3H6WA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns5217 at 1.50 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 88
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA02
4WKMA 2REGA 3MZBA 3V89B 2F6GA 3DELB 2PX1A 2F97A 1I6QA 4PFUA 1LAFE 1NH8A 4TQUQ 5K2XA 1XT8A 1NH7A 2DWIA 2ZYKA 3N94A 4IO4A 1JW1A 4M4GA 1DOTA 1MG1A 3RNNA 2H4IA 3LC8A 3H6UA 3G3IA 1BP5A 1IQ7A 4I9DA 4I62A 3FVGA 1JETA 4O3AA 1JVYA 2G93A 4NF6B 3Q26A 3BFTA 3U8QA 3IO6A 5B7DA 1GTKA 2P1SA 4JWYA 5CC2A 1UTHB 3W15C 4F22A 4YICA 3GXAA 3MP6A 4G4PA 3V83A 4IO5A 3R26A 2NUVA 3SERA 1PC3A 2X7PA 3FVKA 4P0GA 1MS7A 3SKPA 3MWBA 1QULA 4QFKA 3RN8A 3M3FA 1N04A 3KEIA 4U1OA 1GV8A 1B6HA 1FTJA 2RC7A 4ND9A 3KOSA 4JB7A 5ITPA 2P2AA 3FVOA 3UGWA 1P1WA 4EXLA 1QKAA 2NOOA 4NWDA 2DYXA 1BKAA 1HSLA 4Z7EA 2A5SA 1EZPA 2ABHA 4H1XA 2O1MA 1QJMA 2ZYMA 2XD2A 4G8MA 1A54A 2E0SA 4ECFA 1B32A 5I58A 3THIA 1QKBA 1LSTA 1MXZA 2F35A 4R9FA 3RT6B 4O3BA 3Q28A 1N76A 3T96B 3IOUA 1DMBA 4ZEKA 1JQFA 4OETA 3MBPA 3FXQA 3VV5A 3ZS6A 1CB6A 4UA8A 3KZGA 4GVOA 3CI8A 4F3PA 4F2QA 3MW0A 4R2BA 2O69A 4H5FA 5CMCA 4OHNA 1MQGA 2CZLA 2F34A 4RNSA 4L17A 4ONYA 4RXLA 1AMFA 2RINA 1H43A 1LLSA 3DLNA 2QPQA 3IORA 4F18A 3C32A 4NEDA 2Q88A 3L6GA 3TDJA 3C33A 1KWHA 3W9VA 4R6KA 5DYHA 1AOVA 3I6VA 3S9EA 2Q89A 3SEUA 3O6HA 4H67A 1IIWA 2PBWA 3MUQA 3DP6A 3TELA 2VGQA 1NNPA 4QSCA 1IEJA 4DXCA 1ZMGA 3CG1A 1B3LA 3TEPA 3QSLA 3EF7A 1HSJA 1YTVA 4P0IA 3N26A 4E0XA 5LOMA 3QK6A 2O84X 2O7IA 1L5TA 3T66A 2ZYOA 3LSXA 5H8NA 1FQBA 2DWAA 3VLVA 3FV2A 5BUUA 5CRYA 2X26A 3E9XA 1Y1MA 3U94A 1R1NA 1WODA 3VDFA 1XC1A 1N7WA 3HHGA 3K6XA 3KBRA 2WKYA 1SQYA 1IXCA 4ZE8A 1JVXA 1MXXA 2OZZA 1B0LA 1SW2A 1IXGA 5B70A 1DTGA 3OD7A 3VFJA 3IOVA 1M5EA 5I59A 1Y1ZA 3OXNA 5AA1A 1P1UA 2H9BA 3VE1B 3EHTA 4Z0IA 2AIXA 4GFRA 2RC9A 2F36A 4R75A 3PU5A 1MY1A 4YKJA 3O66A 3UK4A 4NE4A 3EHSA 4KI0E 2QMXA 4EF1A 1URDA 5HBCA 1FQDA 3C4MA 3K00A 1TT1A 1JNFA 3N5LA 1URSA 1VSOA 3MVZA 3R7XA 1N84A 2RKMA 4HCYA 3PPOA 3FV1A 2XXQA 5J1DA 3FGSA 4QSEA 1R9LA 4QSDA 3LUYA 4RA1A 3TTNA 3PV0E 4NF8A 1B2HA 4OERA 2XXHA 3CSGA 1FQCA 3D4CA 2XXXA 2I3WA 3U72A 2F8DA 3W9WA 1WVJA 