1M5FA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j-y702f) in complex with acpa at 1.95 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5fA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5fA01
5JEIA 4FECA 2DYXA 4LONB 5FHOA 4DCXA 2REJA 2ZYMA 3OOAA 2VOZA 2KLFA 4YB6A 5CBSA 1ZBMA 2CZLA 5ELVA 3S9NC 4G8HA 2PX1A 1MPDA 2OBGA 5I57A 1B4HA 2DWAA 4RYAA 4QFOA 4Q30B 1NNPA 1MXWA 4F3PA 2HQ0A 4XKNA 1FTKA 5DEXB 3IORA 3TELA 3G3GA 1EZOA 2YJPA 2CMOA 4OESA 3HSTA 4AB5A 1IQ7A 5HBCA 4NF6B 3LSFB 3PMVA 3G3IA 5FHMA 3LBSA 3RTFB 2D21A 2XXUA 3GXAA 3R7XA 4H8IA 1GV8A 4OENA 4OHNA 3IAZA 4OFOA 1H44A 4ZEIA 1PDAA 2REGA 3I5OA 4TOZA 4LP2B 1MDP1 2F8DA 3Q29A 4PFTA 2PT2A 1B40A 3CFXA 5FTHA 1ZTYA 4BDMA 2O68A 2QS3A 2QSXA 4IO5A 3C32A 1N7WA 5H8FB 1TFAA 1NH8A 2FA7A 1O63A 4R73A 1POY1 3D4GA 4I8CA 1URDA 2VP1A 4G8MA 2VD2A 4QSEA 4R2FA 4YICA 4JXIA 3IJXB 3N6UA 2PYYA 2Q9TA 4HCWA 4NMYA 2Z8DA 3KN3A 4EQBA 4ESWA 2Z23A 3KOTA 3KGCA 3B7DA 5DEXA 2P2AA 3KSXA 4HS7A 4JSDA 1A8EA 1GTKA 4H6DA 4NF5B 1SVXB 5FHNA 4POWA 3JZJA 4F1YA 4F29A 2XD3A 2HZLA 4OETA 5HM4B 4KCCA 4G8NA 3OXNA 1SI1A 3B6TA 2Y7RA 4ESXA 3ODBA 3V8XB 2GHBA 1B58A 2XXRA 4C1TA 3BFUA 1MXYA 3JV9A 4XKQA 1P1NA 2V3UA 2I4BA 4OXVA 4GVOA 2V25A 3FJ7A 4GWOA 3ZSFA 2YPNA 1JW1A 2I49A 2YLNA 3CFLA 2H25A 3TEPA 1IITA 2G29A 4FE8A 3SEVA 5L9SA 1B5HA 1N0TA 4IGTA 2ONKE 1UTHB 3O2AA 2Z8FA 3IB0A 3TTMA 3U93A 3OO8A 3MP1A 4ZEBA 2UXAA 1SYHA 5H8QB 4Q0CA 3PUZE 1HSJA 4G68B 3HO7A 4QRZA 5K2YA 3FJGA 3FATA 1NFTA 2DWJA 4ISUA 2XX8A 3T96B 2F36A 5KDTA 3OEKA 1IXHA 2P1SA 4EUOA 4EDPA 4FATA 2BJJX 2F7AA 5L9MA 5IAIA 3TAJA 1A7LA 3MP8A 4MLVA 3K2DA 1SQYA 4KYEA 3HV1A 1ELJA 4L17A 3MW0A 1EU8A 4GRKA 3EHTA 3KN8A 2M8CA 2RC9A 3PMWA 1LAHE 4EF1A 1USYE 1QW0A 3MVYA 3HCQA 1L5TA 3DELB 1XOCA 2XXIA 3R26A 3PV0E 3H6UA 1A40A 3LUYA 4XKRA 4DIGA 3S9MC 3CR9A 3OO9A 3IOWA 2ANJA 3K00A 2UVGA 2OLBA 3O97A 5B70A 2AIXA 1NH7A 4OERA 2H9BA 3MP6A 1UTHA 4ZEKA 2Q89A 3PD8A 1QUKA 1D3KA 3H7MA 2AYSA 4H67A 2QS1A 3ONMA 4BDQA 1DSNA 5L9OA 4OZ9A 1D9YA 5B7DA 2ZXTA 1PC3A 1IEJA 5M2VA 4WKMA 1B4ZA 3KJTA 4KYSA 4H5GA 3K0VA 1WDNA 1ZU0A 3H03A 4KYDA 5KCJB 2XXWA 