2I4BA

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with bicarbonate and calcium
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
401
structure length
401
Chain Sequence
PEMMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Bicarbonate transporter
publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
total genus 142
structure length 401
sequence length 401
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4bA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i4bA01
1P1OA 3ONMA 2I49A 3K1MA 3KN3A 4GIZA 4R6KA 4R9GA 1SW2A 1SDXA 5I57B 3KN8A 3TODA 3TYHA 1A7LA 3KSJA 3S9MC 5AA4B 3OENA 1SI0A 3HCQA 5CRYA 4I1DA 4TLLB 5I2NB 1CB6A 2FNCA 3UK4A 3VXCA 4N07A 1QKBA 1PB8A 3FVGA 4ZZAA 1QVSA 4DDDA 3Q28A 1UIUA 3KG2A 5EHMA 1M5BA 2PVUA 3CFXA 3FZVA 2KLFA 3USDA 2O1LA 4ND9A 3K4UA 3TZAA 3H3GA 3R26A 3M8UA 1DTZA 1S9TA 2PT1A 3TEPA 1HSEA 2PMSA 3FASA 5DEXB 4FAJA 1SQYA 3UORA 3FATA 3IK6B 2NUVA 3E13X 4MLQA 2I3WA 1Y20A 1MXUA 4R74A 2THIA 5AA1A 1QJMA 4DLDA 1SW4A 5I58B 3IOWA 1O63A 3TPAA 3MAMA 4BDMA 2XXWA 1FQEA 3W9WA 4NF4A 5I56B 1IQ7A 1B58A 3G3KA 2ZXTA 4H1XA 3QUJA 2NVUB 1A55A 1MS7A 4ZE8A 5FTHA 4XKQA 1EZPA 3VLWA 3TTNA 1P99A 3S9LC 1HSJA 3B6QA 4ZEIA 1M5FA 1NNTA 3HSTA 2Q8JA 1MH3A 4H65A 4R72A 2YJPA 2ONKE 3PPRA 2UVIA 4THIA 3ZKKA 2UYEA 2XX8A 3LBSA 1IXHA 4EQ9A 2RCBA 1ZLQA 3RPWA 5DYHA 4ISUA 2QL3A 4H67A 4Z7EA 4OERA 3IB1A 2QSXA 3GLBA 4H8IA 4JBZA 4FEBA 2XXUA 1EZ9A 1QUKA 4OTEA 1MPBA 3O9PA 3CFZA 4RJZA 2NWJA 2DE3A 1JNFA 3CIJA 4OESA 3CSGA 1BP5A 1FTJA 4YKIA 3K6XA 1MXWA 2PBWA 3P7IA 1IZ1A 3JZJA 1ATGA 1LSTA 1XT8A 5I57A 5AA2D 4FORA 3MC2A 4EXKA 3SEXA 5L9OA 1XVXA 1VR5A 1B40A 4X48A 3JYRA 5AA4A 4F19A 3MWBA 4ZECA 5HM4B 1MPDA 1N0TA 1N84A 3G3FA 1LAFE 3KOTA 1YAEA 4YU0A 2IEEA 3BFUA 1NH7A 2F35A 3CSBA 1A8FA 4EXLA 4QFLA 1IXGA 2HQ0A 4DXCA 1USYH 4E0XA 2B3BA 1QUJA 5DEXA 2XXQA 3D4CA 3T66A 4U22A 4QFKA 3MVZA 1MXVA 4IB2A 1B1HA 3IL1B 3T22A 2OBGA 2XXHA 1B3FA 2O7IA 5BUUA 2DXYA 3FV2A 3EF7A 3FGSA 