3U93A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p2221 form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
252
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
total genus 78
structure length 252
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A02
2YPNA 4NF5B 2O84X 2XXIA 4OWDA 4R75A 2V3UA 3KJ7A 1OMPA 4GOTA 2DWJA 1DTGA 1MDQA 2XXYA 4IO3A 3LSWA 4OYVA 3FJ7A 4QSCA 5HM4B 4WEDA 3Q26A 1QUJA 4Q5TA 4C0RA 2QPQA 1B0HA 2IA4A 2IEEA 2VD2A 3K0VA 4DXBA 4ZECA 5L9SA 5I57B 1QUKA 3E9XA 2ZNSA 1TFDA 2O1LA 3FJMA 4QF9A 5CM6A 3S9NC 1MY3A 1DPPA 2QRYA 3K4UA 4FIMA 4ZE9A 1LFGA 3SEWA 1PDAA 4PFUA 2I49A 1MXUA 3PU5A 4N13A 2HEUA 2PX1A 3OXNA 3PUXE 4XKQA 3FJGA 3PPNA 4NF5A 2QS1A 3CFZA 4F2QA 3TTLA 1H43A 5KCJB 1SVXB 3BFUA 3HHGA 3H06B 2P0SA 2XX7A 3T66A 1BKAA 1HSJA 1M5EA 1Y1MA 2I0BA 2O69A 3JZJA 3T93B 1URGA 4TLMB 2PT2A 2Q88A 4MLQA 3CI8A 1MM7A 1ZLQA 3S4UA 3OEKA 1O64A 1Q1KA 1US5A 1B4ZA 2Z8DA 3ILUB 3KN7A 3G3HA 2XXPA 3UK4A 5ICQA 2V84A 1IQ7A 1O7TA 5DTBA 1R9LA 1B7ZA 4PFWA 3TFLA 2I0CA 3TCGA 1VE4A 3U72A 5F1QA 1GR2A 2A5TB 2H5YA 2ANJA 4FECA 4XKNA 1ANFA 2NXOA 3O29A 3DM0A 3RY3A 4F31B 1JEUA 2HFBA 1SI0A 1JEVA 4H5FA 2ABHA 2XXVA 5IAIA 4FORA 4H67A 2Z22A 4LVQA 3G3JA 5H8QB 5AA3A 5JTYA 3A3CA 1M5BA 4QFLA 3GLBA 4ZE8A 4C1TA 1MQGA 3IO6A 4Q8RA 2CMOA 4BDMA 2QL3A 3OD7A 4DXCA 4YMBA 2GHBA 2F36A 1GTKA 3PGFA 4RYAA 2QSXA 2Z8EA 2YLNA 2Q9TA 3C34A 4OEVA 4Z7EA 3CG1A 5I58A 3H6UA 1B32A 1LFIA 1PB9A 4OVJA 5H8HB 3TKDA 4U22A 1QKAA 4PQJA 3UORA 3MPLA 3WAFA 4G8NA 1NNTA 2QMXA 1ZJLA 1N76A 2DWIA 2OLBA 4G68C 1UTHB 1MXWA 1QJMA 4N07A 1JETA 4FEBA 5LOMA 1CE2A 3S9EA 1ZU0A 2YJPA 1D3KA 3H4ZA 2RF1A 1B4HA 3A09A 1Y3QA 1XVYA 3MZBA 3PMXA 2ZYKA 4BDQA 1JW4A 2O6AA 2D21A 2UVGA 1ZIUA 1MXVA 2OK2A 3PUWE 5I2NA 3FGSA 2AL4A 3IK6B 3KJTA 3V89B 3B6QA 4QFPA 3FXRA 3LR1A 1SW2A 1SYHA 1PB7A 1USYH 3CVGA 4XKPA 3USDA 1OLCA 4RPNA 3PD9A 2I4CA 1DMBA 1NFTA 4GQOA 1IXIA 1WVJA 3MP1A 1R1NA 3MC2A 2H4IA 4OHNA 2P2AA 3C35A 4QFKA 3IJOB 1WODA 2Q2AA 3TCFA 1QVSA 4YKIA 3CR9A 1II5A 1JQFA 2KLFA 3H03A 3KSXA 3SETA 1R9QA 1SW4A 2D5WA 3PPRA 1Y1ZA 1N7XA 3OSQA 3H3GA 4NF8B 5HBCA 1P1OA 3EHSA 4YMAA 2ZNUA 4XKRA 