3H6WA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns5217 at 1.50 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 88
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA02
4LONB 2UVGA 4U1ZA 5FTIA 4LVQA 5H8QB 3CFZA 3KG2A 5ITOA 1IIWA 3IOUA 3EQ1A 4OQOA 3CIJA 1JW4A 4ZE8A 1HSJA 2HZLA 4JDFA 4EXKA 4RNSA 5CC2A 2DE3A 3MP1A 4RPNA 2DE4A 3Q28A 2XXPA 3M3LA 3U1OA 3IR1A 4DCXA 1M5EA 4Z0IA 1OVTA 4FJPA 3QK6A 4LQ2A 2G93A 4LZ8A 5I57A 3KZGA 3ECRA 3R26A 5FTHA 2RCBA 4JSOA 4PE5B 1FW0A 2H25A 4YU0A 3ZSFA 1GR2A 3K02A 3TCHA 5EHMA 4QFPA 5H8FB 1LAXA 1P1QA 1SYIA 3KN8A 5K2YA 2CMOA 3KFMA 3TCFA 4JWOA 3DM0A 3TTNA 3KEIA 2OBGA 3OO6A 1AL3A 4FATA 1QKBA 4DLDA 1LGBC 4F1UA 3U94A 3CFXA 4DIGA 3G3JA 3RT6B 4IY5A 2ONSA 3P7IA 3SEVA 4RXLA 4U21A 3LBSA 2OWSA 1OIBA 2CZLA 1LFIA 4GF8A 4C1TA 1US5A 4FAJA 1NFTA 1Y20A 3BFUA 1LB8A 3AXFA 3KJ7A 4WKMA 3RT8A 4R9FA 3TAJA 3TDJA 1MQDA 3OD7A 4HCYA 2QSXA 4NWDA 3VFJA 3MVYA 3ONMA 2DWIA 1FTJA 3O29A 3PPRA 2UXAA 1BIYA 4IO3A 3SETA 4EXLA 5L9SA 2DQVA 3E3KA 4OMBA 3EPEA 5CBRA 2P0SA 2KLFA 3PUXE 3VLUA 3USDA 5I56A 3PPPA 1RKMA 2OWTA 5TPAA 2QMWA 1B52A 2F6PA 4NF5B 4R74A 3K1PA 3MVWA 3SDFA 4GIZA 4C1UA 4G4PA 5CMKA 5I2KA 3GLBA 3PMVA 1DTGA 1FQFA 2V3UA 3O97A 4OXVA 1PBQA 4PQJA 3VVDA 2H5YA 4IGTA 1MXXA 2QS1A 2ZNUA 1MXZA 5TU0A 1N3XA 3MPKA 2B3BA 4GFRA 3T9UA 3U72A 5BWJA 3FUZA 3H3GA 1SW1A 3H03A 1R9LA 1TXFA 2Y7KA 3CSGA 2ONRA 1B5JA 4GXAA 4X48A 2ZXTA 3B6TA 2PMSA 4F39A 5H8HB 5ITPA 4F18A 5AE4A 4YB6A 3ODBA 4GRKA 2ABHA 4H5FA 1UTHB 5H8NB 4PETA 5DT6A 2GHAA 3MC2A 2A5SA 3RN8A 3N6UA 2ONKE 2V93A 3S9NC 3IL1B 3K0VA 3B6QA 3H4ZA 3UN6A 4FORA 1R9QA 4XXUA 2GHBA 1NMUA 3L6HA 1I6BA 3T93B 3UA8A 2ZMBA 3O6GA 4NMYA 4PFUA 4C0RA 2Q9TA 2I4BA 1B32A 2RC7A 2HZKA 3MVZA 1A8EA 3EHSA 2ZYOA 3T22A 3V83A 3U92A 4OYVA 3HV1A 1MQJA 4WXJA 4TOZA 1JEVA 2ESNA 3PPQA 2O1MA 3K6XA 1A40A 1GGGA 1RYOA 1MPDA 3I6VA 3MP6A 3CR9A 3LR1A 2PT1A 2YLNA 4TQUQ 2REGA 1L5TA 