1MY0A

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 100 nm brw)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my0A01
1N76A 2I0CA 3PU5A 4H65A 4JSOA 4PFWA 3ZKLA 2XXPA 2DS9A 4NWCA 2QS4A 3H6VA 4HTGA 3ZS6A 1LGBC 3KSJA 1H43A 2IEEA 3PPRA 4KYEA 1Q1KA 3IO4A 4FE8A 1DTZA 4H0WA 4RA1A 1IXIA 1GTKA 1SI1A 3LC8A 3VVEA 4E0WA 2I4CA 3PUXE 2AIXA 5DEXA 2VP1A 2XXHA 4LZ7A 4N07A 3K4UA 2XXXA 3CI8A 1FW0A 4FECA 4WEPA 1DOTA 1JQFA 5HBCA 3V8XB 3B6WA 2V84A 1MY0A 1LBCA 2DQVA 1B3GA 3OSRA 4G4PA 5EHMA 4R75A 4FAJA 4EF2A 4OHNA 3HHGA 3KN8A 5KZTA 1XVXA 1O7TA 3FVKA 3SETA 3FIRA 4R6HA 4ZEIA 2Y7KA 4EQ9A 2ZXTA 3MPLA 3FD3A 2F78A 1MXVA 4G68B 3LUYA 1Y1ZA 1QULA 1EU8A 2PVUA 1M5EA 3USDA 3FVNA 1FQDA 1LFGA 2DWJA 2RC8A 4IGRA 3KOTA 3KFMA 1P1OA 4ZE8A 1MDP1 3K0VA 3C32A 3T93B 2F6GA 3TKDA 5DYHA 4ZZEA 3U94A 4F1VA 5B7DA 1LB9A 3K1NA 3Q25A 4NF5A 4NEDA 4U2RA 3IX1A 4LA9A 1A40A 2Z8FA 5DT6A 5B70A 2ZNUA 4U23A 1LAFE 2UVGA 3IO6A 1YTVA 2WKYA 4R2FA 3H7MA 4YZZA 5AA2D 4GRKA 4DLDA 3PUZE 4YU0A 2H25A 4LZ5A 4LVQA 4JWYA 2Q88A 1ANFA 5L9SA 5DVJA 1MQGA 2XX8A 1QW0A 4F3SA 1BLFA 4F29A 1NMUA 4KCDA 1LCFA 1PB8A 2DXYA 2DVZA 4UACA 1QKBA 4XIGQ 1I6BA 1FTMA 4X1DA 1US4A 1PBPA 2X7PA 1LFHA 1GV8A 4YMBA 1UTHA 1FTLA 1N84A 3I3VA 1J1NA 5ITPA 3QAXA 3KEIA 4G8MA 4AB5A 1MXXA 4NF4A 3RLFE 3TMGA 5ICQA 2RKMA 1MM6A 3MWBA 1NKXA 1OLCA 3VVFA 3P7IA 2PMSA 2OWSA 3U1OA 3UIFA 1FQCA 4KD5A 1ZBMA 1B3EA 1MQDA 2FA7A 2Y7WA 1MY2A 1MY3A 3TCHA 3FVGA 3K1PA 2O7IA 1B0HA 1Y9UA 2VGQA 2O6AA 4GWOA 2YLNA 4RK9A 2B3BA 1N7WA 4WKMA 3RN8A 4GQOA 3KJ7A 3Q29A 3SESA 5F7VA 4ZEDA 5I56B 3HCQA 1B3LA 1RYXA 3K6WA 1LLSA 2FYIA 4NF6A 3SEWA 5I59B 5AA3A 3GLBA 2QMWA 3KN7A 4H5FA 4I1DA 4DDDA 1A54A 3GXAA 1B7ZA 3IB0A 1QUIA 2XXVA 4NF8B 4GOTA 4NF4B 4Z7EA 4LZ8A 1FQFA 1N3XA 2AL5A 4KPTA 5CI5A 5H8SA 3LSFB 1TXFA 5L9OA 3S9EA 1RYOA 4RY1A 2I48A 2GHBA 2XXYA 4IO4A 4THIA 4OFOA 3TQWA 3RTFB 1JETA 2A5TA 3CFLA 2PT1A 4ZE9A 3IK6B 1B4HA 3UORA 2HAUA 4GFRA 2VHAA 2R9JA 1QUKA 2Z8EA 1F9BA 3ONMA 4GXAA 5CRYA 1WVJA 3TTKA 2F6PA 3C9HA 4QFNA 4YICA 1Y20A 5I2KA 3CFXA 2ZNSA 1NH8A 2HCAA 5AA2B 1IXGA 2GHAA 3TAJA 1MH4A 3V89B 