3OD7A

Haemophilus influenzae ferric binding protein a -iron loaded
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 116
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A02
1XHYA 2F5XA 3JYRA 4NEDA 4F3GA 5I56A 2UVGA 2RINA 3U94A 4OXVA 3O2AA 1PC3A 1PBQA 3SDFA 3KN3A 4LONB 1QUIA 5KDTA 3DP4A 4ELQA 3FIRA 1JEVA 4NMYA 4ZZAA 5H8QA 3K01A 4IB2A 5KZTA 1B32A 1MG1A 5F7VA 4EDPA 4HCWA 1D9VA 2Y7WA 3I3VA 3K6XA 4ECFA 1NNPA 2VD2A 5IKBA 1TXFA 1SYIA 2BJJX 2ABHA 3QUJA 3TQLA 1JEUA 2I0BA 1JETA 3R6UA 5KCJA 3G3JA 3LSWA 3O6GA 4R75A 4AQ4A 4DXBA 2UVIA 4RJZA 3CFLA 4R73A 2NOOA 4JSDA 5CMKA 4LATA 5CRYA 1A99A 4QFPA 2P2AA 4YZZA 1XS5A 4NF8A 1Y3QA 4F18A 3OEKA 4WKMA 2OZZA 1LAFE 4R74A 4IO4A 1LFHA 2I3VA 4N13A 2DE3A 2DWJA 3HHFA 3S4UA 1DPPA 3IB0A 1CE2A 4IGTA 3W9VA 1DPEA 3O28A 4GXSB 2XX9A 2B3BA 2HAVA 4NTLA 3OSRA 3G3KA 4QFOA 4R2BA 1MDQA 4JB7A 3CR9A 4XKQA 1IUDA 1P1QA 4YU0A 4KR5A 3V8XB 3O9PA 4FECA 2DQVA 4QSEA 1AH5A 3R26A 4U1OA 2H4IA 5L9MA 2DWIA 2Z8FA 4DZ1A 3USDA 1MY3A 5I59A 3PPQA 2RC9A 4H0WA 4GF8A 5AA4A 4NF5A 3MZ1A 1DOTA 1MXZA 2HZKA 3OO9A 1BIYA 3Q26A 3Q27A 3PUYE 3TAJA 4F3PA 5L9OA 4U4SA 2AL5A 3F11A 3FJGA 1MXXA 3TCFA 3IX1A 5I57A 4N07A 1MPBA 2Y7IA 4PFTA 5DTBA 2V25A 2QS4A 2I58A 4H5FA 4JXIA 1B0HA 1QW0A 2QMWA 4EXKA 5I2NB 2H5YA 3C32A 1B7ZA 1TT1A 2R71A 4X48A 1H76A 5AA1A 4OFLA 3IJOB 1SBPA 2GFEA 3MVXA 2DXRA 3MQ9A 2YLNA 1O63A 4G2ZA 4MBPA 1BLFA 1M5BA 2F7AA 3E13X 4KFQA 1NNKA 3FV2A 3K4UA 4MF3A 2Z23A 3TQWA 1LB9A 1GGGA 1FTLA 2A5TB 2B3FA 1IIWA 2NXOA 1POTA 4R2FA 3S9LC 1BTJA 4LQ5A 1FTKA 2F34A 2DXYA 3T9UA 1HSJA 4IO2A 1SW2A 4L17A 5AE4A 4ELOA 1B52A 3FJ7A 3H06B 4G4PA 3TTNA 4OETA 2F8DA 2O51A 3T9XB 3TCHA 1MXVA 3LSLA 4H67A 2IA4A 4QHQA 1B05A 1UQWA 3KBRA 1MXWA 2VOZA 3RGYA 1JW5A 1B40A 3H6WA 2FNCA 3Q25A 1B3FA 4GVOA 3S9EA 3HN0A 3PU5A 3IK6B 1LFGA 4XIGQ 4F1UA 5F1QA 4P11A 3D4CA 1B3LA 4M1VA 4DCXA 4DXUA 3MZBA 4ZS9A 1PB8A 3ZSFA 1JW1A 1ATGA 5H8HA 2UVJA 1GR2A 3L6GA 4R6YA 3LUYA 5FHNA 1BP5A 1IZ1A 1N0TA 2XXHA 1PB7A 2ZYMA 4GWOA 4H8JA 5L8DA 3IOUA 4YAHX 3VVFA 2F7BA 2XXQA 2OLBA 2REJA 5TP9B 4OEVA 2HXWA 2WKYA 1B3GA 3B7DA 3FXUA 3HV1A 1I6BA 3OMBA 