1LAHE

Structural bases for multiple ligand specificity of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
ALPQTVRIGTDTTYAPFSSKDAKGEFIGFDIDLGNEMCKRMQVKCTWVASDFDALIPSLKAKKIDAIISSLSITDKRQQEIAFSDKLYAADSRLIAAKGSPIQPTLESLKGKHVGVLQGSTQEAYANDNWRTKGVDVVAYANQDLIYSDLTAGRLDAALQDEVAASEGFLKQPAGKEYAFAGPSVKDKKYFGDGTGVGLRKDDTELKAAFDKALTELRQDGTYDKMAKKYFDFNVYGDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LYSINE, ARGININE, ORNITHINE-BINDING PROTEIN
publication title Structural basis for multiple ligand specificity of the periplasmic lysine-, arginine-, ornithine-binding protein.
pubmed rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Amino acid transport
total genus 83
structure length 238
sequence length 238
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lahE01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lahE02
1B05A 4OERA 2DXYA 4C0RA 1FQDA 4QSDA 1B5IA 2XD2A 4NTLA 4F39A 4NWCA 1ZTYA 4ZEIA 2ZMBA 4I62A 5I2KA 3U8QA 4IGRA 1MQDA 3SEVA 2Y7PA 3EHSA 3W9WA 3IX1A 2WKYA 4GVOA 3E9XA 4LONB 3OO6A 4F2QA 2RKMA 4GXSB 3GZGA 2HAUA 2H9BA 4FAJA 4YICA 4ECFA 4OXVA 1BKAA 1N0TA 1TT1A 2F5XA 2H99A 3KJ7A 4NF8A 3EHTA 4HCYA 3MBPA 2A5SA 1FQEA 3KFMA 4ISUA 2D21A 4JBZA 2M8CA 1FTLA 3RN8A 2DOJA 2DWJA 3N5LA 5FTHA 1DPEA 4N07A 4U22A 4JWYA 4R6KA 1R9QA 4JSDA 3OO9A 2Q9TA 1B6HA 4NEDA 4DCYA 1JVXA 1Y3QA 3PUZE 5FHNA 2A5TA 4ONYA 3PPOA 3RT8A 4BDMA 2Z8EA 3OXNA 1PBPA 5AA4B 1XHYA 1DTGA 3FVNA 1EZPA 1PB7A 3G3GA 1AOVA 3TUSA 4ESWA 1DTZA 1P1NA 3H06B 3RLFE 3IOUA 4F22A 2QS2A 3CIJA 1MG1A 1FQAA 3Q26A 4IY6A 1NMUA 1EU8A 1OVBA 4F1YA 4H67A 3SESA 3VLWA 1QULA 4ELQA 1EZOA 5A5XA 3TQLA 3IR1A 4RK9A 3H03A 2NWJA 3MC2A 2G29A 3VE1B 1N3WA 4YB6A 4EUOA 4H1XA 1M5EA 4I9DA 3VVFA 1ZJLA 5L9MA 5KDTA 4QFKA 1SQYA 4ZECA 3TELA 2X26A 3M8UA 1UIVA 1IZ1A 5ICTA 4KFQA 2Y84A 