2XXXA 4U1ZA 3OEKA 3S9LC 3LSXA 4ELPA 1B5JA 4LZ8A 2ZYNA 3K6WA 3R26A 1T0KA 3PD8A 1H45A 4LQ5A 2O68A 3PUWE 3KSJA 2DE3A 4DXBA 3CVGA 1WODA 4IO2A 1Y3NA 3BBRA 1Y4CA 4Z0IA 3FATA 1D4NA 5BWJA 4DDDA 4NF6B 4OERA 2H9BA 2QS4A 3I3VA 4C0RA 2RC7A 3RTWB 5CBSA 3OSQA 3DP6A 1ZTYA 2DE2A 1VFDA 1URGA 1B3FA 3R7XA 1R1NA 2R71A 1IQ7A 3BKIB 3GLBA 3O29A 2F5XA 3K6UA 5DEXA 3LUYA 1YAEA 1FQDA 3H6VA 2V93A 4U23A 3EQ1A 4DCXA 3FJ7A 3PUYE 2UVGA 4RPNA 5ITOA 4KFQA 4LA9A 4JBZA 3IO6A 3CFLA 1R9LA 3HSTA 1IIWA 5I2KA 3S9MC 1M5DA 3USDA 4DE8A 1Y4TA 4PFUA 5B7DA 2OWTA 1BIYA 1F9BA 4H8IA 2F7AA 1MY0A 1NH7A 1II5A 3G3KA 1B1XA 4BDOA 5ITPA 3RQTA 3O28A 3C34A 2D3IA 2Q9TA 3JYRA 3TZAA 4NF5A 2I4BA 1DMBA 3TQWA 2F7BA 4ZE8A 3G3IA 3FD3A 4BDRA 3M8UA 2IA4A 3IB0A 2ZNTA 4KYDA 2DWHA 5AA4A 4RA1A 3H6TA 4AB6A 4EUOA 5CM6A 2Q2AA 1NKXA 3MWBA 4PFYA 2Y84A 3V8XB 4NWCA 3PD9A 2GRVA 1MPDA 5H8SA 1M5FA 2A5TB 4YKJA 1ELJA 2VD2A 3C31A 3MZ1A 3H4ZA 3H03A 3U92A 1US5A 2XX7A 1YTVA 3RT6B 3FJMA 4P11A 3TTLA 4XIGQ 2ZYMA 3I5OA 2O84X 2X7PA 4WXJA 1QKAA 1XVXA 3I6VA 4Q30B 1GVCA 5I57B 1Y3QA 3RY3A 5A5XA 5CBRA 2H25A 2HAVA 4YZZA 3HCQA 1OQGA 2F8DA 4MLVA 1LGBC 4LUBA 1DTZA 1MH4A 4F3SA 5JTYA 1LB8A 1MXUA 3PMXA 5CRYA 4BDLA 4TQUQ 3L6HA 3BFTA 4FIMA 4G68B 3N94A 3OO8A 5L9OA 2V84A 1A8FA 5AE4A 5H8NB 3SEXA 1LCTA 4OMBA 4E0WA 3H6WA 5IAIA 4R72A 4YKIA 4KCDA 4Q8RA 4H5GA 3TPAA 1QUIA 4ELOA 3OOAA 5L9MA 1YPNA 4JXIA 1USYH 2G93A 1B9JA 4KPTA 5L8DA 1B58A 3VVEA 4EQ7A 2DXYA 4POXA 4IO6A 2OWSA 3RLFE 3K1PA 3ZKLA 3BFUA 3KFMA 4IY6A 4R6HA 3TCGA 1UTHB 2V3UA 1H76A 4IO4A 2F7CA 3H3GA 2P2AA 2UVHA 1UTBB 2DYXA 5EYFA 4JSDA 4WEDA 2PT1A 2FNCA 4JWYA 1DOTA 2BJJX 3N6UA 3FZVA 1FTMA 3MZBA 2AIXA 1PBQA 3PMWA 5HBCA 4R6YA 4NF4A 2QS3A 4NF4B 4IO3A 3FGSA 2KLFA 3CR9A 3K6VA 4GL0A 1N3XA 3CIJA 1DPEA 4ZEBA 4EF2A 2Z8FA 5B70A 5M2VA 2QS1A 2AL5A 2Y7IA 3FV2A 