2UYEA 3M8UA 4Q8RA 3W15C 4YKKA 3N5LA 3KOSA 4ZEFA 1B51A 3LSXA 2XXVA 5H8FA 1GTKA 3IB2A 3B6WA 1UIVA 1D3KA 3N94A 2P0SA 4C1TA 2XHDA 4GFRA 3S9MC 1DTZA 1FCKA 4OESA 4HTGA 4KD5A 4QSCA 3TZAA 4ELPA 1LBCA 4G8HA 3PUWE 4GL0A 4GRKA 3V5AA 5DT6A 1NFTA 3M3FA 1IXGA 1IXHA 1OQHA 3HSTA 4ISUA 3KEIA 4YICA 5ELVA 5FHMA 1OVBA 3RY3A 3EHUA 4MLVA 4EXLA 3MW0A 4F39A 2DP8A 3K6UA 5BWJA 3ILTB 1SDXA 2B65A 2VGQA 3MVZA 4I1DA 5KCJB 2ZNSA 3FVKA 3OO6A 1Q35A 1NMUA 1B5HA 2DVCA 3KSXA 2F36A 2Q8JA 4FATA 3FD3A 4H1XA 5DYHA 3ZS6A 2X7PA 2D5WA 1VFDA 3RLFE 1T0KA 2I4BA 4QF9A 4G68C 3VV5A 4ESXA 3RN8A 5HPQA 4I9DA 3THIA 1I6AA 1N7WA 4TOZA 2DWAA 2V3TA 4BDNA 3A3UA 2DE4A 2XXWA 4PE5B 4U21A 1B4HA 2XXIA 2Q88A 4FIMA 3TELA 1UTHB 2V3UA 3K6WA 1ANFA 2UXAA 4IO6A 2OWTA 4G8MA 4LVQA 5CI5A 1D9YA 5ITOA 3FUZA 3PV0E 2PBWA 3IB1A 1LAHE 4IGRA 3UA8A 3KG2A 3R7XA 4I62A 3VDFA 4F1YA 1JVXA 1Q1KA 2VP1A 4LZ8A 1JQFA 3FZVA 4ESWA 1O7TA 4EUOA 3GBAA 4YKIA 3TTLA 2THIA 5M2VA 1EZ9A 3KN7A 3QUFA 2Z8EA 4OENA 3K00A 4F22A 1TFAA 1Y3NA 2V84A 3A09A 3PMWA 5TP9A 3PUVE 2P1SA 4IO7A 4KYSA 4BDMA 5I84A 3SKPA 3FVOA 1RYXA 2HQ0A 2DWHA 3C34A 4R9FA 4P0GA 1EZPA 1MPDA 3TTKA 3B6QA 3DELB 3MZ9A 3KSJA 4THIA 5DVFA 3KJTA 2Y84A 3D4GA 4NF4B 1L5TA 2DSFA 5JK4A 3OELA 2FA7A 2NUVA 3PPOA 4F31B 2H99A 2DVZA 5AA4B 4LUBA 3PD8A 4YB6A 4ELRA 4QFNA 2HFBA 4ZECA 2ZYNA 3CFXA 3K1NA 3MBPA 1P99A 4P0IA 5JTYB 3CSGA 3BBRA 3MVYA 3UORA 1Y4TA 3MP6A 1N3XA 4AB5A 4FEDA 1MM6A 2E1SA 1P1WA 2XD3A 1A55A 1OIBA 3FJMA 3QXMA 3SEXA 4FAJA 3PMXA 5JEIA 2G93A 3FXRA 4GXAA 1WDNA 1EH3A 4OEUA 4RY1A 4NF6B 3PUZE 4LZ7A 4RPNA 3G3HA 4TLLB 3LSFB 3PD9A 4UA8A 4YB7A 1Y9UA 5HBCA 1USYH 3WAFA 4HW8A 1FQBA 1R9QA 5ITPA 5L9SA 3MPLA 3KGCA 4AB6A 1WODA 2REGA 4ZZEA 3FV1A 4QFLA 1XVYA 1XT8A 2QS1A 4NF8B 1LBBA 3S2VA 4LQ2A 3UGWA 3JV9A 2XXUA 3M3KA 1TFDA 2PMSA 3HPIA 3JZJA 3PGFA 4M4GA 1QULA 4NWCA 1GV8A 3RPWA 5I2KA 1JVYA 2OBGA 2XXYA 1URSA 2GHAA 3CFZA 1KWHA 3N6TA 2A5SA 4JWXA 4XKPA 3GZGA 2ZNUA 3MC2A 5CMCA 1UTBB 2QL3A 4RK2A 3SESA 1Z7ME 2V93A 2PX1A 3TMGA 1LB8A 4POWA 3U93A 2GRVA 1N76A 3IO6A 1SYHA 4GL8A 4QSDA 1QVSA 1OLAA 1NL5A 3W9WA 4R9GA 2F35A 3L6HA 4DLDA 2O1MA 