2F35A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core with ubp302 at 1.87 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A02
4F2QA 3O6IA 3OD7A 5TPAA 4P0IA 1EZOA 1XVYA 3W9WA 2FYIA 1Y1MA 1UTHA 1Q1KA 5DEXA 2Q2AA 4HW8A 1NNPA 3O97A 1B0HA 4G4PA 3O28A 2CZLA 3OO9A 3RQTA 3PGFA 1SW5A 4HCWA 4KFQA 4KPTA 2VD2A 1NH8A 5CRYA 1EZPA 5CM6A 1Y4TA 3QSLA 2XD3A 4YMAA 1P1QA 3M3KA 4EQ9A 1FQFA 1SI1A 1MXWA 3KOSA 2Z8EA 4OWDA 1O64A 2XD2A 3E3KA 1PB9A 5BWJA 1R9QA 3SESA 2AYSA 5CMKA 1B3LA 3BKIB 2A5TA 4GWOA 4POXA 1UIUA 2F7AA 4H5FA 1D3KA 4YB6A 4PFTA 4N07A 1N0TA 1MY4A 1UTBB 4RA1A 2V3TA 1LAXA 3N94A 3PMXA 2I48A 3DP8A 2DWJA 2XXRA 4E0WA 4BDNA 5EHMA 4TLMB 1Y9UA 4JB7A 4G8MA 1N84A 4Z0IA 3M8UA 3GLBA 1DPEA 1ELJA 4C1TA 1D9VA 4KI0E 3A09A 1GR2A 5I56B 4EXLA 5KDTA 4NWDA 3IL1B 1WODA 1H76A 1NKXA 2NUVA 4H8JA 3PPNA 3R7XA 3FV2A 4F3SA 3PPPA 3QK6A 2HEUA 4DLDA 4NF4B 3C36A 3H4ZA 3EQ1A 1I6BA 4ZEKA 3Q28A 1DTZA 3Q26A 1JVXA 1H44A 3MP8A 2B65A 1S9TA 3RUMA 3A3UA 4IO2A 5I59A 3MVWA 4I9DA 2ANJA 5DVIA 2LAOA 4IGTA 1PBQA 2QS3A 2HZLA 1NNKA 1LFGA 2VGQA 5IKBA 3UORA 3CFLA 5HBCA 1LAGE 3SEWA 2I3WA 3U94A 2QS2A 2GH9A 4XIGQ 4U21A 2QRYA 1CE2A 1POTA 3C33A 1P1WA 2XXHA 4RYAA 5L9SA 4FAJA 3ONMA 1QKBA 1BP5A 3N26A 3FD3A 3TPAA 2DS9A 3RNNA 4X9TA 3KOTA 4G77A 4X1DA 4JSOA 2KLFA 2RC9A 3CFXA 5L9OA 1Y4CA 2IA4A 4KD5A 2Y84A 4H65A 4IY5A 5F7VA 3PUXE 4MFIA 1PB7A 1B7HA 3FASA 2H9BA 2XX8A 1US4A 4DIGA 2O84X 4WXJA 1LBCA 2V3QA 3GXAA 1FCKA 1FTOA 5JEIA 3CI8A 1NNFA 2UVHA 2D3IA 5CMMA 4NF5A 4OVJA 1LB8A 1ZMGA 1RYXA 2RC8A 5AA1A 2Z8DA 1NH7A 3OXNA 1MG1A 4YAHX 2Z23A 1JW5A 5KCJA 3OEKA 2UVIA 1LB9A 3DLNA 2NVUB 1Z7ME 2PBWA 2R9JA 3TODA 3HPIA 3UGWA 3FVNA 3FJ7A 2QMXA 4PFWA 3CSGA 3UN6A 2RINA 2ONKE 4HCYA 5H8FB 4FE8A 4NEDA 3ODBA 4LQ2A 5CMCA 2PYYA 3C31A 4KR5A 3OO7A 2GRVA 4IO3A 3TELA 4MLQA 5H8QB 2BJJX 2F5XA 1N3WA 4F2OA 3S9MC 4YMBA 1IXCA 4LZ8A 2H98A 4EF2A 4OYVA 4PETA 3K6XA 1O63A 4YKIA 1IXGA 2RF1A 3FIRA 4LATA 1VR5A 3TTRA 3W9VA 5AA2A 3CR9A 3CSBA 3FUZA 3ILTB 2XHDA 1JNFA 4IO6A 1TWYA 1POY1 3T9HB 4H6DA 3MZ9A 4QFLA 1FW0A 1SQYA 4GD5A 3AXFA 3MPKA 3PPRA 4YU0A 3U72A 1B2HA 