3H6WA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns5217 at 1.50 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 88
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA02
4NMYA 2P1SA 2M8CA 4UACA 1MM7A 3PMVA 3TYHA 4BDRA 3CFLA 2NVUB 1A54A 5L9MA 5B7DA 2OWTA 2HAUA 4P0GA 2F34A 2RC7A 3VE1B 1JQFA 3D4GA 3RTFB 4U4SA 3ECRA 2DVZA 4GL0A 2DE2A 2Z8DA 1MPDA 3ILUB 3IOTA 3CR9A 3EN3A 4QFPA 1D3KA 4XKNA 4O3AA 3G3HA 3SEUA 4H0WA 3ZKKA 2V3QA 2Q88A 1I6BA 1SVXB 3PPRA 4QHQA 4O3BA 4LZ8A 2XXVA 3JV9A 4LZ5A 2ZMBA 4JWXA 3TDJA 2ZNUA 5DEXA 4PFUA 4ELPA 3G3KA 3D4CA 2DSFA 2ZNTA 4LQ5A 2REGA 4OENA 4GQOA 3VVDA 3TMGA 3SERA 3DP8A 4X48A 2YJPA 5DTBA 1OLCA 3EPEA 4OZ9A 2P2AA 3RPWA 4G4PA 1ZLQA 5F7VA 2O1LA 4LQ2A 1LSTA 1N84A 3KJ7A 3A09A 3K01A 4OXVA 4FECA 3N26A 2F7BA 2IEEA 2DWHA 3MZBA 1WDNA 1Y3QA 1FW0A 3MC2A 4IO6A 5TP9B 4QF9A 1B3EA 3F11A 3IX1A 3QYTA 1UTHA 4TLLB 4ZEFA 2Z22A 1YAEA 3V89B 3PPPA 4QFLA 2V3TA 4G2ZA 4C0RA 5TU0A 3PUWE 1MPCA 3CRBA 3MVYA 1Q1KA 2PBWA 5DYHA 3O66A 1H76A 3FUZA 3G3IA 4F19A 3M3KA 4YU0A 1H43A 2I3WA 5J1DA 3FV1A 1ZU0A 1AH5A 4YKKA 4NTLA 2UVHA 4N07A 4KHZE 1B9JA 4NF5B 4JWOA 4JXIA 2AIXA 4AB6A 5K2XA 5ELVA 4PFWA 3QK6A 4GOTA 1TFDA 3O28A 1D9YA 1DOTA 1NH8A 4G68B 3BKIB 3KGCA 4YAHX 1USYE 3Q26A 3UP9A 2F5XA 1MY3A 2UXAA 4FE8A 1N76A 1RYOA 2RC8A 4YB6A 2QRYA 4ZDMA 3UN6A 2XXTA 5CMMA 3MZ9A 4WEPA 1A7LA 1P1WA 4POWA 2DWJA 3TEPA 3LSFB 1LFGA 2DP8A 4YB7A 4PFTA 3TCFA 3EF7A 4QSCA 2O69A 5H8QB 5KDTA 1VFDA 1DMBA 2I4BA 1T0KA 5JK4A 2E0SA 5CMCA 1OVTA 1D4NA 3N6TA 2BJJX 1SW2A 1B3LA 3R7XA 4KYDA 1N0TA 3QAXA 4I62A 3FXRA 1JETA 3E9XA 3H4ZA 4IY5A 2XD3A 4H5GA 4Q0CA 2ESNA 5FTHA 1MXUA 5I57A 1QKBA 4XKRA 4F2OA 2OK2A 3M3LA 4JDFA 4QSEA 3FVOA 5A5XB 5EHSA 4H6DA 5AA2B 1NNFA 3RQTA 3TUSA 1SI1A 1R1NA 1JEUA 4Z7EA 3U1OA 1MQJA 1UQWA 1DTZA 3T22A 4ZE8A 3GXAA 3E3KA 1PB7A 2ZXTA 1PBQA 5DVFA 3BBRA 1MS7A 4OFJA 3FGSA 1NNKA 4PQJA 4GXAA 2H99A 4R6KA 1XVXA 4F22A 1B32A 1UIVA 3C32A 2UYEA 1NKXA 3USDA 4UA8A 1XT8A 4IO4A 3K6VA 5H8SA 1FQCA 1WVJA 1SYIA 3KJTA 1MH3A 2VP1A 2DWIA 2PT1A 3PD8A 1IXIA 4KYEA 1BTJA 3EHSA 2X26A 1FQDA 5JEIA 3GLBA 1N7WA 4OHNA 1NMUA 