3U93A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p2221 form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
252
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 78
structure length 252
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A02
1N84A 1H43A 2Q9TA 2YPNA 2NWJA 3OENA 2GHAA 2NOOA 4GD5A 5I58A 2HFBA 3VVEA 1NMUA 5CBSA 2DS9A 5TU0A 1Y4CA 1B2HA 3T9XB 2UYEA 1IXGA 1YTVA 4BDNA 4KYSA 3VLUA 3KOTA 2DVCA 4AB6A 2XD3A 3ILTB 1TWYA 3MPKA 3TCHA 3M3KA 3TFLA 4QSCA 1N04A 3MJNA 1B4HA 2IA4A 1BKAA 2V93A 1MXYA 3PD8A 4OYVA 3PUWE 1H45A 3RT6B 3KG2A 3BBRA 4DE8A 3ZSFA 3SERA 3CSGA 3UN6A 2AYSA 4OESA 5AA3A 3CIJA 4YU0A 2XX9A 3N26A 5LOMA 2Q2AA 3ZKKA 2I4BA 3C35A 2AL4A 1EZPA 2RC8A 1WODA 2XHDA 1MPDA 1Y20A 1ATGA 3FJGA 3V89B 1P1UA 3K1NA 3VDFA 5H8FB 5H8FA 4N13A 1B1XA 3E3KA 4ZZEA 5K2YA 2GRVA 4ZEIA 2CMOA 2W7YA 4FEBA 5CMBA 5I2NB 5I2NA 2O7IA 3CFXA 2I0BA 4X1BA 2DYXA 1QKBA 4GXAA 4QF9A 4JDFA 5I2KB 2AIXA 1D4NA 3KOSA 4GXSB 4KD5A 3TPAA 4F22A 3A09A 3IL1B 1B3FA 2I3WA 2VGQA 4IGTA 1S7YA 3GZGA 1NNTA 3KEIA 2V3UA 4G68B 4G68A 2P1SA 2DXRA 4MLQA 3Q28A 1LAFE 1R1NA 2OLBA 2RC9A 1O64A 2Y7KA 3T22A 1FQAA 3K02A 1I69A 4EXKA 5FTIA 4NF4B 5H8HA 2Q88A 3ODBA 2OJTA 5I57A 4NE4A 4YMAA 2XD2A 4ZEFA 3SEVA 3TQLA 1MM6A 5BUUA 2F6PA 3KGCA 2WKYA 4OWDA 4U4SA 1CE2A 4EUOA 5F7VA 1SYHA 3FV1A 2DXYA 5ICQA 3H6WA 1MDP1 4LZ5A 1B7HA 1NFTA 1EZ9A 3IORA 2GHBA 3SEWA 4WEDA 4F1YA 1VSOA 3Q29A 2UVGA 4KQPA 3C9HA 3TELA 4QSEA 3VXCA 4PFUA 2X26A 3V8XB 1JW4A 5AA2A 4F2QA 3K6UA 1JQFA 2XXRA 3Q25A 1B3LA 1LBCA 1FTJA 2H98A 4R2FA 3BKIB 3MVXA 3T9VA 4R2BA 3RPWA 4ONYA 1Z7NE 1N3XA 4QSDA 1MXWA 4F31B 2RKMA 3IB0A 3PPQA 3HV1A 1TXFA 2XXWA 4XKQA 4OFLA 1MXUA 4YB7A 3S9EA 5FHOA 2D5WA 2O1LA 5CMCA 3I6VA 3V5AA 3S9MC 2DE3A 2DWAA 2ONKE 5DVIA 3USDA 2UVHA 2O51A 3FXQA 3B6TA 1VR5A 1S50A 2DE4A 4BDRA 4H65A 3VFJA 2I0CA 3MC2A 2ZYMA 4ISUA 1M5BA 4OFJA 1AOVA 1DTZA 1LGBC 4BDLA 3OO6A 3OMBA 4RPOA 1A7LA 1B7UA 4Z7EA 4WEPA 5ITPA 1B0HA 1USYE 1B46A 3MZ9A 3ZKLA 3ZS6A 5I59A 5A5XB 2X7QA 1AL3A 2I3VA 4HW8A 4I8CA 1IQ7A 1SW5A 1QUJA 3U8QA 1J1NA 1USYH 4WKMA 5ITOA 3LSWA 3B6WA 3O9PA 4IO5A 3IO4A 1LAGE 5HBCA 2I58A 