2GHAA 5ITPA 4H6DA 3TEPA 2B3FA 3IX1A 4MBPA 4KYDA 3FVOA 2Q89A 4NTLA 2DSFA 2ESNA 5CMCA 2OJTA 3VLUA 5KDTA 1UIVA 3MWBA 2M8CA 3FATA 3G3FA 1RKMA 1MQJA 3SEYA 3RLFE 5DVIA 4U1ZA 4DDDA 3CG3A 4JWOA 2CZLA 3HV1A 4OFOA 3TTNA 1LFHA 1ZMGA 3IO4A 3MZ9A 3IL1B 1B40A 1HSEA 4ELPA 2F5XA 2B65A 1SDXA 4GL8A 2DWHA 3E13X 1VFEA 5CRYA 5DEXB 1ZKBA 3K6UA 3SKPA 3TTRA 1JVXA 4KPTA 3CRBA 3MW0A 4JDFA 3I6VA 5DVFA 2OWTA 3TPAA 4M4GA 4F3SA 4GFRA 1FQBA 3AXFA 4R6HA 4F1VA 1A54A 4QFNA 3VLWA 5H8NB 1B1HA 2O7IA 3QSLA 1MY4A 2BJJX 4ZZAA 1XT8A 2F6GA 2I58A 1B5JA 3KEIA 1Y20A 4RJZA 3SDFA 4BDOA 4X1BA 4YB5A 4ZEDA 4YKJA 4ZEBA 3T9HB 3K2DA 1QUIA 1P1WA 2F7AA 2X7PA 4NF6A 5H8NA 3VVDA 2F7BA 4YB7A 3B6WA 1Z7ME 4EXLA 2D3IA 3EN3A 3THIA 5I2KB 2Y7KA 4RK9A 1J1NA 4IY6A 4F39A 1SBPA 2WKYA 4IO7A 4E0WA 3M8UA 4OEUA 3Q25A 4GXSB 3MVWA 1FQAA 1GV8A 4DCYA 3QYTA 3KBRA 1B58A 2HAUA 2V3TA 1B46A 3C31A 1D4NA 2DOJA 2UXAA 1A55A 2GRVA 3HN0A 5H8SA 1Y9UA 4NWDA 1QULA 3V5AA 1A99A 1RYXA 3RQTA 4KYSA 1F9BA 1FTKA 3H7MA 1A40A 1M5FA 3UGWA 1IXCA 3W9VA 5JK4A 1MXXA 5TP9A 3W9WA 5CMMA 3R26A 3KGCA 4IO2A 4MF3A 1NNKA 3KN8A 3C9HA 3O6IA 3RPWA 4QSEA 2O51A 3VE1B 2AYSA 4NE4A 4K3FA 1AL3A 1B9JA 1N7WA 2REJA 3HCQA 3KZGA 4FE8A 5FHMA 5CC2A 3E4RA 4F1UA 5IKBA 1NMUA 3DP4A 4U21A 4F3GA 4GLIA 1FW0A 1B05A 1P1QA 4MH5A 2F6PA 1M5CA 3LSLA 3QK6A 3VLVA 1OQHA 1XS5A 1JVYA 2Y7WA 3OO7A 3QUJA 4R2FA 5AA4A 4DE8A 1EZOA 5BWJA 1BP5A 1FQDA 3KFMA 4GD5A 1MY0A 1TXFA 2ZYMA 3O6HA 1MXYA 4YZZA 3HPIA 2NVUB 3TZAA 3SEVA 4JWYA 4FAJA 1AH5A 1LCTA 3IB2A 4JB7A 3U93A 4LATA 3TTKA 1AOVA 2Z8FA 1YAEA 4BLAA 3O9PA 1H3DA 4MLVA 2HQ0A 4TQUQ 4H5GA 4R6YA 2F7CA 3OENA 4OFJA 5CI5A 5FTHA 4DLDA 1NH8A 1MH3A 1MQIA 3FUZA 1Y4CA 3EHUA 4I9DA 4LQ2A 3TELA 1VFDA 2NUVA 5M2VA 3IB0A 1LB8A 2GH9A 4KD5A 2R6GE 2DS9A 1OIBA 5KCJA 1R6ZA 4HCYA 4R6KA 1PBPA 5I59B 3DELB 5H8HA 4HW8A 1B0LA 1I6AA 4TOZA 5K2XA 5KZTA 3EQ1A 3PV0E 2PBWA 1LAGE 2QJEA 2QS4A 1YTVA 4O3BA 1S9TA 4ECFA 3G3GA 2DP8A 1MQDA 2ZYNA 4KFQA 3T9VA 4C1UA 1IZ1A 3HHFA 1URDA 4KCDA 5CMBA 2P1SA 2QS2A 4GWOA 4OZ9A 4AQ4A 4F19A 2I6EA 5BUUA 2FNCA 3N26A 4G2ZA 1B7UA 1N3XA 3IJXB 3OELA 4OFLA 2XXRA 4FATA 3K1PA 3B7DA 4KCCA 1XC1A 4OERA 