2PMSA 4ZEBA 4U2RA 4R6YA 3K0VA 4RPOA 1FQFA 5ITOA 3BBRA 3WAEA 3OO7A 4ZEDA 3KOTA 3KN8A 1MPBA 4XIGQ 3QUJA 2V84A 2DOJA 2KLFA 1N7XA 3CSBA 4XKPA 4EQ7A 2DQVA 1B7ZA 1MXVA 1XVXA 1Y3QA 1B4HA 1A99A 1A40A 4ZEFA 2I6EA 4R2FA 3K02A 2O68A 3O97A 3IO4A 1M5CA 3DP8A 3UP9A 3KSXA 5L8DA 5F7VA 3TCFA 1SYHA 1B40A 2B65A 3C31A 3T9VA 1PEBA 1PDAA 3PPRA 3T93B 4PP0A 4DDDA 1MM7A 5CM6A 4Q0CA 4OXVA 4FATA 3HN0A 4BDRA 3WAFA 2GFEA 2UYFA 4JSDA 2F7AA 1MY0A 3GBAA 3A3UA 4QF9A 2THIA 1J1NA 3H6WA 4QFNA 3ZSFA 4JXIA 1SBPA 1MPCA 2DE4A 2V25A 3L6HA 2XXTA 1QUKA 1NNTA 1A7LA 5M2VA 4YKKA 4OESA 5JTYA 4F3GA 3IJXB 1QUIA 5TU0A 3TZAA 4ZS9A 5H8NB 3SEYA 4KQPA 2F5XA 3KJ7A 3QIMA 4PFWA 4Q8RA 3KN3A 1NKXA 4F19A 1MY2A 3MVXA 3K1NA 2QS2A 3CG3A 3CFXA 1F9BA 3S9MC 3TTLA 2I49A 4ISUA 3IB2A 3O28A 3N6UA 3SESA 2UVHA 4FE8A 2Y7KA 3UIFA 2PVUA 4OMBA 3T9UA 4X1BA 3H06B 3PMXA 5I59B 5FHOA 1O7TA 2ANJA 3LBSA 3O6IA 2V3QA 3CR9A 1MXUA 3S9NC 1SW1A 4LZ7A 1RYOA 4GXAA 2HQ0A 1US4A 3S2VA 3KFMA 1UQWA 1Z7NE 1Y20A 4YB5A 4GRKA 2Y7PA 1DPEA 3V8XB 3K6UA 4RK2A 4G68C 3TUSA 2V3UA 1B5IA 4YB6A 3FJ7A 4F29A 3IL1B 2HFBA 2IEEA 3K6VA 2DP8A 3PGFA 4NF8B 5ELVA 4H65A 5TPAA 3D4GA 1OVBA 3TAJA 1OMPA 5I57A 2UVGA 4ELOA 2I4CA 2Y84A 5TP9A 4F3BA 2VOZA 1EZ9A 1PBPA 1I6AA 3MC2A 4OYVA 4ELQA 4OQOA 2FA7A 1MDP1 4ELPA 1FW0A 1ZKBA 1WDNA 4ZDMA 2I3VA 3MZ9A 4Q30B 3FUZA 3MP8A 3PPNA 4YZZA 5H8HA 4F1UA 3K1PA 1SW4A 2B3FA 5AA4A 3H4ZA 3VVFA 4QFLA 3UA8A 3VVDA 2UYEA 3OO9A 4U22A 3O29A 3FASA 4YU0A 4NF4A 4RK9A 1N3XA 4KCCA 1VR5A 2FYIA 4YB7A 3OO8A 3TYHA 1R9QA 2XX7A 4GXSB 2DXYA 1H45A 2Q8JA 1TXFA 2CMOA 5I56A 1NFTA 4KD5A 3KN7A 2OWTA 3E13X 4OZ9A 1P1NA 5DVJA 3PD8A 3H6TA 1POY1 1A8EA 3OEMA 4DCYA 4LQ2A 1GVCA 3G3JA 3O9PA 1LB9A 1RYXA 2E1SA 3CVGA 3IB0A 5JTYB 2Z22A 3RQTA 4DXUA 2IA4A 3VXBA 4NMYA 4LP2B 4PQJA 3EQ1A 2HCAA 2YPNA 2DVCA 4K3FA 1SI0A 2ZNSA 1M5DA 5CBRA 4OFLA 1UTBA 2XXVA 4HS7A 3JV9A 2OJTA 3O6GA 2GHAA 4OFJA 3VVEA 3G3KA 3IAZA 3Q27A 4R74A 4NWCA 4IO6A 1TWYA 4GD5A 1NNFA 2H98A 4DCXA 3K1MA 1Z7ME 1B3FA 5HPQA 1TFDA 2R71A 4QFOA 2QS4A 1O64A 4EDPA 3PUZE 4RJZA 4FORA 5BWJA 1POTA 2W7YA 2XD3A 3TFLA 1LAXA 4PETA 4WEDA 4JWOA 1MQJA 1FTLA 