1Y4TA

Ferric binding protein from campylobacter jejuni
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
SELNIYSARHYNADFEIIKKFEEKTGIKVNHTQAKASELIKRLSLEGSNSPADIFITADISNLTEAKNLGLLSPVSSKYLEEFIPAHLRDKDKEWFAITKRARIIAYNKNTNIDISKMKNYEDLAKAEFKGEIVMRSATAPYSKTLLASIIANDGNKEAKAWAKGVLENLATNPKGGDRDQARQVFAGEAKFAVMNTYYIGLLKNSKNPKDVEVGNSLGIIFPNQDNRGTHINISGIAMTKSSKNQDAAKKFMEFMLSPEIQKILTDSNYEFPIRNDVELSQTVKDFGTFKEDQIPVSKIAENIKEAVKIYDEVGFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords putative iron-uptake ABC transport system periplasmic iron-b
publication title Anion-independent iron coordination by the Campylobacter jejuni ferric binding protein
pubmed doi rcsb
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Metal binding protein
total genus 123
structure length 317
sequence length 317
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1y4tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1y4tA02
5BWJA 3UA8A 3JV9A 2O51A 4Q0CA 1URDA 4G2ZA 5AA4B 2DVCA 5K2YA 3PPOA 1B40A 2V84A 4NTLA 3T66A 3IL1B 3K01A 1FTMA 2QS4A 3MAMA 2RCBA 2XX8A 1IXCA 2O7IA 4OWDA 3TQWA 4ECFA 2HQ0A 1B7ZA 1TT1A 3V83A 1Y4CA 4U1OA 3THIA 1N76A 1PB8A 3O6HA 1GR2A 4XXUA 3G7WA 2XXQA 4ESWA 2ABHA 4QFPA 1Y9UA 1H3DA 4NF5B 1AL3A 5DT6A 1MY3A 2AL4A 4F2QA 1D4NA 3VDFA 1I6QA 1UTHA 5F1QA 5CMBA 4Q5TA 5KDTA 3TDJA 5HM4B 1A99A 3D4GA 1NH8A 2DE4A 4YKPA 2GFEA 2XXRA 4H5GA 3CG1A 3MC2A 3EN3A 3FUZA 3OELA 4NWCA 4KYSA 3IOVA 4AQ4A 4OXVA 3PGFA 1MQIA 1AIVA 3SERA 1IITA 4DXUA 2DWAA 1PBQA 4F3BA 3FVKA 5CMMA 3WAFA 4FJPA 3DP6A 3MPLA 5ICTA 2V93A 1RYXA 1GV8A 2UVGA 1QUJA 5I2KA 3BBRA 4R6HA 4F3GA 2Z8DA 4LQ5A 3LR1A 4QSEA 3FZVA 1SQYA 2CMOA 2WKYA 1B3LA 4EF1A 2XXIA 3MWBA 1IQ7A 3D4CA 1MQJA 3FXRA 4YZZA 2O1LA 4PQJA 4H8IA 3O66A 3IB0A 2V3UA 2RC9A 4ZEFA 2HCAA 1F9BA 4PETA 3MBPA 3G3FA 2I58A 5L8DA 3KSXA 