1Y4TA

Ferric binding protein from campylobacter jejuni
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
SELNIYSARHYNADFEIIKKFEEKTGIKVNHTQAKASELIKRLSLEGSNSPADIFITADISNLTEAKNLGLLSPVSSKYLEEFIPAHLRDKDKEWFAITKRARIIAYNKNTNIDISKMKNYEDLAKAEFKGEIVMRSATAPYSKTLLASIIANDGNKEAKAWAKGVLENLATNPKGGDRDQARQVFAGEAKFAVMNTYYIGLLKNSKNPKDVEVGNSLGIIFPNQDNRGTHINISGIAMTKSSKNQDAAKKFMEFMLSPEIQKILTDSNYEFPIRNDVELSQTVKDFGTFKEDQIPVSKIAENIKEAVKIYDEVGFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Anion-independent iron coordination by the Campylobacter jejuni ferric binding protein
pubmed doi rcsb
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords putative iron-uptake ABC transport system periplasmic iron-b
total genus 123
structure length 317
sequence length 317
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1y4tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1y4tA02
1BKAA 3HHFA 3CSGA 3HSTA 3KSXA 3O6HA 1EH3A 1USYH 2D5WA 5I2NB 3BFTA 3FUZA 1IZ1A 1FTLA 4EQ9A 1MPBA 1SYHA 1HSJA 1Q1KA 1S9TA 5ICTA 3FXRA 4AB6A 3K0VA 4EQBA 4F2QA 2RC8A 3G7WA 3EPEA 2Y7KA 2F5XA 3QAXA 3QUFA 4KHZE 4PFTA 4X1DA 3ZKLA 2DQVA 1LAXA 1SD3A 3K6XA 2I4CA 2XXYA 3K00A 1NNKA 2ZYOA 3H03A 3HO7A 3EHSA 3MP1A 5K2YA 3RN8A 5KZTA 2CZLA 5H8SA 5L9OA 2X7PA 5H8HA 1IUDA 4RK2A 2I0CA 3EHUA 4FATA 3RT6B 3TTKA 1R6ZA 1UTHA 1B5JA 4ZEIA 1HSEA 4M4GA 5A5XB 3U1OA 3Q25A 4EF1A 4GFRA 4AQ4A 4OENA 2DSFA 4EDPA 3HV1A 4G8MA 1R1NA 4QFLA 5CMMA 5H8FA 2RF1A 1PB7A 1FQBA 1SI0A 1P1NA 1MXWA 4RXLA 3UA8A 1MQHA 1GTKA 1TFDA 1ZIUA 4I9DA 1IIWA 4OWDA 3QSLA 3MVZA 3RTFB 1SDXA 3EN3A 2V93A 1L5TA 1NKXA 1AIVA 4N07A 1JQFA 1Z7ME 4O3BA 1QUKA 3H6UA 3BFUA 4DZ1A 1O63A 3TCGA 2OJTA 2A5SA 3B6TA 4F3BA 4ZEDA 4XKRA 1VFEA 3PMVA 4QSCA 1OLCA 4YICA 3UK4A 3ZS6A 1MH4A 3VFJA 3TEPA 4X48A 5DVIA 4OMBA 3UGWA 4ESXA 3A3UA 4GD5A 4KCCA 4YKKA 3OEKA 5EHSA 3CRBA 1PB8A 3MZBA 3G3HA 2QSXA 4KI0E 1I6AA 1TWYA 3U72A 3ZKKA 1MH3A 4OFJA 3G3JA 2F7CA 1Y4CA 2F6GA 3K2DA 3K4UA 4YMBA 5B7DA 5ICQA 1B1HA 2F36A 2I3WA 1D3KA 3M3KA 4IY6A 3S9EA 5I2NA 1QVSA 1KWHA 