2I3WA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of s729c mutant
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDCKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA02
4RJZA 5ITPA 3K1MA 4M1VA 1WVJA 3FIRA 5HBCA 4ZEDA 5AA3A 5FHMA 1MG1A 1NH7A 1XVYA 4R74A 5ICTA 1SW4A 3PUYE 1FW0A 1MXUA 1I6QA 1MXYA 3N5LA 1IXCA 4G77A 4GL0A 4R72A 1B4ZA 2QRYA 1SD3A 1Z7NE 1RYXA 4P0IA 4E0XA 3LSFB 2RINA 2I6EA 1MM7A 3RN8A 3MW0A 2HFBA 1A7LA 1B32A 1B4HA 2UYFA 3PPNA 5DVJA 4O3CA 3GZGA 1P1NA 4ZE8A 4YB7A 3FJGA 5H8QB 1IZ1A 3AXFA 3MZBA 4YKKA 4Z7EA 2I0CA 3ONMA 4IGRA 4IO4A 1MY2A 3UN6A 3VLUA 3HHGA 3MP1A 1GR2A 3I3VA 2UVGA 2Y7RA 3C33A 5I57B 1ANFA 1D9VA 1FTMA 1MQHA 1ZU0A 2OJTA 3O97A 4GF8A 4THIA 4F1YA 3T96B 5HM4B 1IITA 5AA4A 1EZPA 5FHOA 2A5SA 3ZKKA 4GXSB 2I49A 2PVUA 2YPNA 3FGSA 4OVJA 4ELOA 1LBCA 1JEVA 2F7BA 4ESWA 1D4NA 4H1XA 3KN8A 4DCXA 3TCHA 4NE4A 4P11A 3SESA 2ABHA 1B1HA 5DT6A 4U22A 4LUBA 5CRYA 4HTGA 4F3BA 5TU0A 2NUVA 3S9MC 5H8FB 4N6PA 4NF6A 3SKPA 1NFTA 1Y3PA 3C4MA 5DYHA 1A8FA 2GH9A 3PPRA 3PUXE 4C0RA 1B3HA 4FE8A 4XTCQ 3RPWA 5F1QA 3F11A 1P1WA 4PE5B 3MZ1A 3OENA 1YPNA 3FATA 4WEPA 5A5XB 4DIGA 2HAVA 3DP6A 4U2RA 4U4XA 4UA8A 3H6VA 3SEUA 3VFJA 3VVFA 1XT8A 1GGGA 1FQFA 3DM0A 1NH8A 4TLLB 1O64A 5I2KA 3EPEA 5EYFA 3MJNA 3KJTA 4NF4A 4ZS9A 1US5A 4MFIA 4G4PA 2RCBA 1IQ7A 3R7XA 1JQFA 3VDFA 4Q8RA 5KCJB 1S9TA 1PEBA 3H6TA 1A54A 2OLBA 2AIXA 2HEUA 1TFAA 4MF3A 4AQ4A 1N3WA 1JVYA 3TTNA 2H5YA 3CVGA 3TCFA 4GVOA 3CRBA 4F19A 1DMBA 3OMBA 4BDQA 1JW4A 3IB1A 4JDFA 4KCCA 4RK2A 4GRKA 3RLFE 2VOZA 4NF5A 3IB2A 4RYAA 5EHMA 3SEYA 4ZZEA 5AA1A 3ZS6A 2Z8FA 4KQPA 4RY1A 3U92A 4F3SA 2Z8DA 4G8NA 3QIMA 4K3FA 1QKAA 4G68B 1FTOA 4IY6A 1JW5A 3T9HB 2I3VA 1R9LA 2ZNUA 3K4UA 4X1DA 1PBPA 4FEBA 4LQ2A 3HV1A 1MS7A 4LVQA 5AA2B 3RTWB 1LCTA 1IIWA 1MY4A 4OETA 1LGBC 1B6HA 2IEEA 1P1QA 2X26A 3KSXA 1FQBA 3OO6A 3G7WA 3MVWA 3N6UA 1MDQA 3LUYA 1A99A 1NKXA 2D21A 3O2AA 3VLWA 