3OD7A

Haemophilus influenzae ferric binding protein a -iron loaded
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 116
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A02
3L6GA 4H8JA 5I84A 2GHAA 2UYFA 4GXSB 5B7DA 1SYIA 2F6GA 1Y20A 2HFBA 1MS7A 4PE5B 1FTMA 2V3UA 4QFPA 3MVZA 4LA9A 4F1UA 1B05A 3OELA 2DE3A 5DT6A 1NKXA 3EHTA 2Y7KA 5I56B 3K1MA 1ZBMA 2WKYA 2Q2CA 3UA8A 3TFLA 1PB7A 2OWSA 3T9VA 4IGRA 5AA4A 4YKPA 4XXUA 1FCKA 3T9UA 4F1VA 1VR5A 4OFLA 4GFRA 1A7LA 3U1OA 2XD3A 1LB8A 2Q9TA 3I6VA 3SEYA 1P1OA 4NF5B 1D3KA 3TYHA 1XOCA 2DVCA 3JZJA 2OBGA 2O84X 2I6EA 4IB2A 3HPIA 5DVFA 2RF1A 1EZ9A 1I6BA 5H8QB 3M3LA 4IY6A 3VVDA 5CC2A 3SEXA 3VFJA 3PPQA 2XXXA 2I3WA 1SW1A 4L17A 1IQ7A 4BDOA 1OMPA 4N07A 4ZZEA 2ZYOA 1SBPA 3KEIA 4IO7A 1IXHA 4R75A 1B9JA 2ABHA 3PPPA 4XTCQ 3Q26A 1ZTYA 1H3DA 1URGA 4H6DA 2ZNTA 2DWIA 1YPNA 3R26A 2DYXA 3CR9A 2F7BA 1NNPA 1ZMGA 3DP6A 3E4RA 4H8IA 5I58B 3IB0A 4ZE8A 5AA3A 2E0SA 3RTWB 3RN8A 4FE8A 1A54A 5H8HA 3G7WA 1BP5A 5ICTA 3JYRA 4ESWA 2CMOA 1HSLA 4ZZAA 4HCWA 3W9WA 3U92A 2HCAA 4XKQA 2AL5A 4JXIA 5JTYA 4OERA 3B6QA 4R9FA 3O6IA 5DEXB 1MXZA 4ONYA 5EYFA 3S9MC 3TEPA 3CSBA 4H5FA 2O51A 3SESA 1FQDA 5I2NB 1Q1KA 3FUZA 1B3EA 2Q89A 4ZEFA 1CE2A 3KSXA 5ITOA 4MFIA 3O2AA 1UIVA 3WAFA 4QF9A 1O7TA 3IJOB 3IOUA 3M8UA 2E1SA 4JBZA 5EHMA 4MF3A 4WKMA 3K01A 3CFXA 1R6ZA 1YCJA 3QUFA 2G29A 4IGTA 2F7AA 1NNFA 2I0BA 3BKIB 3KN3A 4M4GA 2Y7PA 1JW1A 3LBSA 1A8FA 4KFQA 4ZEKA 3T96B 5FHOA 3RTFB 1OVBA 4PETA 3QK6A 2ZXTA 3EN3A 3FJMA 3VLUA 1SI1A 2XXUA 3RT8A 2QL3A 2F36A 4F2QA 5F7VA 1P1QA 1US5A 4G68B 3SERA 1BKAA 2H9BA 4QSCA 4LVQA 1QUKA 2XXVA 3MVWA 2X7PA 4OEVA 4YAHX 1NFTA 3CFZA 1B3LA 3CI8A 1MY3A 1I6AA 3PV0E 1B1HA 3FATA 2OLBA 2V93A 4YZZA 5ICQA 4F3SA 1JEVA 2XXQA 3MVXA 1UTBB 2QS2A 1Y3QA 4H0WA 4EQ9A 5BUUA 3KOSA 3FXUA 4GF8A 4ELOA 1USYE 2AIXA 1FQCA 2NWJA 4DE8A 1UTHA 3O66A 3JV9A 5IAIA 3RQTA 3HCQA 4EQ7A 3MZ1A 4U4XA 1WODA 3TTKA 1DOTA 5CI5A 1PBQA 5I57A 1MM6A 4BLAA 2OCUA 3OOAA 2A5SA 3IOTA 3KFMA 3EPEA 2A5TB 4R74A 1II5A 3O6GA 5L9SA 3PU5A 3MPLA 5DYHA 4EF2A 1MXVA 5H8NA 3TQLA 4EUOA 4X1BA 5EHSA 4F22A 3H4ZA 4O3BA 3LR1A 2VOZA 