4ELRA

Ferric binding protein with iron and carbonate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
SPTLTIYSGRGQSLVEPLVKQFEAETGIRVQVRYSTDAQILAALQEEGSRSPADLFWANTAGALGQASAKGLLRPLGETLLEKPIAFVPASRTWVPVTVRLRVLAYNPDRIKAEELPESLLDLPRFAREKGLVGRVGWTPTYSSFQDMVAGMIALYGEEKTREWLLAMKALAPKAYPSNPAMLDAIRAGEVDLGSTNHYYVVRFRRAGYRLGMHHFRDGDAGNLALVTGAGLLKTSKNLAAATRFLTYLLSPQAQQYFVGNIGEYPLVKGVALDPNLLPLEEALAKSPKLDLEKLPLDRALRLLRETGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport
source organism Thermus thermophilus
publication title Crystal structure of ferric binding protein A
rcsb
molecule keywords Iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein
total genus 108
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4elrA02
2XX9A 4AB5A 1RYXA 3MBPA 2HCAA 5A5XB 1HSEA 3M3FA 3A09A 4R74A 3CFZA 4G68A 4F29A 1B5JA 1GR2A 4EF1A 5ELVA 1QJMA 2E1SA 4R6HA 1IUDA 4E0XA 1JW4A 5H8QB 5FTIA 2H9BA 5KDTB 3EPEA 1B3HA 2OWSA 4QFOA 5CMCA 1MDQA 1B4HA 4GLIA 5ITOA 1Z7NE 3OSQA 1QUIA 2A5TA 4BLAA 3EHSA 4TOZA 2XXWA 4DXBA 3UGWA 1A7LA 5TP9A 4U1ZA 3PUVE 5I2KB 3HHGA 5H8SA 2HZLA 4IGTA 4OERA 3OO6A 3EN3A 4PETA 2UVGA 5HM4B 4JWOA 4LQ2A 3GBBA 4F3BA 4JWXA 3GZGA 2PT2A 3R26A 3KN7A 4EXKA 3KJ7A 1ZU0A 3LUYA 4X9TA 1UTBB 3K01A 2Q2AA 3H6VA 4BDLA 3W9VA 3K02A 1ELJA 3FZVA 2QS1A 2WKYA 4OENA 1LCFA 3E3KA 5I59A 1NNFA 2ZNTA 3C33A 3HCQA 2DE3A 2OLBA 3FASA 3I5OA 5AE4A 3PD8A 1UQWA 2QS3A 2CZLA 4EQBA 2ESNA 2QMWA 3Q25A 2XXTA 4PE5B 5H8NB 2O84X 2DP8A 2RCAA 3TZAA 3K2DA 4DXCA 3Q27A 2I58A 4LQ5A 4P11A 5AA4B 1MY0A 4H67A 2HAVA 4X1BA 3IB0A 1MRPA 4LZ7A 1SI0A 1MPCA 3OENA 3PUZE 4QHQA 2FYIA 1S9TA 3VLWA 4MFIA 2I0CA 4U2RA 1A54A 1LB8A 1MQIA 3GLBA 3ECRA 3SEXA 1AH5A 3BFUA 1CB6A 3THIA 2Q9TA 4F31B 1OIBA 3PD9A 1B05A 4XIGQ 3HN0A 1NMUA 3DELB 5B7DA 4MLQA 3OD7A 1JEVA 