1FTKA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2i) in complex with kainate at 1.6 a resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
262
structure length
250
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 78
structure length 250
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA01
2QJEA 3FATA 5I56A 4ZEKA 2I6EA 3C34A 4OENA 1UTBB 2I0CA 4GFRA 3MZ1A 1OQGA 2O51A 1TWYA 4IGTA 4NTLA 1WODA 2O84X 3H6TA 3HV1A 1R9LA 3PPOA 4F3BA 1XT8A 3KBRA 1T0KA 1XC1A 3U92A 1EZOA 2I0BA 3K1NA 1ZJLA 3QYTA 1ZU0A 1N76A 5DVJA 3OXNA 3HN0A 4PFWA 2F35A 1FTOA 5I2NB 2RC9A 5H8QA 3A09A 5KDTA 2HZKA 2XXTA 2DXYA 4DXBA 4XXUA 4HS7A 3M3FA 4KCDA 2HZLA 4KD5A 2QMWA 3KN8A 4F1YA 1O63A 1MXVA 4PP0A 4GWOA 3I5OA 4Z0IA 4YICA 3W9VA 4RNSA 4E0WA 3GBBA 2DWJA 3IK6B 1QUJA 1YCJA 1LB9A 1XOCA 2DE2A 4LATA 3MP6A 3CRBA 1MY3A 4ZE9A 4ZZAA 4POWA 3ILTB 2DWIA 4QFPA 3N26A 1N7WA 3RLFE 5A5XB 2F7AA 4U2RA 4OVJA 2XXVA 3IJOB 5AE4A 2XXRA 2FNCA 4NE4A 4EQBA 5I57A 1URGA 2X26A 1PEBA 4AB6A 1YPNA 4G8MA 1S7YA 5HPQA 5I58A 4MBPA 3RT8A 3SKPA 5CMBA 3USDA 4MF3A 3MVZA 2E1SA 2UXAA 4YAHX 4LVQA 4LA9A 1H76A 4LZ8A 4AQ4A 3FXUA 3F11A 3M8UA 4NF5B 1GVCA 1J1NA 4HCWA 4QHQA 3T9UA 5AA2A 1VSOA 4H8JA 3G3JA 3DP6A 1B3FA 5L8DA 3FGSA 1UTBA 2V3QA 1B32A 1AMFA 1GV8A 3FVGA 1AL3A 2BJJX 3PPRA 4RK9A 3C36A 3KOTA 3C33A 2NWJA 3TCFA 4OXVA 4NMYA 1VFEA 3RN8A 2GHAA 4I62A 1LAHE 1WDNA 4OWDA 5K2YA 3TTLA 3FIRA 1B3LA 3VXCA 4TQUQ 2P0SA 4EXKA 1SW2A 4F22A 4NF4B 2I3WA 4QRZA 1MXUA 4NWCA 4FEDA 1VE4A 3P7IA 1MQHA 4H6DA 3EF7A 1OLAA 3PUYE 3O6GA 1JNFA 1IEJA 2OJTA 4NWDA 3PU5A 4PFTA 2F5XA 1R1NA 1PB9A 3KN7A 4F29A 2M8CA 4DZ1A 3UK4A 5L9OA 3SETA 4Q0CA 2PT2A 4PQJA 1MQDA 1P1WA 4TLLB 5A5XA 4OTEA 3T22A 1F9BA 1LBCA 3Q28A 3K1PA 3DP4A 5CC2A 4F1VA 3EHSA 2Y7KA 5EHMA 1USYH 4BDQA 3MWBA 2UVIA 3OSRA 3T96B 4GXAA 3ONMA 1B1HA 1FTJA 3V83A 3O9PA 4EDPA 1CE2A 1BIYA 3K6VA 2A5SA 4UACA 2OCUA 3S9NC 3H03A 2Q9TA 3IAZA 3ECRA 4I1DA 4DXUA 2VOZA 