4LATA

Crystal structure of phosphate abc transporter, periplasmic phosphate-binding protein psts 1 (pbp1) from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a in complex with phosphate
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
b'ESITAVGSTALQPLVEVAADEFGTIHVGKTVNVQGGGSGTGLSQVQSGAVDIGNSDVFAEEKDGIDASALVDHKVAVAGLALIVNKEVDVDNLTTEQLRQIFIGEVTNWKEVGGKDLPISVINRAAGSGSRATFDTVIMEGQSAMQSQEQDSNGAVKSIVSKSPGAISYLSLTYIDDSVKSMKLNGYDLSPENISSNNWPLWSYEHMYTLGQPNELAAEFLNFVLSDETQEGIVKGLKYIPIKEMKVEKDAAGTVTVLEG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS 1 (PBP1) from Streptococcus pneumoniae Canada MDR_19A in complex with phosphate
rcsb
molecule keywords Phosphate-binding protein PstS 1
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transport protein
total genus 87
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4latA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4latA02
4ZE9A 2DWAA 1LAXA 1MDQA 4ELOA 3C9HA 1Y4CA 2WKYA 2NOOA 4PFUA 1M5DA 1RYOA 5DVJA 1N7XA 1TXFA 4XIGQ 2GHBA 4EF1A 4OXVA 2XX7A 3B6WA 3VLWA 3CG1A 3EPEA 2GH9A 4C1TA 1US4A 3MPLA 2F6PA 4LZ8A 1Q35A 2V93A 1YAEA 1LSTA 1DTGA 4I1DA 2Q2CA 1FW0A 3C31A 3HHFA 1M5CA 1TFAA 3FUZA 3Q29A 1SW4A 4QFPA 1NNPA 4H6DA 1R9LA 3K1MA 2O1LA 2CZLA 3PUVE 2F78A 2Y84A 1TFDA 4X9TA 4FEDA 1B2HA 1SYIA 4ECFA 4ZECA 4R6KA 3CG3A 1B6HA 2RCBA 2UYFA 1RYXA 5I84A 3OEMA 5H8SA 4ZEFA 3GZGA 3KEIA 1EH3A 1NH7A 4EQ9A 1BIYA 3OD7A 2XHDA 1IQ7A 5AA4A 2DWIA 1SVXB 5H8HA 4JBZA 4KCCA 5L8DA 1R1NA 1H45A 2D3IA 3VXBA 4JSDA 5CC2A 1B3GA 3CSBA 2VGQA 3C33A 2PYYA 2XXQA 3OELA 1AOVA 1UIVA 4NEDA 2E1SA 4JXIA 3UK4A 1MG1A 4R2FA 2AL4A 4LP2B 4JDFA 3I3VA 5JTYB 1N0TA 2ZMBA 2QJEA 3T96B 4U4SA 1LBCA 2PT2A 1VSOA 3FV2A 5I59A 1MM6A 4JB7A 1B5IA 1XVYA 3FXUA 1M5BA 2THIA 1SD3A 2DQVA 1ZJLA 4G8NA 1N3WA 2Y7PA 4OVJA 4LQ2A 