4RJZA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, an open conformation
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
VTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords ABC transporter, substrate binding protein (Sugar)
publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, Target EFI-510558
rcsb
source organism Agrobacterium fabrum
total genus 126
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rjzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rjzA02
2HFBA 1VSOA 2F7CA 1I6AA 4DXUA 1RKMA 5JK4A 1SW4A 1H45A 4WKMA 2HQ0A 1GV8A 4YB6A 2H9BA 2P0SA 5I56B 3TYHA 2GRVA 2ABHA 1NH8A 3PGFA 3IB0A 1B1HA 4MFIA 2PVUA 4DZ1A 1N0TA 3FJGA 4PE5B 3Q26A 1OVTA 4Q5TA 4KYEA 3TQLA 2PBWA 1DMBA 1MXWA 4ZE9A 1GR2A 4ZZAA 3SETA 4E0WA 2Z22A 4OFJA 3IB2A 1H44A 3SERA 3EHSA 3UORA 2O6AA 2M8CA 1FW0A 2CMOA 3P7IA 1B2HA 1FQDA 3PU5A 4OXVA 4X48A 1A8FA 5I56A 2OWTA 3K4UA 2V3TA 4BLAA 3FXUA 3U72A 2ONSA 3D4GA 3IOUA 1ATGA 1FQBA 2F78A 4QSCA 2DXYA 2VP1A 4F22A 1Y4TA 3UN6A 1Y1MA 3KSJA 3KGCA 3UA8A 1UTHA 1ZBMA 1MXYA 4R2FA 3C33A 4MH5A 4NF8B 4YB7A 2RC9A 2NWJA 4WXJA 5DVIA 1LBBA 3LR1A 1MH3A 2PT1A 3HV1A 1QVSA 3K01A 3Q28A 4HS7A 2CZLA 2Q9TA 1Y1ZA 2Y7PA 3N6UA 1OIBA 3TCGA 4GD5A 2DP8A 4KYDA 2P1SA 5M2VA 2XX9A 2DVZA 2DOJA 5B7DA 2QS4A 1MQHA 4GXAA 3BFTA 2ONKE 1JEVA 1IXGA 4XKPA 4OQOA 3CG3A 3S9LC 2W7YA 2D21A 2ZNSA 1T0KA 1I69A 1VR5A 2F35A 2ANJA 3KJ7A 5CC2A 4NF5A 4G8NA 2Y7WA 4RY1A 1B5JA 3S9NC 4GL0A 2ZXTA 4L17A 4EQ7A 4IGTA 2QRYA 3JV9A 3V8XB 1B3LA 2FNCA 2THIA 5ITPA 2HEUA 1MXVA 4F29A 4OTEA 3QUFA 4U23A 1B7HA 5CMCA 1PEBA 5CMBA 4IO3A 5CRYA 1N7XA 4YMBA 4G4PA 3TTLA 3MP6A 1B7UA 3EN3A 4ZS9A 2OBGA 3AXFA 4XKNA 3OEMA 3UIFA 5CM6A 4R6HA 3OELA 2V3QA 2Y84A 1Y3NA 5H8FB 1AH5A 3O2AA 5EHMA 4F3GA 3IORA 2ZYNA 3IOTA 3PD9A 2ESNA 4U4XA 1RYXA 5CBSA 3FZVA 3KOTA 4X9TA 3K6WA 4P0IA 1OQHA 3M3KA 4F3BA 4N07A 1FQAA 1MG1A 2QMWA 3KSXA 4IY6A 1QUIA 5TP9A 3HSTA 3W9VA 4GFRA 5H8SA 3S9MC 2HCAA 2Q89A 4DE8A 4BDMA 