4U2RA 3KN7A 2Q8JA 3CSGA 2ZNUA 3FXQA 2V3QA 3K1MA 4P0IA 4QF9A 1DTGA 1N7XA 5ICQA 4NWCA 2XXYA 1XT8A 1US5A 2ZYOA 3V89B 4ZE8A 5EHSA 1P99A 4F18A 3UP9A 4ZECA 4F3SA 5ICTA 1M5EA 2PT1A 4EXKA 3VLWA 1PEBA 2ONRA 2RC8A 3Q27A 1VFDA 4R2BA 1Y20A 1FQDA 5JTYB 2RCBA 1B7ZA 4ELOA 3E9XA 4O3AA 3IB2A 4U1OA 5I56A 1BLFA 3C36A 4MLQA 1P1UA 2B65A 3K02A 2UYEA 1MRPA 1LGBC 2X7QA 2E1SA 3FZVA 4DXCA 3GBBA 4I62A 3N26A 4YMBA 3MVXA 1B0HA 3IK6B 4LATA 3HHGA 4XKPA 2UVIA 3MUQA 4Q5TA 1LSTA 1ZIUA 1RYXA 1SD3A 3V83A 3P7IA 3IX1A 5CMBA 1QJMA 4Z7EA 3PPQA 2GHAA 3QK6A 3I6VA 1FTLA 1FQBA 1O7TA 2THIA 3QXMA 4QFNA 4ZEDA 2ZYKA 4GLIA 3OSRA 5KCJA 4F2OA 3VVDA 4QSDA 1Q1KA 1SW1A 1Q35A 1JVYA 3MZ9A 2PVUA 5CI5A 3H3GA 3O6GA 1PB9A 2I0CA 4FEBA 1MQHA 3K4UA 4THIA 4U22A 5H8HB 1LB8A 3IR1A 1DMBA 3U94A 3SETA 1MQJA 4JBZA 5A5XB 1AH5A 3C4MA 1R6ZA 5JTYA 2F34A 4LQ2A 4PFWA 4F39A 3KG2A 4R72A 4GD5A 1P1QA 4RA1A 1NKXA 3ILTB 3QAXA 4QFKA 3TQLA 4GXSB 2V93A 4KHZE 2QJEA 4P0GA 4OTEA 3THIA 4N07A 3MJNA 3VLUA 3VFJA 3MPKA 3T93B 3I3VA 1JW4A 3FVNA 2QPQA 2XX7A 4X48A 3T9HB 3DP8A 4POXA 2I4CA 2QMWA 3C31A 2A5TA 1LFHA 4UACA 3K1NA 2HZKA 1LCTA 3TYHA 1S7YA 1BTJA 2WKYA 4OFLA 4HW8A 3TQWA 3MBPA 4U21A 1VE4A 2I58A 1QULA 1QVSA 1YAEA 3OD7A 4R75A 1QUIA 3LSXA 3S9LC 4PP0A 4H1XA 2RKMA 5H8HA 3AXFA 3QUFA 5KZTA 5A5XA 2VHAA 5AA2A 2XXPA 2QS4A 1YCJA 1VSOA 4OFJA 3PUWE 3TODA 4EQ7A 3RN8A 3SDFA 2RC7A 2R6GE 3DM0A 2XHDA 3FVGA 4N13A 1SYIA 5EYFA 5KDTB 1UTBB 1IXCA 4EXLA 1ZKBA 1B3LA 3G7WA 3OEMA 3C33A 2I0BA 4X1BA 4Q8RA 1N3XA 4ELPA 2O6AA 3TDJA 4LVQA 1AL3A 1QUJA 1URGA 3OMBA 2Q2AA 2B3FA 5CC2A 4XXUA 4LUBA 4YB7A 3FD3A 4RY1A 3O29A 3VV5A 1TT1A 4DCYA 2ZNSA 3ZKKA 1Y3QA 1FTMA 3N5LA 4EF2A 4IO2A 1NNTA 3PD9A 3JYRA 4UA8A 4PQJA 1HSLA 4KQPA 4X1DA 1B3HA 3ILUB 1FTJA 3V5AA 3M8UA 2QL3A 3UN6A 3D4CA 1MY2A 5DTBA 3OO7A 1MPCA 4NF4A 2Y7IA 1JEVA 2XX9A 1S50A 4G68C 2DOJA 3QYTA 4O3BA 2X7PA 2QMXA 2HAUA 1D4NA 1WVJA 3CG1A 5CBRA 4QFLA 4R6HA 4PFYA 4AB6A 4LA9A 1JETA 4TQUQ 3KSJA 4OVJA 4BDOA 4IO6A 2IEEA 1FW0A 2O69A 3QUJA 2PMSA 1LAGE 4RJZA 3S2VA 1PB7A 3MVWA 3W15C 4DXBA 1UTBA 1A8FA 1URSA 4IY5A 1IIWA 4U4SA 3PPPA 1XVXA 4ZZEA 2O1MA 4YKKA 1USYH 