1FTKA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2i) in complex with kainate at 1.6 a resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
262
structure length
250
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 78
structure length 250
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftkA01
2DWIA 5H8QA 3HPIA 4H5FA 4YZZA 4GXSB 2DYXA 4YB6A 2F35A 1YTVA 2CMOA 4LA9A 1N7WA 2HEUA 4NF5A 3MVYA 4XKQA 4BDMA 2O84X 4F18A 2I0CA 1M5DA 4EQBA 3IJXB 5ITOA 1MQDA 3OD7A 2V3UA 3FATA 4FORA 3MP8A 4YAHX 3UK4A 3H06B 2UVJA 3T66A 3M3FA 1DPPA 3C36A 1IITA 3R7XA 1OVTA 3UIFA 4GF8A 3HO7A 5FHOA 3IOUA 1SYHA 2OJTA 5AA4B 2O1LA 1FTOA 5EHSA 5TP9B 5TPAA 2V3QA 1URGA 1D3KA 3FVOA 2Z8DA 4NWCA 2RINA 1OQGA 4XIGQ 4U2RA 3ECRA 2HZKA 4ESXA 1ATGA 5LOMA 3N5LA 5JK4A 4ZZEA 3SESA 4DLDA 4H8JA 3PPQA 5F1QA 3MWBA 5AA2B 1P1WA 3E9XA 1Z7NE 3PPOA 1MY0A 4YKKA 3FJGA 2QJEA 4RPOA 3B6WA 4HTGA 1LBBA 2DP8A 3L6HA 5CI5A 3VFJA 3K0VA 3GBBA 1MY4A 4X1DA 3PD9A 1NNKA 4OQOA 3IB0A 1JW1A 1JW5A 4O3AA 2AL4A 4OZ9A 2QL3A 3KBRA 1B5HA 1TT1A 2F7CA 3KEIA 4DE8A 3T93B 3GXAA 1FCKA 3PPPA 4QFKA 3O6HA 4N13A 1KWHA 3K6WA 3LSWA 5CBSA 3H6TA 3Q26A 4R2BA 2NUVA 4OYVA 2R9JA 5I2NA 3HHFA 3K6UA 2DE4A 1IXCA 1MQHA 1NNPA 1Y9UA 3IO6A 2O68A 2X7PA 1S7YA 4OWDA 2H98A 4Q0CA 4OERA 4BDRA 1B6HA 3R6UA 4Q5TA 4ZEFA 1RKMA 4LZ8A 3A3UA 1MY3A 4LQ2A 1PDAA 4LZ5A 4OXVA 2I48A 3MVZA 1MY1A 2Q8JA 1OMPA 4RA1A 3KG2A 4QFPA 3OELA 2H4IA 4FIMA 4AB5A 4NMYA 1WODA 3T9UA 4MH5A 1JETA 2RC9A 2F78A 2B65A 3WAFA 3QIMA 1P1OA 5A5XA 4Z0IA 4YICA 4O3BA 4XTCQ 1R6ZA 3TMGA 2REJA 1JQFA 3M3LA 3QUJA 3E3KA 4PFWA 3C4MA 3SEXA 4KHZE 2ZYMA 3VE1B 3H6VA 1ZKBA 2F7AA 2I6EA 3CSBA 1XHYA 1B5JA 5I2NB 2DWJA 3IJOB 4U1OA 2XXYA 1TFDA 5L9SA 3KSJA 4OEVA 1SBPA 2YJPA 4N6PA 4OFJA 3AXFA 4DZ1A 3K4UA 3OO8A 3HV1A 3VVEA 3TFLA 3S9LC 1A40A 2AYSA 4R2FA 2OCUA 2VP1A 1TWYA 4IGRA 2PVUA 1UTHB 1VE4A 4R6KA 2A5TA 2VGQA 5ITPA 3OEMA 4EXLA 4HCYA 3I6VA 1B7ZA 3TUSA 4FE8A 1B3EA 