2I3WA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of s729c mutant
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDCKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA02
3JZJA 1QUJA 3QUFA 2DWHA 3T9HB 4N07A 3USDA 2E1SA 2OBGA 3VLVA 4IB2A 1QW0A 4GRKA 2O84X 3V8XB 4XKNA 5JK4A 3EQ1A 4YMBA 1GTKA 2AL4A 1UTHB 4YKJA 2NUVA 1IXCA 1QKAA 2ZNTA 5I56A 3OXNA 4OEVA 4ZE9A 2UVJA 2R6GE 1LBBA 4X1BA 4LQ2A 3EHTA 3OEKA 4IO4A 4OMBA 3SEYA 1Y3PA 3H06B 1PBQA 3KSXA 3SEWA 3PUYE 5I58B 2D3IA 2H25A 2X26A 3BBRA 4IO7A 3KBRA 1CB6A 4LA9A 5KDTA 4PFYA 3OOAA 3QIMA 4XTCQ 4C0RA 1M5BA 3B7DA 1B1HA 2DWAA 2FNCA 1A99A 3FIRA 1NNKA 4FATA 4ZEFA 3RUMA 3SKPA 4RJZA 4BDMA 1S9TA 3U94A 4JWYA 3EHUA 2F6PA 3TDJA 2DE2A 3TTRA 4F29A 3V5AA 4KCDA 4EXLA 3DP4A 2DSFA 1A8EA 1Q35A 1XS5A 4R6HA 3OSRA 1Z7ME 4G8MA 1B7HA 1SQYA 4AB6A 3PMXA 3PPQA 4KD5A 3PD9A 4ZEKA 5ICQA 3HPIA 2Y7WA 3P7IA 2HEUA 2RC7A 4Q30B 3Q27A 1D3KA 3E9XA 4QHQA 2GH9A 1MH4A 2F7BA 4H67A 3IR1A 4NF8A 4IO5A 1DTZA 4FIMA 4F1YA 5AA4A 4DXUA 5KCJA 1Q1KA 1JVXA 4X9TA 2FA7A 1WVJA 1XHYA 4FEBA 2RCBA 3G3KA 3MAMA 2NXOA 3ILTB 1MPDA 4EQ9A 2Q9TA 1IITA 4PE5B 1B40A 1OIBA 4OETA 3QSLA 1IXGA 4NWCA 4E0WA 3K6WA 3CG1A 3ZS6A 4F3SA 4FEDA 4GXAA 3GXAA 4EUOA 2PYYA 1MQJA 3PV0E 2Z8EA 4R74A 1USYH 2UYEA 4OWDA 3IJXB 1Y4CA 2FYIA 3DLNA 2H99A 3FGSA 5CBSA 3L6GA 3MQ9A 4NWDA 5CM6A 5CI5A 1NH8A 1QULA 1SW2A 3KGCA 3ONMA 2OZZA 3EPEA 3VVDA 4RK2A 3KEIA 1MDP1 4KYEA 3MP6A 4WEDA 4R9GA 3ZSFA 4ZEDA 2PMSA 3G3HA 1IUDA 4QFNA 1FQCA 4NF6B 4DDDA 2F78A 1FTOA 2HAVA 1T0KA 3TUSA 3PU5A 4BLAA 4G8HA 4GD5A 3SESA 1MXWA 1RKMA 3K6XA 5JEIA 4IGRA 1PBPA 1SW5A 4POXA 5DVIA 4BDRA 4DXCA 2F36A 4G68B 5AA3A 3DP6A 1BTJA 3OO8A 2HFBA 1P1NA 1DTGA 3ECRA 1SDXA 2A5TB 4ZS9A 2QL3A 4WXJA 2VD3A 2HQ0A 3BKIB 2D5WA 3CRBA 3A3CA 3Q29A 4OYVA 3KN8A 5K2YA 2YJPA 1WODA 3DP8A 2UVIA 1AIVA 4RYAA 3MVYA 4R2FA 1LB8A 1GGGA 1YTVA 2R71A 3Q28A 4H1XA 5EYFA 4BDNA 5I2NA 3K0VA 3K01A 