1M5FA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j-y702f) in complex with acpa at 1.95 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5fA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5fA01
5EHMA 3QSLA 1ANFA 2QRYA 4BDMA 1LCFA 3MPLA 1ZIUA 3H4ZA 2I3VA 1I69A 2Y7WA 4N13A 2KLFA 4BDLA 4RK9A 1SYHA 4Q5TA 4RA1A 4ECFA 1B3LA 3CSBA 1Z7NE 3K00A 1DSNA 4C1UA 3KG2A 2VP1A 3C4MA 2F36A 4GL0A 4AQ4A 4LP2B 3A3UA 1NNPA 4ZE9A 2A5TA 3I6VA 4R75A 1MY0A 2FA7A 3CIJA 3FVOA 3MVWA 3TUSA 2OBGA 1XHYA 3QUJA 4Q0CA 1MXVA 1LLSA 2Z8FA 1QKBA 3FIRA 4AB5A 4DE8A 2HZKA 2XX8A 4HW8A 3FXQA 1OLAA 4XTCQ 3FJMA 4QF9A 3OOAA 3CSGA 4RPOA 4QSCA 1JW1A 3RT8A 4OYVA 4I62A 3FUZA 2R9JA 4FJPA 3M3KA 4WXJA 3BKIB 2I58A 1A8EA 3TTRA 3Q27A 2X7PA 5B70A 4I8CA 2DE2A 1N7WA 4DCXA 2GHBA 3MBPA 3ZKKA 3QIMA 3T9UA 5LOMA 5AA4A 5CMCA 3I3VA 3KOTA 3O97A 3PMXA 4AB6A 5HM4B 1N76A 1P1NA 4F18A 3PMVA 4F19A 5I84A 3RLFE 4ONYA 3EHTA 3RGYA 4Q30B 4FECA 1IXIA 2NVUB 5I2NB 2DXRA 1JW4A 4OFLA 3CFZA 3K1PA 3THIA 3S4UA 5CC2A 1EZOA 5DYHA 1FQBA 2DWAA 5F1QA 3IB0A 2Z8EA 1B0LA 1MY2A 1OLCA 4FAJA 1B40A 3H6TA 2Q8JA 2B3FA 2V93A 1B4ZA 1B51A 3FJ7A 4ZS9A 3C36A 4NWDA 4F2QA 3TAJA 2R71A 3TEPA 1B2HA 3MVZA 3IL1B 3W9WA 1H45A 1P1UA 4R2BA 1B7ZA 4OEUA 2OWTA 5AA2B 2DE3A 3OO6A 4NF4B 3IR1A 4R9GA 1M5BA 4TLMB 4F31B 1N3WA 1ZBMA 4NF6B 5FTHA 5I56A 2AL5A 1LBCA 3FD3A 2ONSA 5TPAB 1JNFA 2XX9A 4U21A 3TTNA 1SW1A 2GFEA 4OHNA 3DP6A 3OELA 3VV5A 3KFMA 2REGA 2NWJA 1Y1MA 4F3SA 2Y84A 3Q29A 3K01A 1YTVA 2HEUA 2F6GA 1SD3A 1FQFA 1B46A 2YPNA 5FHOA 4Q8RA 4F29A 3G3JA 3K2DA 1S7YA 3IO6A 3S2VA 4PFWA 3DP4A 3K6WA 2I0CA 4H67A 2B3BA 4OESA 1VSOA 4G77A 1DOTA 2O68A 1DTZA 4K3FA 3M8UA 3O6GA 4NF8B 3Q26A 1J1NA 1Z7ME 1S9TA 1FTLA 5I2KB 4ZEFA 4HCWA 4E0XA 1N7XA 4LZ5A 4NF5B 4F3GA 3N6TA 4F3BA 3MP6A 1ZLQA 1B52A 1XT8A 4G2ZA 2ANJA 3EN3A 3PPQA 2UVGA 4KQPA 3G7WA 2PVUA 3AXFA 4G8HA 2P1SA 4P11A 2ABHA 1DPPA 3C9HA 3GLBA 1FQEA 2PX1A 2I3WA 4LONB 3T9XB 3Q28A 1GTKA 1QUJA 3TMGA 2A5SA 4TQUQ 3PD8A 1IXCA 1GR2A 3IOTA 5TU0A 1SI1A 3ONMA 5BWJA 2I6EA 2REJA 4KD5A 3TQWA 4F39A 2OCUA 1H76A 3PMWA 3HHGA 2QS3A 1IUDA 1Y20A 5ICTA 4YB5A 3R6UA 