1MH3A 2PYYA 1POTA 3KZGA 4NWDA 4FJPA 2M8CA 4PQJA 1HSLA 2R9JA 4I8CA 1MXXA 1XOCA 2QMWA 4ZZEA 4JB7A 3SEYA 1A40A 3G3GA 1ZIUA 2RC9A 3V89B 1GV8A 5IKBA 4YKKA 2ONKE 1MPBA 5JEIA 1PB8A 3KEIA 1B52A 1ZU0A 3M3LA 3IORA 4H0WA 3FUZA 4RXLA 4GFRA 4ELRA 2ZNSA 1OVTA 4FEBA 1SW1A 1VE4A 3L6GA 1FQAA 4G8HA 3MC2A 3UGWA 3TKDA 3CG1A 3DLNA 1FTKA 1N3WA 2WKYA 3MPKA 3OO7A 1RKMA 3HPIA 3TTNA 4QFKA 2IEEA 3OXNA 3C32A 1BP5A 2Q88A 4BDNA 5TPAA 4F18A 3LR1A 5TP9B 1LB9A 1CB6A 2D21A 2UVJA 4OFLA 3W15C 2UVIA 3VLWA 3SKPA 1P1OA 4XXUA 2ESNA 4RJZA 3UIFA 1LLSA 2ONSA 2XD2A 1JETA 1I6BA 4POWA 3N6TA 1DPPA 1A8EA 2Y7RA 2XXQA 4OWDA 2Z23A 4UACA 3T9UA 3UK4A 1Z7NE 1IXCA 3RGYA 4R9FA 1XHYA 1H3DA 1URDA 4K3FA 1MM6A 1XS5A 4FECA 4G2ZA 4LONB 4QFNA 2UYEA 4KI0E 3B6QA 2HCAA 1I69A 1PBPA 2AL4A 4TLMB 1GGGA 1POY1 4XKNA 2P0SA 5I2NA 1PDAA 1N76A 1EZOA 3MPLA 4QSCA 3MAMA 2F36A 1SI0A 2GHBA 3C4MA 3HN0A 2I0CA 1JW5A 2UXAA 3IJOB 4EXLA 1P1WA 2Q89A 3A3CA 4ESXA 2W7YA 2V3QA 5F1QA 4OESA 3PUVE 1SI1A 3LSWA 2RF1A 4FORA 1H44A 2I58A 4GVOA 4QSEA 4OVJA 4ZECA 3QXMA 2LAOA 4H8JA 5BUUA 5CMKA 4ONYA 1MXWA 5I56A 3KOTA 4U22A 1P99A 5HM4B 5AA1A 3EHSA 1JVYA 5ISUA 4KD5A 3IOVA 4RNSA 1Q35A 1EH3A 1WDNA 3IOUA 1USYE 4GF8A 3EHTA 4I9DA 1B5IA 2Y7WA 5AA2A 5FHOA 3K00A 3Q26A 4NTLA 4U4SA 1NNPA 2XHDA 4THIA 4H5FA 3MBPA 4JWOA 4F2OA 5DEXB 3G3HA 2VHAA 4PFWA 4ZZAA 1NFTA 3A3UA 4RPOA 4GWOA 1IZ1A 1AIVA 3K1NA 1FTOA 1JVXA 3FVNA 3IB1A 2ONRA 2O6AA 3VXCA 5I2KB 2ANJA 3DM0A 3FASA 3LC8A 2NOOA 4OEUA 3ZKKA 2DXRA 2REGA 3VDFA 3CFZA 2F6GA 5L9SA 3KJTA 1TFAA 3CSGA 1B5HA 1FQFA 3K01A 1PB9A 1VSOA 2DWJA 5I58A 1B0HA 2E0SA 5I58B 2VOZA 2HEUA 3TEPA 2DWIA 1S7YA 5J1DA 4NF5B 1Z7ME 1MQIA 2QSXA 3MP6A 5I84A 3ONMA 4LZ7A 1LFIA 5DVIA 2HFBA 4HW8A 4YB6A 3DP4A 1BTJA 2QRYA 3GXAA 4YMBA 3PUZE 5AA4B 1YCJA 2PBWA 3QUJA 2QJEA 3VXBA 3SERA 1UQWA 3T9VA 4O3BA 3U8QA 