2F35A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core with ubp302 at 1.87 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f35A02
2DS9A 3ZSFA 2OK2A 1MY0A 2XXXA 2RKMA 3FIRA 2VGQA 3SEYA 2X26A 4OFLA 3K6XA 1B5IA 4F19A 3N6TA 3GXAA 3Q27A 5L9MA 4KQPA 4XKRA 4QSCA 3RUMA 1N0TA 1FQBA 1M5FA 4GLIA 1B3HA 3FUZA 1IITA 3FJMA 4EUOA 5DVIA 3RQTA 2F5XA 4YZZA 4MBPA 1GTKA 3B6WA 4N6PA 3TCGA 1B4ZA 3C4MA 3DELB 3KGCA 1LAXA 3PD8A 3HHFA 3PMWA 4DCXA 2Z8DA 2F7CA 2F35A 4R9FA 4PFTA 2V3QA 4NF4B 4QFKA 1MQHA 3RGYA 1RYXA 5KCJA 2O1LA 3DP6A 3H6UA 3I3VA 1TFAA 4C1TA 4LQ5A 5J1DA 1EZ9A 4HCWA 2UXAA 1WDNA 4R6KA 1D3KA 4NF4A 1AH5A 2OLBA 4FECA 3TQWA 2XD3A 2Q88A 3O2AA 3FV1A 2QJEA 4IO3A 4PFYA 2GFEA 2NWJA 3OEMA 1VFDA 3C33A 4NE4A 3FZVA 2XXIA 4U1ZA 4O3CA 2QPQA 4N07A 3IX1A 3JV9A 3KEIA 4OHNA 3FJGA 3OELA 2UVGA 5AA2B 2O84X 4LQ2A 3GBAA 1NFTA 3OOAA 3KG2A 4YMAA 1ZMGA 3T96B 1MQGA 2RCAA 3DP8A 1XOCA 2I6EA 5AA2A 5I58B 4DDDA 3HN0A 4IO6A 1MS7A 1QULA 4H8IA 3VXCA 1ZLQA 4HS7A 1DTGA 5I58A 4QFPA 2I48A 1A54A 3ONMA 4IO2A 4JWYA 4LZ8A 3FVOA 1B6HA 1IQ7A 1Z7ME 1EU8A 4GQOA 2ESNA 1POY1 1UIVA 4EF1A 1H44A 2XHDA 2ZYNA 3EHSA 3IOUA 3S9MC 1PB7A 3OO7A 4WXJA 3N5LA 1NL5A 3TPAA 1DSNA 1NNPA 5M2VA 4GIZA 1UTHB 3FXRA 3B6TA 3T22A 2DWJA 4U22A 4E0XA 2ZNTA 2FA7A 1P1OA 5ITPA 5ICTA 1IEJA 1MXYA 1Y4TA 3K00A 3U94A 2Y84A 3TYHA 2DE2A 1HSJA 4QSEA 2REJA 4QSDA 4I62A 1QW0A 3EN3A 2PT2A 1FTMA 2REGA 2ZYOA 5H8HB 3CFZA 2B3BA 1MH4A 2DE3A 5AA1A 4RJZA 5KDTB 1USYH 5H8FA 5ELVA 1NH8A 2NUVA 5H8HA 3K6VA 3B7DA 5FTHA 1QKAA 4N13A 4P11A 4R6HA 1QUKA 2DOJA 5HBCA 5ICQA 2PVUA 4TLLB 3S9EA 1YTVA 3U92A 4R73A 3D4GA 5DEXB 3OO6A 1LAFE 2NVUB 1LBCA 3LSFB 3P7IA 4MFIA 1Y1MA 3PU5A 3OSRA 3E9XA 1SW1A 3MPLA 3BFTA 1YPNA 4LUBA 4KFQA 2XXRA 3CVGA 1A55A 5BUUA 3ZS6A 3IOWA 3TTKA 3SDFA 3KZGA 1GV8A 3A3UA 2ZNSA 1LBBA 1MM6A 1S50A 1FQDA 4YB6A 3LR1A 1ZKBA 5TPAA 3WAEA 4C0RA 1EH3A 4YKJA 1DOTA 3FATA 4ESWA 1J1NA 1KWHA 1PBPA 1B46A 2G29A 2ONSA 4HTGA 3V83A 4OMBA 3AXFA 5FHNA 4YAHX 1OLCA 3KOTA 1S9TA 1JW4A 4POXA 1MQIA 2P0SA 2CMOA 3UA8A 4EXLA 1XT8A 4G8MA 2AIXA 4WEPA 1FTJA 2OZZA 3GBBA 2F8DA 1R9LA 4ECFA 