3U93A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p2221 form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
252
Chain Sequence
b'NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGCP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 78
structure length 252
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A02
5H8QB 1MXXA 3U92A 1A54A 2AL5A 1QUIA 2DWAA 3RTWB 1B5HA 2FYIA 3TQWA 1BTJA 4Q0CA 4UA8A 2XXWA 1Y1MA 3FATA 2ZMBA 3OO8A 4R72A 3N6UA 3IOWA 4ELOA 2VD2A 4TOZA 3O6GA 4GXAA 3TAJA 3KN3A 4EQBA 2R9JA 3Q27A 1NNFA 5I56A 5AA2D 3DP6A 4LATA 3RTFB 1B3FA 1MDQA 3S4UA 4F2QA 3CFXA 4KFQA 3VV5A 5I56B 4U1OA 3BKIB 3G3JA 2FNCA 3MP6A 4JXIA 2XXQA 3FD3A 4JWOA 3TUSA 3FGSA 5HM4B 3ZS6A 2NVUB 2D5WA 3PUVE 1NNTA 1B5IA 4PQJA 5I2KA 3OENA 1O7TA 1B1XA 2RINA 3C34A 3IX1A 1SD3A 2O7IA 3IK6B 4LZ7A 4BDOA 4E0WA 3CR9A 5TU0A 1M5CA 3H06B 5I2KB 3K6XA 3TTLA 2I3WA 4WEPA 5CBSA 1MY2A 1TFDA 4P11A 1JW5A 2DS9A 3MVXA 4ONYA 4OFOA 2OJTA 1SW5A 3VDFA 1PDAA 4R6HA 3O6HA 1A7LA 3PPPA 3QIMA 4LA9A 2XD3A 3RGYA 4QSDA 4P0IA 4NWCA 2DVCA 4FECA 5TP9A 1NFTA 3IAZA 3AXFA 1IUDA 1LBBA 1QW0A 3S9EA 1HSEA 4BDLA 3MPKA 3MAMA 3KOSA 5TP9B 1UIUA 4IO5A 5JEIA 2THIA 1URGA 4RA1A 3K02A 1Y1ZA 4Z7EA 2Q2CA 4E0XA 2F7CA 4HS7A 2QS2A 4XKQA 4KCCA 2F7AA 2ZNTA 1QUJA 1WVJA 1BIYA 1H44A 4DXBA 4QFKA 5ICTA 1ATGA 2O6AA 3A09A 4ZS9A 4WKMA 4ELPA 4LVQA 3WAFA 2G93A 2HXWA 1FTJA 3UORA 4F3PA 3PD8A 3H7MA 5DVJA 4IGRA 3UGWA 1TT1A 4LUBA 4HCYA 3D4CA 4BDRA 3DP8A 2XXYA 2NWJA 1LB9A 3PD9A 3WAEA 3K2DA 2NUVA 3LUYA 3K6WA 4KYEA 1B52A 2XX7A 1N76A 3ZSFA 2ZNUA 1BP5A 3B6WA 3VVEA 3SEXA 1S50A 3MJNA 4I8CA 2X7PA 3CVGA 4R9FA 2I48A 3EN3A 4TQUQ 4ESWA 1YTVA 1UTHA 4EF2A 1J1NA 4U22A 1QKBA 4FJPA 2H5YA 1MH3A 2I6EA 1MS7A 2RC7A 5KCJA 3SDFA 2W7YA 4KR5A 3QK6A 1NH8A 2QJEA 3I3VA 5KCJB 2QL3A 5CMBA 4GVOA 1YAEA 4C0RA 4ESXA 5BUUA 4XKPA 5TPAB 3FXUA 4OWDA 3TTRA 1SI0A 3QUJA 2V84A 2E1SA 2DE2A 3TODA 1FQAA 2R71A 4OERA 3RUMA 3SESA 1S9TA 1Y9UA 4OZ9A 4HTGA 2V93A 4ZE9A 4EUOA 2A5TB 2HEUA 3K1PA 1N0TA 1RYOA 5H8SA 1XC1A 4F18A 1JNFA 4R73A 4FATA 3FXQA 3N5LA 4ZZAA 4RY1A 3ODBA 3U72A 1SW2A 3EHUA 4YB7A 3OD7A 2H4IA 1LFIA 4YKIA 3DLNA 3QAXA 3V5AA 