3U93A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p2221 form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
252
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 252
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A02
3N6TA 3TPAA 1MH4A 3EPEA 3OO9A 3N5LA 3K02A 1OIBA 3MZ9A 4ND9A 4OFOA 4YU0A 4O3AA 1LLSA 4P0IA 3MZBA 2E0SA 5LOMA 3MZ1A 3G3HA 1GTKA 3USDA 2DS9A 1MQIA 4YKPA 1QKBA 3I5OA 4P11A 1GV8A 3HO7A 3BKIB 2ZYMA 3C32A 2QS4A 4U22A 2GHAA 2XXVA 3ZKLA 3IO4A 3IOUA 5L9OA 1B05A 2Z8EA 3PMVA 3TCHA 1CE2A 2D5WA 2F7BA 1O7TA 5TPAB 1TXFA 2PT1A 4R2BA 5CMCA 4GOTA 1HSLA 1VE4A 2ZYNA 3QUFA 4TOZA 4ZEFA 3EN3A 3U72A 1GVCA 2F6PA 3TODA 2XXXA 2F97A 3MP1A 4KHZE 2NVUB 1QUIA 4LATA 1SW5A 4DXCA 1FQAA 3DP8A 4L17A 1FTKA 2XX7A 1Y9UA 1MY4A 3PMXA 1S9TA 3F11A 4PFWA 3EHUA 4OWDA 4QSEA 3VV5A 5CBRA 1FQFA 2QJEA 2UVIA 3TTMA 4U23A 4JBZA 4Z0IA 3S9EA 5J1DA 2REGA 3E4RA 1I6AA 4NWDA 5ICQA 4NE4A 3PUZE 4G8MA 3OD7A 5DVIA 2DE4A 4F1YA 1N84A 5JTYA 1WDNA 3SEWA 3EQ1A 4QRZA 2F7CA 2Q88A 2NUVA 2O69A 3FXRA 2VD3A 4WEDA 4YB6A 1JEVA 4EXLA 1N3XA 4FE8A 5ITOA 3FUZA 3CFLA 1A54A 4FEDA 3TQLA 4LONB 4GIZA 2I3VA 1MQGA 1ELJA 4H5GA 3S2VA 3FJMA 5TP9B 3TKDA 4NF5A 3N6UA 1FQDA 1UQWA 4PQJA 2DE3A 3B6TA 3BFTA 4RK9A 4G68B 2PYYA 3RUMA 3MPKA 5H8QB 3PPNA 1B52A 2RC7A 2V84A 4FATA 1B7HA 4OEVA 1BTJA 3VVDA 5I84A 1YPNA 3M3KA 5I59A 3A3CA 3I3VA 5I2NA 3H03A 1M5BA 1JQFA 1Z7ME 4FAJA 3LSXA 2XD3A 1B9JA 1KWHA 3U92A 3SEUA 3JYRA 4PETA 3RTWB 3IORA 1NNTA 2O51A 4U4SA 2QS3A 4EF2A 3H7MA 4DCXA 5DEXA 3RQTA 3ONMA 2YJPA 1PC3A 4Z7EA 3PUWE 4FORA 1NH8A 1WODA 4IO7A 3LSFB 5FHMA 4ZEDA 1OLCA 1ATGA 2Q89A 2Q8JA 4DE8A 2HAUA 4MFIA 1JW1A 3S9MC 3RT8A 4LQ5A 4R75A 3THIA 1MXWA 5I57A 3TDJA 1LGBC 4R6HA 2AYSA 3S9NC 4GRKA 4R73A 4HCYA 3B7DA 2ALUA 2UYFA 4YAHX 1XVXA 4F18A 4ELOA 4JB7A 1JNFA 1MXXA 1M5EA 2GH9A 2W7YA 3VLUA 1MY1A 4NMYA 3RT6B 5CMKA 4KI0E 5TU0A 3SEXA 4OTEA 4NWCA 2OBGA 1PDAA 5L9MA 1XS5A 2F78A 2QS1A 1JVYA 4QHQA 1ZLQA 3FV2A 5KCJB 3KFMA 2DP8A 2Y7PA 1WVJA 4M1VA 5FTIA 4TLMB 5KZTA 3LUYA 5F1QA 3IOTA 4QFOA 4AB6A 3S9LC 3TEPA 2KLFA 4HCWA 3LSWA 4NF8A 1AL3A 1H44A 1P1OA 4RPNA 4F22A 1II5A 3N94A 