3OD7A

Haemophilus influenzae ferric binding protein a -iron loaded
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
b'DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Metal binding protein
total genus 116
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3od7A02
2NVUB 4Q5TA 3FJ7A 5DVIA 2QL3A 1XS5A 2UYEA 1IXGA 3B6TA 3H7MA 1UIVA 3H4ZA 4GXAA 3OO7A 3G3JA 2UVGA 5I84A 4XXUA 3KSJA 4IO7A 3IR1A 4Z0IA 2VGQA 1B1XA 1TXFA 2A5TB 2RCAA 4ZZAA 4F39A 4QFNA 4G2ZA 1XT8A 2Q2AA 5CMCA 4X1DA 1DOTA 1QUJA 3LC8A 4QFKA 2DWJA 2RINA 3EQ1A 2I0CA 2QPQA 3H6UA 3V83A 2ZMBA 1N84A 4FJPA 3KZGA 4DXUA 1EH3A 1YAEA 4G8HA 1FTLA 2HFBA 4OHNA 3I5OA 1FTJA 3CG1A 1US5A 5H8HA 4PETA 2ALUA 4OZ9A 1D4NA 3GZGA 5JEIA 3K02A 4IY5A 3PPRA 3DP4A 2QS4A 4ELRA 4GVOA 3VVFA 3G7WA 3USDA 4HW8A 3UORA 2DXRA 1SW1A 4F3SA 3PGFA 4GWOA 2H98A 4Z7EA 5B70A 4DE8A 4E0WA 1JW1A 2DS9A 2ZNTA 2Z23A 4TLMB 3W9VA 2X26A 1MQGA 1UTHA 4P0GA 1JVXA 2UXAA 4GLIA 4H6DA 2F8DA 3UA8A 3MZ9A 1I6BA 2Y7KA 3SEWA 5H8NB 1Y1ZA 1EZOA 3TAJA 3HHFA 3ILUB 2F7CA 4U1OA 1N3XA 2QS2A 4OFJA 2HAVA 5ELVA 4XIGQ 3DM0A 5DVJA 2OWTA 4KCDA 3H6WA 1R9QA 1LAHE 4LZ8A 3BBRA 3U1OA 4WEDA 3T9VA 3IB1A 4NWCA 2I48A 3TCHA 3CSGA 2XXUA 1P99A 3MWBA 1POTA 2XD3A 3PMWA 3MVXA 4QSCA 2Y7IA 3W15C 3SERA 1ZTYA 1PB9A 1MM7A 4X1BA 1JVYA 1N0TA 2R9JA 3LR1A 3CFXA 4ND9A 4WXJA 1MXXA 3FASA 1M5EA 3A3UA 2ANJA 3IOWA 4JXIA 1US4A 1CB6A 1FQCA 2YPNA 3C34A 2O1MA 4ZE9A 2D3IA 1B7ZA 4GD5A 3G3IA 4N13A 3T9HB 3GBAA 4BDOA 5FHOA 1VFEA 4H65A 3K0VA 1OQGA 4HS7A 4NEDA 5I2KB 5KDTA 3G3HA 4H8JA 4EXKA 3H3GA 3SKPA 3G3KA 5CMKA 2QS1A 3S9EA 3AXFA 4ECFA 2I3VA 1B51A 2XXYA 3C36A 2REJA 2DVZA 4XKPA 2CMOA 3N6TA 2A5TA 5KCJB 4I62A 1I6QA 4IO5A 3OOAA 4K3FA 5B7DA 4U22A 3IO4A 4IY6A 3I3VA 1Y3PA 4R73A 2P0SA 2DE4A 3H03A 2OCUA 1EZ9A 3CIJA 1QVSA 3LSWA 3CR9A 5I56B 2V3QA 4U4XA 1HSLA 4BDNA 2B3BA 3KN8A 3FJMA 2LAOA 2E0SA 3OSQA 3FVGA 5EHMA 1H76A 1FQFA 4NE4A 3S4UA 1NNTA 4F3PA 2DXYA 2OWSA 1B1HA 4LQ2A 2G29A 3OXNA 3SETA 3QUJA 4THIA 3TKDA 1AOVA 2B65A 2V93A 2Y7WA 4OENA 1MXWA 3SDFA 4I1DA 4OFLA 4ESXA 3M3LA 4YAHX 2XHDA 1B7UA 4YICA 3HCQA 3L6GA 1IZ1A 4IO6A 2OLBA 3T9UA 4H5FA 4KD5A 1MPCA 