1HSJA

Sarr mbp fusion structure
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALAAAQTNAAAEFMSKINDINDLVNATFQVKKFFRDTKKKFNLNYEEIYILNHILRSESNEISSKEIAKCSEFKPYYLTKALQKLKDLKLLSKKRSLQDERTVIVYVTDTQKANIQKLISELEEYIKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the SarR protein from Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FUSION PROTEIN CONSISTING OF STAPHYLOCOCCUS ACCESSORY REGULA
molecule tags Transcription/sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 143
structure length 487
sequence length 487
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF12802 MarR_2 MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1hsjA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA01
5E1XA 1BLFA 4P9FA 2QL3A 4RK9A 1USYH 3O6BB 2GQQA 2A5TB 3KSJA 1KYWA 2ZYKA 2V79A 4IO2A 2ZMEB 1P6RA 3QYTA 3OELA 5IKBA 2NOOA 1IN6A 4DQ2A 4OIQF 2A5SA 1E17A 2MA3A 4L9TA 5LHIA 4GL8A 4OHNA 2P7CB 2O6AA 2ONRA 4G9YA 3COAC 1TXFA 3GZ5A 3IC7A 2QQ9A 4H5FA 4OMZA 4LB5A 2RC8A 3M8UA 3KN3A 2REJA 4KCDA 4HQEA 3U93A 4C1UA 3FM3A 3I3VA 4DCXA 2BEOA 3DV8A 1Y3PA 5BS6A 3MWMA 2MH2A 4NMYA 1OYYA 3BFTA 3O3KA 3SFZA 4O3BA 1W7PB 2AL4A 3LSWA 4IGRA 4XKPA 1LSTA 3TUSA 3KP7A 1OMIA 1N0TA 4E70A 2M45A 1B4AA 2V3QA 2HDCA 4QHQA 5AE4A 5IAIA 3LC8A 3K6UA 1AWCA 2ZO4A 2YX4A 4IVNA 5J8CA 1Z7UA 1FQEA 5CRYA 2QWWA 2IRFG 4RJZA 5I56B 3P9CA 5JEIA 2RF1A 2R7FA 1ZN2A 3KETA 2E1SA 2P8TA 1XDSA 4AB6A 1YW9A 3P9KA 3SQNA 3E6BA 3TZAA 2RCBA 4LFUA 1JEUA 2DSFA 4RYAA 1JETA 4UACA 1SI1A 3CFLA 4M74A 1R9QA 4OETA 1QQIA 5H8QA 2XGXA 3KP5A 3ILTB 4OIRF 3H6WA 3MAJA 2XAQA 1D9VA 5E1ZB 4HF0A 1TBXA 5TPAB 3VEPA 3UGWA 2I48A 3O66A 4MH5A 1P2FA 1YPNA 3OSRA 5CVIA 5F1RA 4XKNA 1PB7A 2A68F 3A3UA 1R22A 1URSA 3SEYA 1F9NA 4NF6B 3TYHA 5JFRA 3ELKA 3R4KA 4ZEKA 1T2KA 4MFIA 4ETSA 1IXGA 1MDMB 3OMBA 2XXTA 3LUYA 4JQFA 2OJTA 4GXSB 1BI2A 4Q4ZF 4LLNA 3UN6A 5CMKA 4LMYA 1STZA 3CVGA 4N13A 3TO9A 1XCVA 5FLXZ 1ZG1A 2XX8A 4HBLA 3I59A 2CQKA 5FHOA 4OWDA 1W7PD 2Z8EA 3FMSA 4G8XA 2PT1A 2MC3A 5KDTB 3E4RA 5CVUA 2D45A 4AIHA 1DTZA 2RVCA 3TDZC 