1LAHE

Structural bases for multiple ligand specificity of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
ALPQTVRIGTDTTYAPFSSKDAKGEFIGFDIDLGNEMCKRMQVKCTWVASDFDALIPSLKAKKIDAIISSLSITDKRQQEIAFSDKLYAADSRLIAAKGSPIQPTLESLKGKHVGVLQGSTQEAYANDNWRTKGVDVVAYANQDLIYSDLTAGRLDAALQDEVAASEGFLKQPAGKEYAFAGPSVKDKKYFGDGTGVGLRKDDTELKAAFDKALTELRQDGTYDKMAKKYFDFNVYGDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Amino acid transport
molecule keywords LYSINE, ARGININE, ORNITHINE-BINDING PROTEIN
publication title Structural basis for multiple ligand specificity of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein.
pubmed rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 83
structure length 238
sequence length 238
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lahE01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lahE02
1MXWA 3PPOA 4ZEDA 1NKXA 1IEJA 3TCFA 2F36A 3CFLA 1SYIA 2UYFA 1RYOA 1Q35A 2O84X 2ZYMA 3FJGA 1VFDA 4GL0A 1NNKA 1ELJA 1FQEA 4MBPA 1SYHA 4OERA 3G3GA 3CIJA 3BFTA 2CZLA 4EQ9A 1WDNA 4KQPA 1MXVA 3OSQA 4JWXA 3K4UA 1GGGA 4ELQA 3B7DA 4G4PA 1JQFA 2XXIA 4F1UA 1LGBC 3IB1A 4YMBA 1A40A 4IO4A 1LFIA 5BWJA 4IO7A 1NNPA 3MBPA 1N3XA 1QKBA 4EF1A 1SDXA 4XXUA 4H5FA 2DWHA 4OWDA 3L6GA 3TCHA 2RCAA 3RTWB 2X7PA 3ZSFA 4M1VA 1HSJA 3DP6A 2I58A 1JEVA 5KCJA 4KYEA 3K2DA 3TKDA 4FJPA 3D4CA 3IK6B 1I69A 5A5XA 2ZYNA 1MQHA 4ZEKA 2Z23A 2OWSA 4MF3A 4O3AA 1LFHA 2DYXA 3ZS6A 2XXQA 3TTNA 5CC2A 3W15C 3I3VA 2O69A 4U1ZA 1I6AA 1MM7A 1OVTA 1US5A 5FHMA 4OFLA 2RKMA 2LAOA 3I6VA 2XXYA 4LZ5A 3S2VA 2V84A 3FV2A 2ZXTA 2M8CA 4YB6A 1NNTA 5K2YA 2UVGA 2IEEA 2H99A 1IIWA 2YJPA 4X1DA 3UA8A 3MPKA 3E3KA 3OO7A 4QFNA 1XS5A 4ONYA 1MH3A 3Q27A 2F6GA 1YPNA 2AL4A 3U92A 1B3HA 2REJA 3K6WA 4U1OA 1N0TA 1Z7NE 5DYHA 2Z8DA 4GD5A 3C35A 4NE4A 2VHAA 1LAXA 2QMXA 