3OD7A

Haemophilus influenzae ferric binding protein a -iron loaded
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 116
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A02
1B32A 1MQGA 5H8QA 1MH4A 3T93B 3IB1A 1NKXA 3B7DA 5I56A 2Q9TA 2DWAA 2VOZA 4NTLA 4R75A 1UTHB 1T0KA 2Y84A 3QXMA 5M2VA 2CMOA 1DOTA 2DE3A 1DTGA 1QJMA 3PPOA 3V83A 1IXHA 1FQAA 4EXKA 4G77A 2HZLA 5EYFA 1D3KA 4N6PA 1N0TA 2AL5A 4QFLA 3MUQA 2REJA 5AA2D 2DVZA 5I58A 3DP6A 4GF8A 3RT6B 4EQ9A 3FVOA 4O3AA 3MQ9A 3QAXA 3HHGA 1MM7A 5L9OA 4OETA 5TPAB 2V93A 3Q25A 3VXBA 4R2FA 4ELRA 2H98A 4P0GA 2AIXA 1IITA 2I0BA 4U2RA 4XTCQ 3MP8A 5I2KB 1EH3A 1ZKBA 3O9PA 4HS7A 5K2YA 5I2KA 2HCAA 2DWHA 3M3FA 3PGFA 4U22A 1Y1MA 1R1NA 3IK6B 4WKMA 1N04A 3FJ7A 5CBSA 1LB9A 5H8NB 4G4PA 1UIVA 1MS7A 2OWSA 5CMMA 1DPEA 1JETA 3JV9A 3TQWA 4ZEFA 4PFYA 1B3FA 3O6IA 1A8EA 2V25A 4YKJA 1NH8A 1AMFA 5I58B 3TQLA 3SEWA 4GRKA 4OFOA 2A5TA 1B2HA 2HQ0A 3MZ9A 1SQYA 1VFDA 1GV8A 4R6KA 4HTGA 2F6PA 3RTFB 2Y7IA 1GGGA 5A5XB 4MLQA 3A3CA 3A09A 1JW5A 4LVQA 2UVGA 3BFUA 1ZMGA 3E9XA 4NMYA 4THIA 4ELOA 5A5XA 1Y3QA 2QL3A 2AYSA 1Y3PA 3CSGA 2XXQA 1OQGA 4P0IA 1QKAA 1NMUA 3KN8A 3OO8A 4UACA 3FVGA 3RQTA 4R6HA 3EQ1A 2H4IA 3ZKLA 2ZNSA 4KCCA 2NVUB 1EU8A 3JYRA 4POXA 3S4UA 3PPPA 1PC3A 2H9BA 3DP8A 4I9DA 4Q8RA 2Y7PA 3TUSA 3RY3A 5L8DA 3N5LA 1IXCA 3G3KA 3MW0A 3KGCA 3N26A 4FECA 1SBPA 2THIA 4MF3A 4JWYA 3G3JA 4FIMA 1POY1 4F3GA 3GBBA 2HAUA 3K6XA 3CG1A 3N6TA 3I5OA 4TLMB 3T66A 1O7TA 2W7YA 3O2AA 3SKPA 4Q5TA 3T9HB 4ECFA 2DYXA 5AA4A 2XXPA 1TWYA 5JTYA 1B5IA 2XXTA 4ZS9A 2XD2A 4OEUA 1FQBA 1I69A 2ABHA 4LP2B 2HZKA 3SERA 3VLWA 1OVTA 3KEIA 3PUWE 4IY5A 2GFEA 3MP1A 1JEVA 1FTLA 3WAEA 1SI1A 3N94A 2PX1A 4RA1A 4F19A 1NNFA 3K6WA 3O6HA 1LAFE 4TOZA 4QFPA 4DXUA 1H45A 1OLAA 3AXFA 4FEDA 1I6BA 1UTHA 3E4RA 3K1PA 3MVXA 1LFGA 4U21A 4U1OA 3IOUA 1A54A 1ELJA 4I8CA 1UTBB 2I3VA 1S50A 2OLBA 1TFDA 1SI0A 3FXUA 4OTEA 5H8QB 3T9XB 1NFTA 5DEXB 4F3BA 1PB9A 2ZYKA 3KOSA 1LLSA 1VR5A 3SEYA 1IUDA 3FV2A 1MDQA 2OJTA 4GIZA 5ISUA 4H8IA 4Q0CA 4NWDA 5L9SA 4FE8A 3WAFA 2CZLA 2ZNUA 4RY1A 3G3GA 4EXLA 4BDNA 4H65A 3O97A 2UVJA 3H7MA 4ZDMA 3VLUA 