1IQ7A

Ovotransferrin, c-terminal lobe, apo form
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
343
structure length
341
Chain Sequence
RIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESCSKDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Anion-mediated Fe3+ release mechanism in ovotransferrin C-lobe: a structurally identified SO4(2-) binding site and its implications for the kinetic pathway.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords Ovotransferrin
total genus 102
structure length 341
sequence length 343
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iq7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iq7A02
3E3KA 2F97A 1FTOA 3VVFA 4O3AA 2FYIA 3C31A 3MUQA 1FQDA 1PB9A 5DVFA 2P0SA 2GRVA 2PX1A 4OESA 2HQ0A 3IR1A 3MVYA 3TMGA 3M3LA 1XS5A 2AL4A 3E13X 4I1DA 4H6DA 5H8HA 4G8NA 3RT6B 2F5XA 1A7LA 2E0SA 3B7DA 4PFYA 4F3PA 4LVQA 2QS4A 2R71A 1MS7A 3C4MA 1MPDA 3RGYA 5HPQA 3IL1B 2YPNA 1BTJA 3G3FA 3G3IA 3K1NA 3CG3A 1JEUA 3I5OA 4AB5A 4FAJA 4ZDMA 4ELOA 3K6XA 4KI0E 3LUYA 2Z23A 4R2BA 1B7UA 4N13A 3V8XB 3KFMA 3S9NC 1JNFA 4WEPA 3MBPA 1Y1ZA 1P1QA 1OLAA 1MDQA 3KZGA 3H7MA 4EQ7A 4RPOA 4OMBA 3VVDA 4C0RA 3MVWA 4NMYA 1ZKBA 3E9XA 5KDTB 4P0IA 4JWYA 3USDA 4IO3A 5FHMA 1N0TA 3EPEA 1B0LA 5FHNA 1N84A 3HCQA 3FD3A 4QSDA 4OFJA 3FIRA 3QK6A 5L9OA 1RKMA 4YMAA 3TCHA 2DXYA 3L6HA 5ICQA 3G3HA 3VXCA 3MJNA 1H43A 2NWJA 5DEXB 5JTYB 1MXYA 5CMKA 3O28A 1M5CA 3PUXE 1NL5A 2ONSA 2GH9A 5AA4A 1M5BA 4O3BA 4YKJA 1URGA 2O7IA 3QAXA 1ZU0A 2I48A 3V89B 5A5XA 2XXTA 1SBPA 1IQ7A 3T93B 1LSTA 3UGWA 1NNKA 4YKPA 2ONKE 5I56A 3T9UA 2F78A 4JSDA 2H98A 3IB2A 4NF6A 1B7ZA 3UORA 1CB6A 3PPOA 1ZMGA 2O84X 3H6UA 3OD7A 5EHMA 4Z7EA 3UA8A 4XIGQ 1B1XA 4GLIA 2REGA 2NUVA 3IB0A 5BUUA 5AA1A 4OQOA 3C35A 4ZZAA 2I4CA 