1VSOA 1N7WA 4UACA 1HSLA 4MLQA 1H44A 5CBRA 1AIVA 3G3IA 4ND9A 2GHAA 4R6HA 4GLIA 3FVGA 4RNSA 2WKYA 4EDPA 3IR1A 1B3EA 2D3IA 2B3FA 3ECRA 4YKPA 4I8CA 1EH3A 4KFQA 2UYEA 3KOSA 4NF8B 3EHTA 2PVUA 4ISUA 2HXWA 2VP1A 3PD9A 1TFAA 4KPTA 5CBSA 1GVCA 3TMGA 2ZYOA 4MFIA 3SEUA 4I1DA 3UP9A 4PFYA 1MQJA 3S9NC 5L9MA 1UIVA 2Q89A 3PU5A 2I3WA 3T9HB 1P1WA 4LATA 5DEXA 1I6QA 1MY1A 1B5IA 3IORA 4EQBA 1ZU0A 3TEPA 3GXAA 2XX9A 3MUQA 4JWYA 4F1YA 3VLUA 1O64A 2XXTA 3N94A 2NOOA 2RC8A 2UVJA 4YU0A 1UTHA 2F7CA 4DCYA 3RN8A 2Y7RA 2W7YA 2PT2A 5HPQA 5FTIA 4ZEBA 2I48A 2B3BA 3K1NA 1B4HA 3C32A 3OSRA 3PUWE 3TQWA 5ICQA 3T9XB 2HZKA 1B1XA 4RK2A 4QFPA 1B3LA 3O29A 2ONKE 3FUZA 4R73A 3B6QA 3UK4A 2Y7PA 4NF4B 2V25A 5CMMA 3H6UA 1OLAA 3U94A 4KI0E 3ONMA 5TU0A 4FECA 4X1BA 2H25A 1XVXA 3IX1A 3WAEA 1XOCA 2HZLA 4UA8A 3SDFA 3OD7A 2R71A 3T22A 5CMCA 4NF5B 1S50A 3Q25A 4OTEA 4Q5TA 3CG3A 2ONRA 4ELRA 4EXKA 5AA3A 3PPNA 3W9WA 3FVKA 3T93B 4ZEFA 1IUDA 1JNFA 3FIRA 3HSTA 1MQGA 4QFLA 3IB2A 4R6KA 5CMKA 4HCWA 1OQGA 3G3JA 1XVYA 1Z7ME 1FW0A 4L17A 3PPRA 2O51A 4JSOA 4TQUQ 2I3VA 4DE8A 4NMYA 2QRYA 3LSWA 2PX1A 2NUVA 2B65A 1A7LA 2ZYKA 1H43A 1AH5A 4F18A 2I49A 3ZKKA 1LB9A 3MZBA 2XXHA 4OZ9A 5I57A 1IXCA 1JW1A 4GXAA 3TYHA 3HO7A 4BDRA 1MY3A 5IKBA 1B9JA 1I6BA 4IGRA 1PEBA 2DE2A 3H06B 3OOAA 1IQ7A 3MZ9A 5EHMA 1IITA 1B0HA 2A5TA 3GZGA 3O6IA 3S9MC 2QS3A 2FYIA 4R72A 1URGA 2XXRA 4DDDA 1PB8A 3H6WA 5DTBA 5H8HB 4YAHX 1SQYA 1B40A 1CB6A 1R6ZA 1P1QA 5K2XA 4H0WA 1DOTA 1L5TA 3WAFA 1BLFA 3N6TA 3C34A 1UQWA 3AXFA 3PMVA 1MDP1 4QSDA 3RUMA 4XIGQ 1GTKA 1O7TA 2G29A 1EU8A 1EZPA 4KYSA 1NL5A 3BBRA 4F3PA 4FE8A 3BFUA 4AB5A 4ZDMA 5I56B 2E1SA 3TTMA 2Q8JA 1D3KA 4H1XA 3FXQA 4F3SA 4U2RA 1EZOA 4NF6B 2KLFA 1JEUA 1Y9UA 3RQTA 4LQ2A 5FTHA 3TPAA 4RPOA 2F78A 4PP0A 4Q8RA 3VVEA 1O63A 3OENA 5CI5A 4GOTA 4N6PA 4H65A 3T66A 1S7YA 1VR5A 5FHNA 