1MXZA 1LCTA 4PP0A 4LA9A 3FJ7A 3QYTA 2XXYA 3PUZE 2I4CA 3PPNA 3U94A 1OMPA 1B05A 4UACA 4NTLA 4M4GA 3CVGA 1NH7A 3N94A 3LSFB 1UIVA 2VOZA 1QUKA 3RTFB 5KCJB 2I48A 5KCJA 3IX1A 4XTCQ 1Y1ZA 3IO6A 1XHYA 3TTKA 1QJMA 1AH5A 1BTJA 1R6ZA 1BP5A 2HQ0A 2UXAA 1DPEA 4G8HA 3IOVA 1SW2A 1MXXA 3VXBA 3C31A 5JTYA 3E13X 1POTA 3U72A 4FIMA 4FJPA 4KI0E 3FUZA 4EQ9A 3IK6B 2QJEA 3PMXA 3S2VA 2H25A 1XC1A 2HEUA 1A99A 2M8CA 1PC3A 4LQ2A 3K1PA 4PFTA 5CC2A 1XOCA 1OQHA 2XXTA 5KZTA 5EHSA 2VD2A 4ZEKA 3FV2A 1R9LA 3KSXA 4FECA 4F1VA 2REJA 3UA8A 4KHZE 4R74A 4OHNA 1PDAA 2O1MA 3EN3A 5K2XA 3OSQA 4ELRA 4N6PA 2ESNA 4YAHX 1QW0A 4HS7A 2QMWA 2XXIA 4O3CA 3PMVA 1PBQA 3CG3A 3G3KA 1NNFA 2REGA 3O2AA 4NF6B 3MVZA 1MH4A 4IY5A 4Q8RA 1P1QA 4Z0IA 4C1TA 2DVZA 3H7MA 4GIZA 4I62A 3T9HB 5IKBA 1FTMA 1VE4A 4HTGA 1ZTYA 4F3PA 3EHSA 2HZKA 4OTEA 1B32A 4F39A 2DQVA 3K6VA 1FTLA 2HAVA 1FQEA 3FVKA 4RPNA 1UTHB 1UTHA 2DSFA 4LZ7A 4RXLA 1XVYA 3FASA 4YKPA 2PT2A 3MP6A 4G8NA 3MBPA 4YKKA 3M3FA 2OWSA 2Q89A 3IAZA 1DTGA 4OERA 4R75A 3PU5A 2P0SA 3H6UA 2ZMBA 2DE2A 3C4MA 2XX7A 3RGYA 1POY1 4ND9A 5ELVA 3TZAA 2NXOA 3OEKA 4ESXA 1I6QA 4RA1A 2ANJA 3PD9A 1A8FA 3MZ1A 4LZ8A 2QSXA 2F34A 1MPBA 5CM6A 1FTOA 3PPOA 5FHMA 2V3QA 3IOUA 2Y84A 4LONB 1D9VA 3TUSA 4FAJA 4KCDA 1Q1KA 1MRPA 1PBPA 2AL5A 3R26A 1A8EA 4NMYA 2B65A 2VP1A 4F29A 4LATA 1PB7A 2OCUA 4ZE9A 3CFLA 5JEIA 3S9LC 2I49A 2H4IA 4P0GA 4JWXA 3ONMA 1LCFA 2O69A 2ZNSA 1IITA 3GBAA 4PFYA 4BDQA 3G3FA 4R72A 3CR9A 3O66A 1AIVA 4OEVA 4MFIA 4ECFA 5CI5A 4R73A 4ZZAA 2YJPA 1LFIA 4YB6A 1ZJLA 5HPQA 4QFLA 4GVOA 3TMGA 1II5A 5H8SA 4FE8A 1A40A 3OEMA 2B3FA 5I2KA 1ZBMA 4NWCA 3IJXB 4JWYA 1B5JA 4IO3A 4JXIA 3TDJA 3IB2A 1EU8A 4IO7A 3QUFA 4N07A 3IJOB 2Z8FA 4JSDA 3N6TA 1LSTA 4RJZA 3KFMA 4NF4A 2IEEA 3OD7A 1B3HA 3N6UA 4THIA 5B7DA 4BDOA 1B4ZA 2RF1A 2F8DA 3K01A 2UVJA 2OZZA 3MW0A 2KLFA 4GFRA 1Y1MA 4K3FA 4QFKA 1I6BA 4DXCA 2O7UA 3IOWA 4YB5A 5L8DA 3DP8A 1LFGA 1XVXA 4GQOA 4DZ1A 1SW1A 3G3GA 5AA2D 4BLAA 1SDXA 5TPAB 2RC7A 3GLBA 3UP9A 1MY4A 3KN3A 3SKPA 5IAIA 3EF7A 5M2VA 3L6HA 4TLLB 1MY2A 5DVJA 3HN0A 3PV0E 3T9UA 2F36A 2R9JA 4EF1A 1JVYA 1MY0A 1VFEA 3MPLA 3TEPA 3LSXA 4G4PA 3K00A 2CZLA 