1MY0A

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 100 nm brw)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my0A01
3R7XA 3HO7A 3GBAA 5KZTA 3WAFA 1ZLQA 1BTJA 3FZVA 4F2QA 4FECA 1Y3PA 3CR9A 2I4BA 3RN8A 1B5IA 2GH9A 4H6DA 3TTKA 4I1DA 4QFNA 4G2ZA 1O64A 2GFEA 1URDA 1D4NA 1MXWA 3UGWA 4ELPA 3A09A 1MXVA 3BBRA 1II5A 3G3IA 1WVJA 1H43A 3MZ9A 4NEDA 2H25A 1DMBA 4GIZA 1TT1A 4H8JA 4I9DA 4BLAA 2O7IA 1QJMA 2ZYOA 1XOCA 3FATA 4F1UA 3SEXA 2Z8FA 4OWDA 4ESWA 4GRKA 4F3PA 1B05A 4F3GA 3T93B 3FXUA 4F39A 3LBSA 2O1MA 3O28A 2DXYA 1RKMA 3O9PA 3MVWA 3VXBA 2A5TA 4ONYA 1ZBMA 5IAIA 1B0LA 3IO4A 4KQPA 2AYSA 3IK6B 2ZXTA 3IJOB 4KFQA 3ZKKA 5JK4A 3IB2A 5H8QA 4FE8A 2W7YA 4NF4B 4O3CA 4F22A 1ELJA 4KYEA 4DXUA 3FUZA 4IGRA 3M3FA 1PDAA 1OVBA 3TKDA 3B7DA 4KYDA 2XXTA 1N0TA 4NF8B 3S9NC 1SYIA 3S9LC 5I84A 3D4CA 2DS9A 2PX1A 5AA2A 2Y7KA 3QK6A 5TP9B 4IY6A 1WDNA 1Z7NE 4LQ2A 3PD9A 1ZTYA 4POXA 1MXXA 2DWIA 4FJPA 3H4ZA 3TTNA 1GR2A 5I57B 4RY1A 1US5A 4R6HA 2I0CA 4HCYA 3PUXE 1B0HA 3S2VA 1GGGA 5TPAB 3KSJA 1M5FA 1GV8A 4ZDMA 4JWYA 2DE4A 1FTOA 3O6HA 1USYH 1AH5A 3OENA 4YAHX 4YKIA 4Q5TA 3UA8A 2XX7A 4OERA 3CRBA 4WKMA 2I6EA 1MM7A 4EDPA 3IAZA 5ICTA 1LCFA 5L8DA 2QS1A 5M2VA 1USYE 1BKAA 4HW8A 1P1UA 2P0SA 2M8CA 3OXNA 3KN8A 1LFIA 4FORA 3SEWA 4YKPA 3Q27A 1Y3QA 5I2KA 5CMCA 2I0BA 4G68B 3TDJA 1YPNA 3G7WA 1Y4CA 3IOTA 5H8SA 1DSNA 2Y7RA 1Q1KA 2AL5A 3THIA 3SEYA 1ATGA 5AA4B 4R72A 1D9YA 2YJPA 1XHYA 4R9FA 3K6VA 3MVZA 2I58A 3PPOA 3LSWA 2RC9A 4DLDA 2DVCA 1IZ1A 3N94A 3PU5A 4TQUQ 1B4ZA 4O3BA 2G29A 3ZKLA 3MBPA 3MZBA 3OEMA 5EYFA 3LUYA 1LSTA 1A40A 5L9SA 1NNTA 5I56B 1FQBA 2XXUA 2DVZA 2NVUB 1VSOA 4G8HA 3IB1A 5I2NA 2Z23A 1DPPA 1EU8A 2ZYKA 3DM0A 2ALUA 4GXAA 3MVXA 2Y7IA 1AMFA 3QYTA 3RLFE 4I62A 3Q25A 3UP9A 4OTEA 4NE4A 4R9GA 4G8NA 4GD5A 4OQOA 2XD2A 2OK2A 3PUWE 2REJA 4PFYA 5AA3A 2XXWA 3GBBA 3VDFA 3QSLA 1S9TA 4IO7A 3QIMA 3TTLA 3MC2A 1AOVA 4GOTA 1PEBA 2XX8A 3P7IA 1A7LA 5AE4A 1SDXA 3HHGA 2XXPA 1DOTA 1IUDA 2ONRA 3MP6A 4OFLA 3SEUA 1YCJA 1Y9UA 1FTLA 3K2DA 3RTWB 1CB6A 1MQDA 1SW2A 4AB6A 3CVGA 3FXRA 5I58B 2REGA 2QS2A 1R6ZA 1FW0A 4OEVA 4F19A 