3U93A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p2221 form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
252
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 252
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A02
4Q8RA 3LSLA 2E1SA 1KWHA 2UYFA 1B4ZA 1XVXA 4ZE9A 4H8JA 3PV0E 2UVHA 1AH5A 2OLBA 1ZBMA 3IK6B 3N26A 5L9OA 3H4ZA 1NNPA 2D21A 3O66A 1PB7A 4OHNA 2OWTA 4PE5B 4FEBA 5I59A 2OBGA 5IKBA 4HW8A 2OJTA 3SESA 1JEUA 4FEDA 4IGRA 2Q88A 4GXAA 4WXJA 5I59B 4FJPA 1N7XA 1QUKA 3PU5A 4NWCA 1XS5A 4OETA 4YMAA 2HAVA 1IEJA 4P0IA 5K2YA 4P11A 4XIGQ 2PT1A 1LBBA 4QHQA 3TFLA 4FAJA 1BLFA 4X1BA 3A3CA 3S2VA 1P1OA 3CR9A 3FV1A 4HS7A 1N04A 5I57A 4OFJA 3USDA 2RF1A 2QS3A 1MDQA 4KPTA 2F78A 5CMBA 2VOZA 1UIVA 4MF3A 2NVUB 4YB6A 4PFUA 1DTZA 2ZNSA 3O9PA 5I57B 1B51A 1F9BA 3R26A 4G68C 1SYHA 1CE2A 3C32A 2Z23A 5I56A 1JW1A 1EZPA 5DVIA 1A54A 2CZLA 3TTRA 2QMWA 1QW0A 5I56B 1MPDA 4F1UA 4DE8A 3KN7A 5I2KA 4TLMB 4OESA 2Y7KA 4HCWA 2PX1A 4LVQA 3M8UA 2DWJA 1MXZA 2ALUA 5I2KB 3KG2A 3C31A 3PUYE 3H06B 3P7IA 3KSXA 4MLQA 1SW4A 4C1TA 3O29A 4OFOA 5DT6A 4KFQA 4EUOA 4ZEBA 4RJZA 1P99A 3GZGA 3BBRA 5AE4A 3G3FA 1B40A 4DLDA 1RYOA 2XXPA 3E3KA 3FJ7A 3UGWA 2XXXA 3S9EA 2VD3A 1ZMGA 4E0XA 2YJPA 2ESNA 3T22A 4F19A 2UVIA 4LZ5A 4NMYA 4GQOA 4RK2A 1ZTYA 2V3UA 3OENA 1NNFA 1CB6A 2Y7IA 3PMXA 4X48A 1QULA 4ELOA 1N3WA 4YKKA 1NFTA 2O84X 1A8EA 2XD3A 3K1NA 1LB9A 1MQIA 4GFRA 1B05A 1TFDA 1MQGA 2ONRA 2RC9A 2DE4A 2VD2A 4AQ4A 3W9WA 3H6WA 1XC1A 3TCGA 3OSQA 1NH8A 3LUYA 3MZ1A 2AL5A 2PYYA 1FTLA 4FATA 2XXYA 3HHGA 3IORA 1B0LA 1S50A 1M5EA 3GXAA 1MQDA 4R9GA 1B3GA 5ICQA 4U1ZA 4LUBA 1MS7A 2OZZA 3K6VA 3V83A 4OEUA 2QSXA 3HO7A 4TQUQ 1MY1A 3QIMA 3VLWA 3KOSA 3V8XB 3MZBA 5FTHA 1MQJA 2REGA 3FVNA 2UXAA 3TAJA 5J1DA 4DCYA 4F1VA 3C36A 3MVWA 3A3UA 2GRVA 3TZAA 2I0CA 3PD8A 3PUZE 2Q8JA 2Z8DA 1ZLQA 1MM7A 1USYE 2F6PA 3SEWA 4QFKA 3MBPA 4RPNA 3TPAA 1FQFA 4UA8A 2B3FA 1URDA 3RQTA 4YZZA 3MVXA 1N0TA 1NNKA 2RCAA 4DCXA 5I84A 3IX1A 3E4RA 1FQDA 1TT1A 3EQ1A 4ELRA 3TCHA 3VVEA 1MY2A 4ONYA 4ZS9A 3FV2A 3G3IA 1O7TA 3FATA 3VVDA 4IY5A 4LZ8A 2DOJA 3TUSA 4QSEA 4JWOA 2DE3A 1B52A 4GIZA 4E0WA 