4TQUQ 1O63A 4IGRA 3MUQA 1URGA 4F18A 2QS2A 1A54A 2Q2CA 1MQHA 1GR2A 4C1UA 3JYRA 3MVYA 1MY3A 3TODA 2A5TB 4XKPA 2A5TA 1IUDA 3VE1B 2FYIA 5ICTA 3U1OA 1TFAA 2QRYA 3RQTA 3RTWB 1MXVA 1EH3A 4RY1A 4NF8B 4POWA 1P1OA 1B3GA 2RINA 4MH5A 2QL3A 1D3KA 1HSJA 3U92A 1IXIA 3H03A 4MF3A 1DOTA 4XKNA 5DYHA 4GOTA 2Z8EA 3DLNA 3PUXE 5CMMA 2Z8DA 1FQDA 3H6VA 2LAOA 1Y4TA 4H8IA 3KBRA 4OETA 1JETA 2ALUA 1QUIA 1JVXA 1R9QA 3G3HA 1DPPA 3LBSA 2F35A 3MP8A 5A5XA 1YPNA 4P11A 1JW5A 1LAHE 2H9BA 3MQ9A 1S9TA 2Y7IA 2UYFA 1B40A 3FVOA 1P1NA 3G3IA 1MQJA 1SW4A 2ZXTA 1IZ1A 2FA7A 3OO7A 1N7WA 2QMXA 4P0IA 3CFZA 1DMBA 3W9VA 3E9XA 4H8JA 2XXXA 1MH3A 4YKJA 4ELOA 3FVNA 4Q5TA 3M8UA 1URSA 1OLAA 3EHTA 3LR1A 4ESWA 2ABHA 2DP8A 3K0VA 1M5FA 1PB9A 4UA8A 3SETA 1N3WA 3SEXA 1AMFA 4YICA 4EQ7A 3HCQA 4H67A 4DCXA 2PVUA 4JBZA 3QXMA 1LAXA 3HPIA 2QS4A 2Q8JA 5L9SA 4E0WA 3R7XA 3O29A 2UVIA 3WAFA 4OXVA 2HXWA 4H6DA 3MWBA 3TTMA 2V84A 3RLFE 2PMSA 2F5XA 4U22A 2I6EA 1M5EA 4KFQA 3FJMA 3TKDA 3QUJA 5I84A 3OO9A 4FORA 3PUYE 1IXCA 4PQJA 3KJTA 3C32A 2E1SA 1SVXB 1MDQA 3O6GA 2GH9A 3S4UA 4G2ZA 2V3TA 1RYOA 3QK6A 3RT8A 3I5OA 1O7TA 3UGWA 4YZZA 3OO8A 1FTKA 3LSLA 4QRZA 1UQWA 4ZS9A 4H1XA 1HSEA 1Y3NA 3IOTA 2DWJA 1IXHA 4WXJA 1TT1A 2A5SA 3RUMA 4C0RA 4OENA 4XXUA 1HSLA 3M3LA 4LUBA 3VVDA 3O97A 4GF8A 1OVTA 4NF6A 5CMKA 1B52A 3D4GA 4G77A 3CRBA 2PX1A 4F3BA 4EF2A 1TFDA 2XXQA 2RCAA 1US5A 3AXFA 4IB2A 4EQBA 2ZNTA 3TCFA 2ZYKA 3BFTA 3CI8A 2NVUB 1UTBB 1JEUA 2O68A 2YLNA 4JSOA 4DIGA 4PFWA 2Z22A 3C36A 1Y3PA 4EDPA 3H6TA 1IIWA 2F7AA 2D3IA 2DWIA 3H3GA 5DTBA 5H8NB 4R6KA 3KJ7A 4JB7A 3MZBA 4R9FA 4HCWA 4AQ4A 1DSNA 3PMWA 5CRYA 5F1QA 3N5LA 2Y7PA 1LLSA 2THIA 1OLCA 3C34A 3RY3A 3UIFA 5I58B 4F3GA 4TOZA 1FQCA 3K6WA 3FXUA 2F97A 3BFUA 1N76A 1B1HA 1F9BA 1P1WA 3VVFA 2ZYNA 1LB9A 1PB8A 1MS7A 2QPQA 5AA4B 5AA4A 1BIYA 2ONRA 2XXUA 3KN7A 1FQBA 4MLVA 1RKMA 3CSBA 4U2RA 3SEUA 1H44A 2DWHA 1YCJA 2ZNUA 4G68C 5H8QB 5H8QA 4DLDA 1LBBA 2OWTA 3ILUB 1FQFA 3IR1A 1ZIUA 4GL8A 3TAJA 3C33A 1NL5A 3JV9A 2HZLA 1SBPA 3H06B 3OOAA 1B5IA 3OELA 3QIMA 1MQGA 2QS1A 5ISUA 3WAEA 1YAEA 5L9OA 3FGSA 3L6GA 1LFHA 3LUYA 1B7ZA 4FATA 1CB6A 1QULA 1KWHA 2R71A 1MQIA 