4JWOA

The crystal structure of a possible phosphate binding protein from planctomyces limnophilus dsm 3776
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
284
structure length
284
Chain Sequence
SISGTIAVDGSSTVFPISQAVAEEFEGKFPEVKLTVAMSGTGGGFKKFIAEEIDVTGASRPITEKEAAECKAKGIDYVEFQVAIDGLTVVINPANTFAECMTVAELNKIWAADSKVSKWSEVREGWPDEPIQLFGADTASGTFDYFTEVINGKAKSSRSDYTANSNDNILVQGVVDSKGALGYFGYAYFAENASKLKAVKISDGKKAVCVEPTPATIESGEYTPLSRPLFIYTTKAKLKRPEVAEFIKFLLSEKGDQLVEEVKYIKVPKSVKETMQQRLADALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Phosphate binding protein
molecule keywords Phosphate binding protein
publication title The crystal structure of a possible phosphate binding protein from Planctomyces limnophilus DSM 3776
rcsb
source organism Planctomyces limnophilus
total genus 96
structure length 284
sequence length 284
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12727 PBP_like PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwoA01
1Q1KA 2R9JA 4QFKA 2I49A 3U8QA 3TCGA 1UIVA 2NOOA 1SI0A 2D21A 2DE4A 4ZZAA 2Z8FA 1SW1A 2B3BA 3HO7A 1LAHE 4PETA 2F6GA 4YB7A 1S50A 4HCWA 3PUXE 5DVIA 1RYXA 4QFNA 3FVNA 4ESXA 1MH3A 5CMBA 2M8CA 1AOVA 3KN8A 2O1MA 3RUMA 2XXVA 3FASA 3EHUA 1M5DA 1CE2A 2OBGA 3R7XA 1OMPA 4Q30B 4R6HA 4E0XA 3RPWA 2DWJA 3VLUA 3S4UA 2ONSA 1USYE 4QRZA 3TTMA 4YKKA 5JTYB 2ONKE 3M3KA 3Q28A 1FTLA 3O66A 1II5A 4RXLA 4AQ4A 1MXZA 2V3QA 5KZTA 4PFTA 2VHAA 3VVDA 4TQUQ 1L5TA 4F2QA 1PB9A 3C31A 1B9JA 1B5IA 4FIMA 1H3DA 1OVBA 4F3SA 1VE4A 4HW8A 1QVSA 4U1OA 2I3WA 3K4UA 3IOVA 3S9NC 2XXWA 1XC1A 4YMBA 3U1OA 1TXFA 1LCTA 3QUFA 4F31B 3VXBA 3JYRA 1FTOA 5FTHA 5JTYA 2B65A 1MY1A 4H67A 3KZGA 3GBBA 4QSCA 1YPNA 2AYSA 3WAEA 4R6KA 4IO6A 3QYTA 3Q29A 5IKBA 3FGSA 2QS1A 3S2VA 5EHSA 3OEMA 4F1UA 1Y3QA 2UVHA 2V3UA 1OQGA 2VD3A 1D3KA 1R6ZA 4GL8A 4BDOA 1B52A 