2F35A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core with ubp302 at 1.87 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
b'RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A02
2DE4A 1FTMA 2WKYA 3RY3A 3DP6A 5KCJB 4YZZA 1MY2A 3ILUB 3C9HA 2DE3A 4G8HA 4I1DA 2IA4A 3FXQA 3THIA 1Z7NE 3FASA 4DCYA 4OWDA 4OQOA 4TLMB 2O7UA 3TFLA 4F1VA 1EH3A 3O9PA 1SQYA 4FECA 2I49A 5ICTA 5LOMA 2GRVA 3KJTA 3FXUA 2QMWA 3PUZE 3IK6B 1UQWA 2XD3A 2QJEA 2XXTA 3O2AA 4EQ9A 4GLIA 5DVJA 5AA1A 5TU0A 3M3LA 1EU8A 3KJ7A 3QK6A 1OQGA 2H4IA 1POTA 2XXVA 4Q0CA 5I2KB 3LSLA 5B70A 5I84A 3OO8A 2OWSA 2FNCA 2F6GA 2UVGA 1LFIA 4R6KA 2RC9A 3MVXA 4DXBA 4GXSB 4G8NA 3VV5A 3DP4A 4YKJA 4NF8A 4ECFA 1H45A 3VFJA 2DP8A 1Y1MA 1ZJLA 4K3FA 3C33A 1UIUA 4POWA 3VXBA 2ZYOA 3OOAA 3DP8A 4R9FA 4ZEIA 1EZ9A 1ZIUA 3MZ1A 3ZKKA 3PPRA 3G3FA 2D3IA 3WAEA 1ZU0A 3Q28A 4KCDA 4ESWA 3IR1A 4U1ZA 3A09A 4ISUA 4L17A 3PUVE 3T9UA 1PB9A 4LATA 2OLBA 2HFBA 2Y7KA 1B9JA 2XXPA 4F3BA 5KDTA 1SYHA 1USYH 3L6HA 1AL3A 1A8EA 5H8FA 4KR5A 1MY3A 4U4XA 4GD5A 2RCAA 1SVXB 1SW5A 1S50A 4ZZEA 1S9TA 3V83A 3N94A 2AL4A 1B0LA 3TQLA 1Y4TA 4Q5TA 2ONRA 5DTBA 1ELJA 1JQFA 3L6GA 2CZLA 4ZEDA 4FEDA 4GL8A 4FEBA 3VVFA 3H6TA 3O29A 3KOSA 1NNPA 2QS2A 4POXA 5TP9B 4F3SA 4LZ7A 1B5HA 2H99A 4AB6A 3C36A 4BDQA 2HAVA 4NF4A 3EHTA 1NNTA 3OMBA 5TPAB 2O7IA 2UVHA 1QUKA 1MXYA 3N5LA 2QPQA 2X7PA 4YAHX 1QKBA 4YICA 2ABHA 1LBBA 2I3VA 3TKDA 2A5TA 1UTHB 5FHOA 1A7LA 2Q2AA 3G7WA 3S2VA 3VVEA 3EHSA 4RK2A 4M1VA 1SW1A 2ZYMA 4PQJA 3H06B 5H8HA 2M8CA 2REGA 3FJMA 4MF3A 3TCHA 4YKKA 2F97A 2Z22A 3ILTB 4LA9A 4N13A 1GR2A 3CSGA 5CM6A 5KCJA 3G3KA 3G3GA 3ZKLA 1SD3A 4RPNA 4PFUA 1B3GA 1QUIA 2F35A 3OSQA 2CMOA 4ONYA 2V3UA 2QSXA 5ITOA 2F36A 3U92A 4LQ2A 4GWOA 1IUDA 3OO7A 2XXQA 3IB1A 2GHBA 3W9VA 4IGRA 5DVIA 4XTCQ 3TTRA 1MPDA 2B3FA 4ELPA 3SESA 1OQHA 1LAHE 3FATA 4YMAA 1FQAA 1B58A 4KYEA 1HSLA 3I5OA 1SYIA 2I58A 1N7XA 1Q1KA 1BLFA 4DCXA 2F7CA 4MLQA 3CFLA 4NF8B 3VVDA 1N0TA 3K6XA 1FTOA 3S9LC 1B5IA 3W9WA 1B3HA 4QFKA 1TWYA 2O84X 4G4PA 3JZJA 1NL5A 3EPEA 3SDFA 3EQ1A 1VFDA 1XHYA 3G3IA 4C1TA 4HW8A 1N3WA 1B3EA 2H9BA 4O3CA 1TXFA 2I3WA 