3G3FA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer with glutamate and nacl at 1.38 angstrom resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3fA02
4F1YA 3KN7A 1O7TA 3T9XB 3H6UA 1XVYA 4U1ZA 3K6WA 3Q28A 1NL5A 2QS4A 3G3HA 1B05A 3VVEA 4X48A 5CC2A 3HO7A 4Q8RA 1FTLA 5J1DA 2H4IA 4KHZE 4DLDA 3JV9A 3CFLA 1MH3A 2HAVA 3E13X 3QUFA 3KOSA 4IY5A 2H99A 3PPQA 4NF8A 4THIA 1II5A 2DWAA 1Q1KA 3RN8A 4Q0CA 4X9TA 1DTZA 1RYXA 2NUVA 3S2VA 3C31A 1B3FA 3MUQA 1SW4A 4KYEA 3RTFB 4QFOA 1Y4TA 4R9FA 5EHSA 3KBRA 4R6KA 4P0GA 4N6PA 3TELA 3SKPA 4F1UA 1B40A 3T9VA 2CMOA 1BIYA 4U4SA 2V3UA 4G4PA 3RTWB 1FQBA 3FASA 4PETA 4U22A 1PC3A 3PD9A 2XXQA 2ZMBA 1HSEA 1TT1A 2ZNUA 4IB2A 3T9UA 1ZU0A 2AL5A 4KFQA 4F3PA 3MWBA 1JVYA 4DXBA 4BDOA 4LZ5A 4FORA 1ZMGA 1B3EA 4QF9A 3UGWA 1MQGA 3A09A 4ZS9A 1QUJA 1ZBMA 2XXRA 1OMPA 4L17A 3D4GA 1NMUA 4GVOA 1WVJA 3VVDA 1EZ9A 2DS9A 1NNFA 3H7MA 1UTBA 2F5XA 2RF1A 2Q9TA 3T96B 5CMMA 4JSOA 1N7WA 3F11A 4ELOA 3T22A 5ITPA 4FEDA 2HZKA 4FJPA 4JB7A 3FATA 4X1DA 1QKAA 3T9HB 4ZEFA 3CIJA 1OIBA 3C36A 1MG1A 4IO7A 4GRKA 4NE4A 1SBPA 4OTEA 2V25A 1Y1MA 2YLNA 1MXYA 3SERA 2XD3A 3SEXA 3PUZE 5DVJA 1DOTA 3ZKKA 4G68C 2Q8JA 2F78A 1UTHB 3MP1A 3FVKA 3EHTA 2ONSA 4OQOA 3HPIA 3N6TA 1CE2A 3USDA 1SYHA 4RPOA 2ABHA 2DWHA 3IOWA 3EPEA 4PFUA 5B7DA 4LVQA 4GOTA 5IKBA 2Z8EA 4HTGA 4KYDA 2F6GA 4ESWA 2RCAA 2NXOA 5FTHA 5TPAB 5AE4A 3MAMA 3RT6B 4F22A 1YAEA 3GZGA 3K1MA 4NEDA 2O68A 2ZYMA 2ZYKA 3IO6A 5L9OA 1FTOA 2QMXA 3OSRA 3SEVA 1FCKA 3R26A 1MXXA 1OVTA 5JK4A 3OO7A 5TPAA 2YJPA 3Q26A 2Y7KA 5I58B 3N5LA 4ZDMA 1LFGA 1MY3A 4PFTA 4G77A 2KLFA 2A5TA 2XXPA 3RQTA 5H8NB 4QSEA 2QS1A 4LQ5A 2H98A 4NF5A 2B3FA 4EDPA 4LP2B 1UIUA 3O97A 5TP9B 3JZJA 2Q88A 1GTKA 1PBQA 3ILTB 1NNPA 3P7IA 4DXUA 2Z23A 4GXAA 3EF7A 1MY1A 2D21A 2O1LA 4RXLA 3SDFA 3H6TA 3TCGA 4ZZAA 5CBSA 4O3AA 1IXCA 3IK6B 5ICQA 4AB6A 3H06B 4DDDA 3UN6A 4NF6A 4RA1A 4G8NA 5CI5A 1M5CA 2DVZA 3OOAA 4H1XA 4U4XA 1B5IA 2GHBA 3IB2A 3K6XA 4QHQA 4IO5A 2I49A 2F36A 3LSXA 2XX7A 4O3CA 1Z7NE 4YAHX 2O69A 5F1QA 3FD3A 1IZ1A 3CG3A 2F97A 3OELA 1QUIA 3LSWA 4RYAA 3LSLA 3O6IA 2ANJA 3EQ1A 5DEXA 4GIZA 