1Y4TA

Ferric binding protein from campylobacter jejuni
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
SELNIYSARHYNADFEIIKKFEEKTGIKVNHTQAKASELIKRLSLEGSNSPADIFITADISNLTEAKNLGLLSPVSSKYLEEFIPAHLRDKDKEWFAITKRARIIAYNKNTNIDISKMKNYEDLAKAEFKGEIVMRSATAPYSKTLLASIIANDGNKEAKAWAKGVLENLATNPKGGDRDQARQVFAGEAKFAVMNTYYIGLLKNSKNPKDVEVGNSLGIIFPNQDNRGTHINISGIAMTKSSKNQDAAKKFMEFMLSPEIQKILTDSNYEFPIRNDVELSQTVKDFGTFKEDQIPVSKIAENIKEAVKIYDEVGFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
source organism Campylobacter jejuni
publication title Anion-independent iron coordination by the Campylobacter jejuni ferric binding protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords putative iron-uptake ABC transport system periplasmic iron-b
total genus 123
structure length 317
sequence length 317
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1y4tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1y4tA02
3H6UA 3E13X 4U1OA 1QW0A 3LR1A 5EHMA 4G2ZA 3FATA 1O63A 3FXRA 4YB7A 4FECA 4LVQA 2FA7A 3TZAA 3T66A 3IJOB 4NTLA 4LZ8A 3TCHA 4X48A 3DLNA 3O6IA 3M3LA 3MPKA 3QUFA 3P7IA 3HCQA 1JEUA 3B6TA 4H1XA 3TQWA 3H6WA 2I6EA 5CMMA 4RJZA 5I56B 4FIMA 3B6QA 4X1DA 3MVXA 3MP1A 1RYOA 5DT6A 3N94A 3MAMA 2Q88A 3FVOA 1URGA 4OZ9A 3O29A 1SW2A 3T9HB 2G93A 5H8NA 1ZBMA 2OK2A 4THIA 1B0LA 1IZ1A 4R2FA 4AB5A 1US5A 4QSDA 1OLAA 1A40A 3A3CA 3MP8A 1HSLA 2Y7IA 1B4HA 2OWTA 2IEEA 3OO9A 3V83A 4I8CA 3TTLA 2AIXA 2VOZA 4WKMA 5I2KA 4JB7A 3SERA 3V5AA 5JTYA 2XXWA 3ODBA 4ZE8A 1QKBA 5FHNA 4LONB 3CFXA 3BFUA 2BJJX 1ZLQA 5JEIA 2RCBA 4YKJA 3FD3A 1QUIA 3KN3A 1I6QA 1WDNA 5I2NA 3CG3A 3ILUB 4R2BA 3VVEA 2I0BA 4HCWA 3C35A 1B3FA 4OFLA 1FQAA 3U72A 4POXA 5K2YA 4EQ7A 5I59A 3OENA 5AE4A 3M8UA 4G8NA 2D3IA 1L5TA 3PPQA 3VV5A 3G3HA 2O1LA 1B05A 3RNNA 2O7UA 2OWSA 4RXLA 4YKPA 3LSFB 4YAHX 1PB8A 