3PPNA 3OO6A 3K1PA 4FAJA 1JVXA 4LZ7A 1OQHA 1UIVA 1B3EA 3M3FA 1HSEA 3B6QA 1CB6A 2DQVA 1JW5A 1MY3A 2RCAA 5I2KA 4KI0E 2ESNA 1XHYA 3MAMA 3TTKA 3MWBA 1SW4A 4MFIA 4C1UA 1TXFA 3PPOA 3T9XB 3SKPA 3TKDA 1IZ1A 1QKAA 1MQIA 1WODA 4YAHX 5CMMA 5I58B 1SDXA 3UK4A 3PPRA 1JNFA 5I56B 1DTZA 3FVKA 5BUUA 2F97A 3SERA 5I84A 5H8SA 4ELQA 1H45A 2QS2A 1H43A 4GQOA 3U92A 1DPPA 4R9GA 2VD3A 3O6HA 3KZGA 1NL5A 3ZS6A 3IOUA 1O64A 2F78A 4TLMB 5AA4A 4ND9A 1H76A 4ZDMA 4F1VA 4KFQA 3FASA 1N84A 4YKIA 3QSLA 4PE5B 4R6KA 4RPNA 5IKBA 3Q25A 3VVFA 2XXVA 1TWYA 1MPBA 2Y7PA 5CM6A 1OQGA 3GLBA 1AOVA 2OK2A 1M5CA 1MXZA 2NOOA 3HHFA 1FQEA 3SEUA 3CRBA 3UA8A 2XXHA 1OLAA 1OVTA 1VFEA 3TMGA 4OMBA 1XVYA 3R6UA 3T9UA 4JSOA 4F19A 2GFEA 1B32A 4ECFA 1DOTA 1BIYA 4R9FA 1I6BA 3RTWB 4U1ZA 2I3WA 1LLSA 1B5IA 3TPAA 1MS7A 4FEDA 4R74A 5I58A 1MY4A 4BLAA 4H8JA 1FTOA 4R6YA 3UIFA 1YTVA 1GGGA 2ONSA 3CI8A 3H4ZA 2DSFA 2O51A 3ZKLA 1ATGA 2RINA 3U8QA 3O66A 5CMKA 3MVZA 4OEVA 3H6VA 4DLDA 3EF7A 5DT6A 1B1HA 4ZE9A 3K01A 3PUXE 3DP4A 1Y9UA 4IY6A 4GXAA 1LFGA 4H0WA 2OZZA 3RGYA 3VE1B 3H6TA 2A5TB 1D9VA 4GF8A 3C9HA 3H6WA 3LSLA 3EPEA 1MQGA 2I48A 2X26A 4ONYA 3A09A 3M3KA 5DVIA 4I1DA 4U23A 3Q28A 1XS5A 1IXGA 2F6GA 3A3CA 2F35A 5ITPA 3FIRA 1Y1ZA 1MY1A 3PU5A 1R9LA 2GH9A 4K3FA 5F1QA 2D5WA 2P0SA 1BKAA 1TFDA 2H5YA 1QKBA 5AA2B 4KPTA 1LBCA 3IOVA 3VXBA 3H06B 3IL1B 3EHSA 4C0RA 1PBPA 1MG1A 3GZGA 3O6IA 1Y1MA 4E0WA 4ELRA 4OQOA 1Y4CA 2O1LA 2FNCA 2DWIA 3OSQA 1B2HA 4OYVA 1P1OA 3FV1A 4XIGQ 1OMPA 2R9JA 3VLVA 2HCAA 2OWTA 5I59B 2Q88A 2AL5A 4YMAA 1FQFA 5TU0A 4WEDA 5EHMA 4IO3A 3LSWA 4HCYA 4RXLA 1UIUA 4AQ4A 2DP8A 3RPWA 1KWHA 5F7VA 4WEPA 3G3FA 3FGSA 3F11A 3IOTA 3MQ9A 3QIMA 1MXXA 1AMFA 1RKMA 1MH4A 4NE4A 1N76A 2UVHA 4OWDA 4NEDA 1N3WA 3TCGA 3USDA 3PUYE 3U72A 3KBRA 2DE4A 4PFUA 1SW5A 3DP6A 2VGQA 3C35A 5BWJA 4KD5A 4YKPA 4GIZA 1SBPA 1SI0A 1T0KA 3E4RA 4NF4B 1BP5A 3BBRA 1H3DA 2F6PA 4JDFA 1R1NA 2GRVA 3RNNA 1RYOA 3KFMA 4G77A 3K6VA 3SEYA 3SESA 2V84A 2XXQA 2H4IA 1B46A 4NTLA 2F7CA 2H99A 4QFPA 3VVEA 1M5DA 3TCFA 3KEIA 5K2XA 1B5JA 1FCKA 3T22A 4F2QA 3PUVE 2F5XA 2DVCA 2F7BA 1NMUA 2Y7KA 1M5BA 3KOSA 5I59A 3E3KA 2V3TA 