3GBBA 5EYFA 4FEDA 4GL0A 1QKAA 2RCBA 4RYAA 3VLWA 1ZMGA 1SD3A 3HSTA 4BDMA 2R6GE 3IB1A 4U23A 2O6AA 4DXUA 3Q27A 4GLIA 4KYDA 3O6HA 1JNFA 3SEYA 4ELQA 5H8HB 1Y3QA 1B9JA 3G7WA 1B3EA 4OVJA 1US4A 4L17A 3S9NC 1RYXA 2DOJA 5I57B 5I56B 4RK2A 5I56A 4AB5A 4I9DA 3OXNA 4GRKA 4LQ5A 3G3JA 2NUVA 3MAMA 4KYEA 5CBRA 5TPAA 3B7DA 2Z23A 4JWOA 2P2AA 3VLVA 3FXRA 3K1MA 3FD3A 3KN8A 4F2OA 4ZE8A 2BJJX 1L5TA 4KPTA 3W9WA 1B51A 1Q35A 3F11A 1H76A 2X7PA 1NNKA 1D9YA 5AA2B 5EHMA 3VV5A 4YMBA 1B58A 3SDFA 1URDA 4RK9A 3TTNA 1MM7A 4QHQA 4HCYA 1OVBA 1NH8A 4O3AA 4DXBA 1QVSA 4F19A 5FHNA 4ZEBA 4NF8A 3T66A 5DT6A 1ZU0A 3HHGA 4OMBA 5DVFA 4E0XA 3FVGA 4R6YA 2E0SA 1BLFA 4POXA 3OSRA 3THIA 1B6HA 1MG1A 2F78A 5TP9B 5L9MA 3PPPA 5TP9A 5AE4A 4KR5A 4YKIA 2OK2A 1FCKA 4X48A 3EPEA 3FATA 1ZKBA 4H5FA 1MQDA 3PGFA 1Z7ME 2PYYA 1ELJA 4IY6A 4DDDA 2FNCA 2B3BA 5J1DA 3O6IA 5HM4B 1M5DA 5B70A 1A55A 2XXVA 1JW1A 3TYHA 4QFPA 1H3DA 5I59B 2H99A 5AA1A 2Y7WA 5KDTB 4GWOA 5KDTA 1Y9UA 1OIBA 4NF5B 3O28A 4OEUA 4NF5A 4PETA 2GFEA 2Y7RA 3U93A 4PE5B 2F7BA 3PUVE 1UIUA 2ONSA 1MPCA 4I1DA 4U4XA 1EZOA 2HCAA 4ELPA 3CG1A 4IO2A 3SESA 1GVCA 5FTHA 4MBPA 3K2DA 2VD3A 3RNNA 1T0KA 4ZEDA 2OBGA 1N7XA 3UK4A 2ZYOA 1WDNA 3DELB 5BWJA 3UORA 4ZECA 1SYIA 4OZ9A 2V25A 4Q30B 1NNPA 1WVJA 4QFNA 3E4RA 3LC8A 1FW0A 4NEDA 4R9GA 4OQOA 2F7CA 4EXLA 1GGGA 3RN8A 2D21A 1MY1A 4ZDMA 1VFDA 5DEXB 4OFOA 5DEXA 3H4ZA 2G93A 3W15C 1SI0A 3A3CA 4TLMB 1I6AA 1LB8A 5JTYB 3GXAA 4U21A 4G8MA 2XXHA 2F6GA 4NWDA 3HO7A 3B6QA 4LP2B 3MVWA 2H5YA 3TTLA 4LVQA 3I3VA 3P7IA 1M5CA 3T93B 1B0LA 3PPRA 3TCGA 2PT1A 3K6XA 3DP4A 2HAUA 3DP6A 2G29A 1XT8A 1B5HA 3EQ1A 2QS3A 3R6UA 3MP1A 1XS5A 1ZLQA 4F3SA 4F1UA 4U1OA 4IO4A 1P99A 2PBWA 3DM0A 4X9TA 1PEBA 1ANFA 3D4CA 4M1VA 4RNSA 3Q26A 1NKXA 3V83A 3KSJA 4DCYA 1SQYA 4R6HA 1IEJA 2XXPA 2VHAA 3EHUA 5JK4A 1OQGA 3TQWA 1JEVA 3T96B 3FIRA 3A3UA 3FZVA 3KZGA 4KCCA 3HHFA 3QAXA 1UTBA 4X1DA 2O84X 4O3BA 4XIGQ 4U1ZA 4IO6A 3K4UA 3QSLA 4XKRA 4Q0CA 3TTRA 1SI1A 4QFOA 1GV8A 3ECRA 1GTKA 4H5GA 4H0WA 2XX8A 5H8NA 3JZJA 1N0TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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