1DP7P 3QU6A 2X26A 4QSCA 1ZLQA 3K02A 4POWA 3TTKA 4QRZA 1VSOA 5AIPA 4POXA 4BH9A 1R9LA 3I5OA 4R2FA 4DZ1A 3K0VA 1II5A 4WWCA 2LF7A 1SBPA 2PBWA 1L5TA 3S9LC 3R60A 1B5HA 4KI0E 3V8JA 2X0LA 2PMSA 4R73A 3O29A 1R36A 1PP7U 2QS2A 3BOQA 5K2YA 1FTLA 1FT9A 3PFIA 3PUYE 3KZYA 5CJ9A 1M5EA 3T8RA 1HXDA 2VN2A 1SD3A 1US4A 3JAMK 1AOVA 1IQ7A 3IJOB 2ZCWA 3PPNA 2VE8A 5AA1A 3V89B 1MJ9A 2P1SA 2STTA 1K78B 4R72A 3W9VA 2GWRA 1FYLA 4NF4A 3ECOA 4F19A 3ABUA 3VDFA 4PE5B 2XHKA 1U8RA 3B6QA 2STWA 3U9GA 2PN6A 3OO6A 1FPQA 4DDDA 5L9SA 1ANFA 1OR7A 1BM9A 1ZKBA 3EF7A 2HAUA 5JK4A 4PFWA 2DVCA 4KICA 4Q8RA 4KYWA 1MH4A 3HYIA 3CO7C 1MXZA 3IB2A 1BI1A 5DD8A 1O3RA 2GH9A 2XXYA 3MPKA 3FJGA 3SZTA 1Y3NA 3CUQB 2XXXA 3LSLA 4FHTA 1VFDA 3HRTA 4GLIA 4FEBA 1E2XA 3LSFB 4JWOA 1J7KA 1GVCA 4UVBA 2O84X 1BIBA 1TFAA 2RC7A 3SDFA 5CYVA 2Z22A 1KU9A 3FD3A 2ESNA 3R61A 4I2OA 1LCFA 2DTRA 2AL5A 4KCCA 4U21A 2FQ3A 1FTOA 2VD3A 3VFJA 2GZWA 1MDQA 1FTMA 1CF7A 3IL1B 2XKPA 5LEJA 3I54A 1EZ9A 1MGTA 4MLQA 2V1DA 1MXVA 3QAXA 3PPQA 3HHGA 2HYGD 3E13X 1XMKA 4OEUA 2VBYA 4PFTA 1MQHA 4G6DA 2ZXJA 2O6GE 5DEQA 3DP8A 5A5XA 4MHGA 2FE3A 3EHTA 1HW2A 3HHFA 3TAJA 4YU0A 1IRFA 1U2WA 4GYIA 4KA4A 1LBCA 5L3CA 4F18A 1RYXA 1B58A 3RPQA 1O7LA 2DWIA 1QUJA 5ICGA 4IRIA 3TO7A 4ENNA 1M5FA 2CO5A 4OVJA 1B3GA 5EYFA 3U72A 1EZPA 2UVGA 4ESBA 4S04A 5AA2D 3GFMA 1I6BA 4L9JA 1R1UA 1B3FA 1PBPA 2DOJA 1POTA 2YPNA 4IO6A 3TELA 1XOCA 2V3UA 3PQKA 1B40A 1J9IA 5DVIA 2PVUA 4GGGA 4PGHA 1I27A 2Z99A 3J81K 1QUIA 4N07A 4P55A 4KYDA 4EJVA 5D6FA 4JSOA 2XAFA 1SFEA 3REOA 4MF3A 4HZFA 4N9IA 5I58B 3RUMA 3LQRA 4HX4A 4HTGA 1Z7ME 1SW4A 1N7WA 2HZLA 1DOTA 3GVAA 2OCUA 3HO7A 2QRYA 2GFEA 3RT8A 2BV6A 1FQAA 2VC1A 2IA0A 2XVCA 1BIAA 2DWJA 1NNFA 3FGSA 3Q27A 3ZPLA 2XAJA 4ZE8A 1PBQA 1FP1D 2HFHA 2ZFWA 3CR9A 4I9DA 3L6HA 3W6JB 4I62A 3BJOA 3IHUA 1NFTA 3MAMA 3WTTC 1S3JA 1IAWA 4D0PA 2FBHA 3JAMZ 2O1LA 5HLHA 5ED4A 2O7UA 3LA3A 3SZPA 2M30A 5FD6A 1HSEA 3FX3A 3MC2A 2RN7A 3HRSA 3FM5A 4WXJA 3K2ZA 2XXVA 4AIKA 3V83A 2D5WA 3SETA 1L3LA 3IK6B 4U22A 2IJLA 2F7AA 5L8DA 1F5TA 2ONSA 4LUBA 1FSHA 3GLXA 