3OD7A

Haemophilus influenzae ferric binding protein a -iron loaded
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
total genus 116
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A02
1DPEA 2RC7A 4H5GA 1R1NA 4Q0CA 3OD7A 3GLBA 1SI0A 2Z8DA 2DVZA 3HHFA 5H8FB 4GF8A 4FECA 1UIVA 4R2BA 5FHMA 3PMVA 3HCQA 3S2VA 3PPQA 5FHOA 2I3VA 2REJA 4ELOA 5JEIA 1QKAA 1FCKA 4QFKA 4G8MA 3FASA 1JQFA 3IORA 2PT2A 2DYXA 1AOVA 2V93A 3H4ZA 4NF5A 3ILTB 2O1MA 2VD2A 1O64A 3E9XA 5HPQA 3DP4A 4FEDA 1B1XA 4NF4A 2XXQA 1YCJA 5I59B 1OIBA 2UVJA 3N26A 1D9VA 4Q8RA 4K3FA 4JWYA 2PX1A 1FTLA 2BJJX 4RJZA 1YPNA 5FTHA 4F3SA 5CRYA 4PE5B 4U21A 3DM0A 1IQ7A 1S7YA 1POY1 3ZKKA 3N6UA 2AYSA 3OELA 3I6VA 2ZNUA 1B58A 2Z22A 1O7TA 5M2VA 1Y1MA 1Z7NE 1DTZA 1JVYA 2H4IA 4H1XA 4KR5A 2H25A 2Y7KA 3QAXA 4I8CA 4LA9A 2R6GE 1FQBA 1N7XA 5EYFA 4FEBA 4YU0A 3T9HB 3SEWA 4QFLA 3C4MA 4LATA 3K0VA 4E0XA 3TCHA 2O7IA 3THIA 1NKXA 4BDMA 3S9NC 3K2DA 1ZLQA 3RNNA 4C1TA 2QS3A 3BBRA 4U2RA 4YB7A 1B3EA 2QS1A 3O28A 2F5XA 2I49A 1M5EA 5CBSA 3MPKA 2M8CA 1MRPA 5ICQA 1SI1A 3FXRA 1P1NA 2GH9A 3PPNA 3LBSA 2PMSA 5I2KB 1JVXA 3GBAA 1NFTA 5I57B 1MM6A 3D4CA 4MH5A 3T66A 3PD9A 5KDTB 3KN3A 3IOTA 1H45A 1NNTA 2LAOA 3PUZE 1MXWA 3IAZA 4GLIA 3T9XB 3EHUA 3TZAA 1KWHA 2XXWA 3K1MA 2CZLA 5IAIA 3PU5A 2DVCA 2DXYA 4OERA 3OSRA 3U8QA 5JTYA 1T0KA 4XKRA 1PB9A 1A55A 4EQ9A 2E1SA 3KSJA 1FTKA 4EXKA 5I2NB 4R9GA 4QSEA 1JNFA 2F35A 4H8IA 3MZBA 2F36A 3SDFA 2THIA 4F3GA 1UTHA 3O66A 3MP1A 4OXVA 3RPWA 4FIMA 4M1VA 1HSJA 4Q30B 2YLNA 1DMBA 2R9JA 4GQOA 3IB1A 3VV5A 5KCJB 3TKDA 4FE8A 1UTBA 3N94A 4IO4A 4ND9A 5IKBA 1B46A 1B4HA 1YTVA 3SEYA 5ICTA 1MY2A 2Z23A 1ATGA 1TXFA 4OZ9A 2A5SA 3TTNA 5H8FA 2O68A 4I1DA 3N5LA 1LLSA 4BDLA 2Z8FA 2NVUB 4KYSA 1XVXA 4LZ8A 3OMBA 3M8UA 1SVXB 3O6IA 4RYAA 5CMMA 4NF8B 2E0SA 4EDPA 4C1UA 2ZXTA 3MC2A 2RC9A 1IXCA 4IY5A 1FTJA 2RKMA 5CI5A 4FATA 2A5TB 2H98A 4WEDA 4P11A 1MXVA 2Q88A 2HCAA 3JZJA 4JSOA 1UQWA 2H9BA 1BLFA 2DWJA 5I59A 3EF7A 4LZ5A 2XXUA 3DP8A 1B9JA 3K6XA 3TTKA 1H43A 4G8HA 4RK9A 1OVBA 1XHYA 2KLFA 5JK4A 2IA4A 4EF1A 4R73A 2H5YA 2HAVA 4KQPA 4RK2A 3G3JA 3H6UA 4HS7A 1WDNA 2DWHA 