5JTYA 4QFNA 2OZZA 5AA3A 4OETA 3TCHA 1UQWA 1FW0A 1PBQA 2Y7KA 5FTHA 3FV2A 5JTYB 3MZBA 5EHSA 2GH9A 2UYEA 5KDTA 4IO7A 3RT8A 5H8HA 1AL3A 3RNNA 2V3UA 2ZYOA 1N84A 4QSCA 4AB5A 3LSWA 4G4PA 5H8HB 4FAJA 4YB6A 4R2FA 4IO3A 3JV9A 1URDA 4KHZE 5I2NA 3FIRA 3IOVA 3N26A 3T22A 5I84A 1N04A 2RC9A 1Z7ME 3FVGA 2DOJA 1H45A 4QFOA 3MZ9A 4ELQA 1MQIA 3PUYE 1DPEA 4C1TA 1NL5A 2AL4A 4O3AA 2AIXA 4GFRA 2BJJX 1B7HA 1YPNA 2YPNA 3MP1A 4EXKA 2IA4A 2RKMA 1DPPA 1IXGA 4NTLA 4LZ5A 1MPBA 1MXWA 2O1LA 3CRBA 4F39A 2YLNA 3GBAA 2B65A 3H3GA 2Z22A 3FASA 3OO6A 4KQPA 3KSXA 4H1XA 1MPCA 5CC2A 2PT2A 3PV0E 4G8NA 2DVZA 1RKMA 1FQEA 3M3FA 3B7DA 3MUQA 4HW8A 5I59A 3ILTB 1A8FA 3MQ9A 3JZJA 1CB6A 1MQDA 3N6TA 3UK4A 3C9HA 1VR5A 5I59B 3FUZA 4KYSA 3S2VA 1DTGA 2F6PA 1NH7A 4KPTA 5FTIA 4M4GA 1I6AA 2PVUA 3S9LC 4F3BA 1B51A 3E13X 3CG1A 4QFPA 3IJOB 5L8DA 5CI5A 1MQGA 3LSLA 4DDDA 1EU8A 2Y7RA 4OHNA 1UIVA 2D3IA 3R6UA 4R6KA 4MF3A 4DIGA 1VSOA 2HZKA 4RXLA 5L9SA 2Y84A 5IAIA 2DWJA 4DZ1A 1USYE 3MC2A 1SQYA 3G3GA 1MRPA 3G3FA 5CBRA 1B2HA 5CRYA 5DEXA 3V83A 4U2RA 1LGBC 1B4HA 4KD5A 1B9JA 5F7VA 4OTEA 4PFYA 3RT6B 2I4BA 2XD2A 4N6PA 5DEXB 1WDNA 3QYTA 1VFEA 4RYAA 1OVBA 4YU0A 1US4A 3M3LA 4GXSB 3FJ7A 2B3FA 1MY4A 1FTLA 1NNKA 4YZZA 1MH4A 1A55A 3EQ1A 3I6VA 4BLAA 1POTA 4GQOA 4PE5B 1TXFA 5A5XA 5B70A 1XHYA 1LBCA 2DWIA 2B3BA 5BWJA 1MXZA 2PX1A 1PBPA 3HO7A 4JB7A 5LOMA 5A5XB 1M5DA 3TTMA 1VE4A 2XXXA 3L6HA 5AA4A 2Y7IA 2XXIA 3K4UA 3GLBA 3CFLA 1P1WA 4YKPA 4R75A 3DM0A 3G7WA 3IO4A 4YICA 5AA4B 1HSJA 1IIWA 4EXLA 2OWSA 3T9XB 3VXBA 2IEEA 2PBWA 5JK4A 5M2VA 4X1DA 1M5FA 1SW1A 1QJMA 4QHQA 5K2YA 1SYHA 1JVXA 3I5OA 4NWDA 4OYVA 3OSQA 1M5EA 4FIMA 4JWXA 2HQ0A 3UP9A 4H8IA 1M5BA 4MLQA 5KZTA 4BDNA 3EPEA 4H65A 3LSFB 1N7WA 4UACA 3E3KA 2F34A 3D4GA 1A99A 1D9YA 3KZGA 4Z0IA 3K1MA 2HCAA 3KJ7A 1Q35A 4ZDMA 1EH3A 3T96B 2HAVA 1R9LA 2QS1A 4X48A 4YKKA 3H6WA 1NKXA 2F36A 4IO6A 3A3UA 1QULA 2X26A 4L17A 2RC8A 3IOUA 1P99A 2Q88A 3PMVA 1BKAA 4OEVA 1H3DA 3T66A 4ZZEA 3TYHA 3T9VA 1QKAA 4GOTA 4R74A 4EDPA 1Y4CA 1B4ZA 4GD5A 4BDMA 2XXTA 4H0WA 4KCDA 3KOTA 2VHAA 4LONB 3W9VA 4YMAA 1OLCA 1B1HA 1SVXB 2F78A 2HAUA 2RF1A 5FHOA 4FE8A 3TQLA 2RCBA 3FJGA 1F9BA 2XXVA 