1PB9A 4U4SA 3IOVA 2ZYKA 4JWXA 2VGQA 3MWBA 4G8NA 4JXIA 3U93A 4QRZA 3IK6B 1DSNA 1ANFA 2UVHA 1FQDA 3PPOA 3MZBA 2O6AA 4PFTA 4GLIA 1MQIA 1OQGA 3S9MC 2Y84A 3IOUA 3CVGA 3LSLA 3SEVA 3T9XB 3HN0A 2OK2A 5I56B 5I84A 3MVWA 3KOSA 4RPNA 4LONB 2VD2A 1B3HA 5FHNA 2P2AA 2XXRA 4JSDA 1Y9UA 3Q25A 3D4GA 4I9DA 3SEXA 3TTLA 4FAJA 3K6UA 2AYSA 5KDTB 3K1MA 4KQPA 4U22A 1IZ1A 3H3GA 3CSBA 3E4RA 1A7LA 1MRPA 3UN6A 1ELJA 2XXXA 5L8DA 3TQLA 1HSJA 2XXPA 1MPBA 4UACA 3PUVE 1BP5A 5CRYA 3HCQA 3DELB 5H8FA 2QMWA 3M3FA 2X7PA 2Q8JA 2O1LA 2E0SA 4OFJA 2OCUA 4TOZA 3FJMA 1DMBA 3SERA 3G3JA 4GF8A 1MQGA 2XXIA 4X1DA 2QMXA 2XHDA 1BKAA 3IB2A 3JYRA 4POWA 3H7MA 3FVGA 3IB0A 4YKKA 4XXUA 3HHGA 2ANJA 2P1SA 3G3FA 2NVUB 3H6VA 1NNTA 5JTYA 3PMVA 3K1PA 3MZ9A 4QSCA 4ELOA 4P0IA 4NF8B 2KLFA 3L6HA 4WEPA 3H6TA 5AA4B 4ZZEA 5KCJB 5FHOA 1II5A 2NWJA 1TT1A 3LSWA 1QUIA 3CIJA 2PX1A 1ZBMA 5BUUA 1A55A 1OMPA 3SDFA 1EZPA 1POTA 4OQOA 3TEPA 4NTLA 1AMFA 3T9UA 3W9VA 1B3GA 4LVQA 3UK4A 1B6HA 1QJMA 2UVGA 3OEMA 5H8HA 4DE8A 4H5FA 3HHFA 2F35A 2HAUA 4ESXA 3VXBA 2O7UA 1MQDA 2REJA 1LFHA 1B3EA 1S50A 4NMYA 1FTLA 1TFAA 4F2QA 1IXIA 4THIA 4F18A 2HZLA 3C31A 4GWOA 5J1DA 1AOVA 4PETA 2QS1A 1M5FA 4DCYA 4ZEBA 4ZEIA 1SI0A 3CR9A 3Q26A 1B4ZA 4OVJA 1O7TA 3K02A 1LLSA 4K3FA 2F34A 3U92A 3CSGA 2VOZA 1LBCA 2F7AA 2O7IA 3QYTA 4F22A 3EN3A 4R73A 4Q5TA 4LZ7A 1JW1A 3PD8A 3FXRA 1M5CA 3G3GA 4LQ5A 2ZNUA 3V89B 2NOOA 4RPOA 2XXQA 2CMOA 1IQ7A 3CFXA 4ZDMA 3B6TA 1EH3A 2QS3A 2XX8A 1FW0A 1UIVA 2XXUA 5TU0A 5H8NA 3MJNA 3O28A 3TELA 3VVFA 4RY1A 1R9LA 1LGBC 2GRVA 4OHNA 4LATA 4I62A 4KYSA 4XKQA 4ZE8A 4MLQA 3HSTA 3OSQA 3EF7A 4YKIA 2XXHA 3FV2A 5DTBA 4EF1A 3VLUA 5L9MA 5I2NB 1PB7A 1MG1A 1DOTA 3C32A 4IO2A 1XVXA 1Z7NE 1WDNA 3ZKKA 1OLAA 4TLLB 1N7XA 1URSA 3TYHA 4KI0E 1B9JA 3VFJA 2RC9A 1XVYA 5F7VA 4KFQA 3IO6A 3PMWA 1B7UA 2DOJA 3S9EA 1EU8A 5EHSA 1SW4A 1RYXA 1MY3A 3LSFB 2DXYA 2AIXA 1FQFA 4PFUA 3C9HA 5AA1A 3AXFA 2DQVA 1RYOA 