3K0VA 4DXBA 1RYXA 1DSNA 2BJJX 4RA1A 4ZDMA 2I4CA 5AA2B 4POXA 1UIVA 4ECFA 3KJ7A 4P0GA 4F2OA 2ZYKA 5CM6A 4NF4B 2I49A 4Q0CA 3TQWA 5KDTA 2V3TA 4N07A 3W15C 4JSDA 4GD5A 4G8HA 4OERA 4RY1A 1UTBB 4IY5A 3VVEA 3PUXE 1LAHE 1TFAA 2I48A 4TQUQ 2QMXA 3LR1A 4WKMA 1RYOA 2Y7IA 2A5TA 3TTKA 3G3IA 3FVGA 2O1LA 1XC1A 2B3FA 2ONKE 3MVZA 1GR2A 1R1NA 1YCJA 2WKYA 4ELQA 4YKIA 3A3UA 3KN7A 1LFHA 1IITA 4PFUA 4ZZEA 1JVXA 3KOTA 1DOTA 2RKMA 3VDFA 4F1VA 2VGQA 3UA8A 5A5XA 1B40A 2Q2CA 4WXJA 3TTLA 4MBPA 2R71A 1ZIUA 3MC2A 1FTOA 1MS7A 2Y7KA 4PFTA 4EF1A 3WAEA 4POWA 1QVSA 3OO8A 1N3WA 3DM0A 4LVQA 3PD8A 3TYHA 2QSXA 3TZAA 3OENA 1FTJA 1SVXB 2ONSA 5I56A 2RCBA 3GBAA 1NMUA 4WEPA 1ZJLA 5AA1A 1AMFA 3RTFB 3H06B 1LAGE 3O28A 4GQOA 4XKQA 3KEIA 3H3GA 2OK2A 2ONRA 2XD2A 3PPOA 1LSTA 2UYEA 1US4A 2O7UA 4IY6A 1PEBA 4R72A 4THIA 2Y84A 4Q8RA 1Y4TA 4YICA 1A40A 1IXIA 4JWYA 4ESWA 4LZ8A 4LQ2A 2A5SA 3U1OA 5JTYB 3MAMA 2R6GE 4KR5A 3V5AA 3OMBA 4H0WA 4K3FA 3O29A 3CI8A 3VFJA 3QK6A 4KYSA 4EDPA 4LP2B 4LZ7A 1XOCA 3MBPA 4RNSA 1UIUA 1JW5A 1SQYA 5H8FA 1URDA 4NF6A 2DXRA 1URSA 3OO7A 4JDFA 3PPPA 4QFLA 1D3KA 1QUKA 4NF5B 2RF1A 2HCAA 3GZGA 3RLFE 1M5DA 2Q9TA 4OVJA 4U1ZA 3FV1A 3PU5A 4OFLA 3CG3A 1AH5A 3C9HA 3Q28A 3HSTA 3VXBA 3MVYA 4ONYA 4GXAA 1A8EA 3IR1A 1SI0A 2DOJA 3MVXA 1LBBA 2DQVA 3BBRA 3KN3A 4RXLA 2GRVA 2F5XA 3D4CA 3DELB 1IZ1A 5I59B 4ISUA 1Y3NA 4E0XA 1NH7A 5I2NB 4X1DA 2G93A 5H8SA 3O6HA 2ZXTA 1Q1KA 1XVYA 1POY1 4UA8A 3U8QA 3S4UA 2HXWA 2P0SA 4OZ9A 2Y7RA 3Q26A 4F3PA 2REJA 5DEXB 1LFGA 1NKXA 1D4NA 2I0BA 1B46A 4Q30B 4G68C 3K6WA 5I2KA 1B3GA 1M5CA 3OSRA 3QUJA 1MRPA 1BP5A 3HCQA 4C1UA 4XIGQ 2O68A 1SW1A 2DVZA 3ECRA 4EQ7A 3PPRA 2G29A 2M8CA 1IXCA 1VSOA 1SDXA 1N76A 4RK2A 5AA4B 5I57B 2OZZA 3U94A 3IAZA 5JK4A 4EUOA 2DVCA 4X9TA 4ZEIA 1US5A 4OMBA 2RINA 4X1BA 3FXQA 1BIYA 4XKRA 2Z8DA 1DTGA 3VE1B 2XXRA 3WAFA 5DTBA 1B4ZA 3K1PA 4RPOA 1N7WA 4U21A 3UK4A 2ZMBA 2IA4A 5M2VA 2VOZA 2RC9A 1B5HA 2Z22A 3UN6A 3H6WA 1MPBA 1L5TA 4KQPA 1FTMA 2UVGA 5EYFA 1SW4A 1MQDA 1LAFE 3LBSA 2OCUA 2F36A 3E9XA 3OXNA 4H8JA 4I9DA 2HFBA 3G3FA 3HN0A 1B7UA 2VD2A 1OVTA 1R6ZA 3JV9A 3OEMA 4H1XA 1IIWA 1EU8A 3CFXA 5EHSA 