1GGGA 1TWYA 3KEIA 1XHYA 4DCXA 2UVJA 2HCAA 4XKNA 3OO6A 2HZLA 4KCCA 3EHSA 3IO4A 2Z22A 5CMKA 2PX1A 1S7YA 4GXSB 1B5JA 1MXUA 3K01A 3IR1A 4HCWA 3MPKA 2ZXTA 2XXIA 4YB7A 4QFPA 2PBWA 1LFHA 4U1OA 4WEDA 3D4CA 5I2NA 3K1PA 3VDFA 1A99A 3S9LC 1LAXA 4ESXA 4H5FA 1URGA 4TOZA 3OXNA 3TTRA 4H67A 2XXYA 1DMBA 5I59B 1H45A 3V89B 1Z7ME 3MZBA 1F9BA 1NH8A 1D4NA 4BDMA 4LZ8A 2VHAA 4MF3A 1ZKBA 3K2DA 1AIVA 2XXHA 1Y3PA 3AXFA 3K00A 4AB5A 1PB9A 1TFAA 2F7BA 4OEUA 1IEJA 1M5FA 2V84A 1OLCA 3TFLA 3GBAA 2O7IA 2DWIA 4BDRA 5H8QA 4IO3A 3SEUA 3IJXB 4OESA 3TTNA 3V8XB 3PPNA 4H8JA 3SEWA 4GWOA 3PD8A 3PPPA 3KOTA 1EU8A 1IXHA 4QFNA 3CFXA 4KR5A 3EN3A 4I1DA 4Q30B 3UIFA 3H6WA 3B7DA 4FE8A 2P2AA 1GR2A 1MXVA 4G8HA 2PT1A 4KQPA 2ONKE 5KCJB 4F3SA 1Y9UA 4ZEDA 5A5XA 3TODA 3HN0A 2R9JA 4PFWA 4FEBA 1A8EA 3VLUA 4H65A 4IO6A 4N07A 3W9WA 1QUKA 4Z7EA 2HXWA 3HSTA 2DP8A 2F8DA 1PDAA 4ONYA 1MRPA 2I58A 1D3KA 1FTKA 1LB8A 1B9JA 5TU0A 4JDFA 5AA4A 2I4BA 4POWA 1XC1A 3U72A 3CI8A 1T0KA 2P1SA 3DP4A 5L8DA 2M8CA 1OLAA 3PGFA 5H8FB 1FQEA 3OEKA 5HM4B 3S9EA 1IUDA 4OENA 1B0HA 1N0TA 1IIWA 2E0SA 3OEMA 2O1MA 3RUMA 1YPNA 5I2KB 4ELPA 2I6EA 3H6VA 5I57B 3IOVA 5H8HB 2P0SA 1A40A 2RC7A 2B65A 5H8FA 1FQDA 1LCTA 1LLSA 2IA4A 4GFRA 3IOTA 2VD2A 4RK9A 3TZAA 2AYSA 1N76A 4MFIA 1SQYA 3E4RA 5BUUA 4NTLA 4R72A 4PFYA 4H6DA 1FQFA 3G3FA 1LCFA 3TKDA 4OYVA 2H9BA 1XS5A 1MQIA 4UA8A 2NWJA 2I0BA 1Y4CA 3B6WA 1XVXA 3PMVA 4HW8A 2NOOA 4HS7A 2FA7A 3N6UA 2R6GE 4QSCA 4FECA 5I56B 1P1OA 3K0VA 5KZTA 3SEYA 1I6AA 2GFEA 4DCYA 3S9NC 4K3FA 1B1HA 3HV1A 4JWOA 4KCDA 2PT2A 2RINA 1B7ZA 3OSQA 1DPEA 4OWDA 3TTLA 1MDP1 3E3KA 5H8SA 3LC8A 3MJNA 1RKMA 2XXXA 1B58A 1DSNA 4OZ9A 2I3WA 2Z8FA 3H3GA 4OMBA 3ONMA 3PPOA 3FGSA 3G3JA 4GL8A 1LAGE 4NF4B 1GV8A 3PMXA 3CR9A 2FYIA 5JTYB 3BBRA 2O51A 3FVOA 3IOUA 4EXKA 4YKJA 4Q5TA 1SI1A 2GHAA 4R2BA 1UTHA 2NVUB 1LFIA 1P1QA 1JW5A 3O6HA 4G68B 1EH3A 1VFDA 3MC2A 3TPAA 3QYTA 3M3KA 3RT8A 3C34A 1B32A 3G3GA 5EYFA 2DE2A 5L9MA 1JVXA 4EXLA 3FXQA 2F35A 2THIA 4NWCA 4EUOA 2ZYNA 1URSA 4C1UA 4QFKA 4R74A 5FHMA 5CBRA 1NNKA 3C32A 1SW2A 2FNCA 3HHGA 1FTMA 1D9YA 4KI0E 3OO8A 2OWSA 2O6AA 4YKIA 1H44A 