1IQ7A

Ovotransferrin, c-terminal lobe, apo form
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
343
structure length
341
Chain Sequence
RIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESCSKDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Anion-mediated Fe3+ release mechanism in ovotransferrin C-lobe: a structurally identified SO4(2-) binding site and its implications for the kinetic pathway.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ovotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 102
structure length 341
sequence length 343
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iq7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iq7A02
2IEEA 3D4CA 4N07A 4WEDA 2UYFA 2Z22A 3CSGA 3TTKA 1LFHA 1AH5A 3FUZA 4DE8A 4PQJA 4ZZAA 3L6HA 5I84A 5J1DA 3IORA 5DT6A 2F97A 3RTWB 4OETA 1RYXA 2Z8FA 2XXXA 3PD9A 3TQWA 4KFQA 4OZ9A 4Q8RA 2AIXA 3O66A 3QK6A 4F1VA 1M5EA 1ZKBA 3FV1A 3TFLA 4YAHX 2QRYA 1UTBA 3CI8A 5AA1A 3TTNA 1B2HA 2UYEA 4F2QA 1XS5A 3TPAA 4LQ2A 1IIWA 2AL4A 4H5FA 2UVHA 3HO7A 3OD7A 1B5JA 4EQ9A 3HV1A 1SW4A 4I1DA 1AOVA 4PETA 3T96B 4FIMA 4DIGA 3CR9A 1MQIA 4LVQA 3SEUA 5KDTA 1B3LA 4EXLA 3K6XA 3PUWE 1US5A 1XHYA 2GHBA 4TOZA 4EQBA 4Z0IA 3VVFA 1DTGA 4XKPA 1B3FA 3K1PA 3I3VA 2H25A 2NWJA 3AXFA 3PPRA 4GOTA 3LSLA 3PGFA 4ZECA 3MWBA 3O9PA 4K3FA 2QS2A 3VLVA 5JTYB 3ZS6A 2Z23A 2DXRA 3TTLA 1LAXA 3DELB 2KLFA 3B6TA 4YB6A 1A8EA 1B40A 2ZYNA 1QW0A 4KYEA 1NNPA 4ESWA 1NL5A 3KGCA 4G8NA 3L6GA 2W7YA 1IXIA 4GL0A 1MY0A 3C31A 1MQHA 4U23A 1LAHE 1B3GA 3CRBA 1R9QA 2E1SA 1YPNA 4ZE9A 3W15C 1II5A 3VLWA 4WXJA 4R74A 4LZ8A 5CMKA 2P2AA 3G3IA 2QSXA 4YZZA 2GFEA 4OENA 2DS9A 1A99A 1TFDA 3QUJA 4O3AA 1A55A 4OMBA 4U2RA 3H4ZA 3SETA 3DLNA 5I59A 4ZEFA 3UGWA 4XTCQ 5CMBA 3HCQA 1MM6A 3TTMA 4BDMA 4OFOA 