1EU8A 3DP4A 1FTLA 3MJNA 4EQBA 2DP8A 4NF4B 4KPTA 4PFUA 3SEUA 3TTNA 3RLFE 1H43A 4LZ5A 4DIGA 1R1NA 1JVXA 1KWHA 1F9BA 4TOZA 3RT6B 2QRYA 3IO6A 4AB5A 1N0TA 4XKRA 1OIBA 5JK4A 4BDLA 3UGWA 1MQJA 3Q28A 3HV1A 3TPAA 1Y1MA 1Y1ZA 3DP8A 1LAHE 4KHZE 5FHNA 2PMSA 2ZYNA 4FAJA 2ONKE 2P0SA 2PYYA 2HQ0A 1MQHA 2Z8FA 2XD2A 3G3JA 4POWA 1L5TA 2Z8EA 4K3FA 4NF6A 5LOMA 1B32A 2ESNA 3ZKKA 2NXOA 1QUJA 5KZTA 1DPEA 4QFNA 3SETA 3U93A 4GL8A 3DELB 1DTGA 2AL4A 3EHUA 5HM4B 4IO3A 3HHFA 4UA8A 5A5XA 1IXGA 3G3HA 3D4CA 3TTMA 3VDFA 1DTZA 4F1YA 4NF8B 2DWHA 2Q8JA 4OHNA 5TP9A 2V3TA 1AIVA 1B7ZA 2NOOA 3FVGA 1T0KA 3C35A 3W9VA 1MH4A 3ONMA 4QRZA 1PBPA 1B5HA 3V89B 2HEUA 5I59A 2DVZA 4DLDA 4FORA 4QFKA 3IK6B 3OXNA 1FQEA 4NEDA 2UVIA 4R6YA 4YICA 4MLQA 1MPDA 1OLAA 1PB8A 1OLCA 3VVEA 3V83A 1BLFA 3PPRA 1B2HA 4QFOA 3C9HA 3FIRA 2PT2A 1WVJA 3TQWA 3VLWA 5KCJA 2H25A 4DXUA 1MY1A 3UN6A 4ELRA 4F18A 2QS4A 1TFDA 3K6UA 2Z22A 1MXYA 5H8FA 4H65A 4YMAA 4U1OA 2THIA 2F78A 3F11A 1LCTA 2H99A 1AOVA 1D9VA 5I58A 1MQIA 2R71A 3UK4A 3N6UA 3FASA 3I5OA 3BFUA 1P1UA 2Y7WA 1MH3A 1VE4A 3OSQA 4FIMA 4JWYA 1FQFA 4R6HA 1QKAA 4R2FA 4KQPA 4DXCA 4PP0A 5DEXA 3IJXB 3LSWA 3KN7A 4R72A 3GXAA 1QULA 1TWYA 1R9QA 1ELJA 4F31B 2BJJX 4Q30B 5CMBA 1A8EA 3TZAA 1FW0A 4GL0A 3GBAA 1XVYA 3H03A 3MW0A 4PQJA 4F3PA 5I2NA 2OK2A 2ONSA 5AA4B 2RCBA 3FJGA 4AQ4A 2O68A 3M3FA 3K6VA 3MC2A 2F34A 4G8HA 4LQ5A 2ZNSA 4ZDMA 3OO8A 1PEBA 5I2KA 1B1XA 4U1ZA 1RYXA 2REJA 5IKBA 3CVGA 3EF7A 3R7XA 3HN0A 4AB6A 1SW4A 5HPQA 2P1SA 1NL5A 2DWAA 4R73A 1TT1A 3CG1A 3N94A 2OZZA 2HZLA 3SEWA 2XX8A 2H5YA 3KBRA 4U23A 1ZIUA 4YB6A 1FTKA 3CG3A 3UORA 4RY1A 2I4BA 3K0VA 1ZU0A 3MP1A 1H45A 1N3XA 3IOWA 3HSTA 2RC8A 2YLNA 1IIWA 3H6WA 1VSOA 2OJTA 3PUXE 3DM0A 3EQ1A 3DLNA 4GQOA 3MZ9A 4RXLA 1NH7A 1Y9UA 1IEJA 1URSA 1EZPA 1NH8A 4ND9A 1A99A 3QXMA 3V5AA 5FTHA 2UVJA 3O29A 2DS9A 3H3GA 4U2RA 4EF1A 2O1MA 5L8DA 4NWDA 1MY2A 2ZNUA 4N13A 5TPAA 4XIGQ 2NUVA 3U94A 1MQDA 3CIJA 1UTBA 1DPPA 5H8HB 1LFHA 2VD3A 3MVYA 2Q2AA 3RNNA 4LONB 5DVJA 3QYTA 1P99A 4Q5TA 2RKMA 5JTYB 4RK2A 1H76A 3M3KA 1IITA 4E0XA 1XVXA 4NE4A 4MBPA 1DSNA 3OEMA 1Q35A 3KOTA 4RK9A 1IUDA 