1I69A 3QSLA 3EPEA 5H8QB 1OMPA 1PBQA 2DWHA 4IY6A 2RCBA 4BDOA 4RPNA 3F11A 5FHOA 1VFEA 4OFOA 2UVIA 1AIVA 1PDAA 1F9BA 3C36A 4ZEDA 4DXCA 1FCKA 4KPTA 1EZPA 3E3KA 3TMGA 1HSEA 3ECRA 4XIGQ 1IXCA 2UVJA 2Y7KA 3S2VA 1MRPA 5EYFA 2DSFA 1B5JA 1P99A 4PFUA 2X7QA 2I4BA 3DP4A 2RF1A 3SERA 1P1UA 5I2NB 1QKBA 3O9PA 4G2ZA 5B70A 1FQFA 3CR9A 4X9TA 2H98A 2OWTA 2VOZA 3RTWB 4M1VA 4OEUA 3QK6A 1MY4A 4IB2A 4RXLA 5I2NA 3I5OA 4GL8A 3O28A 1S7YA 1IXIA 2R6GE 1M5EA 5I84A 1YAEA 2Z8FA 4ELQA 1AMFA 3MPKA 4QHQA 4Z0IA 1MXUA 3O6GA 1AOVA 4GF8A 1MY1A 3PGFA 3MP1A 4JWXA 1B1XA 3TODA 1N7WA 2P2AA 3SEVA 4KI0E 1Y4CA 3LSXA 3MVWA 3DM0A 5F1QA 4AB6A 4YKPA 2GHBA 1RKMA 2DP8A 2Q89A 1MY2A 3PD9A 2A5TA 2HXWA 3MBPA 5K2YA 3HSTA 1SD3A 1B58A 1JNFA 4LATA 4EXKA 1MPDA 5LOMA 1A99A 4LZ7A 1SW2A 3K2DA 4AB5A 3UK4A 3EHTA 2O7IA 5JK4A 1YCJA 1D9VA 1LAHE 4KYSA 4GOTA 3K01A 3G3FA 1ZIUA 3D4CA 3O97A 4FIMA 5AE4A 3C9HA 4EQ7A 2I4CA 4LP2B 5KCJB 3RN8A 4U23A 4NF5B 3VE1B 3FASA 3THIA 1MDP1 3OO9A 1MQDA 4JDFA 4BDLA 3FVNA 4FJPA 3PUYE 4NF5A 1Y9UA 4F39A 3OMBA 1B3EA 1LB8A 3UGWA 3HO7A 3W15C 3TFLA 4JWOA 3VFJA 1B9JA 1JEVA 1MDQA 5HPQA 2DXRA 1JW5A 2H4IA 4JB7A 2W7YA 2XX7A 5ISUA 5CRYA 2Z22A 2AYSA 1EZOA 4G68A 3L6HA 3G3JA 3VVFA 2DVCA 1DPPA 4U1OA 1MM7A 1JEUA 3BFUA 1JETA 3CSGA 3C35A 3TTLA 4RK2A 3MW0A 3EF7A 1UQWA 4NF8B 4GFRA 3MQ9A 4GL0A 1H45A 4F1UA 5F7VA 2O1MA 4MLQA 2Y7IA 1NNTA 1IZ1A 1D9YA 1Y3PA 1B32A 4R9GA 3KN7A 3PMVA 5TP9A 4NF8A 4NF6B 2DWAA 3Q29A 2DQVA 3PUWE 2QS1A 4DZ1A 1T0KA 4RNSA 2GHAA 1R6ZA 4BDRA 4OYVA 1L5TA 5A5XB 1NNKA 3KJ7A 3MC2A 3IK6B 3K1MA 3KBRA 3L6GA 4NF6A 1BTJA 4QF9A 1TFDA 4GVOA 2RC9A 1D4NA 1FTOA 3TKDA 3SEUA 2THIA 5A5XA 2F36A 1Y3NA 1SI0A 3MUQA 1IIWA 2I3VA 3U8QA 4F3PA 3R6UA 3Q28A 3QAXA 5L9SA 3ODBA 3VLUA 5JEIA 3K02A 4NEDA 2RINA 3PUXE 4OWDA 3LBSA 3IB1A 3CG1A 1N3WA 3C34A 4PE5B 4RPOA 1ATGA 1FQCA 4H65A 5JTYB 1SYHA 2Y7RA 3PPOA 2WKYA 3PUVE 1SW5A 2VD3A 1CB6A 5I2KA 1DMBA 2ZMBA 4DXBA 5H8FB 3MZBA 5JTYA 4OEVA 4F31B 1CE2A 4ELPA 2XXUA 4YB5A 5FTIA 1BKAA 1ZJLA 3TUSA 4DXUA 1LFGA 4IO7A 5L8DA 2Q9TA 3TTRA 2Y7WA 1OQGA 4PQJA 3VV5A 4OFJA 1JQFA 3RT8A 4H67A 2ZNUA 4EDPA 4XKPA 