1FTKA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2i) in complex with kainate at 1.6 a resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
262
structure length
250
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 250
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA01
4X48A 1P1QA 1SW1A 4GQOA 3K6VA 3KOTA 2O7UA 3PUZE 5FTIA 2DP8A 3E3KA 3H6VA 4X1BA 3G7WA 3ILTB 1NMUA 1FQCA 4FORA 4XKNA 1B3LA 3LSWA 3V89B 4XKRA 1XT8A 3O6IA 3RLFE 1N84A 4M1VA 4G2ZA 3MPKA 4ZEDA 5ICTA 2R71A 4RK9A 2G93A 4TLLB 1M5CA 2I3VA 4ZDMA 1XS5A 3SDFA 2ZNTA 1URGA 4OESA 5BUUA 3A3CA 4H65A 3TFLA 1B5IA 1N0TA 1H76A 1JQFA 1QKBA 5EHMA 2RF1A 4LP2B 2QJEA 2H9BA 2Q2AA 1H45A 3UGWA 2GHAA 1EZ9A 3WAEA 2X26A 4GLIA 1MDP1 3MWBA 5H8FA 3IB1A 1M5FA 2D5WA 1MQGA 4Q0CA 3PUVE 3E4RA 1FTMA 3MZBA 1XVXA 4PFWA 4JWOA 4MFIA 4EUOA 3K1PA 1FTLA 4PFTA 1N3XA 4JBZA 4F2OA 4N13A 3FD3A 4MH5A 2OLBA 4WEPA 4GXSB 2DSFA 4R6HA 3HN0A 2NVUB 3QUJA 3CVGA 4P11A 3N6TA 1JW4A 4MF3A 5CBRA 3QAXA 5CI5A 3FXQA 3OSRA 1AOVA 3BFTA 1MG1A 4GVOA 3B6TA 2DE4A 1LAGE 3PD9A 3TAJA 4GD5A 4OERA 2E1SA 1JW1A 4NWCA 4KQPA 2CMOA 5H8SA 5I57B 4EF2A 4ELOA 2I0CA 1QW0A 1OVBA 2Q89A 3KN7A 2OJTA 4ELPA 1T0KA 2WKYA 2QRYA 4H8JA 3K01A 1VR5A 3OEKA 3THIA 4U22A 4AQ4A 3CSGA 4O3CA 5I58B 1DSNA 3MZ1A 2PT1A 2G29A 3DP8A 4XXUA 3TEPA 2DXYA 1AIVA 5TPAB 1EH3A 4QSEA 2F5XA 1AMFA 5HBCA 1DTGA 4LONB 1BIYA 2V3QA 4I8CA 3RGYA 1MH4A 3EPEA 5FHMA 1SW5A 1NNKA 3BBRA 2PYYA 4EQ9A 1RYXA 3KOSA 1IXCA 2DE3A 3IOUA 2UVJA 1LGBC 3GXAA 2CZLA 4FATA 2F35A 4Q30B 5F7VA 4F1UA 3W9WA 1POTA 4EXLA 1S50A 1IXIA 3BKIB 3T9VA 4GFRA 4U1ZA 3EN3A 3C9HA 5ELVA 3T96B 3FASA 1VE4A 2XX8A 4IGRA 1D4NA 2ANJA 3PMWA 4QFKA 1B7HA 5CBSA 2XXTA 2HAUA 3IORA 2XX7A 3MUQA 3S9LC 3RY3A 3KJTA 1IZ1A 5ICQA 3UP9A 4DZ1A 4OTEA 5I2KA 1MY2A 3TELA 3FJ7A 5AE4A 2RC8A 4ESXA 4JWXA 2QL3A 5FHOA 1SW4A 3RQTA 4DXBA 1I6BA 4NF5B 2PX1A 1M5BA 3FVOA 3MBPA 1N76A 3BFUA 4BDOA 1H43A 4YZZA 1MXZA 3H6TA 4ZEBA 4YKKA 2RC7A 2XXQA 3EHTA 4ZS9A 1R1NA 3B7DA 5AA4A 5KCJA 1WDNA 5DTBA 4F2QA 1A99A 3OOAA 4THIA 1GV8A 1FTOA 4DDDA 2P2AA 2I0BA 2RC9A 5I84A 1B52A 2XXRA 1MQIA 2XXWA 1M5DA 5CC2A 3C34A 4DCXA 2QMXA 1UTHB 