2I3WA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of s729c mutant
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDCKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA02
1XT8A 2O1MA 4NF6A 4DXUA 2D5WA 1B1XA 3V8XB 2ESNA 1BKAA 1IUDA 2UVIA 4N13A 1MPCA 4KPTA 3QAXA 5AA2D 2OK2A 3H4ZA 2X7QA 2G93A 4ECFA 3K0VA 4ZEKA 1MY3A 3KOTA 3FJMA 5HPQA 5FHMA 1AIVA 3THIA 4RNSA 4QF9A 3O6IA 3TDJA 3PPNA 4GIZA 2QSXA 1FQDA 5H8NA 3E13X 5I59A 5H8HA 3G3FA 1I6AA 4DCYA 3K2DA 1MQJA 4FORA 1SW1A 2THIA 3OO9A 4HTGA 3FV1A 3PUYE 3B6TA 4OEVA 3MZ1A 4C1TA 2R9JA 3Q28A 3OEMA 3HHFA 4KR5A 4RPNA 2D21A 2PT1A 2Z23A 2V93A 3TEPA 3RT6B 4QHQA 3ZSFA 3MUQA 4X1BA 3PD9A 1QUKA 4G68A 4U1OA 4N6PA 2YLNA 1O64A 4AB6A 1LSTA 1DMBA 1POY1 1DOTA 3O29A 5DTBA 2E0SA 4R6KA 3AXFA 3DELB 2M8CA 2O84X 1D3KA 1B0LA 3DLNA 2CZLA 1HSLA 4NF5A 4GQOA 2DVZA 3SKPA 2ZNTA 5AA4B 3VE1B 3A3UA 1TT1A 2DWIA 3E4RA 4PFWA 1IIWA 4GVOA 3EHSA 1ZBMA 2I0CA 2Y7WA 4H8IA 1ZMGA 3CR9A 4YKKA 3RN8A 3O9PA 2ZYNA 1Y3PA 4RJZA 4QFKA 3MJNA 3FVOA 2ONKE 2UVJA 1JEUA 3C36A 3SEYA 1OMPA 4LP2B 4MFIA 1EU8A 1B32A 1FW0A 2Z22A 4BDMA 1SQYA 1OVBA 1FTOA 4QSDA 3KN7A 2PYYA 4NF4B 3CFLA 3CFZA 4O3AA 1Y4CA 1B5JA 1OLAA 1PBPA 1Z7NE 5TU0A 4EQ9A 3T96B 1OQGA 5K2XA 4MF3A 3VFJA 1N84A 2HEUA 5CRYA 1OLCA 2WKYA 1MY1A 4G77A 1MPBA 4YMBA 1BP5A 5LOMA 5B7DA 5AA1A 4OEUA 1P1WA 1XOCA 4LA9A 3TCHA 1QJMA 3FXQA 1ATGA 4G8HA 2Y84A 4GXAA 4YICA 3FXRA 4MH5A 2XD3A 1DTGA 1POTA 3H7MA 1S9TA 3SEUA 2A5TA 1Y3NA 4NWCA 4KD5A 2Z8FA 1LAFE 3SEWA 4DIGA 3RQTA 3KBRA 4F39A 3LBSA 1XVXA 3GLBA 4JWOA 4RA1A 3PPPA 4ZE8A 1S7YA 4IO3A 2HAUA 5I2NB 4IO7A 4YKJA 1YPNA 4PQJA 4NF8A 1FQAA 4ELOA 4C1UA 2RINA 1N7WA 1PB9A 2ZNUA 3S9LC 4KCCA 1MXXA 3IO4A 4XKQA 3MP6A 3K6WA 3T66A 5IKBA 1B9JA 3H6VA 5KZTA 3FVNA 2RC7A 2PX1A 3OXNA 1B7UA 3RTFB 2IEEA 3LSLA 5ITPA 2VGQA 4IO2A 3B6QA 3LSFB 1MPDA 4FATA 1RKMA 1Y3QA 3G3IA 5KDTB 3IB1A 5ICTA 1NL5A 3P7IA 1USYH 2D3IA 4LATA 3O6GA 1A8FA 1N3WA 3MVXA 1D9YA 3U93A 4R75A 1LB9A 3LC8A 3K01A 4EDPA 3L6HA 3HPIA 3R7XA 1ELJA 5I58A 1B51A 4KYEA 4Z0IA 4DXCA 2R6GE 2GHAA 1NNKA 1R1NA 3PMWA 4G8MA 5I56B 3W15C 4OMBA 3FVKA 2G29A 4YAHX 