1FTKA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2i) in complex with kainate at 1.6 a resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
262
structure length
250
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 78
structure length 250
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA01
3H6WA 3SESA 3ZKKA 1Y3NA 3MP1A 5K2XA 1B51A 1IXCA 4KCCA 3TTMA 3VFJA 4LZ8A 5F1QA 3S9LC 4LVQA 3HCQA 3PU5A 1ZLQA 1B52A 3C33A 1TXFA 1GR2A 4ZEKA 1N3WA 3CG1A 2OLBA 2NUVA 3K1NA 3KGCA 3MW0A 1PB9A 2XXRA 4IY5A 3C32A 4GRKA 4P0GA 3W15C 5ICTA 3HHGA 2Z8EA 3KFMA 4BLAA 2RF1A 4ESWA 3SERA 1B5IA 4TLMB 2DE3A 1EZPA 3FVKA 4HW8A 3K6VA 3TZAA 4R6KA 1SW1A 4H5FA 1WDNA 4WKMA 4R72A 1AL3A 4IB2A 5M2VA 2ESNA 2QS4A 2Q8JA 1P1OA 1B05A 2REJA 5EHMA 2O6AA 4OTEA 1SYIA 3RNNA 1LSTA 1BIYA 1B1HA 3SEYA 3IO4A 4BDMA 3ECRA 1MY4A 1YCJA 1IEJA 2DWAA 1MRPA 1MQJA 3PPNA 1JW4A 3O2AA 4QSCA 3KG2A 4JSOA 1II5A 4FECA 3IX1A 1JW1A 3E9XA 2XXUA 3C4MA 5I2KB 1H76A 4F29A 4ECFA 4OXVA 2H98A 4JSDA 1DMBA 2THIA 4OYVA 3JZJA 4ISUA 4YU0A 4DLDA 3W9WA 1VFEA 3KEIA 3TTRA 1UTBA 1UTHA 2OZZA 5DVFA 3KN8A 1LAFE 2F34A 2P1SA 3T9HB 4ESXA 1MDP1 2Z8FA 4H8IA 5J1DA 2ALUA 3N6TA 5DEXA 5KDTA 4U21A 4F39A 3RUMA 1MPDA 4MFIA 3S2VA 4H8JA 3DP6A 3EF7A 4RA1A 3T66A 3CFLA 2H25A 4M4GA 2PX1A 4NEDA 4QSEA 3FVGA 2R6GE 4UACA 4G68A 3F11A 4PQJA 4YKPA 1B3GA 4IY6A 2F6PA 4OHNA 1QKAA 4QF9A 2DVZA 2YLNA 2G29A 1S9TA 4F3BA 4UA8A 2AIXA 3R26A 4G4PA 4MLQA 3H03A 4LATA 4OENA 1RKMA 3KSJA 3MPKA 4KYEA 1QUIA 4C1TA 3Q26A 1NKXA 4OFJA 3TELA 5FTHA 2ZNTA 4N07A 4KQPA 2D5WA 4YZZA 1URDA 5L9OA 3MAMA 1LCTA 1P1WA 1FTKA 1CB6A 2QSXA 2XXWA 3OSQA 4G2ZA 3MQ9A 2V84A 3PUZE 3CSGA 1SDXA 3M3KA 4EUOA 2IEEA 5FHMA 4F22A 4IO2A 3RT8A 4ZE9A 1A99A 2VP1A 3O9PA 3L6GA 5FHNA 4WEPA 3FXQA 4I62A 3GBAA 1O63A 2QRYA 3MVWA 3D4CA 4JDFA 5EYFA 4F31B 1GV8A 1B46A 4DCXA 4OWDA 3RT6B 3ZSFA 1B7UA 2ONRA 1ATGA 3IJOB 2GRVA 4KPTA 2XXIA 2O68A 4FAJA 1TFAA 4ZECA 3DP8A 1HSJA 5ITPA 4F1UA 3IO6A 2Y7WA 3TAJA 3KZGA 2PBWA 3U92A 3VLVA 3FV1A 3GBBA 1LAXA 2DP8A 1MXZA 3C31A 3SDFA 4GQOA 2Y84A 3W9VA 1I69A 4LONB 5AA2D 1L5TA 4EXKA 3Q25A 2I49A 3DLNA 2RKMA 2DSFA 1P1QA 3T22A 2QL3A 4TOZA 