3PUZE 3LC8A 3PGFA 3IOWA 2IA4A 3GLBA 1LAFE 1MY4A 3TODA 1AL3A 1LBBA 5KDTB 4LUBA 1B2HA 3K6XA 4PFUA 3TCGA 1MM6A 4GFRA 3KN7A 4G68C 2OLBA 3HHFA 4KD5A 4OHNA 2NWJA 2O1LA 1MG1A 4M4GA 2V3QA 2F5XA 1PC3A 5B7DA 4H8JA 3CI8A 3K00A 3SETA 3B6WA 4IO6A 5AA1A 4G68B 1JW4A 1M5CA 1ZMGA 3M3KA 2V3UA 5ITOA 3FJ7A 2I6EA 2GH9A 1MPCA 3MAMA 3K1PA 4F2QA 3Q26A 3A09A 4QSCA 3R26A 3KOTA 3FASA 2OBGA 3C31A 3OMBA 1Y1MA 1QW0A 2D21A 1MXYA 1N3WA 1USYE 3EQ1A 4U21A 3MC2A 1OLCA 3V83A 3IOTA 1B3FA 3Q29A 1LLSA 4G2ZA 3MVYA 4F29A 1QUKA 1B52A 1MXXA 2HFBA 2DWIA 1Y3NA 5H8FB 3EN3A 1BKAA 2QS4A 4IY5A 5I2NB 5TPAB 2Z8FA 4JWOA 3OO8A 2H9BA 4DXCA 1QUJA 1R9QA 4E0WA 5AA2A 3EHUA 3F11A 1OVBA 3OEKA 4PQJA 3IL1B 3OO9A 1FTOA 3C33A 3G3HA 2F7BA 2GRVA 3SEYA 5AA4B 4FEBA 1PB9A 4IGTA 4G8MA 3SEVA 5JTYB 4F31B 3QYTA 1GV8A 3IJOB 4QFOA 4DXBA 4U4XA 5JK4A 3U8QA 4R75A 1SW4A 2Y7KA 1QUIA 1N76A 1AMFA 2DWAA 4ECFA 3VVDA 3K6VA 3QUJA 2Y7IA 5L9OA 2RINA 3C9HA 3MVXA 2ZNSA 5CMBA 2XX8A 3VDFA 3MWBA 4WEDA 5AE4A 3PUYE 2Q88A 5I56A 4P0IA 2O1MA 2DVZA 4GF8A 1BP5A 3KFMA 3LSXA 1M5EA 1NH7A 3VLVA 1M5BA 4ELOA 2HAUA 4THIA 3SEXA 1LB8A 3S4UA 1QKAA 2OK2A 1SI1A 3T9UA 3FVNA 1FCKA 1B05A 5I58B 1YAEA 1PDAA 1HSEA 1SVXB 1JW5A 5DVIA 2V3TA 1BIYA 2UVIA 4F1VA 3PPPA 1IZ1A 1UTBB 1JVYA 2I0CA 1SW5A 3VE1B 2XX7A 4F3GA 5H8QB 1MQDA 1J1NA 3IO6A 4G77A 3CRBA 2X26A 1MPBA 3LSFB 3LR1A 1DSNA 3KSXA 3V8XB 1P1OA 3TUSA 2D5WA 4OEUA 2GHBA 4R9GA 3U93A 3PPQA 3Q28A 4H67A 2OCUA 2ANJA 1FTMA 4RYAA 2NVUB 3OO6A 5F1QA 1SBPA 4JXIA 5L9SA 2HEUA 4BDQA 1OMPA 3QSLA 3V5AA 4EQ7A 3K6UA 2FNCA 2Q2AA 3G7WA 2HQ0A 1FQAA 3RPWA 4EXLA 4XKRA 3ILTB 2F8DA 3QAXA 3JYRA 1SW1A 1YCJA 4WKMA 1A99A 4QSEA 2Z22A 2FA7A 3M3FA 4LQ5A 4R9FA 4XTCQ 4FEDA 3VXBA 5ELVA 3PD8A 1LAGE 3KSJA 3ODBA 1T0KA 1H76A 5DT6A 2QL3A 3GBAA 3MQ9A 3H6TA 4F3BA 2RF1A 1M5FA 1MXUA 4PFTA 4ZS9A 2I4BA 4EF2A 3DLNA 