3W9WA 4EDPA 3MC2A 4O3AA 2IA4A 1B5HA 2O7IA 4RXLA 4NEDA 2Q88A 4JDFA 4OVJA 3N5LA 2DWAA 1UTBA 3R6UA 3ZS6A 1YTVA 3FD3A 2RCBA 2LAOA 3RT8A 4Q30B 3PMXA 1JNFA 3TQWA 2Q2AA 3Q27A 3LUYA 2GFEA 3DLNA 1JW4A 3OSQA 1B32A 3MAMA 5I2KA 3BFUA 3PD8A 1B3FA 4FE8A 2UVJA 2F8DA 1MM6A 4G77A 3UK4A 5I58B 3VVEA 1MXUA 1XC1A 3ECRA 4KD5A 2H98A 1LB8A 1B7ZA 3CFZA 1NL5A 1TFDA 1KWHA 1FQEA 2DE2A 2Q2CA 2O51A 1MY3A 1AL3A 4U4SA 1BP5A 4FECA 2ONRA 2V93A 5FHNA 1N3XA 4O3BA 1Z7NE 5TPAB 2IEEA 4FORA 3K1NA 4OHNA 3TUSA 3GXAA 5BUUA 1MRPA 1XOCA 4NF6B 1NNTA 4HTGA 5AA1A 4YAHX 4ZE8A 4OEVA 1A8EA 4NE4A 3U1OA 1US5A 4TLLB 3L6GA 1QKBA 2YPNA 4LZ5A 1ZIUA 3G3FA 2UYEA 1IXHA 1JW1A 1MDQA 2I48A 3VLVA 4POXA 3TTMA 4RPNA 3THIA 4KR5A 2DXRA 3O6IA 3UP9A 1A55A 3VDFA 3QUJA 5TPAA 3PPPA 3O97A 1US4A 4Z7EA 3I3VA 1AOVA 5BWJA 3OOAA 3H6WA 1NFTA 3TAJA 3HCQA 1F9BA 2ZMBA 4R74A 3U92A 3QXMA 4QFOA 1M5FA 4QFNA 2P2AA 3T22A 4I62A 2O1LA 3GBBA 4RYAA 3PUXE 4BDNA 2ZYKA 2QS2A 4R9GA 5K2YA 2RC8A 5I57A 2XXWA 5KCJB 4TLMB 4OERA 1MY0A 1CB6A 2QMXA 2FA7A 2I4BA 4TOZA 2E0SA 4FIMA 1EZPA 4LQ5A 2I0BA 4FEBA 3VLWA 2I6EA 2HZLA 4H67A 4QF9A 4F18A 5HM4B 4RNSA 3FATA 3K6XA 3MZBA 1URDA 1IXCA 1NNFA 4QFLA 5K2XA 4F3PA 3PUYE 1SYIA 4U1ZA 2XD3A 1ZJLA 3RNNA 3H6UA 3O6GA 4G68C 4DIGA 1SI0A 3MW0A 3CIJA 4P11A 5H8NB 3G3GA 5KCJA 1N7WA 2QJEA 1S7YA 1OLCA 3GBAA 4F31B 1LAXA 4F2QA 5AE4A 5ITOA 4JWYA 3DP8A 3G3KA 4YZZA 1SW1A 3QYTA 3DP6A 1PBQA 4DCXA 1IQ7A 3VLUA 5B70A 4OYVA 1JVXA 2V84A 4LVQA 1MY2A 5JTYB 1ZU0A 4QFKA 1LB9A 2X26A 1SVXB 3MPLA 4ZZEA 1OQGA 1XT8A 1HSEA 2HAUA 4AB5A 3BKIB 4Q0CA 1SW5A 4KPTA 2DSFA 1B3GA 2I3VA 4JWXA 2F7AA 3IL1B 3IJOB 2ZYOA 3K1PA 4LP2B 2O84X 1CE2A 1XVYA 4KCDA 3IO4A 5AA2B 4M1VA 3A09A 1SW2A 2OK2A 3L6HA 1NNKA 4OWDA 5DEXB 3G3IA 1Q35A 1P1NA 3KOSA 4ESWA 1EU8A 1FTOA 3HHGA 2REGA 4JXIA 5A5XB 1B58A 3IOVA 1MPBA 3JYRA 2XXUA 3LBSA 3QIMA 5F1QA 3T9HB 2AL4A 3V83A 4I9DA 2YLNA 4ELQA 4LZ7A 5DYHA 5EHSA 3KN8A 3DP4A 4EXLA 3MJNA 2REJA 5IKBA 4FATA 3E3KA 3CFXA 1R9QA 1TT1A 3M8UA 1ZLQA 