4WEDA 1A8EA 4F31B 4OQOA 3RUMA 1OVTA 2I49A 1MRPA 2PBWA 1LAFE 4BDOA 3L6HA 1B05A 3CFXA 3GLBA 3OENA 3AXFA 3KN8A 1IUDA 4MF3A 5B7DA 1B58A 3N26A 2QPQA 3W9WA 2RINA 3QYTA 5DVIA 5TU0A 1P1NA 3DP4A 2ZNTA 4NE4A 3MW0A 5CRYA 1A7LA 4BDLA 3QK6A 4OEUA 1N7WA 3HV1A 4LATA 3DELB 4GQOA 2QRYA 3T9XB 1I6BA 3TAJA 3USDA 4MH5A 3KG2A 4YB6A 4IGTA 3SEXA 5I57B 4LONB 2HZKA 2ESNA 3UP9A 2Q8JA 3UORA 4GIZA 2QS3A 1NNKA 3L6GA 4ZE8A 4ND9A 1FTLA 4NF4A 4R74A 5BUUA 1VR5A 4XKNA 1YCJA 2P1SA 2OWTA 1B51A 1LFHA 1JW1A 4LP2B 5IAIA 5FHMA 1SYIA 3IB1A 3FVGA 2ZMBA 1B32A 3H7MA 2REJA 1YPNA 4TOZA 3S9NC 3ZKLA 3E13X 5AA4A 4ZEDA 3O2AA 2PVUA 1ZBMA 2RF1A 1S7YA 3E3KA 3TODA 2DWJA 3M3FA 2I48A 3V5AA 3PUZE 4G8MA 2AL5A 4JDFA 1MY1A 1IXGA 3OO9A 4Z0IA 3BFTA 5EHMA 3JZJA 4ELPA 2Q88A 1P1WA 4TLMB 4HTGA 4R73A 2BJJX 4ONYA 1MPDA 1DTGA 3IR1A 1P1QA 2H4IA 1BTJA 3T9UA 4NF5A 3LSLA 2DWHA 3H3GA 2HAUA 2E1SA 2R9JA 4MBPA 3ODBA 2DP8A 1UIUA 4LQ2A 3VFJA 4F1VA 2UVIA 4FATA 2H9BA 3ZKKA 2VHAA 1NNTA 3SEVA 5FHNA 4G8HA 2ONSA 2UXAA 1Y3PA 3TTMA 3CVGA 4OEVA 1TXFA 1USYE 1LAGE 4H8JA 4QSDA 1Y3QA 2VD3A 4GRKA 3E9XA 4DIGA 3SEUA 3LSXA 4F18A 4JWOA 5AE4A 4IGRA 3SEWA 4G68A 1B1XA 1JVYA 1MXYA 3S4UA 4BLAA 4R6KA 3OXNA 3K0VA 1ZU0A 1Z7ME 3LSWA 1IXIA 4JWYA 4GFRA 3A3UA 3TYHA 1LCTA 1UTBA 3IORA 3U8QA 4RPNA 1FQDA 2DE3A 1O7TA 2F6GA 4FEDA 3FIRA 2XD3A 1B7UA 3C4MA 4YKKA 4XKQA 1B5JA 3U93A 2ONKE 2FNCA 4POWA 1PBPA 4KD5A 4HW8A 3I3VA 2OZZA 3DP8A 4KI0E 2Q89A 4ELOA 1II5A 3RGYA 2KLFA 3VXBA 2V3QA 3OD7A 1R9QA 5HPQA 3R6UA 4QRZA 5JTYB 4KQPA 2QS1A 3IJOB 3GBBA 1N04A 1TWYA 2F34A 1NFTA 4K3FA 4JXIA 5L9MA 1TFAA 2O68A 2GHAA 3M3KA 3OO7A 1NH7A 3S9EA 3TCGA 3VLVA 1M5EA 4PE5B 3K00A 3PV0E 1XC1A 1DPEA 2RC8A 3TELA 3FATA 4P0IA 3RNNA 3PUWE 5AA2A 3VXCA 4YICA 3PD9A 1H45A 3HO7A 5I57A 1EZ9A 4Q30B 2OJTA 3SESA 2DWIA 5LOMA 3KN3A 2F97A 4IB2A 1FQFA 3U1OA 4EDPA 5CBSA 2ALUA 