1Q1KA 3UGWA 2XXYA 2ZYOA 1P1QA 2XD2A 5CI5A 1D4NA 3H06B 1NFTA 4H1XA 2GHBA 3TYHA 2XXIA 1US5A 4I8CA 5JEIA 4JB7A 1B7HA 1JVYA 2H9BA 4Q30B 2O68A 1MQGA 1HSEA 1QW0A 5I57B 4LZ8A 5I2KB 1NKXA 4G2ZA 2NOOA 4LQ5A 1M5EA 3WAEA 4NEDA 1SYHA 1SDXA 4R2BA 3FIRA 4OWDA 1SYIA 4UA8A 1YCJA 3RUMA 2F7BA 4DXBA 4JWXA 4P11A 2XXWA 2UVGA 4POWA 1KWHA 3IOVA 4ONYA 3TPAA 2HZLA 1N04A 5TP9B 1O7TA 3S4UA 3ONMA 1AH5A 3N6UA 2REJA 1LCFA 4U2RA 3DP8A 1MRPA 3N5LA 1QUJA 1S50A 1F9BA 1VSOA 1AMFA 4H5FA 1B3LA 2OLBA 3CI8A 4RXLA 1SI0A 4R6HA 3TUSA 3UN6A 5JTYA 3CSGA 4F1UA 2NVUB 1JETA 5FHOA 1UTBA 3U92A 2UYEA 3F11A 4U4SA 1QKBA 1MM6A 4F2OA 4YU0A 4OYVA 1IXHA 1NH7A 2I6EA 1EZ9A 2B3FA 1FTMA 3IK6B 4OQOA 3ZKLA 3H03A 2H98A 4FEDA 2UXAA 1FQFA 4XTCQ 2QS3A 2XX8A 3TKDA 1Y1MA 1PB7A 1SW5A 4G8NA 2DP8A 1B5HA 5CM6A 3UIFA 4BDQA 3V5AA 2Q8JA 3TTRA 3RPWA 3JZJA 3MBPA 4GLIA 4BDNA 3KN3A 4ZECA 2DSFA 2XXTA 4GD5A 1AL3A 3JV9A 1J1NA 2DVCA 2IA4A 1JEVA 3QK6A 1EH3A 4MBPA 5FTHA 2F35A 4JSDA 2Q88A 3QYTA 2ZYMA 5DVIA 2XXPA 1Y20A 3IJXB 4XXUA 1XC1A 4PP0A 4H6DA 4FEBA 5H8SA 3BFTA 3EN3A 5CMMA 3TODA 2F5XA 2F7CA 5ELVA 1B58A 2AIXA 1IEJA 2XXHA 1I6BA 3VV5A 1IXIA 3VVFA 4OXVA 5TPAA 1URSA 1IXCA 2HCAA 3MP8A 4BDOA 3TTKA 2QMWA 3KJTA 3MC2A 4GFRA 4E0XA 3KJ7A 3B6WA 3PMXA 5BUUA 1YTVA 3O6HA 3H6TA 2RF1A 5L9OA 3ECRA 3OSRA 3WAFA 4PE5B 1M5BA 3EPEA 3VLUA 1UIUA 5KCJB 4KHZE 3PUVE 2PMSA 3FD3A 5AA3A 1A99A 5CMBA 1R9QA 1A7LA 2OJTA 2NUVA 4L17A 1MXWA 4C0RA 3KFMA 1II5A 3TFLA 2OWSA 1O63A 2HQ0A 1MXYA 4ELPA 4M4GA 4KI0E 5H8FB 1EZPA 4WEDA 1ZLQA 4P0IA 3VLVA 4JDFA 1CE2A 3RGYA 3RTWB 4QFPA 2HZKA 3HO7A 3T9HB 4IY6A 5CMCA 2XX9A 3OELA 2AL5A 2QS4A 2YPNA 3OMBA 2E1SA 2O6AA 3CG3A 5FTIA 2DWAA 4DLDA 1DPPA 2V84A 3OOAA 1MXUA 1B4HA 3N94A 3IB2A 2VD3A 4RPOA 1MM7A 3ILUB 4OTEA 1RYOA 4R72A 1SI1A 1B2HA 4KCDA 3VVDA 2B65A 3ILTB 1MH3A 3FVGA 4UACA 4QFNA 1H45A 5H8QB 4FE8A 4XKPA 4O3BA 3C33A 2F7AA 3K1MA 3G3HA 3T93B 1NMUA 1ZKBA 3USDA 2Q89A 2ONRA 2ALUA 3Q27A 4LZ7A 4ZEBA 4Q5TA 4NF4A 5ITOA 4Q0CA 3A3CA 3MVZA 2GRVA 4OFJA 2Y7IA 4EF2A 2GH9A 3G3KA 4X1DA 1PC3A 2I4BA 4FJPA 1M5CA 1CB6A 2H4IA 3T9UA 2ONSA 1N76A 3OO8A 1Y1ZA 2I49A 2F34A 4EXLA 