1NNFA 2GHAA 1B0LA 1B3FA 4LONB 3PPOA 4F31B 5H8NB 4TOZA 2PX1A 1LSTA 1IXGA 2VGQA 3I5OA 4OEUA 4ZDMA 3GXAA 4F3PA 4IO2A 3M8UA 4IB2A 2DS9A 4R2FA 2GFEA 2ZYMA 3A3UA 3FD3A 2HQ0A 4F1UA 4HW8A 1QUJA 1LAXA 1B9JA 4H8JA 3T22A 2XD3A 3TCGA 5KDTB 3SDFA 2ONRA 4XKPA 2I4BA 2NWJA 3W15C 1LAHE 4QF9A 1EH3A 3GBAA 4YKPA 3IB0A 2UYEA 1Y4CA 4JB7A 3TTKA 2ANJA 5ELVA 3S9LC 3KOTA 5TPAB 2Z22A 1XC1A 3K6VA 5I56A 4DZ1A 1AL3A 2RC8A 3OEKA 5ITOA 2DE3A 4NF8A 4MH5A 5H8SA 2ZYKA 4R73A 4EQBA 2XXUA 3IL1B 3JYRA 4O3AA 2A5TB 2LAOA 2OWTA 3LSWA 4JWOA 4PFWA 3TQLA 4GLIA 3FJ7A 5CMKA 3KG2A 1US4A 1USYE 3O66A 4BDLA 1USYH 5J1DA 3K1PA 4NF5B 4LZ7A 1OLAA 4ZEKA 2E1SA 4IGTA 2RC7A 4DE8A 3FXRA 3OD7A 2P2AA 1LB8A 4ND9A 2F7AA 3FJMA 4M4GA 2B3FA 3C32A 3OXNA 4TQUQ 5CBSA 5FHNA 5L9MA 3S2VA 1VE4A 1MXZA 2XXWA 1B1XA 4GXAA 4OYVA 4R75A 5DEXB 5FTHA 3RY3A 4ZEBA 3KSJA 3IORA 5L9SA 4NWCA 1YAEA 2F34A 1SDXA 5L9OA 2Q8JA 4F18A 3P7IA 1SI1A 1NNKA 1R6ZA 1SI0A 1WDNA 3Q25A 4GL8A 3T9XB 2KLFA 4BDMA 5I57A 3HO7A 2DWHA 5CMCA 3Q26A 2XXPA 3ZSFA 2I0BA 4GFRA 1QVSA 2Y7IA 1H3DA 4JWYA 3H3GA 2PT1A 4OHNA 3IOTA 4YMBA 4F2OA 5CBRA 3G3KA 4MLQA 3DP4A 3D4GA 4KFQA 3O6HA 1MDP1 3H6UA 1NNPA 4RA1A 5BUUA 3MAMA 2H25A 3PUVE 4KR5A 2GHBA 1IXIA 3QUFA 4IY5A 5TPAA 2F7CA 3U1OA 3LSXA 4H8IA 4PFUA 1N7WA 4G2ZA 4DXBA 3U94A 2VD2A 1Y3NA 2M8CA 5CI5A 1Q35A 5BWJA 1ELJA 1TT1A 2XXHA 4TLMB 1ATGA 4AB6A 2X7QA 3T9VA 2XXVA 1H43A 3HCQA 3C35A 3TFLA 1TXFA 3V8XB 3MC2A 4QFKA 1MH4A 1SBPA 1OVTA 4AB5A 5I2NB 4OTEA 1O63A 1NMUA 2O69A 3DP8A 1HSEA 1IEJA 4EUOA 1LFGA 3MWBA 3OO7A 3VXBA 1BIYA 4OENA 3CR9A 1N3XA 3U8QA 4HS7A 1PBQA 3SEXA 5B7DA 1N0TA 3MPKA 2OBGA 4XKNA 2O7UA 2F6GA 3MVYA 4F3GA 1SYHA 2O1LA 3VVDA 4DLDA 2XHDA 3DELB 1GV8A 4ZECA 1MQDA 2ONKE 4JSOA 3IO6A 2QPQA 2REJA 4G68C 3EHUA 4XXUA 4LP2B 4IO6A 2FA7A 3QSLA 1CB6A 2G93A 2DVCA 3R26A 2XXTA 1QUKA 3QYTA 4ISUA 4KYSA 1DPPA 4NF4B 4XKQA 4F22A 3VV5A 2ZMBA 3TKDA 1ZTYA 4BDRA 2Y84A 2XXRA 3HSTA 