3FASA 2A5TB 4G68B 3RY3A 3TYHA 3LSWA 1N0TA 2AL4A 2AYSA 1VFDA 2GFEA 4G68C 1IXGA 3V89B 3TTMA 2Y7PA 1OQHA 3SEVA 1B5HA 2I49A 3EHTA 3ILTB 3MAMA 2DE4A 3FD3A 4G4PA 4HCWA 4OXVA 1I69A 2NVUB 3A09A 1QW0A 2ONSA 3KN7A 4PE5B 1MXZA 4R9FA 1NFTA 3TZAA 3RUMA 1NNPA 4NF4B 2NOOA 1B3LA 3MUQA 1MY2A 2NWJA 4IO7A 4RPNA 2DXRA 3D4GA 4OFOA 2G29A 2YLNA 5TU0A 3RPWA 3T66A 1I6BA 3H6VA 1ZBMA 2F6PA 3K01A 4GRKA 4H1XA 4Q5TA 5A5XA 4QFPA 1H43A 2UVHA 2VD2A 1BTJA 1MXYA 2VD3A 2Y7IA 5AA4A 2CMOA 3MC2A 4FJPA 4IGRA 4LZ8A 1XVYA 3TCFA 5AE4A 2Z8EA 3H4ZA 4N6PA 4I62A 4ZZEA 2DVZA 2HZKA 1B6HA 3MJNA 3PMXA 3PUXE 4GQOA 3B7DA 4KYEA 3L6HA 4QRZA 1N7XA 1A8FA 3MZ9A 4GIZA 2UYFA 1MDP1 3U8QA 3HCQA 4QF9A 4YB6A 3RQTA 1VE4A 3VXBA 2PT1A 3DP4A 3O97A 3N5LA 3QYTA 4R2FA 2D3IA 4F1YA 2B65A 1XS5A 3QIMA 5FHOA 1O64A 5L9SA 4M1VA 3N94A 2DXYA 4GXAA 5H8QB 5AA2B 4O3AA 1N04A 1JNFA 3FVOA 3LSLA 4P11A 2ZNSA 1S7YA 1MM7A 4JBZA 1MY4A 4DXBA 3OSQA 1XT8A 1TT1A 1URDA 5B70A 4OQOA 3HN0A 3IB0A 1MRPA 1DPPA 1Y3QA 4YKJA 4ZDMA 5K2XA 3IOUA 5CM6A 2AIXA 2XXXA 1ZMGA 4O3CA 3CIJA 5DTBA 3OEMA 1P99A 1LBBA 2R6GE 4NWCA 2A5TA 2NUVA 3Q27A 4G68A 1LCFA 5JTYA 3PUYE 1MS7A 5HPQA 4IO6A 1NNFA 3GBAA 3S9NC 3H3GA 3LC8A 1LFIA 2XD3A 3CG1A 1A54A 4LUBA 3V5AA 4G77A 3OOAA 2OK2A 3KJ7A 3OO6A 4R72A 4DE8A 4OZ9A 3M8UA 2V25A 4L17A 2GHBA 4NF4A 1FTJA 1B7HA 4OEVA 3G3IA 4ZS9A 1JEUA 2Z8FA 3KJTA 3GXAA 4R9GA 2E0SA 1URSA 1D9VA 3FATA 4I8CA 4GLIA 4LVQA 5AA4B 2O6AA 2Z8DA 1AMFA 4KR5A 2Q2AA 3TELA 3R7XA 4THIA 3TAJA 2ZYMA 1PC3A 1RYOA 4X9TA 4XKQA 2Q88A 3IOWA 3SERA 1Y3NA 4MLVA 3ZSFA 2Y7RA 4X1BA 3K1PA 5TPAA 3ECRA 3CFZA 5F1QA 3V83A 3G3GA 2XHDA 3LSFB 4H65A 4F31B 2HCAA 4HW8A 3FVKA 1ZTYA 3OO8A 4YB5A 4IY5A 2D21A 1POTA 2KLFA 2O1MA 4HCYA 2QS2A 3VLVA 3H06B 5AA2A 5H8QA 3C31A 1AL3A 1UIVA 1DTZA 2PBWA 2G93A 2IA4A 3E3KA 3MVWA 3PUZE 3K1MA 4GL0A 4OETA 1M5EA 3C32A 1F9BA 1A55A 1B4HA 1Y3PA 4U4SA 3RTWB 2GHAA 4U2RA 2RCBA 2XD2A 3PD8A 3VLWA 2XXQA 2ZNTA 4KCDA 5L8DA 2V3UA 3QK6A 1HSLA 3H6WA 3JZJA 5DEXA 4GF8A 3TTLA 3K02A 1A40A 2H25A 1N3XA 2F8DA 2F7BA 3KFMA 1MQJA 4N13A 4F18A 1M5BA 2VGQA 