4MLQA 1GV8A 3T9VA 3R6UA 3H03A 1MXWA 2HAVA 1A40A 2YJPA 2F7AA 4BDRA 1MPCA 3R26A 3PGFA 1I6AA 5CMKA 3DM0A 4GL0A 4NE4A 2Q9TA 3IORA 5CI5A 4R9FA 2XXTA 4LP2B 4LONB 4HCYA 2QMXA 4NF4B 1FQCA 2R6GE 5I2KB 3FIRA 1N76A 1NNTA 1T0KA 3PPOA 5CM6A 1QKBA 3O29A 5TP9B 4OESA 1ZLQA 2ZYOA 1JQFA 1MRPA 2F6PA 4U2RA 3ONMA 4LZ5A 4DXUA 1IQ7A 2Y7WA 3GZGA 1IXCA 3OEKA 4MBPA 4QF9A 2YPNA 3VLVA 4H65A 4DXBA 1AH5A 4GFRA 2XD3A 3DELB 2O6AA 1DOTA 1LSTA 2I3VA 5AA2B 3ODBA 3GXAA 1P1QA 3MP1A 2RINA 5BWJA 2P0SA 4NF4A 1PB8A 1QW0A 4TLMB 4F3PA 5I2KA 3KGCA 3BKIB 4UACA 2NUVA 3FATA 4ZEBA 2ZYMA 3G3GA 4NF8A 2RC7A 2PYYA 5TP9A 1DSNA 4ZECA 2PX1A 2DE3A 2RC9A 1B1HA 4TLLB 3QSLA 3EHTA 2HAUA 5ISUA 2H99A 4ZEKA 1YTVA 4U22A 4R6YA 1GVCA 1H43A 3FXUA 3O2AA 5I59B 5AA2A 2XX9A 3LBSA 1IIWA 3O6IA 4G4PA 1A99A 3VV5A 4OWDA 4RPNA 4ISUA 2I48A 4F39A 3PMWA 2DOJA 3H6VA 4YMAA 3LSWA 3MZBA 3TTKA 3OSQA 3RTFB 4L17A 3CFXA 4U4SA 2RF1A 3RN8A 4C1TA 4ZE9A 3B6QA 3KEIA 3LR1A 3BFTA 4OTEA 1SI1A 2FA7A 3K1MA 1LAFE 3IJXB 2QJEA 5K2YA 4QSDA 1SW2A 2XHDA 2YLNA 1XOCA 3IO6A 4LQ5A 4OEVA 4JSDA 5I59A 4N07A 3T9HB 4P0IA 1B40A 3HHFA 3FJGA 3FJ7A 4U23A 3U93A 3OO8A 1Q35A 3PMXA 1EZPA 1BTJA 3V89B 1MXXA 2H5YA 3H6UA 1MY3A 4GD5A 4OVJA 1EU8A 4EDPA 2Y7IA 1VR5A 1MPBA 4OENA 2QPQA 5FHMA 4LZ7A 4YU0A 2VOZA 3UP9A 1A8FA 2QSXA 3MZ1A 4OXVA 4EQ7A 4G68A 3HPIA 1FW0A 4KR5A 1GTKA 3MP6A 4FAJA 4KCCA 4Z7EA 4N6PA 2ZYKA 4JDFA 4M4GA 1S7YA 1JNFA 3MAMA 3IR1A 3RGYA 4JWXA 4O3BA 4QHQA 5FHOA 4IO3A 2GHBA 1US5A 4JBZA 4FEDA 2GRVA 2O1LA 1LAGE 1MM7A 4NTLA 1TWYA 2G93A 1JVXA 1GR2A 4X1DA 3D4GA 5K2XA 1MXVA 4X9TA 4XXUA 5AE4A 3OENA 4PE5B 3V5AA 1TT1A 1Y4CA 2B3FA 3MVYA 3HCQA 3SKPA 1FQAA 1SYHA 1A55A 2R71A 2QL3A 3G7WA 4I8CA 4WKMA 3Q27A 2ABHA 2KLFA 5L8DA 2ESNA 3EN3A 2UVIA 1SW5A 4FATA 3S9LC 5B70A 3IOWA 1AL3A 1IEJA 4ZEFA 4EXKA 4P11A 3ECRA 3VVFA 4F3BA 5HBCA 3RTWB 2WKYA 5DTBA 3IB1A 2F7CA 