3H6WA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns5217 at 1.50 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 88
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6wA02
2RC7A 5I57B 4HCWA 1MXVA 4IGTA 2V25A 4PFTA 4AQ4A 1I6BA 3TAJA 4N13A 5I2KA 1JEUA 4RK2A 2FNCA 2R9JA 3PUZE 4DXBA 5IKBA 2H99A 1QUIA 4LQ5A 2H25A 5L9OA 1USYH 3V89B 3F11A 1VE4A 1MS7A 2Y7KA 5DEXA 3PU5A 1UQWA 4R2FA 1XC1A 3RT6B 1Q1KA 4GXAA 3HO7A 5J1DA 4O3BA 1MH3A 1JNFA 4OTEA 2DOJA 4OFJA 5CMMA 3K6WA 3QSLA 3TDJA 4JBZA 1L5TA 3KSXA 2DP8A 1MQGA 1ZKBA 5TP9A 1Z7NE 3UGWA 4EF1A 2Q2AA 4ZE8A 1PBPA 1B3LA 3KSJA 3PUVE 3K2DA 3OD7A 3RGYA 4ND9A 5H8HA 3MQ9A 3C32A 1WVJA 3MVXA 1MM6A 2I49A 1SYHA 1WODA 2F7CA 2F8DA 1BIYA 1NNPA 2D3IA 3PGFA 4THIA 2G29A 2GRVA 4IO6A 1M5BA 1MY3A 3SEXA 5H8SA 4JWOA 1LBCA 2VOZA 3PMWA 3VLVA 1M5EA 4F3PA 4G8MA 3B7DA 4R9FA 2CZLA 3U8QA 1IXGA 5I56A 4IY5A 4ZEIA 4O3CA 4EQ9A 2ZYKA 4R72A 3FGSA 5FTHA 1EZOA 3MPLA 3DP4A 3LSXA 4JDFA 5AA2B 5ELVA 1LFHA 3CVGA 5AA2D 4AB6A 4YZZA 4F2QA 4BLAA 4H1XA 3E9XA 3K1PA 4QFKA 1S9TA 4EQ7A 2DVCA 2F7BA 1JW4A 1PB9A 1HSEA 4NF5B 3U92A 1DOTA 2NXOA 3TEPA 1MXWA 5DT6A 2M8CA 3VLUA 3S9LC 5AA4A 3GBAA 3H6VA 3K6UA 3VE1B 2HXWA 1B0LA 1LB9A 3N6UA 4XKNA 3VXBA 4MBPA 1IEJA 5I84A 3CFXA 4PQJA 5FHOA 5H8NA 4F3BA 4GVOA 3EHSA 1QULA 3R6UA 5DYHA 3K01A 1SW1A 1IQ7A 1USYE 4MF3A 1LB8A 4NE4A 3PPRA 4EDPA 5FTIA 2ZMBA 3BKIB 3K00A 4Q30B 1PB8A 1TXFA 4RXLA 2XXYA 1LFGA 5HBCA 2QS1A 5H8FB 1I6QA 1QKBA 1QUJA 3U1OA 1OIBA 1MXXA 1ATGA 3C31A 3O6IA 3C33A 4FIMA 2O6AA 3PD8A 4IY6A 3W9WA 4G68C 1AL3A 3HV1A 3FATA 4F31B 3UORA 1B5IA 4QFNA 3FJMA 2Q88A 3MVWA 4P0GA 3MP6A 1Y3NA 3ILUB 5EYFA 3BFTA 4KYSA 1MY0A 4G4PA 1ZBMA 1WDNA 3O66A 1M5CA 2XX7A 3IB1A 4ZE9A 1FW0A 1P1WA 4HW8A 1OMPA 3K0VA 3MP1A 1RYXA 4MLQA 5FHMA 4C1TA 2O69A 4U21A 1UTBA 3JZJA 3FUZA 2PYYA 3QUJA 5I58B 4HTGA 4KHZE 3T96B 2A5SA 3CIJA 2GH9A 3A3UA 4ESWA 1TWYA 4BDRA 2P2AA 4QSEA 1DPEA 1XT8A 4NF8A 5BUUA 4OZ9A 4R74A 4LONB 1DPPA 1GTKA 2F5XA 4R6YA 2NUVA 4XKRA 4ZZEA 1B5HA 3K6XA 3LSLA 1DTGA 4U1ZA 1B2HA 3IAZA 3FXUA 2YPNA 1B9JA 2HCAA 4U23A 1ANFA 4NWDA 4XTCQ 1MY4A 2PX1A 4I62A 1H43A 