4GD5A 4OHNA 5CMKA 3W15C 4MBPA 4QFPA 1SBPA 3MAMA 3UGWA 5TU0A 3TCHA 3F11A 2XXHA 4Q0CA 1MDQA 3B6TA 3H3GA 2DWHA 1MPCA 5CBSA 3I3VA 4DDDA 3K6VA 2I3WA 1OIBA 4LQ5A 3OEKA 4ZE8A 1BLFA 1MH3A 3KOSA 1FTMA 3DP6A 1NNPA 1P1UA 3L6HA 5F1QA 1NFTA 4NE4A 4GL8A 1UTHA 1SI1A 3KN3A 2LAOA 3HSTA 4POWA 3MQ9A 1VFDA 1POY1 5B70A 1USYE 2REGA 4MLQA 3VFJA 5I2NB 3KBRA 1QKBA 4N13A 3JZJA 1UTBB 4JWOA 1YPNA 3VXCA 1MXZA 3OELA 1D9VA 3W9VA 2YLNA 2Y7IA 5I84A 3IAZA 4ZEDA 3CSGA 5CBRA 1B9JA 3FXUA 1XT8A 2NOOA 5DT6A 2F35A 1NNKA 3EPEA 2UYEA 3PPPA 2R6GE 3PUVE 1B4HA 2IEEA 4G8HA 1S50A 3C31A 1SYIA 1TXFA 1LSTA 1TWYA 2UVJA 2QPQA 3KN8A 4LQ2A 1SDXA 4EQBA 4LP2B 4ZZAA 3DELB 4ZS9A 3FV2A 3I6VA 3ZS6A 5TPAB 4PQJA 4G77A 3EN3A 2DS9A 3ILUB 4R2FA 2DE2A 4G68B 1MQHA 4OTEA 4FEDA 1ZLQA 3C34A 2XX9A 4F1VA 1LBCA 2F36A 4X1DA 3VVDA 3T9VA 1MY3A 3CSBA 1ZKBA 4ELRA 4NMYA 4FORA 2REJA 4IO4A 3UP9A 4G68C 1LBBA 2PT1A 4YKKA 4F31B 2HQ0A 2B65A 4LZ8A 2I6EA 4DXCA 2ONRA 3B6QA 3ZKKA 3K01A 4OMBA 4JSOA 3K02A 3SEUA 4X9TA 3PU5A 3TTNA 1B4ZA 4KHZE 1PB8A 5AE4A 3ONMA 1UQWA 3IB1A 2QMXA 3TTLA 4G2ZA 3LSFB 1EH3A 3BFTA 3MVXA 1RYOA 2X7QA 3M3LA 5JK4A 3V5AA 2I48A 3FGSA 5EYFA 1YCJA 4BDLA 3O6IA 3QK6A 4UACA 5I57A 2X7PA 4X1BA 2XXUA 1PB9A 3PUWE 4QFNA 2ESNA 1MXVA 3QUJA 2YPNA 4DCXA 4I8CA 5HPQA 3C33A 1LCFA 2Y7WA 2XXXA 4HW8A 2RCAA 3JYRA 2DWAA 4ESXA 4H8JA 4KD5A 5AA2D 4ZE9A 2O84X 5DEXB 2I0BA 4O3BA 4OETA 4KR5A 2QMWA 2F78A 1N76A 2RC7A 1F9BA 1H3DA 1UTBA 4ZDMA 1B3EA 1I6BA 3PD8A 2ZXTA 4OVJA 1QUJA 1O7TA 5AA2A 3LR1A 3MVZA 2HZKA 3T9XB 2ZYKA 1FQBA 3U92A 2F97A 3FIRA 1VR5A 1A54A 2P2AA 1EZ9A 1URSA 5I56B 4RPNA 5TPAA 1MQIA 3QIMA 2O6AA 4WEPA 2UVIA 1BIYA 3VVEA 3PGFA 3IOWA 3LSXA 2XX8A 1VE4A 4MH5A 2R71A 1VSOA 1IITA 2E0SA 3D4CA 2XHDA 5DTBA 2GH9A 4BLAA 2H5YA 4POXA 1MS7A 1P1WA 1CE2A 2FNCA 3TCFA 3UN6A 5CI5A 3C32A 5FHMA 3SKPA 1YTVA 3S4UA 