2ZXTA 4JWYA 1BLFA 3RT8A 4ZEDA 4R73A 3MVYA 4R72A 1NFTA 1Y3PA 2PYYA 3IX1A 4F1UA 3MBPA 3PMWA 2XX8A 2OZZA 3JZJA 4YKKA 4FORA 3TZAA 3OO7A 3C9HA 2Z8EA 5H8QA 3RLFE 1JW5A 3ILTB 1SVXB 5H8NA 5AA2D 2I4BA 2ZNTA 2I49A 4OYVA 1SBPA 1R6ZA 3RT6B 1S9TA 1TWYA 1N0TA 1B4ZA 5F7VA 1MXZA 5HPQA 3N6UA 4E0XA 3OSQA 1MDP1 1VFDA 5CC2A 1S50A 1N3XA 1SW1A 3O6IA 3Q28A 3MVZA 2XXRA 3U72A 1Z7ME 1B7UA 2RC7A 3OO6A 2V3QA 4HTGA 1JQFA 1SI0A 1O7TA 1SW5A 4H1XA 2O1MA 4XKRA 2DE2A 2R6GE 3QYTA 4G68B 1OQHA 5CMMA 4E0WA 3DP6A 4Q0CA 3OO8A 3RGYA 3OSRA 3JV9A 1H76A 3UP9A 1MS7A 3H6UA 3LR1A 3TMGA 1HSEA 3CFZA 3IL1B 1B7ZA 1Y3NA 3T66A 3FJ7A 4LONB 1QUIA 2B3FA 5FTIA 4TQUQ 2NUVA 3N6TA 3VVDA 3PUVE 4QFNA 1OLCA 2HZKA 3ZKKA 1FQCA 5LOMA 2NVUB 3K2DA 5ITPA 3MP1A 4OFJA 3PV0E 5I2KB 1VSOA 3MPLA 1LFGA 2H9BA 1N7WA 5L9OA 3IB0A 5BUUA 4Q5TA 1NMUA 3KJTA 3O28A 2IA4A 5DVIA 4JSOA 5L8DA 1ZU0A 2O69A 3PD8A 1XT8A 1LCTA 1BTJA 1FTOA 4L17A 3QXMA 4R6YA 3MP6A 3GXAA 5JTYA 1LAGE 4IGRA 3CIJA 3JYRA 4NF4B 2QMXA 3PMVA 5K2XA 4X1BA 1EZPA 5FHNA 4MF3A 1URDA 2QS3A 5I58B 1GGGA 1MXXA 4WKMA 3UK4A 4I8CA 2UVIA 4NMYA 3T9HB 1SI1A 3Q25A 3C32A 3S9MC 2DWJA 3BKIB 3C35A 4GIZA 1MQDA 1A40A 2F5XA 2D21A 4OWDA 4JWXA 3VVEA 4NEDA 3U94A 1Y4TA 4JBZA 1KWHA 2O6AA 4F1YA 3M3KA 1B58A 2PX1A 2V3UA 3TYHA 3TELA 1Y3QA 1B3EA 1ATGA 3B6WA 5H8FB 3PU5A 3OXNA 4NWDA 2HEUA 3IOWA 5TP9A 1VR5A 3I6VA 1OVTA 1USYH 2F7BA 1WVJA 3FXUA 4GFRA 1P1OA 3OO9A 2Q2CA 2XXWA 3BFTA 3FD3A 4QFLA 5AA2B 1DOTA 4Q30B 4OVJA 3EPEA 3KN8A 3DM0A 3BFUA 2V25A 3PPOA 2DXYA 3D4GA 4MLVA 1AMFA 4LUBA 1B05A 4G77A 2ESNA 1MRPA 1B5IA 1B52A 2QS4A 3FVGA 3ZKLA 1PDAA 2RC9A 4TLMB 2QMWA 4G4PA 3K02A 2DP8A 5A5XB 3S9LC 4KR5A 1O64A 2ABHA 4QF9A 4MH5A 5DVFA 1HSLA 1LLSA 2RF1A 1JNFA 2Q89A 3GBAA 4AQ4A 1LCFA 3FZVA 3FVNA 1A7LA 4GVOA 2VP1A 4KQPA 4F31B 3FGSA 3S9NC 