4RJZA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, an open conformation
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
VTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, Target EFI-510558
rcsb
source organism Agrobacterium fabrum
molecule tags Transport protein
molecule keywords ABC transporter, substrate binding protein (Sugar)
total genus 126
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rjzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rjzA02
1UQWA 4TLMB 4O3CA 1M5FA 2H25A 1I6AA 2O1LA 2YJPA 2ZYOA 4G77A 4KFQA 4R6HA 3MJNA 1EU8A 1P99A 3OOAA 4GXSB 1PBQA 4I1DA 5L8DA 5ITPA 3PD8A 1IZ1A 4LQ2A 3C9HA 1B5HA 1M5CA 1O63A 4QFLA 5KDTB 4KYSA 3USDA 4R2FA 3TMGA 1D4NA 1XVYA 3CFZA 2GRVA 3KEIA 4PQJA 2VD2A 5AA4B 3DM0A 1IUDA 1Y3PA 3QK6A 4KHZE 2PVUA 4NF8A 4P0IA 3S9LC 1RYXA 2GFEA 2UYEA 3A3UA 2QRYA 2O69A 1TFDA 5L9MA 1ELJA 2G93A 2I0CA 2Y7IA 3D4GA 3HPIA 3TELA 4AQ4A 4EUOA 1FQEA 4F29A 1R9LA 4C1UA 4F2QA 1SYHA 3IO4A 3MVZA 3A09A 2V3TA 2A5TB 4GFRA 3WAFA 3IK6B 4ELQA 4FAJA 2O68A 4U1OA 4F39A 2I58A 2V93A 3TTMA 3TUSA 2WKYA 4ELOA 5CMKA 1QUIA 2RC7A 4QFKA 4R9GA 2E1SA 3QAXA 2OCUA 2QMWA 1P1OA 1H43A 3KN7A 1MQDA 3LSWA 3OSRA 2NUVA 1A8FA 3KSXA 3V8XB 3PD9A 4KYEA 4EXKA 1A54A 3H6VA 3HHGA 1LFIA 4ZDMA 4NF4A 1ZIUA 3OO8A 5IAIA 1MQGA 2F78A 3BFTA 3RQTA 3TKDA 1RYOA 1UTHA 3QIMA 1I6QA 3A3CA 1MPBA 2NOOA 1SVXB 4UA8A 1JEVA 4AB6A 1A55A 1FQCA 1Y1MA 3K6XA 3CIJA 1IQ7A 3RGYA 5CMBA 3EHTA 3HO7A 3OELA 5B70A 2HCAA 3M3LA 2Z23A 4JSDA 4BDNA 2R9JA 3QXMA 4ZE9A 1B46A 1VE4A 4OEVA 5TP9A 3ZKKA 1IXHA 4RPNA 4GWOA 2ZNUA 3MVYA 5AA2B 5CM6A 3VFJA 1UTBA 4YICA 4YKKA 3I5OA 1NNFA 4IO4A 2UYFA 5J1DA 1S9TA 2AL5A 1US5A 2XHDA 3IB0A 3K6WA 4X1BA 4ZEDA 1MY0A 2H4IA 3HCQA 3HHFA 4PE5B 3M3KA 3SEXA 4ZECA 2VGQA 2DSFA 3R7XA 3K4UA 3UGWA 4I62A 3CSBA 4BDOA 5KCJB 4R6KA 1Y4TA 2Y7WA 3GBAA 5DEXA 2F8DA 1QULA 3VVFA 1B6HA 2M8CA 3GBBA 1DOTA 1LAHE 1PB7A 1P1QA 3UP9A 1FTKA 3PUWE 4F1VA 2VHAA 4FECA 4GLIA 4NEDA 1GGGA 