1B1XA 3BFTA 4F3GA 5A5XB 2DOJA 2AL5A 2WKYA 3A09A 3M8UA 1VFDA 4ZZEA 1JW1A 1O64A 3OENA 3OSQA 1A54A 3K1NA 4ELOA 1NNPA 4NF8B 1P1NA 1BKAA 1LAFE 1B40A 1MY3A 3TODA 1B3EA 5CRYA 3OMBA 5HBCA 1TFAA 5TP9A 3UK4A 1NH8A 3ZKLA 1PC3A 1JQFA 5IAIA 3KOSA 3OO8A 5TP9B 2O7UA 2RINA 1LLSA 5JTYA 2F7BA 4R73A 3RQTA 3IJXB 3TTLA 1WVJA 3FGSA 3IAZA 4ZE9A 3PUVE 3G3GA 1B5HA 2THIA 4F22A 3G3KA 1NL5A 2Q89A 2YJPA 4ZECA 5IKBA 2DS9A 1BP5A 3DP8A 3UORA 5I57B 3S2VA 1SDXA 1SQYA 2ZYKA 4U22A 2Y7PA 2QL3A 3PD8A 3QAXA 3QIMA 1S7YA 1PBPA 4LATA 4RA1A 1LBBA 1USYE 4F31B 5AA2B 3VXBA 4YAHX 1Z7NE 4Z7EA 1P1WA 1TFDA 3DP6A 2XXQA 4ELRA 5DEXA 1SBPA 4QSDA 1M5DA 1P1UA 3EHUA 3IB1A 1B4HA 4H65A 3C9HA 4QRZA 5DVFA 1OLAA 5HM4B 1D3KA 3S9EA 3A3CA 4MLQA 3TPAA 5JEIA 1UQWA 5AA1A 3VLWA 2Z8FA 3JYRA 4HCWA 1I6AA 2OJTA 4XKQA 3UIFA 3VLVA 4FE8A 4ECFA 2DWHA 4H8IA 3VVFA 2H9BA 3PV0E 3M3KA 4I8CA 4R6KA 4MH5A 5CMCA 1N76A 1JNFA 2ZYMA 1IZ1A 3B6WA 3PGFA 5DVJA 4BDOA 4F2OA 2G29A 4FECA 2V3QA 4XIGQ 4FEDA 4LZ5A 3OO9A 1I6QA 3FV2A 1QKAA 3JZJA 1QUJA 5KDTA 4F2QA 1MQGA 5DEXB 2V3TA 1MXWA 1UTHA 5H8NA 3OOAA 1IITA 4YMBA 3H6WA 3IK6B 2Z23A 3T66A 1UTBB 3DLNA 5JTYB 1S50A 1B5IA 3M3FA 1IXHA 1QVSA 3PD9A 4LZ7A 1CE2A 1P99A 4RPOA 1ZU0A 5I56B 1AH5A 1MXUA 1MXYA 4DXCA 5I84A 1MDP1 4DXUA 3V89B 1B3GA 2Q88A 4I9DA 4OEVA 3TCGA 1XVXA 5H8QA 2UVHA 2H4IA 1LAGE 1MPBA 2F78A 3N26A 1B3LA 4EF1A 2QS3A 4EDPA 1B3HA 5AA2A 3O66A 3IO6A 1MQHA 3BBRA 3K2DA 3RLFE 3MVXA 1LCFA 1FQAA 1O7TA 3G3FA 4F3PA 4U4XA 3RPWA 4U2RA 2QRYA 1B0HA 4DZ1A 2O6AA 3QXMA 1B6HA 1DTZA 3QSLA 4E0WA 3HHFA 1DPEA 4NF8A 2Q2AA 2ANJA 3EF7A 5I59B 2I4CA 3RGYA 2B3FA 3KSXA 1LCTA 1YPNA 2O68A 2I3VA 4IO5A 2RKMA 3PUZE 2NVUB 2XXUA 3RTFB 1B3FA 1H44A 1QJMA 2DXRA 2F97A 2HXWA 3CI8A 4KCDA 2E1SA 4KI0E 3C36A 4LP2B 5DTBA 3WAEA 1B7ZA 2B65A 1XS5A 5L9OA 3OELA 1LB9A 4KHZE 1URSA 2Z8DA 5L9MA 1ZKBA 1DPPA 2DYXA 2UYFA 4UA8A 4MF3A 2HFBA 1N7XA 3SESA 2F36A 1J1NA 1US4A 3V5AA 4GL8A 