1MY0A

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 100 nm brw)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my0A01
2UVHA 5DEXB 1GR2A 3LUYA 1HSJA 1PB7A 4FORA 3G3HA 1FQEA 3RQTA 4P0GA 3OELA 1VR5A 3G7WA 3G3JA 4R74A 5ISUA 3S2VA 1UTBB 4OETA 1ZU0A 4MBPA 3UN6A 3PMXA 2OLBA 2PX1A 3O97A 4ZDMA 2XHDA 1S7YA 4YB7A 2ZYKA 3BFTA 2F8DA 4GOTA 4YKPA 3DLNA 3K6UA 3T66A 3K02A 2W7YA 1A99A 3OO7A 1PB8A 4NWDA 4KYDA 5FHNA 4Q8RA 1ZLQA 3MBPA 3K1PA 2ZYMA 1OVBA 3Q28A 4AB5A 4ZECA 2IEEA 3B6WA 4JBZA 5H8QB 2F6GA 4ZE8A 1B9JA 2PVUA 3KSJA 3PPOA 2THIA 2ONSA 2UYFA 2R9JA 2UVGA 1UIUA 3K01A 1ZMGA 1Y1MA 2H99A 4XTCQ 2O1LA 3KN8A 2XXHA 1TWYA 5I58B 4LQ5A 4F3BA 1URDA 1A54A 4Q0CA 3KJTA 3MVYA 4G68A 3I5OA 5DVIA 2HXWA 2Z8DA 3FV2A 1Q1KA 1I6BA 3WAEA 4GLIA 4JWXA 1ZBMA 1LAXA 1SDXA 2D5WA 3MZ9A 5AA4B 1UTHA 4YKJA 3QK6A 1H43A 1QUKA 4MLVA 4GQOA 2XXYA 5TPAA 5ITPA 3DM0A 1Z7NE 4TLMB 1JEVA 3U1OA 1ZKBA 5H8HB 2PYYA 4YMAA 3ONMA 4QFLA 3G3FA 3C35A 3T22A 1FQBA 3OO9A 1XVYA 3EHTA 1N04A 3K4UA 4PP0A 3PV0E 3O66A 1EZOA 3L6GA 2ABHA 3MVXA 4ZS9A 3S9LC 2QJEA 4X9TA 2Q2CA 1FTLA 4H6DA 2HZLA 5H8NB 4JWYA 3RTFB 2V25A 4N13A 1JETA 4TLLB 1M5BA 4ESWA 2GHAA 4OQOA 4YZZA 4EDPA 3TTLA 5I56A 4HTGA 1WODA 3S9EA 3O6GA 4R73A 2H25A 4KPTA 3MPKA 4IGTA 3H6VA 4GWOA 1OQGA 4QFOA 1QKAA 4O3BA 2IA4A 4ECFA 4LVQA 1MG1A 3PUWE 3K6VA 4QRZA 4YMBA 3G3IA 1DTGA 3CR9A 3RNNA 2RC7A 1QW0A 4GIZA 2HAUA 2DSFA 2HAVA 4KYSA 4U4SA 2OWTA 2CMOA 1LB8A 1MQDA 3H3GA 1BIYA 3MPLA 1SYIA 4G4PA 2NVUB 3TTKA 1A8FA 3E13X 1B6HA 3N94A 1EZPA 3MP8A 5L9SA 5H8FA 3U94A 2AIXA 3QUJA 5ITOA 1R1NA 2KLFA 2P0SA 1MH4A 3EHSA 4RPNA 1BTJA 3IR1A 1H3DA 5L8DA 3MW0A 2DP8A 1I6QA 1OLAA 1NNFA 1N76A 2UVIA 5TU0A 1XHYA 5JTYB 1S50A 3IB0A 3MVWA 4ELPA 1SBPA 1RKMA 4PFYA 4Z7EA 3TEPA 3K1NA 1R9LA 2Y7WA 2OZZA 4FEBA 2Y7IA 2NUVA 3H6UA 3RPWA 2VD3A 3OEMA 5FTHA 3IOUA 4NE4A 4KQPA 5CMCA 2G93A 3KOSA 4Q5TA 4G68C 1OMPA 5DVJA 4YB5A 3LSLA 1EZ9A 2F7CA 1YCJA 3C33A 4E0WA 4G8HA 2QMWA 1FTMA 4H0WA 2HFBA 1MM7A 4NF5A 4KCDA 4QFPA 1P1NA 4K3FA 5F1QA 4EXLA 3B6TA 3LBSA 2I6EA 4EQBA 1FQFA 1XT8A 2DVCA 1Y4CA 5CBSA 4ISUA 4U23A 1UQWA 1B4HA 