1IZ1A 4R2FA 1B3FA 4GVOA 4QSEA 4XKRA 1NH8A 3LSFB 1BKAA 1ANFA 2Q89A 3UGWA 4DIGA 3L6HA 1B7UA 3FV1A 4LVQA 5DVFA 4OEUA 2PT2A 4F3GA 3MJNA 4JB7A 2I4BA 1IXHA 1B3GA 4OFLA 5ICQA 4U1ZA 1N3WA 2H98A 3KOTA 4MLVA 4KI0E 1HSEA 1QUIA 3QUJA 4DE8A 1POTA 1B5HA 5FTIA 4RJZA 3I5OA 5CBSA 1Y1MA 3RNNA 1N7WA 3JV9A 1UTBB 3TQLA 4LZ8A 3N6UA 4IO2A 1YCJA 1EH3A 3MVZA 1DTGA 3SERA 2ZNSA 1OLAA 1NMUA 3FJMA 3IK6B 1USYH 2XX8A 2H9BA 4ND9A 1QJMA 1SVXB 3Q25A 3SEXA 1BLFA 1P1UA 3UIFA 2F97A 1SDXA 3O6GA 3C34A 4GOTA 4RK2A 4GLIA 3THIA 4KYSA 2W7YA 5LOMA 2XXUA 1MDQA 1LB8A 1B58A 2HZLA 2NWJA 1XVXA 4MH5A 1TFAA 4H8JA 2RC8A 1DTZA 4G8NA 3TCHA 3GLBA 1UTBA 2X7QA 3TKDA 1FTKA 3K2DA 1FTJA 1FQDA 1I6QA 2VGQA 2O69A 4U21A 1B2HA 2DS9A 1MS7A 4IB2A 2Z8EA 4XKPA 1BIYA 3H7MA 3S9MC 3K1NA 2DXRA 1VSOA 5H8SA 3PPRA 4ELQA 1AMFA 3FVOA 1OQHA 3M3FA 3MPKA 5L9MA 4BDMA 1F9BA 5AA2D 3UK4A 1JVYA 3FVKA 1A8EA 2I0CA 2XXQA 3KN7A 4H5FA 2OJTA 1N3XA 1S9TA 4NMYA 3TTLA 3T96B 3EQ1A 2OK2A 1POY1 4IGTA 1H44A 2O7UA 1UIUA 4E0WA 4I62A 4HTGA 3CSBA 4NF6B 2BJJX 3PUWE 3K02A 4NF5B 4KCDA 2H4IA 5TPAB 2REGA 3C33A 3G3HA 1R1NA 4GF8A 2V93A 1A54A 2HZKA 4NF8B 3C35A 4GQOA 2DXYA 3E13X 2O84X 1N04A 5KCJB 5DYHA 3VDFA 2NXOA 2I58A 5AA3A 3IL1B 3GBAA 2A5TB 3U94A 4I9DA 3RT8A 4DDDA 3T22A 4EXLA 2I6EA 4R72A 5CMMA 1MQGA 2O68A 5JK4A 1FQFA 2DE2A 1EZOA 4NF6A 5H8NB 2QS4A 1B32A 1OIBA 3MZ9A 4NF5A 1QKAA 3TPAA 4IY5A 3OO6A 5TPAA 4YKJA 1Y3NA 3ILUB 1Y4TA 5IAIA 1SBPA 1MPDA 1IXGA 3KBRA 3SEWA 4XKQA 3H06B 4BDLA 1Y3PA 3QIMA 2ALUA 5KCJA 3TUSA 2DWIA 1PDAA 2F5XA 3FUZA 3PPPA 2Y7PA 2I0BA 2A5TA 2OZZA 1P99A 4LQ2A 3C9HA 3OO9A 2ZXTA 5F1QA 4PFUA 1O64A 4DLDA 3IOTA 3VFJA 3KN3A 3H6TA 4F1VA 1NNPA 1ZTYA 4P0GA 1GGGA 5A5XB 2XXRA 2F8DA 3FV2A 4EQ9A 2V84A 5H8NA 1N0TA 3MWBA 2DP8A 4O3CA 4ZE8A 4OQOA 4Q5TA 4OHNA 3O6HA 3TFLA 1FQEA 3KG2A 1URDA 3VXCA 4POXA 3OO7A 2E1SA 1XHYA 3LUYA 5M2VA 4KPTA 