2I3WA

Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: structure of s729c mutant
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDCKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Measurement of Conformational Changes accompanying Desensitization in an Ionotropic Glutamate Receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i3wA02
3T9XB 1S50A 2ZYKA 4WXJA 1B3LA 4ZEBA 2ZYMA 5JEIA 1P99A 1SQYA 2Z8DA 2R71A 1A40A 1MQHA 3MP1A 5B70A 5L9SA 4YU0A 5H8HA 2Q9TA 3H6WA 3MVWA 4EF2A 3ILTB 4C1TA 2I48A 2D21A 4IGTA 2F35A 2XD3A 4IO4A 4GRKA 4YKIA 1Y9UA 1N04A 3ZS6A 2QRYA 2XXRA 2H25A 5F1QA 3HSTA 3TFLA 5DT6A 3T96B 2G93A 2XXWA 3DELB 4KCDA 1B1XA 3MP8A 2PYYA 4RNSA 4X1BA 1UTBA 5H8FB 1VFDA 4Q0CA 5I2KA 3AXFA 1TFAA 1RYXA 2NWJA 1VSOA 3TODA 4MFIA 1PB8A 3EHTA 1N0TA 4PFYA 5TU0A 3VE1B 2UVGA 1TWYA 4BDLA 4WEDA 3FGSA 4XIGQ 1QJMA 5DEXB 4KQPA 1B0HA 2QS4A 4LA9A 3KJTA 3KGCA 3A3CA 4IO7A 3SERA 4YMAA 3KN3A 3SESA 3RPWA 2RC9A 1B5JA 1I6BA 1JNFA 3D4GA 1SD3A 4R9FA 3S9NC 1B7UA 3ZKKA 4EXLA 2DWJA 1ZMGA 2DWAA 2OLBA 5CMCA 3CR9A 1B5IA 2PT1A 3SEUA 4G68C 1MM7A 4N13A 1POY1 1ZU0A 1MXWA 1O7TA 4ECFA 1B51A 4YB7A 4U21A 3CVGA 1UTBB 4QSDA 5I56A 3TQWA 3N6UA 4F3BA 3C4MA 4N6PA 5LOMA 1EZOA 4FORA 4POXA 3TTMA 1NH8A 3HHFA 1M5DA 1FQFA 3H7MA 1LLSA 4H0WA 2RF1A 5HM4B 3OENA 4ZDMA 1LFIA 3G7WA 3MVYA 2F8DA 1MQGA 4LVQA 4GIZA 3IOUA 3O97A 1NFTA 3TTLA 3ODBA 2Z8FA 3PPNA 3RN8A 3N5LA 4JWOA 2VGQA 2Y7KA 4TLLB 3MPLA 1DPPA 3T22A 3PUVE 1M5EA 1UIUA 4L17A 5K2XA 3H4ZA 3FV2A 2OWSA 1O63A 4QFOA 2QSXA 3H6UA 1H3DA 4F2QA 3MJNA 1NKXA 4NTLA 1A54A 3QAXA 1FTKA 2ZNSA 3PUWE 1GVCA 5KCJB 2QMXA 3O6HA 1N76A 3RUMA 4THIA 3TUSA 3DLNA 1B46A 2DOJA 3FV1A 4PFUA 3LSLA 4ZEKA 4GD5A 2Y7RA 4H6DA 1NL5A 3ZKLA 