3W9WA 2OWTA 5H8QB 4ECFA 2AIXA 1PEBA 1XS5A 2PYYA 4OFJA 5IKBA 4F3SA 3EQ1A 5I2KB 2DP8A 4H5GA 4HCYA 3SEWA 3TTLA 1O7TA 3O6HA 2Z8DA 2OBGA 4F1YA 3Q28A 1D9YA 4Q0CA 4OYVA 2CMOA 2F6PA 4GOTA 4MLQA 4WXJA 2DXRA 1Y20A 3KZGA 3RT6B 3VLUA 3SEYA 2P1SA 4F3GA 2P0SA 1ZTYA 3E9XA 4GXAA 3PMWA 2XXPA 2F7BA 2O7UA 4QFOA 5FHMA 4G4PA 2H9BA 2UVJA 2I4BA 4YB5A 3T66A 3T9XB 5TPAA 2XX7A 3PPPA 4LQ5A 1LB8A 5FTIA 3TZAA 1MM7A 5LOMA 4E0XA 1LCFA 3O28A 4JWOA 4BDMA 1H3DA 1EZPA 4BDLA 2KLFA 1SW4A 1EZOA 4QSDA 4OETA 3I3VA 1NNTA 2P2AA 4LONB 3PUYE 3S9EA 1JVXA 1J1NA 4OZ9A 5I56A 1Y4CA 4ISUA 2I49A 3K6VA 4OVJA 4RJZA 3VV5A 1B3LA 4H8IA 1T0KA 4NF5A 1PBPA 1QUKA 1FQDA 3LBSA 2OJTA 5F1QA 3C33A 4FEDA 4H5FA 3C4MA 2O6AA 4XKNA 3CG3A 2I0BA 2O1MA 1QKBA 3G3HA 5DVFA 1SW2A 3V5AA 3H4ZA 4GF8A 3O9PA 5HBCA 4OWDA 5I58A 1SW1A 2LAOA 4ZZAA 3H3GA 1NKXA 4RA1A 4F3PA 2DYXA 3B6WA 2DVZA 3RY3A 3D4CA 4U4SA 2PT1A 3O29A 4DIGA 4FATA 2XXIA 5H8NA 4H1XA 3CFXA 3MZBA 4C0RA 5AA4A 2F36A 2A5TA 2X7QA 3H03A 2RC8A 3PU5A 3JV9A 4EQ9A 2RCBA 2I48A 2F5XA 4RYAA 1LFGA 3IAZA 3UORA 1MH3A 4JWXA 1D9VA 2ZMBA 3LUYA 1B1XA 4YB6A 4BDRA 4KQPA 1IIWA 1SI0A 4NF8B 1FTLA 3K01A 1IXCA 1CB6A 3F11A 4IO5A 2F7CA 4NF6A 4U4XA 3RLFE 5A5XB 5H8FA 1B4HA 3U93A 1Y3NA 3FASA 3ZSFA 1WDNA 2R71A 2OZZA 3G3GA 5ICTA 4HW8A 2Q88A 1MXYA 4H65A 1FQFA 4LZ8A 3PPOA 4XKRA 1MY1A 1KWHA 3MUQA 3VXCA 1N7XA 4IY5A 1EZ9A 2I3VA 4LUBA 2XD2A 4FORA 3EHSA 2DWAA 2HAVA 3MC2A 4G68B 5DVIA 2HQ0A 5ITOA 1GV8A 3T22A 1Q1KA 1SI1A 4DXCA 2VD3A 2XX9A 4F2OA 3IB2A 4HCWA 1Y1ZA 3FJMA 5ISUA 3E13X 2QS4A 1HSLA 1M5DA 2H98A 3B6TA 2I4CA 3KJ7A 2THIA 4U21A 5DTBA 4MBPA 3TCFA 2DS9A 4ZEBA 3GZGA 1JQFA 3RN8A 2FYIA 3RNNA 4LVQA 3UK4A 5I57A 2Y7KA 1DSNA 1AMFA 3MPKA 4I8CA 1B5JA 4N07A 3N5LA 3S2VA 4NF5B 1ANFA 1URSA 5EYFA 1UIUA 2ALUA 3L6HA 5H8HB 3WAEA 2XXUA 4BDQA 3VDFA 3G3KA 4X1DA 4OQOA 3JZJA 2ZYMA 1H76A 2DOJA 2REJA 5F7VA 1ZJLA 3BKIB 2V84A 3HSTA 3OO6A 5DEXB 3IL1B 4F1UA 1OQGA 4O3AA 4R9FA 4K3FA 2Z8FA 5H8NB 2HZKA 4DXBA 3Q26A 5CI5A 1B1HA 