3U1OA 1IXIA 1B7ZA 2ONSA 1QVSA 4ESXA 3CVGA 1ATGA 1XHYA 4LVQA 4O3CA 2DE3A 1MQIA 4PE5B 3H7MA 3MPLA 3CSBA 1LAHE 2O7UA 5KCJB 4U23A 3C4MA 4YB7A 5FHOA 2R9JA 3OELA 1B1HA 5JTYA 2DXRA 1Y4CA 4ZE8A 5A5XB 3E4RA 1LCTA 1ZIUA 4YICA 3T96B 3QXMA 3PMWA 2P0SA 3RY3A 1OQHA 1FQDA 4F2OA 4X9TA 1B32A 2XXXA 4FORA 5H8NB 3EF7A 4X48A 4GVOA 3VV5A 4MLVA 4DLDA 4XKQA 3S9LC 4I9DA 2BJJX 2F35A 3O9PA 4DCXA 1UIUA 3TFLA 3PMXA 3MVWA 4LP2B 4XKNA 1B3GA 1VFEA 1DTZA 4NTLA 1VE4A 1MY2A 3UIFA 1A54A 1FTKA 1H45A 4NF8A 5IAIA 1A8EA 5B70A 4OVJA 4YKIA 2P2AA 2RC7A 3I5OA 5BUUA 4ZZAA 3K01A 1N84A 1LSTA 3MW0A 3CFXA 2O6AA 3IAZA 1B58A 2O68A 3H3GA 4WEPA 4NWDA 3RLFE 4O3BA 2QPQA 3GBBA 4OXVA 4OENA 4PETA 3DP4A 3S9EA 3FATA 1A8FA 4XKPA 1LCFA 4TLLB 1S9TA 3DP8A 3QIMA 3KBRA 3T9VA 4K3FA 5I59B 3TAJA 4GRKA 2AIXA 1IXGA 4AB6A 1NMUA 4ESWA 3EPEA 3VXCA 3KG2A 3RTFB 1XT8A 1YTVA 3FZVA 3QUFA 4FATA 4OMBA 4H8IA 1PBPA 4C1UA 3MP6A 1II5A 2F34A 3CSGA 4C1TA 5TP9B 1JVXA 2VOZA 4OESA 2G93A 1NFTA 3R6UA 2UXAA 2VD2A 3C36A 5DEXB 5JEIA 4KR5A 1MRPA 3HCQA 1B4ZA 1DTGA 3SERA 1MS7A 4NF4A 1P99A 2DOJA 2Q9TA 1B6HA 3A3UA 2OWTA 5L8DA 3FVOA 5I2KB 3TQLA 1SI0A 4OFJA 3CFZA 3P7IA 4JDFA 1UTHB 1QULA 2DXYA 4NF5A 2H4IA 4TOZA 2P1SA 1OIBA 4AQ4A 1PBQA 2DE4A 1P1UA 3RNNA 3FGSA 4GIZA 1Y3QA 4P0GA 4IO5A 3HV1A 5CM6A 4ZECA 1GR2A 2O7IA 4QRZA 5DVFA 1DMBA 4GQOA 1ZJLA 2QJEA 1TT1A 2VD3A 2QS2A 2Y84A 4HS7A 4IO3A 4F19A 2QMWA 3ZKLA 4YKKA 5H8SA 4KHZE 3TZAA 5EHSA 5HM4B 1DPEA 2I4CA 3FJMA 1Y1ZA 3UN6A 4P11A 2ESNA 4QF9A 1N04A 2DWJA 1LBCA 1ZKBA 3V89B 3O6HA 4H6DA 3LBSA 3DELB 5H8NA 4RY1A 1D4NA 4F39A 2RC9A 5KZTA 4KCCA 3UORA 1B0LA 2AYSA 1TXFA 4KYDA 2UVHA 1NH8A 3FD3A 4YMAA 2NXOA 5H8HA 3VVFA 4KCDA 4DIGA 5J1DA 2THIA 1FTLA 4ZE9A 1Y3PA 4DZ1A 4OYVA 1JETA 1BTJA 5I57B 1IXHA 3M3LA 1CE2A 4JSDA 4NEDA 1MH4A 1QJMA 2X7QA 4LONB 4IB2A 1AOVA 3U72A 1A55A 4GXSB 