3H7MA 4DXCA 4H5GA 5KCJA 2I4CA 3IK6B 2XX7A 3QSLA 2DXRA 1PDAA 3IOVA 1H44A 5I57B 4HS7A 4EXKA 3CRBA 3KZGA 4PFTA 1ATGA 1EU8A 3GBAA 3BBRA 2RCAA 4XKRA 3PUYE 1POY1 3H6TA 1J1NA 1P1QA 2I58A 4G8MA 4MF3A 1LAHE 4R6HA 2AYSA 2RCBA 2QPQA 1URSA 3C36A 1LFIA 3S9MC 1MPBA 3R6UA 1LAGE 5CRYA 3O6IA 5HBCA 3KEIA 3FXUA 4ZEBA 2F35A 2DWIA 4N6PA 3I6VA 3SEYA 3ILUB 5CM6A 4OTEA 3A3CA 1DPEA 1ZTYA 2QS3A 3S9NC 1MXUA 3ZKKA 3HN0A 2XXUA 2DYXA 4POXA 2NOOA 2F97A 4FIMA 2CZLA 2OK2A 3CSBA 4WEPA 5I2KA 3UORA 1M5DA 1Y3QA 3TMGA 2I49A 2DXYA 2HZKA 3TPAA 3MUQA 5ELVA 1LGBC 5A5XB 1PC3A 4FAJA 3ZS6A 2I0BA 2Q2AA 2E0SA 3KGCA 4NTLA 2PBWA 3L6HA 3UIFA 3LSWA 2ZMBA 4ONYA 5EHMA 3IO4A 4OMBA 5KDTA 3UK4A 2P1SA 5J1DA 3U93A 4X1DA 4IO3A 1AH5A 1LB9A 4H8JA 3FGSA 3GXAA 1VFEA 3H06B 4IO7A 3K6XA 3SEWA 5CMBA 4ESXA 3GBBA 4IO2A 1QUIA 1SI1A 4HCYA 3QIMA 2DE4A 3EHUA 4H67A 2I4BA 2RC9A 4BDOA 5I59A 1DPPA 2XD2A 1SYHA 4M4GA 3IOWA 4I8CA 3SEVA 3O6HA 4QF9A 3ILTB 1LSTA 4OXVA 2F6PA 2Z8EA 1VSOA 4YB6A 4IB2A 3M8UA 3C4MA 4O3AA 1MPCA 2B65A 1B7UA 3TTMA 1QUJA 3ECRA 1MQGA 3VFJA 1M5EA 1B3EA 3CG1A 2QSXA 1B3GA 2DWAA 1QVSA 3LSXA 2YLNA 3N6UA 3MP6A 4YAHX 4R9FA 1IUDA 4R2BA 5IAIA 5ICQA 2I3WA 3TODA 3H6WA 3TQLA 1US4A 2DE2A 2ONKE 2F7BA 4ZZEA 1JVXA 1N7XA 2YJPA 2ANJA 3N5LA 1US5A 3QYTA 3IJOB 5CMKA 4NEDA 1Q35A 2Q8JA 3GLBA 5M2VA 5FHOA 3TKDA 4BDQA 5AA3A 4PQJA 3TTNA 1O64A 4F3SA 4GD5A 3FJMA 5DEXA 1B0LA 3K00A 3A3UA 3PGFA 1SI0A 1SW5A 2R6GE 1MXZA 4JSOA 2HEUA 2DQVA 4KFQA 2X7QA 5AA2D 3HV1A 2F34A 2D21A 1H45A 4U2RA 3FVGA 4G77A 1UTBA 4OYVA 4BDNA 1PB9A 1P1UA 2F5XA 4RK2A 3K6WA 3KN7A 2XX9A 1MQHA 4R6KA 3HO7A 2VP1A 5HPQA 4OFOA 4NF6B 1DOTA 3KOTA 4YU0A 3KJ7A 3MAMA 2HCAA 1GGGA 2PMSA 5AA2B 3KFMA 4OWDA 5KZTA 4ND9A 1ZJLA 1A8EA 1FQCA 3CFZA 1B52A 2DS9A 4NF4B 3TZAA 2V3QA 5EYFA 3VVDA 3TCFA 1IXGA 5H8QA 2AL4A 2XXQA 5TP9B 1PBPA 1B3FA 1MXVA 3A09A 3T9VA 5AA1A 3FJ7A 1P1WA 3CSGA 1Y20A 3Q26A 3D4CA 2NXOA 4MH5A 3C31A 3JZJA 3MZBA 5I58A 1MRPA 3SEXA 4AB6A 3KN3A 4P11A 2E1SA 2DE3A 3TELA 1ZIUA 2O68A 1NNPA 3K1MA 2V3TA 2XD3A 2OJTA 4EQ7A 5JK4A 2Q89A 5L9MA 2RC8A 2I3VA 1Y3PA 5AA4A 3CG3A 4FATA 4OEVA 1MM6A 1QKBA 