1NMUA 1B4ZA 3QYTA 1QUJA 4P0IA 5FHMA 1FCKA 4H1XA 1SYHA 3KSXA 3FJGA 3TFLA 1QVSA 1NL5A 1MRPA 2B3BA 4H6DA 3K0VA 3IAZA 1VFEA 1M5BA 3VE1B 1MXVA 1MY4A 4N6PA 1TXFA 2H98A 3O9PA 3K1MA 1LBBA 4HCYA 4HS7A 1OQHA 1B7UA 4YKPA 1MPCA 1R9QA 3ILUB 1HSEA 3O66A 1FTLA 3RN8A 3T96B 5A5XB 4X9TA 1IEJA 1AOVA 3U94A 1QKBA 4F39A 4G77A 3E3KA 5KZTA 3MZ9A 5JTYB 4XKRA 3A09A 4GL8A 3K2DA 3DELB 2F35A 1P1NA 3IJXB 3F11A 1IXGA 3H6UA 2R6GE 1TT1A 4ELQA 3TMGA 1B3LA 2VP1A 1Y1MA 2QMXA 2XD3A 3FIRA 1VR5A 2V3TA 3EHUA 2I48A 2REJA 3ILTB 3WAFA 4G8MA 3QIMA 4FEDA 1B7HA 3C35A 4Q5TA 3LSLA 1D9VA 4KYEA 4LZ5A 3PPRA 3TCHA 4F1VA 4F3BA 3MQ9A 4DLDA 3KGCA 3QUFA 3O97A 1QW0A 3SEWA 1J1NA 3U93A 1EU8A 1NH8A 3FVKA 2RCBA 4FATA 1OLAA 1D3KA 5ELVA 2I3WA 1XT8A 2DVCA 1B3GA 2PMSA 1QULA 4YB5A 2Q8JA 1PB7A 3KN3A 3TELA 2YPNA 1A99A 3IL1B 3G3FA 3E9XA 4QFPA 5FTIA 4XTCQ 3CRBA 2I4CA 4GXAA 4YMAA 3K4UA 4R73A 1I6QA 4G68C 4XKPA 4QHQA 2GHAA 3HV1A 4GQOA 3GBBA 3TYHA 4AB5A 1H43A 4NF8A 3OSRA 2NWJA 2CMOA 3VLVA 1A7LA 4NEDA 2XXRA 4FE8A 4JWXA 1KWHA 4PP0A 3RNNA 1RYXA 1MXZA 1SQYA 4NMYA 3PV0E 4Q0CA 4X48A 3THIA 1AMFA 4F19A 3G3JA 1D9YA 3TTRA 2OK2A 2XXWA 2F78A 3U1OA 2HZKA 1OVBA 4E0XA 4LQ2A 1S9TA 1Y9UA 1B4HA 3FV1A 2QL3A 2V25A 1LSTA 1O63A 1DSNA 4PE5B 5KDTA 5CMCA 2RC8A 4QFLA 2DE4A 5H8QA 2DVZA 4ND9A 4OYVA 4ZE9A 3MW0A 2DP8A 2ZMBA 2FA7A 4EXKA 5AA2D 3KG2A 1WVJA 3T22A 3PPPA 1DTGA 5FHNA 2NXOA 3OMBA 4G4PA 2O51A 5TPAB 3D4CA 4YB7A 4ZEDA 3S2VA 3OEMA 5H8FA 3QAXA 3FXUA 4H65A 3Q25A 4R74A 4WEPA 1ZLQA 4R2BA 1LFGA 1LAHE 1R6ZA 4U4XA 2ZNUA 1ANFA 2Z22A 3OO6A 4G8NA 3KN8A 1URSA 1ZJLA 1N04A 1JEUA 3LSFB 4ECFA 2ZXTA 1ATGA 1B46A 3V83A 3KOSA 4OFJA 3HO7A 1B3HA 4AQ4A 5CMMA 2P1SA 5I59A 3O6GA 4OFOA 4RY1A 4H67A 4F1UA 1EZ9A 1OLCA 4GXSB 1P1QA 4RK2A 3MP8A 4JDFA 5H8HA 4OQOA 5I2NB 2AYSA 2ABHA 2HXWA 1BKAA 4JSOA 4IB2A 4N13A 2DSFA 