4RJZA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, an open conformation
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
VTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ABC transporter, substrate binding protein (Sugar)
publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, Target EFI-510558
rcsb
source organism Agrobacterium fabrum
molecule tags Transport protein
total genus 126
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rjzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rjzA02
3ODBA 1MM6A 4U23A 4U21A 4N13A 4R74A 2ONRA 3RLFE 2I6EA 3L6HA 1MRPA 1PEBA 2DS9A 1B7UA 3MVWA 3FXRA 5H8NB 2D3IA 2V84A 2V3TA 3PD8A 5DTBA 4OERA 4AQ4A 4ZEFA 3VVFA 2ZMBA 1B9JA 4ZEBA 1YAEA 4XKRA 4GXSB 4Q0CA 3M3KA 4ZEIA 3LSLA 1VFEA 2XD3A 3O9PA 4FJPA 2Z8EA 3S9MC 2OBGA 1L5TA 2H25A 2FYIA 1AOVA 4NMYA 2E1SA 2NUVA 1ANFA 3CFLA 3FJMA 3K00A 4OFJA 2GHAA 3BBRA 4R72A 1URDA 2B65A 3O2AA 3S4UA 3MJNA 1ZIUA 2REGA 1R9QA 4QFLA 1MY0A 4DXCA 1I69A 3RNNA 4U1ZA 1M5FA 1LFGA 2P0SA 4KI0E 2XXWA 3V8XB 2I0CA 4LA9A 4EQ9A 3UIFA 1MY4A 3MC2A 1FQAA 3H06B 4X9TA 4F18A 5FHNA 2QMXA 4LUBA 3W9VA 2PVUA 3KSXA 4GQOA 1D9YA 4O3AA 3P7IA 3LUYA 4QFNA 3TAJA 2OWSA 1GTKA 4HTGA 2F36A 3CG1A 4XTCQ 1DPEA 3RT6B 3U72A 1N84A 3T9UA 1EZPA 3I3VA 1MXVA 2BJJX 2QPQA 5IKBA 3TCFA 1B6HA 4E0WA 3PUZE 3KOSA 1BTJA 1B4HA 1PDAA 4YMBA 1MQIA 3N5LA 2O7IA 2HXWA 3FJGA 4TLLB 1URSA 4C0RA 1ZKBA 3IORA 3C4MA 3GZGA 1MS7A 2X7PA 1N76A 1O7TA 4ND9A 2ZYMA 5DVIA 2Z8DA 2D5WA 2XHDA 1FTJA 2QMWA 2NXOA 4LVQA 5DVJA 2F7CA 3KFMA 3GXAA 3G3FA 3N26A 2XXTA 1IQ7A 3K0VA 5CMCA 4YMAA 4TQUQ 1IXGA 1LB9A 4PETA 3EF7A 2QJEA 1JVYA 4GVOA 1Z7NE 1UIUA 1Q35A 3GLBA 3K02A 4X1BA 1S7YA 3CFXA 3HPIA 3HV1A 3VXBA 1OMPA 4OVJA 4NE4A 4G4PA 3KBRA 1QKAA 3K6XA 4ZZEA 3DP6A 5L9SA 2O7UA 3LSFB 4G2ZA 3GBAA 3FXUA 3FVNA 3QSLA 2ZYKA 2UVHA 1Y1MA 4GOTA 3G3GA 1CB6A 4OTEA 5TPAB 4KPTA 2LAOA 3TPAA 3TELA 3Q25A 1B7HA 3MP6A 4WXJA 3IB1A 1DTGA 3Q29A 2DYXA 5JTYA 3MW0A 3A09A 5KCJB 3B6QA 