3R7XA 5F7VA 1PEBA 4KD5A 3HHGA 4HCWA 4ZEFA 4X48A 2F36A 1D9VA 1USYH 4JB7A 2UXAA 1MQIA 1LBCA 4U4XA 4XXUA 2LAOA 3ZSFA 3MQ9A 5H8HA 4OFJA 1HSEA 4MFIA 5LOMA 4QSEA 3E4RA 2XXTA 4JWOA 4OERA 4RJZA 3VV5A 2XXXA 4N07A 3O2AA 2QS1A 4DCXA 4NF8B 5CC2A 2OBGA 1F9BA 2GH9A 3BKIB 1O7TA 1R6ZA 2G29A 3M3KA 3E3KA 3QXMA 3P7IA 3LR1A 3RGYA 2Y7KA 3HCQA 1DSNA 4F2QA 1JEUA 3PD8A 5BWJA 5H8NA 1GV8A 1EH3A 2R71A 3OOAA 1XOCA 4XKNA 3FJGA 1P1OA 3LC8A 3GZGA 3TQWA 1N0TA 1HSLA 1SQYA 4GXAA 1B7HA 4GL8A 3VLVA 3T93B 5I2NB 2H9BA 4R6YA 3MP1A 3FXRA 3QUFA 1T0KA 4GRKA 4DIGA 2GFEA 4R9GA 3KG2A 1IXCA 4F19A 1MXYA 4AQ4A 4IO5A 4P0IA 2YPNA 2O51A 4PFWA 1LFHA 4DE8A 3OEKA 4U21A 2REJA 2XXVA 5L9OA 3SDFA 5JEIA 1NKXA 2Y7PA 2VD2A 4U1ZA 2GRVA 4PETA 2OWSA 3M3FA 3IAZA 3TAJA 2VGQA 2FNCA 2QRYA 2VHAA 4LZ7A 2O69A 1GVCA 1TFDA 4LZ5A 4LONB 3VLWA 4FECA 5B70A 3TFLA 1MY4A 3TYHA 1NNTA 3Q29A 2A5TA 2Q88A 3VLUA 1B51A 3U72A 3W9WA 2ESNA 1LAFE 3C34A 2PT2A 3ODBA 1VFDA 1Y4TA 4F31B 1B1HA 4F3PA 1JW1A 4KI0E 1MH3A 4IY5A 4R75A 4OZ9A 1NH7A 3THIA 4BDRA 5JTYA 3C32A 3PPNA 3IO6A 3CI8A 1FTJA 4EF2A 3OSQA 1FQDA 4POWA 3F11A 2WKYA 1B1XA 3H03A 4LZ8A 4YKKA 4JSDA 1M5CA 1Z7ME 3B6QA 4H1XA 3M3LA 4WXJA 1JVYA 1DMBA 4F22A 4Z0IA 1AMFA 2O6AA 1ANFA 2XXIA 4QSDA 4YICA 3G3GA 3UP9A 3V83A 4G68B 4F3GA 4DZ1A 3RTWB 4RY1A 2ZXTA 3TUSA 2UYEA 4QSCA 5B7DA 5AE4A 1NL5A 3E9XA 1B7ZA 3CVGA 1A40A 4XIGQ 3PUVE 1UTHB 3Q27A 4F1YA 4ZEDA 4OFLA 3IB2A 5TPAB 5DTBA 4QFNA 1SW1A 2DWHA 3VVFA 4F2OA 1MY2A 2XXWA 1FTKA 2V84A 4OENA 1TFAA 5I57A 5DT6A 3RT8A 3U92A 2QMXA 3DP6A 3FV1A 4FE8A 4GXSB 3KBRA 1N7WA 1AOVA 4F1VA 3LSFB 4UA8A 4IGRA 4GVOA 2H5YA 4LA9A 3EPEA 3PPRA 4F39A 3RUMA 1IIWA 3O29A 4U1OA 3RY3A 1POTA 4KCCA 5IKBA 3W15C 4KHZE 4ZZAA 3UA8A 2DVZA 2ZYNA 1FQAA 1UIVA 1URGA 2O7UA 2O1MA 2I0CA 2Q9TA 1D4NA 4E0XA 3MC2A 3OENA 4MLQA 3VXBA 4GL0A 3Q25A 1NMUA 3CIJA 4DLDA 1R9QA 4XKPA 3IB1A 1I6AA 5CMMA 3MJNA 1WVJA 3IL1B 5I56B 3VVEA 4NMYA 1DTZA 4GF8A 4TQUQ 1B3LA 2BJJX 3IJXB 3MZ1A 5FHMA 2XX8A 4LQ2A 3O28A 1N84A 3H4ZA 1YTVA 5CI5A 3B7DA 5A5XA 1JQFA 4G2ZA 4IY6A 1B4ZA 2GHBA 1CE2A 3UGWA 4RXLA 4IO6A 4OEUA 4RNSA 3MWBA 4THIA 