1SYIA 2VOZA 5F1QA 4F22A 1JW1A 4MF3A 5ISUA 2O7IA 5FTHA 3CFZA 2NOOA 2XXPA 4OFLA 3O29A 1XC1A 1B3HA 3KN8A 2UVJA 1PEBA 3S9LC 5TP9B 2ZNTA 3RLFE 4F29A 3BFTA 4I62A 1SD3A 1I69A 4YICA 1DPPA 3PUZE 4G68A 3GZGA 3Q27A 2DE3A 3O66A 4JWYA 1FTJA 3FJMA 3FZVA 3OEMA 4FATA 4GQOA 3RPWA 5EHSA 3SEYA 2HCAA 4N13A 3F11A 4BDMA 3FVOA 2QL3A 2OK2A 4P11A 4DE8A 1AIVA 2ABHA 3OMBA 3SEUA 4ZEDA 1TFAA 1URDA 3IO4A 5H8HA 5I58A 1FTKA 2F6PA 4U4SA 2H25A 3OSRA 4QFKA 3N6UA 4U1OA 4ESWA 3QYTA 4DCXA 4R2BA 4U22A 3TQLA 4JWOA 4BDOA 5I57B 3EF7A 4GIZA 1AL3A 1GGGA 4AQ4A 5BUUA 4GFRA 4Q0CA 4GF8A 3RY3A 3C32A 1I6QA 3K6UA 3ILUB 1B5JA 2E1SA 1R6ZA 3TZAA 2PT1A 1MXXA 2HAUA 3IJOB 3ECRA 1OQGA 5DYHA 1Y3NA 4JDFA 3U1OA 4AB5A 3H6UA 2QSXA 2W7YA 2UXAA 2F35A 1ZKBA 3T93B 1B1HA 3MQ9A 2PVUA 4ZEFA 3K00A 2DSFA 1BKAA 3USDA 3HCQA 1MY0A 1SI0A 1R1NA 3KEIA 1MDQA 1P1OA 3PUWE 4IO7A 1MY3A 1FQCA 4FJPA 1OVBA 4RPNA 1JETA 1EZ9A 4F18A 1M5EA 2B3FA 4GL0A 2F8DA 3QUJA 4DDDA 4H8IA 2ESNA 1GVCA 3MVXA 3KN3A 3JV9A 3W15C 1FQDA 1TFDA 4LA9A 1UTBA 1VSOA 1B6HA 1FQBA 3TQWA 1URGA 4EF1A 4JSDA 1RKMA 4OFOA 1N3XA 1IQ7A 1XOCA 4TLLB 4G68C 3TYHA 1Q35A 2H5YA 3TTLA 5FHNA 3IB1A 2XX9A 5I56A 3H06B 2THIA 3PUVE 1JEVA 4BLAA 3T9XB 4QSCA 2YPNA 5B7DA 4G8NA 1IIWA 3OENA 1YPNA 3E4RA 4ESXA 1Y20A 1HSEA 5AA4B 4ZZAA 4RY1A 4NF4A 2XXVA 2XXIA 1F9BA 1SDXA 4K3FA 5DVJA 3KBRA 3K6VA 4PE5B 3K2DA 1D4NA 2F7CA 3IK6B 3OO8A 2V84A 1MDP1 2DE2A 1D9YA 1LLSA 2Q9TA 1A55A 3RT6B 3I6VA 3CVGA 4F39A 1B40A 3SEXA 4DCYA 1LFIA 4KYDA 4LZ7A 3K1MA 1XS5A 4F19A 4FECA 2DP8A 3BBRA 4ELRA 2A5TB 3I3VA 4ELPA 3RGYA 2B3BA 5HPQA 3IO6A 2OWTA 5H8NB 3A3CA 3K1NA 1LCTA 3MJNA 3MZBA 4KQPA 1FQAA 1LAFE 2P0SA 3K01A 2OJTA 3PUYE 5CMBA 1B3GA 4N6PA 2H99A 4TOZA 4R2FA 3GBAA 4QSEA 5ITPA 2Y7PA 1MXYA 4ECFA 4U4XA 2G29A 4ZE8A 3SERA 2ZNSA 4U1ZA 1B3EA 5K2XA 2GHBA 4LVQA 4GLIA 2PMSA 2DVZA 3WAEA 2E0SA 1DTGA 3OO6A 4M1VA 2UYFA 4PP0A 2YJPA 3V5AA 3CIJA 2PX1A 3FJGA 2XXYA 4R73A 2AL5A 3IOWA 2Q88A 4BDRA 1B5HA 3D4GA 4IB2A 4F1YA 1MS7A 5JTYB 1JEUA 1LAHE 5IAIA 5H8FA 4BDQA 1MQDA 3O2AA 4YKJA 5I2NB 3M3LA 2Y7IA 1SBPA 3VVFA 1VFDA 1QJMA 4QRZA 3EHTA 4I8CA 4O3BA 3VLVA 