3KN3A 2UVJA 4DXCA 3I3VA 4LP2B 5I59A 4F31B 5FHNA 4KYDA 3H6UA 2Y84A 2DOJA 5IKBA 3O2AA 1NKXA 1P1UA 1R6ZA 1NL5A 1ZIUA 3OEKA 1N04A 4WXJA 2O68A 1US4A 3RQTA 5I2KA 1TFDA 3JV9A 5AA2D 3PV0E 4OETA 4R74A 4U1ZA 3LSFB 4IO7A 1UTHB 1QUKA 5JTYB 1MRPA 4NF6B 2V93A 1WVJA 1N84A 1QVSA 5CBSA 5DEXB 3GZGA 3LC8A 1SD3A 3MP8A 3IORA 3T93B 2E0SA 3VLWA 4G77A 3V89B 1A7LA 2H98A 4OQOA 3PGFA 2UVHA 1A99A 2H99A 3VVEA 3FXQA 2R6GE 5CMCA 3OO8A 4M4GA 2HCAA 1UIUA 3EHUA 5FHOA 1HSJA 3IOTA 4R2FA 1II5A 2R71A 3U94A 3TEPA 2XX8A 1MY0A 4ELOA 1H45A 3OELA 3T9HB 4BDNA 4IY5A 5EYFA 1MG1A 4YKIA 1MPCA 3M3KA 4C0RA 4KYEA 2F6PA 3TTNA 4GVOA 2IEEA 3KGCA 1ATGA 1OVBA 3OMBA 2NOOA 1UQWA 5H8SA 5DTBA 4IO3A 1IUDA 4X9TA 1IXIA 4X1DA 3HPIA 2GFEA 3S2VA 3MAMA 4O3BA 3TMGA 4X48A 2XD2A 4GLIA 3CFZA 3U1OA 5J1DA 2B65A 4OESA 2I49A 4MFIA 3PPNA 4ZEDA 5HM4B 2DVZA 4RJZA 2I4BA 4IB2A 1MXYA 4IO5A 1SDXA 5ISUA 5KCJB 4ZDMA 4ZS9A 3K6XA 4P11A 3SERA 1LFHA 2YLNA 3ODBA 3EQ1A 3MW0A 5CBRA 4QFOA 3QXMA 3R6UA 3KSXA 1NFTA 4LZ5A 4G68B 3G3KA 2RF1A 1SVXB 4ONYA 2G29A 3GLBA 1UTHA 1B5HA 4NF6A 4OHNA 3TQLA 3TPAA 3QK6A 4YKJA 4F2QA 3FVNA 4ISUA 4K3FA 3K4UA 4ZEFA 1ZMGA 3W9WA 1B9JA 2QS2A 1AOVA 1DOTA 4JSDA 2QSXA 5TPAB 1I6AA 3TDJA 3S9EA 3T66A 3K6UA 4F39A 3C4MA 2PMSA 3GXAA 3R26A 3A3UA 2Y7RA 2RC7A 1PBQA 1USYE 4YB7A 2B3FA 4FE8A 1NNKA 4GIZA 3ZKLA 4DCXA 2DP8A 2YJPA 3MVWA 2Z23A 1JVXA 1FQCA 4FIMA 5FTIA 3LBSA 3O6HA 2UYFA 4YMAA 1B58A 3G7WA 4H67A 4Q30B 3JYRA 4ELRA 2REGA 1NMUA 1B52A 2ZYMA 3L6HA 1B0LA 3PUVE 3A3CA 2QL3A 4RA1A 4POXA 4BDMA 2DVCA 3QSLA 4NF8B 3V5AA 1QJMA 1LCFA 2PYYA 2V3UA 1MPBA 3RY3A 2RCAA 1B0HA 3W15C 1VFDA 5AA4B 1SQYA 2DSFA 4YKPA 3FASA 3RGYA 1A54A 3THIA 3Q25A 4RPOA 5DT6A 1B5IA 3TKDA 1B4HA 3FXRA 3B7DA 2OK2A 5KCJA 1IITA 1I6BA 3IR1A 2DQVA 3KJTA 3ZKKA 1AH5A 1QUIA 4KCCA 5M2VA 4H5GA 2Q88A 4ZZEA 4QF9A 2NUVA 1ZLQA 2XX7A 2V3TA 3BKIB 1GGGA 4G68A 1MM6A 1Y4CA 1JW1A 3IOUA 2GH9A 3N94A 1BKAA 1MXZA 1MDP1 2I4CA 3RUMA 1MH3A 4NEDA 