2OWSA 2Y7KA 4Q5TA 1DSNA 4G77A 3BFUA 3FGSA 3IOWA 2XX8A 1EU8A 4HS7A 3MVWA 1NNTA 3LBSA 3SETA 3T93B 3TPAA 3RQTA 2RF1A 2O6AA 3P7IA 4OMBA 3EHSA 3MP1A 2ONRA 3UP9A 4BLAA 4XTCQ 2H98A 4NF4A 5EHMA 1B46A 3PPNA 4X1BA 1LAXA 3CVGA 5B70A 4G8NA 2VD3A 2H25A 3G3FA 4MLQA 3T9HB 5JTYA 1EZOA 4OVJA 3BFTA 3MJNA 1US4A 4ND9A 2DS9A 3IJXB 4JDFA 2O68A 4OTEA 3ZKKA 2RC8A 3EN3A 4G68B 1PEBA 2GH9A 2O1LA 1USYE 1MQHA 5K2XA 2D21A 2ZYKA 3C33A 4RXLA 3SEWA 1QUKA 1IITA 3MP8A 2Q2CA 3BKIB 2QMXA 2HEUA 3OENA 3SEYA 4KHZE 3KJ7A 3ECRA 1Y1MA 5AA2D 1XVXA 3FASA 1Z7NE 5A5XA 2IEEA 3SEUA 3U72A 1MXYA 2ESNA 2FYIA 4IO5A 4LP2B 4ZE8A 4F2OA 1JW4A 5DVIA 1RKMA 1QKBA 2CMOA 3HHGA 3IO4A 5J1DA 4E0WA 4F3BA 1Y4CA 1FQEA 2RCAA 4LZ5A 1R6ZA 1HSLA 4GIZA 1N7XA 3TEPA 1SQYA 1A8FA 2V3QA 4Q30B 3GXAA 3UN6A 3IORA 2I4CA 5CBRA 1B1HA 2YPNA 3I5OA 3V89B 4EQ7A 3G3GA 3O97A 3OSQA 3KZGA 3DM0A 1IXCA 3MUQA 1AMFA 3HCQA 3TTMA 1SVXB 2AIXA 1MY4A 3TKDA 3KFMA 3E9XA 1A8EA 3TTRA 1NH8A 4KCDA 3SEVA 4LA9A 2M8CA 3E4RA 4OHNA 2O7UA 1FQDA 3EQ1A 3ILUB 3O29A 1OMPA 4KYDA 2I0CA 2NVUB 1P1UA 5I58A 1ELJA 1NNFA 5I58B 3ONMA 4KYEA 2E0SA 4R6HA 3CG1A 5DEXA 3TYHA 4Z0IA 4NE4A 3QIMA 3RNNA 3VLVA 5IAIA 1II5A 4FORA 1B2HA 1TWYA 3MPKA 4BDQA 4JWYA 2QRYA 3M3LA 4PQJA 3H6VA 4EQBA 3H7MA 5I59B 3VVEA 1LGBC 3U92A 5CBSA 3VE1B 1MRPA 5CC2A 1I6QA 1FTJA 2DYXA 2F6PA 3MAMA 1ZBMA 1MY0A 2PVUA 3O6HA 4OFOA 2X26A 4BDLA 2PT1A 1YAEA 4EQ9A 4H5GA 2PYYA 3U1OA 3G3IA 4YB5A 4XKNA 4OERA 4BDOA 1B0LA 1B3HA 2HZLA 3EHTA 3TUSA 4X1DA 1H3DA 4JBZA 3TDJA 1MY1A 3VXBA 3CRBA 4KPTA 3FVGA 1OQGA 1YCJA 3I6VA 1BKAA 1Y1ZA 2OCUA 2XXXA 3C31A 3IR1A 3LR1A 3FATA 2DOJA 3QK6A 5K2YA 1MM7A 2O69A 2R6GE 2QPQA 3KN8A 4YMAA 3ZKLA 1A40A 3TFLA 2XXTA 1B3EA 2ANJA 1ZLQA 3QYTA 2O7IA 5H8SA 2A5TA 2QJEA 1FQAA 2XXRA 4N6PA 1URDA 4WEPA 1AOVA 2HCAA 3PPPA 1FW0A 4QFKA 1MH4A 3K0VA 2AYSA 4ZEBA 3PUXE 4WEDA 3ODBA 2I6EA 3QAXA 4DCYA 1XC1A 4F1VA 2D3IA 3LC8A 2Y7PA 4U22A 4U4XA 3KOTA 4EF2A 4IY6A 4X9TA 2F6GA 3N6UA 2I3WA 2W7YA 1MXUA 1MH3A 1OVTA 3FXQA 3H03A 2GHBA 4XXUA 5EYFA 1XOCA 1ZU0A 4PFYA 2ALUA 4R6KA 1US5A 1UIUA 4DDDA 3O66A 1PB9A 5BUUA 2O84X 2RCBA 1WVJA 3G7WA 1M5FA 5ISUA 