3DLNA 4GFRA 4LONB 4ISUA 4AB6A 5H8QB 3RT8A 4FATA 3MP8A 3E9XA 2THIA 3RN8A 1B52A 3DELB 4JWYA 1P1UA 3A09A 4RJZA 2I49A 2HXWA 5H8NA 1ZJLA 3EN3A 3QYTA 2F6PA 5ISUA 2HZLA 5L9OA 1OLCA 3W9WA 1USYH 1ZU0A 2DWHA 2VD3A 4H8IA 3QIMA 4X48A 2ONSA 4KYSA 4RYAA 4DCYA 2ZNUA 1LLSA 3EHTA 3O28A 3V8XB 1OVTA 5DYHA 2I58A 1M5CA 1B4ZA 3OENA 1TWYA 4GL8A 4R9GA 4EUOA 2DSFA 1B0HA 2UYFA 1P1QA 5AA2D 2Z8DA 1Q1KA 2XXVA 3A3CA 4NF4B 3TEPA 1DSNA 4N6PA 3MVWA 4I8CA 1BLFA 3C32A 4R2BA 1Y4TA 3CG3A 4LVQA 2QRYA 2XX7A 3VLWA 1LAFE 3IB0A 1DMBA 3CVGA 4IO3A 4YKIA 3PU5A 4ZDMA 3PUZE 3K1MA 1B40A 1LBBA 5I2KA 2XXIA 1B58A 3K00A 1ZLQA 2F97A 4YB5A 3TQWA 2OBGA 4H67A 1Y3QA 2F78A 1VSOA 1NNFA 2O6AA 2RC7A 1PDAA 4IO2A 5I59B 3ECRA 3T66A 4HCWA 5KCJA 1HSJA 3FV2A 2CZLA 1MQIA 3N5LA 3OMBA 5TP9B 5CBRA 1BKAA 1A8EA 4H0WA 3FGSA 3BFTA 1JQFA 3HN0A 1B2HA 1FCKA 3C4MA 3VFJA 5CRYA 1WODA 4F1YA 4QFLA 4ZECA 2GRVA 4XKQA 4R75A 5I56A 1UTBB 3S9NC 1EZPA 4DZ1A 1KWHA 1Q35A 1GR2A 1MG1A 2ZXTA 5I2NB 4NMYA 3IX1A 3IJOB 1UIUA 4HCYA 3ILTB 4POWA 3VXCA 3THIA 4UACA 2Q8JA 1ATGA 4KFQA 1FTKA 4F2OA 3K4UA 4F3GA 4IGTA 2Y7RA 2I3WA 4POXA 4M1VA 2B3FA 5CMBA 2RKMA 1BTJA 3JZJA 2I4BA 3MP6A 4KHZE 3FZVA 5L9MA 4EQ7A 2FA7A 1D9VA 4ZS9A 3OEMA 1ZBMA 3M3FA 1QJMA 5AA3A 3RTWB 1S7YA 1YCJA 3Q26A 4MLVA 5H8QA 3JYRA 1NFTA 4NF6B 1MS7A 1SW2A 3VDFA 1PB8A 1Y4CA 2PYYA 4YU0A 1MQHA 1QULA 4F29A 2BJJX 3MJNA 3RLFE 1XOCA 4OTEA 1SI1A 2Q88A 2Q9TA 2RC8A 2XXHA 4G8NA 2ONRA 5F1QA 2AL4A 3N26A 2V3TA 4ZEIA 4WEPA 4MH5A 4KR5A 3ZKKA 3Q27A 4QSEA 3HV1A 3RY3A 1MXUA 4F1VA 3PUXE 4R72A 1BP5A 1OIBA 4RK9A 1Y20A 1MXZA 4MF3A 3D4GA 3IO6A 4YZZA 4LATA 2ZNSA 2Q89A 1B5HA 2HEUA 4AB5A 5AA2B 1O63A 3U8QA 3QUFA 1QUIA 4DIGA 1FW0A 2Z8FA 3T93B 1PBQA 5DVFA 1CE2A 2DQVA 2V3UA 5I58B 1B5JA 5L8DA 4YB6A 3CSBA 4FORA 4NF4A 1QUKA 2HAUA 3IK6B 4R6HA 4KPTA 2UVJA 1LCTA 1M5FA 1N3WA 2XXQA 1FTMA 1QKBA 2ZYNA 1IEJA 1B7HA 1RYOA 2V84A 3IOVA 4RNSA 1LB9A 3TZAA 3O6GA 2I6EA 4XTCQ 4EQ9A 4BLAA 4PFWA 3IOTA 4R6YA 4DDDA 1NH7A 1IITA 1NL5A 3CRBA 3KOSA 1JW5A 1LAXA 1AIVA 1FQBA 5I59A 3TTMA 4IGRA 3RUMA 4LQ5A 5TP9A 3VVDA 3FD3A 2QSXA 1MQJA 3MAMA 5ITPA 3O6HA 4G68C 5KZTA 1O64A 1MH3A 4BDQA 5ICQA 1R6ZA 