3P7IA 1PC3A 4Q30B 2ZYKA 5H8QA 2OBGA 3OOAA 3M3FA 3HO7A 4F31B 1LBBA 4P0GA 3PU5A 3QIMA 4JBZA 4ONYA 3R6UA 3TEPA 2O68A 1TT1A 4Q8RA 4QF9A 1SW2A 3SKPA 2DYXA 3FXQA 3C9HA 3MZ1A 4FIMA 2D21A 3PMWA 2ZYMA 3U92A 4F3GA 2FNCA 1NMUA 3ZKKA 1AMFA 3T66A 3PPOA 1M5BA 2A5SA 3TTNA 2F36A 1FTLA 2DXRA 4THIA 2QPQA 2Y7WA 1P99A 3G7WA 1YTVA 1XVXA 1B7UA 2OZZA 3H6VA 3H6TA 4WKMA 4KYSA 3ZS6A 4ISUA 3OELA 3JYRA 1SW4A 4AB6A 1T0KA 3S4UA 1ZJLA 4YB7A 3TAJA 4MLVA 2P2AA 4GVOA 4QSDA 1B4HA 2I4BA 5LOMA 1QVSA 4C1UA 1H43A 3IORA 3D4CA 3KSJA 1MXVA 1N76A 4XKPA 1YCJA 4RK2A 1SVXB 3SDFA 3LSXA 2WKYA 3MP6A 3O9PA 3L6HA 4MBPA 4ZECA 5L9MA 2XXTA 2ZXTA 4QHQA 4ZZEA 3TCHA 3FXRA 3B6TA 3VVDA 3IOTA 2X26A 1PDAA 1MM6A 2VP1A 3VLWA 2REJA 3WAFA 2OLBA 2UVGA 1A99A 3MUQA 1Z7NE 3QXMA 4MH5A 5CBSA 4OXVA 1USYE 1IZ1A 3T22A 1MQIA 1MH3A 4F3PA 3PV0E 4F1VA 5ITOA 2O1LA 3T9UA 4R9GA 1CB6A 2Q89A 1HSLA 5I57A 2VHAA 2RCBA 2O51A 5JK4A 3TMGA 3VLUA 4OTEA 1JVYA 4ZS9A 4H67A 5I84A 4I1DA 4R6YA 3IB0A 3LBSA 4LP2B 4L17A 3HHGA 3FVGA 2ZYOA 2PT2A 3BFUA 3T96B 3SEVA 1MPBA 5AA3A 4QFOA 4NMYA 4G8HA 2I6EA 1QW0A 1S7YA 5I2KB 5H8SA 1VFEA 4Z7EA 1QUKA 2I0BA 3QUFA 4NF6B 3UIFA 1B9JA 5AE4A 3IOUA 1QKAA 4LQ5A 2AL4A 3DM0A 3K6WA 1ATGA 1KWHA 1AOVA 3UP9A 3IR1A 2HXWA 3VVEA 1B05A 2ALUA 4JWXA 2ZNUA 3S9EA 4PFYA 3MC2A 4R75A 2DXYA 4X1BA 2D5WA 2OCUA 4NF8B 1MY1A 4EXKA 3SETA 4NWCA 1URSA 2GFEA 1OMPA 5M2VA 1ANFA 1LCFA 4R6KA 2QS4A 3I5OA 4RPOA 4R74A 1ZBMA 1A8FA 2HAVA 1BTJA 3CG3A 3S2VA 5CBRA 3HN0A 4R6HA 3VFJA 4O3AA 2V93A 3IX1A 1SYHA 3TCGA 4ELQA 4XKRA 4DXCA 1A40A 1N7XA 1MQHA 1MPDA 3TTMA 3G3IA 2O6AA 2HFBA 1QUIA 3MVZA 1XT8A 3HHFA 1LSTA 4M4GA 1ZTYA 3R26A 1OQHA 4NE4A 5AA4A 2GHAA 1SW1A 5A5XB 3TKDA 2I0CA 1M5FA 4FEBA 2F78A 4BDLA 1B46A 2DQVA 3EPEA 3G3JA 3CG1A 2R71A 3C4MA 3PD9A 3UA8A 5KZTA 1B5IA 2RCAA 2V3UA 3LUYA 2UYEA 3N6TA 3H03A 1ZLQA 2QJEA 5TPAB 3HV1A 3KGCA 1UTHB 1DSNA 5DEXB 3RTWB 3RN8A 3VXBA 2XXXA 3LSLA 1JQFA 1OVTA 4H0WA 4OEUA 3THIA 1US5A 3Q25A 3B6WA 1Y3PA 5H8NA 3LR1A 4LONB 1MRPA 5DT6A 3KSXA 4KCDA 3FV1A 1P1UA 2DOJA 3RT8A 3KFMA 3C34A 3MP1A 4QFPA 1A8EA 1WVJA 2H4IA 4YZZA 3IJXB 1B3FA 4GXAA 3HSTA 