1N7WA 1MQIA 2XX8A 4L17A 2XD2A 3C9HA 1NNFA 3O97A 5CMKA 4G77A 3OEKA 1SW4A 5JTYB 2PBWA 4GIZA 3EF7A 1MQDA 2KLFA 3MAMA 1N0TA 4LVQA 4YB6A 5K2XA 4NF4B 2DYXA 3OO8A 1IZ1A 3V8XB 2OWSA 3WAEA 4NEDA 2F36A 3G3HA 2LAOA 3CI8A 4FAJA 1B4HA 1Y4TA 4G8HA 1LGBC 1EH3A 1M5FA 4JSOA 3T9VA 3FVOA 3LSFB 1YPNA 3OO9A 1MXZA 3KJ7A 1VFEA 5F7VA 2DVZA 3PMVA 3N26A 1N04A 1O64A 2VGQA 4H67A 1SI0A 3KJTA 2QMWA 3CSBA 2UXAA 1B46A 3T9XB 3BBRA 5A5XB 3OXNA 1VSOA 2E1SA 4M4GA 3LBSA 5KCJB 4ONYA 3MVZA 2PMSA 2I3VA 1POTA 2E0SA 1LAFE 4G2ZA 1MRPA 2ZYOA 4RYAA 3KZGA 2ZYNA 1DSNA 1US4A 5LOMA 2V3TA 1LAXA 4BDMA 1OVBA 3A3CA 4R75A 2DXYA 5KDTA 4ZEBA 4RJZA 1SYIA 3OMBA 5CMCA 4I9DA 4RNSA 4RY1A 3OSQA 5L8DA 3SKPA 3SEYA 1LAHE 3PUWE 4KI0E 2V3UA 3RNNA 1H44A 3KN3A 4H5FA 5A5XA 4NMYA 5AA3A 4R73A 3MWBA 2R71A 5H8QB 1A8EA 5ITOA 1ZTYA 4F3SA 2HAUA 4KYEA 4X48A 4Q5TA 3DP8A 4IO4A 2ANJA 4TQUQ 3LSWA 2XD3A 4DLDA 1M5DA 2O68A 3K6VA 2ZNUA 1B1HA 3MJNA 4GF8A 3Q27A 2UVIA 3QYTA 1IXHA 1Y3QA 3AXFA 2RKMA 3SEUA 1FTLA 2B65A 3Q26A 4IO3A 2P0SA 3QIMA 4QSCA 5L9SA 2F35A 3M3KA 3VVDA 1PEBA 4JSDA 5I57A 3IOWA 1PC3A 4F2OA 4YAHX 4F39A 2O7IA 1UIVA 3KBRA 2PT1A 3W15C 3RUMA 4PE5B 3P7IA 2RC9A 3ODBA 1ZJLA 2V84A 1LCTA 4QRZA 2FYIA 4DXUA 1MPDA 4GL8A 2UYFA 1R9LA 2I3WA 3HN0A 2A5TB 1H3DA 2QSXA 1URGA 3QK6A 3KGCA 3IB2A 1S7YA 1MQJA 3HHGA 3CFLA 4WXJA 1FTOA 2GFEA 3PUYE 1A40A 4N07A 4ZEKA 3E4RA 4ECFA 1ZLQA 5EHSA 3KG2A 4KCCA 5DTBA 1B4ZA 1LBBA 2XXIA 4H5GA 4PFUA 1FQBA 4JWYA 3G3JA 1ZU0A 1US5A 4FJPA 3O9PA 4DCYA 4ZS9A 2XXWA 4OXVA 5BWJA 3LC8A 3G3GA 1A99A 4F18A 2O7UA 4X9TA 3DLNA 3O2AA 3PMXA 3WAFA 1JQFA 4R6HA 3TZAA 1JW1A 1TFAA 2DQVA 2Y7RA 4ZDMA 1PB7A 2UVHA 2BJJX 4KYDA 2QPQA 1FQDA 1AMFA 3S4UA 4OQOA 3D4CA 2Z8DA 2XXUA 3OOAA 3KOSA 1QVSA 2ALUA 3JYRA 3O6HA 3FXQA 1II5A 1Y1ZA 1BKAA 2ZNTA 1GR2A 1UTHB 4BDOA 2XXVA 3CR9A 1LAGE 5AA2A 2CMOA 2DSFA 2RCBA 2QL3A 4POWA 1N3WA 4EF2A 1N76A 1CE2A 1P1NA 2Z23A 4P11A 3IORA 3K4UA 4GWOA 3IO4A 3U93A 1MDQA 4XXUA 3KN8A 5EHMA 1Z7ME 4F1VA 4DIGA 1GVCA 3FV1A 4R6KA 1FTJA 4NF5A 1MM7A 3MC2A 4QF9A 2XX9A 2ONSA 2RCAA 2ZNSA 2FA7A 2VHAA 3B6TA 5CI5A 2HZLA 3KN7A 4P0IA 3RY3A 1QW0A 4YMAA 3KFMA 