3E13X

Iron reconstituted ferric binding protein from campylobacter jejuni
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
SELNIYSARHYNADFEIIKKFEEKTGIKVNHTQAKASELIKRLSLEGSNSPADIFITADISNLTEAKNLGLLSPVSSKYLEEFIPAHLRDKDKEWFAITKRARIIAYNKNTNIDISKMKNYEDLAKAEFKGEIVMRSATAPYSKTLLASIIANDGNKEAKAWAKGVLENLATNPKGGDRDQARQVFAGEAKFAVMNTYYIGLLKNSKNPKDVEVGNSLGIIFPNQDNRGTHINISGIAMTKSSKNQDAAKKFMEFMLSPEIQKILTDSNYEFPIRNDVELSQTVKDFGTFKEDQIPVSKIAENIKEAVKIYDEVGFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Small hinge motion by the anion-independent ferric binding protein from Campylobacter jejuni
rcsb
molecule keywords Putative iron-uptake ABC transport system,periplasmic iron-b
molecule tags Metal binding protein
source organism Campylobacter jejuni
total genus 122
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e13X01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e13X02
3B7DA 3MVYA 1RYXA 2Y7KA 4RY1A 1LAXA 3ZKKA 5L9OA 1JEUA 1QUJA 3PMWA 2Z8DA 3BKIB 3PPNA 1FQFA 3VV5A 4YKIA 4OYVA 4F29A 3H06B 3TCHA 3K6XA 3VDFA 3QIMA 4F39A 2UYFA 4R73A 1A7LA 1D9VA 3TTKA 5I58A 3U93A 5K2XA 1EH3A 2Y7WA 4UACA 2HZLA 4Q8RA 1MPDA 2F6PA 3KN7A 4L17A 5CRYA 2ALUA 3GBAA 4G68A 1DTZA 2O69A 5DVFA 5DT6A 1A54A 2QRYA 2GFEA 3O6IA 2WKYA 1QUKA 4X1DA 3MVXA 1SW5A 1R6ZA 3FV2A 4LQ5A 4YMAA 3U72A 3W15C 2X26A 4R74A 3K00A 3SKPA 2OWSA 4O3CA 2QSXA 3S9EA 1MXYA 5I2KB 5CBSA 1LLSA 1B3LA 2RC9A 2F97A 1I6AA 2I0BA 3K6UA 4UA8A 1MRPA 2V84A 3BFUA 1IEJA 3RT8A 3O6HA 4XKNA 1SI0A 1ZLQA 1USYE 4Z0IA 3IK6B 5H8NB 1ZTYA 2X7PA 1PB8A 4YAHX 3TQWA 3TYHA 2DWAA 3IOTA 1QULA 4BDRA 3N26A 2RKMA 4XKQA 4XIGQ 3HN0A 2V3TA 1FCKA 4U23A 4LATA 2DOJA 3RGYA 1MS7A 4DDDA 3PD8A 4IGTA 3LSWA 1B1HA 5FHMA 3I3VA 4DE8A 5CM6A 1B05A 2M8CA 5B70A 3CSBA 5ISUA 1FW0A 4H0WA 3K1MA 2Z8FA 4DCXA 3EHUA 4H67A 1XVYA 5ITOA 3B6QA 1B3GA 2W7YA 4NEDA 1B4HA 1N3WA 4YKPA 4H8IA 3LBSA 4IO6A 4ZEIA 3IB1A 4RPOA 3JZJA 4JSOA 1XT8A 3DM0A 4U22A 5H8NA 1ZBMA 4OFOA 2PBWA 2ONRA 4RK2A 4O3AA 2XX9A 1B3HA 1WDNA 2FYIA 3SESA 2I3WA 1B3EA 4ZZAA 1MQHA 3GZGA 