3TCHA 2HQ0A 3QAXA 3PMVA 1RYOA 1MPDA 3VE1B 3I3VA 4I62A 1B5IA 3FZVA 1XC1A 4OVJA 1N3XA 1MS7A 1II5A 1I69A 1JW5A 3OO8A 1LCTA 2A5SA 2P2AA 2D3IA 5BUUA 3PMWA 2REGA 1MY0A 1SVXB 2AL5A 4Q30B 3WAFA 5H8FB 1SD3A 3FD3A 3MVZA 4OHNA 4UACA 4DXUA 4ZEIA 5DYHA 1ELJA 1YAEA 2Y7RA 4L17A 1B3HA 4GFRA 3TDJA 4EF1A 4BLAA 3EQ1A 1IXHA 1OQHA 1FTOA 5ICTA 3TCGA 3VXCA 4IO4A 3FIRA 1MY3A 1QULA 4LATA 4EQ9A 1B2HA 4ZEKA 1A55A 1AIVA 1CB6A 1LBBA 2I48A 4H8IA 4QHQA 4ELOA 1XS5A 1BLFA 5K2YA 2FYIA 2O7IA 3OSRA 2FA7A 2XXPA 1OLCA 4XKQA 1MDP1 4M1VA 3SKPA 3FASA 4KR5A 3S4UA 4NF5B 1FW0A 1FCKA 4ELQA 3RT6B 4JXIA 3AXFA 5EHSA 1PBQA 1USYE 4NWCA 3K2DA 3PPPA 3VDFA 1BP5A 1SW2A 4FEDA 1LCFA 1JW4A 1LLSA 1A7LA 1YPNA 3OO6A 5KCJB 1B32A 2QL3A 2H4IA 3RLFE 3FVOA 1D9YA 1B58A 5FTIA 1MQJA 1GTKA 3PUZE 3U8QA 4NF6A 3KSXA 4H5FA 4DCYA 2A5TB 3ZKLA 1N3WA 2M8CA 4FJPA 1B46A 3R26A 4I1DA 3USDA 2RF1A 4RA1A 1TXFA 5AA2A 1KWHA 1IEJA 2H98A 4C0RA 2Y84A 3CFLA 4PFUA 3G3KA 4JDFA 4NF4A 4YKIA 2VOZA 2Z22A 1OIBA 3TTRA 3O9PA 4EUOA 1OVTA 3OXNA 5DVFA 1B5JA 5TP9A 3RN8A 2O84X 4O3CA 4RPOA 1IXIA 1TT1A 1B05A 4RK9A 1P99A 5CBRA 1IZ1A 3OD7A 3IORA 5K2XA 1MY1A 5HM4B 2QS2A 3HSTA 1O63A 2Z23A 2Z8FA 2OCUA 4HW8A 3CFXA 3DELB 4U22A 4H65A 4R72A 4OESA 3OMBA 2B3BA 2ALUA 3K0VA 5I2KB 1B40A 3IOTA 1H76A 2ZYOA 2DWJA 4I9DA 1IITA 1NFTA 3JV9A 3EF7A 4DDDA 4R2FA 2ZNUA 1M5FA 1S9TA 3FVKA 3DP4A 2NWJA 1Y3NA 4RYAA 3SEUA 1D3KA 2DOJA 3DP8A 5H8SA 1XVXA 1JNFA 5KDTB 3T9XB 3T96B 1L5TA 4DXBA 3V5AA 4ELRA 4F18A 3FVNA 3T9UA 2QS4A 4X1BA 1NH8A 1AL3A 3HHFA 3HPIA 1IQ7A 3T9HB 3V8XB 2X26A 5I59B 3BFUA 3SETA 4F29A 3PPQA 1WDNA 4NF8A 3JYRA 3SESA 4LP2B 1MDQA 1LFGA 3N26A 2RKMA 4QFKA 3N6TA 2ZNTA 3FXQA 3PUXE 1QJMA 1VE4A 1NNKA 4G8NA 4KYEA 2ZNSA 2V3UA 3W9VA 4C1UA 1MXWA 5I2NA 1B5HA 1SW4A 2ONRA 4LUBA 4WEDA 1Y1ZA 2PT1A 4BDMA 3C9HA 1Y9UA 3V89B 3D4GA 2F78A 3FUZA 2F7AA 2V93A 1B0HA 4ZE9A 2RINA 3IX1A 4F1UA 4C1TA 4TOZA 2XXRA 3PD9A 3FATA 4BDLA 3PU5A 2X7PA 2B3FA 4WKMA 5I84A 4PE5B 1MXXA 3SERA 1BKAA 1RYXA 2UVJA 3EN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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