3IK6B 2Z8EA 2P0SA 1OQHA 1LCTA 3VLUA 2XXPA 3I5OA 5KDTB 4M4GA 1UTBB 2VD3A 3EHUA 5I58B 2YJPA 1H76A 3AXFA 1XHYA 1O7TA 3N6UA 4NF6A 2UVJA 1XC1A 3HSTA 3K4UA 3EF7A 4DCXA 5I57A 3DP8A 4GXSB 3FVKA 2FA7A 3OOAA 4PQJA 4TLMB 4WXJA 3RT6B 2XX8A 3VVEA 3L6HA 1IXGA 2KLFA 3UP9A 2V3UA 3MZ1A 4ESWA 3UA8A 2XX9A 3SETA 3TTMA 4QSCA 3KN8A 4GL8A 3TCFA 5DEXA 2F34A 1S50A 4U21A 4P11A 3UGWA 4F1UA 1N76A 1JW1A 1B0LA 4QSDA 2F36A 2O7IA 2F8DA 1B7HA 2NWJA 3PUWE 1DPEA 3PMWA 2Y7KA 2H99A 2REJA 2ZYNA 3K01A 3IO6A 3O29A 4F22A 3HO7A 4N6PA 1MPBA 2XXXA 1XOCA 4ZEIA 5BUUA 1XS5A 4RPNA 4F3BA 4YKJA 2QL3A 2RC9A 3C34A 4OTEA 3ONMA 2X7PA 4EQ7A 2O1MA 3OO8A 1ZBMA 3O28A 1ATGA 1MY3A 5I56A 1BP5A 2XD2A 1B58A 4ZEBA 1S7YA 4DZ1A 4H1XA 2I48A 2DP8A 1D9VA 5CRYA 2DSFA 2ONSA 3UORA 4XXUA 5IKBA 5JK4A 4AB6A 2O69A 3GBAA 3TFLA 5CMCA 1D4NA 3HN0A 2R6GE 3MVXA 4NF5B 2ALUA 3FVGA 4YMBA 4Z7EA 2DE2A 3RY3A 1URSA 2F35A 3PMXA 4KYEA 1SW5A 3IOTA 2I4CA 4OFLA 4NMYA 1NNFA 3FVNA 5ICQA 3HHGA 3JYRA 4LUBA 4F18A 4LONB 4XKQA 5CMBA 3O9PA 3MPKA 1GVCA 3BFTA 1T0KA 1POTA 2GFEA 2I49A 1YCJA 4YKPA 2XXYA 4ISUA 1ZU0A 2V3QA 4EQBA 2D5WA 3VVFA 1A99A 1I6QA 2QMXA 3MVYA 2B65A 4NWCA 5L9SA 1HSLA 3G3HA 4IGRA 1DOTA 4QFOA 2DXRA 1AH5A 3TAJA 3T9UA 2XXTA 4HTGA 3KSJA 5IAIA 3LUYA 1B40A 3W15C 1IZ1A 3QYTA 5ITPA 4WKMA 4K3FA 1N3XA 3FV1A 4OYVA 1LGBC 3MUQA 1XT8A 4RK2A 3B6QA 4IY5A 3G7WA 1II5A 2OLBA 5ITOA 1MY0A 4DLDA 3H6VA 5DTBA 1O63A 2OK2A 1EU8A 1LFGA 4RK9A 3K2DA 4QFNA 1B32A 3KOTA 1SI1A 2RF1A 3FVOA 3PPOA 4F39A 5DVIA 2G93A 4MLVA 4X1DA 5CBRA 4LA9A 4UA8A 2Z8FA 3VLVA 4Q8RA 1URGA 4LVQA 4NF4B 2OCUA 4F3GA 4PE5B 4R2BA 4H8IA 3PD9A 2OBGA 2PT1A 2Z22A 3H6UA 4NWDA 4RY1A 3DLNA 1D3KA 4BLAA 3MP8A 2XXRA 3E9XA 4OETA 4HS7A 1B7UA 3KSXA 1FQFA 1MXUA 1PDAA 2HZKA 1B05A 4POXA 5FTIA 4FORA 3TPAA 1LAGE 3EHTA 3ZS6A 3TTKA 1TWYA 3IJXB 3H3GA 1B51A 3WAFA 3C4MA 4G68B 3A3UA 