1B7UA 2YJPA 4ZEBA 3V83A 4KYSA 3TUSA 4KFQA 1H44A 4U1OA 4R72A 2H9BA 1AOVA 3OO8A 2HZKA 5H8HB 3T9XB 2Y84A 1NNFA 4OZ9A 1GVCA 1M5CA 4FORA 4PE5B 3C33A 1URDA 3VVDA 3T96B 3PUVE 5H8QB 4WKMA 4ISUA 4EF2A 4MLVA 3PUXE 2G93A 4H1XA 4JXIA 1HSLA 3O97A 4QF9A 4OWDA 2ONKE 3FJMA 1Y4CA 3K1NA 1QJMA 2AIXA 2R6GE 1DTGA 5KCJB 1F9BA 1P1UA 3CI8A 5CMMA 4R75A 3OSQA 3I5OA 1IIWA 3BFTA 5TU0A 3HSTA 2O1MA 4BDLA 2G29A 3EN3A 2X7QA 4QRZA 4QSEA 3EHSA 3O29A 5I57A 1A40A 3A09A 2F5XA 4AQ4A 1ZKBA 2Y7RA 2XHDA 2H25A 3FXRA 3U8QA 5I2NA 2XX8A 2H98A 4M1VA 3DP4A 3VLUA 3JV9A 1NNPA 4FJPA 4AB6A 2GHAA 1EU8A 3G3HA 3MP6A 1UTHA 4ZECA 1I6QA 5ITPA 4F31B 1O7TA 2OCUA 3CR9A 3U94A 5HPQA 1WVJA 1FQCA 4YICA 4OMBA 3TQLA 1MH4A 1QUIA 1MPBA 3KGCA 1Z7NE 5DEXA 4FEDA 3Q26A 2VD2A 2DWHA 3CFXA 2ZXTA 4NF4A 3O2AA 5K2YA 2XXHA 1B7ZA 4KPTA 2RC8A 5AA3A 1MQGA 2DE2A 2F34A 2XXWA 4OEUA 5HBCA 2XXIA 1PB7A 2QL3A 2XD3A 4DXBA 4C0RA 4ELPA 1ATGA 4LONB 1JVXA 1YCJA 2Z22A 1Y20A 1M5EA 3ZKLA 4GL0A 2I58A 5CMCA 5F7VA 3OEMA 3O9PA 5ICQA 3JYRA 5KZTA 1Y3NA 1FQDA 5TPAB 1JW5A 1NMUA 4YZZA 3UIFA 2F78A 1PBPA 4FAJA 3FZVA 2HQ0A 3LSFB 4O3BA 1BIYA 4I1DA 3LUYA 4YB7A 1LB8A 2REJA 3MP8A 1BLFA 2ANJA 4ZE9A 3MVZA 4Q0CA 3K0VA 4THIA 1JW1A 3G3JA 1A8FA 2A5SA 2QS1A 1B6HA 1N04A 1AL3A 4M4GA 1XS5A 1MM7A 1GGGA 2E1SA 4I8CA 3Q29A 3FJGA 1S50A 2DE4A 1N0TA 2DWJA 1Y9UA 1IITA 4F19A 3AXFA 3QUJA 3OO6A 5F1QA 3U1OA 1P99A 2YLNA 3SERA 4HCYA 4LZ5A 5AA1A 3FVGA 3ZSFA 3FUZA 3OO9A 4H5GA 3T66A 3B6WA 3E13X 3E9XA 1B58A 5KDTA 1MQJA 2RC7A 1KWHA 4F3SA 5TPAA 4HW8A 3FIRA 4POXA 3OEKA 3GXAA 3TCGA 3A3UA 3H6TA 4FIMA 2CMOA 2QMWA 2PT1A 2D21A 1NH7A 1BP5A 3N6TA 2NXOA 4U21A 4H6DA 2V3QA 2XXRA 3MQ9A 5JK4A 1QW0A 4OFLA 4YU0A 2UVHA 5BUUA 4YKJA 1I6BA 3M8UA 3H3GA 4RYAA 2XX7A 1Y4TA 4H5FA 4R2FA 4JB7A 4QSDA 1YTVA 4JDFA 3PPPA 3FGSA 4G68C 3S4UA 1SQYA 1Q35A 1UIUA 3D4CA 1OLCA 3PD9A 2P1SA 4F1VA 4BDNA 4OERA 1LAHE 4GIZA 4DLDA 1MPCA 3IOUA 3KG2A 4P0IA 3KEIA 5JEIA 3UA8A 4EQBA 4XTCQ 2HEUA 1GR2A 1MM6A 1WODA 5CBRA 3ILTB 2OJTA 4P0GA 1PB9A 3O6GA 1VFDA 3PUZE 5I59A 3KOSA 3U92A 3K02A 4DXCA 3DP6A 3IOVA 