1FTKA 4IO5A 2O7IA 3SESA 3HCQA 1B40A 1LFIA 2KLFA 2XXRA 4OHNA 3IL1B 3V89B 4ELQA 4RY1A 4KQPA 4PETA 4G68C 4YKPA 3HSTA 5I2NA 3QIMA 4HCYA 2AYSA 5AA2B 1B7ZA 3BKIB 2NXOA 1GR2A 4HS7A 3DP4A 3IOUA 1FCKA 3CIJA 3EHTA 4F3SA 1LBBA 2NWJA 3KZGA 3VVEA 5L9SA 2F6GA 3O28A 4ZEDA 4YMAA 3U8QA 5KDTA 3K00A 1LB8A 4R9GA 3IOTA 3KOSA 1BTJA 3PU5A 3QUJA 2VHAA 4F19A 5AE4A 1IZ1A 1M5FA 1L5TA 4R74A 4BDRA 5DEXB 1TWYA 3S9MC 4GL8A 1WVJA 2V3UA 4GL0A 1I6QA 1H43A 3IB0A 3S9NC 5CBSA 1UTHB 5I56A 2H99A 4IO6A 2Z8DA 5J1DA 1LFHA 1ZIUA 2W7YA 3SEVA 1ZTYA 3GBBA 3M8UA 1MH4A 1DSNA 2I48A 3QSLA 4HW8A 1OVTA 2PVUA 1MDP1 3A09A 3OEKA 3TQLA 3PPOA 4FECA 2QS2A 4G4PA 3K1PA 4YB5A 5I57A 4IO4A 5I2KA 3BBRA 1LBCA 2R71A 4R9FA 2RC9A 3W9WA 4TLMB 2Q2AA 5EYFA 5A5XB 2I3VA 4AB5A 5ICQA 4U21A 3G7WA 1B6HA 2X7PA 1XS5A 4NWDA 2O1LA 1PBQA 3PUZE 2RKMA 4LQ2A 3K1NA 4N07A 2X26A 4NMYA 3HHGA 3C34A 5TP9A 2OCUA 3PD8A 3S2VA 3PPQA 1OQHA 1ZU0A 4MLQA 4F3BA 4YB7A 4KYSA 1UIVA 4R2FA 3PUWE 3E9XA 3H6UA 1P1NA 3OSQA 2QRYA 1JW4A 2Z8EA 4ND9A 3Q29A 1A55A 1MQHA 1VR5A 3CG1A 4TLLB 1QKAA 3L6GA 4YZZA 1TFAA 3K6UA 4K3FA 4H5GA 1B3FA 2RCBA 2QS1A 1H3DA 1IQ7A 4E0WA 2VP1A 2DE2A 1P99A 2DQVA 1Y9UA 1B3GA 1FQCA 4YB6A 3TCFA 4ESXA 3IR1A 4H65A 5FHNA 4OZ9A 4F3PA 4AQ4A 3QUFA 2HXWA 4NF6B 4DCXA 1N0TA 3CRBA 2I58A 2RC8A 3TAJA 5DYHA 4FIMA 4OETA 5BWJA 1B05A 1OIBA 3LSXA 5M2VA 1MQDA 2XX7A 4LONB 4EQ7A 1XVYA 3M3KA 2DOJA 1T0KA 2QJEA 2QL3A 4KFQA 3UK4A 4IGRA 2V3TA 2DWJA 1MXZA 1NNFA 1NH8A 3H6WA 4U4XA 4XIGQ 4ESWA 4F31B 1NNPA 2O51A 2YJPA 3R26A 3K6VA 4POXA 3Q26A 4YKIA 5H8NB 3RLFE 5CC2A 1USYE 4WEPA 5I59B 2DWHA 5H8HB 3LR1A 4JBZA 4TOZA 2ZNSA 1AOVA 3V83A 3FV2A 3G3JA 4TQUQ 3RY3A 2F97A 4PFYA 1MY2A 3U72A 4RK2A 3VXBA 1NNTA 4JSOA 1IXGA 1FQEA 4FAJA 3GZGA 2Q2CA 3JYRA 5F1QA 4OENA 2VOZA 3BFUA 1US4A 3KSXA 4ISUA 1LCTA 3SEXA 1Q35A 3FGSA 4EF1A 4X9TA 2QPQA 4G68B 3T9XB 2DYXA 4ZZEA 4H67A 4X48A 4U23A 3MW0A 4F2QA 5I84A 2DS9A 3MVWA 2FYIA 3UP9A 3LSWA 1B0HA 4I9DA 5KCJA 3GBAA 2DXRA 4NF5B 1R9LA 4R73A 2XHDA 5HM4B 1N3XA 3W9VA 3TQWA 1ZJLA 4KYDA 5JK4A 4XKRA 3CSBA 3O66A 5DVFA 4QSEA 4F18A 3OENA 3TZAA 4GRKA 1P1OA 1A40A 5L8DA 1PB8A 1DPEA 