2PMSA 5TU0A 4GFRA 3MPLA 1YAEA 4O3BA 1MRPA 1NNTA 3SEWA 1MQIA 4BDMA 4KYEA 2OCUA 5KCJA 3TYHA 2DS9A 1FQFA 3C33A 2M8CA 3RN8A 1J1NA 1XHYA 4N07A 4OTEA 3D4GA 4U23A 4EF2A 1DTGA 1VR5A 1H44A 2F6PA 4IO3A 4TQUQ 1N3WA 1D9VA 5DYHA 3H3GA 2F35A 1ZTYA 3TELA 3MUQA 3S4UA 1B5JA 3PPPA 2Q9TA 3S9NC 4NF5B 3C36A 4XTCQ 3N5LA 5AA2D 4ZS9A 4BDQA 3Q26A 5JTYB 4LQ5A 3CFZA 2P1SA 2QS3A 4POWA 2Z8FA 1YTVA 3DELB 1MM6A 3IAZA 2V84A 1QVSA 2DVCA 3IB1A 1YPNA 1SDXA 3FUZA 2HZLA 1A8EA 2IA4A 1B7UA 1B7ZA 3G3IA 2RINA 4EF1A 1IXCA 3ZKKA 2VP1A 1MQHA 1T0KA 1QJMA 2XXUA 1QULA 3S2VA 3PUXE 3DP8A 2I49A 2DXYA 3HO7A 1B3LA 4U4SA 3TCFA 1BIYA 3H7MA 4G4PA 4G8MA 3K4UA 3MVYA 3W15C 3K1NA 3QYTA 2H5YA 3BBRA 4G68A 1UIUA 3SDFA 4QSCA 3RGYA 2YLNA 1IUDA 3KOSA 4AB6A 3E9XA 3MZBA 1Y1ZA 5I57A 2DE3A 1PBPA 1TFAA 3FASA 3RTFB 3ECRA 4F19A 4LZ5A 5KCJB 3I5OA 3PPNA 2YPNA 2H99A 1B1XA 3MQ9A 2DP8A 1SW5A 5IKBA 5CBSA 1S7YA 3V89B 5DVIA 1B3EA 3D4CA 2Q89A 4C1TA 4GQOA 3DM0A 2O69A 1Y3PA 3C34A 5ICQA 3S9EA 4XXUA 5JK4A 4PFWA 2DE4A 1H43A 1MXUA 1XS5A 4QFLA 1IXHA 2XXRA 4IO5A 3LC8A 3M3KA 4OXVA 5HM4B 4IB2A 3UK4A 3K6UA 1N84A 4RYAA 1OQGA 4QFOA 1B58A 5J1DA 1GVCA 2I0CA 2I58A 4JWOA 1IXIA 5BUUA 4PP0A 2XXVA 4DCYA 4H67A 2QS2A 3RT8A 3UA8A 4XKQA 3G3JA 3RUMA 5KDTB 4F2QA 1D9YA 3IO4A 1SYHA 3TTMA 4I62A 2HCAA 5I56A 1B46A 3OSRA 1NFTA 1ATGA 2F8DA 1TFDA 5B7DA 2PVUA 4QFKA 3AXFA 1PDAA 4JWXA 4RK2A 4PE5B 1URDA 2XXXA 2PX1A 3HHFA 4DXUA 4MLQA 4G68B 1B6HA 1I6AA 3T96B 4JSOA 3PPRA 2HFBA 2Z23A 2VD3A 4X1BA 4ONYA 5I57B 1SW1A 3VDFA 1Y4CA 1OVTA 3PPOA 4KHZE 4OEUA 3MWBA 1P99A 1IEJA 1BLFA 1MXWA 3MJNA 4ZE9A 2XD2A 1IQ7A 4IO4A 1M5CA 4IY5A 4YICA 3G3KA 2F7CA 1MXYA 1LB8A 2D5WA 3TODA 3K6XA 1A54A 4UACA 2DVZA 1LBBA 4AQ4A 4QF9A 2GH9A 1NNFA 4PFUA 5DTBA 1B2HA 1MH3A 4WEPA 4M1VA 2OJTA 1ANFA 4R9GA 3H4ZA 2GFEA 1MM7A 4HTGA 1SVXB 3JV9A 1M5FA 2RC8A 2V3TA 4Q8RA 1FW0A 1DMBA 