2PT1A 4JXIA 1F9BA 5ELVA 4DCYA 5HBCA 4LZ7A 3ECRA 1LFHA 4IO5A 2XD2A 2V3QA 2UXAA 4JWYA 3FGSA 3H6VA 3IB2A 3PUVE 1II5A 2XXHA 1USYH 4X9TA 3O9PA 3LR1A 1QUIA 4YMBA 1B5JA 3DLNA 4IY6A 5CI5A 4H0WA 4JB7A 3U8QA 4IO3A 4R6YA 4R74A 3MW0A 3KOSA 1PC3A 1VE4A 4ESXA 3N5LA 1AMFA 3JZJA 1POY1 1I6QA 2DVCA 4N6PA 3FZVA 2DYXA 4GXSB 4QHQA 5DEXA 3VVFA 2PT2A 3OEKA 4PFYA 2ESNA 4OVJA 1TWYA 3KSXA 2O7IA 4YB6A 3PU5A 2A5TB 3C32A 4ZEBA 4EXLA 4MF3A 4XXUA 1PDAA 4LA9A 3WAFA 1OIBA 4M4GA 4IO7A 4H1XA 1NH7A 4EQBA 5L9OA 2AYSA 4ND9A 1FTOA 3LSWA 4FATA 5ISUA 3O66A 1ELJA 4GWOA 4ZEKA 3F11A 3WAEA 4Z7EA 1IXHA 3EF7A 1BP5A 3MWBA 4GVOA 2DOJA 1D4NA 2Y7IA 1GGGA 5L9MA 1NNKA 1PBQA 2HQ0A 4FORA 4H8IA 1O64A 4LUBA 1NMUA 3KN8A 5IAIA 1T0KA 3PPOA 4KFQA 3TFLA 3LSXA 2F5XA 4EDPA 1OMPA 1Y3NA 5AA4B 1VR5A 4IGTA 2GRVA 2ONRA 3PGFA 2RF1A 5L9SA 3OD7A 5AE4A 3RNNA 1B1XA 2OJTA 2V3UA 4XKQA 3K6UA 3IORA 4OQOA 4RNSA 4BLAA 4KYSA 4ISUA 3V83A 1IXGA 3PUYE 1MRPA 2R6GE 3N94A 4F22A 1GV8A 4F1VA 1PBPA 2G93A 1JW5A 1UTBB 3H3GA 2DE4A 4IB2A 3V8XB 3C33A 1MH3A 1JQFA 3QXMA 5CMMA 1H44A 1RYOA 3RN8A 1M5FA 4C0RA 2XXQA 2F6PA 2P0SA 1TT1A 3E13X 4JBZA 4GXAA 4FIMA 3T66A 3VFJA 3KZGA 1YAEA 3ZKLA 2Q2CA 3T93B 4GD5A 3CG1A 2ONKE 2QS1A 3HHFA 4C1TA 2UYFA 5A5XA 3S9EA 4EF1A 3FASA 3MVYA 3MZ1A 2Q9TA 2RCAA 1XC1A 5I56B 5H8NA 1IEJA 1MQIA 3LBSA 2ZYMA 3GXAA 1MXXA 2F7CA 3QUFA 4R6KA 4U1ZA 4R72A 4BDRA 3CR9A 4O3CA 1D9VA 2OK2A 4L17A 2B65A 1JVYA 4X1BA 1P1QA 2XXUA 2O7UA 3IO4A 3ILTB 4KI0E 1XS5A 4PFUA 3UORA 2G29A 4YKPA 4GRKA 3KSJA 4ZZAA 2QS2A 1B7HA 4IO2A 1LSTA 4EQ9A 4TOZA 2DP8A 2F7BA 2HZLA 2RC9A 1OVBA 1PB9A 3CFXA 1YCJA 4OTEA 4RK2A 1O7TA 4H5FA 4KHZE 3GBBA 5I57A 3N26A 4RPNA 2OLBA 1MPBA 3H03A 3S9NC 1SW2A 4POXA 5J1DA 4YKJA 4GF8A 3TTKA 4XKRA 3BFUA 3UK4A 3PD9A 3TTMA 4P0GA 2Y7KA 4IO4A 4U2RA 2H9BA 1DTGA 1BTJA 1MQGA 1NL5A 3HO7A 5K2XA 5L8DA 3HN0A 3TTLA 4YZZA 2CZLA 3V89B 3G3IA 3UGWA 3IK6B 1UIUA 4N07A 3FJGA 1B1HA 2F8DA 4OZ9A 3FVGA 1B5HA 3T9VA 2Z23A 3VLUA 5KCJA 5H8FA 4XIGQ 3VXBA 1NH8A 2UVJA 3O6IA 4ZZEA 2UVIA 1HSLA 2DWHA 5JK4A 2Q89A 1URGA 3QYTA 4QSEA 1URDA 3SDFA 2O51A 2H99A 1Y3QA 4DZ1A 3KJTA 4PE5B 3IJXB 1Y9UA 3VLVA 