2O7IA 3VV5A 3IORA 4TLMB 4XTCQ 3CI8A 4ZEFA 3IB1A 4TOZA 4RJZA 2QS1A 4OFLA 1FCKA 4ZZAA 1MPCA 2P1SA 3DM0A 3FV2A 3SEUA 3K6UA 2DWJA 1B46A 1QUIA 2V3QA 3KZGA 4QFNA 5CRYA 3MVYA 3SKPA 1MXUA 3G3FA 3O9PA 2QJEA 5DVJA 1YPNA 5BWJA 2HQ0A 3KBRA 3M3LA 1P1QA 4MBPA 4PETA 4F1VA 4DCYA 1ELJA 1H44A 2R71A 1B9JA 3CR9A 4Q30B 1IEJA 3S2VA 4FECA 4MF3A 3G3KA 3FGSA 4QSDA 5I56B 1WVJA 1ZU0A 2M8CA 3S9MC 2FNCA 1FTMA 4I1DA 2RCAA 4F1UA 1B3EA 2DS9A 3KN3A 4YKPA 1ANFA 5L9MA 3W15C 4Z7EA 2DWIA 3IB2A 4JWOA 5F7VA 3OENA 4GL8A 1PBPA 3PUVE 1I6QA 5I59A 3MPKA 5TPAB 4G8NA 3RNNA 2VHAA 2I6EA 5I57A 1XVXA 1SI1A 5FTIA 3VDFA 3U94A 4Z0IA 5AA3A 3PPNA 4XIGQ 2B3FA 5CMKA 5IKBA 3CSBA 3IJOB 4IO3A 3F11A 4BDQA 3UORA 3KOTA 1B3FA 4H6DA 2OLBA 4PFUA 4F22A 2ZMBA 2REGA 3Q29A 4GVOA 4RY1A 1B4ZA 1IXHA 1IITA 2Q8JA 1B51A 3IR1A 2HXWA 2QS4A 1GVCA 1MM6A 3TTRA 3WAEA 4UACA 3VLUA 3VE1B 1SYIA 3FXQA 2DP8A 5ELVA 3VVDA 4RK9A 2P2AA 3LR1A 1J1NA 2ESNA 3I3VA 3PPOA 3IAZA 5DEXB 5FHNA 1B3HA 2DOJA 1A7LA 1DSNA 1Y1ZA 4FEDA 1NL5A 2VOZA 4KPTA 4LATA 1JEVA 3TFLA 4DLDA 5KDTB 1LB9A 1OVBA 2VP1A 3OXNA 4HTGA 5AA2D 3VVEA 3PV0E 1B05A 4BDRA 4KQPA 4F2OA 2RKMA 3GLBA 3IK6B 4IO5A 4U1ZA 2O69A 2ANJA 3C34A 4QSEA 1D4NA 4NWDA 3T9XB 4ELRA 5I58A 3O6IA 3T9UA 3U92A 3H6TA 4F3SA 1MQGA 3SEXA 5HM4B 3S9LC 3PUWE 4YU0A 4OVJA 1FQAA 2H5YA 5BUUA 3C33A 3MP8A 3Q26A 2PMSA 1NH8A 3DP6A 1OQGA 3CVGA 3IO6A 2QPQA 4E0XA 1QJMA 4P0GA 4F39A 4GWOA 3RGYA 3KGCA 1B1XA 1B32A 2GRVA 4JSOA 4R6HA 1ATGA 1SW5A 3RLFE 1NNTA 3KG2A 3RT8A 3KOSA 3IX1A 1B3GA 1US5A 3JYRA 4Q0CA 3PMWA 4NTLA 3TQLA 5J1DA 2ZNUA 3BBRA 4U23A 4ESWA 5I59B 5I57B 1POY1 1AH5A 1Y9UA 1YCJA 5FHMA 4F3PA 1FW0A 1XC1A 1IXCA 3R26A 5FTHA 3T96B 1FQCA 3EF7A 4JB7A 1OMPA 1JVXA 1QULA 2F34A 4LA9A 4MLQA 3W9VA 3LUYA 1Y20A 2F7AA 3FZVA 3DP8A 2PYYA 3CFXA 4JSDA 1B40A 1FTKA 4ZEKA 3Q28A 2RINA 4OHNA 3UIFA 3B6WA 4LZ7A 2O68A 3FJMA 4AB5A 1IXIA 1N84A 1S50A 3E4RA 1H3DA 2XXHA 3PPQA 4XXUA 3LBSA 5M2VA 4MH5A 4LZ5A 3SEYA 2Z23A 4U22A 3SESA 3VVFA 2XXTA 1EU8A 2XXWA 3QUJA 4BDOA 1PB9A 1URGA 2XX8A 1QKAA 2ZYKA 1FQFA 4POWA 2I58A 3FVNA 4RNSA 