5J1DA 5KDTB 4PFWA 3FXQA 1QUKA 4IGRA 2AIXA 4ISUA 5L8DA 2BJJX 3SERA 2I3WA 1I69A 2ZNSA 1A8FA 2XX9A 3QUFA 1B46A 4OENA 2XXIA 4JWYA 4RK9A 1CB6A 1N3WA 1BLFA 2V84A 3MQ9A 1Y9UA 1LSTA 5HPQA 4JXIA 1TWYA 4YB7A 1B58A 3D4CA 4IO6A 4P0GA 3OO7A 2PBWA 2R6GE 2FYIA 4PFTA 4YMAA 1SI0A 2F34A 2X7QA 2XX7A 3FV1A 3LUYA 4H8JA 4THIA 2Q2CA 1OMPA 2H98A 4RYAA 3FIRA 4YKJA 5TPAB 2R9JA 3W9WA 2UVIA 1PB8A 2XHDA 3KOTA 2XXHA 3MUQA 4O3BA 1NNTA 3TELA 3PUWE 1B4ZA 3K00A 5ICQA 4I62A 4NEDA 1S9TA 3H6UA 3MZ9A 2PT2A 3H7MA 2VGQA 3PMXA 1AIVA 4U4SA 2I48A 3S9LC 3K6UA 4IY6A 1Q35A 2OK2A 1IUDA 3TYHA 5I2NB 1FQBA 1IXIA 2I0BA 3HN0A 2F35A 5EHSA 4JBZA 3O6IA 1MY2A 3EN3A 1ZTYA 1QW0A 2OCUA 4JB7A 4QFKA 3TKDA 1M5CA 4GOTA 3SEXA 2W7YA 1B05A 1PEBA 2P2AA 2UYEA 1ANFA 1B0LA 3QYTA 1URGA 4RJZA 3ZS6A 3B7DA 4N13A 4ZEFA 3BKIB 3VE1B 1VE4A 2XXTA 2GH9A 2XXWA 3EHTA 3GZGA 3I3VA 1MH3A 2HAUA 2HAVA 2XXVA 2UVJA 3H6VA 3PMWA 1MQIA 3FJGA 4NE4A 4KYDA 4OVJA 1JETA 4TLLB 2RC9A 3GBBA 4F1YA 2ZYNA 3W9VA 4P11A 4QFLA 2DVCA 2XD2A 1ZJLA 4F1VA 3D4GA 5F1QA 4PFYA 4GVOA 4G2ZA 3DP4A 1SW4A 5CM6A 1EZOA 1M5FA 4BDNA 4NF4B 3FATA 5AA4B 1R1NA 1FQCA 1D4NA 5FHMA 4JSDA 2F8DA 2HQ0A 1UIVA 1SW2A 1ELJA 1PB7A 2VP1A 5I59A 3LSWA 3Q26A 1A55A 1NNFA 3GBAA 4R6HA 4NTLA 1RYXA 1N0TA 1URDA 2O1LA 2VD3A 1QULA 3O2AA 1Y1ZA 4H6DA 1OQHA 3FVOA 3IOTA 4YKIA 4I1DA 3QUJA 3HHGA 1NNKA 2PVUA 4H0WA 4RY1A 4Q0CA 2AYSA 3OEKA 4OWDA 2Y7WA 1JEUA 5KCJA 3N94A 3CVGA 2DE2A 4Q30B 1EU8A 3UP9A 1Q1KA 3GXAA 5EYFA 2FNCA 4HS7A 2R71A 2Y84A 3RY3A 1AOVA 2VOZA 3OEMA 1XVYA 4YZZA 1Y4TA 1USYH 1GVCA 3TTMA 2Z22A 4BDRA 1ZMGA 2DWJA 4FEBA 3C4MA 4L17A 4G68B 3IB2A 4MFIA 4O3CA 1NKXA 4XTCQ 3TTKA 2QMXA 4U1OA 4KD5A 4XKPA 3V8XB 3ILUB 4U23A 2F7CA 4E0XA 4OFOA 4R6YA 4IB2A 1UTBA 3TMGA 4AQ4A 4ELQA 5F7VA 5M2VA 1MPCA 4BDQA 4DDDA 4H67A 1MM6A 4H5GA 1WDNA 3H06B 3G7WA 4G68C 1MXVA 3IJOB 1MY0A 3MP8A 1POY1 4P0IA 5I58B 3PU5A 3MJNA 2RC8A 4OESA 1ZIUA 3K6WA 3LSLA 1PB9A 