4ZZEA 3MVZA 2H25A 4KYSA 4AB6A 2ALUA 4F1VA 3O2AA 4IGTA 4KHZE 3SEWA 4IO6A 2F8DA 1ANFA 4QF9A 4JWYA 4KPTA 4AB5A 1WVJA 1RYOA 4ELRA 5I2NB 1MXXA 3MQ9A 4HTGA 4I1DA 2XXVA 3O6HA 3M3FA 4YICA 4ISUA 1LLSA 2I4BA 1NKXA 3V8XB 3H3GA 1UIUA 5H8NA 1B4HA 1Y3NA 4XTCQ 2LAOA 1MPBA 2X7PA 1MY0A 2RINA 2XXIA 3RPWA 3FXUA 1UTBA 4H5GA 2B65A 4G77A 3HHFA 1DPEA 1MRPA 1MPDA 4DXCA 3KN3A 1PB8A 4U4SA 1WODA 2F34A 3ODBA 1MQDA 4RJZA 4BDMA 3E9XA 4NF8A 1NH7A 5H8FB 3SEVA 2Q8JA 3N26A 4LUBA 3K1NA 3KEIA 2F7BA 3TTRA 4C1TA 1MS7A 4PE5B 5H8QA 3TPAA 1EZOA 3TUSA 2F6GA 1ZBMA 3ONMA 4YB5A 1UQWA 2O7IA 4NWDA 1GVCA 1QUIA 1MDQA 4QFPA 3QIMA 4Q8RA 1P1WA 3FZVA 4HCWA 1BP5A 2ZXTA 5F1QA 2I49A 3S2VA 2XXUA 4G68A 4JSDA 3FJGA 3IX1A 4LZ5A 3EF7A 3L6HA 5BWJA 4X9TA 1AH5A 5LOMA 4KYEA 3ZKLA 4E0XA 4GL8A 2I3WA 1PEBA 3LSLA 2H99A 2F7AA 2VD2A 4HCYA 2HXWA 1F9BA 1ATGA 4NMYA 4XKQA 1FQEA 4K3FA 1JETA 3VVFA 2UYFA 4IB2A 1B7ZA 1H44A 4OQOA 1LFIA 1NL5A 4FIMA 2VHAA 2F78A 4RY1A 3VXBA 4F18A 4EQ7A 5IKBA 4R73A 1ZMGA 3TDJA 4G8HA 3VFJA 3FVGA 3ILUB 2YJPA 4ESWA 5I59A 1B9JA 4XIGQ 4N07A 4JDFA 3OENA 3MAMA 4NEDA 4IO3A 4LZ8A 1A54A 3OO9A 1HSLA 3IO6A 1Y4TA 2DWAA 4R6KA 4LATA 2YPNA 3W9VA 3CG3A 4LQ5A 1B3EA 3MVXA 2KLFA 3TCGA 4IY6A 1FQBA 3KJ7A 3Q25A 4WEDA 3Q28A 4I62A 1BTJA 3F11A 2XXPA 2M8CA 4ND9A 1PB9A 3PPNA 4POXA 5CM6A 4H0WA 1PBPA 3FXRA 2ABHA 5TU0A 1SI0A 4ZE8A 3R6UA 3T93B 1MM6A 4F31B 2H4IA 5A5XA 2Z8DA 1QUJA 3H06B 1HSJA 1YTVA 4ELQA 1N3WA 4QHQA 4DIGA 2O51A 3O66A 4E0WA 5I2KB 4FE8A 1ZTYA 1N7WA 3I6VA 4RK2A 1PDAA 3HCQA 1TFDA 2NOOA 3OO8A 5TP9A 2FA7A 3MZ9A 1XHYA 4NE4A 4WKMA 4OETA 4RPOA 1QUKA 4MLVA 3U92A 4F19A 4BLAA 3CSBA 2VGQA 3K00A 3FVNA 2DWJA 4BDRA 4OFJA 5AA4B 1POY1 5KCJB 3EHUA 3VLVA 1B0LA 5M2VA 1N7XA 3I5OA 4YKPA 1N04A 3K1MA 1Y20A 1NNTA 2Y84A 4ONYA 2R6GE 4R74A 1SW2A 5FHNA 5I56A 5FTHA 1S7YA 2HZKA 1EZPA 5ITOA 3FV1A 5KDTA 4P0IA 1IITA 1MXVA 1JVYA 2REJA 2AL5A 2GRVA 3Q27A 2DWIA 3PUXE 2ONSA 4H5FA 3HHGA 3L6GA 3O28A 4UA8A 4X1DA 1Q35A 2OWTA 4QFNA 4MLQA 2RCBA 3G3JA 3M3LA 3IJXB 4KYDA 1A7LA 3UA8A 1LFHA 1P99A 3MP6A 1SQYA 3TCFA 1SYHA 4NTLA 3FUZA 4FJPA 3FV2A 1LB9A 4QFOA 3TQLA 2ONRA 3UN6A 3S9NC 5H8NB 3DP4A 3C4MA 2XD2A 