3C36A 1IEJA 1FQFA 1JEUA 3N26A 4TLMB 5DEXB 5CC2A 2RCBA 4ZZAA 3OELA 2O7UA 3RT8A 3DP6A 4NF6A 4PETA 3VXCA 3FJMA 1NNFA 4ZECA 1LFGA 2ONSA 2KLFA 4PFWA 3N6UA 4NWCA 2LAOA 4RPNA 4YKKA 1M5BA 3TCGA 2R6GE 3AXFA 4JB7A 2UVJA 4F18A 1OQHA 1R9QA 1TFDA 2XXYA 4RK2A 3IORA 1TFAA 3K6WA 4JWOA 5L9OA 4IO6A 3T9XB 3CI8A 5DVFA 3TODA 5DT6A 4H5GA 2H5YA 5CBRA 2HXWA 2ZNTA 3ECRA 4MLQA 1NH8A 1FTKA 1SD3A 2F6GA 4NF5A 2DSFA 1P1WA 4EQ7A 2HQ0A 1S50A 1LAFE 3CIJA 3RY3A 4TOZA 2GRVA 4OZ9A 3L6GA 3ZSFA 1IXHA 2E0SA 2F34A 1JVXA 3H03A 2X7PA 4Q8RA 2WKYA 4ELOA 1MQHA 2H99A 1MY1A 2RCAA 4YICA 2A5TB 1OLCA 4BDOA 4QFKA 3K01A 1NNPA 4XKNA 4MLVA 1QUJA 5CMMA 4Z0IA 3FD3A 4ZEBA 1MQIA 3FVKA 5H8QB 1P1NA 1LAXA 2D5WA 3MP1A 1VR5A 3H06B 5DVIA 1IQ7A 1B3LA 1CE2A 3A3UA 1Y1MA 5K2YA 2F6PA 3C35A 3EF7A 1XC1A 3O29A 3PPPA 3DP4A 4LA9A 4FEDA 1QKAA 2FA7A 4OFOA 5AA2B 4JSDA 4QFPA 4UACA 3JV9A 4E0XA 3V83A 4LUBA 1I69A 1FCKA 5DYHA 4LZ8A 4THIA 1LGBC 4IY5A 2XHDA 3PD8A 3Q28A 2XXXA 1QVSA 3CFZA 4EXLA 5F1QA 3O6IA 5DVJA 4AB5A 1MY3A 5BWJA 1A99A 4U22A 4YB7A 3KBRA 4LP2B 3F11A 1XT8A 4QF9A 4P0IA 4YU0A 3K6XA 2NXOA 3VLUA 1XVXA 1OMPA 4LQ5A 4H1XA 5BUUA 2IEEA 4H65A 1BP5A 1UTBA 4HCWA 3SEVA 3C31A 4BDMA 3PUVE 4U4XA 4X1BA 3SDFA 3TELA 2CMOA 3U8QA 1MPCA 3T96B 1GVCA 3Q26A 5FHMA 4N6PA 3CG1A 1B3EA 3LC8A 2V84A 2ANJA 3K1MA 3B6TA 2HZKA 4OYVA 3C32A 2QPQA 1IXGA 4KI0E 1N7XA 4Q0CA 3EQ1A 4ISUA 5I2KB 4OVJA 2FNCA 4L17A 1D3KA 3G3JA 3JYRA 1I6QA 1XS5A 2PT2A 3K02A 3D4GA 2Y84A 2HAUA 4G4PA 3K0VA 5KDTA 3OO7A 1I6BA 3CG3A 3TCFA 1LFHA 2VD2A 4QSCA 4DXCA 5ITPA 3TZAA 3IR1A 3MJNA 3KSXA 1FQEA 2NUVA 3RTFB 3W9VA 4F29A 3PUZE 4IO3A 4BDQA 1MRPA 5L9MA 4GL0A 2QS3A 3PMVA 2I3VA 3U94A 2HCAA 2F7AA 3TQWA 5I2NB 1JNFA 5A5XA 1MQJA 1B3GA 3UIFA 3DELB 4H8IA 1I6AA 3TTMA 3KN7A 1SI0A 1EZPA 3K6UA 5IKBA 1POY1 1HSJA 4MF3A 1O63A 1Q35A 5FHOA 3LSLA 4BDRA 3IX1A 3L6HA 4EXKA 1A55A 3EN3A 1ZMGA 3MP8A 4R6YA 4FIMA 4R73A 4YKJA 2XXIA 3CFXA 3RT6B 3S9MC 5I59A 4NF4A 2OZZA 1Y3NA 2QMWA 2D21A 1P1QA 3TAJA 1MDP1 4LONB 2Q9TA 4JBZA 1LLSA 4ESXA 3HSTA 4PE5B 1Y1ZA 2R9JA 4NF8A 3FJ7A 2ZYNA 3M3LA 4ELQA 4I8CA 1MXYA 1SVXB 1QUKA 1T0KA 3E4RA 