5H8NA 5KDTA 1OVTA 2UXAA 2Q2CA 4KFQA 3K6VA 4RYAA 3DELB 4Q8RA 2V84A 1FQDA 1CB6A 3KSJA 3N6TA 2NXOA 3R6UA 1EZPA 1MPDA 2UVIA 2DWHA 3PD9A 4ISUA 2LAOA 4NF8B 4UA8A 4OTEA 4YKIA 2XXPA 3TTNA 5I58B 4EXLA 2DE2A 2W7YA 1Y1MA 2YJPA 1LFGA 4OYVA 1B52A 4H5FA 5DT6A 2E1SA 3TMGA 2PVUA 3E13X 2O1LA 1ZJLA 1QUJA 3WAFA 1VSOA 3TODA 4C0RA 3CFLA 4U4XA 5CBSA 1LAHE 2WKYA 1NMUA 4TQUQ 1JVYA 3BKIB 1M5DA 4YMAA 4FAJA 5EYFA 2HAUA 5JTYB 3T22A 2F35A 2PX1A 2THIA 5I84A 2AL5A 2Q9TA 2IEEA 5KCJA 4ELOA 2O7UA 1B2HA 4NEDA 3OO9A 4G8HA 2Q89A 3LSXA 3I5OA 4LQ5A 1B5IA 2H4IA 1H76A 2XXVA 3HPIA 4NF6A 2I4BA 2HZLA 2I48A 4OERA 1P1OA 1UTBA 4R75A 4R6YA 5DYHA 1FTOA 3K1NA 2HEUA 3UP9A 4F29A 3OD7A 4TLLB 1Z7NE 1SW4A 1II5A 4F19A 1DPEA 5AA1A 4LONB 3IJXB 4BDNA 4ELPA 1B0HA 2OWSA 3FJGA 2R9JA 3V8XB 4ZECA 4QHQA 3EQ1A 1EZ9A 2O51A 3IO4A 5JK4A 1A8EA 3U93A 1GR2A 4R73A 2ABHA 1VR5A 4ZE9A 3T9VA 1BLFA 3OSRA 2QMXA 3KEIA 2O84X 1O7TA 3O6GA 2H9BA 2H98A 5H8NB 3TCHA 2H99A 4C1UA 1LFHA 1JW4A 4FORA 3MBPA 1IQ7A 3OMBA 2ONRA 4FEBA 1PEBA 3N6UA 4RPOA 3N26A 2Z22A 3VXCA 5CC2A 1MQIA 3T93B 4DXCA 4K3FA 3UN6A 4MFIA 2P0SA 2I3VA 3B6QA 2X7QA 3DLNA 4PFWA 2ALUA 4WEDA 4F3GA 1B7UA 4YAHX 1R9LA 5TP9B 2RC7A 3I6VA 4NF8A 3TKDA 3TQWA 4P0IA 1GGGA 3JV9A 1A99A 1BIYA 3QXMA 2XXIA 4FE8A 4U1OA 1T0KA 3L6GA 4GOTA 2DWAA 1TXFA 2YPNA 3KN8A 4JXIA 3SDFA 1B7ZA 1WDNA 4ECFA 1MXXA 3ONMA 3GZGA 4HS7A 5EHMA 2DE3A 3H7MA 3OO7A 4GXSB 4IGTA 2V3TA 4NMYA 4OESA 1TFAA 1D9YA 1PDAA 1UQWA 1USYE 3THIA 3MVXA 4R74A 1JW1A 1MXVA 1N7WA 2FA7A 4EUOA 3MP6A 3MQ9A 4NF5A 4ZE8A 5IAIA 4DIGA 2RC9A 3C9HA 4NF6B 2HFBA 3GBBA 4OEUA 1JW5A 4JWXA 4R2BA 4YB7A 2X26A 2HAVA 2BJJX 1UTBB 4FIMA 5JEIA 1QKBA 3AXFA 3O2AA 3SEWA 3CG3A 4U21A 5CI5A 1LCTA 3HHGA 5DVFA 1SBPA 3TDJA 1LAFE 1N76A 3MZ1A 4PQJA 3IOVA 3M3FA 3C36A 2ONKE 3MW0A 1LB8A 3ILUB 3IL1B 3IOTA 3PGFA 2OWTA 4JWYA 1DMBA 1YTVA 5HBCA 1FQEA 3A3CA 3OELA 3MPLA 2UYEA 4ZEBA 3P7IA 4EF2A 5I2KA 1DTGA 3TPAA 4PP0A 1BP5A 3S4UA 2I0BA 4C1TA 3O66A 2XX7A 4KYSA 5ISUA 4KYDA 1WODA 3O29A 1LBCA 4H8IA 5ITPA 3PPPA 1SW2A 3C4MA 2XX9A 5CMBA 1AOVA 1LSTA 3PU5A 