1Y4TA

Ferric binding protein from campylobacter jejuni
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
b'SELNIYSARHYNADFEIIKKFEEKTGIKVNHTQAKASELIKRLSLEGSNSPADIFITADISNLTEAKNLGLLSPVSSKYLEEFIPAHLRDKDKEWFAITKRARIIAYNKNTNIDISKMKNYEDLAKAEFKGEIVMRSATAPYSKTLLASIIANDGNKEAKAWAKGVLENLATNPKGGDRDQARQVFAGEAKFAVMNTYYIGLLKNSKNPKDVEVGNSLGIIFPNQDNRGTHINISGIAMTKSSKNQDAAKKFMEFMLSPEIQKILTDSNYEFPIRNDVELSQTVKDFGTFKEDQIPVSKIAENIKEAVKIYDEVGFR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Anion-independent iron coordination by the Campylobacter jejuni ferric binding protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords putative iron-uptake ABC transport system periplasmic iron-b
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Metal binding protein
total genus 123
structure length 317
sequence length 317
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1y4tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1y4tA02
1URSA 2UYFA 3W9VA 5FHNA 3GBAA 1VSOA 3MPKA 4EQ9A 2E0SA 1JW4A 4DCXA 3PPOA 1LFGA 2DE4A 5I2KA 2PMSA 4WXJA 3VDFA 1A55A 3VVFA 2W7YA 2VD2A 2GHAA 3M3KA 4H1XA 2QS4A 5I58A 4F1YA 4I9DA 1ZIUA 4NMYA 2XXQA 2PT1A 1XHYA 1LAFE 2V84A 3FZVA 1B9JA 5CBRA 1MDQA 2ZNTA 3O97A 4O3CA 3ODBA 1DTGA 1MQGA 2XXTA 1XVYA 5K2YA 3UP9A 2I6EA 3H06B 3RTWB 1B3LA 3H3GA 1OVBA 4KYSA 1Y4CA 3ZKKA 3EN3A 3QK6A 4NF5A 4R6YA 4LUBA 1LAGE 4GXAA 1Y20A 1TFAA 4N13A 1P1NA 4GOTA 2G93A 3SDFA 4NF8A 1A8EA 2IA4A 2Q89A 4DIGA 1NNFA 4ELOA 1S9TA 2ZYMA 3KOTA 1BKAA 2I58A 2PT2A 1OVTA 2WKYA 5DEXA 3BBRA 2XXWA 4HCWA 3G7WA 2PBWA 2XXRA 2QPQA 3IL1B 1WODA 1JQFA 1PC3A 1BP5A 4TLMB 2XXIA 4MFIA 2QMXA 3CR9A 1CE2A 1MPBA 3U8QA 4F3GA 3Q28A 3IOTA 3ONMA 4TQUQ 3OENA 4U23A 1IITA 4DDDA 3P7IA 1FTMA 4BDRA 2NWJA 2H5YA 4ZEBA 5HBCA 3KN8A 5HPQA 2DXYA 2VD3A 2QMWA 3C31A 5CC2A 1FTKA 4DLDA 4OEVA 