5I84A 1FTKA 2ESNA 1H45A 5JTYA 2X7PA 3KGCA 3V83A 4NWDA 1EZOA 4LQ5A 3FXQA 2Y7KA 3EHTA 2XX7A 3MZ9A 3VLVA 3IO4A 3Q27A 2Y7PA 3B6QA 3BFUA 4OFOA 5F7VA 3TTLA 1EU8A 4OZ9A 1R9QA 1F9BA 3EQ1A 5I2KB 2R6GE 3QAXA 4I8CA 2Y7WA 2XX9A 3PMXA 2REGA 2Z8EA 4R6KA 3ILUB 3S4UA 2THIA 4Q30B 3SEWA 2Q2CA 3USDA 3WAFA 4ELRA 5IKBA 5TP9B 1LFHA 1S7YA 3N94A 1T0KA 2VHAA 2XXYA 1XHYA 1Y20A 1ZKBA 1UTHB 3PGFA 4YB5A 3IX1A 3B6WA 1YCJA 2DQVA 1B40A 2BJJX 2HZLA 4IO3A 1B3LA 1N76A 4MBPA 3SEVA 1O7TA 3N6TA 4KHZE 3FVGA 1DPEA 3FZVA 4YZZA 3UP9A 3VVEA 4FAJA 1RYOA 4FECA 1M5CA 4YB6A 3TTRA 3VE1B 4ZEFA 1MQIA 1N7XA 1MPDA 2GRVA 5H8QA 2D3IA 1MM6A 2RCAA 4Z0IA 5K2YA 4N13A 1AOVA 4XKRA 1B5IA 1H44A 1P1UA 2P0SA 2ZNTA 4BDNA 4I62A 3M3FA 5I59B 5KDTA 3IOVA 3KBRA 4QSDA 1SVXB 2OZZA 3HN0A 1SW1A 5IAIA 1GTKA 3BBRA 3O29A 4ZZAA 5AA2D 1FTLA 3O9PA 5H8HA 4FJPA 4GWOA 3TZAA 3WAEA 1MH3A 3A09A 1FQDA 3LSLA 1LB9A 3CFZA 2B3BA 1I6AA 3MVXA 3ZKLA 3HPIA 4OQOA 3QUJA 2HZKA 3PMWA 4NF8B 5I2NA 1B7HA 5HPQA 2V3TA 1MXVA 1VFEA 4QFNA 4F29A 2V84A 1SQYA 2OCUA 1SW2A 4H67A 3K02A 1URSA 4WKMA 1VFDA 2E0SA 1FQAA 2Q2AA 3G3FA 2V3UA 3K1NA 1WODA 4R9GA 1QUIA 4GIZA 3RUMA 4EQ7A 3K00A 1ZMGA 1M5BA 3G3HA 4QSCA 5I58B 2XXQA 3E4RA 4OXVA 4FEDA 2AL5A 2PYYA 4EQ9A 5AA4B 3OOAA 1JETA 2F6PA 2ONSA 2OK2A 4U1ZA 4YKIA 4ELPA 3JZJA 2F35A 2R71A 2O84X 1IXHA 3K01A 1D3KA 1UTHA 3D4CA 4GD5A 4GQOA 4H0WA 1R1NA 4N07A 2G29A 3IJOB 3PV0E 3U93A 4ECFA 4EDPA 3MUQA 2ZNSA 4RPOA 4C1TA 2XXXA 1OMPA 3GLBA 2ZXTA 1RKMA 4GOTA 2UVJA 3H7MA 4Q0CA 3TYHA 4EF1A 1PB8A 4H6DA 1VR5A 1OVBA 2YJPA 4ONYA 4QFOA 4OFJA 4X1BA 2DE4A 1DTGA 2O7IA 4O3BA 1CE2A 2DSFA 3BKIB 5LOMA 1Z7ME 2FNCA 3CG1A 3K0VA 1BP5A 4IO7A 2PT2A 3IK6B 3V89B 5I59A 5KZTA 4OEVA 1ZJLA 1JNFA 2ZYOA 1TWYA 2Z23A 3KZGA 1I69A 2DOJA 4RNSA 2CZLA 3ILTB 1L5TA 3MVZA 3K6UA 3SETA 4WXJA 1P99A 3OO8A 4PFTA 2PMSA 1FQEA 3PD8A 2RF1A 1UIUA 4G68A 4POWA 1A40A 4Q5TA 2DWIA 3CIJA 3V5AA 1OQHA 4PETA 1JW1A 3IOUA 