1FCKA 2X26A 2Z23A 4F1UA 5I57B 2NWJA 3OEKA 2F8DA 1SW4A 3K1MA 3R6UA 3SEYA 1Z7ME 2DP8A 4PFUA 1SQYA 1URDA 3QSLA 4BDRA 5F1QA 5TP9A 3QUJA 1SVXB 2O69A 1JVYA 3T9UA 2Y84A 1Y3NA 4OESA 3VLUA 1ZMGA 2DSFA 2QPQA 4KCCA 4O3BA 4R2BA 4JDFA 4YB7A 5FTHA 2B65A 3EHUA 4DZ1A 1AOVA 3CSGA 1B7UA 2AL4A 3N5LA 1ELJA 1OIBA 1R1NA 1PB7A 2ONKE 2UVHA 3QIMA 3A3UA 1DPPA 1UTHB 1ZU0A 3KOSA 4FORA 4LQ5A 1B46A 1MDQA 5DTBA 5CMKA 1VR5A 4HCYA 4XXUA 1XOCA 1YPNA 5CBRA 4MBPA 4NTLA 3DLNA 5L8DA 3UA8A 3V5AA 4JXIA 3A09A 2F34A 5AA2A 3SEUA 1IUDA 1UQWA 2AYSA 4R72A 5DVIA 3JV9A 1FQEA 3M3KA 2RF1A 3TCGA 4OXVA 5JEIA 4OERA 1MG1A 3GBAA 3O66A 1KWHA 4H67A 4R6KA 2E1SA 4WXJA 1R9QA 1B6HA 1AL3A 1B05A 2Y7RA 2Z8DA 4RYAA 3MQ9A 3R26A 4X48A 3B6QA 1OVTA 3MVXA 5M2VA 1EZOA 5JK4A 1JEVA 1B58A 1SBPA 3DP4A 2HQ0A 3MP8A 4GD5A 1YCJA 1NNKA 4L17A 3RQTA 1D9VA 3PPOA 3T9HB 2O68A 3TCFA 4OEUA 1TFDA 4U4SA 2E0SA 1QVSA 3H6TA 4P0IA 4OQOA 3SDFA 4NF6B 4ESWA 3OO7A 1R6ZA 3TPAA 2XX9A 4OYVA 4TLMB 4U22A 2NVUB 4IGTA 3T9XB 3VLWA 1IITA 3OXNA 3PPPA 4QFKA 1IIWA 5CM6A 3MVZA 1M5FA 3SERA 3PPNA 4H6DA 5KDTA 4FEBA 3H06B 1A8FA 4OENA 1M5BA 2G93A 3OO8A 4DXBA 3I5OA 3RUMA 2O1MA 3FXRA 2X7QA 4IO2A 4Q0CA 1MXZA 2H98A 4ONYA 1RKMA 4QHQA 3EF7A 3SEXA 1NNFA 2XXWA 3W9VA 3O29A 4N13A 3OO6A 4XKQA 1I6AA 3HN0A 1B3HA 5I58B 2NXOA 2V3TA 3FXQA 4XTCQ 2ESNA 2YPNA 3OENA 4MF3A 5EYFA 2UXAA 1USYH 1XHYA 1UTBA 1ZJLA 4ESXA 3M3LA 4YKJA 4G77A 2F5XA 3IB1A 4U21A 5I59A 4IY6A 1US5A 1DMBA 5JTYB 3VVDA 3O6IA 4Q30B 3IOTA 1BKAA 2DWIA 3KG2A 4G8HA 4OFLA 4R9FA 5FTIA 5TPAB 3S2VA 3K6UA 4ZDMA 3W9WA 3WAFA 4KYSA 4QFOA 4LONB 3TTRA 1MXWA 5IAIA 1B4ZA 1ZTYA 3MAMA 4ISUA 3MW0A 4KR5A 4OTEA 4QFPA 4QSCA 1TFAA 2Z22A 1B9JA 4Z0IA 5H8FA 1URGA 3FV1A 4KQPA 2I4BA 2HZLA 2O84X 3T96B 3VV5A 3CVGA 3RPWA 2XXUA 4G68A 3LBSA 1Y4CA 2XXIA 1B40A 1MXUA 1TWYA 2ZYNA 3O97A 4FIMA 2Q2CA 3MPKA 3C33A 4H5GA 5HM4B 1P1NA 1B52A 3TDJA 3RNNA 4LUBA 4IB2A 4OWDA 1AMFA 4IO5A 2PT2A 2XX7A 1NL5A 2ZNTA 3EHTA 3H6UA 1JVXA 3G3KA 3Q27A 4POXA 4ZEBA 4BDNA 4C0RA 1GGGA 2Q2AA 3K6XA 1Y4TA 3L6GA 4MFIA 1A7LA 2FNCA 3PUYE 4ZS9A 3UN6A 2V93A 5BUUA 3FJMA 4IO3A 4F19A 2OBGA 1B5HA 