4ELRA

Ferric binding protein with iron and carbonate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
SPTLTIYSGRGQSLVEPLVKQFEAETGIRVQVRYSTDAQILAALQEEGSRSPADLFWANTAGALGQASAKGLLRPLGETLLEKPIAFVPASRTWVPVTVRLRVLAYNPDRIKAEELPESLLDLPRFAREKGLVGRVGWTPTYSSFQDMVAGMIALYGEEKTREWLLAMKALAPKAYPSNPAMLDAIRAGEVDLGSTNHYYVVRFRRAGYRLGMHHFRDGDAGNLALVTGAGLLKTSKNLAAATRFLTYLLSPQAQQYFVGNIGEYPLVKGVALDPNLLPLEEALAKSPKLDLEKLPLDRALRLLRETGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of ferric binding protein A
rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords Iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein
total genus 108
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elrA02
1LFIA 1O63A 3PD9A 2RF1A 3OO6A 4EXLA 4JWOA 1MPCA 3SEVA 3DM0A 5JK4A 5F1QA 1FTKA 2O69A 2YPNA 3RQTA 2Q8JA 5AA2A 3MP6A 5H8NA 4JWXA 1N7WA 4FECA 2GH9A 3WAFA 3QYTA 5FTIA 4F1YA 1F9BA 1EZPA 1Y9UA 2F6GA 3S9MC 1PDAA 5I2KB 5IKBA 2HXWA 4OENA 3G3KA 4G68C 3LR1A 2F7CA 3LSXA 2AL5A 3TELA 2XXRA 4Q30B 1R6ZA 1SBPA 3RPWA 3RT8A 2PT2A 5DYHA 1NFTA 3JYRA 3N94A 4YB6A 1XHYA 1R9LA 2UXAA 3C4MA 4UACA 1B6HA 2XXPA 4RJZA 1MXVA 2QSXA 1A54A 3IOTA 4F1UA 4L17A 1MXUA 4IGRA 2F8DA 1MXXA 1B51A 1URGA 1M5FA 1ANFA 2Z23A 4JSOA 4G8HA 2HEUA 5I2NB 4G8MA 4TLMB 3CFLA 4N13A 2D5WA 3OXNA 2ABHA 1B3FA 4U4SA 4NE4A 3U94A 3MZ9A 4JDFA 1SI1A 3GZGA 3UK4A 3IR1A 3DP6A 4YICA 1NMUA 1XC1A 4N6PA 3VLVA 1SW5A 3QUFA 3MPLA 1I6AA 4YU0A 3UN6A 3TEPA 2ZXTA 3DLNA 4NEDA 1JW1A 4OFLA 1JVXA 2OCUA 4R9GA 5FHOA 3PUXE 2V84A 1I6QA 3CR9A 4IO5A 2ONKE 2PBWA 4OTEA 1MG1A 1D4NA 1MM6A 4ESWA 4XKPA 3FXRA 1BKAA 2UVIA 4U1OA 3B6QA 3R7XA 3FVKA 4ZE8A 2QPQA 2Z8EA 3VDFA 4PP0A 3IJXB 4H5GA 4AB6A 3V5AA 4LQ5A 4EQ9A 4KI0E 3U72A 3GXAA 4P11A 4YAHX 3MVYA 3PMVA 2A5TA 3K00A 4QFPA 1N0TA 2NWJA 2YJPA 4R72A 