5HM4B 4NE4A 3T9HB 1R6ZA 2V3QA 4DXUA 2GH9A 4M1VA 1OLCA 1QW0A 2O84X 1YAEA 5FHNA 1NH7A 1IXIA 3BBRA 5M2VA 4RK9A 5JK4A 4GQOA 4TLLB 4U23A 4JB7A 1N84A 3T96B 1QUJA 1MRPA 2GHAA 3FGSA 3S9MC 1B0HA 3FXQA 1POY1 3KJTA 2DWHA 1B32A 1JW5A 1JEUA 2B3BA 2RCAA 3CVGA 4GL0A 1FTJA 1FTMA 4X9TA 1LBBA 4Q30B 4XKQA 3RT8A 1LAGE 4QSCA 1IITA 3ZS6A 3DP6A 3PPRA 4H6DA 5KZTA 1A99A 4NWCA 4LZ7A 1D3KA 5H8FB 5CMCA 1Z7NE 2HAUA 4EQ7A 4KPTA 2ZYKA 3IOWA 1N3XA 1MXZA 1B4ZA 1JW4A 4XIGQ 1N7WA 1FCKA 1Q35A 2PT2A 1H44A 3MP8A 3HV1A 2H99A 4Q8RA 4YMAA 3VVDA 3QUJA 5AA2A 4R74A 2XXQA 5TPAB 4QRZA 1DPEA 1B3FA 3FJGA 1R9QA 4PFWA 4F3BA 2Y7RA 4H0WA 4OMBA 2PBWA 3TAJA 3VLWA 4UACA 1B05A 1IEJA 1PDAA 3G3JA 3KOTA 1JW1A 3TDJA 3UN6A 2XXRA 4GRKA 2REGA 1R1NA 2Q2CA 3IOTA 4RY1A 3ILUB 3IO6A 4XKPA 4THIA 4WKMA 1L5TA 3SEUA 4PFTA 1URDA 5CMMA 1A8EA 2Q9TA 3K1NA 3RPWA 3ZKLA 1MQIA 1OLAA 1POTA 2OWSA 2ZNTA 2XXVA 5I2KA 5CRYA 1SDXA 3KFMA 4HTGA 4R75A 4U1ZA 5EHSA 1FQBA 1SD3A 1B7ZA 1NFTA 1NH8A 1TXFA 1MDP1 3M3FA 4G68C 4I9DA 3KSJA 3K00A 2CZLA 3N6UA 3TTRA 5JTYA 1P1WA 5I84A 4WEDA 2AL4A 3OO9A 3FIRA 2RKMA 1QJMA 2X7PA 3IB1A 4POXA 3H06B 2PMSA 5AE4A 2R6GE 4TQUQ 4N6PA 3TTNA 3MVWA 1B9JA 1Z7ME 4ZZEA 1ATGA 3H7MA 3H6WA 4AB5A 2Y84A 5KCJA 1US4A 1B52A 3U72A 5CBRA 3OMBA 4JBZA 1MPDA 4ZS9A 2GHBA 3IX1A 4OEUA 3MZ9A 4LP2B 2XXXA 3IORA 3OO7A 1XC1A 2DXYA 1MY3A 1NMUA 2IA4A 3Q25A 4IGRA 3TYHA 4G8MA 2G29A 4GIZA 4L17A 4TOZA 1LSTA 4KD5A 3QSLA 4RNSA 2HZLA 4KYDA 3TCHA 5AA2D 3KN8A 3B7DA 2XXYA 4ESWA 3MP1A 3SETA 1XVXA 4EDPA 4OTEA 1DPPA 3SDFA 4Q5TA 1NL5A 4ONYA 2NVUB 3P7IA 4RXLA 2RF1A 1Y3QA 3OSQA 1BIYA 2QS1A 4PFUA 4ZEFA 4ELPA 3FVOA 3MW0A 1NNKA 1LBCA 1N04A 1UTHB 3MWBA 3QUFA 3KN3A 4FJPA 2QJEA 1DTGA 5I56B 4LZ5A 4R72A 4JDFA 2V3UA 5A5XA 1YTVA 2FNCA 4F31B 2VOZA 4G68A 2DQVA 3U92A 2DE3A 3IOUA 3CFLA 5JEIA 2D3IA 3OD7A 3PV0E 4C1TA 2HXWA 2UXAA 2UVHA 3R6UA 4OFLA 4OXVA 1VFEA 4NWDA 2D5WA 4PFYA 2RINA 2B65A 3EHUA 1XHYA 1BKAA 1MXWA 3IJOB 4KR5A 2W7YA 2F6GA 3C35A 3LR1A 1PB9A 1GTKA 