3U93A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p2221 form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
252
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
total genus 78
structure length 252
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A02
3H6VA 4KI0E 3U72A 1Y20A 1B3FA 1SI0A 4WXJA 1N7XA 2V84A 4G68B 3OSQA 4EF2A 3RLFE 3CR9A 3KSXA 2FA7A 3TKDA 2F7CA 1BKAA 3E9XA 2V3QA 2GH9A 1MPCA 3H7MA 2Q8JA 1B46A 3SDFA 1JEVA 5HBCA 1SQYA 1MY4A 4RXLA 2VD2A 2VOZA 1NH8A 2RCAA 2XX7A 2A5TA 3PPQA 5DT6A 4ZDMA 3TQLA 1JQFA 2DWAA 1B3GA 1URDA 2F6PA 2I48A 2I4CA 2YJPA 3G3IA 4G68A 1WODA 1IXCA 3CIJA 1ZBMA 1NNTA 3E13X 3UA8A 4U23A 4F29A 3KN8A 1MXYA 3U93A 5DYHA 3OO9A 4G2ZA 1BP5A 3KOSA 3SEWA 1R9LA 1SVXB 4OWDA 5CM6A 1EU8A 2ZXTA 3HO7A 4GL0A 3G3GA 1H44A 3N5LA 5EYFA 1IITA 3MP6A 1DTZA 5H8FA 4GWOA 2UVGA 4QFPA 3CSGA 1R6ZA 4R2BA 3Q27A 5FHOA 5BWJA 3PPNA 1B5JA 3MQ9A 4POWA 2AYSA 2AIXA 3N6TA 3U94A 3WAEA 4ELRA 2O1MA 4KFQA 5AA2B 3ODBA 4WEPA 3JV9A 3UN6A 1GV8A 4LZ7A 1MPDA 5B7DA 1VFEA 3H6TA 4H6DA 4OXVA 3RPWA 4GIZA 4U4XA 1I69A 1ZIUA 2XXWA 4GQOA 4IO5A 5H8HB 2DYXA 2Y7WA 1N3WA 3LBSA 1D3KA 1A8EA 3N26A 3FASA 1MDP1 3HV1A 3TQWA 3CG3A 4GLIA 4ND9A 3A3CA 2RC9A 3C31A 3TTKA 1MXVA 4C1TA 1IXHA 3IJXB 3VXBA 4QFLA 4GFRA 1B0LA 1B7ZA 2DQVA 3B6QA 3F11A 3Q26A 1TXFA 1B4HA 1B51A 2PX1A 3CFXA 3JYRA 2XHDA 2PVUA 1OLCA 3FUZA 3O97A 4XTCQ 5DVFA 3PD9A 4R74A 1DTGA 5I57A 1H3DA 5CBRA 1XS5A 5A5XA 3VVEA 4ELOA 3FVOA 3TCFA 2UVJA 4NWDA 2PT1A 3SEXA 4YZZA 1FQEA 2HFBA 3SETA 1OQGA 1MQDA 1JEUA 1XVXA 2V3UA 4L17A 4NF6B 1FTKA 2UYFA 3T66A 2XXTA 4JSOA 1RYOA 3QSLA 4RY1A 5I58B 5DVJA 3M3KA 4FECA 4OYVA 2H5YA 4LVQA 4F2QA 3K1NA 4QFNA 1PB9A 3QYTA 1QKAA 2OBGA 1XOCA 3MC2A 3R26A 4IGRA 1N0TA 2H25A 4GXSB 5TP9A 2KLFA 5CMKA 4PFYA 1PB8A 3EHTA 1A99A 3RGYA 5H8HA 3OEKA 2H9BA 4QF9A 1IXGA 3IL1B 3LR1A 2QS4A 3LC8A 3MJNA 1LAGE 4YB6A 3RT8A 1HSJA 2H98A 2ESNA 5DEXA 5FHMA 4Z7EA 3O6HA 3PU5A 3C34A 3MBPA 3MPLA 5CI5A 4NF8B 2F78A 4FIMA 3OXNA 5ELVA 1MXUA 4IO6A 3EF7A 2ALUA 3W15C 3FXQA 4KD5A 4N13A 4PQJA 3THIA 2RC8A 4OZ9A 5ISUA 3PUVE 1MH4A 4DE8A 4OFJA 3TTNA 1LCFA 4HW8A 1UTHA 4ZE9A 4FEDA 1TWYA 