3HPIA 3IOVA 1WVJA 3ILUB 4YZZA 2A5TB 3KN8A 2QS1A 1D9VA 4ZZEA 3R7XA 4RJZA 3PV0E 4NF6A 1USYH 4WXJA 4OQOA 1ZTYA 3TTLA 4PFWA 1R9LA 4POXA 3HN0A 1B7UA 3O97A 3LUYA 5I59A 2PT1A 2V93A 1XC1A 3L6HA 3CR9A 4GWOA 2XD2A 3O2AA 3N26A 2F7AA 2ZMBA 4LA9A 4QFKA 4RXLA 3MVZA 5ISUA 3RT6B 3K1MA 1D9YA 4DXUA 2XD3A 5KDTA 3W9VA 3SEWA 3K02A 5TP9A 2Y7WA 4RK9A 1TWYA 2I0BA 2GFEA 2YLNA 3O6GA 3FV1A 4OETA 4U4SA 4IO2A 3TDJA 1PB7A 4NWCA 1FQCA 2PYYA 1B46A 4RA1A 3QK6A 5I2KA 1TFDA 3CG1A 4BDLA 4FAJA 3A3CA 1ZLQA 4JBZA 5CRYA 3E9XA 4FIMA 4QHQA 4YB5A 4G68A 4R6YA 2XXWA 4G8HA 1ZBMA 2XHDA 3UGWA 4HTGA 2HAVA 2XXVA 1SW2A 3PUXE 1EZ9A 3IOUA 5LOMA 3M8UA 4BDNA 3IO4A 3FXRA 3MP1A 1SD3A 4RPNA 4I62A 2E0SA 1MY0A 2DP8A 2HCAA 3N5LA 2R6GE 2ABHA 1RYXA 5HBCA 4Z7EA 3IB0A 3N6UA 3SESA 1Y4TA 5H8FA 3MP8A 3KZGA 5I2NA 5TPAA 4ZEIA 3KGCA 1Q1KA 3D4GA 4E0XA 3G3KA 3K0VA 3KN3A 2H5YA 3OEMA 2PBWA 4C0RA 3O66A 1Y20A 1POTA 3THIA 4G8NA 3TELA 1WODA 2QSXA 1MDQA 1R1NA 3MZ1A 1URSA 4N13A 3USDA 5AA4A 3IJXB 3VFJA 3TTKA 3KEIA 2DQVA 1MXZA 2F97A 2DSFA 4LZ8A 1FQFA 1B5JA 5ICTA 3FXUA 4JB7A 3O28A 4YKJA 2CMOA 3HHGA 1M5DA 4Q30B 4R2BA 3E13X 5DVJA 3SKPA 3PUVE 2VGQA 2DS9A 1DPPA 2F6PA 4LZ7A 2RCBA 5AA2B 3OXNA 2DVCA 4Z0IA 1NNFA 1B7HA 4BLAA 3JV9A 3RGYA 2XXUA 2ZNUA 2A5SA 3KJTA 4TLMB 4ELPA 3H4ZA 4OFOA 3EHSA 3DM0A 4POWA 1LFGA 5M2VA 2ZNTA 5F7VA 3H6VA 1URDA 4F22A 2OZZA 4EUOA 1US4A 4R2FA 2Z8EA 2REGA 5I58A 5ITPA 3JZJA 2XXPA 1N7XA 4N07A 1MPDA 3KJ7A 4IY6A 1KWHA 2PMSA 3G3FA 4U22A 1UTBA 3H03A 3VLWA 5H8QA 5I84A 4HW8A 2ALUA 4BDMA 2Q2CA 4H5GA 4OEVA 1H3DA 5AA2D 3RT8A 2YPNA 4HCYA 5EYFA 1P1NA 4MH5A 1FTJA 1F9BA 1B51A 1FQBA 2H98A 1ANFA 1RKMA 4GL8A 4Q0CA 4R74A 3TTRA 2OJTA 4BDOA 3B6TA 3LSLA 1POY1 1B5HA 2AL5A 3MJNA 3BKIB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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