1MH4A 3U94A 2RC8A 3HSTA 2F5XA 3USDA 4KFQA 4EXLA 3K6UA 4XIGQ 4OVJA 4LP2B 2Y84A 4IO2A 1H76A 1A7LA 1Q35A 1ZJLA 3C34A 4F3PA 4YAHX 1MDP1 2ONRA 5FHMA 1HSLA 4OYVA 4QF9A 1NNTA 4RYAA 1M5EA 1NNKA 2O84X 4F2OA 4F22A 4HW8A 4KYDA 5H8HA 4M1VA 3OXNA 5I58B 3O6HA 4HS7A 4OERA 5KDTB 1N04A 2OLBA 3LR1A 4U21A 3IORA 2A5TA 3L6HA 3JV9A 1SW1A 1D4NA 4JWXA 5KCJA 1LB9A 5FTIA 1PDAA 3RT8A 4L17A 5DT6A 1AMFA 2B3FA 3TQWA 5I59B 3SKPA 1YTVA 3TCFA 3HO7A 4FECA 5CRYA 4LA9A 1N7WA 2GH9A 3O66A 3RNNA 3HCQA 2DWJA 4H8IA 3MPLA 1UQWA 3TTLA 2DVZA 5CMMA 3VLUA 5A5XA 3T9XB 4NF6A 5B7DA 3TCHA 2DVCA 4EF2A 2RC9A 2ZYKA 3RN8A 3FVGA 3TUSA 3KN3A 3HHFA 2F8DA 1N0TA 2Y7KA 1UTBB 3MZ9A 3PGFA 5DVFA 5K2XA 2V3UA 1SVXB 2I3WA 4JSDA 5H8QA 3E13X 3T9VA 3KZGA 4RPNA 2FYIA 1SW5A 2AYSA 5J1DA 4KPTA 2I48A 4R9GA 5HM4B 4ISUA 1VFEA 4OENA 3RPWA 5JTYA 1JW5A 4GD5A 2H9BA 4GL8A 4OZ9A 3WAEA 4NWDA 3PPNA 4NF4B 1RKMA 3H6TA 4JWYA 2HCAA 3OD7A 1OQGA 1D9VA 1P1QA 4IO3A 3THIA 3B6QA 1PEBA 1TFDA 3K1MA 1P99A 3G3JA 4R2BA 2Q88A 4KD5A 3CI8A 4JSOA 1PB8A 4H5GA 3ECRA 3FIRA 3JYRA 2OK2A 3OO8A 5EHMA 2HXWA 4RXLA 1B1HA 2D21A 3C35A 3FJGA 5I2NA 2M8CA 3MW0A 1B52A 3FUZA 1LCFA 4EXKA 4O3BA 3OO6A 3RT6B 3SETA 5H8HB 4F1UA 5FTHA 4H0WA 4LVQA 3O9PA 4Q5TA 3Q29A 1QUKA 1B5HA 1OLAA 2Y7PA 2Q2AA 4YB6A 5EYFA 3DP4A 3TTKA 2NVUB 3FXRA 3V8XB 1N76A 3ZSFA 1B5JA 1Q1KA 2V3TA 1IIWA 2I3VA 2THIA 4DXUA 3C4MA 3LBSA 2HAVA 1Y1MA 1H45A 2RINA 4KQPA 1MY2A 1NMUA 1AOVA 3K6WA 1R9LA 3VFJA 3IO4A 3OO9A 4FJPA 4JB7A 1N3XA 4HCYA 2UVGA 4GQOA 3A3CA 1US5A 5AA1A 1B0HA 3WAFA 4QFPA 1IUDA 3QUFA 2ZYNA 1ZKBA 1SD3A 4AB6A 2QJEA 5ICQA 3VVEA 1FTLA 4G68B 3E3KA 1Y3NA 4YKPA 3O6IA 4RA1A 4FE8A 3PU5A 4NE4A 3CSGA 4H5FA 4YICA 3EHTA 1EU8A 5FHOA 2Q9TA 2DP8A 1XT8A 1ZTYA 2OJTA 1POY1 2RC7A 4U22A 3B6TA 3MP8A 4FIMA 2F34A 2B65A 3LSXA 3HHGA 4DCYA 3VXCA 4GFRA 4R2FA 5L9OA 1MXVA 3FXUA 5CMCA 3T9UA 4JWOA 