5EHMA 3W15C 4QFPA 3Q29A 3PPPA 3C36A 2RC8A 5CMBA 1OQGA 3VV5A 3V89B 1SW2A 4FORA 1QKBA 4JXIA 4QRZA 3K4UA 3UP9A 4DXUA 1MH3A 1WDNA 1B5HA 1B4ZA 5A5XA 2Y7PA 1N7WA 5JK4A 1XHYA 2AIXA 4R75A 1Z7ME 2ZYKA 2QJEA 3DP6A 3EF7A 4X48A 1A8EA 3ONMA 5H8QA 1B3EA 2QMXA 4XKPA 4JDFA 2DOJA 5ICQA 5KDTA 1S50A 4H5GA 4O3BA 3H7MA 2P2AA 3LSWA 3T66A 3TTKA 4JB7A 2F7AA 1B6HA 4I9DA 1M5DA 3TAJA 2Y84A 3LR1A 4DCXA 5K2XA 2UVIA 3QK6A 4XKQA 5I2KA 4LVQA 5DVJA 2X7QA 4MF3A 2UYEA 2H98A 4FAJA 3C34A 3LSLA 5DYHA 4QSEA 4Q5TA 1D9YA 2DQVA 3PMWA 4RXLA 3OO8A 2I48A 3V83A 1UTBA 2AL4A 2IA4A 1YTVA 3VXCA 2ZNSA 1B58A 1LAFE 3AXFA 4GWOA 3P7IA 1IXIA 2O6AA 3K1NA 1O63A 3KEIA 4IO5A 1H45A 3SEYA 5DT6A 3G3IA 2XXPA 3QSLA 1AL3A 1UTHB 1ANFA 1FTKA 3TMGA 1P99A 1SVXB 3PGFA 4YB5A 4KHZE 3S9EA 4LONB 3V5AA 4QFLA 1FTOA 1IEJA 3IR1A 3H06B 5DTBA 3RPWA 1MY3A 2QSXA 2DWHA 3MZ1A 1TWYA 5EHSA 1MG1A 4LA9A 4LZ5A 5H8NA 2XXQA 5M2VA 2F34A 1FQEA 1LAHE 3LSXA 1KWHA 2OCUA 4YZZA 2GHBA 2UYFA 4F3PA 3BFTA 5AA3A 3H4ZA 1JQFA 2PBWA 3JYRA 3FVOA 2YJPA 1EZPA 3FVKA 3JZJA 2V3UA 2YPNA 1NNKA 3S2VA 3VLUA 3BBRA 4EQ9A 4M1VA 1P1WA 1MQHA 5I57B 4R6YA 2OZZA 1L5TA 1Q35A 1I6BA 1DPPA 4ESXA 4HCYA 3G7WA 4R9GA 2RCBA 5L8DA 2HFBA 5ICTA 4U22A 4WXJA 3ZSFA 1R6ZA 1QKAA 1Y4TA 2ZXTA 1FTLA 1TFDA 2ALUA 1P1OA 3KSJA 1UIUA 4HTGA 4X1DA 3UIFA 3I6VA 3K1PA 2D5WA 1AOVA 3PPQA 4JSOA 1SBPA 4P0GA 1LFIA 4R2BA 1LLSA 5L9MA 1AMFA 4OTEA 4DIGA 1H3DA 4F1YA 1P1QA 1B1HA 3KN8A 4ZEBA 3B7DA 1SW4A 3CG1A 4THIA 3OXNA 4I1DA 3VLVA 3IJOB 2DVZA 2O69A 3IL1B 2V84A 3DP8A 1GVCA 3FJ7A 1XVXA 3O28A 3PPRA 3QAXA 4H1XA 5F7VA 3CG3A 2G29A 2H99A 1II5A 3TDJA 3MP8A 3TTLA 4F2OA 4KQPA 5KZTA 2REGA 1YAEA 3A3CA 3KGCA 4EF2A 2V25A 1BTJA 4G8NA 2NWJA 2VOZA 1JVYA 4OEUA 4F2QA 2PMSA 3K6UA 1RKMA 3RLFE 4NE4A 1M5BA 4OWDA 1IITA 1DOTA 2VHAA 4XKRA 3QYTA 2D3IA 1IIWA 1MQDA 2XXXA 