3T96B 5CMBA 5K2XA 5AA2A 3H4ZA 2UYFA 3LR1A 5H8QA 3FJ7A 4EXKA 2OWTA 1FTJA 3TCFA 3VVEA 3C36A 3OO6A 2QJEA 1H43A 4RNSA 1NL5A 3IOWA 1D9YA 2XXTA 1B5IA 1EZOA 4F2OA 4IO6A 4AQ4A 4JB7A 4PFWA 1LAGE 4ELRA 4FJPA 1LFGA 1OLCA 1MM7A 2ZYNA 4GVOA 2ZXTA 2B3FA 4OXVA 2QSXA 3PUZE 3O2AA 3RGYA 5B70A 5H8FB 3A09A 4F3PA 3FVKA 1JNFA 1UIUA 2B65A 4BDLA 3SEUA 5L9SA 1BLFA 4H0WA 3TKDA 4O3BA 1DPEA 2HZKA 5CBRA 1MXUA 4ZZAA 1NNPA 3FASA 1GR2A 3VV5A 3QUJA 4EQBA 3IJOB 4YB7A 1MXVA 1NH7A 1POY1 3ILUB 2RC8A 2R9JA 3IOTA 1TXFA 2I4BA 5ITOA 1ZKBA 4AB5A 5I59A 1ZMGA 5JTYB 2M8CA 1LSTA 3TFLA 1B5HA 1SI1A 2ESNA 1M5DA 3MP1A 1JVYA 2QPQA 4DIGA 3RTFB 5BWJA 2QRYA 4QSEA 3U8QA 4H6DA 3W15C 1B7ZA 1O63A 1QKBA 4GFRA 1B4HA 2F6GA 2Y7RA 1PEBA 3N26A 2I0BA 4ZECA 3LUYA 2VP1A 1LAHE 1R1NA 2AL5A 1L5TA 3TAJA 3H03A 5H8HB 3IAZA 4U1ZA 3W9WA 2XD3A 3RT8A 1XT8A 3N5LA 5AA2D 3O6IA 4FE8A 2ONSA 2F97A 1QUKA 5TP9A 3N6UA 2DP8A 1R9QA 4NF4A 1B32A 3GBBA 2G29A 4O3CA 1UTBA 4G68C 1ZLQA 1QVSA 3C4MA 4M4GA 3TTNA 1B58A 5DEXA 1US5A 1YAEA 4F3GA 4MF3A 1SYIA 3PGFA 1HSEA 2I6EA 1Y1MA 4R2BA 2PT1A 3KJTA 3PUXE 1MDQA 3O66A 2OLBA 2PBWA 3KN7A 3H6UA 1SYHA 3M3KA 3RQTA 1B0LA 4OENA 2HCAA 2I49A 3RN8A 1LCFA 3ZKLA 3FD3A 3CI8A 5TPAA 4HTGA 1N76A 2DWIA 1SBPA 1OVBA 3K6VA 1MY1A 4MFIA 1BIYA 1PC3A 1IXHA 1AH5A 1TWYA 3RT6B 4ELQA 2DXRA 3LC8A 4H65A 2V84A 4G77A 3KSJA 5CMKA 2DVCA 3T93B 1UQWA 4G4PA 2I3VA 1S7YA 3MVZA 1FTMA 4GL0A 3CFZA 3R7XA 4FECA 5H8NB 1M5EA 4F31B 3C33A 3R6UA 1OQHA 1KWHA 1N3XA 2Z8FA 1PB8A 1URDA 2P0SA 3VLWA 1B05A 4QFPA 4TQUQ 2XX9A 4KYDA 2XD2A 2DS9A 4QFOA 3U72A 3CFLA 3O97A 1VFDA 1USYE 3G3IA 2YPNA 4IGTA 2ONRA 3UGWA 3UA8A 4EF2A 2O69A 1URGA 2V3QA 5A5XA 1ZTYA 4EDPA 5DT6A 4C1UA 3MPKA 1US4A 3IB1A 4XKPA 1LFIA 3QK6A 5CMCA 1O64A 4R72A 4HW8A 2Q88A 1N7WA 3O6HA 5AA2B 5H8QB 3H6WA 3KZGA 3MBPA 5HBCA 1MY4A 1VSOA 4OERA 2UXAA 3TCHA 1GV8A 1NKXA 3FJGA 1P1UA 2Z22A 4F39A 2O51A 4U21A 3FATA 4LZ8A 4Q8RA 3IX1A 3TTKA 