4OMBA 3T9VA 2RINA 1YCJA 3IJXB 3OO6A 3HV1A 1L5TA 4OQOA 1LAGE 2DXYA 1IXGA 4ISUA 4BDNA 3MVXA 1B3GA 5HBCA 4OERA 4OETA 4I8CA 2HEUA 1A7LA 3H06B 3OEMA 3FIRA 4IO6A 4IO3A 4NF5B 1IUDA 4O3CA 4YB5A 3ONMA 1XVYA 4PETA 1O64A 4DDDA 4KHZE 1R6ZA 4K3FA 3LC8A 2M8CA 4Q8RA 1N7WA 1IIWA 4EQ9A 3JV9A 3BKIB 2YJPA 2DS9A 3GXAA 3K4UA 3TAJA 5A5XA 3PUXE 4PFWA 1VR5A 3DP8A 1FQDA 3CFLA 1SVXB 4C0RA 3UK4A 4DXUA 2UVIA 3KN7A 4GWOA 2XXIA 1XOCA 5CBSA 2CMOA 1LBCA 4DCYA 2HZLA 2RCAA 1LB8A 2HAVA 3C32A 4PP0A 1URDA 1DPEA 1P1OA 2Q88A 4Z7EA 3TCFA 2I4CA 5KZTA 5KDTA 1MXVA 3OMBA 3HPIA 2O84X 1SW1A 2QL3A 1LBBA 2HQ0A 3FVOA 2HAUA 5FTHA 4FIMA 1Q1KA 5CMMA 1ZLQA 4H67A 3PMVA 4POWA 2ABHA 1MY4A 5DTBA 4U23A 3K00A 3KFMA 4ZS9A 1T0KA 3V8XB 3IB2A 2V93A 1EU8A 3EN3A 2ZXTA 3BFTA 3PD8A 1B7ZA 3LSFB 4F1UA 4G77A 1EH3A 2F6PA 2V25A 4HTGA 4YAHX 1R9LA 3IJOB 4DIGA 4OZ9A 2E0SA 3IO6A 1FTLA 4GL8A 4U4SA 2WKYA 3OO8A 3VVEA 4I62A 4FJPA 1N84A 2REGA 1LFGA 5KDTB 4LZ8A 4R75A 3HHGA 2BJJX 1Y20A 4F18A 3K6XA 3C9HA 2XXTA 3DM0A 2RKMA 4WEPA 4G2ZA 1BKAA 4BDOA 3O6IA 4ESWA 4QSEA 2XXQA 3KSJA 1UQWA 1S7YA 1UIVA 3T93B 3SKPA 3MBPA 1B7HA 1B52A 3OELA 1LGBC 1USYE 3U92A 2O68A 4QHQA 2E1SA 1JW1A 1Y3PA 4R73A 3RGYA 1LCTA 1DSNA 2PMSA 2P2AA 1BIYA 4Z0IA 1DOTA 1ELJA 3OO7A 4GVOA 4LONB 4OENA 3MVZA 4DXCA 4E0XA 3QXMA 1N3WA 2Q2CA 4U1OA 2XXVA 4HS7A 2F36A 2OBGA 1MY0A 1Y4CA 4NEDA 4NF8B 3T66A 3A3UA 3LR1A 3TTNA 5EHSA 1MY1A 5JK4A 3L6HA 1POTA 1US4A 1Y3QA 4E0WA 4RPOA 3U94A 2D3IA 5ELVA 1MPBA 4F19A 1Y1ZA 4G8HA 3HN0A 4KYSA 1IXCA 1VFEA 3O66A 4GFRA 1IZ1A 5JTYA 2Y7WA 4PFTA 3K6VA 4LQ5A 4TLMB 2HFBA 2I0BA 1B32A 1SI0A 4G68B 5AA3A 3K6WA 2IA4A 1LAHE 3WAEA 3TTKA 3KN8A 5L9MA 2X7PA 2O1MA 1JQFA 4X1DA 3B6TA 3QUFA 2F78A 3PMWA 1XC1A 5H8NA 4YMBA 