5DVFA 3RNNA 4IO3A 1ZIUA 2W7YA 1II5A 1OLAA 5H8FB 4KCDA 2ZNTA 1B1XA 4TLLB 5KZTA 1IUDA 3K00A 2B3FA 3OO8A 4GQOA 1M5FA 3K0VA 3IK6B 3KGCA 3OMBA 2Q2AA 4RYAA 4DXBA 4IB2A 4PFYA 2O1LA 4U1ZA 4U4XA 1IEJA 1MXWA 3S2VA 2OBGA 4KI0E 3OENA 1D9YA 1GV8A 5TP9B 3L6GA 2HAVA 2GHBA 2RC8A 4OQOA 1DPPA 3FV1A 4F3BA 1H44A 1PEBA 3OSQA 4C1UA 2CMOA 5EHMA 5FHOA 4GL0A 5I58B 4MLVA 3UA8A 3PMVA 1LFGA 4U21A 1B2HA 2H98A 1BTJA 4NWDA 2Y7RA 3ILTB 1SYHA 1Y3NA 3U93A 3THIA 5JTYB 3ZSFA 1LAGE 4R75A 3OOAA 4H65A 3T9UA 3TTMA 4IO7A 4IY5A 3G3JA 1ZBMA 3HV1A 4MF3A 1NNTA 4YKPA 5L9OA 3FVGA 5ISUA 2PT2A 2HZLA 1MPDA 3MVYA 2NXOA 1A8FA 1MY1A 1FCKA 4F1UA 4YU0A 4HS7A 3MPLA 3LUYA 3IB0A 3AXFA 5H8HA 3CFZA 3DP4A 1LFHA 1LAXA 5F7VA 1D4NA 2O68A 2AL4A 1WVJA 4HCWA 4YAHX 4C1TA 3TODA 2AIXA 3SEYA 3TTRA 4PP0A 4YB7A 1JNFA 1LAHE 1M5BA 3EF7A 1BP5A 2I3VA 2F34A 2HXWA 3CG1A 3IO4A 4GIZA 2PMSA 1LFIA 3KSXA 5ITOA 1JW5A 2KLFA 2XXPA 1URDA 3LSLA 3DLNA 3GXAA 2P0SA 2VGQA 3KG2A 1QJMA 4LVQA 3TAJA 1USYH 3FUZA 3OSRA 3U72A 5H8QB 1QUIA 4H0WA 4QHQA 3G3FA 1FTJA 1WDNA 4BDQA 1US5A 4GF8A 1JW4A 3V89B 3C9HA 2Z8DA 2XXVA 1NNFA 1NL5A 2GRVA 4ELOA 4FIMA 4MFIA 1N04A 4DZ1A 1GGGA 4R6HA 3TFLA 2QS4A 4K3FA 5BWJA 1IXCA 4JWXA 4PFWA 4F19A 4YKIA 4KCCA 2DYXA 1FTOA 3MWBA 4DIGA 2H4IA 3P7IA 2D5WA 3B6WA 1O64A 4M4GA 1GVCA 2ZYNA 1RKMA 2VD2A 3H6WA 3KOTA 5EHSA 2B3BA 3IL1B 3IOTA 1PBQA 3G3HA 1DMBA 2OWTA 1HSEA 3Q28A 1AL3A 3U1OA 1MDP1 5DVIA 1DOTA 1J1NA 5DVJA 1SW2A 4FATA 3QUFA 5TP9A 4OENA 2FYIA 3EQ1A 1HSLA 1A40A 1P99A 3MJNA 3RGYA 2Z8FA 1MH4A 2RINA 1XVYA 4ZEKA 3N26A 3OEMA 5I58A 1YAEA 5IKBA 1M5CA 3QXMA 4XKPA 3G7WA 4GRKA 2YJPA 1B7HA 3QAXA 3LC8A 2DE3A 3K2DA 3C35A 5AA4A 1IXGA 3U94A 1MY0A 2V25A 2OLBA 3E13X 4LZ7A 3A3CA 2UVGA 2F7CA 4AB6A 4RJZA 1Y9UA 2ZYMA 2V3TA 4XTCQ 2V93A 1PC3A 1OQHA 2HFBA 3TQWA 3IJXB 3CRBA 1Q1KA 1MXYA 4ELPA 4NF4B 3GBAA 