3GBBA 1POY1 5I84A 2VP1A 1N3XA 3IO4A 1B40A 3PPOA 2UVIA 2HAUA 4K3FA 3V8XB 1LAGE 3LR1A 5H8FB 4PETA 4RK9A 3C36A 1O63A 4XXUA 1LFHA 1MDQA 2ZNUA 3MUQA 3TFLA 2UVGA 5J1DA 3SEWA 4WEDA 2Q2CA 1PEBA 3S9LC 4IO7A 4F1YA 1USYH 3HO7A 3PU5A 4ELQA 2NVUB 3UGWA 4YB5A 4IB2A 4OTEA 4KI0E 1Z7ME 3SEUA 3IO6A 3K6VA 4QSCA 1H43A 4DIGA 5JTYA 3VXCA 4QFNA 3MWBA 5DYHA 1QVSA 3K01A 5ICTA 1B1XA 1H3DA 4GXSB 5AA4B 3M3LA 2H5YA 1US5A 2DXRA 1O64A 4KYEA 2I6EA 3KJTA 1ZIUA 2O6AA 4EXKA 4GQOA 3N94A 4HCWA 2R9JA 5H8FA 4IY5A 4POWA 4PFUA 2XD2A 2KLFA 3DLNA 2I3VA 1MG1A 4MH5A 4MF3A 2O7UA 4JWOA 1FQBA 1IQ7A 3TAJA 1QKBA 5L8DA 3WAFA 2E0SA 4NF5A 3FASA 1LGBC 2ZYNA 3H6UA 2IEEA 5AA2D 2UVJA 3CG1A 1SI1A 1HSJA 1LB9A 1B9JA 1NNKA 5EYFA 5I57B 1OIBA 3H4ZA 3FATA 3D4GA 1JQFA 3PUWE 5I2NB 3EHTA 2RF1A 1IXCA 3MBPA 4E0XA 4C1TA 4IO2A 1CB6A 1B46A 4N13A 5AA4A 4X9TA 1UTHB 2F6GA 1MXVA 4NF8B 1QKAA 1OVBA 3THIA 1SD3A 2F8DA 1A99A 5IAIA 1S9TA 3HV1A 1BTJA 1EZPA 4TOZA 2Q88A 3IJOB 3CFZA 4OETA 2F7CA 3WAEA 4E0WA 2XXPA 4ZEDA 5DEXB 1N76A 3CVGA 2PMSA 5DVIA 3UORA 3PMXA 2PYYA 4NF4B 1URGA 2QMXA 1P1NA 1CE2A 4EDPA 3G3FA 2OLBA 3S9MC 3HPIA 3O28A 4OQOA 4OXVA 1XOCA 1B3FA 4G8MA 1Y3PA 4F18A 2VD3A 2DQVA 4LA9A 3V5AA 3CIJA 3N6UA 3O66A 3MP1A 3DP8A 1MQDA 3VE1B 2A5TB 1LBCA 3MAMA 1BKAA 4AB5A 3Q25A 3QXMA 2P2AA 4FEBA 3OOAA 3QK6A 3M3FA 4TQUQ 2FA7A 4NF8A 3TELA 5AE4A 2B65A 2QJEA 4EF1A 4ZE8A 4R9GA 2P0SA 1MY3A 1JW4A 4ECFA 2NOOA 3FD3A 4U4SA 3HHGA 5EHSA 2LAOA 3M3KA 3KN3A 4C1UA 3S2VA 4DXUA 2DE3A 4QFOA 1US4A 4KQPA 2DSFA 3OSRA 1FTOA 3T9HB 2ESNA 2B3BA 3HCQA 4KR5A 3K2DA 2BJJX 4F22A 4XKPA 3KOTA 4G2ZA 1VSOA 3R6UA 2IA4A 2O1LA 2RCBA 3TDJA 3RUMA 1A55A 1S7YA 2QS4A 4DZ1A 3MC2A 3TTRA 2Z23A 4R9FA 2V3UA 2A5TA 3CSGA 4Q30B 3EPEA 2HFBA 4QFLA 3R7XA 1M5FA 3MZBA 2REGA 4G8HA 5IKBA 1LCFA 5KDTB 1D9YA 3RN8A 2F7BA 2V25A 3FVKA 4WXJA 2YPNA 1Y1MA 4ELOA 1URSA 5I56B 3H6WA 3FVOA 4WEPA 1B32A 4GOTA 4R6KA 5BWJA 2DYXA 2GH9A 3CG3A 4RPNA 1OQGA 3S9NC 4U1ZA 4KCCA 2NWJA 1UTBA 4FE8A 3IOWA 3IR1A 2HAVA 1SVXB 2H4IA 1I69A 3PPRA 4OEVA 4HS7A 4U2RA 2I4BA 3FVNA 1FTJA 1RKMA 4F3PA 