3HSTA 1M5EA 1B7HA 3MBPA 1B51A 2QS3A 3TQWA 2D5WA 1FCKA 4DCYA 4G8HA 4WXJA 3USDA 4X48A 3TAJA 4DZ1A 5ELVA 4RA1A 4KYEA 4YZZA 2Y7KA 3FZVA 4JXIA 1O63A 1PBPA 4QFOA 3TCFA 5A5XA 3IAZA 4OFOA 2D3IA 4NEDA 4G68B 3MPLA 2HEUA 1MXYA 3OD7A 1MH4A 4OETA 3EF7A 1P1OA 2ANJA 4FEBA 1LGBC 3PPQA 3TZAA 3BFUA 4NWCA 4MF3A 3MVXA 4IO4A 4EQBA 4POWA 3WAFA 2ZNTA 2DWHA 1H76A 3A3UA 1D4NA 3CG1A 4BDNA 4KHZE 4ELRA 5I58A 1JW4A 2AL4A 1J1NA 3B6WA 2XXHA 1R9LA 3I3VA 3K6UA 4QFPA 1VFDA 3M3LA 1IITA 3SEUA 4FE8A 3PD9A 1MG1A 3PUYE 4RNSA 4YB5A 3S9EA 4PFYA 4F29A 3UN6A 4JWYA 3G3KA 3RY3A 4FECA 5HPQA 1IUDA 1RYOA 3SETA 3C32A 2ZYNA 4NWDA 1LLSA 3K6WA 3H4ZA 3V8XB 1JEUA 1FTMA 3MW0A 1UTHA 1MDP1 1LBBA 3U72A 2XXYA 1M5FA 3P7IA 1MQDA 3MUQA 1URSA 3KSJA 5L9OA 1MXUA 3RLFE 3BBRA 3DLNA 4PP0A 1PC3A 3CIJA 2XD2A 1NL5A 1LB9A 4PFWA 2DWAA 2Q2AA 4R2BA 3QAXA 1D9VA 2VP1A 3M8UA 4IY6A 3F11A 2PMSA 1ATGA 1JETA 3W15C 2RCAA 3IX1A 3HHGA 4ELPA 3D4CA 2A5SA 4ESWA 3T66A 5CBRA 3HV1A 1SYIA 3TODA 1JW5A 4Q8RA 3CI8A 2QRYA 1LAXA 3LSXA 2X26A 3TDJA 1N7XA 1NKXA 4H8IA 3UA8A 3O9PA 4R74A 2F7BA 3AXFA 3VLWA 3KFMA 2LAOA 3PD8A 3ZKKA 3OSRA 2X7PA 3H6WA 1WVJA 4RK9A 5H8QB 2HXWA 5F7VA 3A3CA 1MM6A 5I57A 1B0LA 3W9WA 3DP6A 2UYEA 4Q0CA 3KOSA 3VE1B 3CFLA 3E9XA 3OXNA 4G68C 2GHAA 4HS7A 5CC2A 5BUUA 4ZS9A 2F34A 3MVWA 2G29A 1I69A 3TELA 1US4A 4H6DA 4ZZEA 5EYFA 4TOZA 3OMBA 4F1YA 5I84A 3EPEA 4BDQA 3PUZE 4FORA 3SEYA 2F36A 2OWSA 1ZIUA 5DEXB 1NH7A 3PMVA 4O3AA 5H8QA 4EF1A 3E4RA 3A09A 4EF2A 4QFLA 4G77A 1B46A 4KFQA 1DPEA 2UXAA 2V3TA 3QK6A 4GXSB 4Z0IA 4GWOA 3OOAA 3TEPA 1JEVA 4F22A 1B5JA 4K3FA 3T9UA 1Y9UA 3ZKLA 3W9VA 1AIVA 4ELOA 2O51A 2QMWA 5JEIA 4MFIA 4IO7A 3KJ7A 1HSJA 4RY1A 3QXMA 3FVGA 4THIA 4KQPA 2RCBA 5KDTB 3RT6B 3SEVA 5ICTA 4H0WA 1XT8A 3TYHA 4PQJA 2XX7A 3N5LA 1PBQA 5DEXA 3U92A 4C1UA 1QULA 3G3IA 3ILTB 2P1SA 5AA4B 1VFEA 5DVJA 2XXIA 4LUBA 1B4HA 4OYVA 