4I8CA 4OENA 3EHUA 1R9QA 4G77A 5I56A 1WODA 2Y7KA 4P0IA 3VVDA 1DPPA 4F18A 3WAFA 3EHSA 2GRVA 1PDAA 3TCGA 1SW1A 3MBPA 1PB7A 2VOZA 3U92A 1QKAA 5CI5A 1VSOA 4IO6A 3UP9A 2XHDA 4NF6B 1URSA 1FTMA 1DOTA 4U4XA 1NNKA 4DE8A 1ZTYA 3MVXA 1D3KA 4XKNA 4P11A 5B7DA 1PBQA 3BFTA 4X1DA 4R2BA 1S50A 3MP8A 4PETA 3Q29A 3SEUA 4IO7A 5A5XA 2HXWA 5L9SA 4F31B 3EPEA 1MQDA 1BLFA 3MW0A 2GH9A 3V89B 2R9JA 4LONB 4GFRA 3OOAA 4ZS9A 4ELRA 2DQVA 2IA4A 3OO7A 5H8HB 2DXRA 4XKRA 1HSLA 1USYE 2DWJA 5JEIA 2ZYNA 3MP6A 1JW4A 3UA8A 2V93A 4Q5TA 2Z8DA 4M4GA 5JK4A 2I0BA 3V5AA 3B7DA 2V3UA 1B51A 4FIMA 1A8EA 1DTGA 4QSEA 4OEVA 3G3HA 4JSDA 1IITA 2ONSA 2XXXA 3ZSFA 2OLBA 1B7ZA 1XOCA 2OJTA 3GZGA 4X1BA 3PD8A 4LUBA 5TPAB 4NF8A 4HCYA 5IAIA 3TKDA 2Z8FA 4MBPA 2HZKA 1QUIA 3O6HA 4NE4A 4DXBA 1N7WA 3LUYA 4QSDA 4Z0IA 4WEPA 1MDP1 4HW8A 2AYSA 3DP6A 1FQFA 2HCAA 3LSLA 1J1NA 3PPPA 3AXFA 2P0SA 2F7AA 4OWDA 3IX1A 1P1QA 4FJPA 4Q30B 2XXIA 3TCHA 2I4BA 3UGWA 4GWOA 5H8SA 1XS5A 3SEWA 1XVYA 3DLNA 2DWHA 5K2YA 3TELA 1MRPA 3A3UA 1PBPA 3K6WA 1URDA 4Q0CA 1I6QA 2REGA 3DP8A 5FHNA 2RC8A 4FE8A 4H0WA 3MPKA 3V8XB 1YTVA 3FD3A 3C9HA 3S2VA 4F2OA 1B0HA 4NF6A 4F3SA 4YB6A 4GOTA 5I59B 2QJEA 2V3QA 4PFYA 3GXAA 4GL8A 1PEBA 4QFNA 3Q25A 5LOMA 3FXQA 4MF3A 1DPEA 2W7YA 3LSWA 4U1OA 4KYEA 3TFLA 2ONRA 4PFWA 3EN3A 1JVXA 2O7UA 5H8HA 4F2QA 1B1XA 4NEDA 1R6ZA 5FHOA 2Y7PA 3HO7A 3T96B 2UVJA 4GRKA 3FJ7A 2O6AA 1LCFA 3KJ7A 4G4PA 3TMGA 2VD3A 1FCKA 1IXIA 1UTHB 3KFMA 3QUFA 4IGRA 3IR1A 4POXA 4LP2B 3IAZA 5CBRA 1BTJA 3N6UA 3MQ9A 1AOVA 5CMKA 3RN8A 3ZKLA 1ZKBA 3O2AA 5FTIA 1MPCA 1N3XA 1A99A 5CC2A 4F3GA 4KI0E 5EYFA 1URGA 3W9VA 5TPAA 1UIVA 2I48A 1Y1ZA 2HZLA 2AL5A 2Q89A 3KBRA 1YPNA 3OELA 1B5JA 3ILUB 2I6EA 2OWTA 5AE4A 4JXIA 3H03A 2WKYA 2DS9A 3C35A 4OXVA 4KYDA 4WXJA 5CMCA 3BBRA 3O6GA 5CMBA 3HPIA 4ELPA 1OQHA 1MY1A 4F3BA 4H6DA 1NNFA 2UVHA 1MY4A 2HAUA 2H9BA 4G8NA 3R7XA 2RC9A 5KDTA 4LQ2A 1NFTA 3T93B 1RKMA 3MZBA 1LAGE 3MZ1A 4UACA 3GBAA 4G8MA 2O51A 3VDFA 3VE1B 1H44A 4FECA 1L5TA 