5DYHA 3C33A 1Z7NE 2GHBA 1UTBB 1JVXA 3SEXA 3MP8A 3MJNA 2AYSA 2XX9A 4YB6A 1FTJA 3H03A 3TODA 3OD7A 4DE8A 1H3DA 4PETA 2GFEA 1PB7A 1MXWA 4NF8B 4LZ7A 3C36A 1P1NA 4QRZA 4QFLA 5H8HB 1ZKBA 2Y7RA 2Z23A 4FEBA 2O1MA 3GBAA 1B05A 5H8QB 3K6XA 3PD8A 1B51A 2HEUA 4KR5A 1Q1KA 3R26A 5AA3A 3PPRA 4GRKA 3GZGA 4G8NA 3IK6B 3VLUA 2THIA 2OZZA 1OLCA 1DMBA 1SI1A 2ESNA 4G68B 1A8EA 5J1DA 2HZLA 2V3TA 1II5A 3LUYA 2ZYMA 3G3HA 3HO7A 1B0HA 3RTFB 2O6AA 5AA2D 1MY4A 4IY5A 3OSQA 1QVSA 3DELB 1DOTA 2VOZA 4NF4A 3Q29A 3ZSFA 3OELA 4MBPA 2XXXA 3FATA 3S9EA 3H7MA 4C1UA 3A09A 3OO7A 1B7UA 1IUDA 2PVUA 3HPIA 4R72A 4DCYA 2QS3A 2A5TA 1GGGA 3RNNA 4BDLA 4LVQA 1SVXB 2DYXA 1R9QA 2F6PA 2P1SA 3V83A 2UYEA 1ZJLA 3PMXA 1XVYA 4GOTA 3KZGA 3LSXA 4OEUA 5I59B 1ELJA 4R9FA 2D3IA 5L8DA 1ZU0A 4KI0E 2Z8EA 3G3KA 4I9DA 2F7CA 1R9LA 4R2BA 4U23A 1OLAA 2DE2A 1TWYA 3VVEA 2QMWA 1B5JA 5DT6A 3T9XB 3E13X 3TTLA 3ECRA 4U2RA 2NXOA 3DLNA 5HM4B 1B3FA 3K6WA 3H6WA 4IO5A 3CRBA 3T9UA 4U21A 1OVTA 3U1OA 4KFQA 3O9PA 1B1XA 4OXVA 5JTYA 3LC8A 5K2YA 3U72A 3EHSA 3H6UA 3JYRA 3QUFA 4YAHX 4ZEIA 3VLWA 2V25A 3TTKA 5A5XB 3I3VA 1A8FA 3FJMA 3TKDA 4ZEFA 1A40A 4F39A 1D9YA 2O68A 1D9VA 1FCKA 2XD3A 1B1HA 3HV1A 3RN8A 3MW0A 4M4GA 3AXFA 3CIJA 4H67A 1Y1ZA 4NF5A 2ZYNA 1HSEA 3PUWE 2Y7WA 2UVIA 3LSFB 1OQHA 3RT6B 1KWHA 1TXFA 4OYVA 1JNFA 1VFDA 1JEVA 4EQBA 2RKMA 5TP9B 5B70A 2IA4A 1URDA 3O97A 1XOCA 4DXUA 3CFXA 5CMCA 5L9SA 1FTKA 2QSXA 4R9GA 3K0VA 1OMPA 2XXHA 4H6DA 3QSLA 3K2DA 1CB6A 2IEEA 3B6QA 3OEMA 4YU0A 2P0SA 5K2XA 2YLNA 5DVJA 1YCJA 2VP1A 4QSCA 4G4PA 2I58A 5B7DA 5I56B 2E0SA 1PBQA 1B32A 3N94A 3FVKA 4GWOA 1IXHA 4BDNA 2OWSA 5KDTB 3PV0E 4F22A 4JB7A 3IAZA 2F97A 1S9TA 1IXGA 4UACA 1EU8A 2A5SA 2HCAA 2ZYOA 3A3UA 3PMVA 4EXKA 4O3BA 5I2NA 3EQ1A 4C0RA 3B6WA 4F3GA 3C35A 3IJOB 3V5AA 1FW0A 4ECFA 3FIRA 5JEIA 4KCCA 2DXRA 1I6QA 3IO4A 4EDPA 3KFMA 3USDA 3TTNA 3TZAA 5DEXA 4O3AA 3UIFA 1Y4CA 3IOVA 5CMKA 1LCFA 3K02A 4YMBA 4TQUQ 1YAEA 4Z0IA 3KG2A 4OENA 3KBRA 1FQAA 4OEVA 4OMBA 1SD3A 3D4GA 4NF6A 3PPOA 3S4UA 1B3GA 1R6ZA 4JSOA 5EYFA 1MY3A 3KGCA 1JW5A 1PC3A 1O63A 1LCTA 2BJJX 4KD5A 4RNSA 3QYTA 1MQHA 1MY1A 1MXUA 3ZKKA 3Q26A 3FGSA 3U94A 1IIWA 