5IAIA 3KN7A 1B58A 3TDJA 3WAEA 3RQTA 3FJGA 2Z22A 1B7UA 3CR9A 3Q27A 4GOTA 4OFOA 2D3IA 4WXJA 3FATA 4BDNA 4P0GA 4U4SA 1Y4CA 3MZBA 3KEIA 2PYYA 1H43A 4OEUA 4FJPA 1SW4A 3QSLA 4TLMB 4RA1A 3ODBA 4E0WA 5ITPA 4NF8B 3TKDA 2RCBA 5DYHA 2GFEA 1ANFA 2V3QA 4HTGA 1P1QA 1IXIA 4U23A 5HM4B 3E4RA 1P1OA 1JETA 2I49A 4OYVA 1AMFA 1B51A 1N84A 2XXIA 1TFDA 3K6UA 2RC9A 3PV0E 4OFLA 1QW0A 4YB5A 1LCTA 3DP8A 3FVKA 1URGA 4R2BA 1QUKA 4IO5A 2F6PA 4N6PA 5K2YA 5LOMA 1ELJA 3O9PA 1B7ZA 3PPRA 5BUUA 4R9FA 2Q2CA 1KWHA 4XKNA 5I2NA 1R1NA 5I59B 2F8DA 1B46A 3Q29A 3CFLA 3KSJA 1I69A 2P1SA 3HN0A 5M2VA 3RPWA 1SI0A 3O2AA 2F7AA 3UORA 4RY1A 1RYXA 3A09A 2H25A 2UYFA 3FXRA 1I6QA 4O3CA 1XOCA 3USDA 3C36A 4RNSA 1Y4TA 3VLUA 4XXUA 1FW0A 3O6HA 2DVZA 3IORA 1IIWA 1VFEA 4G8NA 4G68A 2ALUA 1R6ZA 4BDRA 2ONSA 4EQ7A 4KQPA 3G3KA 4R9GA 4NF6B 5L9SA 3TZAA 4OZ9A 4TQUQ 3LBSA 3FJ7A 4H5GA 2XXRA 3B7DA 3T9HB 2OCUA 2Z23A 1SD3A 4RK2A 5CC2A 4OESA 1SVXB 4QF9A 3S9EA 2G93A 1Z7NE 1QKAA 2I0CA 3RUMA 5CM6A 2OZZA 2I4BA 2GHAA 3VDFA 4G4PA 5JEIA 1UTHB 3N6TA 3N94A 2Q8JA 4IO6A 4F29A 5L8DA 4QRZA 3SERA 1CB6A 3PD9A 1MY4A 4F3SA 4IO2A 1OVTA 4F3PA 3LSWA 4NF4A 1POTA 2PVUA 1B5HA 5ICQA 4RPOA 4PFUA 4OFJA 1MQJA 2HEUA 3K1PA 3IJOB 2PBWA 3DM0A 3PPNA 4OWDA 4PETA 3TYHA 4FEBA 3BKIB 3O6GA 1AIVA 3CG3A 1Y3PA 3SEWA 3KJTA 3G3IA 3V83A 3K1MA 1I6AA 4LATA 1B32A 3D4GA 3RTWB 3S9NC 1MPBA 3RTFB 2IA4A 3MZ1A 2ONKE 1ZMGA 3PMXA 2UXAA 4LUBA 1WODA 3PMWA 4DE8A 2QS1A 4Z7EA 3FXQA 4I1DA 4JB7A 3FVOA 3JV9A 4KYSA 2QJEA 1B0HA 2XXYA 3MZ9A 1B3HA 3CI8A 3MVWA 5DEXA 3A3UA 3H6UA 3T93B 4H6DA 4DLDA 1B3GA 2DWIA 3MPKA 5I59A 4FE8A 2Q88A 4NF5B 1PDAA 4XKQA 1A7LA 2DQVA 2QRYA 1R9LA 1NH8A 5K2XA 3R26A 1FTKA 2V3UA 1LB9A 2CZLA 2ZNUA 3MUQA 3GBBA 4THIA 4IGTA 1LB8A 3WAFA 4X48A 3HHGA 3H4ZA 1US4A 4PE5B 1S9TA 2DXRA 1D3KA 5I56A 4AQ4A 3UK4A 1FQFA 2ZNSA 1OMPA 1JEUA 