3H6WA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns5217 at 1.50 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 88
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA02
1PEBA 2F8DA 4POXA 3U1OA 1TFDA 4U1ZA 4R75A 4YKKA 2D5WA 2X26A 4F1VA 4X48A 2UVHA 4GOTA 3EN3A 3T22A 1AMFA 2ZYKA 3FJMA 4TLLB 2E0SA 1RKMA 1IITA 4G68B 1AOVA 2HXWA 4KD5A 1D9VA 4BDQA 1MY0A 5CC2A 3U92A 4QFNA 3M8UA 3RTWB 3ZKKA 2FA7A 4FJPA 4GLIA 3T9VA 1XOCA 3UGWA 1Q1KA 3Q28A 1XT8A 3TTKA 2R71A 3PPPA 5AA1A 1YCJA 3TPAA 3IOUA 3CG1A 3KJ7A 1JEUA 1GV8A 4RK2A 5TP9A 2OK2A 4PFTA 1B4ZA 1P1WA 2YLNA 4NEDA 1DMBA 1VE4A 4I1DA 4KR5A 1OIBA 2PBWA 3C35A 2E1SA 5ITOA 1A40A 3TUSA 3JV9A 3SETA 4BDNA 3KJTA 4I62A 1LBCA 3CR9A 5KZTA 1NMUA 4JWYA 4FATA 3H6WA 2I3VA 4NTLA 3FD3A 3HCQA 2D3IA 4R9FA 4LATA 2VD3A 3DP6A 5IAIA 1SW1A 2B3FA 2QS4A 3FVKA 4YKJA 2VHAA 5I56B 2KLFA 4ESWA 1FQEA 2RC9A 3C34A 3CIJA 4KPTA 4P11A 2XXRA 3K6UA 3OO8A 1JW1A 1B46A 1MY1A 2Y7PA 4OERA 4AB6A 4F29A 4ZDMA 3VXCA 3FXUA 1MM6A 4X9TA 2XXPA 1M5FA 5BWJA 4PP0A 4R2FA 1IXIA 2ABHA 5AA2B 3TZAA 5AE4A 3VVEA 4NMYA 4LZ8A 3Q25A 3MVZA 2RF1A 1P1UA 5LOMA 3ILUB 2F6GA 3O66A 1MM7A 5F1QA 1B40A 3C32A 2Z8FA 4UA8A 3TAJA 1F9BA 2M8CA 1OMPA 1N84A 3E3KA 4GD5A 1PBQA 2XXVA 3H7MA 4LZ5A 1SI0A 4OVJA 4DXCA 4Q8RA 4U4SA 4EQBA 1MXWA 3LR1A 4IGTA 1CE2A 1LFHA 5EHSA 1M5BA 1VFDA 3LSXA 1MXZA 5H8QA 5I59A 5H8FA 4OEVA 3LUYA 3KN7A 5DVJA 1QUIA 4GIZA 3S2VA 1QVSA 4F3SA 1I69A 5L9MA 5KDTA 5CMCA 3QSLA 4R72A 1B6HA 1GR2A 2X7PA 4GXSB 4FEDA 4KFQA 1QUJA 5H8HA 4GRKA 1IUDA 4OHNA 2I48A 3FXRA 4H5GA 1B2HA 5CBSA 1SI1A 4P0IA 4THIA 1A99A 1LAHE 1UTBA 3MP8A 1DPPA 2XXHA 2F6PA 1LGBC 3QXMA 1USYE 4QFPA 3B7DA 3D4CA 4YKIA 4G4PA 4ECFA 5I2NA 2GRVA 4F18A 2F7CA 4GWOA 1ZU0A 4QHQA 4Z0IA 1UTHB 1SYHA 4ZECA 3I5OA 3BFTA 2F35A 1B0HA 3OD7A 3MUQA 1L5TA 1QW0A 2UVJA 5I57B 3O2AA 5FHMA 1BIYA 3FV2A 1SW4A 3C9HA 3DP4A 3IJXB 4HW8A 3E4RA 1MDP1 1DTZA 3K1NA 1VFEA 1B4HA 