1Z7ME 4HCYA 4F19A 4YKIA 4ZS9A 2ZYMA 1M5BA 1B3HA 1UIUA 1J1NA 4RYAA 4FECA 4G77A 4RPNA 3U8QA 4EDPA 1OVTA 1LLSA 4DCYA 1LCFA 3USDA 2D3IA 1ANFA 4QSDA 1MY0A 1FQAA 2V3QA 1MPCA 2YPNA 4RNSA 4ECFA 4Z7EA 4NTLA 5FTIA 4XKNA 4ISUA 3GZGA 4TQUQ 4TLLB 2CZLA 3PD9A 4HS7A 2H4IA 1MG1A 2Q88A 3IORA 4DCXA 3LSXA 1B3GA 2XXTA 3Q25A 3VXBA 3TELA 1PC3A 5CRYA 2DE2A 4OXVA 3OO9A 4P0GA 4ELPA 2ONRA 1LAGE 2O1LA 3C4MA 4C1UA 4R2BA 3ILTB 3C32A 3TTLA 5CMKA 3PUZE 2Z23A 1A55A 4WEPA 2Z8DA 3ILUB 5M2VA 1Z7NE 4O3AA 1B7UA 4G2ZA 2G93A 2HAUA 3TCHA 4OFJA 3MBPA 3TAJA 4POXA 4F3BA 1QW0A 4LP2B 4OESA 3UP9A 2QMWA 1BIYA 3MPKA 1P1WA 5CMCA 4EXLA 2HXWA 2I58A 2VP1A 1DMBA 3R6UA 1B5JA 1PB9A 4OFOA 1N84A 3Q27A 2X26A 4YMBA 4GWOA 1RYOA 3BBRA 5ELVA 1UTHB 2B3FA 1Y4TA 1H44A 2I48A 4LZ7A 2O7IA 4Q0CA 3FVNA 4GXAA 3O9PA 2PBWA 3FD3A 3T9HB 4NF8A 3IL1B 3ZKLA 3C34A 4BDQA 1VFEA 4RPOA 3B6TA 1LB9A 3T9XB 3H7MA 5I57B 1B4ZA 1M5CA 1UQWA 1SI0A 3TDJA 3LSFB 5FHMA 4GVOA 5JEIA 2RC7A 1S9TA 2XXIA 3K4UA 4FEDA 2VGQA 2HZKA 3FXRA 1MM7A 5H8NB 3H6UA 1IXCA 3E13X 4QHQA 5I56A 1QKBA 4N6PA 4ESXA 3GLBA 4KYSA 3WAEA 4ELQA 3VV5A 1MXXA 2LAOA 4DZ1A 4U4SA 4GRKA 4KD5A 4GD5A 1B52A 1SQYA 2NVUB 4OEUA 3PUYE 3O6HA 4X1DA 1YTVA 3KJ7A 3VE1B 4HTGA 4C0RA 1MRPA 3CSGA 2ANJA 2F5XA 5AA2B 5CM6A 5KDTB 3Q29A 4NF5A 3BFTA 3FV1A 1LBBA 3UIFA 1ATGA 5AA2D 1YAEA 1LGBC 1HSEA 2IA4A 2F8DA 2DOJA 3TTRA 5H8QA 5CBRA 3T22A 2D5WA 2OWTA 1MDP1 3S9EA 2DQVA 2R9JA 4NF6B 3RUMA 3THIA 5CMMA 4BDMA 1B0LA 1N3WA 3KSJA 3U72A 3TMGA 1LSTA 1XT8A 2HAVA 1Y3NA 4YU0A 4WEDA 1ZLQA 1B5IA 4ZE9A 2XX7A 3VLVA 3N6TA 1JQFA 2UVGA 2XXRA 1S50A 3KN8A 1QUIA 4GIZA 5A5XB 4F2OA 4I8CA 1WDNA 3N5LA 1GTKA 1HSJA 3ZSFA 1JEUA 3OO6A 1FTJA 5TP9B 1S7YA 4NMYA 1IZ1A 3B6WA 2FNCA 1GVCA 1M5EA 5TU0A 3AXFA 3LSLA 3QSLA 5J1DA 4BDNA 2B65A 5I59B 2P2AA 2REGA 3GBBA 4U22A 4OETA 1LFIA 4IO2A 4I1DA 3S4UA 2QMXA 4LATA 3HO7A 2F35A 4BDRA 1N7WA 4ZECA 4OZ9A 1MPBA 4FJPA 3EHSA 1N04A 2QPQA 4JSDA 4THIA 5L9MA 4G8NA 3KG2A 4O3CA 1M5FA 5KCJB 3G3IA 1B46A 1I69A 2F6PA 2RC9A 3B7DA 4LUBA 2RCAA 1B3FA 3H6TA 2AYSA 1LFGA 2IEEA 2I49A 3QAXA 1MXWA 2DXYA 5K2XA 2Y84A 3IX1A 3A3UA 4TLMB 5H8FB 2GFEA 