1MQIA 2FA7A 2F6GA 1B4HA 3GLBA 3Q25A 3RTWB 1DTZA 4U22A 3R26A 4YU0A 1USYE 1YPNA 3H7MA 5A5XB 4H5GA 3C33A 3H03A 4MFIA 4UACA 3G3GA 4UA8A 4LVQA 1XVYA 1FQDA 1AOVA 3FJMA 5JEIA 1LCFA 3PUZE 4GD5A 4ZZAA 4R9GA 3I5OA 3JV9A 3LSFB 4IO5A 3VVDA 3MBPA 3H6WA 1A8EA 4NEDA 3K1MA 3QAXA 2F5XA 2E1SA 5I57B 3VV5A 1ZMGA 2RC8A 4F3GA 2QS2A 3DELB 1DTGA 3N94A 4L17A 1Y3NA 2DXRA 1I6BA 2DSFA 2XXVA 1UIUA 4AQ4A 5ELVA 2HQ0A 4TQUQ 4QSEA 2OZZA 2QSXA 3RGYA 3SETA 1FTJA 2GRVA 2ONRA 2XX9A 3KN7A 1MQJA 3PPNA 3IB2A 3FIRA 4BDQA 2HCAA 4KYDA 1QJMA 3FD3A 4OESA 2ZNTA 3KJ7A 5EYFA 2Y7KA 1BKAA 1EZPA 3LSXA 4X1BA 1MXXA 1XVXA 4ZE9A 3FUZA 4G68C 2ANJA 1A54A 4GFRA 4YKIA 3TELA 1CB6A 4LUBA 2NXOA 3TYHA 3CFXA 4G8HA 3FXRA 4ZEIA 5DVFA 2DWHA 3M3KA 1FQBA 4JDFA 2Y7WA 4QSCA 3M8UA 4GL8A 3N26A 4C1UA 4JWYA 3QUFA 1PC3A 3OSRA 2ZMBA 3UGWA 1B5IA 1WDNA 5CC2A 4LP2B 3IOTA 3BKIB 5AA2A 4X48A 1YAEA 3DM0A 3UORA 5DVIA 2YLNA 3SEWA 3SKPA 4RY1A 1US4A 2HAUA 2UVIA 4ELOA 1LFGA 3CVGA 1H44A 5FHMA 2A5SA 4PQJA 1BIYA 2RC7A 3IOVA 5ISUA 4IGTA 1GTKA 4RPNA 5L8DA 1N76A 3KN3A 3VLVA 1F9BA 2R71A 2P2AA 4QRZA 4GVOA 1US5A 1USYH 1N7XA 4MF3A 2PT1A 3I3VA 2OWSA 4WKMA 4PE5B 3SEYA 4JB7A 2F8DA 4G8MA 2D3IA 4M1VA 5CMMA 3IAZA 2Q88A 1MPCA 4DIGA 4KI0E 4U4XA 4R72A 1MDQA 4BLAA 1MH3A 5CMKA 2XX8A 3K6XA 1JW4A 3S9MC 1CE2A 4JWXA 4EXKA 1H43A 1UQWA 2H99A 3S9EA 3TEPA 4JSOA 1S50A 3TCFA 3UA8A 4KYEA 1LB8A 4WEDA 4MLQA 1XOCA 4OENA 4R75A 1B3HA 1Y3PA 1Y4TA 5M2VA 1H76A 3K1PA 1WVJA 2Y84A 2O7UA 4IO3A 3A3CA 1PBQA 4QFOA 2NOOA 3CI8A 5CMCA 1LAGE 4R6HA 4IO7A 3TTLA 3TAJA 1IXHA 1H3DA 4G77A 1MXUA 1P1QA 2NWJA 2F7BA 3JYRA 3MAMA 4KCCA 2V93A 4H0WA 2I3VA 4YB7A 4TLMB 2AIXA 5I2KB 5ICQA 2OLBA 4RNSA 4F31B 1SQYA 1HSLA 3UP9A 3KZGA 1M5EA 3P7IA 1ZU0A 3OEKA 5CMBA 3W9WA 4NF6A 1EZ9A 1P1UA 3PMXA 1JEVA 1NFTA 3KJTA 3PMVA 5EHMA 4F3SA 4XKNA 1DPEA 1XS5A 3C9HA 1LLSA 4LQ5A 2IEEA 3FV1A 5I59A 1FQAA 2V3TA 3TCHA 3TQLA 3TTRA 3O29A 2D5WA 3HCQA 4K3FA 3QK6A 3KOSA 3K01A 4XKPA 