3KOTA 1LFIA 5TPAA 1NNPA 4IO5A 5B70A 1BKAA 3OO6A 1D9YA 3PV0E 3KN7A 1SI0A 1IZ1A 4DDDA 3TTLA 2DXRA 2UVHA 2Z22A 4FJPA 3BBRA 3JYRA 3S9MC 3QXMA 4F19A 5JEIA 1NNKA 2AL4A 1GTKA 3I6VA 1YPNA 3DP4A 5ELVA 1NNFA 3HSTA 2Y7IA 4DIGA 3C9HA 3WAFA 4ZEBA 1OLCA 5H8QA 3PD9A 1QUKA 1Y4TA 1WVJA 3K0VA 3RPWA 4OFOA 3OXNA 1MQIA 4K3FA 4XXUA 5KDTB 5BUUA 4PFWA 1XHYA 1FQDA 2CMOA 1Y3QA 4ONYA 4ELOA 5AA1A 1FCKA 3T9XB 1QULA 3O66A 4LQ2A 1ZMGA 4NWDA 2KLFA 4ZS9A 2AL5A 3HN0A 4R6YA 4OEVA 1NMUA 4QFLA 1YAEA 4X48A 1M5DA 2VGQA 4GL8A 3VXBA 1LBCA 5CMCA 3QSLA 1A8FA 2BJJX 1R9QA 3H7MA 3CFXA 1B3LA 5I57A 2ANJA 1VFDA 4GWOA 3RQTA 4R9FA 2X7PA 1FTLA 2PYYA 4U23A 3G7WA 1PBQA 2VHAA 2PT1A 4YMAA 1ZKBA 3TMGA 4KR5A 5CC2A 4NF8A 5CMBA 1N7WA 4C1UA 2B3FA 3TUSA 3Q28A 5IKBA 1POTA 2RC9A 3UA8A 3VDFA 1WODA 1GVCA 3IOVA 1US5A 2IA4A 3R7XA 4QHQA 3PPPA 1J1NA 3QAXA 2I4BA 2ZYKA 3IJXB 3A3CA 2F8DA 3O6IA 1B4HA 4OZ9A 3H4ZA 3G3HA 1I6QA 2UVIA 3T9UA 1UIVA 2DOJA 2O7UA 1A8EA 2CZLA 3K01A 1MDQA 3TCFA 2O51A 4WEDA 5A5XA 3UK4A 3K6WA 1SVXB 1M5CA 4FEBA 3KBRA 1FQFA 1P99A 3SETA 1Y3PA 5JK4A 1MXYA 2DWIA 1IITA 3OO7A 4R75A 4FATA 1DPPA 4IO7A 2VOZA 1XVYA 3PUWE 1P1NA 4AB6A 5H8HA 3HV1A 2X26A 4YB6A 2ZNSA 1B5JA 3VE1B 1XC1A 5ITOA 1XVXA 4I9DA 3V89B 3PUYE 5HM4B 2ONKE 3H6VA 3N94A 1MY0A 1JNFA 2HZLA 4HCYA 2REGA 4AB5A 1FQBA 2VD3A 4RK9A 3HPIA 1SBPA 4BDNA 1O7TA 3H6TA 3Q29A 3RTFB 1SYHA 1TWYA 3C36A 3MVZA 5AA4B 1B0HA 3GXAA 4XKNA 4PETA 2O1MA 3FJ7A 5H8NA 4F2QA 2DQVA 2HEUA 2HCAA 4LUBA 4GVOA 4G77A 1NL5A 2HFBA 2Y7PA 4Z7EA 1MXXA 1B7HA 1SW2A 1Y1ZA 4NF6B 2GFEA 4Q5TA 2FYIA 3FIRA 3HO7A 2AYSA 3ODBA 1A54A 4GFRA 3IK6B 2NXOA 5HPQA 4RPOA 4F2OA 3MBPA 3ZKLA 2YJPA 4RY1A 4Z0IA 2F97A 4R2FA 3VXCA 2UVJA 3U94A 3FJGA 5JTYA 5DVJA 3K02A 1EU8A 3LSWA 1B7ZA 4LA9A 3SEWA 1D3KA 3DM0A 2UXAA 5I57B 1N0TA 4DXBA 3VVFA 3KN3A 5I58B 1F9BA 4H1XA 3O28A 1S7YA 2HAVA 3K6UA 3TYHA 4RK2A 1EZ9A 2A5TA 4DXUA 1ZBMA 5H8SA 1M5BA 4NF8B 1EZOA 4JB7A 2XX9A 1B5HA 1POY1 1MH4A 4EF2A 2O1LA 2HXWA 2NVUB 3CIJA 2XXVA 4XTCQ 4U2RA 4OEUA 1B2HA 2HQ0A 2OBGA 1OQHA 4QRZA 4R73A 5TP9A 4POWA 1B1XA 3M3FA 4LZ5A 1N04A 4ZEIA 1A7LA 2XXXA 2QJEA 4H6DA 4PFUA 5DYHA 1FTOA 3MUQA 1H45A 1DOTA 4R74A 