4FE8A 2Z8EA 3TCGA 1HSEA 5BWJA 4DE8A 3O97A 3FXUA 2F97A 1MM6A 3C32A 1VR5A 1MG1A 4PP0A 5H8HA 3TFLA 1JVYA 1TFAA 4DCXA 4MLVA 4FEBA 5I57B 1AIVA 2DVCA 3OEMA 4NMYA 1B3EA 5JTYB 4X48A 3FD3A 3Q29A 1EH3A 4IY6A 5ELVA 4EF1A 5K2XA 1FTOA 4E0WA 1LGBC 3VXBA 2O7IA 3FJ7A 1ZLQA 2DWIA 1QKAA 2E0SA 1LAFE 3LSLA 1TT1A 3HN0A 2ONSA 3CI8A 3FXRA 3MBPA 1LB9A 3T93B 3MZ1A 1B51A 1B0LA 1UIVA 3MAMA 5AA3A 1GVCA 1MXVA 3H6UA 3O66A 4DDDA 4ND9A 3MQ9A 3C36A 3MVXA 3MPLA 3N94A 3PUXE 4G2ZA 3LSXA 4G8NA 1QVSA 2ZNSA 2ESNA 1B2HA 2QS2A 4KCCA 3TPAA 1P1NA 1AH5A 4Z7EA 1ZMGA 4EXLA 3K02A 2F35A 3N26A 4DLDA 3EPEA 1B7UA 1OVBA 2DE4A 1OQHA 3G3IA 1A7LA 3K6UA 3OENA 4HS7A 4POWA 1RKMA 5DYHA 3VE1B 4ZE8A 2X26A 3K0VA 3KG2A 4YZZA 1B3HA 3O6GA 1WODA 2B3FA 2UVIA 2XX8A 3THIA 3OXNA 1MQJA 1MY4A 2IEEA 3V89B 4DZ1A 4OHNA 2ONRA 1AL3A 1B5IA 3KBRA 4F18A 2F7AA 3ODBA 3FVKA 4N13A 1N76A 5DVJA 2ZXTA 5FTHA 4ZEIA 4GVOA 5K2YA 1II5A 2RC9A 3SKPA 5I2NA 5TP9B 1I69A 1MXXA 3QYTA 3C34A 5ICQA 3G3FA 5CC2A 1XOCA 2QMXA 1SW5A 4R73A 1DTZA 4EF2A 1MPCA 1LFHA 3LSFB 4F19A 4IO3A 2ABHA 2ONKE 3E4RA 3L6GA 3T9UA 3K1PA 4M4GA 5B7DA 5CBSA 1M5EA 1MDQA 4IGTA 4LA9A 1SYIA 4KI0E 4R6YA 1LLSA 1H45A 5I59A 1CE2A 1B3GA 3LC8A 4IB2A 4KCDA 4OESA 4FIMA 2Z22A 5H8SA 5FHOA 4G8HA 1YCJA 2Y7PA 2QSXA 1FW0A 4YU0A 2ZYNA 3CSGA 3SESA 3TQLA 4MFIA 4MF3A 1WVJA 1OMPA 3IOVA 2NWJA 3K1MA 1BTJA 1ZBMA 2HEUA 5AA1A 3U1OA 1M5BA 3N6TA 3FVGA 4RK2A 2DE2A 2OLBA 4QFNA 1MY2A 3M8UA 3Q27A 1MS7A 3RUMA 2DWJA 1B58A 1BLFA 3PUVE 4IO6A 3SERA 3ECRA 5I59B 3SEVA 2XD3A 3RTWB 4Z0IA 2FA7A 4JXIA 4XXUA 3TEPA 4F22A 2QPQA 1HSJA 4R2BA 3RTFB 5BUUA 2OK2A 3TTKA 2XXTA 1UTBB 1PC3A 3DP4A 4WEPA 1TWYA 1LCTA 3G7WA 5L9OA 3IJXB 2XXWA 5I2NB 4QHQA 1N0TA 2QS3A 2VP1A 3V83A 3B6QA 3UIFA 2AYSA 1MQHA 1ZU0A 2A5SA 5H8QA 4YKIA 4BLAA 1SQYA 1BP5A 5L9SA 1USYE 4GL8A 3FZVA 5TU0A 1MXUA 1FQAA 2F34A 3FVNA 4JWYA 4U22A 4LATA 4OERA 1A40A 2XXHA 2YPNA 2BJJX 4YB7A 4EQBA 1XT8A 2HFBA 3AXFA 3K2DA 3DP8A 4O3BA 5DT6A 3IR1A 3S4UA 3FATA 3O6IA 2I3WA 