1P1WA 4GXAA 2VD3A 5L9OA 4OTEA 3E3KA 1OVBA 2AL4A 4QFKA 3CRBA 2P0SA 1PBPA 3TCHA 1CB6A 4H8JA 3R7XA 3KZGA 3FASA 4NF6A 4GXSB 4F22A 2DXRA 1MPCA 4F2OA 1P1QA 3MAMA 1BP5A 1J1NA 3IB0A 3IB1A 4MF3A 4OESA 5H8HB 4G8MA 4DZ1A 2O69A 3CI8A 3OXNA 3OD7A 3IOWA 4YZZA 4NF4A 5L8DA 4F1YA 2B65A 2PT2A 4C1UA 1DTZA 5AA4A 3BBRA 5DVJA 3P7IA 1H76A 2X7QA 3TKDA 2Z23A 3S9MC 2HCAA 4R9GA 3PPQA 3Q26A 4YICA 4MH5A 3QYTA 4NE4A 1MQJA 3O29A 4R6YA 4FAJA 5I2KB 2DSFA 5I59A 3RY3A 1MG1A 2VD2A 3V83A 4JBZA 1MY2A 2VOZA 3WAFA 4JXIA 4NF6B 3TZAA 3QUJA 2R9JA 4M1VA 2GHBA 4TOZA 2XHDA 2REJA 4ZEDA 5AA2A 3TYHA 4F29A 4JSOA 1QKBA 5FTIA 4EF1A 1XS5A 4EXKA 4IGRA 3C31A 5DYHA 3N26A 4NF4B 2DQVA 2QJEA 5IKBA 2RC7A 3VDFA 4GOTA 5BUUA 5FHOA 1TXFA 2ALUA 4ESXA 1H44A 2F34A 3H03A 4MLVA 2XX8A 3VLVA 1JVXA 4GLIA 5H8QA 3K0VA 2FNCA 5ICQA 1MS7A 1FTMA 5TP9A 4HW8A 1IEJA 5I56B 2B3FA 2O1LA 3MZ1A 5CRYA 2Y84A 3S9EA 4RPNA 1QULA 3C35A 3HCQA 1JW4A 3I5OA 4AB6A 4OFJA 4QFPA 2ONKE 5B7DA 2GRVA 2I4BA 3OOAA 1Y1MA 3TDJA 1RYOA 4QFNA 3MC2A 5M2VA 2OZZA 3IR1A 1VE4A 4IB2A 4JDFA 4LUBA 1MQIA 1URGA 1YAEA 4H5GA 2VHAA 3R26A 3A09A 4OFOA 4QFLA 2XX9A 3QK6A 1B3FA 1MDQA 4G4PA 2O51A 4XKPA 3HO7A 4GQOA 1PB9A 4EQ7A 2XXUA 1USYH 3MZBA 3VXCA 2XD2A 3RTFB 4FEDA 4BDRA 4X9TA 2Q8JA 4JWYA 3ECRA 4JWXA 3FXRA 4ZEIA 1RKMA 5I57A 1AIVA 4PE5B 1URSA 3B6WA 3Q27A 3G3FA 1HSEA 3GBAA 4XXUA 4ELRA 2F7BA 2HZKA 4OWDA 1FQAA 2XXHA 3VLWA 1ANFA 1UTHA 3VV5A 1AL3A 3QIMA 4F39A 3W9WA 4HCYA 1B4ZA 1WODA 4Q5TA 4HCWA 2GH9A 4LQ2A 1QW0A 1NH7A 4H1XA 4KCCA 2XX7A 3KOTA 3SETA 1XT8A 3GBBA 2UYEA 1N3XA 3TEPA 4OEUA 3Q29A 2AYSA 1F9BA 3S9LC 1Y4TA 3SEYA 5A5XB 3QSLA 2OJTA 3N94A 2ESNA 1QUIA 3FVGA 3OO9A 2QS1A 1D9YA 3THIA 2H9BA 3FJGA 1AMFA 5TPAA 1B40A 3K2DA 2DE2A 1MDP1 4KYEA 