2GRVA 3IJXB 3OEKA 4ONYA 5ITOA 1MG1A 2H25A 3OO8A 4F22A 2R9JA 4KD5A 1M5BA 2F7BA 4F29A 2OJTA 1MY3A 2I3WA 2Q2AA 2YLNA 1AL3A 1B0LA 4OERA 3RY3A 1LGBC 2XX9A 3SEXA 1NNFA 5CC2A 3FVKA 1OLAA 3SESA 5AA3A 4F2OA 4DE8A 3K1PA 4NMYA 3S9NC 4RY1A 3MZ1A 3H6WA 2IA4A 1HSLA 3FXUA 2OCUA 1URDA 3O29A 5TU0A 3IOTA 3TCFA 5TPAB 5L9OA 2HAUA 5CI5A 4LA9A 4TLMB 4G77A 4XTCQ 1Z7NE 5CM6A 3G3GA 1OQHA 2H99A 2V25A 3RNNA 4OZ9A 5EHSA 1MXZA 2F6GA 1UIUA 3TQLA 1I6BA 4X1DA 3K1NA 2PX1A 2HZKA 2O68A 3IB2A 3TDJA 3T9XB 1BP5A 2O69A 1LCTA 3U1OA 1N76A 1B0HA 2Q2CA 1XVXA 2KLFA 4F18A 1B7UA 3LC8A 5I56B 2ALUA 4G68C 3T9HB 3USDA 3MVYA 4FATA 4BDNA 4BDMA 2I49A 2ANJA 3C32A 2ONKE 2YPNA 1SVXB 3PMXA 4OVJA 2FNCA 1LFIA 3U72A 4KCDA 5I56A 3VVEA 5CMMA 3K4UA 4OETA 4LVQA 5EHMA 2FYIA 2F97A 1R9QA 3HPIA 4GXSB 4R75A 2HCAA 1H76A 5K2XA 3SETA 1XHYA 5AA4A 3KFMA 1SW4A 3PPRA 2VD2A 4IY5A 2QRYA 1ZTYA 3ILTB 4NWDA 4THIA 3BKIB 2XXVA 5I59A 3CI8A 3H03A 1OVBA 2HZLA 1IXGA 3KJTA 5DVFA 3RTFB 4UACA 4FORA 4OQOA 3N94A 4R6YA 4ZZAA 3KSXA 1Q1KA 2OWSA 2XXQA 1B51A 4XKNA 2A5SA 2QS2A 1N7XA 3H3GA 1NH7A 3VLWA 3MVXA 4EF2A 1B05A 2G93A 4IO4A 1I6QA 2M8CA 4R72A 2DVZA 3TTNA 1SI1A 3OD7A 3CFLA 2E1SA 4R2BA 1FQAA 4YB7A 3T9VA 3M3FA 3M8UA 2X7PA 4OESA 3HV1A 2XX8A 3KN8A 3TCHA 3KSJA 1XVYA 1LLSA 5DYHA 3EHUA 2A5TB 5IKBA 1SBPA 1B2HA 3FJ7A 2V84A 2IEEA 3DLNA 4H1XA 2HFBA 4I9DA 4GD5A 2B65A 1M5CA 4R2FA 1A8FA 2NXOA 3ZKLA 4DIGA 1B52A 2XXWA 4Z7EA 4Q5TA 2H5YA 2XD2A 3RT6B 3T93B 1IXHA 4FE8A 1TWYA 1UTBA 2PMSA 4ZECA 2DWIA 2YJPA 1ANFA 3N26A 4O3AA 3IO4A 3CSBA 3WAFA 4PP0A 5IAIA 4YICA 5CMCA 1GGGA 4X48A 4U4SA 1MH3A 1SDXA 2Z23A 2V3UA 4RYAA 3V8XB 4Q8RA 1ELJA 4I8CA 4RK9A 4PFWA 3E4RA 4U2RA 4F2QA 1B1HA 1Q35A 4YU0A 1MXXA 2H9BA 3IAZA 1O7TA 1B7HA 2NOOA 1LSTA 3G3IA 3QXMA 5H8NB 1WVJA 2CZLA 3RLFE 4G68B 1VE4A 3SKPA 3UORA 3PPPA 2AL5A 1B5HA 4YMBA 4F3GA 4QFNA 3H6VA 4QRZA 3TAJA 5H8NA 3UIFA 2D21A 4H5FA 1MXVA 4P0IA 3A3CA 1LFHA 3O6HA 1NKXA 1VR5A 2LAOA 2QS4A 1II5A 2E0SA 2Z8EA 3ZKKA 2ABHA 3MZ9A 3JYRA 1MXWA 3VVDA 4IGTA 5TP9B 1ZBMA 4RA1A 4KYDA 2O7UA 1P1QA 3G7WA 3C31A 2QS3A 4TOZA 4NWCA 3O66A 3K0VA 4ZEBA 5B7DA 1A7LA 