1SBPA 2Q89A 3FUZA 3S9NC 1O64A 4NF6B 4NTLA 3H6TA 3PMVA 4PETA 3C31A 3E3KA 4DCYA 4H67A 1AOVA 2NXOA 1N3WA 1P1UA 4QFPA 3FV1A 3TQWA 1B7HA 5I58B 1F9BA 1OIBA 3PUZE 4QSEA 1S50A 4QF9A 3UA8A 3JYRA 3OEKA 5EHMA 3W9VA 1OVTA 3EN3A 2YLNA 2V25A 3I6VA 3FV2A 4P11A 4YKJA 2UVGA 1I6BA 4IO7A 4XTCQ 5HPQA 3T9VA 2D21A 1ZKBA 1JETA 1GR2A 1NNPA 3DELB 1B40A 3TODA 1USYH 3MP6A 4P0GA 3ILTB 1S7YA 4YAHX 3GXAA 1MH4A 3EF7A 1VFDA 3PPNA 4GD5A 3U94A 3KGCA 2Q8JA 4YMBA 4ZEKA 1VSOA 3PMXA 4OFOA 3GLBA 1DMBA 1PB8A 1URGA 4MH5A 4ESXA 3PPQA 2I6EA 4NF4B 4OENA 1YPNA 1Y9UA 3KOSA 2PX1A 3U8QA 3DLNA 1JNFA 3R26A 4H8JA 4U2RA 4YKPA 3CG1A 2QL3A 3CR9A 4JSOA 4ELRA 2O51A 2ANJA 3VVEA 3BFUA 3VLVA 2H5YA 4IO2A 5KDTA 2Q2AA 3O2AA 3W15C 3CRBA 3PGFA 3ONMA 4RPOA 1IXGA 1LAXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TLMB 4O3CA 2YJPA 5L8DA 3OOAA 1PBQA 4OANA 4LQ2A 1O63A 4PF8A 2GRVA 1IUDA 4KHZE 4NF8A 1RYXA 2UYEA 5L9MA 2QRYA 4N8YA 1TFDA 3TELA 1ELJA 3D4GA 2I0CA 4BDRA 3T0JA 4EUOA 1R9LA 4C1UA 2V3TA 4ELQA 3IK6B 3TUSA 1QUIA 1IMCA 3KN7A 3LSWA 1MQDA 3KSXA 4KYEA 1A54A 3HHGA 4ZDMA 1RYOA 1UTHA 1I6QA 3A3CA 1Y1MA 3CIJA 4QXDA 5ET7A 4BDNA 4ZE9A 4OEVA 3MVYA 4N6DA 3VFJA 4YKKA 2PFYA 1NNFA 2UYFA 1S9TA 2XHDA 3M3KA 2DSFA 4BDOA 2PFZA 4R6KA 1Y4TA 2F8DA 1QULA 1B6HA 2M8CA 3GBBA 3UP9A 1P1QA 1FBFA 4GLIA 2AIXA 5IKBA 2DP8A 4H5GA 2Z8DA 3PTYA 2OBGA 5I3SA 2XXKA 2CMOA 2F6PA 4GOTA 4MLQA 2DXRA 3KZGA 3E9XA 3PMWA 5FHMA 3T66A 2I4BA 2XX7A 2QVUA 4BDMA 1EZPA 4BDLA 1NNTA 2P2AA 1NI9A 3FXBA 3VV5A 1B3LA 4NF5A 2FIEA 5F1QA 4FEDA 2I0BA 2O1MA 4GF8A 3O9PA 4ZZAA 3H3GA 4H46A 3RY3A 3D4CA 4HE0A 4U4SA 2PT1A 3O29A 2XXIA 3IFAA 4C0RA 2X7QA 3H03A 3JV9A 2F5XA 3FBPA 4JWXA 3LUYA 1IIWA 1SI0A 4NF8B 2R8TA 4U4XA 1IXCA 3F11A 4IO5A 3FASA 2R71A 5ICTA 3PPOA 1KWHA 1NUYA 3MUQA 1N7XA 4IY5A 1LBVA 4FORA 5ITOA 4G68B 1Q1KA 2XX9A 3E13X 3KJ7A 3RN8A 3CHGA 5J16A 5I57A 3S2VA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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