4ZEBA 2PVUA 3UA8A 3LR1A 1JQFA 2REGA 3U93A 2ONRA 4ZE8A 3WAFA 3PPRA 4GL0A 5I58A 4U23A 3T66A 3PV0E 2VOZA 3A3CA 4RNSA 2Z8DA 3KFMA 3PU5A 2DSFA 1PB7A 2D3IA 4IO4A 4E0WA 2QPQA 1R9LA 5KDTB 3SETA 1MPDA 5H8NA 2DOJA 2UYFA 2UXAA 2O84X 3U92A 5HPQA 3R6UA 2Y84A 2F7CA 1US4A 4TLLB 4I8CA 5TP9A 4ZEKA 4PE5B 4PQJA 3TUSA 1JNFA 1ZTYA 1B3HA 3N26A 3MVXA 1LB9A 3FJ7A 1URDA 3FZVA 2IEEA 5DT6A 1MQHA 1XOCA 2HQ0A 4C1TA 5IAIA 3RLFE 1Y3NA 3MP6A 2OCUA 4JSDA 1IXIA 1HSLA 1N3WA 1BP5A 3K4UA 3CG1A 3H4ZA 4EF2A 3CSBA 3M3FA 4I62A 3WAEA 3I6VA 2PYYA 3KJ7A 2Y7RA 2DE3A 1DPPA 5K2YA 3TQWA 1LAHE 1POTA 3ILUB 4ELQA 5HBCA 2RKMA 2UVHA 3K02A 3OD7A 4XIGQ 4ELRA 3TAJA 4WEPA 1M5BA 3DELB 3N94A 2OLBA 4O3BA 4QFLA 4NWDA 2VP1A 1TXFA 3FXRA 2G93A 4F3BA 2X26A 1LBCA 4XTCQ 1H43A 3LUYA 1IITA 2AL4A 1NKXA 4F2OA 3HCQA 3L6HA 4F2QA 3VLVA 2OK2A 2OJTA 3FJMA 1R6ZA 3B6QA 3MBPA 4IO2A 2W7YA 5AA2B 2F34A 1FW0A 1N3XA 3DM0A 4GD5A 3R7XA 4DIGA 3QK6A 4YMAA 3FIRA 3O2AA 3VVFA 3G7WA 4OFOA 3GXAA 3C33A 1MPCA 5I59A 3BFTA 3SESA 1I69A 5CRYA 5M2VA 5AA2A 1B52A 2I3VA 1OQGA 4FATA 4ZECA 4F31B 2G29A 4X1BA 2WKYA 1KWHA 4XKQA 1VSOA 1UQWA 5L9SA 2AIXA 1HSJA 4LA9A 1S50A 3Q29A 3MW0A 1ATGA 5ICTA 1QKBA 4ND9A 1GVCA 1EZPA 3MZ1A 1I6QA 4MBPA 1P1WA 1DTGA 1LAFE 3KN8A 2YPNA 4QSDA 2RCBA 3C35A 3B6TA 1ZLQA 1OVBA 1B3LA 2DE4A 3VFJA 3DP8A 2ESNA 1SYIA 3KJTA 1B1XA 3KSXA 4R6YA 3W15C 4N13A 4YB5A 1P99A 4YU0A 5CMCA 2GRVA 2H25A 2R71A 5KCJA 5FHNA 4ECFA 3PUYE 1LBBA 2UYEA 4RJZA 5BWJA 5JEIA 3A3UA 4BDNA 1LGBC 4NF8B 4F39A 3RPWA 3K6UA 4IY6A 4PP0A 3TCHA 4IGTA 4XKPA 1AOVA 1SI0A 3KZGA 3VV5A 3VLWA 3K1NA 2XD2A 4FIMA 4GLIA 2QS2A 4YMBA 5AA2D 2OZZA 4HCYA 1JETA 2XX8A 3VE1B 1A55A 4R9GA 1P1NA 5I84A 3KGCA 1US5A 1QVSA 5I2KA 1OQHA 4OERA 3PUXE 5I57A 5H8HA 3ZSFA 4DZ1A 1L5TA 1B5HA 2QSXA 1NH7A 4JWXA 4R6HA 2XXUA 4LUBA 5DYHA 4AQ4A 1PEBA 1N04A 1B46A 2B3BA 1PBPA 1P1UA 4POXA 2QMWA 5DTBA 3OMBA 1A8FA 1MY4A 1SDXA 1QJMA 1BTJA 1USYE 3FJGA 3I5OA 4R75A 1UTBB 3QSLA 3VXBA 4YICA 5AA3A 5F7VA 4F19A 4OFLA 1YCJA 2XXWA 4M4GA 3UORA 5I56A 3FV2A 4H0WA 3CSGA 2QRYA 4BDLA 1MM7A 4I9DA 4OEVA 1NFTA 2I48A 5B70A 1XT8A 2HAUA 3LSFB 3I3VA 4KPTA 