5BWJA 4BDMA 3L6GA 4ZS9A 5H8NA 1MXYA 1LCTA 3HHFA 1PB9A 4R2FA 4IO6A 5KDTB 1QKAA 4KYDA 5K2YA 1IXGA 4ZEKA 3JZJA 4IO3A 5DVFA 4GVOA 5FTHA 4F3GA 2QRYA 4DXUA 1VFEA 3K6UA 1LB8A 4U4XA 5HPQA 3MUQA 4QSCA 4YKJA 2E1SA 4GF8A 4ZE9A 4NTLA 4F1UA 2FNCA 3B6QA 2XXQA 1Y1ZA 1MQJA 1I69A 4YMAA 1B2HA 1PB7A 3HHGA 1B1HA 2R9JA 3FZVA 1NFTA 3H4ZA 3T9UA 3PPQA 4KPTA 4NEDA 2D21A 2AIXA 4PE5B 1ZMGA 1MH3A 3VLVA 1FQEA 4JWXA 3U93A 4KYEA 3SEYA 1B32A 4GFRA 1IXHA 3IJOB 4KCCA 2OWSA 4QFPA 1R9QA 5A5XB 3K1MA 3TCGA 1Y20A 1LBCA 1MDQA 1OVBA 4EQ9A 2F7AA 4M4GA 1ZBMA 1NNKA 1MDP1 5H8HB 4MLQA 1B58A 1TT1A 2P2AA 3VXCA 2V25A 3O9PA 1POTA 1MY2A 3VLWA 3SERA 2YLNA 3KN8A 2OJTA 3KG2A 3FXUA 3KJTA 5I56B 2B3BA 1SBPA 4OFJA 1DMBA 4EQBA 5CC2A 1FCKA 1PB8A 2VHAA 5FHNA 2P1SA 5AE4A 2ZNUA 4O3BA 5AA3A 2QMWA 1USYH 1B3LA 1EZOA 5DYHA 4KCDA 4GWOA 4GL0A 5KCJA 1O64A 5JEIA 3UORA 3R26A 3KSXA 3QYTA 4FECA 3C33A 4IO4A 4UACA 2I58A 4N13A 2GFEA 4OEUA 4F29A 5IAIA 2IEEA 2X26A 4IO2A 1UTHA 1BKAA 5AA2D 1MXVA 4F19A 3G7WA 1FQCA 2XXTA 3KSJA 3MWBA 5AA2A 1DTZA 3ILUB 1MG1A 2Y7WA 2UVJA 1O63A 3EF7A 2O6AA 1D9VA 1SD3A 4QSDA 2YPNA 4ZEBA 5B7DA 2H4IA 3OELA 3T9VA 2DWIA 1B5IA 1IEJA 3GXAA 4N6PA 1ZTYA 3T96B 1J1NA 2O1MA 4GXSB 1HSEA 5L8DA 1PBQA 3T66A 3TTRA 3C31A 5CBSA 2I4BA 3KZGA 3AXFA 3FATA 3H6UA 3IB1A 3M3LA 2Z8FA 1VFDA 3G3JA 3MJNA 1QJMA 1IQ7A 2PBWA 3TUSA 3IK6B 1S7YA 5BUUA 1R9LA 4H65A 4U1OA 3C4MA 4XTCQ 3MP8A 4G2ZA 3ZS6A 4JSOA 4I8CA 4R9GA 3W9WA 1JEUA 4JXIA 3MQ9A 5I58A 3OOAA 3C35A 4HTGA 4F3BA 4KD5A 4XXUA 3TTNA 3SDFA 1LAXA 2O84X 1B3FA 1B0HA 1I6BA 2XXUA 4F31B 2NXOA 5HM4B 3I6VA 3B6WA 2ABHA 3EHTA 3FD3A 5I2KB 1B1XA 4YMBA 4R74A 3PD9A 4H8IA 4DCYA 3C36A 1MPCA 4DLDA 4JWOA 1Y4CA 4FJPA 1Q35A 1YTVA 2ZNTA 1MXZA 1NNPA 1A7LA 3T9XB 2DYXA 4BLAA 3CG1A 3PMWA 3OEKA 3H6TA 5CMBA 2D3IA 2QPQA 4G77A 2DE2A 3GLBA 4DZ1A 3DP4A 3V83A 1F9BA 3IJXB 4QFNA 1SI1A 2PX1A 4E0WA 2QS2A 4C1TA 3MW0A 2THIA 2H9BA 4ZE8A 5IKBA 3CSGA 2XX8A 1FTLA 1SYHA 4H6DA 3V8XB 1MPDA 1TFDA 1Z7NE 1LB9A 3T22A 4LUBA 3MPLA 3KBRA 5F7VA 1ANFA 3O6GA 1QUJA 2FYIA 2ZNSA 3K1NA 1OLAA 1N0TA 1OMPA 2XXHA 1Y3PA 5TPAA 4MLVA 4YZZA 3UP9A 4KFQA 1H76A 2OLBA 4R9FA 3E13X 