1S9TA

Crystal structure of the glur6 ligand binding core in complex with quisqualate at 1.8a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
total genus 88
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1s9tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1s9tA02
4FATA 1M5FA 1MQIA 1Y1ZA 3VE1B 4F22A 5ITOA 5F1QA 2I0BA 3A3CA 3DP6A 4PETA 2H99A 2ONSA 1JVXA 1NMUA 1JW1A 3FVKA 3UGWA 3THIA 3O6GA 3VLUA 4GF8A 5HPQA 3C36A 2XXPA 1MM7A 2XHDA 1FQCA 4HS7A 4F3PA 2H4IA 4OQOA 3U93A 3TAJA 1MQDA 3VFJA 2QS3A 1QKAA 2A5SA 4ZE8A 4ISUA 1CB6A 2V93A 3Q27A 1MQJA 1MRPA 4G4PA 4EF1A 4G8HA 2XX8A 1IEJA 3N26A 1PEBA 1GR2A 1M5CA 1USYE 4F1YA 1N7XA 3SERA 4H65A 3EN3A 3VXBA 3UP9A 4NE4A 5I2KB 4OFOA 3CFZA 3HPIA 4GVOA 2GH9A 3O66A 2Z8FA 1D9VA 1OQHA 1B52A 1BLFA 3LSFB 5DT6A 5A5XB 3PUXE 4N13A 1TT1A 4NF8A 3QK6A 2H98A 3RT6B 2XXIA 5ITPA 1R1NA 3KGCA 4F31B 4YMAA 3MAMA 2DWJA 3F11A 1D9YA 1FTJA 3G3IA 2R9JA 5B7DA 5KZTA 4AQ4A 1LB8A 2AL5A 3CSBA 1VFEA 4DZ1A 3T66A 3W9WA 4G8MA 5HM4B 3PMXA 4NWDA 5CRYA 3CR9A 2H25A 5AA3A 1JETA 4N07A 2THIA 2UVHA 1T0KA 3T22A 4RK9A 1SYHA 4POXA 2GFEA 2UVIA 4O3CA 1LGBC 3BFUA 1FQDA 3TFLA 4RNSA 1TFDA 5AE4A 5BUUA 3WAEA 4ELRA 1VSOA 3CVGA 4DIGA 2F97A 3GBAA 2HXWA 5I59A 5I57A 4R9GA 2ALUA 4OEVA 3EHUA 5H8FB 5DVIA 1RKMA 4TOZA 1GVCA 1NNFA 1LBBA 1A99A 3IR1A 1LAGE 4OWDA 5L9OA 2QPQA 4RXLA 2F7AA 1IXGA 4FORA 3G3FA 2DWAA 1ZBMA 2PMSA 4R9FA 2Y7KA 4ELOA 4EUOA 1N0TA 1WVJA 3H6TA 4QFNA 1B58A 4RPNA 3MVZA 2ONKE 2VP1A 3FJ7A 2REGA 4R75A 3ONMA 2CMOA 3FUZA 1OMPA 3H06B 1ZU0A 1YCJA 2IA4A 1S9TA 3KOTA 2XX9A 1GV8A 4G68A 3PU5A 4QF9A 3C32A 1EH3A 3CFLA 4MF3A 1JW5A 1Z7ME 1IXIA 4IO6A 1SD3A 4OFLA 4KR5A 4OVJA 4R6HA 2R71A 1MM6A 3ILTB 2DWHA 4JDFA 3K6UA 