5A5XA 2O68A 4G8HA 3TPAA 3O6IA 3O6GA 3GBBA 2DXYA 3CG3A 1FQCA 1DSNA 2FYIA 3MBPA 3PU5A 4EXKA 2V25A 4NTLA 2F5XA 1PC3A 1YTVA 3CFXA 4BDOA 1UIVA 1Y4TA 3S9NC 3TODA 1FTJA 1HSJA 2PBWA 1B2HA 3FUZA 2ALUA 4JWXA 3E3KA 1MQGA 1B46A 1GVCA 4OWDA 3LBSA 4I9DA 2CMOA 4PP0A 1IUDA 3E9XA 5EHSA 3PMVA 2NXOA 4EXLA 5JK4A 3EN3A 3FV2A 3KN3A 5M2VA 2R9JA 5CMMA 3CSBA 3TEPA 1B5HA 2QMXA 2I48A 1KWHA 4HCWA 1ZBMA 3G3JA 3W9VA 4PQJA 1Y1MA 1ZLQA 4QFPA 2HAUA 2I58A 4U21A 3RT6B 4FIMA 4R9FA 1M5DA 2H99A 3L6GA 2Q88A 4ZE9A 1MQJA 4WEDA 3B7DA 4KYEA 2UVHA 1MPBA 1XOCA 2F8DA 2VD3A 2XX8A 4BLAA 3H03A 3R6UA 5H8NA 1NL5A 4UACA 4DCYA 1A55A 1EZ9A 5DTBA 3OELA 1M5FA 4YICA 2UVIA 4NMYA 3TTMA 2I3WA 4ELQA 3KJ7A 1NNTA 1MRPA 3OSRA 4DXUA 1AIVA 3N26A 4KPTA 3E13X 3H4ZA 1SW5A 2VP1A 1BLFA 4FORA 5H8FA 2QS3A 4IO5A 2RC9A 3IAZA 3KFMA 1D9YA 3EHSA 3C34A 3CSGA 4X9TA 4QRZA 3Q28A 5L8DA 3I6VA 2H4IA 3OEMA 3QK6A 5TP9A 1Y1ZA 2HCAA 1HSLA 2DXRA 2UXAA 2YLNA 1B3GA 5DVFA 3UA8A 4X48A 3MPLA 3TUSA 1VSOA 3K2DA 3T9UA 3M3KA 2Q9TA 3Q29A 4OERA 1XS5A 1LCFA 2F36A 2F97A 3U72A 4LZ5A 1BTJA 4KD5A 4NF6B 4OMBA 1MPCA 1I6BA 4LZ8A 4R6YA 1B51A 2XXIA 1A8EA 5CMBA 3C9HA 1FCKA 1URDA 3ODBA 2O6AA 4POXA 1QULA 1AH5A 1TFDA 1MY1A 2D5WA 2QS1A 1PDAA 2H98A 3UORA 3TDJA 3PD9A 4YMAA 4G8MA 3QXMA 3DLNA 3CFLA 3EF7A 3PPQA 4PFYA 4U23A 2WKYA 4H5FA 2DYXA 2QS4A 2Q89A 1MY3A 5FTIA 4QHQA 3TAJA 2DVZA 4KYDA 2QS2A 2IA4A 3KOSA 2V3QA 4C1UA 5KCJA 3RNNA 1P1OA 4YU0A 1MY0A 1B3EA 4P0GA 5K2XA 3TQWA 1BKAA 4I1DA 3W9WA 2I4CA 2AYSA 1B7UA 4L17A 2AL4A 4NEDA 5DVIA 5AA2A 5ICQA 2QMWA 3LR1A 1URGA 1POTA 1OQGA 4U1OA 3UGWA 4JXIA 3M3LA 3UK4A 3LC8A 4R6HA 1JEUA 3OO9A 2H9BA 3C31A 3K6XA 3MP8A 4QSEA 5H8HB 4XIGQ 3A3CA 5I58A 1UTBB 3H6WA 4RK9A 3MQ9A 3PPPA 1N84A 1MXXA 3G3IA 4DXCA 1DOTA 2V93A 2ZYNA 1QW0A 2B65A 3IOWA 1Y3QA 1LBBA 3ECRA 3THIA 3FVKA 5AE4A 3G3GA 4ZEIA 1DTZA 3OSQA 1MXWA 2QL3A 4F1VA 3B6TA 1UQWA 3C36A 4ESXA 2XD2A 4KCDA 1N04A 4QFLA 1LAGE 