1VSOA 2PT2A 4JWOA 2THIA 3S4UA 2DVCA 3CG3A 4OZ9A 2UYEA 5A5XA 2HZKA 2ONKE 2QS2A 5KCJB 4OFLA 2ZNTA 1B58A 4F1UA 3T9HB 2A5SA 3PUYE 3FATA 2XX9A 2R6GE 4NF5A 4MFIA 1LFGA 5CMKA 3PD9A 4XIGQ 1QUKA 3OXNA 4NF8B 4IB2A 3ECRA 4FEBA 4ISUA 4C1TA 1O7TA 3PMWA 4F2QA 4DCYA 3VVDA 3QYTA 4LONB 4NE4A 2F78A 3ZKLA 2I0CA 5I58B 2OCUA 2YJPA 3K01A 1D3KA 1A55A 3R6UA 4PQJA 2ZXTA 5ICTA 4ZEDA 3MC2A 3TKDA 1LSTA 1MXVA 2RCBA 2DP8A 3U72A 2VD2A 3UA8A 2RC7A 4YB5A 2H98A 4M4GA 4NF6B 3S9EA 1SDXA 2XD3A 3KG2A 4U1OA 3OSRA 4OFJA 4ZS9A 3TTRA 1QJMA 3T96B 5DVFA 1YTVA 3CI8A 2Y7KA 1JW4A 4HCYA 1TXFA 5DVIA 5JTYB 3QAXA 1A54A 3QK6A 1MY2A 4U23A 5CI5A 3I3VA 1D4NA 1FCKA 3OMBA 3TYHA 3CFLA 2HAUA 4KI0E 4F19A 5H8HB 4RXLA 3TTNA 3G3FA 3V5AA 1H76A 2OLBA 1Y4TA 1HSEA 1B7ZA 4AQ4A 1DPEA 3IK6B 3EHSA 3S9MC 3U8QA 1FTOA 4IGRA 2XXQA 2X7QA 1UTBB 5FHNA 3IJOB 2GFEA 4X1BA 4U21A 3UN6A 1NNTA 4RY1A 2ALUA 4G8MA 3SEWA 2GHAA 3FXQA 1URDA 5CMBA 2VGQA 3PPRA 2Z8EA 4NF4A 4N13A 1IZ1A 1SQYA 3MVXA 5H8SA 1N3XA 1LAFE 2F36A 4ND9A 3RT8A 3RPWA 2DWIA 2DWAA 5DT6A 1OLAA 5DEXA 4KQPA 3DM0A 2Q89A 1MQIA 3H06B 3ZSFA 1LFIA 2I0BA 5K2XA 1H3DA 1B1HA 4TQUQ 1LCFA 3F11A 2UXAA 3FV1A 4EQ9A 4H0WA 3K6VA 2QSXA 4F3BA 1IXCA 4OYVA 3TCGA 3VLUA 1FW0A 1ZTYA 1B3GA 1M5DA 3HHGA 4BDOA 3USDA 1MQDA 3Q29A 2ZYOA 3IO4A 3BBRA 1BTJA 5A5XB 1Y3QA 1POY1 1AIVA 2V25A 1B7HA 4XKNA 3IB1A 2I4CA 3S9NC 3E13X 2H5YA 4F2OA 3KEIA 4ELRA 1Z7ME 3W9VA 3AXFA 2XXWA 4YB7A 2CMOA 2DE2A 1M5CA 3A3CA 1FTLA 1I6BA 2PYYA 2H4IA 4O3AA 3FVOA 1Q35A 4KCDA 1OVTA 4MBPA 4QSEA 4WEDA 3RUMA 1PB7A 4H65A 3K2DA 1O63A 1JNFA 2DWHA 1AH5A 3PPQA 1P1QA 2QL3A 2REGA 4JSOA 5JK4A 1NH8A 4OENA 2AYSA 2F7BA 3Q26A 4FE8A 2XXXA 2XXIA 1PBPA 3MPLA 5TPAA 3LSWA 3TCFA 3M3FA 3MQ9A 1UIUA 5H8NA 3TTLA 4KCCA 4RYAA 1UQWA 5BUUA 4F22A 4YZZA 1OQHA 2QJEA 2HAVA 4QSCA 3OOAA 1O64A 4FIMA 1SYIA 4KYSA 1LB9A 4OMBA 3HN0A 4IO4A 2XX8A 1RYXA 4JDFA 4HS7A 2ZMBA 3C36A 4R6KA 1B3FA 2IA4A 3EQ1A 3EHUA 