4F3SA 1I6AA 1GTKA 4H67A 4R72A 3I6VA 2B65A 5CM6A 1B2HA 2V93A 3FVOA 3FJGA 2ZXTA 4F2QA 5K2XA 2X7PA 5A5XA 3KN3A 3TYHA 3RT6B 1B7UA 2HAUA 3F11A 4ESWA 3MPKA 5A5XB 4QSCA 2V84A 4LONB 5HPQA 1SYIA 3S9NC 3H6UA 5H8HA 1Y3QA 2XX9A 3HV1A 1D3KA 2DVCA 5DEXA 1P1NA 5H8HB 1L5TA 3OO9A 4C1UA 3DP8A 1Y9UA 4NF8A 3FXUA 3OD7A 5DEXB 1LBCA 5FHNA 3TMGA 3H3GA 1Z7ME 3QUFA 3KOTA 4NF8B 4THIA 4YICA 1IITA 2DWHA 4OYVA 3LC8A 3O28A 3T66A 3B7DA 3I3VA 2V25A 2H4IA 5CMKA 5I2NA 3G3JA 1SD3A 4ZECA 4EDPA 3CSBA 2QRYA 4BDQA 4BDRA 4RPOA 2YPNA 5I2NB 4KYDA 1B3EA 3PPOA 3CSGA 3KBRA 1OLCA 3WAFA 4ND9A 1IIWA 3N6UA 3S9MC 3U93A 1MXWA 3U1OA 1DPPA 4RYAA 1URGA 1J1NA 4DXUA 5FTIA 1P1QA 1LFHA 1B5IA 4IY6A 4YKPA 1UQWA 3IJXB 2XXQA 3PUVE 4NWDA 2HXWA 4XKPA 1QKBA 3SDFA 2H5YA 5TPAA 1I6QA 4OMBA 3TDJA 4NF4B 3OOAA 1H76A 2DP8A 3SEXA 1FCKA 4X9TA 5EHMA 5TPAB 1YAEA 4QSDA 1LGBC 1B1XA 4YU0A 3KEIA 4TLLB 3LSXA 1IZ1A 4XKNA 3KZGA 4OZ9A 1SI1A 3H6TA 4JBZA 3LSFB 3K02A 3DP6A 2NUVA 2AIXA 2ZYOA 1LSTA 4U4XA 1B5JA 1VFDA 4MFIA 1GR2A 3OEMA 1MY3A 2OWSA 3E9XA 4Z7EA 4KR5A 3Q29A 4ZE8A 3K0VA 3CFLA 4L17A 1IXCA 1ANFA 2FYIA 2UYEA 4Z0IA 4H5FA 4EF1A 3RN8A 4H0WA 1VSOA 2LAOA 3N6TA 2I4CA 3KGCA 3TTKA 4LP2B 3FIRA 4XKQA 2CMOA 2GFEA 4EXLA 2I49A 2ANJA 4I1DA 1PDAA 4XXUA 2H9BA 4BDLA 2V3TA 2E0SA 2ZYMA 3QYTA 1SW1A 1ZJLA 4QFPA 3DLNA 4WEDA 2F97A 1BKAA 5H8QA 3QK6A 4TOZA 5EHSA 1N76A 3W15C 4DZ1A 1WDNA 4PETA 3JZJA 2F35A 5H8QB 1WODA 2Z8FA 2O7IA 3MZ9A 2O6AA 4JDFA 2QS4A 4KD5A 2A5TA 3HHFA 1AMFA 3WAEA 2DS9A 3O6HA 1JEVA 4NF6B 3TCFA 4IO7A 4NTLA 1R9LA 4F29A 4K3FA 1XVYA 2A5TB 1MXVA 5IAIA 1QJMA 4BLAA 2VP1A 1S7YA 3UIFA 1R6ZA 1SVXB 3IB0A 1FTOA 1LAXA 1MPCA 1OIBA 3CFZA 1LAFE 4OXVA 2ABHA 3VLVA 2F6GA 4IGTA 1ZU0A 3H6VA 3K4UA 3OXNA 4MH5A 2M8CA 3G7WA 1IXGA 3E13X 2O1LA 1B9JA 1T0KA 3K6XA 1B58A 3CG1A 2HEUA 5B70A 2I0BA 1DMBA 3C4MA 1QKAA 5DVFA 3M3LA 4F31B 2AYSA 4RA1A 3KJ7A 4C0RA 3IR1A 4QFOA 1EZ9A 2QPQA 1EU8A 1MXXA 2UVGA 3UP9A 4GXSB 4AB5A 4PFWA 2XX7A 3ECRA 2RC7A 3OELA 5JEIA 1VFEA 4H65A 1LFIA 1QUJA 3M3FA 3Q27A 4R2BA 3G3HA 1MG1A 3R7XA 2PBWA 2ZNUA 4KYEA 4XKRA 3RUMA 3O2AA 1IXIA 3H03A 3OO6A 2Q89A 1EH3A 2F36A 3K01A 4F3PA 