3N94A 3UORA 3K00A 5H8FB 1NFTA 2IA4A 3PU5A 3TTNA 2P2AA 3H3GA 1XS5A 5H8HB 1QUKA 4LA9A 1LCFA 1NNFA 4R9GA 2XXPA 4DCXA 1B3HA 2E0SA 4DXCA 5AA1A 2RKMA 4I1DA 4M1VA 2AIXA 3LSLA 1B1XA 4G8MA 5KDTA 1B4ZA 4F2OA 5HM4B 1M5BA 3CVGA 4YKPA 2V25A 3DP8A 3K0VA 5TU0A 2DVCA 2GH9A 3Q26A 3O28A 2NVUB 3RQTA 3JZJA 3IB2A 2OWTA 1QUJA 1XVYA 1URGA 5AA4A 2CMOA 5J1DA 4EUOA 1OLCA 1MY0A 3FXRA 1MQHA 5H8FA 3IOUA 4GXAA 3SESA 1M5CA 5H8HA 2GFEA 1WODA 4X1BA 3IO4A 2DSFA 2HFBA 4XTCQ 3V83A 3E3KA 2VD2A 1KWHA 3C36A 1O7TA 1SQYA 3FXQA 2REJA 5ITOA 4RPOA 3EHSA 2Q8JA 1DMBA 1ELJA 2DYXA 1ZKBA 4UA8A 4KYDA 3TTRA 3PV0E 1Z7ME 3LC8A 2Z23A 2I4CA 1ZMGA 2H25A 1P1NA 4F19A 2THIA 2CZLA 4WEPA 2F35A 4BLAA 1R9QA 1P1WA 5FHNA 3T9XB 4XIGQ 1MQJA 1B3LA 1ZBMA 3DP4A 4AB6A 2AL5A 3MQ9A 4ZEDA 1MY4A 2OLBA 1DPPA 3ZS6A 3PPNA 2UVGA 2PBWA 3TMGA 3OELA 5DT6A 5I58B 2Q88A 3N6TA 3N26A 4R75A 3HN0A 5I2NB 1NNKA 4H1XA 3MC2A 1D9YA 3G3JA 5B7DA 2HQ0A 4JSOA 3CFZA 4N13A 4GRKA 4YICA 3KSXA 4GIZA 1CB6A 1B6HA 4YKIA 2UYFA 1B0HA 2IEEA 4WEDA 1PB7A 2PVUA 4YB6A 2FNCA 3CSGA 3FD3A 1YAEA 1FQBA 1Y1ZA 5CRYA 2O7IA 2UVJA 2ZNUA 4G2ZA 1LFIA 1ZJLA 4OZ9A 1A7LA 3K1PA 5I56B 3CG3A 3MP8A 4ECFA 4KD5A 4R73A 1BP5A 1WDNA 3I6VA 1UTHB 5I2NA 1LFHA 2ONRA 1Z7NE 4U4XA 1MQIA 4ZEIA 3K6XA 3CR9A 1MY2A 1SW4A 2Y7RA 3O97A 1IXIA 2DQVA 1B05A 3IB0A 1UQWA 1SD3A 1EZ9A 3IJOB 2FYIA 2QS2A 1PEBA 1H45A 3T93B 3B7DA 1Y20A 3G3FA 4H5GA 3CRBA 2Q2CA 1LBCA 4IO5A 3K6VA 3L6GA 5I56A 3VVEA 1HSLA 1B7ZA 1N84A 3K01A 2Y84A 4ZDMA 2OCUA 4YAHX 4F18A 2HCAA 1LFGA 2DVZA 4ONYA 5CMCA 4FJPA 5ITPA 4OFJA 3SDFA 2Z8DA 2F78A 1B3EA 3PUVE 1OVTA 4LATA 4RYAA 4IGRA 4OERA 5EHMA 1ZU0A 4XKNA 4AB5A 4JWOA 2PT1A 3B6TA 3C4MA 4C0RA 2XXXA 1TFDA 2ZMBA 4OMBA 1I6BA 3KJTA 1RKMA 2Z22A 5I57B 5L9SA 3ZSFA 1JW1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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