4ZECA 1MH3A 1MQJA 1P1UA 1OQGA 3K6UA 4F29A 4YMAA 4G8MA 1SDXA 4N6PA 2GH9A 1O64A 2Z22A 3TQWA 3VDFA 1UIVA 2H5YA 1L5TA 4TLMB 2NWJA 4IO4A 4OWDA 3N6UA 2PBWA 4OFOA 4GIZA 5HPQA 3M8UA 3UK4A 5AA2A 4G68C 2B3BA 4NF4B 4F3BA 2Y7PA 2QS2A 2HFBA 4P0GA 3O6GA 1Z7ME 4RYAA 4GF8A 3VV5A 3CFZA 3MP1A 3KSXA 2PMSA 4R75A 3RT8A 2A5TB 3R7XA 3G3FA 1B2HA 2Z8FA 2X7QA 3RTWB 3D4CA 4U1OA 4FAJA 2UXAA 2HQ0A 3G3GA 3TYHA 2UVHA 3SERA 1YPNA 3MPLA 2ZNUA 3W15C 5JK4A 1IQ7A 4Q5TA 2QS4A 1B40A 4QSDA 1BKAA 2ZYKA 3CFLA 3PU5A 4OFLA 5L9MA 1B5HA 1DTZA 1LBBA 1LAXA 2H98A 3TTMA 4TOZA 2ZNSA 3G3IA 1B58A 3TMGA 3P7IA 3PPQA 4FEDA 4LA9A 3CG1A 1CE2A 3SESA 4WXJA 4IO2A 3U93A 2NUVA 2V3UA 3KSJA 5JTYB 3SKPA 1A55A 1OIBA 4FECA 1BLFA 1FQFA 4IO7A 4BDQA 4LQ2A 1LB8A 3OXNA 2FYIA 3PGFA 2QPQA 1LFGA 3IOTA 3OMBA 3IOWA 1VFEA 4YB7A 2VD3A 3SEUA 4KCDA 1NNFA 2D21A 1USYH 3O29A 4PQJA 2DVZA 4XKPA 3QK6A 3TCHA 5L9OA 5DVFA 3IL1B 4R6YA 1LAHE 1US4A 2AIXA 1GR2A 4H8IA 2RCAA 1Y3PA 5ISUA 1Y9UA 1JEUA 2R9JA 2B3FA 5I57A 2I6EA 2PT2A 1B6HA 2F36A 1LAFE 1NFTA 4HW8A 4H1XA 1D3KA 4DLDA 3T9HB 2QS1A 1URSA 5CMMA 2OK2A 2I48A 1US5A 5CMBA 4OHNA 4GXAA 2XXYA 2REGA 2DQVA 5I58A 1RKMA 2DVCA 1XC1A 4F3PA 4RA1A 3OO6A 2V84A 2DWHA 4HS7A 4PFYA 4RXLA 2Y7IA 3IR1A 5TPAA 3DP6A 4OZ9A 1MXYA 1LSTA 1SYIA 4F1YA 1GTKA 2O1LA 1B46A 4ZEKA 4Z7EA 4GL0A 1DPPA 2FNCA 2Q2CA 2O84X 3DM0A 3CR9A 2W7YA 4L17A 1B3HA 3RUMA 2XHDA 1Y3QA 1ZLQA 1P1OA 2Q9TA 1QULA 1LBCA 5CRYA 3T66A 3UORA 3VVDA 3JV9A 2Y7KA 3MVYA 1Y1MA 4PFUA 1MPCA 5EHSA 3SEYA 5DEXB 4R2FA 1NNPA 3MVWA 2AL4A 3M3KA 3JZJA 1NH8A 4RPNA 3KN8A 4OVJA 1I6AA 3S9MC 5IAIA 1I69A 1MM7A 5KZTA 1M5EA 2I4CA 2OCUA 3VXCA 2DS9A 3N5LA 1AL3A 1IEJA 1VSOA 4ZZAA 5H8HA 1TFAA 3GBBA 3H4ZA 4NF6B 2ZMBA 3PUYE 2DOJA 2HAVA 3WAFA 4EF1A 2OBGA 3T22A 3SETA 5ITPA 1B4ZA 3PPPA 3VE1B 3QXMA 4POWA 4ZE9A 3C31A 3LBSA 4YKJA 1TT1A 3IB0A 3C32A 1FQDA 2O69A 2UVGA 3CI8A 3U8QA 3ZS6A 3GLBA 4JXIA 1QJMA 4F3SA 2V93A 2ONKE 4U4XA 1UTHA 5AA1A 1O7TA 4PP0A 5DVIA 1J1NA 4YKIA 3K4UA 1QKAA 1SBPA 1USYE 5AA2B 1ZIUA 2Q88A 3HSTA 3LR1A 3MC2A 3IB2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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