4IO7A 3O28A 3TTNA 1O64A 2DOJA 5IKBA 5H8QA 2V3QA 4G8NA 4FJPA 3CIJA 4KI0E 4RK2A 2QL3A 4I62A 1AH5A 1TT1A 3GZGA 5EHSA 3FUZA 4TQUQ 3KZGA 3LSXA 1II5A 3N6UA 4OFJA 4ZEFA 4F31B 4DIGA 3D4CA 1MS7A 2O1LA 4F22A 3E4RA 3T22A 1PB9A 4I8CA 2I6EA 3IB2A 1MRPA 3C35A 4MLQA 4Q8RA 1MXYA 2D3IA 4G2ZA 4GVOA 5CMBA 3C34A 3MP1A 3MZ1A 3RTWB 4BLAA 1SYIA 3TQLA 4KHZE 3RT8A 2Q8JA 2DVCA 2QSXA 1Z7NE 2I3WA 2Y7IA 2QS3A 3BFTA 2F7BA 1JW5A 5K2YA 3U92A 4C1TA 3CG3A 3C36A 1FQAA 3H6WA 4U4XA 4JBZA 1N7XA 4JB7A 5I2KB 4ZEKA 4EXKA 4HCWA 1WODA 4EUOA 2DE3A 4AB6A 3H3GA 2UVJA 5CMMA 4F2QA 2CZLA 1D3KA 3MP6A 5DVFA 3BBRA 4N6PA 4P0GA 3N26A 3G3FA 3M8UA 4BDQA 5H8HA 1B51A 4DCYA 4R6YA 5TPAA 3KBRA 4GL8A 3H03A 3FJ7A 1FTJA 1USYE 3FGSA 2R71A 1LAHE 3G3HA 4U1ZA 3UP9A 4DE8A 3OO9A 3MC2A 1SI0A 5TP9B 3THIA 4NWDA 2YJPA 4GXSB 4QFLA 1MPCA 1XVYA 2F35A 5ELVA 2Y7PA 5H8FB 2OJTA 3FZVA 3K2DA 4R9GA 4YAHX 5A5XA 4TOZA 3ECRA 1ZIUA 2THIA 2O7UA 3CR9A 2I0BA 2VOZA 3S9LC 1XS5A 3LR1A 2A5TB 4GF8A 3IORA 1CB6A 1DSNA 1I69A 3T66A 2UYFA 2ZYOA 1S7YA 1HSEA 2F36A 2ANJA 1B5JA 2HXWA 4M1VA 4M4GA 3UGWA 1AIVA 3IOUA 3IOVA 4WEDA 1UTBB 4KYDA 2I49A 2VD3A 4FEDA 5AA4A 4JSDA 3LSWA 5HPQA 2GH9A 1OQHA 1MQHA 1H3DA 1S50A 2W7YA 1MPBA 1I6QA 3MJNA 4Q5TA 4ELOA 3D4GA 3EQ1A 3IJXB 3KJTA 3QXMA 4JWOA 3O2AA 4O3CA 3U93A 5ICTA 4YB5A 1DTGA 1IQ7A 3FXUA 1OVBA 1D4NA 3PGFA 2M8CA 3VXCA 3VLVA 2F97A 3OMBA 1N04A 2XXTA 2I3VA 3JZJA 3H4ZA 3HV1A 2BJJX 2DE4A 3K02A 2V25A 3PUVE 2ABHA 4LQ2A 2F7AA 2XD3A 4POWA 5AE4A 5BWJA 3HPIA 2HAVA 4QF9A 4R74A 2UVIA 2F7CA 1QUJA 1PDAA 4OVJA 5H8NB 4YKKA 1VFDA 1LB8A 5CMCA 4BDOA 4YB6A 3SEVA 1YAEA 3GBBA 2P0SA 3O9PA 3TUSA 2OLBA 1B1XA 4HS7A 4OMBA 1SW2A 1B1HA 5I2NB 3PV0E 1PEBA 1JW4A 5KDTB 1MH3A 3DP8A 3E3KA 1VSOA 3O6HA 3PMVA 4LATA 4RJZA 5FHNA 2REGA 3Q28A 1QKAA 3C31A 2H4IA 2RCAA 4C1UA 5DEXB 1M5DA 2ONSA 1Y3QA 3DP6A 1S9TA 2P1SA 3FV2A 2LAOA 3L6HA 3SKPA 3MUQA 4XKPA 1EZ9A 3IR1A 4BDMA 5L9MA 4KFQA 3EPEA 3G3IA 1A55A 3CG1A 3C4MA 2Q89A 3DELB 3KGCA 3O6GA 3TTLA 1ATGA 4EQ7A 3PMWA 3OOAA 4PFTA 1H44A 2UYEA 2V3UA 3HSTA 4FATA 4YMAA 1D9YA 4RPNA 2XXQA 2ZYMA 3MZ9A 2CMOA 2QS1A 1B7HA 2D21A 