3FGSA 3TKDA 5HBCA 1YCJA 4N07A 4LATA 4LP2B 3RQTA 3OO7A 4RPNA 3K6XA 3H6UA 1UIVA 4Q8RA 1VE4A 1PC3A 4E0WA 2RKMA 4ND9A 3FVGA 3UA8A 3Q26A 3L6HA 4GD5A 1URGA 1MY4A 3G3HA 3MC2A 4R73A 3G3JA 1LFHA 1D3KA 4OZ9A 4UACA 2I49A 4QSDA 2HXWA 4Z0IA 3VFJA 4RA1A 4KD5A 2GHAA 5I56B 3MW0A 1LBBA 4G8MA 3EQ1A 2NOOA 5JTYA 4U4SA 3ILTB 3TCGA 1B7ZA 2ANJA 5CM6A 3MWBA 3BKIB 3K00A 2Y7WA 4ZZAA 3OMBA 1DTGA 3CFXA 1USYE 1PEBA 1FQBA 3RGYA 1M5CA 3N5LA 5TU0A 4AB6A 1EU8A 1Y3QA 1MXZA 4KI0E 4K3FA 3MVZA 4WKMA 1ZBMA 1USYH 1Y1ZA 3CVGA 3CIJA 1DSNA 2DXYA 5DEXB 3KG2A 1B3LA 4Z7EA 2ONSA 2R6GE 3PV0E 2A5SA 1MQJA 3T9XB 5I2NB 3O2AA 1IQ7A 4DCYA 3TFLA 2W7YA 4FEBA 2O1LA 2OK2A 2I4BA 4JWYA 1B9JA 1Y3PA 2VD2A 1N84A 1B7UA 2Q2CA 2QL3A 1FW0A 4WEPA 1EZOA 1PBPA 2B3FA 3QUJA 1NH8A 3FIRA 5L9OA 5AA2B 3VVEA 2DWAA 4WEDA 2XXHA 2OJTA 1A8FA 2F6GA 4QSCA 4EQ7A 1LAGE 3LSFB 4OEVA 4IO2A 1TXFA 3RNNA 2Z8EA 4NTLA 3KFMA 4G8HA 3MVYA 1XC1A 5KCJB 1R1NA 3T93B 4MBPA 3E4RA 2Z8DA 2P0SA 2F35A 3IO4A 2O51A 3WAFA 3Q28A 2H4IA 2HZKA 3VVFA 3VXBA 1ZKBA 4ELQA 4GQOA 3C32A 1PB7A 3MP1A 1FCKA 1VSOA 4GL8A 3M8UA 5BUUA 3VE1B 4FIMA 4RJZA 4H8JA 1B51A 2XXRA 3DM0A 1HSLA 3PU5A 1PDAA 1N0TA 3TCHA 4ZZEA 5CI5A 3S4UA 1O7TA 3TCFA 4TLLB 2CMOA 3MAMA 4G77A 4YICA 4H65A 1DTZA 4QFNA 1P1UA 3CFLA 5CBSA 3IK6B 2NXOA 3V8XB 1PBQA 1SI1A 3PMXA 2XD2A 3TELA 1OMPA 4Q0CA 2O68A 3FUZA 4PFWA 1CE2A 1FTMA 1BP5A 5I56A 4NF8B 3SKPA 2ONRA 4KCCA 2BJJX 3H6WA 3KSXA 1EZ9A 2PYYA 2B3BA 3N26A 1XOCA 3MP6A 4H5FA 4F22A 4HW8A 1Y3NA 3T22A 1SYHA 1MM7A 4G4PA 4M4GA 4POXA 4H8IA 1LSTA 1B46A 3RT8A 1MPBA 2XHDA 4PFYA 3TEPA 4FE8A 2I3VA 2ABHA 3HHFA 4BDNA 2RINA 4ISUA 4OHNA 2XXVA 1FTJA 4GFRA 5I58B 1VFDA 1QVSA 4OQOA 2AL5A 3U72A 1SQYA 1URDA 1MXXA 5AA4A 2VGQA 4EXLA 4ZDMA 5DEXA 3K6WA 2V93A 3IJXB 3H3GA 1BIYA 3PMVA 2GRVA 3EHTA 4NF4B 4ZEDA 1XS5A 3G3GA 