1US4A 1MQDA 5H8HA 1FCKA 1IXGA 5I84A 2OZZA 1ZKBA 2PX1A 3JZJA 4EF2A 3UA8A 3KSJA 3OD7A 3L6HA 3T9UA 5CI5A 4KFQA 2D5WA 4U2RA 4I9DA 3TODA 3OSQA 2I4CA 1FQEA 1TWYA 1ATGA 3I6VA 5BUUA 4H65A 2ANJA 3MJNA 2FYIA 2X7PA 4R6YA 4DXCA 1CB6A 1SI0A 1L5TA 3TTRA 2QMXA 4MLVA 3VFJA 2NXOA 2DE4A 3O6HA 1B7HA 4Q30B 1RYXA 1EZOA 2VOZA 4C1TA 2V3UA 1B0HA 2DQVA 3TPAA 4TQUQ 2XXQA 4ELQA 3W15C 2I49A 3FXQA 4U4XA 1R9LA 2H25A 1YPNA 1D9VA 4M4GA 3AXFA 1EH3A 1FTMA 2XXXA 1PEBA 3RN8A 2XXWA 3PPQA 3RGYA 3MVWA 1SDXA 3UK4A 2RINA 2G93A 3RT8A 1Y1MA 2B3FA 4GRKA 3MZ1A 1LGBC 3IJOB 1B3FA 1Y4CA 2HFBA 1JEVA 1TFAA 2H4IA 2OCUA 1I6QA 2GHAA 1F9BA 3MPLA 3FVGA 3B6QA 2AL4A 1QUIA 2DWAA 5HBCA 1OLAA 3V83A 4X1BA 3KSXA 3Q25A 1OQHA 5EHMA 1MY1A 2O84X 2UVIA 5EYFA 3KZGA 2Z8FA 3SDFA 1S50A 3CI8A 3G7WA 5LOMA 2QS4A 4ESWA 1ANFA 5H8FB 3H6VA 3OOAA 3C4MA 4BDQA 4MBPA 3IK6B 5H8NA 4WEDA 5TPAA 2ZYOA 3FVNA 3C33A 1GTKA 3S9LC 4AB5A 2UVJA 1SQYA 3B6TA 2ZNSA 3A3CA 3K6WA 1DPEA 3PUXE 1MH4A 3SKPA 3M3FA 1O63A 5HPQA 1A40A 1FQBA 1UTBB 2O51A 5KCJA 4ZEBA 4F2QA 3VXCA 4ZEIA 5AE4A 2A5SA 2DVCA 5AA4B 2RKMA 2QS1A 4KR5A 1OVBA 4R9FA 1MXZA 1Z7ME 3GZGA 4XKQA 4K3FA 3DP6A 2DS9A 3K4UA 4GLIA 3FJ7A 5I2KA 2VD2A 4G77A 3BFTA 3V8XB 1PBPA 2G29A 3K6UA 4POXA 1ZMGA 3RTWB 2THIA 3HHFA 1URSA 3K00A 3B7DA 3KG2A 4EUOA 1MXYA 2HQ0A 3PPNA 4BDLA 5I59A 5I58B 3E13X 2B65A 3PMWA 1IXCA 1MXXA 1II5A 2HCAA 3TZAA 1M5BA 3WAEA 4R9GA 4RK2A 1B5IA 1MQHA 2DXRA 2I48A 2F6GA 3Q27A 3DM0A 3R26A 3VLUA 2O7IA 3T93B 4NF4A 1LB9A 4ESXA 3RNNA 3CFZA 4NF8B 3IB0A 4WXJA 2VHAA 2A5TB 3PUYE 4DXUA 5ITOA 4BDOA 1OMPA 4HTGA 2OJTA 2XXRA 3GBBA 2DOJA 4GIZA 3OENA 3KN3A 2F7AA 4IGTA 2YLNA 1SYHA 1AL3A 4RPNA 1WODA 1GR2A 1SW4A 2Y84A 2H98A 1JNFA 4QFKA 1MXWA 3VVEA 4F29A 1PDAA 3O97A 4G8HA 2X7QA 3TTMA 4R72A 5CM6A 4NF6A 1B3GA 4BDMA 5JTYA 1I6AA 4OESA 1H3DA 1POTA 4F31B 4C1UA 3PUVE 3T9VA 2GHBA 3FJMA 3IOUA 3N5LA 1QULA 4JSDA 1SW1A 1DSNA 1URDA 3S2VA 2AL5A 1POY1 1MG1A 2W7YA 3A3UA 3O29A 5DEXB 1Y20A 1HSJA 1EZPA 1QKAA 3O9PA 5I2NA 5AA3A 3K1PA 1LAFE 4JSOA 3IB2A 3PV0E 1XS5A 3P7IA 3LR1A 5I56A 1B52A 3SESA 2E1SA 4F3PA 3IL1B 3TQWA 1B3HA 1N3XA 2I3VA 3PU5A 4R6HA 