2CZLA 1B9JA 4OFJA 5ITOA 3H3GA 1AIVA 4NF6B 3KG2A 3VVEA 4GLIA 3KGCA 3MPLA 1UIVA 3K1PA 3DP8A 5H8HA 2DQVA 3U1OA 4NMYA 1FTJA 5HBCA 4X9TA 4H0WA 4KD5A 3B6QA 5KCJB 2XXQA 2NOOA 1Z7ME 5CRYA 2RF1A 1MS7A 4GL8A 1PB9A 5B7DA 2Y7PA 1EH3A 4OHNA 1QULA 3G3GA 3H6WA 4WEDA 2XD3A 4F1VA 2B65A 4H5FA 1LAGE 5H8NA 1B3HA 5CMBA 2HFBA 1MPDA 1NMUA 3QAXA 1ZIUA 4NF5B 3KJTA 2DE3A 3MPKA 2UYEA 3N5LA 2DYXA 3S4UA 1B7HA 4H67A 5JTYA 2QJEA 4RK9A 1FQCA 3U92A 1URSA 2DXRA 3MW0A 1QUIA 4XIGQ 4IO5A 1DPEA 2I48A 2V25A 4O3AA 4P0GA 2ZNSA 1Y20A 3BFTA 1DTGA 1P99A 1SW4A 4BDLA 1US4A 1QKBA 4OXVA 3E3KA 5H8FA 3KZGA 1UIUA 4XXUA 2DWHA 5CI5A 4C1UA 1LBBA 2H9BA 3E13X 2YLNA 4EUOA 3K4UA 2O68A 4EF2A 3G3HA 1NKXA 4JWXA 2R71A 4OMBA 2OJTA 2UVGA 1R9LA 1B1HA 3FVGA 4PFUA 4F2OA 3H6UA 1J1NA 1ZU0A 2AL4A 3G3FA 3OO6A 4RA1A 3RUMA 4TLLB 4X48A 1H3DA 5CMKA 2OWTA 5ELVA 3O6GA 3H6VA 4QFOA 2BJJX 3ZS6A 3ILUB 3HPIA 5ISUA 2ZMBA 1ZJLA 2F36A 3SKPA 3U93A 3IO6A 3TFLA 3OSRA 3VV5A 4R2FA 2DOJA 1M5CA 2V3TA 3VVDA 1BIYA 2O84X 4IGTA 3MQ9A 4WEPA 4KYSA 4G8MA 1H45A 3FASA 5FTIA 4AQ4A 1UTBB 4U2RA 5AA1A 3RPWA 3TMGA 1VFEA 1SYHA 4U21A 2RKMA 4GWOA 4RNSA 3OEKA 3C4MA 1B7UA 4ZEIA 3FV1A 4HTGA 3KEIA 3W15C 5FTHA 3TQLA 1B58A 1MQGA 2F8DA 3C33A 1TWYA 3ODBA 2H98A 3V89B 3O2AA 2I3WA 3UN6A 1B1XA 2OLBA 2OBGA 2Q2CA 1MY4A 4LVQA 1B32A 1N3XA 2RC7A 3H6TA 4LZ5A 4UA8A 3KN3A 5TU0A 4X1DA 3VE1B 2ESNA 3SERA 1B3FA 1PBPA 2VGQA 4OETA 1IXCA 3MAMA 1UTHA 4GFRA 4C1TA 1OVTA 4RJZA 3RNNA 2AIXA 1GTKA 3TYHA 4EF1A 4YB5A 2F5XA 3K1NA 1PB7A 5KDTB 4DE8A 4NWDA 4XKPA 3PMWA 2O1LA 4FATA 4C0RA 1DTZA 2HAVA 3TTRA 3CSGA 1RYXA 3K00A 2XX9A 1URGA 4ZEKA 3FGSA 2PVUA 1SQYA 3OD7A 3HHFA 5LOMA 2GHBA 4YMBA 2QS4A 4KPTA 4IO2A 1MG1A 2B3FA 3V5AA 2X7QA 3FV2A 3PPQA 1M5EA 2G93A 3R6UA 1B4HA 1JETA 1JW5A 5A5XB 3CSBA 4Z7EA 3I6VA 4ELRA 1MM6A 4KCDA 4QRZA 3T9VA 4M4GA 2A5SA 5CM6A 5K2XA 1FTMA 5HPQA 1JEVA 4HS7A 4PP0A 5AA2D 3IJXB 1IXIA 2IA4A 4KCCA 3OO9A 1D9VA 4OESA 3QUJA 1B46A 4F31B 2VP1A 1MXUA 1B7ZA 1AL3A 3BFUA 1IIWA 1B51A 3T66A 4XKQA 2ZYMA 2PBWA 4YMAA 2D3IA 5HM4B 3FVOA 5I59B 3U72A 2ABHA 3M3KA 1SI1A 3TCHA 1PB8A 1SBPA 4E0WA 3ONMA 