5I2NB 4QHQA 1JVXA 4DXBA 1VFEA 4EF2A 4HCYA 1VSOA 3IJXB 5I56B 5FTHA 3MVZA 1QUKA 2Y7WA 5TPAA 3EHTA 2YPNA 3KEIA 4ZZAA 5H8HB 2O1MA 4QFKA 1KWHA 4DLDA 5CBRA 4RYAA 3KBRA 4F3SA 1POY1 4F29A 4QF9A 3MP1A 1LBCA 1OQHA 3OMBA 4U22A 4DZ1A 2IA4A 3ILUB 2NVUB 4UACA 3KJTA 4OZ9A 4O3BA 1MG1A 1URGA 5H8NB 1BP5A 2XXTA 3CR9A 2V25A 4KYDA 1DTZA 1RYOA 3PD8A 4F1UA 3W15C 3CIJA 1FTOA 1R1NA 3FJMA 4KR5A 4OYVA 3VLWA 2REGA 3MJNA 4IO4A 1DMBA 2NUVA 4HS7A 5CMCA 3RT8A 3MQ9A 1OLCA 4PFTA 2M8CA 4U4SA 4N6PA 4JWXA 2HXWA 1EU8A 3B6WA 5ELVA 4BDQA 1M5FA 4YKJA 4IY6A 1VE4A 1P99A 2E0SA 5H8FA 1B2HA 5F7VA 5DEXB 1URSA 1D3KA 4KHZE 4OFJA 5H8SA 3K1MA 3FV2A 4OTEA 3KOSA 1XS5A 1P1UA 5JK4A 2I3WA 2X7PA 4G68B 5ITOA 3C33A 4X48A 3OSRA 2I4BA 3TTLA 4TLLB 3FJ7A 1Q1KA 2UVHA 2AYSA 3S9MC 3IO6A 1UTBB 4R9GA 1R6ZA 3I5OA 4E0WA 1O63A 3FVOA 1B6HA 4QFNA 3B6QA 4BDMA 1DOTA 4AB6A 1N0TA 3LSFB 3TTNA 3H06B 2DSFA 3FD3A 4EXKA 1NL5A 3C9HA 3IOUA 2W7YA 1Y3NA 3KZGA 3K2DA 4GXSB 4N07A 4F22A 3FASA 3IO4A 1SDXA 1JNFA 2D5WA 1B4HA 5H8QB 3CI8A 1PC3A 3JYRA 3M8UA 4ELRA 1YTVA 3O29A 3C34A 2F36A 4IO5A 4EXLA 1MXZA 4ZECA 1O64A 3U94A 3IB2A 3IOTA 2DE2A 4YB7A 4F3PA 1QKBA 5AA2B 1SI1A 3O9PA 4ZDMA 4H1XA 2ZYNA 2P0SA 1YAEA 1WODA 2F7BA 3FXQA 1R9LA 2H99A 1AOVA 3R26A 5JTYA 2O69A 2G29A 4RY1A 2G93A 4ZE9A 1OLAA 4RA1A 2V3TA 4P11A 3TFLA 4POXA 4F19A 3Q26A 1B9JA 1PB9A 3EQ1A 3SDFA 2XD2A 2DXYA 3K6XA 3GXAA 3O97A 4I62A 1N3WA 2ZNSA 1IIWA 5TPAB 1MXUA 4F2OA 4YAHX 4DDDA 1BLFA 4U21A 2XHDA 1Z7NE 1LFGA 4DCXA 3TMGA 4MLVA 4X1BA 4IO2A 2XX7A 4AB5A 5AA2D 5I2NA 1S50A 4DXCA 4PFUA 3T93B 3PMXA 3U72A 5I56A 1XOCA 4O3CA 1MH3A 4YB5A 4M1VA 4WKMA 4I8CA 3GZGA 3H6UA 4JSDA 1ZJLA 5H8HA 1ZIUA 3MZBA 2DVZA 4H67A 1B3EA 5FTIA 3Q29A 1SW4A 1M5DA 2PT2A 1LB8A 1FTKA 2PYYA 4M4GA 1XT8A 3LC8A 1MXWA 1DSNA 2VD2A 4GF8A 4LVQA 4R2FA 1ZKBA 5H8FB 1NNPA 4FORA 3EPEA 3BFUA 3RTWB 5H8NA 1SD3A 