1QKBA 2YJPA 4MBPA 1S9TA 4G8HA 2RCBA 4OERA 3OXNA 3TPAA 2RC9A 3FASA 1PDAA 4ZEKA 1GTKA 1FQDA 2VD2A 3BKIB 2GHAA 1BTJA 2Q2CA 2KLFA 3LC8A 4JSOA 5DVFA 4BDRA 4OWDA 4C1UA 1B7UA 2UVHA 2X7QA 2YPNA 1URGA 3MJNA 3O66A 1P1OA 3QK6A 3FVKA 3DM0A 4LQ2A 5FHMA 4DXCA 3SEXA 5KDTA 2P1SA 2ZYOA 5ITOA 3M3LA 3THIA 4EF1A 5HM4B 1OIBA 4QRZA 5JK4A 2Q89A 3S9NC 1WODA 3VFJA 1AL3A 1ATGA 1RKMA 4NF5A 3QUJA 1QW0A 3UORA 3T96B 3KG2A 2O84X 2O68A 3IB2A 2Q2AA 4BDLA 1J1NA 4GXAA 4YB5A 5DVJA 3K0VA 2Z8FA 1OVBA 3EPEA 3FJGA 4DIGA 5FHNA 4GL0A 4OHNA 1Y4TA 2P0SA 1B3EA 3KZGA 1B5JA 1FTJA 3K4UA 1I6AA 1MY0A 5DEXA 3Q28A 1URDA 1O63A 1IXIA 1TFAA 2DWJA 4U1ZA 3TELA 3PU5A 3FIRA 5TPAA 1B7ZA 4JWXA 3PUXE 4QHQA 2ZMBA 3PD9A 2D3IA 3IJOB 3PV0E 4Q30B 1NNKA 3ECRA 2ZNTA 3GBAA 3O28A 1MY4A 2VHAA 1UQWA 3MZ1A 4N13A 4NWCA 4QFKA 4ESWA 1S7YA 3DP4A 1RYOA 1R6ZA 4RNSA 5FTIA 5H8FB 1O64A 1HSLA 3MBPA 2PT2A 4FJPA 4FAJA 1FW0A 4KYEA 2XXWA 1B0LA 4LONB 3FXQA 3W9VA 4F31B 3OEMA 5K2XA 3M8UA 3S9LC 1SW5A 1IZ1A 2YLNA 3LSLA 3MC2A 3TMGA 3V89B 4YKPA 5TP9B 4E0WA 2XXIA 2BJJX 3C35A 3HV1A 4POWA 4L17A 2XX7A 1SW4A 4LQ5A 4LZ7A 1A7LA 1N7WA 1I6QA 2R71A 4G8MA 4G2ZA 3RNNA 4TLLB 4RPOA 2OBGA 4R9FA 1B52A 1DMBA 4YZZA 4LZ8A 3OSQA 1B05A 2NUVA 1USYH 1A40A 2B65A 1LGBC 3IO6A 1JW1A 3T9UA 2I3WA 3CVGA 3PPRA 4X9TA 1GVCA 1B4HA 2Z22A 4E0XA 4F39A 4PE5B 1B46A 1ZIUA 3O6GA 5FTHA 5TU0A 2UYEA 2ESNA 4DDDA 1Y1ZA 4KYSA 1LSTA 4OMBA 4EUOA 4F29A 5LOMA 3I3VA 4GL8A 3LSXA 2DSFA 2UYFA 2F7AA 3VE1B 2H99A 4JSDA 4OESA 1VSOA 3H3GA 1SYIA 1QVSA 2OWTA 4F2OA 1LBCA 1NH7A 2A5TB 1USYE 4ND9A 1H43A 4G68C 4OXVA 5ELVA 3TTRA 3MZBA 3OSRA 4DLDA 3FGSA 3DELB 4GVOA 2O7UA 2XXYA 3LBSA 1DSNA 3RGYA 3C4MA 4GOTA 4H0WA 3U94A 4DXBA 2ONKE 3KOTA 2F7BA 3MWBA 1Y4CA 1US5A 3LSFB 3L6GA 5B70A 4KPTA 3ODBA 4DCXA 2RCAA 3USDA 2ONRA 1IXGA 3H6UA 3TTLA 3UN6A 2HAVA 3G3HA 4NE4A 5IKBA 1BKAA 5H8HB 3ZS6A 4UA8A 2XX9A 2DE4A 1UTBA 5CI5A 4DZ1A 4GLIA 5FHOA 3H6WA 1CB6A 1OQHA 1NNTA 5TP9A 1D4NA 1B0HA 3OO9A 3TAJA 1EZ9A 1WDNA 4G68A 3KJTA 3RPWA 2B3BA 3E3KA 2D21A 2F34A 4Z7EA 4KYDA 5HPQA 1B4ZA 2I49A 2NOOA 3U92A 2QMWA 4ZEBA 4KD5A 1B51A 4BDOA 2F8DA 3EN3A 1PBPA 