3V5AA 2D5WA 4NF6B 1XVXA 2QS3A 3ILTB 1IITA 4YKPA 4G8NA 4LZ7A 1SW2A 4XKQA 1Q35A 1NNKA 2UYEA 1ZMGA 5AA1A 3TFLA 3ZSFA 1SD3A 2DS9A 2F6GA 1B7UA 3HCQA 5CBSA 4GRKA 2XXPA 4Q8RA 2OWTA 1NKXA 5H8FA 4POXA 3USDA 3TCHA 2Y7WA 2I0BA 1NMUA 4H6DA 4IO5A 1OLAA 3TUSA 1URSA 3RTFB 1FQEA 3W9VA 2XXXA 2RF1A 3FV2A 2XXQA 3U72A 5CC2A 4BDQA 1LLSA 3T9HB 3PV0E 2OJTA 2NVUB 1D9YA 2I4BA 3L6GA 2OZZA 1MPBA 3HHFA 2REJA 3O29A 3K1MA 4KQPA 2F78A 2Z22A 1VR5A 1O7TA 5I59B 5ISUA 2DWIA 1MXUA 4YKJA 1GGGA 2XXTA 3FXRA 4G68B 4LA9A 1CB6A 4GL0A 3G3KA 1SBPA 1A7LA 3FJ7A 1Y3PA 4RK9A 4OWDA 1H76A 3RQTA 1URDA 5I58A 3RN8A 2HEUA 4ELQA 4ZZAA 1I6AA 4OFOA 4Q0CA 2ABHA 5CRYA 1B1XA 1SDXA 1B05A 1YCJA 3TYHA 1FQAA 4U4SA 4TLMB 3M3LA 4EXKA 3C34A 4QFOA 2DE3A 4C1UA 2YLNA 3FJGA 1P1QA 1LFIA 1OVTA 5M2VA 1TFDA 1B3GA 4PETA 4OMBA 4H8IA 3LR1A 4OHNA 4QFPA 2I0CA 2YJPA 1R6ZA 5HPQA 3Q28A 1MXYA 3PPNA 2GHBA 4ZEDA 4F1YA 3PPOA 1SW5A 2HFBA 2QJEA 3OO7A 4PFYA 1D3KA 3RPWA 5JTYA 5I2NB 4U22A 1HSJA 3Q25A 1B7ZA 3VLWA 4ELPA 4MLVA 1NL5A 4YB5A 2UVJA 3ECRA 4OESA 2Q9TA 4YKIA 1B3EA 4NF4A 4IO2A 4F19A 4E0XA 3T66A 3DM0A 3HSTA 1A8FA 2AIXA 4DDDA 3MVYA 3IJOB 1OQHA 2QS4A 2OBGA 3GZGA 3K1NA 1J1NA 5JEIA 3QAXA 2F7AA 2RC8A 1PDAA 3H03A 1T0KA 3TTMA 5I2KB 1FTKA 4FE8A 3TQLA 2DWAA 3ZKKA 1P1UA 3EN3A 2NWJA 3A09A 2AL4A 4FEBA 4DXCA 1TT1A 3TODA 3KOTA 3TTRA 4O3AA 5DEXB 2OLBA 3CFZA 2GHAA 3MPKA 1MPCA 5KCJA 3IK6B 4UA8A 5TPAB 3HPIA 4FORA 2PT2A 2AL5A 1IXCA 3H6WA 2H4IA 3H6TA 3QUFA 4EUOA 2Q2CA 1NFTA 3DELB 4KCDA 1QJMA 5TP9B 3SESA 1R9QA 3UIFA 2XXRA 2ZXTA 3OELA 4AB5A 4EQBA 4TLLB 4F1UA 5H8HB 1AIVA 5K2YA 2R6GE 4R2BA 3E13X 3O6GA 2P1SA 1F9BA 1LCFA 4M1VA 1NH8A 2I4CA 1MG1A 2O84X 4LQ2A 3TCFA 4KR5A 3R26A 4K3FA 1R1NA 3SERA 5H8QA 4ZECA 1MQHA 3MW0A 5TPAA 1OQGA 2WKYA 4DCXA 3EHUA 2Y7IA 4KFQA 5I56B 2OK2A 3RTWB 3H06B 4QSDA 1I69A 1ZIUA 4GFRA 3CRBA 1Y9UA 2G93A 4WEPA 3IR1A 4MFIA 3R7XA 3UN6A 4GQOA 3E3KA 4RA1A 3TELA 1EZPA 5AE4A 3TTKA 4KD5A 3N5LA 3M3FA 1MDP1 1BLFA 3C35A 2THIA 5ITPA 4U2RA 3GLBA 4Z7EA 1D4NA 5JK4A 5ICTA 1B51A 1A54A 3MP8A 1ELJA 3UP9A 3S9MC 2W7YA 1DTZA 2H9BA 2Z8EA 4XKPA 4OERA 5KZTA 1MY2A 4I8CA 3VVFA 1B58A 