4PETA 4EDPA 3FXRA 2DS9A 3FXQA 4ESXA 3RTFB 3O6HA 4GRKA 3U94A 2DOJA 3RUMA 1ANFA 1MXZA 3TTRA 5I2KB 2XXUA 1BLFA 5H8NA 2UVHA 3SESA 1UTHA 3K6WA 1SDXA 1FTLA 3M3LA 1RKMA 4R9GA 3QIMA 3R6UA 1OIBA 2H4IA 5HBCA 2ESNA 3V89B 2G29A 1P1QA 4XKPA 1JEUA 4C1UA 4TOZA 4GVOA 5TP9B 2YPNA 2F5XA 3B6TA 3H7MA 2ONKE 1F9BA 1FQBA 3S9NC 3QUJA 2QPQA 4Q5TA 5KCJA 2DE4A 4R72A 1JNFA 4YU0A 2F97A 4QF9A 4OHNA 4YKIA 1Y4TA 3G3KA 3U72A 4EUOA 3Q25A 4YICA 3MQ9A 2LAOA 4FIMA 4U1OA 3FJGA 4IO2A 1R6ZA 3H06B 1PC3A 1B5JA 1B52A 3O6GA 2ZNUA 4ELQA 3MW0A 1IITA 4C0RA 2HFBA 4HW8A 5ICTA 2NUVA 1IUDA 1S9TA 2HEUA 1US5A 4RA1A 1GTKA 3I6VA 1I6BA 4QFLA 1ZTYA 4DCYA 3WAEA 3KGCA 3RGYA 4OENA 5JEIA 1FCKA 2UYEA 3TQWA 4KPTA 2W7YA 4JWOA 1P99A 2UVIA 1JQFA 3T9VA 2Q88A 1ZMGA 2I0CA 1PB8A 5H8FB 3FJMA 3PD8A 1A7LA 4G68C 1B7ZA 1JW5A 1R9QA 4NF8A 5TPAA 4FEBA 3PUXE 3EHSA 1PBPA 4YB7A 4IY6A 3TODA 1BTJA 4ND9A 4F29A 1B0HA 3H4ZA 3SEXA 3LBSA 2ZNSA 3T93B 3RNNA 5I2NB 3O97A 5DVFA 3IOVA 2A5TA 2HAUA 1NL5A 3ZKLA 5CBSA 1IEJA 3PU5A 3VVDA 3G3GA 1NMUA 2F6GA 2OZZA 3IX1A 2OWSA 1DPPA 3BFUA 3IR1A 5J1DA 3DP4A 1PEBA 5H8QB 3DP6A 1A40A 2O84X 3MZ9A 1B3EA 1JETA 2H5YA 5DYHA 2IEEA 2BJJX 3A3CA 3VDFA 2ANJA 1MXYA 4F2OA 1WDNA 1MXXA 1NH8A 5K2XA 4QFKA 1B9JA 4FJPA 4GL0A 1N7WA 3HCQA 4R74A 5LOMA 3D4CA 4JWXA 4ZEKA 4KFQA 4LZ5A 4AQ4A 5AA2B 4F1VA 4U22A 4DDDA 4O3BA 2I0BA 3A09A 1MQHA 4DXBA 1N04A 4OFOA 3IO4A 4QSEA 2HAVA 3U93A 4X48A 5TU0A 2P2AA 4LATA 3SDFA 2ONRA 3SEYA 4H65A 1FQEA 1TT1A 2AL5A 3R7XA 1NKXA 1P1OA 4IO4A 2V25A 5AE4A 2QSXA 3MZBA 3LR1A 5DT6A 1Z7NE 2ZYMA 3W9WA 4DXUA 2B3FA 1FQAA 3VXCA 1WVJA 3ZSFA 2VHAA 2QS1A 4HCYA 1A8EA 5FHNA 4KQPA 1LB9A 2X26A 3V8XB 1OVBA 3MVWA 3G3JA 2QS4A 4HCWA 4YB5A 1FTMA 2QRYA 4ELPA 3R26A 2DWJA 3TTLA 3MBPA 1B3FA 1B46A 2M8CA 3K02A 4U4XA 3N94A 1FTOA 4KR5A 3V5AA 3IOWA 4QHQA 1H3DA 3UN6A 4MBPA 4GF8A 1Y3QA 3M3KA 1UQWA 