5CC2A 5EYFA 2DWAA 1B5HA 3T93B 3FXUA 4OEVA 5L9OA 2ONSA 1N76A 1SQYA 2DSFA 2XXQA 5ITOA 1MY3A 3FIRA 1MXXA 3UN6A 3FXQA 3PD8A 1HSJA 2ZYKA 3RTWB 4GXSB 4GWOA 5H8FA 2V3QA 4F1VA 1Q1KA 3B6WA 1QUJA 3K6WA 2CMOA 4GIZA 3IOTA 4R6HA 4YB6A 1LCFA 5B70A 4LUBA 4WEDA 1MPDA 1XOCA 4DLDA 1II5A 2QPQA 3EF7A 2XXYA 3OEKA 4FJPA 4Z7EA 2H98A 2PT1A 2F7AA 2RC7A 1A55A 5BWJA 2ESNA 2UVJA 2I4CA 2PYYA 3RQTA 4OVJA 2HAUA 3MBPA 3OMBA 3KSXA 2RCAA 4GL8A 1MQGA 4KYSA 5ISUA 3SKPA 4QHQA 1AOVA 2GHAA 4F22A 4NF5A 1P1WA 3KJ7A 1LAXA 4IY6A 3IOWA 3EHSA 1DTZA 1MPCA 3CSGA 3RPWA 3SESA 1MDQA 2B3FA 3U93A 3MZ1A 1MY2A 4JDFA 2QJEA 3E3KA 5H8HA 2H9BA 3T9UA 1NL5A 2Y7RA 1JW1A 2F5XA 4OESA 2R6GE 5H8SA 4YKIA 4LATA 5DVJA 2KLFA 4OENA 4YMAA 3Q29A 4JBZA 1TXFA 3IJXB 4MF3A 1LLSA 3T9VA 1MY1A 2ZNSA 1Y9UA 2LAOA 1FTLA 4TLLB 1VFEA 1ELJA 4OMBA 2F36A 3HN0A 1FTMA 3UORA 4LQ2A 4JXIA 3PUYE 5AA4A 1N0TA 2XX7A 1UTHA 3H06B 5TPAB 1JVYA 1PBQA 3I6VA 4U1ZA 2R9JA 1SI0A 4N13A 1O7TA 1P1UA 4ZEBA 3EQ1A 3CIJA 1KWHA 4YMBA 1F9BA 3E4RA 2D21A 3GZGA 4ZEKA 3FVGA 5CBRA 3KBRA 1EU8A 3OXNA 3U1OA 3K6VA 3TUSA 1URSA 1UTBB 3ONMA 5H8FB 2UYFA 3LBSA 2THIA 1B51A 3MC2A 2R71A 4OWDA 4E0WA 1MY0A 3HHGA 1EH3A 2P0SA 5CMCA 1SBPA 2F34A 3IOVA 2UVIA 2Z8EA 2ONRA 1LSTA 3FV2A 1POTA 1H45A 5EHSA 5CMBA 1BP5A 3PU5A 4DDDA 1FCKA 2QS4A 5I58A 1S9TA 2DOJA 1B4ZA 5L8DA 1FQCA 4KPTA 5A5XA 4GRKA 4H5FA 3O28A 4UA8A 2CZLA 4Z0IA 1P1NA 1DPPA 1SW4A 1MXZA 3U8QA 2QRYA 4NWDA 1EZOA 1LBCA 2V3UA 5AA3A 1XC1A 1OQHA 3TEPA 3H03A 1LCTA 5H8HB 4HW8A 4F39A 1ZU0A 5ELVA 3OSQA 1B32A 1I69A 3OELA 1OMPA 1R1NA 1JEVA 5CI5A 3IOUA 1JQFA 4YZZA 4M4GA 4YB5A 1MQJA 4OFOA 2NWJA 4C1UA 3Q28A 3EPEA 3K2DA 4BLAA 3HPIA 5AA4B 5KDTA 4U22A 1ZJLA 2HZKA 2Z22A 2ZYMA 3FVKA 5DVFA 3PV0E 1SD3A 2A5TB 3Q27A 4I1DA 1UTHB 1LGBC 2AL4A 4R72A 2HXWA 1AH5A 1B52A 1FTJA 2QS1A 4KQPA 3BFTA 4O3AA 3QSLA 1P1QA 1US4A 3KJTA 