1P1OA 2UVIA 3GZGA 4F1UA 1D9VA 1JW1A 2Y7PA 1HSEA 4R6YA 5EHSA 3OEMA 5KZTA 4YKPA 4GFRA 1QKAA 4R74A 4FE8A 1YAEA 4O3BA 1GVCA 5EHMA 2ALUA 4X9TA 4EQ7A 3FGSA 1LFHA 2F8DA 4H1XA 5L9SA 2B3BA 3MVZA 4KPTA 2F7AA 2G29A 4OFJA 1M5CA 5ISUA 4OXVA 1WVJA 3EN3A 3V8XB 4F19A 4IO5A 5A5XB 1B7UA 1NMUA 1B40A 3KSXA 4LZ5A 1DOTA 5CMKA 4KI0E 1N7WA 2Q89A 4JDFA 4I62A 4RXLA 5BWJA 2XXUA 1P99A 4BDRA 4OERA 4P0GA 4IO3A 1O63A 3T9HB 2XXYA 4LZ8A 4OFLA 2OZZA 1B3FA 2P2AA 3WAFA 4ZE9A 2QS4A 2RCBA 3OO6A 1MY4A 1P1WA 2FA7A 3S4UA 3B6QA 1AH5A 2O51A 4GOTA 4NF4B 4XXUA 2D5WA 4GVOA 3PPPA 4LP2B 1HSJA 5FTHA 4N6PA 3E9XA 3DLNA 1EZPA 3T66A 2ESNA 2F6PA 4EXLA 5B7DA 3ONMA 3C4MA 3B6WA 3KBRA 3N26A 1PEBA 4JXIA 4XKQA 1H76A 3Q27A 4ZEKA 4ELOA 3B7DA 3LR1A 1DPPA 4F3GA 2F78A 1URSA 3PMWA 4H8IA 3O6GA 2DSFA 1B0HA 2OCUA 3HHGA 4HCWA 3H03A 1UTHA 1OLAA 2O6AA 3VLVA 3PUXE 2QS3A 2V25A 3TTNA 3H6WA 4QSCA 5I58B 1JNFA 4ZECA 2Y7IA 2XX9A 1URGA 4QFLA 3RQTA 3PMXA 2UYFA 1JEVA 1MQGA 2Q88A 1OVTA 2REJA 1NKXA 3CG3A 3SEXA 1YTVA 3IL1B 4IO2A 2DXYA 4BDOA 1WDNA 3BKIB 4FORA 1POY1 1RKMA 2VOZA 3ZSFA 3HPIA 1I6AA 3MZ9A 2W7YA 3IX1A 2I6EA 1USYE 1M5DA 3BBRA 2P0SA 4GL0A 2HAUA 1I69A 4RA1A 1DTGA 4BDNA 2DYXA 3MWBA 3ZS6A 2DE2A 4MH5A 5CMCA 1F9BA 5DYHA 3A3CA 3PU5A 3IOVA 1R9LA 4RNSA 4G8MA 1FQCA 2RINA 3K6VA 1LLSA 4OHNA 5F1QA 3UORA 3MPKA 4F18A 5HPQA 4Q30B 4FIMA 4HS7A 3E3KA 3A3UA 5CMBA 5AA4B 2V3QA 1WODA 4KYDA 4QFPA 3PPQA 3QAXA 4YB5A 2V3TA 3U72A 1P1UA 5JK4A 3CIJA 1J1NA 2NXOA 4LVQA 4ZZAA 5ELVA 1PC3A 3O6HA 4PE5B 4OETA 1QJMA 5H8SA 4N07A 2X7QA 1ZMGA 3K01A 1QVSA 2QMXA 1I6BA 1JVXA 4GF8A 3DM0A 4DLDA 5H8NB 1B7ZA 1P1NA 3HV1A 3IJXB 4H6DA 3PGFA 1D9YA 1LBCA 1RYOA 3OXNA 1II5A 1MS7A 1MM6A 2PT1A 1A55A 1DMBA 4JWYA 2O1MA 4R2BA 3CRBA 3PPNA 3MJNA 1JEUA 3BFTA 3USDA 1QULA 5A5XA 4O3AA 1FQFA 2O68A 3MVYA 4FAJA 4WEDA 1NH7A 5AA2B 3TAJA 1VR5A 1RYXA 3HCQA 3PV0E 3SERA 1VSOA 2VD3A 4F29A 1AIVA 4DXUA 4PFYA 3FV2A 3LSFB 4QF9A 3TUSA 1URDA 1FQBA 4NEDA 4IB2A 1PB7A 3PUWE 1XOCA 4FATA 3OENA 3EHUA 3MUQA 3U93A 3IB2A 3KFMA 3MVWA 3CFZA 4MLVA 3T9XB 2A5SA 3FXRA 3RLFE 5DEXA 3I3VA 1UIVA 4F39A 3LSXA 2PX1A 3IOTA 3O6IA 1PDAA 1MY0A 