1MS7A 1M5DA 1FTJA 1I69A 4PFUA 3M3LA 4O3CA 1WDNA 3M3FA 5EHSA 2AL4A 3HV1A 3R6UA 3EHUA 1MY0A 2O7UA 4F1VA 2FNCA 1SW2A 1QULA 4GOTA 5AA4A 5H8FA 2QMXA 1XHYA 1JW5A 1SW4A 2FA7A 2PBWA 4NE4A 4DE8A 3TTNA 1FQBA 3FUZA 4ZS9A 1B52A 5L9MA 2H25A 1MQIA 2DE3A 2Y7RA 3I5OA 4DZ1A 3PUXE 2O69A 1LAXA 3O2AA 4ZE9A 3SERA 2DE4A 1P1UA 3IJOB 4R6YA 3MVYA 4F22A 2P2AA 1DTZA 3U1OA 1D9VA 4WXJA 1B4ZA 1H76A 3KEIA 3FJGA 4QFOA 1H44A 5DT6A 4ZZAA 5H8QA 3TCGA 2BJJX 2RCAA 3D4CA 2Y7PA 3H3GA 2OWTA 2A5TB 4F29A 1LAHE 1QUIA 3VLWA 4EQBA 3DM0A 1SD3A 3HN0A 3N6TA 1B46A 1VFEA 4QRZA 2ZYKA 5IAIA 5B70A 4F1YA 4NF8B 2V25A 4IY5A 3TTLA 1B1HA 1Y4TA 1BLFA 1GGGA 3K4UA 3RNNA 4M1VA 4RK9A 3VDFA 1LAGE 4BDLA 3PGFA 2I3WA 1VFDA 3FXUA 3MAMA 4HCWA 4GWOA 1JVXA 3D4GA 3T22A 1VE4A 3MZ9A 3GXAA 1GTKA 2DXYA 2GFEA 2XXXA 1PEBA 4Q8RA 3EQ1A 4LZ5A 4Z7EA 4DDDA 4EXKA 3ODBA 3E3KA 4EUOA 3KN8A 2VD2A 4XKNA 2F6PA 2REGA 4GF8A 4ZEFA 3TTMA 3IX1A 4U22A 3KSJA 5I58B 2OBGA 2B3BA 3EF7A 4GXSB 4QSCA 3PMVA 4LUBA 5AA2A 1JQFA 3MWBA 2Q9TA 3FJ7A 5F7VA 3IOWA 1JNFA 3VXCA 1EZOA 3SETA 1N7XA 1MY4A 3CFXA 3RT8A 3LUYA 3C9HA 2UVHA 1A54A 2V3QA 3TMGA 1LFGA 4RYAA 1LGBC 3PPRA 4THIA 4QFLA 1A8EA 4JXIA 3O97A 4JWYA 1GV8A 5DEXA 2P0SA 2A5SA 3Q25A 1YAEA 1FTLA 4I1DA 3N26A 1HSJA 5K2YA 2F78A 3MQ9A 5DVJA 1UTHA 2ANJA 2CMOA 3C31A 1URGA 2F36A 3OO7A 4ZEIA 1SBPA 3ZKKA 1MG1A 4I62A 5HBCA 3OD7A 4OFLA 3TELA 4NTLA 2I4CA 4LVQA 4H0WA 3KG2A 4F3GA 1B5IA 3FATA 3UORA 5ISUA 3G3GA 3OO6A 3K02A 1UQWA 1PDAA 3I6VA 2ABHA 3IORA 5JTYB 1LLSA 2UYFA 1MDQA 5EHMA 1RYXA 2H5YA 3MPLA 2I0BA 1UTBB 3C4MA 5A5XA 1QVSA 2HFBA 4IB2A 3I3VA 3IO6A 3KGCA 1ANFA 2Y7KA 3C35A 3QXMA 3FZVA 4U1ZA 1MXVA 3K6XA 1TFDA 3U94A 3PV0E 4P0GA 2OZZA 4ZDMA 2PT2A 4MLVA 4OESA 1R6ZA 4IGTA 3MPKA 1IITA 1URDA 4PFTA 4WKMA 2ZMBA 3CVGA 2XXUA 3MZBA 3IAZA 2P1SA 2XXVA 1B3HA 3B7DA 1JW1A 1WODA 4OFOA 4OERA 3UA8A 1TXFA 1BIYA 3T9VA 4BLAA 5CBRA 1B3EA 1Z7ME 3ZS6A 2F8DA 3C32A 5CMKA 3S9EA 4ELRA 2LAOA 3DP6A 3MP1A 4H8JA 3FASA 2ZXTA 4OVJA 2HAVA 1GVCA 3SDFA 2XXQA 5TPAB 1SVXB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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