2B65A 4F19A 1NMUA 3JZJA 1A54A 5TP9A 5DVIA 4PFWA 1AIVA 4DIGA 1B6HA 4G4PA 1TT1A 2UVIA 4U4XA 1FQBA 3K1PA 3LSWA 1LAFE 4Z0IA 5H8HB 2X7PA 4ECFA 1B05A 1SYIA 4R9FA 4MFIA 1EU8A 3MVXA 4LZ5A 1SQYA 4JXIA 4X9TA 3QIMA 2F34A 3PUVE 4Q5TA 3TTMA 4Q30B 1PB8A 2HEUA 3TAJA 1B40A 2F7CA 2NXOA 4PFTA 1TWYA 4F1UA 2ZNSA 3N26A 3OSQA 2QJEA 3SEUA 5H8FA 2Y7PA 4K3FA 1UTBA 2HZLA 1HSJA 3AXFA 4H8IA 4DE8A 4NF8A 1DPEA 4F2OA 1R6ZA 4N6PA 1IIWA 4ELQA 2OK2A 4H1XA 1GV8A 4C1UA 1NNPA 3FATA 3IB1A 1US4A 4IY5A 2H5YA 1B0HA 2XXXA 1PDAA 3M3FA 5K2XA 2A5SA 1GR2A 5LOMA 2XD3A 1TFDA 2DE4A 3R6UA 4ZECA 2F7AA 4POWA 1OVBA 1MRPA 4IY6A 4G8MA 4NEDA 4LP2B 3KN7A 2QPQA 3OO7A 1A8FA 3LBSA 2Q88A 3FXQA 3MPKA 4ZS9A 1I6QA 3DLNA 4I9DA 2RF1A 4YB5A 1JVYA 1B32A 1B4HA 3KOSA 2REJA 1GGGA 5DYHA 2HZKA 5CC2A 4UA8A 3EHSA 3N5LA 4WEDA 5AA4B 4QHQA 2LAOA 1O64A 2HFBA 3MWBA 3RNNA 2IEEA 5A5XB 1ANFA 1FQCA 5F7VA 2OZZA 4X48A 4FATA 1MDP1 4FEBA 5I56B 3H6WA 3DP6A 2XD2A 2X26A 1BIYA 2V3TA 1IXGA 4XXUA 4NF6B 3K2DA 2O1LA 3O2AA 2FA7A 1URDA 2UVJA 4KPTA 1H76A 4OHNA 4MLVA 1MY0A 2VP1A 3C32A 3B6QA 3C36A 3RY3A 3IOTA 4ONYA 1DSNA 5L9MA 3HSTA 3BBRA 5TP9B 2UYEA 5KCJA 3MQ9A 5H8QA 1JW4A 5CMCA 3L6GA 3FVOA 3VLWA 3FASA 4LQ2A 1BKAA 4EXKA 2Y7WA 2QL3A 4ZEBA 4U23A 3O6GA 4I8CA 1UTHA 3UIFA 3S2VA 4OTEA 2VGQA 2DQVA 1TXFA 4OFOA 5H8FB 4P11A 3T22A 3TQLA 3PD8A 1LAXA 4HW8A 1B52A 1OVTA 2NOOA 3T66A 3H4ZA 5CBSA 4DLDA 4NF8B 2Y7KA 4KYSA 4DDDA 3TPAA 3TDJA 4TLMB 4EXLA 1FTJA 2XX7A 3PUZE 1B9JA 3F11A 2DE2A 3O6HA 3SDFA 2OBGA 5M2VA 3IX1A 1M5DA 2DWIA 1EZOA 3CI8A 1D9YA 2I3WA 3N94A 3IO4A 1YTVA 2D3IA 5K2YA 4NWCA 5TPAA 4QSEA 1SW5A 3A3CA 1R1NA 3WAFA 3LSFB 3V83A 3VLVA 3G3JA 1H3DA 1Q35A 3H6TA 4U1ZA 3I3VA 4LONB 4IGRA 2HCAA 1DTGA 4H8JA 1QW0A 4F1VA 3UP9A 4BDRA 2VD3A 3FXUA 2PT1A 4F29A 4NTLA 3CSBA 1KWHA 3IJXB 4MF3A 