4IO2A 4KR5A 4KYSA 2YPNA 3KJTA 1SI1A 4KPTA 1GV8A 5CMMA 5FHNA 1A99A 1LFGA 1VR5A 3C34A 4X9TA 2D5WA 2FA7A 4AB6A 1FQEA 3W15C 1EZ9A 2Z8EA 3E4RA 2AL4A 1F9BA 2NUVA 1XOCA 4LQ5A 4QFNA 3TFLA 2OZZA 1H43A 1MY1A 3MWBA 4OEUA 3RUMA 3K1MA 4R2FA 3TUSA 3IO4A 1N04A 4MBPA 3HCQA 4FIMA 4G68A 4IO4A 4G8HA 1POTA 3IOWA 1B2HA 2V25A 1KWHA 2DWAA 4Q5TA 3UGWA 4WEPA 5DYHA 4AB5A 3U8QA 3FZVA 4X1DA 3I5OA 3TQWA 3F11A 1EH3A 3C35A 3KN7A 4NF5A 4EQ9A 3R7XA 4WEDA 4GXSB 2O7IA 4DCYA 4QHQA 1P1OA 2VD2A 3DELB 4UACA 3T9VA 2PX1A 4ESWA 4F29A 4NWCA 4R9GA 3FVNA 4POXA 1B7UA 3G3IA 1B1HA 1IXGA 2O51A 3FVKA 1YAEA 4ZEIA 1H76A 3KBRA 3H6TA 1N7WA 1QUIA 1R6ZA 3IOVA 4DE8A 2NOOA 4F3SA 3TQLA 5BUUA 3SKPA 4KFQA 1HSLA 3N5LA 2A5TB 3O28A 3C32A 1Z7ME 2NWJA 3RTWB 5A5XA 4XKNA 4R75A 2ZNTA 3CSBA 1FTMA 4ZDMA 1BTJA 1DMBA 4QSCA 1XHYA 1FTKA 1YTVA 1II5A 1WODA 1XC1A 2O84X 1MG1A 2REJA 3CRBA 2I49A 4NF6A 3TZAA 4GL0A 3VDFA 3KSJA 2XD3A 4OHNA 4QSEA 4TLMB 3RNNA 3HPIA 1TT1A 1AMFA 3LC8A 3PPOA 1FCKA 3O9PA 4ND9A 1H45A 4EUOA 1JVXA 2X7PA 5ICTA 4G8MA 1SYHA 3U93A 2HEUA 1B9JA 1FTOA 3K4UA 3Q29A 2O69A 1OLCA 2XXRA 5I2KB 4YICA 5KCJB 2I0CA 4M4GA 3O6HA 3PUYE 4N6PA 4OERA 1GTKA 3C31A 3HSTA 4YKKA 1O63A 2Q8JA 5B7DA 3CG3A 4KCCA 1IEJA 1H3DA 1Y3PA 2A5TA 1UIUA 3JV9A 3K01A 1MDQA 3VVEA 2D3IA 3WAFA 2I58A 2NXOA 4MLVA 3S4UA 3ZKKA 5H8HA 3MAMA 4GQOA 3ILTB 4H1XA 3LSXA 4YKPA 5I2NA 2E0SA 5H8SA 1JW5A 1OQGA 1D9VA 2HCAA 3E9XA 4O3AA 2LAOA 1T0KA 3Q25A 2M8CA 2H99A 4NF4A 4X1BA 5K2XA 2QPQA 5AA4A 4ELPA 1LBCA 3VXCA 4F3BA 4OETA 5B70A 3SEUA 4KYEA 4LA9A 1A7LA 3IB0A 4F19A 5AA2D 4QF9A 1VFEA 5DVIA 1MS7A 4HW8A 2QJEA 2I6EA 5LOMA 2IA4A 1Y3NA 3OSRA 4XKRA 3PPNA 3T9XB 3SEWA 4OFLA 4G8NA 4QFOA 3LSFB 4GWOA 2D21A 4ESXA 3T96B 1LFHA 3HO7A 3L6GA 3R6UA 1OVBA 4OFJA 4GD5A 4OZ9A 1Y4CA 3FVGA 4DXBA 1FTLA 1NH7A 1PDAA 4KQPA 4RK2A 2Y7IA 4R2BA 4NF6B 3FJMA 1SW5A 3K6VA 2GFEA 3MBPA 4ZZAA 4ZEDA 5H8FA 2DP8A 2F7AA 3CG1A 4ZEBA 4EQBA 2QS2A 