2Q89A 2Q88A 4CGZA 2DE3A 1RI7A 3LFKA 3DF8A 4KMFA 3MZ1A 2F78A 1US5A 4X1BA 1S7OA 2FRHA 4CDGA 4AIJA 5TPAA 4GRKA 4G7OF 1MQGA 4RGSA 1B3LA 2CSOA 1A99A 5D5WB 3QPHA 5FTHA 1WKMA 3V7RA 1S9TA 4LQ2A 2O69A 2ABHA 4MTEA 1URGA 5ICCA 1J2XA 2KIUA 4PGGA 1JW5A 2I3VA 5HS9A 1DMBA 4M4GA 4H1XA 1OVTA 1FCKA 1MXXA 2RCAA 1BOAA 3NQOA 5B70A 2OZZA 5J8FA 3LQQA 2XROA 4UHTA 1I6AA 2E1CA 1AL3A 3H6VA 4GWOA 1NNTA 3WGGA 2V93A 4R74A 1CE2A 3WTYC 3RN8A 5BQTA 3F22A 4O3MA 2Z5UA 3G3KA 5KDTA 1G6NA 1FYMA 2HYFA 2Z8DA 3M1EA 3THIA 3CG3A 5H8QB 1HBXG 2K27A 1TT1A 3FVNA 5L3BA 4Q0CA 3JV9A 2V9VA 1GXPA 3DP6A 2EFOA 4IO4A 2OQRA 4OTEA 4X9TA 2TDXA 3TCFA 4C0RA 2THIA 3VODA 2DWAA 4YKKA 4KFQA 1CB6A 3DELB 4NQWA 5EEHA 1FQBA 3GZ6A 5DDGA 1FTJA 4X1DA 2KLFA 3TQLA 1H44A 3B6WA 3FHZA 1WWXA 1P1NA 5D5UB 4G7HF 5D5VB 3JSOA 2D1VA 2WTEA 4ZEBA 4TV7A 3TDUC 1HW5A 4CHUA 1QGPA 1S50A 1ZLKA 1LFHA 2VBWA 4KYEA 4E0XA 4O5VA 5L3GA 3PMWA 3C7JA 5HDKA 3EN3A 3I59B 3KP3A 4QWQA 3NRVA 3PGFA 2G93A 3CDHA 3O97A 1F1ZA 1H0MA 2E1NA 1FZPB 3J7AO 2P5KA 5ICQA 1ZHFA 2DO7A 3ERED 2VODA 1IW7F 4HAMA 1Y0UA 3HUGA 4EJTA 2F5CA 4XXUA 3J81Z 3MBPA 4CYDA 5JTYB 1DPRA 2KIFA 2HEOA 1ODDA 3F6VA 1QBJA 3VV5A 3BY6A 3I58A 1YIOA 1Z7NE 1J75A 2ZKZA 3ZMTA 1Y4CA 5H20A 3MCZA 2H9BA 5JI6A 4RB1A 4KIFA 4MQVA 2OAZA 4XSXF 4KD5A 3W9WA 2F7BA 3VVDA 4FECA 4WK8F 1BC7C 3C32A 4QFKA 4YKIA 4G4PA 3K1PA 2DK5A 3ECRA 4H8IA 4FE8A 1ZU0A 3EQLF 4I0AA 5I2KA 2EWNA 1A8EA 3CFXA 3K6XA 4KHZE 2VXZA 4RA1A 4WX9A 1QNTA 1AH5A 1Z91A 2L3DA 2MH9A 2YLNA 4YIIA 1RUNA 1TW2A 1D9YA 2JT1A 1ZMGA 2DAOA 4BDOA 4G2ZA 2L02A 2KRFA 3WTUC 1PP8F 4OQOA 4WXDA 1Z6RA 2I58A 2P7VB 4NF5A 3IO6A 3HHHA 2F5XA 4BHPA 2QQAA 1K7AA 1B9JA 3HSFA 3ZN0A 2UXXA 2Z8FA 1ZIUA 2F2EA 1G3WA 3TOBA 3KEOA 3C3WA 3SXYA 4RY1A 2Q2EA 5LRRA 2UVJA 2VGQA 1R1VA 1M5CA 3O6HA 4QFLA 3V8XB 2DQRA 3R0AA 3UORA 2DLLA 2CWEA 2XRNA 3CG1A 4OENA 3B73A 2OWSA 3L00A 2M1BA 1RIOH 2JTVA 2QUFA 1FX7A 1KQ0A 3N6TA 4WF2A 5F1QA 3QOPA 3ZMDA 3PUZE 2O68A 3O2PE 4U23A 1TQMA 1WRJA 2PBIA 4N0BA 4Z0IA 4BDRA 2RKHA 2EB7A 1AOYA 1MM7A 1CF7B 4PFYA 5DUKA 3HV1A 3Q25A 3BWGA 3RTWB 4EJOA 