2XD2A 2ESNA 3H6VA 1PEBA 1WDNA 4JWXA 4F19A 3S9LC 1UTBA 1IIWA 1SDXA 4P11A 4BDLA 3EHUA 3O97A 3GBBA 3FVKA 3S9MC 4FEBA 1SW4A 4GOTA 5I2NA 3KN3A 1SYIA 5H8FB 3KFMA 4NTLA 3UIFA 2OK2A 1JEVA 1URGA 4JDFA 4BDRA 4TOZA 4ESWA 5A5XB 5BUUA 1MY0A 5HM4B 1USYE 3O29A 4RA1A 1N04A 1XVXA 3K1NA 3TCGA 3FUZA 2ABHA 1GGGA 1MQDA 3TUSA 4YKPA 1PBPA 5CBSA 3MUQA 3O66A 2O84X 2R71A 2H99A 3FXQA 1SI0A 1A8FA 3MVYA 3VVEA 5FTHA 3SEXA 4NF6A 5AA4B 3ZSFA 1B5IA 4FECA 2ONKE 1TFDA 1N7XA 2YJPA 1J1NA 4O3BA 1A99A 2Z8EA 3D4CA 4NWDA 3OO8A 4F2QA 3IB2A 3FJGA 2OJTA 4KCCA 4LA9A 2X7PA 1URSA 4PFTA 4R9FA 3FATA 1NKXA 2HZKA 3OELA 1XHYA 4YKJA 5CM6A 3TMGA 3KGCA 1RKMA 2DYXA 3SEYA 1OVBA 3TYHA 4Q0CA 4TQUQ 4XKRA 4QFOA 5J1DA 1ZMGA 1MPDA 3TELA 3HPIA 2QJEA 4KQPA 3SEVA 4OWDA 5AA2A 1N76A 4OEVA 4N07A 1MH4A 1FTOA 5TPAB 4GIZA 5HPQA 2ZYMA 1B3FA 5JK4A 3PMVA 4RPNA 4QRZA 5I58A 2O68A 2PBWA 1AH5A 4JB7A 2UVIA 4OMBA 4DXCA 2D5WA 1TFAA 5M2VA 4FIMA 5HBCA 1DPPA 3HHGA 3PUYE 5I57B 3MW0A 5LOMA 1B6HA 2GH9A 1Y1MA 3MP1A 3DP8A 4G77A 2Q2CA 1Z7NE 4AQ4A 1UQWA 1MY2A 2XXXA 4MLQA 4YKKA 3FXRA 3JV9A 2NXOA 4R74A 3WAFA 1BIYA 1XVYA 3B6WA 3U72A 4GXSB 3KBRA 3PUVE 4EXLA 3TFLA 3GXAA 4H1XA 4FAJA 1A55A 3N6UA 1R1NA 3V89B 1QKAA 4I9DA 1GTKA 4NF8B 3IOUA 3U93A 3UGWA 4FEDA 4LUBA 3MBPA 5IAIA 3MPLA 4YMBA 1OMPA 2XX9A 3MZ1A 4GRKA 3KN7A 2F36A 3GLBA 4RXLA 4IB2A 3ZKLA 1EU8A 4OVJA 3CFZA 4EDPA 4ZZEA 3O6IA 3VLVA 4H5GA 3B6QA 3R6UA 1SW5A 2HQ0A 1H45A 1L5TA 1II5A 1MDQA 4OFOA 5H8FA 1NH8A 5DT6A 2RC9A 1N7WA 3TCFA 2PVUA 3OD7A 2VOZA 1DTZA 3F11A 3EF7A 1XC1A 3CFLA 5A5XA 4RPOA 2AL5A 4QHQA 3EPEA 3ONMA 4U23A 3HSTA 3B7DA 4JSDA 1LFGA 3OO9A 2YLNA 3TQLA 1JETA 4UA8A 4EF1A 3PD8A 3O9PA 1VR5A 2IEEA 1IXIA 2PT2A 3LUYA 3TTKA 1D9YA 3EHSA 3K6VA 1B05A 1NNPA 5AA4A 4JBZA 3TTNA 4ZEKA 1GVCA 1P1NA 5CMMA 2DP8A 5F7VA 2RF1A 4GF8A 5CI5A 4PFYA 4OETA 3K6WA 1Z7ME 5K2XA 3T22A 1ANFA 4OXVA 5EHSA 1OQHA 4PP0A 2W7YA 2O1LA 4O3CA 4IO4A 4FE8A 4U21A 3MQ9A 1AL3A 3U92A 1M5BA 5H8SA 2H4IA 4PFUA 3TTLA 1VFDA 4PQJA 1MXVA 3H06B 2NOOA 2NWJA 2H25A 5JTYB 3SEUA 1DTGA 1B3GA 3K6XA 3MVZA 2P1SA 4ONYA 1LBCA 3M8UA 3PV0E 1MM6A 3TODA 1P1OA 1HSEA 2F5XA 3CI8A 2I0BA 4WKMA 2O51A 