3N6TA 2VHAA 4OTEA 1HSEA 1Y3QA 2ALUA 2DSFA 3MZBA 5CBSA 1EZPA 1LAHE 3FASA 5CMBA 1SD3A 3VV5A 5I58A 5KZTA 2DXYA 4EQ7A 5JK4A 3MW0A 1D9YA 2F5XA 1ZLQA 2XXYA 1M5BA 3MZ1A 3KN3A 3OXNA 4BLAA 1MRPA 3G3HA 2XXXA 5FHOA 3FXRA 3THIA 2OLBA 1Y1MA 1DOTA 1YCJA 3SEYA 2PYYA 4BDLA 4ZEKA 1MY4A 3MPLA 4LUBA 3S9MC 5ISUA 3Q27A 3IX1A 4EF2A 3KGCA 4N07A 2RCAA 4IO7A 2P1SA 1JVYA 5ELVA 4JWXA 3FXUA 1IQ7A 4PP0A 3TTRA 2QS4A 4M1VA 2Y7RA 4G77A 3FD3A 3TEPA 4HTGA 3A3UA 2F6GA 2IEEA 1ZBMA 1XT8A 1DSNA 4GLIA 4K3FA 5CI5A 5AA3A 3T9HB 3C33A 1SVXB 4Q8RA 1MM7A 2GRVA 4BDMA 3FJ7A 1N84A 1B51A 2X26A 1ATGA 4YB5A 4ZS9A 1B7HA 1VSOA 3IORA 2DVZA 2RF1A 1IXCA 1MH4A 4ONYA 4R72A 2XX8A 1FQDA 4POWA 3CFLA 3E13X
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UVGA 4U1ZA 3EQ1A 3CIJA 2HZLA 4JDFA 4EXKA 4RNSA 2XXPA 2OWZA 4LZ8A 3QK6A 5A5LA 5FTHA 1FW0A 3ROJA 1YYZA 5ET7A 5EHMA 1LAXA 1P1QA 1SYIA 5K2YA 4PGNA 3KEIA 1LGBC 4NQ8A 3G3JA 2ONSA 3LBSA 2OWSA 1OIBA 4GF8A 1LBYA 3BFUA 3RT8A 3TAJA 1MQDA 3VFJA 1NV7A 3E3KA 3EPEA 2B4MA 1EYKA 1B52A 4NF5B 5I2KA 4G4PA 3GLBA 3PMVA 4OXVA 1PBQA 4IGTA 1MXXA 5TU0A 1N3XA 3U72A 3H03A 1FPFA 3B6TA 1NI9A 4F39A 5AE4A 4GRKA 4PETA 3S9NC 2ONKE 1LEVA 4MJOA 2GHBA 1IMEA 1FJ9A 3O6GA 2WBBA 2Q9TA 1B32A 2HZKA 3EHSA 3T22A 3HV1A 4TOZA 2F3BA 5T3JA 1A40A 5IZZA 1Q9DA 4TQUQ 1L5TA 4F3GA 2DOJA 2AL5A 1VFDA 4ZZEA 3OENA 4KXPA 1A54A 4NF8B 1BKAA 1B40A 5TP9A 3OMBA 4HXVA 5TP9B 1LLSA 3QMFA 1FBPA 4R73A 3RQTA 3TTLA 3G3GA 1B5HA 4F22A 4AS5A 5IKBA 2DS9A 3UORA 1SDXA 1SQYA 2ZYKA 5ET5A 3PD8A 1S7YA 4RA1A 1LBBA 1TFDA 3DP6A 1SBPA 1D3KA 4MLQA 3TPAA 5JEIA 1UQWA 5AA1A 3VLWA 1I6AA 4FE8A 5I3SA 3VVFA 2H9BA 3M3KA 4MH5A 3BIGA 1JNFA 3B6WA 4NGUA 4XIGQ 4LZ5A 3OO9A 2QVRA 3FV2A 4F2QA 1MQGA 2QVUA 3H6WA 1UTBB 1B5IA 3M3FA 1QVSA 4N17A 2Q88A 1XVXA 2UVHA 1B3HA 5AA2A 1FQAA 4XF5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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