4E0XA 5I59A 1MQJA 3MVZA 1NKXA 1MG1A 3OELA 5JEIA 3C33A 4HTGA 4XKPA 1MY0A 4MH5A 3T93B 4BDNA 1P1WA 4ZEFA 1OMPA 3MP8A 4NMYA 1F9BA 3C36A 4UA8A 3V89B 3TEPA 1BLFA 4O3BA 2V3TA 2HEUA 3T9HB 3K6XA 4MLQA 4NEDA 3RNNA 3TAJA 3K6VA 4F22A 1MQHA 1UTBB 3A09A 4BDRA 3OO7A 1URGA 2PT2A 3VFJA 3IORA 3SERA 4O3CA 4LA9A 3FJGA 1URSA 2UVIA 4JSDA 4U22A 2Q9TA 1US5A 1YCJA 2VGQA 1D9YA 2F36A 4MF3A 3PV0E 5AA2A 3RUMA 1SBPA 3V83A 1AH5A 4U1OA 4TLLB 3O66A 2Q89A 2Y7RA 1P1QA 1N76A 2VHAA 2Y7IA 5H8QB 2B65A 5TPAA 1Y1ZA 1Y3NA 1N3XA 3PMVA 1TT1A 4H0WA 4KCDA 3K1MA 4H5GA 4OVJA 1YAEA 3HN0A 4QFOA 1A55A 5L9MA 3QUJA 4ZEKA 3LSWA 4DDDA 1L5TA 4FEBA 1XHYA 4YKPA 2V93A 4F18A 3QK6A 3U92A 3VVDA 1NFTA 2HQ0A 4ZECA 1JETA 5EHMA 3SEUA 3DLNA 4IGTA 3PUWE 1O64A 1B7UA 2H4IA 4EXLA 1KWHA 2E1SA 4R9GA 2OWTA 2B3BA 1HSEA 2XXIA 3A3UA 2OCUA 3D4GA 3PMXA 2HCAA 2O84X 3B6TA 4N07A 5K2YA 4ESXA 5AA3A 1IUDA 3ZSFA 1B5IA 3LSLA 3W9VA 2REGA 5KZTA 1MXWA 1B40A 3FJ7A 1JW1A 1H45A 2XD3A 4F3BA 2DE4A 3MP1A 2RC7A 3N94A 4AQ4A 3KEIA 1FCKA 2XXPA 2DWHA 1IQ7A 2FYIA 2R71A 2THIA 3G3HA 2XXVA 3D4CA 1FW0A 3KZGA 3IOUA 3O6GA 4NF5B 4OHNA 4Q0CA 4THIA 3TELA 5KDTA 3H6UA 3O6IA 1B52A 2DVZA 2HZKA 3K6UA 3UGWA 4F3SA 5I2NA 3I3VA 1SI1A 5AA4B 2Z8EA 5KCJA 4PFWA 3O9PA 1SYIA 1WDNA 2O51A 2REJA 1II5A 1ZJLA 4MFIA 4NF4A 4NF8A 1H76A 4RPOA 4EUOA 4H5FA 1Q35A 4GF8A 5ITOA 3TDJA 5B70A 2IA4A 3T22A 1LBBA 4FE8A 1BIYA 3MVYA 5L8DA 2UYEA 4WKMA 4IO3A 1NNFA 2UVHA 3TTMA 2I49A 3KN3A 4ZZAA 4G8HA 4I1DA 2O7UA 2HAVA 2I3VA 4HS7A 4POXA 1LBCA 4R6HA 4ZZEA 3T9UA 1A54A 2I0BA 3K0VA 3CFLA 3G3JA 3K02A 4UACA 4XIGQ 5I2KB 2FNCA 1DMBA 2XX9A 1ELJA 1AL3A 1P1OA 2Y7PA 3MVWA 3BFUA 3PD8A 4IY6A 4F1VA 1AIVA 3FV1A 3P7IA 1USYH 4OEUA 4OFLA 1JVXA 5AE4A 5M2VA 4KYSA 1EH3A 3PUXE 2D3IA 4GRKA 4DXUA 1UTHB 1MRPA 3MUQA 4YKJA 5TPAB 3Q29A 3L6HA 4ZEIA 3ZS6A 3KGCA 3MW0A 2ANJA 2NXOA 2DWJA 5A5XB 3M8UA 1LFGA 3PUZE 2Z8DA 5I56B 3DP6A 3ILTB 4R72A 3EPEA 4HCYA 4IY5A 3TODA 2RF1A 2QMWA 3HPIA 1I6AA 4G77A 1OVTA 4AB5A 4P0GA 4DIGA 5K2XA 1FTJA 1Y3PA 2GHBA 1YTVA 5JK4A 1VR5A 1YPNA 2G29A 1SW4A 1B3LA 2Q2CA 4KHZE 1NL5A 1UTBA 3DP8A 4GXAA 2Q88A 2QPQA 4LZ5A 1RYXA 1O63A 3FVGA 1WVJA 4QSEA 