3N94A 1A8EA 1N0TA 2OWSA 3K6WA 2XXWA 3FD3A 3CIJA 3CSGA 1FTMA 1Y3NA 2DE3A 2PT1A 1XVXA 2RKMA 3KN3A 5KDTB 1N84A 4ND9A 1IXGA 1HSLA 1VR5A 3D4CA 4P11A 5FTIA 3K01A 2UYEA 4QSDA 3UIFA 3S9LC 1SI1A 2OZZA 4ELOA 3VDFA 2RC7A 2ZNTA 1Q35A 2H9BA 3M3LA 1A7LA 4N6PA 5JEIA 3TUSA 3OO8A 1EZ9A 1I6BA 2Y84A 2RINA 1NH7A 1OLAA 1LSTA 1MDP1 1OVTA 3U8QA 2G93A 2ONKE 2XXTA 4XTCQ 1SW1A 2O1MA 3QUFA 3FIRA 3N5LA 1OVBA 3O2AA 3QAXA 4NF4A 4PE5B 3RT6B 2UVHA 1SQYA 2XHDA 1B3LA 1P1NA 1XHYA 2H98A 3ODBA 3RNNA 1BTJA 3O28A 3FVGA 4E0XA 5CBSA 1Y4TA 4LP2B 4EF1A 4R72A 3S2VA 1FTOA 5AA4B 4U1OA 1MY1A 3FZVA 4EQ7A 1IUDA 2DQVA 4IO6A 3T22A 2UVJA 1DSNA 3FV2A 3W15C 4RPOA 4G68A 2XX9A 2Q2CA 3KOSA 4ONYA 1B1XA 3GBAA 3RTWB 1POTA 2DXRA 2ZYOA 3LBSA 2AIXA 4IGRA 3Q28A 1EU8A 4MFIA 4PP0A 1LLSA 1M5DA 3ECRA 3RT8A 5I58B 4OENA 3MPKA 3GZGA 5F7VA 5ISUA 4HCWA 1EZPA 1FQCA 2XD3A 4NEDA 5I56A 3M3KA 3V8XB 5TU0A 5B70A 3BBRA 5TPAB 1H45A 1LGBC 3PMVA 4RNSA 5TP9B 4GXAA 3TCHA 4F3PA 1WDNA 4G8HA 1FTJA 2ALUA 2O7UA 4OTEA 3N6UA 4EQBA 1LBBA 2E0SA 2I48A 3I5OA 2AL5A 1JNFA 4P0GA 3PPQA 4UACA 5DVJA 3RN8A 1VSOA 3WAEA 4IY5A 1TWYA 2RC9A 4IO4A 4X9TA 2F78A 2W7YA 2VD3A 5DT6A 5EHMA 3LC8A 5AA2A 1B3GA 3IB1A 2A5SA 1RYOA 3O97A 2I4BA 2V3QA 5CMKA 2NWJA 2LAOA 3T9UA 4F18A 1MH4A 3ONMA 1A8FA 3C36A 5L9OA 3KG2A 2PYYA 4P0IA 3TYHA 2DE4A 4JXIA 5H8FA 4DXUA 2OBGA 4GL0A 3PD8A 2QS3A 4EF2A 4POWA 3OSRA 1B52A 3EHTA 3VVFA 4BDRA 1FQFA 1NKXA 2O68A 3K00A 2DXYA 4F22A 3JYRA 2QMWA 2VP1A 5FHOA 2V93A 4F1YA 5B7DA 2PVUA 2Y7IA 2H99A 4OETA 4YU0A 4Z0IA 1JW5A 1S50A 4DZ1A 1YPNA 4H8IA 3PUZE 1SD3A 3GXAA 4H0WA 4I62A 4ZDMA 5L8DA 3S9MC 4U4SA 3OEMA 1L5TA 4GF8A 3M3FA 3DLNA 3IOUA 4OQOA 5EYFA 3QIMA 1FCKA 2THIA 1UQWA 3PUYE 3K02A 4XIGQ 4LZ7A 1IITA 4DIGA 3D4GA 4OXVA 3PMWA 5CBRA 4YICA 3EPEA 4KYEA 1ATGA 4ZEIA 1B2HA 3KSJA 5H8QA 5JTYB 1B3FA 1UIUA 2X7QA 2ONRA 3MZ1A 2FA7A 5HPQA 4LZ8A 3MBPA 5ITOA 1AIVA 1NL5A 4LA9A 3VVEA 3G3IA 4ELQA 1Z7NE 5J1DA 5ICTA 1AMFA 1T0KA 1O63A 2DE2A 4IB2A 3LSFB 4UA8A 4HTGA 5H8FB 3TQLA 1ZTYA 4ZEKA 3UP9A 1B3EA 3ILTB 3I3VA 5I2KA 4JSDA 4NF4B 3H6TA 4RY1A 1MXZA 2XXHA 4Q30B 4M1VA 3IORA 4U23A 4JWXA 3F11A 5AE4A 3IR1A 3ZKLA 4XXUA 