4U1OA 3DELB 3FASA 4IO3A 3MP8A 1QVSA 5IKBA 1M5CA 1MY0A 3N94A 1IXHA 1QUJA 1NNTA 3SEYA 3IOWA 3MW0A 2CMOA 4X1DA 4U23A 3FV2A 4OMBA 3H6UA 2V84A 1AMFA 2UVGA 5AA1A 3MBPA 1KWHA 2R71A 1IUDA 1UTHB 3H6TA 3MQ9A 4HW8A 2KLFA 4N6PA 3CSGA 4IGRA 1MY2A 4M1VA 3TAJA 1LAXA 4TLMB 4N13A 3I3VA 4XTCQ 3KOTA 2Q2AA 4RYAA 1LLSA 3N6UA 5ITPA 4JWYA 3VVFA 1B6HA 3G3FA 1S9TA 2I58A 3DP4A 4EQ9A 4H8JA 3HN0A 3RUMA 3EHTA 2V25A 4OWDA 1LCTA 3U8QA 3IB1A 4PE5B 1NH7A 2HZLA 4H8IA 3OO6A 3KFMA 3W9VA 4ZEKA 2RCBA 2XXPA 4I8CA 1QJMA 1FTJA 5IAIA 4ND9A 1B0LA 1S7YA 4GWOA 1VR5A 4P11A 4LA9A 1NFTA 2F97A 3G3JA 3OO9A 1GGGA 4OETA 1R9QA 3Q29A 1SW5A 2XX7A 4TOZA 4ECFA 1Q35A 3SEXA 4R74A 4WKMA 4EDPA 4MFIA 2QMWA 5KDTB 4ZEDA 4F18A 4F1VA 4EXKA 1LAHE 2R6GE 4ELRA 4ZECA 3OSRA 1B2HA 4PFYA 3ZS6A 1I69A 4ONYA 3UIFA 2Z23A 2Y7KA 1M5EA 3TELA 4BDNA 4R2BA 1P99A 5CRYA 2Y7RA 3H7MA 1P1QA 2OLBA 2QL3A 3CVGA 5ISUA 4G8MA 1MY4A 1BP5A 1HSLA 2FA7A 1US5A 3I5OA 5I57B 2OWSA 1NL5A 4PP0A 3QUJA 4IB2A 3OO7A 2CZLA 4ZS9A 2QS2A 3U72A 1MQGA 1P1OA 3E4RA 1LFHA 4F39A 1JW5A 3EHUA 1ZTYA 1FQFA 2O7UA 1MXVA 5DT6A 1XOCA 2YPNA 3OEKA 5F1QA 4Z0IA 5CBSA 5CMKA 1GVCA 2F8DA 1IITA 4FEDA 2F35A 4R75A 4OTEA 1N04A 5ICTA 4RK9A 3LSWA 4DZ1A 4PETA 3CFXA 3K1NA 2XXYA 5HM4B 4Q5TA 5L9SA 5TP9A 3HHGA 3PUZE 1MQIA 4F3BA 2GRVA 3EQ1A 3IAZA 3K0VA 3VXBA 5H8HB 3C9HA 2ALUA 3MPKA 1N7XA 4LATA 2NWJA 3T9HB 1CE2A 4QRZA 1QW0A 2V93A 5M2VA 1BKAA 3QUFA 4EF1A 3PGFA 3C35A 1JVXA 1MDP1 3O2AA 4NF5A 1LCFA 3VLVA 4Q8RA 4HCWA 1NNPA 1AOVA 1GV8A 4NE4A 4G68A 2Z8EA 3T96B 3TFLA 1M5DA 3MP6A 4U21A 1ZBMA 5ICQA 1BIYA 1IEJA 4JBZA 3DLNA 4OVJA 3VDFA 4DE8A 2O68A 1B51A 4ISUA 1PC3A 1B4HA 3PPOA 4YMAA 5H8QA 3S4UA 4YZZA 4H5FA 4R2FA 2ONKE 4EQBA 3T66A 3HPIA 4QSDA 3RLFE 4F3GA 1DTGA 4OEUA 2ZYNA 3RT6B 3M8UA 1B5JA 3WAFA 4FAJA 1QUKA 1B05A 2XXIA 3TKDA 1A8FA 3ZKLA 3FATA 2H5YA 2VGQA 3MP1A 2H9BA 4RXLA 3KEIA 3V5AA 4GXSB 2I0CA 1ZIUA 2I0BA 3OO8A 4JB7A 1JVYA 2PMSA 3FZVA 1B7UA 3HCQA 4XXUA 4YICA 2OBGA 5A5XA 3SETA 4YB5A 2Y7PA 1FQAA 5CMBA 3UORA 3MUQA 5AA2A 1B58A 3TTNA 4DIGA 3HO7A 2ONRA 1B7ZA 3FJGA 3UGWA 3KN7A 4MF3A 2RCAA 4YKIA 2GH9A 5B70A 1FTOA 4KQPA 1Y9UA 