5H8SA 1B0HA 3Q27A 2H5YA 1R1NA 4ONYA 2B65A 2REGA 1SD3A 3O6HA 3T22A 4X1DA 3FJMA 2FNCA 4RK2A 2F35A 4DXCA 3IB1A 3MW0A 3PUZE 5DTBA 3G3KA 3C33A 4OFLA 2O7UA 3OELA 4THIA 4QFKA 3SERA 1NKXA 4ELRA 4N13A 2LAOA 4G68A 1SDXA 1B0LA 1MQGA 4NTLA 3FVOA 4QSDA 2GH9A 4P0IA 3VLUA 2RKMA 3P7IA 2YJPA 3V5AA 4RPOA 3U92A 1JETA 2B3BA 4U4XA 4LP2B 4XXUA 5CMCA 1XOCA 2O51A 2D3IA 4LQ5A 4YKJA 1NH7A 1D4NA 5H8HB 2I0BA 3K6WA 1GV8A 2XXQA 2XXUA 1B4HA 5KCJB 3FATA 1SQYA 2ZNSA 3Q26A 4R9FA 2XXYA 5I2KA 1S7YA 1RYOA 1B32A 2VD2A 4M4GA 2D5WA 3CG1A 2V3TA 5ICTA 3C34A 3R7XA 2NXOA 3K6UA 4AB5A 1Y1ZA 3UN6A 4JB7A 4OHNA 1DPPA 3FIRA 1GTKA 4FE8A 5CRYA 1D3KA 1I69A 4BDNA 4DCYA 3RN8A 3V8XB 4XKQA 4ZS9A 1I6AA 4IO4A 3SESA 3C36A 3RTFB 1VE4A 5FHOA 3H3GA 3HHFA 5AA3A 3M3LA 4AB6A 3IK6B 2P1SA 3CSBA 2HAUA 4EXKA 4QSCA 5FTHA 3S2VA 4NF4A 4NF6B 1YCJA 4R6HA 2XXPA 4IO5A 1R9LA 4OTEA 4MLQA 3IR1A 4H67A 4UA8A 2HFBA 5I58A 1JEUA 1LFIA 3HSTA 3TDJA 1O63A 3CG3A 1DTZA 1OVBA 5I56B 1ELJA 3QAXA 4UACA 3SEVA 3KN7A 1EZ9A 3QSLA 1NNKA 3T9UA 4QFPA 3RUMA 4IY6A 2DE3A 2FYIA 3SEXA 1TFAA 4DZ1A 3G7WA 1XVYA 2HXWA 3MZ9A 1T0KA 1POTA 3I5OA 1ZIUA 1TXFA 2O7IA 1IZ1A 5H8FA 2XHDA 1IQ7A 4YKPA 5CBRA 1MG1A 5I2NB 4LA9A 3ZSFA 4ZZEA 1MM7A 2DOJA 3PPQA 3MQ9A 3IOTA 3QIMA 2DE4A 4ZEIA 4N6PA 5AA2A 2UXAA 3R26A 3KEIA 3OMBA 1XC1A 2AL5A 2BJJX 3IO6A 2HQ0A 1N84A 3B7DA 1YAEA 4I9DA 2PVUA 4NF5B 2OK2A 3KBRA 1IXGA 2ZMBA 3W9WA 4WEPA 4POWA 3F11A 4U22A 2XX9A 5A5XA 2X7QA 1MQJA 3IOVA 4OEVA 1HSJA 1WDNA 3MPKA 3T9XB 1PBQA 1FTKA 4I62A 4NE4A 1JW1A 2HCAA 4C1TA 3KOSA 2XXTA 3K1NA 3V83A 4KCCA 3TCGA 4DXUA 1H45A 4RY1A 4X48A 4EQ7A 4MFIA 1TT1A 5HBCA 4HS7A 1EU8A 1Q1KA 2I48A 1MPCA 2NOOA 2ZNUA 3W9VA 4POXA 1QKBA 4RXLA 4HW8A 2YLNA 4HCWA 1ANFA 3G3FA 4QFOA 3H6WA 3PPPA 1FTMA 2XX7A 1LGBC 4F3SA 1FCKA 1LB9A 2ZYMA 4IO6A 3CVGA 1M5CA 