3N6UA 2V3UA 4DIGA 2FA7A 3IAZA 4GL0A 3G3HA 2DVZA 4OXVA 4IO7A 5I56A 4DXBA 1IEJA 2H99A 2O7IA 4IY5A 1QKAA 1WDNA 3G3IA 4NWDA 1T0KA 3C34A 2Z22A 3Q25A 4MF3A 3IOWA 3RN8A 2XHDA 4NF4B 4DCXA 3K2DA 1O64A 2F36A 4I62A 4QFLA 1MM7A 1FQAA 1B0LA 2V3TA 1GR2A 1LB9A 2UVGA 2AIXA 5I58A 4GL8A 1VFDA 3H7MA 4E0WA 1JQFA 3LBSA 2Z8DA 1N3XA 1XVXA 2VHAA 3RTFB 5KCJA 1MRPA 1B2HA 1PB7A 4GIZA 1B32A 1SD3A 3C31A 1FTMA 4RXLA 4F1VA 3V89B 4U22A 4RK2A 2XXTA 4POXA 2OBGA 4QSCA 3FJ7A 1TFAA 3A3UA 1MY2A 1ELJA 3HPIA 1NNPA 1EZOA 3K6XA 3LUYA 3Q27A 1L5TA 4LZ8A 3RGYA 3IX1A 3LSWA 2B3BA 2XXWA 3OSRA 4GOTA 3EHUA 4U21A 1PB9A 2DXRA 3TDJA 2UVHA 2DE4A 4M4GA 2XXUA 1HSLA 4QSDA 3M3KA 3PUVE 2KLFA 4I9DA 1MY4A 3IL1B 5I2KA 3TTRA 1A40A 1LAGE 2HZKA 3FATA 1Y3QA 3T9XB 4LONB 1MPDA 2HQ0A 5JEIA 5H8QA 3IOVA 4YKIA 3PMWA 3HHFA 3PMXA 1B3GA 2E1SA 2V3QA 4H1XA 4KYEA 2WKYA 1S7YA 1MH3A 5H8FA 4NF6B 1IQ7A 4AQ4A 2X26A 4ELPA 2AL4A 3RT6B 3MC2A 4ZEKA 2G29A 2QMWA 2FYIA 3PPOA 5TU0A 3P7IA 4OMBA 3T93B 2P2AA 1MY3A 1MQHA 3F11A 1MDQA 3I3VA 4QFOA 3MZ1A 3TAJA 3PUYE 1MY0A 2ANJA 2DQVA 5CMBA 2I3VA 5DTBA 2Y84A 2GFEA 3A09A 1P1QA 3OEMA 1IITA 1B1HA 3FVGA 3K02A 3T9VA 4YKKA 2D21A 3S9NC 5B7DA 1TT1A 5I57B 4PE5B 1QW0A 3FXUA 4M1VA 1B1XA 2ZYOA 1PBPA 5CI5A 4H6DA 5K2YA 2P0SA 5AA4B 1WVJA 3G3FA 5H8HA 3MZBA 1FQCA 1USYE 3EN3A 3RY3A 1FQEA 4WXJA 3R6UA 2R6GE 4JSDA 1N04A 5AE4A 4BLAA 1J1NA 3FXQA 1UTHB 3IOUA 4HCYA 3FVNA 3V8XB 4YZZA 4MFIA 2XXYA 5CMCA 1IXHA 3H6UA 1AH5A 4Q5TA 3TTMA 1S9TA 2ZYNA 3UIFA 3CFXA 1TFDA 4LZ5A 3KBRA 4QHQA 1MQJA 2DE3A 4H8JA 2HZLA 5TPAA 1XVYA 3E3KA 1SYIA 3TCGA 4P0GA 3OO8A 4FIMA 1SW1A 3O66A 4KD5A 5CC2A 2O6AA 1PBQA 3MJNA 1M5BA 1ZTYA 4OETA 3Q29A 4GRKA 1M5DA 3ZKKA 2XXIA 3H6TA 3MVWA 4JBZA 5I84A 3KG2A 1B7ZA 3FUZA 3E9XA 3OSQA 4NF4A 2QMXA 3O6IA 1LCFA 2VD3A 4IGTA 5BUUA 2CMOA 1N7XA 