1JEUA 1P1WA 5H8NB 3FV2A 1IUDA 5DVFA 3G3HA 1PB8A 3Q26A 5I2KB 5FTIA 5DVJA 5TPAB 3WAEA 3TZAA 3C34A 3CG3A 3GBAA 1NNKA 3RT6B 4F31B 4FIMA 1LB9A 4NF6A 1GVCA 3W9VA 1ZJLA 2O7IA 2OJTA 5J1DA 3IB1A 4IO4A 4GFRA 4LZ8A 1IXIA 4FJPA 5AE4A 3K6WA 1Z7ME 3CVGA 4DXUA 2I6EA 4EQ9A 4I9DA 3S4UA 1I6AA 3TTLA 1B05A 1R9QA 2RF1A 4JWYA 3CFZA 3W9WA 4NWDA 5TP9B 1XC1A 3RQTA 2QRYA 3IO6A 3IJOB 4M1VA 1EH3A 4RK9A 3K6UA 3FXUA 4YU0A 4RNSA 3M3LA 4Z0IA 5AA2D 3TTNA 4O3CA 5H8FA 3G3KA 2AL4A 4ZEFA 1LAFE 4JB7A 2Y7WA 5AA4B 3TFLA 4IB2A 1N04A 2FYIA 2ABHA 2DVZA 3SEWA 3EN3A 5ISUA 1M5FA 3FVOA 1B9JA 3VDFA 5H8NA 5L8DA 4BDNA 1VR5A 3OELA 1J1NA 4IGRA 4YKJA 2D3IA 1EZ9A 1NNFA 4LQ5A 2DXRA 3BKIB 2E0SA 3UGWA 3O28A 2HAVA 5TPAA 3HN0A 4NF5A 3HPIA 2W7YA 1GR2A 1B6HA 3PMXA 4BDRA 5AA1A 4LZ5A 1ANFA 3BFTA 3MPLA 2OWSA 1A55A 1CE2A 1MM7A 1B3GA 2IA4A 1YPNA 5I2NB 2R71A 1OVBA 3PGFA 3DLNA 4MH5A 1PBQA 3RUMA 4G2ZA 1EZPA 1I6QA 2NXOA 3G3JA 4FORA 3K6XA 5TP9A 3RLFE 1B52A 1I69A 3U1OA 2LAOA 3T66A 1B7HA 4DZ1A 3FXRA 2Y84A 2O84X 1Y3PA 1B1XA 4GL0A 3VXCA 2A5SA 4DE8A 1S9TA 4N6PA 4MBPA 4GOTA 3LC8A 2ZMBA 1Z7NE 1US4A 5H8QA 2UYFA 2DWHA 4G68A 4QHQA 4RK2A 4NF8B 1LAXA 4QSCA 1JQFA 4X9TA 4F3GA 1B3FA 2NUVA 2Z8EA 3CSBA 4E0XA 4KR5A 4MF3A 1LCFA 4F3BA 2Q2CA 1POTA 4JWOA 1Y4TA 1B7UA 2ZNTA 1MM6A 3TCHA 3MZBA 2NVUB 1LBBA 1LFIA 1FQAA 2HXWA 1MXUA 3L6HA 4IO7A 1MH3A 1MXVA 3OENA 5CMCA 4M4GA 5CRYA 5I2NA 1UQWA 2O7UA 1A54A 3O9PA 2B3BA 2H98A 2G93A 3S9EA 1AIVA 3EHUA 4YB5A 1OLCA 1MQDA 1A99A 2DE2A 3RY3A 4F22A 1ZMGA 3RT8A 5I57B 2ZYNA 4TLLB 1OIBA 3E13X 5AA3A 1F9BA 2OCUA 1DPEA 2HFBA 1MY0A 2PBWA 3A3UA 2Z22A 1B51A 3CIJA 3MC2A 4BDLA 4ZZAA 4KCDA 4G4PA 1B0LA 3N94A 5ITOA 4DDDA 2UVJA 2ALUA 4H65A 3LR1A 4U4XA 3KJ7A 4NF8A 3FJMA 4RPOA 4YZZA 3L6GA 4H5FA 1SW2A 4GL8A 2XXTA 3FUZA 3TTRA 4ZS9A 3TUSA 2I3VA 4HTGA 1II5A 5HPQA 2DS9A 2DE3A 4PETA 2DXYA 3ECRA 2XXXA 1ZLQA 1Y3NA 3N6TA 4JWXA 2NWJA 3WAFA 5DYHA 3T9VA 3EQ1A 4F1UA 5JK4A 4XTCQ 1MDQA 4WXJA 3IO4A 5LOMA 1FQCA 3UORA 2HEUA 3MZ1A 3B6WA 4OEUA 3SEXA 4P11A 2XD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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