4JWYA 4DXCA 3VXCA 1SVXB 3O9PA 3KG2A 2Y7PA 2OBGA 3IAZA 4LZ7A 5ELVA 3C9HA 3IL1B 4RK2A 3TDJA 2DWJA 3G3KA 1B0LA 4P0IA 4YKPA 3JYRA 4XXUA 4FAJA 3MVWA 3O28A 3O66A 2XHDA 4GQOA 1B51A 1MY0A 3ZKLA 3UP9A 3W9VA 2DXYA 2PMSA 4NF4A 2DQVA 1MS7A 5LOMA 2Q2CA 3M3LA 1J1NA 3MVYA 5ITOA 5JTYA 1SW5A 2VD3A 3L6GA 3FUZA 2QL3A 3CRBA 4MH5A 1B4ZA 1WODA 2DYXA 3M8UA 3OO9A 4ZEIA 3CFZA 3OENA 3RY3A 5EHMA 4F18A 2H5YA 3V83A 1LSTA 4LATA 4OFJA 4U2RA 2V93A 3U94A 2Q2AA 4BLAA 3MZ9A 3MP8A 4G68A 4TQUQ 3IX1A 2F7AA 3QXMA 4OVJA 2X7PA 4EQBA 3ODBA 3KN3A 3O6GA 1R9QA 5FHOA 2A5TB 4IGRA 3ECRA 5DVFA 1I6BA 4NF5B 1B3GA 3TCFA 2VGQA 1MQJA 3IJOB 3MVZA 5DVIA 4ISUA 1MH4A 3C4MA 1MXZA 4MLVA 3QUJA 4OHNA 2HFBA 3RNNA 2CZLA 1FQAA 4TLMB 2ZYOA 3TYHA 1SD3A 4WXJA 1B7UA 4KD5A 2XXTA 2F6PA 4WKMA 1TFDA 3TTMA 1ANFA 1MPBA 4E0XA 4P11A 1R1NA 1FTJA 4Z0IA 2I4CA 2O7UA 1MXWA 1IQ7A 4NF6B 2UVGA 4RPNA 1AH5A 3QIMA 1IXGA 2ZNSA 1O63A 2XXVA 1N84A 3K6VA 4F29A 1A7LA 2X7QA 5KDTA 1AL3A 3HHFA 3Q27A 2RC9A 1ZIUA 2HEUA 3PUWE 2REJA 4XKRA 4U21A 4EQ7A 1Y1ZA 3BKIB 3BFUA 5ISUA 1B2HA 4F1VA 4C0RA 1VE4A 4OXVA 5DEXB 3H03A 3S4UA 3TMGA 4ZZEA 4UACA 2Y7WA 4EF1A 3U1OA 3G3IA 3THIA 3RGYA 3KSJA 4KYSA 4DE8A 1SW1A 1M5EA 5CM6A 2ALUA 1AMFA 4G2ZA 4H8IA 2I0CA 1Y20A 3EHUA 1USYH 1JEVA 4R2FA 3U8QA 4NMYA 4EQ9A 1D9VA 2BJJX 1POY1 4F3GA 3IORA 2DXRA 4YB6A 4LONB 4LQ2A 5I2NB 4RY1A 3FV1A 2GH9A 2A5SA 2XX9A 3Q25A 4QRZA 3MPLA 2UVIA 1VR5A 3QAXA 3TTKA 1NNTA 3GLBA 3FVNA 1MM6A 3LBSA 1B4HA 5CMBA 2QS3A 1FQCA 2ZNTA 3FVGA 3IB1A 3ZS6A 2RC8A 1JW1A 1H76A 3DLNA 3PMWA 1RYOA 3S9MC 5AA1A 1A54A 1VFEA 3UK4A 4ZE9A 3PUVE 4G8MA 1O64A 4H5GA 3T93B 5H8QB 1S9TA 1PB8A 1Y3QA 4JBZA 2E1SA 2Y7IA 4M1VA 1WDNA 2D5WA 1MY2A 4JXIA 3O29A 3CVGA 3IB0A 2DVCA 2V3TA 1ELJA 5FTIA 2LAOA 1CB6A 4OETA 2Q89A 1QULA 5K2XA 1UIVA 1Q35A 3TQLA 1MQDA 1BKAA 1ZJLA 1QW0A 3DP6A 1M5DA 2QJEA 3E9XA 5A5XB 4YZZA 2V3QA 1YTVA 4YKKA 1B7HA 1B6HA 3GBBA 4MLQA 4BDQA 4GF8A 3FXUA 5AA4B 3TEPA 1JEUA 3V5AA 4R73A 1MDQA 1H3DA 1EZOA 2OWTA 1JW4A 1N7XA 3MQ9A 1BLFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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