1MXYA 2H25A 1NL5A 2NUVA 1IQ7A 5IKBA 3MZBA 4PFWA 5B70A 2Q88A 1HSLA 3V83A 3MAMA 4EXLA 4WXJA 3P7IA 3FVNA 4GL0A 1J1NA 3FIRA 1JEVA 1SBPA 4OQOA 4H8JA 1H45A 4RK9A 3H6VA 3R7XA 2O6AA 1WODA 1IXHA 3IOTA 5FTIA 3TFLA 4ZEIA 5AA3A 3MBPA 1LLSA 4BDLA 3T66A 2Q2AA 5ISUA 4POWA 4PETA 1FTMA 4YAHX 1B3EA 2VOZA 3JZJA 4OXVA 2VP1A 1R9QA 5I2KA 4JWXA 5FHOA 5DEXB 5FTHA 4ESXA 1M5EA 2GH9A 3UP9A 2RC8A 4Q30B 3SESA 1LAGE 3IL1B 1IIWA 3G7WA 3KN8A 2P1SA 1NFTA 1EZ9A 2B65A 1MG1A 3GLBA 3BFUA 3PMXA 2DOJA 2HQ0A 3FZVA 1SW2A 2DQVA 2PX1A 3IO6A 3RGYA 1RYOA 3H6TA 1ELJA 4M1VA 2B3BA 4R2BA 5TP9B 3W15C 4RNSA 4IO3A 2OJTA 4YMBA 3OEKA 2GHBA 4MLVA 3IOWA 3FASA 2NVUB 4BLAA 1R6ZA 1B7UA 2AL5A 1AL3A 3K0VA 4U4XA 5DYHA 4DE8A 1P1OA 1SD3A 3PGFA 1MPDA 1TWYA 3PPOA 1Z7NE 1N7XA 2OWSA 4AB5A 4OESA 3U93A 2V3TA 5HM4B 4ELPA 1ZLQA 3MWBA 3BKIB 1XC1A 3L6HA 1Y20A 4ELOA 3WAEA 2Q2CA 4XXUA 1VR5A 4DDDA 1US5A 2QS1A 1PB8A 1B52A 2V93A 2O7UA 1TT1A 4LQ5A 4IO2A 4K3FA 2Y7IA 1JVXA 3L6GA 4GFRA 3FGSA 2REJA 1Y1MA 2Z8DA 4JXIA 4EF2A 4ELQA 4Q0CA 1EH3A 3C33A 1QKAA 2IEEA 4IO5A 4KHZE 1P1NA 1EZPA 2BJJX 4ONYA 3SEXA 1B05A 2DE4A 3W9WA 3KBRA 1LCTA 3M3KA 4ZZAA 3O29A 3TODA 4N07A 1NH7A 4P0GA 3IR1A 3O9PA 4EDPA 3G3JA 1PDAA 3K00A 1N0TA 4YMAA 1MY4A 4MF3A 1R9LA 1D9YA 1MPCA 2V3QA 3RNNA 1MY3A 3EF7A 3DLNA 3R26A 2YPNA 5H8QB 5I59B 2CZLA 4JSDA 4EXKA 5H8FB 4R6YA 1KWHA 2H9BA 3GBBA 3OO7A 2UVIA 4EQ7A 5KDTB 1B5HA 3PUWE 3K1PA 3M3LA 1I6QA 3H03A 2F97A 3PD8A 3PU5A 1B0LA 2Y7RA 1BP5A 4GF8A 3HHFA 5I2KB 4WKMA 3E9XA 3VV5A 5I84A 3T9XB 4ZZEA 4IO7A 1HSJA 2ZNSA 4H8IA 2PMSA 4F3GA 2OBGA 4TLMB 3QUFA 4H67A 2UYFA 3SEYA 3FUZA 2I3WA 3FVGA 3RTFB 3KOTA 3T9UA 2I4BA 4PE5B 4BDRA 5EYFA 1ZIUA 1US4A 2QPQA 4PFYA 2DWJA 5ICQA 3N94A 1Y3PA 1MXXA 1USYH 1LB8A 5I2NB 2XXTA 3RLFE 1MQHA 1QKBA 3RY3A 3CFZA 1GTKA 3EHTA 2O84X 3C4MA 5L9OA 1Y3NA 3B6QA 3SDFA 5JEIA 4MH5A 2ANJA 2DVZA 3LSFB 4LUBA 1T0KA 3S9LC 4DXBA 1FQCA 1MRPA 2O51A 1OLCA 3N5LA 