1YAEA 2DP8A 4X48A 1TT1A 1BIYA 2R9JA 5I59B 3MVWA 1P99A 4YB6A 5EHMA 4QSEA 2REGA 1II5A 2QS2A 3FXRA 3LR1A 4PETA 3UP9A 1IEJA 4C0RA 3OEKA 5HBCA 5KCJB 4PFUA 1H3DA 1N3XA 3V8XB 1EZPA 3B6QA 1FTMA 4NF4B 5ICTA 1LCFA 1MXXA 1FTKA 4M1VA 4OVJA 5DT6A 4ZE8A 2G29A 5I57B 5J1DA 5H8HA 1FCKA 5CBRA 1PBQA 3PD8A 4ZZAA 2GH9A 1A55A 1M5BA 2RINA 2FYIA 1JVXA 2O69A 2X7PA 2F97A 5AE4A 3H4ZA 1Y9UA 4LZ5A 4EF2A 1POTA 1MY2A 1XC1A 1IIWA 2DE2A 3SESA 4ELPA 3S9EA 1PB7A 1SW2A 2OCUA 2Q8JA 1H44A 2GHBA 4OZ9A 4IO7A 4PFWA 4H5GA 2IA4A 2NXOA 4JWOA 4K3FA 4PQJA 4EQBA 4F22A 2M8CA 3K6UA 4YB7A 3W15C 4YMAA 1B1HA 4XXUA 2ZYNA 4IO5A 1ZU0A 2B3FA 3R6UA 4JBZA 1FQFA 2A5SA 4IO6A 3TZAA 2PBWA 1URSA 3QSLA 1QULA 2F78A 1YTVA 1B7HA 3CFXA 4FORA 2ZYMA 3RT8A 4N07A 1XS5A 3TKDA 3C33A 3MPLA 4C1TA 1SVXB 4MFIA 1ZLQA 3HO7A 4QFOA 3UK4A 2PYYA 4BLAA 4KI0E 4RXLA 3C31A 3SDFA 3U72A 2VP1A 1B3GA 2Q88A 2XHDA 3FJMA 4H6DA 4P11A 5H8NA 3ONMA 4IGRA 4G8NA 2VD3A 1MH3A 2PT1A 4IO2A 3UA8A 5KZTA 3CFZA 3VVDA 2QPQA 2WKYA 2FNCA 3H6VA 2F35A 3VLVA 1NL5A 3VV5A 3CIJA 4Z0IA 1OMPA 3M3KA 1VFEA 5KCJA 1H76A 5CMBA 2DS9A 2F7CA 5AA3A 4RJZA 3ZKKA 1HSEA 4WEDA 2XXUA 4I1DA 4IB2A 1FQEA 4NF8B 5CMCA 1N3WA 4F2QA 3L6HA 2H5YA 3SETA 2UXAA 1JEUA 4QSCA 2DOJA 1B3HA 3F11A 4OEVA 5IAIA 2HXWA 2DQVA 3TYHA 5JTYB 1B5HA 1MRPA 1UIUA 5CRYA 3EHTA 2XXVA 1YCJA 4R73A 5AA4B 3OO6A 3OELA 1N7XA 4TQUQ 3UGWA 2F6GA 3KJ7A 4OENA 3K1MA 1ZBMA 3RTWB 1YPNA 1LAGE 3QYTA 3KN3A 4ZEIA 3D4CA 1P1NA 1ZTYA 3IO4A 4WXJA 3ZSFA 2Z23A 4U23A 2OZZA 1BP5A 1LAXA 1HSJA 3EHSA 3G3IA 3G3FA 3LUYA 1TXFA 4JB7A 4JDFA 4H1XA 1SDXA 1R9QA 5ICQA 3PPQA 3MPKA 1JQFA 1JW4A 2XXXA 5AA1A 2F5XA 3D4GA 4LUBA 2QSXA 1AIVA 1M5FA 2XXRA 2Z8DA 1MXVA 1AOVA 5I57A 1ANFA 2O51A 4NEDA 1MPDA 3R7XA 1B40A 1FQCA 2UVIA 4KFQA 3B6TA 3RLFE 2I6EA 4ESXA 5KDTB 3K01A 1Q1KA 3CRBA 3IOVA 4YMBA 1QUIA 1KWHA 4HW8A 2F36A 3MP6A 4O3BA 2DWIA 5I59A 3T22A 3OENA 4QSDA 5B7DA 1P1WA 3IJXB 4NF6A 3GLBA 4OQOA 3TDJA 3W9WA 5EHSA 3PPNA 4H5FA 3PMWA 3SEVA 2DXYA 1FTOA 1DTZA 3FD3A 4H67A 4DE8A 1PB8A 2X26A 3H06B 4G68B 4F1YA 4F1UA 5JEIA 1ZJLA 1MXZA 4HCWA 2RKMA 2RC7A 4JXIA 1F9BA 2QJEA 3IOTA 3KBRA 4OFLA 1LBBA 