3O6GA 1IXIA 1MXVA 3USDA 3N5LA 4R9GA 4THIA 3G3FA 4H67A 3ZS6A 1B40A 3FUZA 3CG3A 4EQ7A 4X9TA 2LAOA 5EHSA 3L6HA 1Y9UA 3N6UA 4YB5A 4BDQA 1OQGA 1AMFA 2NOOA 3OMBA 1TT1A 2GH9A 4OVJA 1CE2A 2F7CA 4XKPA 1MM6A 1FQEA 1LLSA 4HTGA 2F36A 3LR1A 3U8QA 4BDLA 5AE4A 4DXCA 3RLFE 4NF5A 4KD5A 3IL1B 3H3GA 2O7IA 2DWHA 4KHZE 3H6UA 1LB9A 3H06B 3PD8A 4F1YA 3PPOA 4F3GA 1B6HA 2XD3A 1GGGA 1ZTYA 1PC3A 4XIGQ 3CR9A 2F5XA 3V5AA 3OD7A 3OEKA 3IB1A 1JEUA 3PPRA 4TQUQ 4ND9A 1MY3A 5CBRA 3FXRA 4RXLA 2H5YA 5I56A 2F78A 4PFYA 5CRYA 5B7DA 4F3SA 1B9JA 3LBSA 2W7YA 4WXJA 1QUJA 4U1ZA 3BFTA 4QFPA 3MZ1A 3E3KA 2DS9A 4ELRA 1ZJLA 3IAZA 4E0XA 3T9VA 1ZIUA 4QFNA 1S50A 2R9JA 1LAHE 3U1OA 3EHUA 1Y4CA 3MZBA 1JETA 5TU0A 3UIFA 3IORA 4OETA 5I59A 3TEPA 3HHFA 4EQBA 3FXUA 4ZE8A 1UTBB 1UTHB 3PUVE 4YAHX 2I0CA 1M5FA 2Y7RA 3MVYA 4Q0CA 5JTYB 3GLBA 3UORA 1UQWA 5I2NA 3FVOA 2F6GA 1MPBA 4L17A 5AA3A 2DYXA 3EN3A 5DEXB 3TTKA 4I1DA 2OK2A 4M1VA 1N84A 5HBCA 3SEVA 1LBBA 5I2KA 2PT2A 4MLVA 1SW4A 3OO8A 4HS7A 2A5TB 3K1PA 3QIMA 3PMVA 2X7QA 4G68B 3IB0A 3ILUB 3OOAA 4MBPA 4QFKA 2I58A 1OVTA 3MPLA 2ZYOA 4U4SA 5TP9B 2RCBA 3UGWA 1XT8A 3C34A 2ZNUA 1IQ7A 3B7DA 2E0SA 3SEXA 4YKJA 1FW0A 1H3DA 5FTIA 3FVNA 3PMXA 3ILTB 3TODA 1SQYA 4HCWA 3O97A 4PE5B 5DT6A 4U1OA 3DELB 5F7VA 3TCHA 2Z8DA 4GF8A 4U22A 4NTLA 1VE4A 1SW5A 1DPEA 4YB7A 3OELA 5AA2A 4N6PA 4LZ7A 4OQOA 3VLUA 3M8UA 1O64A 3U72A 2QS1A 2V3UA 4F1VA 3Q27A 4TLLB 4KI0E 2DWJA 3BFUA 1B4ZA 1B58A 2F7AA 3KSXA 4G68C 1D9VA 4NF5B 2FA7A 4E0WA 2DXYA 2F7BA 4ZEFA 3K00A 4BDOA 1SD3A 3CRBA 2V93A 1EH3A 2OJTA 1B32A 1BTJA 1XOCA 3RTWB 1JW5A 4RNSA 1MS7A 4O3BA 4OMBA 2Q2CA 2QS3A 3P7IA 2I4CA 4FEDA 3S9EA 3VV5A 2O84X 1MQHA 1MXWA 3RY3A 4ZZAA 4PP0A 4YMBA 1MQGA 1MY1A 2B65A 2XX8A 5I56B 4JBZA 3S9NC 1JVYA 2P0SA 3TQLA 2Q9TA 3LC8A 4OERA 3R6UA 3PPQA 1MY2A 3WAEA 1OIBA 2QS2A 3IOWA 3KJTA 4IO3A 3PGFA 1A55A 5CMMA 2R71A 5TPAB 1BP5A 1LFGA 1LB8A 3T93B 1IIWA 2ZXTA 2H9BA 3N26A 4XKRA 3KJ7A 2UYEA 2XXTA 2NWJA 1Z7NE 3S4UA 1PB8A 3VVEA 2PVUA 4GD5A 1B3FA 1B0LA 5I59B 2V3QA 3A09A 3EQ1A 2ABHA 4KCDA 3V83A 3K4UA 1XS5A 2P2AA 4KYSA 1Y1MA 3QK6A 3B6TA 1H44A 1N7XA 3MJNA 3OSRA 5DVIA 5I2NB 5H8QB 3G3KA 4G8MA 