3RGYA 2Q8JA 2RC8A 2F7BA 4JDFA 2F97A 1P1OA 2VOZA 4GF8A 3V8XB 4G68C 4OEUA 1N3WA 3PUYE 4IB2A 5FHNA 1IITA 1B6HA 2PMSA 1NNKA 2H4IA 1Y4TA 2VHAA 5CBSA 5H8HB 3SESA 3C34A 4GVOA 4XTCQ 1N76A 4QSEA 4EQ9A 4ZE9A 1B5HA 3M8UA 3OMBA 1PC3A 3I3VA 2Y7WA 2DWJA 2DP8A 4FEBA 4NTLA 3VVFA 4KR5A 4ZEDA 3GLBA 3UK4A 3VLVA 4KHZE 1NL5A 2Q89A 2PYYA 3IL1B 5H8NB 2ONKE 4MFIA 3MWBA 4LATA 3FJGA 4ZE8A 2UXAA 1LBCA 3VLWA 1JW1A 3QUFA 4U1ZA 3TPAA 2NWJA 3S9EA 1HSLA 2X26A 3QXMA 2YPNA 2UVIA 5JTYB 4Q30B 2QSXA 3N6TA 4BDNA 4RYAA 2V3UA 3T9HB 1A8EA 5TP9A 1LB9A 5DTBA 1TXFA 5JEIA 1NH7A 2I4CA 3RQTA 2UVHA 5H8FB 3USDA 1FQAA 4K3FA 2V93A 5I57A 4F3BA 4RPOA 2F35A 4DIGA 1MPBA 1MH3A 2RINA 4LZ7A 4ECFA 3R26A 3KJ7A 4ZS9A 5TPAA 1YTVA 1ANFA 4POWA 4F3SA 1L5TA 3OO8A 3FIRA 4GQOA 1MXZA 4R74A 1N84A 3HCQA 3O66A 3KOSA 4U1OA 4GXSB 4OENA 3EHUA 4QFLA 4ND9A 4WXJA 3E9XA 3FXQA 3OOAA 5J1DA 2HEUA 2GHAA 1YAEA 3B6WA 3ILTB 5ICQA 1B2HA 3HV1A 2O69A 4N13A 1RYOA 3A3CA 1JVYA 1VFDA 4R2BA 3GZGA 4DCXA 4YB6A 2B3BA 2XXVA 1VE4A 2OCUA 4EQBA 1N7WA 1FQDA 3I5OA 4DZ1A 2P1SA 2Z8DA 3H7MA 3UORA 2DE2A 4M1VA 2Q2AA 1B5JA 4PQJA 1S7YA 1EZ9A 2QRYA 3HN0A 2QL3A 4YZZA 1MDQA 4IO4A 1B52A 4G68A 1POTA 5EHMA 2O6AA 4F1YA 3MUQA 1F9BA 4MH5A 2DWAA 4DDDA 3OSQA 4QSDA 3LSFB 1MY2A 5AA4A 2UYFA 1H44A 4ZEFA 3T22A 4MBPA 2FYIA 4XKRA 3IOUA 4RXLA 1N04A 3VFJA 2F78A 3Q29A 3JZJA 4R75A 1WODA 3PPRA 3SETA 2PT1A 2THIA 3DLNA 3PPNA 1JQFA 3LR1A 3EPEA 1B40A 4DCYA 1LB8A 1LAHE 3PV0E 3TUSA 1SW5A 2VD3A 3MZ1A 4QHQA 3WAEA 5I56A 4DXBA 1UTHB 1EZOA 4U23A 1NFTA 4JXIA 3TEPA 4FAJA 2Z22A 3W9WA 2XXHA 3G3KA 4R6KA 3T9UA 5B70A 3IB0A 4P11A 2P2AA 1H76A 1PBQA 3CFLA 3BKIB 2F7CA 4G77A 5KCJA 3GXAA 1ZKBA 1BLFA 1HSEA 1MY0A 2I49A 1OLAA 1XVYA 2Q88A 3LSXA 2ZNUA 4ZZEA 1A54A 1O7TA 1QW0A 3EHSA 4N07A 3PMXA 1UQWA 2XXRA 2Z8EA 2V3QA 3FVNA 3KFMA 5F7VA 4JSOA 2OWSA 2E1SA 1R1NA 4U4SA 2QMXA 1SW1A 3MVYA 3EHTA 3C9HA 1OQGA 1LCTA 1MH4A 1OIBA 1JW4A 2O51A 1M5DA 1KWHA 5EHSA 3O97A 2HZLA 5I58A 3PGFA 3IOVA 3IOWA 4PFTA 3KOTA 1A8FA 5DEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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