5M2VA 3MPLA 4E0XA 2H5YA 4IO6A 5DVFA 4OESA 1ATGA 3VDFA 5L9MA 3LC8A 5I58A 2RC7A 2XXWA 3UIFA 1AOVA 3B6TA 4LUBA 3H3GA 3HO7A 4TOZA 3HHFA 3H6VA 2XHDA 2I48A 1BP5A 3H7MA 4XIGQ 2ANJA 2YLNA 4YB7A 4THIA 2BJJX 4I8CA 5IKBA 2DXRA 2Q2CA 2F7BA 4U23A 3S9EA 4F3PA 5CBRA 3OELA 1MXWA 4U1OA 3KN3A 1US4A 1Y3QA 4PFWA 3R6UA 1N76A 1B5JA 3N6UA 4X1DA 4KCCA 4PETA 1MPBA 4YMBA 1PB8A 1Y4CA 3TCFA 1LB8A 1FQEA 3V5AA 3V89B 3JV9A 4JB7A 4FJPA 4TQUQ 1Q35A 4QSEA 3FJ7A 3FIRA 1UTBB 1OMPA 5JEIA 1MQHA 1B52A 2GFEA 1MXVA 3SEWA 5AA4A 4MBPA 1Y3PA 5I2NB 1MQIA 4OTEA 5HBCA 3S9MC 1CE2A 2R71A 4ZEBA 3GBAA 3R7XA 4U21A 3OSRA 3UK4A 3C35A 3CG1A 3O66A 4C0RA 2GHAA 4OEVA 3KOTA 3IOUA 3PUYE 4AB5A 1M5BA 5H8NA 4EDPA 1IIWA 1N3XA 3FVKA 1D3KA 4R6HA 2VGQA 4UA8A 5H8QA 4OEUA 5FHNA 3RNNA 4LONB 4G68A 4RYAA 1IXGA 3CFXA 4TLLB 4DZ1A 4JWXA 5FTIA 4ND9A 1R1NA 1XC1A 2HZKA 3HN0A 4XKPA 3TELA 1B51A 2LAOA 1QW0A 5AA3A 2THIA 3TODA 3CVGA 3K02A 2Y7WA 2I4BA 3EF7A 2VP1A 1BIYA 2DWJA 4RK9A 3JYRA 4Z7EA 3D4CA 5AA2A 3ODBA 4HCYA 3G3JA 1R6ZA 1B05A 3QSLA 3MAMA 4ZE8A 2NVUB 4H5GA 3IJOB 4DDDA 5I59A 4QFOA 2Z8FA 4R9GA 4JWOA 4AQ4A 4NF5B 3IO4A 4F22A 3S9NC 1PBQA 5DEXB 2G93A 1LAFE 2QL3A 3T93B 5AE4A 1OVBA 4MFIA 2O69A 2DVZA 2Z8EA 3PD9A 3MW0A 1O64A 2DS9A 3C32A 3K1NA 2R6GE 1SI0A 3E4RA 5DT6A 2XXRA 3FV1A 4YU0A 2OBGA 2AIXA 1D4NA 2QS1A 5ITPA 1N84A 4BDLA 1IITA 2B65A 4F2QA 4OYVA 4C1UA 3OEKA 4GXAA 1A8FA 1US5A 5I57B 4GQOA 1B7HA 2Y7RA 4Q8RA 1GTKA 4NE4A 3K6WA 2Q8JA 3FZVA 3QUFA 1B1XA 4BDMA 3R26A 2DWHA 1B4ZA 5L8DA 3KN7A 4H0WA 1Z7ME 1VE4A 1JETA 1Y20A 1ZBMA 2UXAA 4QFNA 4IGTA 3VXCA 1FW0A 4EUOA 2XXXA 2I4CA 3TCGA 1LGBC 2XX7A 4G2ZA 4GRKA 4P0IA 2NUVA 3MQ9A 4F2OA 5FHMA 1NNKA 1H43A 1B32A 4RJZA 1L5TA 1LCFA 2O1LA 1BTJA 4ZDMA 2Q9TA 2ONSA 4NF6A 3Q25A 5CI5A 4OFOA 3W15C 1CB6A 3TQWA 3C31A 1SBPA 3K0VA 1SI1A 3LBSA 5HM4B 4OZ9A 3VE1B 1MRPA 4YB6A 5K2XA 3RT8A 1FTLA 2I0BA 2YPNA 4X1BA 4OMBA 1IEJA 1R9QA 3PMVA 1LAGE 1XT8A 4H67A 1H44A 1B2HA 1Y1ZA 1UTBA 2V84A 1FTKA 1I6QA 2OK2A 3FUZA 1BKAA 3MC2A 3UN6A 5CBSA 2RC8A 2AYSA 1GV8A 4I9DA 1EZOA 4Z0IA 1B1HA 3FVNA 3MBPA 1MQDA 2UYEA 1MH3A 5I2NA 1MXUA 1IXIA 5F7VA 2ZYNA 3PD8A 