1IITA 3W9WA 5CRYA 1SYHA 2HAVA 3EPEA 2DXYA 2XXVA 5A5XB 2F6GA 1B40A 3KG2A 3ZKLA 4DXUA 2O69A 2I3WA 1B2HA 3Q27A 3M3LA 4H5GA 3C34A 3DM0A 3MPLA 3S9NC 4IB2A 1FTKA 4JSOA 1PBQA 4NF8B 3CSGA 4GL0A 1LAGE 3VE1B 3RGYA 3TQLA 2DQVA 2YPNA 3KEIA 3IOVA 4EXKA 3WAEA 3IO6A 4R6HA 1LB8A 3UN6A 3N6UA 4YB7A 3IB2A 3TZAA 1AMFA 2Y7WA 3OD7A 4F22A 1ELJA 4Q30B 3V89B 4FAJA 1IEJA 2H4IA 1XS5A 5CBSA 2V3QA 3G3HA 4BDOA 4MLQA 4OQOA 3EHUA 3AXFA 2XX8A 5AE4A 1IZ1A 2ABHA 2GH9A 3B7DA 1US4A 1NMUA 5AA4B 3LBSA 4H8JA 1MH4A 1IUDA 3PUVE 1I6QA 3M8UA 2XXHA 3IK6B 3KN8A 3QAXA 2HCAA 2Q9TA 1DOTA 3FUZA 4LZ7A 4POWA 4BDQA 1TFAA 4YKIA 4LQ2A 4PQJA 1YTVA 4OMBA 2DWHA 5I2KB 1VFDA 4THIA 4QSDA 1N3WA 2OK2A 3ILTB 3EN3A 4ZZAA 2DOJA 3ECRA 2QSXA 3RTFB 3VFJA 4R9GA 1M5BA 3U94A 2UVJA 5CMMA 1II5A 3IO4A 4DIGA 2F97A 4EF2A 4P0GA 3TTKA 2UVIA 2QS3A 2XXPA 4ZDMA 3CR9A 4F31B 1QW0A 4Z7EA 3SESA 4IO5A 3K01A 3MWBA 4OXVA 4KQPA 3O66A 4ESXA 3A3UA 2F5XA 5I56A 4F2QA 4F2OA 2R6GE 2HEUA 1QJMA 3PUWE 1GV8A 2A5TA 4KYSA 4YKKA 1US5A 5H8FA 3OEMA 3U93A 1NNTA 3CSBA 4H5FA 2XX9A 3HN0A 5ELVA 5I57A 1XVYA 4X48A 2P1SA 1A8FA 3ZSFA 5L8DA 2CMOA 3S2VA 5F7VA 2G29A 2XXQA 4GFRA 1M5CA 4M4GA 4NF5B 2HAUA 1B1HA 4HCYA 4YKPA 1A7LA 4NTLA 3T66A 3H6VA 4YKJA 5JK4A 5B7DA 1N04A 3TTLA 3HSTA 1OLAA 4L17A 1YPNA 2Q89A 1GR2A 1Y3NA 3FGSA 3H6UA 4XKQA 5I59B 5H8HA 1CE2A 5H8QB 1OQHA 1TT1A 4YICA 3KOTA 1MDQA 4LONB 3K6UA 3MVYA 3G7WA 4MLVA 1MQJA 4NF6B 3IJOB 3ILUB 2M8CA 1MY1A 2RCAA 1DSNA 3DP8A 2XXRA 1SQYA 4DXBA 4H0WA 5I58A 4ONYA 3RY3A 2RCBA 4RY1A 3SEWA 3EHSA 1MY2A 2I3VA 2GRVA 4GD5A 4QFPA 4GWOA 5EYFA 2F34A 4G77A 1POTA 4WKMA 1P1NA 2H99A 3O29A 3OMBA 1LAHE 1B3LA 5CBRA 5AA2A 3SEVA 1LAXA 5K2XA 1B4ZA 1FW0A 4OZ9A 3K4UA 1SD3A 1ZLQA 3K6WA 3SEYA 4OETA 3T93B 1JW4A 1SW5A 4PP0A 4RK2A 4MF3A 5H8NA 2VHAA 2Q2AA 1HSLA 1BIYA 1BLFA 4KR5A 2B3BA 4JDFA 4NF4B 4XIGQ 3SERA 1M5EA 2NWJA 3IR1A 3TKDA 3TCGA 5L9OA 3SEXA 3TTRA 2HFBA 4P0IA 1UTHB 1AH5A 1QULA 3HHGA 1NH8A 1GVCA 3S9EA 4RYAA 4R6YA 3KN3A 5BWJA 3B6WA 2CZLA 