4H65A 4YKJA 3TMGA 4HCYA 3RGYA 5CM6A 3CI8A 3RQTA 1B05A 1B7ZA 4U4SA 2O51A 1OIBA 2RKMA 3IJXB 3K6WA 3MP6A 4EF2A 1AMFA 1QJMA 4YAHX 4JSDA 1H76A 2A5TA 1S50A 2DWJA 1OLCA 3T93B 2DE2A 1ZIUA 3RT8A 1LAFE 2OWSA 4F2QA 3FVOA 3T66A 1J1NA 1JVXA 4OESA 3JV9A 4H5GA 3KN7A 3FXUA 4FATA 3H06B 3KEIA 1B58A 3FV1A 1PB9A 3PUZE 3TELA 3IR1A 2F78A 1B0HA 1LLSA 1M5EA 5I56B 5JTYB 1B5JA 1LFIA 1SYIA 2W7YA 5DEXA 3O28A 3SERA 2DWAA 4DDDA 2QJEA 1Y9UA 2O1MA 3L6HA 4JBZA 5ISUA 3PUWE 1B52A 4OFLA 1UTBA 4LATA 3BFTA 3HHFA 3RTFB 1QKBA 3FVNA 1POY1 1Q1KA 1XVXA 2NOOA 2P1SA 3FASA 4KI0E 4RPNA 4E0WA 1II5A 4LA9A 4F39A 2HXWA 5B70A 3S9EA 5JEIA 1PB7A 2DP8A 4RXLA 2QSXA 4MLVA 3UIFA 5CC2A 2NVUB 3VXCA 4R2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HBCA 4ZEDA 1MG1A 4R74A 1SW4A 1MXUA 1FPLA 1MXYA 5F24A 4GL0A 2HFBA 2UYFA 1P1NA 4N91A 4N6KA 3VLUA 4PBHA 4OVPA 3C33A 1FRPA 3O97A 4GF8A 2A5SA 4GXSB 3FGSA 4OVJA 1XI6A 1JEVA 1D4NA 2ZZWA 3KN8A 2ABHA 5DT6A 4F3BA 3S9MC 3GYYA 1FPDA 1Y3PA 5DYHA 4C0RA 3PPRA 4AS5A 4XTCQ 5F1QA 4PE5B 4UA8A 3H6VA 1XT8A 4N15A 1NH8A 4TLLB 1US5A 4MFIA 4G4PA 2AIXA 2HEUA 2VPOA 4DI3D 4MF3A 1N3WA 3CVGA 4PFRA 4BDQA 3LV0A 4F29A 4RK2A 3ZS6A 4F3SA 4G8NA 4K3FA 3HFUA 2I3VA 5EQ9A 2ZNUA 1PBPA 2F3BA 4FEBA 1MS7A 1LEVA 1LCTA 1B6HA 2X26A 3KSXA 1FQBA 3G7WA 1MDQA 2GHAA 1B0LA 4F31B 1LSTA 1IXGA 2VGQA 4F3PA 2GFEA 2ZYMA 3FD3A 2XD3A 2I4BA 4XEQA 3IB0A 2ANJA 2FIXA 2ZYKA 4EQBA 3JYRA 4O3AA 3TQLA 2A5TB 2OWTA 4OVQA 3FJ7A 4BDLA 1USYH 1FSAA 4IGTA 2P2AA 1LB8A 3OXNA 4P3LA 3S2VA 1VE4A 4MNCA 4GXAA 4R75A 5DEXB 4JVIA 1KA1A 5L9SA 2F34A 5L9OA 4F18A 2FIEA 1SI1A 1R6ZA 1SI0A 4JVDA 5I57A 2MKZA 2XXPA 4GFRA 4JWYA 4O7IA 2WX9A 3IOTA 4F2OA 3D1RA 3D4GA 1NV0A 1NNPA 2H25A 1IXIA 1N7WA 4G2ZA 4HE0A 2VD2A 1Q35A 3T9VA 1MH4A 4AB5A 1NMUA 4EUOA 1HSEA 1IEJA 1BIYA 1N3XA 1PBQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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