2XD3A 4FAJA 2DSFA 4HTGA 2QS4A 1IZ1A 4IGTA 3VLVA 4OHNA 4GVOA 3CR9A 3IJXB 2F34A 2Q2CA 2DE2A 1USYH 3SERA 3TTLA 4BLAA 4GL8A 3K00A 5AA2B 5DVFA 2XXRA 3TODA 4GXSB 1P1OA 2O69A 1MPCA 3IOVA 5AA1A 3SEXA 3R6UA 2DOJA 3TTMA 1FQEA 4O3BA 4TLLB 4ZEBA 4YKPA 3MUQA 1SDXA 4YMBA 4PFTA 5DVIA 5TU0A 3EPEA 3G3FA 4G8NA 1HSLA 1Q35A 4UACA 1OVTA 4R2FA 3RGYA 1IXHA 1GTKA 2GRVA 1IXGA 1B2HA 3IOUA 2XXIA 3O6HA 4BDOA 2OWTA 4GIZA 1OLCA 4ZS9A 1LAHE 3CFXA 4NMYA 5TPAB 2F78A 2X7PA 5F1QA 1B3FA 3PMXA 2OZZA 4PP0A 5AA4A 3MW0A 4OQOA 3QIMA 4MF3A 3G3GA 1VFDA 2PT1A 3TQLA 5AA3A 3D4GA 5KDTA 2F8DA 3H6TA 3PUXE 3V8XB 5I56A 1R6ZA 4DIGA 4JDFA 1QUKA 2ONKE 4MLVA 4OFOA 1ZIUA 4DE8A 3RLFE 3TDJA 2PYYA 1D3KA 4TLMB 1N7WA 1RKMA 2P1SA 2DP8A 1M5FA 4P0IA 1N84A 4DXUA 4IO6A 1B5JA 3MP6A 4E0WA 2GFEA 1US4A 3FATA 3FJ7A 4LONB 1XVYA 4U22A 1A54A 2ALUA 1ZKBA 3S4UA 4JWXA 1LBCA 3A3UA 1WVJA 1JEVA 4YZZA 2QMXA 3U93A 2DWIA 2V3QA 2XXVA 3H6VA 4YKJA 2ZYOA 1JEUA 4X1DA 1Y9UA 4NE4A 2UXAA 3ODBA 3C9HA 1DTGA 3B7DA 1I6QA 3USDA 4XKPA 4NF6A 2ONRA 2ZMBA 3UGWA 4R74A 5DVJA 3B6TA 4IO5A 1FQFA 2FA7A 1NH8A 2VD3A 3MZ9A 4UA8A 2VP1A 1B51A 3IOWA 4G68C 4U23A 4OEVA 4IGRA 3RUMA 5AE4A 4OMBA 4DXBA 2FYIA 4IO7A 1B1HA 1SW2A 3CIJA 2OCUA 1ZMGA 3KSXA 5I58B 3QUFA 1XC1A 4ECFA 2Y7PA 1B5IA 1I6AA 3L6HA 1FTMA 5A5XB 4F39A 3V83A 3MQ9A 3PMWA 4ONYA 3IX1A 1A7LA 3QUJA 3KJ7A 3PUVE 4F22A 4U1OA 1Y3PA 4P0GA 1Y1ZA 4OFJA 4F31B 4I62A 3MAMA 1IXIA 2REGA 4OVJA 4RA1A 4EXLA 1GGGA 1NMUA 3VVEA 5L8DA 1VE4A 4JWOA 3UIFA 5L9OA 1PB7A 4XKNA 3S9LC 4EQ7A 3H03A 2QJEA 4OFLA 2OK2A 2G93A 1WODA 3K6WA 4Z7EA 3FVOA 3MVZA 3W15C 4O3CA 5F7VA 2DE4A 5CC2A 1P1QA 3VXCA 3TEPA 5ISUA 4C0RA 2DE3A 2XXTA 5CBRA 1US5A 4ZEFA 3EHTA 3FZVA 3UN6A 2V25A 1F9BA 3H3GA 5AA2D 1IEJA 1MY4A 2D5WA 3G3KA 3UA8A 3PPPA 5CMCA 3HV1A 1ZJLA 2O51A 2Q2AA 4LQ5A 2Q8JA 1FQCA 4R6YA 3LSXA 1VFEA 4WXJA 1TT1A 1QULA 4G68B 1LGBC 3CRBA 1I6BA 2F7CA 2OBGA 3KGCA 3FD3A 1MPDA 1SYIA 3Q29A 1HSEA 3G7WA 3U92A 2VOZA 1Q1KA 3TUSA 2NUVA 5L9SA 2I4CA 1FQAA 1H3DA 1H76A 1MY0A 3MPLA 4OEUA 3R7XA 3LR1A 2O6AA 4RY1A 5H8QA 4PFYA 4IY6A 2FNCA 3FV2A 4H0WA 3O29A 1PDAA 3CFLA 1CB6A 4NWDA 5L9MA 3VXBA 