3B7DA 1FQEA 1I6AA 5H8HA 4AB6A 1IZ1A 1UTHA 1B05A 2OBGA 1MXVA 4I62A 2R6GE 3FJ7A 4EF1A 2B3BA 3PPRA 4THIA 3N6UA 2O1MA 4ELQA 1N3WA 2QPQA 1ZTYA 4JBZA 1B32A 1HSEA 3K02A 1B2HA 4Q30B 1MXZA 4RK9A 1IIWA 1UTBB 4ZEKA 5FTHA 1SI0A 4C1TA 3G3KA 4ISUA 4WXJA 5HM4B 3DP6A 1IXIA 1P1NA 1POY1 2LAOA 2PT2A 4H65A 4ELRA 1QULA 4NF6B 1EH3A 1M5BA 1GR2A 3G7WA 2Q9TA 2X7QA 2HFBA 3ONMA 2UVGA 2AL5A 4BDLA 4F29A 2I58A 4PFYA 3VXCA 5DEXA 2P1SA 4IO2A 5I59B 4U1ZA 2XXRA 2P0SA 2GFEA 3VLWA 2BJJX 1Y20A 5I57A 2Q89A 2F36A 5H8HB 3QSLA 4H1XA 4EF2A 3IL1B 1TFAA 3D4GA 3VVFA 4DXBA 3TTMA 3G3IA 3T96B 1MG1A 1AIVA 3U72A 4LATA 2XXTA 1VFDA 3IR1A 3FVGA 4PFUA 3PUWE 2REGA 1L5TA 3U1OA 3N6TA 1RYOA 4NE4A 4TLLB 4EUOA 1ZIUA 2DVCA 2I4CA 3ZS6A 3DLNA 1O64A 5KCJA 3CIJA 1MM6A 3CSGA 1Z7ME 4U21A 1LB9A 4IO6A 1D9YA 1FQFA 3RT8A 1URSA 4MLVA 5B7DA 4GXAA 3SEVA 1SD3A 5DVJA 4GOTA 3W15C 4EQ7A 4U4SA 1MDP1 4KQPA 3THIA 4PP0A 1RYXA 3RN8A 3U8QA 1ZBMA 5I58B 3PUVE 4KD5A 1PB7A 2O6AA 3PU5A 2NVUB 3S9NC 3IK6B 1T0KA 3FXUA 3V83A 1N04A 3EHSA 3OO9A 3ZKLA 2ZYKA 1GV8A 4M4GA 2Z22A 2F34A 4NF8B 1BP5A 1AL3A 5DEXB 4LZ7A 2FYIA 3LUYA 2WKYA 3U94A 3MUQA 4JXIA 2G93A 1NNFA 2H9BA 2FNCA 1LCTA 2H5YA 2W7YA 3PUYE 5F7VA 1B51A 4WEPA 3TQWA 3IB1A 1SW2A 1LFHA 2PMSA 1ZLQA 3SDFA 3G3JA 3H3GA 4OEUA 3EHUA 1D4NA 2DVZA 4ESWA 4F22A 1B9JA 2ZYNA 3FV2A 1N3XA 3CFLA 4I1DA 4PETA 4H8IA 2HZLA 2V84A 5KCJB 3ILUB 5AE4A 3KFMA 4OFOA 1QUJA 1SW1A 2ESNA 1S9TA 2ALUA 1P99A 2XXHA 2GHAA 1XC1A 3CFZA 5CBRA 3SERA 2I0BA 4QHQA 5FHNA 5K2XA 2UVHA 4JWOA 3C35A 4FECA 4H67A 3U93A 1A99A 3MP1A 2I4BA 2E0SA 5IAIA 4LONB 3EN3A 2ONSA 2QS1A 1JVXA 4ZS9A 2Q2AA 4F2OA 3A09A 3OSQA 1MS7A 5JTYA 4GRKA 1VR5A 3MVWA 1SDXA 3EF7A 4QFNA 2Y7RA 2QS4A 3OXNA 1O7TA 2X26A 3O9PA 4TOZA 4DXCA 3U92A 1A55A 2M8CA 1PEBA 2O69A 4YKPA 2Y7PA 3IO4A 4I8CA 4ZEDA 3G3FA 2DOJA 3LR1A 1A7LA 4OETA 3PGFA 1M5FA 3RQTA 1LAFE 1Q1KA 2DE2A 3FVNA 2V25A 4G68A 3IX1A 4ECFA 3VXBA 3OOAA 3CR9A 3MP6A 5H8NA 3BBRA 1B1XA 