3A3CA 3FVNA 1H3DA 3RUMA 4O3CA 3HV1A 1MPDA 1B4ZA 5TPAB 4YMBA 1D3KA 1DPPA 3U93A 3TTRA 4HCWA 3IK6B 5I57B 5TP9B 4FEDA 3MAMA 3IX1A 3B7DA 4EXKA 2AYSA 2OLBA 1ZU0A 2AL5A 2OBGA 2ZMBA 5L9SA 2H5YA 4U4SA 4ESXA 2Q9TA 2HAUA 1B3GA 4NF5A 1B3HA 5FHMA 3G7WA 5H8HB 5AA4B 1YAEA 3EPEA 3I5OA 3Q25A 3ONMA 2ZNTA 3RT8A 4DZ1A 3PMVA 2Y7RA 4NF4B 1D9VA 1II5A 1ZJLA 4OENA 1MY4A 4OTEA 5JK4A 2DWHA 3MPKA 2I4BA 1VFDA 1MH3A 2Q2AA 1GGGA 3QYTA 5I58B 3RPWA 2I0CA 4YAHX 5I56B 4F31B 5AA2A 4HTGA 5EHMA 3FXUA 2XXPA 4RY1A 2XXUA 3LR1A 1BIYA 1YPNA 4U23A 5I2KA 5AE4A 1LGBC 1MDQA 3FJMA 3QAXA 4IO7A 1XS5A 1OQGA 1USYE 4IY5A 1MXYA 5KCJA 4GLIA 4ZECA 2Q2CA 4BDLA 1UTHA 2R9JA 1PB7A 5FHNA 3SEVA 4LZ5A 3IB1A 1EH3A 1IUDA 3JYRA 2PT2A 2XXRA 4R72A 4DIGA 4N13A 4XKQA 3TQWA 1NNKA 4PFYA 1Q1KA 3T22A 2QL3A 2DE3A 4X9TA 1B05A 2VD3A 2ZXTA 2I0BA 3SETA 3E4RA 3ILTB 2FNCA 4XKNA 4OEVA 5FTHA 5DTBA 2F6PA 4PFTA 5I2NA 3TCGA 4EQ9A 4OWDA 3CIJA 3HHFA 1MRPA 2HXWA 4R6HA 1B52A 3M3LA 4H8IA 2Y7WA 4R73A 2UVJA 4QHQA 5JEIA 3PUXE 4G77A 4ZE9A 2AL4A 4LUBA 2O7UA 4OVJA 3OENA 2QS1A 3PMWA 3MZ1A 2DE2A 3S9LC 3SEXA 1B7UA 2H99A 4LVQA 4C1TA 3FJGA 1PB8A 1PBQA 5DT6A 1ZBMA 1ELJA 1AH5A 1OIBA 4KHZE 3PUWE 1MQDA 1FQAA 5H8QA 1MXWA 2D5WA 3U92A 2VHAA 1S7YA 2DSFA 1LAHE 3HSTA 1USYH 1ZLQA 4U1ZA 1MQIA 2HZKA 2REJA 4FAJA 1B1HA 4JWXA 1LFIA 1LCFA 2NVUB 3C34A 2BJJX 3OSRA 4NF5B 1IXHA 3K2DA 2RC8A 3V5AA 1URGA 1MM6A 2QJEA 2A5TA 2Z8EA 1B51A 1QUJA 4WXJA 3VLUA 3FATA 3VLWA 5FTIA 3RLFE 3N6TA 3TTMA 4QFPA 1UIUA 2DXRA 4F1YA 5DEXA 5DVIA 1B5HA 3CFLA 3TTKA 3MPLA 1ATGA 2H25A 2HZLA 4IB2A 2LAOA 1OLAA 5AA2B 4KYSA 2ZYNA 5L9OA 1O63A 3DP4A 4F1VA 1NL5A 3TCHA 1BTJA 5I2KB 2XXYA 3T9XB 1P1OA 2O51A 2G29A 4I1DA 2HAVA 3QXMA 2XXWA 5KCJB 4ESWA 2RF1A 3HCQA 1EU8A 4IO3A 1YCJA 5K2YA 4P11A 1SDXA 5A5XA 3OMBA 4IGTA 2V3TA 1QVSA 5ICTA 4FEBA 3LSWA 1VFEA 4N07A 3BFUA 2QMWA 1MQHA 1NMUA 4THIA 3B6TA 4MLVA 2ONRA 2O6AA 2Z23A 1US5A 4GWOA 3OEKA 5IAIA 5CI5A 3G3HA 1P99A 3A09A 1RKMA 1IITA 1FCKA 1LAGE 5CMMA 1LCTA 2XXIA 1SYIA 5I2NB 4EF2A 3S4UA 4HW8A 1FTMA 1Y3PA 2P0SA 1UIVA 4KPTA 3VXCA 4POWA 2NXOA 2M8CA 5I84A 1LFHA 2RCBA 1B46A 4X48A 3JZJA 1I6BA 