3CRBA 4JWYA 4QSDA 1P99A 3QUFA 2ZYOA 3BBRA 1MXZA 3H06B 4BLAA 2YPNA 3H6WA 4F3GA 5I2KA 4H8IA 3OOAA 4LQ5A 3CFZA 4TLMB 3K2DA 1XT8A 1GVCA 1B58A 4Q5TA 5FTIA 1D9VA 5I59B 1I6BA 3UIFA 4H8JA 3E4RA 4OEVA 3TUSA 4F19A 2NOOA 5AA2D 2ABHA 1MH3A 4RNSA 5I58A 2I0CA 5L9SA 3H3GA 4IB2A 1CB6A 1MXXA 2W7YA 1VSOA 2LAOA 4MLVA 4RPNA 2Z23A 3HHGA 4EQBA 5ITPA 2PBWA 4ZEDA 2VP1A 1N84A 3G3KA 2IEEA 2RKMA 3KG2A 4R2FA 3W9WA 3FIRA 1O7TA 3IOVA 4M1VA 4WEDA 1PBPA 2F97A 4LONB 4QRZA 4YKKA 4FORA 5AA1A 2QL3A 3LUYA 1Y4TA 4QSCA 5DVIA 3S9EA 3C9HA 1AMFA 2CZLA 1PDAA 4U1ZA 1GGGA 3K6WA 3PPRA 3K01A 1B1HA 5F7VA 4EXKA 1AOVA 1B6HA 1SDXA 3OEMA 4XKRA 1QJMA 3DP4A 4K3FA 3S4UA 4X9TA 3GZGA 4EF1A 2XXHA 3CG1A 2P0SA 4LATA 4Q30B 3ZKKA 3MAMA 4FJPA 4R75A 4KR5A 3RT6B 4FAJA 5HPQA 4F3PA 4OESA 4R6YA 3LSXA 2DS9A 3T9VA 1B7HA 2P2AA 4ELQA 3T9XB 1JVYA 3MPKA 2O6AA 3MZ9A 3TCGA 2WKYA 1MDQA 2I3WA 5H8SA 4C0RA 3K4UA 2HZLA 2ZYKA 5I57B 1FTOA 3FD3A 1UQWA 3IK6B 3KJTA 4F39A 2V25A 3HCQA 1Y9UA 2PMSA 3C32A 3G3FA 4X1DA 5H8FB 3SEYA 3PPPA 4DCXA 2F35A 2GHAA 4HCWA 4YU0A 4LZ8A 4YAHX 4X1BA 2NWJA 1EZOA 2X26A 2QS2A 1J1NA 2ZYNA 3IB0A 1M5DA 4BDOA 1M5FA 1R9QA 1B0HA 3BKIB 3TTRA 4AB6A 2F7BA 1UIUA 3V5AA 1Y1MA 2XX8A 4ESWA 3H4ZA 3IOTA 1MY2A 1D4NA 1IZ1A 1OVBA 5CBSA 1QULA 4RJZA 2A5TB 2E0SA 4IO2A 3MWBA 5CMMA 3ONMA 3O29A 1POY1 3FXRA 1BTJA 2QMXA 3R6UA 4DXCA 5BUUA 1Y4CA 3RY3A 1JW5A 5ICTA 1LGBC 1NH7A 4JDFA 4R9FA 3EHUA 4H1XA 4NF4B 4R6KA 3IJOB 1IEJA 4JBZA 2F34A 3OO8A 4GOTA 4M4GA 2Q2AA 5J1DA 3HHFA 2ZNTA 1QUKA 1S50A 5CMCA 4LUBA 1TFDA 5L9OA 3GLBA 3VVFA 3QXMA 5KCJB 1ZMGA 2Y7KA 1NMUA 3SEVA 2I58A 3G7WA 3OSRA 5I2NB 3O28A 2NUVA 3OMBA 5H8QA 2O68A 5FHNA 4YMBA 1M5EA 1B32A 4OENA 3E3KA 1RKMA 3FGSA 1IXIA 3DM0A 2AL4A 1IIWA 4XXUA 4F1UA 1A7LA 2I4BA 3MVXA 1FQDA 4F31B 2OJTA 4QFKA 1LFHA 1B3EA 4YB7A 5FTHA 3S9NC 1MS7A 3S9LC 4GL8A 3IB1A 3VLUA 4JWOA 3KOTA 4EQ9A 2BJJX 4KYEA 4ONYA 3ILUB 3S9MC 1P1NA 1PBQA 2ONRA 1EZ9A 3UK4A 4N6PA 4OETA 4DXBA 2QRYA 4YMAA 2OK2A 3BFTA 3RTFB 3RTWB 3FV2A 1R1NA 3VXCA 3Q25A 2ZNSA 4ZS9A 1HSLA 3M3LA 1MPBA 1VFDA 3KFMA 4IO7A 3U8QA 1MM7A 1LAXA 1POTA 4I62A 1B9JA 1MQGA 4YKIA 3U1OA 4ELPA 1PB7A 3EHSA 4ZE8A 