4BDRA 3FV2A 1SW2A 1Y4CA 2VHAA 1NH8A 2Q2AA 2VGQA 1N7XA 3DP4A 3MZ1A 3K00A 4OXVA 3DP8A 2THIA 1B6HA 2QPQA 4PFUA 1Y9UA 2O1LA 2R71A 3KSXA 3N94A 1DSNA 1B3HA 4F2OA 2WKYA 4H5GA 3RY3A 5FHMA 5H8HA 3THIA 4FECA 5DEXB 3E9XA 3TQLA 2Z8DA 4HCYA 1M5BA 1LAFE 3VDFA 3A3UA 1A8FA 3K4UA 4U1OA 5KCJA 2O68A 3O97A 1P1UA 1B1XA 3N5LA 1NNTA 4EF2A 4IO3A 4F22A 3R6UA 3RNNA 2M8CA 3E13X 1FTJA 5B7DA 4M1VA 4KCDA 4IO2A 4XIGQ 3FXRA 4ISUA 3TEPA 1BKAA 3O6GA 4GF8A 4BDQA 3OOAA 3EF7A 4JXIA 3MJNA 3TKDA 2I3VA 4JSDA 2I3WA 1A54A 1P1QA 1AIVA 3H6VA 2Q9TA 2A5TB 2QJEA 2Y7RA 1B7HA 4YMBA 5DVJA 3WAFA 3HPIA 4G68C 1CB6A 3VFJA 1JVYA 2Y84A 3EHTA 4YICA 4ELPA 4R6KA 1Y20A 3M3FA 5CBSA 1PEBA 3O2AA 4G8MA 1FQDA 2ZYOA 2VD3A 2GRVA 4DDDA 3MP8A 5I56A 5IKBA 4G2ZA 2DQVA 2RCAA 1JVXA 3KSJA 3KZGA 5TU0A 2F78A 4F3BA 3U8QA 4F29A 1P1WA 2ZYKA 2F6GA 2Y7KA 1Z7NE 2H99A 2ONSA 5HM4B 4FJPA 1N3WA 4MBPA 1RKMA 2OCUA 2PT1A 3UIFA 2QL3A 1PC3A 3M8UA 3Q29A 1EH3A 1MY4A 2H98A 3MAMA 1ZTYA 4DCXA 5CM6A 3VV5A 1N76A 3CFXA 3LBSA 5ISUA 5I2NA 4H0WA 2O84X 1J1NA 2RC8A 4DLDA 3PMXA 2I58A 3SKPA 1GVCA 1I6BA 1ZJLA 5CI5A 2FA7A 3BBRA 4U1ZA 5TPAB 3A3CA 2PBWA 4C1UA 4GWOA 3E3KA 5L9MA 3OEMA 4KHZE 3UA8A 3IB2A 3TODA 4ZDMA 1XVXA 5JEIA 3IOUA 3SEYA 2G93A 4NF5A 2F34A 1FQFA 3K01A 2ONKE 4YKIA 3LC8A 2REJA 4KYDA 5AA4B 2A5SA 4ELQA 1MXYA 1YTVA 4DXBA 5I57B 3H6TA 4GQOA 2DWIA 2HAVA 2R9JA 3T93B 1AL3A 3H03A 1SYHA 3HN0A 4QHQA 3E4RA 4Z7EA 2I6EA 2G29A 2ONRA 3A09A 3PUYE 2UVGA 4F39A 1JEVA 1JW4A 3LSWA 1IUDA 1MH4A 4ZEKA 1POY1 1Y1MA 3IAZA 4BLAA 4NF8B 3QUFA 2X26A 4RK9A 3U1OA 2OWTA 4F19A 3KJ7A 3MVWA 1DMBA 2ANJA 3IO4A 3PPNA 4OERA 1MXWA 2HZLA 1IEJA 4KI0E 1FTLA 1OIBA 3MC2A 1PB7A 4F18A 4F3PA 4LZ5A 1H43A 4OESA 2AYSA 4X9TA 4KPTA 4P0GA 4P11A 2PT2A 2V84A 2CZLA 1UIVA 4ND9A 3B6QA 4YMAA 3C4MA 2OWSA 3GZGA 3TUSA 1OQGA 1Q35A 