5KDTA 4XKRA 2X7PA 2HZLA 4U1OA 1ANFA 3IAZA 4GXSB 4O3AA 5JK4A 2YJPA 1IXGA 1D3KA 2Q2CA 1B2HA 3VLWA 4FORA 4R9FA 4R6HA 2H98A 1B3FA 1SYIA 5I2NB 3BKIB 1LFIA 3DELB 5I59A 4IY6A 1MXWA 3TKDA 4IGRA 1PB7A 1MRPA 5H8NA 1XS5A 5EHSA 2H4IA 4ZEKA 1VE4A 2B3BA 4KHZE 2OWTA 1QUJA 5B70A 1QKAA 5L9SA 4N07A 4BLAA 2AL5A 4Q0CA 5CMBA 3UA8A 3KFMA 5ISUA 2O51A 2P2AA 5DTBA 4WEPA 3TTRA 3QIMA 4QSCA 4G4PA 2XXYA 4PFWA 1NKXA 4AQ4A 3TFLA 2D3IA 3W15C 4H8JA 2CZLA 1UTBA 2HEUA 4U1ZA 1YPNA 1EZOA 2GHBA 5DVJA 3TTMA 3EF7A 3HV1A 3K1PA 3M3FA 3CG1A 1US4A 4U4XA 1VR5A 4ONYA 2F7AA 4NEDA 1P1OA 4BDOA 1MH3A 1LB8A 1DPEA 2RF1A 2PVUA 1URDA 2ONSA 3K6VA 2IEEA 1I6AA 2O7UA 1CB6A 4I62A 5AA3A 3MQ9A 1XC1A 4NF4A 4LQ2A 3TAJA 3H6VA 3K00A 1FTOA 3MVXA 1SW2A 3GBBA 2OZZA 3H4ZA 3TDJA 1MQHA 4H67A 2QS3A 4ZE9A 4F29A 3GLBA 2OWSA 3SEWA 4ND9A 4DE8A 5IAIA 3TQLA 1PBPA 4MBPA 1MXZA 4IO7A 3M8UA 2I4CA 2V93A 3FV2A 2QSXA 4RPOA 1LBBA 4OESA 3U93A 3SESA 5DYHA 3VV5A 3PPRA 1TXFA 1BLFA 1QW0A 3C9HA 4FEDA 4YMAA 4QSEA 5ICTA 1TWYA 2UVHA 3FJMA 3MZ1A 3EPEA 1SQYA 1VFDA 1MY3A 2PX1A 4LZ8A 3T66A 3KGCA 1GV8A 1N3WA 3PMVA 3TZAA 2G29A 3SEXA 1JVXA 3MVZA 3N6UA 4Q30B 5I57B 2Y7WA 4OWDA 2QRYA 2OBGA 3N26A 4Q8RA 1R6ZA 2F78A 4LZ7A 1B40A 3S9LC 5F7VA 3V5AA 3OO7A 5H8NB 3GZGA 3BFTA 4F3BA 3FVKA 1GR2A 4OTEA 4NTLA 1RYXA 5JEIA 4GWOA 1SYHA 1I6BA 1FQAA 4I8CA 2ZYOA 4R74A 1ZU0A 1PBQA 2Z23A 1QJMA 5L8DA 4F3SA 1B58A 4JBZA 2H25A 2DWIA 4Z0IA 2ABHA 2HFBA 3Q27A 1XOCA 2O6AA 4H65A 3V83A 5TPAB 1T0KA 3U72A 4ELQA 1B7ZA 4YU0A 3OMBA 4X48A 1UIVA 1H43A 5I56A 4UACA 1QUIA 4G68A 2VP1A 2V3QA 3KSXA 4POXA 1IQ7A 1II5A 4G68C 3TELA 4R73A 1FCKA 5ITPA 2O69A 3FV1A 3K4UA 2Z8FA 4ZECA 3QSLA 2QS1A 4ZS9A 4XTCQ 3KEIA 3K6XA 1QULA 1FQFA 4LONB 1IEJA 1LLSA 4YKJA 1A54A 4BDMA 3IK6B 3RUMA 3F11A 3VVDA 3I6VA 4X1DA 3OSRA 3I3VA 2NOOA 3CVGA 3KBRA 3DLNA 1IZ1A 4RY1A 1DSNA 2P0SA 2VOZA 3PUXE 