1PB9A 2B65A 2I0CA 4H8IA 3G3JA 3DELB 3O2AA 5L9MA 4NF5A 2HCAA 3MVYA 1NNKA 4G8NA 2XXHA 1FQAA 3G3KA 1TFAA 1H45A 3CFXA 3E3KA 2F35A 4DCYA 3HHFA 4OENA 3U92A 1R9QA 3I5OA 4JWOA 1GGGA 3TPAA 1PC3A 3O28A 1EU8A 4HCWA 3FXRA 4U1ZA 1AIVA 3OD7A 4EQ7A 4ZEFA 5CMMA 1FTMA 3B6QA 4X48A 3T93B 5I56B 4GQOA 5CC2A 2V84A 1LLSA 3T9UA 3IJXB 5I59B 5I57B 5FTHA 4DXCA 1Y3NA 4MLQA 1FTOA 3FGSA 3TTRA 4THIA 3EF7A 1Y4CA 4ZEDA 4Z0IA 1JEVA 4GWOA 1MY4A 3K1MA 5I84A 4BDMA 1SDXA 4FIMA 1B9JA 1NFTA 4NF4B 3USDA 2Y84A 3FASA 4KI0E 2IEEA 1N04A 4NEDA 4RA1A 3U8QA 2E0SA 4YB7A 3GXAA 4ZZEA 2Q89A 4Q8RA 3IAZA 1SBPA 2HAVA 2I48A 5B70A 2O7UA 4G68B 3M3LA 4OESA 1JNFA 1BP5A 3TEPA 3C33A 4OERA 4IO7A 3ILUB 3FXUA 2HAUA 4OXVA 1I69A 4U22A 3TCGA 1M5BA 1PB7A 3MC2A 3PPPA 1QJMA 3C34A 4ZEBA 4R2BA 4H8JA 5AA2D 1Y9UA 2YLNA 4EQBA 4NTLA 3VLWA 3E13X 2P2AA 2A5TB 1PDAA 4RPOA 4NWCA 3TODA 2O68A 1B05A 5JTYA 1P1WA 2V3UA 3G3GA 3ZKKA 1Y3PA 1YAEA 5H8HB 4GL8A 1P1NA 1B1HA 2DS9A 3SDFA 1LAXA 4JWXA 1PB8A 4ND9A 4KCDA 5A5XA 1ATGA 2Z8EA 1FCKA 4HTGA 3MBPA 4JXIA 3PUVE 3V8XB 2R6GE 5I2NB 1B4ZA 3EQ1A 3MW0A 1IQ7A 3AXFA 1ANFA 3T9VA 4IB2A 1POTA 1A40A 1N84A 1SW5A 3SKPA 4FE8A 4YKJA 2E1SA 4FEDA 2FNCA 3K01A 3MWBA 1Z7NE 1JEUA 4Q5TA 4WEDA 3TCHA 3S9NC 3HSTA 2ZYOA 5H8NB 2ESNA 4U4XA 5CMCA 4ELPA 1DTZA 2DVZA 1US4A 2M8CA 3OSRA 4I8CA 4OETA 3RN8A 3H6UA 3DM0A 1BKAA 3RNNA 4JB7A 4PE5B 4FJPA 5H8FA 3KN3A 3RGYA 4GFRA 4QFLA 4GRKA 1H44A 3CIJA 3B6WA 4AB6A 2NOOA 3MVWA 2LAOA 2Q88A 3PD8A 1B4HA 4X9TA 3KSJA 1P99A 3N6TA 3MJNA 5J1DA 3QXMA 5JTYB 2DE2A 4GIZA 5CM6A 1L5TA 2B3FA 1MY0A 2F7CA 4KFQA 2VD2A 2X7QA 5TU0A 3PV0E 1ZTYA 4IO2A 1B3LA 3OO6A 1O7TA 2CZLA 3FV1A 2OZZA 1SI0A 4E0XA 1B6HA 2DXRA 3K4UA 2X7PA 1P1UA 3WAFA 2REJA 4C1TA 