1PB8A 3BKIB 1USYE 1DTZA 2ZXTA 4EUOA 1Y3PA 5I2NB 1N3WA 1B5HA 4R74A 2XXXA 3RTFB 1UTBB 2G29A 1SYIA 3FVNA 3FASA 1NNFA 2DVZA 3Q27A 4QFOA 3PUVE 3DP6A 4U4XA 4KQPA 4X1DA 3VV5A 2UYFA 4ELRA 4ZEFA 1URSA 2HZLA 5A5XB 3MQ9A 4YKKA 4KHZE 5I56B 3MVYA 4NWCA 4YKPA 3R7XA 3MUQA 3O66A 1CB6A 1LCFA 1LAHE 4H8JA 4I8CA 4IO5A 5DEXA 2DWAA 3K6VA 4G8MA 2ZMBA 4RA1A 1IXHA 2FYIA 1BLFA 4QRZA 1B3HA 2F97A 2I3VA 3IOVA 3FV1A 3VXBA 2ONSA 1TFAA 4LUBA 3TAJA 2XXQA 3A3UA 1MM6A 2R9JA 3N6TA 1JW1A 1KWHA 2HZKA 3ZS6A 3MVXA 4PFTA 1MPBA 3HSTA 3ZKKA 3SESA 4EXKA 3VXCA 1P99A 4POXA 3IAZA 4EQ9A 3K1MA 3MP8A 1YCJA 2PMSA 2RCBA 3QXMA 1MRPA 3FXUA 4R9GA 2RCAA 5FHNA 5A5XA 1B51A 3P7IA 4NF8A 5I59A 2HXWA 2E1SA 3C32A 2XD2A 2RC8A 4WXJA 4THIA 4I1DA 3ZSFA 1UTBA 3DP8A 3H6WA 4YAHX 1D9YA 3FVKA 3BFTA 3C4MA 3MVZA 1XOCA 1LAFE 3RUMA 3TQWA 4AB6A 1FQEA 3LSXA 3SEUA 3IOWA 4FEDA 1EH3A 2Z23A 1SW5A 3JV9A 1N04A 4OESA 1MPDA 4AB5A 2Y7PA 3Q29A 2UVIA 2Y7RA 3SERA 4WEPA 4H1XA 3TDJA 2F35A 3K6XA 2DYXA 2REGA 3K1NA 3CSBA 2XX8A 1DPEA 3OMBA 3OO9A 4GRKA 4Q0CA 1IIWA 4RK2A 4YB6A 5EHSA 1QKBA 4LONB 1FTLA 3RGYA 1ELJA 2B3BA 5AA2B 1US4A 5K2YA 3UN6A 2NOOA 4GIZA 1POY1 1LB9A 2OCUA 2R71A 1D9VA 3TMGA 1UTHA 4BDNA 4BDLA 4EDPA 1TT1A 3OO6A 4DCXA 1PBQA 3MJNA 1MY2A 1B5IA 1H44A 4G4PA 4JBZA 3L6HA 4OMBA 1PEBA 1H76A 4LQ5A 4PETA 4X48A 3O6GA 3G7WA 2I3WA 5TPAA 4L17A 1B6HA 2F8DA 1QW0A 3B6TA 3PPOA 1BIYA 1GVCA 3CFLA 2F34A 1MPCA 2XXUA 3GBBA 4TLLB 3TTMA 4O3CA 4LZ5A 4ESXA 4R9FA 5ELVA 1LBCA 3PPPA 1ZBMA 1MQHA 1LAXA 4GVOA 3KOTA 3TODA 4ZZEA 4IGTA 1S7YA 3E3KA 1IEJA 2VHAA 4JSOA 4G68B 4ISUA 4H65A 3L6GA 4O3AA 1OQGA 4WKMA 5I57A 2VGQA 4PFYA 3MAMA 4U2RA 3V83A 3T9XB 3U94A 3U92A 2A5TA 2Q8JA 1P1UA 1NNPA 1MG1A 2VOZA 4F2OA 2H25A 3IOTA 1MS7A 4R73A 1B7HA 3T96B 3CFXA 3EF7A 3HO7A 2GFEA 3U1OA 4ESWA 4NMYA 3R6UA 3H6VA 1GGGA 4HS7A 3UA8A 3LUYA 4F29A 5I84A 2X26A 2V25A 4ZS9A 3SEXA 4FJPA 2DVCA 3C33A 3FXQA 4G77A 1PC3A 4QHQA 4F3BA 4NF6B 4RXLA 1I6QA 5AA2D 5L9MA 1DOTA 2HAVA 3MP6A 2HCAA 1I69A 5AA1A 5DYHA 4R2BA 4KR5A 3VFJA 3G3KA 4KI0E 3OOAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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