3FIRA 3PUVE 3RPWA 1B5JA 2DWJA 3QSLA 2V3UA 2DSFA 1CB6A 1MY0A 4ELPA 2F35A 3K6VA 2XXPA 5H8NB 2UXAA 1BLFA 4EXKA 3K2DA 3RN8A 4BDOA 1OQGA 4F2QA 1MQHA 3FJGA 1URGA 4I62A 1XHYA 1MY3A 5DT6A 4BDNA 3MP6A 3TCFA 2HZLA 1B3EA 1JW4A 1DPEA 3L6HA 1IUDA 4IGRA 2NOOA 4H67A 4ELRA 1MM6A 2OWTA 4OETA 4F39A 3IB0A 3OSQA 4HS7A 3K00A 1B4HA 3CRBA 2V3QA 4G8NA 5K2XA 4IO5A 2QL3A 2GHBA 3DLNA 3D4GA 4LZ5A 3FASA 3ZSFA 1PBPA 3TELA 3IX1A 2AL5A 2H5YA 4RJZA 1N7XA 4AQ4A 5CRYA 2DWAA 4PP0A 4G4PA 5ISUA 3PUYE 4HW8A 1A55A 3K01A 3SEVA 1N04A 2DXYA 3RNNA 4DIGA 3RY3A 3LC8A 4NF8B 3O66A 4ESXA 3ILTB 4BDQA 2AL4A 3UGWA 1AIVA 4YKKA 1MM7A 3K4UA 2H25A 5EHMA 3IOWA 2XX9A 5TP9A 4QF9A 1EZPA 3IB2A 2H99A 3CIJA 3TFLA 4OYVA 1P1NA 3O97A 3O6IA 3IOVA 3V89B 4TLLB 1NL5A 5AA4A 1H3DA 4G68A 1AOVA 3MVWA 1A99A 5B70A 5H8QA 1B0LA 5ITPA 3UIFA 3QAXA 2XXYA 2PT2A 1B6HA 1GGGA 2UVHA 1B51A 2HQ0A 3IO6A 3FVKA 3R7XA 3CVGA 1QW0A 1ZKBA 1H45A 1SW2A 3W9VA 3OO6A 1Y1MA 3QIMA 3H6VA 2HEUA 2A5TB 2Z23A 1A8FA 1P1UA 4GLIA 2F8DA 2F6GA 4OESA 1USYE 3FGSA 3T93B 2I6EA 1T0KA 1D9YA 1TWYA 1DPPA 3M8UA 4AB5A 4LA9A 4ZECA 1NNFA 4F3SA 4I1DA 4U2RA 5ICTA 1RKMA 1ZU0A 3K6XA 3ZKKA 1VR5A 4O3CA 2RCAA 4X48A 3G3GA 2PMSA 3A09A 2X7PA 4IB2A 1LFIA 5HBCA 3Q25A 4OQOA 2ANJA 1UTHB 4Q5TA 1FQBA 1P99A 1XT8A 2ZYOA 3QXMA 5CMMA 1OQHA 3LSLA 3SKPA 4PFYA 2XXIA 3FJ7A 4YB7A 4ZZAA 1I6QA 1MXUA 3C34A 2I3WA 3ODBA 1LCFA 3KOSA 2X7QA 4R6KA 1M5FA 3CR9A 2PVUA 2XXWA 5FHOA 3Q27A 3VVFA 4MH5A 1FW0A 3R6UA 2FA7A 2I0CA 4QFKA 4DDDA 1B3HA 1QULA 3DP6A 4RYAA 2H98A 1P1QA 2CMOA 2XHDA 2RC8A 3Q29A 4MF3A 1JETA 4FEBA 4BDLA 4C0RA 3CSBA 1YAEA 4OENA 1P1WA 3PV0E 5ELVA 4H5FA 3SETA 2HAVA 3SESA 5DVJA 3EHSA 3E3KA 3KGCA 3PGFA 4OXVA 4XKPA 3GBBA 3IL1B 3T9HB 1SYIA 4YB5A 2LAOA 3HV1A 4OHNA 2O7IA 1EH3A 5I58B 2VP1A 2F34A 2B65A 1B7ZA 3N26A 1Y3QA 1H43A 4BDRA 3FVNA 2DWHA 1HSJA 3HPIA 3RGYA 4XKNA 4GL8A 4IGTA 4NF4A 3M3FA 5H8FB 5L9SA 3G3KA 3O2AA 4NF6B 4FIMA 1S50A 2ESNA 2V93A 5H8HA 3TAJA 3FVOA 3TMGA 3P7IA 2NWJA 1UTBA 2CZLA 2HZKA 3CFZA 4R6YA 1EZ9A 5CI5A 2Q2AA 3BFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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