3QK6A 3O2AA 4LVQA 1OIBA 4PFTA 3SESA 3VV5A 2DS9A 1MXYA 1M5EA 5EHMA 1S50A 3PPOA 1UIVA 4MFIA 4U1OA 4DXCA 1NNKA 2Q2CA 2X7QA 2X26A 4X1DA 4KYSA 3ZSFA 3RPWA 3T93B 2Y7PA 4MLQA 4DCYA 5I56B 5LOMA 2CZLA 4GLIA 3CI8A 2RKMA 4F2QA 3PU5A 3B6WA 1O64A 2OBGA 4GRKA 1LFHA 3T9XB 3OENA 2OJTA 3M3KA 2PX1A 3GZGA 3UP9A 1LCFA 1TWYA 1O7TA 4NF6A 4OEVA 5AA2B 3ODBA 1MG1A 3S4UA 2XXTA 3PMVA 3FXRA 4DIGA 3TTKA 1B6HA 2O7IA 4L17A 4TLLB 3QSLA 1GTKA 5F7VA 2VD3A 3T9HB 1FW0A 5DVFA 3MVWA 5FTHA 3KN7A 1B05A 1MQGA 3IO4A 4RK9A 1ZKBA 4OZ9A 1MQDA 1MM7A 2UYFA 1MY1A 1TFDA 1LBCA 2OZZA 3VLUA 1FTJA 3D4GA 2ZYKA 4F22A 1US4A 5KCJA 3MP1A 3AXFA 4QSDA 2DQVA 2F6PA 2NUVA 5KCJB 3VVDA 1N7XA 4IY5A 2H99A 4LP2B 4GOTA 2F97A 1FQBA 2I0BA 5CMBA 4U21A 3CFXA 1A55A 1RYOA 1Q1KA 3H7MA 2XX8A 2D5WA 2I3VA 3IR1A 5ICQA 2PVUA 4QF9A 2OLBA 4TOZA 2XXYA 3EN3A 1MQHA 1UIUA 4Z7EA 4M4GA 3ZS6A 1JW1A 3JV9A 5K2YA 4F1YA 4HTGA 2O1LA 3CSBA 2GH9A 2A5TA 1OMPA 1SW5A 5DT6A 4EDPA 3TTMA 1SVXB 3FVOA 3IOTA 1GR2A 3MUQA 4KHZE 2XXUA 4UA8A 3EF7A 4ZDMA 4XKQA 1A54A 3MJNA 1SW4A 3KBRA 1I6AA 3UA8A 4N07A 4I62A 1Y3PA 4YAHX 3IX1A 3O6HA 1SW2A 4I1DA 5I57A 1Y1ZA 3H06B 3W9WA 1B51A 4EQBA 1AH5A 5DVJA 3S9NC 3PGFA 4GD5A 4ZEIA 3N5LA 1SYIA 3W9VA 2DOJA 4C1UA 4BDQA 4G68A 5EHSA 2HZLA 4QFOA 3DP8A 2FYIA 3TODA 4EQ9A 3TAJA 1IITA 5H8NA 3T66A 3SDFA 4ZEFA 2Y7KA 4R9GA 4OHNA 3ECRA 1IXIA 2QPQA 5JK4A 2YJPA 2HAUA 2Z8DA 1NNTA 3IB2A 3OO9A 3E4RA 4HCWA 1MY3A 4C1TA 3SEVA 4F29A 1ZBMA 1UTHA 2H4IA 3PPQA 1LAGE 4R2FA 2B65A 1QUKA 1UTBA 2GFEA 2VGQA 3RT8A 3TDJA 3R6UA 3B7DA 2XXHA 3SEUA 2O1MA 1HSJA 2O69A 1B40A 1B7ZA 1XVYA 3C36A 3Q28A 3TUSA 4IGRA 4IO5A 4U2RA 3JZJA 3SETA 3K02A 2YLNA 4O3CA 3B6TA 4YU0A 3RUMA 4PETA 1JEVA 5HPQA 4ZS9A 4MBPA 4ISUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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