3CVGA 3VVDA 1Y3QA 1AL3A 1B5JA 3D4CA 4WEDA 2RINA 1MQHA 1D4NA 4ELOA 2DSFA 4KYEA 3RT8A 1FTLA 4RPOA 1QVSA 4NWDA 2REJA 4RA1A 1AIVA 3O6GA 3FZVA 3PGFA 4OESA 4KHZE 4LP2B 3UGWA 5I2NB 1ATGA 3MBPA 5DEXB 1XT8A 3N94A 2VP1A 5JEIA 3PPPA 5AA3A 2A5SA 2F7BA 2ONSA 1JQFA 1SW1A 3IOWA 4QSEA 5ISUA 4N07A 4HS7A 1FTOA 3IB0A 3RPWA 4POXA 3QIMA 2XXYA 1N3XA 1MM7A 4R2BA 1A8EA 1SDXA 3WAFA 3K1PA 5FTHA 2X7QA 2UVGA 3JV9A 1R1NA 2V3UA 2H98A 1XC1A 3I6VA 5HBCA 5CC2A 3PMXA 4ZS9A 1NKXA 4G8HA 5AA1A 4G8NA 4QSCA 4F1UA 4NEDA 4U22A 5M2VA 1MPBA 2DE4A 4U1OA 1FQDA 2O68A 1RYOA 4UACA 3QUJA 1B51A 2ZXTA 1UIVA 2QS4A 5ICTA 5TP9B 4ELRA 3MPKA 3EQ1A 3KZGA 5ICQA 1O64A 1WVJA 1UTBB 4F3PA 1TXFA 3SDFA 4BDMA 1NL5A 4WEPA 1POY1 2B3FA 3K1MA 4PFYA 3K2DA 3KGCA 3D4GA 3PMWA 1FQCA 3OENA 1BP5A 3OEKA 4FIMA 4OEUA 1RYXA 4HCWA 3OOAA 3R7XA 1B32A 1Y3PA 1P1QA 3K6VA 4DZ1A 3K1NA 2I4CA 1B52A 5DYHA 2DVCA 1H3DA 4EDPA 3G3KA 1WDNA 1SW4A 3HHFA 1ZJLA 3M3FA 3SETA 4JWYA 2V93A 3DP4A 1HSJA 4EF1A 1I6AA 3G3IA 4JXIA 1PB7A 4F1YA 4ZECA 2RKMA 5CMKA 2KLFA 5DT6A 3TUSA 2R9JA 4X1DA 1FQBA 1LFHA 3B6TA 1MDP1 2XXUA 3DLNA 5TPAA 2F78A 2HZKA 3C35A 1YCJA 1H44A 5KZTA 3R26A 5B70A 3MVXA 4QFOA 5K2YA 3MZBA 4XXUA 3C33A 1Y9UA 3MQ9A 1SBPA 4PFTA 1M5DA 3JZJA 3O97A 1Q1KA 5F1QA 5KCJA 2Q2CA 1JW1A 1OQGA 2F8DA 4K3FA 3IAZA 1USYH 3SKPA 1SI1A 3GBBA 4G8MA 5A5XA 4BDRA 1JEUA 5I56B 1Y4TA 3LC8A 2FNCA 4YAHX 2VD3A 4FATA 2O6AA 3FATA 4I62A 4KD5A 5DVFA 2D21A 4JB7A 2Y7RA 3USDA 5KDTB 3TODA 4DE8A 2RC8A 2Z22A 5BUUA 4NF8A 3QXMA 3RN8A 3BFUA 1B05A 1N7WA 2PBWA 1J1NA 1DPPA 1NNFA 3W15C 1TWYA 4QFKA 2OZZA 1JNFA 4C1TA 3IOUA 1SW2A 1B0LA 2I0BA 3MVZA 3Q26A 3TTMA 1LBCA 4EXLA 4F19A 3UA8A 3IJXB 4O3BA 1MXWA 2UYEA 1QUJA 3MZ1A 1SYIA 2IA4A 4GLIA 2DWIA 1XVXA 2I58A 2DE3A 2PT1A 2GHBA 4F29A 3FVKA 5CM6A 1I6BA 1R6ZA 2HZLA 2ONKE 1HSEA 3VV5A 3MP1A 2VD2A 3LR1A 3FIRA 1H43A 2Z23A 4R6KA 4YU0A 2H5YA 4LQ5A 1ZMGA 1MQDA 2RF1A 3HCQA 2RC7A 1B3HA 4ELQA 2Q8JA 3TYHA 4N6PA 2OJTA 3EHTA 4FE8A 4JSDA 4F1VA 4QHQA 2QL3A 5AA2B 