2ONKE 3MJNA 2Y7IA 1GGGA 2YPNA 1Q35A 3CRBA 3KGCA 3JZJA 5I2KA 5FTIA 4R6YA 1M5CA 4FATA 3T9HB 1B40A 3DP4A 4DCXA 4EDPA 2UYEA 3FXQA 4F1VA 4EQ9A 3VLUA 4FEDA 2Z8EA 1B46A 3HHGA 3EPEA 5BUUA 3TZAA 3QYTA 3RLFE 3LSLA 2KLFA 4G2ZA 1H45A 3RTFB 4OMBA 5H8FA 5KZTA 3TTKA 4GL0A 5JTYB 3HSTA 4QSDA 2RCBA 4OHNA 3RPWA 1SI1A 1B7HA 2GH9A 3O6GA 3B6TA 3UN6A 1LAXA 4RXLA 4E0XA 1MH4A 4NWDA 3V8XB 1LSTA 5DYHA 2ZYOA 4YB5A 2RCAA 1JVYA 3C32A 3L6GA 1NNTA 3O97A 3K2DA 4YKJA 4G68B 3TCGA 2ABHA 4E0WA 1MPBA 1OQHA 1EU8A 3OO6A 3PV0E 3S4UA 1B7UA 5H8NB 1IQ7A 1FQCA 3Q27A 1UTBA 1DMBA 4H6DA 1PB8A 1DSNA 1B58A 5HPQA 1B0HA 1D9VA 3KSXA 5H8QB 3LC8A 4ZECA 1NH7A 2QMWA 4ZDMA 3RUMA 4R74A 3MC2A 3BFUA 3RY3A 4GWOA 1VSOA 4ZEBA 1R9QA 2D21A 4DDDA 4OVJA 4NF5B 2RF1A 1MXYA 3H6UA 3O66A 3TODA 1B52A 3TPAA 2I49A 1R1NA 4BDNA 2XXUA 1EZOA 4HCWA 3HN0A 4F1UA 1MPDA 4U23A 3FASA 3MW0A 1B3LA 1NH8A 1B0LA 3ODBA 5H8FB 4YMBA 1PBPA 3FZVA 1NMUA 1MQGA 4Q8RA 5L9OA 5BWJA 4DXUA 2ZNUA 5KDTA 4X9TA 4RYAA 5TPAB 1PB9A 2Q2CA 3BFTA 2QS3A 1FTLA 2GHBA 4F1YA 2PYYA 4MBPA 1XT8A 3DP8A 5CRYA 2UXAA 2ZXTA 1ZJLA 3MPLA 2I3WA 3RT6B 4KFQA 3ILTB 3F11A 3IORA 1I69A 3WAEA 2XXPA 5ICTA 2CZLA 1UIVA 2PX1A 4POXA 2XD2A 1IXGA 3K00A 5I56A 4F2QA 1Y1ZA 4F19A 1B3FA 1LGBC 1A8FA 1N84A 4FAJA 4GLIA 3B6QA 4OTEA 5I58A 4FEBA 5DTBA 3ZKKA 3MPKA 3G3HA 4ND9A 3MZBA 4F39A 4F3BA 1O63A 2DS9A 2VD3A 4P0IA 2HXWA 3T9XB 2VOZA 1QKBA 3Q29A 4NF8A 4NF4A 1SW5A 3FGSA 4FJPA 3KOTA 3KN8A 3OO7A 3T9VA 3ZSFA 2PBWA 4YMAA 5KDTB 3OMBA 1N0TA 2OK2A 4PFTA 5L9MA 3GZGA 1HSJA 5DT6A 1FW0A 1AMFA 1MRPA 3LBSA 1TXFA 4O3CA 2DQVA 4QFLA 3Q28A 5AA3A 5IKBA 1NKXA 4F3PA 3K1NA 4OFLA 1Y4CA 3EQ1A 3IOWA 3C34A 5AA2D 3E4RA 2XD3A 2F97A 2G29A 1QVSA 4XKRA 5CM6A 2RKMA 5I56B 1B3GA 4KR5A 3OENA 1LAHE 1BLFA 1VFEA 2Z8FA 1QUIA 4P11A 3E13X 1SW4A 1DOTA 4IY5A 1OVBA 1B4ZA 4HS7A 1LBCA 4IB2A 4P0GA 2DE3A 1ANFA 2XXXA 4RJZA 2XXQA 3O6IA 3H4ZA 3W9VA 1B1HA 1OLAA 2VD2A 4JSDA 2VHAA 4KYSA 2THIA 4NF4B 2O51A 