1MQDA 2QRYA 3CVGA 1AL3A 3WAEA 1EU8A 4OERA 3VVDA 1POY1 5H8SA 4ZE9A 4G8NA 3D4CA 3PD8A 4EXKA 4F3PA 4DLDA 1P1UA 3S9EA 5DEXB 4KFQA 1ZKBA 4LA9A 2I4BA 4ELQA 1R1NA 3RUMA 3SEWA 3E4RA 2V93A 2PYYA 3S2VA 4I8CA 2ZNUA 4PQJA 3USDA 5IAIA 1BP5A 3GLBA 2Q89A 4O3AA 2P1SA 2I0BA 5CRYA 3MPKA 4NF5A 1UQWA 1ZJLA 5K2XA 4OEUA 3DP8A 2A5SA 1POTA 4GLIA 4IO3A 4EQBA 4FE8A 1B3HA 2RC9A 4GQOA 3MAMA 3PPRA 2I3WA 4KHZE 2DE2A 4JWYA 2XXVA 4R2BA 2XD3A 1YAEA 4IY6A 5A5XB 4OYVA 4F22A 4OESA 3K1NA 4KCDA 2REGA 4THIA 1UTBB 3OOAA 2ZNSA 4U2RA 4G2ZA 2Y7RA 4G77A 5AA3A 5F7VA 4YB7A 4LVQA 2XD2A 1B7HA 5BWJA 1NNKA 2AYSA 1DSNA 3KN3A 4PFTA 3VFJA 3HHGA 5EHMA 4RNSA 2W7YA 3FJMA 4RY1A 1P1WA 3H6WA 2VOZA 4R6HA 2D3IA 1S50A 2RC8A 4ZEIA 4ELOA 2DWJA 1URSA 1Y4CA 4F2OA 3KEIA 1CE2A 4X48A 4LP2B 5FTHA 1DMBA 3TTLA 4C1TA 1JEUA 1SDXA 5TP9B 2F78A 3FJGA 1OLAA 3BBRA 2H98A 3I6VA 4OWDA 1QKBA 1GTKA 2F34A 4BDRA 3K1PA 4WEDA 3MVXA 1URDA 1QUIA 3C9HA 1ZLQA 1TXFA 1Y20A 1SI0A 3KN7A 2ONSA 1B3EA 3CG1A 3S9LC 5ISUA 4R9FA 4ONYA 3VVFA 2RCAA 3IB2A 2XX9A 1GV8A 3ODBA 4EF1A 2PMSA 1OIBA 3OELA 1HSJA 3LC8A 1IXCA 5B70A 5L9MA 4OQOA 1OVBA 4RPNA 3IB0A 5ITOA 5L9SA 4F3SA 5I57A 2X7PA 3O6GA 4F3GA 1JEVA 3A3CA 2XX7A 4R75A 3M3LA 3TQLA 4BDLA 1I6BA 5JTYB 2QS3A 3GBBA 1IIWA 4MLQA 4H5FA 2F7BA 3IB1A 4FEBA 3C36A 3BFUA 3O6HA 4H65A 3ILTB 4KPTA 3FIRA 4BDNA 2I49A 2VP1A 1VFEA 4ELRA 3TFLA 1IXGA 1TWYA 4XIGQ 5H8NB 3FVOA 1LGBC 1MS7A 5KDTA 2DYXA 2VGQA 1GVCA 4OVJA 3ECRA 2Y7PA 5FHMA 1FTOA 3JZJA 3KOSA 1NNFA 3T9HB 3VV5A 1IZ1A 3ILUB 3W9WA 1B58A 1Y3PA 3TCFA 3K01A 4OFOA 2Y7WA 3V83A 4YKJA 4DDDA 3B7DA 2OWTA 4H67A 3QXMA 2CZLA 4XKRA 4XKQA 4GXAA 3N6TA 5I59B 2R71A 5DT6A 3TKDA 2O68A 3EQ1A 1B9JA 2NXOA 2OZZA 5DEXA 2RC7A 2HAVA 3GBAA 4GFRA 1R9QA 4HTGA 4MLVA 3K6VA 1B46A 1D9YA 1AOVA 2IEEA 3VLUA 1DTGA 2ZYKA 4X9TA 5ITPA 