1HSEA 4Q0CA 2QL3A 1D3KA 2PT2A 1B7HA 4ESWA 4IGRA 3VV5A 5CI5A 4PFTA 3VXCA 2RC8A 3PPOA 4PFWA 3PD9A 4F19A 4DLDA 4GXAA 3M8UA 1QUKA 3LC8A 5FHNA 5KDTA 1MXUA 4XXUA 3SEVA 1Y4TA 3PMWA 3Q25A 2F36A 3DLNA 3QYTA 5AA4B 1MXVA 4PP0A 3QAXA 1EZPA 3OMBA 1OVBA 1LB9A 4I62A 3U72A 3UN6A 1URSA 3K02A 4KHZE 3MZBA 2OLBA 1USYH 3GBBA 3LUYA 4U4SA 2O1LA 4F18A 4U2RA 2OCUA 1R6ZA 5DEXA 3RQTA 4XKRA 2Y7RA 2HZKA 4LZ8A 4Q30B 1MPCA 2DVCA 5I56A 3CSGA 4WKMA 4YKKA 1NKXA 3S9MC 2D5WA 4XKNA 4H1XA 3I6VA 3ODBA 4OFJA 3MZ9A 4LQ2A 4G68C 3SEXA 4IO5A 2HEUA 3FATA 1AL3A 1US5A 4TLMB 1SQYA 4GD5A 4H67A 2OWSA 4WEPA 1MY3A 2G29A 1IUDA 4LQ5A 3IO4A 5DTBA 4NF4A 4KYDA 2BJJX 1UQWA 4ZEIA 4P0GA 1MPDA 3SETA 2ABHA 5CMKA 1MY1A 2RKMA 3O97A 3EHTA 2P0SA 2QMWA 5L8DA 4ZE9A 2I4BA 1Y1MA 2PVUA 3ECRA 4I9DA 4ZECA 2HFBA 1NH7A 3TZAA 5ICQA 4LZ5A 2NVUB 1P1QA 3CRBA 3VDFA 4G77A 4F1VA 3JZJA 1XVXA 4H5FA 3UIFA 4LATA 1DMBA 5FHOA 3QUJA 4NF6B 2O1MA 2HZLA 3CG3A 3OO7A 4H6DA 4YZZA 3SESA 2RC9A 2HQ0A 1FTLA 2D21A 5KDTB 2A5TA 3JV9A 3KOSA 3QSLA 4RK2A 3FVNA 2F78A 3IX1A 4GXSB 1A54A 4ECFA 1DOTA 1BIYA 2ZYNA 5TP9B 5TPAA 5H8SA 3IK6B 2I3WA 1MXYA 5H8QB 3IB2A 5AA2A 2F8DA 4XIGQ 5H8HA 4C1UA 4YB5A 5DEXB 3TKDA 4Z7EA 2QMXA 3FJMA 2XXRA 2XXVA 3H3GA 2XD3A 1B3HA 1B5JA 3TTNA 1MS7A 3OELA 1HSJA 3MUQA 2Q9TA 3FJGA 1OLAA 4P11A 3L6HA 4IY6A 1ZMGA 4F3BA 4GL0A 1B5IA 3G3HA 3KJ7A 4QHQA 5I2NA 4YB6A 3O6HA 4PQJA 4QRZA 3LSXA 3SEYA 4UA8A 2D3IA 3M3FA 1QKBA 3RLFE 1IXCA 4ESXA 4YMBA 1URGA 2DE3A 1LSTA 1N76A 3ZS6A 1B7UA 2ZNSA 1QW0A 2XXXA 5BWJA 1I6AA 3S4UA 2O51A 3E9XA 3RPWA 3KJTA 1LCFA 5H8NA 4LONB 1IXHA 1MG1A 3K0VA 1JW4A 5IKBA 3IOVA 1NL5A 3A3UA 4DCXA 2NWJA 3GLBA 3R26A 1ZIUA 4ZEKA 2NXOA 2DYXA 5DVFA 4YKIA 2I4CA 4L17A 1QVSA 1N7WA 