1MXYA 5I2NA 4BDOA 2VD2A 3D4CA 4E0WA 1AH5A 3L6GA 3B6QA 3IAZA 4U23A 4LVQA 1BKAA 2XXXA 3SKPA 2QMXA 1MXZA 3R7XA 4THIA 4OXVA 1QKAA 2QMWA 4UACA 5H8SA 4DDDA 1URSA 3HPIA 4R2FA 1H43A 2D21A 1SYIA 3H7MA 1CB6A 2HAUA 3TQLA 3RPWA 5DEXB 2ZYKA 4GQOA 3U92A 1JVXA 2IEEA 1B0HA 1MG1A 4G68A 4GL8A 3VVDA 4RYAA 3QAXA 5CM6A 5DVFA 4ELOA 1Q35A 1B3GA 4X1DA 3VE1B 1YPNA 4O3BA 1QJMA 1MM7A 3MP1A 3FVKA 4QFNA 2X26A 1LAGE 3H6UA 1N0TA 3FV2A 1JEVA 1A55A 3RQTA 3DM0A 4Z0IA 3D4GA 3K4UA 2XXYA 1LAHE 3K6VA 1B7UA 1SW4A 2GH9A 5B7DA 2ZNTA 3B7DA 3E4RA 2DVZA 3RTWB 2NUVA 4WEDA 2FYIA 2XHDA 2P2AA 3T9HB 2DQVA 3W9VA 4UA8A 3SETA 3SEUA 4QFPA 4PQJA 3UIFA 2GHAA 1I6AA 1ZTYA 4U22A 3PPPA 4R73A 4RXLA 1TFAA 5DVIA 1FW0A 3O29A 4OEVA 4RY1A 3IOUA 2O6AA 4LQ5A 1NFTA 5AA2D 1AOVA 1N84A 3TELA 4YMAA 1A54A 2XXPA 3RT6B 1US4A 4MLVA 3UP9A 4OFJA 3OXNA 4DLDA 1EZPA 1I6BA 3TYHA 4MH5A 3OO8A 4HCYA 1R9QA 2I48A 3SESA 5M2VA 4G8MA 2LAOA 3CRBA 1D3KA 4HTGA 2HXWA 5I59A 3OEMA 4GFRA 4LZ8A 1B5IA 4WKMA 2ZXTA 4JWOA 3CI8A 3KEIA 3LSLA 4MBPA 3U93A 4ZECA 3MVXA 3TDJA 4HS7A 1MS7A 4YKIA 2E1SA 1WVJA 3M3FA 2HAVA 4R6HA 2PBWA 4NE4A 4KPTA 5DVJA 1M5CA 5JTYA 1ZU0A 4DIGA 1MQJA 1MXUA 4O3AA 3TCGA 2VGQA 3HSTA 3TCHA 2CMOA 3KGCA 3MC2A 5H8HA 3MAMA 4GIZA 4KYEA 1Q1KA 1M5EA 1H3DA 2Q88A 3KN3A 3GZGA 5H8QA 4IGRA 5H8NB 1NNTA 4LQ2A 2OWSA 3TCFA 4OFOA 1A7LA 1FTMA 3MZ9A 1UIVA 2XXRA 4JSDA 2XX7A 5AA1A 3TZAA 3OENA 2NXOA 1SQYA 1TFDA 1MQHA 4OETA 5KDTA 4LATA 2ZYOA 2THIA 1SBPA 3IOWA 4ELPA 3EQ1A 3U1OA 1IIWA 4G4PA 4KCDA 1MY4A 3G3FA 2XXTA 1B6HA 4NWCA 1R9LA 2O1MA 1NNFA 4FEDA 2V3TA 3FXRA 2I4BA 1MQDA 3T96B 3ZS6A 1UTHA 3DELB 4ELRA 5FTIA 5I57B 2M8CA 3G3GA 3CG3A 2H25A 1GVCA 3SEVA 1B4HA 1ATGA 4RJZA 1QULA 1JEUA 1AL3A 3I5OA 1FQCA 5I58A 4XKPA 1MXWA 4U4SA 2ZNUA 1A99A 2HFBA 3ILUB 1LB8A 1B3HA 3L6HA 3MJNA 5BUUA 2F7AA 4IY5A 3R26A 3N6UA 4G8NA 1EH3A 3FXUA 1DPEA 4H8JA 3OO7A 1PEBA 1N3XA 1QVSA 5TP9A 1B9JA 2V25A 5EHSA 4OENA 3PV0E 3KJ7A 5CMKA 1MH4A 4I1DA 2E0SA 3K1MA 3C35A 5H8FB 5KCJB 1RYXA 1MY1A 2QJEA 2PYYA 2OZZA 3OO9A 2XXIA 1LCTA 4PETA 2ZMBA 2F35A 3EHUA 3SERA 4M1VA 1BIYA 2VOZA 1SI0A 3IOVA 2V84A 3OSRA 4QFLA 1S50A 4BDQA 2BJJX 