4PE5B 5TP9B 4YU0A 5DEXA 2E0SA 1QULA 1UTHB 2Y7PA 3IJXB 4GD5A 4FEDA 4IB2A 3RPWA 3G3HA 3ECRA 1MXVA 2Y7WA 4G8HA 1D9YA 4RJZA 2DSFA 2F7CA 4ZEBA 3FASA 3G3JA 2Q88A 3VXBA 4FAJA 4PFWA 5EHMA 1MY2A 3TCFA 4GL8A 4RA1A 3K0VA 3EHUA 1VFEA 3LUYA 3LSXA 1FQBA 1GR2A 2CMOA 1D9VA 4BDLA 1MPBA 5DYHA 5L9SA 3LSFB 1LSTA 1OLAA 2ALUA 1IITA 1FQEA 4FATA 2F6PA 2A5TA 1IXCA 4U21A 1NNFA 1UTBB 2OBGA 3K1MA 2F7AA 1B5HA 1M5DA 3V89B 3ONMA 3HHGA 3RQTA 4ELOA 1F9BA 4LATA 2YPNA 3EQ1A 3K6VA 1FQAA 1WODA 2PMSA 1PB9A 5JK4A 2F36A 4XKNA 4GLIA 2DVCA 3OEKA 4QSEA 1MY1A 1LB8A 4IGTA 3PUXE 2RCBA 5EYFA 5KDTB 1UIUA 4F3GA 1BP5A 3TAJA 1USYE 4IO7A 5ICQA 4YB7A 3GBBA 4PFTA 4PP0A 5BWJA 5KZTA 2DVZA 1PB8A 3TTRA 2OLBA 1ZLQA 4R2BA 3WAEA 4O3BA 2XXIA 2XXHA 4ZE8A 4RYAA 3SDFA 5EHSA 4LZ7A 4OQOA 1L5TA 1B9JA 2RINA 1MY3A 1P99A 4GRKA 3KN3A 1IXHA 3S9EA 3O29A 4BDOA 5TPAA 3VE1B 3TCHA 3G3GA 4EDPA 2I0CA 5M2VA 3SEWA 4PFYA 3FXQA 2P0SA 2DWAA 1DPEA 2UVJA 4R2FA 5F1QA 1QVSA 4JWOA 4IY5A 3CFLA 4R9GA 4EUOA 2DWHA 2V93A 2Y7IA 4U4SA 4H8IA 5B70A 1MPDA 5AA4A 1N04A 2GHAA 5I57A 3T9VA 3FVKA 1MXUA 3MUQA 1ZMGA 4TLLB 3ODBA 1H44A 3EHSA 2H4IA 4QRZA 5ITOA 3MVXA 1B1HA 1US4A 5K2YA 1BIYA 1LBBA 4RPNA 3VXCA 3UORA 3OENA 4KYSA 4FEBA 1H3DA 5AE4A 2X7PA 4NF8A 4EF1A 4YB5A 3KG2A 2VOZA 4GXAA 1FW0A 5I59B 4RNSA 1ZBMA 1MDQA 3U93A 2XD3A 3EN3A 1M5FA 1MH3A 3ILUB 4OEUA 4O3CA 4GXSB 3MZBA 3FJGA 1I6QA 2QS1A 4C0RA 1QUJA 1QKAA 4JDFA 1B51A 3N26A 1B46A 1QJMA 2I4CA 5IAIA 3GLBA 1URSA 4H8JA 1PBPA 2DYXA 1P1NA 2Q8JA 1SYIA 2OJTA 1LBCA 3H7MA 1URGA 4H65A 5H8QB 1OMPA 5H8NB 1UQWA 4NF6A 1EZOA 3KFMA 3H06B 3IJOB 1QUKA 4NWCA 1CE2A 5ELVA 4ESXA 3USDA 1UTHA 4ECFA 2XXVA 2F8DA 4KD5A 3S4UA 3KOTA 4H6DA 2XD2A 4R75A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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