5HPQA 1B6HA 3PMWA 2I58A 3CI8A 2FYIA 1SD3A 3D4GA 3SEYA 1GV8A 2H25A 4FATA 1MM7A 2Z22A 5JTYA 5I59A 3M3FA 4H8JA 2I3VA 3CRBA 1BIYA 4EQBA 3CG1A 5ITOA 5CBSA 3FUZA 4EF2A 1PB9A 2XD3A 2DVZA 1UTBB 3MVYA 4IO2A 4XTCQ 4RK9A 1LAHE 2VD2A 1OQGA 1NL5A 1OLAA 1GVCA 1M5EA 5I2NA 5H8NB 1OLCA 3OO8A 3OMBA 1CE2A 3KJTA 3U93A 2ABHA 3OSQA 5F1QA 3HN0A 1P1WA 4O3CA 4KCDA 2XX7A 1MXZA 2R6GE 3OO6A 3GBBA 2F97A 4BDLA 2R71A 2HAVA 1FW0A 1D4NA 2F36A 1UTHA 1DMBA 1FQDA 3BKIB 3WAEA 1IIWA 3T9XB 4QHQA 2D3IA 4DCYA 4OYVA 2GHAA 5KZTA 2H5YA 2OZZA 1LB9A 3IO6A 1Y4TA 3KOSA 4G68B 3L6HA 3G7WA 1SVXB 4AB5A 3N6TA 3H6TA 2YLNA 5I58A 1II5A 4M1VA 3VLVA 2Y7WA 1MM6A 2ALUA 4GF8A 3U94A 4IY6A 2RC7A 3FJMA 1B2HA 3A09A 3K2DA 3IJOB 3RTFB 4G68C 2VGQA 2XXVA 4OEUA 4KFQA 3TCFA 3PPNA 1ELJA 2Y7RA 4R6YA 3DM0A 2GHBA 2FA7A 4QSCA 2UYFA 4C1UA 3C34A 3QK6A 1US5A 3SETA 4EUOA 4OFLA 4C1TA 4ONYA 5FHMA 3KEIA 1VE4A 1IXCA 3M3LA 2ZNUA 3IOVA 4RXLA 3ODBA 1LFIA 4G8HA 3FIRA 2Q2CA 3MPLA 3C32A 1RYXA 3FJGA 1SBPA 3FXUA 2F6PA 1XHYA 4X9TA 3PV0E 2RCAA 4IO3A 4ELOA 2QS1A 1LLSA 3KZGA 2PYYA 2F5XA 4NF5B 3H6WA 1T0KA 4IO5A 2NOOA 3ILTB 1B5IA 1UTBA 1LB8A 4YMAA 3VXBA 4JWXA 4YMBA 1TXFA 4YICA 5DTBA 1N76A 1P1NA 4U21A 3U8QA 5H8NA 4F1VA 5CMMA 3HHFA 4XXUA 1N7XA 2F6GA 4ECFA 4LATA 4JWOA 3FVKA 3IORA 3TTKA 1Y1MA 5AA2B 2VHAA 3CFLA 3H6VA 3HHGA 4WEDA 3THIA 1JQFA 1JW5A 2UXAA 5DVJA 4XKPA 1B46A 2F34A 1Y4CA 4WKMA 4ZEBA 2XXPA 1NMUA 2PX1A 1SYHA 4DCXA 4NF4B 1F9BA 4AQ4A 1H43A 5ISUA 4G68A 2DE2A 3RQTA 1I6AA 4ZEKA 5HBCA 4HS7A 2E0SA 3KSXA 3LSXA 1MY0A 2Q88A 1XC1A 4RY1A 1ZMGA 1MXYA 2QS2A 4DIGA 4RPNA 4EDPA 2QS4A 2XX9A 2CZLA 4ESWA 2LAOA 3OEMA 2G93A 3S9NC 1OVTA 1IEJA 5B70A 5DVFA 1Y9UA 4NTLA 4ZEFA 3A3CA 2Q2AA 4BLAA 3RTWB 4EF1A 3H4ZA 1AMFA 1TT1A 4PFTA 1B3GA 2REJA 2A5SA 3T9UA 2DOJA 1LAXA 3H7MA 1I6BA 4MH5A 3RUMA 3FXRA 3L6GA 4RA1A 4YKJA 4F1UA 1MXXA 3VVFA 4UA8A 4RYAA 1ZJLA 1OMPA 2I4CA 2ZYOA 3K02A 1B4ZA 1B7UA 3QSLA 4NF5A 4TQUQ 2BJJX 3V83A 4HCWA 4OMBA 1B9JA 1LBBA 5TP9B 3K00A 4ZEDA 