2RINA 3ODBA 1ZLQA 2GRVA 4OETA 1URSA 5AA1A 4F2OA 5J1DA 5I2NA 2GFEA 2XHDA 4GLIA 3VDFA 4K3FA 2DWAA 2D5WA 2O51A 3QYTA 4IO6A 1MM7A 4H8JA 1MY4A 4NF5B 4F39A 1A99A 3PD8A 2ONRA 3K00A 2KLFA 3U8QA 1B2HA 4QRZA 4XKRA 2HFBA 4MH5A 3MZBA 3FATA 4EQBA 3W15C 3RY3A 2QMXA 3EHSA 3Q26A 2ALUA 1EH3A 1IXHA 4R73A 5KCJB 3N94A 5I58A 1VE4A 2IA4A 2OK2A 3IL1B 3IOWA 1HSLA 5H8NA 3IAZA 4MLVA 5TU0A 1NNPA 3B6TA 4UA8A 1SDXA 2NUVA 2ZMBA 3N6TA 1POTA 3QUFA 4PETA 3EN3A 1FTKA 1WDNA 2DXRA 5JTYA 1IXCA 4IY5A 3TYHA 3OEMA 1LAXA 1MQIA 1Q35A 3LSLA 4YKIA 1Y3PA 4QSEA 3S9MC 1OLAA 2H5YA 2OZZA 3S9NC 4EF1A 3PUWE 1OMPA 2B3FA 3MVYA 1NH7A 1O63A 1SW1A 3A3CA 2VD2A 3KN3A 5FHMA 3OD7A 1CE2A 3ZKKA 2DYXA 4DXCA 1B5IA 2PYYA 4ND9A 3AXFA 4PP0A 4U1OA 3TFLA 2Q9TA 3B7DA 2A5SA 1B0LA 1JNFA 3FASA 4X9TA 3BFUA 2OCUA 3F11A 5I56A 5ITOA 3VFJA 1A8EA 1PC3A 1DPEA 1XT8A 2RC7A 2RCBA 4H1XA 4NE4A 1UIVA 4O3AA 1MPDA 1SYHA 2I58A 2QRYA 1QJMA 5AA4B 3BKIB 2G29A 1JEUA 3DM0A 3G7WA 3MVWA 4PFYA 3T9VA 1N3WA 2XXRA 5I84A 1IZ1A 2XD2A 1B3FA 3TEPA 5ISUA 4NF8A 4XKNA 1ZKBA 1FQBA 2NOOA 4RPOA 4AQ4A 4LP2B 1B32A 5H8QB 1SW5A 3V83A 1POY1 1BTJA 2RC9A 3E13X 3FJGA 4F1YA 1JW1A 1BP5A 1UIUA 1VFEA 4X1BA 1IEJA 4JWXA 3ILUB 4DXUA 4F3BA 1LAGE 2P2AA 2DWHA 1PBQA 2R6GE 5H8HB 3FVOA 4F18A 3MBPA 4DCXA 4PQJA 3WAEA 3TTMA 3UK4A 1XC1A 5FHOA 4G68C 1MY1A 1NNTA 3CFZA 4ELRA 2REJA 4P11A 5A5XB 3ZSFA 4OZ9A 4RXLA 4GIZA 1LCTA 4NMYA 5CBSA 1Y1MA 1GVCA 1LFIA 1T0KA 3KSXA 2PBWA 3CSBA 3TODA 4F3PA 2H99A 1HSJA 3JYRA 1H76A 3CRBA 3R7XA 1P99A 3S4UA 3HHFA 1L5TA 2QS2A 3M3FA 3TELA 4HW8A 4ZECA 3IJOB 5KCJA 3HO7A 4RNSA 2ZYKA 1BIYA 1GR2A 2HEUA 4PE5B 1R9LA 5I57A 3TZAA 3RT6B 1FTOA 1SD3A 1M5CA 3OSQA 1H45A 4ELQA 3VXBA 2HZKA 3U72A 2DE2A 3K6VA 2QJEA 4H8IA 4ELPA 5CC2A 4EXLA 4F3GA 4I9DA 3K01A 4GL0A 1P1UA 3I6VA 1MQJA 1LSTA 3PMXA 2OWTA 3PPQA 3QK6A 4TLLB 4E0XA 3RGYA 3VE1B 1EZPA 4QSDA 4ZZAA 4EDPA 3G3GA 3OELA 4ECFA 1N0TA 1P1WA 1OQGA 1LBBA 3E9XA 3ILTB 2H9BA 1P1QA 5K2XA 1NFTA 5LOMA 4YKPA 3G3JA 4OEVA 2PX1A 3PD9A 4BDLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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