5L9MA 3I3VA 3PMWA 2V25A 1KWHA 4RJZA 4JXIA 1MQDA 4G8NA 4AQ4A 2ZMBA 1UIUA 4GLIA 4G8HA 3TCGA 1MM7A 1MG1A 3TFLA 1FTMA 1URGA 1USYE 3IB2A 2G93A 2QMWA 4IGRA 4POXA 4Q8RA 3TQWA 2I3VA 4ZDMA 3TKDA 5CMKA 4Q30B 1I6AA 2UVGA 1HSLA 3O29A 3V8XB 4JWXA 3TTNA 2WKYA 1USYH 5K2YA 3VVDA 5ISUA 3RGYA 4X1DA 4DZ1A 4ZZEA 1SI1A 2O69A 4QFOA 1PDAA 4NF4A 2H99A 2Q2AA 3IOUA 3LSFB 4DE8A 4R6HA 5CBSA 1N3XA 2RC8A 2RC7A 2ZYNA 4QSDA 4JWYA 4O3AA 5KCJA 2RCAA 1TFDA 4DCYA 4YICA 3K1MA 4NWCA 1ZU0A 1VSOA 4OFLA 1R6ZA 3MP8A 5AA2B 4R2BA 1LCFA 5H8FA 4YKIA 3MZ9A 4GIZA 4GL0A 2V3TA 1PEBA 4H5GA 3AXFA 3EPEA 4F18A 2QMXA 5DTBA 1Y20A 3VLWA 2Y7KA 4ZEDA 3A3UA 3M3LA 3PUXE 4MH5A 4KYDA 4LQ5A 5A5XB 1IXGA 4PFTA 4F3PA 4EXLA 1URSA 5L9SA 4IGTA 4RYAA 1D4NA 1DSNA 4P0IA 1DTGA 1PBPA 4MF3A 3FD3A 3GZGA 3LUYA 4BDRA 5H8HB 3G3IA 2Q89A 1M5EA 1MPCA 1JEVA 4ELPA 5KZTA 3BKIB 1DTZA 2GHAA 4EF1A 1B3EA 1H43A 1QKBA 4XKQA 4NMYA 1RYXA 3IR1A 3FGSA 3MVXA 4YKKA 1VR5A 3EHTA 4FE8A 1YTVA 1MH3A 2DE2A 3D4GA 4GXSB 2ONSA 4C0RA 1MXUA 5L8DA 1P1UA 1A40A 2XD2A 4N13A 3G3GA 5BWJA 1Z7ME 2FNCA 2DE4A 3MP6A 3T96B 5H8NB 3OEMA 5CM6A 1JQFA 1I6BA 1ELJA 3K6XA 5FHOA 4JWOA 2Q88A 1FQAA 2YPNA 1PB7A 5LOMA 1OMPA 3CI8A 2F35A 1Q1KA 4NE4A 2I3WA 4I8CA 1QVSA 1US4A 3B6WA 3QUJA 1FQCA 1HSEA 3O6HA 4KFQA 1N76A 2M8CA 3B6QA 1OVBA 3CVGA 1LFHA 2I0BA 2HZKA 2XXPA 2RINA 1LAGE 3ONMA 4IO4A 3C35A 4H65A 3UP9A 1R1NA 1Q35A 3FATA 3TPAA 5AA4A 3KOSA 4GOTA 1IXHA 1BLFA 4OESA 4X1BA 1T0KA 1R9LA 5IAIA 4ELQA 1NNTA 4EDPA 4U4XA 2D21A 4O3CA 4FIMA 4GXAA 3E4RA 3CFZA 4NF6A 2HAUA 3FV2A 3SEUA 3QYTA 3THIA 2OWTA 4NF4B 3JV9A 2H4IA 1IUDA 4RPNA 1LGBC 2Z23A 1AH5A 4LP2B 3SKPA 1AOVA 2QPQA 5KCJB 1RYOA 2DVCA 2E1SA 2XXQA 4FORA 3EHSA 2GHBA 1JVXA 3QUFA 2D3IA 2B3BA 1NH7A 5H8FB 2OCUA 2XX7A 2XXHA 3K2DA 5CI5A 5I58A 1OLAA 1FTJA 2PMSA 3LSXA 3MC2A 1NH8A 3LSLA 3RN8A 3E13X 3FZVA 3I5OA 2UYFA 1B3HA 3U93A 2I48A 3IOTA 3MWBA 5I84A 1QW0A 3OENA 4IO6A 3CSBA 3FASA 3G3JA 4H0WA 3TDJA 1ANFA 2I6EA 2XXYA 5ICQA 4EQ9A 1NFTA 1QJMA 2OWSA 2VD2A 3OO9A 3FJMA 3UN6A 1AIVA 2A5SA 4P11A 2ZYMA 2XHDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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