3MC2A 3KJTA 4E0WA 3PUZE 1Y3QA 2R6GE 1NH7A 3G3FA 4PFUA 3FVOA 4FATA 2UVJA 1UIUA 1WDNA 4X9TA 2FA7A 1B1XA 4ZDMA 4EQBA 4MLQA 3SERA 1MM7A 5BUUA 4P0GA 1NL5A 2X26A 4JXIA 4ESWA 2AIXA 3MAMA 1B3HA 5H8SA 3EHSA 1LCTA 2O1LA 5AA4B 3TODA 1MQJA 4G8NA 3QAXA 3QYTA 4U2RA 1AIVA 2Y7RA 3O28A 1R1NA 3LUYA 1LSTA 4BDLA 3TEPA 1B3GA 5CMKA 3PUYE 3T96B 4TOZA 1Z7ME 1OMPA 4R6KA 4ECFA 4OFJA 3MVYA 4QFOA 4F2QA 5KZTA 4ZE8A 1EZ9A 2V25A 4QRZA 3IJOB 3PUWE 4IO4A 3SEYA 4ZZEA 4EF1A 1IXIA 3Q26A 1B4HA 1S50A 3CRBA 3OSQA 3OELA 1DOTA 5TP9B 2XX8A 4LQ5A 1B6HA 3EHUA 1DTZA 5AA2B 1YAEA 5H8FA 1NH8A 4MLVA 3OEKA 1B0LA 3VLVA 2PYYA 4PFYA 1S7YA 3G3GA 3H6UA 2NXOA 4KCDA 2E1SA 3N6TA 4UA8A 3MP6A 1DPPA 2XD3A 1D9YA 3RY3A 1B32A 5I56B 2YLNA 3PPPA 4PQJA 3RGYA 4F18A 5I84A 4POWA 2I49A 3QXMA 1B05A 1MY1A 3FJ7A 3H03A 1LAHE 3KOSA 3MP1A 4OQOA 5AA2D 3CFXA 3MVWA 1R9QA 3M3LA 1UTHB 4QHQA 3LC8A 2H99A 2UYEA 5DVIA 3AXFA 3T9HB 4IB2A 2YPNA 4P11A 3G3KA 5TU0A 4QSDA 1HSJA 3VE1B 4ZEIA 3IO6A 2HAUA 4XKNA 4EDPA 1O7TA 2ESNA 3IOVA 3VXBA 2ZNUA 1M5BA 3FGSA 1ZBMA 2DE2A 3OEMA 3E4RA 4OEUA 2GFEA 3LSFB 3Q25A 3W9WA 2HZKA 1MM6A 3RQTA 3H6WA 4C1UA 3O29A 1PB9A 4XKQA 1J1NA 4MH5A 5I57A 3S9EA 3L6GA 1FW0A 1OQHA 1ELJA 3IX1A 4DZ1A 4GF8A 3ZS6A 5AE4A 4YKKA 4G77A 1XVXA 2I4BA 1MQIA 4NWCA 3UORA 3D4CA 4GIZA 1JETA 1AH5A 3PV0E 4RNSA 3R7XA 1A40A 3ILUB 3OOAA 4OHNA 1SW4A 2ZXTA 1MXUA 1NFTA 2XXUA 1JVYA 4DXBA 1FQCA 4OETA 3TCGA 4RJZA 2DE3A 5TPAA 4QFKA 4F39A 2Q8JA 2XD2A 3TPAA 3KJ7A 1BIYA 3CIJA 3IB1A 3BFUA 1O64A 1FQDA 1USYE 1POTA 2DS9A 5H8FB 3DP8A 1A8FA 1MY4A 4G8HA 4PP0A 3R26A 2CMOA 5CBSA 2I0CA 1LFHA 2I0BA 2GRVA 4IO5A 3KSJA 4XKPA 1O63A 2VHAA 1OLCA 4DXCA 2F7BA 3LSLA 3C33A 2DWAA 4ZEDA 3RLFE 4EUOA 2REGA 5F1QA 2O7IA 3MUQA 2X7QA 2UVIA 1I6QA 1LGBC 4RK9A 3G3HA 2DXRA 2BJJX 2ALUA 1L5TA 2AL4A 4N6PA 4ESXA 2F6PA 2XX7A 2XX9A 4F1VA 1A99A 1JEUA 1MY0A 1USYH 