2UYFA 2NUVA 1B3FA 1B3EA 4BDOA 4F2OA 3RUMA 4KPTA 4H0WA 2FYIA 3IO6A 1MH3A 3EHSA 3OEMA 3UK4A 3TQWA 3FV2A 3I3VA 3HO7A 1UTBB 1I6BA 2O69A 3OO8A 1B40A 4N6PA 1DSNA 3MPLA 4EDPA 3IOUA 3Q28A 2F7BA 2XXQA 2VOZA 2X26A 4R72A 2OBGA 2GRVA 1UIVA 4QFKA 4LZ7A 3Q26A 2DSFA 4HCYA 5I58B 4QSEA 3L6GA 4X1BA 3S9EA 2P1SA 5TPAB 3V83A 4YICA 2DP8A 5AA2B 4KQPA 2OWTA 1M5EA 2PX1A 4WXJA 1DPPA 3MZ1A 4OEUA 3PUYE 1XOCA 3HCQA 1LAFE 2Q2CA 3RTFB 4ZS9A 2XXTA 1PBPA 3KZGA 4G2ZA 1IZ1A 2QS1A 4R6KA 4ZZAA 1WDNA 3TCFA 2PT1A 3N94A 1O63A 2V3QA 3H6VA 1MQHA 4P0IA 2RF1A 1R9LA 3FXQA 1AH5A 2UVJA 4TLLB 2O84X 2QSXA 2GHAA 4RYAA 5AA4A 1FW0A 4R73A 2XD2A 1VFDA 1TXFA 2YJPA 4R74A 1ZLQA 1Y3QA 5KCJA 2Y7IA 3TELA 5FHMA 2ZYKA 1RYXA 1DTGA 4FECA 3VVDA 2PBWA 1OVTA 3TTLA 2F5XA 2VD3A 1WODA 3W9VA 1MXWA 4IGTA 2UXAA 1OQGA 2H9BA 3PPNA 3V5AA 3R6UA 3FIRA 2Y7WA 1RYOA 2ZYMA 4U1OA 4OYVA 1QUJA 1H43A 3BBRA 3B6TA 3V89B 4EQ9A 3B7DA 4GLIA 3H03A 3FVOA 3IB1A 1NH8A 2XXYA 3LSWA 5CMBA 3EPEA 2I49A 1SW1A 2O7IA 4BDRA 4EXLA 5IAIA 1A7LA 4BDNA 3O29A 5DVJA 2I6EA 3A09A 3U94A 4DXUA 1AOVA 3GZGA 2V3TA 2RC7A 3P7IA 3IORA 1LAHE 5K2YA 3C4MA 2Z22A 4LP2B 1MDP1 3KFMA 1M5DA 3KEIA 3VLVA 1IITA 1SYIA 2UVGA 4MBPA 1B3GA 3MP6A 4K3FA 4GOTA 4O3BA 4RJZA 5FTIA 2RCAA 5EHSA 1QUIA 2UYEA 4MLVA 4UACA 4O3AA 3K1PA 4M1VA 3FD3A 4NF6A 1SI1A 2OJTA 4HW8A 2ONRA 3C35A 5DYHA 1I6QA 2Y7PA 4R2FA 3IOWA 5EYFA 1TWYA 1FQBA 5TP9A 5KCJB 3KBRA 3HN0A 2ZNTA 5H8QA 1CE2A 1GTKA 4ONYA 1O64A 3OO9A 4PFYA 3OXNA 4OTEA 3PPRA 4YKPA 4LVQA 2WKYA 2AYSA 3MQ9A 3N6UA 1Q35A 5JK4A 3TTKA 1B1XA 4ELQA 3PUZE 4JSDA 2O6AA 1MY2A 5CBRA 4U21A 3TDJA 4QSDA 4OMBA 1SW2A 4EF2A 1EZ9A 4OZ9A 2ZNUA 3DP8A 1F9BA 3TUSA 3IJOB 3FZVA 3KSXA 1B32A 1YTVA 1SVXB 3HHGA 1B5HA 2I3VA 