3K1NA 3L6GA 1EZOA 3IB0A 1MXYA 3K00A 2Z8EA 1XVXA 2YJPA 3PMXA 4EQ9A 5ELVA 4QFLA 4OESA 4PFUA 5L9MA 3U94A 1L5TA 4I1DA 1IEJA 2CZLA 2DP8A 4GWOA 3KFMA 2DSFA 1A8EA 3HSTA 5CMCA 1KWHA 2DE4A 1FTMA 1IITA 1UTHB 2NOOA 4XKNA 3PPRA 3T9HB 4WEDA 2Q8JA 2R6GE 2HFBA 1I6QA 4X1BA 4AB6A 4DXUA 3O97A 2XHDA 1B40A 4PP0A 3QSLA 3F11A 3HV1A 4TLMB 3FVOA 3P7IA 3LC8A 1B0LA 4JSDA 1FQDA 3W15C 1MY0A 3IB2A 2D21A 3FVKA 1LAHE 4ND9A 3O9PA 5CMMA 3CI8A 3EHSA 1B5JA 1VFDA 4IO2A 3ONMA 4ECFA 3VVFA 4GIZA 4F19A 4U21A 3Q29A 2ZYMA 3DELB 3V8XB 3IO6A 3ECRA 2I0CA 3OEKA 2H99A 1B58A 1QVSA 2NXOA 1B46A 1NMUA 4GRKA 3TPAA 1JEVA 2UXAA 1PEBA 1XVYA 1TWYA 5L9OA 5KDTB 4H67A 4JDFA 4U23A 3SEUA 4F1UA 3T9UA 1LCFA 1URSA 5HBCA 1Y3PA 3C36A 4ZECA 3R26A 3MP8A 5DT6A 5I2NB 2QS3A 2Y7WA 3JYRA 4F29A 4C1UA 1DSNA 3QXMA 2P1SA 3C31A 2O7UA 1XT8A 2F5XA 4Q30B 5I57A 2UVGA 1Y4TA 1YCJA 5ISUA 2CMOA 4RK9A 2DWHA 5DVFA 1IZ1A 3PPNA 2DXRA 3T93B 3U1OA 2XX9A 3RPWA 3KSJA 3OXNA 4NEDA 4N13A 1PB9A 1OQGA 4G2ZA 4FEDA 3BFUA 4I9DA 4NE4A 5H8NA 3PPOA 1OQHA 3PUWE 1R1NA 3M8UA 1IXIA 2A5SA 2O51A 3ILUB 3PPQA 5ITPA 3EHTA 3C4MA 5H8NB 3HHGA 1B3HA 4O3BA 1ELJA 1JW4A 1QUKA 2F8DA 2X7QA 1PB8A 1MM6A 4NF5A 4O3CA 4U4SA 1P1UA 4F1VA 1EZPA 5J1DA 1GR2A 1SBPA 1FQBA 1NNPA 1B32A 4NF5B 3TZAA 1B7UA 4TLLB 2VD3A 1LAGE 3K6VA 1FTKA 1GTKA 2DE3A 4XXUA 2GHBA 4DLDA 3PU5A 4POWA 4ZEIA 2UVJA 2UVIA 3KG2A 5H8FA 1OLAA 1SDXA 4R9GA 4MBPA 3IJXB 3O6IA 3RN8A 1P1OA 1LCTA 2REJA 4RJZA 5H8FB 3OO9A 3O29A 3G3IA 4Q8RA 1II5A 4LZ8A 3H6UA 1IQ7A 1Y3NA 2ESNA 1JETA 4U4XA 3SEVA 2I49A 4R2BA 4PETA 2O68A 2QMWA 4F3SA 4H5FA 2GHAA 1RYXA 1US5A 3PMWA 4RK2A 1UTBA 1XS5A 2ZYNA 3GZGA 3TTKA 3OOAA 4ZEBA 4OEUA 2M8CA 4ISUA 1UTBB 5FHNA 3PGFA 2I3VA 3O66A 1P1QA 2F35A 1B0HA 4IO4A 3VLUA 3HCQA 4N07A 2Y7PA 3SETA 4LP2B 2ZNSA 3CIJA 1R9QA 3KN7A 4PFWA 3O28A 3K6UA 1AIVA 4R6YA 2H9BA 3HPIA 4Q5TA 1N7XA 1I6BA 1LSTA 4M1VA 4YB5A 3ZKKA 4KYDA 4ELRA 1DOTA 3TKDA 1O64A 4LQ2A 4JSOA 2H98A 3FVNA 3K01A 1MQHA 3Q26A 4G8MA 4KI0E 2XXRA 1AMFA 3CSGA 5AA2A 2GFEA 4HCWA 1A40A 2RCAA 3MZ1A 1O63A 3RLFE 4I62A 3CFZA 4XKRA 4DXCA 4OXVA 3OO7A 4G68C 3TTNA 5AA2B 4GLIA 2G29A 4GF8A 3H4ZA 3BBRA 5I58A 2ABHA 4ZEDA 1ANFA 