1QKAA 3D4GA 3VV5A 2GHAA 4F31B 1B1XA 2NXOA 5JTYA 3CIJA 3FATA 3TKDA 4WEDA 5L9MA 5HPQA 3QAXA 3OO7A 3TDJA 2QS3A 3V83A 1LFHA 1LLSA 4PP0A 3IB1A 3S4UA 2AIXA 2VD2A 3CFZA 3GLBA 1Y3NA 2D21A 4OEUA 1P1UA 5KDTA 1UTBA 4GWOA 1QJMA 3SERA 4KI0E 3LSXA 5I58A 1MH4A 1JEVA 5FHOA 4ZE8A 1CB6A 3CSGA 3JZJA 3MJNA 4JWYA 1QKBA 5A5XB 1POY1 1B1HA 4MH5A 1JVYA 2ZXTA 3MWBA 2O51A 1NNKA 2VP1A 1SW2A 4E0WA 4KD5A 5EHSA 5AA4B 2H25A 5H8HB 1SYHA 2Y7WA 5ISUA 3MAMA 3VE1B 3IB2A 1GR2A 2CMOA 4TLLB 3BKIB 3MC2A 3LSFB 1LAHE 3P7IA 2XD3A 1XVXA 3FASA 2Q89A 1YTVA 1AL3A 1P1WA 3DELB 3FJ7A 3FIRA 1HSJA 2HCAA 4MLQA 4R6HA 2DXYA 5I59B 4H67A 4DXCA 3PUYE 1MQIA 2DE3A 2ZYKA 4LZ7A 1MXVA 3PV0E 5CMMA 1URDA 5M2VA 1IXHA 3MVZA 1VE4A 3L6GA 1QVSA 4ZEDA 1VR5A 3RTWB 1JW4A 3IL1B 1NNTA 1PBQA 2RINA 3QXMA 3KZGA 4PFTA 1SQYA 3LSLA 4RYAA 2VOZA 1AIVA 3SEVA 4OESA 3USDA 4Q0CA 4NF6B 3TEPA 1J1NA 4E0XA 3Q27A 1MRPA 4OWDA 1Y1ZA 3K0VA 4UACA 4IO6A 5I57B 1QUKA 2A5SA 3PPNA 2R9JA 1O64A 3OO6A 2REGA 4F2QA 4KYDA 5B70A 2I4BA 4MFIA 1DMBA 4H5GA 4NF5A 3G3IA 4OFJA 4O3AA 2FNCA 2I58A 1EZ9A 4R6YA 3TYHA 3RQTA 5DEXB 1USYE 3PPRA 4ZZAA 3GXAA 4N13A 4LQ5A 1BKAA 4F19A 4BDNA 3E4RA 5CM6A 2DVCA 4R73A 3FZVA 4ELRA 2Q9TA 3LSWA 3Q28A 3B7DA 1MDP1 3KBRA 4GOTA 1P1NA 2F7CA 2GRVA 3QK6A 4BDQA 4IO3A 5AA3A 3M8UA 3S9LC 1PB7A 3K1NA 2XXHA 2O68A 3TMGA 3PUZE 1IIWA 1OVTA 1DTZA 3HPIA 2HXWA 3PGFA 5I56B 3MP6A 4O3CA 3OSRA 4YMAA 3IOUA 5A5XA 1Y1MA 2NVUB 3H6WA 1Y3PA 2RKMA 4XKNA 1ELJA 3O6IA 4PFWA 5K2YA 3TZAA 1FQCA 3OO9A 1B4HA 2RC7A 1CE2A 4OEVA 2O6AA 5KZTA 3N5LA 1LAFE 4XKRA 4YAHX 1DSNA 3E13X 4GIZA 1B5HA 5L9OA 3PMVA 1QULA 5B7DA 3QSLA 3UIFA 3H6TA 2H98A 1I69A 1A55A 1HSEA 4P0GA 1LB8A 3U92A 1WODA 2UVGA 2I3WA 2DWHA 4NF4A 3CVGA 1IXIA 4U1ZA 4Q30B 2Q8JA 4X1BA 1MPDA 3OENA 4PFYA 4WEPA 4FATA 3T66A 3OXNA 3T9XB 1B4ZA 3CR9A 3ODBA 3OEKA 4QRZA 4U23A 4TQUQ 3TQLA 3IORA 