3K02A 2REJA 4ELRA 4F31B 1YCJA 4ZEFA 5BWJA 4EQ7A 2QL3A 3MWBA 4PE5B 5AA4A 3PD8A 1SI1A 5I2KB 1WVJA 5CI5A 2XXPA 3K2DA 4M4GA 1MXYA 2FNCA 1RYOA 1FQBA 3MZBA 3KG2A 3MJNA 3DM0A 3T93B 4R72A 3ZKLA 4JDFA 4WEDA 1MPCA 2O68A 1B4ZA 4P0IA 4OXVA 1EH3A 1GTKA 3GXAA 3FATA 3O2AA 3EQ1A 4LZ5A 1SDXA 1TT1A 4THIA 1OIBA 3H7MA 5TP9A 1P1WA 1KWHA 2HQ0A 4X1BA 3CFZA 5AA2A 3PUVE 1B46A 4Z7EA 1ZLQA 4ZZAA 3FD3A 4E0XA 3IB0A 4NF5B 2R9JA 4QFNA 4OFOA 3PPQA 1F9BA 2DSFA 4TLLB 2ZNSA 3N94A 2XHDA 3A09A 3CFLA 3V89B 3LSWA 2KLFA 3IOWA 1B7UA 1HSEA 4NF8B 2RKMA 5ELVA 3MBPA 1H3DA 5IKBA 1IXHA 3PMWA 3QUJA 2O1MA 1UTHA 1GGGA 3JZJA 5DEXB 3S9NC 2VGQA 3K0VA 3B6WA 3SEUA 4LATA 2QS2A 3UIFA 1NNPA 4U4SA 2DOJA 3G3IA 3UGWA 2Z22A 3IOUA 1AL3A 3C32A 4R75A 2ZMBA 3R6UA 3FXQA 1MPDA 1B7HA 1M5FA 2ONKE 2DWHA 1P1UA 1QKBA 1MQDA 4AB5A 2DYXA 1B3EA 1URGA 2R71A 2F36A 4IY5A 3ILTB 1IXCA 3HN0A 3CSBA 2OCUA 2P1SA 3CG3A 1Y9UA 4GL0A 2NUVA 3N5LA 4KYEA 4K3FA 3PD9A 3O6GA 1N84A 3A3UA 1Y4TA 3I5OA 4GLIA 5M2VA 4YKIA 4ELPA 4C1TA 2Z8EA 3U1OA 3IJXB 5CM6A 2ANJA 4G8MA 3D4GA 4OFLA 4IO6A 1JNFA 2Y7IA 2DQVA 3E9XA 3T22A 1MXXA 1M5CA 4I1DA 2Z8DA 1Y3PA 4GVOA 3SEVA 1BTJA 1B51A 1MS7A 4G2ZA 3HPIA 4BDNA 1ATGA 2A5TB 2XXHA 4OMBA 2F35A 4YB5A 3UK4A 4WKMA 4YB7A 3TTNA 4C0RA 1M5DA 5KCJB 4QFLA 3C36A 1H44A 2UXAA 5LOMA 2D5WA 3FVNA 4PFTA 2F97A 1FTJA 1DMBA 4FEBA 3S2VA 4KR5A 4GRKA 4KI0E 3PMXA 2XXXA 1LBCA 3RTFB 1QVSA 1SBPA 1N7XA 2A5SA 4PETA 5ITOA 3TMGA 3UN6A 5A5XB 3KN7A 4HTGA 1FQEA 4NF6B 2LAOA 4MF3A 1LAXA 4F19A 3K1NA 3S9MC 3B7DA 3K01A 3TYHA 1I69A 1Z7NE 3IB2A 1ZMGA 1JEVA 4XXUA 4YZZA 1JW1A 4H6DA 1SI0A 2RCAA 2RCBA 5H8QB 1Y1ZA 3FASA 1B5IA 4IGTA 3S4UA 1EZPA 2F7CA 4BDQA 4FAJA 5L9MA 3IR1A 1GVCA 5JTYB 1MG1A 3DP6A 4KCCA 4RK2A 4YMBA 3U92A 2F6GA 2XXVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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