1B52A 4F3BA 4GLIA 1OMPA 3SETA 2AL5A 1TFAA 3TZAA 1B51A 1TXFA 3RNNA 3K1PA 4ESXA 1HSEA 3UP9A 4JWYA 1SW1A 5I59B 4G77A 4OFJA 3G7WA 3H7MA 3OO7A 5L9SA 4PFTA 1MXUA 3C34A 4GFRA 1NH8A 3F11A 3T93B 2PVUA 3FV1A 5I56A 3QSLA 3UK4A 4JWXA 3PUYE 3LSLA 2RCAA 3QYTA 2VHAA 3QUFA 4OESA 3MW0A 1ZJLA 4RJZA 4X48A 5FTHA 2I0CA 3IJXB 5AA2B 4G4PA 4IO4A 1OQHA 2ZYOA 5DTBA 3PV0E 2VGQA 4GWOA 2OZZA 4LZ7A 1IZ1A 4IGRA 4KD5A 4BDMA 2XXXA 4LVQA 2PT2A 3TTLA 3ZS6A 2Q8JA 3MPLA 5HM4B 1LFGA 4G8NA 4Z7EA 2I49A 2FNCA 4EUOA 1R9LA 5A5XB 3BBRA 1SYHA 4F2QA 4F2OA 1RYOA 2I48A 4BDOA 2Q2AA 1SW4A 2H99A 5JTYB 3TEPA 1J1NA 4ZS9A 4PFWA 3FJ7A 4YB6A 2RINA 3G3KA 1B4ZA 1ELJA 1JVYA 3FXUA 4KCDA 3E3KA 4JBZA 4FECA 1JEVA 2QS3A 1MH3A 4F3GA 1AH5A 1MXXA 1ZU0A 4I62A 3KSJA 5AA2A 1AMFA 4YMBA 4TLLB 3L6GA 4QHQA 1IXGA 1NNTA 3UN6A 4NF5B 3K6WA 1VFEA 4RA1A 1PBQA 1MY1A 2ABHA 2XXYA 1SYIA 3VLWA 3T22A 3I6VA 1YPNA 3ONMA 3G3IA 2DS9A 4ZEKA 5A5XA 3MPKA 2ZYKA 3H03A 4ELRA 5LOMA 4BDQA 4X1BA 1B5IA 3OELA 3VLVA 5FTIA 1P1WA 3L6HA 4KYDA 3N5LA 1D4NA 1FTKA 3C32A 4RXLA 1N84A 2CZLA 3KBRA 4MBPA 5EHMA 3VVFA 4EXLA 3TKDA 3C35A 4ESWA 1FTMA 1SW2A 2O51A 4OHNA 2DVZA 5I2KA 2O84X 4GF8A 3ECRA 4QFKA 2UXAA 1DSNA 2Z8EA 4EQ7A 2D5WA 3LSXA 4MFIA 2UYEA 1AIVA 2I4CA 3P7IA 4PP0A 1MY2A 3C31A 4IO5A 4NWCA 3TMGA 4GXAA 1D3KA 5DVJA 4Q5TA 4LP2B 1POTA 1FQEA 2XXVA 3KFMA 1B0LA 3PPQA 4ONYA 3KZGA 2DVCA 1Y1ZA 1B2HA 2F7AA 1N7XA 4MLQA 4NF6B 3KJ7A 4N6PA 3PMVA 3GLBA 1IUDA 4IY6A 2GHBA 4ND9A 3TODA 2F36A 3CFLA 1MY4A 3IX1A 2ZNTA 4NE4A 1MQIA 3ILUB 5TP9B 1JETA 3R26A 3T9UA 4NMYA 4YKKA 3PGFA 3W9WA 3EQ1A 1LAFE 3KSXA 3IB0A 3TCFA 4XKRA 1H76A 4RNSA 1N7WA 4DCYA 2ZYMA 3OXNA 3VFJA 2XXUA 2XXQA 1YAEA 4TLMB 2XXTA 3MZ9A 1LBBA 3TTNA 4R6HA 4U4XA 4PFYA 3C4MA 3VXBA 2Q9TA 3QAXA 4LZ8A 1ZMGA 2DWIA 3OENA 3DELB 2OK2A 1A8EA 2B3FA 3USDA 1R9QA 4I9DA 1PDAA 1B7HA 1Q1KA 2NUVA 3A3CA 1B5JA 1JNFA 1VR5A 1XHYA 5H8HA 4NF6A 2DP8A 2Y7IA 2ONSA 1SBPA 3Q28A 3EF7A 1UQWA 4IO3A 1ANFA 3IORA 1SDXA 5TP9A 5H8QA 2AYSA 1IXIA 3T9VA 1L5TA 1DOTA 4GD5A 4ZEFA 1XVXA 4R6YA 3RTFB 2F35A 2DXYA 4LUBA 3SEYA 1MXZA 1UTBB 