3CG3A 4ISUA 4IY6A 5CMMA 5I57A 3MC2A 4R6YA 5L9OA 5CC2A 3E3KA 2B3BA 5I2KA 3I3VA 2Z23A 3THIA 1TFDA 2RCAA 1B2HA 3T22A 2LAOA 4YMAA 1ZJLA 4ND9A 3S4UA 4NF5A 1FTKA 4YZZA 3U1OA 1B3LA 3HO7A 1AL3A 4MBPA 3WAFA 4N13A 5IAIA 1MY2A 5IKBA 5ISUA 1N3WA 4LP2B 3GZGA 4O3AA 4KR5A 1MXXA 1R6ZA 1YCJA 3O29A 4PQJA 3ODBA 4BDOA 4DLDA 2H4IA 1MPCA 2RKMA 1PDAA 1Y3QA 4BDQA 1XC1A 2ZMBA 3TMGA 5I59B 4Z0IA 1P99A 4N6PA 5F1QA 4U2RA 3TPAA 2CZLA 1P1OA 2XXWA 4TLMB 5H8SA 3RPWA 3TTMA 1B3FA 4I1DA 4F3BA 2A5SA 3FVOA 4MLVA 3UP9A 1VR5A 3K4UA 4F1UA 3MZ1A 1FQEA 3KFMA 2O68A 3FXQA 4M1VA 3B6WA 4R6KA 1LCTA 1NNFA 1H45A 3FVNA 4OZ9A 3PPPA 1JQFA 2IEEA 4E0XA 2D21A 1A40A 4OFOA 5FHMA 2HXWA 1N84A 2DVZA 1B46A 2REGA 2XX7A 4C1TA 3A3UA 4GXSB 2QS4A 5TP9B 1Y3NA 1JEVA 3K1NA 1LB9A 4X48A 4H8JA 3K2DA 4NF4B 2Y7KA 2W7YA 3E13X 1J1NA 1UTBB 1D4NA 4GQOA 4U1OA 3FZVA 4LZ5A 5DEXB 5FTIA 1EZ9A 3KOTA 3T9VA 3JV9A 5B7DA 2H98A 3RLFE 4QSDA 1SW1A 1I6AA 4R75A 1D9VA 4OESA 2H5YA 3RTWB 3OENA 3UIFA 1UTHA 3OO7A 1B1XA 3GLBA 4KHZE 1B5JA 3S2VA 3PUWE 5EHMA 3PPNA 4KPTA 3TODA 4G2ZA 1MY0A 4JSOA 1B52A 4ONYA 1JETA 5TPAB 5DYHA 2Q2AA 3R26A 2YLNA 2V25A 2VHAA 4NE4A 5I58A 2XXVA 3TCGA 1HSLA 2V3UA 3C35A 3OD7A 3N94A 3RNNA 1Y4TA 3MW0A 1GVCA 5LOMA 2OJTA 3MPLA 1FCKA 2ONKE 4Z7EA 4ELPA 2Y7PA 4NEDA 1ZU0A 4IO3A 3MP8A 4P0GA 1MM6A 4GIZA 4JWOA 3V83A 4HCWA 5ICTA 3LBSA 3BFTA 1Y20A 3D4CA 4YICA 3M3LA 1JW4A 2GFEA 3DM0A 3K00A 1LAXA 5HM4B 4QF9A 1VE4A 2I3WA 1FQAA 1I6QA 3OELA 3KN3A 1H76A 4QFKA 3TQWA 2DE3A 1CE2A 2WKYA 4YKPA 3QXMA 3M8UA 4LUBA 3T66A 1IIWA 2PVUA 5A5XB 5HPQA 2F7CA 4PP0A 2I48A 4H8IA 3IORA 1MS7A 1ATGA 3GBAA 3F11A 2GHBA 3N6TA 2F5XA 1B51A 1NFTA 1IEJA 3HV1A 1DPPA 3O6GA 4YB6A 2OWSA 3MUQA 4DXBA 3FXUA 2I0CA 4KCCA 4L17A 1N04A 5ELVA 1SD3A 5DVFA 4I8CA 1MH3A 2Y7IA 2ZNSA 4YAHX 3C34A 1A8FA 5DVJA 5ITPA 3WAEA 1MXZA 4F1VA 4ECFA 2ZYMA 3O9PA 4RA1A 4IY5A 3SETA 5M2VA 4U4XA 2H9BA 2RF1A 5I57B 1OVTA 4OFLA 5I2KB 4FORA 