4ZEDA 3LUYA 4C1TA 2F97A 2UXAA 3G3FA 1TXFA 1NNTA 2I0CA 2F7CA 3RPWA 3D4GA 4KYDA 1B7HA 4H67A 3C33A 2GRVA 4M1VA 3KJTA 5B70A 1N76A 3OENA 4IO6A 1PDAA 5DTBA 4G68C 3G3KA 4QSEA 3PMXA 1OQHA 3FV2A 4JWXA 3CRBA 3TUSA 1I6QA 4KYEA 1NNKA 1GR2A 4RA1A 4G68A 4F29A 1SD3A 2Y7IA 1B40A 4HW8A 3A3CA 4KR5A 1FQBA 4PFTA 1SYHA 1SVXB 2W7YA 2PX1A 2FYIA 3FXQA 4F39A 4JSOA 4R6KA 4OQOA 5H8SA 3L6HA 4JWOA 1JW5A 3W15C 2UYEA 2VHAA 4IY5A 3O97A 3PUWE 1QVSA 3OO7A 4MLVA 2QS1A 4MH5A 1M5DA 5I2KB 2KLFA 1NMUA 3RGYA 3VVFA 5BWJA 1URDA 3PGFA 2DE4A 4LZ8A 2PT1A 1B51A 2RINA 3IOVA 1US4A 1FTOA 2YJPA 1Y4CA 2XXHA 3MP6A 1N7XA 3OD7A 1SW5A 4LQ2A 4OTEA 3G3GA 2ALUA 2XXPA 2GHBA 4KCDA 3LC8A 3IAZA 3VXCA 3K6XA 1MXUA 2A5TA 3IO4A 1D9YA 3K00A 1AMFA 3T66A 4U21A 4E0WA 4Q8RA 2V25A 2QSXA 5ITPA 3SKPA 4FATA 1MDQA 2I4CA 5AE4A 4YB7A 3K1PA 3E3KA 1BTJA 1JETA 4NF4A 5TPAB 4G8MA 4IO4A 2I3VA 3P7IA 2DXRA 4JB7A 1USYH 1ZKBA 3ECRA 3T93B 3PUVE 3MWBA 2DSFA 1JNFA 1B0HA 1A40A 3PMVA 4OVJA 3C36A 2O6AA 3ZS6A 3A09A 1ZJLA 3S9LC 4NWCA 3HHGA 1IXIA 1POY1 2O69A 2QS3A 2XXYA 3PPNA 1Y3PA 3FVOA 4KI0E 2X7QA 1EZOA 4JDFA 3RY3A 4WXJA 3PD8A 1MY4A 4Z0IA 3QUJA 1POTA 3K6WA 4H5GA 3K02A 1B4HA 3FVKA 1XHYA 4I62A 3MUQA 1OQGA 1TFAA 4PFWA 1VFDA 3TKDA 2XXWA 1O64A 4X48A 5HBCA 3MZBA 1LBCA 5K2YA 3H06B 2XHDA 3V8XB 3MAMA 1SDXA 2Y7RA 2M8CA 4KCCA 1EH3A 3QIMA 4OENA 4UACA 3KGCA 1SW2A 4EXKA 1AL3A 3PPOA 2H98A 4F3GA 4DXBA 4PFYA 3N26A 4G4PA 1JVYA 3IR1A 2V84A 4XKPA 4FEBA 2XX9A 1R9LA 5F1QA 3CFLA 3MP8A 1CB6A 4OYVA 5AA2A 2O7UA 2B3BA 5DVIA 5CBSA 1QJMA 5KDTA 4ZEIA 3E9XA 2PVUA 3K2DA 4DDDA 1XC1A 2UVHA 1B6HA 3MQ9A 3FJ7A 4IO5A 4GOTA 1JW4A 1RKMA 1LAXA 3S9NC 3S2VA 2ZYKA 2R6GE 2VD2A 4QFLA 3K1NA 2DWJA 1B58A 4OWDA 3TODA 4RJZA 1P1NA 2ZMBA 3H6VA 2GH9A 4X9TA 3PMWA 1D4NA 4P0IA 1AH5A 4YKJA 1O63A 3TCFA 3O28A 4P11A 4R9GA 1GV8A 5ISUA 3C31A 1GGGA 1XS5A 2D21A 4YB5A 4ZEBA 1MQGA 4I9DA 2FA7A 3OEKA 4YKKA 1LAFE 3IB1A 3OMBA 3FZVA 3FGSA 3SDFA 3TCGA 3ODBA 3IB2A 4OMBA 3KZGA 3SEVA 2QJEA 3OSRA 4GLIA 3I3VA 4H1XA 5L9OA 5AA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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