1B0HA 1II5A 3TTMA 5KCJA 1LFIA 1NL5A 2Y7PA 4QFPA 1LSTA 3C9HA 5L9MA 4LQ2A 4OVJA 3KN8A 4GL8A 1PC3A 1TT1A 4NTLA 4OENA 5B7DA 1P1QA 4H65A 1IXHA 3RT6B 2QS2A 3OMBA 2ZNSA 2OWTA 3VVEA 1GTKA 5CC2A 3TPAA 4P11A 1M5BA 3W9VA 5CMBA 1H45A 3V89B 1Y3QA 3B6TA 4H8JA 2O68A 3IL1B 1VE4A 3ODBA 1EZOA 4FATA 4EQ9A 3H6VA 3IB2A 3OD7A 3FXQA 1NFTA 3MZ1A 3HHFA 2HCAA 1DPPA 3E4RA 1EZ9A 4ZDMA 3Q27A 5ELVA 2V93A 5CI5A 1OLAA 1FTLA 4PQJA 1UIVA 4JSDA 3RPWA 5FHNA 1MDP1 2Q89A 5CMKA 3SEVA 3CRBA 2O7IA 4NWDA 1M5DA 2THIA 1LCTA 3MVWA 3LC8A 4GRKA 3RQTA 4ZZEA 3RY3A 2D3IA 1OVTA 1MXWA 3RTWB 5H8SA 2OBGA 5I58B 1DMBA 2AL4A 3MJNA 4GVOA 1TFDA 2R71A 4F1UA 1T0KA 5FHOA 1R1NA 4G68B 2PX1A 3G3GA 4BLAA 1DPEA 3IAZA 3RLFE 1XC1A 3K4UA 4KHZE 1TWYA 4N07A 4R2BA 4HTGA 1FQAA 3SEXA 5M2VA 2QPQA 2ZMBA 2VOZA 1NKXA 1B5HA 2HXWA 1P1OA 3SDFA 2GRVA 1GV8A 1MY0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3B7DA 3MVYA 1RYXA 2Y7KA 4RY1A 1LAXA 3ZKKA 5L9OA 1JEUA 1QUJA 3PMWA 2Z8DA 3BKIB 3PPNA 1FQFA 3VV5A 4YKIA 4OYVA 4F29A 3H06B 3TCHA 3K6XA 3VDFA 4PTKA 3QIMA 4F39A 2GQ1A 2UYFA 4R73A 1A7LA 1D9VA 3TTKA 5I58A 3U93A 5K2XA 1EH3A 2Y7WA 1LBYA 4UACA 2HZLA 4Q8RA 1FPGA 1FBDA 1MPDA 2B4MA 2F6PA 3KN7A 4L17A 5CRYA 2PFZA 2ALUA 3GBAA 4G68A 1DTZA 2O69A 5DVFA 5DT6A 1A54A 2QRYA 2GFEA 3O6IA 3QMFA 2WKYA 1QUKA 4X1DA 3MVXA 2QFLA 1SW5A 1R6ZA 3FV2A 4LQ5A 4YMAA 3U72A 1NUXA 3W15C 2X26A 4OVQA 4R74A 3IFCA 4I40A 3K00A 3SKPA 2OWSA 4O3CA 2QSXA 3S9EA 1MXYA 5I2KB 3T1BA 2OX3A 5CBSA 1LLSA 1B3LA 2RC9A 2F97A 1I6AA 4MNPA 2I0BA 1CNQA 3K6UA 4UA8A 1MRPA 2V84A 3BFUA 5ET5A 1IEJA 1LBZA 3RT8A 2XWOA 3O6HA 4XKNA 1SI0A 1ZLQA 1USYE 4H46A 4Z0IA 3IK6B 5H8NB 1ZTYA 2X7PA 1PB8A 2V4CA 4YAHX 4I3YA 3TQWA 3TYHA 2DWAA 2FHYA 3IOTA 1QULA 4BDRA 1LBVA 3N26A 2RKMA 4XKQA 4XIGQ 3HN0A 2V3TA 1FCKA 4U23A 4LATA 2DOJA 3BIHA 3RGYA 1MS7A 4DDDA 3PD8A 4IGTA 4PF6A 3LSWA 1B1HA 5FHMA 3I3VA 4DE8A 5CM6A 1B05A 2M8CA 5B70A 3CSBA 4X8RA 5ISUA 1FW0A 4H0WA 3K1MA 2Z8FA 4DCXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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