5I59B 4PFUA 1MXYA 3MZBA 4RY1A 4YKJA 4HCWA 3FD3A 3RY3A 4JBZA 4OYVA 2Y7IA 4N6PA 1D9VA 2V3QA 1OVBA 1US5A 1NH7A 4IO6A 5EYFA 2F5XA 5AA2A 4KR5A 3MUQA 2DSFA 4HS7A 3KOSA 4ONYA 4XXUA 4FEDA 4I8CA 4GOTA 2LAOA 1MH4A 1TFAA 5AA1A 1N3XA 1LAXA 2Z23A 1MDP1 1FQCA 3PUWE 4BDMA 2F8DA 2DE2A 3GXAA 1B7HA 3WAEA 1MXWA 5KCJA 3HSTA 4P0IA 3SERA 4BDOA 4IB2A 3MPKA 1B40A 5CRYA 1T0KA 1F9BA 1SYIA 2M8CA 4DZ1A 1FQAA 1JNFA 1TT1A 3OSRA 4C1TA 1B32A 1URSA 2DVCA 2F97A 2E0SA 4YB7A 3JV9A 4OETA 3PPNA 4KPTA 2RF1A 1JEUA 3G3KA 3HPIA 3KJTA 4Q30B 5FTHA 1BKAA 2F6PA 1PB8A 4LUBA 3C35A 3CRBA 4YMBA 2I6EA 2XXUA 4FECA 3IB2A 5DVIA 4ELPA 3MVWA 3UK4A 3IOTA 3K0VA 5B70A 5CC2A 3SESA 4O3CA 1RYOA 4OFLA 1GV8A 3VVDA 1XVYA 3FXQA 4UA8A 1LFGA 3O6HA 3S9MC 2REJA 4YKPA 5I84A 2ONKE 3FV1A 5IKBA 2OBGA 4IO4A 1PB9A 1B0LA 1Y9UA 4NF8A 4PFTA 3I3VA 3KOTA 2DYXA 1R9LA 2F7BA 2H25A 4GIZA 4GXAA 4QF9A 3DLNA 3RUMA 1J1NA 1UTHA 2THIA 4ZEFA 2VP1A 3U8QA 2D21A 5DVFA 1ZTYA 4POWA 5L9SA 4YKIA 1ZJLA 4OESA 3QIMA 3D4CA 4R72A 3RT6B 3ZKKA 3B6QA 2OWTA 4F19A 1US4A 5I58A 3IX1A 3IOUA 1IXCA 1Y20A 4NF6B 4DE8A 3OOAA 4GF8A 1P1NA 1LBCA 3RTWB 2ZYOA 4FJPA 4JSDA 3FVNA 3FV2A 4U21A 4XTCQ 2F7CA 3MVXA 2UVHA 3FXRA 4GVOA 1MS7A 3DP4A 1B3GA 1SW5A 2Y7RA 3ZS6A 3MJNA 5TPAB 2PVUA 1ZLQA 4YB6A 1NNTA 4YAHX 3O6GA 3B6WA 3MQ9A 4NF4A 3U93A 1ATGA 4OMBA 4I62A 5ITPA 1LCTA 1LB9A 5ISUA 4BDRA 1A99A 5FHNA 3KBRA 1POY1 5H8HB 3OO9A 5I57A 3F11A 1ZIUA 3RTFB 1QULA 1IXHA 5JEIA 4R6KA 4MH5A 4KCDA 1MXVA 3FJMA 2R9JA 3SDFA 3SEVA 4U1OA 2PT1A 3TTRA 3EHUA 1FQDA 3E9XA 3ILUB 4ZS9A 4KFQA 4DLDA 2Q8JA 1B0HA 1I6QA 1MY2A 5CMKA 3IOVA 1M5EA 2PX1A 3B6TA 1VFEA 1R9QA 4EDPA 4RPOA 1OVTA 2KLFA 1N04A 3MZ9A 3K1MA 3H6TA 4KYSA 5AA2D 4BDQA 5CMMA 4PQJA 5H8FB 1Y4CA 2DWJA 2HQ0A 2QRYA 5FHOA 3R6UA 3TODA 3PPOA 3G3FA 4U23A 3HO7A 4NF5B 1SD3A 3FXUA 2I4CA 