2Q89A 3O6IA 4KI0E 1N3WA 4YKPA 5ICTA 1MS7A 4PFWA 5DVJA 3EPEA 2ONKE 1NH7A 4H65A 4JSOA 2F97A 1ZKBA 4FE8A 3CG3A 1QUJA 1SW4A 2ZXTA 4IO3A 3UK4A 1QJMA 1POY1 2ZMBA 4BDRA 1MDP1 3V83A 2OJTA 4K3FA 1VE4A 4U23A 1PDAA 3HO7A 3K6VA 5H8QB 3Q29A 5H8NB 2Z22A 2XD2A 1YTVA 3OO8A 2DE2A 4MFIA 4TQUQ 4DE8A 1ZIUA 4O3CA 2H9BA 1S50A 1S9TA 1VFEA 1LFIA 2I49A 2RKMA 4FEBA 4HCYA 4DXCA 2QS3A 3CSBA 4GD5A 2Q2AA 2XXPA 4PP0A 1RYOA 5H8FB 3TODA 1SI0A 4ZEDA 3U8QA 1IQ7A 4DIGA 1CB6A 5TU0A 1S7YA 1ZMGA 3DP6A 3H6TA 1B5IA 2LAOA 4PFUA 1A54A 1H44A 1B58A 1JNFA 2QS2A 4WXJA 3VVDA 1FTMA 4OQOA 3T66A 4YKJA 2ZYOA 3K02A 4GLIA 1SW5A 3GLBA 3N26A 5CMMA 3K1MA 4ZDMA 3UIFA 4POXA 3H3GA 3OOAA 1R1NA 1B7UA 4JWOA 2AL4A 2XX7A 1LCTA 3IOVA 4NF5B 4R72A 3CIJA 4Z7EA 1OLCA 1PBPA 2Q9TA 3OXNA 2PT2A 4I8CA 1MQJA 1GVCA 1LCFA 1M5CA 1N04A 2F78A 3H6UA 4RNSA 4U2RA 4C0RA 4C1UA 4E0XA 4ZE9A 1M5EA 1YPNA 4O3BA 3E3KA 3PMVA 4MH5A 1MY2A 1ZJLA 3IOTA 5HM4B 1DMBA 3QSLA 3T96B 4IY5A 3RUMA 1VSOA 1Y3PA 2ONSA 1O64A 1R9LA 1IEJA 2KLFA 3C4MA 2ZNTA 4OYVA 3C36A 4TLMB 1B1XA 5H8HB 1H43A 3TCGA 4O3AA 2R9JA 2YJPA 5LOMA 1P1NA 2NWJA 1SI1A 3T9VA 2VHAA 3VXCA 3T22A 1LSTA 1DTGA 1F9BA 4GQOA 4F3SA 5CM6A 4H6DA 5TPAB 3DLNA 1B7HA 4F2QA 5TPAA 4RA1A 1ZTYA 1M5DA 1MPCA 2G29A 3GBBA 3OO7A 5I2NA 4OFJA 4YMBA 4G68A 4UACA 4ONYA 3H4ZA 5I56B 1SD3A 4F29A 5AA2B 3OD7A 4RK9A 4EF1A 5EHSA 3IL1B 3RT6B 3MWBA 3RTFB 3B6TA 1FQCA 5KDTB 4NF6A 2UYFA 5I57B 5FTIA 5CMBA 1B9JA 1I69A 5AA3A 5AA2A 1LLSA 1URGA 1A7LA 4KCCA 3RTWB 3S9NC 1QKAA 3DP8A 1J1NA 2QSXA 1VR5A 2F7CA 2UVHA 4NWDA 3C9HA 4RPOA 4ZEKA 3K2DA 1IXIA 5I2KB 1H45A 2Z8DA 5A5XB 1B5JA 1FQFA 1N84A 2I48A 1NKXA 4PETA 3Q28A 2Y7RA 1B4ZA 3AXFA 4FJPA 4GOTA 4Q0CA 3RT8A 1LAGE 1P1OA 5FTHA 4U1ZA 3IAZA 1UTHA 4RYAA 2HAUA 1MQDA 3FVNA 4KQPA 4F19A 1AIVA 3K1PA 1UTBA 2OK2A 1AL3A 2X7QA 1FTOA 3WAEA 5ICQA 2RC7A 3OEMA 3PPRA 4OWDA 4ZEIA 4QRZA 1SW1A 1B6HA 1HSEA 4H8IA 3EF7A 4XKRA 3VLUA 5DEXB 3C35A 3SERA 1Y20A 1MQGA 4OZ9A 1D4NA 2CZLA 3A3CA 5H8NA 1MQIA 3CI8A 5B7DA 3VFJA 3VLWA 5FHOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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