3IOUA 4G8NA 3SEVA 2RC8A 1URSA 1Q35A 3FASA 1FQCA 4G4PA 2DE2A 4ESXA 2IEEA 2XX8A 2DWAA 3VLUA 1D9VA 1OLAA 2R9JA 4F2OA 1P1UA 3D4CA 3OMBA 1QUIA 2AL4A 1B4HA 2XD2A 2XXVA 4DXBA 3TELA 3PUXE 4IO6A 2H98A 2FA7A 5H8NA 4BDNA 4FIMA 1AIVA 5ISUA 1A55A 3OSRA 1JW4A 3EHUA 2Q2CA 5H8NB 4H1XA 3Q25A 3S9LC 1TFAA 1A40A 3UN6A 5B7DA 1Y1ZA 2D5WA 1B6HA 1B3LA 3S4UA 1AL3A 5KZTA 3VV5A 3B6QA 1UIUA 2ZMBA 3PD9A 5DVJA 3IB2A 1B3HA 3T96B 1ATGA 4LQ5A 2Y7WA 3PUWE 4POWA 3VXBA 4BDMA 4I9DA 1NL5A 2Z22A 4R6KA 5AA2D 3VXCA 3V89B 2GHBA 4PFTA 3T9XB 1LAGE 4R73A 5F1QA 3C33A 3VFJA 2O68A 1DOTA 2QJEA 5F7VA 1HSEA 1POTA 1B32A 3FUZA 5I58A 2NWJA 3Q26A 4U22A 1LLSA 3TTMA 3RPWA 3DP4A 2NOOA 1WVJA 3CVGA 5HM4B 3U72A 4ZZAA 5L8DA 2ONKE 3M3KA 5I58B 1TWYA 4KCDA 4GL0A 1MXUA 3RTWB 2XXWA 3JYRA 5KDTA 1RYXA 3K2DA 3K6UA 5ITPA 1XT8A 1H45A 1GVCA 1ZIUA 3U94A 1N7WA 2F7AA 4YKJA 5KDTB 2PT2A 4RK9A 1FTKA 2I48A 3ILUB 3IAZA 3K6WA 5CI5A 3AXFA 4Q0CA 1OQGA 4G8HA 4LQ2A 2O7UA 3L6GA 1NH7A 4R74A 3EF7A 2Y7RA 1Q1KA 2QS2A 3OEKA 4OVJA 4RXLA 4MBPA 1EZOA 1Y4CA 2XXHA 4M1VA 4FE8A 4R6YA 1IQ7A 2D3IA 1Y3PA 2FNCA 2ONSA 3QAXA 1LCTA 2DXRA 4O3AA 2REJA 1MH4A 4R9FA 3T9HB 2OCUA 3KN8A 4H6DA 2F34A 4IO5A 1US5A 1PBPA 1BP5A 1XHYA 4EQBA 4OFLA 3EPEA 3T9UA 4NF4A 1PB8A 1B1HA 3IOTA 4O3BA 3MW0A 4RY1A 3IJOB 2PVUA 4U1OA 1FQAA 2I3VA 3MP8A 4Q30B 5L9SA 4AB6A 4JXIA 1PC3A 3KFMA 3SKPA 4OEVA 2NXOA 3LBSA 1I69A 1Z7NE 2IA4A 3G3KA 3Q28A 2VHAA 2ZYKA 4DDDA 3GLBA 4Q5TA 4U23A 2H99A 1M5BA 1ELJA 1R9QA 3C34A 3PMWA 4FORA 1HSLA 4NEDA 4QFNA 1IUDA 5DYHA 1DSNA 2RCBA 2P1SA 1BTJA 1H3DA 4U4SA 1N3XA 1JETA 5TP9A 3A09A 1LCFA 3MJNA 3TTNA 2H25A 3UORA 1XOCA 3D4GA 2P0SA 3RLFE 1GV8A 5TP9B 4N07A 2XXRA 1A99A 1USYH 3KSJA 3MVZA 1JQFA 3MWBA 3FJMA 4G68A 3N94A 4POXA 1MH3A 3VE1B 3KJTA 3CI8A 3RNNA 3C9HA 1QVSA 4G68B 3PPPA 2DVZA 4GVOA 2F7CA 1MY0A 3BFUA 5FHOA 1MPBA 4YKIA 4NF6A 3HCQA 1PB9A 4N6PA 3MP6A 4R6HA 4YB5A 1MRPA 3IOVA 3U92A 1MXYA 4EF2A 4PP0A 4R2FA 3TQWA 4GRKA 1AOVA 2R6GE 5CBSA 4N13A 4KYSA 2G93A 4X1DA 2XXTA 2Y7PA 4F22A 1M5DA 1SBPA 4JWXA 1B7ZA 1YTVA 3PPRA 4WEPA 3ILTB 1GGGA 5M2VA 5CMCA 4U21A 4KCCA 1Y4TA 5EYFA 3B6WA 3HSTA 1Y1MA 3RT8A 1FW0A 