4BDQA 3K6XA 2H5YA 1NNTA 2F34A 1XS5A 3KN7A 4MFIA 2ANJA 4XKPA 5ELVA 2VGQA 1URDA 2FA7A 1ZKBA 5EHMA 4RY1A 1LCTA 4QFPA 3SEUA 4F3SA 1VR5A 5L9SA 3KN8A 3K1NA 2G93A 2QRYA 4M4GA 2QS4A 2ZXTA 1VE4A 4AB5A 1II5A 3SEWA 3Q29A 3OENA 2V25A 5F7VA 3QUFA 1B51A 1MQGA 4QSCA 4IY5A 1Y20A 1B46A 1A55A 1UTBA 4NF8B 1SW4A 4F2QA 3RT8A 1LFHA 3IB0A 3UA8A 3D4CA 2VHAA 4F3GA 1XT8A 4LA9A 3T9XB 5I58A 3ZSFA 4NMYA 1UTHA 4U23A 1EZOA 1Q1KA 1FQFA 4TQUQ 4DXBA 2Q2AA 5CBSA 2RCBA 4DE8A 2QJEA 3K6VA 3FVGA 2AL4A 3DP4A 3RTWB 3MP1A 2QS2A 4H5GA 1QULA 2I58A 4F39A 4QFOA 3M3KA 3PGFA 4MH5A 4JWYA 5K2XA 3UORA 2XXUA 1P1OA 3T9HB 4POWA 1S7YA 1JQFA 2KLFA 2Q8JA 2Z8DA 4FEBA 3BKIB 2XX7A 5M2VA 3S9LC 1FTKA 4JSOA 3TTMA 3QIMA 1IIWA 1MXXA 2F6GA 4FAJA 1A8EA 1A8FA 1DPEA 4YAHX 3IL1B 3HV1A 3RY3A 3D4GA 3PMVA 4BLAA 2XXWA 1LFGA 5JEIA 3U1OA 1ELJA 2AIXA 1LFIA 3C31A 4IO3A 3TMGA 2RINA 4PFUA 2DWIA 3C9HA 1MDQA 4XKQA 3LBSA 4DDDA 1OIBA 3LSLA 2B3BA 3CG1A 3OOAA 3H6WA 1XC1A 4I1DA 1BTJA 4EXKA 3O6IA 1HSLA 1UIUA 5LOMA 1MXZA 1ZJLA 3H4ZA 3MVXA 5ICTA 2DXYA 5ISUA 1UTHB 3W15C 3OSQA 3VVEA 1LBCA 4F29A 2W7YA 4NF5B 4BDLA 3N5LA 1H3DA 3E4RA 3JYRA 3O9PA 1FQEA 1JVYA 1NNPA 3PPQA 4ZDMA 3TYHA 4IO4A 2DQVA 3BFTA 1OLCA 1B2HA 1B7ZA 4KYSA 2DOJA 1POY1 5I2KA 3MPKA 1XHYA 3ZKLA 2Z23A 1MPBA 3K00A 1XVYA 3R7XA 2F6PA 4OHNA 2DE4A 2GHBA 1H76A 5HBCA 1MH4A 1N3WA 4KCCA 3T96B 3S2VA 3VVFA 4C0RA 4XTCQ 3OEKA 4JBZA 3KG2A 1KWHA 3G7WA 4E0WA 3K6WA 1YPNA 1D4NA 1AMFA 4YU0A 1J1NA 4KYEA 2YPNA 2ZMBA 3H7MA 3K2DA 1N3XA 3MP8A 1B0LA 4R6YA 2PYYA 4KD5A 3TQLA 3LR1A 2OK2A 3CI8A 4F1UA 1B0HA 3IOTA 1PBQA 4X1DA 5AA1A 1S50A 4LUBA 3PUWE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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