4EQBA 1B32A 1D9YA 1LFGA 3PPRA 3T96B 3V5AA 3ILUB 5H8NA 4FJPA 4BDRA 4AB6A 1RYOA 1JW4A 4YKKA 1P1WA 3TELA 3WAEA 4NF5B 1N0TA 4H5FA 4XKQA 2NWJA 1NNFA 1SW4A 2Y7RA 1O63A 4NF4B 1FTOA 1SYHA 1PBPA 3HO7A 1AMFA 2UYEA 1A8FA 3M3LA 4ZEIA 3FJMA 3FXUA 4JSDA 2F97A 3C32A 1Y20A 3W9WA 2I4BA 3RN8A 3FJGA 3DP6A 4KD5A 2ANJA 2B3BA 4ESXA 3MVXA 5TP9B 3MP8A 1PC3A 3ZSFA 3W9VA 3PGFA 1DPPA 2Z8EA 1IITA 3SESA 2UYFA 3O2AA 3DELB 4THIA 4L17A 3CSGA 1QW0A 1EZ9A 1MH3A 3E13X 3S9MC 2I58A 3I5OA 1XOCA 5ITPA 2I48A 3H6WA 3C33A 1B0HA 3K01A 1FQDA 1URDA 2D21A 5CMKA 3O97A 4TQUQ 2F6PA 1GV8A 2YJPA 4HCWA 4N13A 2B3FA 4ESWA 3C36A 4IB2A 1LAXA 1PBQA 4QFPA 2UVGA 1OMPA 2R71A 4ZECA 3LC8A 2V3TA 4AQ4A 4BDQA 2ONSA 4RXLA 1B7ZA 1YAEA 5A5XA 5BWJA 1LBBA 4AB5A 1MQDA 3TYHA 2CMOA 4H67A 4ELPA 1SD3A 3M3FA 3WAFA 3L6GA 1MQIA 1B5HA 1CE2A 4LP2B 2Y84A 1P1UA 3LSLA 3OOAA 4U4XA 5I84A 2QL3A 3PUYE 1EH3A 4BDNA 4OENA 3T93B 3E3KA 1GVCA 3RT6B 3Q25A 1SBPA 2RINA 3HN0A 4JBZA 3T22A 3CG3A 1MXYA 2UVHA 1XS5A 2XX7A 3EHSA 4YAHX 4KYDA 4KCCA 3OENA 5DYHA 3R26A 3TCGA 1EZPA 5JTYB 4OYVA 3OXNA 4Q5TA 2O1LA 3LSFB 3PPOA 1PB8A 1FW0A 1D4NA 5I2KA 2Y7WA 2UVIA 5BUUA 2GHAA 5I57A 1MY1A 4H6DA 3MBPA 1L5TA 1IIWA 1MQGA 1EZOA 2OLBA 4LUBA 4R72A 1B7UA 5H8SA 1R9QA 3Q28A 1UTHB 4MLQA 2XXYA 2VGQA 4JB7A 4EUOA 3FVNA 1SW5A 1R9LA 4G2ZA 3V89B 4F29A 3OO6A 1GR2A 1MS7A 3CI8A 1LAGE 2W7YA 1J1NA 4F18A 1DSNA 2YPNA 1UTBB 3IB0A 3TQWA 3BFUA 3M3KA 4QSCA 3IL1B 4IO3A 4N6PA 4TOZA 5I2NA 1A8EA 4ELQA 3KFMA 4F2OA 3VFJA 3ECRA 1POTA 2X26A 5FTIA 4MBPA 1MH4A 2NXOA 2QRYA 3DLNA 3UP9A 5EHMA 4KFQA 4GWOA 3LSWA 4R6HA 1LB8A 3I3VA 4GFRA 2Q9TA 3MWBA 2ZNSA 1ZBMA 3U1OA 5KCJA 3H7MA 3MZ1A 3OEKA 4OTEA 4DCYA 3KOTA 3C34A 3SEVA 2ABHA 3UORA 3RTFB 3P7IA 3TTRA 1MM7A 4IO2A 2HAUA 1LCTA 2RC8A 2XD2A 4WEPA 1AH5A 1MQHA 1MXZA 1XT8A 2QS2A 4KCDA 3B6QA 3T9UA 4POWA 3RQTA 4DLDA 1UIUA 3KOSA 2VHAA 4F2QA 4EF2A 3F11A 1JW5A 4YB6A 2DS9A 1A40A 3CG1A 2OWSA 5EHSA 4F3BA 3EQ1A 3SKPA 3JV9A 3K1NA 2ESNA 3RY3A 4YMAA 4F1VA 3KJTA 4NF8A 4ZDMA 1TWYA 2XXHA 1OLAA 5TP9A 2F7BA 1N04A 2A5TA 4X1BA 4RNSA 2AL4A 1MDQA 3IJOB 3CSBA 2PBWA 4YICA 5HM4B 4DXCA 5DTBA 3ZKLA 1S50A 