4H65A 5ICQA 1NNPA 1VE4A 3HSTA 5AA4A 4X48A 3M3FA 4DCYA 4EDPA 3SKPA 2PYYA 1DSNA 3C35A 1US4A 4RK9A 5F1QA 3ECRA 1B1XA 3IO4A 3IR1A 3FVNA 2Z22A 4P0IA 3TTLA 3L6GA 1DPPA 4ZEBA 2GRVA 2AL5A 4Z0IA 2I6EA 3WAFA 4QHQA 3MZ1A 5H8NA 3V8XB 3FZVA 4F2OA 2M8CA 1LAFE 2G93A 4FATA 1M5BA 1MM6A 1ATGA 3FVKA 3GBBA 5CC2A 4NWCA 3TCHA 2A5SA 4U21A 3R7XA 4KQPA 2D21A 1FQFA 1MY1A 1FTLA 1N04A 1QUJA 2P1SA 2YLNA 3B6WA 4G8MA 2H99A 4RYAA 5EHSA 1CE2A 4LP2B 2HXWA 3OD7A 5IKBA 1T0KA 3KBRA 3QAXA 4OERA 4JWXA 2DXYA 3I6VA 4F1YA 2R6GE 4I8CA 2F8DA 3K00A 5LOMA 1B05A 2UXAA 1Q1KA 3B7DA 4R73A 1FQCA 2QSXA 2Z8FA 3PGFA 4U4SA 3TZAA 3C4MA 1SW2A 4C1UA 5H8NB 4BDMA 5JTYA 2RCBA 2XXUA 1FTMA 1PEBA 2ONKE 2XXRA 3PPOA 4O3AA 2OZZA 1OQHA 2F5XA 1S9TA 4I9DA 1M5CA 5HM4B 1P1UA 1SW1A 4JXIA 1FQAA 1JNFA 1ZLQA 4JB7A 5JTYB 3N6UA 4GD5A 3IX1A 4IO4A 3FATA 4OTEA 1USYE 3KSJA 3IAZA 4PETA 3PMWA 5DEXB 4Q8RA 2XXYA 3K1PA 3CSBA 4KYDA 3VLWA 2XXXA 3KJ7A 4RA1A 4EQ7A 3PUYE 1B4ZA 5TP9B 4ISUA 3KN7A 1PC3A 2F6GA 3EQ1A 4U2RA 1LLSA 1MQIA 1ANFA 2DE2A 2O7IA 4PFTA 1QUIA 1QVSA 2DSFA 1ZTYA 2X7QA 1A8FA 3O2AA 3UP9A 4BDLA 4G4PA 4PFUA 4XKNA 5DTBA 3JZJA 2B3FA 3VLVA 5CRYA 4BDQA 4PE5B 1B3HA 2ZMBA 2ZNUA 1ZU0A 2CMOA 1DOTA 1LSTA 2F7AA 4OMBA 4KPTA 1N7WA 3TMGA 4PP0A 3UORA 4LQ2A 2X7PA 2HAUA 1OIBA 2ZYMA 2DE3A 1JW4A 4OFOA 5I56A 3S2VA 4NF5A 1Z7NE 4G8NA 4TQUQ 3GBAA 5I84A 3DELB 4TOZA 4NE4A 4E0WA 2R9JA 3IB2A 3SESA 2O1LA 1SD3A 2O69A 3GXAA 2D5WA 1Y3QA 1Z7ME 2DWIA 2GFEA 1SYHA 3IO6A 2DVCA 1LFIA 1UIVA 1FQBA 2DXRA 3IOWA 1I6QA 2RINA 3VDFA 1XVYA 5CMBA 3I5OA 1SW5A 1TFAA 1H43A 4ECFA 1A40A 4NTLA 1OLAA 2QS3A 3FXUA 2NVUB 3Q28A 3ZKLA 1LB9A 1B5HA 5IAIA 3T96B 1GR2A 1GTKA 3CVGA 3VV5A 3RQTA 3CI8A 2Y84A 2DP8A 2OLBA 4XKQA 3TFLA 3MZBA 3EN3A 2DOJA 4NF6A 3FJMA 3VE1B 4KCCA 3USDA 1EZPA 3QIMA 1B2HA 3RN8A 4DZ1A 3TPAA 1ZKBA 4DLDA 2OWSA 1S7YA 2XXQA 2ONSA 3LSFB 1DPEA 4H67A 4RK2A 5TU0A 4G68C 1LB8A 4OQOA 4GVOA 4YICA 4P11A 4YB5A 2XD2A 3OENA 2QJEA 3AXFA 1NNKA 1XC1A 1MY3A 5KDTB 3H03A 3TYHA 2QS1A 2VD3A 1QKBA 1LAHE 1LCTA 1QW0A 4MBPA 3OO6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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