3RPWA 4ELRA 2PT1A 1LCFA 3G3HA 1SYIA 3OSQA 3G3KA 3IR1A 4ZE8A 1JW1A 5CBSA 2VP1A 1URSA 3VDFA 4KR5A 1H43A 3I6VA 1MQJA 1DTZA 3LSWA 1BIYA 3PUZE 1H3DA 2F7AA 1QVSA 2RC7A 3K6WA 4POWA 4G8HA 4I1DA 2PBWA 1B40A 1QJMA 1JVYA 1O63A 2HAVA 2HEUA 1PEBA 1LB9A 2P1SA 3V89B 2BJJX 2RC8A 3TEPA 2F34A 2V93A 3KN3A 4DCYA 3W9WA 3TELA 3IB0A 2VHAA 3TZAA 4GRKA 1MPCA 4LONB 5I2KB 4O3BA 4IO5A 4MLVA 1B7ZA 4BDQA 4JXIA 3FV2A 1FW0A 3FVGA 3MP6A 2XXYA 2QL3A 3LSLA 4ZEIA 3SEWA 1A40A 3MWBA 3QIMA 3R26A 1US5A 3IO6A 3MJNA 3OENA 3QUJA 1NMUA 1TXFA 2I0CA 4KCCA 1R1NA 1QUJA 1PB9A 3H7MA 2DE4A 5CMKA 1UTHA 3JZJA 4G4PA 4M4GA 1US4A 4ND9A 5CMBA 1IUDA 4ZS9A 5DT6A 4FEBA 5DVJA 2O51A 4ZDMA 2ZYMA 2I58A 4H5GA 3HHGA 4E0WA 4JSDA 3Q26A 3O6IA 4F3SA 5DTBA 2XXHA 1PB8A 3UP9A 4FEDA 2UYEA 3IORA 3V5AA 1B3FA 4ZEFA 5KDTA 3OXNA 2DYXA 4YKKA 4EQ9A 5KZTA 2V3TA 3H4ZA 4G8NA 4R74A 1FTKA 4IGRA 1Y1ZA 3FD3A 2O6AA 3VLVA 4QFLA 4H0WA 2B3FA 3EQ1A 1JVXA 3CFXA 2I0BA 2QMXA 1BLFA 2UYFA 3BBRA 3U93A 3PPNA 4WKMA 4K3FA 5HM4B 2D5WA 1I6AA 5DEXA 1N3XA 3IOVA 3CIJA 1MPBA 4JSOA 5I57B 3HCQA 4WEDA 2QSXA 2AL4A 3QYTA 3PV0E 1VSOA 1GR2A 1B3GA 3E13X 1RYOA 1B4HA 1P1NA 4DLDA 4MH5A 4EQBA 3H06B 1DPEA 5I57A 1LAGE 1POTA 4OENA 3LUYA 4ESXA 2F78A 4L17A 2D3IA 1N84A 5CBRA 3K6UA 5AA4B 3T9UA 2F6PA 3T66A 3B6QA 4ISUA 1USYE 3MP8A 5H8SA 4F1VA 1P1WA 1B3LA 2QMWA 4YKIA 4HW8A 3CRBA 4NTLA 3TTMA 3VXBA 3CG3A 4TQUQ 4XXUA 4JBZA 3S4UA 4KYEA 5I59B 4BLAA 4HCYA 4GXAA 3MVZA 4QFOA 1URGA 3UN6A 3FXQA 2DXYA 4Q30B 1QUIA 1ZU0A 4UA8A 1FQEA 4FAJA 2OBGA 3W9VA 2PYYA 1O64A 3QUFA 2GH9A 4PETA 3S9LC 1N04A 4ZEKA 5BWJA 4ZE9A 3FGSA 4AQ4A 3IJOB 5H8QA 3ILUB 2R71A 4H8JA 4KHZE 1XS5A 1SQYA 1GVCA 2XXTA 3Q25A 2ZXTA 3IL1B 3MAMA 4F1YA 3GLBA 4MF3A 4C1UA 1WODA 3GZGA 1OVTA 4U4XA 4Q0CA 4OTEA 1TT1A 4H6DA 1Y20A 4GWOA 2Y7PA 1Y3QA 4F3BA 2ZYKA 4LZ5A 4XKQA 1XC1A 4X1BA 4OXVA 4P0GA 2Q8JA 3R7XA 3PPQA 3A09A 3M3KA 1OIBA 2UVHA 1A8EA 1UTBB 3N6UA 4U21A 2ONRA 5AA2D 3KOSA 2XXPA 2HQ0A 3H6TA 4ZZEA 5FHMA 4ELOA 1FTLA 1M5DA 1PC3A 3M3LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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