2O69A 3CSGA 2I49A 3MJNA 4YICA 5DTBA 2FYIA 1UIVA 3IOVA 3JYRA 4XKQA 5L8DA 4LP2B 4XKRA 4R9GA 1GGGA 3HO7A 3N6TA 3OO9A 5CRYA 3B6WA 3PUXE 3MPKA 4JB7A 3H6UA 4ZE9A 4RJZA 3HPIA 2XHDA 2UVGA 3MZ9A 4EUOA 3PV0E 4NF5B 1XVXA 3N6UA 1UTHA 1NNPA 3G3HA 4G68C 4KYEA 1IXGA 5HBCA 4GVOA 1NNKA 3CFXA 3O6IA 5M2VA 4O3CA 1ZKBA 2W7YA 4G8HA 1JETA 1BLFA 2A5TA 3V8XB 1BKAA 1EU8A 1OQGA 3OELA 3B6TA 1MS7A 3H3GA 5I57A 3TTMA 2G93A 3CRBA 5AA4A 1QULA 4IO6A 2ZYMA 4Q5TA 1POTA 2V84A 1XVYA 1JQFA 4GQOA 3OO6A 3KZGA 2QS3A 4QSDA 1DOTA 3TDJA 5J1DA 3SEUA 4UACA 2DSFA 4NWDA 2Q9TA 4OTEA 2ESNA 4WEPA 2NOOA 3N26A 4OETA 3KFMA 1YAEA 5KCJA 3A3UA 3K4UA 1Y1ZA 1DTGA 2P0SA 3DELB 3G3KA 4H5FA 1JW5A 4EF1A 2DYXA 3C31A 2O1MA 3U94A 1NKXA 4ZE8A 1WDNA 3RT6B 4TOZA 2O7IA 4NF8A 3CVGA 3MZ1A 4DIGA 2ZNUA 1XHYA 3VVFA 2PVUA 3SKPA 2OWTA 1MPBA 2G29A 2PT1A 4E0XA 3PUVE 2ONSA 2RKMA 3ZS6A 1ZJLA 3KOSA 2QRYA 3UIFA 1FQBA 4IY6A 5I58A 2V3UA 2P2AA 1ATGA 1GVCA 4O3BA 3UORA 4KYDA 1S7YA 4R6HA 1MH3A 4RA1A 2RCAA 1B51A 3MVWA 2HFBA 2HEUA 1WVJA 3DP8A 4U2RA 4Z7EA 3KSJA 3PMVA 4NF6A 1B5IA 4QFOA 3TCHA 3I6VA 5AA2D 1URSA 1NNFA 1N7WA 5TU0A 3TQWA 1I6AA 4XKPA 1B9JA 1MQGA 3HV1A 4G77A 1DSNA 4NF4B 4DZ1A 3KGCA 5EHMA 4C0RA 2NWJA 2FNCA 2F7AA 5CBRA 1LBBA 3KSXA 5JTYA 3LSLA 4DXUA 1Y4CA 4LA9A 4N6PA 4IY5A 3OEMA 3CSBA 3TQLA 3ONMA 4ZEKA 3MW0A 5K2YA 1TFAA 3KN3A 1B3LA 2QMWA 2I58A 1YPNA 3IX1A 3LBSA 1SW5A 1A7LA 2ONRA 2Y84A 4HCWA 1MH4A 4H1XA 1MXUA 3EPEA 2XD2A 1OVBA 4L17A 2WKYA 3QIMA 4MLQA 3WAFA 3O28A 3PUZE 4H6DA 3ILTB 3IB2A 2D21A 2R9JA 2AL4A 3TMGA 2DE3A 4F31B 5B7DA 2I6EA 2DS9A 2HZLA 4GL8A 4FAJA 1A8EA 3D4GA 4I8CA 1FTKA 4YKPA 4X1DA 4F39A 1PC3A 2XXYA 1B3HA 1CB6A 4DLDA 1II5A 3H4ZA 2DXRA 2A5TB 5L9SA 4QFKA 1Y9UA 1A8FA 4G68A 4R73A 4QF9A 1MQJA 4QRZA 4F1YA 3G3IA 3K02A 2Z23A 1ZMGA 1B32A 4F3PA 4RPOA 5AA4B 2O68A 3VLWA 3THIA 1R1NA 3GBAA 4U22A 1FQDA 4JBZA 2Y7WA 4XTCQ 2XXUA 4G2ZA 2AIXA 3LC8A 4RPNA 5TPAB 3SEVA 4I9DA 