3GBAA 3TPAA 1PB8A 1ZMGA 2D5WA 4QSDA 5HPQA 2I4CA 3A3CA 1MDP1 2ZNSA 4KYDA 3RY3A 3A09A 3CVGA 4YU0A 3PUZE 2DSFA 1N04A 2F34A 2FNCA 1MPCA 2DXYA 2W7YA 2XXWA 1VFEA 1IQ7A 2UYEA 1B05A 5ICQA 3MQ9A 1A8FA 1B3EA 2IA4A 3OMBA 1B58A 1MM6A 1XVYA 2YLNA 3B6WA 1UTBA 1LAXA 4FEBA 1LAFE 4DXCA 4NEDA 2VD3A 2D3IA 2O84X 2RINA 3P7IA 5DT6A 3T22A 5EYFA 4EF2A 4DXUA 3S9LC 3H06B 2DWIA 5ITPA 3IX1A 3KN7A 4F1UA 4G68B 1P1WA 3O28A 3MUQA 4ZEIA 3TKDA 4ZE8A 3FV1A 3K1NA 4I9DA 4EQ7A 3S9MC 1WDNA 3TODA 2VHAA 1FQDA 3LC8A 1D9YA 3BBRA 3E3KA 1R6ZA 4OERA 5CBRA 4F3PA 3U94A 3B6TA 2XD3A 4ESWA 1QUKA 1CE2A 2Y7PA 3HV1A 3RUMA 1MY3A 1LFGA 1A40A 3PPRA 4POWA 4XKNA 2NOOA 4GOTA 5ITOA 4FE8A 5CMBA 1FTJA 2QSXA 3SEYA 3G3HA 1EU8A 1LGBC 3VVEA 3EHSA 2ALUA 1MDQA 1Y4CA 3MZBA 1OQHA 1LBBA 3OSQA 1FQAA 4TLLB 4NTLA 3USDA 1IZ1A 2Z8DA 2H4IA 4H5GA 4KR5A 4KCCA 1HSEA 1PB7A 2RCBA 2YJPA 2RC7A 1TXFA 2XXVA 3VLWA 5FHNA 2AL4A 2X7QA 4JWXA 5I59B 3SEWA 3QK6A 5AA2A 3BFTA 1P99A 2UVHA 4NF4A 3LUYA 4U4XA 4GLIA 2AIXA 5CBSA 5F7VA 4YB7A 3K02A 4NF6A 4PP0A 3IB1A 5TPAA 4NMYA 3E9XA 1WODA 2QL3A 1R1NA 1L5TA 3G3KA 3MPKA 2QPQA 1B32A 4WEPA 4JSOA 5JTYB 2ZYNA 3UA8A 3ODBA 3VXCA 2Z22A 1QW0A 1BLFA 3VDFA 3C31A 3H6WA 5H8HB 2H5YA 4QRZA 1XVXA 2F97A 4MFIA 4P0IA 3SEXA 1Y3PA 1KWHA 1VFDA 4IO6A 5H8QB 2RC8A 4OMBA 5KZTA 3UN6A 4YICA 1B3FA 2DS9A 1NKXA 5KDTB 2WKYA 4NF8A 1SW5A 1EZ9A 4OWDA 1SDXA 5AA3A 2PMSA 1SVXB 1MPDA 5K2YA 4EXKA 1OVTA 5I2KA 2Y7RA 4NF5A 3V5AA 2Q2AA 3MP8A 1HSJA 2QS4A 4BDNA 1M5DA 1XOCA 1FCKA 1LFIA 4F2OA 3M3LA 5DTBA 3FATA 4F1YA 1P1OA 1ZJLA 1AIVA 1OQGA 4ZDMA 4PFTA 4YKKA 3U72A 3RTFB 4ELQA 4X48A 1UTHB 3PUXE 1Y1ZA 4U1OA 2DWJA 3KBRA 1USYE 1ZKBA 3Q25A 2RKMA 3CFLA 5FHMA 1O63A 3K0VA 3IJOB 1LB9A 4G68C 3W15C 4QFOA 3FVNA 1DMBA 3O2AA 2HCAA 2I49A 3PPNA 5I58B 5A5XB 4H6DA 3JYRA 4EUOA 2H98A 1US5A 5CRYA 3ZSFA 2O69A 2I0BA 3PUWE 3O6HA 1FTKA 1JETA 3DP8A 1IITA 3HCQA 5TP9B 3JV9A 4R9FA 5IKBA 4QFKA 1UQWA 4JDFA 3K6XA 1POTA 1RKMA 1Y4TA 5JEIA 4YAHX 2O1LA 2F78A 3LSFB 4ZEDA 3C34A 3EPEA 4H65A 4DXBA 4MLQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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