1FCKA 4XTCQ 1B5JA 1BP5A 2F6GA 5B7DA 4F31B 1WODA 4H0WA 3SEXA 1NNFA 3IK6B 4XKRA 1CE2A 5CM6A 4NF5A 4OENA 4RYAA 3WAEA 1IXCA 5KCJB 2O51A 5IKBA 4IO5A 1JVXA 5H8QB 1QVSA 3E4RA 4JB7A 4ZEKA 4TLLB 1TFAA 4DXBA 3S4UA 1MH4A 2PMSA 4DCYA 1P1NA 4JWOA 5CMBA 2DSFA 3R26A 2F8DA 1N3WA 1MY2A 3G3KA 1MQDA 4R75A 1EH3A 4E0XA 3CR9A 2PT2A 1UTHB 3GLBA 4GFRA 1SD3A 2E1SA 3HPIA 4YICA 4LQ5A 4G68A 4YKKA 5I58A 2VOZA 3VV5A 5F1QA 2PYYA 3K01A 4YB7A 1MM7A 5CRYA 3KG2A 1Y4CA 3MW0A 4H5FA 2XHDA 1MXUA 2PVUA 3FJGA 5I2NB 4NE4A 4ZE9A 2GHBA 2O6AA 1B4ZA 3DP8A 3MZBA 4KYDA 3Q28A 3VXBA 3QXMA 2I6EA 4XKNA 2XXHA 3MC2A 1Q1KA 4QFLA 3K1MA 4NF4A 4IO6A 3PUYE 3EN3A 4KQPA 1JW1A 4WXJA 4BDLA 4GL8A 2DVCA 2QS2A 3TQWA 1A8EA 1DTZA 3RPWA 1UIUA 4LATA 4R6YA 1Z7ME 3T9HB 3H6VA 5HBCA 1WDNA 1O7TA 3TFLA 5TPAB 4FEDA 4GOTA 1B3HA 2XXWA 2ABHA 1B46A 2V93A 4KHZE 1A99A 4FECA 1N3XA 3M3KA 3BFTA 4ND9A 1PBQA 2G93A 3K6VA 1MXWA 1I69A 2Z8EA 1B3EA 2O68A 3O29A 1MQJA 2GFEA 3VE1B 1VSOA 3FJ7A 5AA2D 1M5EA 4RPNA 1AMFA 3V5AA 3PGFA 3RTFB 4XKPA 4GRKA 5I59A 5AA2A 1MQIA 1MY1A 4R6KA 2I3VA 3LSXA 2RCAA 1QUIA 3SEWA 2DE3A 1I6AA 3KSXA 2DXRA 4LZ7A 3RN8A 4RXLA 4X1DA 3ZSFA 1LFGA 2Y7RA 3K6UA 4PE5B 3PD9A 4NF5B 2ZYOA 1H45A 2Q9TA 1FQAA 3ZS6A 3DM0A 1N76A 4BDNA 5AA3A 2UVGA 2YLNA 4QRZA 2ZYMA 3C34A 4IGTA 1MXXA 2H25A 3MAMA 1D3KA 2OWTA 4BDQA 4AQ4A 2Q89A 5EHSA 3KOTA 1XHYA 1ZIUA 1IUDA 3FXRA 2QRYA 2XXPA 4G68B 4QF9A 1NNTA 2QMWA 2ANJA 2QSXA 5FTIA 1B5HA 5I58B 5ICTA 1H44A 4JDFA 2HAVA 3EHTA 2THIA 1FW0A 1LGBC 2PBWA 4FE8A 3HV1A 2DVZA 4KD5A 3TZAA 3Q29A 1I6BA 3D4CA 2QS1A 2NVUB 1NFTA 1OMPA 1Y3NA 3TTKA 4DZ1A 2DWAA 5DTBA 4F3BA 3IOUA 3KEIA 2DYXA 4EF2A 2I0CA 3LSLA 4NF4B 1FTMA 4QSCA 3K0VA 4GWOA 3OO8A 4MBPA 4YZZA 2UVHA 4RK2A 1AH5A 4GXAA 3CG1A 4IO4A 1S50A 2UXAA 2RKMA 3TTLA 4GVOA 2Z8DA 3KN3A 2IA4A 3MP8A 