3KZGA 1JW5A 2I0BA 4NMYA 4FATA 3UN6A 3O97A 4RK2A 3D4GA 1OLCA 2Z22A 1VR5A 4RYAA 2V3TA 2QS4A 1NNPA 3SEUA 2Q88A 5J1DA 4RK9A 2RC9A 1WVJA 3LBSA 1B3FA 2DE4A 2F36A 2UVJA 4NWDA 1HSJA 2H5YA 3S9LC 1B1XA 3SETA 1H44A 4ELOA 1M5FA 4OXVA 3USDA 3TTMA 2P1SA 4ELRA 4IY5A 5LOMA 4ESWA 1B52A 5HPQA 3IAZA 4ZEKA 1DPEA 4MLVA 3TUSA 3C9HA 1Y1MA 4F18A 3OELA 2ZYMA 4NEDA 2X7PA 4R9FA 2XXYA 1MQGA 1DMBA 3SEWA 2O7UA 3CI8A 4QFKA 3K6VA 4NF6A 4TQUQ 2DS9A 4GRKA 3T9HB 3T9UA 5K2YA 2ZYNA 2G93A 4ZE9A 1FQFA 3O6IA 4PP0A 4G68B 3PUXE 3U94A 1Q1KA 3TPAA 4DDDA 1GGGA 4F3SA 4OFJA 5TPAA 2VD3A 4F1UA 2O1MA 4GL0A 3T9VA 3N94A 1POTA 5FHMA 2ZMBA 4G68C 3TQLA 3A3UA 3HV1A 1YPNA 4ZECA 3L6GA 3H03A 3FATA 5H8HA 2A5TB 3TTNA 1MY1A 2IEEA 1NL5A 2ZNUA 3IOWA 3ODBA 1JETA 3MPLA 3QXMA 5TP9B 3IO6A 3C31A 4NWCA 4U4XA 4ECFA 4H6DA 2UXAA 1SDXA 2DWIA 3CR9A 2QPQA 1JVXA 4LZ8A 3RN8A 3ZKLA 2AYSA 4L17A 5IAIA 2QS2A 3O29A 2XD3A 1H76A 5I2NA 1LGBC 3M3LA 1S7YA 2GFEA 1MM6A 3M3KA 1A40A 1O64A 3N6UA 4O3AA 3UORA 5JTYB 2NUVA 1QW0A 5CBRA 3OEKA 5H8FA 2NVUB 4GXSB 4IY6A 3FJGA 4AQ4A 1XT8A 2Z8FA 3CSGA 4IGRA 1I6AA 1ZMGA 4N13A 1OLAA 4RNSA 1B5IA 3O9PA 4NF5A 4F39A 1D4NA 1NKXA 2DXRA 4YMAA 3PUYE 2F78A 1B2HA 3VDFA 1AIVA 1EH3A 2FNCA 4R2FA 1BLFA 4OFOA 2FA7A 3IORA 2YLNA 1WODA 4XKNA 3CSBA 3O66A 4H0WA 1IXGA 5BWJA 3KN3A 1MPDA 3E13X 4ZEIA 1QUJA 4ZE8A 5F1QA 1GTKA 3TYHA 1IZ1A 2R71A 4EUOA 3W9WA 1I69A 2O7IA 4IO7A 4KYDA 3C4MA 1N3WA 3T96B 4KYEA 3LC8A 4OVJA 1H43A 4G2ZA 4F1VA 2HEUA 3QUFA 1QUKA 2XX7A 4TLMB 3U92A 2HAUA 2RC7A 1OQHA 2Q89A 1SW1A 4F3GA 2Y7KA 3IB1A 3OEMA 1N7XA 1A55A 1JW1A 3GBAA 2B65A 2I3WA 2X26A 2XX8A 2XXIA 3U1OA 3TQWA 4C1UA 3N6TA 4C0RA 3R7XA 1MXUA 2GH9A 4IO3A 4YU0A 1NFTA 1N76A 3S9NC 4YKKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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