1B3HA 1QW0A 3PPQA 1MS7A 2ZNTA 2HZLA 3S9MC 3T9HB 1OMPA 3KJ7A 3O66A 4ZS9A 2DVZA 4DE8A 3K6UA 1MH3A 3K00A 3EN3A 3TELA 5BWJA 3K6XA 1MY1A 3HV1A 3OMBA 3KN3A 4G68A 3OSQA 4G2ZA 1SBPA 3PPPA 4MF3A 1FTJA 2I6EA 4M1VA 1EZPA 4GQOA 2QMWA 5EYFA 2O7UA 5I2KA 1H43A 4IGTA 1IXCA 1Y9UA 4R75A 3RT8A 4N07A 2V84A 3TCHA 1MY4A 2I3VA 3RLFE 1Q1KA 2ZYOA 1FQDA 1GGGA 4EXKA 5TP9A 2H9BA 4YKKA 4ONYA 4G4PA 2Y7RA 3H03A 4OERA 1D9YA 3G3FA 4F1YA 3T22A 3U1OA 2DYXA 4KHZE 4KCDA 3IAZA 3K1PA 3FD3A 2E0SA 1QUJA 3K6VA 2Y7IA 3RPWA 4EF2A 2R71A 1A8FA 1OQGA 3JV9A 2IA4A 1ZIUA 3O2AA 5AA2D 4JSOA 2OWTA 3N26A 3ILTB 1MXWA 3KN7A 4H8JA 1MPCA 3SEWA 2HQ0A 3EQ1A 4H5FA 1MM7A 3MP1A 1LCFA 2Q2AA 1M5EA 4GLIA 3IB0A 1L5TA 5H8FA 5FTHA 4RXLA 5AA1A 5F1QA 1Z7ME 4XTCQ 3C36A 4P0IA 5H8NB 4G8HA 1UTHB 3THIA 3C35A 3TCGA 3RN8A 4POWA 1USYH 1VFDA 1SW1A 2P1SA 2PMSA 5FHMA 3BBRA 5I2NA 1GV8A 3ZKKA 4EXLA 1KWHA 3KOSA 4OQOA 2UXAA 4I62A 2ABHA 4I8CA 5HM4B 3C32A 1MQDA 1UIUA 5KCJB 1ZLQA 4NTLA 4FECA 3M3FA 4RJZA 3S9EA 5H8QA 4BDMA 4H0WA 4NE4A 4YZZA 2PVUA 2AYSA 4GXAA 2X7QA 1OLCA 2Z8DA 1AMFA 3TUSA 3VFJA 3DM0A 3FGSA 1A54A 3E3KA 2RCAA 4RNSA 3S2VA 2PX1A 1YPNA 1Y20A 2F7AA 3F11A 3KG2A 2FYIA 1I6AA 1MQJA 5ELVA 4GFRA 3N6TA 4FE8A 1EZOA 5AA2A 4BDOA 4G77A 1H44A 4KYSA 4THIA 3GBBA 4NF8B 5TPAB 3KJTA 3ECRA 4DIGA 1ZKBA 2RC8A 3CRBA 2XXIA 4BDRA 1QUIA 1N84A 3W9VA 2V3TA 1SI0A 2YLNA 3SKPA 2B3BA 4G8MA 3KFMA 4F3PA 3LC8A 4R9FA 4I9DA 2A5TB 3TTNA 1LFIA 4IO7A 2XXWA 4OMBA 3IJOB 4IB2A 1NFTA 1MQGA 4RPOA 4U2RA 4GD5A 5EHMA 2Z23A 3QUFA 4BDLA 1LBBA 1VFEA 3Q26A 1PB9A 4Z0IA 3U8QA 4L17A 4OZ9A 1MY2A 4FAJA 2QS2A 1M5FA 4F3SA 4IO5A 4ZZEA 3ILUB 3CFLA 2PBWA 1B3LA 3SEUA 1OLAA 1FTKA 1JVXA 2OJTA 5CMKA 4AB5A 2XXVA 3CFXA 4ZDMA 2F7BA 3CI8A 5CI5A 5F7VA 4YB6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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