3MVWA 1PEBA 3PUWE 3KEIA 4RPNA 3MVYA 4ELRA 3G3HA 3VE1B 4XIGQ 4O3AA 1MDP1 2HEUA 2Q89A 4F1UA 3O9PA 4M4GA 1EU8A 3KZGA 5H8HB 1QUIA 4G77A 3TMGA 1Y4CA 3BKIB 4F1YA 2IEEA 3KN8A 4GXAA 4POXA 4LZ7A 1LB9A 3FV1A 1DOTA 1IUDA 3T9VA 1B3HA 3VLWA 1ZU0A 3IB2A 5HBCA 2WKYA 4GRKA 5AA2A 2H99A 3HHGA 3OO9A 4KI0E 4QRZA 4PQJA 5AA4B 1H44A 3TFLA 2O84X 1BIYA 3C31A 1N3WA 1P99A 2I0CA 4DCXA 4R75A 2HFBA 3KN7A 5DEXB 3VVFA 1LFHA 2XHDA 3IO6A 3K02A 1QKBA 1VSOA 5I56B 4LQ2A 4NTLA 2GHBA 1AIVA 4DDDA 2G29A 1MXXA 1B3GA 4NEDA 1B4ZA 1RYXA 4Z0IA 5TPAA 4PFUA 3RTWB 4OWDA 4YKIA 4QF9A 3TAJA 4WKMA 3C35A 3KBRA 1JW1A 3N6TA 4H8JA 2XXXA 4ISUA 2V84A 1NH7A 5FHNA 3A09A 2XXPA 2PVUA 5K2YA 2Y7IA 2RF1A 3CVGA 1URSA 2QSXA 2DQVA 4OESA 1ZTYA 3K6VA 2F7AA 3QK6A 3QSLA 4ZEKA 3E4RA 3RT8A 5DT6A 1NNKA 3OO8A 4MFIA 3G3IA 2XX8A 3IK6B 3QYTA 3HSTA 3FVKA 1BP5A 1B0LA 4G4PA 4NF6B 3S9EA 3PV0E 3PD8A 3TPAA 3Q27A 3SEUA 4R9FA 2QMWA 1I69A 4F19A 1S9TA 5LOMA 4OETA 1LCFA 1Y4TA 3H06B 5K2XA 2D3IA 4DZ1A 1URGA 4XXUA 4R6KA 1ANFA 3EN3A 3K4UA 2RCAA 4QHQA 3Q26A 4QFNA 1OQGA 2I0BA 2XX9A 1MXUA 2HZKA 1LSTA 3MJNA 1OQHA 4N07A 1B05A 2HQ0A 5KZTA 3OSQA 4HW8A 4XTCQ 4YB5A 1BTJA 1B52A 1BKAA 4PETA 5I58A 4PFWA 3UK4A 4GD5A 4ZE8A 1TFAA 4ZZEA 4F3PA 1VR5A 3CFZA 3IR1A 2P0SA 2X7QA 3GXAA 1NNPA 1M5CA 1MQJA 2HXWA 2QPQA 3B6WA 1USYE 3FIRA 3O6GA 4FORA 3IO4A 4GOTA 3GZGA 2RCBA 2I3WA 4HCYA 5B7DA 3OEMA 2ZYNA 4U4SA 1B7HA 1B6HA 1MPBA 2OJTA 4KPTA 1QUJA 1A99A 4RPOA 5H8HA 3U72A 3VVDA 4ZEDA 4H65A 1Z7ME 2I6EA 2DXRA 1Y3QA 3QXMA 4I9DA 2AL5A 1M5BA 2O7UA 1B3LA 4X48A 4ZE9A 5CM6A 1JETA 3FXQA 1QJMA 5B70A 3FVGA 3TCFA 3HPIA 3BFTA 3VDFA 3LUYA 5ELVA 3ZS6A 4LVQA 1LFIA 2F6GA 3SETA 4QFOA 1MY3A 1SW1A 5H8QB 4KHZE 2HZLA 4QSDA 2B65A 1LAFE 1M5DA 1N76A 1MG1A 1N3XA 3FUZA 3FGSA 3A3CA 3OO7A 4G68A 2P2AA 4U1ZA 4NWCA 1B40A 3GBBA 5DEXA 3ONMA 2V3UA 1NL5A 5ITOA 1ELJA 5H8NB 3KG2A 1SQYA 3AXFA 3K6UA 1II5A 2NOOA 2ZYMA 3K1PA 4GL0A 3VLUA 1QVSA 4X9TA 1AL3A 3JYRA 2ZYKA 2AIXA 1Y3NA 5J1DA 2DWAA 4ZZAA 4JXIA 5CMBA 1TFDA 4KYEA 3U94A 2ZNTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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