4NWCA 1JVXA 1AH5A 4NTLA 5L9MA 5AA4B 3TPAA 3MZ9A 3SDFA 5B7DA 1Y4CA 4HCYA 3LUYA 3H6UA 5H8NB 2DE2A 4GD5A 1N7XA 2F97A 1P99A 3IO6A 2X7PA 2A5TA 2V3QA 4OETA 1VFDA 3IL1B 3IB0A 5F1QA 5DVIA 3H7MA 3PUXE 2O1MA 3D4GA 5CM6A 1PBQA 4X1DA 3S9EA 1YTVA 2QS2A 4OENA 3FASA 1SVXB 3OENA 3C36A 4WKMA 1IUDA 1BTJA 3G3IA 1XVYA 4KPTA 2XXHA 4JWXA 1B52A 2ONKE 4JB7A 4LZ5A 1EZ9A 1BP5A 1B5JA 1S50A 3IOVA 3OSRA 1NNTA 3PD9A 1IXIA 4BDNA 4RPOA 1POY1 1EU8A 4YICA 1D9VA 3SETA 2PVUA 4GOTA 1O63A 2D21A 4EXLA 4GXSB 4GLIA 3T9UA 2Q89A 2REGA 1SQYA 1UTBB 2Y7PA 4OEUA 4U4XA 3I3VA 4N6PA 2NOOA 4LUBA 1RYOA 3VV5A 3PPPA 2F6PA 5DVJA 2I58A 1UTHA 4UACA 4NF8B 1AOVA 4ISUA 1KWHA 1B3FA 3JV9A 3FVGA 3RLFE 2DXRA 4F3GA 2DWHA 3TMGA 3B6QA 1LSTA 1DMBA 3OEMA 3VFJA 3FIRA 4OYVA 4BDLA 2F34A 3K02A 5TU0A 1GV8A 4F22A 3DP6A 5CBRA 1B3HA 2O1LA 1IIWA 4IGRA 4QFLA 3H3GA 1JEVA 3ONMA 4F29A 2XHDA 4DE8A 1OLCA 3PPQA 5ICQA 3EHTA 4LATA 1SI1A 4NF6A 3S9NC 2VD3A 3MBPA 2B3FA 3N94A 1Y1MA 4QHQA 4XIGQ 3H4ZA 1JW5A 3T93B 4HS7A 3U94A 3Q29A 4YMBA 1N84A 3EQ1A 1UIUA 3IJXB 1B32A 1FQCA 1Y20A 4ESXA 1XOCA 3T22A 4FECA 3VXCA 3THIA 4ZEFA 3VVEA 1B40A 4OEVA 3SEWA 2V93A 4MH5A 1P1OA 3CG1A 3CSGA 2IA4A 1JETA 3SEVA 3TQWA 1B7HA 4YU0A 2DE4A 1QKAA 4OFLA 4X1BA 1HSLA 3G3FA 4JXIA 1H45A 2H5YA 4ELOA 4FATA 5I59A 1JVYA 1YAEA 3FD3A 3S2VA 2Z8FA 3C4MA 4I1DA 3KEIA 4OVJA 4E0WA 2B3BA 5B70A 4G68A 4H0WA 2UVGA 2HAVA 1N3XA 1FQFA 1MY1A 2X26A 3FZVA 4FEDA 4YB7A 3G7WA 3I6VA 4LP2B 1NH7A 1RKMA 2AYSA 3IX1A 2VD2A 5HM4B 3L6HA 3TKDA 5CMBA 5KDTB 3VDFA 3M8UA 3UK4A 4IB2A 4TOZA 2O51A 1FTMA 3B6WA 2X7QA 2I48A 2ZYMA 2Q8JA 3I5OA 4H65A 2I6EA 2ONRA 3TTNA 3CG3A 3TTLA 1XS5A 3GBBA 3V83A 2HQ0A 3QXMA 2VP1A 4R9GA 3EPEA 5IAIA 2IEEA 3UA8A 3FVKA 4RPNA 1B0HA 2ESNA 3IOTA 1B6HA 4PFWA 5DVFA 2QRYA 3IOUA 4H8JA 2DWJA 3O28A 4ELRA 4DZ1A 2OCUA 5FHNA 4LZ8A 2HZKA 5I2NA 4U1OA 3GXAA 2QMXA 2RINA 4Z0IA 3RT8A 3FVNA 3MZ1A 1QUKA 4IO7A 2Y84A 3ZS6A 4PP0A 3BFUA 4C0RA 4WEDA 1XHYA 2H98A 3TCGA 1A55A 1FCKA 3ZKLA 1MH4A 4YKKA 3N6TA 3MZBA 3OO6A 3MUQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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