1FTMA 5L9MA 1IXHA 4JSOA 1US4A 4OERA 1SDXA 2HQ0A 4G77A 1ZKBA 2WKYA 1II5A 4HCYA 3TEPA 4P0GA 3UA8A 3THIA 5HBCA 4GWOA 2O51A 2I4BA 4YAHX 4QFLA 3CRBA 5TU0A 4GF8A 1FQBA 1LB8A 4PFYA 1VE4A 1PBQA 1JVXA 4JWYA 2DQVA 5H8FA 3ONMA 3QUJA 3TKDA 2HCAA 4OQOA 2F7BA 3GBAA 2ZYNA 4F18A 3B6TA 3I5OA 4BDOA 1HSJA 3SERA 4ZEFA 4WKMA 3RY3A 5H8FB 1SW2A 3EHSA 3IOWA 1R1NA 4LZ7A 1BIYA 2Y84A 4GLIA 3BFTA 4HTGA 3IL1B 3G3GA 2I6EA 5ICTA 3HPIA 2I3WA 2PMSA 1I6BA 2HZKA 4GD5A 4O3CA 4DXCA 2V3QA 3K1MA 2XXUA 3K00A 4RNSA 1LFGA 4NF5A 3LR1A 1B3FA 4ELPA 2B3BA 3TTLA 4MLVA 4ECFA 1O63A 1SQYA 3TODA 2DWIA 1Y20A 1TXFA 4NF5B 1H44A 4LATA 3MVYA 2THIA 3GBBA 1FQEA 1FTJA 4ZZEA 5KCJA 1SI0A 3BKIB 3PPQA 1P1WA 2YLNA 1OVTA 3CG3A 5AA1A 4KHZE 3ZKLA 4FECA 1Y3NA 4ISUA 2Q9TA 5JK4A 1NKXA 3ZS6A 2X26A 5KCJB 4YMBA 1A8FA 4G8MA 3HN0A 4PQJA 2I58A 4OTEA 5CBRA 2X7QA 3FZVA 3R6UA 3C35A 1PEBA 1JVYA 2R71A 4OWDA 4I62A 4ZDMA 1MM6A 3ODBA 1YPNA 3H7MA 1S9TA 5H8SA 2DXYA 3OO8A 3UK4A 1OQHA 3CFXA 4XTCQ 1POY1 3MP1A 5LOMA 4IO3A 2GHAA 3V5AA 4GOTA 3DM0A 3RTFB 2OK2A 3FVGA 4EXKA 1NNTA 4QRZA 1B5HA 3FGSA 3IO4A 3FXRA 4EQ7A 4EQ9A 4F39A 1JW5A 4U2RA 3RGYA 2P2AA 3CIJA 3O97A 3FXQA 2Z8EA 3ZKKA 3O6GA 4GL8A 2HZLA 3TQLA 1DTGA 2VGQA 3PMVA 2F5XA 4M4GA 4IB2A 2GH9A 3DELB 3K1PA 3FD3A 5CRYA 2F8DA 3MPLA 1UTBA 4JB7A 2HFBA 1SW5A 3MUQA 1B0HA 4JSDA 2DSFA 4OENA 4F3BA 3SEYA 1UTBB 3QSLA 4QF9A 2QMXA 2XHDA 1M5CA 5AA2A 1MDP1 5BUUA 1N84A 2UVJA 1OVBA 1OMPA 5CC2A 2O69A 4YB7A 5AA4A 4KI0E 3LSWA 3IB1A 2W7YA 3PGFA 1VR5A 5AA2B 1LAHE 4R75A 4ZEDA 3FVKA 3W9VA 4H8IA 4F1YA 4IO2A 4ZEKA 1NMUA 5AA4B 5BWJA 2A5SA 5JTYA 4ELQA 3PPNA 3L6HA 1D9YA 5ELVA 1DPEA 2DYXA 4ZEIA 3T9VA 1RKMA 5CMMA 4H5GA 1B7HA 1H43A 3U8QA 1MY4A 5JTYB 2KLFA 1A7LA 1MQHA 1UTHA 3OO7A 3QXMA 1JNFA 3SETA 2QL3A 1M5FA 2O1MA 3N5LA 4IO4A 5DTBA 3VDFA 2RKMA 2Q2AA 1UTHB 5ITOA 4LA9A 4NE4A 3EHTA 4I8CA 4UACA 5FHMA 1O64A 3MC2A 1YCJA 3IO6A 3VVFA 4F3GA 3SEUA 2BJJX 3JV9A 3EN3A 4KQPA 2QS1A 1D4NA 2G29A 3MAMA 3MQ9A 2ZNTA 3O6IA 3ZSFA 5AA3A 1B46A 2XXIA 4DIGA 2RINA 3T93B 4G2ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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