1HSEA 4G68C 1QKAA 1DPPA 1LCFA 5H8NA 2DWJA 2RC8A 3D4GA 4UACA 2O69A 3DP4A 3FGSA 4JWXA 1VE4A 4GQOA 1GVCA 2DS9A 3THIA 3EHUA 3OENA 1S7YA 3GBBA 4YU0A 1EZ9A 1R9QA 1YCJA 4U21A 3MPLA 1FQFA 4OEVA 4EQBA 4N07A 5ITOA 2I58A 1LAHE 1FTKA 1ZTYA 3FVNA 4HTGA 1YAEA 3SKPA 4F3GA 2F6PA 4MH5A 4RA1A 5I2KA 4TQUQ 5I59B 5AA2B 3OOAA 4FORA 4G2ZA 4GXSB 3RT8A 3SEYA 4DCXA 4THIA 1MQGA 1MG1A 3CVGA 1UTBB 3QUJA 4IO2A 1LLSA 1IEJA 4PQJA 5ELVA 4YAHX 3KGCA 3UK4A 4IB2A 1QUKA 4ZE8A 5JTYA 1RYOA 4PFUA 1URSA 3TCGA 3N6UA 3N6TA 3RUMA 5L8DA 2WKYA 2X7QA 2ZYNA 4F22A 3ILTB 4BDOA 3MP1A 1J1NA 2Z8FA 2W7YA 1JETA 3QSLA 2RCBA 3CRBA 5FTHA 2XXVA 4OVJA 1IXIA 4RJZA 1LFIA 1R9LA 4RK9A 3IO6A 1S9TA 2VHAA 3H3GA 3SERA 4OZ9A 3MP6A 2Q2AA 5JK4A 3TELA 1QULA 3QYTA 4KFQA 1D4NA 1MQHA 1JW5A 5CMMA 1P1WA 1P99A 4NWDA 1Y3PA 5ISUA 1Y1MA 2Y84A 1B3FA 4KR5A 4DXUA 2B3BA 4OYVA 4Q8RA 4OEUA 3MZ9A 5CBRA 4EF1A 4M1VA 4R2FA 4WKMA 2Q2CA 4F18A 2QS3A 3KN8A 5I57A 1M5FA 1SVXB 4KYEA 1PB7A 4YMBA 4JBZA 3TKDA 4TOZA 3PPRA 1XVYA 3BKIB 2XX8A 3GXAA 4L17A 3TYHA 3OXNA 3T9VA 4GL0A 5H8NB 4QFNA 3CSGA 3R7XA 3PPQA 3ZKKA 3CFLA 3TODA 3A3UA 4M4GA 3A09A 3FVGA 3B6WA 1B5IA 2I0BA 1LBCA 5CI5A 3CFXA 3FZVA 1IXHA 1RYXA 4F2QA 4PP0A 3O97A 4IO7A 3ODBA 3TTRA 1LCTA 5JEIA 2G29A 1NKXA 2F36A 3H06B 1Y4TA 3PV0E 4ISUA 3FV2A 5I84A 4DXCA 1BLFA 3PMVA 2A5TA 4O3CA 4EDPA 1MPCA 4OERA 5I2KB 3U92A 3HHFA 2GHAA 3G3GA 2XXYA 1DMBA 5HM4B 1B51A 3B6TA 2RC7A 2AYSA 3EF7A 1T0KA 1B3LA 4YKIA 3GZGA 4QFOA 2Y7IA 3DELB 4YB6A 3SETA 4ZEDA 1OQHA 3CIJA 3OMBA 3TTNA 1VFEA 3JYRA 5IAIA 4R74A 1OQGA 3FV1A 1MM6A 3SESA 1HSLA 3VLUA 1SDXA 2P2AA 3PU5A 1DOTA 3VDFA 3UN6A 4ZEIA 2BJJX 1ELJA 3C33A 2ZNUA 3U93A 1MY3A 4H67A 1LB9A 3O6IA 3MZ1A 5H8SA 1II5A 3H03A 3IAZA 4F1YA 4FIMA 3JV9A 4MLQA 2FNCA 4KCDA 1P1UA 2DP8A 4R72A 3OELA 1JEVA 3OSRA 