2XD3A 5H8NB 4KPTA 3VXBA 2PX1A 2FA7A 3HO7A 1JW1A 1T0KA 4NF6A 4U2RA 5I57B 3MP8A 1A99A 1XVXA 1HSJA 2ABHA 4YMBA 2VOZA 3TCGA 1LLSA 5KCJB 2VD3A 2QL3A 1MM6A 5H8SA 1A55A 3H6VA 3K6XA 4H5FA 3H7MA 1SW1A 2O7UA 4Q8RA 2F6GA 4R72A 3TEPA 4PFTA 3FD3A 1B52A 3O28A 3R7XA 1N7XA 5H8FA 4EDPA 4GFRA 1MQGA 5CMMA 2F7BA 4YKJA 4Q5TA 4BDOA 4QSEA 2VHAA 3MP1A 1MM7A 4Z0IA 2DP8A 2OJTA 5AA2B 1B5JA 1A8EA 3TMGA 1TFAA 4O3AA 1MY2A 4RXLA 3QYTA 2Y7KA 1M5DA 2VP1A 3VLVA 3O97A 3BFUA 4KYEA 3C4MA 3S9LC 3K6WA 2O7IA 1LAFE 1H45A 4UA8A 3O29A 1S7YA 1GTKA 1Z7ME 1QVSA 4TOZA 1IQ7A 3PPQA 4G8MA 3GLBA 4GXAA 4F3GA 1GR2A 1H76A 2Q89A 1AH5A 1JEVA 5CRYA 3E3KA 4R6YA 5ELVA 1SW5A 4XIGQ 2XXQA 3K4UA 3SEXA 3SETA 3OO7A 4QFLA 1JVYA 5JTYA 2DSFA 2OK2A 1FQCA 3M3KA 4ZEFA 3M3FA 3RY3A 1UIUA 2O1MA 5CMBA 3TPAA 4R73A 3K1NA 4H8IA 3TTKA 5HBCA 1OLCA 2O51A 4NF5A 5I2KB 2RF1A 4YMAA 4Q30B 3EHUA 4QFOA 3O66A 4EQ9A 4ZEBA 4F2OA 4JXIA 4XKRA 4E0XA 4M1VA 2XX7A 2AL5A 4AB5A 4R74A 4EF2A 2ZYOA 1LGBC 3MW0A 1L5TA 4P11A 1MRPA 2BJJX 3IB2A 4LZ5A 2ANJA 3I5OA 4ND9A 1Y1ZA 4DXUA 3BBRA 5J1DA 4QSCA 1DSNA 1XS5A 2QSXA 4OEVA 5H8NA 4ZZEA 4YZZA 2HCAA 1Y20A 2XXWA 3T66A 5FTIA 4GLIA 4JDFA 2DVCA 1OQGA 2A5TB 1ZU0A 2QS3A 1JQFA 1MXXA 3IO6A 5H8QA 3PUXE 5AA1A 5KCJA 1NKXA 3ECRA 2I4CA 2UVHA 4EXLA 3FZVA 4F18A 1NH7A 3CVGA 3HPIA 2I58A 3ZKLA 3R6UA 3KZGA 4GWOA 2R9JA 1XC1A 2V84A 1N3XA 5A5XB 4EXKA 3N6UA 3FASA 4WKMA 3HCQA 4FECA 2O69A 5CMCA 3T22A 5H8HB 1B3FA 1Y1MA 4WEDA 3H6TA 1Q35A 5KDTB 3SDFA 3HHFA 4P0IA 4EF1A 2DE4A 1B1HA 5AA3A 1ATGA 1O63A 2NVUB 3UIFA 2E1SA 3V8XB 1B40A 1MXUA 5B7DA 1N7WA 4LA9A 3PUYE 3OD7A 2AYSA 3IOVA 3FJMA 1B3LA 2NUVA 2XXTA 3Q25A 3S9MC 4L17A 4U1OA 3T96B 3VV5A 3CFXA 1IXHA 4KYDA 2OWSA 1B0LA 3RT6B 3MP6A 2THIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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