1YTVA 4F29A 4QF9A 2ESNA 3MP8A 4AB5A 1Y3NA 4HW8A 1LFHA 2OLBA 3O28A 1AIVA 1ZU0A 4DZ1A 3QIMA 1LAHE 1DOTA 1A55A 2DVCA 1PEBA 2RCBA 3VVEA 4ZZEA 3W15C 4FATA 4RPOA 1QJMA 3LSLA 4C0RA 3FV2A 5CMMA 1MDP1 1FQFA 1UIUA 3PUWE 5ICQA 1SW4A 3UGWA 4XXUA 5I2NA 3DELB 1JW5A 3KN8A 1XT8A 5DVJA 3KJ7A 2DP8A 3H3GA 4RA1A 1OQHA 2B65A 1N84A 1CB6A 2H4IA 1BLFA 2H25A 2F35A 4G68B 4PFWA 1Y1ZA 2I6EA 1SW2A 2XX8A 4FJPA 4DE8A 4N07A 4EF2A 3PGFA 4U4XA 3HO7A 1NNTA 2F5XA 4EDPA 3QUJA 4F2QA 4ND9A 2O1LA 4ZECA 2OK2A 2O7UA 4F31B 2A5TB 3K0VA 3HN0A 1B4ZA 5TP9A 4WEPA 3H4ZA 2NVUB 3PPNA 4O3BA 4OEVA 4G4PA 4YMBA 1BIYA 1LFGA 3PV0E 1RYOA 4OFJA 3TZAA 5I56B 3HV1A 1MQGA 4R73A 3B6WA 1BTJA 1FTJA 2O51A 2OWSA 4ZEBA 4IO6A 4KR5A 1FQDA 1EH3A 1A8EA 5EHSA 3JV9A 3SETA 1PC3A 2I58A 3PPQA 1P99A 1LCTA 3W9VA 4NF8B 5I58B 1MH4A 5CM6A 1UIVA 2B3FA 4ZS9A 3O2AA 1B5IA 2GRVA 1B3LA 4FAJA 2O84X 3B6TA 3KFMA 4K3FA 1P1OA 2E0SA 3QAXA 2X7QA 1LBBA 4RYAA 3C33A 1QUJA 3FGSA 1SVXB 2DOJA 3H06B 1B0HA 1SYHA 1LBCA 5JTYA 2Y7IA 4YMAA 2F6PA 3U8QA 4Q0CA 2Q9TA 4QFKA 1DTZA 3QK6A 3ZS6A 4BDMA 3CIJA 4NMYA 2THIA 4TOZA 4RK9A 1JW4A 2Z8FA 2IA4A 1AMFA 3RNNA 3VLWA 3G3JA 4IO2A 4X1DA 3SKPA 4LUBA 3THIA 3K6UA 3VE1B 3PPPA 5H8QB 5LOMA 3KJTA 3OENA 3SEUA 1MQIA 3SEXA 4OHNA 3KZGA 5ELVA 3MUQA 5I59A 5H8FB 4EQ7A 1SQYA 3TCHA 1QULA 1Q1KA 5FHNA 3H6VA 3MBPA 1ATGA 1Y1MA 3EHTA 3U93A 5AA1A 1RKMA 1QVSA 1XOCA 1GGGA 1US4A 4GVOA 3PU5A 3ONMA 3SERA 3KGCA 3TQWA 2QS2A 2HFBA 4QFNA 2I0CA 1Z7NE 3L6GA 3MWBA 3HCQA 3EPEA 2OJTA 5EYFA 3Q26A 4OZ9A 4NF6A 2ONRA 3CFZA 3HSTA 1O7TA 3UORA 1MPBA 1MXYA 3OO9A 2M8CA 2LAOA 3Q28A 4LZ7A 2PT1A 1B5HA 1FCKA 1N3WA 4KYSA 3T96B 2UYEA 2ZYMA 3OO7A 2Q88A 1NL5A 3PUZE 2PVUA 5HBCA 1A8FA 5H8HB 1QUKA 4LATA 4GF8A 4R2FA 4DXUA 1Q35A 3TYHA 3EF7A 4R6KA 1B40A 1A7LA 4G68A 4PFYA 3SEYA 3SESA 2QS4A 4HCWA 