2QRYA 1L5TA 3HSTA 1MQJA 3CSBA 4X1BA 3TCHA 1MY3A 3CFLA 2Y7RA 1B3LA 4ZE9A 4R74A 4ONYA 3K6VA 4KCDA 1MQIA 2R6GE 3K1NA 3DLNA 3R26A 1LAHE 3G7WA 3U93A 5ITPA 4IO3A 1Z7NE 2NWJA 4YU0A 3UIFA 2Y7WA 5DYHA 4GD5A 2PVUA 2QS3A 3RUMA 3HPIA 3CR9A 3IOWA 4AQ4A 4F18A 3ILUB 3S9MC 2I4CA 3MVYA 3CG3A 1N76A 4YAHX 1CE2A 2ZXTA 3E13X 3OD7A 2E1SA 3Q26A 1N84A 1SW1A 2PMSA 4NF6B 4OFJA 4RK2A 1SYHA 2VGQA 3PMVA 1MY1A 1IQ7A 3A3UA 4GQOA 3TCGA 5I2NB 1EZOA 4OYVA 3I6VA 1VE4A 3OO7A 3TTKA 4YICA 4KQPA 3FV1A 1AH5A 1MXUA 1Z7ME 3TFLA 5CM6A 2XD3A 1P1UA 1MPCA 2Z8EA 1M5EA 4XIGQ 4MLVA 2LAOA 2IEEA 2O1MA 2QS4A 3GZGA 4HCYA 4QF9A 3VDFA 3IAZA 4FEBA 3IL1B 4R6YA 3EF7A 3N6UA 3O29A 3C32A 1B58A 3PUYE 4XKNA 1M5DA 3OMBA 4ZEDA 2V3TA 4MH5A 4BDQA 1D9VA 2HFBA 2DXRA 4YKKA 3PMXA 3HCQA 4NF5B 5F7VA 1GR2A 1MG1A 5AA2A 3VVEA 1R9LA 4DCYA 3JZJA 1XHYA 4U4SA 5H8SA 5CC2A 2DVCA 4NF4A 5I84A 4XKQA 4GWOA 4AB6A 1MDP1 3LSWA 1QUJA 2I48A 1M5CA 4O3CA 3HN0A 3TEPA 4ZECA 4IY6A 2D5WA 1NNPA 1XOCA 2I4BA 4RK9A 5H8FA 2OK2A 1MXWA 4RPNA 3VVFA 1DPPA 2H25A 2Y7KA 3C36A 4R9GA 2V3UA 4KHZE 5F1QA 3P7IA 2ALUA 5I2NA 3IX1A 1PEBA 1Y20A 2RC8A 4KR5A 5DTBA 3GXAA 3QIMA 3KN7A 2QMXA 4H8JA 4NF8A 4M4GA 2HEUA 2QS1A 1P1QA 3FUZA 1US4A 4QFNA 2V3QA 2XXHA 3C9HA 3PUVE 4YKIA 3RN8A 4FATA 5CMKA 4RYAA 3Q27A 3KFMA 3OOAA 1RYXA 3S2VA 3C34A 1WVJA 3KSJA 1B9JA 4LA9A 1MXYA 1Q35A 4AB5A 4ELQA 2XX8A 4F3PA 1B6HA 3VXCA 3KSXA 2O6AA 3FATA 1LFHA 1JVYA 4ISUA 2ANJA 2G93A 3QUFA 4LATA 3V5AA 1LFIA 5BWJA 2AL4A 3BFTA 1MQHA 4IO4A 3SEUA 2I0CA 3TTNA 3CI8A 3EHUA 4BDMA 3U1OA 5DVIA 3Q29A 4F1VA 2RF1A 3TCFA 1LB8A 1XVXA 1Y3NA 1A8FA 2P2AA 3ILTB 4WEPA 4U4XA 2O1LA 3U8QA 1MM6A 1A99A 3MVZA 3PUZE 3BBRA 3IB0A 3IR1A 2GRVA 4X1DA 4XKPA 4IGTA 1XT8A 1MPBA 1XVYA 3HHFA 3B6WA 4GXSB 5BUUA 1QUKA 4XKRA 3H03A 5I56B 3FVNA 3K02A 3K00A 3TTMA 2O7IA 1MQDA 3IORA 1OLCA 4ZZEA 5AA2B 3K2DA 2E0SA 4F3SA 1LCTA 2FA7A 4PP0A 4I62A 4EQ7A 1D9YA 3T9VA 4R72A 1JNFA 1SD3A 4EDPA 2V84A 3MAMA 4PFTA 5L9MA 1B1XA 1BLFA 4R2BA 2I58A 3FZVA 3H6TA 4GFRA 3TODA 2ONSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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