2F78A 1H45A 4EXLA 3VV5A 2QPQA 1A99A 1FTKA 3MWBA 1URGA 5H8NB 5TPAB 1R6ZA 4QFOA 1VFEA 3ILTB 5FHMA 3IOVA 3JYRA 5CBRA 3QSLA 4YMBA 1EZ9A 1JW4A 3O6IA 1M5FA 4DXBA 1MM6A 2QSXA 3T9XB 3TQLA 1RKMA 2XXHA 4GD5A 1USYH 3K2DA 5KCJB 2P0SA 5FHOA 1B4ZA 2LAOA 4F3SA 3GBAA 3CG1A 4DDDA 4KYSA 3QXMA 2HAVA 2Y7WA 1LAGE 2GFEA 2Q89A 2I6EA 3R6UA 3TCHA 2Q9TA 2ZYKA 4GL8A 1LBBA 1MRPA 3OEMA 1JW1A 4RY1A 4IY6A 3QIMA 3H3GA 2Q2CA 3PD9A 2VD3A 2F6PA 4RNSA 1IIWA 4OFOA 2Q8JA 5I2KB 4P0IA 2F36A 1XVYA 1O64A 5K2YA 1B1HA 1SBPA 1YCJA 4DLDA 2B3BA 2O6AA 1P1UA 1O7TA 3KN8A 4KCCA 3K02A 2D21A 1PB8A 1PB9A 5CC2A 5I59B 2XX9A 4IO5A 2WKYA 4G8NA 3K1MA 1IQ7A 4FJPA 4RJZA 1BLFA 4GVOA 2XXUA 1J1NA 4ZE9A 2NOOA 3C36A 1P1NA 2RF1A 1A55A 1B5HA 2Y7IA 1B46A 2FNCA 3TTKA 2XHDA 1XC1A 2ZYMA 4U22A 4NF4B 2F7CA 1A8EA 4OYVA 5L9OA 3TTLA 4FATA 2DYXA 1B40A 1LFIA 2REJA 1FTLA 3PMXA 2D3IA 4GF8A 3K6XA 4GFRA 4YKJA 3ODBA 2HEUA 1DPPA 4ZZAA 4F1YA 3CIJA 3SEWA 3LSXA 1B1XA 4ZZEA 1LB8A 1TXFA 3Q28A 3H06B 4EQ7A 4L17A 3L6GA 4IO7A 3O6GA 4NF6B 1MDQA 1TT1A 4OERA 5JTYB 1SD3A 2O1MA 2DE3A 4YKPA 5FHNA 4F1UA 3U94A 4MLQA 2ABHA 3IJXB 2PT2A 3FD3A 2NUVA 3IO4A 3G3GA 3OMBA 4H67A 2UYFA 1EU8A 3B6WA 3OXNA 3HSTA 5H8FA 4DCXA 1OIBA 5I2NB 3CG3A 4NEDA 4LVQA 4RA1A 2AYSA 2XX8A 3MVZA 3FXUA 2XD2A 5I56B 1N3WA 3C34A 1YTVA 4HS7A 3SEVA 4XKPA 3IR1A 5DVIA 3IO6A 3S9EA 2HZKA 3S9NC 3MAMA 4U1ZA 1Y1ZA 1UTBA 3CSBA 1LBCA 4IO2A 4FIMA 4LONB 3U93A 3LSLA 4X9TA 3LBSA 4LP2B 4H1XA 2RC9A 3KOSA 3C31A 4OEVA 4HCYA 5AA4A 3ZSFA 4E0WA 3U92A 5KZTA 2QS3A 3S9MC 4R73A 4KPTA 1ELJA 2R9JA 3RY3A 2HXWA 5DVJA 5BWJA 4I1DA 4DCYA 3ONMA 2PYYA 4AQ4A 1HSEA 1VE4A 4FEBA 1AIVA 5FTIA 3H03A 3IORA 1MPBA 3LC8A 1Y4TA 2IA4A 3FIRA 3KBRA 1VSOA 5AA2D 1Y3PA 4G68C 3THIA 3VLWA 1ZJLA 3W9WA 5L8DA 3BFUA 4RPOA 4KD5A 4ELOA 1OQGA 4FORA 4NWCA 4MH5A 4THIA 5I58A 1UIUA 2DXYA 4BLAA 2ONSA 1H44A 1IZ1A 3H6WA 1Z7NE 4OFLA 3HV1A 4XIGQ 3FVKA 1XHYA 3LUYA 4NWDA 4E0XA 2QJEA 4QFNA 3MVXA 4KI0E 3TCGA 4LUBA 1Y3NA 4NF8A 4O3CA 4LZ7A 2PVUA 2A5TA 3OELA 4KCDA 4OQOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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