2DVZA 3PUVE 1JEUA 3IJOB 4BDQA 4G68A 1SD3A 1MH4A 1AL3A 4MBPA 2F7BA 4FIMA 3RY3A 4AB6A 4F3SA 3F11A 4Q5TA 4WEPA 4MH5A 4GQOA 3MQ9A 2HEUA 3KSJA 1OQHA 4GL0A 1B7HA 2GH9A 3P7IA 4KCDA 2NWJA 4YMAA 3OELA 3PD9A 5IKBA 1DSNA 3KGCA 4C0RA 1A8FA 2X7QA 4GL8A 5H8QB 3H3GA 2Y7IA 3MVYA 3PPQA 4U4XA 1Y3NA 3R6UA 3M8UA 3EN3A 1N0TA 5H8SA 1MY3A 2GRVA 1LBCA 1ZTYA 3G3FA 1ANFA 3C9HA 4KYEA 5F1QA 3GZGA 4ELRA 4DXBA 2I48A 2A5TB 3K01A 4TLLB 1SVXB 4XTCQ 4ZZEA 3CRBA 1M5BA 3LSFB 1S50A 4GIZA 2V93A 2R6GE 2D3IA 3FD3A 2PYYA 3FIRA 3IOTA 3MP1A 4ZZAA 5ICQA 4ZEIA 3SDFA 3C36A 4AB5A 2ONSA 1DTZA 4MF3A 5DEXB 3IOWA 2XHDA 4LONB 4KFQA 1PB9A 4EQBA 1A55A 3FXRA 5EHSA 3EHUA 4XXUA 4I8CA 4YKIA 4BDOA 2VP1A 1OLCA 2QS3A 2QSXA 3RTWB 1Y9UA 4BDNA 2Z8DA 3IR1A 3ILUB 3MVWA 2ZNUA 3K4UA 4RYAA 5DVFA 4LQ5A 1I69A 4FJPA 5H8FA 4DE8A 4LATA 4F2OA 5KDTA 5A5XB 3UN6A 4G8HA 1JW4A 1SI1A 4IO2A 3GBBA 4RPNA 3GLBA 4OEUA 1EZOA 3BKIB 5HM4B 4H0WA 4LZ8A 1LBBA 5KZTA 3UORA 3QUFA 3H03A 3TQLA 5CBSA 3KG2A 2ALUA 2RCAA 3FZVA 3H7MA 3G3GA 2UVIA 3ZKKA 1BLFA 2F78A 3TODA 2OK2A 5ISUA 2F7CA 1XVYA 4G68B 5CMBA 3RTFB 1OVTA 4NF6A 2D21A 4M1VA 1FTOA 4YKPA 4G2ZA 3OOAA 4JSOA 4N6PA 3KJTA 3ODBA 1FQEA 3Q29A 3HPIA 4H6DA 3O2AA 4PE5B 4GOTA 3OO6A 2XX9A 3USDA 4H5GA 4GF8A 3RGYA 2OCUA 3ZKLA 4IGRA 2DS9A 3LSLA 2I58A 3H6VA 1UTBB 1LFGA 2QRYA 4MFIA 4LA9A 1B0HA 1LB8A 1Y4CA 4QRZA 1B58A 1JW5A 2GHBA 3OSQA 3PUYE 1B9JA 4DLDA 1N3WA 3I3VA 3AXFA 4JBZA 1JEVA 1XOCA 3U1OA 1T0KA 3T9HB 2Z8FA 5AA3A 1CE2A 1AIVA 2PT1A 2YJPA 4X1DA 4E0WA 1M5FA 3TMGA 1HSEA 2O1LA 4AQ4A 4R9GA 4XKRA 4BLAA 4H8JA 1XHYA 3TKDA 3HO7A 5EYFA 4IY6A 3MJNA 3M3KA 1H76A 4UACA 1B1XA 1GR2A 4F39A 4U21A 1SW5A 4TOZA 1S9TA 1IXIA 1FTKA 2DWJA 2B3BA 4TLMB 3DM0A 5L9MA 4BDMA 4KYDA 1ZIUA 3C35A 2OWSA 4KR5A 5AA2D 2VD2A 5CMKA 3SEWA 4JDFA 1B5JA 2XX8A 4EUOA 1IZ1A 4G8NA 3ECRA 3B6QA 4OFOA 4NTLA 2UXAA 3PPPA 1QW0A 3TPAA 2ONKE 1VE4A 4POXA 1R6ZA 1B3EA 1Q35A 2ESNA 4MLQA 1Y4TA 5H8FB 3CFZA 3B6WA 4C1UA 1D4NA 5KDTB 4FECA 1P1QA 1D9YA 1TFAA 1H44A 2YLNA 3E3KA 3K6WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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