4OFLA 1B05A 3U72A 3V5AA 4R6KA 1MQDA 5ITPA 4EQBA 1BLFA 4Q30B 5DVIA 4QF9A 3CSBA 2HXWA 1Y3NA 1EZPA 1Q35A 4DLDA 3PGFA 5I58A 4H5FA 4H65A 2DVZA 1WDNA 4R6HA 2DYXA 4WKMA 3IORA 1B9JA 3W9VA 3H6TA 4YKPA 3RT6B 4RXLA 1B2HA 2NXOA 3PV0E 2YLNA 4GF8A 1M5BA 3L6GA 4YKJA 3KEIA 3IAZA 3VXBA 4ELPA 4F3PA 1PBQA 2A5TA 4EUOA 1LCFA 2LAOA 1NNKA 4DCXA 4ELQA 4OVJA 1QVSA 2B3BA 3O28A 4DE8A 3ILUB 3SEWA 1FCKA 3U1OA 3OEKA 2F7CA 5H8SA 4LZ7A 3E4RA 5CMBA 3K1PA 1NNPA 2CZLA 5DVFA 1GGGA 3M8UA 1JVYA 1FW0A 5H8FA 3T9HB 3SEXA 3CIJA 4U4XA 1FQCA 4XKNA 1IITA 3GZGA 4EDPA 1P1NA 5F7VA 2O7UA 1B4HA 3EF7A 3EHSA 3M3LA 4MLQA 3CSGA 1MH3A 4AQ4A 5DEXA 4OHNA 3FXUA 3RTWB 1YPNA 1NNTA 2I49A 4YKKA 3D4CA 1D4NA 3PUZE 1TT1A 3K01A 4KR5A 2A5TB 1MY3A 1DTGA 4P11A 3RLFE 1N7XA 2NVUB 5I84A 2H98A 3PPOA 4GL0A 3JZJA 1SYHA 3EQ1A 2V84A 3FATA 3FVNA 4IO5A 3K1MA 2PVUA 2XXXA 2O6AA 4F31B 4LP2B 4XKQA 3PMXA 3M3FA 3G3HA 1MXXA 4BLAA 2A5SA 3SDFA 3UN6A 4FATA 1OLCA 1ZKBA 1LB9A 1ZBMA 1AOVA 4KI0E 5JTYB 1SDXA 4PQJA 5ICTA 3S4UA 4M4GA 4RK9A 3MUQA 5I2NA 5HPQA 3U93A 2NOOA 1MXZA 4KPTA 1LAXA 1XVXA 3I3VA 2OWTA 4RYAA 1TFDA 2Z22A 4ELOA 4P0IA 1ATGA 1HSJA 3LUYA 1B5HA 2ANJA 1HSLA 1R9QA 4ZZEA 2I3WA 2OK2A 5H8NB 1Z7NE 2AIXA 3LBSA 4BDMA 4R74A 2H4IA 3FXQA 2D5WA 4NWCA 1B6HA 1JETA 3OSQA 2XXPA 3MP6A 4N07A 3MZ9A 4RA1A 3TCGA 3K02A 2UVJA 3MPKA 4ZEFA 1BTJA 4R72A 2ZYNA 3LSXA 1PB7A 2GFEA 3MWBA 5CBRA 4I1DA 2H5YA 1QKAA 2DP8A 3MW0A 5KCJA 3DP6A 5I2NB 1B3EA 1US5A 3B6QA 1LFHA 2W7YA 5AA4B 3UP9A 1FQEA 1FQBA 3PD9A 3B7DA 5CC2A 2I58A 5AA1A 2H99A 2QPQA 3K1NA 1MH4A 1QUKA 1JEVA 3UIFA 2Q2AA 2ZNTA 4ZECA 3RNNA 2ONRA 1MPDA 2Q89A 1NNFA 1OVTA 3C36A 2QMWA 2DWIA 3FVKA 2UXAA 1IQ7A 5K2YA 4ZZAA 5I59B 3U8QA 4NF5A 4F3GA 4F3SA 3O2AA 4RY1A 1SI1A 5FHNA 