3H4ZA 3HN0A 2VP1A 3JZJA 2EFPA 1FTKA 3FVGA 3R6SA 3OO8A 1O7TA 4LG0B 4M73A 3M9AA 5ILVA 2R71A 4RGRA 3O2AA 1Z1DA 5E8IA 3GFIA 2PMUA 5I57B 1SFXA 1TFDA 5LRSA 5A5XB 1A54A 3TCGA 4EQQA 2W7YA 5BMZA 2ZJ2A 1B4HA 3FF5A 3D0SA 2HQRA 4U1ZA 3N26A 1JHFA 3GBAA 3Q29A 2ZXTA 1ZLJA 1N84A 5CC2A 2HZKA 4L18B 2MLGA 4LB6B 2ADUA 1IN8A 1J59A 3ZMUA 3WU1B 3KP2A 4WXHA 4LP2B 2XHDA 2XAHA 5D5XB 2XD3A 5E1WA 4FX4A 4EVIA 3ISPA 2ZNUA 5IT9Z 4JWXA 1B1HA 3OSQA 3E5XA 4HLYA 2GA2A 1N3XA 4P0IA 1PDAA 1MY1A 1LAXA 4RK2A 1KYZA 1SMTA 4XKQA 2OBGA 1GHCA 3ZMSA 2X7QA 2FOKA 3WG9A 3KZGA 3OO7A 5I59B 3HIFA 1U3EM 3FUZA 4G68C 3QP5A 4BDLA 1GGGA 3CI8A 2VD2A 4ENMA 4A6EA 2RC9A 1YQAA 1IIWA 5K5OA 1CGPA 3IOVA 2J5PA 1H76A 3IOWA 1Z6TA 3SEUA 4Y17A 3R6UA 3EYIA 1HKQA 2HOEA 2QYOA 1UIVA 4ELQA 4RGXA 3CO6C 1U5TC 3RT6B 1IXIA 4MEXF 5CLSA 1POY1 3PPPA 3KN8A 1KGSA 3Q28A 3KJ7A 4G7ZF 3RPWA 5FGMA 3G7WA 3U1OA 1HSTA 3O9PA 4NEDA 2QQBA 3S9MC 3KP4A 2O0YA 1L0OC 3D4CA 3E5QA 3LA7A 4MNUA 3HOTA 3H03A 1SYHA 2Y75A 3VXCA 3EETA 3EHSA 4U7DA 1TQIA 3LSTA 1QKAA 2I4BA 4A0ZA 1Q35A 3LAJA 3MJNA 4Q30B 4GXAA 4MEYF 3MVXA 3K6WA 2K02A 1H45A 1JW1A 3M3FA 3KP6A 1H9GA 2E7WA 2Q9TA 1GR2A 3FV2A 4PETA 2I49A 4DXUA 3ZQ7A 2VOOA 2JRTA 2ETHA 4YB5A 1A8FA 2XUBA 2B3BA 5E20A 2UYFA 3S9EA 4U0WA 4ON0A 4LD5A 2A07F 4UVAA 4M6XA 2IEEA 4RNSA 4F31B 3GXAA 3I6VA 2RV8A 4ESFA 4EXLA 5BWJA 1ZJLA 1XSVA 3TTLA 4F1VA 3FXUA 1EH8A 4H67A 2H6CA 2EV5A 4AQ4A 4HX8A 4G8NA 1M5DA 1SQYA 2PEXA 3QIMA 4HDUA 2HXWA 2O8XA 1GXQA 3G73A 1LAHE 2HKOA 4IRHA 4EJWA 3RLFE 4KN7X 3IAZA 3SEWA 1NL5A 3ODBA 4M71A 5FHNA 5CBSA 2XXIA 2IP2A 4P5OA 1KQ9A 2FBIA 1J5YA 3PMXA 3WGIA 3AXFA 3RTRA 1FY7A 1BKAA 1B0LA 4LA9A 3IWZA 3SKPA 2EFNA 1J1NA 5JTYA 4OIOF 2XIGA 2O1MA 3IO4A 3OD7A 4ASNA 2GRVA 1G3SA 4BQAA 3MQ9A 1B51A 1BN5A 3KBRA 4PP0A 2VBZA 2HAVA 1FSEA 2ISZA 1VFEA 2LSOA 3KOTA 2HKXA 5KCJB 2A61A 2WC2A 3VXBA 3BPVA 2VOPA 4HQMA 2QS4A 3I64A 1Q1KA 4PQJA 3R26A 4H65A 4EDPA 3ULQB 1OQGA 1NH8A 3GUDA 4LGWA 1R00A 3F23A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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