1RYOA 3TTLA 3LR1A 1DSNA 3I6VA 5ELVA 3O6IA 1SYIA 1ZBMA 1Q1KA 3OD7A 3E9XA 1OIBA 3U72A 3FV1A 1I69A 5H8QB 4PFUA 3S9EA 3SDFA 4XIGQ 5AA2A 1EH3A 2DWAA 3PMXA 4ELQA 3T9HB 2DVCA 4LZ5A 3CG3A 2QMXA 3O28A 4PQJA 3SESA 5CM6A 2XD2A 3MJNA 4YZZA 1JETA 3TUSA 3G3IA 4H5FA 2QPQA 2H99A 1LFGA 1FQAA 1MQHA 4F22A 4QF9A 4E0WA 4TOZA 4IO4A 2X26A 3OO9A 4F3PA 2DYXA 4R6HA 3R6UA 4C0RA 2HEUA 4R73A 4OFJA 1LBCA 2AIXA 4JWYA 3QYTA 3M3KA 4JDFA 4QFPA 5IKBA 4U23A 4GL0A 2QRYA 2F7BA 3B6TA 4JSOA 4BDNA 1MY2A 2XXRA 4NWCA 3RT6B 1MH4A 1FTKA 2DE4A 3TTRA 2PT2A 4JB7A 2ZMBA 2ESNA 2VP1A 3OXNA 1IUDA 3E3KA 4BDQA 4LQ5A 3SERA 1M5DA 3PGFA 5F7VA 2Y7IA 2D5WA 4PE5B 1D9YA 4P0GA 2DP8A 2D21A 5A5XB 3KN7A 2V3TA 1LCTA 5K2XA 2RINA 5TU0A 3HV1A 1JEVA 2XXYA 3K01A 4OQOA 3IJXB 1LGBC 1M5CA 3O66A 3JV9A 1R9LA 5AA3A 5M2VA 3MUQA 4FEDA 3RNNA 2F78A 3PUZE 3EHTA 4PP0A 5I2KB 4DXUA 1B5HA 2GFEA 1D9VA 4OFOA 4HTGA 4TLMB 1JEUA 2A5TB 1ZIUA 5DVIA 3KGCA 4YKKA 1GTKA 2H98A 3I3VA 4EQ7A 2O84X 3UN6A 1Z7NE 4RPOA 4F39A 4F1YA 3QIMA 4IY5A 3FVOA 4I9DA 1WVJA 2G29A 4N6PA 1QW0A 4KPTA 1B0LA 3K0VA 3O29A 3S4UA 3W15C 3IO4A 3TAJA 1MG1A 3F11A 1MDQA 3ECRA 4MLVA 2B65A 4LZ8A 3T9VA 2RF1A 1POTA 3H6UA 2X7PA 5TP9A 4NF8B 1JVYA 3LC8A 3H06B 4QFOA 1B7HA 4RK2A 1N04A 3N5LA 3C33A 2V25A 3K1NA 1MQGA 5H8QA 4R75A 3TTMA 5KCJB 1A40A 1FTOA 3MP1A 3IOTA 1PC3A 4NMYA 4GVOA 1Y3QA 3PD9A 1POY1 1AIVA 2OWSA 4OVJA 3U1OA 3FVNA 3TQLA 3CVGA 4GD5A 2ZNSA 3B6WA 2O69A 3G3GA 5H8FB 1LFHA 1B05A 4POWA 3TQWA 2O68A 2QMWA 3VLUA 2V84A 4N13A 1UQWA 1OVBA 4YB5A 3C31A 4OZ9A 3IOUA 3IB0A 1H45A 3PUVE 4KHZE 3E4RA 3ZS6A 3VFJA 4U4SA 1O64A 1JW1A 3PPOA 1TFAA 1Z7ME 2B3FA 4KCCA 3N94A 1GGGA 3MZ9A 1Y3NA 1NKXA 4YKPA 4KR5A 4YAHX 3TDJA 3QXMA 2P2AA 1EZOA 3DP4A 4DZ1A 3SKPA 1A54A 3G3JA 4LZ7A 2OCUA 4NWDA 1FTLA 3OEKA 1S7YA 3PUWE 2Y84A 4RNSA 4G2ZA 1FQCA 1N3WA 2UVGA 3Q26A 4U1ZA 3VV5A 1O7TA 3EQ1A 1KWHA 4ZE9A 3RLFE 3SEVA 3O97A 3K6VA 2O1MA 1FQBA 5I84A 5I2KA 2I0CA 5DT6A 4LA9A 1B4HA 2Q9TA 5BWJA 1B3LA 2A5TA 4BDRA 1Q35A 3PUXE 