2OWSA 2QMXA 4F2OA 1I6QA 4ESXA 3FJGA 3E9XA 1SYIA 2F6GA 4JDFA 1SW4A 1POY1 1JW5A 5I2NA 1UIVA 1MQGA 3VLUA 4F19A 2XXPA 2D5WA 2DS9A 5KZTA 4Q8RA 1DPEA 3FV1A 3MVYA 3C35A 1Q35A 1FQFA 1OLCA 2XXYA 3H6WA 2O7UA 1NNPA 2LAOA 1N3XA 3QIMA 5H8HB 4MLQA 1XHYA 3TQWA 2H9BA 3VVDA 1B1XA 1PC3A 3M3LA 5FHMA 1B7UA 1JEVA 4M1VA 2QS1A 3ILUB 2Q2CA 1ANFA 5JEIA 4C1TA 3LSWA 1XVYA 4NF8A 2F78A 4THIA 3CR9A 3FVOA 3LUYA 3KOSA 3FUZA 4UA8A 2OBGA 4KPTA 1B7HA 1GR2A 5AA4A 1ZKBA 3FD3A 1FTMA 3ZSFA 3V8XB 4U4SA 2XXHA 4EF1A 1D3KA 1IXHA 1SW5A 4YZZA 1ZTYA 3CFLA 3TODA 1FQEA 1MY1A 3MC2A 3EN3A 4H5FA 4N07A 3O29A 1EZ9A 4R6HA 1B6HA 1LCTA 4U22A 5CI5A 4Q5TA 2PVUA 1DTZA 2X7PA 4GL0A 4JB7A 2OWTA 3LSXA 3DLNA 4NF5A 1MY4A 5DYHA 4ECFA 3PD9A 2CMOA 3IO4A 1JW4A 3IB2A 2AYSA 3PMWA 1QKAA 3BFUA 5H8FB 3OSQA 2RINA 1FTKA 3CVGA 2ONSA 1JEUA 1MQIA 4OERA 4QFKA 3D4GA 1NNTA 3CSBA 1O7TA 1D4NA 5ICQA 2QS3A 1H3DA 3JZJA 3C31A 3QAXA 1OVTA 4OMBA 1YAEA 3MZBA 4R75A 5I56B 3U72A 4IY6A 2XXWA 4AB5A 2ZYKA 1MXWA 2QRYA 1IXGA 3TCHA 3OOAA 4U21A 5TP9B 4NF4A 2XX9A 3K1MA 5JK4A 2Y7PA 4OFOA 3TZAA 1B7ZA 3LSLA 1IZ1A 3D4CA 2UYEA 5LOMA 3U93A 4LQ2A 2GRVA 2PBWA 1B4ZA 1Y20A 4QFLA 4OFLA 3IOVA 3RTFB 5F1QA 3H7MA 3SEUA 1QULA 2OLBA 2YPNA 1PB7A 3B6WA 1JVYA 5H8QB 2ZYOA 4O3AA 4H0WA 3G3IA 3KEIA 2V84A 4R9GA 1ELJA 4IO4A 2G93A 2VHAA 4QFNA 5I84A 3N6UA 3VE1B 3FZVA 3IO6A 2F34A 5BWJA 2WKYA 1MQJA 1NH7A 4E0XA 3VDFA 4FAJA 3H4ZA 1LBBA 3G3FA 4WEDA 5DVFA 4GF8A 3RPWA 3PPPA 3E3KA 1CB6A 4G68C 2P1SA 4C1UA 4G8HA 1BP5A 5I57B 3OO7A 2O7IA 5AA1A 2Q2AA 1MM7A 2PT1A 3CIJA 2XXIA 1SYHA 5ICTA 5H8FA 1Q1KA 1VR5A 4U1OA 1MH4A 3KG2A 3OEMA 4OYVA 1LFIA 1Y4TA 1M5BA 4GD5A 1MXXA 5K2XA 3OO9A 3VXBA 2ZNTA 2H4IA 4F3SA 1EU8A 3C32A 4WEPA 1FQDA 5JTYA 2RCBA 2FA7A 2Y7WA 5AA2B 3H3GA 4R73A 2NVUB 5DEXA 1B2HA 1P1NA 2VGQA 3K01A 4BDRA 4BDLA 2X7QA 2D3IA 3PMXA 5TP9A 1FTLA 3MJNA 2H25A 1OMPA 4ZE8A 3DP8A 3SEXA 1US5A 4JBZA 1B3HA 3B6TA 1IIWA 2Z8FA 4R6KA 1JQFA 1NNFA 4GOTA 2RKMA 