4GWOA 4HS7A 3DP4A 3KOTA 4H0WA 3TODA 2FNCA 4PFUA 2V25A 4GXSB 3EHSA 3TUSA 3CG3A 3OD7A 4POWA 1FQBA 1D9VA 2R9JA 5TPAB 5AA4A 1FTLA 1N76A 3T9UA 4I1DA 2ZNTA 3C32A 4MH5A 3TMGA 3MW0A 4UA8A 4IB2A 2H9BA 4DXCA 1UTHA 1II5A 4FEDA 5CMKA 2HCAA 1OMPA 1XS5A 3TTKA 2Q2CA 2XXXA 1US5A 5AA2B 2RKMA 4IO4A 4NF8A 3VXBA 3O9PA 2F97A 2VD2A 3IO4A 2ALUA 2G93A 1JNFA 1OQGA 3C35A 3MP1A 5DVFA 2DXYA 4F39A 1ZBMA 1VE4A 2QJEA 3KSXA 1LSTA 4QRZA 1LAFE 3O29A 1MY1A 3KSJA 4F3BA 4H8IA 3IORA 4NF5B 5KZTA 3U1OA 4U23A 1WODA 4PETA 4X1BA 4EUOA 1OLCA 4TQUQ 4Z0IA 4NTLA 4BDQA 3RLFE 4LQ2A 4ECFA 2XXQA 3AXFA 3CSBA 2F7AA 3ZSFA 4R6YA 2GHAA 1H76A 3R26A 3D4GA 4XTCQ 2I4CA 4U1ZA 3UA8A 3K1MA 4ESXA 3CRBA 2RINA 3K4UA 4ZEDA 4KCCA 5L8DA 1IXIA 2DWIA 4ZDMA 3H03A 3UP9A 3CI8A 1B52A 1H43A 5M2VA 2H5YA 3TPAA 1PB8A 1B5JA 2YLNA 1M5EA 1NH7A 1NH8A 2Q2AA 3N26A 3IO6A 3BKIB 3L6HA 5A5XA 5CBSA 3M3FA 5J1DA 2BJJX 1UTBA 3S4UA 3CSGA 3TTNA 3OEKA 3OMBA 1B7UA 4WKMA 5CBRA 1I69A 4JXIA 3ZKLA 2DS9A 5DVIA 3O97A 1B05A 5AA2D 3MVZA 3LSFB 1IUDA 1FW0A 1M5CA 1H45A 1P1NA 3IK6B 1DPPA 1Z7ME 2XXHA 1LB8A 3G7WA 4F19A 4P0IA 2REJA 4BDOA 1VSOA 4TLLB 3IJOB 3MQ9A 1JVYA 1ZMGA 4DCYA 4YKPA 5ICTA 1DPEA 4F18A 4KQPA 3FASA 3E13X 4C1UA 3VXCA 1B4HA 1NKXA 1MXZA 4ZEFA 3G3GA 1ZIUA 3RTWB 1USYH 4QSEA 2DSFA 3QSLA 2NOOA 1KWHA 2GHBA 4YB5A 4NWCA 4FORA 3FZVA 4O3CA 2Y7KA 3T66A 5HPQA 4JB7A 1VR5A 3SDFA 4ISUA 3U92A 4E0XA 1LLSA 1H3DA 3FV1A 1RYXA 2DWHA 3K6WA 4Z7EA 1Y4TA 4Q8RA 1YCJA 4KYDA 1YPNA 1JETA 2NUVA 2O1MA 1MXWA 4ZZAA 2HAUA 1LAXA 3M8UA 5HM4B 4MBPA 1HSEA 5L9OA 2QL3A 1D3KA 5KCJB 3FD3A 4XKNA 2DWAA 1OVTA 3I5OA 5KDTB 2PX1A 2UYFA 3BFTA 1A99A 2ZMBA 3N5LA 1H44A 3T22A 1EZ9A 4GD5A 2QS1A 2UVJA 4R74A 2I48A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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