3VLUA 2ZYNA 1MY4A 3WAFA 4F1YA 2Y7KA 5AA1A 1A8FA 1LAFE 4EDPA 4C0RA 2REGA 3C31A 1S50A 5FTHA 3GBAA 2QL3A 3VLWA 3O97A 3MP6A 4QSEA 4ZEIA 2RF1A 1JW4A 3N6UA 3KN7A 4XIGQ 1POY1 3SEVA 1PEBA 4OYVA 1NKXA 2Q2AA 1A99A 2UVHA 3FJGA 4FEBA 3TQLA 2B65A 1B3GA 4NF4B 1GTKA 3PUZE 5I58B 1LAGE 2XXPA 3OOAA 1AIVA 1NH8A 4NF8A 5A5XB 3UIFA 1CB6A 4H8JA 4DXBA 1IXGA 3S9LC 4MLVA 3MZ9A 4BDOA 3K1PA 3A09A 2NUVA 1YCJA 2I48A 4MBPA 2RC9A 1R6ZA 3R6UA 5FTIA 5AA2A 3CRBA 4JWYA 2ZXTA 2QSXA 4RNSA 5IAIA 4DZ1A 1MS7A 4R6KA 3H6TA 4N6PA 3MVWA 3DP4A 4IO6A 1Z7ME 4G8HA 3L6HA 3QIMA 3TFLA 4WXJA 3QK6A 3USDA 4ELPA 4ZZAA 1B40A 3G3GA 4H5GA 2DXRA 4L17A 1XVXA 1Y4TA 4FE8A 2XXHA 2OLBA 2F7BA 3PUWE 1NNPA 3T22A 5L9SA 2E1SA 4U2RA 2QMWA 3SEUA 3KZGA 3KEIA 2I3WA 2PT2A 4F3BA 4DIGA 4Q0CA 3GXAA 4NWCA 4LP2B 1FQBA 1H3DA 4EXKA 4F3SA 1EZPA 3W9VA 3A3UA 2ZNTA 4P0GA 4ESXA 3DP6A 4U21A 3IK6B 4ELOA 4PFYA 4YKKA 4KCCA 4RY1A 4MFIA 2O84X 4KR5A 4NF8B 3S9MC 4ECFA 2WKYA 1WVJA 3EHUA 4RA1A 3FV1A 5ITPA 4HCYA 1OLCA 1PB9A 4KD5A 1D3KA 2W7YA 1Y3NA 4GF8A 5TPAA 1LAHE 4ISUA 1SI1A 1OVBA 5FHOA 3GBBA 1NMUA 2O6AA 5AA2B 2OBGA 2V93A 3K01A 3HSTA 1UQWA 3G3FA 4PFTA 1DPEA 1FTOA 3UP9A 3OO6A 1IIWA 4JSDA 3KGCA 3TCGA 3SEXA 1EZ9A 1JNFA 2DQVA 2AL5A 1UIVA 1D4NA 1UTBA 1CE2A 4DCXA 3CFLA 1DSNA 3O9PA 3IX1A 3IB2A 5CMKA 4RPNA 3LSXA 4EQ9A 4NMYA 4GL0A 5HPQA 4IO2A 1R9LA 4GD5A 3TKDA 4BDRA 4FAJA 3U92A 2DYXA 3KSJA 1LFGA 3PGFA 2HAVA 4F1UA 5L9MA 2V25A 3C32A 4XKPA 4ZZEA 1RKMA 3LUYA 4X9TA 3GLBA 4R9FA 3IORA 3M3FA 5K2XA 3TPAA 2DE2A 4PQJA 3I3VA 4EXLA 3IB0A 4KFQA 3O6HA 4YU0A 4OQOA 1M5DA 3QAXA 3FJMA 2YJPA 3ZKLA 2I3VA 5DEXB 5ICTA 2DWIA 3MW0A 5HBCA 2O1MA 2Z8DA 4PETA 4E0XA 1H76A 4O3CA 3K00A 3N6TA 3B7DA 3IR1A 3O66A 2DWHA 2XHDA 5LOMA 4R73A 4R74A 4LA9A 3IO6A 3O2AA 2XXIA 3OEMA 1FQDA 4R75A 1OIBA 4GLIA 3MVZA 4OHNA 2A5TA 2B3BA 1Q35A 1N04A 3H6VA 3K1MA 3PMVA 