2DE4A 3Q26A 3K6WA 4U4XA 3VV5A 1P1OA 4F3GA 3PMVA 2DWHA 3FVKA 4GQOA 4XKQA 4F1UA 3E13X 2AL4A 3RTWB 1P99A 2F97A 4F18A 3TUSA 2VP1A 1URSA 4XKRA 1TXFA 2F8DA 3PPQA 2VD2A 4H8IA 4FATA 4ZEBA 1TFAA 1M5DA 3Q29A 2XXXA 4JWOA 3OO6A 1DSNA 2O6AA 3K02A 4GRKA 4EQ7A 1MDQA 2ONKE 4YB5A 2F7CA 5ELVA 3PUWE 2XHDA 1A55A 3TFLA 4PFYA 3CG1A 4OEVA 2HQ0A 4RYAA 1I69A 3VFJA 4PETA 3TAJA 4DLDA 3HSTA 3FJ7A 3UN6A 1PDAA 3K2DA 4YMBA 3MPLA 3B6QA 2VD3A 4OFJA 2THIA 1A8EA 3S9MC 4P0GA 1SW1A 1FQBA 3PUXE 2OZZA 1B05A 5AA3A 1DPPA 4FECA 1PB8A 5IAIA 1DMBA 4ZECA 4FJPA 4DCYA 4ELQA 4PFUA 3OD7A 3MZ9A 2AIXA 1M5FA 2W7YA 4XTCQ 3K0VA 4JXIA 5CMKA 1LB8A 3C9HA 4OZ9A 1D9VA 5I59B 5ITOA 1O64A 2ANJA 5L9SA 5H8NB 3DM0A 2A5TB 4LUBA 1JETA 4LONB 4R72A 4KYSA 3FJMA 1ZBMA 1Y1MA 4XKPA 2ZNUA 5TPAA 1SBPA 3UGWA 2F7BA 3EPEA 4G2ZA 2FYIA 3T9XB 1A8FA 1RKMA 4IO2A 2Z22A 4DE8A 5I2KB 2UVGA 2HAVA 4BLAA 1Y9UA 2DE3A 1FW0A 2D21A 3O6IA 4YKKA 2DXRA 4JWYA 2Z8EA 3QUFA 1RYXA 3L6GA 3RNNA 1H43A 4R2BA 2O1LA 1LGBC 2H5YA 2KLFA 1LSTA 4RXLA 4ESWA 3WAEA 1B5JA 4LZ7A 5CM6A 3KFMA 4EQ9A 3MUQA 3CG3A 4X1BA 4R6YA 3O97A 4OEUA 4GL8A 2NXOA 3IB0A 1Y3QA 2O1MA 2I48A 3SESA 4DIGA 2F36A 5FTHA 3U8QA 3WAFA 4JWXA 4BDOA 4GXSB 4HTGA 3TYHA 1LAFE 3K00A 3MQ9A 3MBPA 1BTJA 3HCQA 3AXFA 3SEVA 3S9LC 1MPDA 2DWAA 4EF2A 3EHTA 4KR5A 3H6VA 1SI1A 4DDDA 3N5LA 4I8CA 3TELA 1B3GA 4EXLA 4N6PA 1Z7NE 5F7VA 3G3GA 3VLVA 3QUJA 2HXWA 2GHBA 5L9MA 3GBAA 4FEBA 3CFXA 2QS4A 1MY2A 2ONRA 3O66A 4ELPA 4G4PA 3T9VA 1FQAA 3KJ7A 3TTMA 3BBRA 1Y1ZA 1HSLA 3LR1A 4I9DA 4LQ5A 5B70A 1POTA 3DELB 3FV2A 3OENA 4QSEA 2Y7IA 3HO7A 3S4UA 4WKMA 1QKBA 1GTKA 2I3VA 4KFQA 4QSDA 3UP9A 1Y3NA 5ITPA 5H8NA 4ND9A 2XXQA 3IX1A 4FORA 4XKNA 2A5TA 4G8NA 1L5TA 3UIFA 1B51A 2ZXTA 3RT6B 2HFBA 3UORA 4KHZE 3IOWA 2ABHA 2QPQA 3BFTA 4H1XA 4PE5B 2DYXA 2XD3A 4TLMB 4N13A 1EZPA 4YB6A 1QW0A 5EHSA 1A40A 4RPNA 1TT1A 2IA4A 2Q89A 3KZGA 2O69A 5HBCA 2ESNA 1M5EA 5H8HA 1S50A 2AL5A 3MP1A 5TU0A 1RYOA 1LLSA 4KI0E 3R7XA 