5I2KA 5HM4B 1S9TA 3FASA 3IL1B 3MP8A 2O84X 2ZYOA 1LFIA 4R73A 2R71A 4IY5A 3FXQA 3CIJA 4IGTA 4LZ5A 2DP8A 4DCXA 2DXRA 2PX1A 4I8CA 1MXUA 1IXIA 3FVOA 1ZBMA 4R9FA 1JETA 4DLDA 3E13X 4RJZA 3RTWB 2YLNA 5CMBA 2AL5A 4XKNA 4EQ7A 4ZE9A 1FTMA 1PBPA 3QYTA 4PE5B 4F39A 4IGRA 4OFOA 5AA2D 3IOTA 2PT2A 5ITPA 1FQFA 1LAFE 4G68A 1B46A 1MPDA 2VGQA 1XHYA 4JWXA 3QUFA 5EHSA 4O3CA 2O51A 2DWJA 2AIXA 3KN7A 3O6IA 4H65A 4R75A 1DMBA 4BLAA 5TU0A 1FQEA 1LGBC 1EH3A 4NF5A 4H1XA 1OLCA 4JWOA 1ZTYA 3PD9A 4FEDA 3T9VA 3ONMA 4E0XA 5H8SA 2W7YA 3PV0E 1GGGA 1D9VA 3T9HB 1P99A 5CI5A 2XXIA 4GF8A 5I59A 3H4ZA 4KYDA 1PB9A 5H8QA 1FCKA 2F35A 3PPOA 1RKMA 1EZOA 1SVXB 2NVUB 3TFLA 3OO8A 4FEBA 4NF6A 3E9XA 1A55A 1A40A 3TEPA 1Y1ZA 5ITOA 3I5OA 4FORA 4ISUA 3OXNA 1B5IA 3JYRA 2RC9A 1LLSA 1B1XA 2Q88A 3TCHA 1JVXA 4ESWA 4QRZA 3OELA 4OFLA 5I84A 4MBPA 2VOZA 1MXXA 1MXZA 1MY3A 1B0HA 1B58A 4RXLA 1VE4A 4IO2A 1H45A 3CRBA 2XD2A 3HO7A 3CFZA 3U92A 4KCCA 1NNKA 1A54A 4OENA 2ZYNA 1P1UA 4KCDA 3BFTA 3G3JA 3H3GA 3KJ7A 4BDNA 3PPRA 4IO3A 2AYSA 1T0KA 1OVBA 4IO4A 3DELB 1SI0A 4UA8A 1NH7A 1JW5A 4U4SA 3V83A 2UYFA 3FD3A 3CI8A 2NOOA 4TLMB 1PC3A 3O28A 1OIBA 5JTYB 2PYYA 4NF4A 4H67A 3VDFA 2OLBA 1B7ZA 1DTZA 3TDJA 4HW8A 4LZ8A 1UTHA 2QS1A 3QK6A 2YJPA 4OEVA 3MZ9A 4RPNA 1EZ9A 3CG3A 1PB8A 4YB6A 3A3CA 3N6TA 4H6DA 3VLUA 3FV2A 1N7XA 2DVZA 1B3EA 1H76A 3FVGA 1UQWA 4OHNA 4OWDA 2ALUA 3E4RA 4F3SA 3T22A 3U1OA 1WODA 4ELPA 4C1UA 1KWHA 4YB5A 2Y7IA 2I48A 4PFWA 1A99A 4DCYA 5I2NA 4U2RA 1MQGA 3VLVA 3OO9A 3ZS6A 1EU8A 5DEXA 4NWCA 2UXAA 1B3GA 2E0SA 1XOCA 3VVEA 3MAMA 2V25A 2ZNTA 4XKPA 1P1WA 4EUOA 3T96B 3KSJA 2DWAA 3UK4A 4RNSA 4Z0IA 4ECFA 2IEEA 3FJ7A 5LOMA 2GFEA 4FECA 4JBZA 3R6UA 3U8QA 2AL4A 3C32A 4F3GA 1QUKA 2H9BA 1F9BA 1JEVA 3OO7A 4G68C 1B3FA 4TOZA 3RQTA 4P11A 4BDLA 3S9LC 3OSQA 2ZNSA 1MXYA 3TQWA 1OVTA 2PMSA 4GRKA 2WKYA 1URGA 2Y84A 2Y7PA 2HQ0A 2QRYA 2XXXA 3PUXE 4GXAA 3IX1A 4YZZA 4R2FA 5FTIA 3C9HA 1S50A 4GIZA 4ZEKA 2F6PA 5HPQA 3PU5A 1ZU0A 3LSWA 5TP9A 3MUQA 3L6GA 