2R9JA 1A40A 3T9VA 2HXWA 4WKMA 4WXJA 3TZAA 1A99A 3H6UA 3M3FA 3UA8A 1MXZA 5H8QB 1MH4A 1ZTYA 1YCJA 4IO4A 2NWJA 4G68B 4KQPA 4RY1A 3SEUA 3TTMA 2ZMBA 2ZXTA 3TMGA 3ECRA 4EF1A 5I56B 1JW4A 2P1SA 1MQJA 1N04A 4NTLA 4ESXA 3TEPA 1KWHA 1ZLQA 2E1SA 2GH9A 2DOJA 2V93A 1NH8A 2PVUA 4JSOA 1XVXA 4XKNA 4E0WA 3UP9A 1B4HA 1DSNA 5JTYB 3UGWA 1AMFA 1GGGA 2PMSA 3O28A 3DELB 5I59B 3MP8A 4RPOA 1MDP1 3P7IA 2XD2A 1YPNA 3RUMA 3T96B 2F5XA 1LB9A 3K2DA 1TT1A 3E13X 3LUYA 3O97A 3OO9A 4X48A 3K4UA 3TYHA 2XXIA 2NOOA 3GBBA 3KEIA 4H65A 2VD2A 2PYYA 3FVOA 4NF5A 3IORA 2Y84A 4PP0A 4JSDA 3U1OA 1SDXA 4F31B 4U2RA 3BFUA 1ANFA 4KFQA 3LSWA 2ZNSA 3MP6A 3OD7A 1XS5A 1JW5A 3AXFA 3IOWA 3M8UA 2KLFA 5IAIA 4NWDA 5CMMA 3SEVA 1NFTA 2DQVA 4WEPA 2FYIA 4U22A 2Z8DA 4LQ5A 4R72A 2DWAA 3I6VA 3U8QA 3TTKA 5I57A 3TTLA 1B3LA 4EF2A 4IO7A 2DVCA 1IZ1A 4NF6B 4F1YA 3K1PA 3KSJA 2E0SA 2OJTA 3IAZA 3K6UA 1S7YA 4G68C 3RGYA 2AL5A 3FJGA 3FD3A 5ICQA 3KZGA 1DTZA 4OVJA 4IY5A 3HSTA 1IXHA 3D4GA 3N6TA 1MY1A 3RN8A 1MPCA 1TFDA 2QRYA 5L9OA 2I0CA 4DIGA 2IEEA 2PBWA 4EQBA 5K2YA 1B46A 3CSBA 4NMYA 1MXXA 1A54A 3KG2A 4GIZA 4H5FA 3TPAA 1FQDA 4R2FA 2F34A 3QYTA 1ZKBA 5J1DA 3G3HA 2RKMA 4H8JA 4BLAA 5CRYA 2Z23A 1NNFA 3F11A 4EXKA 2HCAA 5I2KA 3Q29A 1JVYA 4KHZE 3IO6A 1VFEA 1O7TA 5BUUA 1B6HA 3H4ZA 1DPEA 1XVYA 3RT6B 1MG1A 1SW2A 1Y3NA 1M5FA 4ZS9A 4M4GA 2XX8A 2ZYKA 4DE8A 3KGCA 1LCTA 4G77A 2DWIA 1MM7A 2YJPA 2ZNTA 1M5EA 5KDTB 1OLCA 3KN8A 1FTJA 5H8FB 4ELRA 1QUJA 2HQ0A 3M3KA 3GLBA 1P1QA 4OENA 2UVJA 2D21A 2HEUA 3CR9A 5I56A 3RTWB 2H25A 4ELQA 3TDJA 3RTFB 3GXAA 1IQ7A 1LAXA 4R75A 4HTGA 1OIBA 3VLUA 5AA2D 5EYFA 5CC2A 4U4SA 4XKRA 5JTYA 4QRZA 4QSDA 3RPWA 2ZNUA 4KYSA 4QHQA 1LFGA 4JBZA 4P11A 1TFAA 3T22A 4ZEFA 2X26A 3QXMA 1IXCA 3SEYA 1LSTA 2ONKE 2OWTA 4PFTA 4YKIA 2A5TB 2PT2A 5TP9A 2RF1A 3QIMA 1MDQA 3QUJA 3PPOA 3VLWA 2HZLA 2VHAA 3IB0A 2H98A 3K1MA 3SKPA 4UACA 1T0KA 5TPAA 3K00A 1Y9UA 3MP1A 3U94A 5H8HB 3MZBA 3SETA 4DXCA 3Q26A 1PBPA 3CI8A 4NWCA 1H3DA 1SW4A 3C34A 3FVGA 4IY6A 2XXHA 4KD5A 4R73A 1FCKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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