2RC9A 4BLAA 3IOWA 2V3QA 4PETA 1MXZA 1MPBA 2DWHA 1WVJA 1PC3A 1LBBA 1B7HA 1B3GA 2RINA 4ESXA 1USYE 2CMOA 4U1OA 4U2RA 1QKBA 2XXQA 1AL3A 2HXWA 4LUBA 3VFJA 4BDMA 3S9EA 3U1OA 3U72A 4H5GA 3RTWB 3HN0A 3ZKLA 3OO9A 1OLCA 1PBPA 1USYH 4XKQA 3KSJA 1SI0A 1FTLA 1XT8A 4ELRA 3TUSA 3TEPA 4EUOA 5I57B 2XXRA 1YPNA 3Q26A 3ILUB 1VFDA 1MXVA 4GF8A 1QUJA 1B1HA 3ONMA 4LA9A 5BWJA 2V84A 1N7XA 1SW1A 3Q25A 1Y3QA 3RLFE 3O9PA 3IORA 1SI1A 1XC1A 1UIVA 1EZPA 1ZLQA 3FUZA 3PUWE 2ESNA 4POXA 3T96B 4GD5A 3S9MC 2M8CA 2Q8JA 1OIBA 2O7UA 3W9WA 4R6HA 5DVJA 3MVZA 2OWSA 1POTA 3I6VA 4LZ8A 3U94A 3LR1A 1IITA 1XOCA 4X1BA 2B3FA 2F35A 3U8QA 2Z22A 4ESWA 5L9SA 4QFKA 4ELPA 2R6GE 3EQ1A 2A5TB 4RY1A 4OFLA 5EYFA 3IJOB 1LAGE 3PPPA 1US5A 4U22A 5B70A 1A55A 4I62A 2XX9A 1FQEA 2DOJA 4AB6A 1LFHA 2V25A 3C9HA 2F7BA 3HHGA 1Z7NE 5KZTA 3S9LC 4F39A 2ZMBA 4ZEFA 3BFUA 2ZYKA 1IZ1A 1P1OA 2OCUA 3TCFA 4G8HA 4KCCA 4G77A 3OO6A 5ITPA 4E0WA 3SEVA 3W15C 1QJMA 1JQFA 1NH8A 2O1MA 4Q0CA 3PPNA 3VVEA 1B2HA 4QFPA 1VR5A 4JSOA 2H4IA 3OEKA 5FHOA 3RQTA 1O63A 4F3SA 2ZNTA 4HCWA 2VD2A 3M8UA 3IOVA 5J1DA 1AOVA 4OETA 2H99A 3GBAA 1ZJLA 1PEBA 1MY4A 4R9GA 1D9VA 2D5WA 2I4BA 1L5TA 2R9JA 3CFZA 5DT6A 2YJPA 1SYHA 3OEMA 3Q27A 2H9BA 2ONRA 1N04A 3QUFA 2V3UA 1A40A 1ZBMA 2D21A 3FJMA 3K6WA 5TU0A 5KDTA 4OWDA 1Y20A 3KJTA 3T9XB 2OLBA 2AL5A 2AIXA 2ZXTA 4H65A 1SW2A 2ALUA 1NH7A 1LB8A 3O66A 4HS7A 1POY1 4FJPA 3KBRA 1MH3A 2KLFA 2QMXA 1XVXA 3P7IA 5DEXA 3HO7A 4R73A 1GTKA 4C1TA 3K00A 1F9BA 4RNSA 4EQ9A 3PMWA 3K02A 2I49A 2P1SA 5I2NA 3W9VA 1SW4A 1N7WA 4U4SA 3FVKA 1UQWA 3K4UA 3KJ7A 2HAUA 4GIZA 3LC8A 4HCYA 2CZLA 2OJTA 1B58A 4ZZEA 3PMXA 4OXVA 2XXUA 1Y9UA 4P0GA 1ATGA 2XXIA 3ECRA 3G7WA 5AE4A 2UYFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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