1Z7ME 4G8NA 3FJ7A 1A55A 3TTRA 1P1UA 3USDA 5AA2B 3O6GA 4OYVA 3VLUA 2F97A 1JW5A 2P1SA 4KYDA 4FEBA 5AE4A 3IOVA 2RCBA 3SEVA 3C33A 3Q28A 1D9VA 3KBRA 4FECA 4O3BA 4U1ZA 4FE8A 3BFUA 3PUYE 3CG3A 4RJZA 2PX1A 3IX1A 3OSRA 3N6TA 3PU5A 2DWHA 4UA8A 4H8IA 1PEBA 5H8QB 3H6VA 3C34A 4U2RA 5TP9B 3VFJA 4P0GA 1OQGA 5CM6A 1QUJA 5FHMA 4O3AA 1JEUA 1MXUA 3IOTA 1AH5A 1R1NA 4LZ5A 3G3JA 3UA8A 4AB5A 4MBPA 1B58A 2RC8A 3G3GA 3FZVA 4BDQA 3IL1B 2X26A 3I6VA 3CFZA 2Y7IA 1A99A 2THIA 4NMYA 5AA2D 1GV8A 4JSDA 4KFQA 1MRPA 3KSXA 1B3HA 3TQLA 1A8FA 3GLBA 5J1DA 2YPNA 1SW4A 3RT8A 2V3TA 1OMPA 1B0LA 2Y7PA 1PC3A 3KJ7A 5IAIA 3IK6B 2O7IA 1FTJA 2KLFA 1LSTA 1GR2A 2GHAA 1I69A 1LAFE 1CE2A 2XXYA 1FTOA 5ISUA 2UYFA 1NMUA 2V3UA 2ZMBA 3V89B 5EHMA 1IXIA 3TMGA 1A8EA 4F1VA 3Q25A 4I9DA 2V3QA 1I6AA 2F5XA 2AL5A 2QS3A 2FYIA 1SW2A 3W15C 1GTKA 4LATA 3H3GA 3JYRA 4ZE9A 1H43A 2ONSA 1D3KA 3VVDA 5EYFA 2I0CA 5I57B 2I3VA 4XTCQ 3TPAA 2ZYOA 4OXVA 3CFXA 1MM6A 3R6UA 2DE3A 3G3KA 4R2FA 4TQUQ 2PBWA 1H45A 1B1HA 2VP1A 3TELA 1OIBA 2Z8EA 2R6GE 3DP4A 2I6EA 3RQTA 3EPEA 3MQ9A 1UTHB 3FUZA 1MXYA 3F11A 2IEEA 3CG1A 4IY6A 4NF8A 3O9PA 1M5CA 1EZ9A 1ZJLA 4U22A 4QRZA 3FD3A 1SYIA 2UVHA 3KG2A 1SBPA 5BWJA 2G29A 2NUVA 3T9UA 1M5FA 2ZNUA 1XHYA 3KOSA 3M3KA 4IO2A 3IO4A 2F6GA 1KWHA 1IXHA 2F7AA 2QS2A 3UGWA 1I6QA 4QSCA 4NWDA 3LSWA 4X48A 4DXBA 1DMBA 2DVCA 4RK2A 3FJMA 4G68A 1WVJA 4ONYA 1ZIUA 5CMKA 5ITOA 5TPAB 4ZE8A 4OEVA 4UACA 1YTVA 5CI5A 4KD5A 3UORA 1ZTYA 4IY5A 3EHUA 1SW5A 2OCUA 1OLAA 3PPPA 4JB7A 3S2VA 2DE4A 3G3IA 3PPRA 3ZSFA 1II5A 3E9XA 1S9TA 5I58B 3E13X 4R2BA 4ND9A 1PDAA 1OQHA 4XKRA 3VVFA 2FA7A 4YB6A 3K6UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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