3MVWA 3IORA 1Y20A 2OK2A 3DP4A 4QRZA 5I58B 1AOVA 3Q28A 3PUXE 4BDQA 3S9NC 2ONSA 3MVYA 5AE4A 1MXVA 1SYIA 2QSXA 4MH5A 2PT1A 3C35A 3SEWA 2Q89A 3VLWA 1FTOA 2ZYKA 1B3LA 2UVHA 4IY5A 3MPLA 4PFTA 1WODA 1ZJLA 2XX8A 3KBRA 4U1ZA 1B3GA 3GBBA 3UIFA 3H6TA 1ZBMA 4QSEA 1N3XA 2Q9TA 5EHMA 2DQVA 2XXHA 4YAHX 3A3CA 3V89B 1Y3QA 1S7YA 4DCYA 1XOCA 3G3KA 1DMBA 3MW0A 3VFJA 1IXHA 2DYXA 1JQFA 3B6QA 2REGA 2I0BA 5DYHA 5EYFA 5HPQA 4FORA 2DXYA 4OFLA 5DVIA 1I69A 3RY3A 3BFTA 3C33A 3U93A 3CG3A 2P0SA 1LLSA 4NF8A 1MPDA 1B05A 1OMPA 1MXUA 3MWBA 4JWYA 3RQTA 3EF7A 2E0SA 1AH5A 2O1MA 5CM6A 1GGGA 4F22A 4NF8B 2V3TA 1MDP1 2ANJA 2VP1A 3O2AA 3LR1A 3OEMA 1CE2A 2ONRA 1LFGA 4F2OA 5DTBA 4JBZA 3K0VA 5TPAA 3ZKLA 1OVTA 4IB2A 3USDA 1JEUA 2GRVA 3C32A 3TDJA 3KN8A 3FXRA 1JVYA 4DE8A 1MM7A 3TMGA 1IXCA 2P2AA 2V25A 3VLVA 4H8JA 4OVJA 2UYFA 2VGQA 1ZLQA 1PC3A 1D4NA 4K3FA 3U8QA 1FCKA 1Z7NE 2A5TA 4EF1A 4OMBA 1JW1A 2VOZA 3KJTA 1GV8A 1MY1A 3TELA 4RPOA 2PYYA 1POY1 2H25A 4OQOA 4GL8A 1SW4A 4IY6A 3HN0A 3H03A 4FEBA 1TFAA 4POXA 2I58A 3E9XA 4NF6A 4DCXA 1EZ9A 4LQ5A 3IB1A 1ZTYA 1MQJA 3MVZA 3IOTA 1DTZA 2OBGA 1LB8A 1FQCA 1LAFE 3QUFA 1Q1KA 4GL0A 4NF6B 3VXCA 1BLFA 2ALUA 4G77A 2ZXTA 3E4RA 2QPQA 4ZEKA 3CSBA 3OMBA 4EQ7A 3KEIA 4ZEFA 1N3WA 1USYH 4NF4A 1B7ZA 4XTCQ 2OCUA 3FJMA 5AA1A 4WXJA 1FQFA 2LAOA 5FHMA 5B7DA 2ONKE 5K2XA 4NF4B 1LFHA 2Z8FA 3TCGA 3SERA 4MLVA 5F1QA 4QF9A 1P1NA 1MG1A 3LSXA 1D3KA 3TFLA 2QRYA 1GVCA 4NMYA 1MY3A 3IR1A 3OSRA 4X9TA 3R7XA 1SI1A 4ZE8A 4G8HA 3VVDA 1B6HA 3W9WA 2Z23A 5I57B 3M3KA 4RPNA 4H5GA 1OIBA 2O84X 1H43A 4P0GA 3G3HA 3N94A 2I4CA 2F97A 2HZLA 3TCFA 4F3GA 3THIA 4IGTA 2PMSA 1D9VA 2XXPA 3GXAA 3PUZE 2FA7A 3FV1A 1ZKBA 3H6VA 1LAXA 3S9MC 2F7BA 1H76A 4MFIA 4YKJA 2Q2AA 3SEYA 2AYSA 1B3EA 1PB7A 4F31B 4RNSA 3UA8A 3FZVA 2OWTA 5IKBA 3MBPA 2Z8DA 1T0KA 3Q25A 1HSLA 3OELA 4F1YA 5ITOA 3IL1B 4OENA 2WKYA 4XIGQ 2OLBA 3LBSA 2KLFA 2QS4A 4G68A 3B6TA 2F6GA 3UN6A 2XXUA 4H6DA 3TEPA 4THIA 3KGCA 2O69A 3HHFA 3SKPA 4AQ4A 2QMXA 5ICQA 4G68B 5H8QA 1ZMGA 4OFJA 3VE1B 2V3QA 1ZU0A 5CMKA 1R6ZA 1ZIUA 4YMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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