4KQPA 3N6TA 3MPKA 3SEYA 1XVXA 4F3PA 3IJXB 1XS5A 3E4RA 1N7XA 4R9FA 4XIGQ 1URDA 2V25A 1KWHA 4P0IA 2ZYNA 4IGRA 2I58A 1Y3PA 2XXUA 2R9JA 3UA8A 2REJA 1N3WA 4YU0A 5KDTB 3TTRA 5CMMA 3IL1B 1P1QA 1LAXA 4EUOA 1M5CA 4ZEIA 1HSEA 1B46A 3PD8A 2CZLA 1LAGE 2RC8A 4HCYA 4TOZA 1B3EA 3TCGA 3CSGA 5DVIA 1EH3A 3ZS6A 3G3HA 4O3CA 1LFGA 3VVFA 3HHFA 3Q27A 3TTKA 1MS7A 1IXCA 2Q8JA 2HEUA 2ZMBA 4HW8A 1R9QA 1PBPA 1OQHA 4L17A 1YTVA 4U23A 3HHGA 4Z7EA 1IQ7A 4MH5A 1B40A 3O28A 4MLVA 4RK2A 4RY1A 5I58B 3H06B 3IB1A 1S9TA 3KSJA 1NH8A 3MVXA 1FCKA 4QSCA 2HAUA 5B7DA 4JSOA 1OIBA 1H44A 4IO6A 3PUZE 3SDFA 2ALUA 1AIVA 1DTGA 1SI0A 3I6VA 2B3BA 5CRYA 1Z7ME 2ZNSA 2Z8DA 2PX1A 1N0TA 3CI8A 1BLFA 2P2AA 5BUUA 3SEWA 4H65A 1D9YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QJEA 3FATA 5I56A 4ZEKA 2I6EA 3C34A 4OENA 1UTBB 2I0CA 4GFRA 3MZ1A 1OQGA 2CZKA 2O51A 1TWYA 4IGTA 4NTLA 1WODA 2O84X 3H6TA 3HV1A 1R9LA 3PPOA 4F3BA 3U65A 1XT8A 3KBRA 1T0KA 1XC1A 3U92A 1EZOA 1NV7A 2I0BA 3K1NA 1ZJLA 3QYTA 4XF5A 1ZU0A 1N76A 1FBDA 5DVJA 3OXNA 3HN0A 2Q8MA 4PFWA 1FPBA 2F35A 1FTOA 5I2NB 2RC9A 5H8QA 2HXRA 3A09A 5KDTA 5FBPA 2HZKA 4MCOA 2XXTA 2DXYA 4DXBA 4XXUA 4I40A 4HS7A 3M3FA 4KCDA 2HZLA 4KD5A 1NUZA 2QMWA 3LV0A 3KN8A 4F1YA 1O63A 1MXVA 5ET5A 4PP0A 4GWOA 5EQAA 3CHGA 3I5OA 4Z0IA 4YICA 4NN3A 3W9VA 4O7IA 4RNSA 4E0WA 3GBBA 2DWJA 3IK6B 1QUJA 1YCJA 3KBZA 1LB9A 1XOCA 1SPIA 2DE2A 4LATA 3MP6A 3CRBA 1DBZA 1MY3A 4ZE9A 4ZZAA 4POWA 5IZ1A 3ILTB 1NUWA 4GBWA 2DWIA 4QFPA 4N15A 3N26A 4PAIA 1N7WA 3RLFE 5A5XB 2F7AA 4U2RA 4OVJA 2XXVA 5ET6A 3IJOB 5AE4A 2XXRA 2FNCA 4NE4A 4EQBA 5I57A 1URGA 2CEXA 2FVZA 2X26A 1PEBA 4AB6A 1YPNA 4G8MA 1S7YA 5HPQA 5I58A 4MBPA 2MKZA 3RT8A 3SKPA 4H46A 5CMBA 2QVRA 3USDA 4MF3A 3MVZA 2E1SA 2UXAA 4YAHX 1BK4A 4LVQA 4LA9A 1H76A 4LZ8A 4AQ4A 3FXUA 5I7IA 3F11A 1IMDA 3M8UA 4NF5B 1GVCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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