4EXKA 1MDQA 2F97A 3MWBA 1SW1A 4RA1A 1MG1A 4LP2B 2REJA 4EQ7A 1XHYA 1R9QA 3FV1A 4PFYA 4WEPA 4YZZA 5LOMA 2XXUA 4POXA 2QRYA 3D4CA 1N3WA 2XXRA 1US4A 4NE4A 5TP9A 3ODBA 5H8HB 1MY0A 1LLSA 1RKMA 4LQ2A 3E9XA 1OLAA 1UTHB 1ZKBA 4WXJA 5CMCA 4G2ZA 3SETA 4BDLA 1LGBC 2F78A 2B3BA 5KCJB 3FJ7A 1DOTA 3FIRA 1SQYA 3K6WA 4H0WA 1M5CA 1YAEA 4JDFA 1CE2A 2UVGA 3FVGA 3FXUA 4IO4A 5I2KB 1LAGE 5H8FB 2OCUA 1P1UA 4ONYA 1B0LA 2QL3A 1Y4TA 1MY3A 4ND9A 1RYXA 4H8JA 1OIBA 2QS3A 2Y84A 3PPRA 4IB2A 4H67A 1JETA 2ZYNA 3W9WA 4DDDA 4NF5B 4DCXA 4E0WA 4DXUA 4XKNA 4H5GA 5ITOA 1XOCA 2ZXTA 2PT2A 1MQDA 4WKMA 4KD5A 4BDMA 1H45A 3TUSA 1SVXB 1UIUA 2UVJA 1PBQA 1M5FA 2QMWA 2DYXA 4IO2A 2DVCA 3O28A 1MY1A 1P1WA 2OZZA 3USDA 3C35A 2GH9A 4ELQA 2FYIA 2OBGA 4R6KA 1ZLQA 1EZOA 1B58A 3T9HB 4QFOA 1Q35A 4BLAA 5CBRA 1GV8A 1NH7A 2Y7WA 5I56A 4QFKA 4XKPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CSGA 3O6HA 1EH3A 2Y5LA 3BFTA 3FUZA 4EQ9A 1MPBA 1HSJA 1S9TA 3K0VA 4MAGA 3G7WA 3QAXA 1NNKA 2PCRA 3EHSA 5L9OA 2I0CA 4O8MA 3SZPA 1QGXA 3Q25A 2DSFA 5CMMA 4G8MA 5H8FA 1PB7A 1P1NA 1MXWA 1GTKA 1TFDA 1ZIUA 4I9DA 1SDXA 2V93A 4N07A 3H6UA 5EQAA 4DZ1A 1O63A 2OJTA 4F3BA 1VFEA 1MH4A 3VFJA 3TEPA 3A3UA 4KCCA 5EHSA 4O94A 4PDDA 1I6AA 1TWYA 3U72A 3K2DA 4GWWA 3M3KA 3S9EA 1KWHA 4G68C 3V89B 4PFYA 2DE4A 4OANA 3A09A 3KN7A 3LUZA 3TZAA 4NF4B 1B3LA 2NWJA 3RPWA 5A5XA 3K01A 1ZBMA 4GRKA 4H1XA 5I5PA 4QFPA 2VD2A 2CMOA 3MC2A 4N6PA 3MJNA 3PUXE 3MZ9A 1VE4A 2PT1A 4R2FA 4F1YA 2B65A 2DXYA 4GXAA 4P11A 1KZ8A 1MM7A 5IZ3A 1MY4A 3IB0A 1DPPA 4O3CA 2A5TA 3ROJA 3GBAA 3CG1A 3V5AA 2OK2A 2CEXA 2V25A 4L17A 4NF4A 2B4MA 4GX4A 1JEUA 3KJTA 5I3SA 2E0SA 1FPGA 2Z8DA 2Q2AA 2Q8MA 3TAJA 3KC1A 3ZSFA 3K1PA 5TPAA 3ECRA 5F1QA 3G3GA 2XHDA 4F31B 4HW8A 2KLFA 3VLVA 1FJ9A 3H06B 5ET5A 1AL3A 1M5EA 1F9BA 1A55A 4PE3A 1NV4A 3RTWB 2GHAA 2XD2A 3PD8A 2XXQA 4KCDA 3QK6A 3TTLA 3KFMA 1M5BA 4DI3D 3IORA 2Q74A 4TLMB 4ZEFA 4TOZA 1NV2A 2V3QA 3KZGA 3SKPA 4OVQA 3O9PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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