3TTNA 5DEXA 2XXPA 2VGQA 3KZGA 1B4ZA 3C36A 3WAEA 3ZSFA 2DWHA 2HAVA 1QW0A 5A5XA 4EQ9A 4YKIA 4IY5A 4H5GA 3TPAA 1LLSA 4LQ2A 2NXOA 3OMBA 4NF8A 4ZEBA 3FXQA 1Y3QA 1DTZA 2F7BA 4GRKA 4LUBA 5AA2D 2OCUA 1PBPA 4NWCA 1PB8A 3E13X 3MVYA 1POTA 1B3EA 3JZJA 4YKKA 1HSLA 1EZ9A 2AYSA 3FXRA 4RK9A 1VFDA 2UYFA 4R6KA 2F6GA 1N76A 4ELOA 1LAFE 3V5AA 3RLFE 1I6BA 4P0GA 2OZZA 4XKRA 2RCAA 3CSGA 1Y20A 4PFYA 1LCTA 2A5TB 4GXSB 3LSWA 1UQWA 1A40A 3SESA 1B1XA 3RPWA 5DVJA 5KDTB 1MQIA 2H4IA 4KI0E 3PMWA 3O66A 3C32A 4JB7A 2DE3A 1VFEA 5IAIA 1TFAA 3SEWA 3ODBA 3KFMA 3KG2A 2QSXA 2XXQA 3IO6A 4JSDA 3FV2A 3FVOA 3LC8A 1B40A 4KYSA 5TU0A 4G8HA 4U2RA 4IO7A 2RKMA 2XXVA 2GH9A 3B6TA 3MQ9A 2E1SA 1PB7A 2DQVA 4THIA 2XD2A 2A5TA 2F97A 2R9JA 2B3FA 4OETA 5H8FA 3SEUA 1LFHA 4N13A 2OLBA 4AQ4A 4XTCQ 3N94A 3FIRA 1II5A 4NF4B 2AL5A 1QUKA 3IJXB 4GIZA 2V25A 1Y4CA 4OENA 3QAXA 1NH7A 5AA4B 1B0LA 3R26A 3G3JA 3PPNA 2UVHA 1DPEA 1YCJA 2HZKA 3H4ZA 3TELA 3M3FA 3IR1A 3LSLA 1D9VA 5I2NB 1MPDA 2H99A 3VE1B 2O69A 5ICQA 4PQJA 2X7QA 1M5BA 4RJZA 1BIYA 1N3WA 1DOTA 1O63A 4IGRA 1MM7A 3MP1A 1MXXA 3TMGA 2BJJX 1Y3PA 5I59B 2Z8DA 4Q8RA 3A3CA 4X1BA 4OZ9A 4R2BA 1SBPA 1P99A 2OWSA 2B3BA 3TEPA 4GQOA 3G3HA 3N26A 2WKYA 2Y7IA 2X7PA 4GWOA 3K6VA 4DCYA 3U8QA 3O9PA 2GHBA 5CBRA 3C35A 3KBRA 4HCYA 3UGWA 4EUOA 5I58A 1NNPA 1SI1A 4TQUQ 1S9TA 4ELPA 3KEIA 4IO6A 4RPOA 5AA3A 4BDQA 5J1DA 1NMUA 4PETA 2DS9A 3T9UA 3FASA 4G68B 4ZEDA 1LFGA 1M5CA 3K02A 3PUWE 1D9YA 1QUJA 2AIXA 2XX8A 4MBPA 3MVXA 2A5SA 1JW5A 1WDNA 2Z23A 2G93A 3N6TA 1SDXA 1B6HA 2UVGA 1B0HA 1H76A 3TTKA 4R9FA 3TDJA 3IOWA 3FJ7A 1SD3A 3MBPA 4C1UA 3E9XA 3ZKKA 2ZYMA 5ICTA 3HPIA 3ZKLA 4LATA 1EZOA 3MPKA 2YJPA 3RUMA 4OFLA 3TCHA 4EF1A 4NF6A 1R1NA 1LFIA 2VD2A 1MQJA 4XXUA 4QSEA 3CFLA 1M5DA 3MVZA 1QULA 3TZAA 4G68A 4PFWA 4DXCA 1R9LA 1URSA 1USYH 2XXYA 3CG1A 3PPQA 3S9EA 2XXIA 4OFOA 4PFTA 1ZKBA 4U1OA 4Z0IA 2O68A 4DXBA 4PFUA 4U22A 1XS5A 4NTLA 1FCKA 2PMSA 1WVJA 4ELRA 1OVBA 1B5IA 2FYIA 3S4UA 5KZTA 1IXIA 3EPEA 1PC3A 