4LZ7A 2Q8JA 4FECA 1URGA 3VFJA 1N04A 5H8NB 3MP6A 4YB6A 1ZBMA 3VE1B 3MP1A 3T93B 3FJ7A 3RN8A 1FQAA 4OFOA 3RQTA 3GZGA 4LVQA 2XX7A 3K6WA 4YU0A 3TEPA 5CMMA 1N76A 2LAOA 2NXOA 4ZEBA 3V89B 3O97A 2DXYA 3HSTA 4E0WA 4OEUA 5I56A 3MVYA 3VXBA 1B5JA 2Z22A 1ANFA 2H99A 3ODBA 3O6GA 3GXAA 3OENA 4OWDA 2ZYNA 1PB9A 3K1MA 1P99A 3O6HA 1IEJA 1FTJA 5AA2A 5ELVA 3PPNA 1H43A 1XS5A 4R74A 4LQ2A 4ZEFA 5ITPA 1H44A 5CM6A 3IAZA 1EZOA 3K6XA 1SVXB 3IORA 4QFLA 1MDQA 5F7VA 3VDFA 5HPQA 2O1LA 4G8NA 2OZZA 4PFUA 3UK4A 1S50A 2RINA 3FJGA 1JVYA 2HCAA 4BDMA 1N3WA 3SERA 4GXAA 2F34A 3IB0A 2F5XA 1S9TA 3A09A 4FORA 3G3GA 4HTGA 1LAXA 2QMXA 3QUJA 4DCXA 3OSQA 4C1UA 3Q27A 1FQFA 3VLVA 1B1XA 3TELA 4NWCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PEBA 5I7IA 2F8DA 4POXA 3U1OA 5EYHA 1TFDA 4U1ZA 4R75A 4YKKA 2D5WA 2X26A 4F1VA 4X48A 2UVHA 4GOTA 3EN3A 3T22A 1AMFA 2ZYKA 3FJMA 4TLLB 3EKIA 4P56A 2E0SA 1RKMA 1IITA 4G68B 1AOVA 2HXWA 4KD5A 1YXIA 1D9VA 4BDQA 1MY0A 5CC2A 3E78A 3MYUA 3U92A 4QFNA 3LUZA 3M8UA 3RTWB 3ZKKA 2FA7A 4NGUA 4FJPA 4GLIA 3T9VA 1FBCA 1XOCA 3UGWA 1Q1KA 3Q28A 1XT8A 3TTKA 2R71A 3PPPA 5AA1A 1YCJA 1FBFA 3TPAA 2P3VA 3IOUA 3CG1A 3KJ7A 1JEUA 4N6DA 1GV8A 1FBHA 4RK2A 5TP9A 2OK2A 4PFTA 1B4ZA 1P1WA 2YLNA 4FBPA 1DMBA 4NEDA 1VE4A 4I1DA 4KR5A 1OIBA 2PBWA 3C35A 2E1SA 5ITOA 1A40A 3TUSA 3JV9A 3SETA 4BDNA 1NV5A 4XEQA 3KJTA 2FIEA 4I62A 1LBCA 3CR9A 5KZTA 1NMUA 5EQAA 4JWYA 4XF5A 4FATA 3H6WA 2I3VA 4DI3D 4NTLA 3FD3A 3HCQA 2D3IA 4R9FA 4LATA 1LBYA 2VD3A 3DP6A 2WBDA 2CEYA 4HXVA 5IAIA 1SW1A 2B3FA 2QS4A 3FVKA 4YKJA 2VHAA 5I56B 2KLFA 4ESWA 1FQEA 2CZIA 2RC9A 3C34A 3CIJA 4NHBA 4KPTA 4P11A 2XXRA 3K6UA 3OO8A 1FTAA 1JW1A 1B46A 1MY1A 2Y7PA 4OERA 4AB6A 4F29A 4ZDMA 3VXCA 3FXUA 1MM6A 4X9TA 2XXPA 1M5FA 5BWJA 4PP0A 4PFRA 4R2FA 1IXIA 2ABHA 5AA2B 3TZAA 5AE4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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