2ZMBA 3VVDA 3C4MA 2OZZA 4F18A 3OO7A 2F97A 1B1HA 4ZDMA 2O51A 1VSOA 3BKIB 3VE1B 1JETA 4ELRA 3PMXA 2AYSA 2Y84A 3CI8A 3VVFA 3ILTB 4P11A 4TLMB 4F3GA 4ZECA 2ALUA 5TP9A 4RK9A 4NF6A 3CR9A 4F29A 3KG2A 3CVGA 4K3FA 1NH7A 1PC3A 4BDNA 1Y1MA 1AL3A 1PB7A 1ZIUA 1RYXA 2NXOA 4GVOA 1JVXA 4NF4A 4ZEDA 2A5SA 3K0VA 1BTJA 4BDLA 4G68C 3QUJA 1N7XA 4ELQA 4LZ7A 4FATA 4QRZA 4QFPA 3IL1B 1MXVA 2Q2CA 5H8NB 1O64A 3ZSFA 3FGSA 4FEDA 1I6BA 1IITA 3Q25A 1ZMGA 3T9XB 3U94A 3VFJA 2O68A 4F31B 4DXCA 2UYEA 5I2KB 3SEYA 5F1QA 1R9QA 3SETA 3ZS6A 2REJA 1LFHA 3KOTA 2E0SA 1MH4A 4MH5A 3TTRA 5CRYA 4IO7A 3FZVA 4IGRA 4I9DA 2FYIA 1LFIA 3K02A 4R6YA 3L6GA 5I2NB 5CM6A 5H8QA 1A7LA 1VE4A 2Y7PA 4KI0E 4OERA 4NE4A 2HEUA 4F2OA 4QFNA 2UVGA 3JYRA 5I59B 2XX9A 1FQEA 3V8XB 3QXMA 1BKAA 4H65A 1NNKA 1B9JA 1Y3QA 2XD3A 3KFMA 3OD7A 4EQBA 4ZEFA 3VXCA 1HSEA 3EHTA 1M5BA 5TP9B 4NF6B 1Z7NE 2H4IA 2F78A 2VHAA 2HQ0A 3TMGA 4GOTA 4G77A 4H0WA 3KN8A 4U4XA 4GXAA 5M2VA 4IGTA 3JZJA 1Y20A 2QMXA 1AMFA 3RY3A 1B3HA 5FHMA 3CSBA 2VD2A 4F3PA 1QKAA 5F7VA 2PBWA 2GHBA 2VGQA 4Q5TA 1GGGA 3OO8A 1DOTA 4XKNA 2G29A 2FNCA 1B5IA 2XXTA 3W9WA 2ANJA 3TAJA 2P2AA 4OFJA 5KZTA 1MQDA 3FVNA 3F11A 4DE8A 3VXBA 2NVUB 4TOZA 3TTKA 1USYE 1MPBA 3WAEA 1USYH 4RPOA 2DWJA 2ZNUA 3VLVA 3HV1A 5I84A 3THIA 1GR2A 2GRVA 1WODA 1GV8A 5H8QB 2UXAA 4XKRA 3UGWA 1JW5A 4EUOA 3R7XA 2ONKE 4P0IA 2RKMA 3PD9A 3C9HA 1LB9A 2Q8JA 3CG1A 4H8IA 3EN3A 4NEDA 1N7WA 2F6GA 1TT1A 3LSLA 2ABHA 1FTKA 3O6GA 3PUVE 4FORA 4Q30B 1MDP1 1VFDA 2X7PA 5DEXA 2O7IA 3R26A 3TTNA 1XT8A 4HS7A 3FJ7A 2XX8A 4ND9A 1N3XA 1B0HA 1M5EA 1XVYA 2ZYOA 4KCDA 1QUKA 2X26A 1P1OA 3G7WA 1ZKBA 3LSWA 3RT6B 1B7HA 4KYDA 1TWYA 3N26A 4ESWA 2NOOA 4H6DA 3PMWA 4OETA 1MG1A 2H25A 3TDJA 2Y7WA 1SYIA 2X7QA 2I4BA 3RLFE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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