2I4BA 1NFTA 1UTBA 3T9XB 1TFDA 4GL8A 4AB5A 3VXCA 4ZEDA 3OSRA 2I49A 1IIWA 3OO6A 3Q28A 1NNPA 1LCTA 2X26A 4OYVA 4IO6A 3O6HA 2G93A 4MH5A 3ZKKA 4Q8RA 3PPQA 3F11A 3C36A 4EQBA 3FV1A 2A5TB 1R9LA 3PUYE 5H8FB 1B5HA 1D3KA 4RK9A 5I57B 2O1MA 3UP9A 4I1DA 4M1VA 4Q5TA 2ESNA 1MH3A 4I9DA 5FHMA 1VSOA 5L9MA 3H6WA 4DDDA 1Z7ME 1VR5A 2DE2A 3PPNA 2OCUA 1USYE 4LATA 3E3KA 5J1DA 3H6TA 1O63A 1MPCA 2P2AA 2FA7A 5EHMA 3V5AA 3H7MA 5H8HB 1IXHA 3H03A 4H8IA 1N0TA 4IO7A 4MFIA 2ANJA 1Y4CA 2THIA 1LCFA 3BKIB 3PMVA 3LSXA 1MG1A 1QUIA 4ZE8A 1QKBA 3VLWA 4F3BA 3RUMA 5AA4A 2QS2A 2O1LA 4IY6A 4QF9A 1BKAA 2F7AA 3C31A 1IXCA 5I58B 3SEUA 1P1OA 2ZNUA 2Y7KA 4AB6A 3TTNA 4G68B 1LSTA 4U4XA 2Z8FA 1LBBA 5KDTA 2XX7A 1Y20A 5IAIA 2OWTA 4PFUA 4KFQA 3KJTA 5FHOA 3UORA 3TMGA 3THIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ODBA 1MM6A 4U23A 4U21A 4N13A 4R74A 2ONRA 3RLFE 2I6EA 2WYKA 3L6HA 1MRPA 1PEBA 2DS9A 4G61A 1B7UA 3MVWA 3FXRA 5H8NB 2D3IA 2V84A 2V3TA 3PD8A 5DTBA 4OERA 4AQ4A 4ZEFA 1NI9A 2Q8MA 3VVFA 2ZMBA 1FPEA 1B9JA 4OANA 1YAEA 4ZEBA 4XKRA 4GXSB 4Q0CA 3M3KA 4ZEIA 3LSLA 1KA1A 1VFEA 2XD3A 3O9PA 4FJPA 2Z8EA 3S9MC 2OBGA 1L5TA 2H25A 2FYIA 1FBEA 1AOVA 4NMYA 2E1SA 2NUVA 2L5VA 4HE2A 3ISPA 3U65A 1ANFA 3CFLA 3FJMA 3K00A 4OFJA 2GHAA 3BBRA 4R72A 1URDA 2B65A 4PAFA 3O2AA 3S4UA 3MJNA 1ZIUA 2REGA 1R9QA 4QFLA 4IR8A 1MY0A 4DXCA 4GX4A 1I69A 1BK4A 4GWWA 2QFLA 1G0IA 3RNNA 1FBFA 4U1ZA 1M5FA 1LFGA 4O7IA 4OVTA 2P0SA 2P3NA 4KI0E 2XXWA 3V8XB 2I0CA 4LA9A 4EQ9A 3UIFA 1MY4A 3MC2A 1FQAA 3H06B 4X9TA 1DBZA 4F18A 5FHNA 1IMDA 2QMXA 4LUBA 3W9VA 2PVUA 3KSXA 4GQOA 1D9YA 4O3AA 3P7IA 3LUYA 4QFNA 3TAJA 3KC1A 2WX9A 2OWSA 5ESYA 4NHBA 1GTKA 4HTGA 2F36A 3CG1A 4XTCQ 1DPEA 3RT6B 3U72A 1INPA 1N84A 3T9UA 1EZPA 3I3VA 1MXVA 1LBYA 2BJJX 2QPQA 5IKBA 3TCFA 1B6HA 2PCRA 2ZZVA 4E0WA 3PUZE 3KOSA 4DI3D 1BTJA 1B4HA 1PDAA 4YMBA 1MQIA 3N5LA 2O7IA 2HXWA 3FJGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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