3Q27A 5ITPA 5J1DA 2M8CA 4LVQA 1EU8A 4R9FA 4YB7A 2P1SA 4GXSB 2RKMA 1H76A 3OSRA 1BKAA 1MQJA 4ESXA 5ICQA 4OHNA 3RGYA 3DELB 3CR9A 2NXOA 1B3EA 1AL3A 1B3HA 2ANJA 1B32A 4L17A 2YPNA 4KYSA 3PUYE 1SW5A 4U2RA 1VFDA 1P1UA 4ZZEA 2AL4A 4GQOA 4H5GA 4IGTA 3K1PA 2DSFA 2Z23A 4OETA 4QRZA 3QAXA 4BDOA 1NH8A 4Q8RA 3MVWA 5KCJA 3PU5A 2OK2A 4O3BA 1TWYA 2X7QA 1ANFA 1MY3A 2Z8EA 2HFBA 2ZYKA 2F7CA 3UIFA 1QULA 2CMOA 4O3AA 2DWIA 1YCJA 3C36A 4MFIA 5L8DA 1H3DA 5KDTB 1R1NA 1VFEA 2ZYMA 3RY3A 4GXAA 1NNPA 3N26A 1GR2A 2ZNTA 5H8FA 4AB6A 1US4A 2E1SA 5EHSA 3C4MA 1WDNA 3LSFB 1B52A 2F8DA 2QS3A 4K3FA 4F29A 4R2FA 1ZU0A 3K6UA 4GLIA 3PMVA 5L9MA 4ZDMA 2H4IA 1MQIA 2XXTA 3IB2A 1SI1A 5JTYB 3I5OA 3PPQA 4I62A 1Y3PA 5ICTA 1AH5A 4KQPA 3RT8A 1TFDA 3VVEA 4KD5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P1OA 3ONMA 2I49A 3K1MA 3KN3A 2PFYA 4GIZA 4R6KA 4R9GA 1SW2A 1SDXA 5I57B 3KN8A 3TODA 3TYHA 1A7LA 3KSJA 3S9MC 5AA4B 3OENA 1SI0A 1FSAA 1NUZA 3HCQA 5CRYA 4I1DA 2L5VA 4TLLB 5I2NB 1CB6A 2FNCA 3UK4A 3VXCA 4N07A 1QKBA 1PB8A 3FVGA 4ZZAA 1NV6A 1QVSA 5LTCA 4DDDA 3Q28A 1UIUA 3KG2A 5EHMA 1M5BA 2PVUA 3CFXA 3FZVA 2KLFA 3USDA 2O1LA 4X8RA 4ND9A 3K4UA 3TZAA 3H3GA 3R26A 3M8UA 1DTZA 1S9TA 2PT1A 2XWIA 3TEPA 1HSEA 2PMSA 3FASA 5DEXB 2Q8MA 4GX6A 2HXRA 4FAJA 1SQYA 3UORA 3T0JA 3FATA 3IK6B 2NUVA 3E13X 4MLQA 2I3WA 1INPA 1Y20A 1MXUA 4R74A 2THIA 5AA1A 1QJMA 1RDYA 4DLDA 1SW4A 5I58B 3IOWA 1O63A 3TPAA 3MAMA 3FBPA 4BDMA 2XXWA 1FQEA 1FBDA 3W9WA 4NF4A 5I56B 1IQ7A 1B58A 4PAFA 3G3KA 1IMFA 2ZXTA 4MX6A 4H1XA 3QUJA 2NVUB 1A55A 1MS7A 4ZE8A 5FTHA 4XKQA 1EZPA 3VLWA 3TTNA 1P99A 3S9LC 1HSJA 1EYIA 3B6QA 1KA0A 2ZZXA 4ZEIA 4PFIA 1M5FA 1NNTA 1IMBA 3HSTA 2Q8JA 1MH3A 4H65A 4R72A 2YJPA 2ONKE 3PPRA 2UVIA 4THIA 1FRPA 3ZKKA 2UYEA 2XX8A 3BIHA 3LBSA 1IXHA 4EQ9A 2RCBA 1ZLQA 1NV5A 4NG7A 4DI3D 3RPWA 5DYHA 4ISUA 2QL3A 2WBBA 4H67A 4Z7EA 4OERA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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