1FCKA 2A5TB 1LAHE 1B46A 4QFLA 2QSXA 4ZZEA 1FQCA 1MY0A 1HSJA 1NKXA 3MVYA 5I58A 2VGQA 4ZS9A 3B6TA 3UK4A 2Q2AA 1IEJA 2F35A 5DEXA 2YJPA 1D9YA 4NF8B 1NMUA 4KFQA 3VE1B 2YLNA 3K6UA 5A5XA 3MUQA 3MPKA 1SVXB 2XXYA 2LAOA 3QUJA 3O6GA 4O3AA 2DQVA 5I59B 4OHNA 3Q27A 2RKMA 3PMVA 3IK6B 1UQWA 4LZ5A 3FGSA 4C1UA 1LB9A 2Y7RA 2UYFA 4KCCA 4F1YA 2AIXA 1QJMA 1PDAA 2ZXTA 2XXWA 1FQAA 2F7CA 4BDNA 3VVFA 4YKIA 1L5TA 2DYXA 4EQ9A 1B3HA 3ZSFA 5L9OA 4PP0A 3H4ZA 3ECRA 3RQTA 4E0XA 2D21A 5CI5A 4FE8A 1T0KA 3MZ9A 4PFWA 4N13A 4RNSA 3EHUA 4TQUQ 4UA8A 2UVJA 4PFYA 1N84A 3H6TA 2NWJA 1MPCA 4I9DA 5M2VA 2Y7IA 5H8QA 5B70A 1ZLQA 4MFIA 2ZNUA 3TCFA 4JSOA 2B65A 3VLUA 2F78A 3RT6B 3PPQA 3RLFE 5DTBA 3OOAA 3QAXA 1MDQA 3A3CA 2XXHA 1SI0A 2RC7A 5KCJB 1CB6A 4XKPA 3G3IA 4OFLA 1BIYA 3K1NA 4R2BA 4IY5A 3M3LA 1HSEA 5AA1A 3H6WA 3CSGA 4ZEIA 2FYIA 4G4PA 3TTRA 5ICQA 3CFLA 3RN8A 3O28A 3CRBA 3V8XB 1TFDA 1XVYA 1H44A 2PT1A 4OESA 5J1DA 2XX9A 4GD5A 3KJ7A 2F6PA 1B7HA 3N94A 2B3FA 1LGBC 3CFZA 4WEPA 3TEPA 3E4RA 1IZ1A 2I0BA 1QVSA 1MDP1 4EQ7A 4P0GA 1OVBA 3IAZA 1Y4TA 1S9TA 3PPRA 4XKRA 4YMBA 5TP9B 3EHSA 4F39A 4WXJA 1ELJA 2RCAA 4ZEBA 1JEVA 2XXVA 3KOTA 4OETA 5JEIA 2X7QA 3FV1A 2ANJA 3K1PA 1B3GA 3OEKA 4FAJA 4U23A 5I58B 3OO6A 1LLSA 2CZLA 2I0CA 3SEYA 1MXXA 3I6VA 4FEBA 3ZS6A 1B0LA 3MP8A 1M5BA 1B1HA 3G3GA 1JEUA 2X26A 4OENA 2R71A 1CE2A 1LSTA 1JQFA 3QSLA 5CMKA 2A5TA 5A5XB 4LZ7A 4YMAA 3T22A 1SYHA 4IO6A 2HAVA 2Y84A 3K4UA 3QXMA 3PPNA 3UN6A 2F5XA 3UGWA 1SBPA 3C32A 4GWOA 3C31A 2Z23A 4KCDA 3IX1A 3T96B 1N3XA 4JBZA 1MM6A 2QMXA 2R6GE 4ESXA 2GHBA 1UIVA 3GBAA 3TZAA 1H76A 2B3BA 1JETA 5AA3A 2QMWA 3N5LA 1Y1MA 1US5A 3HSTA 4NF8A 1Q35A 1FTJA 1OQGA 4NEDA 1XVXA 3BKIB 5DVFA 1RKMA 3WAEA 4LZ8A 5I59A 5L9SA 3KSJA 4BDRA 1B5IA 3TUSA 3DLNA 4C0RA 1SW1A 3N6TA 1NNFA 1N7XA 1GGGA 4FECA 2DOJA 1PB7A 1DPPA 3LUYA 3TQLA 3S9LC 3MP6A 2IEEA 