4RXLA 2XXYA 2DWJA 1MQHA 2IA4A 2F8DA 1P1QA 3FV1A 1I6BA 4JBZA 2THIA 1SVXB 3IL1B 1I69A 3UORA 4ESWA 4NF5B 2DYXA 3S9LC 3MVXA 2QS2A 4F19A 4DCXA 4HS7A 1ZIUA 2G93A 4NF6A 3B6QA 1MXYA 2I4CA 1FQBA 3LSXA 2Q89A 3RY3A 3KJ7A 1F9BA 3OO9A 3OMBA 4P11A 3EHSA 4JDFA 4G68A 2PT2A 5AE4A 2DE4A 3G7WA 2Q2CA 1P1WA 3VDFA 1VFEA 2A5TA 4YB5A 4GL8A 4RK9A 4Q0CA 2RINA 1NMUA 4H5GA 1A54A 3IO4A 3I5OA 4XKRA 2Z8DA 1Y1ZA 4GOTA 3FUZA 4U23A 4UA8A 1B0HA 1LAFE 4DZ1A 3S9NC 2BJJX 3BFUA 2ALUA 3KG2A 1JEUA 1JW5A 3QAXA 3VE1B 4MH5A 2ZYOA 2I58A 2GHAA 2X7QA 4HCYA 4OTEA 3VXCA 4QFLA 4WKMA 5KZTA 4R9FA 3PPRA 5FTHA 3TZAA 1H3DA 2V93A 1XOCA 3I6VA 4EQ7A 2V3TA 1N0TA 1H44A 4XIGQ 2O1MA 1YPNA 4OEUA 4YU0A 2ABHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MMPA 3JZJA 1QUJA 3QUFA 2DWHA 3T9HB 4N07A 3USDA 2E1SA 2OBGA 1K9ZA 3VLVA 4IB2A 1QW0A 4GRKA 1LBWA 2O84X 3V8XB 3T1BA 4XKNA 5JK4A 3EQ1A 4YMBA 1GTKA 2AL4A 1UTHB 4YKJA 4DI3D 2NUVA 1IXCA 4OVQA 4HE2A 2OX3A 1QKAA 2ZNTA 2CEXA 5I56A 3OXNA 4OEVA 4ZE9A 2UVJA 2R6GE 1LBBA 4X1BA 4LQ2A 3EHTA 3OEKA 4IO4A 4OMBA 1Y3PA 3H06B 3SEYA 1PBQA 2VT5A 3KSXA 4PTKA 3PUYE 3SEWA 5I58B 2D3IA 2H25A 2X26A 3BBRA 4IO7A 3KBRA 1CB6A 4LA9A 5KDTA 4PFYA 1FJ6A 3OOAA 3QIMA 4XTCQ 4C0RA 1M5BA 1FBHA 3B7DA 1DBZA 4HXVA 1B1HA 2DWAA 2FNCA 1A99A 3FIRA 1NNKA 4FATA 4ZEFA 3RUMA 1NV4A 3ISPA 3SKPA 4RJZA 4BDMA 1S9TA 3U94A 4JWYA 3EHUA 2F6PA 4QXDA 3TDJA 2DE2A 3TTRA 2GQ1A 4F29A 3V5AA 4PF8A 1FBGA 4KCDA 4EXLA 3DP4A 2DSFA 1A8EA 1Q35A 1XS5A 4R6HA 3OSRA 1Z7ME 4G8MA 4N81A 1B7HA 4PGNA 1SQYA 4AB6A 3PMXA 3PPQA 4KD5A 3PD9A 4ZEKA 5ICQA 3HPIA 2Y7WA 3P7IA 2HEUA 2RC7A 4Q30B 3Q27A 1D3KA 3E9XA 4QHQA 2WYPA 2GH9A 1MH4A 1NV2A 2F7BA 4H67A 3IR1A 4NF8A 4IO5A 1DTZA 4FIMA 5ET6A 1LBVA 2XA5A 4F1YA 4GWYA 5AA4A 4DXUA 2ZZVA 5KCJA 4GBVA 3IFAA 1Q1KA 1JVXA 4JVIA 4X9TA 2FA7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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