1OLAA 5TPAA 2Z22A 4NF5B 1MXYA 4QFPA 1IQ7A 2QS3A 2XXTA 1I6AA 4O3AA 1B9JA 3Q25A 1ELJA 2ZYOA 3QK6A 2DWAA 3OEKA 2FNCA 5FTIA 3E13X 5I57A 3UN6A 3P7IA 3LSXA 3Q29A 2PMSA 4R6KA 4U4SA 1MDP1 1S50A 1M5DA 5AE4A 2HCAA 5TU0A 3RT6B 1RYXA 1QW0A 4JSOA 2E1SA 1FQAA 3N94A 1NMUA 3KJTA 2Y84A 2F34A 3O2AA 3Q28A 2DE3A 3K01A 1H43A 2GFEA 5DTBA 4L17A 4G68B 3R7XA 4M4GA 2QMXA 1B32A 3PPNA 1B0LA 2NUVA 3QSLA 3R26A 3T96B 4OQOA 4NF8A 4YB7A 3TPAA 4U2RA 2A5SA 1YPNA 2H9BA 4U1ZA 2RCBA 5AA1A 3I6VA 1YTVA 3IL1B 2WKYA 2H5YA 4MFIA 4F22A 3E3KA 1O7TA 3S2VA 4KI0E 1URDA 2XXPA 3BFUA 1LB8A 1SBPA 3UK4A 3RTFB 3FXUA 3RPWA 4OEUA 1MY3A 2XXRA 1JNFA 1SQYA 4E0XA 2G93A 3RGYA 1A40A 3BKIB 5FHNA 4Q30B 1B4HA 2DVCA 5DEXB 5IKBA 3TDJA 1PB7A 3PPOA 3FVNA 2M8CA 1JEUA 2DOJA 1Y9UA 3IAZA 3C33A 4LZ7A 1LGBC 4G4PA 4ZEDA 3LBSA 1Y3NA 3KEIA 2DE2A 3K2DA 4F1UA 1AMFA 3G3GA 1A7LA 3T9XB 4C1TA 1A54A 3V5AA 3VXBA 4QSDA 2ZYKA 1MRPA 2F7AA 1T0KA 1PC3A 2IA4A 4HTGA 2OZZA 4ZE8A 4LP2B 4R2FA 1GV8A 4DLDA 5CC2A 2P2AA 4OERA 2VHAA 3UP9A 3VV5A 5BWJA 2XX8A 2Y7PA 3ODBA 3FV1A 5FHMA 3H6TA 4P0IA 1LCFA 1FQDA 4X9TA 1FQEA 3C35A 1JW4A 4TLLB 1D3KA 3KOTA 2O7UA 2KLFA 3M3KA 3U94A 5H8HB 3K1PA 2PX1A 3KSXA 1R9LA 2D21A 3C9HA 3K6UA 5JTYA 1ZKBA 3QAXA 1TT1A 4PE5B 1P1WA 4OYVA 1IUDA 3PPPA 3IORA 4C1UA 2AIXA 1H44A 1F9BA 3HO7A 1B3HA 1MY4A 4KYEA 3LSLA 4ZEBA 1LFHA 2I4CA 3PMXA 4NF5A 4RY1A 2VD2A 5EYFA 3QXMA 4DXBA 4ZEFA 4KYDA 2F6GA 4ELOA 2F7BA 3FIRA 1UTHB 2REGA 5K2YA 4Q8RA 1IXHA 4RK2A 3PD9A 3OO6A 4F31B 1IXCA 1H3DA 4JWOA 1B46A 4BDMA 1B3LA 1NNKA 2XXWA 2O7IA 3VLUA 1LSTA 4LZ5A 4ELPA 4ELQA 5L9SA 1VE4A 2O69A 3PUWE 2UVHA 4G68A 4DCXA 4G8MA 5ICTA 1B3EA 3L6HA 1S9TA 4XKNA 4GL0A 2R6GE 3SESA 4EQBA 3IJXB 2VP1A 3PPQA 3WAEA 2FYIA 3C31A 2F35A 4C0RA 1LAGE 3MC2A 3KJ7A 3ZS6A 3E4RA 3RNNA 1DPEA 4QF9A 4YMAA 5ITOA 1ZIUA 4GQOA 2GHAA 3LSFB 3TTRA 2V25A 1SD3A 3MZBA 1LFIA 1POY1 2QMWA 1MY1A 3KG2A 4OESA 1SYHA 3OSRA 3DP6A 2AYSA 4EF2A 4MBPA 2GHBA 3MPKA 5DEXA 4F18A 2DWIA 2X7QA 1I69A 3VE1B 2PT1A 3RQTA 4F3BA 3FVOA 1WVJA 3G3FA 5KDTB 1SVXB 1MPBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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