4RPOA 1GTKA 2Y7PA 1FQEA 3G3HA 3U92A 4KYEA 3S2VA 3EF7A 3O6IA 4RK9A 3K6WA 4GLIA 4R75A 3HPIA 3N6UA 4NF6B 4OVJA 4R6YA 4HCWA 3HHGA 2ONRA 4LUBA 4XIGQ 5DVJA 2F8DA 2O7UA 1FQBA 3QIMA 3R7XA 4THIA 2VP1A 1B5HA 4FIMA 5CC2A 1B52A 2GH9A 4LA9A 2HZLA 2Y7KA 1ATGA 1M5CA 1H43A 5IKBA 5ITPA 4H6DA 3RY3A 2I4CA 3Q25A 3PMWA 4GL8A 3RPWA 5KCJA 2PMSA 1SW2A 5DYHA 2DXRA 1P1OA 1QKAA 4NWDA 4RJZA 1LCFA 2OCUA 4ELQA 2VOZA 3ONMA 1LBBA 2P2AA 1QULA 2ZYMA 2OK2A 3HN0A 1HSLA 3K02A 4KPTA 1EZPA 1WVJA 2I6EA 1IXHA 1MQGA 4X9TA 3H6VA 1B0HA 1LAXA 4IO3A 5EHSA 4H0WA 1D9VA 1Y1ZA 3OSQA 2I3VA 3CG3A 3G3JA 3PUXE 4X1DA 1UTHB 2NOOA 2H5YA 5KDTB 4XTCQ 5CM6A 4OFOA 2HFBA 2OWSA 2Z8EA 1GVCA 1MPBA 2Z22A 4U1ZA 4RK2A 5TP9A 1SW5A 3F11A 3OO8A 2QJEA 3K6VA 5I84A 1MXVA 3ILTB 4NMYA 4EQBA 1MY4A 4G77A 1AMFA 3DM0A 1MY2A 3C36A 3IOWA 1POTA 2DS9A 1EZOA 2XXXA 3W9VA 5I2KB 1ANFA 2OLBA 1FW0A 2A5SA 3TKDA 2THIA 2XXUA 3OEMA 1J1NA 2QL3A 2ZYKA 4G8NA 4GOTA 3TPAA 2F7AA 1MM7A 3PUVE 1PEBA 2PX1A 4Q8RA 2QS2A 4U2RA 3P7IA 1MQHA 4C1TA 4RXLA 1A40A 4DCYA 4ZEKA 2H25A 3SETA 1B4ZA 3MVXA 1OMPA 1MH4A 3SKPA 3Q28A 3MVWA 3PPPA 2Z8FA 3H03A 4QSCA 3HHFA 4GL0A 1QUIA 1ZTYA 1JW4A 3T9VA 2FA7A 2HEUA 4G68C 3VVDA 3QUFA 3HCQA 3KN7A 4R9FA 5K2XA 4U4XA 4R72A 4ISUA 2H98A 4JB7A 4Z7EA 3CSBA 3RTFB 4IO7A 1USYH 4QFOA 3TCHA 3B7DA 1WDNA 1A8FA 1VFDA 1US4A 1I69A 2UYEA 3T9HB 3FJGA 1XHYA 4GVOA 4MLQA 2D3IA 2O6AA 5EYFA 1LFIA 4I1DA 1JW5A 3PUYE 3UIFA 2GRVA 3G3KA 4GXAA 1QW0A 3PU5A 2Q9TA 3V89B 4EUOA 4YU0A 5HBCA 3MZ1A 2Q2CA 4OERA 2NXOA 2O84X 4L17A 5ISUA 2ZYOA 1A54A 1Y20A 3VV5A 2OBGA 5FHOA 3KFMA 1OIBA 4NF4B 4H65A 1I6AA 3C35A 3VVEA 4NF6A 3A09A 1AH5A 1BKAA 1EH3A 3LBSA 3TTKA 1MS7A 4H5FA 1B3FA 1MQDA 3FVNA 1ZMGA 5KZTA 3KGCA 4DE8A 4OMBA 3FXUA 1A55A 2XXPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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