4FEDA 1ZIUA 3KJTA 2DWIA 2Z8FA 1B51A 3G3KA 2XXWA 3CRBA 1HSJA 4HS7A 5L8DA 1IXIA 2NWJA 2DWHA 3K4UA 3FATA 3UK4A 3V89B 2ONSA 2I3VA 4ELOA 3VE1B 1GV8A 2F6GA 4FORA 4XKNA 1Y1ZA 2Q8JA 1H45A 2QMWA 3JZJA 1MH4A 2DWAA 1R9LA 5FHOA 3S9NC 1BIYA 3IAZA 4GRKA 4EDPA 5JTYA 1H3DA 5KDTB 1MM7A 3O6GA 3G3GA 3PMVA 3PD8A 1DMBA 3TFLA 2O69A 2X7PA 1O7TA 3TCFA 4LZ5A 3Q29A 4O3CA 5I2NA 1S50A 4YKPA 2QS1A 2YLNA 1Y3QA 4OQOA 4UA8A 5ELVA 2Y7KA 3U93A 1GTKA 3K0VA 3G3HA 3MVYA 4GXSB 3U8QA 4OESA 1OLAA 5I59B 4IY6A 2CMOA 1B52A 2DVCA 3G3FA 5EYFA 1PBPA 4OETA 3B7DA 4OEVA 1BLFA 1OIBA 2RKMA 2AIXA 2I4CA 5CI5A 3E13X 4OFJA 4YKKA 1IITA 1QULA 4ZDMA 4KCCA 4OERA 2I58A 4EQ7A 2Z22A 4GL8A 4JXIA 1MXUA 5CC2A 4H1XA 3FXUA 3V8XB 3PPQA 2G93A 2V25A 4U2RA 1II5A 3IB2A 3MBPA 2NXOA 2OWSA 1MQJA 3K02A 1NNTA 4IO5A 4UACA 4ND9A 4PQJA 4ZEBA 3K1PA 4XTCQ 3DP4A 3IOVA 4PFUA 3DP6A 3L6GA 3N5LA 4RK9A 4NF5B 1MPCA 1UQWA 1IEJA 3H6WA 1IXHA 5FHMA 4GOTA 3LC8A 2ONRA 1J1NA 5KCJB 4X48A 2XX7A 5TP9A 1UIVA 5B70A 3TDJA 1I6AA 4F3BA 1B1XA 4DXBA 3MAMA 3V83A 2I49A 1EH3A 1VE4A 4U23A 1USYH 5DVFA 1B32A 1MXZA 4OZ9A 1PB8A 4IGRA 4WEPA 3MW0A 5DTBA 3TUSA 3E9XA 4NTLA 1LGBC 2Y7RA 3ZKLA 1WDNA 1NL5A 1MQGA 4RJZA 3KZGA 4LUBA 2REGA 3EHUA 3B6QA 5HM4B 4Q5TA 3VV5A 4R9FA 4EQBA 4IO4A 5ICQA 4RNSA 5AA2B 4R72A 5I2KA 5TU0A 4ZE9A 2M8CA 3EN3A 1A7LA 3FVKA 5AA2D 1B7ZA 2IEEA 1FQEA 4NF6A 5K2YA 4F1UA 2XXUA 2HZKA 4POWA 5ICTA 4TQUQ 1B58A 1AH5A 1FTMA 3VXCA 4OENA 5FTIA 3QAXA 3EHSA 4OMBA 4XXUA 1QUJA 4HTGA 4NF8A 1JW4A 2ZMBA 1LFHA 1B0LA 3GBBA 4G68B 1XHYA 1N7WA 3O6HA 1M5DA 2Q2CA 3DELB 1A54A 1MY2A 4KHZE 2P1SA 1DOTA 4H5GA 3H7MA 3KG2A 2R6GE 4OHNA 4KYEA 1ZU0A 4WEDA 2F34A 1RYOA 4C0RA 2F97A 3MWBA 5J1DA 2O1MA 4G2ZA 3RTFB 3MPLA 1TXFA 1YAEA 3H3GA 5H8HB 5I58B 2FA7A 1NFTA 1L5TA 2X7QA 2HQ0A 3VDFA 2RC7A 4EUOA 1OLCA 3T9VA 4QFNA 3KN7A 3TTKA 1EU8A 4YB5A 1B4ZA 3FGSA 5A5XA 4E0XA 3LSFB 3KJ7A 1IUDA 2ZYNA 1M5CA 1N04A 3C35A 4XKQA 4RXLA 4DZ1A 2VD3A 3OSQA 4DXUA 3LSWA 2O7UA 2DE4A 3ZSFA 1P1NA 2XXQA 2F7BA 4ZEIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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