4H0WA 3IAZA 4FJPA 1GGGA 2XXRA 3VFJA 3RN8A 4R6YA 3DM0A 3M3LA 3OO7A 3S2VA 3KJTA 3PPOA 2QS1A 4RA1A 3O6HA 4H5FA 1MQDA 4KQPA 2Y7KA 3QK6A 1JQFA 3VXBA 2ZNUA 3OD7A 3K00A 5DT6A 1B3HA 3VXCA 4NWDA 1UIUA 1LAGE 3BBRA 4U21A 3T96B 4GLIA 3OEKA 4GL8A 3OSRA 1P1QA 1AIVA 2OJTA 3H7MA 4ZDMA 4OESA 4R75A 3GZGA 1Y9UA 1USYE 1B52A 3FUZA 1TWYA 3LSFB 4H65A 4BDOA 4I8CA 4WEDA 3H6TA 4YU0A 2NVUB 2I4CA 3I5OA 2G29A 3Q29A 5H8NA 4PP0A 2DVCA 3CRBA 1URGA 1OLAA 1UTHB 4OMBA 3FVKA 3K6UA 1LSTA 1O7TA 4QFPA 3EQ1A 1MPCA 4LA9A 3OO9A 2QL3A 1Q1KA 3H6VA 4F19A 2RF1A 3B6QA 1B51A 2I49A 1AMFA 4FAJA 1GTKA 3VVFA 3PUZE 3RTFB 5F7VA 3HO7A 5CMMA 1QKAA 2D3IA 3T9VA 3RTWB 4F1VA 3KN3A 5JTYA 1IUDA 4YICA 2I58A 1A54A 3IX1A 1MH4A 3LSXA 4POWA 3W15C 5H8QB 4M4GA 4KFQA 2F5XA 1TXFA 4H1XA 4QRZA 1MY1A 3FGSA 1FTJA 1IEJA 2H5YA 5H8HB 3U94A 3RQTA 3PPRA 1N84A 4IO2A 4MF3A 5AA2A 1VE4A 4F1YA 4IB2A 4MLQA 5FTHA 3TKDA 2VOZA 2UVIA 3CVGA 3MUQA 4YMAA 4H8JA 4IO5A 3T66A 2H25A 3T93B 4NF5B 3MWBA 5HPQA 3A3UA 4N6PA 3TFLA 3D4CA 3ONMA 1M5EA 2DWJA 1SYHA 5H8QA 3HHFA 4UA8A 2GHAA 2PYYA 5FTIA 1FQCA 5H8HA 2VHAA 4ECFA 4LONB 2HXWA 1P1WA 2XXHA 3C31A 3OO6A 1H3DA 3R7XA 3G7WA 1IITA 5DVFA 5I84A 1ZMGA 3K0VA 3IK6B 1BTJA 2NOOA 2QPQA 3F11A 4C1TA 2B65A 1S50A 5TP9B 4XKQA 1IZ1A 2Z8EA 3K2DA 5CI5A 3DELB 1ANFA 3SEXA 1HSJA 4YKPA 4F2OA 4EF2A 3ILUB 5JEIA 4I1DA 2R71A 2ALUA 1LBCA 1FTMA 1MS7A 4YB5A 3CI8A 3H3GA 1JEUA 1XVXA 1B05A 3FJMA 5HBCA 1UTBB 3Q25A 3GLBA 1XHYA 2NUVA 3K1MA 2Q8JA 4ZEFA 3HN0A 2R6GE 3T9XB 2F36A 4C0RA 1UIVA 4R73A 5ISUA 2O1MA 3TTRA 3RT6B 3FVGA 4YKJA 4LZ8A 5I2KB 5KDTA 3OENA 1MY4A 1LGBC 1JETA 4H8IA 3EHUA 1BKAA 3KN7A 5LOMA 3SDFA 1ZTYA 4GVOA 2RC7A 2XX7A 3RGYA 4FEDA 2I0CA 4XIGQ 1LCFA 3H03A 2I3WA 3TODA 3C4MA 1OMPA 4ZEKA 2XHDA 4OEUA 1YAEA 1R6ZA 4G2ZA 3MZ1A 4ND9A 5EYFA 3WAFA 4DDDA 3CSBA 1MXZA 1NKXA 2DE4A 2Z8FA 3I6VA 4JWOA 2D5WA 3EHTA 4BDLA 1Z7ME 3PMVA 3C9HA 3E4RA 4NF4A 1P1OA 5L8DA 4KHZE 4RK2A 3B7DA 4ISUA 3B6WA 4MLVA 3C34A 5AA4A 1I6QA 3U93A 4EXKA 1J1NA 