3QXMA 4DCYA 4G8NA 3MZ9A 1GVCA 1YCJA 5H8SA 4QF9A 2QMXA 3V5AA 1Y1MA 3O28A 3D4CA 2UYFA 2QRYA 2XX7A 1QW0A 4ONYA 4NTLA 3MZ1A 5J1DA 5B70A 1POTA 1JNFA 4XXUA 1I6QA 5I84A 3USDA 3MVXA 4POWA 1Y3QA 1ELJA 3V89B 1II5A 2A5TB 1SYIA 1OIBA 5HBCA 2F6PA 5TU0A 4R73A 3PMWA 3CG1A 5AA1A 3O2AA 1IUDA 2OWTA 2B3FA 3S2VA 3T22A 2H25A 1J1NA 4R9FA 1MM7A 3TTNA 4GIZA 4GQOA 4RK2A 4I9DA 1SVXB 3TKDA 4HW8A 1NL5A 4KCDA 2XXIA 3PD8A 1MY2A 2Z23A 5K2YA 2DWAA 1R9LA 1FTMA 1LFIA 2DXYA 3K6VA 1BTJA 4C0RA 5AA4A 2HAVA 2XHDA 5TP9A 1AH5A 3FVKA 1QKAA 4IO4A 2ZNSA 3TDJA 2IA4A 2XXWA 4ZE8A 1JEUA 3MQ9A 1FTKA 4Z7EA 1QUKA 4N07A 3VDFA 3RNNA 3PUXE 4KPTA 2O7IA 3GBAA 4ELPA 3EHTA 3C31A 1IEJA 3CG3A 4G4PA 3SEUA 4IY6A 4BDOA 1OLCA 1MXWA 1URDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DWIA 5H8QA 3HPIA 4H5FA 4YZZA 4GXSB 2DYXA 4YB6A 2F35A 1YTVA 1EYIA 2CMOA 4LA9A 1N7WA 1G0HA 2HEUA 4NF5A 1EYKA 3MVYA 4XKQA 4BDMA 2O84X 4F18A 3KC0A 2I0CA 1M5DA 4EQBA 3IJXB 5ITOA 1MQDA 3OD7A 2V3UA 3FATA 4PFRA 4FORA 3MP8A 4PF8A 4YAHX 3UK4A 3H06B 2UVJA 3T66A 3M3FA 1DPPA 3C36A 1IITA 1BK4A 3R7XA 1OVTA 3UIFA 4H45A 4GF8A 3HO7A 5FHOA 3IOUA 1SYHA 2OJTA 5AA4B 2O1LA 1FTOA 5EHSA 5TP9B 5TPAA 2V3QA 1URGA 5IM2A 1D3KA 3FVOA 2Z8DA 4MMPA 4NWCA 2RINA 1OQGA 4XIGQ 4U2RA 3ECRA 2HZKA 4ESXA 1ATGA 5LOMA 3N5LA 5JK4A 4ZZEA 3SESA 4DLDA 4OA4A 4H8JA 3PPQA 5F1QA 1FBGA 3MWBA 5AA2B 1P1WA 3E9XA 1Z7NE 3PPOA 4PDDA 1MY0A 4YKKA 3FJGA 2QJEA 4RPOA 3B6WA 4N91A 4HTGA 1LBBA 2DP8A 3L6HA 5EQ8A 5CI5A 3VFJA 3K0VA 3GBBA 1MY4A 4X1DA 3PD9A 1IMDA 1NNKA 4OQOA 3IB0A 1JW1A 1JW5A 4O3AA 2AL4A 4OZ9A 2QL3A 3KBRA 1YXIA 1B5HA 1TT1A 2F7CA 3KEIA 4OANA 1FPLA 4DE8A 3T93B 3GXAA 1FCKA 3PPPA 4QFKA 5T3JA 3O6HA 4N13A 1KWHA 3K6WA 3LSWA 5CBSA 3H6TA 3Q26A 4R2BA 2NUVA 4OYVA 2R9JA 5I2NA 3HHFA 3K6UA 2DE4A 1IXCA 1MQHA 1NNPA 1Y9UA 3IO6A 4N4UA 2O68A 2X7PA 1IMAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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