3QSLA 4X1DA 3TCFA 5FHMA 4GOTA 5DTBA 3O28A 2XXTA 4ESXA 3V89B 3OXNA 4NMYA 5I2NA 1IIWA 3MZ9A 5L9OA 3SEYA 4HCWA 1H43A 3FVNA 1L5TA 3FV1A 2Y7RA 1O64A 2PX1A 3SEVA 5I59A 2DYXA 3H06B 4H6DA 3OO8A 4QHQA 4E0XA 4AB6A 4WEPA 4ONYA 1YPNA 1ELJA 4DLDA 3IB1A 4QSDA 3MP8A 5ELVA 2RINA 1FQFA 4GF8A 4F1UA 3SKPA 5I57B 3CR9A 2KLFA 1B46A 5L9SA 1GVCA 2QS3A 1A99A 1DTGA 5FHOA 2PT2A 1SQYA 1PB9A 4G8MA 4F3SA 1WODA 2DWIA 2F34A 3ILTB 3PUVE 1D4NA 1DPPA 1POY1 3EF7A 2XXXA 1B9JA 1A7LA 5CMKA 1LAHE 3USDA 1B4HA 1P1UA 2VD3A 3O29A 3PV0E 1MDP1 4O3CA 3VVDA 3VV5A 1PDAA 4UACA 1BLFA 1N04A 1FTLA 2UXAA 1FTKA 1QJMA 1DSNA 2O7UA 4F39A 2F6PA 4ZEIA 1JVYA 1D3KA 3RY3A 4EQBA 4BDRA 4ZECA 1MQGA 4JSOA 5L9MA 3MVWA 4IO4A 1EH3A 4KCCA 2V3UA 4HW8A 4R72A 4JBZA 2ZNTA 4K3FA 1RYOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HFBA 2B4MA 1VSOA 2F7CA 2PCRA 1I6AA 4DXUA 1RKMA 5JK4A 1SW4A 1H45A 4WKMA 2HQ0A 4JVIA 1GV8A 4YB6A 2H9BA 2P0SA 5I56B 3TYHA 2GRVA 2ABHA 1NH8A 1EYIA 3PGFA 3IB0A 1B1HA 4MFIA 2PVUA 4DZ1A 4MIJA 1N0TA 4O8MA 3FJGA 4PE5B 3Q26A 1OVTA 1RDZA 4Q5TA 3E78A 1NV2A 4KYEA 3TQLA 2PBWA 1DMBA 1MXWA 2XWIA 4MX6A 4ZE9A 1GR2A 4ZZAA 3SETA 4E0WA 2Z22A 4OFJA 3IB2A 1H44A 3EKIA 3SERA 1IMEA 3EHSA 3UORA 1AWBA 2CEXA 2O6AA 2M8CA 1FW0A 2CMOA 2Q8MA 1IMFA 3P7IA 1B2HA 1FQDA 3PU5A 4OXVA 4X48A 1A8FA 5I56A 2OWTA 3K4UA 2V3TA 4BLAA 3FXUA 1IMCA 5I3SA 3U72A 2ONSA 3D4GA 3IOUA 2ZZVA 1ATGA 4LN5A 1KA1A 1FQBA 2F78A 4QSCA 2DXYA 2VP1A 4F22A 1Y4TA 3UN6A 1Y1MA 1LBVA 3KSJA 3KGCA 3UA8A 1UTHA 1ZBMA 3RYDA 3KC0A 1MXYA 4R2FA 1DBZA 3C33A 4MH5A 4NF8B 4YB7A 2RC9A 2NWJA 4I3EA 4WXJA 2KQZA 5DVIA 1LBBA 3LR1A 1MH3A 2PT1A 3HV1A 1QVSA 3K01A 3Q28A 4PE3A 4HS7A 2CZLA 2Q9TA 1BK4A 1Y1ZA 4PDHA 2Y7PA 3N6UA 1OIBA 3TCGA 4GD5A 2DP8A 4KYDA 2PFZA 2P1SA 5M2VA 3B50A 1LEVA 2XX9A 2DVZA 4N6DA 2DOJA 5B7DA 2QS4A 1MQHA 4GXAA 3BFTA 2ONKE 1JEVA 2Y5LA 1IXGA 4FBPA 1EYJA 4XKPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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